View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13630_high_5 (Length: 625)

Name: NF13630_high_5
Description: NF13630
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13630_high_5
NF13630_high_5
[»] chr3 (130 HSPs)
chr3 (31-444)||(16618389-16618813)
chr3 (31-444)||(16422123-16422543)
chr3 (31-444)||(19700426-19700858)
chr3 (36-444)||(18057205-18057623)
chr3 (43-444)||(5590261-5590669)
chr3 (52-444)||(7079183-7079587)
chr3 (36-444)||(32296574-32296990)
chr3 (36-444)||(4790533-4790949)
chr3 (53-444)||(5727940-5728339)
chr3 (53-444)||(47029415-47029814)
chr3 (52-444)||(22864748-22865145)
chr3 (52-444)||(22879807-22880204)
chr3 (53-444)||(5717030-5717429)
chr3 (53-444)||(5764029-5764428)
chr3 (36-444)||(10402094-10402508)
chr3 (52-444)||(6536643-6537042)
chr3 (53-444)||(10649033-10649431)
chr3 (52-444)||(17970766-17971163)
chr3 (36-444)||(29658868-29659283)
chr3 (31-444)||(29142654-29143077)
chr3 (52-444)||(20071994-20072395)
chr3 (53-444)||(4422880-4423278)
chr3 (53-444)||(11104261-11104660)
chr3 (63-444)||(5603213-5603603)
chr3 (43-444)||(17978850-17979259)
chr3 (36-444)||(28027236-28027649)
chr3 (31-444)||(4629725-4630144)
chr3 (43-444)||(22381481-22381888)
chr3 (52-444)||(18286255-18286653)
chr3 (52-444)||(18301556-18301954)
chr3 (36-444)||(8217577-8217994)
chr3 (36-444)||(31030145-31030553)
chr3 (63-444)||(31958355-31958745)
chr3 (43-444)||(4340576-4340984)
chr3 (36-444)||(4727578-4727987)
chr3 (53-444)||(5019675-5020072)
chr3 (36-444)||(21680646-21681060)
chr3 (36-444)||(18336573-18336982)
chr3 (63-444)||(24334145-24334535)
chr3 (52-444)||(5472949-5473347)
chr3 (53-444)||(8283358-8283767)
chr3 (36-444)||(18248683-18249098)
chr3 (53-444)||(48471889-48472291)
chr3 (52-444)||(32445115-32445505)
chr3 (53-444)||(15735000-15735393)
chr3 (63-444)||(28345143-28345530)
chr3 (31-444)||(28109851-28110276)
chr3 (53-444)||(51787984-51788382)
chr3 (36-444)||(35886709-35887120)
chr3 (36-444)||(4689596-4690005)
chr3 (36-444)||(6207845-6208256)
chr3 (53-444)||(18231155-18231553)
chr3 (36-444)||(20570746-20571161)
chr3 (31-444)||(5658074-5658491)
chr3 (484-598)||(17970613-17970726)
chr3 (482-597)||(5473385-5473499)
chr3 (482-597)||(8283206-8283320)
chr3 (482-597)||(29658716-29658830)
chr3 (482-597)||(32445547-32445661)
chr3 (482-597)||(48472329-48472443)
chr3 (482-596)||(22381330-22381443)
chr3 (484-597)||(5020112-5020224)
chr3 (484-597)||(10649471-10649583)
chr3 (484-597)||(21681100-21681212)
chr3 (484-597)||(51788421-51788533)
chr3 (482-597)||(4340424-4340538)
chr3 (482-597)||(4630182-4630296)
chr3 (482-597)||(4790381-4790495)
chr3 (482-597)||(16422582-16422696)
chr3 (482-597)||(18286103-18286217)
chr3 (482-597)||(18301404-18301518)
chr3 (482-597)||(20072433-20072547)
chr3 (482-597)||(22864596-22864710)
chr3 (482-597)||(22879655-22879769)
chr3 (482-597)||(31029992-31030106)
chr3 (483-597)||(7079626-7079739)
chr3 (484-598)||(8218036-8218149)
chr3 (484-598)||(10402548-10402661)
chr3 (484-597)||(6536491-6536603)
chr3 (484-597)||(11104110-11104222)
chr3 (482-597)||(4690043-4690157)
chr3 (482-597)||(15734861-15734975)
chr3 (482-597)||(15886489-15886603)
chr3 (482-597)||(16618251-16618364)
chr3 (482-597)||(17978696-17978810)
chr3 (482-597)||(29142502-29142616)
chr3 (482-596)||(35887158-35887271)
chr3 (484-597)||(4423318-4423430)
chr3 (484-597)||(5603061-5603173)
chr3 (263-444)||(15886641-15886814)
chr3 (31-162)||(15886894-15887027)
chr3 (484-597)||(28027689-28027801)
chr3 (484-597)||(28109699-28109811)
chr3 (484-597)||(28345570-28345682)
chr3 (484-597)||(31958203-31958315)
chr3 (482-597)||(5590105-5590219)
chr3 (482-597)||(5658529-5658643)
chr3 (482-597)||(5717467-5717581)
chr3 (482-597)||(5728377-5728491)
chr3 (482-597)||(5763877-5763991)
chr3 (482-581)||(6208295-6208393)
chr3 (482-597)||(18057661-18057775)
chr3 (482-597)||(18231591-18231705)
chr3 (482-597)||(47029852-47029966)
chr3 (484-597)||(18249137-18249249)
chr3 (484-597)||(24334575-24334687)
chr3 (482-597)||(18337020-18337135)
chr3 (484-588)||(20570602-20570705)
chr3 (482-581)||(4728026-4728124)
chr3 (482-597)||(32297028-32297142)
chr3 (53-138)||(8002522-8002607)
chr3 (485-526)||(27560722-27560763)
chr3 (483-524)||(18904179-18904220)
chr3 (484-531)||(72518-72565)
chr3 (484-575)||(17931128-17931218)
chr3 (484-526)||(4453039-4453081)
chr3 (543-588)||(19700908-19700953)
chr3 (482-522)||(15581010-15581050)
chr3 (484-522)||(5947688-5947726)
chr3 (484-522)||(6199974-6200012)
chr3 (484-522)||(8621987-8622025)
chr3 (484-522)||(8810060-8810098)
chr3 (484-522)||(15531814-15531852)
chr3 (484-522)||(15921802-15921840)
chr3 (484-522)||(46383679-46383717)
chr3 (484-522)||(46395177-46395215)
chr3 (484-525)||(23283773-23283814)
chr3 (490-575)||(25268909-25268994)
chr3 (484-525)||(30091508-30091549)
chr3 (483-531)||(9549968-9550016)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (31-444)||(10847557-10847979)
chr7 (42-444)||(16443746-16444156)
chr7 (31-444)||(16047289-16047706)
chr7 (31-444)||(2160544-2160966)
chr7 (31-444)||(5154058-5154477)
chr7 (36-444)||(26268828-26269247)
chr7 (36-444)||(11418522-11418937)
chr7 (31-444)||(5141077-5141498)
chr7 (31-444)||(24586278-24586698)
chr7 (36-444)||(26518772-26519185)
chr7 (36-444)||(5164363-5164778)
chr7 (31-444)||(16745263-16745684)
chr7 (52-444)||(2779247-2779640)
chr7 (42-444)||(26441238-26441648)
chr7 (52-444)||(31129900-31130293)
chr7 (52-444)||(45737296-45737697)
chr7 (63-444)||(4138988-4139378)
chr7 (36-444)||(11446867-11447282)
chr7 (31-444)||(26313592-26314011)
chr7 (53-444)||(31558137-31558535)
chr7 (31-444)||(26509438-26509860)
chr7 (53-444)||(26678847-26679246)
chr7 (31-443)||(31084366-31084786)
chr7 (31-444)||(4205363-4205783)
chr7 (53-444)||(26663655-26664054)
chr7 (36-444)||(10910669-10911078)
chr7 (43-444)||(45393205-45393613)
chr7 (53-444)||(39206882-39207280)
chr7 (36-440)||(3451297-3451709)
chr7 (31-444)||(16512183-16512597)
chr7 (143-444)||(26595754-26596064)
chr7 (484-597)||(26268676-26268788)
chr7 (484-597)||(26313440-26313552)
chr7 (484-597)||(45393653-45393765)
chr7 (482-597)||(45737735-45737849)
chr7 (484-598)||(4138835-4138948)
chr7 (484-597)||(16047747-16047859)
chr7 (484-597)||(26519225-26519337)
chr7 (482-597)||(5154515-5154629)
chr7 (482-597)||(10910517-10910631)
chr7 (482-597)||(11418370-11418484)
chr7 (482-597)||(16512031-16512145)
chr7 (482-597)||(31130331-31130445)
chr7 (482-597)||(31557985-31558099)
chr7 (484-597)||(4205823-4205935)
chr7 (484-597)||(10848019-10848131)
chr7 (482-594)||(5164816-5164927)
chr7 (482-597)||(22152547-22152662)
chr7 (482-597)||(22208462-22208577)
chr7 (482-597)||(5140925-5141039)
chr7 (482-597)||(16443594-16443708)
chr7 (482-597)||(16745111-16745225)
chr7 (482-597)||(24586126-24586240)
chr7 (484-597)||(11447322-11447434)
chr7 (484-597)||(39206731-39206843)
chr7 (482-593)||(2161004-2161114)
chr7 (482-597)||(26663503-26663617)
chr7 (482-597)||(26678695-26678809)
chr7 (482-597)||(31084213-31084327)
chr7 (482-597)||(26596102-26596216)
chr7 (483-597)||(2779679-2779792)
chr7 (53-138)||(26531926-26532011)
chr7 (482-597)||(26509286-26509400)
chr7 (482-578)||(3451751-3451846)
chr7 (484-588)||(26441688-26441791)
chr7 (485-569)||(1890269-1890352)
chr7 (490-575)||(27971370-27971455)
chr7 (484-575)||(4943003-4943094)
chr7 (484-575)||(9472637-9472727)
chr7 (484-531)||(13836690-13836737)
chr7 (484-575)||(27439558-27439649)
chr7 (484-531)||(38409027-38409074)
chr7 (484-522)||(8815980-8816018)
chr7 (484-522)||(15768612-15768650)
chr7 (484-522)||(23881267-23881305)
chr7 (120-178)||(29027283-29027341)
chr7 (484-522)||(30366676-30366714)
chr7 (484-522)||(42632942-42632980)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (31-444)||(25092-25520)
scaffold0109 (482-597)||(25557-25671)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (31-444)||(15276486-15276909)
chr4 (31-444)||(1906240-1906665)
chr4 (31-444)||(15380095-15380515)
chr4 (31-444)||(15233804-15234228)
chr4 (60-444)||(1673877-1674269)
chr4 (36-444)||(39856630-39857043)
chr4 (31-444)||(54839379-54839798)
chr4 (54-444)||(14104554-14104950)
chr4 (36-444)||(27157169-27157586)
chr4 (53-444)||(20332279-20332678)
chr4 (53-444)||(40099493-40099892)
chr4 (54-444)||(30759775-30760170)
chr4 (54-444)||(33667660-33668055)
chr4 (52-444)||(14753351-14753749)
chr4 (31-441)||(6575850-6576259)
chr4 (52-444)||(34182821-34183218)
chr4 (36-444)||(24586218-24586634)
chr4 (36-444)||(5011870-5012286)
chr4 (36-444)||(18794474-18794889)
chr4 (52-444)||(5700549-5700948)
chr4 (43-444)||(21975704-21976112)
chr4 (52-444)||(36338383-36338774)
chr4 (43-444)||(31120367-31120776)
chr4 (52-444)||(24118672-24119070)
chr4 (36-444)||(17019045-17019456)
chr4 (36-444)||(14671009-14671421)
chr4 (133-444)||(36324174-36324484)
chr4 (482-597)||(1906705-1906820)
chr4 (482-597)||(15379943-15380057)
chr4 (484-597)||(30760210-30760322)
chr4 (484-597)||(33667508-33667620)
chr4 (482-598)||(14753198-14753313)
chr4 (482-597)||(14671459-14671573)
chr4 (482-597)||(17019495-17019609)
chr4 (482-597)||(24119108-24119222)
chr4 (482-597)||(39857081-39857195)
chr4 (484-598)||(6576303-6576416)
chr4 (484-597)||(5700988-5701100)
chr4 (484-597)||(34182669-34182781)
chr4 (482-597)||(31120215-31120329)
chr4 (482-597)||(54839837-54839951)
chr4 (484-597)||(27157017-27157129)
chr4 (482-597)||(5012324-5012438)
chr4 (482-597)||(14104988-14105102)
chr4 (482-597)||(15234266-15234380)
chr4 (482-597)||(21976150-21976264)
chr4 (482-597)||(40099341-40099455)
chr4 (484-597)||(36324021-36324134)
chr4 (484-597)||(36338230-36338343)
chr4 (484-597)||(15276334-15276446)
chr4 (484-588)||(18794331-18794434)
chr4 (482-597)||(1674307-1674421)
chr4 (482-597)||(24586066-24586180)
chr4 (482-597)||(20332128-20332241)
chr4 (496-569)||(1878928-1879001)
chr4 (484-560)||(9189178-9189254)
chr4 (484-525)||(33184026-33184067)
chr4 (484-568)||(22709707-22709791)
chr4 (484-531)||(8097855-8097902)
chr4 (484-525)||(20558764-20558805)
chr4 (486-575)||(55791648-55791736)
[»] chr2 (88 HSPs)
chr2 (43-444)||(21697020-21697431)
chr2 (31-444)||(27396298-27396728)
chr2 (31-444)||(19450265-19450694)
chr2 (36-444)||(12661519-12661933)
chr2 (31-444)||(27809676-27810098)
chr2 (36-444)||(27122505-27122918)
chr2 (31-444)||(39896043-39896463)
chr2 (52-444)||(34160840-34161241)
chr2 (53-444)||(254499-254897)
chr2 (53-444)||(16167475-16167873)
chr2 (36-444)||(37383657-37384072)
chr2 (53-444)||(37945712-37946111)
chr2 (31-444)||(12592785-12593209)
chr2 (31-444)||(3788469-3788888)
chr2 (54-444)||(34867681-34868077)
chr2 (53-444)||(9343834-9344232)
chr2 (53-444)||(39045669-39046067)
chr2 (36-444)||(12710448-12710863)
chr2 (52-444)||(34297152-34297544)
chr2 (63-444)||(22921990-22922380)
chr2 (43-444)||(16823184-16823592)
chr2 (43-444)||(16897888-16898296)
chr2 (36-444)||(40239489-40239903)
chr2 (31-444)||(11629032-11629451)
chr2 (31-444)||(37679738-37680160)
chr2 (31-444)||(37695003-37695425)
chr2 (53-444)||(13930391-13930791)
chr2 (31-444)||(21671017-21671440)
chr2 (53-444)||(31882284-31882681)
chr2 (31-444)||(32055777-32056196)
chr2 (63-444)||(19410331-19410721)
chr2 (53-444)||(20843909-20844307)
chr2 (52-444)||(28888275-28888669)
chr2 (36-444)||(23122425-23122835)
chr2 (36-444)||(27782212-27782627)
chr2 (31-444)||(34268773-34269188)
chr2 (53-444)||(37931369-37931774)
chr2 (104-444)||(31868633-31868979)
chr2 (52-444)||(27428300-27428692)
chr2 (482-597)||(27396769-27396883)
chr2 (484-597)||(39896503-39896615)
chr2 (482-597)||(23122271-23122385)
chr2 (482-597)||(27122956-27123070)
chr2 (482-597)||(27428148-27428262)
chr2 (482-597)||(37384110-37384224)
chr2 (483-597)||(21696881-21696994)
chr2 (484-597)||(19410179-19410291)
chr2 (484-597)||(19450113-19450225)
chr2 (484-597)||(37931814-37931926)
chr2 (482-597)||(20844347-20844461)
chr2 (482-597)||(31882719-31882833)
chr2 (307-444)||(23117053-23117191)
chr2 (484-597)||(11628880-11628992)
chr2 (484-597)||(12710296-12710408)
chr2 (484-597)||(31868481-31868593)
chr2 (484-597)||(40239943-40240055)
chr2 (482-597)||(9343682-9343796)
chr2 (482-597)||(16167911-16168025)
chr2 (482-597)||(16823032-16823146)
chr2 (482-597)||(16898334-16898448)
chr2 (482-597)||(34161279-34161393)
chr2 (482-593)||(34268625-34268735)
chr2 (482-596)||(21670865-21670978)
chr2 (482-596)||(37679587-37679700)
chr2 (482-596)||(37694852-37694965)
chr2 (484-597)||(22921838-22921950)
chr2 (488-596)||(28888693-28888800)
chr2 (482-597)||(254347-254461)
chr2 (482-597)||(27810136-27810250)
chr2 (482-597)||(34297582-34297696)
chr2 (482-597)||(37945560-37945674)
chr2 (482-597)||(23117229-23117344)
chr2 (484-588)||(27782668-27782771)
chr2 (482-597)||(12593247-12593361)
chr2 (485-569)||(26721085-26721168)
chr2 (541-597)||(34868125-34868181)
chr2 (36-109)||(31887682-31887755)
chr2 (543-597)||(32056246-32056300)
chr2 (485-578)||(39045534-39045626)
chr2 (484-575)||(42569232-42569323)
chr2 (543-597)||(3788938-3788992)
chr2 (541-597)||(12661981-12662038)
chr2 (484-578)||(13930258-13930351)
chr2 (483-531)||(21854704-21854752)
chr2 (482-525)||(3788926-3788969)
chr2 (484-522)||(12386860-12386898)
chr2 (484-522)||(20276776-20276814)
chr2 (490-575)||(3761105-3761190)
[»] chr5 (116 HSPs)
chr5 (31-444)||(22894400-22894819)
chr5 (31-444)||(25206261-25206688)
chr5 (31-444)||(25270417-25270844)
chr5 (31-444)||(26486380-26486789)
chr5 (36-444)||(11555343-11555757)
chr5 (53-444)||(13318585-13318982)
chr5 (53-444)||(30174471-30174870)
chr5 (36-444)||(23631958-23632375)
chr5 (36-444)||(28655231-28655647)
chr5 (31-444)||(23897858-23898272)
chr5 (54-444)||(33881133-33881530)
chr5 (36-444)||(31820167-31820580)
chr5 (43-444)||(3795534-3795943)
chr5 (52-444)||(9544464-9544864)
chr5 (53-444)||(13180550-13180944)
chr5 (54-444)||(18369289-18369686)
chr5 (52-444)||(31437469-31437861)
chr5 (53-444)||(40467310-40467708)
chr5 (31-444)||(33298517-33298941)
chr5 (31-444)||(9323461-9323880)
chr5 (36-444)||(18494525-18494939)
chr5 (31-444)||(12138160-12138579)
chr5 (54-444)||(24729977-24730374)
chr5 (52-444)||(37746079-37746484)
chr5 (36-444)||(2517054-2517470)
chr5 (36-444)||(15652517-15652930)
chr5 (31-444)||(37760966-37761387)
chr5 (36-444)||(32590033-32590447)
chr5 (43-444)||(33522378-33522787)
chr5 (31-444)||(33783471-33783886)
chr5 (31-444)||(24608229-24608645)
chr5 (53-444)||(34622524-34622923)
chr5 (31-444)||(30035410-30035829)
chr5 (52-444)||(5643805-5644202)
chr5 (52-444)||(37665243-37665642)
chr5 (31-444)||(15752615-15753029)
chr5 (36-444)||(41680693-41681109)
chr5 (52-444)||(18122173-18122572)
chr5 (36-444)||(22992881-22993288)
chr5 (61-444)||(30158048-30158438)
chr5 (31-444)||(6880287-6880708)
chr5 (38-444)||(13436431-13436850)
chr5 (54-444)||(11329644-11330043)
chr5 (36-444)||(37352401-37352816)
chr5 (36-444)||(43084247-43084662)
chr5 (36-444)||(28953537-28953952)
chr5 (31-444)||(24975833-24976247)
chr5 (36-444)||(30940625-30941034)
chr5 (36-444)||(8659229-8659643)
chr5 (482-597)||(25206726-25206840)
chr5 (482-597)||(25270882-25270996)
chr5 (484-598)||(9323920-9324033)
chr5 (484-598)||(12138619-12138732)
chr5 (484-598)||(26486829-26486942)
chr5 (482-598)||(6880746-6880861)
chr5 (482-597)||(18369137-18369251)
chr5 (482-597)||(22894858-22894972)
chr5 (482-597)||(23632413-23632527)
chr5 (482-597)||(24976285-24976399)
chr5 (482-597)||(30158476-30158590)
chr5 (482-597)||(34622961-34623076)
chr5 (482-597)||(41681147-41681261)
chr5 (484-597)||(3795983-3796095)
chr5 (484-597)||(13436275-13436387)
chr5 (484-597)||(15752463-15752575)
chr5 (484-597)||(30035870-30035982)
chr5 (484-596)||(33881570-33881681)
chr5 (482-597)||(11555795-11555909)
chr5 (482-597)||(13180398-13180512)
chr5 (482-597)||(18122021-18122135)
chr5 (482-597)||(18494373-18494487)
chr5 (482-597)||(24608683-24608797)
chr5 (482-597)||(28655685-28655799)
chr5 (482-597)||(33783924-33784038)
chr5 (482-597)||(37352249-37352363)
chr5 (482-597)||(37745927-37746041)
chr5 (484-597)||(5644242-5644354)
chr5 (484-597)||(24730414-24730526)
chr5 (484-596)||(8659078-8659189)
chr5 (482-597)||(2517508-2517622)
chr5 (482-593)||(15652369-15652479)
chr5 (482-597)||(22992729-22992843)
chr5 (482-597)||(33298979-33299093)
chr5 (482-597)||(33522825-33522939)
chr5 (482-597)||(40467156-40467270)
chr5 (482-596)||(11330081-11330194)
chr5 (484-597)||(43084701-43084813)
chr5 (482-597)||(37665090-37665205)
chr5 (482-597)||(9544312-9544426)
chr5 (482-597)||(23898311-23898425)
chr5 (482-597)||(30174908-30175022)
chr5 (482-597)||(32589881-32589995)
chr5 (484-597)||(13318433-13318545)
chr5 (482-597)||(30941072-30941187)
chr5 (484-588)||(37761427-37761530)
chr5 (482-597)||(31437899-31438013)
chr5 (484-588)||(31820024-31820127)
chr5 (482-597)||(28953383-28953497)
chr5 (541-597)||(23726735-23726791)
chr5 (482-575)||(21990745-21990838)
chr5 (482-575)||(33840002-33840095)
chr5 (484-575)||(21862457-21862548)
chr5 (484-526)||(20374430-20374472)
chr5 (482-522)||(21693353-21693393)
chr5 (484-531)||(28849191-28849238)
chr5 (484-522)||(1803677-1803715)
chr5 (484-522)||(7256637-7256675)
chr5 (484-522)||(7792375-7792413)
chr5 (484-522)||(11941199-11941237)
chr5 (484-522)||(15781445-15781483)
chr5 (484-522)||(31523692-31523730)
chr5 (488-569)||(12175679-12175760)
chr5 (490-575)||(20382384-20382469)
chr5 (490-575)||(27228719-27228804)
chr5 (484-525)||(29899064-29899105)
chr5 (484-531)||(24064596-24064644)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (31-444)||(20334272-20334694)
chr1 (31-444)||(16201884-16202312)
chr1 (31-444)||(20466756-20467184)
chr1 (31-444)||(3647125-3647545)
chr1 (54-444)||(28591085-28591481)
chr1 (31-444)||(21891619-21892025)
chr1 (36-444)||(51644204-51644621)
chr1 (52-444)||(28155726-28156127)
chr1 (36-444)||(10968649-10969065)
chr1 (36-444)||(41787166-41787583)
chr1 (54-444)||(10951093-10951491)
chr1 (482-597)||(20334120-20334234)
chr1 (484-597)||(10951531-10951643)
chr1 (482-597)||(28156165-28156279)
chr1 (484-597)||(28591520-28591632)
chr1 (482-597)||(20467223-20467337)
chr1 (504-597)||(16201740-16201832)
chr1 (484-597)||(41787014-41787126)
chr1 (484-597)||(51644661-51644773)
chr1 (484-596)||(10969105-10969216)
chr1 (484-597)||(3647586-3647698)
chr1 (482-597)||(21891463-21891577)
chr1 (484-526)||(2389935-2389977)
chr1 (484-569)||(13457093-13457177)
chr1 (486-559)||(13469050-13469123)
chr1 (484-522)||(5625850-5625888)
chr1 (485-531)||(31545354-31545400)
chr1 (485-522)||(21454697-21454734)
chr1 (486-522)||(9297885-9297921)
[»] chr6 (102 HSPs)
chr6 (31-444)||(22928685-22929107)
chr6 (31-444)||(27284166-27284586)
chr6 (37-444)||(27623511-27623927)
chr6 (31-444)||(29555532-29555952)
chr6 (36-444)||(26110215-26110629)
chr6 (31-444)||(8899503-8899923)
chr6 (31-444)||(16755794-16756215)
chr6 (36-444)||(13292755-13293164)
chr6 (52-444)||(27063477-27063875)
chr6 (36-444)||(27355915-27356330)
chr6 (36-444)||(29507395-29507812)
chr6 (36-444)||(33370235-33370650)
chr6 (36-444)||(34458312-34458725)
chr6 (53-444)||(4763759-4764157)
chr6 (54-444)||(13517998-13518395)
chr6 (52-444)||(14139204-14139597)
chr6 (54-444)||(16680136-16680534)
chr6 (52-444)||(27013728-27014120)
chr6 (36-444)||(28166473-28166889)
chr6 (36-444)||(4539562-4539978)
chr6 (31-444)||(27491107-27491527)
chr6 (36-444)||(27200165-27200580)
chr6 (36-444)||(27248653-27249068)
chr6 (36-444)||(26772433-26772847)
chr6 (36-444)||(27031002-27031414)
chr6 (36-444)||(27208883-27209294)
chr6 (36-444)||(27239934-27240345)
chr6 (36-444)||(26791795-26792210)
chr6 (54-444)||(29579012-29579408)
chr6 (43-444)||(30551804-30552212)
chr6 (36-444)||(27025124-27025535)
chr6 (31-444)||(24869684-24870098)
chr6 (36-444)||(28213433-28213849)
chr6 (52-444)||(26926763-26927146)
chr6 (37-444)||(16937829-16938243)
chr6 (53-444)||(4778876-4779275)
chr6 (53-444)||(15406337-15406731)
chr6 (53-444)||(15418124-15418518)
chr6 (36-444)||(24299564-24299974)
chr6 (36-444)||(4531267-4531682)
chr6 (138-444)||(26666462-26666774)
chr6 (74-444)||(20174566-20174953)
chr6 (74-444)||(22161038-22161425)
chr6 (482-597)||(33370083-33370197)
chr6 (484-597)||(4531722-4531834)
chr6 (482-597)||(27355763-27355877)
chr6 (482-597)||(29507850-29507964)
chr6 (482-596)||(24870137-24870250)
chr6 (484-597)||(26927186-26927298)
chr6 (484-596)||(13517847-13517958)
chr6 (482-597)||(4779313-4779427)
chr6 (482-597)||(16756253-16756367)
chr6 (482-597)||(24299412-24299526)
chr6 (482-597)||(26110061-26110175)
chr6 (482-597)||(28166927-28167041)
chr6 (482-597)||(29579446-29579560)
chr6 (482-597)||(4539410-4539524)
chr6 (482-597)||(13292601-13292715)
chr6 (482-597)||(15406185-15406299)
chr6 (482-597)||(15417972-15418086)
chr6 (482-597)||(16680571-16680685)
chr6 (482-597)||(27031452-27031566)
chr6 (482-597)||(28213887-28214001)
chr6 (31-133)||(23851450-23851552)
chr6 (484-597)||(4764197-4764309)
chr6 (484-597)||(26792250-26792362)
chr6 (484-597)||(27063915-27064027)
chr6 (482-597)||(27200618-27200733)
chr6 (482-597)||(27248500-27248615)
chr6 (482-597)||(14139052-14139166)
chr6 (482-597)||(27014158-27014272)
chr6 (482-597)||(27209332-27209446)
chr6 (482-597)||(27239782-27239896)
chr6 (482-597)||(30551652-30551766)
chr6 (482-597)||(34458160-34458274)
chr6 (484-597)||(27491566-27491678)
chr6 (484-596)||(8899352-8899463)
chr6 (482-597)||(22928532-22928647)
chr6 (482-581)||(27025573-27025671)
chr6 (482-597)||(29555990-29556104)
chr6 (483-597)||(16937677-16937790)
chr6 (484-597)||(27284014-27284126)
chr6 (484-597)||(27623359-27623471)
chr6 (482-597)||(26666310-26666424)
chr6 (482-597)||(26772281-26772395)
chr6 (485-569)||(27548248-27548331)
chr6 (484-597)||(20174996-20175108)
chr6 (484-597)||(22160883-22160995)
chr6 (484-560)||(25710257-25710332)
chr6 (482-575)||(28308730-28308823)
chr6 (484-531)||(174314-174361)
chr6 (484-575)||(16584627-16584718)
chr6 (484-575)||(16610662-16610753)
chr6 (484-575)||(18947666-18947756)
chr6 (484-575)||(27515726-27515816)
chr6 (484-522)||(617847-617885)
chr6 (484-522)||(1547641-1547679)
chr6 (484-522)||(24145377-24145415)
chr6 (484-525)||(18752987-18753028)
chr6 (490-531)||(27053523-27053564)
chr6 (120-198)||(5991426-5991506)
chr6 (483-531)||(25501248-25501296)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (36-444)||(22074748-22075164)
chr8 (36-444)||(19910981-19911398)
chr8 (31-444)||(18796683-18797104)
chr8 (31-444)||(19202194-19202603)
chr8 (36-444)||(33248348-33248762)
chr8 (36-444)||(21341989-21342405)
chr8 (36-444)||(15773556-15773971)
chr8 (31-444)||(28355769-28356192)
chr8 (53-444)||(31360527-31360925)
chr8 (52-444)||(9360620-9361018)
chr8 (31-444)||(19680425-19680844)
chr8 (31-440)||(19655170-19655583)
chr8 (31-444)||(29835300-29835719)
chr8 (63-444)||(31483689-31484079)
chr8 (52-444)||(18715478-18715879)
chr8 (36-444)||(44566962-44567380)
chr8 (36-444)||(12086542-12086958)
chr8 (31-444)||(33264708-33265120)
chr8 (31-444)||(27602733-27603146)
chr8 (36-444)||(2131087-2131496)
chr8 (31-444)||(22138883-22139297)
chr8 (36-444)||(19694077-19694488)
chr8 (36-444)||(14569139-14569551)
chr8 (36-303)||(16260205-16260479)
chr8 (482-597)||(22074596-22074710)
chr8 (484-597)||(15774011-15774123)
chr8 (484-597)||(44567420-44567532)
chr8 (484-597)||(18715919-18716031)
chr8 (482-597)||(19202042-19202156)
chr8 (482-597)||(19655012-19655126)
chr8 (482-597)||(19694526-19694640)
chr8 (482-597)||(21341837-21341951)
chr8 (482-597)||(22139322-22139436)
chr8 (482-597)||(27602581-27602695)
chr8 (482-597)||(29835757-29835871)
chr8 (484-598)||(33265160-33265273)
chr8 (484-597)||(19680884-19680996)
chr8 (484-597)||(31483537-31483649)
chr8 (482-597)||(12086390-12086504)
chr8 (482-597)||(18797142-18797256)
chr8 (482-597)||(19910829-19910943)
chr8 (482-596)||(2130935-2131048)
chr8 (484-598)||(31360965-31361078)
chr8 (482-597)||(28355617-28355731)
chr8 (482-597)||(33248800-33248914)
chr8 (484-588)||(9361048-9361150)
chr8 (482-597)||(14569589-14569704)
chr8 (485-569)||(16771675-16771758)
chr8 (485-569)||(25794043-25794126)
chr8 (484-525)||(21477865-21477906)
chr8 (484-531)||(6668218-6668265)
chr8 (484-529)||(39840343-39840388)
chr8 (485-525)||(22158805-22158845)
[»] scaffold0322 (4 HSPs)
scaffold0322 (31-444)||(12023-12454)
scaffold0322 (31-444)||(1634-2054)
scaffold0322 (482-597)||(12479-12593)
scaffold0322 (482-595)||(2092-2204)
[»] scaffold0792 (2 HSPs)
scaffold0792 (36-444)||(4460-4878)
scaffold0792 (482-597)||(4307-4421)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (31-444)||(9499-9918)
scaffold0547 (482-597)||(9347-9461)
[»] scaffold0159 (4 HSPs)
scaffold0159 (31-444)||(3036-3458)
scaffold0159 (245-444)||(18007-18205)
scaffold0159 (484-597)||(2884-2996)
scaffold0159 (484-597)||(18245-18357)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (52-444)||(12034-12432)
scaffold0418 (484-597)||(12472-12584)
[»] scaffold0143 (4 HSPs)
scaffold0143 (31-444)||(9891-10310)
scaffold0143 (52-444)||(33295-33691)
scaffold0143 (482-597)||(33730-33844)
scaffold0143 (484-597)||(10351-10463)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (52-444)||(8786-9184)
scaffold0237 (484-597)||(8634-8746)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (36-444)||(18567-18984)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (36-444)||(13931-14347)
scaffold0038 (482-597)||(14385-14499)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (36-444)||(6048-6460)
scaffold0089 (482-596)||(6498-6611)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (36-444)||(15551-15973)
scaffold0336 (482-597)||(16011-16125)
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (36-444)||(24763-25174)
scaffold0240 (482-525)||(24682-24725)
[»] scaffold0093 (2 HSPs)
scaffold0093 (260-444)||(1-184)
scaffold0093 (482-597)||(209-323)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (36-217)||(359-540)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (31-200)||(26241-26410)
[»] scaffold0099 (3 HSPs)
scaffold0099 (60-206)||(40744-40898)
scaffold0099 (326-444)||(40486-40606)
scaffold0099 (482-597)||(40321-40444)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (484-575)||(15200-15291)
[»] scaffold1837 (1 HSPs)
scaffold1837 (485-526)||(577-618)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (484-568)||(5523-5607)
[»] scaffold1418 (1 HSPs)
scaffold1418 (484-575)||(1405-1496)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (484-575)||(141-232)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (485-531)||(173131-173177)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (482-531)||(20999-21048)
scaffold0016 (120-198)||(20638-20718)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (483-531)||(175-223)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (482-522)||(20517-20557)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (484-575)||(3376-3467)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (485-524)||(33006-33045)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (484-575)||(28319-28409)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (484-522)||(1284-1322)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (484-522)||(758-796)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (484-522)||(8252-8290)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (489-575)||(69116-69202)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (484-522)||(90367-90405)
[»] scaffold0799 (1 HSPs)
scaffold0799 (486-575)||(5231-5319)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (484-525)||(11148-11189)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (484-525)||(15248-15289)
[»] scaffold1691 (1 HSPs)
scaffold1691 (484-532)||(1148-1196)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (482-522)||(32121-32161)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (120-202)||(20592-20676)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 130)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16618813 - 16618389
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16618813 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16618714  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctac---------- 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||              
T  16618713 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 16618614  T
Q  221 -tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg-aaaaagttttttgtctgtt 318  Q
     ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||    
T  16618613 ctttcaaagctatgtac-aaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccatt 16618515  T
Q  319 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16618514 ttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttcc 16618415  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  16618414 ccaggatagtctgtggccaatggcaa 16618389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 16422123 - 16422543
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16422123 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttcc-ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16422221  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||          
T  16422222 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 16422321  T
Q  225 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
         ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  16422322 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtgtattt 16422418  T
Q  320 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16422419 tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 16422518  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16422519 caggatagtctgtggtcaatggcaa 16422543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 19700426 - 19700858
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19700426 catcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 19700525  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||               
T  19700526 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttta 19700625  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnn-------cattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt 311  Q
    |||||||||||||||||               |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700626 ctttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt 19700725  T
Q  312 gtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcagg 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||     
T  19700726 gtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaga 19700825  T
Q  412 ctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700826 ttcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 19700858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 18057205 - 18057623
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18057205 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18057304  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------acttt 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||           |||||    
T  18057305 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 18057404  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatctt-gataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt-g 321  Q
    ||||| |||||||        ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  18057405 caaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctatttttg 18057500  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18057501 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 18057600  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18057601 ggatagtctgtggtcaatggcaa 18057623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5590669 - 5590261
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5590669 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgta 5590570  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||    
T  5590569 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 5590470  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaac 330  Q
    |||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||    
T  5590469 tgtac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaac 5590375  T
Q  331 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 430  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  5590374 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 5590275  T
Q  431 gtggtcaatggcaa 444  Q
     |||||||||||||    
T  5590274 atggtcaatggcaa 5590261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 7079183 - 7079587
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079183 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 7079282  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||           ||||||||||||||| ||         
T  7079283 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatac 7079382  T
Q  241 nnnncattttctttcta-tcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7079383 aaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-aaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 7079481  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  7079482 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 7079581  T
Q  439 tggcaa 444  Q
    ||||||    
T  7079582 tggcaa 7079587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296990
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact-------------ctactt 222  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |             ||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 32296773  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  32296774 tcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 32296867  T
Q  323 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  32296868 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 32296967  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32296968 ggatagtctgtggtcaatggcaa 32296990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4790949 - 4790533
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4790949 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4790850  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------cttt 223  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||    
T  4790849 gctttgtaaatccgtggattcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 4790750  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 323  Q
    ||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  4790749 caaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 4790655  T
Q  324 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  4790654 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 4790555  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4790554 gatagtctgtggtcaatggcaa 4790533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 5727940 - 5728339
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5727940 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5728039  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  5728040 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5728139  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5728140 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 5728233  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5728234 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5728333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 47029415 - 47029814
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47029415 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 47029514  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  47029515 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 47029614  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47029615 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 47029708  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  47029709 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 47029808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22865145 - 22864748
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865145 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22865046  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||          ||||||||||||||| | |||         
T  22865045 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactatgctttcttctactttcaaagctgtatac----a 22864950  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22864949 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 22864852  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  22864851 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggtcaatg 22864752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22880204 - 22879807
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880204 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22880105  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||          ||||||||||||||| | |||         
T  22880104 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactatgctttcttctactttcaaagctgtatac----a 22880009  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22880008 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 22879911  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  22879910 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggtcaatg 22879811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 5717030 - 5717429
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5717030 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5717129  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  5717130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5717229  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5717230 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 5717323  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5717324 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5717423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5764428 - 5764029
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5764428 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5764329  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  5764328 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5764229  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5764228 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 5764135  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5764134 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5764035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 10402094 - 10402508
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10402094 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 10402193  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttca 225  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||           ||||||||||    
T  10402194 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaattctatttttttctactttca 10402293  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  10402294 aagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaa 10402387  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  10402388 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 10402487  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10402488 atagtctgtggtcaatggcaa 10402508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6537042 - 6536643
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6537042 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6536943  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  6536942 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 6536847  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6536846 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaatt--aaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaa 6536749  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  6536748 cagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggtcaa 6536649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 10649033 - 10649431
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10649033 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10649132  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||| ||| |||         
T  10649133 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 10649232  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 340  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10649233 t---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 10649327  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10649328 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 10649427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17971163 - 17970766
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17971163 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 17971064  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          |||| |||||||||||| |||         
T  17971063 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatacaattt 17970964  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17970963 ----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 17970870  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17970869 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 17970770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658868
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||           |||||||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 29659084  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||| ||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| |||| ||||| |    
T  29659083 aaagttatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--cctttggtctattttgaa 29658990  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  29658989 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 29658890  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29658889 gatagtctgtggtcaatggcaa 29658868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29143077 - 29142654
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29143077 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29142978  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctct 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             |||    
T  29142977 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttct 29142878  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    |||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  29142877 actttcaaagctatatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatt 29142783  T
Q  319 tt---gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 415  Q
    ||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  29142782 tttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 29142683  T
Q  416 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29142682 cctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 29142654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 20071994 - 20072395
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20071994 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20072093  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  20072094 agtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 20072189  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagc 336  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20072190 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 20072287  T
Q  337 aacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 436  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  20072288 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtc 20072387  T
Q  437 aatggcaa 444  Q
    ||||||||    
T  20072388 aatggcaa 20072395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 4422880 - 4423278
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422880 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4422979  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  4422980 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 4423075  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4423076 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 4423173  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  4423174 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaat 4423273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11104660 - 11104261
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11104660 gcttgcgagttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11104561  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||  ||          
T  11104560 gccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaata--taca 11104463  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11104462 atttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 11104365  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11104364 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 11104265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 63 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5603603 - 5603213
Alignment:
Q  63 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5603603 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 5603504  T
Q  163 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  5603503 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 5603408  T
Q  249 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  5603407 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacc 5603310  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5603309 ttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 5603213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17979259 - 17978850
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17979259 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 17979160  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||    
T  17979159 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 17979060  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg--aaagcaaa 329  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||  ||||||||    
T  17979059 tatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaaagcaaa 17978965  T
Q  330 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||    
T  17978964 cctgagcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatc 17978865  T
Q  430 tgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||    
T  17978864 tgtggtcaatggcaa 17978850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027649
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||           ||||||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaattctattttcttctactttca 28027435  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaa 324  Q
    ||||||| |||         |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||    
T  28027436 aagctatatacaattt----attttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaa 28027529  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  28027530 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagga 28027629  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28027630 tagtctgtggtcaatggcaa 28027649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 4629725 - 4630144
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4629725 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 4629824  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctcta 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  4629825 ccaagctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 4629924  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    ||||||||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  4629925 ctttcaaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattt 4630019  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |     
T  4630020 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcct 4630118  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4630119 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 4630144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22381888 - 22381481
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22381888 aagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 22381789  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||||||||    
T  22381788 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta 22381689  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaa 329  Q
    | |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  22381688 tatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaa 22381595  T
Q  330 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 429  Q
    ||||||| |||  |||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22381594 cctgagcgacagtgtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 22381496  T
Q  430 tgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||    
T  22381495 tgtggtcaatggcaa 22381481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18286653 - 18286255
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286653 tgcttgcaaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18286554  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  18286553 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 18286458  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  18286457 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaa 18286360  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18286359 cagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 18286261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18301954 - 18301556
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301954 tgcttgcaaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18301855  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  18301854 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 18301759  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  18301758 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaa 18301661  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18301660 cagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 18301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 8217577 - 8217994
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8217577 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8217676  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  8217677 ctttgtggatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 8217776  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    |||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| |||||     
T  8217777 aaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttga 8217871  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  8217872 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 8217971  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8217972 ggatagtctgtggtcaatggcaa 8217994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31030553 - 31030145
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31030553 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31030454  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||           |||||||||    
T  31030453 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 31030354  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 324  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||  |||    
T  31030353 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaa 31030264  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  31030263 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaagatatgttacaagcaggttctcctccagga 31030165  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31030164 tagtctgtggtcaatggcaa 31030145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31958745 - 31958355
Alignment:
Q  63 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31958745 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 31958646  T
Q  163 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  31958645 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 31958550  T
Q  249 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  31958549 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacc 31958452  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31958451 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 31958355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4340984 - 4340576
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4340984 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 4340885  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||    
T  4340884 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagcta 4340785  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaa 329  Q
    | |||        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| | ||||| ||||||||    
T  4340784 tatac----aaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaaaagcaaa 4340691  T
Q  330 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 429  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  4340690 cctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 4340591  T
Q  430 tgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||    
T  4340590 tgtggtcaatggcaa 4340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 4727578 - 4727987
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4727578 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4727677  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |||||||    
T  4727678 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 4727777  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
    |||||||| |||        ||||||||||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |    
T  4727778 aaagctatatac----aaaacattttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaa 4727866  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4727867 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccag 4727965  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4727966 gatggtctgtggtcaatggcaa 4727987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 5019675 - 5020072
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019675 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 5019774  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnn 242  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||          ||||||||||||||||| |||          
T  5019775 gtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctactttcttctactttcaaagctatatac----aa 5019870  T
Q  243 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
      ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5019871 atcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 5019968  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  5019969 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggtcaatg 5020068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21681060
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 21680845  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    |||| ||| |||         |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  21680846 aaagttatatacaaaaat---attttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaa 21680940  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  21680941 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 21681039  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21681040 atagtctgtggtcaatggcaa 21681060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 18336573 - 18336982
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18336573 tcatcaaaagctcctatacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18336672  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctacttt 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||    
T  18336673 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 18336772  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 323  Q
    ||||||||| |||        ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||    
T  18336773 caaagctatatac----aaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaa 18336862  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  18336863 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 18336961  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  18336962 atagtctatggtcaatggcaa 18336982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 63 - 444
Target Start/End: Original strand, 24334145 - 24334535
Alignment:
Q  63 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24334145 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 24334244  T
Q  163 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              ||||||||||||||||  ||        ||||    
T  24334245 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaa----catt 24334340  T
Q  249 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  24334341 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacc 24334438  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24334439 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 24334535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 5472949 - 5473347
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5472949 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 5473048  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||        
T  5473049 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac---- 5473144  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5473145 aaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa---cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 5473241  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5473242 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5473341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8283767 - 8283358
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8283767 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 8283668  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||           ||||||||||| |||||||         
T  8283667 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtac---aa 8283571  T
Q  242 nnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt--------gaaagcaaacc 331  Q
       ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||        |||||||||||    
T  8283570 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacc 8283471  T
Q  332 tgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  8283470 tgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctg 8283371  T
Q  432 tggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||    
T  8283370 tggtcaatggcaa 8283358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249098
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||           |||||||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttc 18248882  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||  |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| |||| ||||| |    
T  18248883 aaagctacatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--cctttggtctattttgaa 18248976  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  18248977 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 18249076  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18249077 gatagtctgtggtcaatggcaa 18249098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 48471889 - 48472291
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48471889 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatgga 48471988  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||||||||| |||         
T  48471989 gtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----a 48472084  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgag 335  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     | || |||||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48472085 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaa--ctttctgtctattttgaaaagcaaacctgag 48472182  T
Q  336 caacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 435  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48472183 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 48472282  T
Q  436 caatggcaa 444  Q
    |||||||||    
T  48472283 caatggcaa 48472291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 32445115 - 32445505
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445115 tgctcgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 32445214  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||| ||| |||        
T  32445215 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatac---- 32445310  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  32445311 aaaacattttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttg--------aaaagcaaacctgagcaaca 32445402  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32445403 gggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 32445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15735393 - 15735000
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15735393 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 15735294  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc----------tactttcaaagctatgtacnnnnnn 242  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||          ||||||||||| |||||||          
T  15735293 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttactttcaaagttatgtac---aaa 15735197  T
Q  243 nncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
      ||||| | ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||    
T  15735196 aacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 15735103  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15735102 gggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 15735004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 444
Target Start/End: Original strand, 28345143 - 28345530
Alignment:
Q  63 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28345143 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 28345242  T
Q  163 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttct 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||          |||| |||||||||||| |||        |||||||     
T  28345243 cggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatac----aaatcattttcc 28345338  T
Q  253 ttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttg-aaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattc 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28345339 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 28345436  T
Q  351 aaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  28345437 aaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaatggcaa 28345530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28110276 - 28109851
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28110276 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 28110177  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctc 217  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             ||    
T  28110176 tccaagctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttc 28110077  T
Q  218 tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaac----atcttgaaaattgaaaaagttttttgt 313  Q
    ||||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||   |||||||    
T  28110076 tactttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaa--ctttttgt 28109983  T
Q  314 ctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggc 412  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28109982 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggt 28109883  T
Q  413 tcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  28109882 tctcctccaagataatctgtggtcaatggcaa 28109851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 51787984 - 51788382
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51787984 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 51788083  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  51788084 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaat 51788183  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
        |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  51788184 ----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 51788277  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  51788278 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 51788377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 35886709 - 35887120
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35886709 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaa 35886808  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||    
T  35886809 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 35886908  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    |||||||||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||      
T  35886909 caaagctatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tttga 35886998  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  35886999 aaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaac-gaacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 35887097  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35887098 ggatagtctgtggtcaatggcaa 35887120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 4689596 - 4690005
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4689596 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4689695  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc----------tactttc 224  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||          |||||||    
T  4689696 gcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttactttc 4689795  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
     ||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |    
T  4689796 taagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttg--------aa 4689884  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||  ||| | ||||    
T  4689885 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcagattctcctccag 4689983  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4689984 gatagtctgtggtcaatggcaa 4690005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 6207845 - 6208256
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6207845 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 6207944  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctctactt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||             |||||||    
T  6207945 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 6208044  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 320  Q
    |||||||||| |||        ||||||| ||||| | || |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||     
T  6208045 tcaaagctatatac----aaaacattttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tttg 6208133  T
Q  321 gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 420  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6208134 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 6208232  T
Q  421 aggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  6208233 aggatggtctgtggtcaatggcaa 6208256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 18231155 - 18231553
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  18231155 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtgga 18231254  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||           ||||||||||||||||| |||         
T  18231255 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatac----a 18231350  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  18231351 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 18231448  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  18231449 agggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 18231548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570746
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||            |||| ||||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctattttcttctattttc 20570962  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||| |||        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||| | ||||| |    
T  20570961 aaagctatatac----aaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaa 20570868  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | ||||    
T  20570867 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccag 20570768  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20570767 gatagtctgtggtcaatggcaa 20570746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 5658074 - 5658491
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658074 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5658173  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatac--atcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc----------- 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||               
T  5658174 ccaagctttgtaaatccgtggagtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttccttt 5658273  T
Q  218 tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtct 315  Q
    ||||||||| | |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          
T  5658274 tactttcaacgttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtttt------ 5658364  T
Q  316 gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 415  Q
     |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||    ||| ||||||||| |||    
T  5658365 -tttgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgttacaagcaggttct 5658462  T
Q  416 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||    
T  5658463 cctcaaggatagtctgtggtcaatggcaa 5658491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 17970726 - 17970613
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17970726 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 17970628  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  17970627 gaaaagaatttattg 17970613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 5473385 - 5473499
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5473385 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 5473483  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  5473484 ttgaaaagaatttatt 5473499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 8283320 - 8283206
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8283320 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 8283222  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  8283221 ttgaaaagaatttatt 8283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 29658830 - 29658716
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29658830 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 29658732  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  29658731 ttgaaaagaatttatt 29658716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 32445547 - 32445661
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32445547 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaacccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 32445645  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  32445646 ttgaaaagaatttatt 32445661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 48472329 - 48472443
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48472329 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 48472427  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  48472428 ttgaaaagaatttatt 48472443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 22381443 - 22381330
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22381443 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgttggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 22381345  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
    |||||||||||||||    
T  22381344 atgaaaagaatttat 22381330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 5020112 - 5020224
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  5020112 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 5020210  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  5020211 gaaaagaatttatt 5020224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 10649471 - 10649583
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10649471 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 10649569  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  10649570 gaaaagaatttatt 10649583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 21681100 - 21681212
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21681100 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 21681198  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  21681199 gaaaagaatttatt 21681212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 51788421 - 51788533
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  51788421 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 51788519  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  51788520 gaaaagaatttatt 51788533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 4340538 - 4340424
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4340538 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgaggca 4340440  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  4340439 ttgaaaagaatttatt 4340424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 4630182 - 4630296
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4630182 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 4630280  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     | |||||||||||||    
T  4630281 ttaaaaagaatttatt 4630296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 4790495 - 4790381
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4790495 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 4790397  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  4790396 ttgaaaagaatttatt 4790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 16422582 - 16422696
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16422582 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacctgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 16422680  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  16422681 atgaaaagaatttatt 16422696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18286217 - 18286103
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18286217 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 18286119  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  18286118 ttgaaaagaatttatt 18286103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18301518 - 18301404
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18301518 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 18301420  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  18301419 ttgaaaagaatttatt 18301404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 20072433 - 20072547
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20072433 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 20072531  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  20072532 ttgaaaagaatttatt 20072547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22864710 - 22864596
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22864710 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggatcgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 22864612  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  22864611 ttgaaaagaatttatt 22864596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22879769 - 22879655
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22879769 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggatcgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 22879671  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  22879670 ttgaaaagaatttatt 22879655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31030106 - 31029992
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31030106 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattggcaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 31030008  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  31030007 ttgaaaagaatttatt 31029992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 483 - 597
Target Start/End: Original strand, 7079626 - 7079739
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaa 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7079626 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggtggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcat 7079724  T
Q  583 tgaaaagaatttatt 597  Q
    |||||||||||||||    
T  7079725 tgaaaagaatttatt 7079739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 8218036 - 8218149
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  8218036 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 8218134  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  8218135 gaaaagaatttattg 8218149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 10402548 - 10402661
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  10402548 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 10402646  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  10402647 gaaaagaatttattg 10402661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 6536603 - 6536491
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6536603 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 6536505  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||| ||||| ||||    
T  6536504 gaatagaatctatt 6536491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 11104222 - 11104110
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11104222 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacctgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 11104124  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  11104123 gaaaagaatttatt 11104110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 4690043 - 4690157
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4690043 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 4690141  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  4690142 ttgaaaagaatttatt 4690157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15734975 - 15734861
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15734975 aggctcgctaagttgaaaacccagaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 15734877  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  15734876 ttgaaaagaatttatt 15734861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15886603 - 15886489
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15886603 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggct 15886505  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  15886504 ttgaaaagaatttatt 15886489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16618364 - 16618251
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16618364 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagtttaggcaaaaatggggca 16618266  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16618265 atgaaaa-aatttatt 16618251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17978810 - 17978696
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17978810 aggctcgctaagttgaaaacccgaaaggacggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 17978712  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  17978711 ttgaaaagaacttatt 17978696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 29142616 - 29142502
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29142616 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcatcccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 29142518  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  29142517 ttgaaaagaatttatt 29142502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Original strand, 35887158 - 35887271
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35887158 aggctcgctaagttgaaaatccgaaagggcggcttacgcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 35887256  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
     ||||||||||||||    
T  35887257 ttgaaaagaatttat 35887271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 4423318 - 4423430
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  4423318 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggtatt 4423416  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  4423417 gaaaagaatttatt 4423430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 5603173 - 5603061
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5603173 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 5603075  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||    
T  5603074 aaaaagaatttatt 5603061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 263 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15886814 - 15886641
Alignment:
Q  263 ataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacat 361  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  15886814 ataatgacaaatgctcgaagcaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga--------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-cat 15886724  T
Q  362 gcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  15886723 gcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcccggatagtctgtggtcaatggcaa 15886641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15887027 - 15886894
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aatattaccattt 129  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15887027 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 15886928  T
Q  130 tccaagctttgt-aaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15886927 tccaagctttgtaaaatccgtggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 28027689 - 28027801
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  28027689 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 28027787  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  28027788 gaaaagaatttatt 28027801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 28109811 - 28109699
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28109811 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcacctcgctggattgacaccccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 28109713  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  28109712 gaaaagaatttatt 28109699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 28345570 - 28345682
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28345570 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 28345668  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||    
T  28345669 aaaaagaatttatt 28345682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31958315 - 31958203
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31958315 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 31958217  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||    
T  31958216 aaaaagaatttatt 31958203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 5590219 - 5590105
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5590219 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 5590121  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  5590120 ttgaaaagaatttatt 5590105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 5658529 - 5658643
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658529 aggctcactaagttgaaaacccagaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 5658627  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  5658628 ttgaaaagaatttatt 5658643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 5717467 - 5717581
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5717467 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 5717565  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  5717566 ttgaaaagaatttatt 5717581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 5728377 - 5728491
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5728377 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 5728475  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  5728476 ttgaaaagaatttatt 5728491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 5763991 - 5763877
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5763991 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 5763893  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  5763892 ttgaaaagaatttatt 5763877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 581
Target Start/End: Original strand, 6208295 - 6208393
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6208295 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 6208393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 18057661 - 18057775
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18057661 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaag-gagcaccccgctggagtgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 18057759  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  18057760 ttgaaaagaatttatt 18057775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 18231591 - 18231705
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18231591 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgaggca 18231689  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  18231690 ttgaaaagaacttatt 18231705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 47029852 - 47029966
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47029852 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 47029950  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  47029951 ttgaaaagaatttatt 47029966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 18249137 - 18249249
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  18249137 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattaataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 18249235  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  18249236 gaaaagaatttatt 18249249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 24334575 - 24334687
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24334575 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgaaaacccgaaggggcagttcaggcaaaaatggggcatt 24334673  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||    
T  24334674 aaaaagaatttatt 24334687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 18337020 - 18337135
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18337020 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 18337118  T
Q  582 at-gaaaagaatttatt 597  Q
     |  |||||||||||||    
T  18337119 ttaaaaaagaatttatt 18337135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 20570705 - 20570602
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20570705 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaat 20570607  T
Q  584 gaaaa 588  Q
     ||||    
T  20570606 aaaaa 20570602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 581
Target Start/End: Original strand, 4728026 - 4728124
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4728026 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 4728124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 32297028 - 32297142
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32297028 aggctcgctaagttaaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 32297126  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  32297127 ttgaaaagaatttatt 32297142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Original strand, 8002522 - 8002607
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctt 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8002522 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27560763 - 27560722
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27560763 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 27560722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18904220 - 18904179
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18904220 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa 18904179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Original strand, 72518 - 72565
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  72518 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaaatgagc 72565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Original strand, 17931128 - 17931218
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   | || ||| |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  17931128 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcatcctggtggactgaaaacccgaaagggcaatccaggcaaaaat 17931218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 526
Target Start/End: Original strand, 4453039 - 4453081
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 526  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4453039 gctcactaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa 4453081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 588
Target Start/End: Original strand, 19700908 - 19700953
Alignment:
Q  543 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 588  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19700908 ttgacaacccgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaatcaaaa 19700953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15581050 - 15581010
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15581050 aggctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15581010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5947726 - 5947688
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5947726 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 5947688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 6199974 - 6200012
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6199974 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 6200012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 8621987 - 8622025
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8621987 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 8622025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 8810060 - 8810098
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8810060 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 8810098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15531852 - 15531814
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15531852 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15531814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 15921802 - 15921840
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15921802 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15921840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 46383679 - 46383717
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46383679 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 46383717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 46395215 - 46395177
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46395215 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 46395177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23283814 - 23283773
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  23283814 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 23283773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 575
Target Start/End: Original strand, 25268909 - 25268994
Alignment:
Q  490 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  25268909 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 25268994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 30091549 - 30091508
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  30091549 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 30091508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9550016 - 9549968
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  9550016 ggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaagaatgagc 9549968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 10847557 - 10847979
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10847557 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 10847656  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||               
T  10847657 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctgaaactctattttctctcta 10847756  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa-agttttttgtctgtt 318  Q
    |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10847757 ctttcaaagctatgtacaaaaaaa-cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgtt 10847855  T
Q  319 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  10847856 ttgaaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggctcttcc 10847953  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10847954 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 10847979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 42 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16444156 - 16443746
Alignment:
Q  42 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgt 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16444156 gaagcttatgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16444057  T
Q  142 aaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc-----------aaagct 230  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||           ||||||    
T  16444056 aaatccgtggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagct 16443957  T
Q  231 atgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaac 330  Q
    ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16443956 atgtacaaaaaa--cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattttgaaagcaaac 16443860  T
Q  331 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 430  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443859 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 16443760  T
Q  431 gtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||    
T  16443759 gtggtcaatggcaa 16443746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 16047289 - 16047706
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16047289 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16047388  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactt-------- 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||            
T  16047389 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 16047488  T
Q  223 ---tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
       ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||    
T  16047489 ctgtcaaagctatgtacaaaa-----attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaa--gtttttgtctattt 16047581  T
Q  320 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16047582 tgaaagcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccc 16047681  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16047682 cgggatagtctgtggtcaatggcaa 16047706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 2160544 - 2160966
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2160544 catcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 2160643  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||               
T  2160644 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttccttttta 2160743  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2160744 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattt 2160840  T
Q  320 t-gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2160841 ttgaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 2160940  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2160941 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 2160966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 5154058 - 5154477
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5154058 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5154157  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||    
T  5154158 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 5154257  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||    
T  5154258 ctttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattt 5154351  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  5154352 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcct 5154451  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5154452 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 5154477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26269247 - 26268828
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26269247 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26269148  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||||    
T  26269147 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttc 26269048  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 320  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  26269047 aaagctatgtac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttt 26268953  T
Q  321 g-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  26268952 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 26268853  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26268852 caggatagtctgtggtcaatggcaa 26268828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11418937 - 11418522
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11418937 tcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11418838  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctac-----------tttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||||    
T  11418837 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttc 11418738  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||| ||||||||||| |    
T  11418737 aaagctatatac----aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttctgtctgttttgaa 11418644  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||||    
T  11418643 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccag 11418544  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11418543 gatagtctgtggtcaatggcaa 11418522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5141498 - 5141077
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5141498 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5141399  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctcta 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  5141398 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 5141299  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    ||||||||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  5141298 ctttcaaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattt 5141204  T
Q  320 tg--aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  5141203 tgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcc 5141104  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  5141103 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 5141077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24586698 - 24586278
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24586698 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 24586599  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||              
T  24586598 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgtttaagactctatttttcttct 24586499  T
Q  220 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
     ||||||||||||| |||        ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  24586498 actttcaaagctatatacaaaa----cattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 24586405  T
Q  319 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  24586404 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 24586305  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  24586304 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 24586278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 26518772 - 26519185
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26518772 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26518871  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          |||| |||||    
T  26518872 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttca 26518971  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaa 324  Q
    ||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||    
T  26518972 aagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaa 26519065  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  26519066 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 26519165  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26519166 tagtctgtggtcaatggcaa 26519185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 5164363 - 5164778
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5164363 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5164462  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           |||||||||    
T  5164463 ctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 5164562  T
Q  225 aaag-ctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||| |||| |||        |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |    
T  5164563 aaagcctatatac----aaaacattttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaa 5164656  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  5164657 aagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 5164756  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5164757 gatagtctgtggtcaatggcaa 5164778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16745684 - 16745263
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16745684 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16745585  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctcta 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  16745584 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 16745485  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| |    
T  16745484 ctttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctat 16745391  T
Q  318 tttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  16745390 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaagttctc 16745291  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  16745290 cttcaggatagtctgtggtcaatggcaa 16745263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 2779247 - 2779640
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779247 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 2779346  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  2779347 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 2779442  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||    
T  2779443 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 2779536  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  2779537 gggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtcaatg 2779636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 42 - 444
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441648
Alignment:
Q  42 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgt 141  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  142 aaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttg-ttggaaactc------------tactttcaaag 228  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||            |||||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaag 26441437  T
Q  229 ctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagca 327  Q
    |||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||    
T  26441438 ctatatac----aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagca 26441531  T
Q  328 aacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatag 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  26441532 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 26441631  T
Q  428 tctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||    
T  26441632 tctgtggtcaatggcaa 26441648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 31129900 - 31130293
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129900 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31129999  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  31130000 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 31130095  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||    
T  31130096 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 31130189  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  31130190 gggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggtcaatg 31130289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 45737296 - 45737697
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737296 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 45737395  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  45737396 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 45737491  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagc 336  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45737492 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 45737589  T
Q  337 aacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 436  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  45737590 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtc 45737689  T
Q  437 aatggcaa 444  Q
    ||||||||    
T  45737690 aatggcaa 45737697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 63 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4139378 - 4138988
Alignment:
Q  63 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4139378 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 4139279  T
Q  163 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  4139278 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 4139183  T
Q  249 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4139182 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 4139085  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  4139084 ttcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaatggcaa 4138988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447282
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttca 11447066  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||   ||||||||| ||||| |    
T  11447067 aagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 11447160  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||    
T  11447161 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 11447260  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11447261 gatagtctgtggtcaatggcaa 11447282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26314011 - 26313592
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26314011 catcttcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 26313912  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||    
T  26313911 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 26313812  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
     |||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||    
T  26313811 ttttcaaagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattt 26313718  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  26313717 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 26313618  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  26313617 ccaagataatctgtggtcaatggcaa 26313592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31558535 - 31558137
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558535 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31558436  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  31558435 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 31558340  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31558339 aatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 31558242  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  31558241 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaat 31558142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26509860 - 26509438
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26509860 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 26509761  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             ||    
T  26509760 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttc 26509661  T
Q  218 tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |    
T  26509660 tactttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattg-aaaacctttttgtctat 26509566  T
Q  318 tttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||     
T  26509565 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatacatgtcacaagcaggacctc 26509466  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||  | | ||||||||||||||||||    
T  26509465 ccccgaggtggtctgtggtcaatggcaa 26509438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26679246 - 26678847
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26679246 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26679147  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  26679146 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26679047  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26679046 a----cattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 26678953  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    |  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  26678952 cggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 26678853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31084786 - 31084366
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31084786 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 31084687  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctct 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||            |||    
T  31084686 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttttcttct 31084587  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    |||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||| |    
T  31084586 actttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattg--aaatttttttgtctat 31084493  T
Q  318 tttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  31084492 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 31084393  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggca 443  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31084392 ctccaagataatctgtggtcaatggca 31084366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 4205363 - 4205783
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4205363 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 4205462  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||    
T  4205463 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 4205562  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttg-aaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
     |||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    |||||||| ||    
T  4205563 ttttcaaagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaa--ccttttgtctatt 4205656  T
Q  319 ttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  4205657 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 4205756  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||    
T  4205757 tccaagataatctgtggtcaatggcaa 4205783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26664054 - 26663655
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26664054 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26663955  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  26663954 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26663855  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26663854 a----cattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 26663761  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    |  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26663760 cggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggtcaa 26663661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10911078 - 10910669
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  10911078 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaag 10910979  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||||    
T  10910978 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 10910879  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
    |||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |    
T  10910878 aaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttg--------aa 10910790  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  10910789 aagcaaacctgagcaacatggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 10910691  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10910690 gatagtctgtggtcaatggcaa 10910669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Original strand, 45393205 - 45393613
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  45393205 aagcttatgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 45393304  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||           ||||||||||||||||    
T  45393305 aatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagcta 45393404  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaa 329  Q
    |  ||        ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  45393405 tacac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaa 45393498  T
Q  330 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||  |||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  45393499 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtc 45393598  T
Q  430 tgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||    
T  45393599 tgtggtcaatggcaa 45393613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39207280 - 39206882
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39207280 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 39207181  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  39207180 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaat 39207081  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 339  Q
        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  39207080 ----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 39206987  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  39206986 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 39206887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 440
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451709
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttca 225  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||           ||||||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttca 3451496  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||   ||||||||| |||||     
T  3451497 aagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttga 3451590  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  3451591 aaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcaggttctcctcca 3451690  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  3451691 ggatagtatgtggtcaatg 3451709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16512597 - 16512183
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512597 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16512498  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||           ||    
T  16512497 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 16512398  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||         |    
T  16512397 ctttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagtt---------t 16512310  T
Q  318 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |    
T  16512309 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcc 16512210  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16512209 tccaggatagtctgtgatcaatggcaa 16512183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 143 - 444
Target Start/End: Original strand, 26595754 - 26596064
Alignment:
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagc 229  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||    
T  26595754 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagc 26595853  T
Q  230 tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gca 327  Q
    ||| |||        |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||    
T  26595854 tatatacaaca----cattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagca 26595947  T
Q  328 aacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatag 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  26595948 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatag 26596047  T
Q  428 tctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||    
T  26596048 tctgtggtcaatggcaa 26596064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26268788 - 26268676
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26268788 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 26268690  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  26268689 gaaaagaatttatt 26268676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26313552 - 26313440
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26313552 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 26313454  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  26313453 gaaaagaatttatt 26313440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 45393653 - 45393765
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45393653 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 45393751  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  45393752 gaaaagaatttatt 45393765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 45737735 - 45737849
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45737735 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 45737833  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  45737834 ttgaaaagaatttatt 45737849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 4138948 - 4138835
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4138948 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttgggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 4138850  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  4138849 gaaaagaatttattg 4138835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 16047747 - 16047859
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16047747 gctcgccaagttgaaaacccgaaagggcaacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaat 16047845  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  16047846 gaaaagaatttatt 16047859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 26519225 - 26519337
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26519225 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 26519323  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  26519324 gaaaagaatttatt 26519337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 5154515 - 5154629
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5154515 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 5154613  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  5154614 ttgaaaagaatttatt 5154629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10910631 - 10910517
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10910631 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 10910533  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  10910532 ttgaaaagaatttatt 10910517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 11418484 - 11418370
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11418484 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagtccaggcaaaaatggggca 11418386  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  11418385 ttgaaaagaatttatt 11418370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16512145 - 16512031
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16512145 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttagg-aaaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatcgggca 16512047  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  16512046 atgaaaagaatttatt 16512031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 31130331 - 31130445
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31130331 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 31130429  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||| ||||||||||    
T  31130430 ttgaagagaatttatt 31130445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31558099 - 31557985
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31558099 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 31558001  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||| ||||||||||    
T  31558000 ttgaagagaatttatt 31557985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 4205823 - 4205935
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4205823 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaccccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 4205921  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  4205922 gaaaagaatttatt 4205935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 10848019 - 10848131
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  10848019 gctcgctcagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcggttcacgcaaaaatggggcaat 10848117  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  10848118 gaaaagaatttatt 10848131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 482 - 594
Target Start/End: Original strand, 5164816 - 5164927
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5164816 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggca 5164914  T
Q  582 atgaaaagaattt 594  Q
    |||||||||||||    
T  5164915 atgaaaagaattt 5164927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 22152547 - 22152662
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccg-aaagggcagttcaggcgaaaatggggc 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22152547 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaaagggcagttcaggcaaaaatggggc 22152645  T
Q  581 aatgaaaagaatttatt 597  Q
    | |||||||||||||||    
T  22152646 attgaaaagaatttatt 22152662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 22208462 - 22208577
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccg-aaagggcagttcaggcgaaaatggggc 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22208462 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaaagggcagttcaggcaaaaatggggc 22208560  T
Q  581 aatgaaaagaatttatt 597  Q
    | |||||||||||||||    
T  22208561 attgaaaagaatttatt 22208577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 5141039 - 5140925
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5141039 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcacctcgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 5140941  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     || ||||||||||||    
T  5140940 ttggaaagaatttatt 5140925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16443708 - 16443594
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16443708 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcagtttaggcaaaaatggggca 16443610  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    |  |||||||||||||    
T  16443609 agcaaaagaatttatt 16443594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16745225 - 16745111
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16745225 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcggttcaggcaaaaatggggca 16745127  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  16745126 ttgaaaagaatttatt 16745111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24586240 - 24586126
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24586240 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 24586142  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  24586141 ttgaaaagaacttatt 24586126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 11447322 - 11447434
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  11447322 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggtaaaaatggggcatt 11447420  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    | ||||||||||||    
T  11447421 ggaaagaatttatt 11447434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 39206843 - 39206731
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  39206843 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 39206745  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  39206744 gaaaagaatttatt 39206731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 593
Target Start/End: Original strand, 2161004 - 2161114
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2161004 aggctcgctaagttgaaaacccagaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 2161102  T
Q  582 atgaaaagaatt 593  Q
     |||||||||||    
T  2161103 ttgaaaagaatt 2161114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26663617 - 26663503
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26663617 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 26663519  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  26663518 ttgaaaagaatttatt 26663503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26678809 - 26678695
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26678809 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 26678711  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  26678710 ttgaaaagaatttatt 26678695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31084327 - 31084213
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31084327 aggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 31084229  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||| ||||    
T  31084228 ttgaaaagaatctatt 31084213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 26596102 - 26596216
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26596102 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttagacaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 26596200  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  26596201 ttgaaaagaatttatt 26596216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 483 - 597
Target Start/End: Original strand, 2779679 - 2779792
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaa 582  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  2779679 ggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggaagttcaggcaaaaatggggcat 2779777  T
Q  583 tgaaaagaatttatt 597  Q
    |||||||||||||||    
T  2779778 tgaaaagaatttatt 2779792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26532011 - 26531926
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctt 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26532011 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26509400 - 26509286
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaa-cccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggc 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26509400 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcgacttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaaccccaaaagggtagttcaggcaaaaatggggc 26509302  T
Q  581 aatgaaaagaatttatt 597  Q
    || ||||||||| ||||    
T  26509301 aa-gaaaagaatctatt 26509286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 482 - 578
Target Start/End: Original strand, 3451751 - 3451846
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggg 578  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  3451751 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcgatccaggcaaaaatggg 3451846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 484 - 588
Target Start/End: Original strand, 26441688 - 26441791
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26441688 gctcgctaagttgaaaacccgaaagaacgacttaggcaaaa-atgagcacctcgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaat 26441786  T
Q  584 gaaaa 588  Q
     ||||    
T  26441787 aaaaa 26441791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 1890352 - 1890269
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1890352 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggc 1890269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27971455 - 27971370
Alignment:
Q  490 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27971455 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 27971370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4943094 - 4943003
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  4943094 gctcgctaagtcgaaaaccctaaagggcggcttaagccaaaaacgagcgtcccggtggattgagaacccgaaaaggcagtccaggcaaaaat 4943003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Original strand, 9472637 - 9472727
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  9472637 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaacaaa-gagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 9472727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Original strand, 13836690 - 13836737
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  13836690 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 13836737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Original strand, 27439558 - 27439649
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27439558 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggtttaagccaaaaatgagcgtcccgatggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 27439649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Original strand, 38409027 - 38409074
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  38409027 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 38409074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 8815980 - 8816018
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8815980 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 8816018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15768650 - 15768612
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15768650 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15768612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 23881305 - 23881267
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23881305 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 23881267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 29027283 - 29027341
Alignment:
Q  120 attaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactc 178  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  29027283 attaccattttccaaacttttaaaatccgtggaaccacgcctttggcagaccaccactc 29027341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 30366714 - 30366676
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30366714 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 30366676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 42632980 - 42632942
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42632980 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 42632942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 25092 - 25520
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25092 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 25191  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||          
T  25192 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttgaaactctactttctttcta 25291  T
Q  225 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa-----agttttttgtc 314  Q
         ||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  25292 ctttcaaagctatgtacgaaaaaa-cattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtc 25390  T
Q  315 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25391 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 25490  T
Q  415 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25491 ttccccaggatagtctgtggccaatggcaa 25520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 25557 - 25671
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25557 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 25655  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  25656 atgaaaagaatttatt 25671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15276909 - 15276486
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15276909 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 15276810  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctcta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||           |||||    
T  15276809 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctctcta 15276710  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg-aaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  15276709 ctttcaaagctatgtac--aaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgtt 15276612  T
Q  319 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15276611 ttgaaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttcc 15276512  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15276511 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 15276486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 1906240 - 1906665
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1906240 catcttcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 1906339  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctact--------- 221  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||             
T  1906340 ccaagctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctactatctttcta 1906439  T
Q  222 --ttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
      |||||||| ||||||        |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1906440 ctttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctatt 1906539  T
Q  319 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1906540 ttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcc 1906639  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1906640 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 1906665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15380515 - 15380095
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15380515 catcttcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 15380416  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  15380415 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 15380316  T
Q  225 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
         ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15380315 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaa-ttaaaaaagttttt-gtctgttt 15380220  T
Q  320 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15380219 tgaaagcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 15380120  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  15380119 caggatagtctgtggccaatggcaa 15380095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 15233804 - 15234228
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15233804 catcttcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 15233903  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||           ||||    
T  15233904 ccaagctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 15234003  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag----ttttttgtct 315  Q
    |||||||||||||||||         | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  15234004 ctttcaaagctatgtacaaaaa----aatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtct 15234099  T
Q  316 gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 415  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15234100 attttgaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttct 15234199  T
Q  416 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234200 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 15234228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 60 - 444
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674269
Alignment:
Q  60 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  160 cttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||||||||||| ||||||         |||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaat--att 1674074  T
Q  249 ttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1674075 ttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaagcaaacttgagcaacagggtaca 1674174  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1674175 ttcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtggtcaatggcaa 1674269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39857043
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||          ||||||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactcttttttcttctactttca 39856829  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaa 324  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||    
T  39856830 aagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaa 39856923  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  39856924 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 39857023  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39857024 tagtctgtggtcaatggcaa 39857043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 54839379 - 54839798
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54839379 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 54839478  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||    
T  54839479 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaactctattttcttctac 54839578  T
Q  221 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    |||||||||||| |||        ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  54839579 tttcaaagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattt 54839672  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  54839673 tgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 54839772  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  54839773 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 54839798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 14104554 - 14104950
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14104554 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 14104653  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnnnn 242  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||           |||||||||||||| |||          
T  14104654 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaa-- 14104751  T
Q  243 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaa 341  Q
      |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  14104752 --cattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 14104847  T
Q  342 ggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatgg 441  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14104848 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatgg 14104947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27157586 - 27157169
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27157586 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27157487  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactt 222  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              |||||||    
T  27157486 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 27157387  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  27157386 tcaaagctatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 27157292  T
Q  323 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  27157291 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 27157192  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27157191 ggatagtctgtggtcaatggcaa 27157169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20332678 - 20332279
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20332678 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 20332579  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  20332578 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 20332479  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20332478 at----attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 20332385  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20332384 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 20332285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40099892 - 40099493
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40099892 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 40099793  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  40099792 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 40099693  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40099692 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 40099599  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  40099598 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 40099499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 30759775 - 30760170
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30759775 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30759874  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnnn 243  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          |||| |||||||||||| |||           
T  30759875 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatac----aaa 30759970  T
Q  244 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaag 342  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30759971 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30760068  T
Q  343 gtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggc 442  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30760069 gtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggc 30760168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33668055 - 33667660
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33668055 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33667956  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnnn 243  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          |||| |||||||||||| |||           
T  33667955 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatac----aaa 33667860  T
Q  244 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaag 342  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  33667859 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 33667762  T
Q  343 gtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggc 442  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33667761 gtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggc 33667662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14753749 - 14753351
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753749 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14753650  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  14753649 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 14753554  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  14753553 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaa 14753456  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  14753455 cagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 14753357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 441
Target Start/End: Original strand, 6575850 - 6576259
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6575850 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 6575949  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||    
T  6575950 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 6576049  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       | |||    
T  6576050 ctttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------tcttt 6576138  T
Q  320 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  6576139 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 6576237  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatgg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6576238 caggatagtctgtggtcaatgg 6576259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34183218 - 34182821
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183218 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34183119  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||||||||| |||        
T  34183118 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---- 34183023  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34183022 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa---cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 34182926  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  34182925 cagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggtcaa 34182827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24586634 - 24586218
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24586634 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 24586535  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactt 222  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             |||||||    
T  24586534 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactt 24586435  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  24586434 tcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 24586341  T
Q  323 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  24586340 aaagcaaacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 24586241  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24586240 ggatagtctgtggtcaatggcaa 24586218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012286
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctacttt 223  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||           ||||||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctacttt 5012069  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    ||||||||| |||        |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||||| |||||     
T  5012070 caaagctatatac----aaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaatt--aaaaactttttgtctattttga 5012163  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  5012164 aaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 5012263  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5012264 ggatagtctgtggtcaatggcaa 5012286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794474
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 18794690  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||| |||        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |    
T  18794689 aaagctatatac----aaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaa 18794596  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  18794595 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 18794496  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18794495 gatagtctgtggtcaatggcaa 18794474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 5700549 - 5700948
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtg 150  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5700549 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 5700648  T
Q  151 gagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||||||||||| |||        
T  5700649 gagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaagctatatac---- 5700744  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5700745 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaatt--aaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaa 5700842  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5700843 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5700942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Original strand, 21975704 - 21976112
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21975704 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 21975803  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||           ||||||||||||||    
T  21975804 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 21975903  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaac 330  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||    
T  21975904 tatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaac 21975998  T
Q  331 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 430  Q
    | |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21975999 ccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 21976098  T
Q  431 gtggtcaatggcaa 444  Q
     |||||||||||||    
T  21976099 atggtcaatggcaa 21976112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36338774 - 36338383
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36338774 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 36338675  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||||||||| |||        
T  36338674 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---- 36338579  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||    
T  36338578 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 36338486  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36338485 gggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 36338387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31120776 - 31120367
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  31120776 aagcttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtg 31120677  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||    
T  31120676 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 31120577  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacc 331  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | | |||  ||||||||||    
T  31120576 tatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacc 31120480  T
Q  332 tgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctg 431  Q
     |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  31120479 cgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctg 31120380  T
Q  432 tggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||    
T  31120379 tggtcaatggcaa 31120367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 24118672 - 24119070
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118672 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24118771  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  24118772 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatac---- 24118867  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24118868 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaatt--aaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaa 24118965  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||  | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  24118966 cagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtccgtggtcaa 24119064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 17019045 - 17019456
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17019045 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaa 17019144  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc---------- 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||              
T  17019145 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 17019244  T
Q  225 --aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
      ||||||||||||        ||||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||      
T  17019245 caaaagctatgtac---aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagtttt-------tttga 17019334  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  17019335 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 17019433  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17019434 ggatagtctgtggtcaatggcaa 17019456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 14671009 - 14671421
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14671009 tcatcaaaagctcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14671108  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 223  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||           ||||||    
T  14671109 gctttgtaaatccgtggagttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 14671208  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    ||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||      
T  14671209 caaagttatgtac---aagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tttga 14671298  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | | |    
T  14671299 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcta 14671398  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14671399 ggatagtctgtggtcaatggcaa 14671421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 133 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324174
Alignment:
Q  133 aagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctact 221  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 36324385  T
Q  222 ttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    ||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||      
T  36324384 ttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-------tttga 36324296  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | |||    
T  36324295 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctcca 36324197  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36324196 ggatagtctgtggtcaatggcaa 36324174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 1906705 - 1906820
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1906705 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaacgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 1906804  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  1906805 atgaaaagaatttatt 1906820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15380057 - 15379943
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15380057 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 15379959  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  15379958 atgaaaagaatttatt 15379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 30760210 - 30760322
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30760210 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 30760308  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  30760309 gaaaagaatttatt 30760322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 33667620 - 33667508
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33667620 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 33667522  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  33667521 gaaaagaatttatt 33667508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 482 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 14753313 - 14753198
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14753313 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 14753215  T
Q  582 atgaaaagaatttattg 598  Q
     ||||||||||||||||    
T  14753214 ttgaaaagaatttattg 14753198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 14671459 - 14671573
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14671459 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 14671557  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  14671558 ttgaaaagaatttatt 14671573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 17019495 - 17019609
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17019495 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggaaaaaatggggca 17019593  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  17019594 ttgaaaagaatttatt 17019609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 24119108 - 24119222
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24119108 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 24119206  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  24119207 ttgaaaagaatttatt 24119222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 39857081 - 39857195
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39857081 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagtccaggcaaaaatggggca 39857179  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  39857180 ttgaaaagaatttatt 39857195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 6576303 - 6576416
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  6576303 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 6576401  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  6576402 gaaaagaatttattg 6576416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 5700988 - 5701100
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||      
T  5700988 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatg 5701086  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  5701087 gaaaagaatttatt 5701100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 34182781 - 34182669
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34182781 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 34182683  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  34182682 gaaaagaatttatt 34182669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31120329 - 31120215
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31120329 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 31120231  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  31120230 ttgaaaagaacttatt 31120215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 54839837 - 54839951
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  54839837 aggctcgctaagttgagaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccggaagggcagttcaggcaaaaatggggca 54839935  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  54839936 ttgaaaagaatttatt 54839951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27157129 - 27157017
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  27157129 gctcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 27157031  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  27157030 gaaaagaatttatt 27157017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 5012324 - 5012438
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5012324 aggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagctcaggcaaaaatggggca 5012422  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  5012423 ttgaaaagaatttatt 5012438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 14104988 - 14105102
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14104988 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 14105086  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  14105087 ttgaaaagaatttatt 14105102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 15234266 - 15234380
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  15234266 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggtgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacgcgaaagggtagttcaggcaaaattggggca 15234364  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    | ||||||||||||||    
T  15234365 aggaaaagaatttatt 15234380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 21976150 - 21976264
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21976150 aggctcgctaagtcgaaaactcgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 21976248  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  21976249 ttgaaaagaacttatt 21976264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 40099455 - 40099341
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40099455 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 40099357  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  40099356 ttgaaaagaatttatt 40099341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 36324134 - 36324021
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat-ggggcaa 582  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  36324134 gctcgctaagttgagaacccgaaagggcgacctaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgggggcat 36324036  T
Q  583 tgaaaagaatttatt 597  Q
    |||||||||||||||    
T  36324035 tgaaaagaatttatt 36324021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 36338343 - 36338230
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat-ggggcaa 582  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  36338343 gctcgctaagttgagaacccgaaagggcgacctaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgggggcat 36338245  T
Q  583 tgaaaagaatttatt 597  Q
    |||||||||||||||    
T  36338244 tgaaaagaatttatt 36338230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15276446 - 15276334
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15276446 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctgaattgacatcctaaaagggcggttcaggcaaaaatggggcaat 15276348  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  15276347 gaaaagaatttatt 15276334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 18794434 - 18794331
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18794434 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaat 18794336  T
Q  584 gaaaa 588  Q
     ||||    
T  18794335 aaaaa 18794331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 1674307 - 1674421
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1674307 aggctcgctaagttgaaaaccctaaagggcgtcttagtcaaaaatt-agcactccgctggattgacaatccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 1674405  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  1674406 atgaaaagaatttatt 1674421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24586180 - 24586066
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaa-cccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggc 580  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24586180 aggctcgctaagtcgaagacccgaaagggcgacttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaaccccaaaagggtagttcaggcaaaaatggggc 24586082  T
Q  581 aatgaaaagaatttatt 597  Q
    || ||||||||| ||||    
T  24586081 aa-gaaaagaatctatt 24586066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20332241 - 20332128
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20332241 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccaaaagggtagttcaggcaaaaatggggca 20332143  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    | ||||||||| ||||    
T  20332142 a-gaaaagaatctatt 20332128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 496 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 1879001 - 1878928
Alignment:
Q  496 gaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 569  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  1879001 gaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaaagagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggc 1878928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 560
Target Start/End: Original strand, 9189178 - 9189254
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggc 560  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||  |||  | |||||| |||||||||||||    
T  9189178 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggtaaaaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggc 9189254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Original strand, 33184026 - 33184067
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33184026 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa 33184067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 568
Target Start/End: Original strand, 22709707 - 22709791
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcagg 568  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||  || ||||||||||||| |||||||    
T  22709707 gctcgccaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaaatgagcgtcccggtggaccgaaaacccgaaagggcggttcagg 22709791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8097902 - 8097855
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  8097902 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 8097855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Original strand, 20558764 - 20558805
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  20558764 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 20558805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 55791736 - 55791648
Alignment:
Q  486 tcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  55791736 tcgctaagttgaaaacctgaaaaggtggcttaggca-aaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 55791648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 88)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21697431 - 21697020
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21697431 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgta 21697332  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctact-----------ttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||||||||    
T  21697331 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagcta 21697232  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaac 330  Q
    |||||        |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21697231 tgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaagcaaac 21697134  T
Q  331 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21697133 ctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtct 21697034  T
Q  431 gtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||    
T  21697033 gtggtcaatggcaa 21697020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 27396298 - 27396728
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27396298 catcttcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 27396397  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||    
T  27396398 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 27396497  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg--------aaaaagtttttt 311  Q
    |||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  27396498 ctttcaaagctatgtac--aaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagtttttt 27396595  T
Q  312 gtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcagg 411  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27396596 gtcctttttgaaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 27396695  T
Q  412 ctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27396696 ctcttccccaggatagtctgtggccaatggcaa 27396728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19450694 - 19450265
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19450694 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 19450595  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 219  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||               
T  19450594 ccaagctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttgaaactctattttctctcta 19450495  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnn-cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt----tttttgtc 314  Q
    ||||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  19450494 ctttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtc 19450395  T
Q  315 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 414  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19450394 tgttttgaaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggctc 19450295  T
Q  415 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19450294 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 19450265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 12661519 - 12661933
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12661519 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12661618  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           |||||||||    
T  12661619 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 12661718  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  12661719 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaa 12661812  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  12661813 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 12661912  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12661913 atagtctgtggtcaatggcaa 12661933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 27809676 - 27810098
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27809676 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27809775  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac--------------t 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||               |    
T  27809776 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttctt 27809875  T
Q  217 ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 316  Q
    |||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||     
T  27809876 ctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtcta 27809969  T
Q  317 ttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27809970 ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttct 27810069  T
Q  416 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27810070 cctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 27810098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 27122505 - 27122918
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27122505 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27122604  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttca 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||          ||||||||||    
T  27122605 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttaaaactctattttcttctactttca 27122704  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga-aa 324  Q
    ||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||    
T  27122705 aagctatatac----aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgagaa 27122798  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  27122799 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 27122898  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27122899 tagtctgtggtcaatggcaa 27122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 39896043 - 39896463
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39896043 catcgtcatctgaagcttctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 39896142  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 219  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||              
T  39896143 tccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 39896242  T
Q  220 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
     ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| ||    
T  39896243 actttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctatt 39896336  T
Q  319 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  39896337 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 39896436  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  39896437 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 39896463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 34160840 - 34161241
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160840 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34160939  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  34160940 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 34161035  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagc 336  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34161036 aaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 34161133  T
Q  337 aacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 436  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  34161134 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtc 34161233  T
Q  437 aatggcaa 444  Q
    ||||||||    
T  34161234 aatggcaa 34161241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 254897 - 254499
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  254897 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 254798  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  254797 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 254698  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  254697 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac---ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 254605  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  254604 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 254505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 16167475 - 16167873
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16167475 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 16167574  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||| ||| |||         
T  16167575 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16167674  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 340  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16167675 t---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 16167769  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16167770 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 16167869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 37383657 - 37384072
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37383657 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37383756  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------cttt 223  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||    
T  37383757 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 37383856  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 323  Q
    ||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||    
T  37383857 caaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaa 37383950  T
Q  324 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  37383951 aagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 37384050  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37384051 gatagtctgtggtcaatggcaa 37384072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37946111 - 37945712
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37946111 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37946012  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  37946011 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37945912  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37945911 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 37945818  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  37945817 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 37945718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 12592785 - 12593209
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12592785 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 12592884  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctct 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             |||    
T  12592885 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttct 12592984  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtc 314  Q
    |||||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||   ||||||||    
T  12592985 actttcaaagctatatac----aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtc 12593078  T
Q  315 tgtttt-gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggct 413  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12593079 tattttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtt 12593178  T
Q  414 cttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12593179 ctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 12593209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 3788469 - 3788888
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3788469 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3788568  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctcta 219  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  3788569 ccaagctttataaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 3788668  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  3788669 ctttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattt 3788762  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |     
T  3788763 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcct 3788862  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3788863 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 3788888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 34867681 - 34868077
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34867681 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagag 34867780  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnnn 243  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          |||| |||||||||||| |||           
T  34867781 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatac----aaa 34867876  T
Q  244 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaa 341  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  34867877 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 34867974  T
Q  342 ggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatgg 441  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34867975 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatgg 34868074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9344232 - 9343834
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344232 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 9344133  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||           ||||||||||||||||| |||         
T  9344132 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatac----a 9344037  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  9344036 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaac 9343939  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  9343938 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 9343839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39046067 - 39045669
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046067 gcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 39045968  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||           ||||||||||||||||| |||         
T  39045967 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatac----a 39045872  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39045871 aaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 39045774  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  39045773 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 39045674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710448
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttca 12710664  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |    
T  12710663 aagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 12710570  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||    
T  12710569 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 12710470  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12710469 gatagtctgtggtcaatggcaa 12710448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 34297152 - 34297544
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34297152 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 34297251  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  34297252 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 34297347  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||    
T  34297348 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 34297440  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34297441 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 34297540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22922380 - 22921990
Alignment:
Q  63 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22922380 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 22922281  T
Q  163 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  22922280 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 22922185  T
Q  249 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  22922184 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacc 22922087  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22922086 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 22921990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16823592 - 16823184
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16823592 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 16823493  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||    
T  16823492 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 16823393  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaac 330  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||    
T  16823392 tatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaac 16823298  T
Q  331 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 430  Q
    | |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  16823297 ccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 16823198  T
Q  431 gtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||    
T  16823197 gtggtcaatggcaa 16823184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Original strand, 16897888 - 16898296
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16897888 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 16897987  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||    
T  16897988 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 16898087  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaac 330  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||    
T  16898088 tatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaac 16898182  T
Q  331 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 430  Q
    | |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  16898183 ccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 16898282  T
Q  431 gtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||    
T  16898283 gtggtcaatggcaa 16898296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239903
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 40239688  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    |||| ||| |||         |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  40239689 aaagttatatacaaaaat---attttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaa 40239783  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  40239784 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 40239882  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40239883 atagtctgtggtcaatggcaa 40239903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11629451 - 11629032
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11629451 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 11629352  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc----------tac 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||          ||     
T  11629351 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttttat 11629252  T
Q  221 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||   | ||||||| |||    
T  11629251 tttcaaagctatatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaa--ctctttgtctattt 11629157  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  11629156 tgaaaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 11629058  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11629057 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 11629032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37680160 - 37679738
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37680160 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 37680061  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||    
T  37680060 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 37679961  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||| |||||||||| |    
T  37679960 ctttcaaagctatatac---aaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattg--aaatttttttgtctat 37679866  T
Q  318 tttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||     
T  37679865 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctc 37679766  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37679765 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 37679738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37695425 - 37695003
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37695425 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 37695326  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||    
T  37695325 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 37695226  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||| |||||||||| |    
T  37695225 ctttcaaagctatatac---aaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattg--aaatttttttgtctat 37695131  T
Q  318 tttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||     
T  37695130 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctc 37695031  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37695030 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 37695003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13930791 - 13930391
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13930791 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13930692  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             ||||||||||||||||| |||        
T  13930691 gtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatac---a 13930595  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13930594 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 13930497  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  13930496 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtggtcaa 13930397  T
Q  439 tggcaa 444  Q
    ||||||    
T  13930396 tggcaa 13930391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21671440 - 21671017
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21671440 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 21671341  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||    
T  21671340 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 21671241  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||| |    
T  21671240 ctttcaaagctatatac---aaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattg-aaattttttttgtctat 21671145  T
Q  318 tttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||     
T  21671144 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctc 21671045  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21671044 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 21671017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 31882284 - 31882681
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882284 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31882383  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttcaaagctatgtacnnnnnn 242  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||||||||||| |||          
T  31882384 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaagctatatac----aa 31882479  T
Q  243 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||     
T  31882480 aacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaatt-aaaaactttttt-tctattttgaaaagcaaacttgagcaacg 31882577  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31882578 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 31882677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 32055777 - 32056196
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32055777 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 32055876  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||           |||||    
T  32055877 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattctattttcttctac 32055976  T
Q  221 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||   ||||||| | |||    
T  32055977 tttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaa--ctttttgtttattt 32056070  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |     
T  32056071 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcct 32056170  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  32056171 ccaagataatctgtggtcaatggcaa 32056196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 63 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19410721 - 19410331
Alignment:
Q  63 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19410721 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 19410622  T
Q  163 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa--------------ctctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||               |||||||||||||||||  ||        ||||    
T  19410621 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacac----aaaacatt 19410526  T
Q  249 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||     
T  19410525 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggatacc 19410428  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19410427 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 19410331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 20843909 - 20844307
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843909 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20844008  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------------aaagctatgtacnnn 239  Q
    || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            |||| ||||| |       
T  20844009 agtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttc--a 20844106  T
Q  240 nnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagca 337  Q
         ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||||    
T  20844107 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagca 20844200  T
Q  338 acaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 437  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  20844201 acagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtca 20844300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 28888275 - 28888669
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888275 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28888374  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||||||        
T  28888375 agtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtac---a 28888471  T
Q  241 nnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaa 338  Q
        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||    
T  28888472 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaaaagcaaacctgagcaa 28888564  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  28888565 cagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 28888663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23122835 - 23122425
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23122835 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaa 23122736  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 223  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||    
T  23122735 gctttgcaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttacttt 23122636  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
    ||||| |||||||        ||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |    
T  23122635 caaagttatgtac---aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaa 23122546  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||    
T  23122545 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccag 23122447  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23122446 gatagtctgtggtcaatggcaa 23122425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782627
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||            |||| ||||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctattttcttctattttc 27782411  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||| |||        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| | ||||| |    
T  27782412 aaagctatatac----aaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaa 27782505  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | ||||    
T  27782506 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccag 27782605  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27782606 gatagtctgtggtcaatggcaa 27782627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34269188 - 34268773
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34269188 catcttcatcaaaagctcccatgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattct 34269089  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||           ||    
T  34269088 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgtttaaaactctattttcttttta 34268989  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  34268988 ctttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttttttg----- 34268897  T
Q  318 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||    
T  34268896 ---aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagattcttc 34268800  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     | ||||||||||||||||||||||||    
T  34268799 tctaggatagtctgtggtcaatggcaa 34268773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 37931369 - 37931774
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37931369 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37931468  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------------ctctactttcaaagctatgt 234  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||                   ||||||||||||||||| |    
T  37931469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatat 37931568  T
Q  235 acnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacct 332  Q
    ||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  37931569 ac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaaaagcaaacct 37931662  T
Q  333 gagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgt 432  Q
    |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  37931663 gagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgt 37931762  T
Q  433 ggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||    
T  37931763 ggtcaatggcaa 37931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868633
Alignment:
Q  104 accaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgct 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  204 tttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-g 292  Q
    ||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31868879 tttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 31868784  T
Q  293 aaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctattt 391  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  31868783 aaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctattt 31868686  T
Q  392 caatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31868685 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 31868633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27428692 - 27428300
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428692 tgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27428593  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||           ||||||||||| ||||| |        
T  27428592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgc---a 27428496  T
Q  241 nnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaa 338  Q
        ||||||| ||||| | || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||         |||  |||||||||||||||||    
T  27428495 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagtt---------tttgaaaagcaaacctgagcaa 27428405  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || |||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27428404 cagggtacattcaaac-gaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtccgtggtcaa 27428306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 27396769 - 27396883
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27396769 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27396867  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  27396868 atgaaaagaatttatt 27396883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 39896503 - 39896615
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39896503 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 39896601  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  39896602 gaaaagaatttatt 39896615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 23122385 - 23122271
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23122385 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 23122287  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  23122286 ttgaaaagaatttatt 23122271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 27122956 - 27123070
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27122956 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27123054  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  27123055 ttgaaaagaatttatt 27123070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27428262 - 27428148
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27428262 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27428164  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  27428163 atgaaaagaatttatt 27428148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 37384110 - 37384224
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37384110 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 37384208  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  37384209 ttgaaaagaatttatt 37384224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 483 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 21696994 - 21696881
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaa 582  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  21696994 ggcttgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccactggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcga 21696896  T
Q  583 tgaaaagaatttatt 597  Q
    |||||||||||||||    
T  21696895 tgaaaagaatttatt 21696881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19410291 - 19410179
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19410291 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 19410193  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  19410192 gaaaagaatttatt 19410179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19450225 - 19450113
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  19450225 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagagcggttcaggcaaaaatggggcaat 19450127  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  19450126 gaaaagaatttatt 19450113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 37931814 - 37931926
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  37931814 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 37931912  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  37931913 gaaaagaatttatt 37931926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 20844347 - 20844461
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20844347 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccactggattgacaacccgaaggggcagttcaggcaaaaatggggca 20844445  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  20844446 ttgaaaagaatttatt 20844461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 31882719 - 31882833
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  31882719 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaagatggggca 31882817  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  31882818 ttgaaaagaatttatt 31882833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Original strand, 23117053 - 23117191
Alignment:
Q  307 tttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaaca 405  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23117053 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 23117152  T
Q  406 agcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23117153 agcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 23117191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 11628992 - 11628880
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11628992 gctcgctaaggtgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 11628894  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  11628893 gaaaagaatttatt 11628880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 12710408 - 12710296
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12710408 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 12710310  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  12710309 gaaaagaatttatt 12710296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31868593 - 31868481
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31868593 gctcgctaagttgaaaacccgaaagaacgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 31868495  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  31868494 gaaaagaatttatt 31868481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 40239943 - 40240055
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  40239943 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatc 40240041  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  40240042 gaaaagaatttatt 40240055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 9343796 - 9343682
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9343796 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcaacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgataacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 9343698  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  9343697 ttgaaaagaatttatt 9343682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 16167911 - 16168025
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16167911 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 16168009  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  16168010 ttgaaaagaatttatt 16168025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16823146 - 16823032
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16823146 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 16823048  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  16823047 ttgaaaagaacttatt 16823032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 16898334 - 16898448
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16898334 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 16898432  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  16898433 ttgaaaagaacttatt 16898448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 34161279 - 34161393
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34161279 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 34161377  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
      ||||||||||||||    
T  34161378 tcgaaaagaatttatt 34161393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34268735 - 34268625
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34268735 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 34268637  T
Q  582 atgaaaagaatt 593  Q
     |||||||||||    
T  34268636 ttgaaaagaatt 34268625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 21670978 - 21670865
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21670978 aggctcgctaagttggaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 21670880  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
     ||||||||||||||    
T  21670879 ttgaaaagaatttat 21670865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 37679700 - 37679587
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37679700 aggctcgctaagttggaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 37679602  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
     ||||||||||||||    
T  37679601 ttgaaaagaatttat 37679587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 37694965 - 37694852
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37694965 aggctcgctaagttggaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 37694867  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
     ||||||||||||||    
T  37694866 ttgaaaagaatttat 37694852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22921950 - 22921838
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22921950 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 22921852  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||    
T  22921851 aaaaagaatttatt 22921838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 488 - 596
Target Start/End: Original strand, 28888693 - 28888800
Alignment:
Q  488 gctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaa 587  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28888693 gctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaataaaa 28888791  T
Q  588 agaatttat 596  Q
    |||||||||    
T  28888792 agaatttat 28888800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 254461 - 254347
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  254461 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 254363  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  254362 ttgaaaagaatttatt 254347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 27810136 - 27810250
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27810136 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27810234  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  27810235 ttgaaaagaatttatt 27810250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 34297582 - 34297696
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34297582 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaagcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 34297680  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  34297681 ttgaaaagaatttatt 34297696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 37945674 - 37945560
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37945674 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 37945576  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  37945575 ttgaaaagaatttatt 37945560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 23117229 - 23117344
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23117229 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 23117327  T
Q  582 at-gaaaagaatttatt 597  Q
     |  |||||||||||||    
T  23117328 ttaaaaaagaatttatt 23117344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 588
Target Start/End: Original strand, 27782668 - 27782771
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27782668 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaat 27782766  T
Q  584 gaaaa 588  Q
     ||||    
T  27782767 aaaaa 27782771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 12593247 - 12593361
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12593247 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagtccaggcaaaaatggggca 12593345  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  12593346 ttgaaaagaatttatt 12593361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 26721168 - 26721085
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26721168 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggc 26721085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 541 - 597
Target Start/End: Original strand, 34868125 - 34868181
Alignment:
Q  541 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34868125 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 34868181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31887755 - 31887682
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccacc 109  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31887755 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 597
Target Start/End: Original strand, 32056246 - 32056300
Alignment:
Q  543 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32056246 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 32056300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 39045626 - 39045534
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggg 578  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  39045626 ctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcgatccaggcaaaaatggg 39045534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 42569323 - 42569232
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||   | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42569323 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcctggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggcaaaaat 42569232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 597
Target Start/End: Original strand, 3788938 - 3788992
Alignment:
Q  543 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 597  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3788938 ttgaaaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 3788992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 597
Target Start/End: Original strand, 12661981 - 12662038
Alignment:
Q  541 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca-atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  12661981 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatttaaaaagaatttatt 12662038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13930351 - 13930258
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggg 578  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| || || ||| || |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13930351 gctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcactccgctggatcgaaaacccgaaagggcgatccaggcaaaaatggg 13930258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21854752 - 21854704
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  21854752 ggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 21854704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 525
Target Start/End: Original strand, 3788926 - 3788969
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  3788926 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcaattcaggcaaaaa 3788969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 12386860 - 12386898
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12386860 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 12386898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20276814 - 20276776
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20276814 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 20276776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3761190 - 3761105
Alignment:
Q  490 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3761190 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 3761105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 116)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 22894400 - 22894819
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22894400 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 22894499  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||           ||||    
T  22894500 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 22894599  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  22894600 ctttcaaagctatgtacaaaat----attttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg-aaaaggtttttgtctattt 22894694  T
Q  320 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22894695 tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaagcagactcttccc 22894794  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22894795 caggatagtctgtggtcaatggcaa 22894819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 25206261 - 25206688
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25206261 catcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 25206360  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------t 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |    
T  25206361 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttt 25206460  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag---ttttttgtc 314  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  25206461 actttcaaagctatgtac--aaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtc 25206558  T
Q  315 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 414  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  25206559 tattttgaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattc 25206658  T
Q  415 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  25206659 ttccctaggataaactgtggtcaatggcaa 25206688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 25270417 - 25270844
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25270417 catcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 25270516  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------t 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |    
T  25270517 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttt 25270616  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag---ttttttgtc 314  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  25270617 actttcaaagctatgtac--aaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtc 25270714  T
Q  315 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 414  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  25270715 tattttgaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattc 25270814  T
Q  415 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  25270815 ttccctaggataaactgtggtcaatggcaa 25270844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 26486380 - 26486789
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486380 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 26486479  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttcaaagc 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  26486480 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcaaagc 26486579  T
Q  230 tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaa 328  Q
    ||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||    
T  26486580 tatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaa 26486673  T
Q  329 acctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagt 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  26486674 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 26486773  T
Q  429 ctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||    
T  26486774 ctgtggtcaatggcaa 26486789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 11555343 - 11555757
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11555343 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11555442  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           |||||||||    
T  11555443 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 11555542  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||||| ||||| ||    
T  11555543 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttcttgtctattttgaaa 11555636  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||    
T  11555637 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 11555736  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  11555737 atagtcggtggtcaatggcaa 11555757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13318982 - 13318585
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318982 gcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13318883  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||         
T  13318882 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac----a 13318787  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13318786 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 13318689  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  13318688 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaatg 13318589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 30174471 - 30174870
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30174471 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30174570  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  30174571 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 30174670  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30174671 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 30174764  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  30174765 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 30174864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 23631958 - 23632375
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23631958 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 23632057  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||           |||||||||    
T  23632058 cttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 23632157  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt--ga 322  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |    
T  23632158 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaa 23632253  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| | ||||    
T  23632254 aagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttataagccggttctcctccag 23632353  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23632354 gatagtctgtggtcaatggcaa 23632375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 28655231 - 28655647
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28655231 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28655330  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||    
T  28655331 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttca 28655430  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |    
T  28655431 aagctatatac----aaaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattg-aaaacttttttgtctattttgaa 28655525  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  28655526 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 28655625  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28655626 gatagtctgtggtcaatggcaa 28655647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 23897858 - 23898272
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23897858 catcttcatcaaaagctcctatgcttccgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 23897957  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||           ||    
T  23897958 ccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttcttttta 23898057  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  23898058 ctttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa-----------gtt 23898146  T
Q  319 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||  |||||||  |||||     
T  23898147 ttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttgcaagcagattcttct 23898246  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23898247 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 23898272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 33881133 - 33881530
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33881133 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33881232  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-ctcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||           ||||||||||||| |||         
T  33881233 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaa- 33881331  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 340  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33881332 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 33881426  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  33881427 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggtcaatg 33881526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820167
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          |||| |||||    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttca 31820381  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaa 324  Q
    ||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||    
T  31820380 aagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaa 31820287  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||||    
T  31820286 gcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcagga 31820187  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31820186 tagtctgtggtcaatggcaa 31820167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Original strand, 3795534 - 3795943
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3795534 aagcctctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 3795633  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-------------ctctactttcaaagc 229  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||    
T  3795634 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagc 3795733  T
Q  230 tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaa 328  Q
    ||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||    
T  3795734 tatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaa 3795827  T
Q  329 acctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagt 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | ||||||||||    
T  3795828 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagt 3795927  T
Q  429 ctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||    
T  3795928 ctgtggtcaatggcaa 3795943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9544864 - 9544464
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544864 tgcttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9544766  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  9544765 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 9544670  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagc 336  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  9544669 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagtaaacctgagc 9544572  T
Q  337 aacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 436  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||    
T  9544571 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtc 9544472  T
Q  437 aatggcaa 444  Q
    ||||||||    
T  9544471 aatggcaa 9544464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13180944 - 13180550
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180944 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 13180845  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             ||||||||||||||||| |||       
T  13180844 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatac--- 13180748  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaac 339  Q
         |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||||||    
T  13180747 -aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagcaac 13180655  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  13180654 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggtcaat 13180555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18369686 - 18369289
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18369686 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 18369587  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||             ||||||||||||||||| |||         
T  18369586 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 18369488  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 340  Q
       |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18369487 ---cattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 18369393  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18369392 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 18369293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 31437469 - 31437861
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437469 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31437568  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  31437569 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 31437664  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||    
T  31437665 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 31437757  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31437758 gggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtcaatg 31437857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40467708 - 40467310
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40467708 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 40467609  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||           ||||||||||||||||| |||         
T  40467608 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatac----a 40467513  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40467512 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 40467415  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  40467414 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 40467315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 33298517 - 33298941
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33298517 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 33298616  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-------------ctc 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||    
T  33298617 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttc 33298716  T
Q  218 tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |    
T  33298717 tactttcaaagctatatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctat 33298811  T
Q  318 ttt---gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 414  Q
    |||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  33298812 ttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttc 33298911  T
Q  415 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33298912 tcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 33298941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 9323461 - 9323880
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9323461 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 9323560  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||    
T  9323561 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 9323660  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
     |||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||    
T  9323661 ttttcaaagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattt 9323754  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  9323755 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 9323854  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  9323855 ccaagataatctgtggtcaatggcaa 9323880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18494939 - 18494525
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18494939 tcatcaaaagctcctatgctggcgaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18494840  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  18494839 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttcttctactttc 18494740  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 324  Q
    |||||||| |||         | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  18494739 aaagctatatacaattt----actttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 18494646  T
Q  325 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||    
T  18494645 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccagg 18494546  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18494545 atagtctgtggtcaatggcaa 18494525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 12138160 - 12138579
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12138160 catcttcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 12138259  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||    
T  12138260 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 12138359  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
     |||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||    
T  12138360 ttttcaaagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattt 12138453  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  12138454 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 12138553  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  12138554 ccaagataatctgtggtcaatggcaa 12138579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 24729977 - 24730374
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24729977 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 24730076  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttcaaagctatgtacnnnnnnn 243  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||| |||           
T  24730077 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaagctatatacaaaat-- 24730174  T
Q  244 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24730175 --attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 24730270  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  24730271 gggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaatg 24730370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37746484 - 37746079
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746484 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37746385  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttg-ttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||           ||||||||||||||| |||       
T  37746384 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatac--- 37746288  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37746287 -aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaa 37746191  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgt------atgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgt 432  Q
    || ||||||||||||  || |||||||||| ||| ||      ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37746190 cagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgt 37746091  T
Q  433 ggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||    
T  37746090 ggtcaatggcaa 37746079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 2517054 - 2517470
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2517054 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 2517153  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |           ||||||||||    
T  2517154 ctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagattctattttcttctactttca 2517253  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||   ||||||||| |||||     
T  2517254 aagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttga 2517347  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| | |||    
T  2517348 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctcca 2517447  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2517448 ggatagtctgtggtcaatggcaa 2517470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15652930 - 15652517
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15652930 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaag 15652831  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |||||||    
T  15652830 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 15652731  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 324  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |      |||    
T  15652730 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt-ttttaaaaaaaa 15652636  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  15652635 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 15652537  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15652536 tagtctgtggtcaatggcaa 15652517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 37760966 - 37761387
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37760966 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 37761065  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctcta 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  37761066 ccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 37761165  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| | | | ||    
T  37761166 ctttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 37761261  T
Q  319 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    |  ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  37761262 tgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 37761361  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37761362 ccaggatagactgtggtcaatggcaa 37761387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32590033
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctac----------tttca 225  Q
    |||||| ||| ||||| | || ||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||          |||||    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctactttcttctactttca 32590248  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  32590247 aagctatatac----aaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaa 32590154  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  32590153 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 32590054  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32590053 atagtctgtggtcaatggcaa 32590033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Original strand, 33522378 - 33522787
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33522378 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 33522477  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc------------tactttcaaagct 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||            |||||||||||||    
T  33522478 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagct 33522577  T
Q  231 atgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaa 329  Q
    || |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||    
T  33522578 atatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaa 33522672  T
Q  330 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 429  Q
    || |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  33522673 cccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtc 33522772  T
Q  430 tgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||    
T  33522773 tgtggtcaatggcaa 33522787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 33783471 - 33783886
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33783471 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccatttt 33783570  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||    
T  33783571 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttta 33783670  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta--tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 316  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| |||||  | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  33783671 ctttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttg---- 33783763  T
Q  317 ttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
         |||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  33783764 ----aaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 33783858  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33783859 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 33783886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 24608229 - 24608645
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24608229 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 24608328  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------t 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |    
T  24608329 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaactccgctttcttttt 24608428  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 316  Q
    |||||||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  24608429 actttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttg---- 24608521  T
Q  317 ttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| |||     
T  24608522 ----aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctc 24608617  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24608618 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 24608645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 34622524 - 34622923
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34622524 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 34622623  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  34622624 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 34622719  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaa 338  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34622720 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaatt--aaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaa 34622817  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  34622818 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggtcaa 34622917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 30035410 - 30035829
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30035410 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 30035509  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||           |||||    
T  30035510 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattctattttcttctac 30035609  T
Q  221 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||   ||||||| | |||    
T  30035610 tttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaa--ctttttgtttattt 30035703  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||  ||| |     
T  30035704 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcagattctcct 30035803  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  30035804 ccaagataatctgtggtcaatggcaa 30035829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 5643805 - 5644202
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5643805 tgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 5643904  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc----------tactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||          ||||||||||||||| |||         
T  5643905 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttactttcaaagctatatac----a 5644000  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5644001 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 5644098  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  5644099 agggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaat 5644197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37665642 - 37665243
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665642 tgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37665543  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||||||| | |||        
T  37665542 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatac---- 37665447  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaac 339  Q
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| | | | |||  ||||||||||||||||||    
T  37665446 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaac 37665347  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  37665346 agggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 37665248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15753029 - 15752615
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15753029 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 15752930  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctac 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           |||||    
T  15752929 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctac 15752830  T
Q  221 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 320  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  15752829 tttcaaagctatatac----aaaacattttctt----tcttgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctatttt 15752740  T
Q  321 g-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||| ||| | |    
T  15752739 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctc 15752640  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    || |||| |||||||||||||||||    
T  15752639 caagataatctgtggtcaatggcaa 15752615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 41680693 - 41681109
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41680693 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 41680792  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctctacttt 223  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             ||||||||    
T  41680793 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctacttt 41680892  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 323  Q
    ||||||||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | | |||  ||    
T  41680893 caaagctatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaa 41680989  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  41680990 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccagg 41681088  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41681089 atagtctgtggtcaatggcaa 41681109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18122572 - 18122173
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122572 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18122473  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||            ||||||||||||||||| |||       
T  18122472 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaat 18122373  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagca 337  Q
          |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18122372 tt----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 18122279  T
Q  338 acaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 437  Q
    ||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  18122278 acagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggtca 18122180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22993288 - 22992881
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22993288 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22993189  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |||||||    
T  22993188 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 22993089  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 324  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||       |||  |||    
T  22993088 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaaaa 22993000  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  22992999 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 22992901  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22992900 tagtctgtggtcaatggcaa 22992881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 61 - 444
Target Start/End: Original strand, 30158048 - 30158438
Alignment:
Q  61 attcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcc 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30158048 attcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 30158147  T
Q  161 ttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattt 249  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||           ||||||||||||||||| |||        |||||    
T  30158148 tttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatac----aaaacattt 30158243  T
Q  250 tctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  30158244 tccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtaca 30158341  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30158342 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 30158438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 6880287 - 6880708
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6880287 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 6880386  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tct 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||           |||    
T  6880387 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaagactctatttttcttct 6880486  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    |||||||||||||| |||        ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |    
T  6880487 actttcaaagctatatac----aaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctat 6880580  T
Q  318 tttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  6880581 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaagcaggttctc 6880680  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  6880681 ctccaagataatctgtggtcaatggcaa 6880708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 38 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13436850 - 13436431
Alignment:
Q  38 atcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagc 136  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13436850 atcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagc 13436751  T
Q  137 tttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactttc 224  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||            |||||||||    
T  13436750 tttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttc 13436651  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 320  Q
    |||||||| |||          |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    | ||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  13436650 aaagctatatacaaaacat---ttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttt 13436556  T
Q  321 g-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| | |    
T  13436555 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatattacaagcaggttctcctc 13436456  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13436455 caggatagtctgtggtcaatggcaa 13436431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 11329644 - 11330043
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11329644 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 11329743  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttcaaagctatgtacnnnnnn 242  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||            ||||||||||||||||  ||           
T  11329744 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactctattttcttctactttcaaagctaaata--tacaa 11329841  T
Q  243 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
       |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11329842 tttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 11329939  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11329940 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 11330039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352401
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 37352617  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||| |||        ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||| |    
T  37352616 aaagctatatac----aaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaa 37352523  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  37352522 aagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 37352423  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37352422 gataatctgtggtcaatggcaa 37352401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 43084247 - 43084662
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43084247 tcatcaaaagctcctatgctggcgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 43084346  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||| ||||    
T  43084347 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctattttc 43084446  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    |||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  43084447 aaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaa--ctttttgtctattttgaaa 43084541  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||| | |||||    
T  43084542 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccagg 43084641  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43084642 atagtctgtggtcaatggcaa 43084662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953537
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 28953753  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 323  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||  |||| | | | |||  ||    
T  28953752 aaagctatatac----aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaa 28953657  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  28953656 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccagg 28953558  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28953557 atagtctgtggtcaatggcaa 28953537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 24975833 - 24976247
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24975833 catcttcatcaaaagctcctatgctcgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 24975932  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||           ||    
T  24975933 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 24976032  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||         |    
T  24976033 ctttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagtt---------t 24976120  T
Q  318 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |    
T  24976121 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcc 24976220  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     |||||||||| |||||||||||||||    
T  24976221 tccaggatagtatgtggtcaatggcaa 24976247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 30940625 - 30941034
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30940625 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 30940724  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 223  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||           ||||||    
T  30940725 gcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttacttt 30940824  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    ||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||      
T  30940825 caaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt---------tttga 30940912  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  30940913 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-agaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 30941011  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30941012 ggatagtctgtggtcaatggcaa 30941034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8659643 - 8659229
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  8659643 tcatcaaaagctcttgtacttgtgaattcaaagtttcg-ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaag 8659545  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||            |||||||||    
T  8659544 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 8659445  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 323  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | |||||||    
T  8659444 aaagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaa 8659351  T
Q  324 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  8659350 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 8659251  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8659250 gatagtctgtggtcaatggcaa 8659229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 25206726 - 25206840
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25206726 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 25206824  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  25206825 atgaaaagaatttatt 25206840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 25270882 - 25270996
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25270882 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 25270980  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  25270981 atgaaaagaatttatt 25270996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 9323920 - 9324033
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9323920 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 9324018  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  9324019 gaaaagaatttattg 9324033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 12138619 - 12138732
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12138619 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 12138717  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  12138718 gaaaagaatttattg 12138732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 26486829 - 26486942
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26486829 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 26486927  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  26486928 gaaaagaatttattg 26486942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 598
Target Start/End: Original strand, 6880746 - 6880861
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6880746 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 6880844  T
Q  582 atgaaaagaatttattg 598  Q
     ||||||||||||||||    
T  6880845 ttgaaaagaatttattg 6880861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18369251 - 18369137
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18369251 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 18369153  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  18369152 ttgaaaagaatttatt 18369137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 22894858 - 22894972
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22894858 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 22894956  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    | ||||||| ||||||    
T  22894957 aggaaaagagtttatt 22894972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 23632413 - 23632527
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23632413 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 23632511  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  23632512 ttgaaaagaatttatt 23632527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 24976285 - 24976399
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24976285 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcgtcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 24976383  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  24976384 atgaaaagaatttatt 24976399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 30158476 - 30158590
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30158476 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggca 30158574  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  30158575 ttgaaaagaatttatt 30158590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 34622961 - 34623076
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34622961 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaaatgagtaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 34623060  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  34623061 ttgaaaagaatttatt 34623076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 41681147 - 41681261
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41681147 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 41681245  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  41681246 ttgaaaagaatttatt 41681261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 3795983 - 3796095
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3795983 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 3796081  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  3796082 gaaaagaatttatt 3796095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 13436387 - 13436275
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13436387 gctcgctaagttgaaaacccgaaaggacgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 13436289  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  13436288 gaaaagaatttatt 13436275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15752575 - 15752463
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15752575 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 15752477  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  15752476 gaaaagaatttatt 15752463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 30035870 - 30035982
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30035870 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 30035968  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  30035969 gaaaagaatttatt 30035982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 484 - 596
Target Start/End: Original strand, 33881570 - 33881681
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33881570 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 33881668  T
Q  584 gaaaagaatttat 596  Q
    |||||||||||||    
T  33881669 gaaaagaatttat 33881681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 11555795 - 11555909
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11555795 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 11555893  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  11555894 ttgaaaagaatttatt 11555909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 13180512 - 13180398
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13180512 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 13180414  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  13180413 ttgaaaagaatttatt 13180398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18122135 - 18122021
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18122135 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcagcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 18122037  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  18122036 ttgaaaagaatttatt 18122021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18494487 - 18494373
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18494487 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcacctcgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 18494389  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  18494388 ttgaaaagaatttatt 18494373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 24608683 - 24608797
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24608683 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 24608781  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  24608782 ttgaaaagaatttatt 24608797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 28655685 - 28655799
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28655685 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcg 28655783  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  28655784 ttgaaaagaatttatt 28655799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 33783924 - 33784038
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33783924 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 33784022  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  33784023 ttgaaaagaatttatt 33784038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 37352363 - 37352249
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37352363 aggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 37352265  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  37352264 atgaaaagaatttatt 37352249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 37746041 - 37745927
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37746041 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgatttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggca 37745943  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    |||||| |||||||||    
T  37745942 atgaaaggaatttatt 37745927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 5644242 - 5644354
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5644242 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 5644340  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  5644341 gaaaagaatttatt 5644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 24730414 - 24730526
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24730414 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 24730512  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  24730513 gaaaagaatttatt 24730526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 8659189 - 8659078
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8659189 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 8659091  T
Q  584 gaaaagaatttat 596  Q
    |||||||||||||    
T  8659090 gaaaagaatttat 8659078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 2517508 - 2517622
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2517508 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggtggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctgaattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 2517606  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  2517607 ttgaaaagaatttatt 2517622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15652479 - 15652369
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15652479 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 15652381  T
Q  582 atgaaaagaatt 593  Q
     |||||||||||    
T  15652380 ttgaaaagaatt 15652369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22992843 - 22992729
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22992843 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 22992745  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  22992744 ttgaaaagaatttatt 22992729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 33298979 - 33299093
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33298979 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcagcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 33299077  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  33299078 ttgaaaagaatttatt 33299093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 33522825 - 33522939
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33522825 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 33522923  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  33522924 ttgaaaagaacttatt 33522939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 40467270 - 40467156
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40467270 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcaacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgataacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 40467172  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  40467171 ttgaaaagaatttatt 40467156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Original strand, 11330081 - 11330194
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11330081 aggctcgctgagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcacctcgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 11330179  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
     ||||||||||||||    
T  11330180 ttgaaaagaatttat 11330194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 43084701 - 43084813
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  43084701 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgataaccagaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 43084799  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  43084800 gaaaagaatttatt 43084813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 37665205 - 37665090
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37665205 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 37665107  T
Q  582 atg-aaaagaatttatt 597  Q
     || |||||||||||||    
T  37665106 ttgaaaaagaatttatt 37665090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 9544426 - 9544312
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9544426 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 9544328  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  9544327 ttgaaaagaatttatt 9544312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 23898311 - 23898425
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23898311 aggctcactaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggaccgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 23898409  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  23898410 atgaaaagaatttatt 23898425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 30174908 - 30175022
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30174908 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 30175006  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  30175007 ttgaaaagaatttatt 30175022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 32589995 - 32589881
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  32589995 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgataacccgaaaggacaattcaggcaaaaatggggca 32589897  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  32589896 ttgaaaagaatttatt 32589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 13318545 - 13318433
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13318545 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 13318447  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  13318446 gaaaagaatttatt 13318433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 30941072 - 30941187
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30941072 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 30941170  T
Q  582 at-gaaaagaatttatt 597  Q
     |  |||||||||||||    
T  30941171 ttaaaaaagaatttatt 30941187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 588
Target Start/End: Original strand, 37761427 - 37761530
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37761427 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaat 37761525  T
Q  584 gaaaa 588  Q
     ||||    
T  37761526 aaaaa 37761530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 31437899 - 31438013
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31437899 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcacctcgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 31437997  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  31437998 ttgaaaagaatttatt 31438013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 484 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31820127 - 31820024
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31820127 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaat 31820029  T
Q  584 gaaaa 588  Q
     ||||    
T  31820028 aaaaa 31820024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 28953497 - 28953383
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28953497 aggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacctgaaagggcagttcaggcaaaaatggggct 28953399  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  28953398 ttgaaaagaatttatt 28953383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 541 - 597
Target Start/End: Original strand, 23726735 - 23726791
Alignment:
Q  541 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23726735 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 23726791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21990838 - 21990745
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21990838 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 21990745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33840095 - 33840002
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  33840095 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaacgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaaaggcagtccaggcaaaaat 33840002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21862548 - 21862457
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21862548 gctcgctaaatcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 21862457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 20374472 - 20374430
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20374472 gctcgctaagttgaaaacccaaaagggcggcttaggcaaaaaa 20374430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 522
Target Start/End: Original strand, 21693353 - 21693393
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21693353 aggctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 21693393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Original strand, 28849191 - 28849238
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  28849191 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 28849238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 1803677 - 1803715
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1803677 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 1803715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7256675 - 7256637
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7256675 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 7256637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 7792375 - 7792413
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7792375 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 7792413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 11941237 - 11941199
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11941237 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 11941199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15781483 - 15781445
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15781483 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15781445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 31523692 - 31523730
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31523692 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 31523730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 12175760 - 12175679
Alignment:
Q  488 gctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  12175760 gctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggc 12175679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 575
Target Start/End: Original strand, 20382384 - 20382469
Alignment:
Q  490 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  20382384 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaacgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaaaggcagtccaggcaaaaat 20382469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27228804 - 27228719
Alignment:
Q  490 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27228804 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaagtgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 27228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Original strand, 29899064 - 29899105
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  29899064 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 29899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 24064644 - 24064596
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaa-gggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24064644 gctcggtaagtcgaaaacccgaaaagggcggcttaggcaaaaaatgagc 24064596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20334694 - 20334272
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20334694 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 20334595  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||          
T  20334594 ccaagccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 20334495  T
Q  225 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
         ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  20334494 ctttcaaagctatgtacaaaaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattt 20334397  T
Q  320 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20334396 tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 20334297  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20334296 caggatagtctgtggtcaatggcaa 20334272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16202312 - 16201884
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16202312 catcttcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16202213  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||    
T  16202212 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttta 16202113  T
Q  220 ctttcaaagctatgtac-nnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-gtct 315  Q
    |||||||||| ||||||         ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16202112 ctttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtct 16202013  T
Q  316 gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 415  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  16202012 attttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 16201913  T
Q  416 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16201912 tctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 16201884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 20466756 - 20467184
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20466756 catcttcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 20466855  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------a 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |    
T  20466856 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcca 20466955  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaatt------gaaaaagttttttgt 313  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       |||||  ||  |||    
T  20466956 ctttcaaagctatgtac--aaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgt 20467053  T
Q  314 ctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggct 413  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20467054 ctattttgaaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggct 20467153  T
Q  414 cttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20467154 cttccccatgatagtctgtggtcaatggcaa 20467184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 3647125 - 3647545
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3647125 catcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3647224  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa------------ctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             |||    
T  3647225 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttct 3647324  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    |||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  3647325 actttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatt 3647418  T
Q  319 ttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |    
T  3647419 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcc 3647518  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  3647519 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 3647545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 28591085 - 28591481
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28591085 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28591184  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnnnn 242  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||          
T  28591185 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac----aa 28591280  T
Q  243 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaa 341  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  28591281 aacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28591378  T
Q  342 ggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatgg 441  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  28591379 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcagtgg 28591478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21892025 - 21891619
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21892025 catcttcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 21891926  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttcaaagct 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |    
T  21891925 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttt 21891826  T
Q  231 atgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaa 328  Q
    |||| |        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||     |||  |||||||    
T  21891825 atgttc---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaaagttttt-----tttgaaaagcaa 21891734  T
Q  329 acctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagt 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  21891733 acctgagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagt 21891635  T
Q  429 ctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||    
T  21891634 ctgtggtcaatggcaa 21891619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 51644204 - 51644621
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51644204 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 51644303  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-------------ctctactt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||              |||||||    
T  51644304 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 51644403  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||     
T  51644404 tcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaacttttttgtctattttga 51644498  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  | |||    
T  51644499 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcacctcca 51644598  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  51644599 agataatctgtggtcaatggcaa 51644621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 28155726 - 28156127
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155726 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28155825  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  28155826 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 28155921  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagc 336  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28155922 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 28156019  T
Q  337 aacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 436  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28156020 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtc 28156119  T
Q  437 aatggcaa 444  Q
    ||||||||    
T  28156120 aatggcaa 28156127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 10968649 - 10969065
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10968649 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 10968748  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-------------ctctactt 222  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              |||||||    
T  10968749 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 10968848  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||     
T  10968849 tcaaagctatatacaaaat----attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttga 10968942  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||    
T  10968943 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctcca 10969042  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  10969043 ggatggtctgtggtcaatggcaa 10969065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41787583 - 41787166
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41787583 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 41787484  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttc 224  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||          |||||||||    
T  41787483 gctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttc 41787384  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  41787383 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttg 41787290  T
Q  322 -aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 420  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  41787289 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 41787190  T
Q  421 aggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41787189 aggatagtctgtggtcaatggcaa 41787166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 10951093 - 10951491
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10951093 cttgcggattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 10951192  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||        
T  10951193 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 10951292  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 339  Q
        |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  10951293 ----cattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaac 10951386  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  10951387 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaat 10951486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20334234 - 20334120
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20334234 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 20334136  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  20334135 atgaaaagaatttatt 20334120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 10951531 - 10951643
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10951531 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 10951629  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  10951630 gaaaagaatttatt 10951643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 28156165 - 28156279
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28156165 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 28156263  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  28156264 ttgaaaagaatttatt 28156279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 28591520 - 28591632
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28591520 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 28591618  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    |||||||| |||||    
T  28591619 gaaaagaacttatt 28591632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 20467223 - 20467337
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20467223 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaac-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaattgggca 20467321  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    | ||||||||||||||    
T  20467322 aggaaaagaatttatt 20467337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 504 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16201832 - 16201740
Alignment:
Q  504 gaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 597  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16201832 gaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 16201740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 41787126 - 41787014
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  41787126 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 41787028  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  41787027 gaaaagaatttatt 41787014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 51644661 - 51644773
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  51644661 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 51644759  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||| ||||    
T  51644760 gaaaagaatctatt 51644773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 596
Target Start/End: Original strand, 10969105 - 10969216
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  10969105 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcaccccgctgaattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 10969203  T
Q  584 gaaaagaatttat 596  Q
    |||||||||||||    
T  10969204 gaaaagaatttat 10969216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 3647586 - 3647698
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  3647586 gctcgctaagttgaaaacacgaaagggcagcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 3647684  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  3647685 gaaaagaatttatt 3647698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 21891577 - 21891463
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21891577 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggtggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggactgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggca 21891479  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  21891478 ttgaaaagaatttatt 21891463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 526
Target Start/End: Original strand, 2389935 - 2389977
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2389935 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 2389977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 569
Target Start/End: Original strand, 13457093 - 13457177
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 569  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  13457093 gctcgctaagttgaaaacccaaaagggcggctttggcaaaaaa-gagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggc 13457177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 486 - 559
Target Start/End: Original strand, 13469050 - 13469123
Alignment:
Q  486 tcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaaggg 559  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||    
T  13469050 tcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaaggg 13469123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5625888 - 5625850
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5625888 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 5625850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 485 - 531
Target Start/End: Original strand, 31545354 - 31545400
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31545354 ctcgctaagtcgaaaacctgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagc 31545400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21454734 - 21454697
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21454734 ctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 21454697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 486 - 522
Target Start/End: Original strand, 9297885 - 9297921
Alignment:
Q  486 tcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9297885 tcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggcaa 9297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 102)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22929107 - 22928685
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22929107 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 22929008  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctac---------- 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||              
T  22929007 ccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaactctactttctttcta 22928908  T
Q  221 -tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtct-gtt 318  Q
     ||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  22928907 ctttcaaagctatgtac--aaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag-tttttgtctattt 22928811  T
Q  319 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22928810 ttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 22928711  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22928710 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 22928685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27284586 - 27284166
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27284586 catcttcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27284487  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tct 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||            |||    
T  27284486 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttct 27284387  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    |||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  27284386 actttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatt 27284293  T
Q  319 ttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27284292 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttc 27284193  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27284192 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 27284166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 37 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623511
Alignment:
Q  37 catcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagc 136  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  137 tttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-------------ctctacttt 223  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctacttt 27623728  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    ||||||||| |||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||| ||||| |    
T  27623727 caaagctatatacaaaacat---ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 27623633  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27623632 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccag 27623533  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27623532 gatagtctgtggtcaatggcaa 27623511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 29555532 - 29555952
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29555532 catcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29555631  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||           ||    
T  29555632 ccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttcttttta 29555731  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  29555732 ctttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaatt--aaaagctttttgtctatt 29555825  T
Q  319 ttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |    
T  29555826 ttgaaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcccc 29555925  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  29555926 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 29555952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26110629 - 26110215
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26110629 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26110530  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |||||||    
T  26110529 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 26110430  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  26110429 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctgttttgaaa 26110336  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| | ||| |    
T  26110335 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcaggttctcctccaag 26110236  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  26110235 ataatctgtggtcaatggcaa 26110215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8899923 - 8899503
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8899923 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 8899824  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctcta 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  8899823 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 8899724  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    ||||||||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  8899723 ctttcaaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattt 8899629  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |     
T  8899628 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcct 8899529  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8899528 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 8899503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 16755794 - 16756215
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16755794 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16755893  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||    
T  16755894 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 16755993  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaac--atcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||   ||||||||| |    
T  16755994 ctttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaa--ctttttgtctat 16756087  T
Q  318 tttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  16756088 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 16756187  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16756188 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 16756215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13293164 - 13292755
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13293164 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 13293065  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           |||||||||    
T  13293064 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 13292965  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 324  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||    
T  13292964 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaa 13292875  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | ||||||    
T  13292874 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccagga 13292775  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13292774 tagtctgtggtcaatggcaa 13292755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 27063477 - 27063875
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063477 tgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27063576  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  27063577 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 27063672  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27063673 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 27063770  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  27063771 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 27063870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355915
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||           |||||||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 27356131  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| |||| ||||| |    
T  27356130 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--cctttggtctattttgaa 27356037  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27356036 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 27355937  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27355936 gatagtctgtggtcaatggcaa 27355915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 29507395 - 29507812
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29507395 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29507494  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-------------tactt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||             |||||    
T  29507495 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactt 29507594  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  29507595 tcaaagctatatac----aaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttg 29507688  T
Q  322 -aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 420  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  29507689 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 29507788  T
Q  421 aggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29507789 aggatagtctgtggtcaatggcaa 29507812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370235
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 33370451  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||| |||        |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||| ||||| |    
T  33370450 aaagctatatac----aaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattg--aaatttttttgtctattttgaa 33370357  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  33370356 aagcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctctcctccag 33370257  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33370256 gatagtctgtggtcaatggcaa 33370235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458312
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||| ||||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctattttc 34458526  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 324  Q
     ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||    
T  34458525 taagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac---ttttgtctattttgaaa 34458433  T
Q  325 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||    
T  34458432 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 34458333  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34458332 atagtctgtggtcaatggcaa 34458312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 4763759 - 4764157
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763759 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4763858  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  4763859 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 4763954  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4763955 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 4764052  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  4764053 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaat 4764152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13518395 - 13517998
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13518395 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13518296  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-ctcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||           ||||||||||||| |||         
T  13518295 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaa- 13518197  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 340  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13518196 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 13518102  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  13518101 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggtcaatg 13518002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14139597 - 14139204
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139597 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14139498  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  14139497 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 14139402  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||    
T  14139401 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 14139308  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  14139307 tggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtcaatg 14139208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 16680136 - 16680534
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16680136 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggag 16680235  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||            ||||||||||||| ||| |||         
T  16680236 tcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16680335  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  16680336 t---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgaca 16680430  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16680431 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 16680530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 27013728 - 27014120
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013728 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27013827  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||           ||||||||||||||| |||        
T  27013828 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatac---- 27013923  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 340  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||    
T  27013924 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 27014016  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27014017 gggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtcaatg 27014116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 28166473 - 28166889
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28166473 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28166572  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||           |||||||||    
T  28166573 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 28166672  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    |||||||| |||         |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| |||||     
T  28166673 aaagctatatacaattt----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttga 28166766  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  28166767 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 28166866  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28166867 ggatagtctgtggtcaatggcaa 28166889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539562
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc------------tactt 222  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||            |||||    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactt 4539779  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  4539778 tcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctgttttga 4539685  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  4539684 aaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 4539585  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  4539584 agataatctgtggtcaatggcaa 4539562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 27491107 - 27491527
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27491107 catcttcatcaaaagctcctatacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27491206  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||    
T  27491207 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 27491306  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    ||||||||||| | |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| |||| ||    
T  27491307 ctttcaaagctgtatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--cctttggtctatt 27491400  T
Q  319 ttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |    
T  27491401 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcc 27491500  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  27491501 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 27491527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200580
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttc 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||          |||||||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttc 27200364  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |    
T  27200365 aaagctatgtac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 27200459  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27200460 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccag 27200559  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  27200560 g-tagtctgtggtcaatggcaa 27200580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248653
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttc 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||          |||||||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttc 27248869  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |    
T  27248868 aaagctatgtac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 27248774  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27248773 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccag 27248674  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  27248673 g-tagtctgtggtcaatggcaa 27248653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26772847 - 26772433
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26772847 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26772748  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||||    
T  26772747 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttca 26772648  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  26772647 aagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaa--ctttttgtctattttgaaa 26772554  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||    
T  26772553 aacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccagg 26772454  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26772453 atagtctgtggtcaatggcaa 26772433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 27031002 - 27031414
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27031002 tcatcaaaagctcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27031101  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||||    
T  27031102 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttc 27031201  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 323  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  ||    
T  27031202 aaagttatgtac--aaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-----tttgaaa 27031294  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  27031295 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 27031393  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27031394 atagtctgtggtcaatggcaa 27031414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 27208883 - 27209294
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27208883 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaag 27208982  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |||||||    
T  27208983 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 27209082  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta---tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 320  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||   | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  27209083 aaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttg-------- 27209171  T
Q  321 gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 420  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27209172 aaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaa-tgaacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 27209270  T
Q  421 aggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27209271 aggatagtctgtggtcaatggcaa 27209294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27240345 - 27239934
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27240345 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaag 27240246  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |||||||    
T  27240245 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 27240146  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta---tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 320  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||   | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  27240145 aaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttg-------- 27240057  T
Q  321 gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 420  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27240056 aaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaa-tgaacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 27239958  T
Q  421 aggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27239957 aggatagtctgtggtcaatggcaa 27239934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 26791795 - 26792210
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26791795 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26791894  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||            |||||||||    
T  26791895 ctttgtaaatccgtggaatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 26791994  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |    
T  26791995 aaagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 26792088  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||    
T  26792089 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 26792188  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26792189 gatagtctgtggtcaatggcaa 26792210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 444
Target Start/End: Original strand, 29579012 - 29579408
Alignment:
Q  54 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 153  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29579012 cttgcaaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 29579111  T
Q  154 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnnn 243  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          |||| |||||||||||| |||           
T  29579112 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttctattttcaaagctatatac----aaa 29579207  T
Q  244 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttg-aaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaa 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  29579208 tcattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 29579305  T
Q  342 ggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatgg 441  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  29579306 ggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaatgg 29579405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30552212 - 30551804
Alignment:
Q  43 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 142  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  30552212 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 30552113  T
Q  143 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagcta 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||    
T  30552112 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 30552013  T
Q  232 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaac 330  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||    
T  30552012 tatac---aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaaac 30551918  T
Q  331 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 430  Q
    | |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  30551917 ccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 30551818  T
Q  431 gtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||    
T  30551817 gtggtcaatggcaa 30551804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 27025124 - 27025535
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27025124 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27025223  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||||    
T  27025224 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 27025323  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
    |||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |    
T  27025324 aaagttatgtac--aaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttg--------aa 27025413  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  || || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27025414 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 27025513  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27025514 gatagtctgtggtcaatggcaa 27025535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 24869684 - 24870098
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24869684 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 24869783  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||    
T  24869784 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttcttttta 24869883  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  24869884 ctttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttg----- 24869975  T
Q  318 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
        ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |    
T  24869976 ---aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcc 24870071  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  24870072 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 24870098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28213849
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctacttt 223  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||           ||||||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 28213632  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    ||||||| | |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| |||||||     
T  28213633 caaagctgtatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtgtgttttga 28213726  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  28213727 aaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 28213826  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  28213827 agataatctgtggtcaatggcaa 28213849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 26926763 - 26927146
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926763 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26926862  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  26926863 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaattt 26926962  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
        |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26926963 ----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 26927056  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||               |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||    
T  26927057 agggtacattcaaa---------------tgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggtcaat 26927141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16938243 - 16937829
Alignment:
Q  37 catcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16938243 catctgaagcttttgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16938144  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttca 225  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          |||| |||||    
T  16938143 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttca 16938044  T
Q  226 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    ||||||| |||         |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||   ||||||| | ||||| ||    
T  16938043 aagctatatacaaatt----attttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaa--ctttttgtttattttgaaa 16937950  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||| ||| | ||| |    
T  16937949 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaag 16937850  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16937849 ataatctgtggtcaatggcaa 16937829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 4778876 - 4779275
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4778876 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4778975  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc-aaagctatgtacnnn 239  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||| |||||| | |||       
T  4778976 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatac--- 4779072  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagca 337  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4779073 -gaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 4779169  T
Q  338 acaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 437  Q
    ||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||    
T  4779170 acagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtca 4779268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15406731 - 15406337
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406731 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15406632  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||||||        
T  15406631 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtac---a 15406535  T
Q  241 nnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaatt-gaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagca 337  Q
        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  15406534 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagttttttg--------aaaagcaaacctgagca 15406443  T
Q  338 acaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 437  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  15406442 acagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtca 15406344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15418518 - 15418124
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418518 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15418419  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||||||        
T  15418418 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtac---a 15418322  T
Q  241 nnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaatt-gaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagca 337  Q
        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  15418321 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagttttttg--------aaaagcaaacctgagca 15418230  T
Q  338 acaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 437  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  15418229 acagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtca 15418131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24299974 - 24299564
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24299974 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaag 24299875  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||| ||    
T  24299874 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctc 24299775  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 323  Q
    |||| |||||||        | ||| | |||| | || |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||    
T  24299774 aaagttatgtac---aaaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaa 24299684  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||| || ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  24299683 agcaaacctgagtaacagggtacattcaaa-tgaacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 24299585  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24299584 atagtctgtggtcaatggcaa 24299564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 4531267 - 4531682
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4531267 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4531366  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           |||||||||    
T  4531367 ctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 4531466  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    |||||| | |||        |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |    
T  4531467 aaagctgtatac----aaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 4531560  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctat-ttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  4531561 aagcaaacccgagcaacagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 4531659  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  4531660 agataatctgtggtcaatggcaa 4531682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666462
Alignment:
Q  138 ttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaa 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          ||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaa 26666675  T
Q  228 gctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaag- 325  Q
    ||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||      
T  26666674 gctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaac--tttttgtctattttgaaaaa 26666581  T
Q  326 caaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggat 425  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||    
T  26666580 caaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggat 26666481  T
Q  426 agtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26666480 agtctgtggtcaatggcaa 26666462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 444
Target Start/End: Original strand, 20174566 - 20174953
Alignment:
Q  74 aggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctc 173  Q
    ||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |    
T  20174566 aggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccac 20174665  T
Q  174 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-------------tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatct 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||             ||||| ||||| |||||||        |||||||||||||| |    
T  20174666 cactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtac---aaaaacattttctttctattt 20174762  T
Q  261 tgataatgacaatgcttg-aaacaaacatcttgaaaa-----ttgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaa 353  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||      | || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  20174763 tgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaag 20174862  T
Q  354 caaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
      ||||||||||||| ||| |    || |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  20174863 tgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaagacggtatgtggtcaatggcaa 20174953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22161425 - 22161038
Alignment:
Q  74 aggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctc 173  Q
    ||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |    
T  22161425 aggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccac 22161326  T
Q  174 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-------------tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatct 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||             ||||| ||||| |||||||        |||||||||||||| |    
T  22161325 cactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtac---aaaaacattttctttctattt 22161229  T
Q  261 tgataatgacaatgcttg-aaacaaacatcttgaaaa-----ttgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaa 353  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||      | || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  22161228 tgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaag 22161129  T
Q  354 caaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
      ||||||||||||| ||| |    || |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  22161128 tgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaagacggtatgtggtcaatggcaa 22161038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 33370197 - 33370083
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33370197 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 33370099  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  33370098 ctgaaaagaatttatt 33370083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 4531722 - 4531834
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4531722 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 4531820  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  4531821 gaaaagaatttatt 4531834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27355877 - 27355763
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27355877 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27355779  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  27355778 ttgaaaagaatttatt 27355763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 29507850 - 29507964
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29507850 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 29507948  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  29507949 ctgaaaagaatttatt 29507964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Original strand, 24870137 - 24870250
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24870137 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 24870235  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
    |||||||||||||||    
T  24870236 atgaaaagaatttat 24870250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 26927186 - 26927298
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26927186 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 26927284  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  26927285 gaaaagaatttatt 26927298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 484 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 13517958 - 13517847
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13517958 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 13517860  T
Q  584 gaaaagaatttat 596  Q
    |||||||||||||    
T  13517859 gaaaagaatttat 13517847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 4779313 - 4779427
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4779313 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 4779411  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||| ||||||||||    
T  4779412 ttgaagagaatttatt 4779427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 16756253 - 16756367
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16756253 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 16756351  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  16756352 ttgaaaagaatttatt 16756367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24299526 - 24299412
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24299526 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 24299428  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  24299427 ttgaaaagaatttatt 24299412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26110175 - 26110061
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26110175 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 26110077  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  26110076 ttgaaaagaatttatt 26110061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 28166927 - 28167041
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28166927 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 28167025  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||| ||||||||||    
T  28167026 ttgaagagaatttatt 28167041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 29579446 - 29579560
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29579446 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattaacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 29579544  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     | |||||||||||||    
T  29579545 ttaaaaagaatttatt 29579560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 4539524 - 4539410
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4539524 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 4539426  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||| ||||    
T  4539425 ttgaaaagaatctatt 4539410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 13292715 - 13292601
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13292715 aggctcgctaaggtgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 13292617  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  13292616 ttgaaaagaatttatt 13292601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15406299 - 15406185
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15406299 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggtggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 15406201  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  15406200 ttgaaaagaatttatt 15406185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15418086 - 15417972
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15418086 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggtggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 15417988  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  15417987 ttgaaaagaatttatt 15417972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 16680571 - 16680685
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16680571 aggctagctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcacctcgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 16680669  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  16680670 ttgaaaagaatttatt 16680685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 27031452 - 27031566
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27031452 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaag-gagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27031550  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  27031551 ttgaaaagaatttatt 27031566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 28213887 - 28214001
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28213887 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 28213985  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||| ||||    
T  28213986 ttgaaaagaatctatt 28214001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23851552 - 23851450
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23851552 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 23851453  T
Q  131 cca 133  Q
    |||    
T  23851452 cca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 4764197 - 4764309
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  4764197 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggtatt 4764295  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  4764296 gaaaagaatttatt 4764309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 26792250 - 26792362
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26792250 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 26792348  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  26792349 gaaaagaatttatt 26792362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 27063915 - 27064027
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27063915 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttagacaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccggaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 27064013  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  27064014 gaaaagaatttatt 27064027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 27200618 - 27200733
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27200618 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcctaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27200716  T
Q  582 atg-aaaagaatttatt 597  Q
     || |||||||||||||    
T  27200717 ttgaaaaagaatttatt 27200733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27248615 - 27248500
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27248615 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcctaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27248517  T
Q  582 atg-aaaagaatttatt 597  Q
     || |||||||||||||    
T  27248516 ttgaaaaagaatttatt 27248500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 14139166 - 14139052
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14139166 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 14139068  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  14139067 ttgaaaagaatttatt 14139052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 27014158 - 27014272
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27014158 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27014256  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  27014257 ttgaaaagaatttatt 27014272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 27209332 - 27209446
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27209332 aggctcgctaagttgaaaacccgggagggcggcttaggcaaaa-atgagcatcccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27209430  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  27209431 ttgaaaagaatttatt 27209446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27239896 - 27239782
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27239896 aggctcgctaagttgaaaacccgggagggcggcttaggcaaaaa-tgagcatcccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27239798  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  27239797 ttgaaaagaatttatt 27239782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 30551766 - 30551652
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30551766 aggctcgctaagtcgaaaactcgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 30551668  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| |||||    
T  30551667 ttgaaaagaacttatt 30551652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 34458274 - 34458160
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34458274 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 34458176  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  34458175 ttgaaaagaatttatt 34458160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 27491566 - 27491678
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  27491566 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 27491664  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||| ||||    
T  27491665 gaaaagaatctatt 27491678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 8899463 - 8899352
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  8899463 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctgaattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 8899365  T
Q  584 gaaaagaatttat 596  Q
    |||||||||||||    
T  8899364 gaaaagaatttat 8899352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22928647 - 22928532
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccccc-ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggc 580  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22928647 aggcttgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaag-gagcacccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggc 22928549  T
Q  581 aatgaaaagaatttatt 597  Q
    | |||||||||||||||    
T  22928548 attgaaaagaatttatt 22928532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 581
Target Start/End: Original strand, 27025573 - 27025671
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27025573 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27025671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 29555990 - 29556104
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29555990 aggctcgctaagctaaaaacccgagaaggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 29556088  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  29556089 ctgaaaagaatttatt 29556104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 483 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16937790 - 16937677
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaa 582  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16937790 ggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgccggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcag 16937692  T
Q  583 tgaaaagaatttatt 597  Q
    |||||||||||||||    
T  16937691 tgaaaagaatttatt 16937677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27284126 - 27284014
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaa-cccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaa 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27284126 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaaccccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaa 27284028  T
Q  583 tgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| ||||    
T  27284027 -gaaaagaatctatt 27284014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27623471 - 27623359
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaa-cccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaa 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27623471 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaaccccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaa 27623373  T
Q  583 tgaaaagaatttatt 597  Q
     ||||||||| ||||    
T  27623372 -gaaaagaatctatt 27623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26666424 - 26666310
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26666424 aggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaaaggggca 26666326  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     | |||||||||||||    
T  26666325 ttaaaaagaatttatt 26666310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26772395 - 26772281
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26772395 aggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaaaggggca 26772297  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     | |||||||||||||    
T  26772296 ttaaaaagaatttatt 26772281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 569
Target Start/End: Original strand, 27548248 - 27548331
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27548248 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggc 27548331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 20174996 - 20175108
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |  |||||||||||| || ||| | | ||||| | ||||||  |||    
T  20174996 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcgacccgcgggattgacaaccctaagggggaatccaggcaagaatgggataat 20175094  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  20175095 gaaaagaatttatt 20175108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22160995 - 22160883
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |  |||||||||||| || ||| | | ||||| | ||||||  |||    
T  22160995 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcgacccgcgggattgacaaccctaagggggaatccaggcaagaatgggataat 22160897  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  22160896 gaaaagaatttatt 22160883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 560
Target Start/End: Original strand, 25710257 - 25710332
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||  | |||||| |||||||||||||    
T  25710257 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggc 25710332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 575
Target Start/End: Original strand, 28308730 - 28308823
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  28308730 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaacgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaaaggcagtccaggcaaaaat 28308823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Original strand, 174314 - 174361
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  174314 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 174361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Original strand, 16584627 - 16584718
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16584627 gctcgataagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 16584718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16610753 - 16610662
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16610753 gctcgataagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 16610662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18947756 - 18947666
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | | |||| ||||  | || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18947756 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggtgacttaggcaataga-gagcgccccggtggactgaaaacccgaaagggcggttcaggcaaaaat 18947666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Original strand, 27515726 - 27515816
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27515726 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggc-aaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 27515816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 617885 - 617847
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  617885 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 617847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 1547641 - 1547679
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1547641 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 1547679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24145415 - 24145377
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24145415 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 24145377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18753028 - 18752987
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18753028 gctcgctaagtcgaaaacccgtaagggcggcttaggcaaaaa 18752987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27053564 - 27053523
Alignment:
Q  490 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27053564 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagc 27053523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 5991426 - 5991506
Alignment:
Q  120 attaccattttccaagctttgtaaa-tccgtggagccacgccttcggctgacctccact-cttatacatcaatttgagcct 198  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | ||||| |||||||||||    
T  5991426 attaccattttccaaactttttaaaattcgtggagccacgcctttggcagaccaccactccatttacattaatttgagcct 5991506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 25501296 - 25501248
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  25501296 ggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaagaatgagc 25501248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074748
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------- 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||               
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22074965  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 324  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  22074964 aaagctatgtacaaaaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaat--aaaaaagtttttgtctgttttgaaa 22074868  T
Q  325 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 424  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22074867 gcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccctagga 22074768  T
Q  425 tagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22074767 tagtctgtggccaatggcaa 22074748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19911398 - 19910981
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19911398 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaag 19911299  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||           |||||    
T  19911298 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttc 19911199  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt-gaa 323  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  19911198 aaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctatttttgaa 19911102  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |    
T  19911101 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaag 19911002  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19911001 atagtctgtggtcaatggcaa 19910981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 18796683 - 18797104
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18796683 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 18796782  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||              
T  18796783 tccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 18796882  T
Q  220 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
     ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  18796883 actttcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 18796977  T
Q  319 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  18796978 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 18797077  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  18797078 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 18797104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19202603 - 19202194
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagt-ttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19202603 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 19202504  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttcaaagc 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  19202503 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcaaagc 19202404  T
Q  230 tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaa 328  Q
    ||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||    
T  19202403 tatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattttgaaaagcaa 19202310  T
Q  329 acctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagt 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  19202309 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 19202210  T
Q  429 ctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||    
T  19202209 ctgtggtcaatggcaa 19202194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 33248348 - 33248762
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33248348 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33248447  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||           |||||||||    
T  33248448 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 33248547  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aa 323  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  33248548 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaa 33248641  T
Q  324 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | |||||    
T  33248642 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccagg 33248741  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33248742 atagtctgtggtcaatggcaa 33248762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21342405 - 21341989
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21342405 tcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21342306  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||           ||||||    
T  21342305 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttacttt 21342206  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    ||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||   ||||||||| |||||     
T  21342205 caaagctatatac----aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttga 21342112  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  21342111 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 21342012  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  21342011 gaatagtctgtggtcaatggcaa 21341989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 15773556 - 15773971
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15773556 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15773655  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||           |||||||    
T  15773656 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 15773755  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 322  Q
    | |||||| |||        |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |    
T  15773756 agagctatatac----aaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 15773849  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  15773850 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 15773949  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15773950 gatagtctgtggtcaatggcaa 15773971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28356192 - 28355769
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28356192 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 28356093  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact------------- 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |                 
T  28356092 tccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttct 28355993  T
Q  217 -ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtct 315  Q
     |||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  28355992 tctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtct 28355899  T
Q  316 gttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 414  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28355898 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttc 28355799  T
Q  415 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28355798 tcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 28355769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Original strand, 31360527 - 31360925
Alignment:
Q  53 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31360527 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 31360626  T
Q  153 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||| ||| |||         
T  31360627 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 31360726  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 340  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31360727 t---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 31360821  T
Q  341 aggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31360822 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 31360921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 9360620 - 9361018
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9360620 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9360719  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||        
T  9360720 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa 9360819  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 339  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9360820 ----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 9360913  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  9360914 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 9361013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 19680425 - 19680844
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19680425 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 19680524  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||    
T  19680525 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 19680624  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
     |||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||    
T  19680625 ttttcaaagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattt 19680718  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  19680719 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 19680818  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19680819 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 19680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19655583 - 19655170
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata--ttaccatt 128  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19655583 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccatt 19655484  T
Q  129 ttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctac-------- 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||            
T  19655483 ttccaagctttgtaaatccgtggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttt 19655384  T
Q  221 ---tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtct 315  Q
       |||||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          
T  19655383 tactttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg-aaaagtttt------ 19655294  T
Q  316 gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 415  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  19655293 -ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagactct 19655195  T
Q  416 tccccaggatagtctgtggtcaatg 440  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  19655194 tccccaggatagtctttggtcaatg 19655170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 29835300 - 29835719
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29835300 catcttcatctgaagcctctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29835399  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctcta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||            ||||    
T  29835400 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccattttcttcta 29835499  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    ||||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||    
T  29835500 ctttcaaagctatatac----aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtctattt 29835593  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |     
T  29835594 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcct 29835693  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  29835694 ccaagataatctgtggtcaatggcaa 29835719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31484079 - 31483689
Alignment:
Q  63 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31484079 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 31483980  T
Q  163 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  31483979 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 31483884  T
Q  249 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  31483883 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtacc 31483786  T
Q  348 ttcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31483785 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 31483689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 18715478 - 18715879
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715478 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18715577  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||||||| |||         
T  18715578 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatac----a 18715673  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagc 336  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18715674 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 18715771  T
Q  337 aacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 436  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  18715772 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggtc 18715871  T
Q  437 aatggcaa 444  Q
    ||||||||    
T  18715872 aatggcaa 18715879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 44566962 - 44567380
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttct-aggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44566962 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 44567061  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttc 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||          |||||||||    
T  44567062 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttc 44567161  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 320  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  44567162 aaagctatatac----aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttt 44567255  T
Q  321 g-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 419  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  44567256 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 44567355  T
Q  420 caggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    || |||| |||||||||||||||||    
T  44567356 caagataatctgtggtcaatggcaa 44567380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086542
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctacttt 223  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||           ||||||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 12086759  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    ||||||| | |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  12086758 caaagctgtatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctgttttga 12086665  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  12086664 aaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 12086565  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  12086564 agataatctgtggtcaatggcaa 12086542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 33264708 - 33265120
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33264708 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 33264807  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           |||||    
T  33264808 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctac 33264907  T
Q  221 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||  ||||||||| |||    
T  33264908 tttcaaagctatatac----gaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaatt--aaaaactttttgtctattt 33265001  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||       ||||||||| ||| |     
T  33265002 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatttcaat-------acaagcaggttctcct 33265094  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33265095 ccaggttagtctgtggtcaatggcaa 33265120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27603146 - 27602733
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27603146 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27603047  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------ta 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||    
T  27603046 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 27602947  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    |||||||||||||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||         
T  27602946 ctttcaaagctatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattg-aaaagttttttg----- 27602856  T
Q  318 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
        |||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  27602855 ---aaaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 27602760  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  27602759 tccaggatagtctgtggtcaatggcaa 27602733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2131496 - 2131087
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2131496 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 2131397  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctac-----------tttc 224  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||||    
T  2131396 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttc 2131297  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 322  Q
    |||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |    
T  2131296 aaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttctttg--------aa 2131208  T
Q  323 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 422  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  2131207 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 2131109  T
Q  423 gatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2131108 gatagtctgtggtcaatggcaa 2131087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 22138883 - 22139297
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22138883 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 22138982  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------t 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |    
T  22138983 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttcttttt 22139082  T
Q  219 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 316  Q
    |||||||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||              
T  22139083 actttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt---------- 22139169  T
Q  317 ttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  |||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  22139170 ttttgaaagcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 22139269  T
Q  417 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22139270 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 22139297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 19694077 - 19694488
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19694077 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 19694176  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||           ||||||    
T  19694177 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttacttt 19694276  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    ||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||      
T  19694277 caaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tttga 19694366  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| | |||    
T  19694367 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctcca 19694465  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19694466 ggatagtctgtggtcaatggcaa 19694488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 14569139 - 14569551
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| ||||| || || | ||||||||||||||| | |||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14569139 tcatcaaaagctcctatgatggcgaattcaaagtttttgggaa-tgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 14569237  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||||    
T  14569238 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 14569337  T
Q  225 aaagctatgtac-nnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    |||| ||||| |         ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||    
T  14569338 aaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt---------ttttg 14569428  T
Q  322 aaag-caaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 420  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||    
T  14569429 aaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctcc 14569527  T
Q  421 aggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  14569528 aggatattctgtggtcaatggcaa 14569551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 303
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260479
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 16260404  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 303  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16260405 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaa 16260479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22074710 - 22074596
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22074710 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcagccaaaaatggggca 22074612  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  22074611 atgaaaagaatttatt 22074596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 15774011 - 15774123
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15774011 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 15774109  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  15774110 gaaaagaatttatt 15774123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 44567420 - 44567532
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44567420 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 44567518  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  44567519 gaaaagaatttatt 44567532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 18715919 - 18716031
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  18715919 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 18716017  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  18716018 gaaaagaatttatt 18716031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19202156 - 19202042
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19202156 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 19202058  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  19202057 ttgaaaagaatttatt 19202042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19655126 - 19655012
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19655126 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgggaca 19655028  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||||    
T  19655027 atgaaaagaatttatt 19655012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 19694526 - 19694640
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19694526 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcacccctctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 19694624  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  19694625 ttgaaaagaatttatt 19694640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 21341951 - 21341837
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21341951 aggctcgctgagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 21341853  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  21341852 ttgaaaagaatttatt 21341837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 22139322 - 22139436
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22139322 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 22139420  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  22139421 ttgaaaagaatttatt 22139436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27602695 - 27602581
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27602695 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27602597  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  27602596 ttgaaaagaatttatt 27602581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 29835757 - 29835871
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29835757 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatagggca 29835855  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  29835856 ttgaaaagaatttatt 29835871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 33265160 - 33265273
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33265160 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 33265258  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  33265259 gaaaagaatttattg 33265273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 19680884 - 19680996
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19680884 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 19680982  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  19680983 gaaaagaatttatt 19680996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31483649 - 31483537
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31483649 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 31483551  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  31483550 gaaaagaatttatt 31483537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 12086504 - 12086390
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12086504 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 12086406  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||| ||||    
T  12086405 ttgaaaagaatctatt 12086390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 18797142 - 18797256
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18797142 aggctcgctaagttgaaaacctggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 18797240  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  18797241 ttgaaaagaatttatt 18797256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19910943 - 19910829
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19910943 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaat-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 19910845  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  19910844 ttgaaaagaatttatt 19910829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 2131048 - 2130935
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2131048 aggctcgctaagttgaaaactcggaagggcggcttaggcaaaaag-gagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 2130950  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
    |||||||||||||||    
T  2130949 atgaaaagaatttat 2130935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 31360965 - 31361078
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  31360965 gctcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatt 31361063  T
Q  584 gaaaagaatttattg 598  Q
    |||||||||||||||    
T  31361064 gaaaagaatttattg 31361078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 28355731 - 28355617
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28355731 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggca 28355633  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  28355632 ttgaaaagaatttatt 28355617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 33248800 - 33248914
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33248800 aggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaag-gagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 33248898  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  33248899 ttgaaaagaatttatt 33248914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 484 - 588
Target Start/End: Original strand, 9361048 - 9361150
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9361048 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggc-aaaatggggcaat 9361145  T
Q  584 gaaaa 588  Q
     ||||    
T  9361146 aaaaa 9361150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 14569589 - 14569704
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14569589 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcagtttaggcaaaaag-gagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 14569687  T
Q  582 at-gaaaagaatttatt 597  Q
     |  |||||||||||||    
T  14569688 ttaaaaaagaatttatt 14569704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 485 - 569
Target Start/End: Original strand, 16771675 - 16771758
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16771675 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggc 16771758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 569
Target Start/End: Original strand, 25794043 - 25794126
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 569  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  25794043 ctcgctaagttgaaaacccaaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccaaaagggcggtccaggc 25794126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21477906 - 21477865
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21477906 gctcgctaagttgaaaacctgaaatggcgacttaggcaaaaa 21477865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Original strand, 6668218 - 6668265
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6668218 gctcgctaagtcaaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagc 6668265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 39840388 - 39840343
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatga 529  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  39840388 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatga 39840343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22158845 - 22158805
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  22158845 ctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 22158805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 12023 - 12454
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12023 catcttcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 12122  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaattt-gagcctgtgcttttgttggaaactctac--------- 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||             
T  12123 ccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttct 12222  T
Q  221 --tttcaaagctatgtacnnnnnnnn-------cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt 311  Q
      |||||||||||||||                ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12223 actttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt- 12321  T
Q  312 gtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcagg 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12322 gtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 12421  T
Q  412 ctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12422 ctcttctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 12454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 1634 - 2054
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 129  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1634 catcttcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 1733  T
Q  130 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tcta 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||    
T  1734 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttcta 1833  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 318  Q
    ||||||||||||| |||        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| |  |    
T  1834 ctttcaaagctatatac----aaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttact 1927  T
Q  319 ttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  1928 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcc 2027  T
Q  418 cccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  2028 tccgggatagtctgtggtcaatggcaa 2054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 12479 - 12593
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12479 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggtagttcaggcaaaaatggggca 12577  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||| ||||    
T  12578 atgaaaagaatctatt 12593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 2092 - 2204
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2092 aggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggcaagaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 2190  T
Q  582 atgaaaagaattta 595  Q
     |||||||||||||    
T  2191 ttgaaaagaattta 2204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4878 - 4460
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataata-ttaccattttcca 133  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  4878 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttcca 4779  T
Q  134 agctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctt 222  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||    
T  4778 agctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactt 4679  T
Q  223 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt-g 321  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  4678 tcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctatttttg 4583  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4582 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 4483  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4482 ggatagtctgtggtcaatggcaa 4460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 4421 - 4307
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4421 aggcttgctaagttgaaaaccccgaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggca 4323  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  4322 ttgaaaagaatttatt 4307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9918 - 9499
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9918 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 9819  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||    
T  9818 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 9719  T
Q  220 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  9718 ctttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattt 9625  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |     
T  9624 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcct 9525  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9524 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 9499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 9461 - 9347
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9461 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 9363  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
       |||||||||||||    
T  9362 taaaaaagaatttatt 9347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3036
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3458 catcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3359  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa--------------ct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||               |    
T  3358 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 3259  T
Q  217 ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 316  Q
    |||||||||||||||| |||        |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||     
T  3258 ctactttcaaagctatatac----aaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ccttttgtcta 3165  T
Q  317 ttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  3164 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 3065  T
Q  416 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3064 cctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 3036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 444
Target Start/End: Original strand, 18007 - 18205
Alignment:
Q  245 cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaagg 343  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18007 cattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18104  T
Q  344 tacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggca 443  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18105 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggca 18204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 2996 - 2884
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2996 gctcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 2898  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||    
T  2897 aaaaagaatttatt 2884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 18245 - 18357
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18245 gctcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 18343  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||    
T  18344 aaaaagaatttatt 18357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12432
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12034 tgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12133  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnn 240  Q
    || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| ||         
T  12134 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatata----t 12229  T
Q  241 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 339  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 12327  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  12328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 12427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 12472 - 12584
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12472 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 12570  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  12571 gaaaagaatttatt 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 444
Target Start/End: Original strand, 9891 - 10310
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9891 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 9990  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctac 220  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||          ||||     
T  9991 ccaagctttgtgaatccatgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctat 10090  T
Q  221 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 319  Q
    |||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  10091 tttcaaagctatatac----aaaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattt 10184  T
Q  320 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 418  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  10185 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 10284  T
Q  419 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10285 ccaggatagtctgtggtcaatggcaa 10310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Original strand, 33295 - 33691
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 33394  T
Q  151 gagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnn 239  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||||||       
T  33395 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtac--- 33491  T
Q  240 nnnnncattttctttctatcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaa 338  Q
         ||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  33492 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-----ttgtaaaagcaaacctgagcaa 33586  T
Q  339 caaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 438  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  33587 cagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 33685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 33730 - 33844
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33730 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaag-gagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 33828  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  33829 ttgaaaagaatttatt 33844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 10351 - 10463
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10351 gctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatt 10449  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||| ||||||||||    
T  10450 gaagagaatttatt 10463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9184 - 8786
Alignment:
Q  52 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 151  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9184 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9085  T
Q  152 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa----------ctctactttcaaagctatgtacnnnnn 241  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||||||||||| |||         
T  9084 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaagctatatac----a 8989  T
Q  242 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaac 339  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  8988 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaatt--aaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaac 8891  T
Q  340 aaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 439  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  8890 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 8791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 8746 - 8634
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||      
T  8746 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa-tgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatg 8648  T
Q  584 gaaaagaatttatt 597  Q
    ||||||||||||||    
T  8647 gaaaagaatttatt 8634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 18567 - 18984
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18567 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18666  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac----------tctactttc 224  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||          |||||||||    
T  18667 gctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttc 18766  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  18767 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttg 18860  T
Q  322 -aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 420  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  18861 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 18960  T
Q  421 aggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18961 aggatagtctgtggtcaatggcaa 18984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14347
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctacttt 223  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||           ||||||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 14130  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg- 321  Q
    ||||||| | |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| |||||||     
T  14131 caaagctgtatac----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtgtgttttga 14224  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  14225 aaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 14324  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  14325 agataatctgtggtcaatggcaa 14347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 14385 - 14499
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14385 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 14483  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||| ||||    
T  14484 ttgaaaagaatctatt 14499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 6048 - 6460
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  6048 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaa 6147  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||           ||||||    
T  6148 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttacttt 6247  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    ||||| ||||| |        ||||||| ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  6248 caaagttatgttc--aaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttg--------a 6337  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  6338 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 6437  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6438 ggatagtctgtggtcaatggcaa 6460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 596
Target Start/End: Original strand, 6498 - 6611
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6498 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 6596  T
Q  582 atgaaaagaatttat 596  Q
     ||||||||||||||    
T  6597 ttgaaaagaatttat 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Original strand, 15551 - 15973
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 224  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 15750  T
Q  225 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatctt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 317  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||      | ||||||||||||||   ||||||||| |    
T  15751 aaagctatatac----aaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctat 15844  T
Q  318 tttg--aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  15845 tttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 15944  T
Q  416 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15945 cctccaggatagtctgtggtcaatggcaa 15973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 16011 - 16125
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16011 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 16109  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
     |||||||||||||||    
T  16110 ttgaaaagaatttatt 16125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 36 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25174 - 24763
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 134  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25174 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25075  T
Q  135 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||    
T  25074 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 24975  T
Q  224 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 321  Q
    ||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||     |||      
T  24974 caaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa--tttttt-----tttga 24885  T
Q  322 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacatgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 421  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  24884 aaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaac-gaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 24786  T
Q  422 ggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24785 ggatagtctgtggtcaatggcaa 24763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24725 - 24682
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24725 aggctcgctaagttgaaaacccggaagggcgacttaggcaaaaa 24682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 260 - 444
Target Start/End: Original strand, 1 - 184
Alignment:
Q  260 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  360 atgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtggtcaatggcaa 184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Original strand, 209 - 323
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  209 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa-atgagcaccccgctggattgacaacccggaagggcagttcaggcaaaattggggca 307  T
Q  582 atgaaaagaatttatt 597  Q
    | ||||| ||||||||    
T  308 aggaaaataatttatt 323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Original strand, 359 - 540
Alignment:
Q  36 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  136 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26410 - 26241
Alignment:
Q  31 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  26410 catcttcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttt 26311  T
Q  131 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgt 200  Q
     ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26310 tcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgt 26241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40744
Alignment:
Q  60 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtg-ttcaa-tgtaccaccaaccaat-aatattacca-ttttccaagc-tttgtaaatccg-tggag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  154 ccacgccttcggc-tgacctccactcttatacatcaa-tttgagcctgtgctttt 206  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattttgagtctgtgctttt 40744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40486
Alignment:
Q  326 caaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaaca-tgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatg-tgtaacaagcaggctcttccccagg 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||| || ||| | |||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  424 atagtctgtggtcaatggcaa 444  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  40506 atagtatgtggtcaatggcaa 40486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 40444 - 40321
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaaccc-gaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc-acccccctcgattgacaacccgaaagggca-gttca--ggcgaaaatg 576  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||    
T  40444 aggctcgctaagttgaaaaccccggaagggcgtcttaaggcaaaaatgagccaccccgctggattgacaacccgaaagggcacgttcaccggcaaaaatg 40345  T
Q  577 gggc---aatgaaaagaatttatt 597  Q
    ||||   | |||||||||||||||    
T  40344 gggcctaagtgaaaagaatttatt 40321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15291 - 15200
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15291 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 15200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1837 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1837
Description:

Target: scaffold1837; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 485 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 618 - 577
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  618 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 5607 - 5523
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcagg 568  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||  || ||||||||||||| |||||||    
T  5607 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaaatgagcgtcccggtggaccgaaaacccgaaagggcggttcagg 5523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1418 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1418
Description:

Target: scaffold1418; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1496 - 1405
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1496 gctcgctaagtcgaaaactcgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccgatggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Original strand, 141 - 232
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  141 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 531
Target Start/End: Original strand, 173131 - 173177
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  173131 ctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagc 173177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 531
Target Start/End: Original strand, 20999 - 21048
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  20999 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 21048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 20638 - 20718
Alignment:
Q  120 attaccattttccaagctttgtaaa-tccgtggagccacgccttcggctgacctccact-cttatacatcaatttgagcct 198  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||| | | ||||| |||||||||||    
T  20638 attaccattttccaaactttttaaaatccgtggagccacgcctttggccggccaccactccatttacattaatttgagcct 20718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 531
Target Start/End: Original strand, 175 - 223
Alignment:
Q  483 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  175 ggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20557 - 20517
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20557 aggctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 20517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3467 - 3376
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||   |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3467 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcagcttaagccaaaaatgagtgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 3376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 524
Target Start/End: Original strand, 33006 - 33045
Alignment:
Q  485 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 524  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33006 ctcggtaagtcgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 33045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Original strand, 28319 - 28409
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28319 gctcgataagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggc-aaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 28409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 1322 - 1284
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1322 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 1284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 758 - 796
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  758 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 8290 - 8252
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8290 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 8252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 69202 - 69116
Alignment:
Q  489 ctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  69202 ctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 69116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 522
Target Start/End: Original strand, 90367 - 90405
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  90367 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 90405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0799 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0799
Description:

Target: scaffold0799; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5319 - 5231
Alignment:
Q  486 tcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 575  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5319 tcgctaagttgaaaacctgaaaaggtggcttaggca-aaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 5231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Original strand, 11148 - 11189
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  11148 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 11189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15289 - 15248
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 525  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15289 gctcgataagttgaaaacccgaaagggcagcttaggcaaaaa 15248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1691 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1691
Description:

Target: scaffold1691; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 532
Target Start/End: Original strand, 1148 - 1196
Alignment:
Q  484 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagca 532  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  1148 gctcgctaagtcgaaaacccgcaagggcggcttaagccaaaaatgagca 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 32161 - 32121
Alignment:
Q  482 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 522  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  32161 aggctcgctaagttgaaaacctcaaaaggcgacttaggcaa 32121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Original strand, 20592 - 20676
Alignment:
Q  120 attaccattttccaagctttgtaaa-tccgtggagccacgccttcggctgacctccact-cttatacatcaatttgagcctgtgc 202  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||| | | ||||| ||||||||| |||||    
T  20592 attaccattttccaaactttttaaaatccgtggagccacgcctttggcaggccaccactccatttacattaatttgagcatgtgc 20676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University