View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1364_high_1 (Length: 869)

Name: NF1364_high_1
Description: NF1364
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1364_high_1
NF1364_high_1
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (284-681)||(24793383-24793780)
chr4 (261-681)||(17892294-17892714)
chr4 (292-681)||(36943746-36944141)
chr4 (282-681)||(3108957-3109356)
chr4 (277-681)||(2586398-2586781)
chr4 (428-680)||(52721567-52721819)
chr4 (363-680)||(44521699-44522016)
chr4 (428-680)||(24784585-24784837)
chr4 (428-680)||(24823429-24823681)
chr4 (292-680)||(42630131-42630526)
chr4 (292-680)||(31945902-31946267)
chr4 (428-680)||(39957901-39958153)
chr4 (280-655)||(55900826-55901192)
chr4 (283-680)||(40694138-40694513)
chr4 (490-680)||(47607354-47607544)
chr4 (353-631)||(49470419-49470692)
chr4 (479-679)||(51675031-51675230)
chr4 (487-680)||(51859045-51859238)
chr4 (487-680)||(14614754-14614940)
chr4 (268-515)||(754224-754470)
chr4 (487-676)||(1177227-1177417)
chr4 (508-680)||(30683335-30683507)
chr4 (487-645)||(258779-258938)
chr4 (517-677)||(7952789-7952949)
chr4 (278-676)||(36511609-36511989)
chr4 (478-645)||(5835206-5835384)
chr4 (445-645)||(41146349-41146559)
chr4 (387-523)||(722440-722576)
chr4 (539-645)||(43509600-43509706)
chr4 (283-474)||(46431792-46431983)
chr4 (548-645)||(52573044-52573141)
chr4 (554-646)||(5325180-5325272)
chr4 (548-646)||(14795866-14795964)
chr4 (478-641)||(28377273-28377449)
chr4 (283-473)||(37992394-37992583)
chr4 (445-605)||(53323084-53323255)
chr4 (445-619)||(3402762-3402948)
chr4 (604-680)||(46431614-46431690)
chr4 (340-458)||(1177102-1177220)
chr4 (445-645)||(8063260-8063471)
chr4 (502-584)||(37992305-37992387)
chr4 (347-458)||(51858927-51859038)
chr4 (550-619)||(31227201-31227270)
chr4 (792-861)||(36943971-36944040)
chr4 (792-869)||(55900895-55900972)
chr4 (223-358)||(19738704-19738840)
chr4 (223-358)||(52122844-52122980)
chr4 (792-869)||(3109052-3109129)
chr4 (792-869)||(17892542-17892619)
chr4 (445-619)||(38491965-38492136)
chr4 (620-680)||(10258433-10258493)
chr4 (223-317)||(1176988-1177083)
chr4 (284-358)||(21637734-21637808)
chr4 (672-709)||(26858333-26858370)
chr4 (792-861)||(39957990-39958059)
chr4 (792-869)||(42630225-42630302)
chr4 (792-861)||(49470578-49470647)
chr4 (792-869)||(52721648-52721725)
chr4 (337-393)||(726496-726552)
chr4 (445-536)||(14795751-14795841)
chr4 (281-358)||(39957630-39957707)
chr4 (223-329)||(5834837-5834944)
chr4 (223-358)||(8064084-8064220)
chr4 (678-709)||(12893250-12893281)
chr4 (456-538)||(31227092-31227176)
chr4 (228-329)||(52721276-52721378)
chr4 (603-645)||(53324587-53324629)
chr4 (676-709)||(232978-233011)
chr4 (816-861)||(2586618-2586663)
chr4 (261-355)||(5325699-5325793)
chr4 (677-710)||(13388155-13388188)
chr4 (556-629)||(22492895-22492968)
chr4 (672-709)||(24415062-24415099)
chr4 (792-861)||(31945996-31946065)
chr4 (792-861)||(40694350-40694419)
chr4 (792-865)||(47607377-47607450)
chr4 (792-861)||(51675069-51675137)
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (261-681)||(28968556-28968977)
chr3 (281-681)||(47642072-47642472)
chr3 (273-681)||(7899371-7899779)
chr3 (292-680)||(19878756-19879144)
chr3 (261-680)||(25700806-25701228)
chr3 (352-680)||(45056954-45057282)
chr3 (315-659)||(20509830-20510174)
chr3 (428-680)||(52684540-52684792)
chr3 (428-680)||(2566923-2567174)
chr3 (283-680)||(19421484-19421877)
chr3 (428-680)||(21006016-21006268)
chr3 (337-652)||(13352876-13353191)
chr3 (338-680)||(38888750-38889081)
chr3 (286-544)||(30787350-30787609)
chr3 (268-672)||(983247-983627)
chr3 (479-680)||(29916034-29916236)
chr3 (479-680)||(29965187-29965389)
chr3 (262-522)||(21157539-21157800)
chr3 (283-680)||(22289397-22289771)
chr3 (487-655)||(48333212-48333380)
chr3 (278-652)||(2122770-2123124)
chr3 (479-676)||(2122951-2123148)
chr3 (531-680)||(212810-212959)
chr3 (487-680)||(28548296-28548489)
chr3 (478-645)||(22311106-22311284)
chr3 (557-680)||(21157413-21157536)
chr3 (478-645)||(35390126-35390301)
chr3 (517-680)||(25322170-25322333)
chr3 (562-676)||(13748177-13748291)
chr3 (540-646)||(42464302-42464408)
chr3 (570-676)||(45347907-45348013)
chr3 (487-655)||(48334155-48334323)
chr3 (478-644)||(50286911-50287088)
chr3 (283-495)||(55268854-55269066)
chr3 (445-644)||(25936242-25936452)
chr3 (478-645)||(28882243-28882421)
chr3 (223-458)||(45347306-45347541)
chr3 (548-646)||(10224321-10224419)
chr3 (508-635)||(47750631-47750758)
chr3 (588-679)||(41741821-41741912)
chr3 (548-642)||(48123683-48123777)
chr3 (445-645)||(22610440-22610650)
chr3 (569-645)||(30787274-30787350)
chr3 (261-458)||(41741947-41742144)
chr3 (445-645)||(52504986-52505198)
chr3 (283-473)||(6134242-6134432)
chr3 (261-458)||(42229720-42229907)
chr3 (445-645)||(45532226-45532436)
chr3 (540-645)||(52121613-52121718)
chr3 (479-676)||(39664657-39664857)
chr3 (479-654)||(19349300-19349480)
chr3 (528-645)||(33241166-33241288)
chr3 (540-646)||(1678846-1678948)
chr3 (540-646)||(28705591-28705693)
chr3 (261-458)||(13748323-13748519)
chr3 (541-619)||(1528881-1528959)
chr3 (445-538)||(7327968-7328060)
chr3 (445-538)||(37996573-37996665)
chr3 (792-869)||(28968805-28968882)
chr3 (487-546)||(42229914-42229973)
chr3 (792-869)||(47642300-47642377)
chr3 (379-511)||(212670-212802)
chr3 (445-520)||(1678980-1679055)
chr3 (349-453)||(29915926-29916030)
chr3 (349-453)||(29965079-29965183)
chr3 (337-385)||(48334076-48334124)
chr3 (223-329)||(35389757-35389864)
chr3 (223-358)||(40497337-40497473)
chr3 (245-356)||(1679675-1679786)
chr3 (478-540)||(10224440-10224501)
chr3 (223-356)||(7327719-7327853)
chr3 (283-385)||(48333079-48333181)
chr3 (792-869)||(52684621-52684698)
chr3 (455-538)||(28705493-28705576)
chr3 (677-709)||(40410162-40410194)
chr3 (479-511)||(41741916-41741948)
chr3 (671-710)||(17258217-17258256)
chr3 (272-356)||(45532957-45533041)
chr3 (678-709)||(46934275-46934306)
chr3 (678-709)||(50725034-50725065)
chr3 (678-709)||(50787785-50787816)
chr3 (223-329)||(52121187-52121294)
chr3 (678-709)||(54476038-54476069)
chr3 (678-709)||(54716471-54716502)
chr3 (283-329)||(3983765-3983811)
chr3 (228-329)||(30226432-30226534)
chr3 (341-395)||(39664082-39664136)
chr3 (261-356)||(42464884-42464979)
chr3 (445-538)||(48123568-48123660)
chr3 (792-861)||(2122989-2123058)
chr3 (792-861)||(19878850-19878918)
chr3 (792-869)||(20509903-20509980)
chr3 (792-869)||(21006110-21006187)
chr3 (676-709)||(27766804-27766837)
chr3 (792-869)||(47750680-47750757)
chr3 (223-356)||(48122832-48122966)
chr3 (796-861)||(48333242-48333307)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (223-681)||(35342324-35342783)
chr2 (283-680)||(31235839-31236236)
chr2 (272-644)||(34146237-34146609)
chr2 (282-680)||(1005579-1005955)
chr2 (283-681)||(3545233-3545631)
chr2 (272-681)||(21104539-21104938)
chr2 (283-680)||(2319343-2319737)
chr2 (261-681)||(4561834-4562233)
chr2 (293-680)||(14824216-14824582)
chr2 (428-659)||(45158850-45159081)
chr2 (283-680)||(3563908-3564282)
chr2 (480-701)||(4355555-4355773)
chr2 (283-680)||(44156665-44157040)
chr2 (353-680)||(10573632-10573948)
chr2 (479-654)||(24585777-24585953)
chr2 (477-676)||(28746339-28746539)
chr2 (479-680)||(5588280-5588481)
chr2 (261-625)||(8482647-8482989)
chr2 (528-680)||(35996822-35996974)
chr2 (517-652)||(12206267-12206402)
chr2 (498-637)||(40431740-40431879)
chr2 (482-645)||(18301362-18301529)
chr2 (518-680)||(40536498-40536660)
chr2 (445-641)||(40308004-40308212)
chr2 (445-646)||(22485011-22485224)
chr2 (478-645)||(5371338-5371516)
chr2 (478-642)||(12819578-12819753)
chr2 (549-645)||(6125031-6125127)
chr2 (588-680)||(14216910-14217002)
chr2 (508-680)||(9293655-9293831)
chr2 (445-646)||(7807022-7807231)
chr2 (490-645)||(20537114-20537282)
chr2 (445-646)||(4169684-4169896)
chr2 (445-641)||(6496840-6497046)
chr2 (339-456)||(14217027-14217144)
chr2 (223-358)||(33324825-33324961)
chr2 (353-454)||(5588176-5588277)
chr2 (792-869)||(35342611-35342688)
chr2 (223-368)||(38602287-38602433)
chr2 (363-455)||(12206172-12206264)
chr2 (248-455)||(28746539-28746737)
chr2 (792-869)||(31235933-31236010)
chr2 (381-456)||(4355478-4355553)
chr2 (223-358)||(7876721-7876857)
chr2 (223-358)||(40308872-40309008)
chr2 (292-458)||(1776311-1776477)
chr2 (792-860)||(40536498-40536566)
chr2 (363-474)||(9293253-9293364)
chr2 (228-329)||(37134302-37134404)
chr2 (792-869)||(1005784-1005861)
chr2 (223-356)||(4170479-4170613)
chr2 (796-861)||(12206267-12206332)
chr2 (677-710)||(21633354-21633387)
chr2 (223-356)||(22484274-22484408)
chr2 (357-458)||(40431896-40431997)
chr2 (674-709)||(3263026-3263061)
chr2 (478-521)||(6124948-6124991)
chr2 (678-709)||(10741365-10741396)
chr2 (679-709)||(3368668-3368698)
chr2 (679-709)||(31025871-31025901)
chr2 (676-710)||(44078576-44078610)
chr2 (667-709)||(44245256-44245298)
chr2 (681-710)||(52326-52355)
chr2 (792-861)||(4562069-4562138)
chr2 (676-705)||(11188519-11188548)
chr2 (672-709)||(16865308-16865345)
chr2 (792-869)||(40431791-40431868)
chr2 (680-709)||(41454509-41454538)
[»] chr7 (80 HSPs)
chr7 (363-681)||(15878076-15878394)
chr7 (338-653)||(1399949-1400263)
chr7 (352-680)||(23078762-23079090)
chr7 (248-645)||(33454100-33454497)
chr7 (223-680)||(35159869-35160328)
chr7 (259-680)||(44269767-44270182)
chr7 (428-680)||(9283514-9283766)
chr7 (428-680)||(25969717-25969969)
chr7 (340-680)||(36757665-36758009)
chr7 (340-680)||(36767189-36767533)
chr7 (365-680)||(36763445-36763764)
chr7 (428-680)||(9249964-9250215)
chr7 (260-681)||(21409433-21409830)
chr7 (293-680)||(554565-554930)
chr7 (293-680)||(21179911-21180280)
chr7 (479-680)||(36413609-36413809)
chr7 (479-680)||(48153784-48153984)
chr7 (283-655)||(38064731-38065107)
chr7 (478-680)||(19820651-19820853)
chr7 (272-645)||(23969840-23970187)
chr7 (502-680)||(44958990-44959168)
chr7 (230-495)||(40041390-40041655)
chr7 (228-458)||(24956260-24956491)
chr7 (479-676)||(26973296-26973497)
chr7 (478-644)||(16563919-16564096)
chr7 (478-644)||(16601566-16601743)
chr7 (492-680)||(24956501-24956687)
chr7 (223-474)||(44959994-44960246)
chr7 (478-641)||(1042747-1042923)
chr7 (478-645)||(19510888-19511059)
chr7 (540-646)||(39521413-39521519)
chr7 (528-680)||(35136317-35136469)
chr7 (491-645)||(4291946-4292111)
chr7 (533-680)||(11058729-11058876)
chr7 (524-638)||(40053575-40053689)
chr7 (30-124)||(24929323-24929420)
chr7 (455-646)||(47237913-47238116)
chr7 (540-645)||(8029147-8029252)
chr7 (540-644)||(26773257-26773361)
chr7 (445-631)||(36661208-36661405)
chr7 (549-632)||(47719856-47719939)
chr7 (548-645)||(27397282-27397378)
chr7 (445-645)||(11830432-11830642)
chr7 (445-538)||(27555129-27555221)
chr7 (792-869)||(1400015-1400092)
chr7 (445-645)||(16851046-16851254)
chr7 (164-210)||(24929465-24929511)
chr7 (445-645)||(40096401-40096612)
chr7 (445-538)||(48163671-48163763)
chr7 (792-869)||(15878171-15878248)
chr7 (792-861)||(23078856-23078925)
chr7 (612-680)||(47719764-47719832)
chr7 (794-869)||(33454361-33454436)
chr7 (363-458)||(48153690-48153785)
chr7 (428-474)||(11058658-11058704)
chr7 (445-538)||(27354184-27354276)
chr7 (233-329)||(23311736-23311833)
chr7 (792-869)||(36413638-36413715)
chr7 (428-469)||(47719952-47719993)
chr7 (261-329)||(18113943-18114011)
chr7 (261-329)||(26773716-26773784)
chr7 (245-358)||(48163435-48163548)
chr7 (223-358)||(11829693-11829829)
chr7 (223-358)||(27353925-27354061)
chr7 (792-869)||(9250058-9250135)
chr7 (792-869)||(9283608-9283685)
chr7 (792-861)||(21409667-21409736)
chr7 (792-869)||(25969798-25969875)
chr7 (283-328)||(26973118-26973163)
chr7 (792-861)||(48153822-48153891)
chr7 (281-329)||(19820868-19820916)
chr7 (478-538)||(26773376-26773436)
chr7 (223-329)||(25969401-25969508)
chr7 (223-358)||(40095654-40095790)
chr7 (228-329)||(9250426-9250528)
chr7 (228-329)||(34122621-34122723)
chr7 (268-326)||(38064645-38064703)
chr7 (792-869)||(554659-554736)
chr7 (676-709)||(25982982-25983015)
chr7 (272-358)||(38263053-38263139)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (366-681)||(36551535-36551849)
chr1 (315-675)||(24589782-24590142)
chr1 (306-680)||(24851565-24851935)
chr1 (281-562)||(38218449-38218728)
chr1 (405-680)||(32380733-32381009)
chr1 (272-580)||(41675743-41676050)
chr1 (340-605)||(47654789-47655054)
chr1 (479-680)||(9528519-9528720)
chr1 (487-680)||(14167319-14167512)
chr1 (248-676)||(9781675-9782083)
chr1 (261-680)||(29167993-29168390)
chr1 (487-680)||(10822644-10822837)
chr1 (479-652)||(34432118-34432291)
chr1 (436-654)||(3707976-3708183)
chr1 (488-677)||(37922465-37922654)
chr1 (479-676)||(29862039-29862239)
chr1 (479-676)||(34096231-34096429)
chr1 (508-677)||(32797462-32797631)
chr1 (445-646)||(28948370-28948583)
chr1 (478-645)||(13012560-13012731)
chr1 (478-645)||(31652979-31653157)
chr1 (445-646)||(5984919-5985130)
chr1 (455-646)||(28658564-28658768)
chr1 (478-645)||(14334534-14334712)
chr1 (478-645)||(43190020-43190200)
chr1 (445-646)||(25257349-25257558)
chr1 (549-645)||(3427704-3427800)
chr1 (445-648)||(30324452-30324665)
chr1 (445-646)||(8132914-8133123)
chr1 (261-423)||(48715135-48715297)
chr1 (568-680)||(33040711-33040822)
chr1 (554-645)||(37346520-37346609)
chr1 (606-681)||(38218733-38218808)
chr1 (350-587)||(2472681-2472906)
chr1 (595-680)||(15417927-15418012)
chr1 (223-358)||(1043234-1043370)
chr1 (445-645)||(6916027-6916238)
chr1 (510-592)||(15417689-15417771)
chr1 (418-495)||(33039813-33039891)
chr1 (445-646)||(37104382-37104591)
chr1 (445-645)||(38331181-38331392)
chr1 (223-328)||(43189662-43189768)
chr1 (600-655)||(47656062-47656117)
chr1 (445-538)||(36367462-36367554)
chr1 (792-869)||(36551678-36551754)
chr1 (792-869)||(47654958-47655035)
chr1 (338-450)||(9528726-9528838)
chr1 (792-868)||(15417689-15417765)
chr1 (560-645)||(52894866-52894947)
chr1 (487-591)||(10763903-10764009)
chr1 (379-458)||(10822558-10822637)
chr1 (228-358)||(1036471-1036602)
chr1 (228-329)||(14167096-14167198)
chr1 (340-458)||(29861922-29862040)
chr1 (223-356)||(20409531-20409665)
chr1 (261-329)||(30323761-30323829)
chr1 (245-329)||(38948762-38948846)
chr1 (223-358)||(28949216-28949352)
chr1 (340-458)||(34096428-34096546)
chr1 (445-538)||(52894985-52895077)
chr1 (272-329)||(2364734-2364791)
chr1 (676-709)||(7764468-7764501)
chr1 (268-329)||(34432387-34432448)
chr1 (478-538)||(36363338-36363397)
chr1 (273-329)||(40776053-40776109)
chr1 (478-521)||(3427621-3427664)
chr1 (223-358)||(6916849-6916985)
chr1 (273-328)||(10763717-10763772)
chr1 (223-350)||(32381042-32381170)
chr1 (223-358)||(37104127-37104263)
chr1 (223-329)||(37346852-37346959)
chr1 (223-358)||(38330434-38330570)
chr1 (223-358)||(52895688-52895824)
chr1 (223-393)||(3708219-3708390)
chr1 (671-709)||(8774286-8774324)
chr1 (223-356)||(8132190-8132324)
chr1 (616-645)||(10764020-10764049)
chr1 (268-329)||(13012996-13013057)
chr1 (272-329)||(31653406-31653463)
chr1 (680-709)||(35580956-35580985)
chr1 (792-861)||(37922494-37922563)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (223-680)||(26691623-26692082)
chr5 (223-680)||(26961355-26961814)
chr5 (223-644)||(17137945-17138364)
chr5 (228-680)||(26716285-26716716)
chr5 (228-680)||(26986025-26986456)
chr5 (428-680)||(30777063-30777315)
chr5 (223-680)||(30284253-30284718)
chr5 (298-680)||(27938242-27938602)
chr5 (428-680)||(11907504-11907750)
chr5 (352-680)||(27085486-27085817)
chr5 (248-641)||(5722020-5722403)
chr5 (338-680)||(22737962-22738296)
chr5 (340-680)||(25749731-25750049)
chr5 (283-680)||(3934462-3934838)
chr5 (284-680)||(18001631-18002014)
chr5 (482-680)||(3701331-3701528)
chr5 (477-680)||(1921022-1921226)
chr5 (479-676)||(1795635-1795833)
chr5 (487-681)||(7629296-7629490)
chr5 (283-680)||(34032437-34032811)
chr5 (478-680)||(6242683-6242887)
chr5 (487-680)||(21251734-21251927)
chr5 (262-522)||(5612252-5612513)
chr5 (490-681)||(42365775-42365971)
chr5 (349-680)||(41233444-41233760)
chr5 (479-646)||(14836574-14836742)
chr5 (478-622)||(15066454-15066598)
chr5 (261-676)||(43357439-43357831)
chr5 (557-680)||(5612126-5612249)
chr5 (445-646)||(39689892-39690105)
chr5 (517-680)||(39796619-39796782)
chr5 (540-646)||(30918995-30919101)
chr5 (540-645)||(5985640-5985745)
chr5 (567-680)||(9728063-9728176)
chr5 (548-646)||(26794163-26794261)
chr5 (512-680)||(9654025-9654193)
chr5 (540-644)||(10657296-10657400)
chr5 (588-680)||(35746069-35746161)
chr5 (340-474)||(11694328-11694460)
chr5 (445-645)||(9793040-9793248)
chr5 (445-646)||(1638954-1639163)
chr5 (589-653)||(11694466-11694530)
chr5 (248-458)||(1795425-1795636)
chr5 (228-458)||(42365982-42366209)
chr5 (223-358)||(32707806-32707942)
chr5 (792-869)||(11907585-11907662)
chr5 (792-869)||(26691911-26691988)
chr5 (792-869)||(26961643-26961720)
chr5 (228-358)||(41392687-41392818)
chr5 (431-572)||(9729397-9729534)
chr5 (479-515)||(35746161-35746197)
chr5 (223-329)||(1639786-1639893)
chr5 (794-869)||(5722271-5722346)
chr5 (445-535)||(33830505-33830593)
chr5 (223-358)||(39690738-39690874)
chr5 (478-540)||(26794282-26794343)
chr5 (792-869)||(15066485-15066562)
chr5 (792-869)||(30777157-30777234)
chr5 (478-538)||(10657221-10657281)
chr5 (261-329)||(11906264-11906332)
chr5 (261-329)||(12190431-12190499)
chr5 (674-709)||(16822774-16822809)
chr5 (679-710)||(38162589-38162620)
chr5 (283-329)||(19321441-19321487)
chr5 (676-709)||(3223429-3223462)
chr5 (792-869)||(3701358-3701434)
chr5 (792-869)||(3934556-3934633)
chr5 (260-329)||(19102469-19102538)
chr5 (272-358)||(32624934-32625020)
chr5 (417-458)||(35746196-35746237)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (293-681)||(11105364-11105753)
chr6 (428-680)||(3212782-3213034)
chr6 (292-680)||(7254997-7255383)
chr6 (343-657)||(10894194-10894509)
chr6 (427-680)||(32018309-32018561)
chr6 (294-659)||(6707714-6708080)
chr6 (352-680)||(13045035-13045357)
chr6 (279-676)||(19128217-19128593)
chr6 (479-679)||(27084216-27084416)
chr6 (340-680)||(13607430-13607778)
chr6 (418-680)||(13061028-13061289)
chr6 (444-656)||(26327524-26327736)
chr6 (517-680)||(3299339-3299502)
chr6 (445-646)||(7187940-7188154)
chr6 (479-676)||(234551-234754)
chr6 (478-645)||(32130222-32130400)
chr6 (281-505)||(31079667-31079889)
chr6 (570-680)||(4153215-4153325)
chr6 (487-624)||(22988838-22988972)
chr6 (487-624)||(23799424-23799558)
chr6 (548-645)||(8357739-8357835)
chr6 (478-552)||(31740483-31740557)
chr6 (445-645)||(1035979-1036190)
chr6 (261-415)||(26327201-26327354)
chr6 (228-358)||(8356970-8357101)
chr6 (445-538)||(31195633-31195725)
chr6 (792-869)||(11105581-11105658)
chr6 (261-328)||(234352-234419)
chr6 (228-358)||(31195844-31195975)
chr6 (792-869)||(3212863-3212940)
chr6 (792-861)||(3299339-3299408)
chr6 (792-861)||(27084254-27084323)
chr6 (261-329)||(3212523-3212591)
chr6 (406-458)||(27084165-27084217)
chr6 (223-358)||(1036801-1036937)
chr6 (540-607)||(31195551-31195618)
chr6 (445-511)||(8357624-8357689)
chr6 (554-628)||(31740394-31740468)
chr6 (223-356)||(7188756-7188887)
chr6 (676-709)||(26716658-26716691)
chr6 (676-709)||(31951488-31951521)
chr6 (792-869)||(32018390-32018467)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (223-614)||(32424928-32425316)
chr8 (259-680)||(20182418-20182832)
chr8 (339-681)||(7411726-7412068)
chr8 (259-673)||(27968147-27968550)
chr8 (428-680)||(40412756-40413008)
chr8 (283-653)||(27886258-27886615)
chr8 (283-653)||(27944916-27945273)
chr8 (259-653)||(28025133-28025516)
chr8 (428-652)||(27108876-27109100)
chr8 (340-680)||(3892089-3892407)
chr8 (428-680)||(8170759-8171011)
chr8 (261-604)||(38388713-38389054)
chr8 (444-656)||(41098644-41098856)
chr8 (490-676)||(32855-33044)
chr8 (261-638)||(37372305-37372653)
chr8 (487-680)||(5818006-5818199)
chr8 (497-681)||(28737780-28737964)
chr8 (445-646)||(5540164-5540377)
chr8 (445-646)||(28875728-28875941)
chr8 (478-645)||(19436628-19436806)
chr8 (478-645)||(19572777-19572955)
chr8 (478-645)||(32877831-32878011)
chr8 (445-646)||(45216383-45216596)
chr8 (540-645)||(43770868-43770973)
chr8 (478-645)||(25022530-25022708)
chr8 (539-645)||(42949517-42949623)
chr8 (445-645)||(32760098-32760308)
chr8 (478-645)||(6028866-6029046)
chr8 (445-632)||(32638391-32638589)
chr8 (455-645)||(36484176-36484377)
chr8 (445-646)||(4246671-4246880)
chr8 (478-642)||(19947542-19947717)
chr8 (576-645)||(12579693-12579762)
chr8 (229-356)||(4245953-4246081)
chr8 (445-645)||(34900534-34900745)
chr8 (445-538)||(12579820-12579911)
chr8 (554-646)||(37669432-37669523)
chr8 (445-646)||(22200985-22201194)
chr8 (283-564)||(29355691-29355967)
chr8 (223-358)||(16384624-16384760)
chr8 (228-358)||(32759385-32759516)
chr8 (792-869)||(27968386-27968463)
chr8 (223-356)||(36483442-36483576)
chr8 (223-358)||(12580528-12580664)
chr8 (261-356)||(5818288-5818383)
chr8 (677-709)||(26920003-26920035)
chr8 (223-367)||(32877444-32877589)
chr8 (223-329)||(2872914-2873021)
chr8 (223-329)||(6028494-6028601)
chr8 (223-329)||(13422215-13422322)
chr8 (223-358)||(22201312-22201448)
chr8 (223-329)||(28876570-28876677)
chr8 (223-358)||(34901357-34901493)
chr8 (478-521)||(43771004-43771047)
chr8 (625-659)||(38389053-38389087)
chr8 (338-371)||(32792-32825)
chr8 (292-329)||(24100197-24100234)
chr8 (792-869)||(27108942-27109019)
chr8 (792-869)||(27886471-27886548)
chr8 (792-869)||(27945129-27945206)
chr8 (792-869)||(28025372-28025449)
chr8 (445-538)||(37669312-37669403)
chr8 (679-708)||(44807098-44807127)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (487-680)||(202436-202622)
scaffold0005 (548-646)||(43767-43865)
scaffold0005 (445-536)||(43890-43980)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (444-646)||(13607-13808)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (548-646)||(29806-29904)
scaffold0060 (261-358)||(30419-30516)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (478-645)||(5907-6083)
scaffold0250 (245-329)||(5542-5626)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (445-540)||(41365-41458)
scaffold0112 (575-630)||(41276-41331)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (223-358)||(8067-8203)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (445-511)||(27095-27160)
[»] scaffold1171 (1 HSPs)
scaffold1171 (674-709)||(810-845)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (278-325)||(10663-10710)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (680-710)||(199663-199693)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 284 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 24793780 - 24793383
Alignment:
Q  284 atacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatcc 383  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  24793780 atacttttcgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttttaaaaaaataattatctgatacttcccaatacgtatcaggagagtatcc 24793681  T
Q  384 gatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatag 483  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24793680 gatcattatcctacaccagtaactacctcgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttaaatatag 24793581  T
Q  484 tgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaa 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24793580 tgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatctaa 24793481  T
Q  584 ttggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24793480 ttggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctgcgagcctacgactgatttatgttgtttgttaatatatttt 24793383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 261 - 681
Target Start/End: Original strand, 17892294 - 17892714
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||    
T  17892294 tatcatacaccgatacctgcccgatacttcccgatatgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaaaaataattatatgatacttcc 17892393  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtact 460  Q
     ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17892394 caatacgtatcaggagagtatccaatcattatcctacaccagtatctgccccgatacttcccaattaatgttaacaaaaataacttaactcttgagtact 17892493  T
Q  461 gatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctt 560  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17892494 gatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaatgttccttttgaatatagtataacactgatgatgctctt 17892593  T
Q  561 tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattta 660  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  17892594 tttggtttatattgtgtatgtaattgtctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctgcaagcctatgactgattta 17892693  T
Q  661 tgttatttgttaatatatttt 681  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  17892694 tgttgtttgttaatatatttt 17892714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 292 - 681
Target Start/End: Original strand, 36943746 - 36944141
Alignment:
Q  292 cgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcatta 391  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  36943746 cgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaaatttattttttttaaaaataattatctgatacttcctgatacgtatcaggagagtatctgatcatta 36943845  T
Q  392 tcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttctt 491  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36943846 tcctacaccggtatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtagtgatgtgttcttttttgaatatagtgtttctt 36943945  T
Q  492 ttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaa 591  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36943946 ttttagatcgatatagtataatactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaa 36944045  T
Q  592 taatcactctcttaatcgtcaatat------tatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    |||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36944046 taatcaatctcttaatcgtcaatattatttatatttatatttatgttgatgtgttgcgagcctatgactgatttatgttgtttgttaatatatttt 36944141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 282 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 3109356 - 3108957
Alignment:
Q  282 cgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtat 381  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||       || ||||||||||| ||||||||   |||||||||  ||| ||||    
T  3109356 cgatatttttcgatacgtatcagaagattaatcgaagattaaattttattttttaaacaaataattatccgatacttctcgatacgtatccggagagtat 3109257  T
Q  382 ccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatat 481  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  3109256 ccaatcattatcctacaccggtatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttattttttgaatat 3109157  T
Q  482 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3109156 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacacagatggtgctctttttgggatatattgtgtatgt 3109057  T
Q  582 aattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3109056 aattggctaataatcactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatttgctacgagcctatgactgatttatgttgtttgttaatatatttt 3108957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 277 - 681
Target Start/End: Original strand, 2586398 - 2586781
Alignment:
Q  277 ctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagag 376  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||        ||||||||||||||  ||||||||  |||| || || |||    
T  2586398 ctgcccgatactttccaatacgtatcagaagagtatccgaagattaaaatttgtttttttaaaaaataattatcctatacttcccgatacataccaggag 2586497  T
Q  377 cgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttct 476  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||         
T  2586498 agtatctgatcattatcctacaccggtatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttcaggactgatgtgttctt----- 2586592  T
Q  477 aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtg 576  Q
                   |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||    
T  2586593 ---------------ttttagatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatataatataacactgatgatgctcttttgagg-tatattgtg 2586676  T
Q  577 tatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2586677 tatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctgcgagcctatgactgatttatgttgtttgttaatat 2586776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Original strand, 52721567 - 52721819
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  52721567 atgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttct 52721666  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52721667 ttttgaatatagtatatcattgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 52721766  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  52721767 atgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttaatatattt 52721819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 363 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 44522016 - 44521699
Alignment:
Q  363 atacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactga 462  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  44522016 atacgtatcaggagagtatccgataattatccttcattgatatctgccccgatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactaa 44521917  T
Q  463 tgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttt 562  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| || | ||| |||| ||||    
T  44521916 tgtgttcttttttgaatataatgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcactaatggtgctttttt 44521817  T
Q  563 tgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatg 662  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |     
T  44521816 tgagatattttgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatgttatttatatttatgtagatgtgttacgagcgtataactgatttctt 44521717  T
Q  663 ttatttgttaatatattt 680  Q
    || |||||||||||||||    
T  44521716 ttgtttgttaatatattt 44521699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Original strand, 24784585 - 24784837
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||     
T  24784585 atgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagattgatatagtatagcactatcaatgttct 24784684  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24784685 ttttggatatagtatagcaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 24784784  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  24784785 atgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttaatatattt 24784837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 24823681 - 24823429
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||     
T  24823681 atgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagattgatatagtatagcactatcaatgttct 24823582  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823581 ttttggatatagtatagcaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 24823482  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  24823481 atgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttaatatattt 24823429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 292 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 42630526 - 42630131
Alignment:
Q  292 cgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaa-aataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcatt 390  Q
    ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||    
T  42630526 cgatacgtatcaggagaatatccgaagattaaattttattttaaaaaaataataattatccgatacttcctgatacgtatcaggtgagtatccgataatt 42630427  T
Q  391 atcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta------atatagt 484  Q
    ||| | ||| | ||||||| ||||| |||| || || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |       ||||| |    
T  42630426 atcttgcactgatatctgctccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttcttttttttttttggatataat 42630327  T
Q  485 gtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaat 584  Q
    | |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42630326 gcttcttttttgaatcgatgtagtataacactaacaatgttccttttggatagagtataacactgatgatgcttttttttggatatattgtgtatgtaat 42630227  T
Q  585 tggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  42630226 tgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgtgtctatgactgtttccttttgtttgttaatatattt 42630131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 292 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 31946267 - 31945902
Alignment:
Q  292 cgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcatta 391  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  31946267 cgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataatta 31946168  T
Q  392 tcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttctt 491  Q
    ||||  | |  |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||                      |||||| |||||    
T  31946167 tcctgtaacaatatctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagt----------------------atagtgcttctt 31946090  T
Q  492 ttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaa 591  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31946089 ttttggatcgatat-gtatagcactaacaatgttccttttagatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaa 31945991  T
Q  592 taatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31945990 tcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatattt 31945902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Original strand, 39957901 - 39958153
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||     
T  39957901 atgttaactaaaataacttaattcttgaatactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttct 39958000  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39958001 ttttagatatagtataacaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 39958100  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |  | |||||||||||||||    
T  39958101 atgtcgatgtgttacgagcctatgattgatttcttgtgtttgttaatatattt 39958153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 280 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 55901192 - 55900826
Alignment:
Q  280 cccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgt 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||          ||||  || ||    
T  55901192 cccgatacttctcgatacgtatcaggaaaatatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatctgatactt----------atcagaagagt 55901103  T
Q  380 atccgatcattatcctacaccggtatc-tgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaa 478  Q
    || ||||  ||||||||||||| || | |||||| ||  |||||| || ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  55901102 attcgatagttatcctacaccgataccctgccccaatatttcccaattaatggtgactaaaaaaacttaactcttgagtactgatgtgttcttttatgga 55901003  T
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55901002 tataatgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgta 55900903  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactg 655  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55900902 tgtaattgactaatcatcattctcgtaatcgtgagtataatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactg 55900826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Original strand, 40694138 - 40694513
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||    
T  40694138 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatctgaagattaaattttatttttttataaaataattatctgatacttcccgatacgtatgaggagagtatc 40694237  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
    | || |||||||| ||| | |||||||||| || ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||                      |||    
T  40694238 caataattatcctgcactgatatctgccccaatacttcccaattaatattaactaaaataacttaactcttgagt----------------------ata 40694315  T
Q  483 gtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgta 582  Q
     || |||||||||  ||||||||||||||  || |||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40694316 atgcttcttttttgaatcgatatagtatagtactaacaatgtttcttttggatataatatatcacttatgatgctctttttgggatatattacgtatgta 40694415  T
Q  583 attggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  40694416 attgactaatcatcactctcttaattgtcgatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcctttgtttgttaatatattt 40694513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 490 - 680
Target Start/End: Original strand, 47607354 - 47607544
Alignment:
Q  490 ttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggct 589  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47607354 ttttttggatcgatataatatagcaccaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgact 47607453  T
Q  590 aataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  47607454 aattatcactatcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 47607544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 353 - 631
Target Start/End: Original strand, 49470419 - 49470692
Alignment:
Q  353 atacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactct 452  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  49470419 atacttcccgatacgtatcaggagagtatctgataattatcctgcactgatatctgccccgatacttccaa-ttaatgttaactaaaataacttaactct 49470517  T
Q  453 tgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatg 552  Q
    |||||||| ||||   ||||||   |||  |||||| |||||||  ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||    
T  49470518 tgagtactcatgtaaacttttttggata--gtgtttttttttta--tcgatatagtatgtcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatg 49470613  T
Q  553 atgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49470614 atgcactttttggaaaatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 49470692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 479 - 679
Target Start/End: Original strand, 51675031 - 51675230
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  51675031 tatagtgcttcttttttggatagatatagtatatcactaacaatattcctttctaatatagtataacacttatgattctctttttgg-atatattgtata 51675129  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatat 678  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  51675130 tgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcatatgacttgtttattttgtttgttaatatat 51675229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 487 - 680
Target Start/End: Original strand, 51859045 - 51859238
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  51859045 ttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatgatgctctttttgtgatatattgtgaaagtaattg 51859144  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||| | || |||||||||||||||    
T  51859145 actaatcatcacccacttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtggtacgagtttatgatttgtttcttttgtttgttaatatattt 51859238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 487 - 680
Target Start/End: Original strand, 14614754 - 14614940
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14614754 ttcttttttagatcaatataatatagcactaacaatatttcttttggatataacataacatttatgatgttctttttgggatatactgtatatgtaattg 14614853  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     ||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14614854 actaatcat-------ttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 14614940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 268 - 515
Target Start/End: Original strand, 754224 - 754470
Alignment:
Q  268 cactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacg 367  Q
    ||||| || |||||||||| ||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||       ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  754224 cactgttacctgcccgataatttctgatacgtatcagaacagtatccgaagattaa-ttttatcattttaaaaaataattatcatatacttcctgatacg 754322  T
Q  368 tatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgt 467  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  754323 tatcaggagagtatccgatcattatcctacaccgatatccgccccgatacttaccatttaatgttaactaaactaacttaactcttgtgtattgatgtgt 754422  T
Q  468 tctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacac 515  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  754423 tattttttgaatatagtgtttcttttttggatagatatagtatgacac 754470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 487 - 676
Target Start/End: Original strand, 1177227 - 1177417
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgc-tctttttgggatatattgtgtatgtaatt 585  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||| || | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1177227 ttcttttttggattgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtacttttttttgggatatattgtgtatgtaatt 1177326  T
Q  586 ggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  1177327 gactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgttctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatat 1177417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 508 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 30683507 - 30683335
Alignment:
Q  508 tataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaat 607  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  30683507 tatagcactaacaatgttccttttgaatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgattaatcatcactctcttaat 30683408  T
Q  608 cgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  30683407 cgtcgatattatttatatttatgttgatatgctacgagtctatggctggtttcttgtgtttgttaatatattt 30683335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 487 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 258938 - 258779
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc-ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaatt 585  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  258938 ttcttttttggatcaatatagtatagcagtaacaatgttccgttttggatatagtataacacttatggtactctttttgagatatattgtgtatgtaatt 258839  T
Q  586 ggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  258838 gactaattatcactctcttaatcgtcactattatttatatttaagttgatttgctacgag 258779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 517 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 7952949 - 7952789
Alignment:
Q  517 aacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatat 616  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7952949 aacaatgttccttttggatatagtataacattgatgacgctccttttgggatatattatatatgtaattgattaatcatcactcttttaatcgtcaatat 7952850  T
Q  617 tatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatata 677  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| |  | ||||||||||||    
T  7952849 tacttatatttatgttgatatgctacgagtgtatgactggtttcttgtgtttgttaatata 7952789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 36511989 - 36511609
Alignment:
Q  278 tgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaa-taattatctgatacttcctaatacgtatcaagag 376  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||     
T  36511989 tgcccgatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggaa 36511890  T
Q  377 cgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttct 476  Q
     ||||||||| ||||||||  ||   || ||||||| ||  |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||                       
T  36511889 agtatccgataattatcctgaacttatacctgccccaataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagt------------------- 36511809  T
Q  477 aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgg---gatatatt 573  Q
       |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||| || |||||||||||| |||| || | ||| || | |||||     ||||||||    
T  36511808 ---atagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaagaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgtttttttttttttgatatatt 36511712  T
Q  574 gtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaa 673  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||| | || ||||||||    
T  36511711 ttgtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttgtattgatgtgctacgagcctatgaccggtttcttttgtttgttaa 36511612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 5835206 - 5835384
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||           |||||||| ||||| |||||||||||      
T  5835206 atatagtgcttctttttttgatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataacattgatggtgctctttttgat 5835305  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5835306 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgttacgag 5835384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Original strand, 41146349 - 41146559
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |        
T  41146349 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaag-ttccttttggatatagtgtag 41146446  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             ||| || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41146447 cattgatgtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgt 41146545  T
Q  632 tgatgtgctacgag 645  Q
    | ||||||||||||    
T  41146546 ttatgtgctacgag 41146559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 722576 - 722440
Alignment:
Q  387 cattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgt 486  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  722576 cattatcctacaccgatatccgccccgatacttaccatttaatgttaactaaactaacttaactcttgtgtattgatgtgttattttttgaatatagtgt 722477  T
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaata 523  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  722476 ttcttttttggatagatatagtatgacactaacaata 722440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 539 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 43509706 - 43509600
Alignment:
Q  539 atataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtg 638  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43509706 atataatactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtg 43509607  T
Q  639 ctacgag 645  Q
    |||||||    
T  43509606 ctacgag 43509600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 283 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 46431983 - 46431792
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||    ||| |||||| ||| |||||    
T  46431983 gatacttcccgatacgtatcaagagagtatccaaagattaaattttattttaaaaaaaaataattatccgatacttttcgatatgtatcaggagagtatc 46431884  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttt 474  Q
    |||| |||||| | ||||| || |||||| |||  ||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431883 cgataattatcatgcaccgatacctgccctgatatttcacaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttt 46431792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 548 - 645
Target Start/End: Original strand, 52573044 - 52573141
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52573044 tgatggtgctctttttggtatatactgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 52573141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 554 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 5325272 - 5325180
Alignment:
Q  554 tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 646  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  5325272 tgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtgttacgagc 5325180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 548 - 646
Target Start/End: Original strand, 14795866 - 14795964
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 646  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14795866 tgatggtgctctttttgatatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtgctacgagc 14795964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 478 - 641
Target Start/End: Original strand, 28377273 - 28377449
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata-------------acagtgatgatgctctttttg 564  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||             ||| ||||| |||||||||||    
T  28377273 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatataatatagcattgatgtataacactgatggtgctctttttg 28377372  T
Q  565 ggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgcta 641  Q
      |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28377373 ttatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgccaatattatttatatttatgttaatgtgcta 28377449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 283 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37992583 - 37992394
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta-nnnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtat 381  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||| ||| ||||    
T  37992583 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccaaagattaaattttatttttttaaaaaaataattatccgataattcccgatacatatcaggagagtat 37992484  T
Q  382 ccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttt 473  Q
    | ||| ||||| || ||||| |||||||||||||  ||| || || |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37992483 ctgatgattattctgcaccgatatctgccccgatatttctcaattaa--ttaactaaaataacttaactcttgagtaccgatgtgttctttt 37992394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 445 - 605
Target Start/End: Original strand, 53323084 - 53323255
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata------ 538  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||          
T  53323084 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatacagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtag 53323181  T
Q  539 -------atataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctctta 605  Q
            |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  53323182 cattgatgtatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctctta 53323255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 3402948 - 3402762
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata----- 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||         
T  3402948 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 3402851  T
Q  539 --------atataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattat 619  Q
             ||||||| | ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3402850 gcattgatgtataacacttattgtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcatcaatattat 3402762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 46431690 - 46431614
Alignment:
Q  604 taatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  46431690 taatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcccatgactcatttattttgtttgttaatatattt 46431614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 458
Target Start/End: Original strand, 1177102 - 1177220
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||  || ||||||| ||  |||||| || | ||||| ||||    
T  1177102 aaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatccgataattatcctgcacctatacctgccccaataattcccaattaacgttaaataaa 1177201  T
Q  440 ataacttaactcttgagta 458  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1177202 ataacttaactcttgagta 1177220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8063471 - 8063260
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  8063471 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 8063374  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctt---tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
              |||||| ||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  8063373 gcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatattt 8063278  T
Q  628 atgttgatgtgctacgag 645  Q
    || || ||||||||||||    
T  8063277 atattaatgtgctacgag 8063260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 502 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 37992387 - 37992305
Alignment:
Q  502 atatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaat 584  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37992387 atatagtataggactaacaatgttccttttggatataatatagcactaatggtgctctttttgggatatattgggtatgtaat 37992305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 458
Target Start/End: Original strand, 51858927 - 51859038
Alignment:
Q  347 tatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataactt 446  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| | || ||||| | || ||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  51858927 tatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcttgcactgatacctgcctcaatacttcccaattaatgttaactaaaataactt 51859026  T
Q  447 aactcttgagta 458  Q
    ||||||||||||    
T  51859027 aactcttgagta 51859038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 550 - 619
Target Start/End: Original strand, 31227201 - 31227270
Alignment:
Q  550 atgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattat 619  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31227201 atgatgctctttttggtatgtattgcgcatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 31227270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 36944040 - 36943971
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  36944040 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcagtgttatactatatccaaaaggaacattgtt 36943971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 55900895 - 55900972
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  55900895 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgctatattatatccaaaatgaacattgttagtgttat 55900972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 19738704 - 19738840
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  19738704 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 19738803  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  19738804 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 19738840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 52122980 - 52122844
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  52122980 ccgatacttcaaaatggatgacgtactgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 52122881  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  52122880 aaattttatttttttaaaaaataattatctgatactt 52122844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 3109052 - 3109129
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3109052 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccatctgtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 3109129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 17892619 - 17892542
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  17892619 caattacatacacaatataaaccaaaaagagcatcatcagtgttatactatattcaaaaggaacattgttagtgttat 17892542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 38492136 - 38491965
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  38492136 ttaactctt-agtaatgatgtgttctttttttggatatagggattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 38492039  T
Q  544 acagtga------tgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattat 619  Q
     || |||      || |||||||||||| |||||||| ||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||    
T  38492038 gcattgatgtatctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 38491965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 620 - 680
Target Start/End: Original strand, 10258433 - 10258493
Alignment:
Q  620 ttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||    
T  10258433 ttatatttatgttgatgtgctacaagcttatgactggtttcttttgtttgataatatattt 10258493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 317
Target Start/End: Original strand, 1176988 - 1177083
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaa 317  Q
    |||| |||||||||||| |||  || ||||||||| || |||||| |||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1176988 ccgatacttcaaaatagttgacgtatcgtatcccctacgtatcctgcacccatacctgcccgatactttccgatatgtatcagaagagtatccgaa 1177083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 358
Target Start/End: Original strand, 21637734 - 21637808
Alignment:
Q  284 atacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||    
T  21637734 atacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaacaattatctgatactt 21637808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 709
Target Start/End: Original strand, 26858333 - 26858370
Alignment:
Q  672 aatatattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26858333 aatatatttaaggcttaattgcacttttggccccctat 26858370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 39958059 - 39957990
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  39958059 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcggtgttatactatatctaaaaagaacattgtt 39957990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 42630225 - 42630302
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  42630225 caattacatacacaatatatccaaaaaaaagcatcatcagtgttatactctatccaaaaggaacattgttagtgttat 42630302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 49470647 - 49470578
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  49470647 caattacatacacaatattttccaaaaagtgcatcatcaatgctatactatatccaaaaggaacattgtt 49470578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 52721725 - 52721648
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||    
T  52721725 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcaatgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttat 52721648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 726552 - 726496
Alignment:
Q  337 aaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatc 393  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  726552 aaaaagtaattatcatatacttcctgatacgtatcaggagagtatccgatcattatc 726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 536
Target Start/End: Original strand, 14795751 - 14795841
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggata 536  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  14795751 ttaactctt-agtattgatgtgttctttttttggatatagtgattctttttcggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggata 14795841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 358
Target Start/End: Original strand, 39957630 - 39957707
Alignment:
Q  281 ccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  39957630 ccgatacttctcgatacgtatccggagagtatccgaatattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 39957707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Original strand, 5834837 - 5834944
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  5834837 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatgcttcccgatacgtatcgggagagtatccaaatatt 5834936  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  5834937 aaatttta 5834944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8064220 - 8064084
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||  || |||    
T  8064220 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatctaaatatt 8064121  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  8064120 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 8064084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 12893281 - 12893250
Alignment:
Q  678 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12893281 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 12893250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 538
Target Start/End: Original strand, 31227092 - 31227176
Alignment:
Q  456 gtactgatgtgttctttttcta---atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||||||||||||| |    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  31227092 gtactgatgtgttctttttttttttatatagtaattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatata 31227176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 52721276 - 52721378
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||  | ||||| ||| || ||||||||    
T  52721276 acttcaaaatagatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcaccgatatctgcctgatacttcccgatacgtattcggagagtatccaaatattaaatt 52721375  T
Q  327 tta 329  Q
    |||    
T  52721376 tta 52721378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 603 - 645
Target Start/End: Original strand, 53324587 - 53324629
Alignment:
Q  603 ttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  53324587 ttaatcatcaatattatttatatttatgttaatgtactacgag 53324629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 233011 - 232978
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  233011 tattttaggcttaattgcacttttggacccctat 232978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 816 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 2586663 - 2586618
Alignment:
Q  816 aaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2586663 aaaagagcatcatcagtgttatattatatccaaaaggaacattgtt 2586618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5325793 - 5325699
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgata 355  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||       |||||||||||||| ||||    
T  5325793 tatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatctggagagtatccaaatattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgata 5325699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 710
Target Start/End: Original strand, 13388155 - 13388188
Alignment:
Q  677 attttaggcttaattgcacttttggccccctatg 710  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13388155 attttaggcttaattgcagttttggccccctatg 13388188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22492968 - 22492895
Alignment:
Q  556 ctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 629  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||  ||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22492968 ctctttttgggatatatcatatatgtaattgactaattgtcactttctttattatcaatattacttatatttat 22492895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 709
Target Start/End: Original strand, 24415062 - 24415099
Alignment:
Q  672 aatatattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24415062 aatattttttaggcttaattgcacttttggacccctat 24415099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Original strand, 31945996 - 31946065
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| | || |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  31945996 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatctaaaaggaacattgtt 31946065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 40694419 - 40694350
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  40694419 caattacatacgtaatatatcccaaaaagagcatcataagtgatatattatatccaaaagaaacattgtt 40694350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 47607450 - 47607377
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtg 865  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| | || |||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  47607450 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaaaagaaacattgttggtg 47607377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 51675137 - 51675069
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  51675137 caattacatatacaatatat-ccaaaaagagaatcataagtgttatactatattagaaaggaatattgtt 51675069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 261 - 681
Target Start/End: Original strand, 28968556 - 28968977
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||    
T  28968556 tatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcc 28968655  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgta-tccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtac 459  Q
      |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28968656 cgatacgtatcaggagagtaatccgatcattatcctacatcggtatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtaa 28968755  T
Q  460 tgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctct 559  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28968756 tgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatataatataacactaacaatgttcattttggatatagtataacattgatgatgctct 28968855  T
Q  560 ttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28968856 ttttgggatatattgtgtatgtaattggttaataatcactctattaattgtcaatattatttatatttatattgatgtgctacgagcctatgactgattt 28968955  T
Q  660 atgttatttgttaatatatttt 681  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  28968956 atgttgtttgttaatatatttt 28968977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 281 - 681
Target Start/End: Original strand, 47642072 - 47642472
Alignment:
Q  281 ccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgta 380  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||    
T  47642072 ccgatacttcccaatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttataaaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagta 47642171  T
Q  381 tccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaata 480  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  47642172 tccgatcattatcctacacaagtatctgccccgatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttgaata 47642271  T
Q  481 tagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatg 580  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47642272 tagcgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgtgatatattgtgtatg 47642371  T
Q  581 taattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47642372 taattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttgcgagtctatgactgatttatgttgtttgttaatatattt 47642471  T
Q  681 t 681  Q
    |    
T  47642472 t 47642472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 7899779 - 7899371
Alignment:
Q  273 atatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnna-aaaaataattatctgatacttcctaatacgtatc 371  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  7899779 atatctgcttgatatttcccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttacaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatc 7899680  T
Q  372 aagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctt 471  Q
      ||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7899679 gggagagtatctgatcattatcctatactgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctt 7899580  T
Q  472 tttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatata 571  Q
    ||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7899579 ttt-taatatagtgcttctcgtttggatcgatatagtatagcactagcaatgtttcttttggatgtagtataacactgatggtgctctttttgggatata 7899481  T
Q  572 ttgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgtt 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||    
T  7899480 ttgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatgactggtttatgttgtttttt 7899381  T
Q  672 aatatatttt 681  Q
    ||||||||||    
T  7899380 aatatatttt 7899371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 292 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19879144 - 19878756
Alignment:
Q  292 cgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcatta 391  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||       |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  19879144 cgatatgtataaggagagtatccgaagattcaattttattttttaaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcatgagagtattcgataatta 19879045  T
Q  392 tcctacaccggtatctgcccc-gatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttct 490  Q
    |||| ||||| |  ||||||| |||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  19879044 tcctgcaccgctgcctgcccccgatagttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatataatgtttct 19878945  T
Q  491 tttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggcta 590  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| || || || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  19878944 tttttggatcgatataatatatcactaacaatattccttttggatatattatagcactggtggtgctcttttt-ggatatattgtgtatgtaattgacta 19878846  T
Q  591 ataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||| |||||||||||    
T  19878845 atcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgaacttatgactggtttcttttgtttattaatatattt 19878756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 261 - 680
Target Start/End: Original strand, 25700806 - 25701228
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaa-aaaataattatctgatacttc 359  Q
    |||||| ||| |||| ||||| ||||||||   ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||| ||||||||    
T  25700806 tatcctgcaccgatacctgcctgatacttcctaatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttatttttaaaataattatccgatacttc 25700905  T
Q  360 ctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtac 459  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25700906 ccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcactgatgtctgccccgatacttcccaattaatgtttactaaaataacttaactcttgagtac 25701005  T
Q  460 tgatgtgttctttttcta-atatagtgtttctt-ttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgct 557  Q
    | ||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||| | ||||    
T  25701006 ttatgtgttttttttttttatatagtgttttttattttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatagcactgacggtgct 25701105  T
Q  558 ctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgat 657  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25701106 ctttttgggatatattgtgtttgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtcctacgagcctatgactgat 25701205  T
Q  658 ttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    || | || |||||||||||||||    
T  25701206 ttcttttgtttgttaatatattt 25701228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 352 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 45057282 - 45056954
Alignment:
Q  352 gatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactc 451  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  45057282 gatacttcccgatacgtatcatgagagtattcgataattatcctacacagatatctgccctgatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaactc 45057183  T
Q  452 ttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgat 551  Q
    ||||||||| |||||||||||||   ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| |||| || || |    
T  45057182 ttgagtactaatgtgttcttttttggatataatgcttattttttggatcgatatagtacaacactaacaatgtttcttttgtatatagtatagcactgct 45057083  T
Q  552 gatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatg 651  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  45057082 ggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattgttgatattatttatatttatgttgatgcgctacgagcctaag 45056983  T
Q  652 actgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| ||| | || |||||||||||||||    
T  45056982 actggtttcttttgtttgttaatatattt 45056954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 315 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 20510174 - 20509830
Alignment:
Q  315 gaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccga 414  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |  |||| |||| |||||||| || || || ||||||| |    
T  20510174 gaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatctgatacttcccgatacttatcagaaaagtattcgataattatcctgcatcgatacctgccccaa 20510075  T
Q  415 tccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataaca 514  Q
    |  |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20510074 tatttcccaattaatgttgactaaaataacttaactcttgaatagtgatgtattcttttatggatatagtgcttcttttttggatcgacatagtataaca 20509975  T
Q  515 ccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaat 614  Q
    | |||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  20509974 ctaacaatgttcattttggatatagtatatcattgatggtgctccttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcact 20509875  T
Q  615 attatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20509874 attatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgattgattt 20509830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Original strand, 52684540 - 52684792
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  52684540 atgttaactaaaataactcaactattgagtactaatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttct 52684639  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52684640 ttttggatatagtataacaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactcttttaatcgtcaatattatttatattt 52684739  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  52684740 atgttgatgtgctacgagtctatgactggtttcttgtgtttgttaatatattt 52684792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 2567174 - 2566923
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||     
T  2567174 atgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtataacacatacaatgttct 2567075  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    |||||||||||  ||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2567074 ttttggatatagcatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 2566975  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |  | |||||||||||||||    
T  2566974 atgttgatgtgctaggagcttgtgact-atttcttgtgtttgttaatatattt 2566923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Original strand, 19421484 - 19421877
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||     
T  19421484 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaagtaattatccgatacttcccgatacgtatcaggagcgtata 19421583  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
     ||| |||||||| ||||| || |||||| |||  |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||    
T  19421584 tgataattatcctgcaccgatacctgccctgatatttcccaattaatgttaaccaaaataacttaactcttgagcactgatgtattcttttttggatata 19421683  T
Q  483 gtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttg------gatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtg 576  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||       |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19421684 gtgcttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaatgttccttatgaatataaatataatatagcactaatggtgctctttttgggatatattgtg 19421783  T
Q  577 tatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||          |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  19421784 tatgtaattgactaatcatcactctcttaagcatcaat----------tttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatat 19421873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21006268 - 21006016
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  21006268 atgttaaataaaataacttaactattgagtatcgatgtgttcttttttcgatataatgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttct 21006169  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21006168 ttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattc 21006069  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  21006068 atgttgatgtgctacgaacctgtgactggtttcttgtgtttgttaatatattt 21006016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 337 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13353191 - 13352876
Alignment:
Q  337 aaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaatt 436  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| || ||||| || || || |  | ||||| ||||  | || ||||||| |    
T  13353191 aaaaaaaatttatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataataatcctgcatcgatagcgactccgatacttcggaattaatgttaact 13353092  T
Q  437 aaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggata 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  13353091 aaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgacacagtatagcactaacaatgttccttttggata 13352992  T
Q  537 taatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatg 636  Q
    || |||| || | ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13352991 tagtatatcattaatggtgttgtttttaggatatattgtgtatgtaattgactaattatcatacttttaatcctcaatattatttatatctatgttgatg 13352892  T
Q  637 tgctacgagcttatga 652  Q
    |||||||||| |||||    
T  13352891 tgctacgagcctatga 13352876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 338 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 38889081 - 38888750
Alignment:
Q  338 aaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaatta 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||| |||||||| | |   || ||||||||||  ||| || || ||||||| ||    
T  38889081 aaaaataattatttgatacttcccgatgcgtatcaggagagtatccgataattatcctgctctaatacctgccccgatatttctcaattaatgttaacta 38888982  T
Q  438 aaataacttaactcttgagtactgatgtgtt-ctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggata 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| || |||||| ||| |||| |||||| ||| |||||            ||     
T  38888981 aaataacttaactcttgagtactggtgtgtttcttttttggatatagtgcttattttttggattgataaagtatagcactaacaa------------atg 38888894  T
Q  537 taatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatg 636  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38888893 tagtataacattgatgatgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactgtcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatg 38888794  T
Q  637 tgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||| |||  ||||||||||| | || ||||||||| |||||    
T  38888793 tgctacaagcccatgactgatttcttttgtttgttaatgtattt 38888750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 286 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30787609 - 30787350
Alignment:
Q  286 acttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaa-aataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccg 384  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||| ||||||||||  ||||||||  |||| ||||| ||| |||||||    
T  30787609 acttctcgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaaataataattatcctatacttcccgatacatatcaggagagtatccg 30787510  T
Q  385 atcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagt 484  Q
    || |||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  30787509 ataattatcatgcactgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttattttttggatatagt 30787410  T
Q  485 gtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataa 544  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  30787409 gcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttagatatagtataa 30787350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 268 - 672
Target Start/End: Original strand, 983247 - 983627
Alignment:
Q  268 cactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaa-taattatctgatacttcctaatac 366  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||       |||||| |||||||| |||| |||| |||||    
T  983247 cactgatatctgtctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccaaagattaaattttatttaaaaaaaaaaataattatccgatatttcccaatac 983346  T
Q  367 gtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtg 466  Q
    ||         |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  983347 gt---------gtatccaataattatcctgcaccgctatctgccccgatagttcccaattaatgttaactaaaacaacttaactcttgagtacttatgtg 983437  T
Q  467 ttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||  || ||||||||                |||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||  |    
T  983438 ttcttttttggatatagtgtttcttttttgaatggatatagt----------------tccttttggacatagtatagcactgatggtgctctttttatg 983521  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttat 666  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||| | || |    
T  983522 atatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttattcgtcaatattatttatatttacgttgatgtactacgagactatgactaatttcttttgt 983621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 479 - 680
Target Start/End: Original strand, 29916034 - 29916236
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  29916034 tatagtgcttctgttttagatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatggtgttctttttgggatatattgttta 29916133  T
Q  579 tgtaattggctaat-aatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatata 677  Q
    |||||| | |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  29916134 tgtaatcgactaatccatcactctcttgatcgacaatattatttatatttatgttgatatgctacgagtctatgactggtttcttttgtttgttaatata 29916233  T
Q  678 ttt 680  Q
    |||    
T  29916234 ttt 29916236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 479 - 680
Target Start/End: Original strand, 29965187 - 29965389
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  29965187 tatagtgcttctgttttagatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatggtgttctttttgggatatattgttta 29965286  T
Q  579 tgtaattggctaat-aatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatata 677  Q
    |||||| | |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  29965287 tgtaatcgactaatccatcactctcttgatcgacaatattatttatatttatgttgatatgctacgagtctatgactggtttcttttgtttgttaatata 29965386  T
Q  678 ttt 680  Q
    |||    
T  29965387 ttt 29965389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21157800 - 21157539
Alignment:
Q  262 atcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcct 361  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||   |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||    
T  21157800 atcctgcattgataactgcccgatactttctgatacgtaccaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcct 21157701  T
Q  362 aatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactg 461  Q
     |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21157700 gatacgtatcaggagagtatctgataattatcctgcaccgctacctgccccgatagttcccaattaatgttaattaaaataacttaactctcgagtattg 21157601  T
Q  462 atgtgttctttttct-aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaat 522  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  21157600 atgtgttctttttttggatatagtgcttctttttttgattgatatagtatagcactaacaat 21157539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 22289771 - 22289397
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    ||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  22289771 gatacttcctgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttctttaaaaaataatcatctgatactttctaatacgtatcaggagagtatc 22289672  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
     ||| |||||| |  |||| || ||||||  || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||                      |||    
T  22289671 tgataattatcatgtaccgatacctgccctaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaacttttgggt----------------------ata 22289594  T
Q  483 gtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgta 582  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| | ||| || | |||||||||||||||  |||||||    
T  22289593 gtgcttcttttttggatcgatatagtacaacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtg-tttttttgggatatattcggtatgta 22289495  T
Q  583 attggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||    
T  22289494 attgaataatcatcactctattaatcgtcaatattatttatatttacgttgatgtactacgagcctatgaatggtttcttttgtttgttaatatattt 22289397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 487 - 655
Target Start/End: Original strand, 48333212 - 48333380
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  48333212 ttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatattccttttggatatagtataacactgatggtgttcttttcgggatatattgtgtatgtagttg 48333311  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactg 655  Q
     || |   ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48333312 actgaccgtcactctcttaattgtcaatattatatatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactg 48333380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 278 - 652
Target Start/End: Original strand, 2122770 - 2123124
Alignment:
Q  278 tgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaata--attatctgatacttcctaatacgtatcaaga 375  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||       |||||| |  |||||||||||||||   ||||||||||  |    
T  2122770 tgcctgatacttcccgatacgtatcaggagagaatccgaagattaaattttattttaaaaaaaaaaagaattatctgatacttcgcgatacgtatcagta 2122869  T
Q  376 gcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttc 475  Q
    |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| | || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||                      
T  2122870 gactatccgataattatcctgcactggtacctgcctcaatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagt------------------ 2122951  T
Q  476 taatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgt 575  Q
        |||||| |||| ||||  ||| | ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2122952 ----atagtgcttctatttttaatcaaaatagtataagactaacaatctttcttttggatataatataacacttatgatgctctttttgggatatattgt 2123047  T
Q  576 gtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatga 652  Q
    | | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2123048 gaaagtaattgactaatcatcacccacttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgttctacgagcttatga 2123124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 479 - 676
Target Start/End: Original strand, 2122951 - 2123148
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| |||| ||||  ||| | ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2122951 tatagtgcttctatttttaatcaaaatagtataagactaacaatctttcttttggatataatataacacttatgatgctctttttgggatatattgtgaa 2123050  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
     ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| | || |||||||||||    
T  2123051 agtaattgactaatcatcacccacttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgttctacgagcttatgatttgtttcttttgtttgttaatat 2123148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 531 - 680
Target Start/End: Original strand, 212810 - 212959
Alignment:
Q  531 tggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
    |||||||| |||| || | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  212810 tggatatagtatagcactcatgttgctctttttgagatatattatgtatgtaattgactaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttacg 212909  T
Q  631 ttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||    
T  212910 ttgatgtggtacgagcctatgactaatttcttttgtttgttaatatattt 212959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 487 - 680
Target Start/End: Original strand, 28548296 - 28548489
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||| |||||  ||| || ||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  28548296 ttcttttttggatcgatatagcatagcactaacaatgttctttttgaatatagcatatcactgatgttgctctttttgagttatagtgtatatgtaattg 28548395  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |  | |||||||||||||||    
T  28548396 actaattatcactctcttaatcggtaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactagtttcttatgtttgttaatatattt 28548489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 22311106 - 22311284
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  22311106 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttggt 22311205  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22311206 atatcttgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 22311284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 557 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21157536 - 21157413
Alignment:
Q  557 tctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactga 656  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  21157536 tcttttggggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattcatatttatgttgatgtgctaagagcatatgactgg 21157437  T
Q  657 tttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||    
T  21157436 tttcttttacttgttaatatattt 21157413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 35390126 - 35390301
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgat--------gatgctctttttgggata 569  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||        | |||||||||||| |||    
T  35390126 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatatgacactggtgctctttttggtata 35390225  T
Q  570 tattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    | ||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35390226 ttttacgtatgtaattgactaatcatcattctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 35390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 517 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 25322333 - 25322170
Alignment:
Q  517 aacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatat 616  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25322333 aacaatgttccttttggatatagtataacattgatagtgctctttttgggatatattatatatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatat 25322234  T
Q  617 tatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    || |||||||||||| ||| ||||| |||| | ||| || ||| |  | |||||||||||||||    
T  25322233 tacttatatttatgtagatatgctatgagcctgtgattggtttcttgtgtttgttaatatattt 25322170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 562 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 13748291 - 13748177
Alignment:
Q  562 ttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttat 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  13748291 ttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctataactggtttat 13748192  T
Q  662 gttatttgttaatat 676  Q
     || |||||||||||    
T  13748191 tttgtttgttaatat 13748177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 540 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 42464408 - 42464302
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42464408 tataacactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 42464309  T
Q  640 tacgagc 646  Q
    |||||||    
T  42464308 tacgagc 42464302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 570 - 676
Target Start/End: Original strand, 45347907 - 45348013
Alignment:
Q  570 tattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttg 669  Q
    |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  45347907 tattgtgtttgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttcttttgtttg 45348006  T
Q  670 ttaatat 676  Q
    |||||||    
T  45348007 ttaatat 45348013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 487 - 655
Target Start/End: Original strand, 48334155 - 48334323
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| || |||||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  48334155 ttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtataacacggatggtgttcttttcgggatatattgtgcatgtcgttg 48334254  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactg 655  Q
     || |   | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48334255 actgaccgttaccctcttaatcgtcaatattatatatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactg 48334323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 478 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 50287088 - 50286911
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  50287088 atatagtgtttcttttttggatcgatatagtatagcatcaataatgttccttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttggt 50286989  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacga 644  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50286988 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttaatgtactacga 50286911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 283 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 55269066 - 55268854
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||  |||||    
T  55269066 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgcatcaggatagtatc 55268967  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
    |||| |||||||| ||  | ||||||||  ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||    
T  55268966 cgataattatcctgcattgatatctgccatgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaagtcttgagtactgatgtgttattttttggatata 55268867  T
Q  483 gtgtttctttttt 495  Q
    ||  |||||||||    
T  55268866 gttcttctttttt 55268854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 445 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 25936452 - 25936242
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataa 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| | ||     
T  25936452 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgtag 25936355  T
Q  545 cagtgatga-------------tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
    || |||||              |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25936354 cattgatgtatagcactaatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattgtttatatttatgt 25936255  T
Q  632 tgatgtgctacga 644  Q
    | |||||||||||    
T  25936254 taatgtgctacga 25936242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 28882421 - 28882243
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  28882421 atatagtgcttctttttatgatcgatatagtatagcattaacaatgtttcttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttggt 28882322  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28882321 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 28882243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 458
Target Start/End: Original strand, 45347306 - 45347541
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgattaccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatta 322  Q
    |||| |||||||||| | ||| || |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  45347306 ccgatacttcaaaatggttgactatcgtatcccctgc-tatcctgcactgatacctgcccgatacttttcgatacgtatccgaagagtatccgaagatta 45347404  T
Q  323 aatttta-nnnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcc 421  Q
    |||||||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||| ||  |||     
T  45347405 aattttattttttttaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggaaagtatctgataattatcctgcacctatatctgccccaataattct 45347504  T
Q  422 cagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
    || || | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  45347505 caattaacgttaaataaaataacttaaatcttgagta 45347541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 548 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10224419 - 10224321
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10224419 tgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgagcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgagc 10224321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 508 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 47750758 - 47750631
Alignment:
Q  508 tataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggata-tattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaa 606  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  47750758 tataacactaacaatattccttttggatatagtataatattgatggtgctctttt-gggataatattgtatatgtaattgattaatcatcactctcttaa 47750660  T
Q  607 tcgtcaatattatttatatttatgttgat 635  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47750659 tcttcaatattacttatatttatgttgat 47750631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 588 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 41741912 - 41741821
Alignment:
Q  588 ctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatt 679  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  41741912 ctaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatatt 41741821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 548 - 642
Target Start/End: Original strand, 48123683 - 48123777
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctac 642  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48123683 tgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctac 48123777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22610650 - 22610440
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |        
T  22610650 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgtag 22610553  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             |||||| ||||  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22610552 cattgatgtataacactgatagtgctctttttgt-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgt 22610454  T
Q  632 tgatgtgctacgag 645  Q
    | ||||||||||||    
T  22610453 taatgtgctacgag 22610440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 569 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 30787350 - 30787274
Alignment:
Q  569 atattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787350 atattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 30787274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 41742144 - 41741947
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||| || || |||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| | |||||||    
T  41742144 tatcctgcaccgataccttcctgatacttcccgatacatatctggagagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccggtacttcc 41742045  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
      |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | ||  |||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41742044 cgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcactgatacatgccccaatacttcccaattaatgttaagtaaaataacttaactcttgagta 41741947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 52505198 - 52504986
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  52505198 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaag-ttccttttggatatagtgta 52505101  T
Q  544 acagtgatga-------------tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
     || |||||              |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52505100 gcattgatgtatagcactaatggtgctctttttagtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttata 52505001  T
Q  631 ttgatgtgctacgag 645  Q
    || ||||| ||||||    
T  52505000 ttaatgtgttacgag 52504986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 283 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6134432 - 6134242
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||       |||||||||||||| |||||||||  |||  ||||| ||| ||||     
T  6134432 gatacttcccgatatgtatcaggagagtatccgaagattaaatattattttttaaaaaaataattatccgatacttcccgatatttatcaggagagtatt 6134333  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttt 473  Q
    |||| |||||||| || || ||  ||||| | |  |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6134332 cgataattatcctgcatcgatacatgccctgttatttcccaattaatgttgactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttttttt 6134242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 458
Target Start/End: Original strand, 42229720 - 42229907
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||       |||||||||||||| |||||        
T  42229720 tatcctgcaccgatacctgcccgatacttcctgatacgtatcagaagagtatccgaaaattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatac---- 42229815  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
          |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42229816 ------gtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccaatacctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagta 42229907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 45532436 - 45532226
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |        
T  45532436 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggattgatataatatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgtag 45532339  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             ||| || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45532338 cattgatgtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccaccctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 45532240  T
Q  632 tgatgtgctacgag 645  Q
    | ||||||||||||    
T  45532239 taatgtgctacgag 45532226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 540 - 645
Target Start/End: Original strand, 52121613 - 52121718
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52121613 tataacagtgatggtgctctttttgatatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtaaataatatttatatttatgttaatgtgc 52121712  T
Q  640 tacgag 645  Q
    ||||||    
T  52121713 tacgag 52121718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 479 - 676
Target Start/End: Original strand, 39664657 - 39664857
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttg----ggatatattg 574  Q
    ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||| || | ||| |  | |||||     ||||||||||    
T  39664657 tatagtgcttcttttttgtattgatatagtataacactgacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtatttttttttttttggatatattg 39664756  T
Q  575 tgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaat 674  Q
    | ||| |||||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||    
T  39664757 t-tatataattgacaaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgacgtgctacgagcctatgcctgatttcttttgtttgttaat 39664855  T
Q  675 at 676  Q
    ||    
T  39664856 at 39664857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 479 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 19349480 - 19349300
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatat-----att 573  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||| ||||||| | ||| || | ||| |   || |     |||    
T  19349480 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgttttttattttattttatgtatt 19349381  T
Q  574 gtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgact 654  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  19349380 gtgtatgtaattgactaatcgtcgctctcttaatcgtcaatataatttatatttatgttgatgtgttatgagcctatgact 19349300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 528 - 645
Target Start/End: Original strand, 33241166 - 33241288
Alignment:
Q  528 ttttggatataatataacagtgat-----gatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattattta 622  Q
    ||||||||||||||||||| ||||     | ||||||||||   |||| |||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33241166 ttttggatataatataacattgatataacggtgctcttttttatatattttgcatatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 33241265  T
Q  623 tatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  33241266 tatttatgttaatgtgctacgag 33241288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 540 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1678948 - 1678846
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    |||||||||| || ||||||    
T  1678948 tataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttatattaatgtgc 1678853  T
Q  640 tacgagc 646  Q
    |||||||    
T  1678852 tacgagc 1678846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 540 - 646
Target Start/End: Original strand, 28705591 - 28705693
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    |||||||||| || ||||||    
T  28705591 tataacattgatggtgctctttttggtatatattgcatatgtaattgtctaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttatattaatgtgc 28705686  T
Q  640 tacgagc 646  Q
    |||||||    
T  28705687 tacgagc 28705693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 13748519 - 13748323
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  13748519 tatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttttt-taaaataattatctgatacttcc 13748421  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
      ||||||||||  |  ||||||||| |||||| |  |||  || ||||||| ||  || ||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13748420 cgatacgtatcagaaaagtatccgataattatcatgtacctatacctgccccaataatttccaattaacgttaaataaaataatttaactcttgagta 13748323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 541 - 619
Target Start/End: Original strand, 1528881 - 1528959
Alignment:
Q  541 ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattat 619  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1528881 ataacactgctggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 1528959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Original strand, 7327968 - 7328060
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  7327968 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatata 7328060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37996665 - 37996573
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  37996665 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatata 37996573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 28968882 - 28968805
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  28968882 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcaatgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttat 28968805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 487 - 546
Target Start/End: Original strand, 42229914 - 42229973
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataaca 546  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42229914 ttcttttttgaatcgatatagtatagcactaacaatattccttttggatatagtataaca 42229973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 47642377 - 47642300
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  47642377 caattacatacacaatatatcacaaaaagagcatcatcaatgttatactatatccaaaaagaacattgttagtgttat 47642300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 511
Target Start/End: Original strand, 212670 - 212802
Alignment:
Q  379 tatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaa 478  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |  ||  || || |||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  212670 tatccgataattatcctacacatatatctgccccggtatttttcaattaatgtcaactaaaattatttaactcttgagtattgatgtgttcttttttgga 212769  T
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtata 511  Q
    || | || ||||||||| |||||||| ||||||    
T  212770 taaaatgcttctttttttgatcgataaagtata 212802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1679055 - 1678980
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaaca 520  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  1679055 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaaca 1678980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 453
Target Start/End: Original strand, 29915926 - 29916030
Alignment:
Q  349 tctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaa 448  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||| ||| |||||||| || || ||  |||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  29915926 tctgatacttcccgatacgtatcaggatagtatctgataattatcctgcatcgatacatgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaa 29916025  T
Q  449 ctctt 453  Q
    |||||    
T  29916026 ctctt 29916030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 453
Target Start/End: Original strand, 29965079 - 29965183
Alignment:
Q  349 tctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaa 448  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||| ||| |||||||| || || ||  |||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  29965079 tctgatacttcccgatacgtatcaggatagtatctgataattatcctgcatcgatacatgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaa 29965178  T
Q  449 ctctt 453  Q
    |||||    
T  29965179 ctctt 29965183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 385
Target Start/End: Original strand, 48334076 - 48334124
Alignment:
Q  337 aaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccga 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  48334076 aaaaaataattatctgatacttcctgatacgtatcaagaaagtatccga 48334124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Original strand, 35389757 - 35389864
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  35389757 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatcgggagagtatccaaatatt 35389856  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  35389857 aaatttta 35389864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 40497337 - 40497473
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  40497337 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacttgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 40497436  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  40497437 aaattttatttttaaaaaaaataattatccgatactt 40497473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1679786 - 1679675
Alignment:
Q  245 taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaata 344  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||       ||||||||    
T  1679786 taccgtatccactgcatatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttatttttaaaaaaaata 1679687  T
Q  345 attatctgatac 356  Q
    |||||| |||||    
T  1679686 attatccgatac 1679675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10224501 - 10224440
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat 540  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  10224501 atatagtgattcttttttggatcgatttagtataacactaacaa-gttccttttggatataat 10224440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Original strand, 7327719 - 7327853
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | | ||| ||| || |||    
T  7327719 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggatagtatccaaatatt 7327818  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  7327819 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatac 7327853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 385
Target Start/End: Original strand, 48333079 - 48333181
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||| ||| |||||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||    
T  48333079 gatatttcccgatatatattaaaagagtattcgaagattaaattttatattaaaaaaaaataattatttgatacttcctgatacgtatcaggaaagtatc 48333178  T
Q  383 cga 385  Q
    |||    
T  48333179 cga 48333181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 52684698 - 52684621
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||  ||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  52684698 caattacatacacaatatataccaaaaagagcaccatcggtgttatactatatccaaaaagaacattgttagtgttat 52684621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 455 - 538
Target Start/End: Original strand, 28705493 - 28705576
Alignment:
Q  455 agtactgatgtgttctttttct-aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||    
T  28705493 agtacggatgtgttctttttttgaatatagtgattcttttttggatcgatatagaatatcactaacaa-gttcattttggatata 28705576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 677 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 40410194 - 40410162
Alignment:
Q  677 attttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40410194 attttaggcttaattgcacttttggccccctat 40410162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41741948 - 41741916
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtata 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41741948 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtata 41741916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 671 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 17258256 - 17258217
Alignment:
Q  671 taatatattttaggcttaattgcacttttggccccctatg 710  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17258256 taatattttataggcttaattgcacttttggccccctatg 17258217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45533041 - 45532957
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  45533041 gatacctgcccgatacttcccgatacgtatccgaagagtatccaaatattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatac 45532957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 46934306 - 46934275
Alignment:
Q  678 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46934306 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 46934275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 50725065 - 50725034
Alignment:
Q  678 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50725065 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 50725034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 709
Target Start/End: Original strand, 50787785 - 50787816
Alignment:
Q  678 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50787785 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 50787816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Original strand, 52121187 - 52121294
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  52121187 ccgatacttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcactaatacctgtccgatacttctcgatacgtatcgggagagtatccaaatatt 52121286  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  52121287 aaatttta 52121294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 709
Target Start/End: Original strand, 54476038 - 54476069
Alignment:
Q  678 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54476038 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 54476069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 709
Target Start/End: Original strand, 54716471 - 54716502
Alignment:
Q  678 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54716471 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 54716502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 329
Target Start/End: Original strand, 3983765 - 3983811
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3983765 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaatttta 3983811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 30226432 - 30226534
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatga-ttaccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| |  | |||||| ||| |||| |||||||||||||   |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  30226432 acttcaaaatggatgacttatcgtatcctctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttctgatacgtatcaagagagtatccgaagattaaatt 30226531  T
Q  327 tta 329  Q
    |||    
T  30226532 tta 30226534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 395
Target Start/End: Original strand, 39664082 - 39664136
Alignment:
Q  341 aataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcct 395  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  39664082 aataattatctgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatccgataattatcct 39664136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42464979 - 42464884
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||       |||||||||||||| |||||    
T  42464979 tatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccgaagagtatccaaatattaatttttattgttttaaaaaataattatccgatac 42464884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Original strand, 48123568 - 48123660
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  48123568 ttaactctt-agtactgatgtggtcattttttggatatagtgattcttttttgaatcgacatagtataacacaaacaa-gttccttttggatata 48123660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 2123058 - 2122989
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    ||||||| | || ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  2123058 caattactttcacaatatatcccaaaaagagcatcataagtgttatattatatccaaaagaaagattgtt 2122989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Original strand, 19878850 - 19878918
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | || || || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  19878850 caattacatacacaatatat-ccaaaaagagcaccaccagtgctataatatatccaaaaggaatattgtt 19878918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 20509903 - 20509980
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| || |||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  20509903 caattacatacacaatatatcccaaaaggagcaccatcaatgatatactatatccaaaatgaacattgttagtgttat 20509980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 21006110 - 21006187
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||  || |||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  21006110 caattacatacacaatatataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgttat 21006187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 27766837 - 27766804
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27766837 tattttaggcttaattgcacttttggacccctat 27766804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 47750680 - 47750757
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||| | |||||  ||| ||||||| | ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47750680 caattacatatacaatattatcccaaaagagcaccatcaatattatactatatccaaaaggaatattgttagtgttat 47750757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Original strand, 48122832 - 48122966
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||| ||| ||||| |||||   ||||| ||| || |||    
T  48122832 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcatatcctgcaccgatacatgcccgatatttcccgatacgtatccagagagtatccaaatatt 48122931  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  48122932 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatac 48122966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 796 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 48333307 - 48333242
Alignment:
Q  796 tacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||  | ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48333307 tacatacacaatatatcccgaaaagaacaccatcagtgttatactatatccaaaaggaatattgtt 48333242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 223 - 681
Target Start/End: Original strand, 35342324 - 35342783
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||||||   | |||||| ||| |||| || || |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  35342324 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccttgcgtatcctgcaccgatacctacctgatacttcccgatacgtatcaaaagagtatccgaagatt 35342423  T
Q  322 aaatttta-nnnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttc 420  Q
    ||||||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  35342424 aaattttatttttaaaaaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgatcattatcctacacaggtatctgccctgatacttc 35342523  T
Q  421 ccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaaca 520  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35342524 ccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgattactgatgtgttcttttt-taatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaaca 35342622  T
Q  521 atattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatt 620  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35342623 atgttccttttggatataatataacactgatgatgctctttttaggatatattgtgtatgtaattggctaataatcaatctcttaatcgtcaatattatt 35342722  T
Q  621 tatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35342723 tatatttattttgatgtgctacaagccgatgactgatttatgttgtttgttaatatatttt 35342783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 31236236 - 31235839
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| | | |||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  31236236 gatatttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttaattttttaaaaaataatcagccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatc 31236137  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
     ||| ||||||||||| || |||||||| ||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||    
T  31236136 tgataattatcctacatcgatatctgcctcgatatttcacagtaaatgttaactaaaataacttaactcttcagtactgatgtgtttttttttggatata 31236037  T
Q  483 gtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgta 582  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31236036 gtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatatcattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgta 31235937  T
Q  583 attggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | || |||||||||||||||    
T  31235936 attgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactagtttcttttgtttgttaatatattt 31235839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 272 - 644
Target Start/End: Original strand, 34146237 - 34146609
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatc 371  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34146237 gatatctgcctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccaaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatc 34146336  T
Q  372 aagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctt 471  Q
    | ||| ||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  34146337 aggagagtatccgataattattctgcactgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataatttaactcttgagtattgatttgttctt 34146436  T
Q  472 tttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatata 571  Q
    |||   ||||| || || |||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34146437 ttttggatataatgcttattttttagattgatatagtatagcactaacagtgttccttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatata 34146536  T
Q  572 ttgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacga 644  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34146537 ttgtgtaggtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatatgctacga 34146609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 282 - 680
Target Start/End: Original strand, 1005579 - 1005955
Alignment:
Q  282 cgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtat 381  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||    
T  1005579 cgatacttcccgatacgtattagaagagtatctgaagattaaattttatttattttttaaataattatctgatacttcctgatacgtatcagaagagtat 1005678  T
Q  382 ccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatat 481  Q
    | ||| |||||||| ||||  |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||                      ||    
T  1005679 ctgataattatcctgcaccaatatctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagt----------------------at 1005756  T
Q  482 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgt 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1005757 agtgtttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatattccttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttaggatatattgtgtatgt 1005856  T
Q  582 aattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  1005857 aattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatattt 1005955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 283 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 3545631 - 3545233
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaa-aataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtat 381  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||       |||| |||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||| ||||    
T  3545631 gatacttctcgatatgtatcaggagagcatccgaagattaaattttattttaaaaaaataataattatcagatgcttcccgatacatatcaagagagtat 3545532  T
Q  382 ccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatat 481  Q
    | ||| |||||| | ||| | ||||| |||| |  ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  3545531 ctgataattatcatgcactgatatcttccccaaaacttcctaattaatgttaattaaaataacttaattcttgagtactgatgtgttcttttttggatat 3545432  T
Q  482 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgt 581  Q
    |||| || || |||  |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3545431 agtgctttttatttt-atcgatatagtatagcactaataatatttcttttggatatagtataccactgatgatgctccttttaggatatattgtgtatgt 3545333  T
Q  582 aattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||| | || | ||||||||||||||    
T  3545332 aattgattaattatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtactacgagcctatgatcggtttcttttgtatgttaatatatttt 3545233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 272 - 681
Target Start/End: Original strand, 21104539 - 21104938
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatc 371  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||        ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  21104539 gatatctgtctgatatttcccgatacgtatcaaaggagtatccgaagattaaattatactttttttaaaaataattatccgatatttccctatacgtatc 21104638  T
Q  372 aagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctt 471  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  21104639 aggaaagtatccgatcattatcctacaccgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaacttttgagtattgatgtgtactt 21104738  T
Q  472 tttct-aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatat 570  Q
    ||| | ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||            |||||||  | ||||||||||||    
T  21104739 tttttgaatatagtgcttcatttttgtatcgatatagtatatcactaacaatattccttttggat----------gctgatgatattgtttttgggatat 21104828  T
Q  571 attgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgt 670  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  21104829 attgtgtatgtaattgg-ttataatcactctcttaatcgtcaatattatttatgtttatgttgatgtattacgagcctatgactggtgtctgttatttgt 21104927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Original strand, 2319343 - 2319737
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||| |||||    
T  2319343 gatacttcctgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacgtcccgatacgtatcaggagagtatc 2319442  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
    |||| ||||||||  |  | ||||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||    |||||    
T  2319443 cgataattatcctggattgatatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactattgagtactgatgcatttttttatggatata 2319542  T
Q  483 gtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgta 582  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  2319543 gtgcttcttttttggattgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatatccatgatg-tgctctttttgggatatattttctaatta 2319641  T
Q  583 attggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  2319642 attgactaatcatcattcttttaatcgtcaatattatttatattaatgtggatgtgctacgagc--ctgactggtttcttttatttgttaatatattt 2319737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 261 - 681
Target Start/End: Original strand, 4561834 - 4562233
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaa-taattatctgatacttc 359  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||    
T  4561834 tatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacatatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaaataattatctgatacttc 4561933  T
Q  360 ctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtac 459  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||||  || ||| ||| || ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  4561934 ccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcatgcaccaatacctgtcccaatacttcccaattaatgttacttaaaataacttaactcttgagt-- 4562031  T
Q  460 tgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctct 559  Q
                        |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||| | ||||    
T  4562032 --------------------atagtgcttcttttttggattgatatagtatatcactaacaatgttccttttggatatagtatagtacttatggtactct 4562111  T
Q  560 ttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  4562112 ttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatgactggttt 4562211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 293 - 680
Target Start/End: Original strand, 14824216 - 14824582
Alignment:
Q  293 gatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaa-taattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcatta 391  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  14824216 gatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaaaaaataattatccgatatttcccgatacgtatcaggagagtatccgataatta 14824315  T
Q  392 tcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttctt 491  Q
    |||| ||||  || || |||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||                      ||| || |||||    
T  14824316 tcctgcaccaataccttccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagt----------------------ataatgcttctt 14824393  T
Q  492 ttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaa 591  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14824394 ttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaa 14824493  T
Q  592 taatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14824494 tcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatattt 14824582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 428 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 45159081 - 45158850
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||     
T  45159081 atgttaactaaaataattcaactcttcagtacttatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaaaaatgttct 45158982  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45158981 ttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 45158882  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45158881 atgttgatgtgctacgagtctatgactgattt 45158850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Original strand, 3563908 - 3564282
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||    
T  3563908 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttctttaaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcagaagagtatc 3564007  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
    |||| |||||||| || || || ||||| | || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||                      |||    
T  3564008 cgataattatcctgcatcgatacctgccacaatacttcccaattaatgttaagtaaaataacttaactcttgagt----------------------ata 3564085  T
Q  483 gtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgta 582  Q
    |||  |||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3564086 gtgactcttttttggatcattatagtatagcattaacaatgcttcttttggatatagtataacagttatgatgctctttttgggatatattgtgtatgca 3564185  T
Q  583 attggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  3564186 attgactaatcatcactctcttaatcgtcaatatta-ttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 3564282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 480 - 701
Target Start/End: Original strand, 4355555 - 4355773
Alignment:
Q  480 atagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtat 579  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| || | |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  4355555 atagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggggctctttttgggatatattatgtat 4355654  T
Q  580 gtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatt 679  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  4355655 gtaattgactaatcatcactctcttagtcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactgatttcttttgtttgttaatatatt 4355754  T
Q  680 ttaggcttaattgcacttttgg 701  Q
       ||||||||| |||||||||    
T  4355755 ---ggcttaattacacttttgg 4355773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Original strand, 44156665 - 44157040
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnn-aaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtat 381  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||    
T  44156665 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttttttaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggatggtat 44156764  T
Q  382 ccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatat 481  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| ||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||                      ||    
T  44156765 ccgataattatcctgcaccgatacctgacccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagt----------------------at 44156842  T
Q  482 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgt 581  Q
    | || ||||||||| |||||||||| ||||  || |||||| || ||| |||||||| ||||||| |  || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44156843 aatgcttcttttttggatcgatataatatagaactaacaatgtttcttctggatatagtataacacttgtggtgctctttttggg-tatgttgtgtatgt 44156941  T
Q  582 aattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  44156942 aattgactaatcatcactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 44157040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 353 - 680
Target Start/End: Original strand, 10573632 - 10573948
Alignment:
Q  353 atacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactct 452  Q
    ||||||||  |||||||||  ||| ||||||||| ||||| || || || ||  || ||||||  ||| || || |||||||  |||||||||||||| |    
T  10573632 atacttccatatacgtatctggagagtatccgataattattctgcatcgatacatgtcccgatatttctcaattaatgttaaccaaaataacttaactat 10573731  T
Q  453 tgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatg 552  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| |||            ||||||| |||| || || ||    
T  10573732 tgagtagtgatgtgttcttttttggatatagtgcttattttttggatcgataaagtataacactaac------------ggatatagtatatcattggtg 10573819  T
Q  553 atgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaata-ttatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatg 651  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10573820 gtgctctttttgagatatattgtatatgtaattgactaatcatcactcacttaatcgtcaatatttatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatg 10573919  T
Q  652 actgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| ||| | || |||||||||||||||    
T  10573920 actggtttcttttgtttgttaatatattt 10573948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 479 - 654
Target Start/End: Original strand, 24585777 - 24585953
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcctttt-ggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgt 577  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||| |||| || | ||| | |||||||||||||||||| |||    
T  24585777 tatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttctttttggatatagtatagcacttatggtactctttttgggatatattctgt 24585876  T
Q  578 atgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgact 654  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24585877 atgtaattgactaatcttcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtttatgtgctacgagcatatgact 24585953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 477 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 28746539 - 28746339
Alignment:
Q  477 aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttg-ggatatattgt 575  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||| || | ||| |||| |||||  |||||||||||    
T  28746539 aatatagttcttcttttttggatcgatatagtataacaataacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctttttttttggatatattgt 28746440  T
Q  576 gtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaata 675  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  28746439 gtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgctgatgtgatacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaata 28746340  T
Q  676 t 676  Q
    |    
T  28746339 t 28746339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 479 - 680
Target Start/End: Original strand, 5588280 - 5588481
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||| | |||| || | ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  5588280 tatagtgcttattttttggatcgatataatataacactaacaatgtttcttttgcatacagtatatcacttatggtgctctcttcgggatatattgtgta 5588379  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatat 678  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  5588380 tgtaattgactaatcatcattctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagtctatgattgatttcttttgtttgttaatatat 5588479  T
Q  679 tt 680  Q
    ||    
T  5588480 tt 5588481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 8482989 - 8482647
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||     
T  8482989 tatcctgcaccgatatctgtctgatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcg 8482890  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtact 460  Q
      |||| |||||  || | ||||||| |||||||| ||||| || ||||| | || ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  8482889 cgatacatatcagaagagcatccgataattatcctgcaccgatacctgcctcaatacttcccaatcaatgttaattaaaataacttaactcttgagt--- 8482793  T
Q  461 gatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctt 560  Q
                       ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||| |    
T  8482792 -------------------ataatgcttcttttttggatcgatataatataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcaccgatggtgctcgt 8482712  T
Q  561 tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatat 625  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8482711 tttgggatatattgtgtttgtaattgaccaataatcactctcttaatcgacaatattatctatat 8482647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 528 - 680
Target Start/End: Original strand, 35996822 - 35996974
Alignment:
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35996822 ttttggatatagtataacacttatggtgctccttttgggatatattgtgcatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 35996921  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  35996922 atgttgatgtgctacgagtctatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 35996974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 517 - 652
Target Start/End: Original strand, 12206267 - 12206402
Alignment:
Q  517 aacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatat 616  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12206267 aacaatgttccttttggatataatataacattgatggtgctttttttcggatatattttgtatgtatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatat 12206366  T
Q  617 tatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatga 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12206367 tatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatga 12206402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 498 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 40431879 - 40431740
Alignment:
Q  498 atcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatca 597  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  40431879 atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacaccgatggtgctctttttaggatattttgtgtatgtaattgactaagcatca 40431780  T
Q  598 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 637  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40431779 ctctgttaatcatcaatattatttgtatttatgttgatgt 40431740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 645
Target Start/End: Original strand, 18301362 - 18301529
Alignment:
Q  482 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatga----tgctctttttgggatatattgtgt 577  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||| |||| ||| ||    
T  18301362 agtgcttcttttttggatcgatataatatagcactagcaatgttccttttggatataatataacattgatgtatggtgctctttttggtatattttgcgt 18301461  T
Q  578 atgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18301462 atgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 18301529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 518 - 680
Target Start/End: Original strand, 40536498 - 40536660
Alignment:
Q  518 acaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatatt 617  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40536498 acaatgttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttggaatatattgtatatgtaattgactaatcatcactcttttaatcgtcaatatt 40536597  T
Q  618 atttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    | |||||||||||||||| |  ||||||| ||||| || ||| |  | |||||||||||||||    
T  40536598 acttatatttatgttgatattttacgagcctatgattggtttcttgtgtttgttaatatattt 40536660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 445 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 40308212 - 40308004
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |       
T  40308212 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgta 40308115  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40308114 gcattgatgtataacattgatgatgctcttttcggtatatattgagtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 40308015  T
Q  631 ttgatgtgcta 641  Q
    || ||||||||    
T  40308014 ttaatgtgcta 40308004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Original strand, 22485011 - 22485224
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  22485011 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgta 22485108  T
Q  544 acagtgatgat-------------gctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
     || ||||| |             ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22485109 gcattgatgtttatctttgatgttgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttata 22485208  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  22485209 ttaatgtgctacgagc 22485224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 5371338 - 5371516
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataa-----------tataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||           ||||||| ||||| || | |||||||     
T  5371338 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatataaaatagcattcatataacactgatggtgttttttttggt 5371437  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  5371438 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatgtatatttatgttaatgtactacgag 5371516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 478 - 642
Target Start/End: Original strand, 12819578 - 12819753
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||           |||||||| || || ||||||||||||     
T  12819578 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatattccttttggatatagtatagcattgatataacactggtggtgctctttttggt 12819677  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctac 642  Q
    |||| ||  ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12819678 atattttacgtatgtaattgactaatcaccactctattaatcgtcaatattatttatatttatgttaatctgctac 12819753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 549 - 645
Target Start/End: Original strand, 6125031 - 6125127
Alignment:
Q  549 gatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6125031 gatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 6125127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 14217002 - 14216910
Alignment:
Q  588 ctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  14217002 ctaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatatgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 14216910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 508 - 680
Target Start/End: Original strand, 9293655 - 9293831
Alignment:
Q  508 tataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaat 607  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| | || || |||||| ||||| |||||||||| | |    
T  9293655 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggatataatatgcatttaattgactaatcatcactctctcact 9293754  T
Q  608 cg----tcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     |    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||    
T  9293755 tgacaatcaatattatttatatttacactgatgtgctacgagcctatgaatgatttcttttgtttgttaatatattt 9293831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 7807231 - 7807022
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata----- 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||         
T  7807231 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-attccttttgaatatagtgta 7807134  T
Q  539 --------atataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
             ||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  7807133 gcattgatgtataacattgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattttctaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttata 7807038  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  7807037 ttaatgtgctacgagc 7807022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 490 - 645
Target Start/End: Original strand, 20537114 - 20537282
Alignment:
Q  490 ttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatga-------------tgctctttttgggatatattgtg 576  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||              |||||||||||  |||| |||      
T  20537114 ttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatgtataacactgattgtgctctttttgatatattttgct 20537213  T
Q  577 tatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20537214 tatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgttacgag 20537282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 4169896 - 4169684
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |       
T  4169896 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgcttcatttttggatcgatatagtataacactaacaag-ttcctttttgatatagttta 4169799  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              ||| || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4169798 gcattggtgtatagcactgatggtgctctttttgt-acatattgcgtatgtaattgactaatgactactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 4169700  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  4169699 ttaatgtgctacgagc 4169684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 445 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 6497046 - 6496840
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||| |        
T  6497046 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataggactaacaag-ttccttttggatatagtgtag 6496949  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             |||||| ||||  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6496948 cattgatgtataacactgatagtgctctttttgt-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctttcaatcgtcaatattatttatatttatgt 6496850  T
Q  632 tgatgtgcta 641  Q
    | ||||||||    
T  6496849 taatgtgcta 6496840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14217144 - 14217027
Alignment:
Q  339 aaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaa 438  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | ||  |||||| || ||||||| || ||||||| |||    
T  14217144 aaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcactgatacatgccccaatacttcccaattaatgttaagtaa 14217045  T
Q  439 aataacttaactcttgag 456  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14217044 aatgacttaactcttgag 14217027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 33324825 - 33324961
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  33324825 ccgatacttcaaaatggatgatgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 33324924  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  33324925 aaattttatttttaaaaaaaataattatctgatactt 33324961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 454
Target Start/End: Original strand, 5588176 - 5588277
Alignment:
Q  353 atacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactct 452  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||| |  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  5588176 atacttcctgatacatatcatgagagtatccaataattatcctacaccgatacctgccccaacacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactct 5588275  T
Q  453 tg 454  Q
    ||    
T  5588276 tg 5588277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 35342688 - 35342611
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  35342688 caattacatacacaatatatcctaaaaagagcatcatcagtgttatattatatccaaaaggaacattgttagtgttat 35342611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38602433 - 38602287
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  38602433 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 38602334  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgt 368  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38602333 aaattttatttttaaaaaaaataattatctgatactttccaatacgt 38602287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 455
Target Start/End: Original strand, 12206172 - 12206264
Alignment:
Q  363 atacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttga 455  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12206172 atacgtatcatgagagtatccgataattatcctgcactgatatatgccccgatacttcccaattaatggtaactaaaataacttaactcttga 12206264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28746737 - 28746539
Alignment:
Q  248 cgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataatt 347  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||    
T  28746737 cgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttttcgatacgtatcagaagagtatccgaagattaatttttttttttt----aaataatt 28746642  T
Q  348 atctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataactta 447  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||     ||||||  || ||||||| ||  |||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  28746641 atccgatacttcccgatacgtatcaagaaagtatccgataat-----tacacctatacctgccccaataattcccaattaacgttaaataaaataactta 28746547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 31235933 - 31236010
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31235933 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcaatgatatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 31236010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 456
Target Start/End: Original strand, 4355478 - 4355553
Alignment:
Q  381 tccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgag 456  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4355478 tccgataattatcctacactgatacctgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgag 4355553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 7876721 - 7876857
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  7876721 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 7876820  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  7876821 aaattttattttttaaaaaaataattatccgatactt 7876857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40309008 - 40308872
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||   | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  40309008 ccgatacttcaaaatagatgacgtaccgtatcccatgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 40308909  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  40308908 aaattttatttttaaaaaaaataattatccgatactt 40308872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1776477 - 1776311
Alignment:
Q  292 cgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcatta 391  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||  |  ||||| ||| ||||    
T  1776477 cgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttttaaaaaaaaaatcattcgatacttcccgatacgtatcagaaaagtatctgataatta 1776378  T
Q  392 tcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
    |||| ||||  || ||||||| ||  || ||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1776377 tcctgcacctatacctgccccaataatttccaattaacattaaataaaataacttaactcttgagta 1776311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 40536566 - 40536498
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgt 860  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  40536566 caattacatatacaatatattccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgt 40536498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 363 - 474
Target Start/End: Original strand, 9293253 - 9293364
Alignment:
Q  363 atacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactga 462  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||| || | ||||| |   || ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||    
T  9293253 atacgtatcaggagagtatctgatcattattctgcaccgatacccgccccaagattttccaattaatgttaactaaaataactcaactattgagtaccga 9293352  T
Q  463 tgtgttcttttt 474  Q
    ||||||||||||    
T  9293353 tgtgttcttttt 9293364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37134404 - 37134302
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| |  ||||||||||||    
T  37134404 acttcaaaatagatgacgtaccgtatcctctgcgtatcctgcactgatatctgcttgatacttcccgatacgtatcaagagagtatatgaagattaaatt 37134305  T
Q  327 tta 329  Q
    |||    
T  37134304 tta 37134302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 1005861 - 1005784
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||| | || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1005861 caattacatacacaatatatcctaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaaaaggaatattgttagtgttat 1005784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4170613 - 4170479
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  4170613 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcctgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 4170514  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  4170513 aaattttatttttaaaaaaaataattatccgatac 4170479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 796 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 12206332 - 12206267
Alignment:
Q  796 tacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12206332 tacatacaaaatatatccgaaaaaaagcaccatcaatgttatattatatccaaaaggaacattgtt 12206267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 21633387 - 21633354
Alignment:
Q  677 attttaggcttaattgcacttttggccccctatg 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21633387 attttaggcttaattgcacttttggccccctatg 21633354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Original strand, 22484274 - 22484408
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||  | |||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  22484274 ccgatacttcaaaatggatgatgtaccgtattccctgcgtatcctgcatcgatatctgtccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 22484373  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  22484374 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatac 22484408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 40431997 - 40431896
Alignment:
Q  357 ttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgag 456  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| || |||  || || ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  40431997 ttcctgatacgtatcaggacagtatccgataattatcctgcaccgttacctgccccaatacttttcaattaatgtttactaaaataacttaactattgag 40431898  T
Q  457 ta 458  Q
    ||    
T  40431897 ta 40431896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 709
Target Start/End: Original strand, 3263026 - 3263061
Alignment:
Q  674 tatattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3263026 tatattttaggcttaattgcacttttggacccctat 3263061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 521
Target Start/End: Original strand, 6124948 - 6124991
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaa 521  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6124948 atatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa 6124991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 10741396 - 10741365
Alignment:
Q  678 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741396 ttttaggcttaattgcacttttggccccctat 10741365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 709
Target Start/End: Original strand, 3368668 - 3368698
Alignment:
Q  679 tttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3368668 tttaggcttaattgcacttttggccccctat 3368698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 709
Target Start/End: Original strand, 31025871 - 31025901
Alignment:
Q  679 tttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31025871 tttaggcttaattgcacttttggccccctat 31025901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 676 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 44078610 - 44078576
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggccccctatg 710  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44078610 tattttaggtttaattgcacttttggccccctatg 44078576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 667 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 44245298 - 44245256
Alignment:
Q  667 ttgttaatatattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44245298 ttgttcatagattttaggcttaattgcacttttggctccctat 44245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 681 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 52355 - 52326
Alignment:
Q  681 taggcttaattgcacttttggccccctatg 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52355 taggcttaattgcacttttggccccctatg 52326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 4562138 - 4562069
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |  |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  4562138 caattacatacacaatatatcccaaaaagagtaccataagtactatactatatccaaaaggaacattgtt 4562069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 11188548 - 11188519
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggcccc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11188548 tattttaggcttaattgcacttttggcccc 11188519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 709
Target Start/End: Original strand, 16865308 - 16865345
Alignment:
Q  672 aatatattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16865308 aatatttttttggcttaattgcacttttggccccctat 16865345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 40431791 - 40431868
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||| | ||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  40431791 caattacatacacaaaatatcctaaaaagagcaccatcggtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 40431868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 709
Target Start/End: Original strand, 41454509 - 41454538
Alignment:
Q  680 ttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454509 ttaggcttaattgcacttttggccccctat 41454538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 363 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 15878394 - 15878076
Alignment:
Q  363 atacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactga 462  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15878394 atacgtatcaggagagtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatacttcccaattaatattaactaaaataacttaactcttgagtattga 15878295  T
Q  463 tgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttt 562  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15878294 tgtgttctttttttaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatgatgctctttt 15878195  T
Q  563 tgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatg 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15878194 tgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttatg 15878095  T
Q  663 ttatttgttaatatatttt 681  Q
    || ||||||||||||||||    
T  15878094 ttgtttgttaatatatttt 15878076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 338 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 1400263 - 1399949
Alignment:
Q  338 aaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaatta 437  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  1400263 aaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgatcattatcctacacatgtatctgccccgatacttcccaattaatgttaatta 1400164  T
Q  438 aaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatat 537  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1400163 aaataacttaactcttaagtattgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatat 1400064  T
Q  538 aatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 637  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1400063 agtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaataatcactatcttaatcgtcaatattatttatatttat-ttgatgt 1399965  T
Q  638 gctacgagcttatgac 653  Q
     |||||||| ||||||    
T  1399964 actacgagcctatgac 1399949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 352 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 23079090 - 23078762
Alignment:
Q  352 gatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactc 451  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  |||||||  |||| || ||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23079090 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgatagttatcctgtaccgatacctgtcccgatatttcccaattaatgttaattaaaataacttaactc 23078991  T
Q  452 ttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgat 551  Q
    || ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||| || ||||    
T  23078990 ttaagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcctttttgatatagtatagcactgat 23078891  T
Q  552 gatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatg 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23078890 gatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgagtaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctatgagcctatg 23078791  T
Q  652 actgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    | || ||| | || |||||||||||||||    
T  23078790 attggtttcttttgtttgttaatatattt 23078762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 248 - 645
Target Start/End: Original strand, 33454100 - 33454497
Alignment:
Q  248 cgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataatt 347  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  33454100 cgtatcccctgcgtatcctgcactgatatatgtcagatacttctcgatacgtatcaggaaagtatccgaagattaaattttattttttaaaaaaataatt 33454199  T
Q  348 atctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataactta 447  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| |  || |||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||  |||||| || ||||| | ||||| ||||||    
T  33454200 agctgatacttcccaatacttattagaagagtattcgataattatcctacaccgatacttgccccgatatttcccaattaatgttgactaaaaaaactta 33454299  T
Q  448 actcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacag 547  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||     
T  33454300 actcttgagtacttatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatataatatagcac 33454399  T
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33454400 tgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaatcgactaatcatcattctcttaatcgtcggtataatttatatttatgttgatatgctacgag 33454497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 223 - 680
Target Start/End: Original strand, 35159869 - 35160328
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||| || |||||||||  ||||| || ||| ||||  || |  ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  35159869 ccgatacttcaaaatggatgatgtatcgtatcccctgcatattctgcaccgatacttgtctaatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagatt 35159968  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcc 421  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||  || ||||||||| || ||| | ||| | ||||||||||||| ||||     
T  35159969 aaattttattttaaaaaaaaataattatctgatagttcccgatacatatcagaagagtatccgataat-atctttcactgatatctgccccgatacttct 35160067  T
Q  422 cagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacac----ca 517  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||     |    
T  35160068 caattaatgttaattaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttt--ttagatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaatta 35160165  T
Q  518 acaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatatt 617  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||| ||    
T  35160166 acaatgttccttttggatatagtatagcactaatggtgctttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattattaatgtt 35160265  T
Q  618 atttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  35160266 atttatatttatgttgatgtgctacgagtctataactgatttcttttgtttgttaatatattt 35160328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 259 - 680
Target Start/End: Original strand, 44269767 - 44270182
Alignment:
Q  259 catatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||       |||||||||||| | |||||||    
T  44269767 catatcctgcact-atatctgtctgatacttttcgatacgtatcagtagagtatctgaagattaaattttaatttttaaaaaaataattaaccgatactt 44269865  T
Q  359 cctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
    ||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||  ||| || |  ||||||| ||||||||||||||||      |    
T  44269866 cccgatacgtatcaagaaagtatctgataattattctacatcgatatctgcctcgatatttcacaataaatgttaactaaaataacttaactc------a 44269959  T
Q  459 ctgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgct 557  Q
    |  |||| || ||||| |  |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||    
T  44269960 cccatgtatttttttttttgatatggtgcttcttttttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattaatggtgct 44270059  T
Q  558 ctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgat 657  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44270060 ctttttgggatatattgtttatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgat 44270159  T
Q  658 ttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    || | || |||||||||||||||    
T  44270160 ttcttttgtttgttaatatattt 44270182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 9283766 - 9283514
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  9283766 atgttaactaaaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttct 9283667  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9283666 ttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 9283567  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  9283566 atgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 9283514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Original strand, 25969717 - 25969969
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  25969717 atgttaactaaaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttct 25969816  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25969817 ttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 25969916  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  25969917 atgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 25969969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 340 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 36758009 - 36757665
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  36758009 aaataattatccaatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatctttcactgatatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaa 36757910  T
Q  440 ataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacacc----aacaatattccttttggat 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||    
T  36757909 ataacttaactcttgagtactgatgtgtcattttttgtatatagtgcttattttttggatcgatatagtataacactgattaacaatgttccttttggat 36757810  T
Q  536 ataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 635  Q
    ||| |||| || ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36757809 atagtatagcactgatggtgcttttcttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgttatttatatttatgttgat 36757710  T
Q  636 gtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| | || |||||||||||||||    
T  36757709 gtgctacgagcctataactggtttcttttgtttgttaatatattt 36757665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 340 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 36767533 - 36767189
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  36767533 aaataattatccaatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatctttcactgatatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaa 36767434  T
Q  440 ataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacacc----aacaatattccttttggat 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||    
T  36767433 ataacttaactcttgagtactgatgtgtcattttttgtatatagtgcttattttttggatcgatatagtataacactgattaacaatgttccttttggat 36767334  T
Q  536 ataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 635  Q
    ||| |||| || ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36767333 atagtatagcactgatggtgcttttcttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgttatttatatttatgttgat 36767234  T
Q  636 gtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| | || |||||||||||||||    
T  36767233 gtgctacgagcctataactggtttcttttgtttgttaatatattt 36767189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 365 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 36763764 - 36763445
Alignment:
Q  365 acgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatg 464  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36763764 acgtatcaggagagtatccgataattatctttcactgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatg 36763665  T
Q  465 tgttctttttct-aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacac----caacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctct 559  Q
    ||| |||||| |  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |    
T  36763664 tgtcctttttttggatatagtgcctcttttttggatcgatatagtataacactaattaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgct-t 36763566  T
Q  560 ttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  36763565 tttttggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgttatttatatttatgttgatgtgctacgagcctataactggttt 36763466  T
Q  660 atgttatttgttaatatattt 680  Q
     | || |||||||||||||||    
T  36763465 cttttgtttgttaatatattt 36763445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 9250215 - 9249964
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  9250215 atgttaactaaaataatttaactcttgagtaattatgtgt-ctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttct 9250117  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9250116 ttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 9250017  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  9250016 atgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 9249964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 260 - 681
Target Start/End: Original strand, 21409433 - 21409830
Alignment:
Q  260 atatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttc 359  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||       ||||| |||||||| ||||||||    
T  21409433 atatcctgcactgatacctgcctgatacatcccgatacgtatcaggagagtatccaaagattaaattttatttttttaaaaa-taattatcggatacttc 21409531  T
Q  360 ctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtac 459  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  21409532 ctaatacgtatcaggagagtatctgataattatcctacaccgatacctgccccaatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagt-- 21409629  T
Q  460 tgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctct 559  Q
                        ||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| || | ||| ||||||    
T  21409630 --------------------ataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatatttcttttggatatagtatagcacttatgttgctct 21409709  T
Q  560 ttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  21409710 ttttggaatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttacatttatgttgatgtgctatgagcctatgactg-ttt 21409808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 293 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 554930 - 554565
Alignment:
Q  293 gatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattat 392  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  554930 gatacgtatcaggagagtattcgaagattaaattttattttttttaaaaataattatccgatacttcccgataagtatcaggagagtatccgataattat 554831  T
Q  393 cctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttt 492  Q
    ||| ||||| || ||||||| || ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||                      |||||| ||||||    
T  554830 cctgcaccgatacctgccccaatacttcccaatcaatgttaactaaaataacttaactcttgagt----------------------atagtgcttcttt 554753  T
Q  493 tttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaat 592  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  554752 tttggatcgatatagtataacactaacaatgtatcttttagatatagtatatcacttatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaat 554653  T
Q  593 aatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  554652 catcactctcttaatcgttaatattacttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgctttcttttgtttgttaatatattt 554565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 293 - 680
Target Start/End: Original strand, 21179911 - 21180280
Alignment:
Q  293 gatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattat 392  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  21179911 gatatgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaataataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatctgataattat 21180010  T
Q  393 cctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttt 492  Q
    | | || |  || ||||||| ||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||    
T  21180011 catgcatcaatacctgccccaatatttcccagctaatgataactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttattt 21180110  T
Q  493 tttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaat 592  Q
    ||| ||||||||      | ||| ||||            |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  21180111 tttggatcgata------agcactaaca------------gatatagtataacactgatgatgttctttttgggatatattgtatatctaattgactaat 21180192  T
Q  593 aatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  21180193 catcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 21180280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 479 - 680
Target Start/End: Original strand, 36413609 - 36413809
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36413609 tatagtgcttctttttt-gatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacaccgatgatgctctttttaggatatattgtgta 36413707  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatat 678  Q
    ||||||||  |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  36413708 tgtaattgattaagcatcactcacttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagtctatgactgatttcttttgtttgttaatatat 36413807  T
Q  679 tt 680  Q
    ||    
T  36413808 tt 36413809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 479 - 680
Target Start/End: Original strand, 48153784 - 48153984
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48153784 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcacttatgatgctctttttgggatatattgtgta 48153883  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatat 678  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  48153884 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaccattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactg-ttttttttgtttgttaatatat 48153982  T
Q  679 tt 680  Q
    ||    
T  48153983 tt 48153984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 283 - 655
Target Start/End: Original strand, 38064731 - 38065107
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||       ||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||  ||| |||||    
T  38064731 gatacttc-cgatacgtatcaagagagtatccgaagattaaattttattttttaaaataaaaattatcagatatttcccaatacgtatctggagggtatc 38064829  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaat-taaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttt---tcta- 477  Q
     ||| |||||||| ||||  || || ||||| |  |||||| || || ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | |      
T  38064830 tgataattatcctgcaccaatacctaccccgttatttcccaattaatattaaactaaaataacttaacttttgagtactaatgtgtttttttgtgtgtgg 38064929  T
Q  478 atatagtgtttcttttttag-atcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtg 576  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38064930 atatagtgcttctttttttggatcgatataatataacactaacaatgttccttttggatatagtatagcact-atggtgctctttttgggatatattgcg 38065028  T
Q  577 tatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactg 655  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38065029 tatgtaattgactaatcatgactatcttaatcatcaatattgtttatatttatgttgatgtgcttcgagcctatgactg 38065107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 478 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19820853 - 19820651
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgt 577  Q
    |||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  19820853 atatagtgcttctttttcgaatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtataatactgatggtgctctttttgagatatattgtgc 19820754  T
Q  578 atgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatata 677  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  | ||||||||||||    
T  19820753 atgtaattgactaatcatcactattttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgaacctatgactggtttcttgtgtttgttaatata 19820654  T
Q  678 ttt 680  Q
    |||    
T  19820653 ttt 19820651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 272 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23970187 - 23969840
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatc 371  Q
    |||||||| | ||||||||  |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||| | ||||||| |  |||||||||    
T  23970187 gatatctgtctgatacttcctgatacgtattagaagagtatctgaagattaaattttattttcttaaaaaataattacccgatactttccgatacgtatc 23970088  T
Q  372 aagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctt 471  Q
    | ||| ||||||||| |||||||| ||||  ||  |||||  || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  23970087 aggagagtatccgataattatcctgcaccaatacatgccctaatacttctcaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagt-------------- 23970002  T
Q  472 tttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatata 571  Q
            |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||| |    
T  23970001 --------atagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggataaa 23969910  T
Q  572 ttgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23969909 ttgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcacta----ttatatttatgttgatgtgctacgag 23969840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 502 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 44959168 - 44958990
Alignment:
Q  502 atatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactct 601  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| || |||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44959168 atatagtatagcactagcaatgttccttttggatatagtacaacactcatagtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactct 44959069  T
Q  602 cttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||||    
T  44959068 cttaatcgtcaatattatttatgtttatatggatatgctacgagcctatgactgatttcttttgtctgttaatatattt 44958990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 495
Target Start/End: Original strand, 40041390 - 40041655
Alignment:
Q  230 ttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttt 328  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || || ||||||  |||||||  || | ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  40041390 ttcaaaatagatgatgtatcgtatctcctacgtatcctgtactgatacatgtctgatacttcttgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaatttt 40041489  T
Q  329 annnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttga 428  Q
    |       |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| || |    
T  40041490 attttaa-aaaaaataattatccgatatttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcactgatacctgccccgatatttcccaattaa 40041588  T
Q  429 tgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttctttttt 495  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||    
T  40041589 tgttaactaaaataatttaactattgagtactgatgtgttcttttttagatataatgcttctttttt 40041655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 458
Target Start/End: Original strand, 24956260 - 24956491
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||| | || |||||  |||| |||||||  ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24956260 acttcaaaattgatgacgtatcgtatcccctacatatcatgcattgatacatgcctgatactttccgatacgtatcaagagagtatccgaagattaaatt 24956359  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagtt 426  Q
    |||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| | || ||||||| ||    
T  24956360 ttattttaaagaaaaataattatccgatacttcctaatacgtatcaagagagtatctgataattatcctgcaccgatacctgccacaatacttcccaatt 24956459  T
Q  427 gatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24956460 aatgttaactaaaataacttaactcttgagta 24956491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 479 - 676
Target Start/End: Original strand, 26973296 - 26973497
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgat----gctctttttgggatatattg 574  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||| | ||| |    |  ||||||   ||||||||    
T  26973296 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtacaacacttatggtataagtgcttttttttatatattg 26973395  T
Q  575 tgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaat 674  Q
      ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||    
T  26973396 gatatgtaattgagtaattgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaat 26973495  T
Q  675 at 676  Q
    ||    
T  26973496 at 26973497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 478 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 16564096 - 16563919
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  16564096 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagtattgatataacactgatggtgctctttttggt 16563997  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacga 644  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16563996 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga 16563919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 478 - 644
Target Start/End: Original strand, 16601566 - 16601743
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  16601566 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagtattgatataacactgatggtgctctttttggt 16601665  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacga 644  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16601666 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacga 16601743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 492 - 680
Target Start/End: Original strand, 24956501 - 24956687
Alignment:
Q  492 ttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtg-atgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggcta 590  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||   | |||| || |  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  24956501 ttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttgga---agtatagcactttatggtgctctctttgggatatattatgtatgtaattgacta 24956597  T
Q  591 ataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  24956598 atcatcactctattaattgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcatatgactgatttcttttgtttgctaatatattt 24956687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 44960246 - 44959994
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  44960246 ccgatacttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcactgacacctgtctgatacttcccgatatgtatcagaagagtatccaaagatt 44960147  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcc 421  Q
    ||||||||        ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| | | ||||||||| ||||| || ||| | || || ||||| |  ||||    
T  44960146 aaattttattttttgtaaaaataattatcggatacttcccgatacatatcaggggagtatccgataattattctgcactgatacctaccccggtatttcc 44960047  T
Q  422 cagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttt 474  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44960046 caattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttt 44959994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 478 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 1042923 - 1042747
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata-------------acagtgatgatgctctttttg 564  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||             ||| ||||| |||||||||||    
T  1042923 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatataatatagcattgatgtataacactgatggtgctctttttg 1042824  T
Q  565 ggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgcta 641  Q
    | |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1042823 gtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgcta 1042747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 19510888 - 19511059
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatga----tgctctttttgggatatatt 573  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||     |||||||||| | |||| ||    
T  19510888 atatagtgcttctttcttggatcgatataatataacactagcaatgttccttttggatatagtataacattgatgtatggtgctcttttttgtatatttt 19510987  T
Q  574 gtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19510988 gagtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttttgttaatgtgctacgag 19511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 540 - 646
Target Start/End: Original strand, 39521413 - 39521519
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39521413 tataacagtgatgatgctcttttttgtatatattgcgtatgtaattgattaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 39521512  T
Q  640 tacgagc 646  Q
    |||||||    
T  39521513 tacgagc 39521519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 528 - 680
Target Start/End: Original strand, 35136317 - 35136469
Alignment:
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  35136317 ttttgaatatattatagcattaatgatgctctttttgagatatattgtatatgtaattgactaatcatcattctcttaattgccaatattacttatattt 35136416  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  35136417 atgttgatatgctacgagtctatgactggtttattgtgtttgttaatatattt 35136469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 491 - 645
Target Start/End: Original strand, 4291946 - 4292111
Alignment:
Q  491 tttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtat 579  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4291946 tttttggatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatataacactgatgatgctctttttggtatattttgcgtat 4292045  T
Q  580 gtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4292046 gtaattgactaatcaccactctcttaatcgttaatagtatttatatttatgttaatgtgctacgag 4292111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 533 - 680
Target Start/End: Original strand, 11058729 - 11058876
Alignment:
Q  533 gatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 632  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11058729 gatataatgtaacactgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgacaaatcatcattctcttaatcgtcaatattacttatatttatgtt 11058828  T
Q  633 gatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||| ||  |||||||  ||| |  | |||||||||||||||    
T  11058829 gatgtgctaccagactatgactagtttcttgtgtttgttaatatattt 11058876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 524 - 638
Target Start/End: Original strand, 40053575 - 40053689
Alignment:
Q  524 ttccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 623  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40053575 ttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgaggtatattgcatatgtaattgactaatcatcactctcttagtcatcaatattatttat 40053674  T
Q  624 atttatgttgatgtg 638  Q
    |||||||||||||||    
T  40053675 atttatgttgatgtg 40053689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 24929323 - 24929420
Alignment:
Q  30 gcagtttcatatgaaatgtgaaactttgtcttgttggcattcaaatgtttgaaatggaagacaagaaacacattcaaa---aataaaagatttataga 124  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  24929323 gcagtttcatttgatatgtgaaactttgtcttgttggcattcaaatgtttgaaacggaagacaagaaacacattaaaaaataataaaagatttataga 24929420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 455 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 47238116 - 47237913
Alignment:
Q  455 agtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat------------at 542  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| || |            ||    
T  47238116 agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagcattaacaatgtcccttttggatgtagttagcattgatgtat 47238017  T
Q  543 aacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctac 642  Q
    | || || || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47238016 agcactggtggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcatcactttcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctac 47237917  T
Q  643 gagc 646  Q
    ||||    
T  47237916 gagc 47237913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 540 - 645
Target Start/End: Original strand, 8029147 - 8029252
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8029147 tataacactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaagtgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 8029246  T
Q  640 tacgag 645  Q
    ||||||    
T  8029247 tacgag 8029252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 540 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 26773361 - 26773257
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26773361 tataacactaatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 26773262  T
Q  640 tacga 644  Q
    |||||    
T  26773261 tacga 26773257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 445 - 631
Target Start/End: Original strand, 36661208 - 36661405
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| |        
T  36661208 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatacagtgcttcttttttggatcgataaagtataacactaacaag-ttccttttggatatagtgtag 36661305  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             ||| || ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36661306 cattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattacgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 36661405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 549 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 47719939 - 47719856
Alignment:
Q  549 gatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 632  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47719939 gatggtgctctttttggtatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 47719856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 548 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 27397378 - 27397282
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27397378 tgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtgctacgag 27397282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Original strand, 11830432 - 11830642
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||        
T  11830432 ttaactctt-agtactgacgtgttcttttttggatataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatataatgtag 11830529  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             ||| || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11830530 cattgatgtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgaccaatgaccactatcttaattgtcaatattatttatatttatgt 11830628  T
Q  632 tgatgtgctacgag 645  Q
    | ||||| ||||||    
T  11830629 taatgtgttacgag 11830642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27555221 - 27555129
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27555221 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatata 27555129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 1400015 - 1400092
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  1400015 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 1400092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Original strand, 16851046 - 16851254
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| | ||    
T  16851046 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaagtttc-ttttggatatagtgta 16851143  T
Q  544 acagtgatga-------------tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
     || |||||              |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  16851144 gcattgatgtataatactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattatctaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttata 16851239  T
Q  631 ttgatgtgctacgag 645  Q
    || ||||||||||||    
T  16851240 ttaatgtgctacgag 16851254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 24929465 - 24929511
Alignment:
Q  164 aacaagagatttgaattcaattcttgcggtttgtttatttgttttgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24929465 aacaagagatttgaattcaattcttgcggtttatttatttgttttgc 24929511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Original strand, 40096401 - 40096612
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  40096401 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgatttttttttggatcgatatagtatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 40096498  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctt---tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
              |||||| ||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  40096499 gcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatattt 40096594  T
Q  628 atgttgatgtgctacgag 645  Q
    || || ||||||||||||    
T  40096595 atattaatgtgctacgag 40096612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Original strand, 48163671 - 48163763
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  48163671 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatata 48163763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 15878171 - 15878248
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  15878171 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcagtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttat 15878248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Original strand, 23078856 - 23078925
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23078856 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcagtgctatactatatcaaaaaggaacattgtt 23078925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 47719832 - 47719764
Alignment:
Q  612 aatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  | |||||| ||||||||    
T  47719832 aatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttgatatattt 47719764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 794 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 33454436 - 33454361
Alignment:
Q  794 attacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  33454436 attacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgctatattatatccaaaatgaacattgttagtgttat 33454361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 458
Target Start/End: Original strand, 48153690 - 48153785
Alignment:
Q  363 atacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
    ||||||||| | || |||| |||| |||||| | ||||  || ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48153690 atacgtatccaaagagtattcgataattatcttgcaccaatacctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagta 48153785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 474
Target Start/End: Original strand, 11058658 - 11058704
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttt 474  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11058658 atgttaactaaaataacttaactcttgtgtactgatgtgttcttttt 11058704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Original strand, 27354184 - 27354276
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttct-aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  27354184 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatataatatagcactaacaa-gttccttttggatata 27354276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 329
Target Start/End: Original strand, 23311736 - 23311833
Alignment:
Q  233 aaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||     |||||| ||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23311736 aaaatagatgatgtaccgtatcccatgtgtatcctgcaccgatatatgtctgatacttcccgatatgtatcaggagagtatccgaagattaaatttta 23311833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 36413715 - 36413638
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  36413715 caattacatacacaatatatcctaaaaagagcatcatcggtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 36413638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 428 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 47719993 - 47719952
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 469  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47719993 atgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 47719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18114011 - 18113943
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18114011 tatcctgcaccgatatctgcctgatacttcctgatatgtatcaggagagtatctgaagattaaatttta 18113943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26773784 - 26773716
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  26773784 tatcctgcaccgatatctgcccgatacttctcgatacgtatcgggagagtatccaaatattaaatttta 26773716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 358
Target Start/End: Original strand, 48163435 - 48163548
Alignment:
Q  245 taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaata 344  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||       ||||||||    
T  48163435 taccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttatttttttaaaaaata 48163534  T
Q  345 attatctgatactt 358  Q
    |||||| |||||||    
T  48163535 attatccgatactt 48163548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 11829693 - 11829829
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  11829693 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatatctgcctgatacttcccaatacgtatccggagagtatccaaatatt 11829792  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  11829793 aaattttatttttaaaaaaaataattatccgatactt 11829829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 27353925 - 27354061
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||| |||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  27353925 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtattccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 27354024  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  27354025 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 27354061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 9250058 - 9250135
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||    
T  9250058 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttat 9250135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 9283608 - 9283685
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||    
T  9283608 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttat 9283685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 21409736 - 21409667
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | || |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21409736 caattacatacacaatatattccaaaaagagcaacataagtgctatactatatccaaaagaaatattgtt 21409667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 25969875 - 25969798
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||    
T  25969875 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttat 25969798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 328
Target Start/End: Original strand, 26973118 - 26973163
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttt 328  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26973118 gatacttttcgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaatttt 26973163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 48153891 - 48153822
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | || |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  48153891 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcataagtgctatactatatccaaaaggaacattgtt 48153822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19820916 - 19820868
Alignment:
Q  281 ccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19820916 ccgatactttccgatatgtatcaggagagtatccgaagattaaatttta 19820868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 478 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26773436 - 26773376
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  26773436 atataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccgtttggatata 26773376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Original strand, 25969401 - 25969508
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  25969401 ccgatacttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 25969500  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  25969501 aaatttta 25969508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 40095654 - 40095790
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||  || |||    
T  40095654 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatctaaatatt 40095753  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  40095754 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 40095790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9250528 - 9250426
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  9250528 acttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaatt 9250429  T
Q  327 tta 329  Q
    |||    
T  9250428 tta 9250426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34122723 - 34122621
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  34122723 acttcaaaatggatgacgtaccgtatcctctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatctggagagtatccaaatattaaatt 34122624  T
Q  327 tta 329  Q
    |||    
T  34122623 tta 34122621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 326
Target Start/End: Original strand, 38064645 - 38064703
Alignment:
Q  268 cactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  38064645 cactgatacctgaccgatactttccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaatt 38064703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 554659 - 554736
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | || |||| |||||| |||||  | |||||| |||||||    
T  554659 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcataagtgatatactatatctaaaagatacattgttagtgttat 554736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 709
Target Start/End: Original strand, 25982982 - 25983015
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25982982 tattttaggcttaattgcacttttggacccctat 25983015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Original strand, 38263053 - 38263139
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  38263053 gatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttatttttttaaaaaataattatctgatactt 38263139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 366 - 681
Target Start/End: Original strand, 36551535 - 36551849
Alignment:
Q  366 cgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgt 465  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36551535 cgtatcaggagagtatccgatcattatcctatatcgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtagtgatgt 36551634  T
Q  466 gttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgg 565  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36551635 gttcttttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatataatataacactgat-atgctctttttgg 36551733  T
Q  566 gatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgtta 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  36551734 gatatattgtgtatgtaattggctaacaatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtcctacgagcctatgattgatttatgttg 36551833  T
Q  666 tttgttaatatatttt 681  Q
    ||||||||||||||||    
T  36551834 tttgttaatatatttt 36551849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 315 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 24590142 - 24589782
Alignment:
Q  315 gaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccga 414  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||    
T  24590142 gaagattaaattttatttttttaaaaaataattatctgatacttcccgatacatatcaagagagtatccgatcattatcctacaccgatacatgtcccga 24590043  T
Q  415 tccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtg-ttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataac 513  Q
    | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24590042 tacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgcttcttttttgaatatagtgtttcttttttggatcgatatagtataac 24589943  T
Q  514 accaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaa 613  Q
    || |||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24589942 actaacaatgttctttttgaatataatatataattgatgaagctctttttaagatatattgtgta-gtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaa 24589844  T
Q  614 tattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaata 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  24589843 tattatttatatttatgttgatgtgatacgagcctatgactagtttttgttgtttgttaata 24589782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 306 - 680
Target Start/End: Original strand, 24851565 - 24851935
Alignment:
Q  306 agagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtat 405  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||    |||  ||     
T  24851565 agagtatccaaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgcatcaggagagtatccgataattatc----acccatac 24851660  T
Q  406 ctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatat 505  Q
    ||||||||||  || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24851661 ctgccccgatattttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtaatgatgtgttctttttttgatatagtgattcttttttggatcgatat 24851760  T
Q  506 agtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctctta 605  Q
    |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24851761 agtatagcactaacaatgttcgttttggatatagtatagcacaaatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctctta 24851860  T
Q  606 atcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  24851861 atcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagccaatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 24851935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 281 - 562
Target Start/End: Original strand, 38218449 - 38218728
Alignment:
Q  281 ccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgta 380  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||  |||||||||  |||| ||| | ||| |||    
T  38218449 ccgatacttcttgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattattcgatacttcccgatacatattaggagagta 38218548  T
Q  381 tccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaata 480  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38218549 tccgatcattatcctacaccagtatctgccccgatacttcccaattaatattagctaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttctttttttaata 38218648  T
Q  481 tagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttt 562  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  38218649 tagtgtt--ttttttagatcgatataatataacactaacaatgttacttttggatataatataacactgatgacgccctttt 38218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 405 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 32381009 - 32380733
Alignment:
Q  405 tctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgat 503  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |  ||||| || |||||||||  ||  ||    
T  32381009 tctgccctgatacttcccatttaatgttaactaaaataacttaactctagagcactgatgttttttttttttggatataatgcttcttttttgaataaat 32380910  T
Q  504 atagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctct 603  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  32380909 atagtataacactaacaatgttccttttgaatatagtataacactaatggtgctctttttgggatatattatgtatgtaatcgactaatcatcactctct 32380810  T
Q  604 taatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||    
T  32380809 taatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgaccgatttcttttgtttgttaatatattt 32380733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 272 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 41676050 - 41675743
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatc 371  Q
    |||| ||| ||||||||||   ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||    
T  41676050 gatacctgtccgatacttcctaatatgtattggaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccaatacttcccgatacttatc 41675951  T
Q  372 aagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctt 471  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41675950 aggagagtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatac-tcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctt 41675852  T
Q  472 tttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatata 571  Q
    |||  |||||| ||||    | |  ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  41675851 ttttgaatataatgttatactatatgatcgatatagtataacattaacaatgttgcttttagatatagtataacattgatgatgctctttttgaaatata 41675752  T
Q  572 ttgtgtatg 580  Q
    |||||||||    
T  41675751 ttgtgtatg 41675743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 340 - 605
Target Start/End: Original strand, 47654789 - 47655054
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||  || ||| || ||||| | ||||    
T  47654789 aaataattatccgatacatcctcatacttatcagaatagtattcgataattatcctacaccgatacctgccccgatattttccaattaatgttgactaaa 47654888  T
Q  440 ataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataa 539  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  47654889 aaaacttaactcttgagtactgatgtgttcttttacggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatataa 47654988  T
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctctta 605  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  47654989 tatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctctta 47655054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 479 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 9528720 - 9528519
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||| |||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9528720 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacgatgtttcttttggatatagtatagcacttatgatgtcctttttgggatatattgtgta 9528621  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatat 678  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| | || ||| |||||||||    
T  9528620 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtactacgagcatatgactagtttcttttgtttattaatatat 9528521  T
Q  679 tt 680  Q
    ||    
T  9528520 tt 9528519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 487 - 680
Target Start/End: Original strand, 14167319 - 14167512
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14167319 ttctttcttggatcgatatagtataacactaacaatgtatcttttggatatagtatagctcttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 14167418  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  14167419 actaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactaatttattttgtttattaatatattt 14167512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 248 - 676
Target Start/End: Original strand, 9781675 - 9782083
Alignment:
Q  248 cgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataatt 347  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||          |||||||||    
T  9781675 cgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaatttttttttttttttaaaataatt 9781774  T
Q  348 atctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataactta 447  Q
    ||| |||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||  || ||||||| ||  |||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  9781775 atccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatccgataattatcctgcacctatacctgccccaataattcccaattaacgttaaataaaataactta 9781874  T
Q  448 actcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacag 547  Q
    ||||||||||||                      |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||| ||     
T  9781875 actcttgagtac----------------------agtgcttcttttttggatcgatacagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcac 9781952  T
Q  548 tgatgatgctctttt--tgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    | ||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9781953 ttatggtgctttttttttgggatatattgtgtacgtaattgactaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 9782052  T
Q  646 cttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
    | |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  9782053 cctatgactggtttcttttgtttgttaatat 9782083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 680
Target Start/End: Original strand, 29167993 - 29168390
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||| ||||  |||||||| || || ||||||| ||||| |||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||    
T  29167993 tatcctgcaccgatacctgcatgatacttcccgttacgtatcaggagagtatccgaagattaaatttaatttttttaaaaaataattatctgatacttcc 29168092  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtact 460  Q
      |||||||| | ||| ||| || || |||||||| ||| | || || |||| || ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||       
T  29168093 cgatacgtatgaggagagtacccaataattatcctgcactgatacctaccccaatacttcccaattaatattaactaaaataacttaactattgagt--- 29168189  T
Q  461 gatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctt 560  Q
                       ||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| || |||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  29168190 -------------------ataatgcttcttttttggatcaatatagtatagtactaacaatgtttcttttggatatagtatatcacttatgatgctctt 29168270  T
Q  561 tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattta 660  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||     
T  29168271 ttttggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcgatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatggctggtttc 29168370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 487 - 680
Target Start/End: Original strand, 10822644 - 10822837
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822644 ttcttttttggatcgatataatatatcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttacggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 10822743  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | || |||||||||||||||    
T  10822744 actaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgtactacgagcctatgacggttttcttttgtttgttaatatattt 10822837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 479 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 34432291 - 34432118
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  34432291 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttctttgggatatagtatagtacttatggtgttctttttgagatatattgtgta 34432192  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatga 652  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34432191 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctaagagcctatga 34432118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 436 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 3708183 - 3707976
Alignment:
Q  436 taaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggat 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| || ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||            ||||    
T  3708183 taaaataacttaactcttgagtaccgatgtgttcttttttagatataatgcttcttttttggatcgataaagtatagcactaac------------ggat 3708096  T
Q  536 ataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 635  Q
    ||| |||| || || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708095 atagtatagcactggtggtcctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 3707996  T
Q  636 gtgct-acgagcttatgact 654  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  3707995 gtgctaacgagcctatgact 3707976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 488 - 677
Target Start/End: Original strand, 37922465 - 37922654
Alignment:
Q  488 tcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgg 587  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37922465 tctttcttagatagatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattga 37922564  T
Q  588 ctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatata 677  Q
     | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || ||| |  | ||||||||||||    
T  37922565 ttgattataactctcttaatcgccaatattatttatatttatgttgatgtgatatgagcctatgaatggtttcttgtgtttgttaatata 37922654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 479 - 676
Target Start/End: Original strand, 29862039 - 29862239
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttt---tgggatatattgt 575  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||| || | ||  || | ||||   |||||||||||||    
T  29862039 tatagtgcttcttttttggattgataaagtataccactaacaatgtttcttttggatatagtatatcacttatagtgtttttttttttgggatatattgt 29862138  T
Q  576 gtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaata 675  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||    
T  29862139 gtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaata 29862238  T
Q  676 t 676  Q
    |    
T  29862239 t 29862239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 479 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 34096429 - 34096231
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatg-ctctttttgggatatattgtgt 577  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| |||| || | | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  34096429 tatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttagatatagtatagcacttacgatgtttttttttgggacatattgtgt 34096330  T
Q  578 atgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
    |||||||||  | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||    
T  34096329 atgtaattgattgatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgaatggtttcttttgtttgttaatat 34096231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 508 - 677
Target Start/End: Original strand, 32797462 - 32797631
Alignment:
Q  508 tataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaat 607  Q
    |||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32797462 tataacactaataatgttcattttggatatagtatatcattgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgactaatcatcactctcttaat 32797561  T
Q  608 cgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatata 677  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |  | ||||||||||||    
T  32797562 cgtcaatattacttatatttatgttgatatgctacgagcctatgattggtttcttgtgtttgttaatata 32797631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28948583 - 28948370
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  28948583 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaag-ttccttttggatatagtgta 28948486  T
Q  544 acagtgatga-------------tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
     || |||||              |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28948485 gcattgatgtatagctatgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 28948386  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  28948385 ttaatgtgctacgagc 28948370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13012731 - 13012560
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatga----tgctctttttgggatatatt 573  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||     |||||||||||| |||| ||    
T  13012731 atatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactagcaatgttccttttagatatagtataacattgatgtatggtgctctttttggtatatttt 13012632  T
Q  574 gtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13012631 gcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 13012560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31653157 - 31652979
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||           |||||||| | ||| ||||||||||||     
T  31653157 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaattttccttttggatatagtatagcattgatataacacttatggtgctctttttggt 31653058  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31653057 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 31652979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Original strand, 5984919 - 5985130
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||| |        
T  5984919 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaag-ttccttttggatatagtgtag 5985016  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             |||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5985017 cattgatgtataacactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaatttactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 5985115  T
Q  632 tgatgtgctacgagc 646  Q
    | |||||||||||||    
T  5985116 taatgtgctacgagc 5985130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 455 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28658768 - 28658564
Alignment:
Q  455 agtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat------------at 542  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |            ||    
T  28658768 agtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgtagcatgatgtat 28658670  T
Q  543 aacagtgat--gatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgct 640  Q
    | || ||||  | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28658669 agcactgatatggtgttctttttggtatatattgcatatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgct 28658570  T
Q  641 acgagc 646  Q
    ||||||    
T  28658569 acgagc 28658564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 14334534 - 14334712
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  14334534 atatggtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcattgatataacactgatggtgctctttttggt 14334633  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14334634 atattttacgtatgtaattgactaatcaacactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtactacgag 14334712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 43190020 - 43190200
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatga-------------tgctctttttg 564  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||              ||||||||||     
T  43190020 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgtataacactgctcgtgctctttttt 43190119  T
Q  565 ggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    | |||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43190120 gtatattttgcgtatgtatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 43190200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Original strand, 25257349 - 25257558
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |        
T  25257349 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgtag 25257446  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             ||| || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25257447 cattgatgtatagcactgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaa--accactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 25257543  T
Q  632 tgatgtgctacgagc 646  Q
    | |||||||||||||    
T  25257544 taatgtgctacgagc 25257558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 549 - 645
Target Start/End: Original strand, 3427704 - 3427800
Alignment:
Q  549 gatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3427704 gatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 3427800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 445 - 648
Target Start/End: Original strand, 30324452 - 30324665
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |        
T  30324452 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-attccttttggatatagtgtag 30324549  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             |||||| ||||  || ||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30324550 cattgatgcataacactgatagtgatcttttt-gtatatattgcgtacgtaattgactaatgaccactctcttattcgccaatattatttatatttatgt 30324648  T
Q  632 tgatgtgctacgagctt 648  Q
    | |||||||||||||||    
T  30324649 taatgtgctacgagctt 30324665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Original strand, 8132914 - 8133123
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttct-aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  8132914 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttgaatatagtgattcttttttggatcgatatagaatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 8133011  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  8133012 gcattgatgtataacagtgatggtgctctttttggtatatattgcatatgtaattggctaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttata 8133107  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  8133108 ttaatgtgctacgagc 8133123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 48715297 - 48715135
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||    
T  48715297 tatcctacaccgataccggcccgatacttcccgatacgtatcaggagagtgtccgaagattaaattttattgttttaaaaaataattatcagatacttcc 48715198  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttccca 423  Q
      |||| ||||||||| ||||| ||| |||||| |  || | ||||| ||||||| |||||||    
T  48715197 cgatacatatcaagagagtatctgataattatcatgtactgatatcttccccgatacttccca 48715135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 568 - 680
Target Start/End: Original strand, 33040711 - 33040822
Alignment:
Q  568 tatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatt 667  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||  ||| | || ||    
T  33040711 tatattgtgtatgta-ttgaataataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatatgctacaaacctatgactcgtttcttttgtt 33040809  T
Q  668 tgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||    
T  33040810 tgttaatatattt 33040822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 554 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 37346609 - 37346520
Alignment:
Q  554 tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37346609 tgctctttttgg--tattttgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 37346520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 606 - 681
Target Start/End: Original strand, 38218733 - 38218808
Alignment:
Q  606 atcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38218733 atcgtcaatattatttatatttatgttgatgtactacgagcctatgactggtttatgttgtttgttaatatatttt 38218808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2472906 - 2472681
Alignment:
Q  350 ctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaac 449  Q
    ||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||| |  | ||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  2472906 ctgatactttccgatacgtatcaggagagtatccgataattatccagcactgacacctgccccgatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaac 2472807  T
Q  450 tcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtg 549  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||   |||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||             ||||| |||| || ||    
T  2472806 tcttgagtacgaatgtgttattttttggatatagtgcttctttttctgatcgataaagtatagcactaaca------------tatatagtatagcactg 2472719  T
Q  550 atgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgg 587  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2472718 atggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgg 2472681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 595 - 680
Target Start/End: Original strand, 15417927 - 15418012
Alignment:
Q  595 tcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||| |  | |||||||||||||||    
T  15417927 tcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatatgatacgagcctatgaccggtttcttgtgtttgttaatatattt 15418012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 1043234 - 1043370
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  1043234 ccgatacttcaaaatggatgatgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 1043333  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  1043334 aaattttatttttaaaaaaaataattatctgatactt 1043370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6916238 - 6916027
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  6916238 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 6916141  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctt---tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
              |||||| ||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  6916140 gcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatattt 6916045  T
Q  628 atgttgatgtgctacgag 645  Q
    || || ||||||||||||    
T  6916044 atattaatgtgctacgag 6916027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 592
Target Start/End: Original strand, 15417689 - 15417771
Alignment:
Q  510 taacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaat 592  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15417689 taacactaacaatgttcctttttgatatagtataacattgatggtcctctttttgggatatattgtatatgtaattgactaat 15417771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 495
Target Start/End: Original strand, 33039813 - 33039891
Alignment:
Q  418 ttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc-tttttctaatatagtgtttctttttt 495  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  33039813 ttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggaatatagtgtttttttttt 33039891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Original strand, 37104382 - 37104591
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  37104382 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaagtttc-ttttggatatagtgta 37104479  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              |||||| || || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  37104480 gcattgatgtataacactgttggtgctatttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttata 37104575  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  37104576 ttaatgtgctacgagc 37104591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Original strand, 38331181 - 38331392
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  38331181 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 38331278  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctt---tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
              |||||| ||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  38331279 gcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatattt 38331374  T
Q  628 atgttgatgtgctacgag 645  Q
    || || ||||||||||||    
T  38331375 atattaatgtgctacgag 38331392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 328
Target Start/End: Original strand, 43189662 - 43189768
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||    
T  43189662 ccgatacttcaaaatggatgatgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttctcgatacgtatcaggagagtatccaaatatt 43189761  T
Q  322 aaatttt 328  Q
    |||||||    
T  43189762 aaatttt 43189768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 600 - 655
Target Start/End: Original strand, 47656062 - 47656117
Alignment:
Q  600 ctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactg 655  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47656062 ctcttaatcgtcagtataatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactg 47656117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 36367554 - 36367462
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  36367554 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatata 36367462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 36551754 - 36551678
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  36551754 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcat-atcagtgttatattatatccaaaaggaacattgttagtgttat 36551678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 47655035 - 47654958
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  47655035 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgctatattatatccaaaatgaacattgttagtgttat 47654958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 338 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9528838 - 9528726
Alignment:
Q  338 aaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaatta 437  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||| ||||| || ||| | || ||||||| || ||||  | || ||||||| ||    
T  9528838 aaaaataattatctgatacttcccgatacgtattaggagagtatccgataattattctgcacagatacctgccccaatacttcttaattaatgttaacta 9528739  T
Q  438 aaataacttaact 450  Q
    |||||||||||||    
T  9528738 aaataacttaact 9528726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 792 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 15417765 - 15417689
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgtta 868  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15417765 caattacatatacaatatatcccaaaaagaggaccatcaatgttatactatatcaaaaaggaacattgttagtgtta 15417689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 560 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 52894947 - 52894866
Alignment:
Q  560 ttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    |||||||||| || ||||||||||||    
T  52894947 ttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttatattaatgtgctacgag 52894866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 487 - 591
Target Start/End: Original strand, 10763903 - 10764009
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgc--tctttttgggatatattgtgtatgtaat 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||||  ||| || | ||| |||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10763903 ttcttttttagatcgatatagtatagcactaaaaatgtttcttttggatatagaatatcacttatggtgctttttttttggaatatattgtgtatgtaat 10764002  T
Q  585 tggctaa 591  Q
    || ||||    
T  10764003 tgactaa 10764009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 458
Target Start/End: Original strand, 10822558 - 10822637
Alignment:
Q  379 tatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
    |||||||| ||||||||  | || || ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822558 tatccgataattatccttgatcgatacctgccccaatacttctcaattgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 10822637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 358
Target Start/End: Original strand, 1036471 - 1036602
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  1036471 acttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaatt 1036570  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||       ||||||||||||||||||||||    
T  1036571 ttattttttaaaaaaataattatctgatactt 1036602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 14167096 - 14167198
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatga-ttaccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| ||  | |||||| ||| |||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14167096 acttcaaaatggatgacttatcgtatcacctgcgtatcctgcaccgatatctgtctgatacttcctgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaatt 14167195  T
Q  327 tta 329  Q
    |||    
T  14167196 tta 14167198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 458
Target Start/End: Original strand, 29861922 - 29862040
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||  || ||| ||| ||  |||||| || | ||||| ||||    
T  29861922 aaataattatccgatacttctcgatacgtatcaggaaagtatccgataattatcctgcacctatacctgtcccaataattcccaattaacgttaaataaa 29862021  T
Q  440 ataacttaactcttgagta 458  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29862022 ataacttaactcttgagta 29862040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20409665 - 20409531
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  20409665 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 20409566  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  20409565 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatac 20409531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Original strand, 30323761 - 30323829
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  30323761 tatcctgcactgatatctgcccgatacttcccgatacgtatctggagagtatccaaatattaaatttta 30323829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 329
Target Start/End: Original strand, 38948762 - 38948846
Alignment:
Q  245 taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||    
T  38948762 taccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatatctgcccaatacttctcgatacgtatccgaagaatatccaaatattaaatttta 38948846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28949352 - 28949216
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  28949352 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcctgatacgtatccggagagtatccaaatatt 28949253  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  28949252 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 28949216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 34096546 - 34096428
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||| || |||||||| ||||  || ||||||| ||  ||| || || | ||||| ||||    
T  34096546 aaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatccaataattatcctgcacctatacctgccccaataattctcaattaacgttaaataaa 34096447  T
Q  440 ataacttaactcttgagta 458  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  34096446 ataacttaactctcgagta 34096428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 52895077 - 52894985
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||    
T  52895077 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgatttttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattttggatata 52894985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Original strand, 2364734 - 2364791
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2364734 gatacctgcccaatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaatttta 2364791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 7764501 - 7764468
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7764501 tattttaggcttaattgcacttttggccccctat 7764468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34432448 - 34432387
Alignment:
Q  268 cactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34432448 cactggtatctgcctgatacttcctgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaatttta 34432387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 478 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 36363397 - 36363338
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  36363397 atatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatata 36363338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 329
Target Start/End: Original strand, 40776053 - 40776109
Alignment:
Q  273 atatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  40776053 atatctgcatgatacttctcgatacgtatcaggcgagtatccgaagattaaatttta 40776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 521
Target Start/End: Original strand, 3427621 - 3427664
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaa 521  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3427621 atatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa 3427664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6916985 - 6916849
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||  || |||    
T  6916985 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatctaaatatt 6916886  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  6916885 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 6916849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 328
Target Start/End: Original strand, 10763717 - 10763772
Alignment:
Q  273 atatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttt 328  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10763717 atatctgcccgatattttttgatacgtatcagaagagtatccgaagattaattttt 10763772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32381170 - 32381042
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||| | |||  |||| || | |||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  32381170 ccgatactttaaaatggatgatataccgtatcccctgcatatcatgcaccaatatttgtctgatacttcccaatacgtatcaggagagtatccgaagatt 32381071  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatc 350  Q
    ||||||||       ||||||||||||||    
T  32381070 aaattttatttttttaaaaaataattatc 32381042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 37104127 - 37104263
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  37104127 ccgatacttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcctgatacgtatccggagagtatccaaatatt 37104226  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  37104227 aaattttattttttaaaaaaataattatccgatactt 37104263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37346959 - 37346852
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||| || |||    
T  37346959 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatcgggggagtatccaaatatt 37346860  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  37346859 aaatttta 37346852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 38330434 - 38330570
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||  || |||    
T  38330434 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatctaaatatt 38330533  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  38330534 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 38330570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 52895824 - 52895688
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||  || |||    
T  52895824 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatctaaatatt 52895725  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  52895724 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 52895688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3708390 - 3708219
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  || ||||||| |  ||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| |||    
T  3708390 ccgatacttcaaaatggatgacgtatcgtatcctctgcatatcctacaccaatacatgcccgatacttttcgatacgtatcaggagagtattcgaatatt 3708291  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatc 393  Q
    |||||||        |||| ||||||||  ||||||||   |||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  3708290 aaatttttattttttaaaatataattattcgatacttctcgatacgtatcaggagagtatccaataattatc 3708219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 671 - 709
Target Start/End: Original strand, 8774286 - 8774324
Alignment:
Q  671 taatatattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8774286 taataaattttaggcttaattgcacttttggacccctat 8774324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Original strand, 8132190 - 8132324
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||| ||| ||||  ||  ||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  8132190 ccgatacttcaaaatagatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacatgttcgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 8132289  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  8132290 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatac 8132324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 616 - 645
Target Start/End: Original strand, 10764020 - 10764049
Alignment:
Q  616 ttatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10764020 ttatttatatttatgttgatgtgctacgag 10764049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13013057 - 13012996
Alignment:
Q  268 cactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  13013057 cactgatacctgcccgatacttcccgatacgtatcgggagagtatccaaatattaaatttta 13012996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31653463 - 31653406
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  31653463 gatatctgcccgatacttcccgatacgtatcgggagagtatccaaatattaaatttta 31653406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 35580985 - 35580956
Alignment:
Q  680 ttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580985 ttaggcttaattgcacttttggccccctat 35580956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 37922563 - 37922494
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||||    
T  37922563 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccatcaatgctatactatatccaaaagaaacattgtt 37922494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 223 - 680
Target Start/End: Original strand, 26691623 - 26692082
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| || ||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  26691623 ccgatacttcaaaatagatgacgtatcgtatcccctgcgtattctgcaccgatacctgtctgatacttcccgatacgtatcaagagagtatccgaagatt 26691722  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcc 421  Q
    ||||||||        ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||| |||| |||||||| ||  | ||||||| ||||| |||||    
T  26691723 aaattttattttttttaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggatagtatgcgataattatcctgcattgatatctgctccgatacttcc 26691822  T
Q  422 cagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaaca 520  Q
    || || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  26691823 caattaatgttaactaaaataacttaagttttgagtactgatgtgttatttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatagagtataacactaaca 26691922  T
Q  521 atattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatt 620  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26691923 atgttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatt 26692022  T
Q  621 tatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26692023 tatatttatgttgatgtggtacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatattt 26692082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 223 - 680
Target Start/End: Original strand, 26961355 - 26961814
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| || ||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  26961355 ccgatacttcaaaatagatgacgtatcgtatcccctgcgtattctgcaccgatacctgtctgatacttcccgatacgtatcaagagagtatccgaagatt 26961454  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcc 421  Q
    ||||||||        ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||| |||| |||||||| ||  | ||||||| ||||| |||||    
T  26961455 aaattttattttttttaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggatagtatgcgataattatcctgcattgatatctgctccgatacttcc 26961554  T
Q  422 cagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaaca 520  Q
    || || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  26961555 caattaatgttaactaaaataacttaagttttgagtactgatgtgttatttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatagagtataacactaaca 26961654  T
Q  521 atattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatt 620  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26961655 atgttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatt 26961754  T
Q  621 tatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26961755 tatatttatgttgatgtggtacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatattt 26961814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 223 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 17138364 - 17137945
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgattaccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatta 322  Q
    |||| ||||||||||||||||     ||||||||  | |||||| ||| ||||  |||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||    
T  17138364 ccgatacttcaaaatagatgacgtatgtatcccctgcgtatcctgcaccgataattgcctgatacttcccgatacgtatcaggagaatatccgaagatta 17138265  T
Q  323 aattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttccc 422  Q
    |||||||       ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||  |||||    
T  17138264 aattttatttttttaaaaagtaattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcactgatatctgccctgatatttccc 17138165  T
Q  423 agttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaat 522  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  17138164 aattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggattgatataatatagcactaacaat 17138065  T
Q  523 attccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattattta 622  Q
     ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17138064 gttccttttgcatataatatagcattgatggtgctc-ttttgggatatattgtgtatatatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 17137966  T
Q  623 tatttatgttgatgtgctacga 644  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  17137965 ta-ttatgttgatgtgctacga 17137945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 228 - 680
Target Start/End: Original strand, 26716285 - 26716716
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26716285 acttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctacaccgatacctgcctgatacttcccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaatt 26716384  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagtt 426  Q
    |||       |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||  || ||||| | || ||||||| ||    
T  26716385 ttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccaatacctgcctcaatacttcccaatt 26716484  T
Q  427 gatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattc 526  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||                      |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  26716485 aatgttagttaaaataacttaactcttgagt----------------------atagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttc 26716562  T
Q  527 cttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatt 626  Q
     ||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26716563 attttggatatagtataacacctatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatt 26716662  T
Q  627 tatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26716663 tatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatattt 26716716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 228 - 680
Target Start/End: Original strand, 26986025 - 26986456
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26986025 acttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctacaccgatacctgcctgatacttcccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaatt 26986124  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagtt 426  Q
    |||       |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||  || ||||| | || ||||||| ||    
T  26986125 ttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccaatacctgcctcaatacttcccaatt 26986224  T
Q  427 gatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattc 526  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||                      |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  26986225 aatgttagttaaaataacttaactcttgagt----------------------atagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttc 26986302  T
Q  527 cttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatt 626  Q
     ||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26986303 attttggatatagtataacacctatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatt 26986402  T
Q  627 tatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26986403 tatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatattt 26986456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 30777315 - 30777063
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  30777315 atgttaactaaaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttct 30777216  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777215 ttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 30777116  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  30777115 atgttgatgtgttacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 30777063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 223 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 30284718 - 30284253
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  30284718 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagatt 30284619  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatac--gtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatcctt 419  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| || ||| |||| | || ||||| || ||||| ||||||||| |||  ||    
T  30284618 aaattttattttaaaaaaaaataattatccgatacttcccgatacacgtaccaggagagtattcaataattattctgcaccgatatctgccctgatattt 30284519  T
Q  420 cccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaac 519  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  30284518 cccaattaatgttaactaaaataacttaactcctgagtagtgatgtgttcttttttgaatatagtgct--ttttttggatcgatatagtataacactaac 30284421  T
Q  520 aatattccttttggatataatataacagtgatgatgctcttttt-------gggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtca 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||| || | ||| || | |||||        ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30284420 aatgttcattttggatatagtatagcactaatggtgttttttttttttttgtggatatattgtgtttctaattgactaatcatcactctcttaatcgtca 30284321  T
Q  613 atattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| | ||  ||||||||||||||    
T  30284320 atattatttatatttatgttgatgtgctaggagcctatgaccggtttcttttgcttgttaatatattt 30284253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 298 - 680
Target Start/End: Original strand, 27938242 - 27938602
Alignment:
Q  298 gtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctac 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  27938242 gtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccaatacgtatcaggagagtatccgataattatcctac 27938341  T
Q  398 accggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttag 497  Q
    |||  ||||| |||  || |||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||                      |||||| ||||||||| |    
T  27938342 accaatatctaccctaatacttctcaattaatattaattaaaataacttaactcttaagt----------------------atagtgcttcttttttgg 27938419  T
Q  498 atcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatca 597  Q
    ||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27938420 atcgatatagtgtagcactaacagtgttccttttggatatagtatagcacgtatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaattatca 27938519  T
Q  598 ctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27938520 ctctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatatgctacgagcctatgactggtttattttgtttgttaatatattt 27938602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Original strand, 11907504 - 11907750
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  11907504 atgttaactaaaataacttaactcctgagtactgatgtattctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgatatattataacaccaacaatgtacc 11907603  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||      |||||    
T  11907604 ttttggatatagtataacactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatat------tattt 11907697  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  11907698 atgttgatgtgctacgagcctacgactggtttcttgtgtttgttaatatattt 11907750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 352 - 680
Target Start/End: Original strand, 27085486 - 27085817
Alignment:
Q  352 gatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||  || ||||| ||| ||||||||  |||| || || |||||||  || ||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  27085486 gatacttcccaatacgtatcagaagagtatctgataattatcctgaaccgatagctcccccgatatttgccaattaatgttaactaaaataacttaactc 27085585  T
Q  452 ttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||| ||||| |||| || |  |    
T  27085586 ttgagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaacaatgttcattttgaatatagtatagcactcgt 27085685  T
Q  552 gatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattattta----tatttatgttgatgtgctacgagct 647  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||     
T  27085686 ggtgctcttttt-ggatatattgtgtatgtaattgactaattatcactttcttaatcatcaatattatttataattatttatgttgatgtgctacgagcc 27085784  T
Q  648 tatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||| |||| ||| | || |||||||||||||||    
T  27085785 tattactggtttcttttgtttgttaatatattt 27085817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 248 - 641
Target Start/End: Original strand, 5722020 - 5722403
Alignment:
Q  248 cgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataatt 347  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||| | ||| ||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  5722020 cgtatcccctgcgtatcctgcactgatacatgcccgatacttctcaatacatatcaggaaagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataatt 5722119  T
Q  348 atctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataactta 447  Q
    |||||||||||          ||||  || |||| |||| ||||||||||||   ||  |||||||||  |||||| || ||||| | ||||| ||||||    
T  5722120 atctgatactt----------atcagaagagtattcgataattatcctacacaaatacttgccccgatatttcccaattaatgttgactaaaaaaactta 5722209  T
Q  448 actcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacag 547  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||     
T  5722210 actcttgagtacttatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttgaatcgatataggataacactaacaatgtttattttggatataatatagcac 5722309  T
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgcta 641  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5722310 tgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaatcgactaatcatcattctcttaatcgtcagtataatttatatttatgttggtgtgcta 5722403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 338 - 680
Target Start/End: Original strand, 22737962 - 22738296
Alignment:
Q  338 aaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaatta 437  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||||||||  || ||||| ||| |||||||| ||| | || ||||| |||| |||| || || ||||||| ||    
T  22737962 aaaaataattatc-gataatttctgatacgtatcagaagagtatctgataattatcctgcactgatacctgcctcgatacttctcaattaatgttaacta 22738060  T
Q  438 aaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatat 537  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22738061 aaataatttaactcttgagcactgatgtgttctttttgga-tatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatat 22738159  T
Q  538 aatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggcta---ataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttga 634  Q
    | |||||||          ||||||||||||||||||||||||||| || |||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22738160 agtataaca---------ttctttttgggatatattgtgtatgtaactgactaaatatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttga 22738250  T
Q  635 tgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||| | || |||||||||||||||    
T  22738251 tgtgttacgagcctatgactagtttcttttgtttgttaatatattt 22738296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 340 - 680
Target Start/End: Original strand, 25749731 - 25750049
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  25749731 aaataattatctgatactttccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccaatacctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaa 25749830  T
Q  440 ataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataa 539  Q
    ||||||||||| ||||||                      |||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||| ||| |||||||||||     
T  25749831 ataacttaacttttgagt----------------------atagtgcttcttttttggatcgatgtaatatagcactaacaatgttcattttggatatag 25749908  T
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    | || || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25749909 tgtagcacttatggtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgtgc 25750008  T
Q  640 tacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25750009 tacgagcctatgactgatttattttgtttgttaatatattt 25750049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 3934838 - 3934462
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaa-aataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtat 381  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       |||| ||||||||||  |||||| |  |||||||||| ||| ||||    
T  3934838 gatacttaccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttttaaaaataataattatccaatactttccgatacgtatcatgagagtat 3934739  T
Q  382 ccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatat 481  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||   || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||                      ||    
T  3934738 ccgataattatcctgcatcgatacctgcctaaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagt----------------------at 3934661  T
Q  482 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgt 581  Q
    | || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3934660 aatgcttcttttttggatcgatataatataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatgatgatctttttgagatatattgtgtatgt 3934561  T
Q  582 aattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  3934560 aattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 3934462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 284 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 18002014 - 18001631
Alignment:
Q  284 atacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatcc 383  Q
    ||||||| |||||  |||||| ||||| |  |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  18002014 atacttcccgatacatatcaggagagtatttgaagattaaattttattttttttaaaaataattatctgatactttccgatacgtatcaagagagtatcc 18001915  T
Q  384 gatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatag 483  Q
    ||| |||||| | ||||| || |||| || ||  ||| || || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18001914 gataattatcatgcaccgatacctgctccaata-ttctcaattaatgttaactaaaataacttaattattgagtactgatgtgttcttttttgaatatag 18001816  T
Q  484 tgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaa 583  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||            |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18001815 tgcttcttttttggatcgataaagtatagcactaa------------tggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattggatatgtaa 18001728  T
Q  584 ttggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  18001727 ttgattaatcatcactctcttacttgtcaatattatttatatttatgttgatgggctacaagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 18001631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 482 - 680
Target Start/End: Original strand, 3701331 - 3701528
Alignment:
Q  482 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgt 581  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3701331 agtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgctctttttgg-atatattgtgcatgt 3701429  T
Q  582 aattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |  | |||||||||||||||    
T  3701430 aattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattttttatatttatgttgatgcgctacgagcctataactgatttcttatgtttgttaatatattt 3701528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 477 - 680
Target Start/End: Original strand, 1921022 - 1921226
Alignment:
Q  477 aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtat-aacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgt 575  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1921022 aatatagtgcttcttttttggatcgatataatattaacactaacaatgatccttttggatatagtatatcactgatgatgctctttttgggatatatttt 1921121  T
Q  576 gtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaata 675  Q
    | |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  | ||||||||||    
T  1921122 gcatgtaatatactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttgtgtttgttaata 1921221  T
Q  676 tattt 680  Q
    |||||    
T  1921222 tattt 1921226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 479 - 676
Target Start/End: Original strand, 1795635 - 1795833
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttt-tgggatatattgtgt 577  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  1795635 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgcttttttttgggatatattgtat 1795734  T
Q  578 atgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  1795735 atgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatat 1795833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 487 - 681
Target Start/End: Original strand, 7629296 - 7629490
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7629296 ttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtatcttttggatatagtatagcactaatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtcattg 7629395  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | || || |||||||||||||    
T  7629396 actaatcatcactctcttaatcgccaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgaatgatttcttttgttagttaatatatttt 7629490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 283 - 680
Target Start/End: Original strand, 34032437 - 34032811
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||    
T  34032437 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaatttttattttttaaaaaaataattatctgatacttcccaatacga---------gtatc 34032527  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagt--tgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaata 480  Q
    |||| ||||| || || || || || |||||||  || ||| |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34032528 cgataattattctgcatcgatacctaccccgatattttccaatattaatgttaactaaaataatttaacttttgagtactaatgtgttctttttttaata 34032627  T
Q  481 tagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatg 580  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |||||| ||| |||            ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34032628 tagtgcttattttttggatcgataaagtatagcactaac------------ggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatg 34032715  T
Q  581 taattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  34032716 taattgattaatcatcactctcttaatcgtcaata----ttatatttatattgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 34032811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 478 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 6242887 - 6242683
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatata--gtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgt 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||  |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  6242887 atatagtgcttcttttttagatcgatatatagtataacactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctttttttggtatatattgt 6242788  T
Q  576 gtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaata 675  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||| |  | ||||||||||    
T  6242787 gtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatattaatgttgatgtgctatgagtctatgactggtttcttgtgtttgttaata 6242688  T
Q  676 tattt 680  Q
    |||||    
T  6242687 tattt 6242683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 487 - 680
Target Start/End: Original strand, 21251734 - 21251927
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21251734 ttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgttctttttgcgatatattgtgtatgtaattg 21251833  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |  | ||| |||||||||||    
T  21251834 actaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcctttgactggtttcttgtgtttattaatatattt 21251927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5612513 - 5612252
Alignment:
Q  262 atcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcct 361  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||   |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||    
T  5612513 atcctgcattgataactgcccgatactttctgatacgtaccaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcct 5612414  T
Q  362 aatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactg 461  Q
     |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5612413 gatacgtatcaggagagtatctgataattatcctgcaccgctacctgccccgatagttcccaattaatgttaattaaaataacttaactctcgagtattg 5612314  T
Q  462 atgtgttctttttct-aatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaat 522  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  5612313 atgtgttctttttttggatatagtgcttctttttttgattgatatagtatagcactaacaat 5612252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 490 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 42365971 - 42365775
Alignment:
Q  490 ttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataa-----cagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaat 584  Q
    |||||| |||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||| |||||     || | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  42365971 ttttttggatcgatatagtatataactaagaatcttccttttggatatagtataatattacactcatggtgctctttttgggatatattgtgcatctaat 42365872  T
Q  585 tggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  42365871 tgactaatcatcactctgttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatatttt 42365775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 349 - 680
Target Start/End: Original strand, 41233444 - 41233760
Alignment:
Q  349 tctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaa 448  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |    || || ||||||| ||  |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  41233444 tctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatctgataattatcat----cgatacctgccccaatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaa 41233539  T
Q  449 ctcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttag-atcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacag 547  Q
    || ||||||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||| | || |||| |||||| ||| ||| |            |||||||||| ||     
T  41233540 ctgttgagtactaatgtgttcttttttggatatagtccttctttttttggattgataaagtatagcactaacga------------atataatatagcac 41233627  T
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagct 647  Q
    |  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41233628 tcctgatgctctttttggtatatatcgtatatgtaattgactaatcatcacgctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacaagcc 41233727  T
Q  648 tatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  41233728 tatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 41233760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 479 - 646
Target Start/End: Original strand, 14836574 - 14836742
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctcttt-ttgggatatattgtgt 577  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||| ||| |||||||| |||    
T  14836574 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatatcactaacaaagtttcttttggatatagtataacacttatggtgctttttattgagatatattttgt 14836673  T
Q  578 atgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 646  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836674 atgtaattgactaatcgtcactctcttaaccgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 14836742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 478 - 622
Target Start/End: Original strand, 15066454 - 15066598
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgt 577  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15066454 atataatgcttcttttttggatcaatatagtataacactaacaatgttcctttcggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgt 15066553  T
Q  578 atgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattattta 622  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15066554 atgtaattgactaatcattactctcttaatcgtcaatattattta 15066598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 43357831 - 43357439
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||| ||| | |||||||  ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||    
T  43357831 tatcctgcaccgatacctgtctgatactttccgatacgtattaaaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcc 43357732  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtact 460  Q
      |||||||||| ||  ||||| ||| |||||||| ||||  || ||||| | ||  |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||       
T  43357731 cgatacgtatcaggaaagtatctgataattatcctgcacctatacctgcctcaataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagt--- 43357635  T
Q  461 gatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgc-tct 559  Q
                       |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||  | | ||| ||| | |    
T  43357634 -------------------atagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagtacttatggtgctttt 43357554  T
Q  560 ttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  43357553 ttttgggatatattatgtatgtaattgac--atcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgactggttt 43357456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 557 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 5612249 - 5612126
Alignment:
Q  557 tctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactga 656  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5612249 tcttttggggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattcatatttatgttgatgtgctaagagcatatgactgg 5612150  T
Q  657 tttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||    
T  5612149 tttcttttacttgttaatatattt 5612126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 39690105 - 39689892
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  39690105 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaag-ttccttttggatatagtgta 39690008  T
Q  544 acagtgatga-------------tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
     || |||||              |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39690007 gcattgatgtatagctatgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 39689908  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  39689907 ttaatgtgctacgagc 39689892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 517 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 39796782 - 39796619
Alignment:
Q  517 aacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatat 616  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39796782 aacaatgttccttttagatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtatatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatat 39796683  T
Q  617 tatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    || |||||||||||||||| || ||||  | ||||| || ||| |  | |||||||||||||||    
T  39796682 tacttatatttatgttgatatgatacgcacatatgagtggtttcttgtgtttgttaatatattt 39796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 540 - 646
Target Start/End: Original strand, 30918995 - 30919101
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30918995 tataacactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 30919094  T
Q  640 tacgagc 646  Q
    |||||||    
T  30919095 tacgagc 30919101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 540 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5985745 - 5985640
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5985745 tataacactgatgatgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 5985646  T
Q  640 tacgag 645  Q
    ||||||    
T  5985645 tacgag 5985640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 567 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 9728176 - 9728063
Alignment:
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttat 666  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  | |    
T  9728176 atatattgtgtacgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgttctacgagcctatgactgatttcttgtgt 9728077  T
Q  667 ttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||    
T  9728076 ttgttaatatattt 9728063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 548 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 26794261 - 26794163
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26794261 tgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgagcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgagc 26794163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 512 - 680
Target Start/End: Original strand, 9654025 - 9654193
Alignment:
Q  512 acaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtc 611  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||     
T  9654025 acactaacaatattccttatggatatattataacatcaatggtgctctttttgtgatatattgtgtatgcaattgactaatcatcattttcttaattgtt 9654124  T
Q  612 aatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  9654125 aatattacttatatttatgttgatatgccacaagcctatgactggtttcttgtgtttgttaatatattt 9654193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 540 - 644
Target Start/End: Original strand, 10657296 - 10657400
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10657296 tataacactaatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgtgc 10657395  T
Q  640 tacga 644  Q
    |||||    
T  10657396 tacga 10657400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 35746161 - 35746069
Alignment:
Q  588 ctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  35746161 ctaatcatcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 35746069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 340 - 474
Target Start/End: Original strand, 11694328 - 11694460
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||| ||  |||||| || ||||||| ||||    
T  11694328 aaataattatctgatacttcccgatacgtatcaagagaatatctgataattatcctgcaccgctacctgccccaatagttcccaattaatgttaa-taaa 11694426  T
Q  440 ataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttt 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11694427 ataacttaactctt-agtactgatgtgttcttttt 11694460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Original strand, 9793040 - 9793248
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  9793040 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 9793137  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  9793138 gcattgatgtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttata 9793233  T
Q  631 ttgatgtgctacgag 645  Q
    || ||||||||||||    
T  9793234 ttaatgtgctacgag 9793248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1639163 - 1638954
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataa 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||  ||| ||||||||||||| ||     
T  1639163 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttaggatatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaacaag-ttcattttggatataatgtag 1639066  T
Q  545 cagtgatga-------------tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
    || |||||              |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1639065 cattgatgtatatcactgacggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccactct--taatcgtcaatattatttatatttatgt 1638969  T
Q  632 tgatgtgctacgagc 646  Q
    | |||||||||||||    
T  1638968 taatgtgctacgagc 1638954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 589 - 653
Target Start/End: Original strand, 11694466 - 11694530
Alignment:
Q  589 taataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgac 653  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11694466 taatcatcactctcttaatcgtgaatattatttatacttatgttgatgtgctacgagcctatgac 11694530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 458
Target Start/End: Original strand, 1795425 - 1795636
Alignment:
Q  248 cgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta-nnnnnnnaaaaaataat 346  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||    
T  1795425 cgtatcccctccgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttttaaaaataat 1795524  T
Q  347 tatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataactt 446  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||  |  ||||||||| |||||||| |||   || ||| ||  ||  ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  1795525 tatccgatacttcccgatacgtatcagaaaagtatccgataattatcctgcacatatacctgtccaaataattcccaactaacgttaaataaaataactt 1795624  T
Q  447 aactcttgagta 458  Q
    ||||||||||||    
T  1795625 aactcttgagta 1795636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 42366209 - 42365982
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||| ||| | |||  |||||| ||| | |||||||||||| |     
T  42366209 acttcaaaatagatgatgtactgtatcccctgcgtatcctgcactgatacctgcccgatatttcccaatacctatcaggagaatatccgaagattaatta 42366110  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagtt 426  Q
    |||          |||||||||||  ||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||   || ||||||| ||    
T  42366109 ttatttttt----aaataattatccaatacttcccgatatgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccgttacctgcctaaatacttcccaatt 42366014  T
Q  427 gatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
     ||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  42366013 aatgttaactgaaataacttaacttttgagta 42365982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32707942 - 32707806
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  32707942 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 32707843  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  32707842 aaattttatttttttaaaaaataattatctgatactt 32707806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 11907662 - 11907585
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  11907662 caattacatacacaatatataccaaaaagagcaccatcagtgttatactatatccaaaaggtacattgttggtgttat 11907585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 26691988 - 26691911
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26691988 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 26691911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 26961720 - 26961643
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26961720 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 26961643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41392818 - 41392687
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||| || ||||||||    
T  41392818 acttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatatgtatccggggagtatccaaatattaaatt 41392719  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||       |||||||||| |||||||||||    
T  41392718 ttattttaaaaaaaaataataatctgatactt 41392687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 9729534 - 9729397
Alignment:
Q  431 ttaattaaaataacttaactcttga-gtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcctt 529  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| || |||||| ||| ||||    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  9729534 ttaactaaaataacttaactctttaagtactaatgtgtttttttttta-tatagtttttttttt----atcgatatagtatagcattaacaatgttcctt 9729440  T
Q  530 ttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatat 572  Q
    ||||||||| |   ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  9729439 ttggatatactgcgacactgatggtgctctttttgagatatat 9729397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35746197 - 35746161
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacac 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35746197 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacac 35746161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1639893 - 1639786
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |||    
T  1639893 ccgatacttcaaaatggatgacgtactgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccgaagagtatccaaatatt 1639794  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  1639793 aaatttta 1639786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 794 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 5722346 - 5722271
Alignment:
Q  794 attacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||    
T  5722346 attacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgctatattatatccaaaataaacattgttagtgttat 5722271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 535
Target Start/End: Original strand, 33830505 - 33830593
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggat 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  33830505 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgatt-ttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggat 33830593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39690874 - 39690738
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  39690874 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcctgatacgtatccggagagtatccaaatatt 39690775  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  39690774 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 39690738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26794343 - 26794282
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat 540  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  26794343 atatagtgattcttttttggatcgatttagtataacactaacaa-gttccttttggatataat 26794282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 15066562 - 15066485
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| || |||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  15066562 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccatcagtgctatactatatccgaaaggaacattgttagtgttat 15066485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 30777157 - 30777234
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||    
T  30777157 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttat 30777234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 478 - 538
Target Start/End: Original strand, 10657221 - 10657281
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  10657221 atataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccgtttggatata 10657281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Original strand, 11906264 - 11906332
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  11906264 tatcctgcaccgatatctgtccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccgaatattaaatttta 11906332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Original strand, 12190431 - 12190499
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |  |||||||||||||    
T  12190431 tatcctgcactgatatctgtccgatacttcttgatacgtatcaggagagtattcagagattaaatttta 12190499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 709
Target Start/End: Original strand, 16822774 - 16822809
Alignment:
Q  674 tatattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16822774 tatattttagacttaattgcacttttggccccctat 16822809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 710
Target Start/End: Original strand, 38162589 - 38162620
Alignment:
Q  679 tttaggcttaattgcacttttggccccctatg 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38162589 tttaggcttaattgcacttttggccccctatg 38162620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 329
Target Start/End: Original strand, 19321441 - 19321487
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19321441 gatacatcccgatgtgtatcagaagagtatccgaagattaaatttta 19321487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 709
Target Start/End: Original strand, 3223429 - 3223462
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3223429 tattttaggcttaattgcacttttggacccctat 3223462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 3701434 - 3701358
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3701434 caattacatgcacaatatat-ccaaaaagagcaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 3701358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 3934556 - 3934633
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||| | ||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  3934556 caattacatacacaatatatctcaaaaagatcatcataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttat 3934633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19102538 - 19102469
Alignment:
Q  260 atatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  19102538 atatcctacattgatatctgtccgatatgtcccgatacgtatcagaagagtatacgacaattaaatttta 19102469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Original strand, 32624934 - 32625020
Alignment:
Q  272 gatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| || |||||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  32624934 gatacctgcccgatacttcccgatacgtattcgaagagtatccaaatattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 32625020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 35746237 - 35746196
Alignment:
Q  417 cttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35746237 cttcccaattaatgttaagtaaaataacttaactcttgagta 35746196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 293 - 681
Target Start/End: Original strand, 11105364 - 11105753
Alignment:
Q  293 gatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattat 392  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||       |||||||||||||  |||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  11105364 gatacgtatcagaagaatattcgaagattaaattttatttttttaaaaaataattattcgatacttccgtatacatatcaaaagagtatccgatcattat 11105463  T
Q  393 cctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttct-aatatagtgtttctt 491  Q
    |||||| || ||||| | ||||| |||| || || ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||| ||||     
T  11105464 cctacaacgatatcttctccgatacttctcaattaatgttaaataaaataaattaattcttgagtattgatatgttcttttttttaatacagtgcttctc 11105563  T
Q  492 ttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaa 591  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11105564 ttttggattgatatagtataacactaacaatgttcattttggatataaaataacactgatggtgctctttttgggatatattatgtatgtaattggctaa 11105663  T
Q  592 taatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  11105664 taaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctacgactggtttctgttgtttgttaatatatttt 11105753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Original strand, 3212782 - 3213034
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  3212782 atgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttct 3212881  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3212882 ttttgaatatagtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 3212981  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3212982 atgttgatgtgttacgagcctatgactgatttattttgtttgttaatatattt 3213034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 292 - 680
Target Start/End: Original strand, 7254997 - 7255383
Alignment:
Q  292 cgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaa-aataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcatt 390  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       | || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| | |    
T  7254997 cgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttaaaaataataataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataagt 7255096  T
Q  391 atcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttct 490  Q
    ||| | ||||| || ||||||||||  || ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||    
T  7255097 atcatgcaccgatacctgccccgatattttccaattaatgttaacttaaataacttaactcttgagtactgatgtgttatttttttgatatagtgcttct 7255196  T
Q  491 tttttagatcgatatagtataacaccaac-aatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggct 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||| ||||||||||||    |||||||| ||    
T  7255197 tttttggatcgatatagtataacattaacaaatgttccttttggatatagtatagcactgattgtgctctttgtgggatatattg----tgtaattgact 7255292  T
Q  590 aataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  7255293 aatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatattaatgttgatgtgctacgagtctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 7255383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 343 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 10894509 - 10894194
Alignment:
Q  343 taattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaata 442  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||  |||||| || ||||||| ||||||     
T  10894509 taattattcgatacttcctaatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccgatacctaccccgatatttcccaattaatgttaactaaaatt 10894410  T
Q  443 acttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatat 542  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  10894409 acttaactctcgagtattgatgtgttctttgttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtat 10894310  T
Q  543 aacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatatta-tttatatttatgttgatgtgcta 641  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  10894309 agcactgatggtgttctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattttatatttatgctgatgtgctt 10894210  T
Q  642 cgagcttatgactgat 657  Q
    ||||| ||||||||||    
T  10894209 cgagcctatgactgat 10894194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 427 - 680
Target Start/End: Original strand, 32018309 - 32018561
Alignment:
Q  427 gatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattc 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  32018309 gatgttaactaaaataacttaactcttgagtact-atgtgttcttttttcgatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaatgttc 32018407  T
Q  527 cttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatt 626  Q
     ||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32018408 tttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatt 32018507  T
Q  627 tatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  32018508 tatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttgtgtttgttaatatattt 32018561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 294 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 6708080 - 6707714
Alignment:
Q  294 atatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatc 393  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||       |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||  || |||| |||| |||| |    
T  6708080 atatgtatcaggagagtatccgaagattaaatattattttaaaaaaaaataattatccgatacttcccgatacttatcagaagagtattcgataattacc 6707981  T
Q  394 ctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttctttt 493  Q
    |  ||||| || |||||||| |  | |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| || |||||||    
T  6707980 cagcaccgatacctgccccgttattccccaattaatgttgactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttcttttatggatataatgcttctttt 6707881  T
Q  494 ttag-atcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaat 592  Q
    || | ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  6707880 tttggatcaatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtatagcattgatggtgctccttttgggatgtattgtgtatgtaattgattaat 6707781  T
Q  593 aatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6707780 catcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgattt 6707714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 352 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 13045357 - 13045035
Alignment:
Q  352 gatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactc 451  Q
    ||||||| || ||| |||||| |||  |||| ||| | |||||| ||||| |||||||||| ||  |||||| || |||| || ||||||||||||||||    
T  13045357 gatactttctgataagtatcaggagaatatctgataactatcctgcaccgatatctgccccaatatttcccaattaatgtcaactaaaataacttaactc 13045258  T
Q  452 ttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgat 551  Q
    ||||||||||     || |||||   ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  13045257 ttgagtactg-----ttattttttggatatagcatttcttttttggattgatatagtataacactaacgatcttccttttggatatagtattgcactgat 13045163  T
Q  552 gatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatg 651  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13045162 ggtgct-tttttaggatatattgtgtatgtaattggctaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatg 13045064  T
Q  652 actgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    | |  ||| | || |||||||||||||||    
T  13045063 atttgtttcttttgtttgttaatatattt 13045035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 279 - 676
Target Start/End: Original strand, 19128217 - 19128593
Alignment:
Q  279 gcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcg 378  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |    
T  19128217 gcccgatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttttttaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaag 19128316  T
Q  379 tatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaa 478  Q
    |||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||  |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||                         
T  19128317 tatccgataattatccttcacctatgtctgccccgataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagt--------------------- 19128395  T
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttg-ggatatattgtgt 577  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  19128396 -atagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgctttttttttggatatattgtgt 19128494  T
Q  578 atgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||    
T  19128495 atgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgtgttacgagcctatgaccgatttcttttgtttgttaatat 19128593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 479 - 679
Target Start/End: Original strand, 27084216 - 27084416
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgta 578  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27084216 tatagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagaactaacaatgttcctttcggatatagtataacacttatgatgctctttttgggatatattgtgta 27084315  T
Q  579 tgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatat 678  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | || |||||||||||||    
T  27084316 tgtaattgactaaccatcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatggctggtttcttttgtttgttaatatat 27084415  T
Q  679 t 679  Q
    |    
T  27084416 t 27084416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 340 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 13607778 - 13607430
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||  ||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| ||  ||  || || ||||||| ||||    
T  13607778 aaataattatatgatacttcccgatacgtatcaggatagtatatgataattatcctacaccgatacctgccccaatatttttcaattaatgttaactaaa 13607679  T
Q  440 ataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaat-------atagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttg 532  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |  |       |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||    
T  13607678 ataacttaattcttgagtattgatgtgttttttttttttttttttttatagtgcttcttttttggatcgatttagtataacacttacaatttttcttttg 13607579  T
Q  533 gatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatat----tta 628  Q
     |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||    
T  13607578 aatataatataaca---atgatgttctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattgtttatatatactta 13607482  T
Q  629 tgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  13607481 tgttgaagtgttacgagcctatgactggtttcttttgtttgttaatatattt 13607430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 418 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 13061289 - 13061028
Alignment:
Q  418 ttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacacca 517  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||   |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  13061289 ttcccaattaatattaactaaaataacttaatttttgagtattgatgtgttattttttggatatagcgcttcttttttggatcgatatagtatagcacta 13061190  T
Q  518 acaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatatt 617  Q
    |  || ||||| |||| |||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13061189 atgatcttcctcttgggtatagtataacactgatgctgtt-tttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatatt 13061091  T
Q  618 atttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||| | || ||| |||||||||||    
T  13061090 atttatatttatgttgatgtgctacaagcctatcacttgtttcttttgtttattaatatattt 13061028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 444 - 656
Target Start/End: Original strand, 26327524 - 26327736
Alignment:
Q  444 cttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | | |||| |||||| ||||    
T  26327524 cttaactctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttggatcaatatagtataacactaacaatgtacattttagatatagtata 26327623  T
Q  544 acagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacg 643  Q
    ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26327624 acactaattgtgctctttttgagatatattgtctatgtaactgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatattaatgttgatgtgctacg 26327723  T
Q  644 agcttatgactga 656  Q
    ||| |||||||||    
T  26327724 agcctatgactga 26327736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 517 - 680
Target Start/End: Original strand, 3299339 - 3299502
Alignment:
Q  517 aacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatat 616  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |    
T  3299339 aacaatgttccttttggatatattatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcattactctcttaatcgttaatgt 3299438  T
Q  617 tatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||  | |||||||||||||||    
T  3299439 tatttatattcatgttgatgtggtacgagcctatgattggtttattgtgtttgttaatatattt 3299502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 7188154 - 7187940
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta--atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat-- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |      
T  7188154 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgt 7188057  T
Q  541 -----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 629  Q
               ||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7188056 agcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattaactaatgatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 7187957  T
Q  630 gttgatgtgctacgagc 646  Q
     || |||||||||||||    
T  7187956 attaatgtgctacgagc 7187940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 479 - 676
Target Start/End: Original strand, 234551 - 234754
Alignment:
Q  479 tatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttggg------atatat 572  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||| ||||||| | ||| || | |||||         ||||||    
T  234551 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgtttttttttttttttttatatat 234650  T
Q  573 tgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgtta 672  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| | || |||||||    
T  234651 tgtgtatgtagttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagtctatgactagtttcttttgtttgtta 234750  T
Q  673 atat 676  Q
    ||||    
T  234751 atat 234754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 32130400 - 32130222
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |           |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  32130400 atatagtgcttcttttttggatcaatatagtatagcattaacaatgttccttttggataaagtataacatttatataacactgatggtgctctttttggt 32130301  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32130300 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 32130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 505
Target Start/End: Original strand, 31079667 - 31079889
Alignment:
Q  281 ccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnna-aaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgt 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  31079667 ccgatacttctcgataagtatcaggatagtatcttaagattaaattttattttattttaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagt 31079766  T
Q  380 atccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaat 479  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || |||| |||||  |||||| |||   |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  31079767 atccgatgattatcatgcaccgatacctgctccgatatttcccaattg---ttaactaaaataacttaaatcttgaatactgatgtgttcttttttggat 31079863  T
Q  480 atagtgtttcttttttagatcgatat 505  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  31079864 atagtgtttcttttttggattgatat 31079889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 570 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 4153325 - 4153215
Alignment:
Q  570 tattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttg 669  Q
    ||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || ||||    
T  4153325 tattgtgtaagtaattgagtgatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgtgctatgagcctatgactgatttcttttgtttg 4153226  T
Q  670 ttaatatattt 680  Q
    |||||||||||    
T  4153225 ttaatatattt 4153215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 487 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 22988972 - 22988838
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    |||    
T  22988972 ttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatacagtataacactgatggtgttccttttgggatatattgtgtat---tttg 22988876  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttata 624  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22988875 actaatcatcactcgcttaatcgtcaatattacttata 22988838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 487 - 624
Target Start/End: Original strand, 23799424 - 23799558
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    |||    
T  23799424 ttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatacagtataacactgatggtgttccttttgggatatattgtgtat---tttg 23799520  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttata 624  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23799521 actaatcatcactcgcttaatcgtcaatattacttata 23799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 548 - 645
Target Start/End: Original strand, 8357739 - 8357835
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8357739 tgatggtgctctttttgt-atatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 8357835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 478 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 31740557 - 31740483
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatg 552  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31740557 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatataatataacattgatg 31740483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1036190 - 1035979
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  1036190 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 1036093  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctt---tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
              |||||| ||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  1036092 gcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatattt 1035997  T
Q  628 atgttgatgtgctacgag 645  Q
    || || ||||||||||||    
T  1035996 atattaatgtgctacgag 1035979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 26327201 - 26327354
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||    
T  26327201 tatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtataaga-gagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcc 26327299  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgat 415  Q
      |||| ||||   || |||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  26327300 cgatacttatctgaagagtattcgatgattatcctgcaccgatacctgccccgat 26327354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 358
Target Start/End: Original strand, 8356970 - 8357101
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  8356970 acttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgtccgatacttcccgatacgtatccgaagagtatccaaatattaaatt 8357069  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||       |||||||||||||| |||||||    
T  8357070 ttattttttaaaaaaataattatccgatactt 8357101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31195725 - 31195633
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  31195725 ttaactctt-agtactgttgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatata 31195633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 11105658 - 11105581
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  11105658 caattacatacataatatatcccaaaaagagcaccatcagtgttattttatatccaaaatgaacattgttagtgttat 11105581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 328
Target Start/End: Original strand, 234352 - 234419
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttt 328  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  234352 tatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaactttt 234419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31195975 - 31195844
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  31195975 acttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatctggagagtatccaaatattaaatt 31195876  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||       |||||||||||||| |||||||    
T  31195875 ttattttttaaaaaaataattatccgatactt 31195844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 3212940 - 3212863
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||  |||| ||| |||||| |||||||    
T  3212940 caattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttat 3212863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 3299408 - 3299339
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  3299408 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccatcagtgctataatatatccaaaaggaacattgtt 3299339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 27084323 - 27084254
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgtt 861  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  27084323 caattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcataagtgttatactatatccgaaaggaacattgtt 27084254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Original strand, 3212523 - 3212591
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  3212523 tatcctgcaccgatatctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaatttta 3212591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 406 - 458
Target Start/End: Original strand, 27084165 - 27084217
Alignment:
Q  406 ctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
    ||||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27084165 ctgcccccatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 27084217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1036937 - 1036801
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||  || |||    
T  1036937 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatctaaatatt 1036838  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  1036837 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 1036801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 31195618 - 31195551
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaat 607  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  31195618 tataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaat 31195551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 511
Target Start/End: Original strand, 8357624 - 8357689
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtata 511  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  8357624 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcaatataatata 8357689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 554 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 31740468 - 31740394
Alignment:
Q  554 tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattta 628  Q
    |||| ||||||| |||| ||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31740468 tgctatttttggtatattttgcgtatgcaaatgactaatccccactctctttatcgtcaatattatttatattta 31740394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7188887 - 7188756
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgattaccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatta 322  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||| ||||||||  |||| ||||| | ||||| ||| || ||||    
T  7188887 ccgatacttcaaaatggatg--taccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcctgatacttcctgatacgtatccggagagtatccaaatatta 7188790  T
Q  323 aattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    |||||||       |||||||||||||| |||||    
T  7188789 aattttatttttaaaaaaaataattatccgatac 7188756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 26716691 - 26716658
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26716691 tattttaggcttaattgcacttttggacccctat 26716658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 31951521 - 31951488
Alignment:
Q  676 tattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31951521 tattttaggcttaattgcacttttggacccctat 31951488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 32018467 - 32018390
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||  || |||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  32018467 caattacatacacaatatataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgttat 32018390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 223 - 614
Target Start/End: Original strand, 32424928 - 32425316
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||||||   | |||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32424928 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccttgcgtatcctgcaccgatacctgtctgatacttcacgatacgtatcagaagagtatccgaagatt 32425027  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcc 421  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  32425028 aaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcccgatatgtatcaggagagtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatactttc 32425127  T
Q  422 cagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaa 521  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32425128 caattaatgttaactaaaataacttaactcttga-------tgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaa 32425220  T
Q  522 ta---ttccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaat 614  Q
    ||   ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32425221 taatgttctttttgaatatagtataacattgatgatgctattttggggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaat 32425316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 259 - 680
Target Start/End: Original strand, 20182418 - 20182832
Alignment:
Q  259 catatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||       |||||||||||| | |||||||    
T  20182418 catatcctgcact-atatctgtctgatacttttcgatacgtatcagtagagtatctgaagattaaattttaatttttaaaaaaataattaaccgatactt 20182516  T
Q  359 cctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 458  Q
    ||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||  ||| || |  ||||||| ||||||||||||||||      |    
T  20182517 cccgatacgtatcaagaaagtatctgataattattctacatcgatatctgcctcgatatttcacaataaatgttaactaaaataacttaactc------a 20182610  T
Q  459 ctgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctc 558  Q
    |  |||| || ||||| | |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  20182611 cccatgtattttttttttgatatggtgcttcttttttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattaatggtgctc 20182710  T
Q  559 tttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatt 658  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20182711 tttttgggatatattgtttatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatt 20182810  T
Q  659 tatgttatttgttaatatattt 680  Q
    | | || |||||||||||||||    
T  20182811 tcttttgtttgttaatatattt 20182832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 339 - 681
Target Start/End: Original strand, 7411726 - 7412068
Alignment:
Q  339 aaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaa 438  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| ||||||| || ||||||| |||    
T  7411726 aaaataattatccgatacttctcgatacatatcaggagagtatccgatcattatcctacattgatacatgccccgatacttcccaattaatgttaactaa 7411825  T
Q  439 aataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||    
T  7411826 aataacttaactcttgagaaccgatgtgttcttttttgaacatagtgctttctttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttattttagatata 7411925  T
Q  539 atataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtg 638  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7411926 atatagcattgatggtgctatttttgggatatattgtttatgcaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttacatttatgtttatgtg 7412025  T
Q  639 ctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  7412026 ctacgagcctatgattggtttatgttgtttgttaatatatttt 7412068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 259 - 673
Target Start/End: Original strand, 27968147 - 27968550
Alignment:
Q  259 catatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaaga--gtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    |||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||    
T  27968147 catatcctgcaccgatacctggctgatacttcccgatacgtatcaggagatcgtatccgaagattaaagtttattttttaaaaaaataattatctgatac 27968246  T
Q  357 ttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgag 456  Q
    |||   |||| ||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||          
T  27968247 ttctcgatacatatcaggagagtatccgataattatcttgcactgatatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaact------ 27968340  T
Q  457 tactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgc 556  Q
        ||||||||||||||   ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  27968341 ----gatgtgttcttttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgc 27968433  T
Q  557 tctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactga 656  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||    
T  27968434 tctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagtctatgaccga 27968533  T
Q  657 tttatgttatttgttaa 673  Q
    ||| | || ||||||||    
T  27968534 tttcttttgtttgttaa 27968550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Original strand, 40412756 - 40413008
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||     
T  40412756 atgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgctttttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttct 40412855  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
     |||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40412856 ctttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 40412955  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  40412956 atgttgatgtgctacgagcctatgactggtttcttgtgtttgttaatatattt 40413008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 283 - 653
Target Start/End: Original strand, 27886258 - 27886615
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||       |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||    
T  27886258 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaagtttatttttaaaaaaaatagttatctgatacttctcaatacatatcaggagagtatc 27886357  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
    |||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| |||| || || |||||||  ||||||||||||||          |||||||| |||||   |||||    
T  27886358 cgataattatcttgcactgatatctgccctgatacttcacaattaatgttaacgaaaataacttaact----------gatgtgttattttttggatata 27886447  T
Q  483 gtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgta 582  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27886448 gtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggctctttttgtgatatattgtgtatgta 27886544  T
Q  583 attggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgac 653  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27886545 attgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagcctatgac 27886615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 283 - 653
Target Start/End: Original strand, 27944916 - 27945273
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatc 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||       |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||    
T  27944916 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaagtttatttttaaaaaaaatagttatctgatacttctcaatacatatcaggagagtatc 27945015  T
Q  383 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatata 482  Q
    |||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| |||| || || |||||||  ||||||||||||||          |||||||| |||||   |||||    
T  27945016 cgataattatcttgcactgatatctgccctgatacttcacaattaatgttaacgaaaataacttaact----------gatgtgttattttttggatata 27945105  T
Q  483 gtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgta 582  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27945106 gtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggctctttttgtgatatattgtgtatgta 27945202  T
Q  583 attggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgac 653  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27945203 attgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagcctatgac 27945273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 259 - 653
Target Start/End: Original strand, 28025133 - 28025516
Alignment:
Q  259 catatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaaga--gtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    |||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||    
T  28025133 catatcctgcaccgatacctggctgatacttcccgatacgtatcaggagatcgtatccgaagattaaagtttattttttaaaaaaataattatctgatac 28025232  T
Q  357 ttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgag 456  Q
    |||   |||| ||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| |||| || || |||||||  ||||||||||||||          
T  28025233 ttctcgatacatatcaggagagtatccgataattatcttgcactgatatctgccctgatacttcacaattaatgttaacgaaaataacttaact------ 28025326  T
Q  457 tactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgc 556  Q
        |||||||| |||||   ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  28025327 ----gatgtgttattttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggc 28025419  T
Q  557 tctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgac 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28025420 tctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgatacgagcctatgac 28025516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 428 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27109100 - 27108876
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27109100 atgttaactaaaataacttaactgttaagtaccgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaattttcc 27109001  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||| |||| || | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27109000 ttttggatatagtatagcacttattgtgctctttttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattgtcaatattatttatagtt 27108901  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatga 652  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  27108900 atgttgatgtgttacgagcctatga 27108876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 340 - 680
Target Start/End: Original strand, 3892089 - 3892407
Alignment:
Q  340 aaataattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaa 439  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || ||||||| ||||    
T  3892089 aaataattatctgatacttctcgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccgatacctgccccaatacttcccaattaatgttaactaaa 3892188  T
Q  440 ataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataa 539  Q
    ||||||||||||||||||                      |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||     
T  3892189 ataacttaactcttgagt----------------------atagtgcttcttttttggattgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatag 3892266  T
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3892267 tataacacttatggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcgctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgt 3892366  T
Q  640 tacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||    
T  3892367 tacgagcctatgactggtttattttgttatttaatatattt 3892407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 428 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 8171011 - 8170759
Alignment:
Q  428 atgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattcc 527  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||     
T  8171011 atgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatatgctcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaccaatgttct 8170912  T
Q  528 ttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
    ||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8170911 ttttggatattgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 8170812  T
Q  628 atgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    | |||||| |||||| |||  ||||||| ||| |  | |||| ||||||||||    
T  8170811 acgttgatatgctacaagcccatgactggtttcttgtgtttggtaatatattt 8170759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 261 - 604
Target Start/End: Original strand, 38388713 - 38389054
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcc 360  Q
    |||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||       |||||| |||||||  ||||||||    
T  38388713 tatcctgcaccgatacctgtccgatacttctcgatacgtgtcaggaaagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaacaattatccaatacttcc 38388812  T
Q  361 taatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtact 460  Q
    | |||| |||||  || |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||| || ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  38388813 tgatacttatcagaagagtattcgataattatcctacaccgatacctgccccgatatttcccaattaatgttgactaaaaaaacttaactctcgagtact 38388912  T
Q  461 gatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctt 560  Q
    |||||||||||||    || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| || | |||||||||      
T  38388913 gatgtgttcttttatggatgtagagtttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggataaaatatagcactcatgatgctc-- 38389010  T
Q  561 tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctctt 604  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38389011 tttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctctt 38389054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 444 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 41098856 - 41098644
Alignment:
Q  444 cttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||| | | |||| |||||| ||||    
T  41098856 cttaattctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgtttcttgtttggatcaatatagtataacattaacaatgtacattttagatatagtata 41098757  T
Q  544 acagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacg 643  Q
    ||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41098756 acactaattgtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatattaatgttgatgtgctacg 41098657  T
Q  644 agcttatgactga 656  Q
    ||| |||||||||    
T  41098656 agcctatgactga 41098644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 490 - 676
Target Start/End: Original strand, 32855 - 33044
Alignment:
Q  490 ttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatg---ctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||||    | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32855 ttttttggatcaatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatgatgttttttttttttggatatattgtatatgtaattg 32954  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatat 676  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  32955 actaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcatatgactggtttcttttatttgttaatat 33044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 638
Target Start/End: Original strand, 37372305 - 37372653
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaa-aataattatctgatacttc 359  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||       | || |||||||||  ||||||||    
T  37372305 tatcctgcactgatacctgtctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttaaaaataataataattattcgatacttc 37372404  T
Q  360 ctaatacgtatcaagagcgtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtac 459  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  | ||||| || ||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||       
T  37372405 ccaatacgtatcaggagagtatccgataattattttgcaccgatacctgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaattcttgag--- 37372501  T
Q  460 tgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctct 559  Q
                       ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||        || |||||||||||| |||| || | ||| ||||||    
T  37372502 -------------------tatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcac--------tttcttttggatatagtatagcacttatggtgctct 37372574  T
Q  560 ttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtg 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37372575 ttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtg 37372653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 487 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 5818199 - 5818006
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagt-gatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaatt 585  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5818199 ttctgttttggattgatgtagtatagcactaacaatgttccttttgaatatagtatagcatttgatggtgctctttt-gggatatattgtgtatgtagtt 5818101  T
Q  586 ggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
    | ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5818100 gactaatcatcactttcttaatggacaatattatttatatttatgttgatatgctacgagcctatgactgatttattttgtttgttaatatattt 5818006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 497 - 681
Target Start/End: Original strand, 28737780 - 28737964
Alignment:
Q  497 gatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatc 596  Q
    |||||||||| |||| ||  || ||| || |||||||||||| |||| || | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28737780 gatcgatataatataccattaataatgtttcttttggatatagtatagcacttattgtgctttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 28737879  T
Q  597 actctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatatttt 681  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   || | |||||||||||||||||||    
T  28737880 actcttttaatcgtcaatgttatttatatttatgttgatgttctacgagcctatgactagattcttttatttgttaatatatttt 28737964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Original strand, 5540164 - 5540377
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |       
T  5540164 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatataatatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgta 5540261  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5540262 gcattgatgtataacactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaataaactaatgaacactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 5540361  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  5540362 ttaatgtgctacgagc 5540377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28875941 - 28875728
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  28875941 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgta 28875844  T
Q  544 acagtgatg-------------atgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
     || |||||             ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28875843 gcattgatgtttattcctgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 28875744  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  28875743 ttaatgtgctacgagc 28875728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 19436628 - 19436806
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgat--------gatg---ctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||        ||||   ||||||||||     
T  19436628 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataaccctgatggtactctttttggt 19436727  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19436728 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 19436806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 19572777 - 19572955
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgat--------gatg---ctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||        ||||   ||||||||||     
T  19572777 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataaccctgatggtactctttttggt 19572876  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19572877 atattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 19572955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 32877831 - 32878011
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata-------------acagtgatgatgctctttttg 564  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||             ||| ||||| |||||||||||    
T  32877831 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcgttgatgtataacactgatggtgctctttttg 32877930  T
Q  565 ggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    | |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32877931 gtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctattaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 32878011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 45216596 - 45216383
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |       
T  45216596 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaag-ttccttttggatatagtgta 45216499  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              ||| || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45216498 gcattgatgtatagcaatgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttata 45216399  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || ||||| |||||||    
T  45216398 ttaatgtgttacgagc 45216383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 540 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 43770973 - 43770868
Alignment:
Q  540 tataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgc 639  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43770973 tataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgc 43770874  T
Q  640 tacgag 645  Q
    ||||||    
T  43770873 tacgag 43770868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 25022530 - 25022708
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  | |||| ||| |||||||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  25022530 atatagtgtttcttttttggatcaatatagtatagcattatcaatgttctttttggatatagtgtagcattgatataacactgatggtgctctttttggt 25022629  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25022630 atattttgcatatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctacgag 25022708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 539 - 645
Target Start/End: Original strand, 42949517 - 42949623
Alignment:
Q  539 atataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtg 638  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42949517 atataacaccgatgatgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatgtatatttatgttaatgtg 42949616  T
Q  639 ctacgag 645  Q
    |||||||    
T  42949617 ctacgag 42949623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Original strand, 32760098 - 32760308
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat---- 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |        
T  32760098 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgtag 32760195  T
Q  541 ---------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
             |||||| ||||  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32760196 cattgatgtataacactgatagtgctctttttgt-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgt 32760294  T
Q  632 tgatgtgctacgag 645  Q
    | ||||||||||||    
T  32760295 taatgtgctacgag 32760308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 6028866 - 6029046
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatga-------------tgctctttttg 564  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||              ||||||||||     
T  6028866 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgtataacactgctcgtgctctttttt 6028965  T
Q  565 ggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    | |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6028966 gtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctgcgag 6029046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 445 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 32638589 - 32638391
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata------ 538  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||| |||||          
T  32638589 ttaactctt-agtactcatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatattgtatagcactaacaa-gttccttttgaatatagtgtag 32638492  T
Q  539 -------atataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 631  Q
            |||| || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32638491 catcgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 32638392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 455 - 645
Target Start/End: Original strand, 36484176 - 36484377
Alignment:
Q  455 agtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat-------------a 541  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |             |    
T  36484176 agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaag-ttccttttggatatagtgtagcattgatgta 36484274  T
Q  542 taacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgcta 641  Q
    ||||| ||||  ||||||||||   |||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36484275 taacactgatagtgctctttttat-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgcta 36484373  T
Q  642 cgag 645  Q
    ||||    
T  36484374 cgag 36484377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Original strand, 4246671 - 4246880
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  4246671 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 4246768  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  4246769 gcattgatgtataacaatgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttata 4246864  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  4246865 ttaatgtgctacgagc 4246880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 478 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 19947717 - 19947542
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgat-----------gatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||           | ||||||||||||     
T  19947717 atatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatgtttcttttgggtatagtataacattgatataacactggtggtgctctttttggt 19947618  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctac 642  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19947617 atgttttgcgtatgtaattgactaatcaccactgtgttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtgctac 19947542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 12579762 - 12579693
Alignment:
Q  576 gtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12579762 gtatgtaattgactaatgaacactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatatgctacgag 12579693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 356
Target Start/End: Original strand, 4245953 - 4246081
Alignment:
Q  229 cttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattt 327  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  4245953 cttcaaaatagatgacgtaccgtatcccctgcatatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccgaagagtatccaaatattaaattt 4246052  T
Q  328 tannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    ||       |||||||||||||| |||||    
T  4246053 tattttttaaaaaaataattatccgatac 4246081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 34900745 - 34900534
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |       
T  34900745 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaag-ttcattttggatatagtgta 34900648  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctt---tttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 627  Q
              |||||| ||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  34900647 gcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatattt 34900552  T
Q  628 atgttgatgtgctacgag 645  Q
    || || ||||||||||||    
T  34900551 atattaatgtgctacgag 34900534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12579911 - 12579820
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  12579911 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatata 12579820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 554 - 646
Target Start/End: Original strand, 37669432 - 37669523
Alignment:
Q  554 tgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 646  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  37669432 tgctctttttgt-atatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgtagtacgagc 37669523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22201194 - 22200985
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat--- 540  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||  ||| ||||||||||| |       
T  22201194 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagtactaacaagtttc-ttttggatatagtgta 22201097  T
Q  541 ----------ataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
              |||||| || || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  22201096 gcattgatgtataacactgttggtgctatttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaata----ttatatttata 22201001  T
Q  631 ttgatgtgctacgagc 646  Q
    || |||||||||||||    
T  22201000 ttaatgtgctacgagc 22200985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 564
Target Start/End: Original strand, 29355691 - 29355967
Alignment:
Q  283 gatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaa-taattatctgatacttcctaatacgtatcaagagcgtat 381  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||       |||||| ||||||   |||||||||  |||||||| | ||  ||||    
T  29355691 gatacttcccgatacgtagcaggagagtatccgaagattaaattttaatttttaaaaaaagtaattagtcgatacttcccgatacgtataaggaaagtat 29355790  T
Q  382 ccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatccttcccagttgatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatat 481  Q
    | ||| ||||||||||  || |||||||| ||||  ||| || |  ||||||| || ||||||||||||||| |      |||||||||||||   ||||    
T  29355791 ctgataattatcctacgtcgatatctgcctcgatatttcacaataaatgttaactacaataacttaactcttca------atgtgttcttttttggatat 29355884  T
Q  482 agtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttg 564  Q
    |||| |||||||||  ||  |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||| || | ||| |||| ||||||    
T  29355885 agtgcttcttttttttattaatatagtataacactaacaatgtttcttttgaatatagtatagcactcatggtgctatttttg 29355967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 16384624 - 16384760
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |||    
T  16384624 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgagtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccgaagagtatccaaatatt 16384723  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  16384724 aaattttattttttaaaaaaataattatccgatactt 16384760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 358
Target Start/End: Original strand, 32759385 - 32759516
Alignment:
Q  228 acttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatt 326  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  32759385 acttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatctggagagtatccaaatattaaatt 32759484  T
Q  327 ttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||       |||||||||||||| |||||||    
T  32759485 ttatttttttaaaaaataattatccgatactt 32759516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 27968463 - 27968386
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  27968463 caattacatacacaatatatcacaaaaagagcaccatcagtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttat 27968386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Original strand, 36483442 - 36483576
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| || |||    
T  36483442 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccgaagagtatccaaatatt 36483541  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  36483542 aaattttattttttaaaaaaataattatccgatac 36483576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12580664 - 12580528
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  12580664 ccgatacttcaaaatagatgatgtaccgtatctcctgcgtatcctgcaccgataactgtctgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 12580565  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||| |||||||||||||||||    
T  12580564 aaattttatttttttaaaatataattatctgatactt 12580528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5818383 - 5818288
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatac 356  Q
    |||||| ||| |||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  5818383 tatcctgcaccgatacctgcatgatatttcccgatatgtatcaggagagtatctgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatctgatac 5818288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 677 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 26920035 - 26920003
Alignment:
Q  677 attttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26920035 attttaggcttaattgcacttttggccccctat 26920003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 367
Target Start/End: Original strand, 32877444 - 32877589
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  32877444 ccgatacttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatcgggagagtatccaaatatt 32877543  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatacttcctaatacg 367  Q
    ||||||||       ||||||||||| || ||||| |||| |||||    
T  32877544 aaattttattttttaaaaaaataattttccgatacatcctgatacg 32877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2873021 - 2872914
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || ||     
T  2873021 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatg 2872922  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  2872921 aaatttta 2872914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Original strand, 6028494 - 6028601
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||  |||| | ||||| ||| || |||    
T  6028494 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatatctgcccgatactttccgatacatatcgggagagtatccaaatatt 6028593  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  6028594 aaatttta 6028601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Original strand, 13422215 - 13422322
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||  | ||||| ||| || |||    
T  13422215 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcatatcctgcaccgatacctgcctgatacttcccgatacgtatacggagagtatccaaatatt 13422314  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  13422315 aaatttta 13422322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22201448 - 22201312
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  || |||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  22201448 ccgatacttcaaaatggatgacgtatcgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 22201349  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  22201348 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 22201312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28876677 - 28876570
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||| || |||    
T  28876677 ccgatacttcaaaatggatgacgtactgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttctcgatacgtatccagagagtatccaaatatt 28876578  T
Q  322 aaatttta 329  Q
    ||||||||    
T  28876577 aaatttta 28876570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34901493 - 34901357
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||  || |||    
T  34901493 ccgatacttcaaaatggatgacgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatactttccgatacgtatccggagagtatctaaatatt 34901394  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  34901393 aaattttatttttttaaaaaataattatccgatactt 34901357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 43771047 - 43771004
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaa 521  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43771047 atatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa 43771004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 625 - 659
Target Start/End: Original strand, 38389053 - 38389087
Alignment:
Q  625 tttatgttgatgtgctacgagcttatgactgattt 659  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38389053 tttatgttgatgtgctacgagcctatgactgattt 38389087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Original strand, 32792 - 32825
Alignment:
Q  338 aaaaataattatctgatacttcctaatacgtatc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32792 aaaaataattatctgatacttcctgatacgtatc 32825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24100234 - 24100197
Alignment:
Q  292 cgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24100234 cgatatgtatcaggagagtatccgaagattaaatttta 24100197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Original strand, 27108942 - 27109019
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |  || | || |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  27108942 caattacatacataatatatcccaaaaagagcacaataagtgctatactatatccaaaaggaaaattgttagtgttat 27109019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 27886548 - 27886471
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  27886548 caattacatacacaatatatcacaaaaagagccccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttat 27886471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 27945206 - 27945129
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  27945206 caattacatacacaatatatcacaaaaagagccccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttat 27945129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 28025449 - 28025372
Alignment:
Q  792 caattacatacaaaatatattccaaaaagagtatcatcactgttatattatatcaaaaaggaatattgttggtgttat 869  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  28025449 caattacatacacaatatatcacaaaaagagccccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttat 28025372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 538
Target Start/End: Original strand, 37669312 - 37669403
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata 538  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||  || ||||||||||||    
T  37669312 ttaactctt-agtattgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcaatataatatagcactaacaa-gtttcttttggatata 37669403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 708
Target Start/End: Original strand, 44807098 - 44807127
Alignment:
Q  679 tttaggcttaattgcacttttggcccccta 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44807098 tttaggcttaattgcacttttggcccccta 44807127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 487 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 202622 - 202436
Alignment:
Q  487 ttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatataacagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattg 586  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  202622 ttcttttttagatcaatataatatagcactaacaatatttcttttggatataacataacatttatgatgttctttttgggatatactgtatatgtaattg 202523  T
Q  587 gctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcttatgactgatttatgttatttgttaatatattt 680  Q
     ||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  202522 actaatcat-------ttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagcctatgactgatttcttttgtttgttaatatattt 202436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 548 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 43865 - 43767
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 646  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43865 tgatggtgctctttttgatatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatattaatgtgctacgagc 43767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 43980 - 43890
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttcta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggata 536  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  43980 ttaactctt-agtattgatgtgttctttttttggatatagtgattctttttcggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggata 43890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 444 - 646
Target Start/End: Original strand, 13607 - 13808
Alignment:
Q  444 cttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataatata 543  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||    |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | | |||| |||||| ||||    
T  13607 cttaactctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgcttctttttg-gatcaatatagtataacagtaacaatgtacattttagatatagtata 13705  T
Q  544 acagtgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacg 643  Q
    ||| | ||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  13706 acactaattgtgctctttttgatatatattgtgtatgtcattgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatattaatgtttatgtgctatg 13805  T
Q  644 agc 646  Q
    |||    
T  13806 agc 13808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 548 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 29904 - 29806
Alignment:
Q  548 tgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgagc 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29904 tgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttaatgtgctacgagc 29806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30516 - 30419
Alignment:
Q  261 tatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||       |||||||||||||| |||||||    
T  30516 tatcctacaccgatacctgcccgatacttcctgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttattttaaaaaaaaataattatccgatactt 30419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 478 - 645
Target Start/End: Original strand, 5907 - 6083
Alignment:
Q  478 atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatata-----------atataacagtgatgatgctctttttggg 566  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||           ||||||||  |||| ||||||||||||     
T  5907 atatagtgcttctttttttgattgatatagtataacattaacaatgttcctttttgatatagtatagcattgatataacaccgatggtgctctttttgg- 6005  T
Q  567 atatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgtgctacgag 645  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  6006 -tattttgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatatgatacgag 6083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 329
Target Start/End: Original strand, 5542 - 5626
Alignment:
Q  245 taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaatttta 329  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  5542 taccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatcgggagagtatccaaatattaaatttta 5626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 445 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 41458 - 41365
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacaccaacaatattccttttggatataat 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  41458 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatataat 41365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 41331 - 41276
Alignment:
Q  575 tgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 630  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41331 tgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatg 41276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8203 - 8067
Alignment:
Q  223 ccgaaacttcaaaatagatgat-taccgtatccccaacatatcctacactgatatctgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagatt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |||    
T  8203 ccgatacttcaaaatggatgatgtaccgtatcccctgcgtatcctgcaccgatacctgcccgatacttcccgatacgtatccggagagtatccaaatatt 8104  T
Q  322 aaattttannnnnnnaaaaaataattatctgatactt 358  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  8103 aaattttatttttaaaaaaaataattatctgatactt 8067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27160 - 27095
Alignment:
Q  445 ttaactcttgagtactgatgtgttctttttctaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtata 511  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27160 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatggtgcttcttttttggatcgatatagtata 27095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1171 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1171
Description:

Target: scaffold1171; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 709
Target Start/End: Original strand, 810 - 845
Alignment:
Q  674 tatattttaggcttaattgcacttttggccccctat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  810 tatattttaggcttaattgcacttttggacccctat 845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 325
Target Start/End: Original strand, 10663 - 10710
Alignment:
Q  278 tgcccgatacttctcgatatgtatcagaagagtgtccgaagattaaat 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  10663 tgcccgatacttctcgatacgtatcaggagagtatcagaagattaaat 10710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 710
Target Start/End: Original strand, 199663 - 199693
Alignment:
Q  680 ttaggcttaattgcacttttggccccctatg 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  199663 ttaggcttaattgcacttttggccccctatg 199693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University