View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13590_high_10 (Length: 333)

Name: NF13590_high_10
Description: NF13590
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13590_high_10
NF13590_high_10
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (14-333)||(11288203-11288521)
chr4 (14-333)||(3393212-3393531)
chr4 (14-333)||(10312180-10312499)
chr4 (14-333)||(17211174-17211494)
chr4 (14-333)||(18412503-18412822)
chr4 (14-317)||(24606660-24606963)
chr4 (14-311)||(242418-242715)
chr4 (14-311)||(32937904-32938201)
chr4 (18-322)||(22436823-22437127)
chr4 (14-322)||(49817635-49817943)
chr4 (14-322)||(957446-957754)
chr4 (14-283)||(49791966-49792235)
chr4 (15-311)||(43889501-43889797)
chr4 (14-322)||(34153277-34153587)
chr4 (14-311)||(21017179-21017476)
chr4 (14-318)||(20778864-20779168)
chr4 (14-322)||(49423749-49424057)
chr4 (16-311)||(51428194-51428489)
chr4 (14-291)||(44560202-44560479)
chr4 (19-283)||(45939438-45939702)
chr4 (16-283)||(51027797-51028064)
chr4 (14-311)||(14330696-14330993)
chr4 (14-283)||(20901698-20901967)
chr4 (14-333)||(13866171-13866490)
chr4 (14-320)||(26591678-26591984)
chr4 (14-311)||(6177317-6177614)
chr4 (14-311)||(25762506-25762803)
chr4 (14-303)||(40353783-40354072)
chr4 (14-311)||(41794564-41794861)
chr4 (14-311)||(56138818-56139115)
chr4 (14-306)||(2772917-2773209)
chr4 (14-322)||(21169359-21169667)
chr4 (15-311)||(31824631-31824927)
chr4 (14-322)||(34529787-34530095)
chr4 (14-333)||(31324082-31324401)
chr4 (14-304)||(42886171-42886464)
chr4 (14-311)||(1042659-1042954)
chr4 (14-292)||(36776540-36776818)
chr4 (14-311)||(1226068-1226364)
chr4 (14-311)||(4785424-4785721)
chr4 (14-311)||(28082146-28082443)
chr4 (18-281)||(37866318-37866582)
chr4 (14-333)||(13850657-13850976)
chr4 (14-311)||(9489587-9489883)
chr4 (18-311)||(33163546-33163839)
chr4 (14-283)||(39588837-39589106)
chr4 (14-311)||(49063888-49064184)
chr4 (16-311)||(46816527-46816820)
chr4 (14-311)||(49094653-49094950)
chr4 (35-311)||(47657357-47657633)
chr4 (16-311)||(6282325-6282620)
chr4 (101-311)||(55796738-55796948)
chr4 (14-188)||(21412650-21412824)
chr4 (126-311)||(21711550-21711735)
chr4 (153-311)||(27759374-27759532)
chr4 (227-333)||(49817177-49817283)
chr4 (14-108)||(55794516-55794610)
chr4 (22-333)||(17291869-17292189)
chr4 (14-63)||(13181546-13181595)
chr4 (14-79)||(21711468-21711533)
chr4 (208-333)||(23124505-23124630)
chr4 (43-120)||(23124727-23124804)
chr4 (92-188)||(20759269-20759365)
chr4 (92-188)||(20765660-20765756)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (14-319)||(33370561-33370866)
chr5 (14-311)||(1400305-1400602)
chr5 (14-283)||(541666-541935)
chr5 (14-311)||(8537861-8538158)
chr5 (14-311)||(11346616-11346913)
chr5 (14-284)||(1971272-1971542)
chr5 (14-311)||(7232-7529)
chr5 (15-311)||(17366739-17367034)
chr5 (14-281)||(18308167-18308434)
chr5 (14-311)||(4724077-4724374)
chr5 (14-311)||(3601248-3601545)
chr5 (14-303)||(8576152-8576441)
chr5 (14-283)||(19400270-19400539)
chr5 (14-311)||(28880898-28881195)
chr5 (14-311)||(35565179-35565475)
chr5 (14-311)||(19036677-19036974)
chr5 (14-311)||(38854065-38854362)
chr5 (16-284)||(40009437-40009705)
chr5 (14-311)||(11027684-11027981)
chr5 (14-303)||(27661388-27661677)
chr5 (14-281)||(35927470-35927737)
chr5 (14-311)||(30709505-30709802)
chr5 (18-311)||(6793389-6793682)
chr5 (14-311)||(36350317-36350605)
chr5 (14-284)||(2599126-2599396)
chr5 (14-212)||(3458743-3458941)
chr5 (56-270)||(3169553-3169766)
chr5 (16-188)||(12742624-12742796)
chr5 (16-188)||(12805442-12805614)
chr5 (14-147)||(7082199-7082332)
chr5 (177-311)||(1694859-1694993)
chr5 (22-333)||(25360564-25360885)
chr5 (43-209)||(15798194-15798361)
chr5 (250-333)||(18920877-18920960)
chr5 (14-114)||(1691152-1691252)
chr5 (250-333)||(17195340-17195423)
chr5 (43-333)||(36311926-36312225)
chr5 (222-311)||(7082336-7082425)
chr5 (253-319)||(12742818-12742884)
chr5 (253-319)||(12805636-12805702)
chr5 (14-66)||(25498301-25498353)
chr5 (108-185)||(1693382-1693459)
chr5 (208-333)||(13131059-13131184)
chr5 (44-209)||(12067697-12067862)
chr5 (278-333)||(2599426-2599481)
chr5 (43-292)||(19747995-19748252)
chr5 (89-119)||(23228872-23228902)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (16-333)||(6754128-6754446)
chr3 (14-333)||(6464322-6464642)
chr3 (14-311)||(44927385-44927682)
chr3 (14-322)||(27186870-27187178)
chr3 (16-306)||(43569834-43570124)
chr3 (14-322)||(46414323-46414631)
chr3 (14-322)||(7954125-7954434)
chr3 (14-311)||(51015199-51015496)
chr3 (14-322)||(51013267-51013575)
chr3 (14-311)||(49218736-49219033)
chr3 (14-322)||(30192460-30192768)
chr3 (14-311)||(13895870-13896167)
chr3 (14-311)||(34472076-34472373)
chr3 (17-333)||(774316-774632)
chr3 (15-311)||(2428410-2428706)
chr3 (15-318)||(48087545-48087848)
chr3 (14-311)||(4004087-4004384)
chr3 (14-291)||(34647287-34647564)
chr3 (14-311)||(39416948-39417245)
chr3 (18-311)||(42382197-42382490)
chr3 (18-311)||(42382977-42383270)
chr3 (14-311)||(2268494-2268791)
chr3 (14-311)||(49610411-49610708)
chr3 (18-322)||(41803829-41804132)
chr3 (18-304)||(51695613-51695899)
chr3 (14-311)||(25576592-25576888)
chr3 (14-311)||(47065609-47065906)
chr3 (14-311)||(47759891-47760188)
chr3 (14-311)||(49140054-49140351)
chr3 (14-311)||(54390364-54390661)
chr3 (14-311)||(14631367-14631664)
chr3 (14-311)||(24702272-24702568)
chr3 (14-311)||(34693290-34693586)
chr3 (14-311)||(46402925-46403222)
chr3 (16-311)||(53826696-53826991)
chr3 (16-326)||(8633344-8633654)
chr3 (14-311)||(2646876-2647173)
chr3 (14-311)||(34049649-34049946)
chr3 (14-303)||(36134930-36135218)
chr3 (14-311)||(49273321-49273618)
chr3 (14-292)||(45100484-45100762)
chr3 (14-311)||(42950020-42950317)
chr3 (16-311)||(52569409-52569703)
chr3 (14-311)||(3495029-3495326)
chr3 (14-292)||(19453248-19453526)
chr3 (16-321)||(7246018-7246323)
chr3 (14-311)||(37281374-37281671)
chr3 (14-311)||(44835487-44835784)
chr3 (14-311)||(10053275-10053568)
chr3 (14-333)||(33449129-33449436)
chr3 (16-322)||(55206873-55207170)
chr3 (104-322)||(41577918-41578136)
chr3 (14-306)||(36721394-36721682)
chr3 (14-333)||(14265330-14265646)
chr3 (72-318)||(43477037-43477283)
chr3 (103-333)||(20375860-20376090)
chr3 (74-311)||(50458691-50458928)
chr3 (135-292)||(42323408-42323565)
chr3 (14-147)||(11378908-11379041)
chr3 (158-311)||(50997454-50997607)
chr3 (126-333)||(25887586-25887795)
chr3 (14-146)||(46346745-46346872)
chr3 (14-186)||(15636946-15637118)
chr3 (222-333)||(18440875-18440986)
chr3 (222-333)||(19485949-19486060)
chr3 (191-322)||(46346601-46346732)
chr3 (14-139)||(42328288-42328413)
chr3 (14-109)||(20378089-20378184)
chr3 (227-319)||(7954774-7954866)
chr3 (22-300)||(17267306-17267590)
chr3 (14-81)||(41577850-41577917)
chr3 (256-333)||(15637155-15637232)
chr3 (14-63)||(43476966-43477014)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (14-333)||(5765114-5765433)
chr1 (14-333)||(13283614-13283932)
chr1 (14-319)||(18842347-18842652)
chr1 (14-311)||(14173759-14174056)
chr1 (14-322)||(38046424-38046732)
chr1 (14-304)||(24270371-24270661)
chr1 (14-322)||(6435680-6435988)
chr1 (14-311)||(35586930-35587227)
chr1 (16-311)||(51269712-51270007)
chr1 (14-311)||(36909469-36909766)
chr1 (14-311)||(39856907-39857204)
chr1 (14-333)||(17696954-17697273)
chr1 (14-283)||(29435881-29436150)
chr1 (14-311)||(42571777-42572074)
chr1 (14-322)||(13972833-13973140)
chr1 (14-311)||(12791274-12791572)
chr1 (14-304)||(29762229-29762519)
chr1 (14-311)||(44337320-44337617)
chr1 (14-311)||(47488038-47488335)
chr1 (16-322)||(49396614-49396920)
chr1 (14-311)||(23342549-23342846)
chr1 (14-283)||(48568433-48568702)
chr1 (14-311)||(50068260-50068557)
chr1 (16-311)||(13635298-13635593)
chr1 (14-324)||(18169933-18170243)
chr1 (14-311)||(45689030-45689324)
chr1 (14-283)||(27486719-27486988)
chr1 (14-283)||(44597609-44597878)
chr1 (14-311)||(49427296-49427592)
chr1 (25-333)||(16532069-16532377)
chr1 (14-311)||(35184878-35185176)
chr1 (14-333)||(17372635-17372955)
chr1 (16-292)||(35526197-35526473)
chr1 (14-322)||(41780601-41780909)
chr1 (14-303)||(19160225-19160514)
chr1 (14-311)||(39224198-39224495)
chr1 (16-303)||(48215108-48215395)
chr1 (52-318)||(21484637-21484903)
chr1 (14-283)||(27035347-27035616)
chr1 (15-275)||(41874921-41875181)
chr1 (72-311)||(35576305-35576544)
chr1 (14-311)||(17686362-17686645)
chr1 (14-322)||(49926370-49926665)
chr1 (14-311)||(37778000-37778284)
chr1 (109-333)||(24363779-24364003)
chr1 (16-311)||(30309833-30310122)
chr1 (108-318)||(3658475-3658685)
chr1 (52-266)||(49598921-49599134)
chr1 (41-283)||(49263017-49263247)
chr1 (128-311)||(46180281-46180465)
chr1 (115-331)||(16081294-16081510)
chr1 (14-117)||(4209159-4209262)
chr1 (46-169)||(16098075-16098198)
chr1 (14-133)||(46181731-46181850)
chr1 (16-110)||(13148201-13148295)
chr1 (221-311)||(40533287-40533377)
chr1 (152-237)||(13148365-13148450)
chr1 (252-333)||(14772511-14772592)
chr1 (43-159)||(15471455-15471571)
chr1 (23-79)||(24364008-24364064)
chr1 (208-292)||(19262433-19262517)
chr1 (45-140)||(48707090-48707185)
chr1 (232-306)||(29707547-29707621)
chr1 (43-188)||(14772665-14772809)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (14-319)||(6901878-6902183)
chr2 (14-319)||(20148030-20148335)
chr2 (14-322)||(35491547-35491855)
chr2 (14-311)||(37312492-37312789)
chr2 (15-331)||(10364611-10364930)
chr2 (14-333)||(33403930-33404246)
chr2 (14-320)||(17796095-17796398)
chr2 (14-303)||(27130514-27130803)
chr2 (15-311)||(10360196-10360492)
chr2 (14-322)||(19471620-19471928)
chr2 (14-311)||(3941649-3941946)
chr2 (14-281)||(29111071-29111337)
chr2 (14-304)||(29906494-29906784)
chr2 (14-322)||(2919351-2919657)
chr2 (14-311)||(3937061-3937358)
chr2 (14-311)||(43982768-43983065)
chr2 (14-283)||(12968327-12968596)
chr2 (14-311)||(29067642-29067938)
chr2 (14-311)||(34521681-34521977)
chr2 (14-311)||(6976752-6977045)
chr2 (14-281)||(16581734-16582003)
chr2 (14-311)||(22493183-22493480)
chr2 (18-311)||(39393807-39394100)
chr2 (14-292)||(5420381-5420659)
chr2 (14-311)||(17424701-17424998)
chr2 (14-311)||(42119924-42120221)
chr2 (14-311)||(42241096-42241393)
chr2 (14-322)||(41499080-41499376)
chr2 (14-245)||(39799905-39800136)
chr2 (14-284)||(32734560-32734829)
chr2 (14-303)||(22001758-22002035)
chr2 (14-230)||(34638878-34639093)
chr2 (14-221)||(16253388-16253595)
chr2 (18-164)||(31770279-31770425)
chr2 (101-244)||(18392032-18392179)
chr2 (14-156)||(40678767-40678909)
chr2 (168-322)||(40677361-40677515)
chr2 (208-333)||(27650402-27650527)
chr2 (43-333)||(31991911-31992210)
chr2 (14-94)||(16706879-16706959)
chr2 (45-294)||(11718688-11718947)
chr2 (247-333)||(16253600-16253686)
chr2 (250-333)||(15891622-15891705)
chr2 (89-303)||(11679093-11679317)
chr2 (22-159)||(26617635-26617771)
chr2 (250-333)||(18036137-18036220)
chr2 (43-209)||(18878445-18878611)
chr2 (239-311)||(18393486-18393558)
chr2 (252-333)||(43491600-43491685)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (14-333)||(1642565-1642884)
chr7 (14-333)||(21614737-21615057)
chr7 (14-322)||(15337894-15338202)
chr7 (14-306)||(46862199-46862491)
chr7 (14-306)||(48270558-48270850)
chr7 (14-292)||(21650433-21650712)
chr7 (14-292)||(36393843-36394121)
chr7 (14-311)||(40588459-40588756)
chr7 (14-311)||(43351100-43351396)
chr7 (14-322)||(48315169-48315477)
chr7 (14-311)||(21187299-21187593)
chr7 (14-273)||(28979060-28979319)
chr7 (14-311)||(20564669-20564966)
chr7 (14-304)||(17183122-17183412)
chr7 (14-311)||(18237474-18237771)
chr7 (14-311)||(42735173-42735469)
chr7 (14-311)||(41048700-41048990)
chr7 (14-292)||(17839233-17839511)
chr7 (14-311)||(30360427-30360723)
chr7 (14-291)||(34140775-34141052)
chr7 (14-311)||(39477240-39477537)
chr7 (14-303)||(28114401-28114690)
chr7 (14-284)||(48220771-48221039)
chr7 (14-304)||(20378710-20379000)
chr7 (14-311)||(45363252-45363540)
chr7 (14-333)||(2356199-2356519)
chr7 (15-243)||(26603273-26603501)
chr7 (14-292)||(10522978-10523257)
chr7 (14-318)||(47268821-47269112)
chr7 (14-283)||(41217524-41217793)
chr7 (121-322)||(30354804-30355005)
chr7 (14-200)||(42682866-42683052)
chr7 (14-220)||(13916744-13916949)
chr7 (196-311)||(2206037-2206152)
chr7 (15-188)||(8726341-8726514)
chr7 (190-311)||(9367120-9367241)
chr7 (22-333)||(149997-150317)
chr7 (22-333)||(3380652-3380971)
chr7 (22-159)||(18146877-18147014)
chr7 (250-323)||(11824839-11824912)
chr7 (208-311)||(28066359-28066462)
chr7 (215-325)||(18149638-18149748)
chr7 (250-311)||(26601778-26601839)
chr7 (89-119)||(12082907-12082937)
chr7 (208-316)||(7414196-7414304)
chr7 (43-159)||(11824623-11824739)
chr7 (229-281)||(13920431-13920483)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (14-311)||(2177-2474)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (18-333)||(14114957-14115268)
chr6 (14-322)||(13402445-13402753)
chr6 (14-322)||(34802885-34803193)
chr6 (16-322)||(32027617-32027923)
chr6 (14-311)||(6205396-6205693)
chr6 (16-321)||(32037677-32037982)
chr6 (16-311)||(27640094-27640389)
chr6 (19-311)||(29108057-29108349)
chr6 (14-283)||(12396688-12396957)
chr6 (14-311)||(801078-801374)
chr6 (14-311)||(11692363-11692660)
chr6 (16-281)||(22305710-22305975)
chr6 (14-283)||(29066471-29066734)
chr6 (14-283)||(29075484-29075747)
chr6 (38-283)||(29110473-29110719)
chr6 (114-283)||(35058763-35058932)
chr6 (161-311)||(30257579-30257729)
chr6 (14-117)||(3765915-3766018)
chr6 (16-118)||(35060161-35060263)
chr6 (54-333)||(20242105-20242392)
chr6 (54-333)||(22136089-22136376)
chr6 (231-333)||(17465313-17465415)
chr6 (43-333)||(28051299-28051599)
chr6 (250-333)||(20192466-20192549)
chr6 (250-333)||(22143442-22143525)
chr6 (89-285)||(2402178-2402383)
chr6 (252-333)||(34134801-34134882)
chr6 (232-281)||(3765818-3765867)
chr6 (264-322)||(35021226-35021284)
chr6 (90-119)||(18744177-18744206)
chr6 (89-117)||(17523458-17523486)
chr6 (89-117)||(21865086-21865114)
chr6 (43-159)||(33719001-33719117)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (16-283)||(41363576-41363843)
chr8 (14-276)||(26484495-26484757)
chr8 (14-311)||(15032323-15032620)
chr8 (14-283)||(34614871-34615140)
chr8 (14-311)||(41856973-41857270)
chr8 (14-322)||(18440283-18440591)
chr8 (14-322)||(44943069-44943376)
chr8 (16-311)||(33799550-33799845)
chr8 (16-283)||(43693057-43693324)
chr8 (16-322)||(42603374-42603680)
chr8 (14-283)||(26452243-26452512)
chr8 (14-311)||(38033924-38034221)
chr8 (14-333)||(31171793-31172112)
chr8 (16-311)||(42168959-42169254)
chr8 (14-311)||(41275312-41275609)
chr8 (14-293)||(19242179-19242458)
chr8 (14-293)||(19315363-19315642)
chr8 (14-305)||(40702278-40702569)
chr8 (14-303)||(28706149-28706438)
chr8 (14-311)||(485257-485554)
chr8 (14-311)||(40415175-40415472)
chr8 (14-311)||(24861261-24861558)
chr8 (14-283)||(2416833-2417102)
chr8 (33-283)||(43638704-43638953)
chr8 (14-255)||(16575610-16575851)
chr8 (14-311)||(40414529-40414825)
chr8 (89-329)||(3589247-3589487)
chr8 (14-213)||(22548181-22548380)
chr8 (45-209)||(12504825-12504989)
chr8 (91-185)||(22843448-22843542)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (14-319)||(24815-25119)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (14-291)||(1700-1977)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (14-311)||(17917-18191)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (33-220)||(63905-64091)
scaffold0004 (253-318)||(64098-64163)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (68-281)||(36619-36841)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (208-316)||(5453-5561)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 11288203 - 11288521
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11288203 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaaccagggaatcaaccccgaagacacaaggagggt 11288302  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11288303 ggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 11288402  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11288403 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatc-acaatttgattctgttagaagatcgtgattaag 11288501  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11288502 tagggaatgcaccttccaac 11288521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 3393212 - 3393531
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3393212 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactaaatgaattcaaccaatgagtcaaccccggagacacaaggagggt 3393311  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3393312 ggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgttttgg 3393411  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |    
T  3393412 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatgattagg 3393511  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3393512 tagggaatgcaccttccaac 3393531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 10312180 - 10312499
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10312180 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctgaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagtgt 10312279  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10312280 ggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 10312379  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |   |||||||||||||| |    
T  10312380 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctggaagatcgtgattagg 10312479  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  10312480 tagggaattcaccttccaac 10312499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 17211174 - 17211494
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17211174 agaggttgaaggttatgtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaaatgaattcaaccaaggagtcaacccatgagacacaaggagggt 17211273  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17211274 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgtgacgagcatgttttgg 17211373  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  17211374 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 17211473  T
Q  314 taggg-aatgcaccttccaac 333  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  17211474 tagggaaatgcatcttccaac 17211494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 18412503 - 18412822
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18412503 agagattgaagattcggcaccttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggt 18412602  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  18412603 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgtgaggagcatgttttgg 18412702  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |    
T  18412703 gagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattagg 18412802  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18412803 tagggaatgcaccttccaac 18412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 317
Target Start/End: Original strand, 24606660 - 24606963
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24606660 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagacttctcaaggatgaactgaatgaattcaactaggtagtcaaccccggagacacaaggagggt 24606759  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | ||||  |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24606760 ggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtattgg 24606859  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  24606860 gagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 24606959  T
Q  314 tagg 317  Q
    ||||    
T  24606960 tagg 24606963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 242715 - 242418
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  242715 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 242616  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  242615 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgg 242516  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  242515 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 242418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32938201 - 32937904
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32938201 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccacatagacacaaggagggt 32938102  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32938101 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttcgg 32938002  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||||||||||| ||||    
T  32938001 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcatta 32937904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Original strand, 22436823 - 22437127
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22436823 gttgaaggttcgatgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaa 22436922  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22436923 cacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 22437022  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagg 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | | ||||||||| |||| ||| |    
T  22437023 acaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcattaggtacg 22437122  T
Q  318 gaatg 322  Q
    |||||    
T  22437123 gaatg 22437127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49817943 - 49817635
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || || || | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  49817943 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacattaagatgtctcaaggatgaactgaatgaaatctaccagcgtgtcaaccctagagacacaaggagggt 49817844  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  49817843 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 49817744  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |    
T  49817743 gagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtcattagg 49817644  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  49817643 tacggaatg 49817635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 957754 - 957446
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  957754 agaggttaaaggtttggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacataaggagggt 957655  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  957654 ggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttag 957555  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  957554 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 957455  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  957454 tacggaatg 957446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49792235 - 49791966
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49792235 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 49792136  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  49792135 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 49792036  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49792035 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 49791966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43889797 - 43889501
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43889797 gaggttaaaggtttggtgcctgggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtg 43889698  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43889697 gaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggg 43889598  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  43889597 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 43889501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34153587 - 34153277
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaa--ttcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34153587 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactggagattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagg 34153488  T
Q  112 gtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtttt 211  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34153487 gtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgtttt 34153388  T
Q  212 gggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  34153387 gggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatta 34153288  T
Q  312 agtagggaatg 322  Q
     ||| ||||||    
T  34153287 tgtacggaatg 34153277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21017476 - 21017179
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21017476 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 21017377  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21017376 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 21017277  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  21017276 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 21017179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20779168 - 20778864
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20779168 agaggttgaaggttcagtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggacacacaagaagggt 20779069  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20779068 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 20778969  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| |||| |    
T  20778968 gagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattagg 20778869  T
Q  314 taggg 318  Q
    |||||    
T  20778868 taggg 20778864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49424057 - 49423749
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  49424057 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 49423958  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  49423957 ggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgg 49423858  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||| |    
T  49423857 gagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccataagatcgtcattagg 49423758  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  49423757 tacggaatg 49423749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 51428489 - 51428194
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51428489 aggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgg 51428390  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51428389 aacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 51428290  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||||||||| ||||    
T  51428289 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcaagaagatcgtcatta 51428194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44560479 - 44560202
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44560479 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 44560380  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44560379 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgttttgg 44560280  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatt 291  Q
    ||||| | |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  44560279 gagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatt 44560202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Original strand, 45939438 - 45939702
Alignment:
Q  19 ttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaat 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  45939438 ttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccgaagacacaaggagggtggaac 45939537  T
Q  119 atgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 218  Q
    | ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  45939538 acgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtgacgagcatgttttgggagca 45939637  T
Q  219 catcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45939638 caacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 45939702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51028064 - 51027797
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  51028064 aggttgaaggttcgatgcgttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggactcaaccccagagacacaaggagagtgg 51027965  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51027964 aacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 51027865  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51027864 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaca 51027797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14330993 - 14330696
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  14330993 agaggttgatggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaaatcactgaattcaaccaaggagtcaacgctagagacacaaggagggt 14330894  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14330893 ggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 14330794  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  14330793 gagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 14330696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20901967 - 20901698
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20901967 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccctgaagacacaaggagggt 20901868  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
     ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20901867 agaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 20901768  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20901767 gagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 20901698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 13866171 - 13866490
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13866171 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtcacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaactaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 13866270  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||  |||  |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  13866271 ggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgttttgg 13866370  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||| | |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |    
T  13866371 gagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagaccgtgattagg 13866470  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  13866471 tagggaatgcacctttcaac 13866490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26591984 - 26591678
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26591984 agaggttgaagattcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 26591885  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  26591884 ggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacatattttgg 26591785  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  26591784 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagg 26591685  T
Q  314 tagggaa 320  Q
    || ||||    
T  26591684 tacggaa 26591678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6177614 - 6177317
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6177614 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 6177515  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6177514 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 6177415  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  6177414 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 6177317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 25762506 - 25762803
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25762506 agaggttgaaggttcgatgttttggtgtaacgttaagaggtcttaatgatgaactggctgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 25762605  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25762606 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 25762705  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  25762706 gagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 25762803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40354072 - 40353783
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  40354072 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggatggt 40353973  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40353972 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 40353873  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  40353872 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 40353783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41794861 - 41794564
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41794861 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 41794762  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41794761 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 41794662  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  41794661 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 41794564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 56138818 - 56139115
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  56138818 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 56138917  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  56138918 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 56139017  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  56139018 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 56139115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Original strand, 2772917 - 2773209
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  2772917 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggatggt 2773016  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2773017 ggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 2773116  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgt 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||   |||||| | |||||||||||    
T  2773117 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgccagaagatcgt 2773209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 21169359 - 21169667
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21169359 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaattgactgaattcaaccacggagtcaaccccagagacacaaggagggt 21169458  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  21169459 ggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatacgcgacgagcatgttttgg 21169558  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  21169559 gagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattagg 21169658  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  21169659 tacggaatg 21169667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31824927 - 31824631
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  31824927 gaggttgaaggttcggtgccttgatgtaaagttaagagctctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaactccagagatgcaaggagggtg 31824828  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31824827 gaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggg 31824728  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |  |||||||||| ||||    
T  31824727 agcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcatta 31824631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34530095 - 34529787
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34530095 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagaagggt 34529996  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  34529995 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcattttttgg 34529896  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  34529895 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 34529796  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  34529795 tacggaatg 34529787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 31324082 - 31324401
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  31324082 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtcacgttaagaggtctcaaggatcaattgcatgaattcaaccaagtagtcaaccccgaagacacaatgaggat 31324181  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |    
T  31324182 ggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtgacgagcatgtttttg 31324281  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |  |||||||| |||||| |    
T  31324282 gagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctagaagatcatgattagg 31324381  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31324382 tagggaatgcaccttccaac 31324401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 42886171 - 42886464
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42886171 agaggttgaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccgggagacacaaggagggt 42886270  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggag---aatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttt 210  Q
    |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  42886271 ggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaacatgacgagcatgctt 42886370  T
Q  211 tgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatc 304  Q
    || ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42886371 tgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatc 42886464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 1042659 - 1042954
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1042659 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccaaagacacaaggagggt 1042758  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    ||||    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1042759 ggaacgcctt--gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 1042856  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  1042857 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 1042954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36776818 - 36776540
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36776818 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcgcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 36776719  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36776718 ggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatggtttgg 36776619  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  36776618 gagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 36776540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 1226068 - 1226364
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  1226068 agaggttgaaggtttggtgccttgatgtaacgttaagaagtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagttaaccccagagacaca-ggagggt 1226166  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1226167 ggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 1226266  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  1226267 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 1226364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4785721 - 4785424
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4785721 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaaccttaagaggtctcaaggattaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 4785622  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  4785621 ggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgaagaacatgttttgg 4785522  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  4785521 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccacaagatcgtcatta 4785424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 28082146 - 28082443
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28082146 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 28082245  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28082246 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 28082345  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||| || ||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||||||||||| ||||    
T  28082346 gagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcatta 28082443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 281
Target Start/End: Original strand, 37866318 - 37866582
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  37866318 gttgaaggttcggtggcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcagagacacaagaagggtggaa 37866417  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtttt-gggag 216  Q
     |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37866418 cacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgatgagcatgttttcgggag 37866517  T
Q  217 cacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37866518 cacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 37866582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 13850657 - 13850976
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | |||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13850657 agaggttgaaggtttggtaccttggtgtcacattaagaggtcttacggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 13850756  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  13850757 ggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgttttgg 13850856  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |    
T  13850857 gagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgccagaagaccgtgattagg 13850956  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13850957 tagggaatgcaccttccaac 13850976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 9489587 - 9489883
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | | |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9489587 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatcaactaactgaattcaacaaaggaatcaaccccggagacacaaggagggt 9489686  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  9489687 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgtttt-g 9489785  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  9489786 gagcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 9489883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33163839 - 33163546
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||||  | | ||||| ||| ||||||||||    
T  33163839 gttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggtgtcagtctcagagacgcaatgagggtggaa 33163740  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33163739 tacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagc 33163640  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  33163639 acaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 33163546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 39588837 - 39589106
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39588837 agaggttgaaggttcgatgccttggtataacgttaagaggtctcaatgatgaactaactgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 39588936  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39588937 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 39589036  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39589037 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 39589106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 49063888 - 49064184
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  49063888 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaa-aggtctaaaggatgaactcactgaattcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggagagt 49063986  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  49063987 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttg 49064086  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  49064087 gagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 49064184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46816820 - 46816527
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46816820 aggttgaaggttcggtgccttgatgtaacattaagagatctcaaggatcaactgaatgaattcaactacggagtcaaccccagagacgcaaggagggtgg 46816721  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46816720 aatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttggga 46816621  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  46816620 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgccagaagatcgtcatta 46816527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 49094653 - 49094950
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||    
T  49094653 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagagatctcaaggatacactgactgaattcaaccaagtagtcaaccccagagacacaaggatggt 49094752  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  49094753 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaccatgttttgg 49094852  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  49094853 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 49094950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47657633 - 47657357
Alignment:
Q  35 ttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||     
T  47657633 ttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaattcaaccaaggaatcaaccccagagacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaaca 47657534  T
Q  135 tccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtgg 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47657533 tccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaacgtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtgg 47657434  T
Q  235 atcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||||||| ||||    
T  47657433 atcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcatta 47657357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6282620 - 6282325
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||  || | |||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  6282620 aggttgaaggttcgatgctttggtatgacattaagaggtctcaaggatgaaccgactaaattcaacaaaggagtcaaccccatagacagaaggagggtgg 6282521  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6282520 aacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 6282421  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  6282420 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatta 6282325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55796948
Alignment:
Q  101 acacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgac 200  Q
    ||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  201 gagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaa 300  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || ||    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaa 55796937  T
Q  301 gatcgtgatta 311  Q
    |||||| ||||    
T  55796938 gatcgtcatta 55796948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21412824 - 21412650
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21412824 agaggttgaaggttcggggccttagtgtaacattaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccacggagacacaaggagggt 21412725  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    |||||| || | |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21412724 ggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacga 21412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 311
Target Start/End: Original strand, 21711550 - 21711735
Alignment:
Q  126 gtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatg 225  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21711550 gtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatg 21711649  T
Q  226 ttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  21711650 ttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 21711735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759532
Alignment:
Q  153 gagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 252  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  253 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 27759532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817177
Alignment:
Q  227 tccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcacc 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtagggaatgcacc 49817184  T
Q  327 ttccaac 333  Q
    |||||||    
T  49817183 ttccaac 49817177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Original strand, 55794516 - 55794610
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaagg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||    
T  55794516 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcaaagacacaagg 55794610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 333
Target Start/End: Original strand, 17291869 - 17292189
Alignment:
Q  22 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatg 121  Q
    |||||||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||||| |  |  ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |    
T  17291869 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggatcagctagatgaaatcaaccaaggactcaacccccgagacacaaggagagtgaaatacg 17291968  T
Q  122 ttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt---------ttg 212  Q
    ||  |||| ||||||||||| | ||| |  |||||||| || | ||| || | ||||||| |||| | ||  |||||| || ||||||         ||     
T  17291969 tttggtatgaacgtccaacgttggactacaggagaataacaatcagtcggctagaattaaagaacaacgacgacgtgaggatcatgttcttgaattttta 17292068  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaa 312  Q
    | ||||||||||| | | ||  |||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||     
T  17292069 gcagcacatcatggttccgtttatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattat 17292168  T
Q  313 gtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17292169 gtagggaatgcaccttccaac 17292189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13181595 - 13181546
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13181595 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggat 13181546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 21711468 - 21711533
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattca 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  21711468 agaggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaattca 21711533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23124630 - 23124505
Alignment:
Q  208 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtg 307  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||||   | |||||||| |||||| | |||||  | |||||||| |||    
T  23124630 ttttggtagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcttaaagatattctcaacaatttgatttcgccagaagattgtg 23124531  T
Q  308 attaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  23124530 attaggtagggaatgcacctttcaac 23124505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23124804 - 23124727
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23124804 acgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtgtaatat 23124727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20759365 - 20759269
Alignment:
Q  92 accccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||| | || ||| || | || |||||||||||    
T  20759365 accccggagacacaaggagggtagaatacatttggtacaaacatccaacgttagacgaggggtgaataacgttcagtcggctagagttaacgaacga 20759269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20765756 - 20765660
Alignment:
Q  92 accccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||| | || ||| || | || |||||||||||    
T  20765756 accccggagacacaaggagggtagaatacatttggtacaaacatccaacgttagacgaggggtgaataacgttcagtcggctagagttaacgaacga 20765660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 319
Target Start/End: Original strand, 33370561 - 33370866
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33370561 agaggttgaatgttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaatttaactagggactcaaccccggagacacaaggagggt 33370660  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33370661 ggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 33370760  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |    
T  33370761 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatgattagg 33370860  T
Q  314 taggga 319  Q
    ||||||    
T  33370861 taggga 33370866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1400602 - 1400305
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400602 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 1400503  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1400502 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 1400403  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  1400402 gagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 1400305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 541935 - 541666
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  541935 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 541836  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  541835 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgggacgagcatgttttgg 541736  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  541735 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaaca 541666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 8537861 - 8538158
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8537861 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 8537960  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8537961 ggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 8538060  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  8538061 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 8538158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 11346616 - 11346913
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11346616 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 11346715  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11346716 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 11346815  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  11346816 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 11346913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 1971272 - 1971542
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971272 agaggttgaaggtttgatgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 1971371  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1971372 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 1971471  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacag 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1971472 gagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacag 1971542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7529 - 7232
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  7529 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaattgaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 7430  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7429 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 7330  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  7329 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 7232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17367034 - 17366739
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17367034 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattctaccaaggagtcaaccccgtagacacaaggagggtg 17366935  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  17366934 gaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacaaacatgttttggg 17366836  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17366835 agcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccagaatatcgtgatta 17366739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Original strand, 18308167 - 18308434
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18308167 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaagtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 18308266  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18308267 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 18308366  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18308367 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 18308434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4724374 - 4724077
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  4724374 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggaaaaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaaagt 4724275  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4724274 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 4724175  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  4724174 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 4724077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 3601248 - 3601545
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3601248 agaggttcaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaattcaatcaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 3601347  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
     ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  3601348 agaacatattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaa 3601447  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3601448 gagcacaacatgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcatta 3601545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8576441 - 8576152
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8576441 agaggttgaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 8576342  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8576341 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgaccatgttttgg 8576242  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  8576241 gagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 8576152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 19400270 - 19400539
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19400270 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttgagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 19400369  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19400370 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 19400469  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19400470 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaca 19400539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 28880898 - 28881195
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28880898 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 28880997  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28880998 ggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 28881097  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  28881098 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 28881195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 35565179 - 35565475
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35565179 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggacgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacataaggagggt 35565278  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35565279 ggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatg-aaacgtgacgagcatgttttgg 35565377  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  35565378 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 35565475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19036974 - 19036677
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19036974 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 19036875  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19036874 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 19036775  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  19036774 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 19036677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 38854065 - 38854362
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  38854065 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggt 38854164  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  38854165 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgg 38854264  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||| ||| ||||    
T  38854265 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagaccgtcatta 38854362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Original strand, 40009437 - 40009705
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  40009437 aggttgaaggttcggtgtcttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaaatgaatgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacgcaaggagggtgg 40009536  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40009537 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 40009636  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacag 284  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  40009637 gcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacag 40009705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 11027684 - 11027981
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  11027684 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggt 11027783  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11027784 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgg 11027883  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  11027884 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 11027981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27661677 - 27661388
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  27661677 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 27661578  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27661577 ggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 27661478  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  27661477 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 27661388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35927737 - 35927470
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||    
T  35927737 agaggttgaaatttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaacctcggagacacaattagggt 35927638  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | || | ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35927637 gtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 35927538  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35927537 gagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 30709505 - 30709802
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||| |||    
T  30709505 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagatacaaggatggt 30709604  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  30709605 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 30709704  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | | ||||||||| ||||    
T  30709705 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcatta 30709802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6793682 - 6793389
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6793682 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaggatggaa 6793583  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
     |  ||| ||||||||| | |||||||||||||| | || ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6793582 cacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagc 6793483  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  6793482 acaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagccagaagatcgtcatta 6793389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36350605 - 36350317
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36350605 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtgtccaggatgaactgactgaattcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggagggt 36350506  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||           
T  36350505 ggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcat------- 36350413  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||||||| ||||    
T  36350412 --gcacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcatta 36350317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 2599126 - 2599396
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2599126 agaggttaaaggtttggtaccttggtgtcaccttaagagatctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 2599225  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |   || ||| |||||||||||||    
T  2599226 ggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacatgaagagcatgttttgg 2599325  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacag 284  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  2599326 gagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatattctcaacag 2599396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Original strand, 3458743 - 3458941
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  3458743 agaggttgaaggttcggcgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacgcaaggagggt 3458842  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttg 212  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3458843 ggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagtatgttttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 270
Target Start/End: Original strand, 3169553 - 3169766
Alignment:
Q  56 tcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggag 155  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3169553 tcaaggatgaactcactgaactcaaccaaggagtcaaccccagagacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggg-ag 3169651  T
Q  156 aatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttg 255  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  3169652 agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttg 3169751  T
Q  256 ctgagatcaactgaa 270  Q
    ||||||||| |||||    
T  3169752 ctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 12742624 - 12742796
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12742624 aggttgaaggttcggcaccttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggtgg 12742723  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12742724 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacga 12742796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 12805442 - 12805614
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12805442 aggttgaaggttcggcaccttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggtgg 12805541  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | || | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12805542 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacga 12805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 7082199 - 7082332
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7082199 agaggttgaaagttcggtgccttggcttaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 7082298  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgac 147  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7082299 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgac 7082332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 311
Target Start/End: Original strand, 1694859 - 1694993
Alignment:
Q  177 attaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatt 276  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||     
T  1694859 attaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatc 1694958  T
Q  277 atcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  1694959 atcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 1694993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25360885 - 25360564
Alignment:
Q  22 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatg 121  Q
    |||||||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  25360885 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccccgaagacacaaggagggtggaataca 25360786  T
Q  122 ttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt---------ttg 212  Q
    ||  |||| || ||| |||| |  |||| ||||||||| | || |||  | | ||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||         |||    
T  25360785 tttggtatgaaagtcgaacgttgtacgacgggagaataacgttcagtcagttagaattaaagaacgacgacgacgtgaggagcatgttctcgattttttg 25360686  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgtt-gctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    | |||||| |||||||  |||||||||||||   || ||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25360685 gcagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgtttgctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgtgatta 25360586  T
Q  312 agtagggaatgcaccttccaac 333  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  25360585 ggtagagaatgcacctttcaac 25360564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15798361 - 15798194
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||  |||| || | ||||||     
T  15798361 acgttaaaaggtctcaaggatcaactgaatgaaatcaactaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaatacatttggtatgaatgcccaacgt 15798262  T
Q  143 tcgacgagggg-agaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt 209  Q
    | ||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  15798261 tggacgaggggcagaataacattcagttggctagaattaacgaacgatgacgacgtgaggagcatgtt 15798194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 333
Target Start/End: Original strand, 18920877 - 18920960
Alignment:
Q  250 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18920877 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaac 18920960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 1691152 - 1691252
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  1691152 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaaagttaagaagtttcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcatagacacaaggagggt 1691251  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  1691252 g 1691252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17195423 - 17195340
Alignment:
Q  250 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17195423 acgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaac 17195340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36312225 - 36311926
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |  ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||      
T  36312225 acgttaaaatgtctcaaggatcaacttgatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacgaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacat 36312126  T
Q  143 tcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt---------ttgggagcacatcatgttccagtg 233  Q
    | |||||  |||||||| | || ||| || | ||||||| |||||  ||  | |||| |||||||||         |||| | ||||||||||||| ||     
T  36312125 tggacgaccggagaataacgttaagtcggctagaattaaagaacgttgacgatgtgaggagcatgttctcgattttttggcaccacatcatgttcccgtt 36312026  T
Q  234 gatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||| || ||   || ||||||||||||||  |||||||| || |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36312025 gatcaatgtgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagatcttctcaatagtttaattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaac 36311926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 311
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082425
Alignment:
Q  222 catgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 7082425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 319
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12742884
Alignment:
Q  253 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtaggga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 12742884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 319
Target Start/End: Original strand, 12805636 - 12805702
Alignment:
Q  253 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtaggga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  12805636 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattaggtaggga 12805702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 66
Target Start/End: Original strand, 25498301 - 25498353
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25498301 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaa 25498353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 185
Target Start/End: Original strand, 1693382 - 1693459
Alignment:
Q  108 gagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaa 185  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  1693382 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaacgaa 1693459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13131184 - 13131059
Alignment:
Q  208 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtg 307  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||  |||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||  |||||||||||    
T  13131184 ttttggtagcacatcatggttctgtttatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtg 13131085  T
Q  308 attaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  13131084 attagctagagaatgcaccttccaac 13131059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12067862 - 12067697
Alignment:
Q  44 cgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgct 143  Q
    |||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||| ||  |||| || |    
T  12067862 cgttaaaaggtctcaaagatcaactgaatgaaatcaaccaaggactgaaccccggagacacaaggagagtggaatacatttggtatgaatatccatcgtt 12067763  T
Q  144 cgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt 209  Q
    |||||||||||||||| | || ||| ||  ||| ||||||||||| ||  | |||| |||||||||    
T  12067762 cgacgaggggagaataacgttcagtcggtcggagttaacgaacgacgacgatgtgaggagcatgtt 12067697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 333
Target Start/End: Original strand, 2599426 - 2599481
Alignment:
Q  278 tcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  2599426 tcaacagtttgattccgtcagaagatcgtgattaggtagagaatgcacctttcaac 2599481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 292
Target Start/End: Original strand, 19747995 - 19748252
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||| | || || ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||   ||| |||||||||||     
T  19747995 acgttaaaaggtctcaaggctcaattgcatgaaatcaaccaaggactcaaccccaaagacacaagaagggtggaatacatttgatatgaacgtccaacgt 19748094  T
Q  143 tcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatg---------ttttgggagcacatcatgttccagtg 233  Q
    | ||| | ||||||||| | || |||  | | |||||||||||||| ||  |||||| || ||||         |||||| |||||| |||||| | |||    
T  19748095 tggacaacgggagaataacgttcagtcagctagaattaacgaacgacgacgacgtgaagaacatgttctccattttttggcagcacaacatgtttccgtg 19748194  T
Q  234 gatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||    
T  19748195 gatcgatatgtttgt-acgttgctgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattc 19748252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23228902 - 23228872
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacaaggagggtggaata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228902 tcaaccccggagacacaaggagggtggaata 23228872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 6754128 - 6754446
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6754128 aggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgaatgaattcaactaaggagtcaaccccggagacacaaagagggtgg 6754227  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6754228 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttggga 6754327  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagta 315  Q
    | ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  6754328 gtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgctagaagatcgtgattatgta 6754427  T
Q  316 ggg-aatgcaccttccaac 333  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  6754428 gggaaatgcaccttccaac 6754446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6464642 - 6464322
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6464642 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaggtatcaaagatgaactgaatgaattcaactaaggagtcaaccccggtgacacaaagagggt 6464543  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  6464542 ggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacaatcatgttttgg 6464443  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  6464442 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaagaagatcgtgattata 6464343  T
Q  314 taggg-aatgcaccttccaac 333  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6464342 tagggaaatgcaccttccaac 6464322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 44927385 - 44927682
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927385 agaggttgaaggttcgatgtcttggtttaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 44927484  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44927485 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 44927584  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  44927585 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 44927682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 27186870 - 27187178
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27186870 agaggttgaaggttcagtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 27186969  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||  ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  27186970 ggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgaacatgttttgg 27187069  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||| |    
T  27187070 gagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgccataatatcgtgattagg 27187169  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    |||||||||    
T  27187170 tagggaatg 27187178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 43569834 - 43570124
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  43569834 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtgg 43569933  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43569934 aacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 43570033  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgt 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||  | |||||||||||    
T  43570034 gcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccagaagatcgt 43570124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 46414631 - 46414323
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46414631 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 46414532  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46414531 ggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 46414432  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  46414431 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 46414332  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  46414331 tacggaatg 46414323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 7954125 - 7954434
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7954125 agaggttgaaggtccgttgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggaagaactgaatgaattcaactaggtagtcaaccccggagacacaaggagggt 7954224  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgagggg-agaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttg 212  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7954225 ggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttg 7954324  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaa 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||     
T  7954325 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgctagaagatcgtcattag 7954424  T
Q  313 gtagggaatg 322  Q
    ||| ||||||    
T  7954425 gtacggaatg 7954434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 51015199 - 51015496
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  51015199 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcgaccccaaagacacaaggagggt 51015298  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51015299 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 51015398  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  51015399 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 51015496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 51013575 - 51013267
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51013575 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 51013476  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51013475 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 51013376  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  51013375 gaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 51013276  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  51013275 tacggaatg 51013267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49219033 - 49218736
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49219033 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 49218934  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  49218933 ggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacgtgacgaacatgttttgg 49218834  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  49218833 gagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 49218736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 30192460 - 30192768
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30192460 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaattttaagaggtctcaagtatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 30192559  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  30192560 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgtctagcatgttttgg 30192659  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  30192660 gagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 30192759  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  30192760 tacggaatg 30192768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13896167 - 13895870
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13896167 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaatgagtcaaccctagagacacaaggagggt 13896068  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13896067 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 13895968  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |  |||||||||| ||||    
T  13895967 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctagaagatcgtcatta 13895870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34472373 - 34472076
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  34472373 agaggttgaagattcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggt 34472274  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34472273 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 34472174  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| | ||||||||||| ||||    
T  34472173 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccagaagatcgtcatta 34472076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 774632 - 774316
Alignment:
Q  17 ggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgga 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  774632 ggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgctaagaggtctcaatgatcaacttgatgaattcaaccaagtagtcaaccccggagacacgaggagagtgga 774533  T
Q  117 atatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggag 216  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||    
T  774532 atgtgtttgctataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgtgaagaacatgttttcggag 774433  T
Q  217 cacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtag 316  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  774432 cactgcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccaccagaagatcgtgattaggtag 774333  T
Q  317 ggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||||||||||||||    
T  774332 ggaatgcaccttccaac 774316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 2428410 - 2428706
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2428410 gaggttgaaggttcggtgacttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtg 2428509  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2428510 gaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggg 2428609  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||| ||||    
T  2428610 agcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcatta 2428706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48087848 - 48087545
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  48087848 gaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaaacgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtg 48087749  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48087748 gaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggg 48087649  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagt 314  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||| ||||| |    
T  48087648 agcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccagaagatcgtcattaatt 48087549  T
Q  315 aggg 318  Q
    ||||    
T  48087548 aggg 48087545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4004384 - 4004087
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4004384 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 4004285  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4004284 ggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 4004185  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  4004184 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatta 4004087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34647564 - 34647287
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34647564 agaggttgaatgttcggtgtcttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccccgagacacaaggagggt 34647465  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  34647464 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttcgg 34647365  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatt 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  34647364 gagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatt 34647287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39417245 - 39416948
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  39417245 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggt 39417146  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39417145 ggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgg 39417046  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||  | ||||||||||| ||||    
T  39417045 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccagaagatcgtcatta 39416948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 42382197 - 42382490
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||     
T  42382197 gttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagtggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgtaaggagggtggac 42382296  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42382297 tacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 42382396  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  42382397 acatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtcatta 42382490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 42382977 - 42383270
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||     
T  42382977 gttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgtaaggagggtggac 42383076  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
    || |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42383077 tacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 42383176  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  42383177 acatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtcatta 42383270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2268791 - 2268494
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  2268791 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggt 2268692  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2268691 ggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgggcatgttttgg 2268592  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  2268591 gagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 2268494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 49610411 - 49610708
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49610411 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 49610510  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49610511 ggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 49610610  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  49610611 gagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 49610708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Original strand, 41803829 - 41804132
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41803829 gttgaaagttcggtgccttggtgtgacgttaa-aggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacaaaaggagggtggaa 41803927  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
     | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41803928 cacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 41804027  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagg 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| ||| |    
T  41804028 acaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacg 41804127  T
Q  318 gaatg 322  Q
    |||||    
T  41804128 gaatg 41804132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 51695899 - 51695613
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51695899 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaa 51695800  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
     |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51695799 caccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatacgtgacgagcatgttttgggagc 51695700  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | |||||||||    
T  51695699 acatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatc 51695613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25576888 - 25576592
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  25576888 agaggttgaaggtttggtgtcttgatgtaacattaagaagtctcaaggatcaactgaatgaattcaactaaggattcaaccccagagacgcaaggagggt 25576789  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25576788 ggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 25576689  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  25576688 gagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgtcagaagatcgtcatta 25576592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 47065609 - 47065906
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47065609 agaggttgaaggtttggtgccttgatgtaacattaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaactccagagacacaaggagggt 47065708  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47065709 ggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaatgtgacgagcatgttttgg 47065808  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  47065809 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 47065906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47760188 - 47759891
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  47760188 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgattaaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggt 47760089  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  47760088 ggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaaacatgttttgg 47759989  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  47759988 gaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 47759891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49140351 - 49140054
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  49140351 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 49140252  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49140251 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 49140152  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  49140151 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 49140054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 54390364 - 54390661
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  54390364 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 54390463  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54390464 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 54390563  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  54390564 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 54390661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 14631367 - 14631664
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14631367 agaggttgaaggttcagtgccttgttgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggt 14631466  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14631467 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 14631566  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14631567 gagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatta 14631664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24702568 - 24702272
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24702568 agaggttaaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaattgaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 24702469  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24702468 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaatt-acgaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgg 24702370  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  24702369 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccagaagatcgtcatta 24702272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34693586 - 34693290
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  34693586 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaatttaaccaaggagttaaccttg-agacacaaggagggt 34693488  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34693487 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 34693388  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||||||||||| ||||    
T  34693387 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgccagaagatcgtcatta 34693290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 46402925 - 46403222
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  46402925 agaggttaaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 46403024  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46403025 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 46403124  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  46403125 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 46403222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 53826991 - 53826696
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  53826991 aggttgaaggttcggtgccttgatttaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtgg 53826892  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  53826891 aatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaatgtgatgagcatgttttggga 53826792  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  53826791 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 53826696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8633654 - 8633344
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  8633654 aggttaaatgtttggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcatggatgaactgaatgaattcaaccaaggagttaacacaggagacacaaggagggtgg 8633555  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  8633554 aatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatattttttggga 8633455  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagta 315  Q
      ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  8633454 tgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtcattaggta 8633355  T
Q  316 gggaatgcacc 326  Q
      |||||||||    
T  8633354 ccgaatgcacc 8633344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2647173 - 2646876
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2647173 agagtttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggataaactgactgaattcaacgaaagagtcaaccccagagacacaaggatggt 2647074  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2647073 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 2646974  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||| ||||    
T  2646973 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcatta 2646876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 34049649 - 34049946
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34049649 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 34049748  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34049749 ggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 34049848  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  34049849 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 34049946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 36134930 - 36135218
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||| |||    
T  36134930 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactggattcaaccaatgagtcaaccctagagacacaaggatggt 36135029  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36135030 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 36135128  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  36135129 gagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 36135218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 49273321 - 49273618
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  49273321 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggaatcaaccctagagacacaaggagggt 49273420  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  49273421 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgg 49273520  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||  ||||| ||||| ||||    
T  49273521 gagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttccagaatatcgtcatta 49273618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45100762 - 45100484
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45100762 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgatttcaaccaaggagtcaatcccatagacacaaggagggt 45100663  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  45100662 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtgacgagcatgttttgg 45100563  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  45100562 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 45100484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42950317 - 42950020
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  42950317 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaatgatcaactgaatgaattcaaccaatgagtcaaccccagagacgcaagaagggt 42950218  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  42950217 ggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 42950118  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  42950117 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 42950020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52569703 - 52569409
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  52569703 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaattcaaccaaggagtcagccccagagacaaaaggatggtgg 52569604  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52569603 aacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaa-gtgacgagcatgttttggga 52569505  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  52569504 gcacaacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgccagaagatcgtcatta 52569409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3495326 - 3495029
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3495326 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtaacgttaaaaggtctcaaggataaactaactaaattcaaccaatgagtcaaccccagagacacaaggatggt 3495227  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3495226 ggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 3495127  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  3495126 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatta 3495029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19453526 - 19453248
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  19453526 agaggttgaaggttaggtaacttagtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatagaaggagggt 19453427  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19453426 ggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttatgg 19453327  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19453326 gagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattc 19453248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 321
Target Start/End: Original strand, 7246018 - 7246323
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||| | ||| |||||| |  ||||||||| || ||||    
T  7246018 aggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaggtttgaaggatgaactaactgaattcaaccaaggattcaacctcatagacacaagaagagtgg 7246117  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7246118 aacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 7246217  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagta 315  Q
      | | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  7246218 ttataacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 7246317  T
Q  316 gggaat 321  Q
     |||||    
T  7246318 tggaat 7246323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 37281374 - 37281671
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   | |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  37281374 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcgctaaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggatgat 37281473  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37281474 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 37281573  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||| | ||||||||||| ||||    
T  37281574 gagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcatta 37281671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44835784 - 44835487
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  44835784 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtcttaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacgcaaggagggt 44835685  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| ||||  ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44835684 ggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 44835585  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  44835584 gagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcatta 44835487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10053568 - 10053275
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||| |||    ||||||||||||||||    
T  10053568 agaggttgaaggtttagtgcattggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaattcaaccaaggagtaaacttgagagacacaaggagggt 10053469  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10053468 ggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgg 10053369  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  10053368 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 10053275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33449436 - 33449129
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||  | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33449436 agaggttgaacgtttggtgccttggtgtaacgttaaaaggtctcaaagatcaactgaatgaatccaatcaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 33449337  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  33449336 gaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgg 33449237  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  33449236 gagcacatcatgttccagtggatcgata------------tgctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccagaagatcgtaattagg 33449149  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33449148 tagggaatgcaccttccaac 33449129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 55207170 - 55206873
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||        |||||| | ||||| ||||||||||     
T  55207170 aggttgaaggttcggtgccttagtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaattcaac--------caacccag-agacagaaggagggtga 55207080  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  55207079 aacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttggga 55206980  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagta 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  55206979 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 55206880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 104 - 322
Target Start/End: Original strand, 41577918 - 41578136
Alignment:
Q  104 caaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgag 203  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41577918 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgag 41578017  T
Q  204 catgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  41578018 catgttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 41578117  T
Q  304 cgtgattaagtagggaatg 322  Q
    | | |||| ||| ||||||    
T  41578118 catcattaggtacggaatg 41578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36721682 - 36721394
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | | | |||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36721682 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtc----ggatgaactcactaaattcaatcatggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 36721587  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  36721586 ggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaatgtttgg 36721487  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgt 306  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  36721486 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgt 36721394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 14265330 - 14265646
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14265330 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtcatgttaagtggtcttaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaaggt 14265429  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||| |   ||||||||| ||||||||||    
T  14265430 ggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacg---acgtgacgaacatgttttgg 14265526  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    || |||| |||||| | |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||| |||||||| || | ||| |||||| | | |||||||||||||| |    
T  14265527 gaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgcctgaagatcgtgattagg 14265626  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  14265627 tagggattgcactttccaac 14265646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 318
Target Start/End: Original strand, 43477037 - 43477283
Alignment:
Q  72 tgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgg 171  Q
    |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||    
T  43477037 tgaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgg 43477136  T
Q  172 gtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaag 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||    
T  43477137 gtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaag 43477236  T
Q  272 atattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtaggg 318  Q
    |||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  43477237 atatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattaattaggg 43477283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20376090 - 20375860
Alignment:
Q  103 acaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacga 202  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||    
T  20376090 acaaggaagatggaatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagga 20375991  T
Q  203 gcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaaga 302  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||| || |||||| | || || |    
T  20375990 gtatgttttgagagcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaata 20375891  T
Q  303 tcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20375890 tcgtgattaggtagggaatgcaccttccaac 20375860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50458928 - 50458691
Alignment:
Q  74 aattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggt 173  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | | | ||  |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  50458928 aattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggt 50458829  T
Q  174 ggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagat 273  Q
    |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||||    
T  50458828 ggaatctacgaacgacgaaaacttgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagat 50458729  T
Q  274 attatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    || ||||| ||| |||||| | | ||||||||| ||||    
T  50458728 atcatcaaaagtttgattccgcctgaagatcgtcatta 50458691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42323408
Alignment:
Q  135 tccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtgg 234  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  235 atcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 42323408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11379041 - 11378908
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11379041 agaggttgaaggtttgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattctaccaaggagtcaacaccggagacacaaggagggt 11378942  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgac 147  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11378941 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgac 11378908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 50997454 - 50997607
Alignment:
Q  158 tatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgct 257  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||    
T  50997454 tatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgct 50997553  T
Q  258 gagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  50997554 tagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 50997607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25887795 - 25887586
Alignment:
Q  126 gtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||  | |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  25887795 gtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacatg 25887696  T
Q  226 ttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtg---attaagtagggaatg 322  Q
    |||  ||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |  |||| ||||||   |||| ||||||||||    
T  25887695 ttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgattattaggtagggaatg 25887597  T
Q  323 caccttccaac 333  Q
    |||||||||||    
T  25887596 caccttccaac 25887586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 46346872 - 46346745
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||     ||||||||||||||||    
T  46346872 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaattcaaccaaggagtcaa-----gagacacaaggagggt 46346778  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcga 146  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  46346777 ggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcga 46346745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 15636946 - 15637118
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||| || || |||||| |||||||| || |||||| ||||||  | | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15636946 agaggttgaaggttcgacaccttcgtgtcacatttagaggtatcaaggatcaactgaatggattcaagaaagtagtcaaccccatagacacaaggagggt 15637045  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaac 186  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15637046 ggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaac 15637118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 333
Target Start/End: Original strand, 18440875 - 18440986
Alignment:
Q  222 catgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaat 321  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| ||||    
T  18440875 catgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagagaat 18440974  T
Q  322 gcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||    
T  18440975 gcaccttccaac 18440986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 333
Target Start/End: Original strand, 19485949 - 19486060
Alignment:
Q  222 catgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaat 321  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| ||||    
T  19485949 catgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagagaat 19486048  T
Q  322 gcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||    
T  19486049 gcaccttccaac 19486060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346601
Alignment:
Q  191 aaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgat 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  291 tctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatg 322  Q
    || | |||||||| || |||| ||| ||||||    
T  46346632 tccgccagaagattgtcattatgtacggaatg 46346601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42328413 - 42328288
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42328413 agaggttgaatgtttgatgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactgactgaattcagccaaggaatcaaccccagagacacaaggagggt 42328314  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaa 139  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||    
T  42328313 ggaacacgttcggtataaacgtccaa 42328288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20378184 - 20378089
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20378184 agaggttgaaggttcggtgccttagtgtcacgttaagaggtctaaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagga 20378089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 319
Target Start/End: Original strand, 7954774 - 7954866
Alignment:
Q  227 tccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtaggga 319  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  7954774 tccagttgatcgatatacgtgtaactttgatgagatcaactaaagattttatcaacagtcttatttcgccagaagatcgtgattaagtaggga 7954866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17267590 - 17267306
Alignment:
Q  22 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatg 121  Q
    |||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |    
T  17267590 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtcttaaggatcaaccgaatgaaatcaaccaaggactcaaccccgtaggcacaaggagagtggaatacg 17267491  T
Q  122 ttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt---------ttg 212  Q
    ||  |||| || |||||||| | || |||||||||| ||| || |||  | | |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||         |||    
T  17267490 tttagtattaatgtccaacgttggatgaggggagaacatcgttcagtcagctagaattaacaaacgacgat---gtgaggagcatgttctcgattttttg 17267394  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaa 300  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||   || |||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  17267393 gcagcacatcatgttcccgtggatcgatatgtaagttacgttgctgagattgcctaaagatattctcaagagtttgattctgccagaa 17267306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 41577850 - 41577917
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaac 81  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  41577850 agaggttgaaggtttggcgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaattcaac 41577917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 333
Target Start/End: Original strand, 15637155 - 15637232
Alignment:
Q  256 ctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||   ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  15637155 ctgagatcaactgaagatattatcaatattttgattttgctggaagatcgtaattcggtagggaattcaccttccaac 15637232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 43476966 - 43477014
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggat 63  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43476966 agaggttgaaggttcagggccttggtgta-cgttaagaggtctcaaggat 43477014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 5765114 - 5765433
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5765114 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagatacaaggagggt 5765213  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  5765214 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacttgatgagcatgttttgg 5765313  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  5765314 gagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgccagaagatcgtgattagg 5765413  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5765414 tagggaatgcaccttccaac 5765433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 13283614 - 13283932
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13283614 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgaatgaatttaaccaaggagtcaaccc-ggagacacgaggagggt 13283712  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13283713 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacatgacgagcatgttttgg 13283812  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  13283813 gagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 13283912  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  13283913 tagagaatgcaccttccaac 13283932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 319
Target Start/End: Original strand, 18842347 - 18842652
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18842347 agaggttgaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaatagtcaaccccggagacacaaggagggt 18842446  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18842447 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 18842546  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||| ||||| |    
T  18842547 gagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgccagaagatcgggattagg 18842646  T
Q  314 taggga 319  Q
    ||||||    
T  18842647 taggga 18842652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14174056 - 14173759
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14174056 agaggttgaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgacttaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 14173957  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14173956 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 14173857  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  14173856 gaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 14173759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 38046732 - 38046424
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38046732 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 38046633  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38046632 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgttttgg 38046533  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||||||| |||| |    
T  38046532 gagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattagg 38046433  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  38046432 tacggaatg 38046424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24270661 - 24270371
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24270661 agaggttggaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 24270562  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24270561 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttag 24270462  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatc 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  24270461 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatc 24270371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 6435680 - 6435988
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6435680 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagagttctcaaggttgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 6435779  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6435780 ggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaagttttgg 6435879  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  6435880 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 6435979  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  6435980 tacggaatg 6435988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35587227 - 35586930
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35587227 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaaaattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 35587128  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35587127 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 35587028  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  35587027 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 35586930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 51269712 - 51270007
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51269712 aggttgaaggtttgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgg 51269811  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51269812 aacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 51269911  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  51269912 gcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 51270007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 36909469 - 36909766
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  36909469 agaggttgaaggttcggtgccttagtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactcaattcaaccaaggagtcaaccctagagacataaggagggt 36909568  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36909569 ggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 36909668  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  36909669 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 36909766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39857204 - 39856907
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  39857204 agaggttgaaggttcaattccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaacaaaggagtcaaccaaggagacacaagaagggt 39857105  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39857104 ggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttgg 39857005  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  39857004 gagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatta 39856907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 17696954 - 17697273
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||  || |||||| |||||||||    
T  17696954 agaggttgaaggttcggtgccttcatataacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaatgccagagacataaggagggt 17697053  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||| | ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17697054 ggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 17697153  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  17697154 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 17697253  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    || |||||||||||||||||    
T  17697254 taaggaatgcaccttccaac 17697273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29435881 - 29436150
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29435881 agaggttgaatgttcggtgtcttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 29435980  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29435981 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 29436080  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29436081 gagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 29436150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42572074 - 42571777
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42572074 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaactcaaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggt 42571975  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42571974 ggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 42571875  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  42571874 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 42571777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 13972833 - 13973140
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13972833 agaggttgaaggttcggcgccttggtgtaactttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaacaagg-agtcaaccccagagacgcaaggagggt 13972931  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13972932 ggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 13973031  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| |||| |    
T  13973032 gagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtcattagg 13973131  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  13973132 tacggaatg 13973140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12791572 - 12791274
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgcctt-ggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggaggg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12791572 agaggttgaaggttcggtgcctttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgagctgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagtaggg 12791473  T
Q  113 tggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttg 212  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  12791472 tggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcattttttt 12791373  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  12791372 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 12791274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29762519 - 29762229
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29762519 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 29762420  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29762419 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 29762320  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatc 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||   |||||| | |||||||||    
T  29762319 gagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgccagaagatc 29762229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44337617 - 44337320
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  44337617 agaggttgaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 44337518  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44337517 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 44337418  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||    
T  44337417 gtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgccagaagatcgtcatta 44337320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47488335 - 47488038
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  47488335 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaatcaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggt 47488236  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47488235 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 47488136  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||  || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||  | ||||||||||| ||||    
T  47488135 gagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagatcgtcatta 47488038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 49396614 - 49396920
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  49396614 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaacgagtcaaccccatagacataaggagggtgg 49396713  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  49396714 aacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 49396813  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagta 315  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  49396814 gcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 49396913  T
Q  316 gggaatg 322  Q
     ||||||    
T  49396914 tggaatg 49396920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 23342549 - 23342846
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  23342549 agagattgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcagggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggaaggt 23342648  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23342649 gaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttg 23342748  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||||||| ||||    
T  23342749 gagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccagaagatcgtcatta 23342846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48568702 - 48568433
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48568702 agaggttgaaggtttggtgccttgatgtaacgttaagagatatcaagaatcaactgaatgaactcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 48568603  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  48568602 ggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtgacgagcatgttttgg 48568503  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48568502 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 48568433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50068557 - 50068260
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50068557 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaatgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaacgagtcaaccccagagacgcaaggagggt 50068458  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  50068457 ggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaatgtgacgaacatgttttgg 50068358  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  50068357 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 50068260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13635593 - 13635298
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13635593 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtgg 13635494  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  13635493 aacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttggga 13635394  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  13635393 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 13635298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 324
Target Start/End: Original strand, 18169933 - 18170243
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18169933 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtttaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagttaaccccagagacacaaggagggt 18170032  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18170033 ggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 18170132  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  18170133 gagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgccagaagatcgtcattagg 18170232  T
Q  314 tagggaatgca 324  Q
    ||  |||||||    
T  18170233 taccgaatgca 18170243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 45689030 - 45689324
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  45689030 agaggttgaag-ttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaactcaaccaaagagtcaaccccaaagacacaaggagggt 45689128  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    ||||||||||  |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45689129 ggaatatgtttgg--ttaacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 45689226  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||| ||||    
T  45689227 gagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccataagatcgtcatta 45689324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27486988 - 27486719
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27486988 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattaaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 27486889  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
     ||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27486888 agatcaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 27486789  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27486788 gagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 27486719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 44597609 - 44597878
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44597609 agaggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggt 44597708  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  44597709 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagtatgttttgg 44597808  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  44597809 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaaca 44597878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 49427296 - 49427592
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  49427296 agaggttgaaagttcggtgc-ttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatacaaggatggt 49427394  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |  | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49427395 gttacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 49427494  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  49427495 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 49427592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16532377 - 16532069
Alignment:
Q  25 gttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16532377 gttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatcaattaaatgaattcaaccaaggagtcaactccggagacacaaggaggatggaatacgttc 16532278  T
Q  125 cgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcat 224  Q
      ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| | |||    
T  16532277 gatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgatgagcatattatgggagcagagcat 16532178  T
Q  225 gttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgca 324  Q
    | || | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16532177 gctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgctagaagatcgtgattaggtatggaatgca 16532078  T
Q  325 ccttccaac 333  Q
     ||||||||    
T  16532077 tcttccaac 16532069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 35184878 - 35185176
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35184878 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcagccccaaagacacaaggagggt 35184977  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtttt-g 212  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  35184978 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 35185077  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  35185078 ggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 35185176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 17372635 - 17372955
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  17372635 agaggctgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaatacaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaagagggt 17372734  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  17372735 gaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaatgtgaagaacatgttttgg 17372834  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||  | ||||||||||| |||| |    
T  17372835 gagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgccagaagatcgtcattagg 17372934  T
Q  314 ta-gggaatgcaccttccaac 333  Q
    || || |||||||||||||||    
T  17372935 tatggaaatgcaccttccaac 17372955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35526473 - 35526197
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35526473 aggttaaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaccgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 35526374  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35526373 aacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacgagacgaccatgttttggga 35526274  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  35526273 gcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 35526197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 41780601 - 41780909
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41780601 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagaagggt 41780700  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  41780701 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatatattttgg 41780800  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||  || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||  | |||||| |||| |||| |    
T  41780801 gagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgccagaagttcgtcattagg 41780900  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  41780901 tacggaatg 41780909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 19160225 - 19160514
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  19160225 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacgaggatggt 19160324  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  19160325 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgactatgttttgg 19160424  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  19160425 gaacacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 19160514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39224495 - 39224198
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39224495 agaggttgaaagtttggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 39224396  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  39224395 ggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 39224296  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  39224295 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 39224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Original strand, 48215108 - 48215395
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  48215108 aggttgaaagttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggctgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcacagacacaaggatggtgg 48215207  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||    
T  48215208 aacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatatttttgga 48215307  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  48215308 gcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 48215395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21484903 - 21484637
Alignment:
Q  52 ggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgagg 151  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21484903 ggtctaaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg 21484804  T
Q  152 ggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaac 251  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21484803 ggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgac 21484704  T
Q  252 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtaggg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  21484703 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccagaagatcgtcattaggtaggg 21484637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27035616 - 27035347
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27035616 agaggttgaaggttaggtgtcttgatgtaacattaagaggtctcaaggatcaattgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 27035517  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  27035516 ggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagtatgttttgg 27035417  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27035416 gagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaca 27035347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41875181 - 41874921
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41875181 gaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtg 41875082  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||||  |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41875081 gaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtgacgagcatgttttggg 41874982  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatat 275  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41874981 agcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatat 41874921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 311
Target Start/End: Original strand, 35576305 - 35576544
Alignment:
Q  72 tgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgg 171  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  35576305 tgaattcaaccaaagagtcaaccctggagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgg 35576404  T
Q  172 gtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaag 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35576405 gtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaag 35576504  T
Q  272 atattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  35576505 atatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 35576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17686645 - 17686362
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17686645 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaa--------------ccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 17686560  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
     ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  17686559 agaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 17686460  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  17686459 gagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 17686362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49926665 - 49926370
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||            ||| |||||| |||| ||||    
T  49926665 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtgacgttaaaaggtcttaaggatgaactgactgaattcaac------------cccagagacagaagg-gggt 49926579  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49926578 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgttttgg 49926479  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  49926478 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 49926379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 37778000 - 37778284
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37778000 agaggttgaaggttcggtgcattggtgtaacgctaagatgtctcaaggatgaactgactgaattcaatcaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 37778099  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    ||||             |||  |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37778100 ggaa-------------aacaaccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 37778186  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  37778187 gagaacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 37778284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 109 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363779
Alignment:
Q  109 agggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgt 208  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  209 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtga 308  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  309 ttaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  24363803 ttaggtagggaatgcaccttccaac 24363779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30310122 - 30309833
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  30310122 aggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcgctgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacataaggagggtgg 30310023  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30310022 aacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 30309923  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||  | ||| ||||||||||||||||| || ||      ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  30309922 gcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtgac------gagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 30309833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 318
Target Start/End: Original strand, 3658475 - 3658685
Alignment:
Q  108 gagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatg 207  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||    
T  3658475 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtg 3658574  T
Q  208 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtg 307  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||||||     
T  3658575 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 3658674  T
Q  308 attaagtaggg 318  Q
    |||| ||||||    
T  3658675 attaggtaggg 3658685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49599134 - 49598921
Alignment:
Q  52 ggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgagg 151  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  49599134 ggtctcaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgagg 49599035  T
Q  152 ggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaac 251  Q
    ||||| ||||||| | ||| ||||| |||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49599034 ggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacg-aaacgtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaac 49598936  T
Q  252 gttgctgagatcaac 266  Q
    |||||||||||||||    
T  49598935 gttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49263247 - 49263017
Alignment:
Q  41 taacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |            |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  49263247 taacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaacaa------------cggagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaac 49263160  T
Q  141 gctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgat 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  49263159 gctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctat 49263060  T
Q  241 atgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  49263059 atgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaca 49263017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 128 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180281
Alignment:
Q  128 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagt-tgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  227 tccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcatta 46180281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 115 - 331
Target Start/End: Original strand, 16081294 - 16081510
Alignment:
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||    
T  16081294 gaatacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttgg 16081393  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagt 314  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||  | || ||| | |||||| | |||||||||||||| ||    
T  16081394 agcacaacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactgagaatatactgaagagtttaattctgccggaagatcgtgattaggt 16081493  T
Q  315 agggaatgcaccttcca 331  Q
    |||||||||||||||||    
T  16081494 agggaatgcaccttcca 16081510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 4209159 - 4209262
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4209159 agaggttgaagattcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 4209258  T
Q  114 ggaa 117  Q
    ||||    
T  4209259 ggaa 4209262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16098198 - 16098075
Alignment:
Q  46 ttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcg 145  Q
    ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16098198 ttaagaggtatcaaagatcaactgaatgaattcaaccaagtagtcaaccctggagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcg 16098099  T
Q  146 acgaggggagaatatcatttagtt 169  Q
    |||| |||||||||||||| ||||    
T  16098098 acgatgggagaatatcattcagtt 16098075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 46181850 - 46181731
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  46181850 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaatgttaagaggtctcaaggatcaattgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggaaggt 46181751  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaac 133  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  46181750 ggaatacgttcggtataaac 46181731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 13148201 - 13148295
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  13148201 aggttgaaggttcgatgccttgatgtaaccttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggag 13148295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40533377 - 40533287
Alignment:
Q  221 tcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| | ||||||||||| ||||    
T  40533377 tcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcatta 40533287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  152 ggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatc 237  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14772592 - 14772511
Alignment:
Q  252 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||| |||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14772592 gttgcagagatcaattgaagatgttctcaacagtttgattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaac 14772511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 15471455 - 15471571
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| ||| |||||||     
T  15471455 acgttaaaaggtgtcaaggatcaactgaatgaaatcaaccaaggtctcaaccccggagacacaaggagtgtggaatacgtttggtatgaacatccaacgt 15471554  T
Q  143 tcgacgaggggagaata 159  Q
    |||||||||||||||||    
T  15471555 tcgacgaggggagaata 15471571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24364064 - 24364008
Alignment:
Q  23 aggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24364064 aggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattca 24364008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262433
Alignment:
Q  208 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattc 19262433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48707185 - 48707090
Alignment:
Q  45 gttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaac 140  Q
    ||||| || ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  48707185 gttaaaagatctgaaggatcaactgaatgaaatcaaccaaggactcaaccctggagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaac 48707090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29707621 - 29707547
Alignment:
Q  232 tggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgt 306  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||    
T  29707621 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgt 29707547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14772809 - 14772665
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || | ||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| |||||||||||     
T  14772809 acgttaaaaggtctcaaggatcaactggaagaaatcaaccagg-actcaactccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgt 14772711  T
Q  143 tcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    | ||| | ||||||||||| || ||| || | ||||||| ||||||    
T  14772710 tggacaacgggagaatatcgttcagtcggctagaattaaagaacga 14772665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 319
Target Start/End: Original strand, 6901878 - 6902183
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6901878 agaggttgaaggttcggtgccatggtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactaggaagtcaaccccggagacacaaggagggt 6901977  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
     ||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6901978 tgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 6902077  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |    
T  6902078 gagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcgagaagatcatgattagg 6902177  T
Q  314 taggga 319  Q
    ||||||    
T  6902178 taggga 6902183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 319
Target Start/End: Original strand, 20148030 - 20148335
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148030 agaggttgaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 20148129  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |    
T  20148130 gaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacatgactagcatgttttag 20148229  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  20148230 gagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 20148329  T
Q  314 taggga 319  Q
    ||||||    
T  20148330 taggga 20148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 35491547 - 35491855
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35491547 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 35491646  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35491647 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 35491746  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  35491747 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 35491846  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  35491847 tacggaatg 35491855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37312789 - 37312492
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37312789 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccccgagacacaaggaggat 37312690  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37312689 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 37312590  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  37312589 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatta 37312492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10364930 - 10364611
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10364930 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtg 10364831  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10364830 gaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggg 10364731  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagt 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| ||    
T  10364730 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattacgt 10364631  T
Q  315 agg---gaatgcaccttcca 331  Q
    |||   ||||||||||||||    
T  10364630 aggaatgaatgcaccttcca 10364611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 33403930 - 33404246
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |   ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33403930 agaggttgaaggttcggtgccttatagtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgaatgaattcatcca---agtcaaccccgaagacacaaagagggt 33404026  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33404027 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 33404126  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |    
T  33404127 gagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccagaagatcgtgattagg 33404226  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33404227 tagggaatgcaccttccaac 33404246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17796398 - 17796095
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17796398 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 17796299  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17796298 ggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 17796199  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    |||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||| |||| |||| |    
T  17796198 gagca---catgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtcagaagctcgtcattagg 17796102  T
Q  314 tagggaa 320  Q
    |||||||    
T  17796101 tagggaa 17796095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27130803 - 27130514
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27130803 agaggttgaaggttcgatgccttggtgcaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcggagacacaaggagggt 27130704  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27130703 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 27130604  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  27130603 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 27130514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10360492 - 10360196
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10360492 gaggttgaaggttcgatgccttggtataacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggaaacacaaggagggtg 10360393  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10360392 gaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttggg 10360293  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  10360292 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 10360196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19471928 - 19471620
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19471928 agaggatgaaggttcggtgcctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactaaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 19471829  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19471828 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 19471729  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  19471728 gagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 19471629  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  19471628 tacggaatg 19471620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 3941649 - 3941946
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3941649 agaggttgaatgttcggtgccttggtttaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggt 3941748  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3941749 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 3941848  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  3941849 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 3941946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Original strand, 29111071 - 29111337
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29111071 agaggttgaag-ttcagtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaactcgaacagggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 29111169  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29111170 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 29111269  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29111270 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaa 29111337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 29906494 - 29906784
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  29906494 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggt 29906593  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  29906594 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaacatgttttgg 29906693  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatc 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||| |||||||||    
T  29906694 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagatc 29906784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2919657 - 2919351
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||    
T  2919657 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaattcaaccaaggagtctacca--gagacacaaggagggt 2919560  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2919559 ggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 2919460  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||| | || |||||||| |||| |    
T  2919459 gagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattagg 2919360  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  2919359 tacggaatg 2919351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3937358 - 3937061
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3937358 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 3937259  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3937258 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 3937159  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  3937158 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 3937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 43982768 - 43983065
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43982768 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccatggagtcaaccccagagacacaaggatggt 43982867  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43982868 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 43982967  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  43982968 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 43983065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12968596 - 12968327
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12968596 agaggtggaaggttcaatgccttgatgtaacgttaagaggtcttaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 12968497  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12968496 ggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 12968397  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12968396 gagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 12968327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 29067642 - 29067938
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||| |||    
T  29067642 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaag-agtcaaccccaaagacacaaggatggt 29067740  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  29067741 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtgacgaccatgttttgg 29067840  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  29067841 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 29067938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34521977 - 34521681
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34521977 agaggttgaaggttcggcgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactaactgaattcaaccaaggagtcaacccag-agacacaaggagggt 34521879  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | || | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34521878 gaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 34521779  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| |||||||| ||||    
T  34521778 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccctcataagatcgtcatta 34521681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 6976752 - 6977045
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6976752 agaggttgaaggt--gatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaacaaggagtcaactccagagacacaaggagggt 6976849  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6976850 ggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagtg--tatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 6976947  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||| ||||    
T  6976948 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcatta 6977045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Original strand, 16581734 - 16582003
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16581734 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctgaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 16581833  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  16581834 ggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaatgtgtcgagcatgttttgg 16581933  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatc--gatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16581934 gagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 16582003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 22493183 - 22493480
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22493183 agagggtgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaagatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggt 22493282  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22493283 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaacgtgacgagcatgttttgg 22493382  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||| |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  22493383 gagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 22493480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 39393807 - 39394100
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  39393807 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaagtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggtgtaa 39393906  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
     |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39393907 caccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 39394006  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||| ||||    
T  39394007 acaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgtcagaagatcgtcatta 39394100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 5420381 - 5420659
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5420381 agagattgaaggtttgatgccttggtgtatcgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaatgagtcaaccccggagacacaaggagggt 5420480  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  5420481 ggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgt 5420580  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  5420581 gagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 5420659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 17424701 - 17424998
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  17424701 agaggtttaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggatggt 17424800  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17424801 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 17424900  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  17424901 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 17424998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 42119924 - 42120221
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  42119924 agaggttgaaggtttgttgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactggatgagttcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggt 42120023  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42120024 ggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 42120123  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  42120124 gagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 42120221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42241393 - 42241096
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42241393 agaggttgaaggttcggtgccttagtgtaacgttaagaggtctaaaggataaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 42241294  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  42241293 gaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 42241194  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  42241193 gagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgccataagatcgtcatta 42241096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41499376 - 41499080
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||            ||| |||||| |||||||||    
T  41499376 agaggttgaaggttcggtgtcatggtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaattcaac------------cccagagacagaaggagggt 41499289  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41499288 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 41499189  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  41499188 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 41499089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39800136 - 39799905
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  39800136 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggt 39800037  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  39800036 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgg 39799937  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcg 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39799936 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcg 39799905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 32734560 - 32734829
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32734560 agaggttgaaggtccagtgcctta-tgtaacgttaagaggtctcaaagatcaactgaatgaattcaaccaatgagtcaaccccagagacacaaggagggt 32734658  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  32734659 ggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaatgtgacaagcatgttttgg 32734758  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacag 284  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32734759 gagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacag 32734829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 22001758 - 22002035
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||            ||| |||||||||||| |||    
T  22001758 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgattgaattcaac------------cccagagacacaaggatggt 22001845  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
     ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22001846 agaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 22001945  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  22001946 gagctcagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 22002035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 34638878 - 34639093
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34638878 agaggttgaaggttcggtgcattggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaacttactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagg-t 34638976  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34638977 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 34639076  T
Q  214 gagcacatcatgttcca 230  Q
    ||||||| |||||||||    
T  34639077 gagcacagcatgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 16253388 - 16253595
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16253388 agaggttgaaggttcggcacgttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactgagtgaatttaaccaaggagtcaacccccgggacacaaggagggt 16253487  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  16253488 ggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagcagcatgttttgg 16253587  T
Q  214 gagcacat 221  Q
    ||||||||    
T  16253588 gagcacat 16253595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 31770279 - 31770425
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||| || ||    
T  31770279 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaaatgaatgaattcaaccaaggagccaaccccatagacacaaggaggatgtaa 31770378  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatt 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31770379 tatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcatt 31770425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Original strand, 18392032 - 18392179
Alignment:
Q  101 acacaaggagggtggaatatgttcc----gtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  18392032 acacaaggagggtggaatacgttcgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 18392131  T
Q  197 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgc 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392132 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40678909 - 40678767
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40678909 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 40678810  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggaga 156  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40678809 ggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggaga 40678767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40677515 - 40677361
Alignment:
Q  168 ttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaact 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40677515 ttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaact 40677416  T
Q  268 gaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatg 322  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  40677415 gaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatg 40677361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650402
Alignment:
Q  208 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtg 307  Q
    |||||| | |||| |||||| | |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  308 attaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  27650427 attaggtagggaatgcaccttccaac 27650402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31992210 - 31991911
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |  ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| ||||||||| |     
T  31992210 acgttaaaaggtctcaaggatcaactagatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaatgt 31992111  T
Q  143 tcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt---------ttgggagcacatcatgttccagtg 233  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||| || | ||||||| ||||||  |  |||||| |||||||||         |||| |||| | |||| | | ||     
T  31992110 tggacgacgggagaataacgttaagtcggctagaattaaagaacgacaacgacgtgaggagcatgttctcaattttttggaagcatagcatggttccgtt 31992011  T
Q  234 gatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
     |||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31992010 tatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaac 31991911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 16706879 - 16706959
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaacc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  16706879 agaggttgaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaacttaatgaattcaaccaaggagtcaacc 16706959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 294
Target Start/End: Original strand, 11718688 - 11718947
Alignment:
Q  45 gttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctc 144  Q
    ||||| ||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||| || |     
T  11718688 gttaaaaggtctcaatgatcaactgcatgaaatcaaccatggactcaaccccggagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccagcgttg 11718787  T
Q  145 gacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatg----------ttttgggagcacatcatgttccagtgg 234  Q
    ||||| ||||||||| | |||| | || | ||||||| |||||| ||  |||||| || ||||          |||| | | ||||||||||||| ||||    
T  11718788 gacgatgggagaataacgtttaatcggctagaattaaagaacgacgacgacgtgatgaacatgttctcgattttttttgcaccacatcatgttcccgtgg 11718887  T
Q  235 atcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctg 294  Q
    |||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11718888 atcgatatgtttctcacgttactgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattctg 11718947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 333
Target Start/End: Original strand, 16253600 - 16253686
Alignment:
Q  247 gtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16253600 gtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagggaatacaccttccaac 16253686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15891705 - 15891622
Alignment:
Q  250 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15891705 acgttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaac 15891622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11679317 - 11679093
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||| |  | | ||||||| ||||||    
T  11679317 tcaaccccggagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgatgggagaataacgtttaatcagctagaattaaagaacga 11679218  T
Q  189 agaaaacgtgacgagcatgtt----------ttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattat 278  Q
     ||  |||||| || ||||||          || | | ||||||||||||| |||||||||||||    | ||||| || |||||||||||||||||| |    
T  11679217 cgacgacgtgatgaacatgttctcgattttttttgcaccacatcatgttcccgtggatcgatatgtttctcacgttacttagatcaactgaagatattct 11679118  T
Q  279 caacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||||| |||||||| || |||||    
T  11679117 caacagtttgattctgccataagat 11679093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26617771 - 26617635
Alignment:
Q  22 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatg 121  Q
    |||||||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  26617771 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggattaactaaatgaaatcaaccaatgactcaactccagagacacaaggagggtggaatacg 26617672  T
Q  122 ttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaata 159  Q
    ||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26617671 tttggtatgaacgtccaacg-ttgacgaggggagaata 26617635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18036220 - 18036137
Alignment:
Q  250 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18036220 acgttgcagagatcaactaaaaatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtaggaaatgcaccttccaac 18036137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 18878445 - 18878611
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| |||||| |||||| || |  ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| |||||||||||     
T  18878445 acgttaaaaggtcttaaggatcaactagatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggaggggggaatacatttggtatgaacgtccaacgt 18878544  T
Q  143 tcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt 209  Q
    | |||||  |||||||| | || ||| |  | |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  18878545 tggacgacaggagaataacgttcagtcgactagaattaacgaacgacgacgacgtgaggagcatgtt 18878611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18393558
Alignment:
Q  239 atatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| ||||||||||| ||||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcatta 18393558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 333
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43491685
Alignment:
Q  252 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaa----tgcaccttccaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||    |||||||||||||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaaagaatgcaccttccaac 43491685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1642884 - 1642565
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1642884 agagattgaaggttcgatgccttggagtaatgttaagaggtctcaaggatcaattgaatgaattcaaccaaggagtcaatcccggagacacaaggagggt 1642785  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1642784 ggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgaggagcatgttttgg 1642685  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |    
T  1642684 gagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattagg 1642585  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1642584 tagggaatgcaccttccaac 1642565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21615057 - 21614737
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21615057 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtatcgttaagaggtctcaatgatgaactgaatgaattcaactagggagtcaacctcggagacacaaggagggt 21614958  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21614957 ggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgg 21614858  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | |||||| ||||||||| |    
T  21614857 gagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgccagaagttcgtgattagg 21614758  T
Q  314 taggg-aatgcaccttccaac 333  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  21614757 tagggaaatgcacctttcaac 21614737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15338202 - 15337894
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15338202 agaggttgaaggttttgtgccttggtgtgacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaaccaaggattcaaccccagagacacaaggagggt 15338103  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15338102 ggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgg 15338003  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |    
T  15338002 gagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgccagaagatcgtcattagg 15337903  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  15337902 tatggaatg 15337894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46862491 - 46862199
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  46862491 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggt 46862392  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  46862391 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcttgttttgg 46862292  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgt 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  46862291 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgccagaagatcgt 46862199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Original strand, 48270558 - 48270850
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48270558 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaaaaagtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacaaaaggagggt 48270657  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48270658 ggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 48270757  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgt 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  48270758 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgt 48270850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 21650433 - 21650712
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaacc-ccggagacacaaggaggg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21650433 agaggttgaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccacctgagacacaaggaggg 21650532  T
Q  113 tggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttg 212  Q
    ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  21650533 tggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttatg 21650632  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650633 ggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 21650712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36394121 - 36393843
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36394121 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 36394022  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36394021 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 36393922  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  36393921 gagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 36393843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 40588459 - 40588756
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40588459 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 40588558  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  40588559 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgatgagcatgttttgg 40588658  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  40588659 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggccagaagatcgtcatta 40588756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43351396 - 43351100
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43351396 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaattcaaccaaggagtctaccccagagacacaaggagggt 43351297  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43351296 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 43351197  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||||||||| ||||    
T  43351196 gagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccaccagaagatcgtcatta 43351100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 48315477 - 48315169
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  48315477 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatagaaggagggt 48315378  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48315377 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 48315278  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| |||| |    
T  48315277 gagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtcattagg 48315178  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  48315177 tacggaatg 48315169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21187593 - 21187299
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21187593 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgtta---ggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 21187497  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  21187496 gaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 21187397  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  21187396 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcatta 21187299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28979319 - 28979060
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28979319 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 28979220  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  28979219 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 28979120  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagat 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28979119 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 20564669 - 20564966
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20564669 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 20564768  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20564769 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 20564868  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  20564869 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 20564966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 17183122 - 17183412
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  17183122 agaggttgaaggtttgttgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccttagagacacaaggagggt 17183221  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | || | |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17183222 gtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 17183321  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatc 304  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  17183322 aagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatc 17183412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 18237474 - 18237771
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||||||| || ||||| |||||| |||    
T  18237474 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttacgaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaagaagtcaactccagagacgcaaggatggt 18237573  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  18237574 ggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacatgacgagcatattttgg 18237673  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  18237674 gagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgccagaagatcgtcatta 18237771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 42735173 - 42735469
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42735173 agaggttgaaggtttggtgcctcggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggt 42735272  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42735273 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 42735371  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||| ||||    
T  42735372 gagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcaagaagatcgtcatta 42735469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 41048700 - 41048990
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||| |||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||| |    
T  41048700 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaag-------tgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacagaaggaggat 41048792  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41048793 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgg 41048892  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  41048893 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 41048990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 17839233 - 17839511
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17839233 agaggttgaatattcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 17839332  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17839333 ggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 17839432  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  17839433 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattc 17839511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 30360427 - 30360723
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30360427 agaggttgaaggttcgatgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 30360526  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30360527 ggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgtaacgagcatgttttgg 30360626  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  30360627 gagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggt-gcgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 30360723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 34140775 - 34141052
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  34140775 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcagccaagaagtcaaccctagagacacaaggagggt 34140874  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  34140875 ggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgg 34140974  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatt 291  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  34140975 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatt 34141052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39477537 - 39477240
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  39477537 agaggttgaaagtttggtggcttagtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagatacacaaggagggt 39477438  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39477437 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 39477338  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  39477337 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 39477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28114690 - 28114401
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28114690 agaggttgaaggttcagtcctttggtgtaacgttaagaggtccaaagggtgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagaaacaaggagggt 28114591  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  28114590 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttag 28114491  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  28114490 gagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgtcaaaagat 28114401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48221039 - 48220771
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  48221039 agaggttgaaggttcggtaccttgatgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggt 48220940  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  48220939 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg--ttgg 48220842  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacag 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48220841 gagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacag 48220771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20379000 - 20378710
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20379000 agaggttgaaggttcgatgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaattgaataaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 20378901  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20378900 ggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 20378801  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatc 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| | |||||||||    
T  20378800 gagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgccagaagatc 20378710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45363540 - 45363252
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45363540 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggt 45363441  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  45363440 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 45363341  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  45363340 gagcacatcatgttccagtggatcgat---------acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 45363252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 2356199 - 2356519
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2356199 agaggttgaaggtttgatgccttggtgtaatgctaagaggtctaaaggatgaactcaccgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 2356298  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  2356299 ggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatgtgacgagcatgttttgg 2356398  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |  | |||| |||||||| |    
T  2356399 gagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgctataagaccgtgattagg 2356498  T
Q  314 taggg-aatgcaccttccaac 333  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  2356499 tagggaaatgcatcttccaac 2356519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26603501 - 26603273
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  26603501 gaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagttaacctcagagacacaaggagggtg 26603402  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggg 214  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26603401 gaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaacgtgacgagcatgttttggg 26603302  T
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatg 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26603301 agcacaacatgttccagtggatcgatatg 26603273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 10522978 - 10523257
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  10522978 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggatggt 10523077  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10523078 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 10523177  T
Q  214 gagcacatcatg-ttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattc 292  Q
    ||||||  |||| |||  ||||||||||||||| || | ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  10523178 gagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattc 10523257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Original strand, 47268821 - 47269112
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||            ||| ||||| ||||||||||    
T  47268821 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaac------------cccagagacgcaaggagggt 47268908  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47268909 ggaatacgttc-gtataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 47269007  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | |||||| | || |||||||| |||||     
T  47269008 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgccaaaagatcgtcattaat 47269107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 41217524 - 41217793
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||| | |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  41217524 agaggttgaaggttcggtgccttgatttaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaggttaaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggt 41217623  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||  |||| |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  41217624 ggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtgaagaacatgttttgg 41217723  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41217724 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 41217793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30355005 - 30354804
Alignment:
Q  121 gttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaca 220  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30355005 gttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaca 30354906  T
Q  221 tcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaa 320  Q
     |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||    
T  30354905 acatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattaggtacggaa 30354806  T
Q  321 tg 322  Q
    ||    
T  30354805 tg 30354804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Original strand, 42682866 - 42683052
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42682866 agaggttgaaggttcggtgacttagtgtaaaattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 42682965  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgac 200  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42682966 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgac 42683052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 13916744 - 13916949
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||    
T  13916744 agaggttgaaggttcggtgccttggcgtaatgttaagaggtttcaaggatgaactgactgaattcaaccaag-agtcaaccccagagacacaaggatggt 13916842  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||  |||| |||| || ||||||||||    
T  13916843 ggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaatgtgatgaccatgttttgg 13916942  T
Q  214 gagcaca 220  Q
    |||||||    
T  13916943 gagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2206152 - 2206037
Alignment:
Q  196 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |     
T  2206152 gtgacgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 2206053  T
Q  296 cagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||||||| ||||    
T  2206052 cagaagatcgtcatta 2206037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8726514 - 8726341
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtg 114  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8726514 gaggatgaagattcggtaccttggtgtcacgttacgaggtctcaaggatcaacttgatgaattcaaccaaggagtcaaccctgtagacacaaggagggtg 8726415  T
Q  115 gaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| || |||||   | |||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  8726414 gaataagttcggtataaacgtccatcgttcgacactgagagaatactattcagttaggtggaattaacaaacga 8726341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9367241 - 9367120
Alignment:
Q  190 gaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctga 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  9367241 gaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttga 9367142  T
Q  290 ttctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||| | || |||||||| ||||    
T  9367141 ttccgccacaagatcgtcatta 9367120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 333
Target Start/End: Original strand, 149997 - 150317
Alignment:
Q  22 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatg 121  Q
    |||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| | ||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||      
T  149997 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaagaatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccttggagacacaagaagggtggaataca 150096  T
Q  122 ttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt---------ttg 212  Q
    ||  |||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||| |||| ||  || | ||||||| |||||| ||  |||| | |||||||||         |||    
T  150097 tttggtatgaacgtctaacgttggacgacgggaggataacattcagccggctagaattaaagaacgacgacgacgtaaggagcatgttctcgattttttg 150196  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaa 312  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||    || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||     
T  150197 gcagcacatcatgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtgattag 150296  T
Q  313 gtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  150297 gtagggaatgcaccttccaac 150317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3380971 - 3380652
Alignment:
Q  22 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatg 121  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||      
T  3380971 aaggttcggtgcattaatgtgacgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatcaacaagg-actcaaccccggagacacaaggagagtgaaataca 3380873  T
Q  122 ttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt---------ttg 212  Q
    ||  |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||  || || | ||||||| |||||| ||  |||||| || ||||||         |||    
T  3380872 tttggtatgaacgtccaacgttggacgacgggagaataacgttctgtcggctagaattaaagaacgacgacgacgtgaggaacatgttctcaattttttg 3380773  T
Q  213 ggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaa 312  Q
    | | |||| |||| |   ||  |||||||||    | || |||  ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||     
T  3380772 gcaacacaacatggtttcgtttatcgatatgtttatcacattgtagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattag 3380673  T
Q  313 gtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3380672 gtagggaatgcaccttccaac 3380652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Original strand, 18146877 - 18147014
Alignment:
Q  22 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatg 121  Q
    |||||||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18146877 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactgaatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtggaatact 18146976  T
Q  122 ttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaata 159  Q
    ||  |||| ||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  18146977 tttggtatgaacgtccaacgttggacgacaggagaata 18147014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 323
Target Start/End: Original strand, 11824839 - 11824912
Alignment:
Q  250 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgc 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11824839 acgttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattaggtagggaatgc 11824912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 311
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066462
Alignment:
Q  208 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtg 307  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||| ||||||    
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  308 atta 311  Q
    ||||    
T  28066459 atta 28066462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 325
Target Start/End: Original strand, 18149638 - 18149748
Alignment:
Q  215 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagt 314  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||    | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||  ||| ||    
T  18149638 agcacaacatgttcccgtggatcgatttgtttttcaagttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgtatttaggt 18149737  T
Q  315 agggaatgcac 325  Q
    |||||||||||    
T  18149738 agggaatgcac 18149748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26601839 - 26601778
Alignment:
Q  250 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  26601839 acgttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcatta 26601778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 119
Target Start/End: Original strand, 12082907 - 12082937
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacaaggagggtggaata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12082907 tcaaccccggagacacaaggagggtggaata 12082937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7414304 - 7414196
Alignment:
Q  208 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtg 307  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||   || ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||||||  ||    
T  7414304 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatctatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaaaatattctcaacagtttgatttcgccagaagattatg 7414205  T
Q  308 attaagtag 316  Q
    |||| ||||    
T  7414204 attaggtag 7414196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 11824623 - 11824739
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  | ||||| ||||| | | | |||||||| |||| |||||||| ||| ||||  ||  |||||||| |||||||     
T  11824623 acgttaaaaggtctcaaggatcaacgggatgaaatcaaccaagcactcaacccctgagaaacaaggagagtgaaataaatttggtataaacatccaacgt 11824722  T
Q  143 tcgacgaggggagaata 159  Q
    | ||||| |||||||||    
T  11824723 tggacgacgggagaata 11824739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 281
Target Start/End: Original strand, 13920431 - 13920483
Alignment:
Q  229 cagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13920431 cagtggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaa 13920483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 2177 - 2474
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2177 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 2276  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2277 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 2376  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||| ||||    
T  2377 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgccaaaagatcgtcatta 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 333
Target Start/End: Original strand, 14114957 - 14115268
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14114957 gttgaaggttcggtgccttggt----cgttaagaggtctcaaggatgaactggatgaattcaaccaaggagtcaacctcggagacacaaggagggtgcaa 14115052  T
Q  118 tatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 217  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14115053 aacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagc 14115152  T
Q  218 acatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagg 317  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  14115153 acaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgccagaagatagtgattaggtagg 14115252  T
Q  318 gaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||||||||||||    
T  14115253 gaatgcaccttccaac 14115268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 13402445 - 13402753
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13402445 agaggttgaaggttaggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggagggt 13402544  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13402545 ggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 13402644  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||||||||||| |||| |    
T  13402645 gagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattagg 13402744  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  13402745 tacggaatg 13402753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34803193 - 34802885
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34803193 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaatcccagagacacaaggagggt 34803094  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||    
T  34803093 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgttcagg 34802994  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | || |||||||| |||| |    
T  34802993 gagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccaaaagatcgtcattagg 34802894  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  34802893 taaggaatg 34802885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32027923 - 32027617
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  32027923 aggttgaaggttcggtgactttttgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggttg 32027824  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32027823 aacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 32027724  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagta 315  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  32027723 gcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 32027624  T
Q  316 gggaatg 322  Q
     ||||||    
T  32027623 cggaatg 32027617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 6205396 - 6205693
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6205396 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 6205495  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6205496 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 6205595  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  6205596 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 6205693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32037982 - 32037677
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  32037982 aggttgaaggttcggtgactttttgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggttg 32037883  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32037882 aacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 32037783  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagta 315  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  32037782 gcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 32037683  T
Q  316 gggaat 321  Q
     |||||    
T  32037682 aggaat 32037677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 27640094 - 27640389
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27640094 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtgg 27640193  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  27640194 aacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttggaa 27640293  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  27640294 gcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 27640389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 29108057 - 29108349
Alignment:
Q  19 ttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29108057 ttgaaggttcggtgccttggtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaatttaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaac 29108156  T
Q  119 atgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 218  Q
    |  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29108157 acctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagca 29108256  T
Q  219 catcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  29108257 cagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 29108349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 12396688 - 12396957
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12396688 agaggttgaaggtttggtgccttggtataacgttaagcggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacataaggagggt 12396787  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||  | |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12396788 ggagcacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 12396887  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12396888 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaaca 12396957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 801078 - 801374
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  801078 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgagtgaattcaaccgagaagtcgaccccagagacacaaggagggt 801177  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| | |||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  801178 ggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggagg-tgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 801276  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  801277 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 801374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 11692363 - 11692660
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  11692363 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactaaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggatggt 11692462  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11692463 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 11692562  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  11692563 aagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 11692660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 281
Target Start/End: Original strand, 22305710 - 22305975
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  22305710 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtgg 22305809  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  22305810 aacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttggga 22305909  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  22305910 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaa 22305975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29066471 - 29066734
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29066471 agaggttgaaggttcggtg------tgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 29066564  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29066565 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 29066664  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29066665 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaaca 29066734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29075484 - 29075747
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29075484 agaggttgaaggttcggtg------tgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 29075577  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29075578 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 29075677  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29075678 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaaca 29075747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 29110473 - 29110719
Alignment:
Q  38 gtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaagga-gggtggaatatgttccgtataaacgtc 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||    
T  29110473 gtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatgggtggaacaccttcggtataaacgtc 29110572  T
Q  137 caacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggat 236  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29110573 caacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggat 29110672  T
Q  237 cgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29110673 cgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaaca 29110719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35058932 - 35058763
Alignment:
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35058932 ggaatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 35058833  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35058832 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaca 35058763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257579
Alignment:
Q  161 catttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgag 260  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  261 atcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||| ||||    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcatta 30257579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3766018 - 3765915
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3766018 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 3765919  T
Q  114 ggaa 117  Q
    ||||    
T  3765918 ggaa 3765915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35060263 - 35060161
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  35060263 aggttgaaggttcggtgtcttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaacgagttaaccccagagacgcaaggagggtgg 35060164  T
Q  116 aat 118  Q
    |||    
T  35060163 aat 35060161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20242392 - 20242105
Alignment:
Q  54 tctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgagggg 153  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||  |||| ||||||||||| | |||||  ||    
T  20242392 tctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacagg 20242293  T
Q  154 agaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt--------ttgggagcacatcat-gttccagtggatcgatatgc 244  Q
    |||||| | || | | || | ||||||| |||||| ||  |||| |  ||||||||        |||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||     
T  20242292 agaataacgttcaatcggctagaattaaagaacgacgacgacgtcaaaagcatgttctcaatttttggcagcacatcatagtttcggtg-atcgatatgt 20242194  T
Q  245 gagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
      || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20242193 ttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaac 20242105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22136376 - 22136089
Alignment:
Q  54 tctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgagggg 153  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||  |||| ||||||||||| | |||||  ||    
T  22136376 tctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacagg 22136277  T
Q  154 agaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt--------ttgggagcacatcat-gttccagtggatcgatatgc 244  Q
    |||||| | || | | || | ||||||| |||||| ||  |||| |  ||||||||        |||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||     
T  22136276 agaataacgttcaatcggctagaattaaagaacgacgacgacgtcaaaagcatgttctcaatttttggcagcacatcatagtttcggtg-atcgatatgt 22136178  T
Q  245 gagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
      || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22136177 ttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaac 22136089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17465415 - 17465313
Alignment:
Q  231 gtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttcc 330  Q
    |||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  17465415 gtggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggtagagaatacaccttcc 17465316  T
Q  331 aac 333  Q
    |||    
T  17465315 aac 17465313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 333
Target Start/End: Original strand, 28051299 - 28051599
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||| |||||| |||||| || |  ||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| |||||||||||     
T  28051299 acgttaaaaggtcttaaggatcaacttgatgaaatcaaccatgaactcaaccccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgt 28051398  T
Q  143 tcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatg---------ttttgggagcacatcatgttccagtg 233  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||| || | ||||||| |||||| || ||||| | |||||||         |||||| |||||| |||| | | |      
T  28051399 tggacgacgggagaataacgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacaacgtcaggagcatgttctcgattttttggcagcacagcatggttctggt 28051498  T
Q  234 gatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagata-ttatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaa 332  Q
    ||||||||||   || ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  28051499 gatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactggagatatttctcaatagtttgattccgctagaagatcgtgattacgtagagaatgcacctttcaa 28051598  T
Q  333 c 333  Q
    |    
T  28051599 c 28051599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 333
Target Start/End: Original strand, 20192466 - 20192549
Alignment:
Q  250 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20192466 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaac 20192549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22143525 - 22143442
Alignment:
Q  250 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22143525 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaac 22143442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 285
Target Start/End: Original strand, 2402178 - 2402383
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| | || ||| |  | ||||||||||||||    
T  2402178 tcaaccccggagacacacggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacgggagaataacgttcagtcgactagaattaacgaacga 2402277  T
Q  189 agaaaacgtgacgagcatg---------ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatc 279  Q
     ||   || || |||||||         |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  2402278 cgacggcgcgaggagcatgttctcgattttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagataatctc 2402377  T
Q  280 aacagt 285  Q
    ||||||    
T  2402378 aacagt 2402383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 333
Target Start/End: Original strand, 34134801 - 34134882
Alignment:
Q  252 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaac 333  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34134801 gttgcagagatcaactgaagaaattctcaacagtttgattccgctaaaagatcgtgattaggtagggaatgcacctttcaac 34134882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765818
Alignment:
Q  232 tggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 3765818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021226
Alignment:
Q  264 aactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatg 322  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaagtacggaatg 35021226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18744206 - 18744177
Alignment:
Q  90 caaccccggagacacaaggagggtggaata 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18744206 caaccccggagacacaaggagggtggaata 18744177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17523486 - 17523458
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523486 tcaaccccggagacacaaggagggtggaa 17523458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21865114 - 21865086
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacaaggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21865114 tcaaccccggagacacaaggagggtggaa 21865086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 33719001 - 33719117
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgc 142  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |  | ||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| |||| ||||  ||  |||| |||||||||||     
T  33719001 acgttaagaggtctcaacgatcaactagaggaaatcaactaaggaatcaaccccggagatataaggaaggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgt 33719100  T
Q  143 tcgacgaggggagaata 159  Q
    | ||||| |||| ||||    
T  33719101 tggacgatgggataata 33719117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 41363576 - 41363843
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41363576 aggttgaaggttcgatgccttggagtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 41363675  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41363676 aacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttggga 41363775  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41363776 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 41363843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Original strand, 26484495 - 26484757
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26484495 agaggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaattaactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 26484594  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26484595 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 26484694  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatt 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26484695 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatatt 26484757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15032620 - 15032323
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  15032620 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagtatggt 15032521  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15032520 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 15032421  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  15032420 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 15032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 34614871 - 34615140
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34614871 agaggttgaagtttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 34614970  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34614971 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 34615070  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34615071 gagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 34615140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41857270 - 41856973
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41857270 agaggttgaaggttcgttgccttggtgtgacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgaattcaatcaaggagtcaaccccagagacagaaggagggt 41857171  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  41857170 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatattttgg 41857071  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  41857070 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 41856973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18440591 - 18440283
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18440591 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggatgaactgactgaattcaatcaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 18440492  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18440491 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttag 18440392  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||  |  |||||||||| |||| |    
T  18440391 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcgagaagatcgtcattagg 18440292  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  18440291 tacggaatg 18440283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44943376 - 44943069
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  44943376 agaggttgaaggttcggcgccttggtgtaacgttaa-aggtctcaaggatgaattgactgaattcaaccaaggagttaaccccagagacacaaggatggt 44943278  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    | || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44943277 gtaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 44943178  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||| || |||| |    
T  44943177 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagg 44943078  T
Q  314 tagggaatg 322  Q
    || ||||||    
T  44943077 tacggaatg 44943069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33799845 - 33799550
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| |||  |||  ||||||||||||    
T  33799845 aggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaatcccatagatgcaaggagggtgg 33799746  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33799745 aatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 33799646  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  33799645 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 33799550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 43693057 - 43693324
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43693057 aggttgaaagttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgg 43693156  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43693157 aacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 43693256  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43693257 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 43693324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 42603374 - 42603680
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  42603374 aggttgaaggttcggtgccttggtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggcgg 42603473  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42603474 aacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 42603573  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| |||| |||    
T  42603574 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattaggta 42603673  T
Q  316 gggaatg 322  Q
     ||||||    
T  42603674 cggaatg 42603680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 26452243 - 26452512
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  26452243 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaattcaaccccagagacacaaggagggt 26452342  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26452343 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 26452442  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26452443 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 26452512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38034221 - 38033924
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38034221 agaggttgaaagttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaaatcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 38034122  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38034121 ggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 38034022  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| | | ||||||||| ||||    
T  38034021 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccggaagatcgtcatta 38033924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31172112 - 31171793
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31172112 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtcacattaaaaggtctcaaggatcaacttaatgaattcaactaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 31172013  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  || |||| | ||| |||  |    
T  31172012 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacatgacaaacatttttcag 31171913  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
     |||||| |||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |    
T  31171912 aagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattagg 31171813  T
Q  314 tagggaatgcaccttccaac 333  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31171812 tatggaatgcaccttccaac 31171793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42169254 - 42168959
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 115  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42169254 aggttgaaggtttgatgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaccaactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacgaggagggtgg 42169155  T
Q  116 aatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga 215  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42169154 aacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 42169055  T
Q  216 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  42169054 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 42168959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 41275312 - 41275609
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41275312 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaaagttaagaggtcttaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 41275411  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  41275412 ggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttga 41275511  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  41275512 gagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 41275609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19242458 - 19242179
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19242458 agaggttgaaggttcgttgcctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggagggt 19242359  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19242358 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 19242259  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattct 293  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  19242258 gaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattct 19242179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19315642 - 19315363
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19315642 agaggttgaaggttcgttgcctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggagggt 19315543  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19315542 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 19315443  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattct 293  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  19315442 gaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattct 19315363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Original strand, 40702278 - 40702569
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  40702278 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagagt 40702377  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40702378 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 40702477  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcg 305  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| | || |||||||    
T  40702478 gaacaaaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcg 40702569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28706438 - 28706149
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28706438 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaaaaggtcccaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggt 28706339  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28706338 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 28706239  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagat 303  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| | ||||||||    
T  28706238 gagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgccagaagat 28706149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 485554 - 485257
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  485554 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagccaaccccagagacacaaggatggt 485455  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  485454 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 485355  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  485354 gagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatta 485257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 40415175 - 40415472
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||||||    
T  40415175 agaggttgaaagttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcgctgaattcaaccaaggagtcagcaccagagacacaaggagggt 40415274  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40415275 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 40415374  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  40415375 gagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcatta 40415472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 24861261 - 24861558
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24861261 agaggttaaaggttcggtgcctggatgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 24861360  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24861361 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 24861460  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24861461 gagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgccagaagatcgtcatta 24861558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 2416833 - 2417102
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||    
T  2416833 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccagaaacacaaggagggt 2416932  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2416933 ggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 2417032  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  2417033 gagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaaca 2417102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 33 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43638953 - 43638704
Alignment:
Q  33 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43638953 ccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggactcaaccccagag-cgcaaggagggtggaatacgttcggtataaa 43638855  T
Q  133 cgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43638854 cgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagt 43638755  T
Q  233 ggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 283  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43638754 gcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaca 43638704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 16575610 - 16575851
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16575610 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggacgaactgaatgaattcaaccagggagtcaacctcgaagacacaaggagggt 16575709  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||    
T  16575710 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgggatgagcatgttttgg 16575809  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttg 255  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  16575810 gaccacaacatgttccagtgcatcgatacgcgcgtaatgttg 16575851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 40414529 - 40414825
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  40414529 agaggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaagtcgctgaattcaaccaaagagtcaacccag-agacacaaggaaggt 40414627  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40414628 ggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 40414727  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||| ||||    
T  40414728 gagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccagaagatcgtcatta 40414825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3589487 - 3589247
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | | | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3589487 tcaacctcggagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacga 3589388  T
Q  189 agaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctg 288  Q
     || ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3589387 cgataacgtgatgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttg 3589288  T
Q  289 attctgtcagaagatcgtgattaagtagggaatgcaccttc 329  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3589287 attccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttc 3589247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 22548181 - 22548380
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22548181 agaggttgaaggtttgatgccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggatgaactgactgaattcaactaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 22548280  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  22548281 ggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12504989 - 12504825
Alignment:
Q  45 gttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctc 144  Q
    ||||| ||||||||| ||| || | |||||| ||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||| ||  |    
T  12504989 gttaaaaggtctcaatgatcaactaaatgaaatcaacgaagaactcaaccccagagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaatgtccatcgtac 12504890  T
Q  145 gacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgtt 209  Q
    || || ||||||||| | || ||| |   ||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  12504889 gatgatgggagaataacgttcagtcgaccggagttaacgaacgacgacgacgtgaggagcatgtt 12504825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22843542 - 22843448
Alignment:
Q  91 aaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaa 185  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| || | ||||| ||||||||| | || |||||  |||| ||||||||    
T  22843542 aaccccgaaaacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccatcgtttgacgatgggagaataacgttcagttgattggagttaacgaa 22843448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 319
Target Start/End: Original strand, 24815 - 25119
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctaaattcaaccagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 24914  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24915 ggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 25014  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaag 313  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||  |||||||||||| |    
T  25015 gagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatatta-caagagtctgattgcgccaatagatcgtgattagg 25113  T
Q  314 taggga 319  Q
    ||||||    
T  25114 taggga 25119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 1700 - 1977
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  1700 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcagccaagaagtcaaccctagagacacaaggagggt 1799  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1800 ggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgg 1899  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatt 291  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  1900 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatt 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18191 - 17917
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||                      ||||||||||    
T  18191 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaac----------------------caaggagggt 18114  T
Q  114 ggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgg 213  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18113 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgg 18015  T
Q  214 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgatta 311  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||    
T  18014 gagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcatta 17917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 63905 - 64091
Alignment:
Q  33 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaa 132  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  63905 ccttggtgtaaggttaagaggcctcaaggatgaactgaatgaattcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggagcacgttcggtataaa 64004  T
Q  133 cgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaca 220  Q
     |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64005 tgtccaacgctcgac-aagggagagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaca 64091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 318
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64163
Alignment:
Q  253 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtgattaagtaggg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||||||| |||| ||||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtaggg 64163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 281
Target Start/End: Original strand, 36619 - 36841
Alignment:
Q  68 tgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatatgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcatttag 167  Q
    |||||||| ||||| | ||  ||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||  |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||    
T  36619 tgaatgaaatcaaccaaggtctcaacccaggagacacatggaacgtggaatacgtttggtatgaacgtcccacgtttgatgaggggagaataacattcag 36718  T
Q  168 ttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgagcatgttttggga---------gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctg 258  Q
    ||||  ||| ||||||||||| ||  | |||| ||||||||| | | |         |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||    
T  36719 ttggccggagttaacgaacgacgacgatgtgaggagcatgttctcgaatttttatcagcacatcatgttcccgtggatcgatatgcttgtcacgttgttg 36818  T
Q  259 agatcaactgaagatattatcaa 281  Q
    |||||  ||||||||||| ||||    
T  36819 agatcgcctgaagatattctcaa 36841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 316
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5561
Alignment:
Q  208 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgtcagaagatcgtg 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||   || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||| |    
T  5453 ttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgatttcgccagaagatcgag 5552  T
Q  308 attaagtag 316  Q
    |||| ||||    
T  5553 attaggtag 5561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University