View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1358_low_48 (Length: 428)

Name: NF1358_low_48
Description: NF1358
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1358_low_48
NF1358_low_48
[»] chr3 (134 HSPs)
chr3 (1-408)||(20698150-20698556)
chr3 (31-408)||(13442274-13442651)
chr3 (1-408)||(17487856-17488275)
chr3 (1-408)||(17499338-17499757)
chr3 (1-408)||(26686887-26687305)
chr3 (31-408)||(43840932-43841309)
chr3 (1-408)||(12399209-12399613)
chr3 (31-408)||(23083104-23083482)
chr3 (31-408)||(18438534-18438912)
chr3 (49-404)||(14576594-14576949)
chr3 (37-408)||(14972854-14973226)
chr3 (49-408)||(25476146-25476506)
chr3 (1-405)||(40213424-40213838)
chr3 (49-395)||(14572602-14572948)
chr3 (49-408)||(11424524-11424880)
chr3 (3-390)||(30029858-30030244)
chr3 (193-405)||(24153115-24153326)
chr3 (53-391)||(42386427-42386767)
chr3 (80-270)||(16796685-16796875)
chr3 (242-405)||(29172583-29172745)
chr3 (242-405)||(7781347-7781509)
chr3 (242-405)||(9707607-9707769)
chr3 (242-405)||(17463178-17463340)
chr3 (242-405)||(17672626-17672788)
chr3 (242-405)||(34159326-34159488)
chr3 (242-405)||(45606907-45607069)
chr3 (242-405)||(55476491-55476653)
chr3 (242-405)||(8899094-8899256)
chr3 (242-405)||(16454281-16454443)
chr3 (242-405)||(28848611-28848773)
chr3 (242-405)||(38961891-38962053)
chr3 (1-389)||(53070402-53070799)
chr3 (242-405)||(13151790-13151953)
chr3 (242-405)||(13154255-13154418)
chr3 (242-406)||(13544024-13544187)
chr3 (242-405)||(6469134-6469296)
chr3 (242-405)||(10247723-10247885)
chr3 (242-401)||(12567564-12567722)
chr3 (242-405)||(17446655-17446816)
chr3 (242-405)||(50242822-50242984)
chr3 (242-403)||(16282811-16282971)
chr3 (242-408)||(43550478-43550644)
chr3 (202-408)||(24340637-24340844)
chr3 (242-403)||(41123892-41124049)
chr3 (291-405)||(55500942-55501055)
chr3 (202-405)||(12119684-12119887)
chr3 (254-406)||(46822267-46822419)
chr3 (274-405)||(15977515-15977645)
chr3 (1-84)||(16809724-16809807)
chr3 (282-405)||(36166598-36166719)
chr3 (277-405)||(15412429-15412557)
chr3 (230-406)||(12511059-12511236)
chr3 (192-270)||(14179570-14179648)
chr3 (226-405)||(8499518-8499697)
chr3 (43-169)||(17248041-17248168)
chr3 (226-405)||(27165250-27165429)
chr3 (202-389)||(52523642-52523831)
chr3 (308-405)||(44494809-44494905)
chr3 (282-390)||(21618464-21618570)
chr3 (202-408)||(37642179-37642386)
chr3 (302-405)||(10556985-10557087)
chr3 (308-405)||(17737236-17737335)
chr3 (202-408)||(23274687-23274894)
chr3 (339-404)||(12174310-12174376)
chr3 (339-408)||(13210378-13210448)
chr3 (289-408)||(15470927-15471043)
chr3 (285-408)||(14234487-14234610)
chr3 (339-401)||(32307684-32307747)
chr3 (264-405)||(53301527-53301669)
chr3 (339-404)||(16103784-16103850)
chr3 (344-405)||(28194693-28194755)
chr3 (339-404)||(49668127-49668193)
chr3 (352-405)||(45577947-45578000)
chr3 (341-404)||(16097332-16097396)
chr3 (339-404)||(9512924-9512990)
chr3 (339-404)||(9520899-9520965)
chr3 (53-95)||(1644447-1644489)
chr3 (53-95)||(32307983-32308025)
chr3 (53-95)||(49667848-49667890)
chr3 (226-315)||(2051138-2051227)
chr3 (319-404)||(15878083-15878168)
chr3 (328-404)||(856140-856216)
chr3 (343-387)||(13919350-13919394)
chr3 (229-408)||(22147467-22147646)
chr3 (55-94)||(12340068-12340107)
chr3 (43-94)||(19725669-19725720)
chr3 (339-389)||(22110403-22110454)
chr3 (339-389)||(43925977-43926028)
chr3 (339-401)||(1644725-1644787)
chr3 (53-95)||(12934075-12934117)
chr3 (319-381)||(23077509-23077571)
chr3 (1-33)||(12340138-12340170)
chr3 (1-33)||(14665991-14666023)
chr3 (1-33)||(14669146-14669178)
chr3 (1-33)||(14735504-14735536)
chr3 (289-389)||(37251168-37251270)
chr3 (43-94)||(1598238-1598289)
chr3 (43-94)||(3833971-3834022)
chr3 (59-94)||(7109999-7110034)
chr3 (59-94)||(7113934-7113969)
chr3 (55-94)||(12852130-12852169)
chr3 (55-94)||(14665921-14665960)
chr3 (55-94)||(14669076-14669115)
chr3 (55-94)||(14735434-14735473)
chr3 (43-94)||(17242269-17242320)
chr3 (59-94)||(22321965-22322000)
chr3 (59-94)||(22337020-22337055)
chr3 (59-94)||(27409417-27409452)
chr3 (43-94)||(38814681-38814732)
chr3 (53-95)||(324549-324591)
chr3 (340-389)||(606378-606428)
chr3 (341-387)||(9577646-9577691)
chr3 (345-407)||(14665398-14665460)
chr3 (319-381)||(14878548-14878610)
chr3 (319-381)||(15051531-15051593)
chr3 (319-381)||(15060307-15060369)
chr3 (52-94)||(16097645-16097687)
chr3 (199-248)||(21618594-21618644)
chr3 (199-244)||(36166747-36166793)
chr3 (53-91)||(49389408-49389446)
chr3 (53-94)||(1465174-1465215)
chr3 (1-30)||(4588518-4588547)
chr3 (53-90)||(9513228-9513265)
chr3 (53-90)||(9521203-9521240)
chr3 (340-381)||(11298580-11298621)
chr3 (57-94)||(13210096-13210133)
chr3 (340-389)||(15246037-15246086)
chr3 (54-95)||(37250932-37250973)
chr3 (345-381)||(3389994-3390030)
chr3 (53-93)||(12171869-12171909)
chr3 (1-33)||(12852067-12852099)
chr3 (1-33)||(13442660-13442692)
chr3 (1-33)||(14572974-14573006)
chr3 (54-94)||(22110116-22110156)
[»] chr4 (102 HSPs)
chr4 (1-408)||(12902757-12903164)
chr4 (1-408)||(7088877-7089284)
chr4 (36-408)||(44052829-44053201)
chr4 (1-406)||(22636437-22636852)
chr4 (1-408)||(14053016-14053422)
chr4 (36-408)||(7893703-7894073)
chr4 (53-401)||(23374125-23374473)
chr4 (1-293)||(3096759-3097050)
chr4 (1-405)||(16377225-16377639)
chr4 (82-408)||(16239764-16240090)
chr4 (31-403)||(14038653-14039026)
chr4 (1-270)||(17047787-17048055)
chr4 (198-408)||(16270147-16270356)
chr4 (224-408)||(7798774-7798958)
chr4 (43-405)||(44928678-44929042)
chr4 (236-408)||(6899891-6900062)
chr4 (283-408)||(52873363-52873488)
chr4 (49-405)||(44102214-44102570)
chr4 (168-408)||(17046487-17046724)
chr4 (242-405)||(18215274-18215436)
chr4 (88-389)||(6190481-6190782)
chr4 (242-405)||(12307-12469)
chr4 (226-405)||(1837494-1837671)
chr4 (31-146)||(7798959-7799074)
chr4 (242-405)||(15118352-15118514)
chr4 (242-405)||(23803265-23803427)
chr4 (242-405)||(52312510-52312672)
chr4 (242-411)||(19242693-19242861)
chr4 (242-405)||(3515007-3515169)
chr4 (242-405)||(44615288-44615450)
chr4 (242-405)||(44773087-44773249)
chr4 (242-405)||(50222339-50222501)
chr4 (242-405)||(51463868-51464030)
chr4 (199-405)||(54798675-54798872)
chr4 (31-211)||(15091093-15091274)
chr4 (242-407)||(19618172-19618336)
chr4 (242-405)||(18239419-18239581)
chr4 (242-401)||(15355324-15355483)
chr4 (202-408)||(15367690-15367896)
chr4 (202-408)||(15402703-15402909)
chr4 (199-405)||(14280316-14280512)
chr4 (322-408)||(3096293-3096379)
chr4 (242-405)||(12610950-12611105)
chr4 (53-390)||(52242958-52243299)
chr4 (202-408)||(15371202-15371408)
chr4 (202-408)||(15373483-15373689)
chr4 (242-407)||(14970707-14970871)
chr4 (226-389)||(13790-13953)
chr4 (202-408)||(15370018-15370223)
chr4 (242-406)||(22353835-22353999)
chr4 (202-408)||(16223532-16223738)
chr4 (242-405)||(7641192-7641344)
chr4 (244-389)||(21815587-21815731)
chr4 (282-405)||(8574864-8574985)
chr4 (339-408)||(15551817-15551887)
chr4 (226-390)||(43198492-43198658)
chr4 (233-359)||(43256106-43256230)
chr4 (339-404)||(12774011-12774077)
chr4 (339-408)||(39706339-39706409)
chr4 (242-402)||(20149832-20149992)
chr4 (224-381)||(15093798-15093955)
chr4 (339-390)||(12288261-12288313)
chr4 (339-404)||(8846360-8846426)
chr4 (53-95)||(12774313-12774355)
chr4 (50-95)||(21815393-21815438)
chr4 (55-94)||(3332201-3332240)
chr4 (231-404)||(15121747-15121917)
chr4 (55-94)||(24029057-24029096)
chr4 (56-94)||(22633980-22634018)
chr4 (53-94)||(15099665-15099706)
chr4 (57-94)||(15552129-15552166)
chr4 (324-381)||(16348700-16348757)
chr4 (324-381)||(16356988-16357045)
chr4 (50-95)||(21815064-21815109)
chr4 (50-95)||(21818486-21818531)
chr4 (58-94)||(13812578-13812614)
chr4 (339-387)||(17333298-17333346)
chr4 (1-33)||(20156993-20157025)
chr4 (1-33)||(22633916-22633948)
chr4 (59-94)||(4561107-4561142)
chr4 (59-94)||(5756711-5756746)
chr4 (43-94)||(19757359-19757410)
chr4 (43-94)||(19782396-19782447)
chr4 (55-94)||(20157056-20157095)
chr4 (59-94)||(33742675-33742710)
chr4 (43-94)||(45938444-45938495)
chr4 (339-389)||(46640507-46640558)
chr4 (339-389)||(53082203-53082254)
chr4 (199-244)||(8574790-8574836)
chr4 (53-119)||(15464694-15464760)
chr4 (3-33)||(24029127-24029157)
chr4 (53-94)||(8846689-8846730)
chr4 (1-33)||(6190819-6190851)
chr4 (345-381)||(11250619-11250655)
chr4 (1-33)||(13812512-13812544)
chr4 (1-33)||(15091283-15091315)
chr4 (345-381)||(15353365-15353401)
chr4 (1-33)||(15552199-15552231)
chr4 (1-33)||(16597031-16597063)
chr4 (43-91)||(26243423-26243471)
chr4 (53-93)||(39706052-39706092)
chr4 (2-30)||(44053218-44053246)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-408)||(13211-13618)
[»] chr6 (99 HSPs)
chr6 (1-408)||(20360674-20361081)
chr6 (1-408)||(20637997-20638404)
chr6 (1-408)||(22779930-22780348)
chr6 (31-408)||(17287540-17287917)
chr6 (49-408)||(29060540-29060900)
chr6 (4-408)||(16920350-16920751)
chr6 (5-408)||(22831503-22831905)
chr6 (1-407)||(18409530-18409947)
chr6 (35-408)||(25629102-25629476)
chr6 (1-408)||(19303244-19303661)
chr6 (5-408)||(20593773-20594187)
chr6 (5-389)||(11185524-11185905)
chr6 (1-182)||(18821533-18821714)
chr6 (241-408)||(16496244-16496411)
chr6 (241-408)||(20076700-20076863)
chr6 (242-405)||(12742317-12742479)
chr6 (242-405)||(18334592-18334754)
chr6 (242-405)||(19005046-19005208)
chr6 (242-405)||(19858919-19859081)
chr6 (242-405)||(22782227-22782389)
chr6 (242-405)||(24422547-24422709)
chr6 (242-405)||(25754809-25754971)
chr6 (242-405)||(33861794-33861956)
chr6 (242-405)||(33864278-33864440)
chr6 (233-408)||(35245586-35245758)
chr6 (242-407)||(30676710-30676874)
chr6 (242-405)||(1595549-1595711)
chr6 (242-405)||(2291180-2291342)
chr6 (242-405)||(8055029-8055191)
chr6 (1-389)||(18456735-18457132)
chr6 (242-405)||(26924640-26924802)
chr6 (242-407)||(34963371-34963535)
chr6 (242-405)||(25656629-25656791)
chr6 (202-390)||(25644338-25644528)
chr6 (242-405)||(1540911-1541073)
chr6 (262-405)||(25688502-25688644)
chr6 (242-402)||(16448526-16448686)
chr6 (45-381)||(25603143-25603478)
chr6 (242-405)||(3852017-3852179)
chr6 (259-389)||(18461895-18462024)
chr6 (242-406)||(19847949-19848114)
chr6 (242-405)||(20556894-20557054)
chr6 (201-381)||(15041465-15041644)
chr6 (45-381)||(25611481-25611816)
chr6 (226-408)||(20109140-20109322)
chr6 (254-406)||(23992429-23992578)
chr6 (339-408)||(27333269-27333339)
chr6 (339-408)||(27394009-27394079)
chr6 (347-408)||(25714417-25714478)
chr6 (224-389)||(18821782-18821946)
chr6 (202-408)||(8227425-8227632)
chr6 (233-359)||(27415887-27416011)
chr6 (339-408)||(28496522-28496592)
chr6 (339-408)||(29808933-29809003)
chr6 (31-95)||(28496216-28496280)
chr6 (43-95)||(29808639-29808691)
chr6 (339-404)||(19652199-19652265)
chr6 (355-408)||(1561303-1561356)
chr6 (319-404)||(19873120-19873205)
chr6 (319-404)||(22432249-22432334)
chr6 (319-404)||(22438799-22438884)
chr6 (339-390)||(9098565-9098617)
chr6 (339-387)||(33443068-33443116)
chr6 (43-94)||(15894186-15894237)
chr6 (319-404)||(19862978-19863063)
chr6 (344-390)||(19668389-19668436)
chr6 (55-94)||(21939699-21939738)
chr6 (361-408)||(22080799-22080846)
chr6 (43-94)||(22334648-22334699)
chr6 (43-94)||(25641940-25641991)
chr6 (339-396)||(4185872-4185930)
chr6 (53-94)||(4185588-4185629)
chr6 (53-94)||(4667978-4668019)
chr6 (288-381)||(18907134-18907226)
chr6 (340-381)||(21766718-21766759)
chr6 (53-94)||(22080502-22080543)
chr6 (289-389)||(23019425-23019525)
chr6 (53-93)||(27333049-27333089)
chr6 (53-93)||(27393789-27393829)
chr6 (59-94)||(8244158-8244193)
chr6 (59-94)||(11567160-11567195)
chr6 (43-94)||(12496605-12496656)
chr6 (53-92)||(19652512-19652551)
chr6 (59-94)||(19870888-19870923)
chr6 (59-94)||(22863243-22863278)
chr6 (339-389)||(23076749-23076800)
chr6 (59-94)||(23395366-23395401)
chr6 (339-389)||(35008167-35008218)
chr6 (340-385)||(16493169-16493214)
chr6 (49-94)||(16924642-16924687)
chr6 (49-94)||(16929357-16929402)
chr6 (340-389)||(18453201-18453250)
chr6 (319-404)||(25642219-25642304)
chr6 (53-94)||(31155163-31155204)
chr6 (54-94)||(19668688-19668728)
chr6 (345-381)||(19790837-19790873)
chr6 (1-33)||(21939769-21939801)
chr6 (54-94)||(23657189-23657229)
chr6 (1-33)||(29060926-29060958)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (3-408)||(8286558-8286964)
chr5 (1-408)||(23390199-23390617)
chr5 (5-408)||(22075018-22075422)
chr5 (1-408)||(21292684-21293090)
chr5 (49-408)||(25421532-25421892)
chr5 (1-408)||(13095495-13095912)
chr5 (1-408)||(24493569-24493986)
chr5 (1-408)||(13025311-13025728)
chr5 (31-408)||(25431395-25431772)
chr5 (1-405)||(24529223-24529639)
chr5 (47-408)||(9077952-9078314)
chr5 (49-408)||(1096467-1096827)
chr5 (1-271)||(22107087-22107357)
chr5 (1-270)||(21985850-21986130)
chr5 (241-408)||(21808343-21808510)
chr5 (241-408)||(21729018-21729185)
chr5 (49-405)||(11581006-11581361)
chr5 (49-405)||(36154589-36154942)
chr5 (242-405)||(264768-264930)
chr5 (242-405)||(39363384-39363546)
chr5 (243-405)||(10732941-10733102)
chr5 (302-408)||(21997549-21997655)
chr5 (242-405)||(20909012-20909174)
chr5 (242-405)||(29329934-29330096)
chr5 (242-405)||(42245365-42245527)
chr5 (193-390)||(18418598-18418793)
chr5 (193-405)||(22412187-22412388)
chr5 (242-405)||(29345980-29346142)
chr5 (242-405)||(29348453-29348615)
chr5 (242-405)||(29350926-29351088)
chr5 (242-405)||(39245136-39245298)
chr5 (242-402)||(18319033-18319193)
chr5 (242-390)||(20902008-20902156)
chr5 (242-405)||(2154613-2154776)
chr5 (53-389)||(22144068-22144406)
chr5 (242-405)||(32027393-32027555)
chr5 (242-405)||(10775675-10775838)
chr5 (254-406)||(17517168-17517320)
chr5 (242-405)||(31061068-31061231)
chr5 (277-405)||(38619434-38619562)
chr5 (233-359)||(18356364-18356488)
chr5 (311-405)||(20918017-20918110)
chr5 (319-404)||(26704075-26704160)
chr5 (319-404)||(26973808-26973893)
chr5 (192-389)||(37723922-37724117)
chr5 (277-404)||(23064512-23064639)
chr5 (339-408)||(19660886-19660956)
chr5 (339-408)||(21329548-21329618)
chr5 (242-402)||(24067110-24067270)
chr5 (233-359)||(20910745-20910869)
chr5 (192-381)||(21873277-21873462)
chr5 (290-389)||(20026942-20027043)
chr5 (339-404)||(22959583-22959649)
chr5 (285-408)||(21502154-21502277)
chr5 (202-408)||(40725853-40726060)
chr5 (282-404)||(21565546-21565668)
chr5 (343-408)||(36314577-36314643)
chr5 (339-387)||(26732884-26732932)
chr5 (230-404)||(22032323-22032492)
chr5 (339-408)||(26012086-26012154)
chr5 (339-408)||(19668898-19668968)
chr5 (351-405)||(20806850-20806904)
chr5 (339-389)||(26740697-26740747)
chr5 (230-404)||(18769947-18770118)
chr5 (1-94)||(22119896-22119998)
chr5 (199-244)||(20766041-20766087)
chr5 (53-94)||(5888940-5888981)
chr5 (57-94)||(19660606-19660643)
chr5 (53-102)||(21501919-21501968)
chr5 (53-90)||(21565863-21565900)
chr5 (53-94)||(22959298-22959339)
chr5 (340-389)||(23469822-23469871)
chr5 (55-95)||(20026706-20026746)
chr5 (231-381)||(23572107-23572254)
chr5 (59-94)||(19472493-19472528)
chr5 (59-94)||(20296145-20296180)
chr5 (282-333)||(20766115-20766166)
chr5 (43-94)||(21340525-21340576)
chr5 (319-382)||(23201382-23201445)
chr5 (43-94)||(23201680-23201731)
chr5 (43-94)||(23535347-23535398)
chr5 (43-94)||(24532806-24532857)
chr5 (55-94)||(24767103-24767142)
chr5 (43-94)||(26665889-26665940)
chr5 (43-94)||(26937486-26937537)
chr5 (55-94)||(31342414-31342453)
chr5 (56-94)||(25744036-25744074)
chr5 (45-94)||(20232847-20232896)
chr5 (340-381)||(20805575-20805616)
chr5 (340-389)||(21328268-21328317)
chr5 (340-385)||(21731514-21731559)
chr5 (53-90)||(21741308-21741345)
chr5 (340-385)||(21809634-21809679)
chr5 (54-94)||(123074-123114)
chr5 (1-33)||(1096853-1096885)
chr5 (341-381)||(20766997-20767037)
chr5 (1-33)||(21871274-21871306)
chr5 (46-94)||(21871329-21871377)
chr5 (1-33)||(21875554-21875586)
chr5 (46-94)||(21875609-21875657)
chr5 (345-381)||(26680605-26680641)
chr5 (345-381)||(26952212-26952248)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-408)||(763-1169)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-408)||(167693-168099)
scaffold0011 (1-408)||(51913-52330)
scaffold0011 (340-389)||(38204-38253)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (1-408)||(27250443-27250850)
chr1 (5-408)||(21026680-21027083)
chr1 (1-407)||(50209916-50210333)
chr1 (1-408)||(22532269-22532687)
chr1 (1-408)||(38801105-38801508)
chr1 (31-331)||(22354316-22354616)
chr1 (1-405)||(34509783-34510198)
chr1 (1-297)||(22355888-22356185)
chr1 (1-297)||(22357574-22357871)
chr1 (47-407)||(20135188-20135548)
chr1 (5-228)||(20846937-20847161)
chr1 (198-407)||(22468608-22468816)
chr1 (43-405)||(433012-433373)
chr1 (226-405)||(23593719-23593897)
chr1 (242-405)||(13988866-13989028)
chr1 (242-405)||(21923291-21923453)
chr1 (242-408)||(45574842-45575008)
chr1 (242-405)||(21475087-21475249)
chr1 (242-405)||(31612313-31612475)
chr1 (242-406)||(21840766-21840929)
chr1 (242-405)||(29298137-29298298)
chr1 (242-405)||(29776688-29776850)
chr1 (242-405)||(16275363-16275526)
chr1 (226-407)||(16361915-16362095)
chr1 (318-408)||(20847185-20847275)
chr1 (224-381)||(21787979-21788136)
chr1 (193-408)||(13212812-13213027)
chr1 (242-411)||(15860008-15860177)
chr1 (205-405)||(21346961-21347161)
chr1 (205-411)||(21342090-21342296)
chr1 (226-389)||(21896195-21896358)
chr1 (242-405)||(22123067-22123230)
chr1 (227-389)||(21861510-21861672)
chr1 (192-270)||(48603652-48603730)
chr1 (242-405)||(21707167-21707329)
chr1 (242-405)||(21711709-21711871)
chr1 (193-389)||(35260986-35261180)
chr1 (340-407)||(20454606-20454673)
chr1 (319-404)||(21714546-21714631)
chr1 (242-402)||(40389157-40389317)
chr1 (233-359)||(33797570-33797694)
chr1 (202-390)||(16758667-16758857)
chr1 (282-408)||(33681010-33681133)
chr1 (339-401)||(21754052-21754115)
chr1 (282-404)||(22921864-22921986)
chr1 (343-408)||(14295606-14295672)
chr1 (282-408)||(22237630-22237753)
chr1 (339-390)||(20918622-20918674)
chr1 (53-117)||(33681301-33681365)
chr1 (339-404)||(20248283-20248349)
chr1 (53-95)||(21754350-21754392)
chr1 (339-390)||(52928021-52928073)
chr1 (43-94)||(20091230-20091281)
chr1 (55-94)||(20918917-20918956)
chr1 (339-389)||(50614168-50614219)
chr1 (339-389)||(50621996-50622047)
chr1 (340-389)||(16368338-16368388)
chr1 (53-94)||(20637165-20637206)
chr1 (53-94)||(21162080-21162121)
chr1 (319-404)||(42865245-42865330)
chr1 (43-94)||(12647166-12647217)
chr1 (59-94)||(16375231-16375266)
chr1 (59-94)||(21407653-21407688)
chr1 (339-389)||(41050087-41050138)
chr1 (59-94)||(52639839-52639874)
chr1 (339-389)||(21533924-21533974)
chr1 (53-94)||(20248592-20248633)
chr1 (56-93)||(22921635-22921672)
chr1 (54-95)||(26065254-26065295)
chr1 (53-94)||(28194213-28194254)
chr1 (53-94)||(35981451-35981492)
chr1 (52-93)||(52927745-52927786)
chr1 (1-33)||(433393-433425)
chr1 (121-169)||(16758890-16758938)
chr1 (1-33)||(20135573-20135605)
chr1 (54-94)||(45310135-45310175)
chr1 (338-389)||(50686630-50686682)
[»] chr7 (105 HSPs)
chr7 (1-408)||(9509189-9509607)
chr7 (31-408)||(12698831-12699209)
chr7 (1-408)||(16385961-16386369)
chr7 (1-406)||(40443393-40443795)
chr7 (5-408)||(26211995-26212399)
chr7 (1-408)||(27847547-27847951)
chr7 (60-408)||(10589039-10589386)
chr7 (1-408)||(38227481-38227898)
chr7 (1-405)||(3564067-3564482)
chr7 (193-405)||(18456319-18456530)
chr7 (37-390)||(15143786-15144140)
chr7 (242-408)||(13647325-13647491)
chr7 (226-405)||(16213684-16213861)
chr7 (43-405)||(44116509-44116871)
chr7 (242-405)||(456321-456483)
chr7 (242-405)||(11972496-11972658)
chr7 (242-405)||(14949122-14949284)
chr7 (242-405)||(15376713-15376875)
chr7 (242-405)||(16232520-16232682)
chr7 (242-405)||(18640272-18640434)
chr7 (242-405)||(20385123-20385285)
chr7 (242-405)||(21189595-21189757)
chr7 (242-405)||(32125491-32125653)
chr7 (242-405)||(41522917-41523079)
chr7 (242-405)||(41525379-41525541)
chr7 (242-404)||(11393287-11393448)
chr7 (242-408)||(18430709-18430874)
chr7 (242-405)||(24702238-24702400)
chr7 (242-405)||(27216860-27217022)
chr7 (259-401)||(24275175-24275316)
chr7 (202-408)||(2280033-2280238)
chr7 (244-405)||(16410059-16410219)
chr7 (49-405)||(17061721-17062077)
chr7 (289-405)||(48273392-48273508)
chr7 (242-405)||(3386333-3386495)
chr7 (239-404)||(14932685-14932851)
chr7 (239-404)||(15356120-15356286)
chr7 (239-404)||(15360234-15360400)
chr7 (242-405)||(24704688-24704847)
chr7 (242-401)||(38898376-38898535)
chr7 (302-405)||(13869346-13869448)
chr7 (225-405)||(20110556-20110724)
chr7 (319-402)||(18154873-18154956)
chr7 (278-405)||(13831373-13831499)
chr7 (339-408)||(67745-67815)
chr7 (339-408)||(28505349-28505419)
chr7 (339-408)||(34200786-34200856)
chr7 (202-389)||(12756631-12756817)
chr7 (202-408)||(19486658-19486865)
chr7 (289-408)||(22072913-22073033)
chr7 (339-404)||(811182-811248)
chr7 (285-408)||(16219715-16219835)
chr7 (339-408)||(16495402-16495472)
chr7 (339-404)||(18005650-18005716)
chr7 (339-404)||(44014182-44014248)
chr7 (339-408)||(47831807-47831877)
chr7 (242-342)||(26355983-26356083)
chr7 (242-342)||(26358435-26358535)
chr7 (339-408)||(11996078-11996148)
chr7 (355-408)||(15754955-15755008)
chr7 (202-390)||(1867910-1868098)
chr7 (230-404)||(17138006-17138177)
chr7 (232-381)||(15211484-15211633)
chr7 (199-248)||(48273538-48273588)
chr7 (279-359)||(2530130-2530208)
chr7 (53-386)||(12255556-12255892)
chr7 (50-171)||(12756478-12756600)
chr7 (53-121)||(16056616-16056684)
chr7 (231-404)||(12187019-12187189)
chr7 (199-385)||(15008410-15008597)
chr7 (55-94)||(18302494-18302533)
chr7 (53-95)||(810894-810936)
chr7 (319-404)||(19649521-19649606)
chr7 (53-102)||(22073223-22073272)
chr7 (57-94)||(28505069-28505106)
chr7 (331-390)||(12901341-12901401)
chr7 (339-390)||(14044764-14044816)
chr7 (339-390)||(14354794-14354846)
chr7 (1-33)||(18302564-18302596)
chr7 (1-90)||(39267349-39267447)
chr7 (55-94)||(2832071-2832110)
chr7 (55-94)||(9389462-9389501)
chr7 (55-94)||(9751316-9751355)
chr7 (55-94)||(11995796-11995835)
chr7 (59-94)||(12718966-12719001)
chr7 (59-94)||(12723877-12723912)
chr7 (344-390)||(16056346-16056393)
chr7 (43-94)||(16438792-16438843)
chr7 (59-94)||(16906974-16907009)
chr7 (43-94)||(17137820-17137871)
chr7 (59-94)||(18279701-18279736)
chr7 (59-94)||(18283664-18283699)
chr7 (55-94)||(34201099-34201138)
chr7 (56-94)||(68061-68099)
chr7 (225-315)||(15113036-15113125)
chr7 (225-315)||(15116573-15116662)
chr7 (339-389)||(18203831-18203881)
chr7 (347-405)||(26356098-26356156)
chr7 (347-405)||(26358550-26358608)
chr7 (53-94)||(44014489-44014530)
chr7 (1-29)||(2832009-2832037)
chr7 (345-381)||(9446216-9446252)
chr7 (1-33)||(9751253-9751285)
chr7 (1-33)||(12699218-12699250)
chr7 (345-381)||(20569654-20569690)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (1-408)||(23285865-23286268)
chr2 (31-408)||(22737924-22738300)
chr2 (1-408)||(22730936-22731355)
chr2 (9-408)||(37838-38235)
chr2 (1-408)||(20309108-20309512)
chr2 (1-408)||(23076442-23076858)
chr2 (1-408)||(23654113-23654507)
chr2 (1-405)||(298518-298933)
chr2 (1-408)||(22337115-22337533)
chr2 (49-408)||(23660023-23660382)
chr2 (104-408)||(23060513-23060815)
chr2 (1-253)||(27753730-27753993)
chr2 (31-389)||(32451673-32452031)
chr2 (242-405)||(22105412-22105575)
chr2 (242-402)||(21155060-21155219)
chr2 (53-408)||(23708383-23708738)
chr2 (242-405)||(18808943-18809105)
chr2 (242-405)||(23130862-23131024)
chr2 (242-405)||(23133329-23133491)
chr2 (242-405)||(23709532-23709694)
chr2 (242-405)||(23712013-23712175)
chr2 (242-405)||(26505379-26505541)
chr2 (242-405)||(26507857-26508019)
chr2 (242-405)||(34402522-34402684)
chr2 (242-405)||(39682313-39682475)
chr2 (242-407)||(32214921-32215085)
chr2 (242-405)||(571397-571559)
chr2 (242-405)||(6725995-6726157)
chr2 (242-405)||(23135590-23135752)
chr2 (242-405)||(24367774-24367936)
chr2 (242-405)||(24898195-24898358)
chr2 (242-405)||(24900678-24900841)
chr2 (242-405)||(24903155-24903318)
chr2 (242-405)||(24905632-24905795)
chr2 (242-405)||(24908107-24908270)
chr2 (242-405)||(32039498-32039660)
chr2 (242-405)||(28577099-28577261)
chr2 (242-403)||(43137301-43137461)
chr2 (242-405)||(45029854-45030016)
chr2 (289-408)||(23103399-23103516)
chr2 (254-401)||(25616192-25616339)
chr2 (242-405)||(38967374-38967537)
chr2 (226-408)||(19671830-19672010)
chr2 (331-408)||(8946657-8946734)
chr2 (242-405)||(24529528-24529691)
chr2 (345-408)||(23040247-23040310)
chr2 (224-381)||(22799063-22799220)
chr2 (282-403)||(28405981-28406103)
chr2 (224-370)||(23019643-23019789)
chr2 (241-389)||(7687-7835)
chr2 (339-407)||(22134258-22134326)
chr2 (326-402)||(24643034-24643109)
chr2 (339-404)||(7679589-7679655)
chr2 (339-408)||(23072000-23072070)
chr2 (282-404)||(25175854-25175976)
chr2 (319-387)||(23038048-23038116)
chr2 (339-387)||(23287384-23287432)
chr2 (339-387)||(26392403-26392451)
chr2 (192-404)||(40622114-40622327)
chr2 (199-389)||(20520104-20520295)
chr2 (343-390)||(18786958-18787006)
chr2 (50-93)||(22133977-22134020)
chr2 (43-94)||(22740717-22740768)
chr2 (339-389)||(23207296-23207347)
chr2 (57-94)||(23071731-23071768)
chr2 (59-94)||(12901286-12901321)
chr2 (225-300)||(22459500-22459575)
chr2 (43-94)||(22460948-22460999)
chr2 (59-94)||(24628252-24628287)
chr2 (59-94)||(24649654-24649689)
chr2 (59-94)||(27379206-27379241)
chr2 (59-94)||(27383252-27383287)
chr2 (59-94)||(27602094-27602129)
chr2 (59-94)||(41530783-41530818)
chr2 (242-316)||(24642856-24642930)
chr2 (53-91)||(28406297-28406335)
chr2 (340-389)||(9241945-9241994)
chr2 (319-404)||(22740996-22741081)
chr2 (52-93)||(25176158-25176199)
chr2 (1-33)||(23660408-23660440)
chr2 (345-381)||(24655396-24655432)
chr2 (345-381)||(24869903-24869939)
chr2 (345-381)||(25961592-25961628)
chr2 (58-94)||(31756232-31756268)
[»] chr8 (92 HSPs)
chr8 (1-408)||(20536208-20536626)
chr8 (4-408)||(21918716-21919121)
chr8 (1-408)||(31971257-31971662)
chr8 (1-408)||(18878940-18879352)
chr8 (48-408)||(18818170-18818530)
chr8 (1-408)||(16199361-16199765)
chr8 (1-408)||(21923631-21924049)
chr8 (31-408)||(23406379-23406758)
chr8 (51-407)||(28648807-28649164)
chr8 (49-408)||(22626736-22627095)
chr8 (1-408)||(45130734-45131117)
chr8 (47-407)||(23648554-23648914)
chr8 (31-411)||(6759255-6759634)
chr8 (36-408)||(16092089-16092463)
chr8 (90-408)||(7372778-7373088)
chr8 (1-270)||(25362854-25363123)
chr8 (43-408)||(22875065-22875431)
chr8 (43-405)||(41598188-41598550)
chr8 (242-405)||(14409444-14409606)
chr8 (242-405)||(1484402-1484564)
chr8 (242-405)||(5853292-5853454)
chr8 (242-401)||(16413316-16413474)
chr8 (242-405)||(20403227-20403389)
chr8 (200-408)||(21389366-21389571)
chr8 (200-408)||(21395896-21396101)
chr8 (200-408)||(21790389-21790594)
chr8 (242-405)||(22001753-22001915)
chr8 (205-408)||(21778697-21778897)
chr8 (242-405)||(4483281-4483442)
chr8 (242-405)||(4542373-4542535)
chr8 (242-405)||(15203231-15203393)
chr8 (242-405)||(20046195-20046357)
chr8 (254-406)||(18678069-18678221)
chr8 (242-405)||(19896265-19896430)
chr8 (254-406)||(32121734-32121886)
chr8 (226-401)||(13508024-13508199)
chr8 (242-401)||(45290694-45290853)
chr8 (242-405)||(14823774-14823935)
chr8 (242-405)||(25484275-25484430)
chr8 (242-407)||(26223917-26224081)
chr8 (226-401)||(13597556-13597731)
chr8 (202-389)||(19801342-19801527)
chr8 (277-390)||(15070573-15070686)
chr8 (242-411)||(19937005-19937174)
chr8 (224-381)||(23776772-23776929)
chr8 (285-408)||(6520368-6520491)
chr8 (226-389)||(20498581-20498744)
chr8 (282-405)||(26219717-26219838)
chr8 (282-408)||(38855246-38855372)
chr8 (339-408)||(17140916-17140986)
chr8 (202-408)||(17612027-17612231)
chr8 (339-408)||(21490995-21491065)
chr8 (282-405)||(26225288-26225409)
chr8 (339-408)||(5866325-5866395)
chr8 (339-408)||(23760895-23760962)
chr8 (339-390)||(983457-983509)
chr8 (289-404)||(21285601-21285716)
chr8 (358-408)||(21249384-21249434)
chr8 (358-408)||(21255222-21255272)
chr8 (339-404)||(26355749-26355815)
chr8 (226-389)||(37116366-37116530)
chr8 (339-389)||(24353039-24353090)
chr8 (199-244)||(26222993-26223039)
chr8 (57-94)||(5866045-5866082)
chr8 (57-94)||(17141229-17141266)
chr8 (319-404)||(17353975-17354060)
chr8 (340-389)||(20502154-20502203)
chr8 (57-94)||(21249697-21249734)
chr8 (53-94)||(39834147-39834188)
chr8 (1-33)||(21255605-21255637)
chr8 (341-396)||(21673716-21673772)
chr8 (339-387)||(22525579-22525627)
chr8 (43-94)||(15538745-15538796)
chr8 (339-389)||(17267045-17267096)
chr8 (339-389)||(19154938-19154989)
chr8 (231-381)||(20465982-20466132)
chr8 (43-94)||(24433995-24434046)
chr8 (59-94)||(43252110-43252145)
chr8 (31-73)||(7373084-7373126)
chr8 (199-248)||(26219862-26219912)
chr8 (57-94)||(21255535-21255572)
chr8 (1-33)||(7373135-7373167)
chr8 (345-381)||(20533467-20533503)
chr8 (1-33)||(21249767-21249799)
chr8 (53-93)||(21674021-21674061)
chr8 (54-94)||(21972353-21972393)
chr8 (54-94)||(21976438-21976478)
chr8 (1-29)||(22627125-22627153)
chr8 (1-33)||(23406767-23406799)
chr8 (341-389)||(28397569-28397617)
chr8 (54-94)||(37116664-37116704)
chr8 (53-93)||(38855015-38855055)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-408)||(3470-3888)
scaffold0292 (49-408)||(343-702)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-408)||(1851-2269)
scaffold0016 (55-94)||(207285-207324)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-408)||(32067-32471)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-408)||(1952-2359)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-408)||(13497-13902)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-408)||(15179-15584)
scaffold0114 (231-404)||(7295-7465)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-408)||(10140-10544)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-390)||(24005-24406)
scaffold0042 (43-94)||(64150-64201)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-408)||(4712-5119)
scaffold0358 (1-343)||(1-343)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (31-408)||(5865-6245)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-408)||(38761-39177)
scaffold0145 (198-408)||(32942-33151)
scaffold0145 (242-410)||(9744-9912)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-408)||(4849-5255)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-408)||(766-1170)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (37-408)||(8479-8846)
scaffold0639 (1-29)||(8865-8893)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-349)||(6669-7017)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-408)||(16282-16686)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-408)||(51582-51986)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (47-405)||(22886-23244)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-408)||(8235-8650)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-408)||(46995-47393)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (31-356)||(13144-13469)
scaffold0175 (333-408)||(34123-34199)
scaffold0175 (352-408)||(273-329)
scaffold0175 (57-93)||(34437-34473)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (31-316)||(124677-124962)
scaffold0021 (339-408)||(121766-121835)
scaffold0021 (230-407)||(174767-174943)
scaffold0021 (54-95)||(136132-136173)
scaffold0021 (54-95)||(144840-144881)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (3-408)||(20910-21306)
[»] scaffold0122 (4 HSPs)
scaffold0122 (49-401)||(25826-26179)
scaffold0122 (1-271)||(33197-33479)
scaffold0122 (282-405)||(44702-44825)
scaffold0122 (1-30)||(25768-25797)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (11-408)||(1289-1683)
scaffold0106 (11-408)||(7266-7660)
scaffold0106 (340-405)||(15291-15356)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (49-408)||(39913-40272)
scaffold0080 (289-389)||(19885-19987)
scaffold0080 (43-94)||(18413-18464)
scaffold0080 (306-381)||(18674-18749)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-407)||(16918-17337)
scaffold0056 (206-389)||(79248-79430)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (49-406)||(39479-39836)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (49-406)||(74976-75333)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (37-405)||(339700-340065)
scaffold0003 (242-405)||(158450-158612)
scaffold0003 (233-359)||(71350-71474)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-405)||(4845-5246)
[»] scaffold0026 (7 HSPs)
scaffold0026 (48-408)||(39858-40217)
scaffold0026 (91-408)||(25896-26213)
scaffold0026 (57-94)||(59271-59308)
scaffold0026 (45-79)||(26555-26589)
scaffold0026 (1-33)||(26611-26643)
scaffold0026 (1-33)||(39634-39666)
scaffold0026 (1-33)||(40242-40274)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (43-408)||(4508-4873)
scaffold0228 (43-408)||(12090-12455)
scaffold0228 (43-408)||(22042-22407)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-270)||(1052-1321)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (1-249)||(3640-3888)
scaffold0165 (1-249)||(7704-7952)
scaffold0165 (202-390)||(27663-27852)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (53-408)||(16365-16721)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (123-408)||(2987-3271)
scaffold0540 (49-112)||(774-837)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-224)||(11227-11450)
scaffold0235 (286-408)||(11442-11564)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (31-389)||(51628-51985)
scaffold0034 (301-408)||(32538-32643)
scaffold0034 (53-119)||(32826-32892)
[»] scaffold0120 (6 HSPs)
scaffold0120 (58-408)||(32729-33077)
scaffold0120 (58-408)||(45928-46276)
scaffold0120 (198-408)||(16113-16322)
scaffold0120 (47-164)||(16331-16449)
scaffold0120 (347-408)||(17389-17450)
scaffold0120 (1-33)||(16473-16505)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (47-327)||(27911-28192)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-216)||(20595-20821)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (204-407)||(3103-3306)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (49-331)||(724-1006)
scaffold0395 (342-408)||(4888-4954)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (60-387)||(4545-4872)
scaffold0070 (43-94)||(10200-10251)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (47-248)||(10323-10525)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (270-408)||(28414-28552)
scaffold0046 (339-408)||(11292-11362)
scaffold0046 (339-408)||(1997-2067)
scaffold0046 (355-408)||(4552-4605)
[»] scaffold0352 (2 HSPs)
scaffold0352 (90-229)||(17790-17929)
scaffold0352 (1-73)||(17711-17794)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (242-405)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (242-405)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (10 HSPs)
scaffold0023 (242-405)||(94411-94573)
scaffold0023 (242-401)||(17440-17598)
scaffold0023 (245-405)||(44454-44614)
scaffold0023 (275-404)||(100378-100507)
scaffold0023 (201-381)||(38394-38573)
scaffold0023 (339-408)||(119875-119945)
scaffold0023 (339-404)||(40225-40291)
scaffold0023 (339-404)||(101503-101569)
scaffold0023 (201-316)||(23581-23695)
scaffold0023 (51-95)||(101709-101753)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (242-405)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (242-405)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (242-405)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (242-405)||(82072-82234)
scaffold0037 (282-390)||(22665-22773)
scaffold0037 (1-94)||(80035-80137)
[»] scaffold0028 (9 HSPs)
scaffold0028 (242-405)||(136680-136842)
scaffold0028 (242-405)||(139149-139311)
scaffold0028 (242-405)||(144087-144249)
scaffold0028 (242-405)||(134211-134373)
scaffold0028 (242-405)||(141618-141780)
scaffold0028 (339-406)||(62200-62268)
scaffold0028 (53-95)||(132967-133009)
scaffold0028 (345-404)||(132662-132722)
scaffold0028 (59-94)||(58492-58527)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (192-345)||(3434-3588)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (242-407)||(11286-11450)
scaffold0029 (231-381)||(12786-12933)
scaffold0029 (59-94)||(61386-61421)
scaffold0029 (61-94)||(65304-65337)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (242-402)||(4300-4459)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (242-406)||(10772-10935)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (51-405)||(16784-17138)
scaffold0142 (1-33)||(7474-7506)
scaffold0142 (55-94)||(7537-7576)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (242-401)||(501088-501246)
scaffold0001 (193-405)||(85530-85742)
scaffold0001 (339-404)||(160688-160754)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (242-405)||(106-268)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (242-405)||(40400-40562)
scaffold0044 (59-95)||(62556-62592)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (242-407)||(12249-12413)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (226-390)||(8484-8650)
scaffold0621 (282-408)||(6535-6661)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (242-406)||(9241-9404)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (241-408)||(128751-128917)
scaffold0031 (202-389)||(20340-20524)
scaffold0031 (1-91)||(20129-20228)
scaffold0031 (319-380)||(65830-65891)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (242-405)||(4214-4377)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (202-408)||(17941-18148)
scaffold0247 (193-405)||(2079-2291)
scaffold0247 (54-118)||(6561-6625)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (242-390)||(29947-30094)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (202-389)||(13147-13336)
scaffold0357 (202-390)||(16014-16203)
scaffold0357 (339-389)||(2680-2731)
scaffold0357 (56-171)||(15866-15983)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (193-405)||(161040-161252)
scaffold0007 (193-325)||(164541-164674)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (242-405)||(12064-12220)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-130)||(182-322)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (242-402)||(1280-1440)
scaffold0101 (319-404)||(8995-9080)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (226-389)||(53488-53651)
scaffold0075 (57-94)||(8062-8099)
scaffold0075 (1-33)||(7997-8029)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (226-408)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (226-408)||(38195-38377)
scaffold0124 (55-94)||(24417-24456)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (282-405)||(116430-116551)
scaffold0022 (339-389)||(129022-129072)
scaffold0022 (340-385)||(78345-78391)
scaffold0022 (54-94)||(128735-128775)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (243-404)||(29558-29720)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (192-382)||(26850-27036)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (233-359)||(15362-15486)
scaffold0107 (340-389)||(36199-36248)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (226-405)||(38641-38820)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (199-389)||(60626-60818)
scaffold0010 (282-396)||(129917-130031)
scaffold0010 (53-94)||(130222-130263)
scaffold0010 (54-95)||(60479-60520)
scaffold0010 (341-389)||(666-714)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (282-404)||(14692-14814)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (192-381)||(16255-16442)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (226-387)||(7998-8161)
scaffold0507 (53-95)||(7822-7864)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (319-404)||(23843-23928)
scaffold0198 (192-271)||(23979-24057)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (282-389)||(1051-1158)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (226-389)||(12587-12749)
scaffold0413 (43-99)||(15370-15426)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (49-157)||(1838-1947)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (282-404)||(19268-19390)
scaffold0102 (53-102)||(19573-19622)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (339-408)||(6611-6681)
scaffold0333 (339-408)||(13991-14061)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (332-405)||(15664-15738)
scaffold0261 (57-94)||(15974-16011)
scaffold0261 (319-404)||(1339-1424)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (339-408)||(6174-6244)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (339-408)||(15828-15898)
scaffold0020 (341-404)||(178898-178961)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (239-381)||(29117-29262)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (1-73)||(13311-13383)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (282-404)||(2801-2923)
scaffold0628 (53-95)||(2567-2609)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (192-381)||(4711-4898)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (343-408)||(1089-1155)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (339-404)||(2696-2762)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (339-408)||(1120-1190)
scaffold0184 (54-94)||(3993-4033)
scaffold0184 (345-381)||(4284-4320)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (53-102)||(437-486)
scaffold1984 (282-404)||(133-255)
[»] scaffold0555 (3 HSPs)
scaffold0555 (282-390)||(10536-10644)
scaffold0555 (43-90)||(897-944)
scaffold0555 (53-95)||(10305-10347)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (339-404)||(28820-28887)
scaffold0211 (53-95)||(28574-28616)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (339-408)||(23934-24001)
scaffold0100 (31-95)||(20426-20490)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (282-396)||(5655-5769)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (192-404)||(21712-21920)
scaffold0210 (192-404)||(29604-29812)
scaffold0210 (43-94)||(21563-21614)
scaffold0210 (43-94)||(29455-29506)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (339-404)||(1086-1152)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (347-389)||(11982-12024)
scaffold0503 (1-171)||(12166-12346)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (285-408)||(12942-13062)
scaffold0138 (53-94)||(13255-13296)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (339-404)||(45843-45909)
scaffold0125 (53-94)||(45555-45596)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (237-404)||(1881-2045)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (319-404)||(36454-36539)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (319-404)||(69794-69879)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (341-408)||(12766-12834)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (339-389)||(6831-6882)
scaffold0556 (53-94)||(7126-7167)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (332-390)||(8118-8177)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (226-333)||(225482-225588)
scaffold0012 (121-171)||(225644-225694)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (319-404)||(19980-20065)
scaffold0139 (289-385)||(38339-38437)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (1-94)||(344-446)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (332-404)||(10567-10639)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (339-390)||(25124-25176)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (339-387)||(206576-206624)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-94)||(10226-10328)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (340-389)||(569-619)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (53-95)||(2066-2108)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (53-95)||(32397-32439)
scaffold0150 (355-404)||(32102-32151)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (289-390)||(10545-10646)
scaffold0078 (53-95)||(10842-10884)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (53-94)||(9391-9432)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (1-91)||(12512-12611)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (57-94)||(2213-2250)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (324-381)||(44104-44161)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (229-265)||(1169-1205)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-33)||(2788-2820)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-33)||(18661-18693)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (339-389)||(6335-6386)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (59-94)||(4875-4910)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (55-94)||(9600-9639)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (279-381)||(192968-193070)
scaffold0017 (59-95)||(192757-192793)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (343-381)||(4999-5037)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (340-389)||(7450-7499)
scaffold0111 (340-389)||(14569-14618)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (324-381)||(1853-1910)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (319-404)||(18236-18321)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (345-381)||(7328-7364)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (341-389)||(3276-3324)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (341-389)||(30350-30398)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 134)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 20698150 - 20698556
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698150 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 20698249  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||    
T  20698250 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattat 20698349  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20698350 aatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatga 20698448  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20698449 attgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 20698548  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  20698549 gatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13442651 - 13442274
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13442651 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcga 13442552  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |   |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442551 cctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 13442452  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13442451 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgt 13442352  T
Q  331 ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13442351 ttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17488275 - 17487856
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488275 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtaggattctgacctgaaatcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 17488176  T
Q  90 gcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggt 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | |    
T  17488175 gcgagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgat 17488076  T
Q  189 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattta 288  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17488075 gatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattta 17487976  T
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487975 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17487876  T
Q  389 gtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || |||||||||||||||||    
T  17487875 gttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17499757 - 17499338
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17499757 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgttggattctgacctgaattcgccacggtgagcagaggctctcgcctc 17499658  T
Q  90 gcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggt 188  Q
     | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | |    
T  17499657 tctagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgat 17499558  T
Q  189 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattta 288  Q
    || ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17499557 gatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattta 17499458  T
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499457 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17499358  T
Q  389 gtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || |||||||||||||||||    
T  17499357 gttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26687305 - 26686887
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687305 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 26687206  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||| |||  ||||| | |  |    
T  26687205 gcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgagg 26687106  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  26687105 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaa 26687006  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687005 gatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 26686906  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | || ||||||||||||||    
T  26686905 ttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43841309 - 43840932
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43841309 gaatgaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcga 43841210  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||  || || |||||| |||  ||||| | |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841209 cctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 43841110  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt 330  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43841109 gttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 43841010  T
Q  331 ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  43841009 ttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12399613 - 12399209
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  12399613 aggaaaaaatataggatgggtttgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtaaaggctctcgcctcacgagtgaccc 12399514  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |  || | ||||||||||| |||||||| | | |  ||||||||||||    
T  12399513 agaaacag--tgacttgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactat 12399417  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||    
T  12399416 aatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttga 12399317  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12399316 attgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 12399217  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  12399216 gatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Original strand, 23083104 - 23083482
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcg 129  Q
    |||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  23083104 gaatgaaactttttggattctgacccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacatagtgtcttgttaggttttgcg 23083203  T
Q  130 acctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 229  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||   | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083204 acctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 23083303  T
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 329  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23083304 tattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctg 23083403  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23083404 tttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18438912 - 18438534
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcg 129  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  18438912 gaatgaaacttttggaattctgacctgaagttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcg 18438813  T
Q  130 acctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 229  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438812 acctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 18438713  T
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||   || |||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  18438712 tgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctg 18438613  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18438612 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 49 - 404
Target Start/End: Original strand, 14576594 - 14576949
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14576594 tctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagtt 14576693  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||| || | | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14576694 gttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 14576793  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||    
T  14576794 ataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctat 14576892  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  14576893 gttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14973226 - 14972854
Alignment:
Q  37 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgaccttt 135  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | |    
T  14973226 aacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgt 14973127  T
Q  136 gttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttga 235  Q
    || |||| ||| |   ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973126 gtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttga 14973027  T
Q  236 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14973026 ttatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14972927  T
Q  336 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14972926 tatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Original strand, 25476146 - 25476506
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25476146 tctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagtt 25476245  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | |  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25476246 gttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgat 25476345  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  25476346 ataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgt 25476445  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25476446 gttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 40213424 - 40213838
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213424 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 40213523  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||| | | ||    
T  40213524 cgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatg 40213623  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||   || ||| || |    
T  40213624 atgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattga 40213723  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40213724 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 40213822  T
Q  390 tcgatgaagatgatga 405  Q
    | ||| ||||||||||    
T  40213823 ttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 49 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14572948 - 14572602
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  14572948 tctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 14572849  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  14572848 gttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgat 14572749  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    |||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14572748 ataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctat 14572650  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatg 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14572649 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Original strand, 11424524 - 11424880
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  11424524 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 11424623  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || ||||||||||| || |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11424624 gttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgat 11424723  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || ||||||||||   |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11424724 ataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctat 11424819  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11424820 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30030244 - 30029858
Alignment:
Q  3 gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaact-tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtga-ccc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30030244 gaaagaatgtgggatgagattgaacctggaatgaaacagtttggaattctgacct-aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatccc 30030146  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||| ||| | |||    
T  30030145 agaa-cagaatgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatat 30030047  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |   ||||||||||||| |||| |||    
T  30030046 aatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tga 30029948  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30029947 attgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagt 30029858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 405
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  293 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 392  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  393 atgaagatgatga 405  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 42386767 - 42386427
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 150  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  42386767 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttgcgaactttgtcgcacgagttgtt 42386669  T
Q  151 gagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 249  Q
    | |||||||||||| |||||| |||  |||||     ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42386668 gtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatat 42386569  T
Q  250 aatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgt 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||   ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42386568 aatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 42386469  T
Q  350 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42386468 tgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagtc 42386427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796685
Alignment:
Q  80 ctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaaga 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaaga 16796776  T
Q  180 ctttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 270  Q
    ||| | |  |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16796775 cttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29172683 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7781447 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9707707 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45607007 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848773
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28848711 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Original strand, 53070402 - 53070799
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga---attaa------acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 91  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||      |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53070402 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 53070501  T
Q  92 gagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtagg-attaagactttaaggt 188  Q
    ||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||  || || | | ||   |    
T  53070502 gagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtata-t 53070599  T
Q  189 gaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattt 287  Q
     |  ||||  || || |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||   |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  53070600 aatattaatgatgatttgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataatt 53070698  T
Q  288 aagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
     ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070699 gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 53070797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 403
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 403  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 408
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Original strand, 24340637 - 24340844
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |    
T  24340637 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgttta 24340736  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     ||||  | ||||||| ||| ||||| || || || | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24340737 cttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 24340835  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  24340836 tgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 403  Q
    |    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  391 cgatgaagatgatga 405  Q
     ||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Original strand, 12119684 - 12119887
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||  |  || |||||||| || ||| |||||| |    
T  12119684 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattg 12119782  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12119783 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12119881  T
Q  400 tgatga 405  Q
    ||||||    
T  12119882 tgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 46822419 - 46822267
Alignment:
Q  254 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 352  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||  ||||| ||||||||| |||    
T  46822419 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgc 46822321  T
Q  353 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  46822320 tattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  274 atatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 373  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  374 catgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 16809807 - 16809724
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctc 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16809807 aggaaagaatgtaggatgagattgatcctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctctc 16809724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  382 ggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15412557 - 15412429
Alignment:
Q  277 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 375  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15412557 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 15412459  T
Q  376 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15412458 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12511236 - 12511059
Alignment:
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgc 327  Q
    |||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  12511236 tgttgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattat-tgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgt 12511138  T
Q  328 tgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8499697 - 8499518
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtca 324  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||  |  || |||||||| || |||  ||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  8499697 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 8499598  T
Q  325 tgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || |||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8499597 tgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Original strand, 17248041 - 17248168
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg-ttag-attttgcgacctttgttgc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||||| |||||| ||    
T  17248041 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttagaattttgcgatctttgtcgc 17248139  T
Q  141 acgagtggtcgagagttgaacctttgggt 169  Q
    |||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  17248140 acgagtcgttgagagttaaaccttggggt 17248168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165250
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||  ||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    | |||||| | | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27165329 gttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Original strand, 52523642 - 52523831
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  52523642 atctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga 52523740  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     ||||| | ||||||  ||| |||||  ||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523741 tttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 308 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  308 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618464
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  382 ggtctaagt 390  Q
    |||||||||    
T  21618472 ggtctaagt 21618464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Original strand, 37642179 - 37642386
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | |    
T  37642179 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 37642278  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37642279 cttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaaga 37642377  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  37642378 tgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 302 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10557087 - 10556985
Alignment:
Q  302 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10557087 ttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  402 atga 405  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 308 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  308 ttgatattactatgtcatgctgtttttgta--aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23274894 - 23274687
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgt-ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| | | |||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |    
T  23274894 atctgtgaagctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgttta 23274795  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     ||||  | ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||    
T  23274794 cttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcatcgaaga 23274696  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  23274695 tgttgatgt 23274687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 12174310 - 12174376
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12174310 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 13210378 - 13210448
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13210378 actgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  388 agtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||   |||||||||||||||    
T  15470944 agt---tgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  285 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 383  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  384 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 339 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32307747 - 32307684
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32307747 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 405
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  264 tacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga-tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttat 361  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | |||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  362 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16103850 - 16103784
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16103850 actgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  344 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 49668127 - 49668193
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  49668127 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 405
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  352 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9512990 - 9512924
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  9512990 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9520965 - 9520899
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  9520965 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 1644447 - 1644489
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644447 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 1644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32308025 - 32307983
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32308025 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 32307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 49667848 - 49667890
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49667848 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 49667890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 315
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051227
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 315  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2051227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 856216 - 856140
Alignment:
Q  328 tgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  856216 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13919394 - 13919350
Alignment:
Q  343 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919394 cctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 408
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147646
Alignment:
Q  229 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 328  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| |    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  329 gtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | ||||| | || ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  22147567 g-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12340107 - 12340068
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12340107 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 12340068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 19725669 - 19725720
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19725669 tgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19725720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 22110403 - 22110454
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110403 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 43926028 - 43925977
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926028 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 401
Target Start/End: Original strand, 1644725 - 1644787
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  1644725 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 12934075 - 12934117
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12934075 acctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagt 12934117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 381
Target Start/End: Original strand, 23077509 - 23077571
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23077509 atgtcataatgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23077571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 12340170 - 12340138
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12340170 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 12340138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 14666023 - 14665991
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14666023 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 14665991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 14669178 - 14669146
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14669178 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 14669146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 14735536 - 14735504
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14735536 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 14735504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 389
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  386 taag 389  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 1598238 - 1598289
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1598238 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 1598289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3834022 - 3833971
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3834022 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3833971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7110034 - 7109999
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7110034 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7109999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7113969 - 7113934
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7113969 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7113934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 12852130 - 12852169
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12852130 ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 12852169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14665960 - 14665921
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14665960 ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14665921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14669115 - 14669076
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14669115 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgag 14669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14735473 - 14735434
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14735473 ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14735434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17242320 - 17242269
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17242320 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17242269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22322000 - 22321965
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22322000 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22321965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22337055 - 22337020
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22337055 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22337020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 27409417 - 27409452
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27409417 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38814732 - 38814681
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38814732 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 38814681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 324591 - 324549
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  324591 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 324549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||| ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 381
Target Start/End: Original strand, 14878548 - 14878610
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||  |||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14878548 atgtcataatgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15051593 - 15051531
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15051593 atgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15060369 - 15060307
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15060369 atgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15060307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16097687 - 16097645
Alignment:
Q  52 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  16097687 gacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 16097645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21618644 - 21618594
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgata 248  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21618644 ataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 21618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36166793 - 36166747
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 244  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36166793 ataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 91
Target Start/End: Original strand, 49389408 - 49389446
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 91  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  49389408 acctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc 49389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 1465174 - 1465215
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1465174 acctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1465215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 4588518 - 4588547
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588518 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 4588547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9513265 - 9513228
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9513265 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9513228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9521240 - 9521203
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9521240 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 381
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298621
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210133
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13210133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37250973
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 37250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 93
Target Start/End: Original strand, 12171869 - 12171909
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12171869 acctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 12171909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 12852067 - 12852099
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12852067 aggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaa 12852099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 13442692 - 13442660
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13442692 aggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaa 13442660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 14573006 - 14572974
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14573006 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 14572974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110156
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22110156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 102)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12903164 - 12902757
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12903164 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgaccc 12903065  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||    
T  12903064 agaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattat 12902965  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12902964 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatga 12902865  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12902864 attacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 12902765  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  12902764 gatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7089284 - 7088877
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089284 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 7089185  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||| |||    
T  7089184 ggaaacagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattat 7089085  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7089084 aatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatga 7088985  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7088984 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 7088885  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  7088884 gatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 36 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44053201 - 44052829
Alignment:
Q  36 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44053201 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgaccttt 44053102  T
Q  136 gttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttga 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44053101 gttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttga 44053002  T
Q  236 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44053001 ttatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 44052902  T
Q  336 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44052901 tatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22636852 - 22636437
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636852 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacttgacctcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 22636753  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |  |    
T  22636752 acgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgagg 22636653  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22636652 atgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 22636554  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636553 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22636454  T
Q  390 tcgatgaagatgatgat 406  Q
    | |||||||||||||||    
T  22636453 ttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 14053016 - 14053422
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14053016 aggaaagaatgtaggatgagattgaacttggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgaccc 14053115  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  14053116 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattat 14053215  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag-atgttgatg 299  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   |||| |||||||||    
T  14053216 aatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatg 14053314  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag 398  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||    
T  14053315 aattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaag 14053412  T
Q  399 atgatgatgt 408  Q
    ||||||||||    
T  14053413 atgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 36 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7894073 - 7893703
Alignment:
Q  36 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  7894073 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctt 7893974  T
Q  135 tgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttg 234  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  7893973 tgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg--- 7893877  T
Q  235 attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttttt 334  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7893876 attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 7893777  T
Q  335 gtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7893776 gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 401
Target Start/End: Original strand, 23374125 - 23374473
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcga 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  23374125 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttga 23374224  T
Q  153 gagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 252  Q
    |  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23374225 ggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataat 23374324  T
Q  253 gttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 352  Q
    ||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23374325 gttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgc 23374424  T
Q  353 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  23374425 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3097050 - 3096759
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097050 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 3096951  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||| |||    
T  3096950 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattat 3096851  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3096850 aatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 16377225 - 16377639
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |          ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16377225 aggaaataatgtaggatgagattgaacctggaatgatcgtagaatgaacttttgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctca 16377324  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtc-gagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggt 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | |    
T  16377325 cgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgat 16377424  T
Q  189 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattta 288  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| ||     
T  16377425 gatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattg 16377524  T
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377525 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16377622  T
Q  389 gtcgatgaagatgatga 405  Q
    || ||||||||| ||||    
T  16377623 gttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 82 - 408
Target Start/End: Original strand, 16239764 - 16240090
Alignment:
Q  82 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  16239764 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagac 16239863  T
Q  181 tttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtg 280  Q
    || | | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||  ||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  281 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14039026 - 14038653
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcg 129  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14039026 gaatgaaacttttggaaatctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcg 14038927  T
Q  130 acctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 229  Q
    | || ||| |||| ||| |   ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | |||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14038926 atctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttga 14038827  T
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||    
T  14038826 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttg 14038727  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 403  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14038726 tttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 17047787 - 17048055
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047787 aggaaaaaatgtaggatgagattgaac-tggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 17047885  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
     ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||  ||| ||     
T  17047886 ggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattac 17047985  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 270  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17047986 aacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 198 - 408
Target Start/End: Original strand, 16270147 - 16270356
Alignment:
Q  198 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  16270147 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 16270246  T
Q  298 tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaa 397  Q
    | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16270247 taacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa 16270345  T
Q  398 gatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||    
T  16270346 gatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 224 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  224 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  324 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 405
Target Start/End: Original strand, 44928678 - 44929042
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgc 140  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| ||    
T  44928678 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgc 44928776  T
Q  141 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgatt 237  Q
    |||||| || ||||||||||||||  |||||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||||||| |||| ||||  || |||||| ||    
T  44928777 acgagtcgttgagagttgaaccttgtggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgttt 44928874  T
Q  238 atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 337  Q
    ||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44928875 atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgta 44928974  T
Q  338 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44928975 tactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  236 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  336 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 283 - 408
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  283 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 382  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  383 gtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44102570 - 44102214
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagt 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| | |||||||   |||||||||| |||||| ||||||||    
T  44102570 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat-acttgtttaggattttgcgatctttgtagcacgagt 44102472  T
Q  147 ggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatg 243  Q
     || |||||||||||||| || |||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  ||    
T  44102471 cgttgagagttgaaccttgggatag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattg 44102375  T
Q  244 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 343  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  44102374 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 44102275  T
Q  344 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44102274 -tgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  168 gtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 267  Q
    ||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattact 17046626  T
Q  268 tgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaac 366  Q
    |||||||| | || |||  |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||| |   | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17046625 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaac 17046529  T
Q  367 taagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  17046528 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18215374 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190481
Alignment:
Q  88 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaagg 187  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||      
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaata 6190683  T
Q  188 tgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat-tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatt 286  Q
    |||  |||| || |||  ||||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||  |||||| |    
T  6190682 tgatattaattacaattcgtgaagctg-ttatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataat 6190585  T
Q  287 taagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 384  Q
    | ||||| ||| |   || | |||||||||  ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6190584 tgagatgattgttcgcttac-attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggt 6190486  T
Q  385 ctaag 389  Q
    |||||    
T  6190485 ctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12407 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 405
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837671
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  1837494 ttgatgttg-ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7799074 - 7798959
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  7799074 gaatgaaacttgtagtattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgtcttgttaggttttgcga 7798975  T
Q  131 cctttgttgcacgagt 146  Q
    |||||||| |||||||    
T  7798974 cctttgtttcacgagt 7798959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15118452 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 411  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Original strand, 54798675 - 54798872
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || |||||| ||||||||     
T  54798675 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 54798764  T
Q  298 tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaa 397  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  54798765 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 54798864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15091274 - 15091093
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcg 129  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15091274 gaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcg 15091175  T
Q  130 acctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaag 211  Q
    | || ||| |||| |||     ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||||||||||||    
T  15091174 atctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239581
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18239519 gt-tgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 401
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15367896 - 15367690
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| |    
T  15367896 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattg 15367798  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15367797 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15367699  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  15367698 tgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15402909 - 15402703
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| |    
T  15402909 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattg 15402811  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15402810 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15402712  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  15402711 tgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14280512 - 14280316
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||      ||||||||||  ||   |  |||||| ||||||||     
T  14280512 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----ctt------attacttgaattatgaatctatatttgagatgttgt 14280423  T
Q  298 tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaa 397  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14280422 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 14280324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  322 tcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 390
Target Start/End: Original strand, 52242958 - 52243299
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 150  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  52242958 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgta 52243056  T
Q  151 gagagttgaacctttgggtaggatt-aagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 248  Q
     |||||||||| || |||||| | | |||| | ||    ||  ||||  || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  52243057 aagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgata 52243155  T
Q  249 taatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgccta 346  Q
    ||||  ||| ||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||||||| |||||| || ||||||||  ||| |||||  ||| ||| | | ||||||||    
T  52243156 taattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgccta 52243254  T
Q  347 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243255 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 52243299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15371408 - 15371202
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||  ||||| |    
T  15371408 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattg 15371310  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15371309 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15371211  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  15371210 tgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15373689 - 15373483
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||  ||||| |    
T  15373689 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattg 15373591  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15373590 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15373492  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  15373491 tgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 389
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13890 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15370223 - 15370018
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| | | |||||  ||||||||||| || ||| |||||| |    
T  15370223 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattg 15370126  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15370125 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15370027  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  15370026 tgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  |  || ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16223738 - 16223532
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||  ||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| |    
T  16223738 atctgtgaagctgatttatgatgatgtgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattg 16223640  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16223639 acttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 16223541  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  16223540 tgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 389
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  244 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 343  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  344 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  382 ggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |||||||||  || ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15551887 - 15551817
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15551887 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 390
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198658
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||   ||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  326 gctgt-ttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |   | ||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 43198658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  233 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 331  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12774077 - 12774011
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12774077 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 39706339 - 39706409
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39706339 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15093955 - 15093798
Alignment:
Q  224 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 322  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  |||| ||||||  ||| || |||||||||||  | ||    
T  15093955 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattat-tgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagt 15093857  T
Q  323 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||||||||| |||| | ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15093856 catgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Original strand, 12288261 - 12288313
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288261 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 12288313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8846426 - 8846360
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8846426 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12774355 - 12774313
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774355 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 12774313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Original strand, 21815393 - 21815438
Alignment:
Q  50 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815393 ctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3332240 - 3332201
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3332240 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3332201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 404
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121917
Alignment:
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 329  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||  |     
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgatta 15121842  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    || |||||| ||||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  15121843 ttgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24029096 - 24029057
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24029096 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 94
Target Start/End: Original strand, 22633980 - 22634018
Alignment:
Q  56 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22633980 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15099706 - 15099665
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15099706 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15552166 - 15552129
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552166 gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgag 15552129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 381
Target Start/End: Original strand, 16348700 - 16348757
Alignment:
Q  324 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16348700 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 381
Target Start/End: Original strand, 16356988 - 16357045
Alignment:
Q  324 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16356988 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Original strand, 21815064 - 21815109
Alignment:
Q  50 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815064 ctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Original strand, 21818486 - 21818531
Alignment:
Q  50 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21818486 ctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21818531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 13812578 - 13812614
Alignment:
Q  58 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13812578 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17333346 - 17333298
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333346 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 20156993 - 20157025
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20156993 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 20157025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 22633916 - 22633948
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22633916 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22633948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 4561107 - 4561142
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4561107 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4561142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 5756711 - 5756746
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5756711 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 5756746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 19757359 - 19757410
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19757359 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19757410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19782447 - 19782396
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19782447 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19782396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 20157056 - 20157095
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20157056 ctgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgag 20157095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33742710 - 33742675
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33742710 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 33742675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45938495 - 45938444
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45938495 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45938444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 46640507 - 46640558
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640507 actgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 53082203 - 53082254
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082203 actgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
Target Start/End: Original strand, 8574790 - 8574836
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 244  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8574790 ataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 119
Target Start/End: Original strand, 15464694 - 15464760
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 119  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||    
T  15464694 acctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtt 15464760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 24029157 - 24029127
Alignment:
Q  3 gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24029157 gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 24029127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8846730 - 8846689
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8846730 accttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 8846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 6190851 - 6190819
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190851 aggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa 6190819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 13812512 - 13812544
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13812512 aggaaataatgtaggatgagattgaacctggaa 13812544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 15091315 - 15091283
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15091315 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 15091283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 15552231 - 15552199
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15552231 aggaaagaatgtaggatgagattggacctggaa 15552199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 16597063 - 16597031
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16597063 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 16597031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Original strand, 26243423 - 26243471
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 91  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26243423 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 26243471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 93
Target Start/End: Original strand, 39706052 - 39706092
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  39706052 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 39706092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 44053246 - 44053218
Alignment:
Q  2 ggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 30  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053246 ggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 44053218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13618 - 13211
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13618 aggaaagaatgtaggatgagactgaacctggaatgaaacttgtggcattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacct 13519  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||    
T  13518 agaatcagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattat 13419  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13418 aatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 13319  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13318 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagat 13219  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  13218 gatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 99)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 20360674 - 20361081
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20360674 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgaccc 20360773  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||    
T  20360774 agaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattat 20360873  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20360874 aatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 20360973  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20360974 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaat 20361073  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  20361074 gatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 20637997 - 20638404
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20637997 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcacctcgcgagtgaccc 20638096  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||| | | ||| ||||| |||    
T  20638097 agaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattat 20638196  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  20638197 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataa 20638296  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20638297 attgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagat 20638396  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  20638397 gatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 22779930 - 22780348
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22779930 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcaagcaaaggctctcgcctc 22780029  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||||| | | ||    
T  22780030 gcgagtaacctagaaacagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatg 22780129  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22780130 atgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 22780229  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22780230 gatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 22780329  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  22780330 ttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Original strand, 17287540 - 17287917
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  17287540 gaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcgattagaggctcttgtctcgtgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagggtttgcta 17287639  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  17287640 tctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgag 17287739  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt 330  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287740 gttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 17287839  T
Q  331 ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17287840 gtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 29060900 - 29060540
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  29060900 tctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagtt 29060801  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    |   |||| |||||||| |||||| ||| |||||| | | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29060800 gctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagat 29060701  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29060700 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctat 29060601  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29060600 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 408
Target Start/End: Original strand, 16920350 - 16920751
Alignment:
Q  4 aaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaga 103  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16920350 aaagaatgtaggataagattgtacctggaattaaacttatggaattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccaga 16920449  T
Q  104 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataat 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  16920450 aacaaagtgacttgttggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataat 16920549  T
Q  204 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaatt 303  Q
    || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||     
T  16920550 ctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatg 16920648  T
Q  304 gcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    | | |||||||   ||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  16920649 gaatttgatatacttatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatga 16920745  T
Q  403 tgatgt 408  Q
    ||||||    
T  16920746 tgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22831905 - 22831503
Alignment:
Q  5 aagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22831905 aagaatataggacgagattgaacctggaattaaactgatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaa 22831806  T
Q  105 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatc 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  22831805 acagagtgacttgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatc 22831706  T
Q  205 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaat--atttaagatgttgatgaat 302  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||  || ||||||||||||||||    
T  22831705 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaat 22831607  T
Q  303 tgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    || | ||||||| | |||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||    
T  22831606 tgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatg 22831510  T
Q  402 atgatgt 408  Q
    |||||||    
T  22831509 atgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 18409530 - 18409947
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||          | |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18409530 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctct 18409629  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||    
T  18409630 ctagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatg 18409729  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||   || ||  || |    
T  18409730 atgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattga 18409829  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18409830 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 18409929  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatg 407  Q
    | ||||||||||||||||    
T  18409930 ttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 35 - 408
Target Start/End: Original strand, 25629102 - 25629476
Alignment:
Q  35 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacct 133  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  25629102 taaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgactt 25629201  T
Q  134 ttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtt 233  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629202 ttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtt 25629301  T
Q  234 gattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  25629302 gattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttt 25629401  T
Q  334 tgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
     ||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25629402 cgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 19303244 - 19303661
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||          |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303244 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 19303343  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||| ||| |   ||||||||||||| |||||| | | ||| || | | ||    
T  19303344 agagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatg 19303443  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   || ||| || |    
T  19303444 atgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattga 19303543  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303544 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 19303642  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
      |||||||||||||||||    
T  19303643 atgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20594187 - 20593773
Alignment:
Q  5 aagaatgtaggatgagattgaacctggaat----------taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20594187 aagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaataaacttttggaaatctgacctgaactcgctacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20594088  T
Q  95 tgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggt 193  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| | | | | |     
T  20594087 tgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatga 20593988  T
Q  194 taactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||   ||   || ||| || |||||    
T  20593987 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatg 20593888  T
Q  294 ttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcga 393  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttga 20593788  T
Q  394 tgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||    
T  20593787 tgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11185905 - 11185524
Alignment:
Q  5 aagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 104  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11185905 aagagtgtaggacgagattgaacctggaattaaacttatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaa 11185806  T
Q  105 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatc 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||  | | ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||    
T  11185805 acatagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatc 11185706  T
Q  205 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattg 304  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| | || |||   |||||| ||||||||||    
T  11185705 tgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattg 11185607  T
Q  305 caattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     | ||||||| | |||||||   |||| ||||| |||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185606 aatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 18821533 - 18821714
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18821533 aggagagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgaccc 18821632  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18821633 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagactt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 241 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  241 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 241 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  241 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18334692 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19859019 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22782289 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  233 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  333 ttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8055091 tt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18457132 - 18456735
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga---attaa------acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 91  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||      |||| | |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18457132 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 18457033  T
Q  92 gagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-agg 187  Q
    ||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| ||  ||| || | ||| |      
T  18457032 gagttgcccaattacagaa-gccttgttcaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggcag--ttatgaatattatata 18456936  T
Q  188 tgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatt 286  Q
    | |  ||||  || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| |    
T  18456935 taatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 18456837  T
Q  287 taagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 386  Q
    | ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456836 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 18456738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  ||||||||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25656691 gc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25644528 - 25644338
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| | || ||||  ||||||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  25644528 atctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatga 25644429  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
     || || ||||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644428 cttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25644338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  1541011 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  262 attacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttat 361  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  362 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  16448626 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 381
Target Start/End: Original strand, 25603143 - 25603478
Alignment:
Q  45 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacga 144  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |   |||||||||  |||| ||   |||||| || ||| ||| ||    
T  25603143 ggattctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatga 25603242  T
Q  145 gtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 244  Q
    || |   ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |  || ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||    
T  25603243 gttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgt 25603342  T
Q  245 gatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcc 344  Q
    ||||| ||||| | | ||||||||||||  |   |||||| || |||||| | ||||||  || |||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||    
T  25603343 gatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcc 25603441  T
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25603442 tatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  259 tgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgt 358  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  359 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848114
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||  ||||| |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||   || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 201 - 381
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041644
Alignment:
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgt-gaatatttaagatgttgatg 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | |||||| ||||||||||||||| || | | | ||||| ||||||||||  ||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgt-atgtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattg 15041562  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041563 aattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 381
Target Start/End: Original strand, 25611481 - 25611816
Alignment:
Q  45 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacga 144  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  |   |||||||||  |||| ||   |||||| || ||| ||| ||    
T  25611481 ggattctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatga 25611580  T
Q  145 gtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 244  Q
    ||     ||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |  || ||| |  | ||||| |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||    
T  25611581 gttacttagagttgaacctttgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgt 25611680  T
Q  245 gatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcc 344  Q
    ||||| ||||| | | ||||||||||||  |   |||||| || |||||| | ||||||  || |||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||    
T  25611681 gatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcc 25611779  T
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25611780 tatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 323  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  324 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23992578 - 23992429
Alignment:
Q  254 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 352  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  23992578 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 23992483  T
Q  353 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  23992482 tattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 27333269 - 27333339
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27333269 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 27394009 - 27394079
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27394009 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  347 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 18821782 - 18821946
Alignment:
Q  224 tgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatg 321  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  ||||  ||||||||  ||||    
T  18821782 tgttaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatg 18821879  T
Q  322 tcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821880 gcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Original strand, 8227425 - 8227632
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | |    
T  8227425 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 8227524  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  8227525 cttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaaga 8227623  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  8227624 tgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  233 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 28496522 - 28496592
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  28496522 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 29808933 - 29809003
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  29808933 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Original strand, 28496216 - 28496280
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496216 gaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 95
Target Start/End: Original strand, 29808639 - 29808691
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808639 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 29808691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19652265 - 19652199
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19652265 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  355 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Original strand, 9098565 - 9098617
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098565 actgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9098617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33443116 - 33443068
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443116 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 15894186 - 15894237
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15894186 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgag 15894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668389
Alignment:
Q  344 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 19668389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21939738 - 21939699
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21939738 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21939699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 408
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  361 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 22334648 - 22334699
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  22334648 tgggattctgacctaaactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgag 22334699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 25641940 - 25641991
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25641940 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25641991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 396
Target Start/End: Original strand, 4185872 - 4185930
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 396  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  4185872 actgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 4185588 - 4185629
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4185588 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4185629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 4667978 - 4668019
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4667978 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18907226 - 18907134
Alignment:
Q  288 aagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||  | || |||||||| |||| | |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907226 aagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 22080502 - 22080543
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080502 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019425
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  388 ag 389  Q
    ||    
T  23019426 ag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 93
Target Start/End: Original strand, 27333049 - 27333089
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27333049 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 93
Target Start/End: Original strand, 27393789 - 27393829
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27393789 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8244193 - 8244158
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8244193 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 8244158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11567195 - 11567160
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11567195 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12496656 - 12496605
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12496656 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12496605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19652551 - 19652512
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcg 92  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19652551 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcg 19652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19870923 - 19870888
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19870923 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19870888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22863278 - 22863243
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22863278 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22863243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23076800 - 23076749
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076800 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23395401 - 23395366
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23395401 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23395366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35008218 - 35008167
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008218 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 94
Target Start/End: Original strand, 16924642 - 16924687
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16924642 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16924687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 94
Target Start/End: Original strand, 16929357 - 16929402
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16929357 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16929402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Original strand, 25642219 - 25642304
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  25642219 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 25642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 31155163 - 31155204
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31155163 acctgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 31155204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668688
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 19668688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 21939801 - 21939769
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21939801 aggaaagaatgtaggatgagattgagcctggaa 21939769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 23657189 - 23657229
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23657189 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23657229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 29060958 - 29060926
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29060958 aggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaa 29060926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 3 - 408
Target Start/End: Original strand, 8286558 - 8286964
Alignment:
Q  3 gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286558 gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctaaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 8286657  T
Q  103 aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||     
T  8286658 aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatat 8286757  T
Q  203 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaat 302  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  8286758 tatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaat 8286857  T
Q  303 tgcaattgatattactatgtcatgctg-tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286858 tgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8286957  T
Q  402 atgatgt 408  Q
    |||||||    
T  8286958 atgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 23390199 - 23390617
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  23390199 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctc 23390298  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
     ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  |    
T  23390299 acgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgagg 23390398  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23390399 atgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 23390498  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390499 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23390598  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  23390599 ttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22075422 - 22075018
Alignment:
Q  5 aagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 104  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075422 aagaatgtaggatgaaaatgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 22075323  T
Q  105 a-cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataat 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||||    
T  22075322 aacagagtgacttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 22075224  T
Q  204 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22075223 atgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaatt 22075124  T
Q  304 gcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag-atga 402  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22075123 gcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatga 22075024  T
Q  403 tgatgt 408  Q
    ||||||    
T  22075023 tgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 21292684 - 21293090
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292684 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 21292783  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  21292784 agaaatagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattat 21292883  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||    
T  21292884 aatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatga 21292982  T
Q  301 attgca--attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag 398  Q
    |||  |  |||||||||| |||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||    
T  21292983 atttgaatattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaag 21293080  T
Q  399 atgatgatgt 408  Q
    ||||||||||    
T  21293081 atgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25421892 - 25421532
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25421892 tctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagtt 25421793  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25421792 gttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgat 25421693  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25421692 ataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctat 25421593  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25421592 gttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13095912 - 13095495
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13095912 aggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggccctcgcctcg 13095813  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||    
T  13095812 cgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatg 13095713  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  13095712 atgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaa 13095613  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13095612 gatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaag 13095514  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  13095513 ttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24493986 - 24493569
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24493986 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctttcgcctcg 24493887  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
     |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||    
T  24493886 tgagtaacccataaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatg 24493787  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  24493786 atgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaa 24493687  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24493686 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 24493588  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  24493587 ttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13025728 - 13025311
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  13025728 aggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcg 13025629  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||    
T  13025628 cgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatg 13025529  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  13025528 atgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaa 13025429  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13025428 gatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaag 13025330  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  13025329 ttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25431772 - 25431395
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcg 129  Q
    |||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  25431772 gaatgaaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgagtgacccagaaatcgagtgccttgttaggattttgcg 25431673  T
Q  130 acctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 229  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25431672 acctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttga 25431573  T
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25431572 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttg 25431473  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25431472 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24529639 - 24529223
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529639 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaggttgtagaatgaaacttttggaattctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 24529540  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| ||| | |||| | | |    
T  24529539 gcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgat 24529440  T
Q  189 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattta 288  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||   || ||| |||    
T  24529439 gatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataatta 24529340  T
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24529240  T
Q  389 gtcgatgaagatgatga 405  Q
    || ||||||||||||||    
T  24529239 gttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 47 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 9078314 - 9077952
Alignment:
Q  47 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||| ||    
T  9078314 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaag 9078215  T
Q  146 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 245  Q
    | ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078214 ttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 9078115  T
Q  246 atataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcct 345  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9078114 atataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcct 9078015  T
Q  346 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9078014 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1096827 - 1096467
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaga-ttttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| || ||| |||| |||     
T  1096827 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagtt 1096728  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    ||  | ||||| ||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1096727 gttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgat 1096628  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| ||| |    
T  1096627 ataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgt 1096528  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1096527 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 22107087 - 22107357
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107087 aggaaagaatgtaggacgagattgaacctgaaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 22107186  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
     |||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||| |||    
T  22107187 ggaaatagagtgccttgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattat 22107286  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22107287 aatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 21985850 - 21986130
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||          | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21985850 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcg 21985949  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||    
T  21985950 cgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatg 21986049  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 270  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21986050 atgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 241 - 408
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  241 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 241 - 408
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  241 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 405
Target Start/End: Original strand, 11581006 - 11581361
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagt 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| | ||||||    
T  11581006 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccatttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgtacgagt 11581104  T
Q  147 ggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatg 243  Q
     || |||||||||||||| ||||||  ||| || | ||| |  | |  ||||  ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  ||    
T  11581105 cgttgagagttgaaccttggggtag--ttatgaatattatatataatattaatgataatctgtgaagttgatttatgatga-ttgatgttg-ttatattg 11581200  T
Q  244 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 343  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||     
T  11581201 tgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt 11581300  T
Q  344 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11581301 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 405
Target Start/End: Original strand, 36154589 - 36154942
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagt 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| ||||||||    
T  36154589 tctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagt 36154687  T
Q  147 ggtcgagagttgaacctttgggtagg-attaagacttta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatg 243  Q
     || |||||||||||||| ||||||  || || | | || |  | |  ||||  || || |||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  ||    
T  36154688 cgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatatatta--ttaatgatgatatgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattg 36154784  T
Q  244 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 343  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36154785 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 36154884  T
Q  344 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36154885 ---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  264868 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 405
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  243 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactg 342  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  343 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10733041 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 302 - 408
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997655
Alignment:
Q  302 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21997648  T
Q  402 atgatgt 408  Q
    |||||||    
T  21997649 atgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418598
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 291  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||| ||||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaaga 18418695  T
Q  292 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  293 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 392  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  393 atgaagatgatga 405  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||  || |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39245198 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18319133 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 390
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902156
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902108 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20902156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2154713 tgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22144406 - 22144068
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 150  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  22144406 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 22144308  T
Q  151 gagagttgaacctttgggtaggatt-aagact-ttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    |||||||||||||| | || | | | |||| | || |  |||  ||||  || | |||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||  |||||||    
T  22144307 gagagttgaaccttggagtcgtaatgaagattgttta--tgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgat 22144210  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    |||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||| |||||    
T  22144209 ataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctat 22144111  T
Q  348 gttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144110 gttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 406
Target Start/End: Original strand, 17517168 - 17517320
Alignment:
Q  254 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 352  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  17517168 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 17517266  T
Q  353 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  17517267 tattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 31061231 - 31061068
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || ||  || |||||||| || | | |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  31061231 tgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 31061132  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31061131 tac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 38619562 - 38619434
Alignment:
Q  277 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 375  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38619562 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgca 38619464  T
Q  376 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38619463 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  233 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  333 ttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 405
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  311 atattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 37724117 - 37723922
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 290  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||   |||||  || ||    
T  37724117 gttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgag 37724019  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37724018 atgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23064639 - 23064512
Alignment:
Q  277 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 375  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23064639 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgca 23064541  T
Q  376 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23064540 tgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 19660886 - 19660956
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19660886 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 21329548 - 21329618
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21329548 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  24067170 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  233 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21873462 - 21873277
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaag 290  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||  |||||    
T  21873462 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatggttaag 21873365  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||||   |||| ||  ||||||||||  | ||||||||| | |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873364 atgt---tgaaatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 389
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 386  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  387 aag 389  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 22959583 - 22959649
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22959583 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 408
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  285 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 383  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| |||   | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  384 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 40726060 - 40725853
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | |    
T  40726060 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 40725961  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     || |    ||||||| ||| ||||| ||  |||| | |||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40725960 cttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaaga 40725862  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  40725861 tgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36314643 - 36314577
Alignment:
Q  343 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  36314643 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22032492 - 22032323
Alignment:
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 329  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  22032492 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgat- 22032398  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  22032397 tgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 26012086 - 26012154
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26012086 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19668968 - 19668898
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19668968 actgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 405
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  351 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 404
Target Start/End: Original strand, 18769947 - 18770118
Alignment:
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct- 328  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  18769947 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 18770042  T
Q  329 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  18770043 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 22119896 - 22119998
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22119896 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 22119994  T
Q  91 cgag 94  Q
    ||||    
T  22119995 cgag 22119998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
Target Start/End: Original strand, 20766041 - 20766087
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20766041 ataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 5888940 - 5888981
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5888940 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 5888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 19660606 - 19660643
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19660606 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 19660643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 102
Target Start/End: Original strand, 21501919 - 21501968
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 102  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21501919 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccag 21501968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21565900 - 21565863
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565900 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 21565863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 22959298 - 22959339
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959298 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 95
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20026746
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 20026746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572107
Alignment:
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 329  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||  |||||  ||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 23572159  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    || |||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23572158 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtc 23572107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 19472493 - 19472528
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19472493 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19472528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20296180 - 20296145
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20296180 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20296145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 333
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766166
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttt 333  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20766166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 21340525 - 21340576
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21340525 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23201445 - 23201382
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 382  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23201445 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 23201382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23201731 - 23201680
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23201731 tgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23201680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 23535347 - 23535398
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23535347 tgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23535398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 24532806 - 24532857
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24532806 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24532857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 24767103 - 24767142
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24767103 ctgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24767142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 26665889 - 26665940
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26665889 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26665940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 26937486 - 26937537
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26937486 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26937537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 31342453 - 31342414
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31342453 ctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 31342414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744036
Alignment:
Q  56 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20232896 - 20232847
Alignment:
Q  45 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20232896 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20232847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 385
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 90
Target Start/End: Original strand, 21741308 - 21741345
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21741308 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21741345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 385
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 123074 - 123114
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  123074 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 123114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 1096885 - 1096853
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096885 aggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaa 1096853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 21871274 - 21871306
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21871274 aggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaa 21871306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Original strand, 21871329 - 21871377
Alignment:
Q  46 gattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21871329 gattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21871377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 21875554 - 21875586
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21875554 aggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaa 21875586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Original strand, 21875609 - 21875657
Alignment:
Q  46 gattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21875609 gattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21875657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 763 - 1169
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  763 aggaaagaatttaggatgagattgaacctagattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 862  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||    
T  863 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattat 962  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  963 aatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatga 1061  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1062 attgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 1161  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  1162 gatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 167693 - 168099
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167693 aggaaagaatttaggatgagattgaacctagattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 167792  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||    
T  167793 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattat 167892  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  167893 aatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatga 167991  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  167992 attgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 168091  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  168092 gatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 52330 - 51913
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52330 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 52231  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||    
T  52230 gcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgacctt-gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatg 52132  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  52131 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 52032  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52031 gatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51932  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  51931 ttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 27250443 - 27250850
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27250443 aggaaagaatgtaggatgggattgaacctggaatgaaacctgtgggattctgacctgaactcgccacgtcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacac 27250542  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |  |||||||| |||    
T  27250543 agaaacagagtcccttgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattat 27250642  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27250643 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatga 27250742  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27250743 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 27250842  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  27250843 gatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21027083 - 21026680
Alignment:
Q  5 aagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21027083 aagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctaaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 21026984  T
Q  105 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatc 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||    
T  21026983 acaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatc 21026884  T
Q  205 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21026883 tgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattg 21026784  T
Q  305 caattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||   || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  21026783 caattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatg 21026684  T
Q  405 atgt 408  Q
    ||||    
T  21026683 atgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 50209916 - 50210333
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50209916 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 50210015  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||    
T  50210016 cgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatg 50210115  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || |    
T  50210116 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttga 50210215  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210216 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50210315  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatg 407  Q
    | ||||||||||||||||    
T  50210316 ttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22532687 - 22532269
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22532687 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaggattgtagaatgaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcg 22532588  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | | ||    
T  22532587 cgagtgacccaaaaacagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatg 22532488  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||    
T  22532487 atgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaa 22532388  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  22532387 gatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaag 22532288  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  22532287 ttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 38801105 - 38801508
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  38801105 aggaaagaatgtaggatgtgattgaacctggaattgaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacct 38801204  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||    
T  38801205 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactat 38801304  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||    
T  38801305 aatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatga 38801403  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| | ||||||| | |||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||    
T  38801404 attgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaaga 38801499  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  38801500 tgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Original strand, 22354316 - 22354616
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22354316 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcga 22354415  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354416 cctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 22354515  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22354516 gttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgt 22354615  T
Q  331 t 331  Q
    |    
T  22354616 t 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 34510198 - 34509783
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34510198 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctca 34510099  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||    
T  34510098 cgagtgacccagaaacagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatg 34509999  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||   || ||| ||||    
T  34509998 atgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaa 34509899  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509898 gatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 34509799  T
Q  390 tcgatgaagatgatga 405  Q
    | ||||||||||||||    
T  34509798 ttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 22355888 - 22356185
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  22355888 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacct 22355986  T
Q  101 agaaacagagtgac-ttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaacta 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||    
T  22355987 agaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaatta 22356086  T
Q  200 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  22356087 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 22357574 - 22357871
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  22357574 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacct 22357672  T
Q  101 agaaacagagtgac-ttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaacta 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||    
T  22357673 agaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaatta 22357772  T
Q  200 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  22357773 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20135548 - 20135188
Alignment:
Q  47 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgcacgag 145  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  20135548 attctgacc-gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgag 20135450  T
Q  146 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 245  Q
    | || |||||||||||||| |||||| | |||||| | | | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20135449 ttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatg 20135350  T
Q  246 atataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcct 345  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  |   |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  20135349 atataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcct 20135250  T
Q  346 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  20135249 atgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 20846937 - 20847161
Alignment:
Q  5 aagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20846937 aagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaa 20847036  T
Q  105 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||| ||||||    
T  20847037 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatc 20847136  T
Q  205 tgtgaagctgttt-aagatgtgttg 228  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  20847137 tatgaagctgtttaaagatgtgttg 20847161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 198 - 407
Target Start/End: Original strand, 22468608 - 22468816
Alignment:
Q  198 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||||    
T  22468608 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattat-tgaataattaagatgttg 22468705  T
Q  297 atgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 396  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |    
T  22468706 ttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgatta 22468805  T
Q  397 agatgatgatg 407  Q
    ||||| |||||    
T  22468806 agatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 433373 - 433012
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || ||||||   |||||||||| |||||| ||    
T  433373 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttgcaaaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgc 433275  T
Q  141 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtagg-attaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgatta 238  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||  || || | | |||  | |  ||||  || |||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| |||    
T  433274 acgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaatattataaa-taatattaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgttta 433176  T
Q  239 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaa 338  Q
    |  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||     
T  433175 tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtat 433076  T
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  433075 actgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 405
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593897
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21923391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 408
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16275463 tgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361915
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    | ||||||| || ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  16361995 gttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 408
Target Start/End: Original strand, 20847185 - 20847275
Alignment:
Q  318 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20847185 tatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 381
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  224 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagt 21788077  T
Q  323 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21788078 catgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 408
Target Start/End: Original strand, 13212812 - 13213027
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 291  Q
    ||||| || |||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||    
T  13212812 ttaacgatgatctgtgaagttgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 13212910  T
Q  292 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
     |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212911 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 13213009  T
Q  391 cgatgaagatgatgatgt 408  Q
     ||| |||||||||||||    
T  13213010 tgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 411
Target Start/End: Original strand, 15860008 - 15860177
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||  || ||||| || |||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  15860008 tgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatac 15860107  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 411  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  15860108 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21347161 - 21346961
Alignment:
Q  205 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaat 302  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| || |    
T  21347161 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 21347063  T
Q  303 tgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21347062 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21346964  T
Q  403 tga 405  Q
    |||    
T  21346963 tga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21342296 - 21342090
Alignment:
Q  205 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaat 302  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| || |    
T  21342296 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 21342198  T
Q  303 tgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21342197 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21342099  T
Q  403 tgatgtcca 411  Q
    ||| |||||    
T  21342098 tgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 389
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896295 gctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||| || |||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  342 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 gt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 389
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  227 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg 326  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  327 ctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||   ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21707229 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||   ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21711771 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 389
Target Start/End: Original strand, 35260986 - 35261180
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 291  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||| | || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||  || | ||||| ||| |||    
T  35260986 ttaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga 35261085  T
Q  292 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||   ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261086 tgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 340 - 407
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  233 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16758857 - 16758667
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||   ||||||| ||     
T  16758857 atctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgt-gatgttgttgt 16758759  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||| | ||||||||  ||| |||||  ||| ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16758758 attgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 16758667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681010
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||    
T  33681034 cggtctaagt---tgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21754115 - 21754052
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21754115 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 404
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||  ||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 408
Target Start/End: Original strand, 14295606 - 14295672
Alignment:
Q  343 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  14295606 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237630
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||    
T  22237654 cggtctaagt---tgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20918674 - 20918622
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918674 actgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20918622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33681365 - 33681301
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||    
T  33681365 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttg 33681301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20248349 - 20248283
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20248349 actgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21754392 - 21754350
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754392 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Original strand, 52928021 - 52928073
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928021 actgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 52928073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 20091230 - 20091281
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  20091230 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgag 20091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20918956 - 20918917
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20918956 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 50614168 - 50614219
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614168 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 50621996 - 50622047
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621996 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368388
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20637206 - 20637165
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20637206 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21162121 - 21162080
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21162121 acctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12647217 - 12647166
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12647217 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12647166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 16375231 - 16375266
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16375231 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16375266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21407688 - 21407653
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21407688 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 41050087 - 41050138
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050087 actgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 52639874 - 52639839
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52639874 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 52639839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 21533924 - 21533974
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533924 actgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20248633 - 20248592
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20248633 acctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgag 20248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 22921635 - 22921672
Alignment:
Q  56 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22921635 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22921672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065254
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 26065254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 28194213 - 28194254
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  28194213 acctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgag 28194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 35981451 - 35981492
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  35981451 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 35981492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 93
Target Start/End: Original strand, 52927745 - 52927786
Alignment:
Q  52 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  52927745 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 52927786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 433425 - 433393
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  433425 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 433393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16758938 - 16758890
Alignment:
Q  121 gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggt 169  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16758938 gattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 16758890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 20135605 - 20135573
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20135605 aggaaagaatgtaggatgagattggacctggaa 20135573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 45310135 - 45310175
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45310135 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45310175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 50686682 - 50686630
Alignment:
Q  338 aactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686682 aactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 105)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 9509607 - 9509189
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9509607 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctc 9509508  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  |    
T  9509507 gcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgagg 9509408  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9509407 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 9509308  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509307 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9509208  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  9509207 ttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12699209 - 12698831
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12699209 gaatgaaactcgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaaacaaagtgacttgttaggttttgcga 12699110  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || | |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12699109 cctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 12699010  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12699009 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt 12698910  T
Q  331 -ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12698909 gttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 16385961 - 16386369
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16385961 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagtggctctcgcctcgcgagtgaccc 16386060  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||    
T  16386061 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactat 16386160  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||    
T  16386161 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatga 16386260  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | | ||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16386261 aatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 16386360  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  16386361 tgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40443795 - 40443393
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443795 aggaaagaatttaggatgagattgaacctggaattaa-cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 40443697  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  40443696 agaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattat 40443597  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  40443596 aatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatga 40443498  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  40443497 attgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaaga 40443400  T
Q  400 tgatgat 406  Q
    |||||||    
T  40443399 tgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26212399 - 26211995
Alignment:
Q  5 aagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212399 aagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 26212300  T
Q  105 a-cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataat 203  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||||    
T  26212299 aacagagtgatttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 26212201  T
Q  204 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26212200 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaatt 26212101  T
Q  304 gcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag-atga 402  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  26212100 gcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatga 26212001  T
Q  403 tgatgt 408  Q
    ||||||    
T  26212000 tgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 27847547 - 27847951
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847547 aggaaagaatttaggatgagattgaacctggaattaaacttatgggattttgacctgaactcgccacggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 27847646  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||    
T  27847647 aaaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactat 27847746  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||    
T  27847747 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 27847845  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| | ||||||| | |||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  27847846 attgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaaga 27847942  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  27847943 tgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 60 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10589386 - 10589039
Alignment:
Q  60 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  10589386 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttgg 10589287  T
Q  160 acctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |    
T  10589286 acctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tat 10589188  T
Q  260 gcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10589187 gcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgtt 10589088  T
Q  360 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  10589087 atttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 38227898 - 38227481
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||          | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227898 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 38227799  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||    
T  38227798 cgagtgacccataaacagagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatg 38227699  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  38227698 atgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaa 38227599  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227598 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38227500  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  38227499 tagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 3564067 - 3564482
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  3564067 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacagcgagcaaatgctctcgcctcg 3564166  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||| ||| |||||| | | ||    
T  3564167 cgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatg 3564266  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || |    
T  3564267 atgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattga 3564366  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564367 gatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 3564466  T
Q  390 tcgatgaagatgatga 405  Q
    | ||||||||||||||    
T  3564467 ttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 405
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  293 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 392  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  393 atgaagatgatga 405  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 15143786 - 15144140
Alignment:
Q  37 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgaccttt 135  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15143786 aacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgaccttt 15143885  T
Q  136 gttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttg 234  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||  |||||| | |||||||| | | ||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||    
T  15143886 gttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattg 15143985  T
Q  235 attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttttt 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||  ||   || ||| || |||||||| ||  ||||| |||||||||  || || ||||||| ||    
T  15143986 attatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttatt 15144085  T
Q  335 gtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    | | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144086 gcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 15144140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16213861 - 16213684
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  16213861 ttgatgttg-ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 16213763  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16213762 gttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44116871 - 44116509
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  | || |||   |||||||||| |||| ||||    
T  44116871 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgactcagttacagaacg-ctagtttaggattttgcgatctttattgc 44116773  T
Q  141 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtagg-attaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgatta 238  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||  || || | | ||   | |  ||||  || || |||||| ||| |||| ||||  ||||||||| |||    
T  44116772 acgagtcgttgagggttgaaccttggggtagttatgaataatatata-taatattaatgatgatatgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-tta 44116675  T
Q  239 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaa 338  Q
    |  |||||||||||  ||| |||||| ||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  44116674 tattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtat 44116575  T
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44116574 actgc-tgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14949222 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15376813 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20385223 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21189695 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 404
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11393387 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 259 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  259 tgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgt 358  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  359 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280238
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| |||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     ||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 2280229  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  2280230 tgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  244 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 343  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt 16410120  T
Q  344 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16410119 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 405
Target Start/End: Original strand, 17061721 - 17062077
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagt 146  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| ||||||||    
T  17061721 tctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagt 17061819  T
Q  147 ggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatg 243  Q
     || |||||||||||| | ||||||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||    
T  17061820 cgttgagagttgaaccatggggtag--ttatgaatattacatataatattaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattg 17061916  T
Q  244 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 343  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  17061917 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgc 17062015  T
Q  344 ctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
      | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17062016 tga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 289 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  389 gtcgatgaagatgatga 405  Q
    || ||| ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3386395 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 404
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  239 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  338 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 404
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  239 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  338 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 404
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  239 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  338 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||   |||||||| |||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 401
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 302 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13869448 - 13869346
Alignment:
Q  302 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13869448 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13869350  T
Q  402 atga 405  Q
    ||||    
T  13869349 atga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20110724 - 20110556
Alignment:
Q  225 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtca 324  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  20110724 gttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 20110626  T
Q  325 tgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20110625 tgctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 319 - 402
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  278 gtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 377  Q
    ||||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 13831401  T
Q  378 agtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  13831400 agtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 67815 - 67745
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  67815 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 28505349 - 28505419
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28505349 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 34200856 - 34200786
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34200856 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Original strand, 12756631 - 12756817
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||| |||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||| || ||| |||| | |    
T  12756631 atctgtgatgctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttta 12756729  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756730 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Original strand, 19486658 - 19486865
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||| | |    
T  19486658 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 19486757  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19486758 cttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaaga 19486856  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  19486857 tgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  388 agtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 811182 - 811248
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  811182 actgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 408
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219835
Alignment:
Q  285 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 383  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  384 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||   |||||||||||||||    
T  16219814 tctaagt---tgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16495472 - 16495402
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16495472 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18005716 - 18005650
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18005716 actgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44014248 - 44014182
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44014248 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 47831877 - 47831807
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47831877 actgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  342 g 342  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  342 g 342  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 11996078 - 11996148
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11996078 actgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 408
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  355 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Original strand, 1867910 - 1868098
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa 301  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| | |     
T  1867910 atctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttcat 1868008  T
Q  302 ttgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868009 ttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1868098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 404
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138177
Alignment:
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct- 328  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 17138101  T
Q  329 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  17138102 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211484
Alignment:
Q  232 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||  |   |||||| || |||||||| ||||||  || |||||||  ||||||||| ||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  332 tttgtaaa-ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
     |||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48273588 - 48273538
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48273588 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 48273538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 359
Target Start/End: Original strand, 2530130 - 2530208
Alignment:
Q  279 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||   |||||||||||||||||||    
T  2530130 tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 12255556 - 12255892
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 150  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| ||||||  ||||||| ||     
T  12255556 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgtt 12255654  T
Q  151 gagagttgaacctttgggtag-gattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 248  Q
    ||||||||||  || ||||||  || |||| | ||   | |  ||||  || |||| ||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  12255655 gagagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataat-atattaatgatgatctatgaagttgttataagatg-attgatgttgtttataatgtgata 12255752  T
Q  249 taatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||  ||| || ||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| || ||||||||  ||| |||||  |   |||| | |||| ||||    
T  12255753 taattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactat 12255852  T
Q  348 gttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 386  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255853 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 171
Target Start/End: Original strand, 12756478 - 12756600
Alignment:
Q  50 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||   ||| |  | ||||||   |||||||||| |||||| ||||||||     
T  12756478 ctgacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattaca-aaagccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtc 12756576  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtag 171  Q
    || |||||||||||||| ||||||    
T  12756577 gttgagagttgaaccttggggtag 12756600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16056684 - 16056616
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag 121  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  16056684 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttag 16056616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12187189 - 12187019
Alignment:
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-g 329  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| | |    
T  12187189 gttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattg 12187094  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  12187093 taattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 385
Target Start/End: Original strand, 15008410 - 15008597
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| || || ||| || |||||     
T  15008410 ataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgt 15008508  T
Q  298 tgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    ||| |||| |||||||||  ||| |||||  ||| |||| || ||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008509 tgatttgc-attgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18302533 - 18302494
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18302533 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 810894 - 810936
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  810894 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 810936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||  |||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22073272 - 22073223
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 102  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22073272 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccag 22073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 28505069 - 28505106
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28505069 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 28505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901341
Alignment:
Q  331 ttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagt 12901341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14044816 - 14044764
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044816 actgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14044764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14354846 - 14354794
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354846 actgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14354794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 18302596 - 18302564
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302596 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 18302564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 39267349 - 39267447
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39267349 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 39267447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 2832071 - 2832110
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2832071 ctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 9389462 - 9389501
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9389462 ctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9389501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 9751316 - 9751355
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9751316 ctgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 11995796 - 11995835
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11995796 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 11995835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12719001 - 12718966
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12719001 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12718966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12723912 - 12723877
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12723912 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16056393 - 16056346
Alignment:
Q  344 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16056393 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagt 16056346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 16438792 - 16438843
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16438792 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16438843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 16906974 - 16907009
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16906974 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16907009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 17137820 - 17137871
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17137820 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17137871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18279736 - 18279701
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18279736 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18279701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18283699 - 18283664
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18283699 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18283664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34201138 - 34201099
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34201138 ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 34201099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 68099 - 68061
Alignment:
Q  56 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  68099 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 68061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15113125 - 15113036
Alignment:
Q  225 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 315  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |  |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15113125 gttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 15113036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15116662 - 15116573
Alignment:
Q  225 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 315  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |  |||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15116662 gttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattga-gatgttgatgacttgcaattgatatt 15116573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18203881 - 18203831
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203881 actgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 405
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356156
Alignment:
Q  347 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  26356098 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 405
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358608
Alignment:
Q  347 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  26358550 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44014530 - 44014489
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  44014530 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 44014489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 2832009 - 2832037
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacct 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832009 aggaaagaatgtaggatgagattgaacct 2832037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 9751253 - 9751285
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9751253 aggaaagaatgtaggatgaggttgaacctggaa 9751285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 12699250 - 12699218
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12699250 aggaaagaatgtaggatgaaattgaacctggaa 12699218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23286268 - 23285865
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23286268 aggaaagaatgtaggatgagattgaacatggaatgaaaattgtgagattatgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacct 23286169  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| |||    
T  23286168 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattat 23286069  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23286068 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatga 23285969  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23285968 attgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 23285873  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  23285872 gatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Original strand, 22737924 - 22738300
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22737924 gaatgaaacttgtgggattctgaactgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggttttgcga 22738023  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738024 cctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 22738123  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738124 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt 22738223  T
Q  331 ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22738224 ttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 22730936 - 22731355
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22730936 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcaaaggctctcgcctc 22731035  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttggg-taggattaagactttaaggt 188  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |      
T  22731036 acgagtcacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgag 22731135  T
Q  189 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattta 288  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22731136 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatattta 22731235  T
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731236 atatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22731335  T
Q  389 gtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
     | |||||||||||||||||    
T  22731336 cttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 408
Target Start/End: Original strand, 37838 - 38235
Alignment:
Q  9 atgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  37838 atgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacat 37937  T
Q  109 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||| ||    
T  37938 agtgacttgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctg 38037  T
Q  209 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat 308  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||||||| |||||||| | |||    
T  38038 aagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaat 38136  T
Q  309 tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38137 tgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20309512 - 20309108
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309512 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 20309413  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  20309412 agaaacaaagtgacttgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactat 20309313  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  20309312 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 20309214  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| | ||||||| | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  20309213 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 20309117  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  20309116 tgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23076858 - 23076442
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23076858 aggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaactt-tggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 23076760  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtga 190  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||  || |||| | |||    
T  23076759 cgagttacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatga 23076660  T
Q  191 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 290  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  23076659 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 23076560  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076559 atattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T
Q  391 cgatgaagatgatgatgt 408  Q
     |||||||||||||||||    
T  23076459 ggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 23654113 - 23654507
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||             ||||||||||||    
T  23654113 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactgttgggattctgacttgaactcgccacggcgagca-------------cgcgagtgaccc 23654199  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||    
T  23654200 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattat 23654299  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23654300 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatga 23654399  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23654400 attgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 23654499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 298518 - 298933
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  298518 aggaaagaatataggatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 298617  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtga 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||    
T  298618 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaaga 298717  T
Q  191 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  298718 ggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 298817  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298818 atgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298917  T
Q  390 tcgatgaagatgatga 405  Q
    | ||| ||||||||||    
T  298918 ttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22337533 - 22337115
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22337533 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcg 22337434  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||| | | ||    
T  22337433 cgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatg 22337334  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |    
T  22337333 atgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttga 22337234  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337233 gatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22337134  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  22337133 ttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23660382 - 23660023
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  23660382 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagtt 23660283  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
     | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||   | ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660282 attgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 23660183  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||  |||||||||||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  23660182 ataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctat 23660084  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23660083 gttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 104 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  104 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataat 203  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| || |||||| |||  ||||| | | ||| ||||| ||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 23060717  T
Q  204 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||| ||    
T  23060716 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 23060618  T
Q  304 gcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23060617 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23060518  T
Q  404 gatgt 408  Q
    |||||    
T  23060517 gatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27753993 - 27753730
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753993 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 27753894  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| | | ||    
T  27753893 gcaagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatg 27753794  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 253  Q
    | ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753793 atgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 389
Target Start/End: Original strand, 32451673 - 32452031
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32451673 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 32451772  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||  |||  |||| || ||| |||||||||| ||| |   |||| ||    
T  32451773 cctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctg-ttatgggatgttaat 32451871  T
Q  231 gttga-ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  |||| |||||||||  |||||||||||    
T  32451872 gttgatttatgatgtgatattatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgc-attgatattgttatgtcatgct 32451969  T
Q  329 gtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     |||||| |  ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451970 atttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 408
Target Start/End: Original strand, 23708383 - 23708738
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtc 150  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  23708383 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 23708481  T
Q  151 gagagttgaacctttgggtaggatt-aagact-ttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || ||||||||||| |||| | | | |||| | || |  |||  ||||  || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||    
T  23708482 gatagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgttta--tgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgat 23708579  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    |||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| | |||||||||    
T  23708580 ataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctat 23708678  T
Q  348 gttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  23708679 gttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23709632 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23712113 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26505441 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26507919 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34402622 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135590
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23135652 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 403  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45029954 gt-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 289 - 408
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23103496  T
Q  389 gtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |  | |||||||||||||||    
T  23103497 gatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25616339 - 25616192
Alignment:
Q  254 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 352  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  25616339 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 25616241  T
Q  353 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  25616240 tattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671830
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||    
T  19672010 ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 19671913  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  19671912 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  331 ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24529628 tga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 408
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 381
Target Start/End: Original strand, 22799063 - 22799220
Alignment:
Q  224 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 322  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  22799063 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagt 22799161  T
Q  323 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| |||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799162 catgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgat 403  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 370
Target Start/End: Original strand, 23019643 - 23019789
Alignment:
Q  224 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 322  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  23019643 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagt 23019741  T
Q  323 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 370  Q
    |||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23019742 catgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 23019789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 389
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  241 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  341 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 407
Target Start/End: Original strand, 22134258 - 22134326
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  22134258 actgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 402
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7679655 - 7679589
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  7679655 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 23072000 - 23072070
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  23072000 actgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    | |||||||| ||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23287432 - 23287384
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287432 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 40622114 - 40622327
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatat-----gtgaatat 285  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||      || |||     
T  40622114 gttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtactgtatac 40622210  T
Q  286 ttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 384  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| |    
T  40622211 ataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgat 40622307  T
Q  385 ctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
     ||||  ||| |||||||||    
T  40622308 ataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 389
Target Start/End: Original strand, 20520104 - 20520295
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| | | || |||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| ||| | ||| ||||||||     
T  20520104 ataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga-tgtttgagatgttgt 20520202  T
Q  298 tgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttt-tgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||| |||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520203 tgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgttttatgta--ctgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 390
Target Start/End: Original strand, 18786958 - 18787006
Alignment:
Q  343 cctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786958 cctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18787006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 93
Target Start/End: Original strand, 22133977 - 22134020
Alignment:
Q  50 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22133977 ctgaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 22740717 - 22740768
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22740717 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22740768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23207347 - 23207296
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207347 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 23071731 - 23071768
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23071731 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 23071768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 12901286 - 12901321
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12901286 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12901321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 300
Target Start/End: Original strand, 22459500 - 22459575
Alignment:
Q  225 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22459500 gttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatga 22459575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 22460948 - 22460999
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22460948 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22460999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 24628252 - 24628287
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24628252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24628287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24649689 - 24649654
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24649689 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24649654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 27379206 - 27379241
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27379206 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27379241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 27383252 - 27383287
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27383252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27383287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27602129 - 27602094
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27602129 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27602094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 41530783 - 41530818
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41530783 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 41530818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642930
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 316  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 24642930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 28406335 - 28406297
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 91  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28406335 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 28406297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241945
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaag 9241945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Original strand, 22740996 - 22741081
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  22740996 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22741081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25176199 - 25176158
Alignment:
Q  52 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  25176199 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 25176158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 23660440 - 23660408
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23660440 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 23660408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756232
Alignment:
Q  58 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 92)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20536626 - 20536208
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536626 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctc 20536527  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |  |    
T  20536526 gcgagtgacccagaaacagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgagg 20536427  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20536426 atgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 20536327  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536326 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20536227  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  20536226 ttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 4 - 408
Target Start/End: Original strand, 21918716 - 21919121
Alignment:
Q  4 aaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt-aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21918716 aaagaatgtaggaagagattgaacctggaaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctag 21918815  T
Q  103 aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||  |    
T  21918816 aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacga 21918915  T
Q  203 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21918916 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  302 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21919114  T
Q  402 atgatgt 408  Q
    |||||||    
T  21919115 atgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 31971662 - 31971257
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  31971662 aggaaaggatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctgacctgaactcgccccggcgagcagaggctgtcacctcgcgagcgaccc 31971563  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  31971562 agaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattat 31971463  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  31971462 aatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 31971364  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31971363 attggaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 31971265  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  31971264 gatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 18878940 - 18879352
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18878940 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaagacgagcagaggctctcgcctc 18879039  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| | | ||    
T  18879040 gcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatg 18879139  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18879140 atgttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaa 18879238  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879239 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18879333  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  18879334 ttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 48 - 408
Target Start/End: Original strand, 18818170 - 18818530
Alignment:
Q  48 ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18818170 ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtt 18818269  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || ||||||||||  || |||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18818270 gttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgat 18818369  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18818370 ataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 18818469  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18818470 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 16199361 - 16199765
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16199361 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaattaaact-gtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagacgctctcgcctcgcgagtgaccc 16199459  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  16199460 aaaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattat 16199559  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||    
T  16199560 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatga 16199658  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  16199659 attgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 16199756  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  16199757 tgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 21923631 - 21924049
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||          |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923631 aggacagaatgtaggatgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaactttttggattctgaccctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctc 21923730  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | | ||    
T  21923731 gcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatg 21923830  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  21923831 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 21923930  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923931 gatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21924030  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  21924031 ttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23406758 - 23406379
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23406758 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgtga 23406659  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||| || || ||  |||  ||||| | |  || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23406658 cctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgat 23406559  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgtt--gatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 328  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23406558 gttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgtt 23406459  T
Q  329 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23406458 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 51 - 407
Target Start/End: Original strand, 28648807 - 28649164
Alignment:
Q  51 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28648807 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgt 28648906  T
Q  150 cgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 249  Q
     |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28648907 tgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 28649006  T
Q  250 aatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgt 349  Q
    ||||||||   |||||||||||  ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28649007 aatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgt 28649106  T
Q  350 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28649107 tgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22627095 - 22626736
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  22627095 tctgacccgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtt 22626996  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22626995 gttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgat 22626896  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||   |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  22626895 ataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctat 22626797  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22626796 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 45130734 - 45131117
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||||||||||||||    
T  45130734 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaac----------------------tcgcctcgcgagtgaccc 45130811  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  45130812 agaaacagagtgacttattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattat 45130911  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||    
T  45130912 aatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatga 45131010  T
Q  301 a-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  45131011 atttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 45131108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23648914 - 23648554
Alignment:
Q  47 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgcacgag 145  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23648914 attctgacc-gaactcgccatggcgatcagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgag 23648816  T
Q  146 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 245  Q
    | || |||||||||||||| |||||| |||||||| | | | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648815 ttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 23648716  T
Q  246 atataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcct 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  23648715 atataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcct 23648616  T
Q  346 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  23648615 atgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6759634 - 6759255
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcg 129  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  6759634 gaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggattttgca 6759535  T
Q  130 acctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttg 228  Q
    | || ||| |||| ||| |   ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759534 atctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttg 6759435  T
Q  229 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||  ||| ||| || ||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  6759434 atgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgt---tgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 6759338  T
Q  329 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 411  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6759337 gtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 408
Target Start/End: Original strand, 16092089 - 16092463
Alignment:
Q  36 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctt 134  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||     
T  16092089 aaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaacagagtgccctgttaggattttgcgatctg 16092188  T
Q  135 tgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgtt 233  Q
    |||  ||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  ||| |||||| | | ||| ||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16092189 tgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgtt 16092288  T
Q  234 gattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16092289 gattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 16092388  T
Q  334 tgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16092389 tgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 90 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7373088 - 7372778
Alignment:
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| | | | |||||| | |  |    
T  7373088 gcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgagg 7372989  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  7372988 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattgaatatttaa 7372897  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372896 gatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7372797  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  7372796 ttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 25362854 - 25363123
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25362854 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgaccc 25362953  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
     ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||    
T  25362954 ggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattat 25363053  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  25363054 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 43 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22875431 - 22875065
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgca 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||    
T  22875431 tgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgca 22875332  T
Q  142 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatg 240  Q
    | ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||  | | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22875331 caagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatg 22875232  T
Q  241 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||    
T  22875231 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatac 22875133  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22875132 tgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 41598550 - 41598188
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgc 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||  ||    
T  41598550 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgccgc 41598452  T
Q  141 acgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagact-tta-aggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgatt 237  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||  ||| || | ||| |  | |  ||||  || ||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||    
T  41598451 acgagtcgttgagagttgaaccttggggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-tt 41598355  T
Q  238 atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 337  Q
    ||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41598354 atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgta 41598255  T
Q  338 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41598254 tact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14409544 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5853392 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 401
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 408
Target Start/End: Original strand, 21389366 - 21389571
Alignment:
Q  200 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 299  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||    
T  21389366 taatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 21389464  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag 398  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  21389465 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 21389561  T
Q  399 atgatgatgt 408  Q
    ||||||||||    
T  21389562 atgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 408
Target Start/End: Original strand, 21395896 - 21396101
Alignment:
Q  200 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 299  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||    
T  21395896 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 21395994  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag 398  Q
    ||||| | ||||||| | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  21395995 aattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 21396091  T
Q  399 atgatgatgt 408  Q
    ||||||||||    
T  21396092 atgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 408
Target Start/End: Original strand, 21790389 - 21790594
Alignment:
Q  200 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 299  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||    
T  21790389 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 21790487  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag 398  Q
    ||||| | ||||||| | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  21790488 aattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 21790584  T
Q  399 atgatgatgt 408  Q
    ||||||||||    
T  21790585 atgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 408
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  205 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattg 304  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  305 caattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 403  Q
     | ||||||| | ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  404 gatgt 408  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15203331 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 406
Target Start/End: Original strand, 18678069 - 18678221
Alignment:
Q  254 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 352  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  18678069 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 18678167  T
Q  353 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  18678168 tattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactat---gtcatgctgtttttgtaa 338  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||     
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32121886 - 32121734
Alignment:
Q  254 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 352  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  32121886 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 32121788  T
Q  353 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||    
T  32121787 tattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 401
Target Start/End: Original strand, 13508024 - 13508199
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||    
T  13508024 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13508123  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    | |||| | | | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13508124 gatgttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 401
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290853
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| |  || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || ||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    | || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 401
Target Start/End: Original strand, 13597556 - 13597731
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||    
T  13597556 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13597655  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    | || ||||| |  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13597656 gatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Original strand, 19801342 - 19801527
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| |||    
T  19801342 atctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 19801440  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     ||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801441 cttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15070686 - 15070573
Alignment:
Q  277 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 375  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15070686 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 15070588  T
Q  376 tgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||||||||||||    
T  15070587 tgagtcggtctaagt 15070573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 411
Target Start/End: Original strand, 19937005 - 19937174
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    ||||||||||   ||||||||||  |||||  || ||||| || || ||| |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19937005 tgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatac 19937104  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 411  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  19937105 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 381
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776929
Alignment:
Q  224 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 322  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagt 23776870  T
Q  323 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23776871 catgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  285 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 383  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  384 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||  ||||  | |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498644 gct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219717
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  382 ggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 408
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17140986 - 17140916
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17140986 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Original strand, 17612027 - 17612231
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||   ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | |    
T  17612027 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt---tataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgttta 17612123  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     || |    ||||||| ||| ||||| |||||| | | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17612124 cttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 17612222  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  17612223 tgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21491065 - 21490995
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21491065 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  382 ggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 5866325 - 5866395
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  5866325 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 23760895 - 23760962
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23760895 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Original strand, 983457 - 983509
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983457 actgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  388 agtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||| ||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  358 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  358 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 26355749 - 26355815
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26355749 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 37116530 - 37116366
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  37116530 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 37116432  T
Q  326 g--ctgtttt-tgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116431 gaactgttttatgta--ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24353090 - 24353039
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353090 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
Target Start/End: Original strand, 26222993 - 26223039
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26222993 ataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 5866045 - 5866082
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5866045 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 5866082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17141266 - 17141229
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17141266 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21249734 - 21249697
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21249734 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21249697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 39834188 - 39834147
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39834188 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 39834147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 21255637 - 21255605
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255637 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 21255605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673716
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 396  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22525627 - 22525579
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525627 actgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15538796 - 15538745
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15538796 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 17267045 - 17267096
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267045 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 19154938 - 19154989
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154938 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 381
Target Start/End: Original strand, 20465982 - 20466132
Alignment:
Q  231 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 329  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||   |||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||  | || ||| ||    
T  20465982 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 20466080  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    || |||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466081 ttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 24433995 - 24434046
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24433995 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 43252145 - 43252110
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43252145 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 43252110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 7373126 - 7373084
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgag 73  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7373126 gaatgaaacttgtgaaattctgacctgaactcgccacggcgag 7373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26219912 - 26219862
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgata 248  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26219912 ataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 26219862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21255572 - 21255535
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255572 gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgag 21255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 7373167 - 7373135
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7373167 aggaaagaatgtaggatgaaattgaacctggaa 7373135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 21249799 - 21249767
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21249799 aggaaagaatgtaggatgagactgaacctggaa 21249767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21674061 - 21674021
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21674061 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 21674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 21972353 - 21972393
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21972353 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21972393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 21976438 - 21976478
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21976438 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21976478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 22627153 - 22627125
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacct 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627153 aggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22627125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 23406799 - 23406767
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23406799 aggaaagaatgtaggatgagattggacctggaa 23406767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 37116704 - 37116664
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37116704 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 93
Target Start/End: Original strand, 38855015 - 38855055
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  38855015 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 38855055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3888 - 3470
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3888 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 3789  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||| |||||||||| | |  |    
T  3788 gcgagtgacccaaaaacagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgagg 3689  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3688 atgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 3589  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3588 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 3489  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3488 ttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 702 - 343
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||     
T  702 tctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatgagtt 603  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  602 gttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 503  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  502 ataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctat 404  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  403 gttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2269 - 1851
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  2269 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctc 2170  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
     ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  |    
T  2169 acgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgagg 2070  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2069 atgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 1970  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1969 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1870  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  1869 ttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 207285 - 207324
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  207285 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32471 - 32067
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32471 aggaaagaatgtgggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 32372  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  32371 agaaacagagttacttttttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattat 32272  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  32271 aatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatga 32173  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32172 attgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 32075  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  32074 gatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2359 - 1952
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2359 aggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacct 2260  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||   ||    
T  2259 agaaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaat 2160  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||| ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||    
T  2159 aatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttga 2060  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  2059 attgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 1960  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  1959 gatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13902 - 13497
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13902 aggaaaggatgtagcatgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctgagctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgaccc 13803  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  13802 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattat 13703  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||    
T  13702 aatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 13604  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    || | |||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  13603 atcgaaattgatattatcatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagtt 13505  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  13504 gatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 15179 - 15584
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15179 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaataaaacttgtaggattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 15278  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |   | ||||||| |||    
T  15279 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattat 15378  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||    
T  15379 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatga 15477  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  15478 attgaaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagat 15576  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  15577 gatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7295
Alignment:
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-g 329  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| | ||| ||| | |||  |||| | |    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat--catgattg 7370  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  7369 ttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 10140 - 10544
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10140 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 10239  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   | ||||||| |||    
T  10240 agaaacagagtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattat 10339  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||    
T  10340 aatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttga 10438  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10439 attgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 10535  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  10536 tgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Original strand, 24005 - 24406
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24005 aggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggctctcgcctcg 24104  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtga 190  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||   |  ||    
T  24105 cgagtgacctagaaacaaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgagga 24204  T
Q  191 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttg-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24205 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 24304  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt-ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24305 gatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T
Q  389 gt 390  Q
    ||    
T  24405 gt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 64201 - 64150
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  64201 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 64150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5119 - 4712
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5119 aggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgaccc 5020  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttaga-ttttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaacta 199  Q
    | ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||    
T  5019 ataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagta 4920  T
Q  200 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 299  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||    
T  4919 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatg 4821  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4820 aattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  4720 tgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 1
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  343 aggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgaccc 244  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttaga-ttttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaacta 199  Q
    | ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||    
T  243 ataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagta 144  T
Q  200 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 299  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||    
T  143 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatg 45  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 343  Q
    ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||    
T  44 aattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Original strand, 5865 - 6245
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5865 gaatgaaatttgcgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcga 5964  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5965 cctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgat 6064  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6065 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgt 6164  T
Q  331 ttttgtaaactgccta---tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||| ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6165 ttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 39177 - 38761
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||          | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39177 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttgaatgaaacttgtgg-attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 39079  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||    
T  39078 cgagtgacccagaaacatagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatg 38979  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38978 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 38879  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38878 gatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaag 38780  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||||||||||||||    
T  38779 ttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 198 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33151 - 32942
Alignment:
Q  198 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  33151 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 33052  T
Q  298 tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaa 397  Q
    | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33051 taacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa 32953  T
Q  398 gatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||    
T  32952 gatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9744
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcc 410  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9812 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5255 - 4849
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  5255 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcttgcctcgcgagtgacct 5156  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||  || ||||||||| ||| | |||||||| | |  | ||||| ||||    
T  5155 agaaacagagtgacttgttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctat 5057  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||| |||    
T  5056 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttga 4957  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagat 400  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4956 attgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 4857  T
Q  401 gatgatgt 408  Q
    ||||||||    
T  4856 gatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 766 - 1170
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  766 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaaccc 865  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  866 agaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactat 965  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  966 aatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 1064  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| ||   ||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  1065 attgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 1161  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  1162 tgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 37 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8846 - 8479
Alignment:
Q  37 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8846 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttg 8747  T
Q  137 ttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat 236  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8746 ttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgat 8647  T
Q  237 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgt 336  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8646 tatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgt 8551  T
Q  337 aaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8550 atactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 8893 - 8865
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacct 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8893 aggaaagaatgtaggatgagattgaacct 8865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7017 - 6669
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7017 aggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 6918  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||||||  |||    
T  6917 ataaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttat 6818  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||    
T  6817 aatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttga 6718  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgt 349  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  6717 attgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16686 - 16282
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16686 aggaaagaatgtaggacgagattgaacctgaaattaaacttatgggattttgaccagaactcggcacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacct 16587  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  16586 agaaacagagtgacttgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactat 16487  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||| ||||||||||    
T  16486 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatga 16388  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| | ||||||| | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  16387 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 16291  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  16290 tgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 51986 - 51582
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51986 aggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaatgaaacttacgggattctaacctgagctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 51887  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  51886 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactat 51787  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||| || |||  ||||||||||||||    
T  51786 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatga 51688  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| | ||| ||| | ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  51687 attgaatttgttataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaa 51591  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  51590 tgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23244 - 22886
Alignment:
Q  47 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgag 145  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23244 attctgaactgagctcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgag 23145  T
Q  146 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 245  Q
    | || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23144 ttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtg 23045  T
Q  246 atataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  23044 atataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gt 22946  T
Q  346 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22945 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 8235 - 8650
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8235 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggaattctggcctaaactcgccacggtgagtagaggctctcgcctc 8334  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttggg-taggattaagactttaaggt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||| |||  ||||| | |      
T  8335 gcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgag 8434  T
Q  189 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattta 288  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  8435 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 8534  T
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 388  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8535 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8630  T
Q  389 gtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8631 gttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 47393 - 46995
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47393 aggaatgaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgagctcgccacggagcgcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 47294  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    | || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||      |||    
T  47293 aaaaccagagtgacttgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tat 47200  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  47199 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||    
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaaga 47004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13469 - 13144
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13469 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcga 13370  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||  ||||| | |  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13369 cctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgat 13270  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt 330  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13269 gttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 13170  T
Q  331 ttttgtaaactgcctatgttgctgtt 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13169 ttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  333 ttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  352 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 34473 - 34437
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 93  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34473 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 124962 - 124677
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  124962 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaaagagtgtcttgttagattttgcga 124863  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124862 cctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 124763  T
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  124762 gttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatatta 124677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  230 tgttgattatgatgtgatataatgttatgt-gcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 328  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||| | ||||||| |  ||||||||||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  329 gtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136173
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 136173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Original strand, 144840 - 144881
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 144881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21306 - 20910
Alignment:
Q  3 gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21306 gaaagaatgtaggatgagattgtacctggaatgaaacttgt----------cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaa 21217  T
Q  103 aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataa 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||    
T  21216 aaacagagtgacttgttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataa 21117  T
Q  203 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaat 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  21116 cctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaat 21017  T
Q  303 tgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21016 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatg 20917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 49 - 401
Target Start/End: Original strand, 25826 - 26179
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25826 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagtt 25925  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    |   |||| |||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926 gctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 26025  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    |||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || ||| |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26026 ataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 26125  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26126 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 33197 - 33479
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33197 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaagtcttacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctc 33296  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggt 188  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||   || ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | |    
T  33297 gcgtgtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgat 33396  T
Q  189 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 271  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  33397 gatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaa 33479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T
Q  382 ggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     |||||||| ||| ||||||||||    
T  44802 agtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 25768 - 25797
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25768 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 25797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1683 - 1289
Alignment:
Q  11 gtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagag 110  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1683 gtaggacgtgattgaacctggaattaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagag 1584  T
Q  111 tgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaa 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||    
T  1583 tgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaa 1484  T
Q  211 gctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattg 310  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| | |||    
T  1483 gctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttg 1385  T
Q  311 atattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||| | ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  1384 atataattatgtcatgatg---ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7660 - 7266
Alignment:
Q  11 gtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagag 110  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7660 gtaggacgtgattgaacctggaattaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagag 7561  T
Q  111 tgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaa 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||    
T  7560 tgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaa 7461  T
Q  211 gctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattg 310  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| | |||    
T  7460 gctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttg 7362  T
Q  311 atattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||| | ||| |||   |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  7361 atataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 340 - 405
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 49 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 40272 - 39913
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagat-tttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  40272 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagtt 40173  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40172 gttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgat 40073  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  40072 ataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctat 39974  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39973 gttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 389
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  386 taag 389  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 18413 - 18464
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18413 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 381
Target Start/End: Original strand, 18674 - 18749
Alignment:
Q  306 aattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||||  | || || ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18674 aattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 16918 - 17337
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16918 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcg 17017  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |   ||    
T  17018 cgagtgacccagaaacagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatg 17117  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || |    
T  17118 atgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttga 17217  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg--tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17218 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17317  T
Q  388 agtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17318 agttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 389
Target Start/End: Original strand, 79248 - 79430
Alignment:
Q  206 gtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattg 304  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| |||    
T  79248 gtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttg 79346  T
Q  305 caattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79347 catttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39836 - 39479
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||| |||| |||     
T  39836 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 39737  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39736 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 39637  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39636 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctat 39538  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39537 gttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 406
Target Start/End: Original strand, 74976 - 75333
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||| |||| |||     
T  74976 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 75075  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75076 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 75175  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  75176 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctat 75274  T
Q  348 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  75275 gttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 405
Target Start/End: Original strand, 339700 - 340065
Alignment:
Q  37 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttg 136  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  339700 aacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgccttgttaggttttgcgacctttg 339799  T
Q  137 ttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat 236  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339800 ttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat 339899  T
Q  237 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgt 336  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  339900 tatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgt 339997  T
Q  337 aaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  339998 atactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  158550 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  233 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 4845 - 5246
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4845 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattgaacttatgggattctgacctgaactcgccaaagagagcagaggatctcgcctcgcgagtgacac 4944  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |   | ||||||| |||    
T  4945 agaaacagagtgacttattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattat 5044  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||| |||||| |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||    
T  5045 aatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 5143  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||| | ||||||| | ||||||||| ||   ||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  5144 attgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 5240  T
Q  400 tgatga 405  Q
    ||||||    
T  5241 tgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 7)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 48 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 40217 - 39858
Alignment:
Q  48 ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagt 146  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  40217 ttctaacctgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaaaccgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatt 40118  T
Q  147 ggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtga 246  Q
     || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40117 tgttgagagttgaacctt-gggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtga 40019  T
Q  247 tataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgccta 346  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  40018 tataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgccta 39920  T
Q  347 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39919 tgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  |    
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaa 289  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  290 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  390 tcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  25914 ttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 59271 - 59308
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  59271 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26589 - 26555
Alignment:
Q  45 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagg 79  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26589 ggattctgacctgaagtcgccacggcgagcagagg 26555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 26643 - 26611
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26643 aggaaagaatgtaggatgagattaaacctggaa 26611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 39634 - 39666
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39634 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 40274 - 40242
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40274 aggaaagaatggaggatgagattgaacctggaa 40242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4873 - 4508
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgca 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| |||    
T  4873 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgca 4774  T
Q  142 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 241  Q
    | ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773 caagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 4674  T
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12455 - 12090
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgca 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| |||    
T  12455 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgca 12356  T
Q  142 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 241  Q
    | ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12355 caagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 12256  T
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22407 - 22042
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgca 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| |||    
T  22407 tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgca 22308  T
Q  142 cgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 241  Q
    | ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307 caagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 22208  T
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1321 - 1052
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1321 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgaccc 1222  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
     |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||    
T  1221 ggaaacaaagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattat 1122  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1121 aatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3888 - 3640
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3888 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgaccc 3789  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
     ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||    
T  3788 ggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattat 3689  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3688 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7952 - 7704
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7952 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgaccc 7853  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
     ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||    
T  7852 ggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattat 7753  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7752 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27852
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
     || || ||||||||  ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 27852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 408
Target Start/End: Original strand, 16365 - 16721
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcg 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || ||| |||| ||| ||      
T  16365 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgccttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgtta 16464  T
Q  152 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 251  Q
     |||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16465 ggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataa 16564  T
Q  252 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 351  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || ||||| || ||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  16565 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttg 16664  T
Q  352 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16665 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 123 - 408
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  123 ttttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagat 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  223 gtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 3186  T
Q  323 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3187 catgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 112
Target Start/End: Original strand, 774 - 837
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  774 tctgacctgaactcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11227 - 11450
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  11227 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgtgggatactgacctgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgagtgacac 11326  T
Q  101 agaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||    
T  11327 agaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattat 11426  T
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgt 224  Q
    |||||||||||||| |||| ||||    
T  11427 aatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 408
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  286 ttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  386 taagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||| | ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 389
Target Start/End: Original strand, 51628 - 51985
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 130  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51628 gaatgaaacttgtgggattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 51727  T
Q  131 cctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||  |||| || ||| |||||||||||| | ||  | || ||    
T  51728 cctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgtt-atgagatattaat 51826  T
Q  231 gttgatt-atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  51827 gttgatttatgatgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgc-attgatattattatgtcttgct 51924  T
Q  329 gtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     |||||| |  ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51925 atttttgaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32643 - 32538
Alignment:
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  32643 attgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 32547  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    |||||||||    
T  32546 tgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32892 - 32826
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||    
T  32892 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgtt 32826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 6)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 408
Target Start/End: Original strand, 32729 - 33077
Alignment:
Q  58 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagt 156  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| || ||| |||| | | ||  |||||    
T  32729 aactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagt 32828  T
Q  157 tgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 255  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||   |  |  ||||  |||||||||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32829 tgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgtt 32926  T
Q  256 atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt 355  Q
    || ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  32927 atatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgt 33024  T
Q  356 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33025 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 46276 - 45928
Alignment:
Q  58 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagt 156  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| || ||| |||| | | ||  |||||    
T  46276 aactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagt 46177  T
Q  157 tgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 255  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||   |  |  ||||  |||||||||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  46176 tgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgtt 46079  T
Q  256 atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt 355  Q
    || ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  46078 atatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgt 45981  T
Q  356 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45980 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16322 - 16113
Alignment:
Q  198 tataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttg 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||   || ||| || ||||| ||    
T  16322 tataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  297 atgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 396  Q
     ||  ||||| |||||||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16125  T
Q  397 agatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||    
T  16124 agatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16449 - 16331
Alignment:
Q  47 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgag 145  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16449 attctgaactgagctcgccacggcgatcagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgag 16350  T
Q  146 tggtcgagagttgaacctt 164  Q
    | || ||||||||||||||    
T  16349 ttgttgagagttgaacctt 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 408
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  347 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 16505 - 16473
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16505 aggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaa 16473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28192 - 27911
Alignment:
Q  47 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | || ||| |||| ||    
T  28192 attctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaag 28093  T
Q  146 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 245  Q
    | ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28092 ttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtg 27993  T
Q  246 atataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgc 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27992 atataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20821 - 20595
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20821 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattatagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 20722  T
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | | ||    
T  20721 gcgagcgacctagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatg 20622  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtt 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  20621 atgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 204 - 407
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  204 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaatt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  304 gcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 403  Q
     || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  404 gatg 407  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 331
Target Start/End: Original strand, 724 - 1006
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtg 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
T  724 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaaacagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagct 823  T
Q  148 gtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 247  Q
    || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | ||||| | ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  824 gttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgat 923  T
Q  248 ataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  924 ataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 408
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4872 - 4545
Alignment:
Q  60 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttg 158  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4872 ctcgccatggcgagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaacagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttg 4773  T
Q  159 aacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttat 257  Q
    ||||||  ||||| ||| ||||||   |  || ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  4772 aaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatataatgtatt 4675  T
Q  258 gtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg 357  Q
     |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||  || || ||||| | ||| | |||||||||| || |||||    
T  4674 atgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttg 4575  T
Q  358 ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4574 ttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10251 - 10200
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10251 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10525 - 10323
Alignment:
Q  47 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||    
T  10525 attctgacctgaactcgccacggcgagcagagcttcccgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaag 10426  T
Q  146 tggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 245  Q
    | ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10425 ttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 10326  T
Q  246 ata 248  Q
    |||    
T  10325 ata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 270 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  270 aagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 369  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  370 gctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28452 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11362 - 11292
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11362 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1997
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2067 actgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  355 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Original strand, 17790 - 17929
Alignment:
Q  90 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtg 189  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |  |    
T  17790 gcgagtcacccagaaatagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgagg 17889  T
Q  190 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 229  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17890 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 17711 - 17794
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga-----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgag 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17711 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgag 17794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 10)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 401
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  245 gatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttttt-gtaaactgc 343  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  344 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44514 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 100507 - 100378
Alignment:
Q  275 tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctg 373  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 100409  T
Q  374 catgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  100408 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 381
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38573
Alignment:
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatg 299  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| ||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttg 38491  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    || || |||||||||||  | |||||| |||| |||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38492 aaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 38573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 119945 - 119875
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  119945 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 40225 - 40291
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  40225 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 101569 - 101503
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  101569 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 316
Target Start/End: Original strand, 23581 - 23695
Alignment:
Q  201 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaagatgttgatg 299  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||||| ||    
T  23581 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttg 23678  T
Q  300 aattgcaattgatatta 316  Q
    || || |||||||||||    
T  23679 aaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 101753 - 101709
Alignment:
Q  51 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  101753 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagt 101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13392
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13454 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 390
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22773
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  381 cggtctaagt 390  Q
    ||||||||||    
T  22764 cggtctaagt 22773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 80035 - 80137
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  80035 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcg 80133  T
Q  91 cgag 94  Q
    ||||    
T  80134 cgag 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 9)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 62268 - 62200
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  62268 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 133009 - 132967
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  133009 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 132967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  345 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 58492 - 58527
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  58492 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 58527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 345
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3588
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 290  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| ||| || ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcct 345  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12786
Alignment:
Q  231 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 329  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||  |||||  ||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 12838  T
Q  330 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    || |||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12837 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtc 12786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 61386 - 61421
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61386 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 61421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 94
Target Start/End: Original strand, 65304 - 65337
Alignment:
Q  61 tcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65304 tcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 65337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| || || ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17138 - 16784
Alignment:
Q  51 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcacgagtgg 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| | |||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |    
T  17138 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat-acttgtttaggattttgcgatctttgtagcacgagtcg 17040  T
Q  149 tcgagagttgaacctt----tgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatg 243  Q
    | || |||||||||||    ||| || || ||    ||  |  |    ||||  || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  ||    
T  17039 ttgatagttgaaccttataatggttatgagta----ttatatatattattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattg 16945  T
Q  244 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 343  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||      
T  16944 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-a 16846  T
Q  344 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16845 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 7474 - 7506
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7474 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 7537 - 7576
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7537 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 401  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 405
Target Start/End: Original strand, 85530 - 85742
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 291  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||    
T  85530 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcaga 85628  T
Q  292 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
     |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  85629 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 85727  T
Q  391 cgatgaagatgatga 405  Q
     ||| ||||||||||    
T  85728 tgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 160754 - 160688
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  160754 actgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 62592 - 62556
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  62592 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 62556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 407  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8484
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 323  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  324 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 406  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  241 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |        
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Original strand, 20340 - 20524
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| |||    
T  20340 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 20437  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20438 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 20129 - 20228
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga---attaa------acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 91  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||      |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20129 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 380
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 408
Target Start/End: Original strand, 17941 - 18148
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |    
T  17941 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgttta 18040  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 399  Q
     ||||  | ||||||| ||| ||||| || || || | | ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18041 cttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 18139  T
Q  400 tgatgatgt 408  Q
    || ||||||    
T  18140 tgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 405
Target Start/End: Original strand, 2079 - 2291
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 291  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||    
T  2079 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 2177  T
Q  292 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
     ||| || || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2178 cgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagt 2276  T
Q  391 cgatgaagatgatga 405  Q
     ||| || |||||||    
T  2277 tgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Original strand, 6561 - 6625
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6561 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagagtgccttgt 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29947
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29994 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 29947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaata-tttaagatgttgatg 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||| ||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  300 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16203
Alignment:
Q  202 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||||| |||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  301 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
     || || ||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 16203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 2731 - 2680
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2731 actgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 171
Target Start/End: Original strand, 15866 - 15983
Alignment:
Q  56 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgag 153  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| |||| ||| ||   |    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatg 15965  T
Q  154 agttgaacctttgggtag 171  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15966 agttgaacctttgggtag 15983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 405
Target Start/End: Original strand, 161040 - 161252
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 291  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||    
T  161040 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatattg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 161138  T
Q  292 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161139 tgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 161237  T
Q  391 cgatgaagatgatga 405  Q
     | | ||||||||||    
T  161238 tggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 164541 - 164674
Alignment:
Q  193 ttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 291  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||    
T  164541 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 164639  T
Q  292 tgttga-tgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  164640 tgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    | || ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 322 - 182
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  322 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgccacg 223  T
Q  91 cgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcga 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  222 cgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcga 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  242 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 340  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 402  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Original strand, 8995 - 9080
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  8995 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 389
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53651
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53588 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8099
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8062 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 7997 - 8029
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7997 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 8029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11464
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11546 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38377
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    | |||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  38295 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 24417 - 24456
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24417 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  382 ggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 129022 - 129072
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129022 actgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78345
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 128735 - 128775
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 128775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  243 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg-aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  342 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
     |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27036 - 26850
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 290  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  ||||    
T  27036 gttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 26940  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 382  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26939 atgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcg 26850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  233 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 359  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 405
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38820
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||  ||| ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    | |||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  38741 gttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 389
Target Start/End: Original strand, 60626 - 60818
Alignment:
Q  199 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 297  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||     
T  60626 ataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgt 60725  T
Q  298 tgaattgcaattgatattactatgtcat--gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||| |||| |||||||||  ||| ||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60726 tgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  381 cggtctaagtcgatga 396  Q
    |||||||||| |||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 130263 - 130222
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  130263 acctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60520
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 60520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 404
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| || |||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttctta-ctgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 381
Target Start/End: Original strand, 16255 - 16442
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaag 290  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||  |||||    
T  16255 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaag 16352  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||| |  |||||||||||  | |||||| |||| |||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16353 atgttgttgaaat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 387
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  326 --gctgtttttgtaaactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
      ||||  |||| | |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8098 gagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 7822 - 7864
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7822 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24057 - 23979
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 271  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24057 gttaactgcaatctgtgaagctgtt-aagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaa 23979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 282 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||||||| | | | ||||||||  ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  381 cggtctaag 389  Q
    |||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12749 - 12587
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |||  |||| | | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  12749 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 12651  T
Q  326 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12650 gctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15426
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370 tgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 15426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 157
Target Start/End: Original strand, 1838 - 1947
Alignment:
Q  49 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgcacgagt 146  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| ||||||||    
T  1838 tctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagt 1936  T
Q  147 ggtcgagagtt 157  Q
     || |||||||    
T  1937 cgttgagagtt 1947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19622 - 19573
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19622 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 19573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6611
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6681 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14061 - 13991
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14061 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15664
Alignment:
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15738 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15974
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16011 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1339
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  1424 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 6174 - 6244
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6174 actgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 15828 - 15898
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15828 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 341 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  239 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatat--ttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 335  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |   |||||||  ||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  336 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    ||| || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 13311 - 13383
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgag 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  13311 aggaaagaatgtaggatgagattgagcctgaaatgaaacttgtgggatcctgacctgaacttgccccggcgag 13383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 404
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||  ||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 2567 - 2609
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2567 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 381
Target Start/End: Original strand, 4711 - 4898
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaag 290  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | | ||||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| | | | ||| |||||  |||||    
T  4711 gttaactgcaatctgtgaagctgtatgaaatgt--taatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattat-tgaatgattaag 4807  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||| |||| || |||||||||||  | |||| |||||| |||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  4808 atgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtc 4898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 408
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1155
Alignment:
Q  343 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1089 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 2696 - 2762
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2696 actgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1190
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  1120 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 3993 - 4033
Alignment:
Q  54 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3993 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 437
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  486 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  381 cggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 390
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10644
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  381 cggtctaagt 390  Q
    ||||||||||    
T  10635 cggtctaagt 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 944 - 897
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  944 tgggattctgccctgaactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10347
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10305 acctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 28820 - 28887
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28820 actgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28616
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 408
Target Start/End: Original strand, 23934 - 24001
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23934 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20490 - 20426
Alignment:
Q  31 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20490 gaatgaaacttttggagttctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcgagt 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  282 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  381 cggtctaagtcgatga 396  Q
    |||||||||| |||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 21712 - 21920
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 290  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  ||||    
T  21712 gttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataag 21808  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| | ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  21809 atgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataag 21905  T
Q  390 tcgatgaagatgatg 404  Q
      ||| |||||||||    
T  21906 atgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 29604 - 29812
Alignment:
Q  192 gttaactataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 290  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  ||||    
T  29604 gttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataag 29700  T
Q  291 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| | ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  29701 atgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataag 29797  T
Q  390 tcgatgaagatgatg 404  Q
      ||| |||||||||    
T  29798 atgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 21563 - 21614
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21563 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Original strand, 29455 - 29506
Alignment:
Q  43 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29455 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 29506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1152 - 1086
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  1152 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  347 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12346 - 12166
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga---attaa------acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 91  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||      |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  12346 aggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgc 12247  T
Q  92 gagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtag 171  Q
    ||||  ||||   |||||    ||  ||| |||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12246 gagttgcccaattacagaagccctgtttaggattttgcgatctttgtcacacgagtcgttgagagttgaaccttggggtag 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12942
Alignment:
Q  285 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 383  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  384 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    |||||||   |||||||||||||||    
T  12963 tctaagt---tgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13255
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  13296 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 45843 - 45909
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  45843 actgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Original strand, 45555 - 45596
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45555 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  237 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-gtttttg 335  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| | ||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 1950  T
Q  336 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36539 - 36454
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||  |||| ||||||  |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36539 atgtcatattgttgttgtaatttgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12766
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 408  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6882 - 6831
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6882 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7167 - 7126
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  7167 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgag 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 390
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8177
Alignment:
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 8177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 225588 - 225482
Alignment:
Q  226 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 325  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||     
T  225588 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcac 225490  T
Q  326 gctgtttt 333  Q
    ||||||||    
T  225489 gctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 225694 - 225644
Alignment:
Q  121 gattttgcgacctttgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtag 171  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  225694 gattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 225644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38339
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 385  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 344
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||  | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  446 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaatacttagaatggaactttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 348  T
Q  91 cgag 94  Q
    ||||    
T  347 cgag 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 404
Target Start/End: Original strand, 10567 - 10639
Alignment:
Q  332 tttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  10567 tttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25176 - 25124
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 390  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Original strand, 206576 - 206624
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206576 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10328 - 10226
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tt------aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||      ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10328 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaaggaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 10230  T
Q  91 cgag 94  Q
    ||||    
T  10229 cgag 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 569
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 2066 - 2108
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2066 acctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32439 - 32397
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32439 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagt 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 32151 - 32102
Alignment:
Q  355 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  32151 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10545
Alignment:
Q  289 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 387  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  388 agt 390  Q
    |||    
T  10547 agt 10545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10842
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10884 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9432 - 9391
Alignment:
Q  53 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9432 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 12512 - 12611
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12512 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacatagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 12610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2250
Alignment:
Q  57 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2213 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 44161 - 44104
Alignment:
Q  324 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44161 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1205
Alignment:
Q  229 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcatta 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 2788 - 2820
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2788 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 18661 - 18693
Alignment:
Q  1 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18661 aggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 18693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6386
Alignment:
Q  339 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Original strand, 4875 - 4910
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4875 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Original strand, 9600 - 9639
Alignment:
Q  55 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 94  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9600 ctgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 381
Target Start/End: Original strand, 192968 - 193070
Alignment:
Q  279 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaa-ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 377  Q
    |||||| || |||||||| ||||||  || |||||||  ||||||||| |||| |||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  192968 tgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 193066  T
Q  378 agtc 381  Q
    ||||    
T  193067 agtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 95
Target Start/End: Original strand, 192757 - 192793
Alignment:
Q  59 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 95  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  192757 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 192793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 381
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  343 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  340 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1910 - 1853
Alignment:
Q  324 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1910 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtc 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18321 - 18236
Alignment:
Q  319 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 404  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  18321 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  345 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30350
Alignment:
Q  341 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 30350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University