View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1359_low_26 (Length: 362)

Name: NF1359_low_26
Description: NF1359
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1359_low_26
NF1359_low_26
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (106-362)||(39812022-39812278)
chr2 (123-362)||(32246596-32246839)
chr2 (132-362)||(44312658-44312887)
chr2 (128-362)||(19344237-19344472)
chr2 (128-362)||(19349095-19349330)
chr2 (134-362)||(11098973-11099196)
chr2 (134-362)||(14291316-14291539)
chr2 (134-362)||(9296447-9296670)
chr2 (30-109)||(40069060-40069139)
chr2 (199-362)||(25398386-25398546)
chr2 (199-362)||(25403524-25403684)
chr2 (312-362)||(3491751-3491801)
chr2 (311-362)||(8040059-8040111)
chr2 (312-354)||(40738844-40738886)
chr2 (311-362)||(14699053-14699105)
chr2 (311-362)||(17865202-17865254)
chr2 (311-362)||(20522219-20522271)
chr2 (313-360)||(34388859-34388907)
chr2 (311-362)||(10445490-10445542)
chr2 (315-362)||(13569331-13569379)
chr2 (311-362)||(21629943-21629994)
chr2 (311-362)||(34682380-34682432)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (118-362)||(39784856-39785102)
chr8 (105-362)||(25328312-25328569)
chr8 (134-362)||(6311121-6311348)
chr8 (134-362)||(7289960-7290188)
chr8 (134-362)||(36979205-36979428)
chr8 (129-362)||(35745208-35745442)
chr8 (149-362)||(33037852-33038063)
chr8 (134-362)||(10689189-10689412)
chr8 (149-362)||(4760121-4760332)
chr8 (149-362)||(18853214-18853425)
chr8 (134-362)||(30655469-30655697)
chr8 (129-362)||(10684298-10684533)
chr8 (134-362)||(18870608-18870828)
chr8 (312-362)||(26287902-26287952)
chr8 (312-362)||(26301159-26301209)
chr8 (312-362)||(26313153-26313203)
chr8 (312-362)||(1262000-1262050)
chr8 (311-362)||(4696642-4696694)
chr8 (311-362)||(26403276-26403328)
chr8 (333-362)||(4456050-4456079)
chr8 (314-362)||(9765865-9765914)
chr8 (311-362)||(5702529-5702581)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (106-362)||(31109617-31109872)
chr7 (128-359)||(12406149-12406379)
chr7 (128-359)||(12396729-12396959)
chr7 (128-362)||(4866547-4866781)
chr7 (106-362)||(24024360-24024618)
chr7 (129-362)||(19992130-19992364)
chr7 (128-362)||(21812272-21812507)
chr7 (134-362)||(20357593-20357816)
chr7 (134-362)||(2057786-2058016)
chr7 (129-362)||(16879889-16880124)
chr7 (129-362)||(16884745-16884980)
chr7 (129-362)||(24261357-24261592)
chr7 (129-362)||(24266236-24266471)
chr7 (134-362)||(1533490-1533709)
chr7 (199-362)||(21639701-21639859)
chr7 (289-362)||(18408742-18408814)
chr7 (199-362)||(21645899-21646057)
chr7 (289-362)||(18413619-18413690)
chr7 (311-362)||(2580389-2580441)
chr7 (311-362)||(2647742-2647794)
chr7 (311-362)||(20284088-20284140)
chr7 (313-362)||(21983285-21983335)
chr7 (311-362)||(9190054-9190106)
chr7 (311-362)||(29159802-29159854)
chr7 (311-362)||(33332496-33332548)
chr7 (311-362)||(46516356-46516408)
chr7 (311-362)||(49091660-49091712)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (106-362)||(28184297-28184556)
chr6 (105-362)||(14737610-14737867)
chr6 (106-362)||(14742470-14742725)
chr6 (132-362)||(22010731-22010960)
chr6 (123-362)||(6438313-6438552)
chr6 (128-362)||(11856789-11857025)
chr6 (106-362)||(28155603-28155861)
chr6 (129-362)||(6005234-6005468)
chr6 (129-362)||(16838561-16838795)
chr6 (129-362)||(33330479-33330715)
chr6 (129-357)||(5343297-5343527)
chr6 (129-362)||(33335976-33336212)
chr6 (134-362)||(5674816-5675036)
chr6 (134-256)||(30125944-30126063)
chr6 (311-362)||(10077211-10077263)
chr6 (311-362)||(5572287-5572339)
chr6 (312-362)||(5757524-5757575)
chr6 (311-362)||(18232844-18232896)
chr6 (311-362)||(31086519-31086571)
chr6 (311-362)||(31979512-31979564)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (106-362)||(22173229-22173484)
chr3 (105-362)||(18656227-18656486)
chr3 (134-362)||(7167072-7167295)
chr3 (134-362)||(2671632-2671855)
chr3 (128-362)||(2677121-2677357)
chr3 (128-362)||(2672965-2673201)
chr3 (129-362)||(8512032-8512268)
chr3 (129-362)||(8516912-8517148)
chr3 (134-362)||(28503910-28504124)
chr3 (129-360)||(10207750-10207983)
chr3 (134-362)||(8739109-8739333)
chr3 (134-362)||(9091347-9091571)
chr3 (160-360)||(24967957-24968156)
chr3 (129-362)||(32475301-32475536)
chr3 (129-362)||(32480158-32480394)
chr3 (134-362)||(8477193-8477413)
chr3 (294-362)||(40372841-40372908)
chr3 (289-362)||(26928637-26928709)
chr3 (312-362)||(1305949-1305999)
chr3 (311-362)||(1417526-1417578)
chr3 (311-362)||(18552919-18552971)
chr3 (311-362)||(21711222-21711274)
chr3 (312-362)||(8370522-8370573)
chr3 (312-362)||(27974988-27975039)
chr3 (312-362)||(27986482-27986533)
chr3 (312-362)||(30709826-30709877)
chr3 (134-222)||(40372980-40373064)
chr3 (315-362)||(1736341-1736389)
chr3 (311-362)||(47923942-47923994)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (123-362)||(45347851-45348090)
chr4 (123-362)||(45357330-45357569)
chr4 (128-362)||(9224441-9224674)
chr4 (128-362)||(9229228-9229461)
chr4 (105-362)||(5732457-5732716)
chr4 (129-362)||(18855544-18855778)
chr4 (134-362)||(51520280-51520508)
chr4 (133-362)||(56146745-56146974)
chr4 (123-362)||(3813835-3814075)
chr4 (134-362)||(29760470-29760692)
chr4 (134-362)||(24741769-24741991)
chr4 (312-362)||(28468575-28468625)
chr4 (311-362)||(10047378-10047430)
chr4 (311-362)||(39245993-39246045)
chr4 (309-362)||(5269237-5269291)
chr4 (311-360)||(42599622-42599672)
chr4 (311-362)||(36315275-36315327)
chr4 (311-362)||(36329484-36329536)
chr4 (311-362)||(38152485-38152537)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (128-362)||(35096-35329)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (105-362)||(15044483-15044737)
chr5 (134-362)||(43592102-43592330)
chr5 (134-362)||(43598547-43598775)
chr5 (134-362)||(43604039-43604267)
chr5 (134-362)||(43609531-43609759)
chr5 (134-362)||(27444793-27445021)
chr5 (134-362)||(27449637-27449865)
chr5 (128-362)||(28807606-28807843)
chr5 (134-362)||(1457196-1457423)
chr5 (127-362)||(37561478-37561716)
chr5 (127-362)||(37556656-37556894)
chr5 (134-362)||(30631231-30631457)
chr5 (129-362)||(2785192-2785426)
chr5 (129-362)||(31397027-31397261)
chr5 (129-362)||(31401884-31402118)
chr5 (129-362)||(33791133-33791367)
chr5 (129-362)||(33767996-33768230)
chr5 (234-362)||(31180138-31180265)
chr5 (199-362)||(24135740-24135899)
chr5 (199-362)||(38192064-38192224)
chr5 (199-362)||(38219289-38219449)
chr5 (199-362)||(35387555-35387713)
chr5 (311-362)||(17004006-17004058)
chr5 (312-362)||(9353378-9353429)
chr5 (312-362)||(36932396-36932447)
chr5 (311-362)||(28832258-28832310)
chr5 (311-362)||(42127456-42127508)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (105-362)||(44023907-44024164)
chr1 (105-362)||(39445291-39445551)
chr1 (123-362)||(25445123-25445363)
chr1 (129-362)||(1055045-1055279)
chr1 (105-362)||(41398031-41398287)
chr1 (106-208)||(41386543-41386646)
chr1 (149-362)||(24787410-24787624)
chr1 (129-362)||(43988498-43988734)
chr1 (199-362)||(24202815-24202973)
chr1 (210-362)||(41390485-41390632)
chr1 (311-360)||(775671-775721)
chr1 (312-362)||(19358889-19358939)
chr1 (312-362)||(19361478-19361528)
chr1 (312-362)||(19380118-19380168)
chr1 (311-362)||(13598397-13598449)
chr1 (311-362)||(47703982-47704034)
chr1 (312-362)||(19072928-19072979)
chr1 (312-362)||(19120818-19120869)
chr1 (312-362)||(26644943-26644994)
chr1 (312-362)||(37069770-37069821)
chr1 (311-362)||(9476260-9476312)
chr1 (311-362)||(16124562-16124614)
chr1 (311-362)||(29651810-29651862)
chr1 (311-362)||(47098870-47098922)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (106-362)||(9676-9930)
scaffold0355 (111-254)||(28-166)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (105-362)||(154-414)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (129-362)||(19199-19433)
scaffold0197 (129-362)||(14343-14578)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (129-360)||(148992-149224)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (129-360)||(2287-2519)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (106-208)||(34136-34239)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (129-362)||(181998-182233)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (134-344)||(300-506)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (105-195)||(13140-13233)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (199-362)||(17998-18157)
scaffold0188 (312-362)||(24091-24141)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (313-361)||(85684-85733)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (311-362)||(5682-5734)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (312-362)||(8465-8516)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39812278 - 39812022
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812278 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 39812179  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812178 aagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 39812079  T
Q  305 accgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812078 accg-agaagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 39812022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 123 - 362
Target Start/End: Original strand, 32246596 - 32246839
Alignment:
Q  123 caaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaa 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32246596 caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaa 32246695  T
Q  222 acaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagc---ggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattg 318  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32246696 acagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattg 32246795  T
Q  319 ttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246796 ttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 32246839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44312887 - 44312658
Alignment:
Q  132 cttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||     
T  44312887 cttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctag 44312788  T
Q  232 gctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattc 330  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  44312787 acaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttc 44312690  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312689 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 44312658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Original strand, 19344237 - 19344472
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  19344237 aaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 19344335  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19344336 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttga 19344432  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19344433 cccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagca 19344472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Original strand, 19349095 - 19349330
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  19349095 aaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 19349193  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19349194 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttga 19349290  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19349291 cccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagca 19349330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11099196 - 11098973
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||      
T  11099196 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctaga 11099101  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11099100 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag-gaagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 11099004  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11099003 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 11098973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 14291316 - 14291539
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacaaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||      
T  14291316 tcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctaga 14291411  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  14291412 ctaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 14291508  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291509 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 14291539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9296670 - 9296447
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||      
T  9296670 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagt 9296575  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  9296574 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 9296478  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9296477 gccaatatggcctaatttgggggagagagca 9296447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40069139 - 40069060
Alignment:
Q  30 agaagattatgagcaatctattaggatacaaagaaatatgcttattatttctatatgatcattcttgtaatgaacttgtt 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40069139 agaagattatgagcaatctatcaggatacaaagaaatatgcttattatttctatatgatcattcttgtaatgaacttgtt 40069060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 25398386 - 25398546
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  25398386 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 25398481  T
Q  298 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25398482 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagca 25398546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 25403524 - 25403684
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  25403524 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 25403619  T
Q  298 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25403620 acaaacacaccaaa-aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagca 25403684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491801
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 3491801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040111
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagca 8040111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 354
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738886
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctggggg 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg 40738886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14699053
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 14699053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865254
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagca 17865254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522271
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 20522271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 360
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388907
Alignment:
Q  313 agattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagag 360  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 34388907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445490
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 10445490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 362
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569379
Alignment:
Q  315 attgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 13569379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21629994
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatct-ggggagagagca 21629994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682380
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagca 34682380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 118 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39785102 - 39784856
Alignment:
Q  118 ggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaaca 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39785102 ggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataaca 39785003  T
Q  217 acaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaaga 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39785002 acaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaaga 39784903  T
Q  316 ttgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784902 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 39784856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25328569 - 25328312
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctc 203  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328569 ttgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctc 25328470  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaaa 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25328469 caagccaacaacaacaaaacaaccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaa 25328371  T
Q  303 acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328370 acaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 25328312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311348
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||  |    
T  6311121 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 6311220  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  6311221 tagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 6311318  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311319 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 6311348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7290188 - 7289960
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||  |    
T  7290188 tcacaccaatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctagac 7290089  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  7290088 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 7289990  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289989 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 7289960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 36979205 - 36979428
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacaaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||      
T  36979205 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaag-caacaacaacaaaaacagccctaga 36979300  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  36979301 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 36979397  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979398 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 36979428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 35745208 - 35745442
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  35745208 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 35745306  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35745307 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttga 35745402  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35745403 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 35745442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33038063 - 33037852
Alignment:
Q  149 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaa--aacaaccctaagctagtgtatagcaa 246  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||||| |||||    
T  33038063 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaa 33037966  T
Q  247 aaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggccta 345  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33037965 aaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggccta 33037869  T
Q  346 atctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||    
T  33037868 atctgggggagagagca 33037852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10689412 - 10689189
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||      
T  10689412 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacaaccctagt 10689317  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaa--aagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaatt 329  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  10689316 gtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag---taagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagtt 10689222  T
Q  330 cagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689221 cagccaatatggcctaatctgggggagagagca 10689189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4760332 - 4760121
Alignment:
Q  149 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacaaccctaagctagtgtatagcaaa 247  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  4760332 aaacaaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaag-caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaa 4760235  T
Q  248 accacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaa 346  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4760234 accacacaaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacatc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaa 4760137  T
Q  347 tctgggggagagagca 362  Q
    | ||||||||||||||    
T  4760136 tatgggggagagagca 4760121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18853425 - 18853214
Alignment:
Q  149 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaa-ccctaagctagtgtatagcaaa 247  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||| |  |||||  || || || ||||||    
T  18853425 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaa 18853327  T
Q  248 accacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaa 346  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18853326 accacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaa 18853230  T
Q  347 tctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||    
T  18853229 tctgggggagagagca 18853214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 30655469 - 30655697
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc--caacaacaacaaaacaaccctaa 231  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||     
T  30655469 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaacaacaacaa-aaaacagccctag 30655563  T
Q  232 gctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcacaaacaagataagcggtaa---aagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaa 327  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||   ||   |||||  || |||||||| || |||||||||||||||     
T  30655564 actagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacacc-aagaagattgttgacccag 30655662  T
Q  328 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655663 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 30655697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10684533 - 10684298
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  10684533 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 10684434  T
Q  226 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  10684433 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 10684339  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10684338 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 10684298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18870828 - 18870608
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||  |    
T  18870828 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaacaacaa-aaaacg-ccctagac 18870735  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    | || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||     
T  18870734 ttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcat 18870638  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870637 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 18870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287952
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 26287952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301209
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 26301209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313203
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 26313203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1262000
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagca 1262000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696642
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattc-agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagca 4696642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403276
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 26403276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 362
Target Start/End: Original strand, 4456050 - 4456079
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456050 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 4456079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765865
Alignment:
Q  314 gattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 9765865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702529
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagca 5702529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31109872 - 31109617
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 205  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109872 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 31109773  T
Q  206 agccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaaca 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||| ||||||||||||    
T  31109772 agccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaaca 31109674  T
Q  306 ccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31109673 ccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagca 31109617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 359
Target Start/End: Original strand, 12406149 - 12406379
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  12406149 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcc 12406248  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 326  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12406249 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgaccca 12406346  T
Q  327 attcagccaatatggcctaatctgggggagaga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406347 gttcagccaatatggcctaatctgggggagaga 12406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 128 - 359
Target Start/End: Original strand, 12396729 - 12396959
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  12396729 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcc 12396828  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 326  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12396829 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgaccca 12396926  T
Q  327 attcagccaatatggcctaatctgggggagaga 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396927 gttcagccaatatggcctaatctgggggagaga 12396959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Original strand, 4866547 - 4866781
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  4866547 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtc 4866646  T
Q  228 ctaagctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccc 325  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4866647 ctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgaccc 4866744  T
Q  326 aattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866745 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 4866781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24024618 - 24024360
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaa-ccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24024618 tgttgtgaatccggttccaaagaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 24024519  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacaaccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaac-aa 301  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |  | ||||| |||||||||||||   ||||| |||||| ||    
T  24024518 aagcaaacaacaacaaaac-agcctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaa 24024421  T
Q  302 aacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024420 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 24024360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 19992130 - 19992364
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| ||    
T  19992130 aaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaac-aaacagcc 19992228  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19992229 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 19992327  T
Q  326 aattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992328 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 19992364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21812507 - 21812272
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  21812507 aaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaac-aaacagc 21812409  T
Q  227 cctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacc 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21812408 cctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagag-ttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacc 21812310  T
Q  325 caattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21812309 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 21812272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20357816 - 20357593
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||      
T  20357816 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctaga 20357721  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  20357720 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaatacc-aagaagattgttgacccagttca 20357624  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357623 gccaatatggcctaatttgggggagagagca 20357593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 2057786 - 2058016
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||      
T  2057786 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctaga 2057882  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaa----caagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaa 327  Q
    || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  2057883 cttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccag 2057981  T
Q  328 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057982 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 2058016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 16879889 - 16880124
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  16879889 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 16879988  T
Q  226 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  16879989 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 16880083  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16880084 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 16880124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 16884745 - 16884980
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  16884745 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 16884844  T
Q  226 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  16884845 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 16884939  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16884940 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 16884980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24261592 - 24261357
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  24261592 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 24261493  T
Q  226 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  24261492 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 24261398  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24261397 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 24261357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24266471 - 24266236
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  24266471 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 24266372  T
Q  226 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  24266371 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 24266277  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24266276 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 24266236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1533709 - 1533490
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||| || ||| |      
T  1533709 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaag-caacaacaacaaaaccagccccagt 1533616  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||  ||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  1533615 ctagtgtagagcaacaccaca-aagagaatacaaag--caaacaatataagc-aagaaagaaagaacaaacacacc-aataagattgttgacccagttca 1533521  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533520 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 1533490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 21639701 - 21639859
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  21639701 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 21639794  T
Q  298 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639795 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 21639859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 362
Target Start/End: Original strand, 18408742 - 18408814
Alignment:
Q  289 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408742 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 18408814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 21645899 - 21646057
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||   ||| ||| ||    
T  21645899 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaa--acaaacaagataagcaagaaaggaa-ga 21645992  T
Q  298 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21645993 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagca 21646057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 362
Target Start/End: Original strand, 18413619 - 18413690
Alignment:
Q  289 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18413619 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagca 18413690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580441
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagca 2580441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647742
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagca 2647742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284140
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 20284140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 362
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983335
Alignment:
Q  313 agattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 21983335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190054
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagca 9190054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159854
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagca 29159854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332496
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattc-agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagca 33332496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516356
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagca 46516356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091712
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagca 49091712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Original strand, 28184297 - 28184556
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaa--tggtct 202  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28184297 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtct 28184396  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaagaacaa 301  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28184397 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaa 28184496  T
Q  302 aacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184497 aacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 28184556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14737867 - 14737610
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737867 ttgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 14737768  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac--aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 302  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737767 aagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 14737669  T
Q  303 acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737668 acaccg-agaagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 14737610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14742725 - 14742470
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 205  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742725 tgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 14742626  T
Q  206 agccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 304  Q
    |||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742625 agcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 14742527  T
Q  305 accgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14742526 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagca 14742470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22010960 - 22010731
Alignment:
Q  132 cttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||     
T  22010960 cttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctag 22010861  T
Q  232 gctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattc 330  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  22010860 acaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttc 22010763  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010762 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 22010731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 123 - 362
Target Start/End: Original strand, 6438313 - 6438552
Alignment:
Q  123 caaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  6438313 caaacgaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaac-aaa 6438411  T
Q  223 caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgtt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6438412 cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgtt 6438510  T
Q  321 gacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438511 gtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 6438552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Original strand, 11856789 - 11857025
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11856789 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc 11856888  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaac---aaaacaccgaacaagattgttgac 323  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||   |||||||| || ||||||||||||    
T  11856889 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacacc-aagaagattgttgac 11856986  T
Q  324 ccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11856987 ccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagca 11857025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28155861 - 28155603
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaa-ccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28155861 tgttgtgaatccggttctaaacaaaaccttcacaccaatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttc 28155762  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacaaccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaa 301  Q
    |||| ||||||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  28155761 aagctaacaacaacaaaacagcc-tatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaa 28155664  T
Q  302 aacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28155663 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 28155603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 6005234 - 6005468
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  6005234 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 6005332  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6005333 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttga 6005428  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6005429 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 6005468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 16838561 - 16838795
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| |     
T  16838561 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaac-ag 16838659  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16838660 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttga 16838755  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16838756 cccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagca 16838795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33330715 - 33330479
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  33330715 aaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 33330617  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |  | |||||  |||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  33330616 cctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaac-aagca-taacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttg 33330520  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33330519 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 33330479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 357
Target Start/End: Original strand, 5343297 - 5343527
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  5343297 aaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 5343395  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    |||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  5343396 cctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttg 5343491  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggaga 357  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343492 acccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33336212 - 33335976
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||| |     
T  33336212 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaac-ag 33336114  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatag-caaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    |||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| |  | |||||  |||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  33336113 cctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaac-aagca-taacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttg 33336017  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33336016 acccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagca 33335976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5675036 - 5674816
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaa-ccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| | |||  || ||| |  ||||||||||||||| | |||||      
T  5675036 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa--gtttcccaagcaacaacaacaaaaccagccctagt 5674942  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||  ||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||    
T  5674941 ctagtgtagagcaacaccaca-aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacacaccaaaga-gattgttgacccagttca 5674847  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674846 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 5674816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30126063 - 30125944
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacaaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||      
T  30126063 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgag-ccaaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctaga 30125968  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacacaa 256  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  30125967 ctagtgtagagcaaaaccacacaa 30125944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077211
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 10077211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572287
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagca 5572287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757524
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 5757524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 18232844 - 18232896
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18232844 caagattgttgactcaaatcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 18232896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086519
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagca 31086519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979564
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagca 31979564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22173484 - 22173229
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 205  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22173484 tgttgtgaatccggtttcaaacaaatcttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 22173385  T
Q  206 agccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 304  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22173384 agcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaac 22173286  T
Q  305 accgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173285 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 22173229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Original strand, 18656227 - 18656486
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18656227 ttgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 18656325  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaac---- 299  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||        
T  18656326 aagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaag--caaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaa 18656423  T
Q  300 aaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656424 aaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 18656486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 7167072 - 7167295
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |    
T  7167072 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagac 7167167  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  7167168 tagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 7167265  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167266 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 7167295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2671855 - 2671632
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacaaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||      
T  2671855 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagt 2671760  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  2671759 ctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 2671663  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671662 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 2671632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2677357 - 2677121
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaa 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  2677357 aaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-a 2677259  T
Q  226 ccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||  |||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  2677258 gcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagca-taacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttg 2677162  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2677161 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 2677121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2673201 - 2672965
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaa 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  2673201 aaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-a 2673103  T
Q  226 ccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||  |||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  2673102 gcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagca-taacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttg 2673006  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2673005 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 2672965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 8512032 - 8512268
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |     
T  8512032 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaac-ag 8512130  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagat-aagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    |||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  |||    || ||||||| || || |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8512131 cctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa---gcatacaagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 8512227  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8512228 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 8512268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 8516912 - 8517148
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |     
T  8516912 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaac-ag 8517010  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagat-aagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    |||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  |||    || ||||||| || || |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8517011 cctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa---gcatacaagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 8517107  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8517108 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 8517148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28504124 - 28503910
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  28504124 tcacaccaatgaat--aacaatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgac 28504029  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||          |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  28504028 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag----------aaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 28503940  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28503939 ccaatatggcctaatctggggaagagagca 28503910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 360
Target Start/End: Original strand, 10207750 - 10207983
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  10207750 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 10207848  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||  |||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  10207849 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagca-taacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttga 10207945  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagag 360  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207946 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8739333 - 8739109
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |  |||||      
T  8739333 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctaga 8739238  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaa-ccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattc 330  Q
    || || || | ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  8739237 cttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttc 8739141  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739140 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 8739109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9091571 - 9091347
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |  |||||      
T  9091571 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctaga 9091476  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaa-ccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattc 330  Q
    || || || | ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  9091475 cttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttc 9091379  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091378 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 9091347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 360
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968156
Alignment:
Q  160 tgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aag 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaag 24968055  T
Q  258 agattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctggggga 355  Q
    || |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||    
T  24968056 agctaacaa---gcatacaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttgggga 24968151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 32475301 - 32475536
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||     
T  32475301 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacag 32475400  T
Q  226 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  32475401 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 32475495  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32475496 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 32475536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 32480158 - 32480394
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa--caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaaca 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  32480158 aaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaaca 32480257  T
Q  225 accctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgtt 320  Q
     || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  32480258 gcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgtt 32480352  T
Q  321 gacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32480353 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 32480394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 8477193 - 8477413
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaa-ccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| | |||  || ||| |  ||||||||||||||| | |||||      
T  8477193 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa--gtttcccaagcaacaacaacaaaaccagccctaga 8477287  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||| | | |||||||  ||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  8477288 ctagtgtagaacaacaccaca-aagataatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacacacc-aagaagattgttgacccagttca 8477382  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477383 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 8477413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372841
Alignment:
Q  294 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 40372841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26928709 - 26928637
Alignment:
Q  289 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26928709 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagca 26928637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1305999
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagca 1305999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417526
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 1417526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552919
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 18552919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711274
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 21711274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370522
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 8370522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974988
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 27974988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986482
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 27986482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709826
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 30709826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40373064 - 40372980
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa 222  Q
    ||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  40373064 tcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacatcaaaa 40372980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736341
Alignment:
Q  315 attgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 1736341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923942
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattc-agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagca 47923942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 123 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45348090 - 45347851
Alignment:
Q  123 caaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45348090 caaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaa 45347991  T
Q  223 caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    ||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45347990 cagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccg-agaagattgttg 45347892  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45347891 acccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagca 45347851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 123 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45357569 - 45357330
Alignment:
Q  123 caaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45357569 caaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaa 45357470  T
Q  223 caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    ||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45357469 cagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccg-agaagattgttg 45357371  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45357370 acccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagca 45357330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9224674 - 9224441
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9224674 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc 9224575  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 326  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9224574 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgaccca 9224477  T
Q  327 attcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224476 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 9224441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9229461 - 9229228
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9229461 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc 9229362  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 326  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9229361 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttaaccca 9229264  T
Q  327 attcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229263 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 9229228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Original strand, 5732457 - 5732716
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5732457 ttgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 5732555  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaac---- 299  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||        
T  5732556 aagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaag--caaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaa 5732653  T
Q  300 aaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732654 aaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 5732716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 18855544 - 18855778
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  18855544 aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagcc 18855642  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18855643 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 18855741  T
Q  326 aattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855742 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 18855778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 51520280 - 51520508
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  |    
T  51520280 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 51520379  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |    
T  51520380 tagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttctg 51520478  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520479 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 51520508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 133 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 56146974 - 56146745
Alignment:
Q  133 ttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||      
T  56146974 ttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 56146875  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||    
T  56146874 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttggtccagttca 56146776  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146775 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 56146745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 123 - 362
Target Start/End: Original strand, 3813835 - 3814075
Alignment:
Q  123 caaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaa 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3813835 caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaa 3813934  T
Q  222 acaaccctaagctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgt 319  Q
    |||  ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||| |  | ||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  3813935 acagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattgt 3814032  T
Q  320 tgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814033 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 3814075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 29760470 - 29760692
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  29760470 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacaaccctagac 29760565  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  29760566 tagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 29760662  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760663 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 29760692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 24741769 - 24741991
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacaaccctaag 232  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||      
T  24741769 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaag-caacaacaacaaaaacagccctaga 24741863  T
Q  233 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattca 331  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  24741864 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 24741960  T
Q  332 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741961 gccaatatggcctaatctgggggagagagca 24741991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468575
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagca 28468575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047430
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 10047430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246045
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 39246045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5269291 - 5269237
Alignment:
Q  309 aacaagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5269291 aacaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 5269237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42599672 - 42599622
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagag 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  42599672 caagattgttgacccaattcagtccaatatgacataatatgggggagagag 42599622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315275
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 36315275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329484
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 36329484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152485
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagca 38152485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35329 - 35096
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35329 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc 35230  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 326  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  35229 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttaaccca 35132  T
Q  327 attcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35131 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 35096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Original strand, 15044483 - 15044737
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15044483 ttgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaata--caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 15044580  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 304  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  15044581 aaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaac 15044680  T
Q  305 accgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15044681 acc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagca 15044737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 43592102 - 43592330
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  |    
T  43592102 tcacatcaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 43592201  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  43592202 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 43592300  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592301 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 43592330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 43598547 - 43598775
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||  |    
T  43598547 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 43598646  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||    
T  43598647 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttggtccagttcag 43598745  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598746 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 43598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 43604039 - 43604267
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||  |    
T  43604039 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 43604138  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||    
T  43604139 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttggtccagttcag 43604237  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604238 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 43604267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 43609531 - 43609759
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||  |    
T  43609531 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 43609630  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||    
T  43609631 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttggtccagttcag 43609729  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609730 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 43609759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 27444793 - 27445021
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||  |    
T  27444793 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagac 27444892  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  27444893 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 27444991  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27444992 gcaatatagcctaatctgggggagagagca 27445021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 27449637 - 27449865
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||  |    
T  27449637 tcacaccaatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagac 27449736  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  27449737 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 27449835  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27449836 ccaatatagcctaatctgggggagagagca 27449865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28807843 - 28807606
Alignment:
Q  128 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  28807843 aaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagc 28807745  T
Q  227 cctaagctagtgtatagc--aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28807744 cctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttga 28807646  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28807645 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 28807606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1457423 - 1457196
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  |    
T  1457423 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 1457324  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||     |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  1457323 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataag-aaagaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 1457226  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1457225 ccaatgtggcctaatctgggggagagagca 1457196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37561716 - 37561478
Alignment:
Q  127 caaaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaaca 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37561716 caaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 37561617  T
Q  225 accctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
     || || | || ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37561616 gcc-tatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 37561519  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37561518 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 37561478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37556894 - 37556656
Alignment:
Q  127 caaaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaaca 224  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37556894 caaatcttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 37556795  T
Q  225 accctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
     || || | || ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37556794 gcc-tatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 37556697  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37556696 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 37556656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 30631231 - 30631457
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagc 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||  |    
T  30631231 tcacacaaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaag-caacaacaacaaaacagccctagac 30631329  T
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcacaaacaagataagcggta--aaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattc 330  Q
    ||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||||| |||||||||||   |||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||| || |||    
T  30631330 tagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataa---gtaagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgactcagttc 30631425  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30631426 agccaatgtggcctaatctgggggagagagca 30631457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 2785192 - 2785426
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  2785192 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 2785290  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2785291 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttga 2785386  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2785387 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 2785426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31397261 - 31397027
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  31397261 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-at 31397163  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgac 323  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  31397162 cctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgac 31397066  T
Q  324 ccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31397065 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 31397027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31402118 - 31401884
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  31402118 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 31402020  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31402019 cctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttga 31401924  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31401923 cccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagca 31401884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 33791133 - 33791367
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  33791133 aaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 33791231  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33791232 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttga 33791327  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33791328 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagca 33791367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Original strand, 33767996 - 33768230
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||| |     
T  33767996 aaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaac-ag 33768094  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |  |||    || ||| ||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33768095 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa---gcatacaggataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttga 33768190  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33768191 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagca 33768230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 362
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180265
Alignment:
Q  234 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 31180235  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180236 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 31180265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 24135740 - 24135899
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||  ||| | | |||||||  ||||||||||||   ||||| |||||    
T  24135740 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agataatacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaa 24135835  T
Q  299 caaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135836 caaacacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 24135899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 38192064 - 38192224
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  38192064 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 38192159  T
Q  298 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192160 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 38192224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 38219289 - 38219449
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  38219289 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 38219384  T
Q  298 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219385 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 38219449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 35387555 - 35387713
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||| | |||||||  ||| ||||||||   ||| ||| ||    
T  35387555 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacaaccctagtctagtgtagagcaactccaca--agagaatacaaagca--aacgagataagcaagaaaggaa-ga 35387648  T
Q  298 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387649 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 35387713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17004006
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 17004006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353378
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 9353378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932396
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 36932396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832310
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 28832310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127456
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattc-agccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagca 42127456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44024164 - 44023907
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctc 203  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  44024164 ttgttgtgaatccgattccaaataaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttc 44024065  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 302  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  44024064 caagcaaacaacaac-aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaa 44023967  T
Q  303 acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023966 acaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 44023907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Original strand, 39445291 - 39445551
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttc--caaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtc 201  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  39445291 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggct 39445390  T
Q  202 tccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaac 299  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39445391 tccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaac 39445488  T
Q  300 aaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445489 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 39445551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 123 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25445363 - 25445123
Alignment:
Q  123 caaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaa 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  25445363 caaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aa 25445265  T
Q  222 acaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgt 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25445264 acagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgt 25445166  T
Q  320 tgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445165 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 25445123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1055279 - 1055045
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||  |||||||| ||||| ||    
T  1055279 aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaac-aaacagcc 1055181  T
Q  228 ctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1055180 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 1055082  T
Q  326 aattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055081 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 1055045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Original strand, 41398031 - 41398287
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctc 203  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41398031 ttgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctc 41398130  T
Q  204 caagc---caacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagc--aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 297  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||      ||| ||||    
T  41398131 caagcaaacaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag------aaggaaga 41398223  T
Q  298 acaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398224 acaaaacaccg-agaagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 41398287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Original strand, 41386543 - 41386646
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386543 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 41386642  T
Q  205 aagc 208  Q
    ||||    
T  41386643 aagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24787624 - 24787410
Alignment:
Q  149 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc--caacaacaacaaaa--caaccctaagctagtgtatagc 244  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||  || |||||  ||  |||| |||    
T  24787624 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagc 24787526  T
Q  245 aaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcc 343  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24787525 aaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcc 24787429  T
Q  344 taatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  24787428 taatctgggggggagagca 24787410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43988734 - 43988498
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |     
T  43988734 aaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaac-ag 43988636  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagat--aagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||  || |   ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||     
T  43988635 cctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttt 43988539  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43988538 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 43988498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24202973 - 24202815
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| |||    
T  24202973 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-gaa 24202879  T
Q  299 caaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202878 caaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 24202815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 362
Target Start/End: Original strand, 41390485 - 41390632
Alignment:
Q  210 aacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacac 306  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||      ||| ||||||||||||     
T  41390485 aacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaacat 41390577  T
Q  307 cgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390578 cgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 41390632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 360
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775721
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagag 360  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 775721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358889
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagca 19358889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361478
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagca 19361478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19380118
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagca 19380118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598449
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 13598449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703982
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 47703982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19072979
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 19072979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120869
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 19120869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644943
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 26644943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069821
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 37069821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476312
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagca 9476312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124562
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 16124562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651862
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 29651862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098870
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagca 47098870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9676
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9930 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctcc 9831  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 304  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  9830 aaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaac 9733  T
Q  305 accgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9732 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 9676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 166 - 28
Alignment:
Q  111 tgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcc 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||      
T  166 tgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagta 73  T
Q  210 aacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  72 aacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 105 - 362
Target Start/End: Original strand, 154 - 414
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttc--caaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtc 201  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  154 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggct 253  T
Q  202 tccaagccaacaacaacaaaacaaccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaac 299  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  254 tccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaac 351  T
Q  300 aaaacaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  352 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19433 - 19199
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  19433 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 19335  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19334 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttga 19239  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19238 cccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagca 19199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14578 - 14343
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  14578 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 14479  T
Q  226 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  14478 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 14384  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14383 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 14343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 149224 - 148992
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  149224 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 149126  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  149125 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttga 149030  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagag 360  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  149029 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 148992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2519 - 2287
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  2519 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaac-ag 2421  T
Q  227 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2420 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttga 2325  T
Q  323 cccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagag 360  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2324 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34239 - 34136
Alignment:
Q  106 tgttttgaattcggttccaaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 204  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34239 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 34140  T
Q  205 aagc 208  Q
    ||||    
T  34139 aagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 182233 - 181998
Alignment:
Q  129 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  182233 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 182134  T
Q  226 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 321  Q
    || ||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  182133 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 182039  T
Q  322 acccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  182038 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagca 181998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 506 - 300
Alignment:
Q  134 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc--caacaacaacaaaacaaccctaa 231  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  506 tcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaacaacaacaa-aaaacagccctaa 411  T
Q  232 gctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggta-aaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccaatt 329  Q
     ||||||   ||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||    
T  410 actagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagc--tagaaagaaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacctagtt 315  T
Q  330 cagccaatatggcct 344  Q
    |||||||||||||||    
T  314 cagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 13140 - 13233
Alignment:
Q  105 ttgttttgaattcggttc--caaacaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 195  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13140 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18157 - 17998
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa--caaccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaag 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| |    
T  18157 gtctccaagc-aacaacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-g 18064  T
Q  297 aacaaa-acaccgaacaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18063 aacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 17998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 24091
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 24091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 361
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85733
Alignment:
Q  313 agattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagc 361  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagc 85733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5734
Alignment:
Q  311 caagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 5734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8465
Alignment:
Q  312 aagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 362  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 8465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University