View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1364_low_35 (Length: 368)

Name: NF1364_low_35
Description: NF1364
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1364_low_35
NF1364_low_35
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (2-343)||(6311097-6311443)
chr8 (2-341)||(7289865-7290211)
chr8 (2-340)||(36979184-36979524)
chr8 (52-340)||(4760075-4760366)
chr8 (2-340)||(30655448-30655793)
chr8 (2-340)||(18870511-18870849)
chr8 (6-304)||(33037761-33038063)
chr8 (2-319)||(25328218-25328540)
chr8 (52-349)||(10689143-10689442)
chr8 (2-340)||(18853117-18853457)
chr8 (28-319)||(39784789-39785086)
chr8 (28-319)||(35745213-35745511)
chr8 (23-319)||(10684224-10684528)
chr8 (52-340)||(1261954-1262238)
chr8 (65-180)||(26287866-26287985)
chr8 (65-180)||(26301123-26301242)
chr8 (65-180)||(26313117-26313236)
chr8 (52-180)||(31071229-31071362)
chr8 (62-145)||(26403240-26403327)
chr8 (64-145)||(4456028-4456113)
chr8 (64-179)||(7412305-7412426)
chr8 (62-145)||(23799587-23799674)
chr8 (64-145)||(19175766-19175851)
chr8 (65-145)||(4696609-4696693)
chr8 (62-142)||(6127224-6127308)
chr8 (84-143)||(9765852-9765914)
chr8 (65-145)||(19752407-19752491)
chr8 (62-145)||(5702493-5702580)
chr8 (266-342)||(19752609-19752683)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (2-341)||(1457101-1457446)
chr5 (2-340)||(43592080-43592425)
chr5 (2-340)||(27444771-27445116)
chr5 (2-340)||(27449615-27449960)
chr5 (2-340)||(43598525-43598870)
chr5 (2-340)||(43604017-43604362)
chr5 (2-340)||(43609509-43609854)
chr5 (2-323)||(30631227-30631553)
chr5 (2-319)||(15044512-15044831)
chr5 (2-319)||(28807514-28807837)
chr5 (2-221)||(31180138-31180360)
chr5 (28-319)||(37556588-37556887)
chr5 (28-319)||(37561410-37561709)
chr5 (52-340)||(38191983-38192270)
chr5 (52-340)||(38219208-38219495)
chr5 (23-319)||(31396953-31397256)
chr5 (23-319)||(31401810-31402113)
chr5 (62-319)||(2785197-2785461)
chr5 (28-301)||(33791158-33791436)
chr5 (28-301)||(33768021-33768299)
chr5 (52-183)||(35387624-35387759)
chr5 (52-340)||(24135659-24135945)
chr5 (64-145)||(9353344-9353429)
chr5 (64-145)||(36932362-36932447)
chr5 (62-145)||(10281751-10281838)
chr5 (64-145)||(15464532-15464617)
chr5 (275-340)||(31180079-31180142)
chr5 (62-145)||(19588746-19588833)
chr5 (62-144)||(11916982-11917068)
chr5 (64-145)||(14520230-14520315)
chr5 (62-145)||(3880299-3880386)
chr5 (62-145)||(17003970-17004057)
chr5 (64-142)||(12084187-12084269)
chr5 (65-145)||(28832259-28832343)
chr5 (284-340)||(35387474-35387527)
chr5 (65-145)||(42127423-42127507)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (2-341)||(51520257-51520603)
chr4 (2-319)||(3813846-3814168)
chr4 (28-341)||(56146677-56146996)
chr4 (2-319)||(9224346-9224668)
chr4 (2-319)||(9229133-9229455)
chr4 (2-340)||(24741748-24742087)
chr4 (28-319)||(18855549-18855845)
chr4 (2-319)||(45357236-45357558)
chr4 (52-340)||(29760449-29760738)
chr4 (2-319)||(45347756-45348079)
chr4 (2-319)||(5732486-5732809)
chr4 (65-180)||(28468542-28468660)
chr4 (52-179)||(31985634-31985764)
chr4 (62-145)||(10047379-10047466)
chr4 (62-145)||(16623303-16623390)
chr4 (62-145)||(39245994-39246081)
chr4 (64-145)||(5396683-5396768)
chr4 (64-145)||(36315241-36315326)
chr4 (64-145)||(36329450-36329535)
chr4 (62-145)||(38152449-38152536)
chr4 (62-140)||(6743425-6743507)
chr4 (63-144)||(5143260-5143345)
chr4 (65-145)||(5269204-5269288)
chr4 (62-145)||(3796529-3796616)
chr4 (63-144)||(5147678-5147763)
chr4 (64-144)||(3777550-3777634)
chr4 (62-141)||(16630690-16630773)
chr4 (62-145)||(24333809-24333896)
chr4 (63-145)||(54867184-54867269)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-319)||(22010635-22010958)
chr6 (2-319)||(11856795-11857120)
chr6 (2-319)||(14737516-14737838)
chr6 (2-319)||(14742376-14742697)
chr6 (28-319)||(6438324-6438619)
chr6 (2-319)||(28184325-28184650)
chr6 (2-319)||(28155510-28155832)
chr6 (52-340)||(5674770-5675057)
chr6 (28-319)||(6005239-6005537)
chr6 (2-319)||(16838566-16838890)
chr6 (2-301)||(33330384-33330690)
chr6 (2-319)||(33335881-33336207)
chr6 (108-301)||(5343322-5343519)
chr6 (195-340)||(30125940-30126084)
chr6 (64-145)||(5757490-5757575)
chr6 (65-179)||(22708984-22709102)
chr6 (67-145)||(21356036-21356118)
chr6 (64-145)||(31086485-31086570)
chr6 (62-145)||(5572251-5572338)
chr6 (63-145)||(4629954-4630040)
chr6 (63-145)||(10077176-10077262)
chr6 (62-145)||(22963700-22963786)
chr6 (62-145)||(23824607-23824693)
chr6 (62-145)||(31979513-31979600)
chr6 (65-145)||(5017482-5017566)
chr6 (84-145)||(31936587-31936651)
chr6 (62-133)||(21801354-21801429)
chr6 (265-340)||(31936398-31936470)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (2-319)||(9583-9902)
scaffold0355 (171-319)||(1-143)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (2-319)||(44312563-44312885)
chr2 (2-342)||(11098877-11099219)
chr2 (2-319)||(32246607-32246933)
chr2 (52-340)||(14291295-14291585)
chr2 (2-319)||(39811928-39812250)
chr2 (52-340)||(9296401-9296691)
chr2 (28-319)||(19344243-19344541)
chr2 (28-319)||(19349101-19349399)
chr2 (52-340)||(25398305-25398592)
chr2 (52-340)||(25403443-25403730)
chr2 (52-180)||(3491716-3491847)
chr2 (65-179)||(40738810-40738926)
chr2 (62-145)||(21629944-21630030)
chr2 (62-145)||(8040060-8040147)
chr2 (62-142)||(13569331-13569415)
chr2 (64-145)||(28259189-28259274)
chr2 (61-145)||(20522220-20522308)
chr2 (62-145)||(10445454-10445541)
chr2 (62-145)||(17865203-17865290)
chr2 (62-145)||(34682344-34682431)
chr2 (62-144)||(34388859-34388945)
chr2 (62-145)||(14699018-14699104)
chr2 (52-107)||(25407663-25407719)
chr2 (62-145)||(31056044-31056131)
chr2 (62-145)||(33528631-33528718)
chr2 (62-144)||(10707262-10707348)
chr2 (62-142)||(8390160-8390244)
chr2 (67-145)||(42039684-42039766)
chr2 (62-145)||(16940219-16940306)
chr2 (62-145)||(17010884-17010971)
chr2 (62-145)||(39482931-39483018)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (2-319)||(24024266-24024589)
chr7 (2-319)||(12396735-12397057)
chr7 (2-319)||(12406155-12406477)
chr7 (1-319)||(31109522-31109844)
chr7 (28-319)||(19992135-19992432)
chr7 (59-319)||(4866553-4866819)
chr7 (25-340)||(20357521-20357837)
chr7 (52-342)||(2057763-2058062)
chr7 (53-319)||(21812229-21812501)
chr7 (52-340)||(1533444-1533730)
chr7 (23-319)||(24266162-24266466)
chr7 (52-340)||(21645818-21646103)
chr7 (23-319)||(24261283-24261587)
chr7 (52-183)||(21639770-21639905)
chr7 (23-319)||(16879894-16880197)
chr7 (23-319)||(16884750-16885053)
chr7 (52-183)||(18408726-18408860)
chr7 (52-180)||(18413606-18413736)
chr7 (62-145)||(29159803-29159890)
chr7 (63-144)||(21983285-21983370)
chr7 (62-145)||(46516320-46516407)
chr7 (62-145)||(49091661-49091748)
chr7 (68-145)||(47263678-47263757)
chr7 (62-145)||(55948-56034)
chr7 (63-144)||(21988909-21988992)
chr7 (64-145)||(44848696-44848781)
chr7 (65-145)||(9190021-9190105)
chr7 (65-145)||(20284089-20284173)
chr7 (64-145)||(2479337-2479421)
chr7 (62-145)||(2647706-2647793)
chr7 (62-145)||(33332460-33332547)
chr7 (65-145)||(2580390-2580474)
chr7 (64-145)||(35960816-35960901)
chr7 (265-340)||(2479148-2479221)
chr7 (65-145)||(9185178-9185262)
chr7 (265-344)||(47263485-47263562)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (2-319)||(22173134-22173456)
chr3 (2-342)||(7167049-7167391)
chr3 (2-340)||(28503814-28504145)
chr3 (52-340)||(2671586-2671876)
chr3 (52-340)||(8739063-8739354)
chr3 (52-340)||(9091301-9091592)
chr3 (2-319)||(18656256-18656579)
chr3 (52-341)||(8477170-8477459)
chr3 (2-319)||(2677026-2677351)
chr3 (23-319)||(8512037-8512342)
chr3 (23-319)||(8516917-8517222)
chr3 (2-319)||(2672870-2673195)
chr3 (52-183)||(40372795-40372929)
chr3 (28-293)||(24967957-24968227)
chr3 (23-319)||(32475306-32475608)
chr3 (52-180)||(1305914-1306045)
chr3 (99-319)||(10207755-10207981)
chr3 (23-319)||(32480163-32480466)
chr3 (2-104)||(28501647-28501750)
chr3 (52-179)||(26928591-26928721)
chr3 (52-179)||(32143287-32143418)
chr3 (237-340)||(40372986-40373085)
chr3 (65-179)||(27986449-27986567)
chr3 (52-179)||(27452924-27453055)
chr3 (64-145)||(8370488-8370573)
chr3 (64-145)||(27974954-27975039)
chr3 (62-145)||(18552883-18552970)
chr3 (62-144)||(36029094-36029180)
chr3 (64-145)||(16264350-16264435)
chr3 (64-145)||(21711223-21711308)
chr3 (62-142)||(1736305-1736389)
chr3 (65-145)||(33386669-33386753)
chr3 (121-180)||(1309819-1309878)
chr3 (62-145)||(3716002-3716089)
chr3 (62-145)||(30709790-30709877)
chr3 (62-145)||(40592782-40592869)
chr3 (62-145)||(48438214-48438301)
chr3 (64-145)||(6794715-6794800)
chr3 (62-145)||(40844652-40844738)
chr3 (65-145)||(1417493-1417577)
chr3 (65-145)||(39039995-39040079)
chr3 (62-145)||(25795781-25795868)
chr3 (62-145)||(26298988-26299075)
chr3 (62-145)||(47923906-47923993)
chr3 (65-145)||(3328359-3328443)
chr3 (65-145)||(37466291-37466375)
chr3 (62-145)||(24695164-24695251)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (2-319)||(35001-35323)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (2-319)||(25445029-25445352)
chr1 (28-319)||(39445322-39445618)
chr1 (28-319)||(44023840-44024135)
chr1 (2-319)||(41398060-41398381)
chr1 (28-319)||(1054978-1055274)
chr1 (2-304)||(24787314-24787624)
chr1 (2-243)||(41390488-41390726)
chr1 (23-301)||(43988424-43988709)
chr1 (52-340)||(24202769-24203054)
chr1 (241-319)||(41386571-41386650)
chr1 (52-180)||(19361432-19361564)
chr1 (52-180)||(19380072-19380204)
chr1 (52-180)||(19358843-19358975)
chr1 (62-145)||(47703946-47704033)
chr1 (64-145)||(26644909-26644994)
chr1 (62-145)||(9476261-9476348)
chr1 (62-145)||(19072928-19073015)
chr1 (62-145)||(19120818-19120905)
chr1 (62-145)||(13598398-13598485)
chr1 (62-145)||(16124526-16124613)
chr1 (62-145)||(27104382-27104469)
chr1 (62-145)||(29651811-29651898)
chr1 (64-145)||(3281708-3281793)
chr1 (64-145)||(37069770-37069855)
chr1 (62-145)||(775672-775759)
chr1 (65-145)||(47098837-47098921)
chr1 (64-145)||(13604635-13604720)
chr1 (284-340)||(19359079-19359132)
chr1 (64-145)||(21536581-21536666)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (28-319)||(185-481)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (23-319)||(148916-149219)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (23-319)||(2211-2514)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (2-319)||(19104-19428)
scaffold0197 (23-319)||(14269-14573)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (113-341)||(300-528)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (52-340)||(24045-24331)
scaffold0188 (52-340)||(17952-18238)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (79-319)||(181980-182228)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (241-319)||(34132-34211)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (64-145)||(8431-8516)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (258-319)||(13171-13233)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (64-144)||(85684-85768)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (62-145)||(5683-5770)
scaffold0006 (62-145)||(2492-2579)
scaffold0006 (64-145)||(133292-133377)
[»] scaffold0087 (3 HSPs)
scaffold0087 (64-145)||(43973-44058)
scaffold0087 (64-145)||(36844-36929)
scaffold0087 (265-340)||(44174-44247)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (62-145)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (65-145)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (62-142)||(17266-17350)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6311443 - 6311097
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 101  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311443 caaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 6311344  T
Q  102 tctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctt-gttagctct 198  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6311343 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctct 6311244  T
Q  199 ttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacat 296  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311243 tagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacat 6311144  T
Q  297 cattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6311143 cattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacagaa 6311097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 7289865 - 7290211
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289865 caaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 7289963  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  7289964 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatggtttgttatct 7290063  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7290064 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 7290163  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  7290164 atcaatgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 7290211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36979524 - 36979184
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgc 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36979524 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 36979426  T
Q  100 tctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  36979425 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatct 36979327  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36979326 ctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacac 36979228  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36979227 atctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 36979184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 4760075 - 4760366
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4760075 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 4760174  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  4760175 gatgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttg 4760274  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4760275 cttggaaaccattt-tgctcattgattaccactatctctagctccacacatctttgtt--tttcattgatgtgagtttcaaccggattcacaaca 4760366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30655793 - 30655448
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgc 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30655793 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgc 30655695  T
Q  100 tctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg----ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgtt 192  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30655694 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgtt 30655595  T
Q  193 agctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg-gttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctc 289  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  30655594 atctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgttgttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctc 30655496  T
Q  290 cacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30655495 cacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 30655448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Original strand, 18870511 - 18870849
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg 98  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18870511 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctg 18870609  T
Q  99 ctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagc 195  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  18870610 ctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatc 18870708  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacaca 295  Q
    |||||||||| ||||| | || || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  18870709 tctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgttttttgttgtttgcttggaaaccattt-aactcatagattaccattatctcttgctccacaca 18870807  T
Q  296 tcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18870808 tctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 18870849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 33037761 - 33038063
Alignment:
Q  6 gggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 104  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037761 gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 33037859  T
Q  105 ccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttg 201  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  33037860 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttg 33037958  T
Q  202 tgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatca 298  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  33037959 tgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttgttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatct 33038057  T
Q  299 ttgttt 304  Q
    ||||||    
T  33038058 ttgttt 33038063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 25328218 - 25328540
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328218 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 25328315  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc--ttcctttcttgcttatcttgtttatg-cttgttagc 195  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | |||||| |||||||  ||| || |    
T  25328316 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttttcctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatc 25328415  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25328416 tc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccgca 25328513  T
Q  294 catcattg-tttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||    
T  25328514 catcattgatttatttcattgttgtga 25328540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 349
Target Start/End: Original strand, 10689143 - 10689442
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10689143 ttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 10689242  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||  |||||| || |||||||||  |||    
T  10689243 ggtgttttgttcttcctttcttacttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttgttg 10689341  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacagaagc 345  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |    
T  10689342 cttggaaaccattag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccgaaaacacaacacaatc 10689438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Original strand, 18853117 - 18853457
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg 98  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18853117 caaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctg 18853215  T
Q  99 ctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagc 195  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  18853216 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatc 18853314  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggc---tggttttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccac 292  Q
    |||||||||| ||||| | || || ||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18853315 tctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccac 18853413  T
Q  293 acatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18853414 acatc----tttgtttcgttggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 18853457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 39784789 - 39785086
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39784789 tgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 39784885  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  39784886 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacact 39784984  T
Q  221 agtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgt 317  Q
    ||  |||||||| ||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39784985 agcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatctttggtttatttcattggtgt 39785084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35745511 - 35745213
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  35745511 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg 35745414  T
Q  124 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  35745413 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacat 35745317  T
Q  220 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggt 315  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35745316 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggt 35745217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Original strand, 10684224 - 10684528
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10684224 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 10684321  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  10684322 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 10684418  T
Q  215 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 309  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  10684419 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 10684518  T
Q  310 attggtgtga 319  Q
    ||||||||||    
T  10684519 attggtgtga 10684528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 1261954 - 1262238
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  1261954 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatcttttt 1262053  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||   ||||   |||| | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  |||    
T  1262054 ggtgtgtttgttcttcctttctatcttatcttgtt--tgcttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttg 1262148  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||| ||  ||  | ||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1262149 cttggagacactt--tactcatagattaccactcccttttactccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 1262238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287866
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttc 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 26287886  T
Q  161 ttcctttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26287885 ttcctttcttgcttatcttg 26287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301123
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttc 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 26301143  T
Q  161 ttcctttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26301142 ttcctttcttgcttatcttg 26301123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313117
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttc 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 26313137  T
Q  161 ttcctttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26313136 ttcctttcttgcttatcttg 26313117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Original strand, 31071229 - 31071362
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttct 147  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| |    
T  31071229 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttt 31071328  T
Q  148 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 180  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31071329 tggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 31071362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403327
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26403327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4456113 - 4456028
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456113 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7412426 - 7412305
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgt 158  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  7412426 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttcatggtgtgtttgt 7412327  T
Q  159 tcttcctttc-ttgcttatctt 179  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  7412326 tccttctttcattgcttatctt 7412305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 23799587 - 23799674
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23799587 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 23799674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 19175766 - 19175851
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19175766 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696693
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 4696693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6127308 - 6127224
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  6127308 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 143
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  84 tggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 143  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752491
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19752491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 5702493 - 5702580
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5702493 cttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5702580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 342
Target Start/End: Original strand, 19752609 - 19752683
Alignment:
Q  266 attgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 342  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  19752609 attgattaccacttccttttgctccacacatctttgttt-tttcattggtgtga-tttttaccggattcacaacaga 19752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 1457101 - 1457446
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457101 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 1457199  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctt-gttagctc 197  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  1457200 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctc 1457299  T
Q  198 tttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacaca 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1457300 tttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacaca 1457399  T
Q  296 tcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  1457400 tcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 1457446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43592425 - 43592080
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592425 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 43592327  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  43592326 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 43592227  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43592226 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 43592127  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43592126 atcattgtttatttcattgatgtgactttggaaccggattcacaaca 43592080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27445116 - 27444771
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445116 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 27445018  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  27445017 ctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 27444918  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27444917 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacac 27444818  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27444817 atcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 27444771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27449960 - 27449615
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449960 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 27449862  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  27449861 ctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 27449762  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27449761 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacat 27449662  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27449661 atcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 27449615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43598870 - 43598525
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598870 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 43598772  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  43598771 ctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 43598672  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43598671 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 43598572  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43598571 atcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43598525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43604362 - 43604017
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604362 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 43604264  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  43604263 ctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 43604164  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43604163 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 43604064  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43604063 atcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43604017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43609854 - 43609509
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609854 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 43609756  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  43609755 ctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 43609656  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43609655 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 43609556  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43609555 atcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30631553 - 30631227
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631553 caaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 30631454  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctc 197  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||     
T  30631453 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcctttcttacttatcttgtttatgctttgttatcta 30631354  T
Q  198 tttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacaca 295  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30631353 tatatgtgattttgctatacactagtctagggct-gttttgttgttgttgcttgaaaaccatttgttctcatagattaccactatctcttgctccacaca 30631255  T
Q  296 tcattgtttatttcattggtgtgagttt 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30631254 tcattgtttatttcatttgtgtgagttt 30631227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15044831 - 15044512
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044831 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 15044734  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||    
T  15044733 ctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatct 15044634  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15044633 c-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctctacac 15044535  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
     ||||||  ||||||||||||||||    
T  15044534 gtcattg--tatttcattggtgtga 15044512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 28807514 - 28807837
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28807514 caaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaga--ttcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgct 28807609  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctttcttgc--ttatcttgtttatgcttgttagc 195  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |  |  |||||||||||||||||||||||    
T  28807610 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgcttgttagc 28807709  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgt--tatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccac 292  Q
    |||||| ||| |||| |  ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28807710 tctttgagtggttttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccac 28807809  T
Q  293 acatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28807810 acatcattggtttatttcattggtgtga 28807837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31180360 - 31180138
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 101  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180360 caaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 31180261  T
Q  102 tct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctct 198  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31180260 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttctttctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctct 31180161  T
Q  199 ttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    ||||||| ||||| |||||||||    
T  31180160 ttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 37556588 - 37556887
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  37556588 tgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 37556685  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |    
T  37556686 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaa 37556785  T
Q  222 gtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgt 317  Q
    |||   ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  37556786 gtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtttattatcattggtgt 37556885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 37561410 - 37561709
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  37561410 tgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 37561507  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |    
T  37561508 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaa 37561607  T
Q  222 gtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgt 317  Q
    |||   ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  37561608 gtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtttattatcattggtgt 37561707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38192270 - 38191983
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38192270 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 38192171  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  38192170 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 38192074  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38192073 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38191983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38219495 - 38219208
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38219495 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 38219396  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  38219395 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 38219299  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38219298 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38219208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Original strand, 31396953 - 31397256
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31396953 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 31397050  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgt---tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  31397051 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgtt-ttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctt 31397147  T
Q  215 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 310  Q
    |||| ||| ||  || || ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31397148 tacattaggcttaggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 31397247  T
Q  311 ttggtgtga 319  Q
    |||||||||    
T  31397248 ttggtgtga 31397256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Original strand, 31401810 - 31402113
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31401810 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggcca 31401907  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  31401908 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctt 31402004  T
Q  215 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 310  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31402005 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 31402104  T
Q  311 ttggtgtga 319  Q
    |||||||||    
T  31402105 ttggtgtga 31402113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2785461 - 2785197
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgt 158  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2785461 cttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgt 2785363  T
Q  159 tctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaa 253  Q
    ||||   | ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||      
T  2785362 tcttttccttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggagg 2785265  T
Q  254 ccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 319  Q
    |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2785264 ccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 2785197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33791436 - 33791158
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  33791436 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattg 33791339  T
Q  124 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| | | ||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||     
T  33791338 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctctatatgtggttttgctatacat 33791242  T
Q  220 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 301  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33791241 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33791158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33768299 - 33768021
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  33768299 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccacattg 33768202  T
Q  124 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| | | ||||| ||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||     
T  33768201 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctg--tatgcttgttagctctatatgtggttttgctatacat 33768105  T
Q  220 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 301  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||   ||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33768104 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33768021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35387759 - 35387624
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  35387759 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatcttttt 35387660  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387659 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctcgttt 35387624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24135945 - 24135659
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24135945 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 24135846  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgttt 244  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||  |  |  |||| | ||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  24135845 ggtgtgtttgttcttccttttctagcttatcttgtt--tgctttgta--ttatcttgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgttt 24135750  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| ||  | | | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  24135749 gcttggagac--tctttactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttat---tttcattggtgtgagttttatccggattcacaaca 24135659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 9353344 - 9353429
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353344 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 36932362 - 36932447
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932362 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10281838 - 10281751
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281838 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15464617 - 15464532
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464617 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31180142 - 31180079
Alignment:
Q  275 cactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31180142 cactatctcttgctccacacatcattgtta--ttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 31180079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19588833 - 19588746
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588833 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 11916982 - 11917068
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916982 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14520315 - 14520230
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520315 tttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3880386 - 3880299
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  3880386 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatctt 3880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004057
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 17004057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 12084187 - 12084269
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 142  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12084187 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832259
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatctt 28832259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35387527 - 35387474
Alignment:
Q  284 ttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35387527 ttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 35387474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127507
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 42127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51520603 - 51520257
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520603 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 51520505  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  51520504 ctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 51520405  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51520404 ctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 51520305  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  51520304 atcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 51520257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3814168 - 3813846
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3814168 caaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 3814072  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctc 197  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814071 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctc 3813972  T
Q  198 tttgtgtgctttt-gttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813971 tttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgctctcattgattaccactatcacttgctccacac 3813872  T
Q  295 atcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  3813871 atcattggtttatttcattggtgtga 3813846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 341
Target Start/End: Original strand, 56146677 - 56146996
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggc 125  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  56146677 tgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggc 56146775  T
Q  126 tgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagt 223  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  56146776 tgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagt 56146875  T
Q  224 ctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagt 321  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56146876 ctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaat 56146975  T
Q  322 tt-caaccggaatcacaacag 341  Q
    ||  ||||||| |||||||||    
T  56146976 ttggaaccggattcacaacag 56146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 9224346 - 9224668
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224346 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 9224444  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9224445 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 9224543  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9224544 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 9224643  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9224644 atcattgtttatttcattggtgtga 9224668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 9229133 - 9229455
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229133 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 9229231  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9229232 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 9229330  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9229331 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 9229430  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9229431 atcattgtttatttcattggtgtga 9229455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24742087 - 24741748
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgc 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24742087 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 24741989  T
Q  100 tctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  24741988 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatct 24741890  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24741889 ctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacac 24741791  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24741790 atctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 24741748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18855845 - 18855549
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18855845 tgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 18855749  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctttcttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18855748 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta 18855649  T
Q  222 gtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18855648 gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 18855549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 45357236 - 45357558
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357236 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 45357333  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagc 195  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||||||||| ||| |||  | |    
T  45357334 ctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatc 45357433  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    || ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45357434 tc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccaca 45357532  T
Q  294 catcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45357533 catcattgtttatttcattggtgtga 45357558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29760738 - 29760449
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29760738 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 29760639  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
T  29760638 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctaggg-ttgttttgttgttgttg 29760541  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29760540 cttggaaaccattt-tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 29760449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 45347756 - 45348079
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347756 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 45347854  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagc 195  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||||||||| ||| |||  | |    
T  45347855 ctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatc 45347954  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    || ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45347955 tc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccaca 45348053  T
Q  294 catcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45348054 catcattgtttatttcattggtgtga 45348079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5732809 - 5732486
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732809 caaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 5732713  T
Q  101 ctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgt 191  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| |||||||   | ||||||||||  ||| ||||    
T  5732712 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgt 5732615  T
Q  192 tagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctc 289  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5732614 tagctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctc 5732515  T
Q  290 cacacatcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5732514 cacacatcattgtat-tttcattggtgtga 5732486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468660
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttc 160  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttc 28468640  T
Q  161 ttcctttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28468641 ttcctttcttgcttatcttg 28468660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Original strand, 31985634 - 31985764
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |     
T  31985634 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt-tt 31985732  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31985733 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 31985764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10047466 - 10047379
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10047466 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10047379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 16623303 - 16623390
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  16623303 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 16623390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39246081 - 39245994
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39246081 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 39245994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 5396683 - 5396768
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396683 tttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 36315241 - 36315326
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36315241 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36315326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 36329450 - 36329535
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36329450 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36329535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152536
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 38152536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 140
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 140  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  63 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269288
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 5269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 3796529 - 3796616
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796529 cttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  63 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3777634 - 3777550
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777634 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 141
Target Start/End: Original strand, 16630690 - 16630773
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 141  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||    
T  16630690 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333809
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 24333809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54867269 - 54867184
Alignment:
Q  63 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54867269 ttttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 54867184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 22010635 - 22010958
Alignment:
Q  1 tcaaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010635 tcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 22010733  T
Q  100 tctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagc 195  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | || |    
T  22010734 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatc 22010832  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010833 tctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 22010932  T
Q  294 catcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22010933 catcattgtttatttcattggtgtga 22010958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11857120 - 11856795
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857120 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 11857022  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt---gttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gtta 193  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||  | |||| |||||||| ||||| | ||    
T  11857021 ctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtttttttgttcttccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggta 11856923  T
Q  194 gctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcca 291  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11856922 tctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctcca 11856823  T
Q  292 cacatcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856822 cacatcattgtttatttcattggtgtga 11856795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 14737516 - 14737838
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737516 caaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 14737613  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  14737614 ctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatcttctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 14737712  T
Q  197 c-tttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14737713 cttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 14737812  T
Q  294 catcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14737813 catcattgtttatttcattggtgtga 14737838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 14742376 - 14742697
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742376 caaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 14742473  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  14742474 ctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatct 14742572  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14742573 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 14742672  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14742673 atcattgtttatttcattggtgtga 14742697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6438619 - 6438324
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6438619 tgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 6438523  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctttcttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6438522 ctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta 6438423  T
Q  222 gtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438422 gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccattggttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 6438324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28184650 - 28184325
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28184650 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tgttgtaaccttttgtaacactttctcatattagattggagagctgct 28184553  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttct--tgcttatcttgtttatgc-ttgttagc 195  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||| |||  | |    
T  28184552 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttctttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatc 28184453  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaacca--tttgttctcattgattaccactatcacttgctcca 291  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28184452 tc-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 28184354  T
Q  292 cacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28184353 cacatcattggtttatttcattggtgtga 28184325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 28155510 - 28155832
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155510 caaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaa--ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 28155606  T
Q  101 ctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagc 195  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||   | |||||||||||||||||||||||    
T  28155607 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgcttgttagc 28155706  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28155707 tcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccaca 28155806  T
Q  294 catcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  28155807 catcattgtttattgcattggtgtga 28155832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 5674770 - 5675057
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  5674770 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctcttt 5674869  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 245  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  5674870 ggtgtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgta-ttctctttgtggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgttgttg 5674966  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||| || | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5674967 cttgggaaac-tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 5675057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6005537 - 6005239
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  6005537 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg 6005440  T
Q  124 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  6005439 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacat 6005343  T
Q  220 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggt 315  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6005342 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggt 6005243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16838890 - 16838566
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 98  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16838890 caaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 16838794  T
Q  99 ctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgtt 192  Q
    ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||    
T  16838793 ctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgtt 16838697  T
Q  193 agctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 290  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| ||||| |  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  16838696 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttgaaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 16838597  T
Q  291 acacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 319  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16838596 acatatcattggtttattctcattggtgtga 16838566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 33330384 - 33330690
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 98  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33330384 caaagggtag-atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 33330480  T
Q  99 ctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgtt 192  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||| | | |||||||| |||||||||||    
T  33330481 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgtt 33330578  T
Q  193 agctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctc 289  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  33330579 agctcttagtgtggtttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctc 33330678  T
Q  290 cacacatcattg 301  Q
    ||||||||||||    
T  33330679 cacacatcattg 33330690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 33335881 - 33336207
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 98  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33335881 caaagggtag-atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 33335977  T
Q  99 ctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgtt 192  Q
    ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||| | | |||||||| |||||||||||    
T  33335978 ctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgtt 33336075  T
Q  193 agctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctc 289  Q
    ||||||| |||| | ||||  |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| | |||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  33336076 agctcttagtgtggtttttactatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagtttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctc 33336175  T
Q  290 cacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33336176 cacacatcattggtttattctcattggtgtga 33336207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5343519 - 5343322
Alignment:
Q  108 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtg 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  5343519 agattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtg 5343423  T
Q  204 t-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    | | ||||| |||||  ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5343422 tggtttttgctatactttaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 5343323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 30125940 - 30126084
Alignment:
Q  195 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgtt---gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcca 291  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  30125940 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttg-gctcatagattatcactacctcttgctcca 30126038  T
Q  292 cacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30126039 cacatctttgt---tttcattggtgtgattttcaaccggattcacaaca 30126084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 5757490 - 5757575
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757490 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22708984
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgtt 159  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  | ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaatttttt-ggtgtgtttgtt 22709004  T
Q  160 cttcctttcttgcttatctt 179  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22709003 cttcctttcttgcttatctt 22708984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21356118 - 21356036
Alignment:
Q  67 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356118 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086570
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatctt 31086570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 5572251 - 5572338
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  5572251 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 5572338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  63 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077262
Alignment:
Q  63 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 10077262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22963786 - 22963700
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22963786 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 22963700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 23824607 - 23824693
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23824607 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 23824693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31979600 - 31979513
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31979600 cttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31979513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017566
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatctt 5017566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936587
Alignment:
Q  84 tggattggagagctgctc--tctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 31936587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 133
Target Start/End: Original strand, 21801354 - 21801429
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgct--ctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgg 133  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801354 cttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31936470 - 31936398
Alignment:
Q  265 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31936470 cattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtga-ttttaaccggattcacaaca 31936398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 9583 - 9902
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9583 caaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 9679  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctct 198  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9680 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctc- 9778  T
Q  199 ttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacat 296  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9779 ttgtgtggttttgctatatactagcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacat 9878  T
Q  297 catt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  9879 cattggtttatttcattggtgtga 9902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 319
Target Start/End: Original strand, 1 - 143
Alignment:
Q  171 gcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcatt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  1 gcttatcttgtttatgcttgttagctc---gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcatt 97  T
Q  269 gattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||      ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  98 gat------tatcacttgctccacacatcattggtttatttaattggtgtga 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312885
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 44312661  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  44312662 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 44312760  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312761 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 44312860  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44312861 atcattgtttatttcattggtgtga 44312885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 11098877 - 11099219
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgc 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11098877 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 11098975  T
Q  100 tctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||    
T  11098976 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcctttcttccttatcttgttt-tgctttggtatct 11099074  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11099075 ctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacac 11099173  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 342  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11099174 atctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaga 11099219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32246933 - 32246607
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246933 caaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 32246836  T
Q  101 ctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcc----tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgtt 192  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||      
T  32246835 ctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctttttttcttgcttatcttgtttatgctttgga 32246736  T
Q  193 agctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 290  Q
    | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32246735 atctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctcc 32246637  T
Q  291 acacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32246636 acacatcattggtttatttcattggtgtga 32246607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14291585 - 14291295
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14291585 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 14291486  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||   |||||||||    
T  14291485 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgttt 14291387  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14291386 gcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 14291295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 39811928 - 39812250
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811928 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 39812025  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||    
T  39812026 ctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatct 39812125  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39812126 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 39812224  T
Q  295 atcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||| || |||||||||||||||||||    
T  39812225 atctttggtttatttcattggtgtga 39812250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 9296401 - 9296691
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9296401 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 9296500  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||   |||||||||    
T  9296501 ggtgttttgttcttcctttcttgcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttt 9296599  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9296600 gcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 9296691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19344541 - 19344243
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  19344541 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattg 19344444  T
Q  124 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  19344443 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacat 19344346  T
Q  220 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtg 316  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19344345 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtg 19344246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19349399 - 19349101
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  19349399 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattg 19349302  T
Q  124 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  19349301 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacat 19349204  T
Q  220 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtg 316  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19349203 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtg 19349104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25398592 - 25398305
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  25398592 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 25398493  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  25398492 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 25398396  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25398395 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 25398305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25403730 - 25403443
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  25403730 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatcttttt 25403631  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  25403630 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 25403534  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25403533 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 25403443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3491847 - 3491716
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3491847 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 3491749  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3491748 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 3491716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738810
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 161  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctccccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttct 40738828  T
Q  162 tcctttcttgcttatctt 179  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40738827 tcctttctagcttatctt 40738810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21630030 - 21629944
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21630030 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 21629944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040060
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 8040060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13569415 - 13569331
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13569415 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 28259189 - 28259274
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259189 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20522308 - 20522220
Alignment:
Q  61 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20522308 ccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20522220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 10445454 - 10445541
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10445454 cttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 10445541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17865290 - 17865203
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17865290 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatctt 17865203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 34682344 - 34682431
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34682344 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 34682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34388945 - 34388859
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388945 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 14699018 - 14699104
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14699018 cttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14699104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25407719 - 25407663
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 107  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25407719 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccc 25407663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056044
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 33528631 - 33528718
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33528631 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 33528718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 10707262 - 10707348
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707262 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 142
Target Start/End: Original strand, 8390160 - 8390244
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 142  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8390160 cttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 42039684 - 42039766
Alignment:
Q  67 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039684 gtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940306
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 16940306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010971
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 17010971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39483018 - 39482931
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39483018 cttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39482931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 24024266 - 24024589
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024266 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacattttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 24024363  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgtttt-gttcttccttt-cttgcttatcttgtttatgcttgttagc 195  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024364 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgcttgttagc 24024463  T
Q  196 tctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||   ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024464 tctttgtgtggttttgctatatactagtcataggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 24024563  T
Q  294 catcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24024564 catcattgtttatttcattggtgtga 24024589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12397057 - 12396735
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12397057 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgtt 12396959  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  12396958 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccctttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 12396860  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12396859 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 12396760  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12396759 atcattgtttatttcattggtgtga 12396735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12406477 - 12406155
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  12406477 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctatt 12406379  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  12406378 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 12406280  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12406279 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 12406180  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12406179 atcattgtttatttcattggtgtga 12406155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 31109522 - 31109844
Alignment:
Q  1 tcaaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109522 tcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 31109619  T
Q  100 tctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttag 194  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |     
T  31109620 tctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttccttttcttgtttatcttgtttatgctttggaat 31109719  T
Q  195 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccac 292  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31109720 ctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctgcac 31109817  T
Q  293 acatcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31109818 acatcattgtttatttcattggtgtga 31109844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19992432 - 19992135
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19992432 tgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 19992335  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19992334 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta 19992235  T
Q  222 gtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |  |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19992234 gcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacctgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 19992135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 59 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4866819 - 4866553
Alignment:
Q  59 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866819 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt 4866720  T
Q  157 gttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgctttt-gttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttgga 251  Q
    |||||||||||    ||||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  4866719 gttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttgga 4866621  T
Q  252 aaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866620 gaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 4866553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 340
Target Start/End: Original strand, 20357521 - 20357837
Alignment:
Q  25 tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatatt 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  20357521 tcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatatt 20357620  T
Q  123 ggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  20357621 ggctgaactgggtcaacaatcttcttggtattttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacact 20357718  T
Q  221 agtctagggctggtt---ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgt 317  Q
    |||||||||||| ||   |||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  20357719 agtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgt 20357814  T
Q  318 gagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  20357815 gagtttcaaccggattcacaaca 20357837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2058062 - 2057763
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2058062 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 2057963  T
Q  149 ggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttg----tttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgt 239  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || |||||||||| | ||   ||||    
T  2057962 ggtgttttgttcttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgt 2057863  T
Q  240 tgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaac 339  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2057862 tgtttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaac 2057766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 319
Target Start/End: Original strand, 21812229 - 21812501
Alignment:
Q  53 tcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcg 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21812229 tcttggaaccttttgtaagactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcg 21812327  T
Q  150 gtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgc 246  Q
    |||||||||||||  | |||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| ||    
T  21812328 gtgttttgttcttttcttttaccgtttatcttgtttatgcttgttaactctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgttagc 21812427  T
Q  247 ttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21812428 ttggaagccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 21812501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 1533444 - 1533730
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1533444 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttatt 1533543  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 245  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | |||||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  1533544 ggtgtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgta-ttctctttgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttgttg 1533640  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1533641 cttggaaac--ttttttctcattgattaccactatattttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 1533730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Original strand, 24266162 - 24266466
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24266162 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 24266259  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  24266260 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 24266356  T
Q  215 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 309  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  24266357 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 24266456  T
Q  310 attggtgtga 319  Q
    ||||||||||    
T  24266457 attggtgtga 24266466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21646103 - 21645818
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21646103 ttcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 21646004  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||   |||| | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  |||    
T  21646003 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtttgt-tttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttg 21645908  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||| ||  ||  | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21645907 cttggagacactt--tactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 21645818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Original strand, 24261283 - 24261587
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24261283 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 24261380  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  24261381 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 24261477  T
Q  215 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 309  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  24261478 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 24261577  T
Q  310 attggtgtga 319  Q
    ||||||||||    
T  24261578 attggtgtga 24261587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21639905 - 21639770
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21639905 ttcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 21639806  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639805 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 21639770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16880197 - 16879894
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16880197 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 16880100  T
Q  120 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  16880099 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 16880003  T
Q  216 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 310  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  16880002 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 16879903  T
Q  311 ttggtgtga 319  Q
    |||||||||    
T  16879902 ttggtgtga 16879894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16885053 - 16884750
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16885053 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 16884956  T
Q  120 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  16884955 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 16884859  T
Q  216 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 310  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  16884858 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 16884759  T
Q  311 ttggtgtga 319  Q
    |||||||||    
T  16884758 ttggtgtga 16884750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18408860 - 18408726
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18408860 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 18408762  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 183  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18408761 ggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgttt 18408726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18413736 - 18413606
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcg 149  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18413736 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttg 18413638  T
Q  150 gtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 180  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18413637 gtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttg 18413606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29159890 - 29159803
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29159890 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 29159803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  63 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 46516320 - 46516407
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46516320 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 46516407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 49091748 - 49091661
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49091748 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatctt 49091661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  68 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 56034 - 55948
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  56034 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 55948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  63 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 44848696 - 44848781
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848696 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190105
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9190105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284089
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20284089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2479421 - 2479337
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479421 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctccccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 2647706 - 2647793
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2647706 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatctt 2647793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 33332460 - 33332547
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  33332460 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 33332547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2580474 - 2580390
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  2580474 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 2580390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960816
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatctt 35960816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2479221 - 2479148
Alignment:
Q  265 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaaca 340  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  2479221 cattgattaccact-tcctttgctccacacatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaaca 2479148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185262
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9185262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47263562 - 47263485
Alignment:
Q  265 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaacagaag 344  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  47263562 cattgattaccact-tcctttgctccacgcatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaacagaag 47263485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 22173134 - 22173456
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173134 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 22173232  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||| ||| ||| || ||    
T  22173233 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttattt-tgctttggtatct 22173331  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22173332 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 22173431  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22173432 atcattgtttatttcattggtgtga 22173456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7167391 - 7167049
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgc 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7167391 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 7167293  T
Q  100 tctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7167292 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatct 7167193  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7167192 ctttgtgtggttttgctctacactagtctagggct-gttttgttgttgttgcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactatctcttgctccacac 7167095  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 342  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7167094 atctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaga 7167049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Original strand, 28503814 - 28504145
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503814 caaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 28503913  T
Q  101 ctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctc 197  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||| |||||| |||    
T  28503914 ctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctt---------tcttgtttatgctttgttatctc 28504004  T
Q  198 tttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacaca 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  28504005 tttgtgtggttttgctatacactagtcaagggct-gttttgttgttgttgcttggaaaccattt-ttctcatagattatcactaccttttgctccacaca 28504102  T
Q  296 tcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  28504103 tcattgtt--attcattggtgtgagttaagaccggattcacaaca 28504145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 2671586 - 2671876
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2671586 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 2671685  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||| ||   |||||||||    
T  2671686 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgttt 2671784  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2671785 gcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 2671876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 8739063 - 8739354
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8739063 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 8739162  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggttttgttg---tt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| | ||||||||   ||    
T  8739163 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatt 8739261  T
Q  244 tgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8739262 tgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 8739354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 9091301 - 9091592
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9091301 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 9091400  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggttttgttg---tt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| | ||||||||   ||    
T  9091401 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatt 9091499  T
Q  244 tgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  9091500 tgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 9091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18656579 - 18656256
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656579 caaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 18656483  T
Q  101 ctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgt 191  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| |||||||   | ||||||||||  ||| ||||    
T  18656482 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgt 18656385  T
Q  192 tagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctc 289  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18656384 tagctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctc 18656285  T
Q  290 cacacatcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18656284 cacacatcattgtat-tttcattggtgtga 18656256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8477459 - 8477170
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8477459 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 8477360  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 245  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||  | | | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  8477359 ggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttatctttgtggtgttgttctacactagtctagggctggttttgttgttgttg 8477263  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttca-accggaatcacaacag 341  Q
    ||||| || | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  8477262 cttgggaaac-tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttataccggattcacaacag 8477170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 2677026 - 2677351
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 98  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2677026 caaagggtag-atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 2677122  T
Q  99 ctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgtt 192  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||| | | |||||||| |||||||||||    
T  2677123 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgtt 2677220  T
Q  193 agctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 290  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  2677221 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatctctatcacttgctcc 2677320  T
Q  291 acacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 319  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2677321 acacatcattggtttattctcattggtgtga 2677351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8512342 - 8512037
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8512342 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 8512245  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttg-cttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtt 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| | |  ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  8512244 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgcttgttaactcttagtgtggttgtgct 8512147  T
Q  214 atacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 309  Q
    | ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8512146 acacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctc 8512047  T
Q  310 attggtgtga 319  Q
    ||||||||||    
T  8512046 attggtgtga 8512037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8517222 - 8516917
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8517222 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 8517125  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttg-cttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtt 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| | |  ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  8517124 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgcttgttaactcttagtgtggttgtgct 8517027  T
Q  214 atacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 309  Q
    | ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8517026 acacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctc 8516927  T
Q  310 attggtgtga 319  Q
    ||||||||||    
T  8516926 attggtgtga 8516917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 2672870 - 2673195
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 98  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2672870 caaagggtag-atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 2672966  T
Q  99 ctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgtt 192  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||| | | |||||||| |||||||||||    
T  2672967 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgtt 2673064  T
Q  193 agctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 290  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  2673065 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttactctcatagattatctctatcacttgctcc 2673164  T
Q  291 acacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 319  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2673165 acacatcattggtttattctcattggtgtga 2673195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Original strand, 40372795 - 40372929
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40372795 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 40372894  T
Q  149 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40372895 ggtgttttgttcttcctatcttgcttatcttgttt 40372929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24968227 - 24967957
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||| ||||    
T  24968227 tgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattg 24968130  T
Q  124 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  24968129 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacat 24968033  T
Q  220 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  24968032 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32475608 - 32475306
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32475608 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 32475512  T
Q  120 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  32475511 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 32475415  T
Q  216 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 310  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  32475414 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 32475315  T
Q  311 ttggtgtga 319  Q
    |||||||||    
T  32475314 ttggtgtga 32475306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1306045 - 1305914
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1306045 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 1305947  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1305946 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 1305914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10207981 - 10207755
Alignment:
Q  99 ctctctcccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgctt-atcttgtttatgcttgttag 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  | |||| || || |||||||| |||||||||||    
T  10207981 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtt-atgcttgttag 10207884  T
Q  195 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccac 292  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  10207883 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 10207784  T
Q  293 acatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 319  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10207783 acatcattggtttattctcattggtgtga 10207755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32480466 - 32480163
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32480466 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 32480370  T
Q  120 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  32480369 attggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 32480273  T
Q  216 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg--tttatt-tc 309  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||    
T  32480272 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttggatttattctc 32480173  T
Q  310 attggtgtga 319  Q
    ||||||||||    
T  32480172 attggtgtga 32480163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 28501647 - 28501750
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501647 caaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 28501746  T
Q  101 ctct 104  Q
    ||||    
T  28501747 ctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Original strand, 26928591 - 26928721
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26928591 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 26928689  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 179  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  26928690 ggtgtgtttgttctttctttctagcttatctt 26928721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32143418 - 32143287
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttct 147  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| |    
T  32143418 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttt 32143319  T
Q  148 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 179  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32143318 -ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 32143287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Original strand, 40372986 - 40373085
Alignment:
Q  237 tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcac 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40372986 tgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcac 40373081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986567
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgtt 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgtt 27986547  T
Q  160 cttcctttcttgcttatctt 179  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  27986548 cattctttcttgcttatctt 27986567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27453055 - 27452924
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttct 147  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  27453055 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt-t 27452957  T
Q  148 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 179  Q
     ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27452956 tggtgtgtttgttccttctttcttgcttatctt 27452924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 8370488 - 8370573
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370488 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 27974954 - 27975039
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974954 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 18552883 - 18552970
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18552883 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 18552970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36029180 - 36029094
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgc--tctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36029180 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16264435 - 16264350
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16264435 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21711308 - 21711223
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21711308 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21711223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 142
Target Start/End: Original strand, 1736305 - 1736389
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1736305 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1309878 - 1309819
Alignment:
Q  121 ttggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1309878 ttggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 1309819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 3716002 - 3716089
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3716002 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 3716089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 30709790 - 30709877
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709790 cttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 40592782 - 40592869
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40592782 cttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 40592869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48438301 - 48438214
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  48438301 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatctt 48438214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 6794715 - 6794800
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  6794715 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatctt 6794800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40844738 - 40844652
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  40844738 cttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatctt 40844652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417577
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 1417577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25795868 - 25795781
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795868 ctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26299075 - 26298988
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26299075 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 26298988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 47923906 - 47923993
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47923906 cttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 47923993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328443
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggc-tgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatctt 3328443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466291
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 37466291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 24695164 - 24695251
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  24695164 cttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 24695251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 35001 - 35323
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35001 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 35099  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagct 196  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  35100 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 35198  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 294  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35199 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 35298  T
Q  295 atcattgtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35299 atcattgtttatttcattggtgtga 35323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 25445029 - 25445352
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445029 caaagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 25445125  T
Q  100 tctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttag 194  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||   | |||||||||||| |||||||||    
T  25445126 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttacgcttgttag 25445225  T
Q  195 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 293  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25445226 ctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcgcttgctccaca 25445325  T
Q  294 catcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25445326 catcattggtttatttcattggtgtga 25445352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39445618 - 39445322
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39445618 tgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 39445522  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctttcttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  39445521 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta 39445422  T
Q  222 gtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39445421 gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 39445322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 44023840 - 44024135
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44023840 tgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 44023936  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactag 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44023937 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttaccatttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactag 44024036  T
Q  223 tctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
      |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44024037 cttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcagttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 44024135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41398381 - 41398060
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398381 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 41398284  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctc 197  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||| || |||    
T  41398283 ctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctt-----cttatcttgtttatgctttggtatctc 41398189  T
Q  198 tttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggtt-----ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 290  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41398188 tttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccatatgttctcattgattatcactatcacttgctcc 41398090  T
Q  291 acacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41398089 acacataattggtttatttcattggtgtga 41398060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 1054978 - 1055274
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1054978 tgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattgg 1055074  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctttcttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1055075 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta 1055174  T
Q  222 gtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |  |||||||| || |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1055175 gcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagacatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 1055274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Original strand, 24787314 - 24787624
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787314 caaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 24787413  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 196  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  24787414 ctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatct 24787511  T
Q  197 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg-gttttgttgt-----ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 290  Q
    ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||  |||||||||     ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24787512 ctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgttgttgcttggaaaccattt-tgctcatttattaccactatctcttgctcc 24787610  T
Q  291 acacatcattgttt 304  Q
    ||||||| ||||||    
T  24787611 acacatctttgttt 24787624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41390726 - 41390488
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390726 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 41390629  T
Q  101 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctc 197  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||| || |||    
T  41390628 ctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatcttctcgatgttttgttcttcctt-----cttatcttgtttatgctttgatatctc 41390534  T
Q  198 tttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 243  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41390533 tttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggct-gttttgttgtt 41390488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 301
Target Start/End: Original strand, 43988424 - 43988709
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43988424 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 43988521  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 215  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||| |||| || || | |  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  43988522 cattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatgcttgttagctcttagtgtggttgtgctat 43988621  T
Q  216 acactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 301  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43988622 acattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 43988709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 24202769 - 24203054
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24202769 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 24202868  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  24202869 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttctct-tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgtttg 24202964  T
Q  246 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24202965 cttggagacactt--tacacatagattaccactcccttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 24203054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41386650 - 41386571
Alignment:
Q  241 gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41386650 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 41386571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Original strand, 19361432 - 19361564
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19361432 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-tt 19361530  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19361531 ggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19361564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Original strand, 19380072 - 19380204
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19380072 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-tt 19380170  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 180  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19380171 ggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19380204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Original strand, 19358843 - 19358975
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19358843 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-tt 19358941  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 180  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19358942 gatgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19358975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704033
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47704033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 26644909 - 26644994
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644909 tttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476261
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9476261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19073015 - 19072928
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073015 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19120905 - 19120818
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120905 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598398
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 13598398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 16124526 - 16124613
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16124526 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 16124613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 27104382 - 27104469
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  27104382 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 27104469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651811
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatctt 29651811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3281793 - 3281708
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281793 tttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37069855 - 37069770
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069855 tttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775672
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 775672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098921
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47098921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 13604635 - 13604720
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604635 tttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Original strand, 19359079 - 19359132
Alignment:
Q  284 ttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19359079 ttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 19359132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 21536581 - 21536666
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca-tattggctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||    
T  21536581 tttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatctt 21536666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 481 - 185
Alignment:
Q  28 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  481 tgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 385  T
Q  125 ctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctttcttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  384 ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta 285  T
Q  222 gtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  284 gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcaccatcacttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Original strand, 148916 - 149219
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  148916 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggcca 149013  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  149014 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgcta 149110  T
Q  215 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 310  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  149111 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 149210  T
Q  311 ttggtgtga 319  Q
    |||||||||    
T  149211 ttggtgtga 149219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2514
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2211 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggcca 2308  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2309 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgcta 2405  T
Q  215 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 310  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2406 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctccacacatcattgatttattctca 2505  T
Q  311 ttggtgtga 319  Q
    |||||||||    
T  2506 ttggtgtga 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 19104 - 19428
Alignment:
Q  2 caaagggtagcatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 98  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  19104 caaagggtag-atctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagctg 19200  T
Q  99 ctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgtt 192  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||    
T  19201 ctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgtt 19297  T
Q  193 agctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 290  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  19298 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 19397  T
Q  291 acacatcattg-tttatt-tcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19398 acacatcattgatttattctcattggtgtga 19428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Original strand, 14269 - 14573
Alignment:
Q  23 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14269 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 14366  T
Q  119 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  14367 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 14463  T
Q  215 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 309  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14464 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 14563  T
Q  310 attggtgtga 319  Q
    ||||||||||    
T  14564 attggtgtga 14573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 341
Target Start/End: Original strand, 300 - 528
Alignment:
Q  113 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttcttggtgttttgttctttctttctagcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggttttg 398  T
Q  212 ttatacactagtctagggctg-gttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttattt 308  Q
     |   ||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||    
T  399 ctcctcactagtttagggctgttttttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---ttt 495  T
Q  309 cattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacag 341  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  496 cattggtgtgagttttaaatggattcacaacag 528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 24045 - 24331
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24045 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 24144  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctgg-ttttgttgt--tt 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||   ||||   |||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  24145 ggtgtgtttgttcttcctttctttcttatcttgttt-tctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgtt 24240  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24241 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 24331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 340
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18238
Alignment:
Q  52 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17952 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 18051  T
Q  149 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctgg-ttttgttgt--tt 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  18052 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttctct-tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgtt 18147  T
Q  245 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 340  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18148 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtttgagttttaaccggattcacaaca 18238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 319
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182228
Alignment:
Q  79 catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | |     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  173 ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattg 269  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| |    
T  182080 ttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatag 182176  T
Q  270 attaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tcattggtgtga 319  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  182177 attacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtga 182228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Original strand, 34132 - 34211
Alignment:
Q  241 gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34132 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 34211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 8431 - 8516
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8431 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13171
Alignment:
Q  258 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 319  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacatatctttggtttatttcattggtgtga 13171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 85768 - 85684
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 144  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85768 tttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5683
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2492
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatctt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 133292 - 133377
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133292 tttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 43973 - 44058
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43973 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 36844 - 36929
Alignment:
Q  64 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36844 tttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 340
Target Start/End: Original strand, 44174 - 44247
Alignment:
Q  265 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaaca 340  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  44174 cattgattaccact-tcctttgctccacacatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaaca 44247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10816 - 10729
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  10816 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 10729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45253
Alignment:
Q  65 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 145  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17350 - 17266
Alignment:
Q  62 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  17350 cttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University