View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1358_low_26 (Length: 520)

Name: NF1358_low_26
Description: NF1358
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1358_low_26
NF1358_low_26
[»] chr8 (95 HSPs)
chr8 (1-500)||(20536208-20536707)
chr8 (1-500)||(18818032-18818530)
chr8 (1-500)||(22626736-22627234)
chr8 (1-500)||(23406379-23406880)
chr8 (1-500)||(18878859-18879352)
chr8 (1-499)||(28648666-28649164)
chr8 (1-500)||(21923550-21924049)
chr8 (1-503)||(6759255-6759756)
chr8 (1-499)||(23648554-23649052)
chr8 (1-500)||(16091963-16092463)
chr8 (2-500)||(21918633-21919121)
chr8 (12-500)||(7372778-7373237)
chr8 (1-500)||(22875065-22875564)
chr8 (1-500)||(31971257-31971743)
chr8 (1-500)||(16199280-16199765)
chr8 (1-497)||(41598188-41598683)
chr8 (173-500)||(45130793-45131117)
chr8 (21-362)||(25362793-25363123)
chr8 (1-481)||(19801049-19801527)
chr8 (1-185)||(5865899-5866082)
chr8 (279-500)||(21389353-21389571)
chr8 (334-497)||(14409444-14409606)
chr8 (284-500)||(21395888-21396101)
chr8 (284-500)||(21790381-21790594)
chr8 (1-185)||(21491308-21491491)
chr8 (334-497)||(1484402-1484564)
chr8 (334-497)||(5853292-5853454)
chr8 (334-493)||(16413316-16413474)
chr8 (334-497)||(20403227-20403389)
chr8 (334-497)||(22001753-22001915)
chr8 (209-493)||(13507914-13508199)
chr8 (297-500)||(21778697-21778897)
chr8 (1-185)||(17141229-17141412)
chr8 (209-493)||(13597446-13597731)
chr8 (1-185)||(21249697-21249880)
chr8 (1-185)||(21255535-21255718)
chr8 (334-497)||(4483281-4483442)
chr8 (334-497)||(4542373-4542535)
chr8 (334-497)||(15203231-15203393)
chr8 (334-497)||(20046195-20046357)
chr8 (4-114)||(45130656-45130766)
chr8 (10-185)||(26355329-26355504)
chr8 (10-184)||(21674021-21674195)
chr8 (346-498)||(18678069-18678221)
chr8 (334-497)||(19896265-19896430)
chr8 (346-498)||(32121734-32121886)
chr8 (235-500)||(17611968-17612231)
chr8 (334-493)||(45290694-45290853)
chr8 (334-497)||(14823774-14823935)
chr8 (334-497)||(25484275-25484430)
chr8 (334-499)||(26223917-26224081)
chr8 (369-482)||(15070573-15070686)
chr8 (334-503)||(19937005-19937174)
chr8 (316-473)||(23776772-23776929)
chr8 (377-500)||(6520368-6520491)
chr8 (318-481)||(20498581-20498744)
chr8 (374-497)||(26219717-26219838)
chr8 (374-500)||(38855246-38855372)
chr8 (431-500)||(17140916-17140986)
chr8 (431-500)||(21490995-21491065)
chr8 (374-497)||(26225288-26225409)
chr8 (11-114)||(38854883-38854986)
chr8 (431-500)||(5866325-5866395)
chr8 (431-500)||(23760895-23760962)
chr8 (431-482)||(983457-983509)
chr8 (381-496)||(21285601-21285716)
chr8 (29-185)||(39834147-39834303)
chr8 (11-89)||(6520779-6520857)
chr8 (450-500)||(21249384-21249434)
chr8 (450-500)||(21255222-21255272)
chr8 (431-496)||(26355749-26355815)
chr8 (20-114)||(23760481-23760575)
chr8 (1-82)||(21389075-21389156)
chr8 (318-481)||(37116366-37116530)
chr8 (285-336)||(26222987-26223039)
chr8 (9-108)||(21414857-21414956)
chr8 (431-481)||(24353039-24353090)
chr8 (411-496)||(17353975-17354060)
chr8 (432-481)||(20502154-20502203)
chr8 (433-488)||(21673716-21673772)
chr8 (431-479)||(22525579-22525627)
chr8 (285-340)||(26219862-26219918)
chr8 (431-481)||(17267045-17267096)
chr8 (431-481)||(19154938-19154989)
chr8 (323-473)||(20465982-20466132)
chr8 (51-110)||(20527812-20527871)
chr8 (51-109)||(18865695-18865753)
chr8 (33-111)||(20499049-20499127)
chr8 (30-83)||(13507660-13507713)
chr8 (30-83)||(13597192-13597245)
chr8 (12-112)||(16409889-16409989)
chr8 (437-473)||(20533467-20533503)
chr8 (433-481)||(28397569-28397617)
chr8 (145-185)||(37116664-37116704)
chr8 (144-184)||(38855015-38855055)
[»] chr7 (114 HSPs)
chr7 (1-500)||(9509189-9509688)
chr7 (1-500)||(12698831-12699331)
chr7 (1-500)||(38227481-38227979)
chr7 (1-497)||(3563986-3564482)
chr7 (1-500)||(26211995-26212484)
chr7 (1-500)||(16385880-16386369)
chr7 (2-498)||(40443393-40443875)
chr7 (153-500)||(10589039-10589384)
chr7 (10-482)||(15143667-15144140)
chr7 (1-500)||(27847466-27847951)
chr7 (12-497)||(17061593-17062077)
chr7 (12-497)||(44116509-44116992)
chr7 (285-497)||(18456319-18456530)
chr7 (12-481)||(12756350-12756817)
chr7 (30-500)||(2279769-2280238)
chr7 (1-181)||(39267268-39267447)
chr7 (1-185)||(2831928-2832110)
chr7 (334-500)||(13647325-13647491)
chr7 (1-185)||(9751172-9751355)
chr7 (318-497)||(16213684-16213861)
chr7 (1-185)||(18302494-18302677)
chr7 (1-185)||(28504923-28505106)
chr7 (334-497)||(456321-456483)
chr7 (334-497)||(11972496-11972658)
chr7 (334-497)||(14949122-14949284)
chr7 (334-497)||(15376713-15376875)
chr7 (334-497)||(16232520-16232682)
chr7 (334-497)||(18640272-18640434)
chr7 (334-497)||(20385123-20385285)
chr7 (334-497)||(21189595-21189757)
chr7 (334-497)||(32125491-32125653)
chr7 (334-497)||(41522917-41523079)
chr7 (334-497)||(41525379-41525541)
chr7 (334-496)||(11393287-11393448)
chr7 (334-500)||(18430709-18430874)
chr7 (10-186)||(810760-810936)
chr7 (10-185)||(44014489-44014664)
chr7 (334-497)||(24702238-24702400)
chr7 (334-497)||(27216860-27217022)
chr7 (351-493)||(24275175-24275316)
chr7 (336-497)||(16410059-16410219)
chr7 (285-497)||(48273392-48273594)
chr7 (1-181)||(15754509-15754689)
chr7 (334-497)||(3386333-3386495)
chr7 (50-478)||(12255462-12255892)
chr7 (1-185)||(34201099-34201282)
chr7 (331-496)||(14932685-14932851)
chr7 (331-496)||(15356120-15356286)
chr7 (331-496)||(15360234-15360400)
chr7 (334-497)||(24704688-24704847)
chr7 (233-493)||(38898275-38898535)
chr7 (394-497)||(13869346-13869448)
chr7 (235-500)||(19486599-19486865)
chr7 (317-497)||(20110556-20110724)
chr7 (411-494)||(18154873-18154956)
chr7 (10-114)||(68132-68236)
chr7 (1-89)||(11995680-11995768)
chr7 (370-497)||(13831373-13831499)
chr7 (431-500)||(67745-67815)
chr7 (431-500)||(28505349-28505419)
chr7 (431-500)||(34200786-34200856)
chr7 (59-251)||(16056576-16056769)
chr7 (11-114)||(16324392-16324495)
chr7 (10-89)||(18006052-18006131)
chr7 (11-114)||(47832194-47832297)
chr7 (381-500)||(22072913-22073033)
chr7 (50-193)||(22073223-22073366)
chr7 (431-496)||(811182-811248)
chr7 (377-500)||(16219715-16219835)
chr7 (431-500)||(16495402-16495472)
chr7 (431-496)||(18005650-18005716)
chr7 (431-496)||(44014182-44014248)
chr7 (431-500)||(47831807-47831877)
chr7 (334-434)||(26355983-26356083)
chr7 (334-434)||(26358435-26358535)
chr7 (279-482)||(1867895-1868098)
chr7 (431-500)||(11996078-11996148)
chr7 (447-500)||(15754955-15755008)
chr7 (160-477)||(15008278-15008597)
chr7 (235-473)||(15211484-15211712)
chr7 (11-186)||(16219348-16219523)
chr7 (322-496)||(17138006-17138177)
chr7 (235-500)||(10063678-10063939)
chr7 (371-451)||(2530130-2530208)
chr7 (21-114)||(9389337-9389430)
chr7 (323-496)||(12187019-12187189)
chr7 (52-110)||(11262691-11262749)
chr7 (411-496)||(19649521-19649606)
chr7 (1-110)||(44407993-44408102)
chr7 (423-482)||(12901341-12901401)
chr7 (431-482)||(14044764-14044816)
chr7 (431-482)||(14354794-14354846)
chr7 (146-185)||(9389462-9389501)
chr7 (51-110)||(14953560-14953619)
chr7 (51-110)||(14959526-14959585)
chr7 (436-482)||(16056346-16056393)
chr7 (1-64)||(19649107-19649170)
chr7 (51-110)||(26420340-26420399)
chr7 (147-185)||(68061-68099)
chr7 (30-84)||(2529628-2529682)
chr7 (317-407)||(15113036-15113125)
chr7 (317-407)||(15116573-15116662)
chr7 (431-481)||(18203831-18203881)
chr7 (439-497)||(26356098-26356156)
chr7 (439-497)||(26358550-26358608)
chr7 (57-110)||(11547957-11548010)
chr7 (57-110)||(11554553-11554606)
chr7 (57-110)||(14148932-14148985)
chr7 (1-114)||(21064784-21064897)
chr7 (437-473)||(9446216-9446252)
chr7 (218-270)||(9751390-9751442)
chr7 (437-473)||(20569654-20569690)
chr7 (57-109)||(20702681-20702733)
chr7 (57-109)||(32768038-32768090)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (4-500)||(22737805-22738300)
chr2 (1-500)||(22730855-22731355)
chr2 (1-500)||(23076442-23076939)
chr2 (1-500)||(23660023-23660521)
chr2 (1-500)||(22337115-22337614)
chr2 (1-500)||(23285865-23286349)
chr2 (1-497)||(298437-298933)
chr2 (1-500)||(23654032-23654507)
chr2 (2-500)||(37750-38235)
chr2 (2-345)||(27753730-27754073)
chr2 (1-500)||(20309108-20309593)
chr2 (195-500)||(23060513-23060815)
chr2 (12-481)||(32451562-32452031)
chr2 (144-500)||(23708383-23708738)
chr2 (334-497)||(22105412-22105575)
chr2 (334-494)||(21155060-21155219)
chr2 (334-497)||(18808943-18809105)
chr2 (334-497)||(23130862-23131024)
chr2 (334-497)||(23133329-23133491)
chr2 (334-497)||(23709532-23709694)
chr2 (334-497)||(23712013-23712175)
chr2 (334-497)||(26505379-26505541)
chr2 (334-497)||(26507857-26508019)
chr2 (334-497)||(34402522-34402684)
chr2 (334-497)||(39682313-39682475)
chr2 (209-500)||(19671830-19672118)
chr2 (334-499)||(32214921-32215085)
chr2 (334-497)||(571397-571559)
chr2 (334-497)||(6725995-6726157)
chr2 (334-497)||(23135590-23135752)
chr2 (334-497)||(24367774-24367936)
chr2 (334-497)||(24898195-24898358)
chr2 (334-497)||(24900678-24900841)
chr2 (334-497)||(24903155-24903318)
chr2 (334-497)||(24905632-24905795)
chr2 (334-497)||(24908107-24908270)
chr2 (334-497)||(32039498-32039660)
chr2 (10-184)||(22133848-22134020)
chr2 (33-185)||(23071617-23071768)
chr2 (334-497)||(28577099-28577261)
chr2 (334-495)||(43137301-43137461)
chr2 (334-497)||(45029854-45030016)
chr2 (381-500)||(23103399-23103516)
chr2 (346-493)||(25616192-25616339)
chr2 (1-104)||(28291924-28292027)
chr2 (46-182)||(28406297-28406433)
chr2 (334-497)||(38967374-38967537)
chr2 (423-500)||(8946657-8946734)
chr2 (334-497)||(24529528-24529691)
chr2 (437-500)||(23040247-23040310)
chr2 (316-473)||(22799063-22799220)
chr2 (374-495)||(28405981-28406103)
chr2 (316-462)||(23019643-23019789)
chr2 (333-481)||(7687-7835)
chr2 (11-184)||(25176158-25176331)
chr2 (431-499)||(22134258-22134326)
chr2 (418-494)||(24643034-24643109)
chr2 (431-496)||(7679589-7679655)
chr2 (164-481)||(20519976-20520295)
chr2 (431-500)||(23072000-23072070)
chr2 (374-496)||(25175854-25175976)
chr2 (411-479)||(23038048-23038116)
chr2 (431-479)||(23287384-23287432)
chr2 (431-479)||(26392403-26392451)
chr2 (293-496)||(40622123-40622327)
chr2 (435-482)||(18786958-18787006)
chr2 (431-481)||(23207296-23207347)
chr2 (317-392)||(22459500-22459575)
chr2 (51-110)||(24503473-24503532)
chr2 (51-109)||(12829434-12829492)
chr2 (334-408)||(24642856-24642930)
chr2 (432-481)||(9241945-9241994)
chr2 (136-185)||(22740719-22740768)
chr2 (411-496)||(22740996-22741081)
chr2 (57-110)||(27197248-27197301)
chr2 (437-473)||(24655396-24655432)
chr2 (437-473)||(24869903-24869939)
chr2 (437-473)||(25961592-25961628)
chr2 (153-185)||(31756232-31756264)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-500)||(51913-52411)
scaffold0011 (1-500)||(167612-168099)
scaffold0011 (432-481)||(38204-38253)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-500)||(3470-3969)
scaffold0292 (9-500)||(343-833)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (1-500)||(1851-2350)
scaffold0016 (21-185)||(207161-207324)
scaffold0016 (218-270)||(207359-207411)
[»] chr5 (103 HSPs)
chr5 (1-500)||(23390118-23390617)
chr5 (1-500)||(25421532-25422031)
chr5 (1-500)||(24493569-24494067)
chr5 (1-497)||(24529223-24529720)
chr5 (1-500)||(25431395-25431893)
chr5 (1-500)||(13095495-13095993)
chr5 (1-500)||(9077952-9078451)
chr5 (1-500)||(13025311-13025809)
chr5 (1-500)||(8286475-8286964)
chr5 (1-500)||(1096467-1096966)
chr5 (1-500)||(22075018-22075507)
chr5 (1-362)||(21985769-21986130)
chr5 (9-500)||(21292611-21293090)
chr5 (12-497)||(36154461-36154942)
chr5 (12-497)||(11580878-11581361)
chr5 (1-363)||(22107006-22107357)
chr5 (50-481)||(22144068-22144500)
chr5 (333-500)||(21808343-21808510)
chr5 (333-500)||(21729018-21729185)
chr5 (1-185)||(21871193-21871377)
chr5 (1-185)||(21875473-21875657)
chr5 (1-185)||(22119815-22119998)
chr5 (334-497)||(264768-264930)
chr5 (334-497)||(39363384-39363546)
chr5 (335-497)||(10732941-10733102)
chr5 (394-500)||(21997549-21997655)
chr5 (12-185)||(22959166-22959339)
chr5 (285-482)||(18418598-18418793)
chr5 (10-181)||(21565863-21566034)
chr5 (285-497)||(22412187-22412388)
chr5 (2-185)||(24766960-24767142)
chr5 (334-497)||(20909012-20909174)
chr5 (334-497)||(29329934-29330096)
chr5 (334-497)||(42245365-42245527)
chr5 (1-185)||(19660459-19660643)
chr5 (334-497)||(29345980-29346142)
chr5 (334-497)||(29348453-29348615)
chr5 (334-497)||(29350926-29351088)
chr5 (334-497)||(39245136-39245298)
chr5 (334-494)||(18319033-18319193)
chr5 (334-482)||(20902008-20902156)
chr5 (334-497)||(2154613-2154776)
chr5 (334-497)||(32027393-32027555)
chr5 (334-497)||(10775675-10775838)
chr5 (10-180)||(19669219-19669390)
chr5 (346-498)||(17517168-17517320)
chr5 (334-497)||(31061068-31061231)
chr5 (369-497)||(38619434-38619562)
chr5 (325-451)||(18356364-18356488)
chr5 (403-497)||(20918017-20918110)
chr5 (411-496)||(26704075-26704160)
chr5 (411-496)||(26973808-26973893)
chr5 (369-496)||(23064512-23064639)
chr5 (293-481)||(37723922-37724108)
chr5 (431-500)||(19660886-19660956)
chr5 (11-184)||(21329127-21329300)
chr5 (431-500)||(21329548-21329618)
chr5 (334-494)||(24067110-24067270)
chr5 (325-451)||(20910745-20910869)
chr5 (382-481)||(20026942-20027043)
chr5 (293-473)||(21873277-21873453)
chr5 (431-496)||(22959583-22959649)
chr5 (285-500)||(40725853-40726069)
chr5 (377-500)||(21502154-21502277)
chr5 (374-496)||(21565546-21565668)
chr5 (435-500)||(36314577-36314643)
chr5 (11-114)||(21498649-21498752)
chr5 (431-479)||(26732884-26732932)
chr5 (322-496)||(22032323-22032492)
chr5 (431-500)||(26012086-26012154)
chr5 (431-500)||(19668898-19668968)
chr5 (443-497)||(20806850-20806904)
chr5 (431-481)||(26740697-26740747)
chr5 (41-185)||(5888837-5888981)
chr5 (322-496)||(18769947-18770118)
chr5 (285-336)||(20766035-20766087)
chr5 (144-193)||(21501919-21501968)
chr5 (432-481)||(23469822-23469871)
chr5 (146-186)||(20026706-20026746)
chr5 (323-473)||(23572107-23572254)
chr5 (57-109)||(41294124-41294176)
chr5 (374-425)||(20766115-20766166)
chr5 (1-44)||(20910434-20910477)
chr5 (51-110)||(21294947-21295006)
chr5 (411-474)||(23201382-23201445)
chr5 (51-109)||(15441638-15441696)
chr5 (30-108)||(20026514-20026592)
chr5 (51-109)||(25406789-25406847)
chr5 (52-110)||(25535351-25535409)
chr5 (147-185)||(25744036-25744074)
chr5 (205-263)||(26740472-26740530)
chr5 (432-473)||(20805575-20805616)
chr5 (432-481)||(21328268-21328317)
chr5 (432-477)||(21731514-21731559)
chr5 (144-181)||(21741308-21741345)
chr5 (432-477)||(21809634-21809679)
chr5 (51-108)||(22588459-22588516)
chr5 (52-109)||(23336973-23337030)
chr5 (57-109)||(17284430-17284482)
chr5 (433-473)||(20766997-20767037)
chr5 (218-270)||(22120033-22120085)
chr5 (437-473)||(26680605-26680641)
chr5 (437-473)||(26952212-26952248)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-500)||(38761-39258)
scaffold0145 (283-500)||(32942-33158)
scaffold0145 (334-502)||(9744-9912)
[»] chr3 (140 HSPs)
chr3 (1-500)||(26686887-26687386)
chr3 (1-500)||(17487856-17488356)
chr3 (1-500)||(18438534-18439033)
chr3 (49-500)||(13442274-13442725)
chr3 (5-500)||(17499338-17499834)
chr3 (1-500)||(25476007-25476506)
chr3 (1-496)||(14576455-14576949)
chr3 (1-500)||(11424385-11424880)
chr3 (1-497)||(40213343-40213838)
chr3 (1-500)||(14972854-14973353)
chr3 (1-500)||(20698069-20698556)
chr3 (1-500)||(23082983-23083482)
chr3 (1-487)||(14572602-14573087)
chr3 (102-500)||(43840932-43841330)
chr3 (1-500)||(12399209-12399694)
chr3 (1-482)||(30029858-30030327)
chr3 (144-483)||(42386427-42386767)
chr3 (1-481)||(53070321-53070799)
chr3 (6-261)||(17247913-17248168)
chr3 (285-497)||(24153115-24153326)
chr3 (171-362)||(16796685-16796875)
chr3 (1-185)||(12340068-12340251)
chr3 (334-497)||(29172583-29172745)
chr3 (1-185)||(14669076-14669259)
chr3 (334-497)||(7781347-7781509)
chr3 (334-497)||(9707607-9707769)
chr3 (334-497)||(17463178-17463340)
chr3 (334-497)||(17672626-17672788)
chr3 (334-497)||(34159326-34159488)
chr3 (334-497)||(45606907-45607069)
chr3 (334-497)||(55476491-55476653)
chr3 (50-481)||(52523398-52523831)
chr3 (1-185)||(12851986-12852169)
chr3 (10-185)||(16097645-16097820)
chr3 (334-497)||(8899094-8899256)
chr3 (334-497)||(16454281-16454443)
chr3 (235-500)||(24340578-24340844)
chr3 (334-497)||(28848611-28848773)
chr3 (334-497)||(38961891-38962053)
chr3 (10-186)||(12933941-12934117)
chr3 (1-185)||(14665921-14666104)
chr3 (1-185)||(14735434-14735617)
chr3 (209-500)||(23274687-23274979)
chr3 (10-186)||(32307983-32308158)
chr3 (1-106)||(43842572-43842677)
chr3 (334-497)||(13151790-13151953)
chr3 (334-497)||(13154255-13154418)
chr3 (334-498)||(13544024-13544187)
chr3 (1-117)||(14179705-14179821)
chr3 (334-497)||(6469134-6469296)
chr3 (334-497)||(10247723-10247885)
chr3 (334-493)||(12567564-12567722)
chr3 (334-497)||(17446655-17446816)
chr3 (334-497)||(50242822-50242984)
chr3 (1-185)||(13209950-13210133)
chr3 (334-495)||(16282811-16282971)
chr3 (334-500)||(43550478-43550644)
chr3 (10-182)||(49389275-49389446)
chr3 (10-186)||(49667715-49667890)
chr3 (334-495)||(41123892-41124049)
chr3 (383-497)||(55500942-55501055)
chr3 (294-497)||(12119684-12119887)
chr3 (346-498)||(46822267-46822419)
chr3 (26-181)||(9513228-9513384)
chr3 (26-181)||(9521203-9521359)
chr3 (366-497)||(15977515-15977645)
chr3 (374-497)||(36166598-36166719)
chr3 (284-362)||(14179570-14179648)
chr3 (1-95)||(17247142-17247236)
chr3 (10-186)||(1644314-1644489)
chr3 (369-497)||(15412429-15412557)
chr3 (30-407)||(2050852-2051227)
chr3 (21-117)||(4588457-4588553)
chr3 (322-498)||(12511059-12511236)
chr3 (318-497)||(8499518-8499697)
chr3 (318-497)||(27165250-27165429)
chr3 (12-117)||(16104163-16104268)
chr3 (285-500)||(37642170-37642386)
chr3 (400-497)||(44494809-44494905)
chr3 (1-114)||(16809775-16809884)
chr3 (374-482)||(21618464-21618570)
chr3 (394-497)||(10556985-10557087)
chr3 (12-89)||(12171750-12171827)
chr3 (400-497)||(17737236-17737335)
chr3 (431-496)||(12174310-12174376)
chr3 (431-500)||(13210378-13210448)
chr3 (381-500)||(15470927-15471043)
chr3 (377-500)||(14234487-14234610)
chr3 (30-263)||(324471-324705)
chr3 (431-493)||(32307684-32307747)
chr3 (356-497)||(53301527-53301669)
chr3 (431-496)||(16103784-16103850)
chr3 (436-497)||(28194693-28194755)
chr3 (431-496)||(49668127-49668193)
chr3 (444-497)||(45577947-45578000)
chr3 (433-496)||(16097332-16097396)
chr3 (431-496)||(9512924-9512990)
chr3 (431-496)||(9520899-9520965)
chr3 (11-182)||(14234809-14234979)
chr3 (11-114)||(15471310-15471413)
chr3 (411-496)||(15878083-15878168)
chr3 (285-500)||(22147431-22147646)
chr3 (420-496)||(856140-856216)
chr3 (435-479)||(13919350-13919394)
chr3 (431-481)||(22110403-22110454)
chr3 (431-481)||(43925977-43926028)
chr3 (431-493)||(1644725-1644787)
chr3 (224-266)||(12339985-12340027)
chr3 (411-473)||(23077509-23077571)
chr3 (1-110)||(839609-839718)
chr3 (29-185)||(1465059-1465215)
chr3 (1-82)||(15877451-15877532)
chr3 (30-111)||(22109926-22110007)
chr3 (285-340)||(21618594-21618650)
chr3 (285-336)||(36166747-36166799)
chr3 (381-481)||(37251168-37251270)
chr3 (51-110)||(24188140-24188199)
chr3 (51-110)||(55149341-55149400)
chr3 (432-481)||(606378-606428)
chr3 (433-479)||(9577646-9577691)
chr3 (30-84)||(14501615-14501669)
chr3 (437-499)||(14665398-14665460)
chr3 (411-473)||(14878548-14878610)
chr3 (411-473)||(15051531-15051593)
chr3 (411-473)||(15060307-15060369)
chr3 (30-108)||(23275133-23275211)
chr3 (30-115)||(605942-606027)
chr3 (432-473)||(11298580-11298621)
chr3 (12-61)||(11852006-11852055)
chr3 (432-481)||(15246037-15246086)
chr3 (145-186)||(37250932-37250973)
chr3 (437-473)||(3389994-3390030)
chr3 (218-270)||(4588628-4588680)
chr3 (144-184)||(12171869-12171909)
chr3 (57-109)||(15691967-15692019)
chr3 (145-185)||(22110116-22110156)
chr3 (57-109)||(23704458-23704510)
chr3 (57-109)||(23722914-23722966)
chr3 (57-109)||(23741370-23741422)
chr3 (57-109)||(41201487-41201539)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (1-497)||(34509783-34510279)
chr1 (1-500)||(22532269-22532768)
chr1 (1-499)||(50209836-50210333)
chr1 (1-500)||(27250362-27250850)
chr1 (1-423)||(22354194-22354616)
chr1 (1-500)||(21026680-21027168)
chr1 (1-499)||(20135188-20135686)
chr1 (4-389)||(22355810-22356185)
chr1 (4-389)||(22357496-22357871)
chr1 (1-497)||(433012-433506)
chr1 (1-500)||(38801024-38801508)
chr1 (1-320)||(20846852-20847161)
chr1 (258-499)||(22468576-22468816)
chr1 (1-185)||(20918917-20919100)
chr1 (318-497)||(23593719-23593897)
chr1 (334-497)||(13988866-13989028)
chr1 (334-497)||(21923291-21923453)
chr1 (334-500)||(45574842-45575008)
chr1 (334-497)||(21475087-21475249)
chr1 (334-497)||(31612313-31612475)
chr1 (209-497)||(21346961-21347249)
chr1 (209-503)||(21342090-21342384)
chr1 (334-498)||(21840766-21840929)
chr1 (10-193)||(33681316-33681499)
chr1 (334-497)||(29298137-29298298)
chr1 (334-497)||(29776688-29776850)
chr1 (334-497)||(16275363-16275526)
chr1 (10-184)||(52927612-52927786)
chr1 (209-482)||(16758667-16758942)
chr1 (318-499)||(16361915-16362095)
chr1 (10-186)||(21754350-21754525)
chr1 (20-185)||(20248592-20248757)
chr1 (410-500)||(20847185-20847275)
chr1 (316-473)||(21787979-21788136)
chr1 (1-86)||(21301160-21301245)
chr1 (294-500)||(13212821-13213027)
chr1 (160-481)||(35260860-35261180)
chr1 (334-503)||(15860008-15860177)
chr1 (284-362)||(48603652-48603730)
chr1 (318-481)||(21896195-21896358)
chr1 (334-497)||(22123067-22123230)
chr1 (12-184)||(22237946-22238117)
chr1 (319-481)||(21861510-21861672)
chr1 (334-497)||(21707167-21707329)
chr1 (334-497)||(21711709-21711871)
chr1 (1-185)||(20091096-20091281)
chr1 (432-499)||(20454606-20454673)
chr1 (1-111)||(21162117-21162227)
chr1 (11-184)||(22921499-22921672)
chr1 (411-496)||(21714546-21714631)
chr1 (334-494)||(40389157-40389317)
chr1 (325-451)||(33797570-33797694)
chr1 (11-114)||(43697746-43697849)
chr1 (374-500)||(33681010-33681133)
chr1 (431-493)||(21754052-21754115)
chr1 (374-496)||(22921864-22921986)
chr1 (435-500)||(14295606-14295672)
chr1 (374-500)||(22237630-22237753)
chr1 (431-482)||(20918622-20918674)
chr1 (431-496)||(20248283-20248349)
chr1 (431-482)||(52928021-52928073)
chr1 (145-263)||(26065176-26065295)
chr1 (431-481)||(50614168-50614219)
chr1 (431-481)||(50621996-50622047)
chr1 (432-481)||(16368338-16368388)
chr1 (30-112)||(21895883-21895965)
chr1 (144-185)||(20637165-20637206)
chr1 (411-496)||(42865245-42865330)
chr1 (29-185)||(28194098-28194254)
chr1 (51-110)||(20524899-20524958)
chr1 (51-110)||(21438157-21438216)
chr1 (51-110)||(23763574-23763633)
chr1 (431-481)||(41050087-41050138)
chr1 (51-109)||(19063884-19063942)
chr1 (51-109)||(19111774-19111832)
chr1 (431-481)||(21533924-21533974)
chr1 (30-112)||(21861145-21861227)
chr1 (209-263)||(27653052-27653106)
chr1 (50-112)||(35981357-35981419)
chr1 (144-185)||(35981451-35981492)
chr1 (210-263)||(52940708-52940761)
chr1 (430-481)||(50686630-50686682)
[»] chr4 (109 HSPs)
chr4 (1-498)||(22636437-22636933)
chr4 (1-500)||(44052829-44053328)
chr4 (1-500)||(12902757-12903244)
chr4 (1-495)||(14038653-14039148)
chr4 (6-497)||(16377149-16377639)
chr4 (1-500)||(7088877-7089365)
chr4 (1-500)||(16239614-16240090)
chr4 (140-500)||(7893703-7894060)
chr4 (1-497)||(44928545-44929042)
chr4 (1-500)||(14052936-14053422)
chr4 (144-493)||(23374125-23374473)
chr4 (1-385)||(3096759-3097131)
chr4 (1-303)||(15091093-15091396)
chr4 (12-497)||(44102214-44102697)
chr4 (283-500)||(16270140-16270356)
chr4 (1-244)||(7798953-7799196)
chr4 (21-362)||(17047726-17048055)
chr4 (316-500)||(7798774-7798958)
chr4 (12-481)||(21815265-21815731)
chr4 (328-500)||(6899891-6900062)
chr4 (1-185)||(15552129-15552312)
chr4 (375-500)||(52873363-52873488)
chr4 (57-482)||(52242871-52243299)
chr4 (1-185)||(24029057-24029240)
chr4 (260-500)||(17046487-17046724)
chr4 (1-185)||(13812431-13812614)
chr4 (334-497)||(18215274-18215436)
chr4 (1-185)||(20156912-20157095)
chr4 (334-497)||(12307-12469)
chr4 (318-497)||(1837494-1837671)
chr4 (334-497)||(15118352-15118514)
chr4 (334-497)||(23803265-23803427)
chr4 (334-497)||(52312510-52312672)
chr4 (12-126)||(6190807-6190921)
chr4 (334-503)||(19242693-19242861)
chr4 (1-185)||(22633835-22634018)
chr4 (285-497)||(54798669-54798872)
chr4 (334-497)||(3515007-3515169)
chr4 (235-500)||(15371202-15371467)
chr4 (235-500)||(15373483-15373748)
chr4 (334-497)||(44615288-44615450)
chr4 (334-497)||(44773087-44773249)
chr4 (334-497)||(50222339-50222501)
chr4 (334-497)||(51463868-51464030)
chr4 (334-499)||(19618172-19618336)
chr4 (12-250)||(21814936-21815173)
chr4 (12-250)||(21818358-21818595)
chr4 (235-500)||(16223532-16223797)
chr4 (1-183)||(16596963-16597144)
chr4 (334-497)||(18239419-18239581)
chr4 (179-481)||(6190481-6190782)
chr4 (285-497)||(14280316-14280518)
chr4 (285-500)||(15367690-15367905)
chr4 (285-500)||(15402703-15402918)
chr4 (10-185)||(8846689-8846865)
chr4 (334-493)||(15355324-15355483)
chr4 (414-500)||(3096293-3096379)
chr4 (334-497)||(12610950-12611105)
chr4 (10-186)||(12774313-12774488)
chr4 (334-499)||(14970707-14970871)
chr4 (285-500)||(15370018-15370232)
chr4 (318-481)||(13790-13953)
chr4 (334-498)||(22353835-22353999)
chr4 (334-497)||(7641192-7641344)
chr4 (30-425)||(15464580-15464977)
chr4 (374-497)||(8574864-8574985)
chr4 (11-114)||(39705920-39706023)
chr4 (431-500)||(15551817-15551887)
chr4 (318-482)||(43198492-43198658)
chr4 (325-451)||(43256106-43256230)
chr4 (431-496)||(12774011-12774077)
chr4 (431-500)||(39706339-39706409)
chr4 (334-494)||(20149832-20149992)
chr4 (316-473)||(15093798-15093955)
chr4 (29-185)||(15099665-15099821)
chr4 (431-482)||(12288261-12288313)
chr4 (51-98)||(17046718-17046765)
chr4 (431-496)||(8846360-8846426)
chr4 (11-89)||(13844950-13845028)
chr4 (30-114)||(43198239-43198323)
chr4 (30-112)||(15868286-15868368)
chr4 (98-185)||(3332201-3332287)
chr4 (51-110)||(14685534-14685593)
chr4 (323-496)||(15121747-15121917)
chr4 (1-110)||(14679325-14679434)
chr4 (29-114)||(15190703-15190788)
chr4 (416-473)||(16348700-16348757)
chr4 (416-473)||(16356988-16357045)
chr4 (285-336)||(8574784-8574836)
chr4 (431-479)||(17333298-17333346)
chr4 (51-110)||(23838796-23838855)
chr4 (431-481)||(46640507-46640558)
chr4 (431-481)||(53082203-53082254)
chr4 (30-112)||(13424-13506)
chr4 (51-109)||(386038-386096)
chr4 (51-109)||(7900855-7900913)
chr4 (51-109)||(15321778-15321836)
chr4 (51-109)||(51493502-51493560)
chr4 (30-83)||(32851868-32851921)
chr4 (57-110)||(35170991-35171044)
chr4 (57-110)||(40471837-40471890)
chr4 (437-473)||(11250619-11250655)
chr4 (153-185)||(15190632-15190664)
chr4 (437-473)||(15353365-15353401)
chr4 (218-270)||(20157130-20157182)
chr4 (218-270)||(24028970-24029022)
chr4 (57-109)||(26284598-26284650)
chr4 (144-184)||(39706052-39706092)
chr4 (57-109)||(40478511-40478563)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-500)||(8155-8650)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (12-497)||(22886-23370)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-500)||(39913-40410)
scaffold0080 (381-481)||(19885-19987)
scaffold0080 (398-473)||(18674-18749)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-500)||(13211-13699)
[»] chr6 (107 HSPs)
chr6 (15-500)||(29060540-29061025)
chr6 (1-500)||(17287418-17287917)
chr6 (1-500)||(22779849-22780348)
chr6 (9-500)||(20360601-20361081)
chr6 (1-500)||(20637916-20638404)
chr6 (1-499)||(18409449-18409947)
chr6 (1-500)||(19303163-19303661)
chr6 (1-500)||(20593773-20594272)
chr6 (7-500)||(25628983-25629476)
chr6 (1-500)||(16920266-16920751)
chr6 (12-481)||(18456735-18457202)
chr6 (1-500)||(22831503-22831990)
chr6 (12-291)||(18821463-18821731)
chr6 (1-186)||(29808505-29808691)
chr6 (1-186)||(28496095-28496280)
chr6 (1-473)||(25603007-25603478)
chr6 (333-500)||(16496244-16496411)
chr6 (3-473)||(25611347-25611816)
chr6 (11-482)||(25644338-25644811)
chr6 (1-481)||(11185524-11185990)
chr6 (333-500)||(20076700-20076863)
chr6 (1-185)||(21939699-21939882)
chr6 (10-183)||(19652512-19652685)
chr6 (334-497)||(12742317-12742479)
chr6 (334-497)||(18334592-18334754)
chr6 (334-497)||(19005046-19005208)
chr6 (334-497)||(19858919-19859081)
chr6 (334-497)||(22782227-22782389)
chr6 (334-497)||(24422547-24422709)
chr6 (334-497)||(25754809-25754971)
chr6 (334-497)||(33861794-33861956)
chr6 (334-497)||(33864278-33864440)
chr6 (325-500)||(35245586-35245758)
chr6 (334-499)||(30676710-30676874)
chr6 (334-497)||(1595549-1595711)
chr6 (334-497)||(2291180-2291342)
chr6 (334-497)||(8055029-8055191)
chr6 (334-497)||(26924640-26924802)
chr6 (1-181)||(1561622-1561802)
chr6 (1-185)||(4667835-4668019)
chr6 (334-499)||(34963371-34963535)
chr6 (258-473)||(15041430-15041644)
chr6 (334-497)||(25656629-25656791)
chr6 (1-185)||(4185445-4185629)
chr6 (334-497)||(1540911-1541073)
chr6 (354-497)||(25688502-25688644)
chr6 (1-185)||(4189271-4189455)
chr6 (1-185)||(4674682-4674866)
chr6 (334-494)||(16448526-16448686)
chr6 (334-497)||(3852017-3852179)
chr6 (351-481)||(18461895-18462024)
chr6 (11-184)||(27332916-27333089)
chr6 (11-184)||(27393656-27393829)
chr6 (1-185)||(15894052-15894237)
chr6 (334-498)||(19847949-19848114)
chr6 (334-497)||(20556894-20557054)
chr6 (235-500)||(8227366-8227632)
chr6 (318-500)||(20109140-20109322)
chr6 (1-115)||(22334504-22334618)
chr6 (346-498)||(23992429-23992578)
chr6 (1-118)||(31155020-31155137)
chr6 (431-500)||(27333269-27333339)
chr6 (431-500)||(27394009-27394079)
chr6 (439-500)||(25714417-25714478)
chr6 (316-481)||(18821782-18821946)
chr6 (249-318)||(5834367-5834436)
chr6 (249-318)||(20177096-20177165)
chr6 (249-318)||(22158826-22158895)
chr6 (30-186)||(23019721-23019877)
chr6 (325-451)||(27415887-27416011)
chr6 (431-500)||(28496522-28496592)
chr6 (431-500)||(29808933-29809003)
chr6 (431-496)||(19652199-19652265)
chr6 (447-500)||(1561303-1561356)
chr6 (411-496)||(19873120-19873205)
chr6 (411-496)||(22432249-22432334)
chr6 (411-496)||(22438799-22438884)
chr6 (431-482)||(9098565-9098617)
chr6 (10-185)||(22080368-22080543)
chr6 (431-479)||(33443068-33443116)
chr6 (11-182)||(25956253-25956424)
chr6 (411-496)||(19862978-19863063)
chr6 (1-110)||(31164480-31164589)
chr6 (436-482)||(19668389-19668436)
chr6 (453-500)||(22080799-22080846)
chr6 (431-488)||(4185872-4185930)
chr6 (380-473)||(18907134-18907226)
chr6 (432-473)||(21766718-21766759)
chr6 (381-481)||(23019425-23019525)
chr6 (1-69)||(22439230-22439298)
chr6 (258-338)||(31164727-31164807)
chr6 (51-110)||(22331803-22331862)
chr6 (431-481)||(23076749-23076800)
chr6 (1-44)||(27415576-27415619)
chr6 (431-481)||(35008167-35008218)
chr6 (51-109)||(1538628-1538686)
chr6 (51-109)||(1544727-1544785)
chr6 (52-109)||(16372223-16372280)
chr6 (432-477)||(16493169-16493214)
chr6 (432-481)||(18453201-18453250)
chr6 (136-185)||(25641942-25641991)
chr6 (411-496)||(25642219-25642304)
chr6 (258-330)||(16924759-16924830)
chr6 (145-185)||(19668688-19668728)
chr6 (437-473)||(19790837-19790873)
chr6 (30-110)||(20109605-20109685)
chr6 (56-96)||(31316781-31316821)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-482)||(23924-24406)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-500)||(8479-8974)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-493)||(25687-26179)
scaffold0122 (1-363)||(33116-33479)
scaffold0122 (374-497)||(44702-44825)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-500)||(5743-6245)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (1-448)||(13144-13591)
scaffold0175 (1-184)||(34437-34619)
scaffold0175 (425-500)||(34123-34199)
scaffold0175 (444-500)||(273-329)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (1-499)||(16837-17337)
scaffold0056 (159-481)||(79109-79430)
scaffold0056 (1-113)||(78984-79096)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (1-500)||(39858-40355)
scaffold0026 (182-500)||(25896-26213)
scaffold0026 (1-126)||(39553-39678)
scaffold0026 (63-170)||(26555-26662)
scaffold0026 (57-185)||(59181-59308)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (1-497)||(339573-340065)
scaffold0003 (334-497)||(158450-158612)
scaffold0003 (325-451)||(71350-71474)
scaffold0003 (1-44)||(71742-71785)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-500)||(4508-5007)
scaffold0228 (1-500)||(12090-12589)
scaffold0228 (1-500)||(22042-22541)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-500)||(682-1169)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (7-500)||(16227-16721)
[»] scaffold0021 (7 HSPs)
scaffold0021 (1-408)||(124677-125081)
scaffold0021 (10-126)||(62935-63051)
scaffold0021 (431-500)||(121766-121835)
scaffold0021 (322-499)||(174767-174943)
scaffold0021 (1-62)||(175202-175263)
scaffold0021 (145-186)||(136132-136173)
scaffold0021 (145-186)||(144840-144881)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-500)||(4849-5336)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-500)||(4712-5200)
scaffold0358 (1-435)||(1-424)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (112-498)||(39479-39864)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (112-498)||(74948-75333)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-500)||(13497-13983)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-500)||(10059-10544)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (1-500)||(15098-15584)
scaffold0114 (1-71)||(32898-32968)
scaffold0114 (323-496)||(7295-7465)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-500)||(32067-32552)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-500)||(1952-2440)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-500)||(20910-21389)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (1-500)||(32581-33077)
scaffold0120 (1-500)||(45928-46424)
scaffold0120 (1-264)||(16323-16585)
scaffold0120 (289-500)||(16113-16323)
scaffold0120 (439-500)||(17389-17450)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-500)||(685-1170)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (1-423)||(584-1006)
scaffold0395 (434-500)||(4888-4954)
scaffold0395 (1-114)||(8114-8227)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-479)||(4545-5022)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (213-500)||(2985-3271)
scaffold0540 (9-201)||(643-835)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-500)||(16282-16767)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-308)||(20595-20902)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (12-481)||(51517-51985)
scaffold0034 (30-251)||(32784-33006)
scaffold0034 (393-500)||(32538-32643)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-441)||(6669-7098)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-497)||(4764-5246)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-500)||(46995-47474)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (107-419)||(27911-28223)
scaffold0130 (1-112)||(28924-29035)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-500)||(1289-1774)
scaffold0106 (1-500)||(7266-7751)
scaffold0106 (432-497)||(15291-15356)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-340)||(10323-10657)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (12-497)||(16784-17268)
scaffold0142 (79-185)||(7471-7576)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-500)||(51582-52067)
scaffold0032 (10-98)||(108967-109055)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (21-362)||(1052-1382)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (1-481)||(20048-20524)
scaffold0031 (333-500)||(128751-128917)
scaffold0031 (411-472)||(65830-65891)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-241)||(163-403)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-321)||(17630-17929)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (21-341)||(3640-3949)
scaffold0165 (21-341)||(7704-8013)
scaffold0165 (294-482)||(27663-27852)
scaffold0165 (30-112)||(27293-27375)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (26-316)||(11171-11450)
scaffold0235 (378-500)||(11442-11564)
scaffold0235 (30-84)||(14055-14109)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (296-499)||(3103-3306)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (1-249)||(1700-1947)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (1-264)||(15237-15500)
scaffold0413 (318-481)||(12587-12749)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (1-186)||(20426-20611)
scaffold0100 (431-500)||(23934-24001)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (362-500)||(28414-28552)
scaffold0046 (431-500)||(11292-11362)
scaffold0046 (431-500)||(1997-2067)
scaffold0046 (447-500)||(4552-4605)
scaffold0046 (1-63)||(14914-14976)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-126)||(18580-18705)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (12-264)||(12165-12416)
scaffold0503 (439-481)||(11982-12024)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (274-437)||(3424-3588)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-120)||(2707-2826)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (1-182)||(12431-12611)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (1-185)||(344-526)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (1-185)||(7916-8099)
scaffold0075 (318-481)||(53488-53651)
scaffold0075 (30-112)||(53122-53204)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (1-185)||(79954-80137)
scaffold0037 (334-497)||(82072-82234)
scaffold0037 (374-482)||(22665-22773)
[»] scaffold0556 (3 HSPs)
scaffold0556 (10-185)||(7126-7301)
scaffold0556 (431-481)||(6831-6882)
scaffold0556 (30-186)||(8330-8486)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-185)||(2067-2250)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (10-186)||(132967-133143)
scaffold0028 (334-497)||(136680-136842)
scaffold0028 (334-497)||(139149-139311)
scaffold0028 (334-497)||(144087-144249)
scaffold0028 (334-497)||(134211-134373)
scaffold0028 (334-497)||(141618-141780)
scaffold0028 (431-498)||(62200-62268)
scaffold0028 (437-496)||(132662-132722)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (334-497)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (334-497)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (10 HSPs)
scaffold0023 (334-497)||(94411-94573)
scaffold0023 (334-493)||(17440-17598)
scaffold0023 (337-497)||(44454-44614)
scaffold0023 (10-186)||(101709-101884)
scaffold0023 (367-496)||(100378-100507)
scaffold0023 (293-473)||(38394-38573)
scaffold0023 (431-500)||(119875-119945)
scaffold0023 (431-496)||(40225-40291)
scaffold0023 (431-496)||(101503-101569)
scaffold0023 (293-408)||(23581-23695)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-185)||(10226-10409)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (2-185)||(9457-9639)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (334-497)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (334-497)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (334-497)||(13947-14109)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (1-111)||(13230-13340)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (1-185)||(9391-9575)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (1-185)||(15974-16157)
scaffold0261 (424-497)||(15664-15738)
scaffold0261 (411-496)||(1339-1424)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-181)||(28902-29081)
scaffold0218 (424-482)||(8118-8177)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (10-186)||(32397-32573)
scaffold0150 (447-496)||(32102-32151)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (334-499)||(11286-11450)
scaffold0029 (323-473)||(12786-12933)
scaffold0029 (51-109)||(125797-125855)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (334-494)||(4300-4459)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (334-498)||(10772-10935)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (209-481)||(13147-13421)
scaffold0357 (147-482)||(15866-16203)
scaffold0357 (431-481)||(2680-2731)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (334-493)||(501088-501246)
scaffold0001 (12-185)||(161000-161173)
scaffold0001 (294-497)||(85539-85742)
scaffold0001 (431-496)||(160688-160754)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-185)||(24272-24456)
scaffold0124 (318-500)||(38195-38377)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (10-186)||(28440-28616)
scaffold0211 (431-496)||(28820-28887)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (10-193)||(437-620)
scaffold1984 (374-496)||(133-255)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (334-497)||(106-268)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (235-500)||(17882-18148)
scaffold0247 (5-108)||(6454-6557)
scaffold0247 (294-497)||(2088-2291)
scaffold0247 (145-201)||(6561-6617)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-104)||(10540-10643)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (334-497)||(40400-40562)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (145-481)||(60479-60818)
scaffold0010 (10-185)||(130222-130397)
scaffold0010 (374-488)||(129917-130031)
scaffold0010 (433-481)||(666-714)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (10-186)||(2434-2609)
scaffold0628 (374-496)||(2801-2923)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (334-499)||(12249-12413)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (318-482)||(8484-8650)
scaffold0621 (374-500)||(6535-6661)
scaffold0621 (10-114)||(6923-7026)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (334-498)||(9241-9404)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (10-185)||(45420-45596)
scaffold0125 (431-496)||(45843-45909)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (10-193)||(19573-19756)
scaffold0102 (374-496)||(19268-19390)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (334-497)||(4214-4377)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (334-482)||(29947-30094)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (209-425)||(225482-225698)
scaffold0012 (50-114)||(227878-227942)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (294-497)||(161049-161252)
scaffold0007 (294-417)||(164550-164674)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (334-497)||(12064-12220)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (12-114)||(3318-3420)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (11-185)||(15462-15636)
scaffold0020 (431-500)||(15828-15898)
scaffold0020 (433-496)||(178898-178961)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (12-113)||(2277-2378)
scaffold0207 (431-496)||(2696-2762)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (334-494)||(1280-1440)
scaffold0101 (411-496)||(8995-9080)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (12-186)||(1934-2108)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (318-500)||(11464-11646)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (374-497)||(116430-116551)
scaffold0022 (431-481)||(129022-129072)
scaffold0022 (432-477)||(78345-78391)
scaffold0022 (50-112)||(80726-80788)
scaffold0022 (285-336)||(116579-116631)
scaffold0022 (145-185)||(128735-128775)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (335-496)||(29558-29720)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (10-114)||(5979-6083)
scaffold0278 (374-488)||(5655-5769)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (293-474)||(26850-27027)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (325-451)||(15362-15486)
scaffold0107 (1-55)||(15052-15106)
scaffold0107 (432-481)||(36199-36248)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (318-497)||(38641-38820)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (374-496)||(14692-14814)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (318-479)||(7998-8161)
scaffold0507 (30-186)||(7708-7864)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (411-496)||(23843-23928)
scaffold0198 (293-363)||(23979-24048)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (293-473)||(16264-16442)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (374-481)||(1051-1158)
[»] scaffold0333 (4 HSPs)
scaffold0333 (11-182)||(6931-7102)
scaffold0333 (11-182)||(14311-14482)
scaffold0333 (431-500)||(6611-6681)
scaffold0333 (431-500)||(13991-14061)
[»] scaffold0138 (4 HSPs)
scaffold0138 (11-185)||(13255-13429)
scaffold0138 (377-500)||(12942-13062)
scaffold0138 (1-110)||(29841-29950)
scaffold0138 (1-110)||(41837-41946)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (431-500)||(6174-6244)
scaffold0243 (29-109)||(5772-5852)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (331-473)||(29117-29262)
[»] scaffold0555 (4 HSPs)
scaffold0555 (1-117)||(962-1078)
scaffold0555 (374-482)||(10536-10644)
scaffold0555 (11-89)||(10200-10278)
scaffold0555 (144-186)||(10305-10347)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (1-77)||(10894-10970)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (435-500)||(1089-1155)
scaffold0530 (29-106)||(678-755)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (431-500)||(1120-1190)
scaffold0184 (437-473)||(4284-4320)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (316-473)||(4741-4898)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (30-186)||(10842-10998)
scaffold0078 (381-482)||(10545-10646)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (33-185)||(43438-43590)
scaffold0116 (33-114)||(47358-47439)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (1-55)||(1078-1132)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (431-496)||(1086-1152)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (293-496)||(21721-21920)
scaffold0210 (293-496)||(29613-29812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (221-482)||(25124-25385)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (329-496)||(1881-2045)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (411-496)||(36454-36539)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (411-496)||(69794-69879)
scaffold0004 (51-110)||(58102-58161)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (433-500)||(12766-12834)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (30-114)||(12381-12465)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (411-496)||(19980-20065)
scaffold0139 (381-477)||(38339-38437)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (424-496)||(10567-10639)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (431-479)||(206576-206624)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (9-108)||(2245-2344)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (432-481)||(569-619)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (416-473)||(44104-44161)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (321-357)||(1169-1205)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (431-481)||(6335-6386)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (371-473)||(192968-193070)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (51-109)||(3560-3618)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-55)||(17346-17400)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (30-84)||(586-640)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (51-109)||(10541-10599)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (51-109)||(14224-14282)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (435-473)||(4999-5037)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (51-109)||(27006-27064)
scaffold0109 (30-84)||(35521-35575)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (209-263)||(24427-24481)
scaffold0076 (30-114)||(24171-24255)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (51-109)||(9704-9762)
scaffold0013 (433-481)||(30350-30398)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (57-110)||(17422-17475)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (432-481)||(7450-7499)
scaffold0111 (432-481)||(14569-14618)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (416-473)||(1853-1910)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (411-496)||(18236-18321)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (437-473)||(7328-7364)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-109)||(8511-8619)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (433-481)||(3276-3324)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (57-109)||(307460-307512)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 95)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20536707 - 20536208
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536707 gagcatgcaagattttgtgattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtaggatga 20536608  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536607 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 20536508  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20536507 agtgacttattaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgt 20536409  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536408 gaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 20536309  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20536308 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 18818032 - 18818530
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18818032 gagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatga 18818131  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818132 gattgaacctggaaagattgtaaaatgaaacttttggtttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 18818231  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18818232 gtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 18818330  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| || ||||    
T  18818331 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaat 18818430  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18818431 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22627234 - 22626736
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627234 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 22627135  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22627134 gattgaacctcgaaagattgtagaat-gaacctttggaaatctgacccgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaacag 22627036  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22627035 agtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgt 22626936  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| |     
T  22626935 gaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtat 22626836  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22626835 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23406880 - 23406379
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406880 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 23406781  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406780 gattggacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 23406681  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23406680 agtgccttgttaggtttt-gtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgt 23406582  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg--ttgatgaattgc 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   || ||| ||||    
T  23406581 gaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgc 23406482  T
Q  398 aattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23406481 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23406382  T
Q  498 tgt 500  Q
    |||    
T  23406381 tgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 18878859 - 18879352
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878859 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 18878958  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878959 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaagacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 18879058  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18879059 agtgccttgtta-gattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgt 18879157  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879158 gaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 18879256  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18879257 ttgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18879351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Original strand, 28648666 - 28649164
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28648666 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatga 28648765  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatct-gacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  28648766 gattgaacatggaaagatt-tagaatgaaaccttttgaattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaacag 28648864  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28648865 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgt 28648964  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||   || ||| ||||||||||| ||| |||||     
T  28648965 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcat 28649064  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28649065 ttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 21923550 - 21924049
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21923550 gagcatgtgagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtaggatga 21923649  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacc-tgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 198  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923650 gattgaacctgaaaagatt-tagaatgaaactttttggattctgaccctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 21923748  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923749 gagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctg 21923847  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21923848 tgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgca 21923947  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21923948 attgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 21924047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6759756 - 6759255
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6759756 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 6759657  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759656 gattgaacttggaaatattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 6759557  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759556 agtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 6759457  T
Q  300 gaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||  ||| ||| || ||||||   ||| |||||    
T  6759456 gaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgt---tgacttgca 6759360  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6759359 tttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 6759260  T
Q  499 gtcca 503  Q
    |||||    
T  6759259 gtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23649052 - 23648554
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23649052 gagcatgcaagatttcatgtttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 23648953  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaac-ttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 198  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23648952 gattggacctgaaaagact-tagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgatcagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaaca 23648855  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23648854 gagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctg 23648755  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| || ||||||    
T  23648754 ttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgca 23648655  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  23648654 aatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23648555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 16091963 - 16092463
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16091963 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 16092062  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||| |||||| ||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16092063 gattaaacctgaaaagatt-taaaaaaaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaacag 16092161  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | | ||||||| |||||||| || |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  16092162 agtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgc 16092261  T
Q  300 gaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||    
T  16092262 gaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgca 16092361  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092362 tttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 16092461  T
Q  499 gt 500  Q
    ||    
T  16092462 gt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 2 - 500
Target Start/End: Original strand, 21918633 - 21919121
Alignment:
Q  2 agcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21918633 agcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggaagag 21918732  T
Q  102 attgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||          |  ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21918733 attgaacctggaaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaga 21918822  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  21918823 gtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtg 21918921  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21918922 aagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaa 21919020  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21919021 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21919120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7373237 - 7372778
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7373237 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctg 7373138  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||                     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7373137 gaaagattgtagaatgaaacttgtgaaattctgacctgaactcgccacggcg---------------------agtgacccagaaacagagtgtcttgtt 7373059  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373058 aggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgttta 7372960  T
Q  311 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattact 410  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |    
T  7372959 agatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattatt 7372868  T
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7372867 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22875564 - 22875065
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22875564 gagcttgcaagatttcgtgattttgacctttgagttaatccttagatgcttttgagcgtctaaacatgtttaataatgattaggaaagattgtagaacga 22875465  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875464 ggttgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 22875365  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | |||||||||  ||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22875364 gtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtg 22875265  T
Q  301 aagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||     
T  22875264 aagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcat 22875165  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22875164 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 22875066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31971743 - 31971257
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31971743 gagcatgcaagatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtaggatga 31971644  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| || || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||    
T  31971643 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgagattctgacctgaactcgccccggcgagcagaggctgtcacctcgcgagcgacccagaaatag 31971555  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31971554 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgt 31971456  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||    
T  31971455 gaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaa 31971357  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 16199280 - 16199765
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199280 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgtcttataatgattaggaaagaatgtaggatga 16199379  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||           |||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16199380 gattgaacct-----------agaattaaactgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagacgctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacaga 16199468  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  16199469 gtgacttatt-ggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtg 16199567  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||| |||    
T  16199568 aagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaat 16199666  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16199667 tgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 16199764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 41598683 - 41598188
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41598683 gagcttgcaggattccgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatga 41598584  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  41598583 gattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacaga 41598484  T
Q  201 gagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
     |  |||| ||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||    
T  41598483 -atgcttgtttaggattttgcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgt 41598385  T
Q  300 gaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    ||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| |||||    
T  41598384 gaaactgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgca 41598286  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41598285 tttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 173 - 500
Target Start/End: Original strand, 45130793 - 45131117
Alignment:
Q  173 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| ||||    
T  45130793 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagac 45130891  T
Q  273 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtg 372  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  45130892 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattg 45130990  T
Q  373 aatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 471  Q
     |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130991 tatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 45131088  T
Q  472 tcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  45131089 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 362
Target Start/End: Original strand, 25362793 - 25363123
Alignment:
Q  21 ttttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 120  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  25362793 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatga--- 25362889  T
Q  121 tagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttg 219  Q
            ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||  ||| |    
T  25362890 --------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-g 25362980  T
Q  220 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25362981 cgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 25363080  T
Q  320 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 362  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  25363081 gttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 481
Target Start/End: Original strand, 19801049 - 19801527
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |    
T  19801049 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagagaataa 19801148  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||   ||  ||||  |||||| | ||| |   |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||      |  ||||    
T  19801149 gattgaacctggaatagtttaagaa-cgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgagtacttgtgttacag 19801247  T
Q  200 agagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    | || |||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||   ||    || |  ||||| || |||||    
T  19801248 a-agccttgtttaggatttttcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtatataacattaatgatgatctg 19801346  T
Q  299 tgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgc 397  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||    
T  19801347 tgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 19801445  T
Q  398 aattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
      ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801446 gtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 5865899 - 5866082
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5865899 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 5865998  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5865999 gattgaacctgaaaagact-tagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 5866082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 279 - 500
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389571
Alignment:
Q  279 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatt 378  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||      
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21389451  T
Q  379 taagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389452 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  478 taagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||  | |||||||||||||||    
T  21389549 taagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14409544 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 284 - 500
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  284 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
     | |||||||||||||||    
T  21396084 tgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 284 - 500
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  284 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
     | |||||||||||||||    
T  21790577 tgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21491491 - 21491308
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21491491 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 21491392  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||  || ||| | ||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21491391 gattgaacctagaaagact-tagaatgaaaatttagagaatctgacc-aaacttgccatggcgagtagaggctcttgcctcgcgag 21491308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5853392 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 493
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 493
Target Start/End: Original strand, 13507914 - 13508199
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt- 307  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||| |||      
T  13507914 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaatcgtgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaaactgaa 13508013  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
    ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||    
T  13508014 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 13508113  T
Q  408 actatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    | ||| ||||| || || || | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13508114 attatatcatgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 297 - 500
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  297 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattg 396  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  397 caattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 495  Q
     | ||||||| | ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  496 gatgt 500  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17141412 - 17141229
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17141412 gagcatgcaagattttgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 17141313  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| | ||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17141312 gattgaacctgaaaagact-tagaatgaaaatttagagaatcagacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 493
Target Start/End: Original strand, 13597446 - 13597731
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-t 307  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||| |||      
T  13597446 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaatcgtgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaaactgaa 13597545  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
    ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| | | ||||  | ||||||    
T  13597546 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatatt 13597645  T
Q  408 actatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    | ||| ||||| || ||||| |  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13597646 attatatcatgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21249880 - 21249697
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249880 gagcatgcaagatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 21249781  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || |||||||||||||| | | ||||  || ||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21249780 gactgaacctggaaagact-tggaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21249697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21255718 - 21255535
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255718 gagcatgcaagatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 21255619  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  || ||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  21255618 gattgaacctggaaagact-tggaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgag 21255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15203331 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Original strand, 45130656 - 45130766
Alignment:
Q  4 catgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagat 103  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130656 catgcaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagat 45130755  T
Q  104 tgaacctggaa 114  Q
    |||||||||||    
T  45130756 tgaacctggaa 45130766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 26355329 - 26355504
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||    
T  26355329 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacc 26355428  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26355429 tggaaagactttagaa-tgaatttttgtgaattgtacctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcacgag 26355504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21674195 - 21674021
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21674195 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 21674096  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||| || |   |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21674095 tggaaagattttagaa-tgaatatttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 21674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 346 - 498
Target Start/End: Original strand, 18678069 - 18678221
Alignment:
Q  346 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  18678069 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 18678167  T
Q  445 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  18678168 tattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactat---gtcatgctgtttttgtaa 430  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||     
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 32121886 - 32121734
Alignment:
Q  346 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  32121886 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 32121788  T
Q  445 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||    
T  32121787 tattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Original strand, 17611968 - 17612231
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||   ||| |    
T  17611968 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt---tataa 17612064  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| |||||| | | |||    
T  17612065 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatact 17612163  T
Q  434 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17612164 gcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 493
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290853
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| |  || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 334 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || ||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    | || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15070686 - 15070573
Alignment:
Q  369 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 467  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15070686 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 15070588  T
Q  468 tgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||||||||||||    
T  15070587 tgagtcggtctaagt 15070573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 503
Target Start/End: Original strand, 19937005 - 19937174
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    ||||||||||   ||||||||||  |||||  || ||||| || || ||| |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19937005 tgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatac 19937104  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 503  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  19937105 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 473
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776929
Alignment:
Q  316 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 414  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagt 23776870  T
Q  415 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23776871 catgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  377 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 475  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  476 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||  ||||  | |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498644 gct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219717
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  474 ggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17140986 - 17140916
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17140986 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21491065 - 21490995
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21491065 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 497
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  474 ggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 38854883 - 38854986
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||||    
T  38854883 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagatttaacct 38854982  T
Q  111 ggaa 114  Q
    ||||    
T  38854983 ggaa 38854986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 5866325 - 5866395
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  5866325 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 23760895 - 23760962
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23760895 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 482
Target Start/End: Original strand, 983457 - 983509
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983457 actgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  480 agtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||| ||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39834303 - 39834147
Alignment:
Q  29 tttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattg 128  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||   ||  |||||      
T  39834303 tttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacttgtatgataatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaatagtttaagaatga 39834204  T
Q  129 aacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    | ||||  || |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39834203 atctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 39834147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 6520857 - 6520779
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 89  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6520857 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataataattaggaaaga 6520779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  450 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  450 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 26355749 - 26355815
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26355749 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 23760481 - 23760575
Alignment:
Q  20 attttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |   |||||||||||||||||    
T  23760481 attttgacttttgagttgatccctgaatgtttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaa 23760575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 21389075 - 21389156
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgatta 82  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||    
T  21389075 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21389156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 37116530 - 37116366
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  37116530 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 37116432  T
Q  418 g--ctgtttt-tgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116431 gaactgttttatgta--ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 336
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 21414857 - 21414956
Alignment:
Q  9 aagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21414857 aagatttcggaatttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 21414956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 24353090 - 24353039
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353090 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673716
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 488  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22525627 - 22525579
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525627 actgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219862
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgata 340  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 26219862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 17267045 - 17267096
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267045 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 19154938 - 19154989
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154938 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 473
Target Start/End: Original strand, 20465982 - 20466132
Alignment:
Q  323 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 421  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||   |||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||  | || ||| ||    
T  20465982 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 20466080  T
Q  422 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    || |||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466081 ttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20527871 - 20527812
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20527871 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 20527812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18865753 - 18865695
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18865753 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 18865695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20499127 - 20499049
Alignment:
Q  33 agttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    |||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  20499127 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattgaacctg 20499049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 13507660 - 13507713
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattag 83  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  13507660 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13507713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 13597192 - 13597245
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattag 83  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  13597192 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13597245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 16409889 - 16409989
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| |||||||||||||||    
T  16409889 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctg 16409988  T
Q  112 g 112  Q
    |    
T  16409989 g 16409989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37116704 - 37116664
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37116704 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 38855015 - 38855055
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38855015 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 38855055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 114)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 9509688 - 9509189
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509688 gagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 9509589  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509588 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 9509489  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9509488 agtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgt 9509390  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509389 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 9509290  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9509289 ttgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 9509190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12699331 - 12698831
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12699331 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 12699232  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
     |||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  12699231 aattgaacctggaaagattgttgaatgaaactcgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaaacaa 12699132  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12699131 agtgacttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgt 12699033  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12699032 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 12698933  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgt-ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12698932 ttgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 12698833  T
Q  499 gt 500  Q
    ||    
T  12698832 gt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 38227979 - 38227481
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38227979 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 38227880  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38227879 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacag 38227781  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38227780 agtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgt 38227681  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||     
T  38227680 gaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcat 38227581  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38227580 ttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Original strand, 3563986 - 3564482
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3563986 gagcttgcaagatttcgttattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 3564085  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564086 gattgaacctggaaagattgtagaat-gaacttttggaaatctgacctgaactcgccacagcgagcaaatgctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 3564184  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3564185 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctat 3564284  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| || ||     
T  3564285 gaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacat 3564384  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564385 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26212484 - 26211995
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  26212484 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggtaagaatgtaggatga 26212385  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-ca 198  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26212384 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaaca 26212296  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26212295 gagtgatttgttag--ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctg 26212198  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26212197 tgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgca 26212098  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag-atgatga 497  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  26212097 attgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatga 26211998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 16385880 - 16386369
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385880 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 16385979  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385980 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagtggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 16386068  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16386069 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgt 16386167  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16386168 gaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaa 16386267  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 40443875 - 40443393
Alignment:
Q  2 agcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag 101  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40443875 agcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgag 40443776  T
Q  102 attgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    |||||||||||||            | ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443775 attgaacctggaa------------ttaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 40443688  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  40443687 gtgacttatt-ggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtg 40443589  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| |||    
T  40443588 aagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaat 40443490  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  40443489 tgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 153 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 10589384 - 10589039
Alignment:
Q  153 cgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaa 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  10589384 cgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgaccttttttgcacgagttgtctagagttgga 10589286  T
Q  253 ccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtg 352  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10589285 cctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatg 10589187  T
Q  353 cattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtta 452  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10589186 cattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgtta 10589087  T
Q  453 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  10589086 tttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 482
Target Start/End: Original strand, 15143667 - 15144140
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaactttta-agttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  15143667 agatttcgtgattttgactttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaac 15143766  T
Q  109 ctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtctt 207  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  15143767 ctggaaagattttagaat-gaacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgcctt 15143865  T
Q  208 gttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg- 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||     
T  15143866 gttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgt 15143965  T
Q  307 tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatat 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||  ||   || ||| || |||||||| ||  ||||| |||||||    
T  15143966 tttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatat 15144065  T
Q  407 tactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||  || || ||||||| ||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144066 tatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 15144140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 27847466 - 27847951
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27847466 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatttaggatga 27847565  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatct-gacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| ||| || | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27847566 gattgaacctggaa-----------ttaaacttatgggattttgacctgaactcgccacggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacag 27847654  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  27847655 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgt 27847753  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |     
T  27847754 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaat 27847852  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||| | |||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  27847853 ttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgat 27847949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 497
Target Start/End: Original strand, 17061593 - 17062077
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17061593 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17061692  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-tt 210  Q
    || ||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |  |||| ||    
T  17061693 gatagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacaga-atgcttgttt 17061791  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-ttt 309  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |||    
T  17061792 aggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccatggggtagttatgaatattacatataatattaataatgatctgtgaagctgattt 17061891  T
Q  310 aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattac 409  Q
    | ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||     
T  17061892 atgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattat 17061990  T
Q  410 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17061991 tatgtcatgct-attttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44116992 - 44116509
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  44116992 atttcgtaattttgactcttgagttgatccttatatgcctttgagtccctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccg 44116893  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-tt 210  Q
    |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |  || | ||    
T  44116892 gaaagatt-tagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgactcagttacaga-acgctagttt 44116795  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-ttt 309  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||    ||   || || ||||| || || |||||| ||| |||    
T  44116794 aggattttgcgatctttattgcacgagtcgttgagggttgaaccttggggtagttatgaataatatatataatattaatgatgatatgtgaaactgattt 44116695  T
Q  310 aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattac 409  Q
    | ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||| ||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||     
T  44116694 atgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 44116596  T
Q  410 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44116595 tatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 285 - 497
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  385 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 484  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  485 atgaagatgatga 497  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 481
Target Start/End: Original strand, 12756350 - 12756817
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12756350 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12756449  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaac-ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-t 209  Q
    | |  |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||| | || |||| |    
T  12756450 g-attatttaagaa-tgaactttttggaagctgacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattaca-aaagccttgtt 12756546  T
Q  210 taggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tt 308  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||    || || ||||| || |||||||| |||| ||    
T  12756547 taggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatctgtgatgctgatt 12756646  T
Q  309 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 408  Q
    || ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||| || ||| |||| | | ||||| |||||||||    
T  12756647 tatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatatta 12756745  T
Q  409 ctatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     ||||||||| |||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756746 ttatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 500
Target Start/End: Original strand, 2279769 - 2280238
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||   ||  ||||| ||    
T  2279769 ttaagttgatatttagatgattttgagtgcctgaacatgcataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgtaatagtttaagaatgga 2279868  T
Q  130 acttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttg 228  Q
      ||| ||  |   |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  || ||  | |||  | |||||| ||| |||||||| |||||    
T  2279869 tttttgggtgttacacctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcctagttatagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttg 2279967  T
Q  229 ttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttga 327  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| | ||||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||     
T  2279968 tcacacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattatttatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgt 2280067  T
Q  328 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 427  Q
    |||| |||||||||||| |||| || |||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  2280068 ttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttg 2280166  T
Q  428 taaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
     | ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  2280167 catactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 39267268 - 39267447
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39267268 gagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 39267367  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 181  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39267368 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 39267447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 2831928 - 2832110
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2831928 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 2832027  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2832028 gattgaacctagaaagact-tagaa-tgaactttggagaatctga-ctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 334 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 9751172 - 9751355
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9751172 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 9751271  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  9751272 ggttgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatttga-ctgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16213861 - 16213684
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  16213861 ttgatgttg-ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 16213763  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16213762 gttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18302677 - 18302494
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18302677 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtaggatga 18302578  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18302577 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggataatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 28504923 - 28505106
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28504923 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 28505022  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28505023 gattgaacctgaaaagact-tagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 28505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14949222 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15376813 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20385223 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21189695 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 334 - 496
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11393387 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 334 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 810760 - 810936
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  810760 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacc 810859  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  810860 tggaaagaatttagaa-tgaatttttgtgaactgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 810936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44014664 - 44014489
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  44014664 agatttcgtaattttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 44014565  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||  |  || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44014564 tggaaagattttagaa-tgaatttttgttagttgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 44014489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 351 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  351 tgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgt 450  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  451 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 336 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  336 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 435  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt 16410120  T
Q  436 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16410119 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273392
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || ||||| | ||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatattga-ga 48273506  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 483  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  484 gatgaagatgatga 497  Q
    ||| ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 15754509 - 15754689
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15754509 gagcatgcaagatttcgaatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatga 15754608  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaat-tgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 181  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||   |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15754609 gattgaacctggaaaaact-tagaatgaaaacttttgagaatctgacc-gaacttgccacggcgagcataggctctcgcctcg 15754689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3386395 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 478
Target Start/End: Original strand, 12255462 - 12255892
Alignment:
Q  50 ttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctg 148  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||   ||  ||||| ||| |||||| |  |  |||||    
T  12255462 ttttgagtgcttgaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaat-gaatttttgggagttacacctg 12255560  T
Q  149 aacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagag 247  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  12255561 aactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacaga-atgcttgtttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgttgagag 12255659  T
Q  248 ttgaaccttggggtagtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 345  Q
    |||||  ||||||||||| || ||| |  || || || ||||| || |||| ||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  12255660 ttgaattttggggtagtaatgaagattgtataat-atattaatgatgatctatgaagttgttataagatg-attgatgttgtttataatgtgatataatt 12255757  T
Q  346 ttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
     ||| || ||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| || ||||||||  ||| |||||  |   |||| | |||| ||||||||     
T  12255758 gtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgt 12255857  T
Q  445 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 478  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255858 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34201282 - 34201099
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  34201282 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttagaatga 34201183  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34201182 gattgaacctgtaaagact-tagaatgaaaatttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 34201099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 331 - 496
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  331 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 429  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  430 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 331 - 496
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  331 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 429  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  430 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 331 - 496
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  331 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 429  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  430 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||   |||||||| |||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 493
Target Start/End: Original strand, 38898275 - 38898535
Alignment:
Q  233 acgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattat 331  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||   ||| | || || ||||| || ||||| ||||||| |||| ||||  |||| |||| ||||    
T  38898275 acgagttgttgtgagttgatccttgggatagttatgaatattatttataatattaatgatgatctgcgaagctgatttatgatgatttgacgttg-ttat 38898373  T
Q  332 gatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaa 430  Q
      |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  38898374 actgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatat 38898473  T
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  38898474 actgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 394 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13869448 - 13869346
Alignment:
Q  394 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13869448 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13869350  T
Q  494 atga 497  Q
    ||||    
T  13869349 atga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Original strand, 19486599 - 19486865
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| |  || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  19486599 gagttgttgagagttgaaccttagggtagttatgaatattaattaaaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 19486698  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||    
T  19486699 tgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 19486797  T
Q  434 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  19486798 gcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20110724 - 20110556
Alignment:
Q  317 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtca 416  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  20110724 gttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 20110626  T
Q  417 tgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20110625 tgctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 411 - 494
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 68236 - 68132
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  68236 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacc 68137  T
Q  110 tggaa 114  Q
    |||||    
T  68136 tggaa 68132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 11995680 - 11995768
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 89  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995680 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11995768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  370 gtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 469  Q
    ||||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 13831401  T
Q  470 agtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  13831400 agtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 67815 - 67745
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  67815 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 28505349 - 28505419
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28505349 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34200856 - 34200786
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34200856 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16056769 - 16056576
Alignment:
Q  59 cctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccac 158  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||   ||  ||||| ||  ||| |||||   |||||||| |||||     
T  16056769 cctgaacatgtataataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccat 16056670  T
Q  159 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtt-tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttga 251  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||   ||||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  16056669 agcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttaggttaaatgcgatctttgtagcacgagttgatgtgagttga 16056576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16324495 - 16324392
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  16324495 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttgaatgtttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacct 16324396  T
Q  111 ggaa 114  Q
    ||||    
T  16324395 ggaa 16324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18006131 - 18006052
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 89  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18006131 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaaga 18006052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 47832297 - 47832194
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||    
T  47832297 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattgaatct 47832198  T
Q  111 ggaa 114  Q
    ||||    
T  47832197 ggaa 47832194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  480 agtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22073366 - 22073223
Alignment:
Q  50 ttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctga 149  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||   ||  ||||| ||  ||| ||| |   ||||||    
T  22073366 ttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctagaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctga 22073267  T
Q  150 acacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 193  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22073266 actcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccag 22073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 811182 - 811248
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  811182 actgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 500
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219835
Alignment:
Q  377 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 475  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  476 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||   |||||||||||||||    
T  16219814 tctaagt---tgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16495472 - 16495402
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16495472 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18005716 - 18005650
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18005716 actgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 44014248 - 44014182
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44014248 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 47831877 - 47831807
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47831877 actgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 434
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  434 g 434  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 434
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  434 g 434  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 482
Target Start/End: Original strand, 1867895 - 1868098
Alignment:
Q  279 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatt 378  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| ||| | ||    
T  1867895 atgatattaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtt 1867993  T
Q  379 taagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 475  Q
    | |||||||| | | ||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1867994 tgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcgg 1868091  T
Q  476 tctaagt 482  Q
    |||||||    
T  1868092 tctaagt 1868098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 11996078 - 11996148
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11996078 actgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 477
Target Start/End: Original strand, 15008278 - 15008597
Alignment:
Q  160 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgg 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||    |||    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |    
T  15008278 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttgtagaataccttgtttagggttttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaaccttcg 15008377  T
Q  259 ggta-gtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 356  Q
     ||| | || |||  |  || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| ||||||    
T  15008378 agtatgaatggaggttgtat-atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcatt 15008476  T
Q  357 acttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttat 453  Q
    |||||||  |||| || || ||| || ||||| ||| |||| |||||||||  ||| |||||  ||| |||| || ||| ||||||||| || |||||      
T  15008477 acttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgc-attgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgttta 15008573  T
Q  454 ttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15008574 ttaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15211712 - 15211484
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgat 334  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||  || ||||||||| |||| ||| |  || || ||||||||||||||||||          ||||||||||    
T  15211712 gagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaataatgacgtttaagatgatatgtgaagctgtttaagat----------tgattatgat 15211623  T
Q  335 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaa-ct 433  Q
    ||||||||||||| | | |||  |||||||  |   |||||| || |||||||| ||||||  || |||||||  ||||||||| |||| |||| |  ||    
T  15211622 gtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattct 15211524  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15211523 gcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Original strand, 16219348 - 16219523
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  16219348 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaacttgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacct 16219447  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||||   ||  |||| |||| |||| ||| |   || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16219448 ggaatagtttaagaa-tgaatttttgggagttacacgtgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 16219523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 496
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138177
Alignment:
Q  322 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct- 420  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 17138101  T
Q  421 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  17138102 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Original strand, 10063678 - 10063939
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| |  || |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  10063678 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgaagatatgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 10063777  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| ||      |||||  |||||||||||||| |||||||| | | |||   | ||||||| ||| ||||| || || || | ||     
T  10063778 tgtgatataattgtatatg-----tttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatacc 10063871  T
Q  434 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  10063872 gcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 451
Target Start/End: Original strand, 2530130 - 2530208
Alignment:
Q  371 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 451  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||   |||||||||||||||||||    
T  2530130 tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Original strand, 9389337 - 9389430
Alignment:
Q  21 ttttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||| || ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  9389337 ttttgacttttaagttgaaccttggatgtttttgagtgtctggacttgtataatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaa 9389430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12187189 - 12187019
Alignment:
Q  323 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-g 421  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| | |    
T  12187189 gttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattg 12187094  T
Q  422 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  12187093 taattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11262749 - 11262691
Alignment:
Q  52 ttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11262749 ttgaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 11262691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||  |||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 44407993 - 44408102
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||  |||||| |||||| ||||   ||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  44407993 gagcatgtaagattttgaaatttcgactttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaa 44408092  T
Q  101 gattgaacct 110  Q
    ||||||||||    
T  44408093 gattgaacct 44408102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901341
Alignment:
Q  423 ttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagt 12901341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14044816 - 14044764
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044816 actgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14044764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14354846 - 14354794
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354846 actgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14354794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 185
Target Start/End: Original strand, 9389462 - 9389501
Alignment:
Q  146 ctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9389462 ctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9389501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14953619 - 14953560
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  14953619 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 14953560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14959585 - 14959526
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  14959585 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 14959526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16056393 - 16056346
Alignment:
Q  436 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16056393 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagt 16056346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 19649107 - 19649170
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaa 64  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  19649107 gagcatgcaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19649170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26420399 - 26420340
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  26420399 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 26420340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 68099 - 68061
Alignment:
Q  147 tgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  68099 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 68061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 2529628 - 2529682
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattagg 84  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2529628 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 2529682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15113125 - 15113036
Alignment:
Q  317 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |  |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15113125 gttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 15113036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15116662 - 15116573
Alignment:
Q  317 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |  |||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15116662 gttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattga-gatgttgatgacttgcaattgatatt 15116573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18203881 - 18203831
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203881 actgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 497
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356156
Alignment:
Q  439 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  26356098 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 497
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358608
Alignment:
Q  439 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  26358550 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Original strand, 11547957 - 11548010
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11547957 tgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacct 11548010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Original strand, 11554553 - 11554606
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11554553 tgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacct 11554606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14148985 - 14148932
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  14148985 tgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 14148932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 21064784 - 21064897
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |  | | |||| | ||||| ||| || |||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||    
T  21064784 gagcttgcaagattttgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggaaatattttagaatga 21064883  T
Q  101 gattgaacctggaa 114  Q
    |||||||| |||||    
T  21064884 gattgaacttggaa 21064897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Original strand, 9751390 - 9751442
Alignment:
Q  218 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 270  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9751390 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 9751442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Original strand, 20702681 - 20702733
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20702681 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 20702733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 32768090 - 32768038
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32768090 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 32768038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Original strand, 22737805 - 22738300
Alignment:
Q  4 catgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737805 catgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagat 22737904  T
Q  104 tgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22737905 tgaacctagaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgaactgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagt 22738004  T
Q  203 gtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 302  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22738005 gccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaa 22738103  T
Q  303 gctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738104 gctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattg 22738203  T
Q  403 atattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22738204 atattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 22730855 - 22731355
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22730855 gagcatgcaatatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 22730954  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22730955 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcaaaggctctcgcctcacgagtcacccagaaacag 22731054  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgggg-tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    || | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22731055 agtgccttgttaggtttt-gcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctg 22731153  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22731154 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgca 22731253  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22731254 attgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgat 22731353  T
Q  499 gt 500  Q
    ||    
T  22731354 gt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23076939 - 23076442
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23076939 gagcatgcaagatttcgtgattttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatga 23076840  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23076839 gattggacctggaaagatt-tagaatgaaactttggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacaga 23076741  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23076740 gtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtg 23076642  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  23076641 aagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaat 23076542  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076541 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23660521 - 23660023
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23660521 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 23660422  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23660421 gattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaaacaga 23660322  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23660321 gtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgta 23660222  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  23660221 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatt 23660122  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23660121 tgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22337614 - 22337115
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337614 gagcatgcaagatttcgtgattctgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 22337515  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337514 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 22337416  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22337415 agagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgt 22337316  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||  |||||     
T  22337315 gaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcat 22337216  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22337215 ttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23286349 - 23285865
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286349 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 23286250  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    |||||||| ||||| ||      |||||     |  || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23286249 gattgaacatggaatgaa-----aattg-----tgagattatgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaga 23286160  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23286159 gtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtg 23286061  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286060 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 23285961  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23285960 tgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Original strand, 298437 - 298933
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  298437 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatataggatga 298536  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298537 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 298635  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||    
T  298636 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgt 298734  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298735 gaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaa 298834  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  298835 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 23654032 - 23654507
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654032 gagcatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 23654131  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || |||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||| |             ||||||||||||||||||||    
T  23654132 gattgaacctggaa-----------ttaaactgttgggattctgacttgaactcgccacggcgagca-------------cgcgagtgacccagaaacag 23654207  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23654208 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgt 23654306  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654307 gaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 23654406  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23654407 ttgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 23654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 500
Target Start/End: Original strand, 37750 - 38235
Alignment:
Q  2 agcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag 101  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37750 agcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaagatgtaggatgag 37849  T
Q  102 attgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    |||||||||||||           || ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37850 attgaacctggaa-----------ttaaacttgtgagattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacata 37938  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  37939 gtgacttgttagacttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctg 38037  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||||||| |||||||| | |||    
T  38038 aagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaat 38136  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38137 tgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27754073 - 27753730
Alignment:
Q  2 agcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27754073 agcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag 27753974  T
Q  102 attgaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27753973 attgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacaga 27753874  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27753873 gtgccttgtta-gattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtg 27753775  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 345  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753774 aaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20309593 - 20309108
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309593 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctggatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 20309494  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20309493 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaa 20309405  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  20309404 agtgacttgttagatttt-gcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgt 20309306  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| |     
T  20309305 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaat 20309207  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||| | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  20309206 ttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 20309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 195 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  195 aacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 294  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 23060718  T
Q  295 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaat 394  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||| |    
T  23060717 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 23060619  T
Q  395 tgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23060618 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 23060519  T
Q  495 tgatgt 500  Q
    ||||||    
T  23060518 tgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 481
Target Start/End: Original strand, 32451562 - 32452031
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32451562 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacatg 32451661  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    |||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32451662 gaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 32451761  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 310  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||    
T  32451762 a-gattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctg-tta 32451859  T
Q  311 agatgtgttgatgttga-ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatatta 408  Q
     |   |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  |||| |||||||||     
T  32451860 tgggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgc-attgatattg 32451957  T
Q  409 ctatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451958 ttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 500
Target Start/End: Original strand, 23708383 - 23708738
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgtt 242  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |  |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23708383 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacaga-atgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 23708481  T
Q  243 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 341  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  23708482 gatagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatat 23708581  T
Q  342 aatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgt 441  Q
    |||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| | |||||||||||    
T  23708582 aattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgt 23708680  T
Q  442 tgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  23708681 tgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23709632 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23712113 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26505441 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26507919 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34402622 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19672118 - 19671830
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 308  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||   ||| | || || ||||| |||||||||||||||| |    
T  19672118 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggg-tagttatgaatattatttataatattaatgataatctgtgaagctgat 19672020  T
Q  309 -taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
     || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| | | ||||  | ||||||    
T  19672019 ctatgatga-ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatatt 19671923  T
Q  408 actatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    | ||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  19671922 attatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 334 - 499
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135590
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23135652 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 22133848 - 22134020
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22133848 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 22133947  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    | | |||| | ||||| |||| |||||  | |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22133948 taggaagactttagaa-tgaa-ttttgtgaactgaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Original strand, 23071617 - 23071768
Alignment:
Q  33 agttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaact 132  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||  || |    
T  23071617 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagact-tagaatgaaaat 23071715  T
Q  133 tttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23071716 ttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 23071768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 495  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45029954 gt-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 500
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23103496  T
Q  481 gtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |  | |||||||||||||||    
T  23103497 gatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 346 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 25616339 - 25616192
Alignment:
Q  346 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  25616339 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 25616241  T
Q  445 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  25616240 tattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 28291924 - 28292027
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28291924 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaagaatgattaggaaagaatgtagaatga 28292023  T
Q  101 gatt 104  Q
    ||||    
T  28292024 gatt 28292027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28406433 - 28406297
Alignment:
Q  46 atgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-a 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||  | ||| |    
T  28406433 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaa-taaaattttgtgaactgaa 28406335  T
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgc 182  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28406334 cctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 28406297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 423 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  423 ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24529628 tga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 437 - 500
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 473
Target Start/End: Original strand, 22799063 - 22799220
Alignment:
Q  316 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 414  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  22799063 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagt 22799161  T
Q  415 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||| |||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799162 catgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgat 495  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 462
Target Start/End: Original strand, 23019643 - 23019789
Alignment:
Q  316 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 414  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  23019643 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagt 23019741  T
Q  415 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 462  Q
    |||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23019742 catgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 23019789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 481
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  333 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  433 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25176331 - 25176158
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  25176331 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacct 25176232  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    ||||   ||  ||||  ||  |||  || |  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25176231 ggaatagtttaagaacagatttttgagagttagacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 25176158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 22134258 - 22134326
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  22134258 actgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 494
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 7679655 - 7679589
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  7679655 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 481
Target Start/End: Original strand, 20519976 - 20520295
Alignment:
Q  164 gtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggta 262  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||  |||||    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||    
T  20519976 gtagaggctctcgcctcgcgagttgcctagttacagaataccttgtttagggttttgcgatctttgttgcacgagatgttatgagtttatccttggggta 20520075  T
Q  263 gtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 360  Q
    | | || ||  |  || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| | | || |||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  20520076 ggaatggaggttgtat-atgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattactt 20520174  T
Q  361 gaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttt-tgtaaactgcctatgttgctg-ttgttattta 456  Q
    |||  |||| || || ||| |||||||| ||| |||| |||||||||  ||| |||||  ||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||  |||    
T  20520175 gaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattgttatatcatgaactgttttatgt--actgcatatgttgctgtttgtttatta 20520270  T
Q  457 actaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20520271 actaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 23072000 - 23072070
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  23072000 actgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    | |||||||| ||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23287432 - 23287384
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287432 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 496
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatat-----gtgaatatttaagatgt 386  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||      || |||  ||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgt 40622219  T
Q  387 tgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcga 485  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||  |||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||    
T  40622220 tgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatga 40622316  T
Q  486 tgaagatgatg 496  Q
    | |||||||||    
T  40622317 ttaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 482
Target Start/End: Original strand, 18786958 - 18787006
Alignment:
Q  435 cctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786958 cctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18787006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23207347 - 23207296
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207347 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Original strand, 22459500 - 22459575
Alignment:
Q  317 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 392  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22459500 gttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatga 22459575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24503532 - 24503473
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  24503532 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 24503473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12829492 - 12829434
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12829492 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 12829434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 408
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642930
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 408  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 24642930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241945
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaag 9241945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Original strand, 22740719 - 22740768
Alignment:
Q  136 ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22740719 ggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22740768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Original strand, 22740996 - 22741081
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  22740996 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22741081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 27197301 - 27197248
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  27197301 tgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 27197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31756264 - 31756232
Alignment:
Q  153 cgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31756264 cgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 52411 - 51913
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52411 gagcatgcaagattttttgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 52312  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52311 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactg 52212  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52211 agtgtcttgttaggtttt-gcgacctt-gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgt 52114  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  52113 gaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaa 52014  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52013 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 51914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 167612 - 168099
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  167612 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatga 167711  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||    |||||| | | |||     | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167712 gattgaacct----agattgaa-acttg-----tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 167801  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  167802 gtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttg 167900  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167901 aagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 167999  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  168000 tgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3969 - 3470
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3969 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 3870  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3869 gattgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacag 3770  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3769 agtgagttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctat 3671  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 3571  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3570 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 833 - 343
Alignment:
Q  9 aagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  833 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaac 734  T
Q  109 ctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg 208  Q
    || |||||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  733 ctagaaagaatttagaatgaaacttttggaatctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttg 634  T
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 308  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  633 ttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtt 534  T
Q  309 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  533 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatatta 434  T
Q  409 ctatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  433 ttacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 2350 - 1851
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2350 gagcatccaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 2251  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  2250 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacag 2151  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2150 agtgccttgttagatttt-gtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgt 2052  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2051 gaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 1952  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1951 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 1852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 207161 - 207324
Alignment:
Q  21 ttttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 120  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  207161 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagact- 207259  T
Q  121 tagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  207260 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Original strand, 207359 - 207411
Alignment:
Q  218 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 270  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  207359 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 207411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 23390118 - 23390617
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390118 gagcatccaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 23390217  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  23390218 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacag 23390317  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23390318 agtgccttgttagatttt-gtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgt 23390416  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390417 gaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 23390516  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23390517 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25422031 - 25421532
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25422031 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaagaacttaggatga 25421932  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25421931 gattggacctggaaagatt-tagaatgaaactttcggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaccg 25421833  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421832 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 25421733  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  25421732 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaa 25421633  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25421632 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24494067 - 24493569
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24494067 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgaacgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 24493968  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  24493967 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctttcgcctcgtgagtaacccataaacag 24493869  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24493868 agtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgt 24493769  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||     
T  24493768 gaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcat 24493669  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24493668 ttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24529720 - 24529223
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529720 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 24529621  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529620 gattgaacctggaaaggttgtagaatgaaacttttggaattctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 24529521  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529520 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgt 24529421  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| |||||     
T  24529420 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcat 24529321  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529320 ttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25431893 - 25431395
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25431893 gagcgtgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagaatttaggatga 25431794  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  25431793 gattggacctggaaagatt-tagaatgaaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgagtgacccagaaatcg 25431695  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431694 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 25431595  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  25431594 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaa 25431495  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  25431494 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatg 25431396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13095993 - 13095495
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095993 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 13095894  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13095893 gattggacctggaaagatt-tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 13095795  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13095794 agtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgt 13095695  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||     
T  13095694 gaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcat 13095595  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13095594 ttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 9078451 - 9077952
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9078451 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatga 9078352  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078351 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaaccttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 9078253  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078252 agtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 9078153  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||   || ||| || |||||||| ||| |||||     
T  9078152 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcac 9078053  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9078052 ttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 9077953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13025809 - 13025311
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025809 gagcatgcaagatttcgtgattttgaattttgagttgatccttagatacttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 13025710  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13025709 gattggacctggaaagatt-tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 13025611  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13025610 agtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgt 13025511  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||     
T  13025510 gaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcat 13025411  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13025410 ttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 8286475 - 8286964
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8286475 gagcatgcaagatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgccggaacatgtctaataatgattaagaaagaatgtaggatga 8286574  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| ||| || ||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286575 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgggattctgacctaaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 8286663  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  8286664 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgt 8286762  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8286763 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaa 8286862  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctg-tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286863 ttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 8286962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1096966 - 1096467
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096966 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 1096867  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096866 gattgaatctggaaagattgcagaat-gaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 1096768  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    |  | ||| ||||  |||||||| || ||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  1096767 aatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctat 1096668  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| |||||     
T  1096667 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcat 1096568  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1096567 ttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22075507 - 22075018
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22075507 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatga 22075408  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-ca 198  Q
     | ||||||||||| ||           ||||| || |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22075407 aaatgaacctggaatga-----------aacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaaca 22075319  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  22075318 gagtgacttgttag--ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatg 22075221  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22075220 tgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgca 22075121  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag-atgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  22075120 attgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatga 22075021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 21985769 - 21986130
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21985769 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 21985868  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21985869 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 21985967  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  21985968 agtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgt 21986067  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 362  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21986068 gaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Original strand, 21292611 - 21293090
Alignment:
Q  9 aagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292611 aagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 21292710  T
Q  109 ctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtctt 207  Q
    ||||||           || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  21292711 ctggaa-----------ttaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactt 21292799  T
Q  208 gttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 307  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21292800 tttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgt 21292898  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca--attgata 405  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||  |  |||||||    
T  21292899 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgata 21292997  T
Q  406 ttactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21292998 ttattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 497
Target Start/End: Original strand, 36154461 - 36154942
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36154461 atttcatgattttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctg 36154560  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-tt 210  Q
    || ||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |  |||| ||    
T  36154561 gatagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacaga-atgcttgttt 36154659  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-ttt 309  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||   ||  | ||||| || || |||||||||| |||    
T  36154660 aggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatatattattaatgatgatatgtgaagctgattt 36154759  T
Q  310 aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattac 409  Q
    | ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||     
T  36154760 atgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 36154858  T
Q  410 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36154859 tatgtcatgctgtttttgtatactgc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 497
Target Start/End: Original strand, 11580878 - 11581361
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11580878 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 11580977  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-tt 210  Q
    || ||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||| ||    
T  11580978 gatagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccatttacaga-atgcttgttt 11581076  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-ttt 309  Q
    ||| |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||   || || ||||| ||||||||||||| || |||    
T  11581077 aggattttgcgatctttgtcgtacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatataatattaatgataatctgtgaagttgattt 11581176  T
Q  310 aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattac 409  Q
    | ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| | |||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||  ||| ||||| |||||||||     
T  11581177 atgatg-attgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattat 11581274  T
Q  410 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11581275 tatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 22107006 - 22107357
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22107006 gagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggacga 22107105  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| ||           || ||||| ||| || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22107106 gattgaacctgaaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaatag 22107194  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22107195 agtgccttgtga-tactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgt 22107293  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 363  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22107294 gaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 22144500 - 22144068
Alignment:
Q  50 ttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctga 149  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||  ||||| ||  ||| ||| |   ||||||    
T  22144500 ttttgagtgcctgaacatgtgtaacaatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagttacacctga 22144401  T
Q  150 acacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagt 248  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  | |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22144400 actcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagt 22144302  T
Q  249 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 347  Q
    |||||||||| || ||| |||   ||  | ||||| ||||| || | |||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||  |    
T  22144301 tgaaccttggagtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgt 22144202  T
Q  348 atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt 447  Q
    || |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||    
T  22144201 atatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgt 22144103  T
Q  448 -tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144102 ctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 333 - 500
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  333 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 333 - 500
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  333 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 21871193 - 21871377
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21871193 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatga 21871292  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21871293 gattgaacctggaaagattatggaa-tggacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21871377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 21875473 - 21875657
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21875473 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatga 21875572  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21875573 gattgaacctggaaagattatggaa-tggacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21875657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 22119815 - 22119998
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22119815 gagcatgcaaaattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 22119914  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22119915 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22119998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  264868 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 335 - 497
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  335 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactg 434  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  435 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10733041 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 394 - 500
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997655
Alignment:
Q  394 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21997648  T
Q  494 atgatgt 500  Q
    |||||||    
T  21997649 atgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 22959166 - 22959339
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  22959166 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 22959265  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || ||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22959266 gagagactttagaa-tgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 285 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418598
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||| ||||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaaga 18418695  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21566034 - 21565863
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21566034 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 21565935  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 181  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| | ||||   |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21565934 tggaaagattttagaa-tgaattttcgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 21565863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 285 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  385 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 484  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  485 atgaagatgatga 497  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 24766960 - 24767142
Alignment:
Q  2 agcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24766960 agcatgcaagatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggatgag 24767059  T
Q  102 attgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24767060 attgaatctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24767142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 19660459 - 19660643
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19660459 gagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtggaatga 19660558  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg--gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||  ||  ||||  |||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19660559 gattaaacctggaaagact-tagaatgaaaactttggagaatctaacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 19660643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||  || |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39245198 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18319133 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 482
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902156
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902108 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20902156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2154713 tgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19669390 - 19669219
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  19669390 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacg 19669291  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctc 180  Q
    |||||||| | ||||||  |  ||||| ||||   |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19669290 tggaaagactttagaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgtgtagaggctctcgcctc 19669219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 498
Target Start/End: Original strand, 17517168 - 17517320
Alignment:
Q  346 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  17517168 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 17517266  T
Q  445 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  17517267 tattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 31061231 - 31061068
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || ||  || |||||||| || | | |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  31061231 tgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 31061132  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31061131 tac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 369 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 38619562 - 38619434
Alignment:
Q  369 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 467  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38619562 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgca 38619464  T
Q  468 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38619463 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  325 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttt 424  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  425 ttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 451  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 403 - 497
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  403 atattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23064639 - 23064512
Alignment:
Q  369 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 467  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23064639 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgca 23064541  T
Q  468 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23064540 tgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 37724108 - 37723922
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||   |||||  || |||||||||||    
T  37724108 aatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatg 37724010  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||  | ||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37724009 aatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 19660886 - 19660956
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19660886 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 21329127 - 21329300
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||    
T  21329127 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacct 21329226  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    ||||  ||| ||| | |||| |||||| |  || || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21329227 ggaataatt-taggaatgaatttttgggagttgcacttgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcga 21329300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 21329548 - 21329618
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21329548 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  24067170 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 451
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  325 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 451  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 382 - 481
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  382 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 478  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  479 aag 481  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21873453 - 21873277
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaagatgttgatg 391  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||  |||||||||   ||    
T  21873453 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatggttaagatgt---tg 21873359  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    || ||  ||||||||||  | ||||||||| | |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873358 aaatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 22959583 - 22959649
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22959583 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725853
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| ||  |||| | |||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||| ||||||    
T  40725870 cgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 500
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  377 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 475  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| |||   | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  476 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 36314643 - 36314577
Alignment:
Q  435 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  36314643 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 21498649 - 21498752
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||| ||| ||||| || |||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  21498649 gattgcgtaattttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtataataattattaggagagattgtagattgagattgaacct 21498748  T
Q  111 ggaa 114  Q
    ||||    
T  21498749 ggaa 21498752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 479
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22032492 - 22032323
Alignment:
Q  322 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 421  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  22032492 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgat- 22032398  T
Q  422 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  22032397 tgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 26012086 - 26012154
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26012086 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19668968 - 19668898
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19668968 actgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 497
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  443 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 185
Target Start/End: Original strand, 5888837 - 5888981
Alignment:
Q  41 cttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat 140  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||   ||  |||||  | ||||  || |    
T  5888837 cttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacatggaatagtttaagaatgaatctttgtgagt 5888936  T
Q  141 ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
       |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5888937 tgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 5888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 496
Target Start/End: Original strand, 18769947 - 18770118
Alignment:
Q  322 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct- 420  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  18769947 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 18770042  T
Q  421 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  18770043 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 336
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766087
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 193
Target Start/End: Original strand, 21501919 - 21501968
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 193  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21501919 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccag 21501968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20026746
Alignment:
Q  146 ctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 20026746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572107
Alignment:
Q  323 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 421  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||  |||||  ||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 23572159  T
Q  422 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    || |||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23572158 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtc 23572107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Original strand, 41294124 - 41294176
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41294124 tgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41294176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 425
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766166
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttt 425  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20766166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 20910434 - 20910477
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatcctta 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  20910434 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaacctta 20910477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Original strand, 21294947 - 21295006
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21294947 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 21295006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23201445 - 23201382
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 474  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23201445 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 23201382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 15441638 - 15441696
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15441638 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 108
Target Start/End: Original strand, 20026514 - 20026592
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  20026514 ttaagtcgatctttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 20026592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25406847 - 25406789
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25406847 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 25406789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 25535409 - 25535351
Alignment:
Q  52 ttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25535409 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25535351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744036
Alignment:
Q  147 tgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 263
Target Start/End: Original strand, 26740472 - 26740530
Alignment:
Q  205 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 263  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  26740472 cttgttagggttttgcgatctttgtcgcaagagatgttgtgagttgatccttggggtag 26740530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 477
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 181
Target Start/End: Original strand, 21741308 - 21741345
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 181  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21741308 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21741345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 477
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22588516 - 22588459
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22588516 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaac 22588459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Original strand, 23336973 - 23337030
Alignment:
Q  52 ttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23336973 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 23337030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17284482 - 17284430
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17284482 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 17284430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Original strand, 22120033 - 22120085
Alignment:
Q  218 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 270  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22120033 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 22120085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39258 - 38761
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39258 gagcatgcaagatttcgtaattttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 39159  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39158 gattgaacctggaaagatttt-gaatgaaacttgtggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacata 39060  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39059 gtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 38960  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | | ||||| |    
T  38959 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatt 38860  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38859 tgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 283 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32942
Alignment:
Q  283 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  383 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
     |||||||||||||||||    
T  32959 tgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9744
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcc 502  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9812 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 140)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26687386 - 26686887
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687386 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 26687287  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687286 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 26687187  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26687186 agtgtcttgttaggtttta-cgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgt 26687088  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  26687087 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaa 26686988  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26686987 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatg 26686888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17488356 - 17487856
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488356 gagcatgcaagatttcgtgaatttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 17488257  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-ca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17488256 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtaggattctgacctgaaatcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaaca 17488157  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488156 gagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctg 17488058  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488057 tgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgca 17487958  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17487957 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 17487858  T
Q  499 gt 500  Q
    ||    
T  17487857 gt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18439033 - 18438534
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18439033 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaaaatga 18438934  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438933 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaacttttggaattctgacctgaagttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 18438835  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18438834 agtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgt 18438735  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||   || |||   ||||||||| ||| |||||     
T  18438734 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcat 18438635  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18438634 ttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13442725 - 13442274
Alignment:
Q  49 cttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacct 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||    
T  13442725 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacct 13442626  T
Q  148 gaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagag 247  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13442625 gaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagag 13442527  T
Q  248 ttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 347  Q
    |||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442526 ttgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 13442427  T
Q  348 atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt 447  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13442426 atgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgt 13442327  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13442326 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17499834 - 17499338
Alignment:
Q  5 atgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagatt 104  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499834 atgcaagatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagatt 17499735  T
Q  105 gaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-cagaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||     
T  17499734 gaacctggaaagattgtagaatgaaacttgttggattctgacctgaattcgccacggtgagcagaggctctcgcctctctagtgacctagaaaacagagt 17499635  T
Q  203 gtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 302  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17499634 gccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaa 17499536  T
Q  303 gctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattg 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499535 tctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattg 17499436  T
Q  403 atattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17499435 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 25476007 - 25476506
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25476007 gagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatga 25476106  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476107 gatcgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 25476206  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25476207 gtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtg 25476306  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |    
T  25476307 aagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatt 25476406  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25476407 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 14576455 - 14576949
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14576455 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtagaatga 14576554  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
     |||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14576555 cattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaa 14576653  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14576654 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgt 14576753  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14576754 gaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaa 14576853  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  14576854 ttgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 11424385 - 11424880
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11424385 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagaatga 11424484  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11424485 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaactttttgaactctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacag 11424583  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11424584 agtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgt 11424683  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || ||||||||||   |||| |    
T  11424684 gaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgcta 11424780  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Original strand, 40213343 - 40213838
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213343 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 40213442  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213443 gattgaacctggaaagattgtagaa-tgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 40213541  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213542 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 40213641  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||     
T  40213642 aaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcat 40213741  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40213742 ttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14973353 - 14972854
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14973353 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 14973254  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14973253 gattaaaccagaaaagattttagaaa-gaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacag 14973155  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14973154 agtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctat 14973055  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| |||||     
T  14973054 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcat 14972955  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14972954 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 14972855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 20698069 - 20698556
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698069 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 20698168  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698169 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 20698257  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698258 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgt 20698356  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20698357 gaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaa 20698455  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20698456 ttgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20698555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 23082983 - 23083482
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  23082983 gagcatgtcagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctggatatgtctaatagtgattaggacaaaatgtaggatga 23083082  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacc-tgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 198  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083083 gattggacctggaaagatt-tagaatgaaactttttggattctgacccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaaca 23083181  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23083182 tagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctg 23083280  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23083281 tgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgca 23083380  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083381 attgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 23083480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14573087 - 14572602
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14573087 gagcatgcaagattttgtgtttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 14572988  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14572987 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 14572889  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14572888 agtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgt 14572789  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  14572788 gaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaa 14572689  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatg 487  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 102 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 43841330 - 43840932
Alignment:
Q  102 attgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841330 attgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 43841231  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43841230 gtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtg 43841132  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  43841131 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaat 43841032  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  43841031 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12399694 - 12399209
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  12399694 gagcatgctagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatataggatgg 12399595  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    | |||||||||||| ||           ||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399594 gtttgaacctggaatga-----------aacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtaaaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacag 12399506  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
     ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  || | |||| |||||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  12399505 tga--cttgttag--ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgt 12399410  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  12399409 gaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcat 12399310  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12399309 ttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12399210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30030327 - 30029858
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30030327 gagcatgcaagatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaataatgattacgaaagaatgtgggatga 30030228  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtga-cccagaaaca 198  Q
    |||||||||||||| ||      ||  |    |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  30030227 gattgaacctggaatga------aacag----tttggaattctgacct-aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatcccagaa-ca 30030140  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  30030139 gaatgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatg 30030041  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |   ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30030040 tgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgca 30029942  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    | |||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30029941 aatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagt 30029858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 144 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 42386767 - 42386427
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgtt 242  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||   ||||| || |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42386767 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtttaggattttgcgaactttgtcgcacgagttgtt 42386669  T
Q  243 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42386668 gtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatat 42386569  T
Q  342 aatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgt 441  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||   ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42386568 aatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 42386469  T
Q  442 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 483  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42386468 tgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagtc 42386427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 481
Target Start/End: Original strand, 53070321 - 53070799
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53070321 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatga 53070420  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaac-ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||   |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||    
T  53070421 gattgaacctggattaatt-aagaa-tgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacag 53070518  T
Q  200 agagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    | || |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||    || || ||||| || || ||    
T  53070519 a-agccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatttg 53070617  T
Q  299 tgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgc 397  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||| |||   |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||    
T  53070618 tgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 53070716  T
Q  398 aattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    | ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070717 atttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 261
Target Start/End: Original strand, 17247913 - 17248168
Alignment:
Q  6 tgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17247913 tgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattg 17248012  T
Q  106 aacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtc 205  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |    
T  17248013 aacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacaga-atgc 17248111  T
Q  206 ttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 261  Q
    ||| ||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17248112 ttgtttagaattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttaaaccttggggt 17248168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 285 - 497
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  385 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 484  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  485 atgaagatgatga 497  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796685
Alignment:
Q  171 ctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-gcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaag 16796777  T
Q  271 acttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 362  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16796776 acttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12340251 - 12340068
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12340251 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 12340152  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12340151 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatct-aactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 12340068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29172683 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14669259 - 14669076
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14669259 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatgtctaatattgaataggaaagaatgtaggatga 14669160  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  14669159 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgag 14669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7781447 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9707707 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45607007 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 481
Target Start/End: Original strand, 52523398 - 52523831
Alignment:
Q  50 ttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctga 149  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||   ||  ||||| ||  ||| ||| |   ||||||    
T  52523398 ttttgagtgcctgaacatgtgtaataattattaggaaagattctagtttgatattgaacctggaacagtttaagaatggatttttgggagttacacctga 52523497  T
Q  150 acacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagt 248  Q
    || |||||  |||||||||||| |||||||  |||||  |||||  |||||  | |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  52523498 actcgccatagcgagtagaggccctcgcctgacgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagt 52523596  T
Q  249 tgaaccttggggtagtattga-gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 346  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |  || | ||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||      
T  52523597 tgaactttggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattg 52523694  T
Q  347 tatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
    ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| |||||  ||||||| | | |||||||||||||     
T  52523695 tatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactgcctatgttgt 52523793  T
Q  445 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523794 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 12851986 - 12852169
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | | ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12851986 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagtttaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 12852085  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12852086 gattgaatctggaaagact-tagaatgaaacttttgataatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 12852169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16097820 - 16097645
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16097820 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacc 16097721  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || ||||||| ||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16097720 tgaaaagattttagaa-tgaatttttgtgaattggacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 16097645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Original strand, 24340578 - 24340844
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  24340578 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 24340677  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||| || || || | |||    
T  24340678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatact 24340776  T
Q  434 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  24340777 gcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848773
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28848711 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 12933941 - 12934117
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  12933941 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 12934040  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12934041 tggaaagattttagaa-tgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagt 12934117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14666104 - 14665921
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||| |||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14666104 gagcatgcaagattttatgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 14666005  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14666004 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14665921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14735617 - 14735434
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||| |||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14735617 gagcatgcaagattttatgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 14735518  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14735517 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14735434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23274979 - 23274687
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-t 307  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||||      
T  23274979 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgagccttgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgaa 23274880  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
    ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| | | |||||||||  |||||||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||    
T  23274879 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 23274780  T
Q  408 actatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    | ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||    
T  23274779 attatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcatcgaagatgttgatgt 23274687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32308158 - 32307983
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32308158 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 32308059  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    | | |||| | ||||| |||| |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32308058 taggaagactttagaa-tgaa-ttttgggaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 32307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 43842677 - 43842572
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43842677 gagcatgcaagatttcatgattttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 43842578  T
Q  101 gattga 106  Q
    ||||||    
T  43842577 gattga 43842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14179821 - 14179705
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14179821 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 14179722  T
Q  101 gattgaacctggaaaga 117  Q
    |||||||| ||||||||    
T  14179721 gattgaacttggaaaga 14179705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 13209950 - 13210133
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13209950 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaat-atgattaggaaagaaagtagaatga 13210048  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaat-tgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||   |||| ||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13210049 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaaactcttgagaatgtgacc-gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13210133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 334 - 495
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 495  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 334 - 500
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 49389275 - 49389446
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  49389275 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 49389374  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgc 182  Q
    |||| ||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  49389375 tggagagactttagaa-tgaa-ttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc 49389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 49667715 - 49667890
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  49667715 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagcgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 49667813  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||  | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  49667814 tggaaagattttagaa-tgaaatattgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 49667890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 495  Q
    |    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  383 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  483 cgatgaagatgatga 497  Q
     ||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 497
Target Start/End: Original strand, 12119684 - 12119887
Alignment:
Q  294 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 391  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||  |  || |||||||| || ||| |||||| |    
T  12119684 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattg 12119782  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 491  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12119783 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12119881  T
Q  492 tgatga 497  Q
    ||||||    
T  12119882 tgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 46822419 - 46822267
Alignment:
Q  346 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||  ||||| ||||||||| |||    
T  46822419 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgc 46822321  T
Q  445 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  46822320 tattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9513384 - 9513228
Alignment:
Q  26 acttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaa 125  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9513384 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagattttagaa 9513285  T
Q  126 ttgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 181  Q
    |  || ||||| |||    |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9513284 tgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9513228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9521359 - 9521203
Alignment:
Q  26 acttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaa 125  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9521359 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagattttagaa 9521260  T
Q  126 ttgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 181  Q
    |  || ||||| |||    |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9521259 tgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 366 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  366 atatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 465  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  466 catgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 374 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  474 ggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 284 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  284 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 17247142 - 17247236
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17247142 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgccggaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 17247236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 1644314 - 1644489
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  1644314 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 1644413  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||  |||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1644414 tgagaagactttagaa-tgaa-ttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 1644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15412557 - 15412429
Alignment:
Q  369 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 467  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15412557 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 15412459  T
Q  468 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15412458 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 407
Target Start/End: Original strand, 2050852 - 2051227
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||  |||   ||  ||||| ||    
T  2050852 ttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctcaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacc--gaatagtttaagaatgga 2050949  T
Q  130 acttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttg 228  Q
      ||| ||| |   |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||| |  | |||||| ||| |||||||| |||||    
T  2050950 tttttgggagttacacctgaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacaaaatg-cttgtttaggattttgcgatctttg 2051048  T
Q  229 ttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttga 327  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || || |||||||||| | |||||||  |||||||||     
T  2051049 tcgcatgagttgttgagagttgaacattgaggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatttgtgaagctgctataagatga-ttgatgttgt 2051147  T
Q  328 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  2051148 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2051227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588553
Alignment:
Q  21 ttttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaga 117  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgtaaaga 4588553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 322 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12511236 - 12511059
Alignment:
Q  322 tgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgc 419  Q
    |||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  12511236 tgttgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattat-tgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgt 12511138  T
Q  420 tgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 8499697 - 8499518
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtca 416  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||  |  || |||||||| || |||  ||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  8499697 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 8499598  T
Q  417 tgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || |||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8499597 tgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165250
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||  ||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    | |||||| | | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27165329 gttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16104268 - 16104163
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  16104268 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctg 16104169  T
Q  112 gaaaga 117  Q
    | ||||    
T  16104168 ggaaga 16104163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 285 - 500
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642386
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||| ||||||    
T  37642369 cgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16809884 - 16809775
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16809884 gagcatgctagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcttgaacat----aataatgattaggaaagaatgtaggatga 16809789  T
Q  101 gattgaacctggaa 114  Q
    |||||| |||||||    
T  16809788 gattgatcctggaa 16809775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618464
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  474 ggtctaagt 482  Q
    |||||||||    
T  21618472 ggtctaagt 21618464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 394 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10557087 - 10556985
Alignment:
Q  394 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10557087 ttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  494 atga 497  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 12171750 - 12171827
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 89  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171750 atttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 12171827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgta--aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 12174310 - 12174376
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12174310 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 13210378 - 13210448
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13210378 actgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  480 agtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||   |||||||||||||||    
T  15470944 agt---tgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  377 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 475  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  476 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 324705 - 324471
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  || | | ||  | |||    
T  324705 ttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaa-ctgagaatagtttaagaatga 324607  T
Q  130 acttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtt-tttgcgaccttt 227  Q
    | |||||| |  || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||    |||||||||||   || |||||||    
T  324606 atttttgggagttgcacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccaagttacagaacaccttgttaggttaaatgtgaccttt 324507  T
Q  228 gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 263  Q
    || | || ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  324506 gtcgtacaagttgatgtgagttgatccttggggtag 324471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 32307747 - 32307684
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32307747 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 356 - 497
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  356 tacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga-tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttat 453  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | |||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  454 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16103850 - 16103784
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16103850 actgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  436 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 49668127 - 49668193
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  49668127 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  444 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9512990 - 9512924
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  9512990 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9520965 - 9520899
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  9520965 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14234979 - 14234809
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||     
T  14234979 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcctgaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacc- 14234881  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgc 182  Q
     |||| | |  |||| |||| |||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14234880 cgaaatagttaagaa-tgaatttttgggagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 14234809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15471413 - 15471310
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  15471413 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaacatgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 15471314  T
Q  111 ggaa 114  Q
    ||||    
T  15471313 ggaa 15471310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 500
Target Start/End: Original strand, 22147431 - 22147646
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  22147431 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattt-atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 22147529  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | || ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22147530 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagt 22147628  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||| ||||||    
T  22147629 cgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 856216 - 856140
Alignment:
Q  420 tgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  856216 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13919394 - 13919350
Alignment:
Q  435 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919394 cctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 22110403 - 22110454
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110403 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 43926028 - 43925977
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926028 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 493
Target Start/End: Original strand, 1644725 - 1644787
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  1644725 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12340027 - 12339985
Alignment:
Q  224 ctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtat 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12340027 ctttgtcgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtat 12339985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 473
Target Start/End: Original strand, 23077509 - 23077571
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23077509 atgtcataatgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23077571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 839718 - 839609
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||||||  ||||   ||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  839718 gagcatgtaagattttgcaatttcgacttttaagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaa 839619  T
Q  101 gattgaacct 110  Q
    ||||||||||    
T  839618 gattgaacct 839609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Original strand, 1465059 - 1465215
Alignment:
Q  29 tttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattg 128  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||  |||  ||||  |    
T  1465059 tttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattatgaaagattgtagattgagattgaacctggaataatttaagaac-g 1465157  T
Q  129 aacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || || ||  |  || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1465158 aatttgtgtgagttgcacctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1465215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 15877451 - 15877532
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgatta 82  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  15877451 gagcatgcaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 15877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 22109926 - 22110007
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  22109926 ttaagttgaactttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctg 22110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618594
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgata 340  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 21618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 336  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 481
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  478 taag 481  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24188199 - 24188140
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  24188199 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 24188140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 55149400 - 55149341
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  55149400 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 55149341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14501669 - 14501615
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattagg 84  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14501669 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14501615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||| ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 473
Target Start/End: Original strand, 14878548 - 14878610
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||  |||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14878548 atgtcataatgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15051593 - 15051531
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15051593 atgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15060369 - 15060307
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15060369 atgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15060307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23275211 - 23275133
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  23275211 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 23275133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 605942 - 606027
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaa 115  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||   | |||  ||||||||||||||||||    
T  605942 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaattttctagattgagattgaacctggaaa 606027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 473
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298621
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11852055 - 11852006
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcct 61  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  11852055 atttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11852006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 186
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37250973
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 37250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Original strand, 4588628 - 4588680
Alignment:
Q  218 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 270  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4588628 tgcgagctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 4588680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 12171869 - 12171909
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12171869 acctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 12171909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Original strand, 15691967 - 15692019
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15691967 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 15692019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110156
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22110156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Original strand, 23704458 - 23704510
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23704458 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23704510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Original strand, 23722914 - 23722966
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23722914 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23722966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Original strand, 23741370 - 23741422
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23741370 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23741422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Original strand, 41201487 - 41201539
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41201487 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41201539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 34510279 - 34509783
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34510279 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 34510180  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34510179 gattgaacctggaaagattgtagaat-gaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacag 34510081  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34510080 agtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatcttt 34509981  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| |||||     
T  34509980 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcat 34509881  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34509880 ttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22532768 - 22532269
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532768 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 22532669  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22532668 gattgaacctggaaggattgtagaat-gaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacag 22532570  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  22532569 agtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgt 22532470  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22532469 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaa 22532370  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22532369 tggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 22532270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Original strand, 50209836 - 50210333
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50209836 gagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatc-ttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 50209934  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50209935 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 50210033  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210034 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 50210133  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||     
T  50210134 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcat 50210233  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50210234 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 27250362 - 27250850
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27250362 gagcatgcaagatttcgtaatattgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgg 27250461  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    |||||||||||||| ||           | || | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27250462 gattgaacctggaatgaa----------acctgtgggattctgacctgaactcgccacgtcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacacagaaacaga 27250551  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    |   |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27250552 gtcccttgttatatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtg 27250650  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250651 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 27250750  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27250751 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 22354194 - 22354616
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  22354194 gagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtaggatga 22354293  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22354294 gattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacag 22354393  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22354394 agtgacttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgt 22354492  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354493 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 22354592  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtt 423  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
T  22354593 ttgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21027168 - 21026680
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||| || || ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21027168 gagcatgcaagaatttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatga 21027069  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| || |  |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21027068 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgaggttctgacctaaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaa 21026980  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21026979 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgt 21026881  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21026880 gaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaa 21026781  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||   || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  21026780 ttgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatg 21026681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 20135686 - 20135188
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||| |||| || ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135686 gagcatgcaatattttgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 20135587  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaac-ttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 198  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20135586 gattggacctggaaagact-tagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaaaca 20135489  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20135488 gagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctg 20135389  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |   |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20135388 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgca 20135289  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
      |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  20135288 catgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 20135189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 389
Target Start/End: Original strand, 22355810 - 22356185
Alignment:
Q  4 catgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagat 103  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22355810 catgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagat 22355909  T
Q  104 tgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagag 203  Q
    ||||||||||| ||      ||||    | | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  22355910 tgaacctggaatga------aatt----tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtg 22355998  T
Q  204 tc-ttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 302  Q
     | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22355999 acattgttagatttt-gagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 22356097  T
Q  303 gctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 389  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  22356098 gctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 389
Target Start/End: Original strand, 22357496 - 22357871
Alignment:
Q  4 catgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagat 103  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357496 catgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagat 22357595  T
Q  104 tgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagag 203  Q
    ||||||||||| ||      ||||    | | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  22357596 tgaacctggaatga------aatt----tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtg 22357684  T
Q  204 tc-ttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 302  Q
     | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357685 acattgttagatttt-gagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 22357783  T
Q  303 gctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 389  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  22357784 gctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 433506 - 433012
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  433506 gagcttgcaagattccgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatga 433407  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |    
T  433406 gattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttgca-a 433308  T
Q  201 gagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
     |  |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||   |||   || || ||||| || ||||||    
T  433307 aatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaatattataaataatattaatgatgatctgt 433208  T
Q  300 gaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
     |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  433207 aaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgca 433108  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  433107 tttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 38801024 - 38801508
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||| | ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38801024 gagcatgcaagatttcatatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgt 38801123  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           |||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38801124 gattgaacctggaa-----------ttgaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 38801212  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||  |||| |||||| |||    
T  38801213 agtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgt 38801311  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||| |     
T  38801312 gaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaat 38801410  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||| | |||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  38801411 ttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgat 38801506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 20846852 - 20847161
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20846852 gagcatgcaagattttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatga 20846951  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| || |  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20846952 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgaggttttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacag 20847040  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||  ||||||| |    
T  20847041 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctat 20847139  T
Q  300 gaagctgttt-aagatgtgttg 320  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  20847140 gaagctgtttaaagatgtgttg 20847161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 258 - 499
Target Start/End: Original strand, 22468576 - 22468816
Alignment:
Q  258 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 357  Q
    ||||||||||||||| |  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468576 gggtagtattgagaccttttgaagttggtaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcatta 22468674  T
Q  358 cttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttattta 456  Q
    ||||| | | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22468675 cttgagatattat-tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattta 22468773  T
Q  457 actaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  22468774 actaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20919100 - 20918917
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||  | ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20919100 gagcatgcaagattttataattttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 20919001  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20919000 gattgaacctgaaaagact-tagaatttaaatttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 497
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593897
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21923391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 334 - 500
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21347249 - 21346961
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-t 307  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   ||||| || || |||||  |    |||||||||| |    
T  21347249 ttaggtttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtggttatgaatattaattataatattaatgctgtattgtgaagctgat 21347150  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatat 406  Q
    ||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||    
T  21347149 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatat 21347051  T
Q  407 tactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21347050 tattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21342384 - 21342090
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-t 307  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   ||||| || || |||||  |    |||||||||| |    
T  21342384 ttaggtttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtggttatgaatattaattataatattaatgctgtattgtgaagctgat 21342285  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatat 406  Q
    ||| ||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||    
T  21342284 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatat 21342186  T
Q  407 tactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 503  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  21342185 tattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33681499 - 33681316
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  33681499 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 33681400  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 193  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| || |   |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33681399 tggaaagattttagaa-tgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccag 33681316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16275463 tgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 52927612 - 52927786
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  52927612 agatttcgtaattttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacc 52927711  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||  || |  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  52927712 tggaaagattttggaa-tgaattttttaaagttagacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 52927786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 209 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16758942 - 16758667
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 308  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16758942 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgtt 16758843  T
Q  309 -taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
     ||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||  ||  ||||||| || |||| | ||||||||    
T  16758842 ataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatatt 16758744  T
Q  408 actatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
      ||| |||||  |||  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16758743 gttatatcatgaactg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 16758667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361915
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    | ||||||| || ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  16361995 gttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21754525 - 21754350
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  21754525 agatttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacc 21754426  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||| |||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21754425 tgggaagactttagaa-tgaa-ttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20248757 - 20248592
Alignment:
Q  20 attttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatt 119  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||| |    
T  20248757 attttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctggagagact 20248658  T
Q  120 gtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
     ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20248657 ttagaa-tgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgag 20248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 500
Target Start/End: Original strand, 20847185 - 20847275
Alignment:
Q  410 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20847185 tatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 473
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  316 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagt 21788077  T
Q  415 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21788078 catgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 21301160 - 21301245
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21301160 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 21301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 500
Target Start/End: Original strand, 13212821 - 13213027
Alignment:
Q  294 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 391  Q
    |||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| |    
T  13212821 atctgtgaagttgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 13212919  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 491  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13212920 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13213018  T
Q  492 tgatgatgt 500  Q
    |||||||||    
T  13213019 tgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 481
Target Start/End: Original strand, 35260860 - 35261180
Alignment:
Q  160 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgg 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| |    |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  35260860 gcgagtagaggccctcgcctcgcgagtttcccagttacaaaataccttgcttaggattttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaacattgg 35260959  T
Q  259 ggtagtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 356  Q
    ||||||| || ||| |  || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||| | || ||||||| ||||  ||| ||||||    
T  35260960 ggtagtaatggagattgtat-atgatattaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcatt 35261058  T
Q  357 acttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttattt 455  Q
    |||||||  || | ||||| ||| ||||||||||   ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||    
T  35261059 acttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttatt 35261154  T
Q  456 aactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35261155 aactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 334 - 503
Target Start/End: Original strand, 15860008 - 15860177
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||  || ||||| || |||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  15860008 tgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatac 15860107  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 503  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  15860108 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 284 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  284 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 318 - 481
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896295 gctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||| || |||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  434 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 gt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22238117 - 22237946
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  22238117 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctg 22238018  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    |||||||| | ||| |||| |||  || |   || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22238017 gaaagattttggaa-tgaattttgtgagttgcacttgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 22237946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 319 - 481
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  319 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg 418  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  419 ctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||   ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21707229 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||   ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21711771 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 20091096 - 20091281
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||| |||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  20091096 gagcatgcaagatttcttatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatga 20091195  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaac--ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||  |||   || ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||    
T  20091196 gattggacctgaaaagact-tagaatgaaacaacttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgag 20091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 432 - 499
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21162227 - 21162117
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  21162227 gagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtagaatga 21162128  T
Q  101 gattgaacctg 111  Q
    |||||||||||    
T  21162127 gattgaacctg 21162117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 22921499 - 22921672
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||     
T  22921499 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacca 22921598  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    ||||   ||  ||||  ||| ||||| || |  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22921599 ggaatagtttaagaa-cgaatttttgagagttagacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22921672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  325 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 451  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43697849 - 43697746
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||| |||||    
T  43697849 gatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattagaaaagattctagattgagatttaacct 43697750  T
Q  111 ggaa 114  Q
    ||||    
T  43697749 ggaa 43697746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681010
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||    
T  33681034 cggtctaagt---tgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21754115 - 21754052
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21754115 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 496
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||  ||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 500
Target Start/End: Original strand, 14295606 - 14295672
Alignment:
Q  435 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  14295606 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237630
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||    
T  22237654 cggtctaagt---tgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20918674 - 20918622
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918674 actgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20918622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20248349 - 20248283
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20248349 actgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 482
Target Start/End: Original strand, 52928021 - 52928073
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928021 actgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 52928073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065176
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttg 243  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||    |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||     
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaataccttgtttagggttttgcgatctttgtcgcacgagatgtta 26065196  T
Q  244 agagttgaaccttggggtag 263  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  26065195 tgagtttatccttggggtag 26065176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 50614168 - 50614219
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614168 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 50621996 - 50622047
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621996 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368388
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 21895883 - 21895965
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 112  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  21895883 ttaagttgatctttagatgattatgagtgcctgaacaagtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 21895965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20637206 - 20637165
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20637206 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Original strand, 28194098 - 28194254
Alignment:
Q  29 tttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattg 128  Q
    ||||||| || ||||  ||| |||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||   ||  |||||      
T  28194098 tttaagtcgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgaaatagtttaagaatga 28194197  T
Q  129 aacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    | ||||  || |   |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28194198 atctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgag 28194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Original strand, 20524899 - 20524958
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20524899 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 20524958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21438216 - 21438157
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21438216 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 21438157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23763633 - 23763574
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  23763633 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 23763574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 41050087 - 41050138
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050087 actgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19063942 - 19063884
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19063942 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19063884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19111832 - 19111774
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19111832 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19111774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 21533924 - 21533974
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533924 actgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 21861145 - 21861227
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 112  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  21861145 ttaagttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 21861227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 263
Target Start/End: Original strand, 27653052 - 27653106
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 263  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  27653052 ttagggttttgcgatctttgttgcacgagatgttatgagttgatccttggggtag 27653106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 112
Target Start/End: Original strand, 35981357 - 35981419
Alignment:
Q  50 ttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 112  Q
    |||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35981357 ttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgg 35981419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 35981451 - 35981492
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35981451 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 35981492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 263
Target Start/End: Original strand, 52940708 - 52940761
Alignment:
Q  210 taggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 263  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  52940708 taggtttttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgatccttggggtag 52940761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 430 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 50686682 - 50686630
Alignment:
Q  430 aactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686682 aactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22636933 - 22636437
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636933 gagcatgcaagattttgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 22636834  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| || ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22636833 gattgaacctggaaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacttgacctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacag 22636734  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22636733 agtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgt 22636635  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636634 gaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 22636536  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22636535 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44053328 - 44052829
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44053328 gagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattgggaaagaatgtaggatga 44053229  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053228 gattgaacctgtaaagattataggatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 44053129  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053128 agtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgt 44053030  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053029 gaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 44052930  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44052929 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatg 44052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12903244 - 12902757
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12903244 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 12903146  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12903145 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgacccagaaacag 12903057  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12903056 agtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgt 12902958  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12902957 gaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaa 12902858  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12902857 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12902758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14039148 - 14038653
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14039148 gagcttgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaatga 14039049  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039048 gattgaacctagaaagattttagaatgaaacttttggaaatctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 14038949  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038948 agtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgt 14038849  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||     
T  14038848 gaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcat 14038749  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 495  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14038748 ttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 6 - 497
Target Start/End: Original strand, 16377149 - 16377639
Alignment:
Q  6 tgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattg 105  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16377149 tgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagcgtctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaggatgagattg 16377248  T
Q  106 aacctggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagt 204  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |     
T  16377249 aacctggaatgatcgtagaa-tgaacttttgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacatagtgc 16377347  T
Q  205 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgt-tgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaag 303  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377348 cttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggag 16377447  T
Q  304 ctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattga 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||    
T  16377448 ctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttga 16377547  T
Q  404 tattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16377548 tattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7089365 - 7088877
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089365 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 7089266  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7089265 gattgaacctggaatga-----------aacttatgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacag 7089177  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7089176 agtgtcttgttagatttt-gcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgt 7089078  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7089077 gaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaa 7088978  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7088977 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 16239614 - 16240090
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaa-tgtaggatg 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16239614 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaatgtagaatg 16239713  T
Q  100 agattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||                      ||||||||||||||||||||||||||    
T  16239714 agattgaacctggaaagatt-tagaatgaaacttgtggattctaacctgaac----------------------tcgcctcgcgagtgacccagaaacag 16239790  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16239791 agtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgc 16239890  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||     
T  16239891 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcat 16239990  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16239991 ttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 140 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7894060 - 7893703
Alignment:
Q  140 tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7894060 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcatgagtt 7893961  T
Q  240 gttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 339  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||     
T  7893960 gccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt---tgctgattatgatgtgaa 7893864  T
Q  340 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 439  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7893863 ataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 7893764  T
Q  440 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7893763 gttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Original strand, 44928545 - 44929042
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44928545 gagcttgcaagattccgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 44928644  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  44928645 gattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacaga 44928744  T
Q  201 gagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
     |  |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||    
T  44928745 -atgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgtggtagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgt 44928843  T
Q  300 gaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    ||||||| |||| ||||  || |||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||  ||| |||||    
T  44928844 gaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgca 44928943  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44928944 tttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 14052936 - 14053422
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||| |||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14052936 gagcatgcaagatt-cgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 14053034  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||| |||||           || ||||| ||| || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14053035 gattgaacttggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacag 14053123  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  14053124 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgt 14053222  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag-atgttgatgaattgca 398  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   |||| |||||||||||||| |    
T  14053223 gaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaa 14053321  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  14053322 attgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatga 14053419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 144 - 493
Target Start/End: Original strand, 23374125 - 23374473
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttg 243  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23374125 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcaacctttgttgcacgagttgttg 23374223  T
Q  244 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 343  Q
    ||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23374224 aggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataa 23374323  T
Q  344 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 443  Q
    |||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23374324 tgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttg 23374423  T
Q  444 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  23374424 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3097131 - 3096759
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097131 gagcatgcaagatttcataattttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 3097032  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097031 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 3096943  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3096942 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgt 3096844  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg 385  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3096843 gaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15091396 - 15091093
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15091396 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtttctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagaatga 15091297  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15091296 gattgaacctggaaggattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 15091197  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15091196 agtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgt 15091097  T
Q  300 gaag 303  Q
    ||||    
T  15091096 gaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44102697 - 44102214
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44102697 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgattatgaa-gaatgtaggatgagattgaacctg 44102599  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-tt 210  Q
    || ||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |  |||| ||    
T  44102598 gatagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacaga-atacttgttt 44102500  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-ttt 309  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |||    
T  44102499 aggattttgcgatctttgtagcacgagtcgttgagagttgaaccttgggatagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgattt 44102400  T
Q  310 aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattac 409  Q
    | ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| | | ||||| |||||||||     
T  44102399 atgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattat 44102301  T
Q  410 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44102300 tatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 283 - 500
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270356
Alignment:
Q  283 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  383 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
     |||||||||||||||||    
T  16270339 tgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7799196 - 7798953
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7799196 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggacataatgtaggatga 7799097  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| | | | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7799096 gattgaacctggaaagtttgtagaatgaaacttgtagtattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaa 7798997  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttga 244  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798996 agtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgtttcacgagttgttga 7798953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 362
Target Start/End: Original strand, 17047726 - 17048055
Alignment:
Q  21 ttttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 120  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||       
T  17047726 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaac-tggaatga--- 17047821  T
Q  121 tagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttg 219  Q
            ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  ||| |    
T  17047822 --------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-g 17047912  T
Q  220 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17047913 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgtt 17048012  T
Q  320 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 362  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17048013 gttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 316 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  316 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  416 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 481
Target Start/End: Original strand, 21815265 - 21815731
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||    
T  21815265 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctg 21815364  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    ||   |||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||| || ||||||    
T  21815365 gattaatta-agaat-gaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtt 21815461  T
Q  211 -aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag-acttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-t 307  Q
     ||| |||||||| |||  | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||  |||  || || || ||||| || || |||||||||| |    
T  21815462 taggattttgcgatcttcatcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggg-tagttatgaatactgtat-ataatattaatgatgatatgtgaagctgat 21815559  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
    ||| | ||  ||||||||| ||||  | |||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||    
T  21815560 ttatggtgatttgatgttg-ttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatatt 21815658  T
Q  408 actatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    | |||||||||||||||||||| || |  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815659 attatgtcatgctgtttttgtatacag-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 328 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  328 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  428 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15552312 - 15552129
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552312 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 15552213  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||  || ||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15552212 gattggacctggaaagact-tagaatcaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgag 15552129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 375 - 500
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  375 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 474  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  475 gtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 482
Target Start/End: Original strand, 52242871 - 52243299
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgcc 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  |||||  |   || ||| |   |||||||| ||||    
T  52242871 tgcctgaacatgtataataatgatcaggaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagttacacctgaactcgcc 52242970  T
Q  157 acggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacct 255  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  | |||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| |    
T  52242971 atagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgtaaagagttgaactt 52243069  T
Q  256 tggggtagtattga-gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgc 353  Q
    |||||||||| ||| || |  || | ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  52243070 tggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgc 52243168  T
Q  354 attacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gt 450  Q
    |||||||| |  |||| ||||| ||| |||||||| |||||| || ||||||||  ||| |||||  ||| ||| | | |||||||||||||||||| ||    
T  52243169 attacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgt 52243267  T
Q  451 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243268 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 52243299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24029240 - 24029057
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24029240 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtaggatga 24029141  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24029140 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 260 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  260 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 359  Q
    |||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattact 17046626  T
Q  360 tgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 458  Q
    |||||||| | || |||  |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||   |||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17046625 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaac 17046529  T
Q  459 taagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  17046528 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 13812431 - 13812614
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13812431 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaatattgattaggaaataatgtaggatga 13812530  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| || ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13812531 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18215374 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 20156912 - 20157095
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20156912 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 20157011  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttt-tggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  ||||||   |||| ||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  20157012 gattgaacctggaaaggct-tagaatgaaactttgaagaatatga-ctgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgag 20157095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12407 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 497
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837671
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  1837494 ttgatgttg-ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15118452 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 6190921 - 6190807
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6190921 atttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 6190822  T
Q  112 gaaagattgtagaat 126  Q
    |||||||||||||||    
T  6190821 gaaagattgtagaat 6190807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 334 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 503  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 22633835 - 22634018
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22633835 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 22633934  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |  |||| ||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22633935 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggataatcaga-ttgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 285 - 497
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || |||||| |||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 483  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  484 gatgaagatgatga 497  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15371467 - 15371202
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||      
T  15371467 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatat 15371369  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||  ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15371368 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15371269  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  15371268 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15373748 - 15373483
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||      
T  15373748 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatat 15373650  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||  ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15373649 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15373550  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  15373549 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 499
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 21814936 - 21815173
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  21814936 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctg 21815035  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaac-ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-t 209  Q
    ||   |||  |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||| || |||| |    
T  21815036 gattaatt-aagaa-tgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtt 21815132  T
Q  210 taggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttg 250  Q
    |||| |||||||| |||  | |||||||| |||||||||||    
T  21815133 taggattttgcgatcttcatcgcacgagtcgttgagagttg 21815173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 21818358 - 21818595
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  21818358 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctg 21818457  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaac-ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-t 209  Q
    ||   |||  |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||| || |||| |    
T  21818458 gattaatt-aagaa-tgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtt 21818554  T
Q  210 taggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttg 250  Q
    |||| |||||||| |||  | |||||||| |||||||||||    
T  21818555 taggattttgcgatcttcatcgcacgagtcgttgagagttg 21818595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16223797 - 16223532
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | | ||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||||      
T  16223797 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacgatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatgtgatgttg-ttatat 16223699  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||  ||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16223698 tgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16223599  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16223598 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16597144 - 16596963
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||  || ||||| | |||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16597144 gagcatgcaagattctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 16597045  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcg 183  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  || ||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16597044 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagtagaggttctcgccccgcg 16596963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239581
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18239519 gt-tgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190481
Alignment:
Q  179 tcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 278  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |      
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaat 6190684  T
Q  279 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat-tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatat 377  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||  ||||||     
T  6190683 atgatattaattacaattcgtgaagctg-ttatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataa 6190586  T
Q  378 ttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 475  Q
    || ||||| ||| |   || | |||||||||  ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6190585 ttgagatgattgttcgcttac-attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcgg 6190487  T
Q  476 tctaag 481  Q
    ||||||    
T  6190486 tctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 285 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280316
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   |  |||||| |||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  384 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 483  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  484 gatgaagatgatga 497  Q
    ||| ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 285 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367690
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  384 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
     |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||| ||||||    
T  15367707 cgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 285 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402703
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  384 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
     |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||| ||||||    
T  15402720 cgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8846865 - 8846689
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8846865 agatttcgtaattttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 8846766  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||||| ||||||  |  ||||| || |   |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8846765 tggaaagattttagaatgaattttttgtgagttgcaccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 8846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 493
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 414 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  414 tcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12774488 - 12774313
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  12774488 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacc 12774389  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||| |||   ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12774388 tggagagacgttagaa-tgaa-ttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 12774313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 499
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 285 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15370232 - 15370018
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 383  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| | | |||||  ||||||||||| || |||    
T  15370232 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgaga 15370135  T
Q  384 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
     |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15370134 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T
Q  483 cgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||| ||||||    
T  15370035 cgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 481
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13890 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  |  || ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 425
Target Start/End: Original strand, 15464580 - 15464977
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||   ||  ||||| ||    
T  15464580 ttaagttgatatttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgaaatagtttaagaatgga 15464679  T
Q  130 acttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-ttaggtttttgcgacctttg 228  Q
      ||| ||  |   |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  | |||| ||||| |||||| | |||||    
T  15464680 tttttgggtgttacacctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttaggattttgcaatctttg 15464779  T
Q  229 ttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttga 327  Q
    | |||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||| ||||| || || |||||||||| | || ||||  ||||||| |     
T  15464780 tcgcacaagttgttatgagttgaaccttggagtagtaatgagaattgtatatgatattaatgatgatttgtgaagctgatatatgatgatttgatgtcgt 15464879  T
Q  328 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttt 425  Q
    |||  || |||||||||  ||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  15464880 ttaaaatttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 497
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  474 ggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||||  || ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 39705920 - 39706023
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  39705920 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacct 39706019  T
Q  111 ggaa 114  Q
    ||||    
T  39706020 ggaa 39706023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15551887 - 15551817
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15551887 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 482
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198658
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||   ||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  418 gctgt-ttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |   | ||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 43198658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 451
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  325 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 423  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 451  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12774077 - 12774011
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12774077 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 39706339 - 39706409
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39706339 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15093955 - 15093798
Alignment:
Q  316 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 414  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  |||| ||||||  ||| || |||||||||||  | ||    
T  15093955 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattat-tgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagt 15093857  T
Q  415 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||||||||| |||| | ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15093856 catgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15099821 - 15099665
Alignment:
Q  29 tttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattg 128  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||   ||  |||| ||    
T  15099821 tttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaatagtttaagaa-tg 15099723  T
Q  129 aacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || ||||| || |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15099722 aatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 482
Target Start/End: Original strand, 12288261 - 12288313
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288261 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 12288313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17046765 - 17046718
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046765 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 17046718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 8846426 - 8846360
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8846426 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13845028 - 13844950
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 89  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13845028 gatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaattatgattagaaaaga 13844950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 43198239 - 43198323
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||    
T  43198239 ttaagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattttagattgagattgaacatggaa 43198323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 15868286 - 15868368
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 112  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  15868286 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 15868368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3332287 - 3332201
Alignment:
Q  98 tgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3332287 tgagattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3332201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14685593 - 14685534
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14685593 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggataagattgaacct 14685534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 496
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121917
Alignment:
Q  323 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 421  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||  |     
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgatta 15121842  T
Q  422 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    || |||||| ||||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  15121843 ttgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14679434 - 14679325
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||  |||||| |||||  ||||  |||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  14679434 gagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaa 14679335  T
Q  101 gattgaacct 110  Q
    ||||||||||    
T  14679334 gattgaacct 14679325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15190788 - 15190703
Alignment:
Q  29 tttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||  ||||||| |||||||||    
T  15190788 tttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaa 15190703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 473
Target Start/End: Original strand, 16348700 - 16348757
Alignment:
Q  416 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16348700 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 473
Target Start/End: Original strand, 16356988 - 16357045
Alignment:
Q  416 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16356988 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 336
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 336  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17333346 - 17333298
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333346 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23838855 - 23838796
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  23838855 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 23838796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 46640507 - 46640558
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640507 actgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 53082203 - 53082254
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082203 actgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 13424 - 13506
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 112  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  13424 ttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 386038 - 386096
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  386038 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 386096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 7900855 - 7900913
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7900855 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 7900913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 15321778 - 15321836
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15321778 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 15321836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 51493502 - 51493560
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51493502 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 51493560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 32851921 - 32851868
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattag 83  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  32851921 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 32851868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 35171044 - 35170991
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  35171044 tgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 35170991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 40471890 - 40471837
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40471890 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacct 40471837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15190664 - 15190632
Alignment:
Q  153 cgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15190664 cgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15190632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Original strand, 20157130 - 20157182
Alignment:
Q  218 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 270  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20157130 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 20157182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24029022 - 24028970
Alignment:
Q  218 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 270  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24029022 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 24028970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Original strand, 26284598 - 26284650
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26284598 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 26284650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 39706052 - 39706092
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39706052 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 39706092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40478563 - 40478511
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40478563 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 40478511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 8155 - 8650
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8155 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttg-atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 8253  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8254 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggaattctggcctaaactcgccacggtgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 8353  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgggg-tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8354 agtgtcttgttaggtttt-gcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctg 8452  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| |||||    
T  8453 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgca 8552  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8553 attgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 8648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23370 - 22886
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23370 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggatctg 23271  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23270 gaaagattgtagaattgaa-ttttggaattctgaactgagctcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgtt 23172  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23171 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgttta 23072  T
Q  311 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattact 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  23071 agatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattatt 22972  T
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22971 atgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40410 - 39913
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40410 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaggaatgtaggatga 40311  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40310 gattgaacctg-acagattgtagaat-gaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 40213  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40212 agtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 40113  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||  |||  ||||     
T  40112 gaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcat 40013  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40012 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 481
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  478 taag 481  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 473
Target Start/End: Original strand, 18674 - 18749
Alignment:
Q  398 aattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||||  | || || ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18674 aattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13699 - 13211
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13699 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 13600  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    || ||||||||||| ||           ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13599 gactgaacctggaatga-----------aacttgtggcattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaatcag 13511  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13510 agtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgt 13412  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13411 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 13312  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13311 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 107)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29061025 - 29060540
Alignment:
Q  15 tcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29061025 tcgtgatttcgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaa 29060926  T
Q  115 agattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttagg 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29060925 agattgtagaat-gaacttttggaaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagg 29060827  T
Q  214 tttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaga 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060826 attttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaaga 29060727  T
Q  314 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatg 413  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  29060726 tgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 29060627  T
Q  414 tcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29060626 tcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 17287418 - 17287917
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17287418 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgt 17287517  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  17287518 gattgtacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcgattagaggctcttgtctcgtgagtgacccagaaacag 17287617  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17287618 agtgtcttgttagggttt-gctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgt 17287716  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  17287717 gaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaa 17287816  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17287817 ttgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 17287916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 22779849 - 22780348
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22779849 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 22779948  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22779949 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcaagcaaaggctctcgcctcgcgagtaacctagaaacag 22780048  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22780049 agtgtcctgttaggtttt-gtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgt 22780147  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  22780148 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaa 22780247  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22780248 ttgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 22780347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Original strand, 20360601 - 20361081
Alignment:
Q  9 aagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360601 aagatttcgtgtttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 20360700  T
Q  109 ctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtctt 207  Q
    |||||| ||           ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20360701 ctggaatga-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 20360789  T
Q  208 gttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20360790 gttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgt 20360888  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360889 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 20360988  T
Q  408 actatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  20360989 attatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 20637916 - 20638404
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637916 gagcatccaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 20638015  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20638016 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcacctcgcgagtgacccagaaacag 20638104  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638105 agtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgt 20638203  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20638204 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaa 20638303  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20638304 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 20638403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Original strand, 18409449 - 18409947
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18409449 gagcatgcaggatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatga 18409548  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18409549 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctctctagtgacccagaaacag 18409647  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18409648 agtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgt 18409747  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||   || ||  || |||||||| ||| |||||     
T  18409748 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcat 18409847  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409848 ttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 19303163 - 19303661
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303163 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 19303262  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19303263 gattgaacctgaaaagatt-tagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccagaaacag 19303361  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19303362 agtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgt 19303461  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||     
T  19303462 gaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcat 19303561  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19303562 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 19303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20594272 - 20593773
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  20594272 gagcttgcaagatttcgtgatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtctaaatatgattagggaagaatgtaggatga 20594173  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20594172 gattgaacctggaaagattgtagaata-aacttttggaaatctgacctgaactcgctacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 20594074  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20594073 agtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgt 20593974  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||   ||   || ||| || |||||||| ||| |||||     
T  20593973 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcat 20593874  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20593873 ttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20593774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 500
Target Start/End: Original strand, 25628983 - 25629476
Alignment:
Q  7 gcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 106  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||| | || |  |||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  25628983 gcaagatttcatgattttgactttttagttgaaccttagatgttgttaagcgcctaaacatctctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattga 25629082  T
Q  107 acctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtc 205  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||||| || | ||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25629083 acctggaaatattttagaata-aacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgcc 25629181  T
Q  206 ttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagct 305  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25629182 ttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagct 25629281  T
Q  306 gtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgata 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  25629282 gtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgata 25629381  T
Q  406 ttactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||  |||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25629382 ttgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 16920266 - 16920751
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16920266 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggataa 16920365  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||| ||||||||           || ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16920366 gattgtacctggaa-----------ttaaacttatggaattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacaa 16920454  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||| || |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| |    
T  16920455 agtgacttgtt-ggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctat 16920553  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| | |     
T  16920554 gaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaat 16920652  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||   ||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  16920653 ttgatatacttatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgat 16920749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18457202 - 18456735
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18457202 atttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 18457103  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    ||   |||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||| || ||||||    
T  18457102 gattaatta-agaat-gaactttttggaagctgacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtt 18457006  T
Q  211 -aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tt 308  Q
     ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| ||    
T  18457005 caggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggcagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatt 18456906  T
Q  309 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 408  Q
    || ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  18456905 tatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 18456807  T
Q  409 ctatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     |||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456806 ttatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22831990 - 22831503
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||    
T  22831990 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtttgaacatgtctaatattgattagtgaagaatataggacga 22831891  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||  |      || |||    | ||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22831890 gattgaacctggaatta------aactga----tgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaaacaga 22831801  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | |||||| || ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||    
T  22831800 gtgacttgtt-ggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtg 22831702  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaat--atttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||  || |||||||||||||||||| |    
T  22831701 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 22831603  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     ||||||| | |||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||    
T  22831602 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 22831506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 18821463 - 18821731
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18821463 atttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 18821562  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    ||| ||           ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  18821563 gaatga-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgtt 18821651  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaatta 291  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||||    
T  18821652 a-gattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaatta 18821731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 29808505 - 29808691
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29808505 gagcatgtaagatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatga 29808604  T
Q  101 gattgaacctggaaaga-ttgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29808605 gattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 29808691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 28496095 - 28496280
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28496095 gagcatgtaagatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatga 28496194  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28496195 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Original strand, 25603007 - 25603478
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||    
T  25603007 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttgagttgaacctgaaacgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcatgatga 25603106  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaac--ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 198  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||  |||   || ||| |||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| |||  |  |   ||||    
T  25603107 gattggacctggaaagact-tagaatgaaacaacttaggattctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtctagaaca 25603205  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||| |  |||| |||   |||||| || ||| ||| |||||| | ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||| | || ||||||    
T  25603206 gagtgcattgtgagg-acttgcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctg 25603304  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||  |   |||||| || |||||| | ||||||  |    
T  25603305 tgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattata 25603403  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    | |||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25603404 aatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 333 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  333 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 473
Target Start/End: Original strand, 25611347 - 25611816
Alignment:
Q  3 gcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaga 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  25611347 gcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcagcatgaga 25611446  T
Q  103 ttgaacctggaaagattgtagaattgaac--ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||  |||   || ||| |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||  |  |   ||||||    
T  25611447 ttggacctggaaagact-tagaatgaaacaacttaggattctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgagctagtctagaacaga 25611545  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | |  |||| |||   |||||| || ||| ||| |||||  | ||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| |||||| |  | ||||| ||    
T  25611546 gtgcattgtgagg-acttgcgatctgtgtcgcatgagttacttagagttgaacctttgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatg 25611644  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||  |   |||||| || |||||| | ||||||  ||     
T  25611645 aagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaa 25611743  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25644811 - 25644338
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||  ||||| |||   ||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  25644811 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgttcatgtataacgttgattaggaaagattttagattgagattgaacct 25644712  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    | ||   ||  ||||| ||  ||| ||| |   ||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |   ||||  | ||||||    
T  25644711 gaaatagtttaagaatggatttttgggagttacacccgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcccggtttcagaatg-cttgtt 25644613  T
Q  211 -aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt-attgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 308  Q
     |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |  || ||||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  25644612 taggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgctgagagttgaaccttggggtagttataaagattatat-atgatattaatgatgatctgtgaagctgat 25644514  T
Q  309 -taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
     || ||||  ||||||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  25644513 atatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatatt 25644414  T
Q  408 actatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
      ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644413 gttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25644338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 11185990 - 11185524
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| | |||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||    
T  11185990 gagcatgtaagatttcgtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtcgaatattgattagtgaagagtgtaggacga 11185891  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  11185890 gattgaacctggaa-----------ttaaacttatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaaacat 11185802  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||  | | ||| | |||||| ||| |||||||||  ||| |||||   ||||||||    
T  11185801 agtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgt 11185703  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| | || |||   |||||| |||||||||| |     
T  11185702 gaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaat 11185604  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||| | |||||||   |||| ||||| |||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185603 ttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 333 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  333 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21939882 - 21939699
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21939882 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtaggatga 21939783  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21939782 gattgagcctggaaagact-tagaataaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21939699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19652685 - 19652512
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19652685 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacc 19652586  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcg 183  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19652585 tggaaagactttagaa-tgaatttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcg 19652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18334692 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19859019 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22782289 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 325 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  325 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  425 ttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 334 - 499
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8055091 tt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1561802 - 1561622
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1561802 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatga 1561703  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaat-tgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 181  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||   |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1561702 gattgaacctggaaaaact-tagaatgaaaacttttgagaatctgacc-gaacttgccacggcgagcataggctctcgcctcg 1561622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 4667835 - 4668019
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  4667835 gagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtga 4667934  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4667935 gattggacctggaaagagtttagaa-tgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 258 - 473
Target Start/End: Original strand, 15041430 - 15041644
Alignment:
Q  258 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 357  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | |||||| ||||||||||    
T  15041430 gggtagtaatgagacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgt-atgtgcatta 15041528  T
Q  358 cttgaagaatatgt-gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttattta 456  Q
    ||||| || | | | ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||| | || ||||||||||    
T  15041529 cttga-gattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttattta 15041627  T
Q  457 actaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15041628 actaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  ||||||||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25656691 gc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 4185445 - 4185629
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||    
T  4185445 gagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcatgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtagagtga 4185544  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4185545 gattgaacctggaaagagtttagaa-tgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4185629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  1541011 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 354 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  354 attacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttat 453  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  454 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4189455 - 4189271
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  4189455 gagcatgcaagattctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtga 4189356  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4189355 gattggacctggaaagagtttagaa-tgaatttttgtgaactgaacctaaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4189271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 4674682 - 4674866
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  4674682 gagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtga 4674781  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4674782 gattggacctggaaagagtttagaa-tgaatttttgtgaactgaaccttaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4674866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  16448626 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  351 tgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgt 450  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  451 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 27332916 - 27333089
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  27332916 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacct 27333015  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| || |   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27333016 ggaaagattttagaa-tgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 27393656 - 27393829
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  27393656 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacct 27393755  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| || |   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27393756 ggaaagattttagaa-tgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 15894052 - 15894237
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  15894052 gagcatgcaagatttcgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatga 15894151  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaat---tgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||    |||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||    
T  15894152 gattggacctggaaagact-tagaatgaaagaac-ttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgag 15894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848114
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||  ||||| |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||   || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Original strand, 8227366 - 8227632
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  8227366 gagttgttgagagttgaaccttagggtagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 8227465  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||    
T  8227466 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 8227564  T
Q  434 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  8227565 gcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 318 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 415  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  416 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 22334504 - 22334618
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  22334504 gagcatgcaagatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatga 22334603  T
Q  101 gattgaacctggaaa 115  Q
    ||||| |||||||||    
T  22334604 gattggacctggaaa 22334618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23992578 - 23992429
Alignment:
Q  346 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  23992578 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 23992483  T
Q  445 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  23992482 tattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 31155020 - 31155137
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||  ||  |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  31155020 gagcatgcaagattctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtagaatga 31155119  T
Q  101 gattgaacctggaaagat 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31155120 gattgaacctggaaagat 31155137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 27333269 - 27333339
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27333269 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 27394009 - 27394079
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27394009 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  439 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 481
Target Start/End: Original strand, 18821782 - 18821946
Alignment:
Q  316 tgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatg 413  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  ||||  ||||||||  ||||    
T  18821782 tgttaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatg 18821879  T
Q  414 tcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821880 gcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 318
Target Start/End: Original strand, 5834367 - 5834436
Alignment:
Q  249 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5834367 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 5834436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20177165 - 20177096
Alignment:
Q  249 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20177165 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 20177096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 318
Target Start/End: Original strand, 22158826 - 22158895
Alignment:
Q  249 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22158826 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 22158895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23019877 - 23019721
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| || ||| ||  | |||    
T  23019877 ttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtgtgataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgg-aatattttaagaatga 23019779  T
Q  130 actttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    | |||| ||| |   |||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  23019778 atttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggcccttgcctcgcgagt 23019721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 451
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  325 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 451  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 28496522 - 28496592
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  28496522 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 29808933 - 29809003
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  29808933 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19652265 - 19652199
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19652265 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 482
Target Start/End: Original strand, 9098565 - 9098617
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098565 actgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9098617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 22080368 - 22080543
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| | |||||  ||| |||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  | ||||||||||    
T  22080368 agatttcgtaactttaaacttttagttgaaccttagatgtttttgagtgactgaacatgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacc 22080467  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||   ||  ||||  |||||| | ||| |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22080468 tggaatagtttaagaa-cgaacttatgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33443116 - 33443068
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443116 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Original strand, 25956253 - 25956424
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||| | |||  ||||||| |||||    
T  25956253 gatttcgtaattttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaattacgattggaaaagattctagattgagatttaacct 25956352  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgc 182  Q
    ||||   ||  ||||| ||  ||||||| |   ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25956353 ggaatagtttaagaatggattttttggagttacacctgtattcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 25956424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 31164480 - 31164589
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||| |||  |||   |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31164480 gagcatgcaagattttgcaattttgacatttgagttgatacttggatgtccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggatga 31164579  T
Q  101 gattgaacct 110  Q
    ||||| ||||    
T  31164580 gattggacct 31164589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668389
Alignment:
Q  436 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 19668389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 500
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  453 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 488
Target Start/End: Original strand, 4185872 - 4185930
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 488  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  4185872 actgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 380 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18907226 - 18907134
Alignment:
Q  380 aagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||  | || |||||||| |||| | |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907226 aagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 381 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019425
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  480 ag 481  Q
    ||    
T  23019426 ag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22439298 - 22439230
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgt 69  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  22439298 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 22439230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 338
Target Start/End: Original strand, 31164727 - 31164807
Alignment:
Q  258 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtga 338  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  31164727 gggtagtagtgagacctaatgttgatgttagagataatttgtaaagctgtttaagatgttttgatgctaattaggatgtga 31164807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 22331862 - 22331803
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  22331862 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 22331803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23076800 - 23076749
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076800 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 27415576 - 27415619
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatcctta 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  27415576 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaacctta 27415619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 35008218 - 35008167
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008218 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 1538628 - 1538686
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1538628 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 1538686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 1544727 - 1544785
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1544727 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 1544785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16372280 - 16372223
Alignment:
Q  52 ttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  16372280 ttgagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 16372223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Original strand, 25641942 - 25641991
Alignment:
Q  136 ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25641942 ggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25641991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Original strand, 25642219 - 25642304
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  25642219 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 25642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 330
Target Start/End: Original strand, 16924759 - 16924830
Alignment:
Q  258 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 330  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  16924759 gggtagtaatgagacctaaggatgatgttaaatacaatctgt-tagctgtttaagacatgttgatgtttatta 16924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668688
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 19668688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20109685 - 20109605
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||||||| | ||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  20109685 ttaagttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 20109605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 31316781 - 31316821
Alignment:
Q  56 atgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 96  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31316781 atgcctgaacatgcctagtaatgattaggaatgaatgtagg 31316821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 23924 - 24406
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23924 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatga 24023  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24024 gattgaacctggaaa-attgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaa 24122  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24123 agtgccttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgt 24221  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttg-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24222 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgca 24321  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgt-ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24322 attgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8974 - 8479
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8974 gagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaatagtgattaggaaagaatgtaggatga 8875  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8874 gattgaacctagaaagattgtaaaatggaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacag 8775  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8774 agtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgt 8676  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  8675 gaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaa 8580  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8579 ttgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 493
Target Start/End: Original strand, 25687 - 26179
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25687 gagcttgcaagatttcatgtttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 25786  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787 gattgaacctgaaaagattgtagaat-gaatttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 25885  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25886 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctat 25985  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || ||| |||| |||||| ||     
T  25986 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacat 26085  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 33116 - 33479
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33116 gagcttgcaagatttcgtgattttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcctggacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 33215  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33216 gattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaagtcttacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgtgtgacccagaaacag 33315  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||| ||| |||||||| || |||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33316 agtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctat 33415  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  33416 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaa 33479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 374 - 497
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T
Q  474 ggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     |||||||| ||| ||||||||||    
T  44802 agtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 5743 - 6245
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5743 gagcatgcaagatttcgtgttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaggatga 5842  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactttt--ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 198  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| ||| |||   ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5843 gattgaacctgggaagattattgaat-gaaatttgcgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaaaca 5941  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5942 gagtgccttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatg 6040  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6041 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgca 6140  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgccta---tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 495  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6141 attgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 6240  T
Q  496 gatgt 500  Q
    |||||    
T  6241 gatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13591 - 13144
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13591 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtaggatga 13492  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13491 gattgaatctgaaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactg 13392  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13391 agtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgt 13293  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  13292 gaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaa 13193  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13192 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34619 - 34437
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34619 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 34520  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34519 gattgaacctgaaaagact-tagaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  425 ttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  444 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Original strand, 16837 - 17337
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16837 gagcatgcaagatttcttgtttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 16936  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 17035  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    ||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17036 agtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgt 17135  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||     
T  17136 aaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcat 17235  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctg--tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17236 ttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 17335  T
Q  498 tg 499  Q
    ||    
T  17336 tg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 79109 - 79430
Alignment:
Q  159 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||| || |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  79109 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaaccttg 79207  T
Q  258 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 356  Q
    |||||||  |||   ||    || || ||||| || ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||    
T  79208 gggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatcagtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatgcatt 79306  T
Q  357 acttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttattta 456  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||    
T  79307 acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgttgttattta 79405  T
Q  457 actaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  79406 actaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 78984 - 79096
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  78984 gagcatgcaagattttgtaattctgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtagaatga 79083  T
Q  101 gattgaacctgga 113  Q
    |||||||||||||    
T  79084 gattgaacctgga 79096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40355 - 39858
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40355 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggaggatga 40256  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  40255 gattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggtttctaacctgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaaaccga 40156  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40155 gtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaacctt-gggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtg 40057  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | | ||||| |    
T  40056 aagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatt 39957  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39956 tgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 182 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  182 cgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatg 281  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  282 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  382 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  482 tcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  25914 ttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 39553 - 39678
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39553 gagcatgccagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatga 39652  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaat 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39653 gattgaacctggaaagaatgtagaat 39678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26662 - 26555
Alignment:
Q  63 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  26662 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattaaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggattctgacctgaagtcgccacggcg 26563  T
Q  163 agtagagg 170  Q
    || |||||    
T  26562 agcagagg 26555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 185
Target Start/End: Original strand, 59181 - 59308
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| | ||| |||||| |||| |||    
T  59181 tgcctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagact-tagaatgaaaatttagagaacctgacc-gaactcgc 59278  T
Q  156 cacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  59279 catggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Original strand, 339573 - 340065
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  339573 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcctgaatttgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatga 339672  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  339673 gattgaacctggaaagattgtagaa-tgaacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatag 339771  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  339772 agtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgt 339870  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||| |     
T  339871 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-at 339969  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  339970 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  158550 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  325 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 451  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 71785 - 71742
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatcctta 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  71785 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaacctta 71742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5007 - 4508
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5007 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatga 4908  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgt-agaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4907 gattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacag 4808  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
     |   || |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807 ggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 4708  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||     
T  4707 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcat 4608  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  4607 ttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatg 4509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12589 - 12090
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12589 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatga 12490  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgt-agaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12489 gattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacag 12390  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
     |   || |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12389 ggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 12290  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||     
T  12289 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcat 12190  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  12189 ttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatg 12091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22541 - 22042
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22541 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatga 22442  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgt-agaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22441 gattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacag 22342  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
     |   || |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341 ggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 22242  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||     
T  22241 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcat 22142  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  22141 ttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatg 22043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 682 - 1169
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  682 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatga 781  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||    |||||| | | |||     | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  782 gattgaacct----agattgaa-acttg-----tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 871  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  872 gtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttg 970  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  971 aagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 1069  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1070 tgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 7 - 500
Target Start/End: Original strand, 16227 - 16721
Alignment:
Q  7 gcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16227 gcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattga 16326  T
Q  107 acctggaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtc 205  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  16327 acctggaaagattttcgaatgaaacgtttggaaatctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgcc 16426  T
Q  206 ttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagct 305  Q
    ||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16427 ttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagct 16526  T
Q  306 gtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgata 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || ||||| || ||| || || ||||||    
T  16527 gtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgata 16626  T
Q  406 ttactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16627 ttattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 7)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 125081 - 124677
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125081 gagcatgcaagatttggtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 124982  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |   ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  124981 g---gaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaaag 124885  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  124884 agtgtcttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgt 124786  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  124785 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaa 124686  T
Q  400 ttgatatta 408  Q
    |||||||||    
T  124685 ttgatatta 124677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 63051 - 62935
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  63051 agatttcgtaaatttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 62952  T
Q  110 tggaaagattgtagaat 126  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  62951 tggaaatattttagaat 62935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 322 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  322 tgttgattatgatgtgatataatgttatgt-gcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 420  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||| | ||||||| |  ||||||||||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  421 gtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 175263 - 175202
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctg 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  175263 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 186
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136173
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 136173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 186
Target Start/End: Original strand, 144840 - 144881
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 144881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5336 - 4849
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5336 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 5237  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           ||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5236 gattgaacctggaatga-----------aacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcttgcctcgcgagtgacctagaaacag 5148  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| || ||| | | ||||||||||| |  ||||  ||||||||||    
T  5147 agtgacttgttag--ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgt 5050  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||     
T  5049 gaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcat 4950  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4949 ttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5200 - 4712
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5200 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 5101  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||| ||||||           || ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  5100 gattgaatctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataag 5012  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  5011 agtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgt 4912  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||    
T  4911 gaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaa 4813  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4812 ttgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 424 - 1
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 325  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||| ||||||           || ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  324 gattgaatctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataag 236  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  235 agtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgt 136  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||    
T  135 gaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaa 37  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 435  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||| |||||    
T  36 ttgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 112 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 39864 - 39479
Alignment:
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  39864 gaaagattgtagaat-gaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtc 39766  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 310  Q
    ||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39765 aggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgttta 39666  T
Q  311 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattact 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  39665 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 39566  T
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39565 atgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 112 - 498
Target Start/End: Original strand, 74948 - 75333
Alignment:
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  74948 gaaagattgtagaat-gaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtc 75046  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 310  Q
    ||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  75047 aggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgttta 75146  T
Q  311 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattact 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  75147 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 75246  T
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  75247 atgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13983 - 13497
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13983 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagcatga 13884  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| || || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13883 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgagattctgagctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacag 13795  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13794 agtgacttgttagatttt-gcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgt 13696  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||| | ||    
T  13695 gaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaa 13597  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatg 13498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 10059 - 10544
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10059 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 10158  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10159 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 10247  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  10248 agtgacttgttagatttt-gcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgt 10346  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  10347 gaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaa 10445  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10446 ttgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 15098 - 15584
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15098 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 15197  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||      || || |    | | ||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15198 gattgaacctggaa------taaaact----tgtaggattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 15287  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  15288 gtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtg 15386  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||    
T  15387 aagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaat 15485  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  15486 tgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 32898 - 32968
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtct 71  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32898 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcctgaacatgtct 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7295
Alignment:
Q  323 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-g 421  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| | ||| ||| | |||  |||| | |    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat--catgattg 7370  T
Q  422 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  7369 ttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32552 - 32067
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32552 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgactaggaaagaatgtgggatga 32453  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| ||| || ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32452 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 32364  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    ||   ||| ||  | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  32363 agttactt-ttttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgt 32265  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||    
T  32264 gaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaa 32166  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32165 ttgatattattatgtcatgttg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 2440 - 1952
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2440 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataataattaggaaggaatgtaggatga 2341  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || |||||  || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2340 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 2252  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||| | ||||| |||    
T  2251 agtgacatgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgt 2153  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
     ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2152 aaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaa 2053  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  2052 ttgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21389 - 20910
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21389 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatga 21290  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||| |||||||| ||           ||||| |         ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21289 gattgtacctggaatga-----------aacttgt---------cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaaaaacaga 21210  T
Q  201 gagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 300  Q
    | | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21209 gtgacttgttgagtttt-gcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtg 21111  T
Q  301 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21110 aagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaat 21011  T
Q  401 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21010 tgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 32581 - 33077
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||    
T  32581 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatga 32680  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||  |  || |||  ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32681 gattgaacctgtaaagattttagaat-gaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacag 32779  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  32780 aatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgt 32879  T
Q  300 gaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32880 gaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgca 32976  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32977 attgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 33075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 46424 - 45928
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||    
T  46424 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatga 46325  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||  |  || |||  ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  46324 gattgaacctgtaaagattttagaat-gaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacag 46226  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  46225 aatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgt 46126  T
Q  300 gaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  46125 gaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgca 46029  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46028 attgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 45930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16585 - 16323
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16585 gagcatgcaagatttcaagattttgacttttgagttgatccttagg-gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacga 16487  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16486 gattgaacctggaaagattgtagaattgaa-ttttggaattctgaactgagctcgccacggcgatcagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaacag 16388  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16387 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagt 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 289 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  289 ttataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgtt 387  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||   || ||| || ||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  388 gatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatg 487  Q
    | ||  ||||| |||||||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  488 aagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 500
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  439 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 685 - 1170
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  685 gagcattcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 784  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  785 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccagaaacag 873  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  874 agtgacttgttagatttt-gcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgt 972  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||    
T  973 gaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaa 1071  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||| | ||||||||| ||   ||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  1072 ttgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 584 - 1006
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  584 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagaacga 683  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaa-tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 198  Q
    ||||||||||||     | | |||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  684 gattgaacctggtttagtag-agaatgaaacttgttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaaaca 782  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||    
T  783 gagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatg 882  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||| ||| ||| ||||     
T  883 tgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc- 981  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtt 423  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  982 attgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 434 - 500
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 8114 - 8227
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || | |||| | ||||  ||| || |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||| ||||    
T  8114 gagcttgcaagatttcgtgattttgagttgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggcaaggttttagaatga 8213  T
Q  101 gattgaacctggaa 114  Q
    |||||||| |||||    
T  8214 gattgaacttggaa 8227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 5022 - 4545
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||    
T  5022 gagcttgcaagatttcgtgactttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaatgactagggaagattgtagaatga 4923  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttgga-atctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||| ||||||  | ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  4922 gattgaacctgaaaagattttagaat-gaacttttgtcgatcagacctgtcctcgccatggcgagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaacag 4824  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  4823 aatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgt 4724  T
Q  300 gaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 398  Q
    || |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||  |    
T  4723 gaggctgttttaaga--tgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattata 4626  T
Q  399 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
     |||||||||  || || ||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4625 tttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 213 - 500
Target Start/End: Original strand, 2985 - 3271
Alignment:
Q  213 gtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2985 gtttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaag 3084  T
Q  313 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactat 412  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||    
T  3085 atgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 3184  T
Q  413 gtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3185 gtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 643 - 835
Alignment:
Q  9 aagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    ||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  643 aagattttgtgattttgaccttcgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaat 742  T
Q  109 ctggaaagattgtagaattgaacttttgg-aatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagag 201  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  743 ctgaaaagattgtagaa-tgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagag 835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16767 - 16282
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16767 gagcatgcaagatttcgtacttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacga 16668  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatct-gacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||| ||           || ||||| ||| || | |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16667 gattgaacctgaaa-----------ttaaacttatgggattttgaccagaactcggcacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 16579  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  16578 agtgacttgtt-ggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgt 16480  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||| |||||||||||||| |     
T  16479 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaat 16381  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||| | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  16380 ttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20902 - 20595
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902 gagcatgtaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 20803  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20802 gattgaacctggaaagattatagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacag 20703  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20702 agtgccttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgt 20604  T
Q  300 gaagctgtt 308  Q
    |||||||||    
T  20603 gaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 481
Target Start/End: Original strand, 51517 - 51985
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51517 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 51616  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatct-gacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt 210  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  51617 gaaagattgtcgaatgaaacttgtgggattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgtt 51716  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 310  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |    
T  51717 agatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgtt-a 51814  T
Q  311 agatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatatta 408  Q
     ||  | || ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  |||| ||||||||||    
T  51815 tgagatattaatgttgatttatgatgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgc-attgatatta 51912  T
Q  409 ctatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     |||||| |||| |||||| |  ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51913 ttatgtcttgctatttttgaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33006 - 32784
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    ||||||||| | ||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||   |   ||||| ||    
T  33006 ttaagttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacttggaatagtctaagaatgga 32907  T
Q  130 acttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtt-tttgcgacctttg 228  Q
      ||| ||| |   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||  | |||||| ||||   ||||| |||||    
T  32906 tttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgttgggttaaatgcgatctttg 32807  T
Q  229 ttgcacgagttgttgagagttga 251  Q
    | |||||||||| || |||||||    
T  32806 tcgcacgagttgatgtgagttga 32784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32643 - 32538
Alignment:
Q  393 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 491  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  32643 attgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 32547  T
Q  492 tgatgatgt 500  Q
    |||||||||    
T  32546 tgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7098 - 6669
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||| |||||||||| |  |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7098 gagcacgcaagatttcatatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataattattaggaaggaatgtaggatga 6999  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || |||||  || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6998 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacag 6910  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| | |||| |||||||||||    
T  6909 agtgacatgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgt 6811  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
     ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6810 aaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcta 6711  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgt 441  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  6710 ttgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Original strand, 4764 - 5246
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 4863  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           |||||||| ||| || ||||||||||| |||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4864 gattgaacctggaa-----------ttgaacttatgggattctgacctgaactcgccaaagagagcagaggatctcgcctcgcgagtgacacagaaacag 4952  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||    
T  4953 agtgacttatt-ggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgt 5051  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    ||| |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |     
T  5052 gaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaat 5150  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||| | ||||||||| ||   ||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  5151 ttgatataattatgtcatgatg---ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 47474 - 46995
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47474 gagcatgcaagatttcgtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatga 47375  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| ||| || ||||||||| | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  47374 gattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgagctcgccacggagcgcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaccag 47286  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||   |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  ||||       ||||||||||    
T  47285 agtgacttgttagaaatg-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgt 47193  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||    
T  47192 gaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaa 47094  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  47093 ttgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 107 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28223 - 27911
Alignment:
Q  107 acctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28223 acctggaaagatt-tagaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgcc 28125  T
Q  206 ttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagct 305  Q
    |||| ||| |||||| | || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28124 ttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagtt 28025  T
Q  306 gtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgata 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  28024 gtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgata 27925  T
Q  406 ttactatgtcatgc 419  Q
    ||| ||||||||||    
T  27924 ttattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29035 - 28924
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29035 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 28936  T
Q  101 gattgaacctgg 112  Q
    ||||||||||||    
T  28935 gattgaacctgg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1774 - 1289
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||| |     
T  1774 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtaggacgt 1675  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| |||||| || | |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1674 gattgaacctggaa-----------ttaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 1586  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| |    
T  1585 agtgacttgtt-ggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctat 1487  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |     
T  1486 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaat 1388  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||| | ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  1387 ttgatataattatgtcatgatg---ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 1291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7751 - 7266
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||| |     
T  7751 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtaggacgt 7652  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||           || ||||| |||||| || | |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7651 gattgaacctggaa-----------ttaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 7563  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| |    
T  7562 agtgacttgtt-ggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctat 7464  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |     
T  7463 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaat 7365  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||||||| | ||| |||   |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  7364 ttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 7268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 432 - 497
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10657 - 10323
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||       |    
T  10657 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgcctagtagtgattaggaaagaatg-------a 10565  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaa--tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||  ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||||    
T  10564 gattgaacctggaaagattttagaatgaaaaattttcaaattctgacctgaactcgccacggcgagcagagcttcccgcctcgcgagtgacctagaaaca 10465  T
Q  199 gagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
     || | ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10464 aagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctg 10365  T
Q  299 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17268 - 16784
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17268 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17169  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-tt 210  Q
    || ||||| ||||||  ||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |  |||| ||    
T  17168 gatagattttagaataaaactttgagaatatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacaga-atacttgttt 17070  T
Q  211 aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-ttt 309  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    | ||  ||||  |||   ||  | ||||| || ||||||||||||| |||    
T  17069 aggattttgcgatctttgtagcacgagtcgttgatagttgaaccttataatggttatgagtattatatatattattaatgatgatctgtgaagctgattt 16970  T
Q  310 aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattac 409  Q
    | ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||     
T  16969 atgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 16871  T
Q  410 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16870 tatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Original strand, 7471 - 7576
Alignment:
Q  79 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  7471 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggataatctga-ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgc 7568  T
Q  178 ctcgcgag 185  Q
    ||||||||    
T  7569 ctcgcgag 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 52067 - 51582
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||||| |||| | ||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52067 gagcttgcaagatttcgtattttttacttttgagttaaacctttgatgcctttgagtgcctgaacaagtctaataatgattaggaaagaatgtaggacga 51968  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||| ||           |||||  || || || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51967 gattgaacctggaatga-----------aacttacgggattctaacctgagctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 51879  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||| ||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||||    
T  51878 agtgacttgttagatttt-gcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgt 51780  T
Q  300 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaa 399  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||| |     
T  51779 gaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaat 51681  T
Q  400 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    ||| ||| | ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  51680 ttgttataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgat 51584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 108967 - 109055
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 98  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  108967 agatttcgtgtttcgaccttttaagttgaaccttgtatacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 109055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1382 - 1052
Alignment:
Q  21 ttttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 120  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  1382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatga--- 1286  T
Q  121 tagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttg 219  Q
            ||||| ||| || |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||| ||  ||| |    
T  1285 --------aacttgtgggattctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagacttt-g 1195  T
Q  220 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1194 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgtt 1095  T
Q  320 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 362  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1094 gttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 481
Target Start/End: Original strand, 20048 - 20524
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20048 gagcatgcaagatttcgtgaatttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtagaatga 20147  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaac-ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    |||||||||||||   |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |   ||||    
T  20148 gattgaacctggattaatt-aagaa-tgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagttgcctaattacag 20245  T
Q  200 agagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 298  Q
    | || |||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||   ||    || |||||||| || |||||    
T  20246 a-agccttgtttaggattttgcggtctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgggatagttatgaatattgtatataatgttaatgatgatctg 20344  T
Q  299 tgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgc 397  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||    
T  20345 tgaagctgatttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 20442  T
Q  398 aattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    | ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20443 atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 333 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  333 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |        
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 472
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 403 - 163
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  403 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 304  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttgga-atctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  303 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaactttttgagttctgacctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgccacgcgagtgacccagaaacag 205  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgt 241  Q
    || | ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||    
T  204 agtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgt 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 17630 - 17929
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17630 gagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 17729  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaactt-ttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||                     ||| ||||||||| ||    
T  17730 gattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcg---------------------agtcacccagaaatag 17808  T
Q  200 agagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 299  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17809 agtgacttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgt 17907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3949 - 3640
Alignment:
Q  21 ttttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 120  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  3949 ttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatga--- 3853  T
Q  121 tagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttg 219  Q
            ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  ||| |    
T  3852 --------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-g 3762  T
Q  220 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3761 tgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 3662  T
Q  320 gatgttgattatgatgtgatat 341  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  3661 gttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8013 - 7704
Alignment:
Q  21 ttttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 120  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  8013 ttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatga--- 7917  T
Q  121 tagaattgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttg 219  Q
            ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  ||| |    
T  7916 --------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagacttt-g 7826  T
Q  220 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825 tgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 7726  T
Q  320 gatgttgattatgatgtgatat 341  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  7725 gttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 482
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27852
Alignment:
Q  294 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  393 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
     || || ||||||||  ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 27852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 27293 - 27375
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 112  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  27293 ttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctgg 27375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 11171 - 11450
Alignment:
Q  26 acttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaa 125  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||            
T  11171 acttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatga-------- 11262  T
Q  126 ttgaacttttggaat-ctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacc 224  Q
       ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || | |||||||| |||| ||||||    
T  11263 ---aacttgtgggatactgacctgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagatttt-gcgacc 11358  T
Q  225 tttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11359 tttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 378 - 500
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  378 ttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  478 taagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 14055
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattagg 84  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14109 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 296 - 499
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  296 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaatt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  396 gcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 495  Q
     || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  496 gatg 499  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1700 - 1947
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1700 gagcttgcaagattctgtgattttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 1798  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1799 gattgaacctggaaagattttagaatgaaactttggaaatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacaga 1898  T
Q  201 gagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtt 249  Q
     |  |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  1899 -atgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagtt 1947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 15237 - 15500
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15237 gagcatgcaagatatcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatga 15336  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||| |    
T  15337 gattgaatctggatagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttaca-a 15435  T
Q  201 gagtcttg-ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt 264  Q
     |  |||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15436 aatacttgcttaggatttttcgatctttgtcgcacgaatcgttgagagttgaaccttggggtagt 15500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12749 - 12587
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |||  |||| | | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  12749 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 12651  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12650 gctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20611 - 20426
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20611 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaataa 20512  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttgga-atctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20511 gattgaacctggaaagatt-tagaatgaaacttttggagttctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcgagt 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 23934 - 24001
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23934 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 362 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  362 aagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 461  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  462 gctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28452 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11362 - 11292
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11362 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1997
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2067 actgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14976 - 14914
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctga 63  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  14976 gagcatgcaagattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgctttggagtgcctga 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 18580 - 18705
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580 gagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 18679  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18680 gattgaacctggaaagattgtagaat 18705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12416 - 12165
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12416 atttcgtgattttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12317  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaac-ttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttg-t 209  Q
    ||   |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||   ||||| || | || |    
T  12316 gattaatt-aagaa-tgaactttttggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacaga-agccctgtt 12220  T
Q  210 taggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt 264  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12219 taggattttgcgatctttgtcacacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 12165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  439 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 274 - 437
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  274 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  373 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcct 437  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 2707 - 2826
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2707 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 2806  T
Q  101 gattgaacctggaaagattg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2807 gattgaacctggaaagattg 2826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 12431 - 12611
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12431 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 12530  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgc 182  Q
    |||||||||||||||||   ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12531 gattgaacctggaaaga-catagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 12611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 526 - 344
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  526 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgaattgaaccttagatgcctt-gagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 428  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  427 gattgaacctggaaatact-tagaatggaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 7916 - 8099
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7916 gagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 8015  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||| | | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8016 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatct-aacagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 481
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53651
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53588 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 53122 - 53204
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 112  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  53122 ttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 53204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 79954 - 80137
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79954 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaacattaaatgccattgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatga 80053  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  80054 gattgaacctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22773
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  473 cggtctaagt 482  Q
    ||||||||||    
T  22764 cggtctaagt 22773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7301 - 7126
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7301 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 7202  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7201 tggaaagattttagaa-tgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgag 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 6882 - 6831
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6882 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8486 - 8330
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||  || ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||   ||  ||||| ||    
T  8486 ttaagttgaaccttaaatgtttttgggtgtctgaatatgtgtaataatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 8387  T
Q  130 acttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
      ||| ||| |   |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8386 tttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtggaggccctcgcctcgcgagt 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 2067 - 2250
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2067 gagcatgcaagattttgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 2166  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2167 gattgaacctgaaaagact-tagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 133143 - 132967
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  133143 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 133044  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  133043 tggaaagactttagaa-tgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 132967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 62268 - 62200
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  62268 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  437 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 10)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 493
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  337 gatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttttt-gtaaactgc 435  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  436 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44514 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 101884 - 101709
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  101884 agatttcgtaatttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 101785  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||| ||| | ||||| |||| |||  |||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  101784 tggagagactttagaa-tgaattttgtgaacttgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagt 101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 367 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 100507 - 100378
Alignment:
Q  367 tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctg 465  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 100409  T
Q  466 catgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  100408 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 293 - 473
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38573
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatg 391  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| ||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttg 38491  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    || || |||||||||||  | |||||| |||| |||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38492 aaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 38573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 119945 - 119875
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  119945 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 40225 - 40291
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  40225 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 101569 - 101503
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  101569 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 408
Target Start/End: Original strand, 23581 - 23695
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaagatgttgatg 391  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||||| ||    
T  23581 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttg 23678  T
Q  392 aattgcaattgatatta 408  Q
    || || |||||||||||    
T  23679 aaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10409 - 10226
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10409 gagcatgtaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctattattgattaggaaagaatgtaggatga 10310  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||||||||| | |||||   |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10309 gattgaacctggaaagact-tagaaggaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 9457 - 9639
Alignment:
Q  2 agcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9457 agcatgcaagatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggatgag 9556  T
Q  102 attgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9557 attgaatctggaaagact-tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13392
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13454 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 13230 - 13340
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230 gagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 13329  T
Q  101 gattgaacctg 111  Q
    |||||| ||||    
T  13330 gattgagcctg 13340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9575 - 9391
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  9575 gagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtga 9476  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9475 gattggacctggaaagagtttagaa-tgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16157 - 15974
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16157 gagcatgcaagattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 16058  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||| ||||| |  | |||  || ||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16057 gattgaacctgaaaagact-caaaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 424 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15664
Alignment:
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15738 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1339
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  1424 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 28902 - 29081
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28902 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatga 29001  T
Q  101 gattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 181  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||  || ||| | |||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29002 gattgaacctagaaagact-tagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcg 29081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 482
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8177
Alignment:
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 8177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32573 - 32397
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32573 agattttgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 32474  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32473 tggaaagactttagaa-tgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagt 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 32151 - 32102
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  32151 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12786
Alignment:
Q  323 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 421  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||  |||||  ||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 12838  T
Q  422 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    || |||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12837 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtc 12786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 125797 - 125855
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  125797 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 125855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| || || ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 13421 - 13147
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 308  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  | ||    ||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  13421 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgtt 13322  T
Q  309 -taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaata-tttaagatgttgatgaattgcaattgatat 406  Q
     |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  13321 ataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatat 13222  T
Q  407 tactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13221 tgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 482
Target Start/End: Original strand, 15866 - 16203
Alignment:
Q  147 tgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgag 245  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||  |||||  | |||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||  |    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatg 15965  T
Q  246 agttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 344  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | ||    ||||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15966 agttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataat 16065  T
Q  345 gttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 444  Q
      ||| |||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||||| ||| || || ||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||| |||||||||     
T  16066 tgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgt 16164  T
Q  445 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16165 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 16203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 2731 - 2680
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2731 actgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 493  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 161173 - 161000
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  161173 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 161074  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || ||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  161073 gagagactttagaa-tgaatttttgtgaactgaacctgaagtcgccatggcgagtagaggctctcacctcacgag 161000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 294 - 497
Target Start/End: Original strand, 85539 - 85742
Alignment:
Q  294 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 391  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| |    
T  85539 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattg 85637  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 491  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  85638 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 85736  T
Q  492 tgatga 497  Q
    ||||||    
T  85737 tgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 160754 - 160688
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  160754 actgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 24272 - 24456
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgatttta-acttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24272 gagcatgcaagatttcgtgatttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatttaggatg 24371  T
Q  100 agattgaacctggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||  |||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24372 agattgaacctagaaagact-tagaatgaaactttggataatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 318 - 500
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38377
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    | |||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  38295 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 28440 - 28616
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  28440 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 28539  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |   |||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28540 tacgaagactttagaa-tgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 28820 - 28887
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28820 actgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 620 - 437
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||     
T  620 agatttcgtaattttgacttttgaattgatccttagacttttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaact 521  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 193  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| || |   |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  520 tggaaagattttagaa-tgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Original strand, 17882 - 18148
Alignment:
Q  235 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  17882 gagttgttgaaagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 17981  T
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||| || || || | | |    
T  17982 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataat 18080  T
Q  434 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  18081 gcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 6454 - 6557
Alignment:
Q  5 atgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagatt 104  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6454 atgcaagatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgccttttagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagatt 6553  T
Q  105 gaac 108  Q
    ||||    
T  6554 gaac 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 497
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2291
Alignment:
Q  294 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 391  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| ||| || |    
T  2088 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattg 2186  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 491  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |    
T  2187 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaa 2285  T
Q  492 tgatga 497  Q
    ||||||    
T  2286 tgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 6561 - 6617
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagag 201  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6561 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagag 6617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10643 - 10540
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643 gagcttgcaagatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 10544  T
Q  101 gatt 104  Q
    ||||    
T  10543 gatt 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 481
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60818
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgtt-aggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttg 243  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||     ||||| ||| ||||| || |||||| ||||||| ||||     
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatacattgtttagggttttgtgatctttgtcgcacgagatgtta 60578  T
Q  244 agagttgaaccttggggtagtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 341  Q
     ||||||||||||||||||| | || ||| |  || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || |||||||||    
T  60579 tgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtat-atgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatat 60677  T
Q  342 aatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat--gctgtttttgtaaactgcctat 439  Q
    | |  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||  ||| ||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  60678 atttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctat 60775  T
Q  440 gttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60776 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 130397 - 130222
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||    
T  130397 agatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacc 130298  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    |||||   ||  ||||| ||  ||| |||||   |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  130297 tggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  473 cggtctaagtcgatga 488  Q
    |||||||||| |||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 2434 - 2609
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||| | ||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  2434 agatttcataattttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacc 2533  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    || ||||||| ||||| |||| |||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2534 tgtaaagattttagaa-tgaaatttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 496
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||  ||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 499
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 499  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8484
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 415  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  416 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7026 - 6923
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  7026 agatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatg-ttttgagtgcctggacatgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacc 6928  T
Q  110 tggaa 114  Q
    |||||    
T  6927 tggaa 6923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 498  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 45420 - 45596
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  45420 agattttgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacc 45519  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||| |||| | ||||||  |  ||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45520 tggtaagactttagaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 45843 - 45909
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  45843 actgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19756 - 19573
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||| || ||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  19756 agattttgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacc 19657  T
Q  110 tggaaagattgtagaattgaactttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 193  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||  |  |   |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19656 tggaaagattttagaa-tgaatttttatgtgttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 19573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 334 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29947
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29994 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 29947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 225698 - 225482
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-t 307  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||   ||||| ||||| || | ||||||||||| |    
T  225698 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaagattatatatgatattaataatgaactgtgaagctgat 225599  T
Q  308 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 407  Q
     || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  225598 atatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatatt 225500  T
Q  408 actatgtcatgctgtttt 425  Q
    | ||| ||| ||||||||    
T  225499 attatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 227942 - 227878
Alignment:
Q  50 ttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  227942 ttttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaa 227878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 497
Target Start/End: Original strand, 161049 - 161252
Alignment:
Q  294 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 391  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||||||||| |    
T  161049 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatattg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 161147  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 491  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  161148 acttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaaga 161246  T
Q  492 tgatga 497  Q
    ||||||    
T  161247 tgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 417
Target Start/End: Original strand, 164550 - 164674
Alignment:
Q  294 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga-tg 391  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||||||||| ||    
T  164550 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 164648  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  164649 acttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    | || ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3420 - 3318
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  3420 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 3321  T
Q  112 gaa 114  Q
    |||    
T  3320 gaa 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 15462 - 15636
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  15462 gatttcgtaattttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacct 15561  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||   ||  ||||| ||  ||| |||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15562 ggaatagtttaagaatggatttttcggaattacacatgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 15636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 15828 - 15898
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15828 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 433 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 113
Target Start/End: Original strand, 2277 - 2378
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  2277 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 2376  T
Q  112 ga 113  Q
    ||    
T  2377 ga 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 2696 - 2762
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2696 actgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  334 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 432  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 494  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Original strand, 8995 - 9080
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  8995 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Original strand, 1934 - 2108
Alignment:
Q  12 atttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 111  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |     
T  1934 atttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacata 2033  T
Q  112 gaaagattgtagaattgaacttttggaatctg-acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
     ||||| | ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2034 aaaagactttagaa-tgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 318 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11464
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    | |||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11546 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 374 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  474 ggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 129022 - 129072
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129022 actgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78345
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 80788 - 80726
Alignment:
Q  50 ttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 112  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  80788 ttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 80726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 116631 - 116579
Alignment:
Q  285 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 336  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  116631 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatatgttaatgttgattatgatgt 116579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Original strand, 128735 - 128775
Alignment:
Q  145 cctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 128775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  335 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg-aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  434 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
     |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6083 - 5979
Alignment:
Q  10 agatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||     
T  6083 agatttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacaggtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaact 5984  T
Q  110 tggaa 114  Q
    |||||    
T  5983 tggaa 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  473 cggtctaagtcgatga 488  Q
    |||||||||| |||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26850
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 391  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 26931  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatg-ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 474  Q
    ||||| ||||||||| | ||  |||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26930 aattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcg 26850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 451
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  325 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 451  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 15052 - 15106
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttga 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  15052 gagcatgcaagatttcgtgattttcacttttgagttgaaccttagatgcctttga 15106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 497
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38820
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||  ||| ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  418 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 497  Q
    | |||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  38741 gttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 496
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| || |||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttctta-ctgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  473 cggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 479
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  318 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 417  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  418 --gctgtttttgtaaactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
      ||||  |||| | |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8098 gagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 7708 - 7864
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||| |||   ||  |||| |||    
T  7708 ttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctagaatagtttaagaa-tga 7806  T
Q  130 actttt-ggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    | |||| ||  |   |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7807 atttttgggggttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24048 - 23979
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 363  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24048 aatctgtgaagctgtt-aagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaa 23979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 293 - 473
Target Start/End: Original strand, 16264 - 16442
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaagatgttgatg 391  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||||| ||    
T  16264 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttg 16361  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    || |  |||||||||||  | |||||| |||| |||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16362 aaat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||||||| | | | ||||||||  ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  473 cggtctaag 481  Q
    |||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7102 - 6931
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  7102 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacct 7003  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgc 182  Q
    ||||   ||  ||||| ||  ||| |||||   |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7002 ggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 6931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14482 - 14311
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  14482 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacct 14383  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgc 182  Q
    ||||   ||  ||||| ||  ||| |||||   |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14382 ggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 14311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6611
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6681 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14061 - 13991
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14061 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13429 - 13255
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  13429 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 13330  T
Q  111 ggaaagattgtagaattgaacttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    ||||   ||  |||| |||| ||||| || |   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13329 ggaatagtttaagaa-tgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12942
Alignment:
Q  377 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 475  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  476 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||   |||||||||||||||    
T  12963 tctaagt---tgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 29841 - 29950
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||  ||||   |||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  29841 gagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaa 29940  T
Q  101 gattgaacct 110  Q
    ||||||||||    
T  29941 gattgaacct 29950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 41837 - 41946
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||  ||||   |||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  41837 gagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaa 41936  T
Q  101 gattgaacct 110  Q
    ||||||||||    
T  41937 gattgaacct 41946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 6174 - 6244
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6174 actgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 109
Target Start/End: Original strand, 5772 - 5852
Alignment:
Q  29 tttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||||||||  |||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  5772 tttaagttgaatcttagatgtttttgagtacctgaacatgtataataatgattaggaaaaattgtagattgagattgaacc 5852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  331 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatat--ttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 427  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |   |||||||  ||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  428 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||| || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1078 - 962
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  1078 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgctagaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatga 979  T
Q  101 gattgaacctggaaaga 117  Q
    ||| | |||||||||||    
T  978 gataggacctggaaaga 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10644
Alignment:
Q  374 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  473 cggtctaagt 482  Q
    ||||||||||    
T  10635 cggtctaagt 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 10200 - 10278
Alignment:
Q  11 gatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 89  Q
    |||||||| ||||| || ||| || ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10200 gatttcgtaattttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagtaaaga 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 186
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10347
Alignment:
Q  144 acctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10305 acctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 10894 - 10970
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataat 77  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10894 gagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 10970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 500
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1155
Alignment:
Q  435 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1089 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Original strand, 678 - 755
Alignment:
Q  29 tttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 106  Q
    ||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  678 tttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggaaagattgtagattgagattga 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 500
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1190
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  1120 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 473
Target Start/End: Original strand, 4741 - 4898
Alignment:
Q  316 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 414  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  4741 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagt 4839  T
Q  415 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    || |||||| |||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  4840 caagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtc 4898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10998 - 10842
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattga 129  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||   ||  |||| |||    
T  10998 ttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctggaatagtttaagaa-tga 10900  T
Q  130 acttttg-gaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 186  Q
    | ||||| || |   |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10899 atttttgtgagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10545
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  480 agt 482  Q
    |||    
T  10547 agt 10545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Original strand, 43438 - 43590
Alignment:
Q  33 agttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaattgaact 132  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||   ||  ||||| ||  |    
T  43438 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 43537  T
Q  133 tttggaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 185  Q
    || ||| |   ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43538 ttgggagttacacctgtactcgccatgacgagtagaggctctcgcctcgcgag 43590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 114
Target Start/End: Original strand, 47358 - 47439
Alignment:
Q  33 agttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  47358 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaa 47439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1132
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttga 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1078 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttga 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1152 - 1086
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  1152 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 496
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 391  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatg 21817  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgct-gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag 490  Q
    ||||| ||||| ||| | |||  |||| | ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||    
T  21818 aattg-aattggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 21914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 496
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  293 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 391  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatg 29709  T
Q  392 aattgcaattgatattactatgtcatgct-gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag 490  Q
    ||||| ||||| ||| | |||  |||| | ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||    
T  29710 aattg-aattggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 29806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25385 - 25124
Alignment:
Q  221 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgtt 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||   || |  || || ||||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  25385 gacctttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgattt 25286  T
Q  320 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg- 418  Q
    ||||||| | || |||||||||| |  ||| | |||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| ||| ||||| |||||||   ||| |||||     
T  25285 gatgttg-taataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatga 25189  T
Q  419 -ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 482  Q
     |||||||  || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25188 gctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  329 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-gtttttg 427  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| | ||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 1950  T
Q  428 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 36539 - 36454
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    |||||||  |||| ||||||  |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36539 atgtcatattgttgttgtaatttgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Original strand, 58102 - 58161
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  58102 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 58161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12766
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12465 - 12381
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  12465 ttaagttgatatttagatgattttgagtgtctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaa 12381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38339
Alignment:
Q  381 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 496
Target Start/End: Original strand, 10567 - 10639
Alignment:
Q  424 tttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  10567 tttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 479
Target Start/End: Original strand, 206576 - 206624
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206576 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 2344 - 2245
Alignment:
Q  9 aagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 108  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2344 aagatttcggaattataactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 569
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44161 - 44104
Alignment:
Q  416 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44161 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1205
Alignment:
Q  321 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcatta 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 481
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6386
Alignment:
Q  431 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 473
Target Start/End: Original strand, 192968 - 193070
Alignment:
Q  371 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaa-ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 469  Q
    |||||| || |||||||| ||||||  || |||||||  ||||||||| |||| |||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  192968 tgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 193066  T
Q  470 agtc 473  Q
    ||||    
T  193067 agtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3618
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  3560 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggatcagattgaacc 3618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 17346 - 17400
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttga 55  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  17346 gagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttga 17400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 586 - 640
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattagg 84  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  586 ttaagttgatccttaaatgattttgagtgcatgaatatgtataataatgattagg 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10541
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  10599 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 14224 - 14282
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  14224 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 14282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 473
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  435 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27064 - 27006
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27064 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 27006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 35521 - 35575
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattagg 84  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35521 ttaagttgaaccttaaatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 35575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 263
Target Start/End: Original strand, 24427 - 24481
Alignment:
Q  209 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 263  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  24427 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgatccttggggtag 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 24171 - 24255
Alignment:
Q  30 ttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 114  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  24171 ttaagttgaagcttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaa 24255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9762 - 9704
Alignment:
Q  51 tttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  9762 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30350
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 30350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Original strand, 17422 - 17475
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 110  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  17422 tgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 17475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  432 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1910 - 1853
Alignment:
Q  416 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1910 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtc 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18321 - 18236
Alignment:
Q  411 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  18321 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  437 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 8511 - 8619
Alignment:
Q  1 gagcatgcaagatttcgtgattttaacttttaagttgatccttatatgcttttgaatgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 100  Q
    |||||||  |||||| || ||||  |||||| |||||  |||||  ||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||| |    
T  8511 gagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcgtgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataa 8610  T
Q  101 gattgaacc 109  Q
    |||||||||    
T  8611 gattgaacc 8619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  433 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 307512 - 307460
Alignment:
Q  57 tgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 109  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  307512 tgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 307460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University