View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13603_low_7 (Length: 255)

Name: NF13603_low_7
Description: NF13603
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13603_low_7
NF13603_low_7
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (16-243)||(26178692-26178919)
chr7 (16-247)||(26082339-26082570)
chr7 (16-247)||(26106126-26106357)
chr7 (25-243)||(26301429-26301647)
chr7 (16-243)||(19103858-19104085)
chr7 (57-243)||(26203544-26203730)
chr7 (57-243)||(26223182-26223368)
chr7 (16-243)||(26154812-26155039)
chr7 (37-243)||(26128197-26128403)
chr7 (25-243)||(26190883-26191101)
chr7 (16-240)||(26297054-26297278)
chr7 (25-243)||(26250463-26250681)
chr7 (16-242)||(26242006-26242232)
chr7 (57-164)||(26207085-26207192)
chr7 (27-109)||(26186290-26186372)
chr7 (55-164)||(26259547-26259656)
chr7 (16-143)||(26184881-26185008)
chr7 (72-164)||(26226635-26226727)
chr7 (151-243)||(26240031-26240123)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (16-245)||(44902850-44903079)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 26178692 - 26178919
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26178692 acaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgttgtttttcttccatttccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 26178791  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26178792 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcgctacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 26178891  T
Q  216 caaatctcaacttattcagttcccttca 243  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  26178892 caaaactcatcttatacagttcccttca 26178919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Original strand, 26082339 - 26082570
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26082339 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttgttccatatccaactcctggccatatgaatccaatgatagccacagcaagactat 26082438  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26082439 ttgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacatttcaaaaagccattgacagtgacttcaattcaggatactccat 26082538  T
Q  216 caaatctcaacttattcagttcccttcatctc 247  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  26082539 caaaactcagcttattcagttcccgtcatctc 26082570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Original strand, 26106126 - 26106357
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26106126 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttgttccatatccaactcctggccatatgaatccaatgatagccacagcaagactat 26106225  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26106226 ttgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacatttcaaaaagccattgacagtgacttcaattcaggatactccat 26106325  T
Q  216 caaatctcaacttattcagttcccttcatctc 247  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  26106326 caaaactcagcttattcagttcccgtcatctc 26106357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 26301429 - 26301647
Alignment:
Q  25 tctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgc 124  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  26301429 tctcaacaatccaataaccaacttcatgtaatttttcttccatttccaactcctggtcatatgaatcctatgatagacacagcaagactatttgccaaac 26301528  T
Q  125 atggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaatctca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||| ||||    
T  26301529 atggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacgatgacttcaattcaggataccctattaaaactca 26301628  T
Q  225 acttattcagttcccttca 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26301629 acttattcagttcccttca 26301647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19104085 - 19103858
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19104085 acaatggaatctcaacaatcccataaccaacttcatgtaacttttcttccatatccaactccaggccatatgattcctatgatagacacagcaagactat 19103986  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 215  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19103985 ttgccaaacatggtgttaatgttacaatcattgctactcatgccaatgcttccacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggatactccat 19103886  T
Q  216 caaatctcaacttattcagttcccttca 243  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  19103885 caaaactcaacttattcccttcccttca 19103858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 243
Target Start/End: Original strand, 26203544 - 26203730
Alignment:
Q  57 ttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacat 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203544 ttttcttccatttccaactcctggccatatgattcctatgatagacacagcaagactatttgccaaacatggtgttaatgttaccatcatcactacacat 26203643  T
Q  157 gccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaatctcaacttattcagttcccttca 243  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  26203644 gctaatgcttcaaccttccaaaaagcgatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaagactcatcttattcagttcccttca 26203730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 243
Target Start/End: Original strand, 26223182 - 26223368
Alignment:
Q  57 ttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacat 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26223182 ttttcttccatttccaactcctggtcatatgatttcaatgattgacacagcaagactatttgccaaacatggtgttaatgttaccatcatcactacacat 26223281  T
Q  157 gccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaatctcaacttattcagttcccttca 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  26223282 gccaatgcttccacattccaaaaatctgtagactgtgacttcaattcaggatactccatcaaaactcatcttatacagttcccttca 26223368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 26154812 - 26155039
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  26154812 acaatggagtctcaacaatcccataaccaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagctagactat 26154911  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 215  Q
    | || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  26154912 ttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctat 26155011  T
Q  216 caaatctcaacttattcagttcccttca 243  Q
    |||| | || |||||  |||||||||||    
T  26155012 caaaacacatcttatcaagttcccttca 26155039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 26128197 - 26128403
Alignment:
Q  37 cataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgcatggtgttaatg 136  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26128197 cataaccaacttcatgttgtttttctttcatatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgccatgcatggtgttaatg 26128296  T
Q  137 ttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaatctcaacttattcagtt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  || || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26128297 ttaccatcatcactacacatgctaatgcctcaacattccaaaaagccatagacagtgacaccagtttaggatactccattaaaactcaacttattcagtt 26128396  T
Q  237 cccttca 243  Q
    |||||||    
T  26128397 cccttca 26128403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 26190883 - 26191101
Alignment:
Q  25 tctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgc 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |    
T  26190883 tctcaacaatcccataacccacttcatgtaacttttcttccatttccatctcctggccatatgattcctatgattgacactgcaagactattagccaaac 26190982  T
Q  125 atggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaatctca 224  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  26190983 atggtgttaatgtaaccatcattactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaaaccatagacagtgacttcagtttaggatactccatcaaaactca 26191082  T
Q  225 acttattcagttcccttca 243  Q
     |||||| | |||||||||    
T  26191083 tcttattgaattcccttca 26191101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Original strand, 26297054 - 26297278
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |  | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  26297054 acaatggagtctcaacaatccaataacaaacttcatgttgtctttcttccatatccatctgctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactat 26297153  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 215  Q
    | || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||||||    
T  26297154 ttgcaaagcatggtgttgatgtaaccatcatcactacacatgccaatgcttcaaggttccaaaaatccatagatagtgacatcagtttaggatactccat 26297253  T
Q  216 caaatctcaacttattcagttccct 240  Q
    |||| || ||||| |||||||||||    
T  26297254 caaaactaaacttcttcagttccct 26297278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 26250463 - 26250681
Alignment:
Q  25 tctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgc 124  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || |  |    
T  26250463 tctcaacaatccaataaccaacttcatgttgtttttcttccatatccatctgctggtcatatgaaccctatgattgacactgcaagactatttgctaaac 26250562  T
Q  125 atggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaatctca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  26250563 atggtgttaatgttaccatcatcactacacatgctaatgcttcaaggttccaaaaatccatagatagtgacatcagtttaggatactccatcaaaactca 26250662  T
Q  225 acttattcagttcccttca 243  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  26250663 acttcttcagtttccttca 26250681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Original strand, 26242006 - 26242232
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  26242006 acaatggaatctcaacaatcccataacaaacttcatgttgtttttcttccatatccagctattggccatatgaaccctatgattgacactgcaagactat 26242105  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 215  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||    
T  26242106 ttgcaaagcatggtgttaatgttaccatcatacttacacatgccaatgcttcaaggttccaaaaatccatagatagtgatgtcagtttaggatactccat 26242205  T
Q  216 caaatctcaacttattcagttcccttc 242  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  26242206 caaaactcaacttcttcagttcccttc 26242232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 164
Target Start/End: Original strand, 26207085 - 26207192
Alignment:
Q  57 ttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacat 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26207085 ttttctaccatatccaactcctggccatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgttaccatcatcactacacaa 26207184  T
Q  157 gccaatgc 164  Q
    || |||||    
T  26207185 gcaaatgc 26207192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 26186290 - 26186372
Alignment:
Q  27 tcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26186290 tcaacaatctcacaaccaacttcatataatttttcttccatttccaactcctggtcatatgattcctaggatagacgcagcaa 26186372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Original strand, 26259547 - 26259656
Alignment:
Q  55 atttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacac 154  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26259547 atttttctaccttatctaactcctggccatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtattaatgttaccattatcactacac 26259646  T
Q  155 atgccaatgc 164  Q
    ||||||||||    
T  26259647 atgccaatgc 26259656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 26184881 - 26185008
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  26184881 acaatggactcccaataatcccataacaaacttcatgtaatttttgttccatatccaactcctggccatatgaatcccatgatagccacatcaagactat 26184980  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccat 143  Q
    | || | ||||||||||||||| |||||    
T  26184981 ttgcaaagcatggtgttaatgtcaccat 26185008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Original strand, 26226635 - 26226727
Alignment:
Q  72 aactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgc 164  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26226635 aactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaaggctatttgcaaagcatggtgttgatgttaccatcatcactacacaagcaaatgc 26226727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 243
Target Start/End: Original strand, 26240031 - 26240123
Alignment:
Q  151 acacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaatctcaacttattcagttcccttca 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| | || ||| | |||||| |||| |||||||||    
T  26240031 acacatgtcaatgcttcaacattccaaaaagccatagagagtgacttcaattcagcataccctattaaaacccaacttcttcaattcccttca 26240123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Original strand, 44902850 - 44903079
Alignment:
Q  16 acaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttcttccatatccaactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactat 115  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44902850 acaatggattctcaacaatccaataaccaacttcatgtagtttttcttccatatccaactcctggccatatgattcccatggtagacacagcaagactat 44902949  T
Q  116 tcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccat 215  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44902950 ttgcaaagcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaacgcttcaactttccaagaatccatagacagtgacttcaattcaggatactctat 44903049  T
Q  216 caaatctcaacttattcagttcccttcatc 245  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44903050 caaaactcagcttattcagttcccttcatc 44903079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University