View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13669_high_2 (Length: 529)

Name: NF13669_high_2
Description: NF13669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13669_high_2
NF13669_high_2
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (2-513)||(27603798-27604310)
chr6 (2-513)||(27717593-27718105)
chr6 (2-513)||(28786814-28787326)
chr6 (2-513)||(27610214-27610726)
chr6 (2-513)||(28792935-28793447)
chr6 (2-513)||(28781677-28782189)
chr6 (2-505)||(27592123-27592627)
chr6 (2-505)||(27676722-27677226)
chr6 (2-507)||(26803022-26803528)
chr6 (2-505)||(27426714-27427218)
chr6 (2-513)||(27530395-27530907)
chr6 (2-503)||(27679526-27680028)
chr6 (2-513)||(31285135-31285647)
chr6 (2-451)||(27705560-27706010)
chr6 (85-502)||(26884730-26885147)
chr6 (2-505)||(26656541-26657045)
chr6 (2-505)||(26762512-26763016)
chr6 (85-505)||(27337197-27337617)
chr6 (85-505)||(27397937-27398357)
chr6 (2-512)||(26623847-26624358)
chr6 (2-512)||(26729824-26730335)
chr6 (2-505)||(26647055-26647559)
chr6 (2-505)||(26753023-26753527)
chr6 (85-505)||(26862240-26862660)
chr6 (2-505)||(27697688-27698192)
chr6 (85-502)||(26143528-26143945)
chr6 (85-502)||(25580382-25580799)
chr6 (85-502)||(25539203-25539620)
chr6 (85-502)||(26056582-26056999)
chr6 (85-502)||(25483719-25484136)
chr6 (85-502)||(26076552-26076969)
chr6 (85-512)||(25492414-25492841)
chr6 (150-511)||(27215177-27215538)
chr6 (87-278)||(26824481-26824672)
chr6 (184-502)||(25511651-25511969)
chr6 (185-278)||(28140295-28140388)
chr6 (127-254)||(29843340-29843467)
chr6 (193-276)||(26950511-26950594)
chr6 (186-239)||(26937790-26937843)
chr6 (193-277)||(28097773-28097857)
chr6 (180-254)||(29826741-29826815)
chr6 (205-276)||(25074647-25074718)
chr6 (205-276)||(26636426-26636497)
chr6 (205-276)||(26742392-26742463)
chr6 (178-241)||(26849465-26849528)
chr6 (392-507)||(28235532-28235647)
chr6 (392-507)||(28326445-28326560)
chr6 (392-507)||(28504081-28504196)
chr6 (178-275)||(26724321-26724418)
chr6 (184-241)||(26975710-26975767)
chr6 (193-254)||(28243563-28243624)
chr6 (392-437)||(28490726-28490771)
chr6 (392-437)||(29803136-29803181)
chr6 (140-220)||(29845851-29845931)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (2-513)||(3806-4318)
scaffold0277 (2-513)||(12769-13281)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (2-513)||(2633-3145)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (2-513)||(8063-8575)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (2-502)||(18698501-18699002)
chr4 (2-502)||(18678661-18679162)
chr4 (2-502)||(18730605-18731106)
chr4 (2-502)||(18723186-18723687)
chr4 (2-502)||(18654578-18655079)
chr4 (2-505)||(18074337-18074841)
chr4 (400-513)||(5090044-5090157)
chr4 (168-275)||(5090285-5090392)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (2-505)||(60145-60649)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (2-507)||(267440-267946)
chr1 (85-513)||(28163470-28163897)
chr1 (66-505)||(28126777-28127217)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (2-513)||(29272932-29273444)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (178-277)||(3280412-3280511)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (186-275)||(16691628-16691717)
chr5 (392-513)||(16691834-16691955)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (392-506)||(57395-57509)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (392-507)||(35694-35809)
scaffold0038 (193-254)||(43725-43786)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (140-220)||(2056-2136)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27604310 - 27603798
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27604310 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtc 27604211  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27604210 tcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacactt 27604111  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27604110 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctcc 27604011  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27604010 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagat 27603911  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27603910 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattaccact 27603811  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    |||||||||||||    
T  27603810 cgagacagacact 27603798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27718105 - 27717593
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27718105 gatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtc 27718006  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27718005 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacactt 27717906  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27717905 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttc 27717806  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  27717805 agaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggt 27717706  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  27717705 tcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccact 27717606  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  27717605 cgagacaaacact 27717593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Original strand, 28786814 - 28787326
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28786814 gatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtc 28786913  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28786914 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacactt 28787013  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28787014 ggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctcc 28787113  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28787114 aggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagac 28787213  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  28787214 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgact 28787313  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  28787314 cgagacaaacact 28787326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27610726 - 27610214
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27610726 gatatgaatacgagtttactggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtc 27610627  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27610626 tcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacactt 27610527  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27610526 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttc 27610427  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  27610426 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggt 27610327  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||    
T  27610326 tcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccact 27610227  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  27610226 cgagacaaacact 27610214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Original strand, 28792935 - 28793447
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28792935 gatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtc 28793034  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28793035 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacactt 28793134  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  28793135 ggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctcc 28793234  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28793235 aggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagat 28793334  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  28793335 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgact 28793434  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  28793435 cgagacaaacact 28793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Original strand, 28781677 - 28782189
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  28781677 gatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcacttacatgttgccaattaccctgttggattacagtc 28781776  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28781777 ccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtcaggatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacactt 28781876  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    | ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28781877 gtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctcc 28781976  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28781977 aggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagac 28782076  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28782077 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccact 28782176  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  28782177 cgagacaaacact 28782189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27592627 - 27592123
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27592627 gatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtc 27592528  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||    
T  27592527 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacactt 27592428  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  27592427 gcgaaagcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctcc 27592328  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| || | |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  27592327 agcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagat 27592228  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||| | |||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||| | |||||||| |||||     
T  27592227 tcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagatgctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacc 27592128  T
Q  501 cgaga 505  Q
    |||||    
T  27592127 cgaga 27592123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27677226 - 27676722
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27677226 gatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcaacaacccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtc 27677127  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||    
T  27677126 tcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacactt 27677027  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  27677026 gcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctcc 27676927  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| || | |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  27676926 agcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagat 27676827  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||| |||||||||| |||  ||  ||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||     
T  27676826 tcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggctttggctggaagactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacc 27676727  T
Q  501 cgaga 505  Q
    |||||    
T  27676726 cgaga 27676722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 507
Target Start/End: Original strand, 26803022 - 26803528
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  26803022 gatatgaatacaagttgattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtcagcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactc 26803121  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | | |||| |||||||||||| |||||    
T  26803122 tcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcactt 26803221  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  26803222 gcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctcc 26803321  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| |||| ||| ||||||||  |  | |  |||| ||||| |    |||| ||||||| ||| |   |||||||||||| |||  |  ||| |||||    
T  26803322 aagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagat 26803421  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26803422 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccact 26803521  T
Q  501 cgagaca 507  Q
    |||||||    
T  26803522 cgagaca 26803528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27427218 - 27426714
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27427218 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtc 27427119  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | | |||| |  |||||||||||||||    
T  27427118 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacactt 27427019  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |    
T  27427018 gcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttcc 27426919  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    |||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||    |||||||||||| ||  |  |||||||||    
T  27426918 aggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagat 27426819  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | |||||||| |||| |  ||||||||| || | ||||||| | |||||||| |||||     
T  27426818 tcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacc 27426719  T
Q  501 cgaga 505  Q
    |||||    
T  27426718 cgaga 27426714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27530907 - 27530395
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27530907 gatatgaatacgagtttattggaaagatagtcgaagacatttccaacaggattagtcgtgagcccttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtc 27530808  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
     ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  27530807 ccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacactt 27530708  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||| |    
T  27530707 gcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaatgtgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctcc 27530608  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| | ||||||||||||||| ||  | | || |||||||| |||||||||||| |||||||| |    || ||| |||||||   |  |||||||||    
T  27530607 aagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcagggaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagat 27530508  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||| |||| ||||| |||| || ||||||||| || | ||| ||  | ||||||||||| |||    
T  27530507 tcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggccttggctggaggacttgattggttcggtcctgggagtagagtcatcattactact 27530408  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||| ||| |||||    
T  27530407 cgaaacaaacact 27530395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 503
Target Start/End: Original strand, 27679526 - 27680028
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27679526 gatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtc 27679625  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||    
T  27679626 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacactt 27679725  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |  ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| |    
T  27679726 gcaagacaaatctataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctcc 27679825  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| |||||||||||||||||       | ||||||||||| |    |||||||||||||||| |    |||||||||||  |   |  |||||||||    
T  27679826 aagagaagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagat 27679925  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || |||||||| |||| || ||||||||| ||   ||||||| | |||||||||||||||    
T  27679926 tcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccact 27680025  T
Q  501 cga 503  Q
    |||    
T  27680026 cga 27680028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Original strand, 31285135 - 31285647
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    |||||||||| ||  |||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||     
T  31285135 gatatgaatatgattttattggagacatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtt 31285234  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |   | || || | || || |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||    
T  31285235 tcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacactt 31285334  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  31285335 gcaagagcaatctataattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctcc 31285434  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| |||||||||| |||||| ||  | | ||||||||||| |    |||||||||||||||| |    || |||||||||||   |  |||||||||    
T  31285435 aagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagat 31285534  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  31285535 tcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccact 31285634  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  31285635 cgagacaaacact 31285647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27706010 - 27705560
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27706010 gatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacatcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtc 27705911  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  27705910 tcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggaggcttgggtaaatcaacactt 27705811  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |    
T  27705810 gcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctcc 27705711  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| |||| ||| ||||||||  |  |    |||| ||||| |    |||| ||||||| ||| |    |||||||||||||||  |  |||||||||    
T  27705710 aagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgaggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagat 27705611  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  27705610 tcttttgattctcgatgatgttgacgataggaagcaactgcatgctttggc 27705560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 502
Target Start/End: Original strand, 26884730 - 26885147
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||| | |||| |||||||||| |   |||| | || || || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  26884730 ctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggctt 26884829  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   |||    
T  26884830 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataat 26884929  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |  | |||||||| |||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||| |    
T  26884930 aacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagac 26885029  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||| |    
T  26885030 tacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcag 26885129  T
Q  485 ggtcatcattaccactcg 502  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26885130 ggtcatcattaccactcg 26885147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Original strand, 26656541 - 26657045
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || ||||||  || ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||      ||||| |||||||| || | |||||||||  ||||    
T  26656541 gatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacatctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttggattagagtc 26656640  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26656641 tcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacactt 26656740  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |    
T  26656741 gccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatctcc 26656840  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||  | |  | |||||||| |||| |||||||||||||||| |    ||||||||||| ||   |  |||||||||    
T  26656841 aggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagat 26656940  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||| | |||||||||||||||    
T  26656941 tcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccact 26657040  T
Q  501 cgaga 505  Q
     ||||    
T  26657041 agaga 26657045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Original strand, 26762512 - 26763016
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || ||||||  || ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||      ||||| |||||||| || | |||||||||  ||||    
T  26762512 gatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacatctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttggattagagtc 26762611  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26762612 tcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacactt 26762711  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |    
T  26762712 gccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatctcc 26762811  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||  | |  | |||||||| |||| |||||||||||||||| |    ||||||||||| ||   |  |||||||||    
T  26762812 aggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagat 26762911  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||| | |||||||||||||||    
T  26762912 tcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccact 26763011  T
Q  501 cgaga 505  Q
     ||||    
T  26763012 agaga 26763016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27337617 - 27337197
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  27337617 ctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggtactagaggctt 27337518  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||   ||     
T  27337517 gggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattcagctcgtaaa 27337418  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||  ||| ||||  |||||||||| |    || ||||||||||    
T  27337417 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggc 27337318  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    |   |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||| |||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||| |    
T  27337317 tatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 27337218  T
Q  485 ggtcatcattaccactcgaga 505  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  27337217 agtcatcatcaccacccgaga 27337197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27398357 - 27397937
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  27398357 ctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggtactagaggctt 27398258  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||   ||     
T  27398257 gggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattcagctcgtaaa 27398158  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||  ||| ||||  |||||||||| |    || ||||||||||    
T  27398157 aacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggc 27398058  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    |   |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||| |||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||| |    
T  27398057 tatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 27397958  T
Q  485 ggtcatcattaccactcgaga 505  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  27397957 agtcatcatcaccacccgaga 27397937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 512
Target Start/End: Original strand, 26623847 - 26624358
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    |||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| || || | ||||||||| |||||    
T  26623847 gatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtc 26623946  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| | | |||| ||||| ||||||||||||    
T  26623947 tcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacactt 26624046  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  26624047 gcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctcc 26624146  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| |||||||||| ||||||  |  | | |||||||||||||    ||||||||||||||||||    || |||||||||||   |  |||||||||    
T  26624147 aagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagat 26624246  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||   ||||||  | |||||||| ||||  | ||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26624247 tcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccact 26624346  T
Q  501 cgagacagacac 512  Q
    ||| ||| ||||    
T  26624347 cgaaacaaacac 26624358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 512
Target Start/End: Original strand, 26729824 - 26730335
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    |||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| || || | ||||||||| |||||    
T  26729824 gatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtc 26729923  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| | | |||| ||||| ||||||||||||    
T  26729924 tcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacactt 26730023  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  26730024 gcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctcc 26730123  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| |||||||||| ||||||  |  | | |||||||||||||    ||||||||||||||||||    || |||||||||||   |  |||||||||    
T  26730124 aagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagat 26730223  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||   ||||||  | |||||||| ||||  | ||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26730224 tcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccact 26730323  T
Q  501 cgagacagacac 512  Q
    ||| ||| ||||    
T  26730324 cgaaacaaacac 26730335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Original strand, 26647055 - 26647559
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||      ||||| || ||||| || | |||||||||  ||||    
T  26647055 gatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttggattagagtc 26647154  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
     ||| || |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26647155 ccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaatcaacactt 26647254  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |    
T  26647255 gccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatctcc 26647354  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    || |||||||||||| ||||||| || || |  | |||||||| |||  | || ||||||||||| |    || |||||||||||   |  |||||||||    
T  26647355 agaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagat 26647454  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||| || ||| |||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||| | |||||||| |||||     
T  26647455 tcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacc 26647554  T
Q  501 cgaga 505  Q
    |||||    
T  26647555 cgaga 26647559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Original strand, 26753023 - 26753527
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||      ||||| || ||||| || | |||||||||  ||||    
T  26753023 gatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttggattagagtc 26753122  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
     ||| || |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26753123 ccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaatcaacactt 26753222  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |    
T  26753223 gccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatctcc 26753322  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    || |||||||||||| ||||||| || || |  | |||||||| |||  | || ||||||||||| |    || |||||||||||   |  |||||||||    
T  26753323 agaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagat 26753422  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||| || ||| |||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||| | |||||||| |||||     
T  26753423 tcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacc 26753522  T
Q  501 cgaga 505  Q
    |||||    
T  26753523 cgaga 26753527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 505
Target Start/End: Original strand, 26862240 - 26862660
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||     ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  26862240 ctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggtactggaggcat 26862339  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||||||| | || || |||||||||||| ||   |||    
T  26862340 ggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattcaactcataat 26862439  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaagg 383  Q
    |  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||     
T  26862440 agcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagtt-aaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttataaaggaaaga 26862538  T
Q  384 ctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagct 483  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||| |||| || || |||| || |||||||||||| | ||||||      
T  26862539 ctaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtttggtcatggaagta 26862638  T
Q  484 gggtcatcattaccactcgaga 505  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  26862639 gagtcatcattaccactcgaga 26862660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27698192 - 27697688
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  27698192 gatatgaatacaagtttattgaagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtc 27698093  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    || |||||||  |||||||||  |||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| | | |||| ||||| ||||||||||||    
T  27698092 tcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacactt 27697993  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||| |    
T  27697992 gcaagagcaatctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtgagaatgaattcagctaaaaataacttggaacatctcc 27697893  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| |||||||||| ||||||  |  |   |||||||| || |    ||||||||| |||||| |    || |||||||||||   |  |||||||||    
T  27697892 aagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagat 27697793  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  |||| || |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||     
T  27697792 tcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggctttggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacc 27697693  T
Q  501 cgaga 505  Q
    |||||    
T  27697692 cgaga 27697688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 502
Target Start/End: Original strand, 26143528 - 26143945
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||| || || ||||||||| |||||||||     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |    
T  26143528 ctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggaggcat 26143627  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||    
T  26143628 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataat 26143727  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaagg 383  Q
    ||  |||||||||| ||||| || |||||||||| |||| || || |||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||    || ||||||||     
T  26143728 aacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaga 26143826  T
Q  384 ctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagct 483  Q
    ||   |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||| || | |||||||     
T  26143827 ctatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagca 26143926  T
Q  484 gggtcatcattaccactcg 502  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26143927 gggtcatcattaccactcg 26143945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 502
Target Start/End: Original strand, 25580382 - 25580799
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||     | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  25580382 ctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggtactggaggcat 25580481  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||| ||||  |   |||    
T  25580482 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttcaattcttaat 25580581  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || ||||||||||| ||  |  | |||||||||| || | || || || |  ||||||| | || ||||||||||||||||||    || |||||||| |    
T  25580582 aacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagac 25580681  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    |   |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||| |    
T  25580682 tatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcag 25580781  T
Q  485 ggtcatcattaccactcg 502  Q
     |||||||||||||||||    
T  25580782 tgtcatcattaccactcg 25580799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 502
Target Start/End: Original strand, 25539203 - 25539620
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| ||||| | | || |||||||||||| |||||||||     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  25539203 ctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcat 25539302  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||     |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||    
T  25539303 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataat 25539402  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || ||||||||||| ||  || ||||||||| ||||| | || || ||||   |||||| | || |||||||||||||||  |    ||||||||||| |    
T  25539403 aacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataacaatcataaaggaaagac 25539502  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    |   |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||| |    
T  25539503 tatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcag 25539602  T
Q  485 ggtcatcattaccactcg 502  Q
     |||||||||||||||||    
T  25539603 agtcatcattaccactcg 25539620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 502
Target Start/End: Original strand, 26056582 - 26056999
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||     | |||||  |||  |||| |||||||||| ||| ||||||  ||||  |    
T  26056582 ctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggaggcat 26056681  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||   ||     
T  26056682 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaag 26056781  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| | || || ||||   | |||| | || |||||||||||||||  |   |||||||||||| |    
T  26056782 aacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagac 26056881  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    |   |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||| |    
T  26056882 tatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcag 26056981  T
Q  485 ggtcatcattaccactcg 502  Q
     |||||||||||||||||    
T  26056982 agtcatcattaccactcg 26056999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 502
Target Start/End: Original strand, 25483719 - 25484136
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |    
T  25483719 ctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggaggcat 25483818  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||    
T  25483819 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataat 25483918  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    ||  |||||||||| ||  ||  |||||||| ||||| | || || ||||   |||||| | || |||||||||||||||  |    ||||||||||| |    
T  25483919 aacctgaaacatctccaaaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcataaaggaaagac 25484018  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    |   |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||| |    
T  25484019 tatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcag 25484118  T
Q  485 ggtcatcattaccactcg 502  Q
     |||||||||||||||||    
T  25484119 agtcatcattaccactcg 25484136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 502
Target Start/End: Original strand, 26076552 - 26076969
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||     | |||||  |||  |||| |||||||||| ||| ||||||  ||||  |    
T  26076552 ctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggaggcat 26076651  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||   ||     
T  26076652 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaag 26076751  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| | || || ||||   | || | | || |||||||||||||||  |   |||||||||||| |    
T  26076752 aacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagac 26076851  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    |   |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||| |    
T  26076852 tatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcag 26076951  T
Q  485 ggtcatcattaccactcg 502  Q
     |||||||||||||||||    
T  26076952 agtcatcattaccactcg 26076969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25492841 - 25492414
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||   |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25492841 ctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggactttatggtactggaggctt 25492742  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||| | | ||||||||||||||||| || |||      
T  25492741 aggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgagagagaattcaactccaaga 25492642  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || |||||| |||| |||||  | |||||||  ||||   ||  | | || ||||||||  || ||||||||||||||||| |    |||||  || | |    
T  25492641 aacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaagaagtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaggac 25492542  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    |   |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||| |||||| | || || ||||||||| || | ||||||| |    
T  25492541 tatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagaggatttggctgaaggacttgattggttcggtcgtggaagcgg 25492442  T
Q  485 ggtcatcattaccactcgagacagacac 512  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||    
T  25492441 agttatcattaccactcgagacaaacac 25492414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 511
Target Start/End: Original strand, 27215177 - 27215538
Alignment:
Q  150 gtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgtt 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  27215177 gtccacatggtaggacttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatatt 27215276  T
Q  250 ttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggagg 349  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||  || ||||| | |||||  ||  | | ||   |||||| |||||    
T  27215277 ttctagaagatgtgaaagagaattcaactttaaataacttgaaacacctgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggagg 27215376  T
Q  350 tgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttg 449  Q
    |||||||||||| ||| |  | |||||  ||| |||   |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||| ||||||||    
T  27215377 tgttagtgaggggattacaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttg 27215476  T
Q  450 gcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccactcgagacagaca 511  Q
    || |||| || ||||||||||||   ||||||  | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  27215477 gctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcattacgactcgaaacagaca 27215538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 278
Target Start/End: Original strand, 26824481 - 26824672
Alignment:
Q  87 gttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgg 186  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| | |||| || |    
T  26824481 gttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggactttacggtattggaggtttag 26824580  T
Q  187 gtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagct 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||   |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26824581 gtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgagagagaattcagct 26824672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 502
Target Start/End: Original strand, 25511651 - 25511969
Alignment:
Q  184 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||   ||    
T  25511651 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaa 25511750  T
Q  284 taaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaagg 383  Q
     || ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| | || || ||||   | || | | || |||||||||||||||  |   ||||||||||||     
T  25511751 gaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaaga 25511850  T
Q  384 ctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagct 483  Q
    ||   |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||||| || | |||||||     
T  25511851 ctatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgactggttcggtcctggaagca 25511950  T
Q  484 gggtcatcattaccactcg 502  Q
    | |||||||||||||||||    
T  25511951 gagtcatcattaccactcg 25511969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 278
Target Start/End: Original strand, 28140295 - 28140388
Alignment:
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagct 278  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  28140295 gggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgagagaaatttcagct 28140388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29843467 - 29843340
Alignment:
Q  127 ttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgc 226  Q
    |||||| || || ||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||| | | | |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  29843467 ttgatgcaaaatttgatgatcgagtccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgc 29843368  T
Q  227 tgatcaatttgaatgctcatgttttctt 254  Q
    |||| |||||||||| |  |||||||||    
T  29843367 tgataaatttgaatgtttgtgttttctt 29843340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 26950511 - 26950594
Alignment:
Q  193 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 276  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  26950511 caacacttgctcaagcagtttataacttgattgctaatcaatttgaatgcaaatgttttcttcacaatgtgagagaaaattcag 26950594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937843
Alignment:
Q  186 ggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 239  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaa 26937843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28097857 - 28097773
Alignment:
Q  193 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagc 277  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28097857 caacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatgtgtctgtttccttcacaatgtgagagaaaattcagc 28097773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 254
Target Start/End: Original strand, 29826741 - 29826815
Alignment:
Q  180 ggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  29826741 ggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatatgattggtgataaatttgaatgcttgtgttttctt 29826815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Original strand, 25074647 - 25074718
Alignment:
Q  205 aagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 276  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  25074647 aagcaatttataatttgattgctaatcaatttgaatgtaagtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 25074718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Original strand, 26636426 - 26636497
Alignment:
Q  205 aagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 276  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  26636426 aagcaatttataatttgatttctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 26636497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Original strand, 26742392 - 26742463
Alignment:
Q  205 aagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcag 276  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  26742392 aagcaatttataatttgatttctaatcaatttgaatgtttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcag 26742463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 241
Target Start/End: Original strand, 26849465 - 26849528
Alignment:
Q  178 gaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 241  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26849465 gaggaatgggaaaaacaacacttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaatg 26849528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 28235532 - 28235647
Alignment:
Q  392 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatc 491  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  |  ||||| | |||| |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||    || |||    
T  28235532 aaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatc 28235631  T
Q  492 attaccactcgagaca 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  28235632 attaccactcgagaca 28235647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 28326445 - 28326560
Alignment:
Q  392 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatc 491  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| | |||| |||||| |||| || ||||||||| || | ||| ||  | || |||    
T  28326445 aaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatc 28326544  T
Q  492 attaccactcgagaca 507  Q
     |||||||||||||||    
T  28326545 gttaccactcgagaca 28326560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 28504081 - 28504196
Alignment:
Q  392 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatc 491  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| | |||| |||||| |||| || ||||||||| || | ||| ||  | || |||    
T  28504081 aaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatc 28504180  T
Q  492 attaccactcgagaca 507  Q
     |||||||||||||||    
T  28504181 gttaccactcgagaca 28504196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 275
Target Start/End: Original strand, 26724321 - 26724418
Alignment:
Q  178 gaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 275  Q
    |||||||||||||| | |||||| |   |||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | |  ||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  26724321 gaggattgggtaaaacgacacttactcgagcagtttatgatttgattgctgatcaatttgaagggttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 26724418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 26975710 - 26975767
Alignment:
Q  184 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 241  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26975710 tgggtaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatg 26975767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Original strand, 28243563 - 28243624
Alignment:
Q  193 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 254  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28243563 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttctt 28243624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28490771 - 28490726
Alignment:
Q  392 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaa 437  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  28490771 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaatttggagcaa 28490726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29803181 - 29803136
Alignment:
Q  392 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaa 437  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  29803181 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaatttggagcaa 29803136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29845931 - 29845851
Alignment:
Q  140 tgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattt 220  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||| | | | |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  29845931 tgatgatcgagtccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataattt 29845851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4318 - 3806
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4318 gatatgaatacaagtttattggagagatagtcaagaacatctccaacaagatcagtcatcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtc 4219  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4218 tcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacactt 4119  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4118 ggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctcc 4019  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4018 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 3919  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3918 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattaccact 3819  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  3818 cgagacaaacact 3806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13281 - 12769
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  13281 gatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtc 13182  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13181 tcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacactt 13082  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13081 ggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctcc 12982  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12981 aggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagac 12882  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12881 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccact 12782  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  12781 cgagacaaacact 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3145 - 2633
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||    
T  3145 gatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtc 3046  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3045 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacactt 2946  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2945 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 2846  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  2845 agttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggt 2746  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  2745 tcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccact 2646  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  2645 cgagacaaacact 2633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Original strand, 8063 - 8575
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  8063 gatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtc 8162  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8163 tcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacactt 8262  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8263 ggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctcc 8362  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  8363 aggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagac 8462  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8463 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccact 8562  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  8563 cgagacaaacact 8575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18699002 - 18698501
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18699002 gatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtc 18698903  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||    
T  18698902 tcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgttaggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacactt 18698803  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18698802 gcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctcc 18698703  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18698702 aggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagat 18698603  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||| |||| || ||||||||| |||  ||||||| | || ||||||||||||    
T  18698602 tcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccact 18698503  T
Q  501 cg 502  Q
    ||    
T  18698502 cg 18698501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 2 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18679162 - 18678661
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18679162 gatatgaatacaagtttattggagagatagtcaaatacgtctctaacaagatcagtcggcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtc 18679063  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||| |||||||    
T  18679062 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggtaggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacactt 18678963  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18678962 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctcc 18678863  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18678862 aggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagat 18678763  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||||||  || || |||| ||||| || |||||||| |||| || ||||||||| ||   ||||||| | || ||||||||||||    
T  18678762 tcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatgctttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccact 18678663  T
Q  501 cg 502  Q
    ||    
T  18678662 cg 18678661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 2 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18731106 - 18730605
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  18731106 gatatgaatacaagtttattgaaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtc 18731007  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||    
T  18731006 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacactt 18730907  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18730906 gctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctcc 18730807  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18730806 aggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagat 18730707  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||| |||| || ||||||||| |||  |||||||   || ||||||||||||    
T  18730706 tcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccact 18730607  T
Q  501 cg 502  Q
    ||    
T  18730606 cg 18730605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 2 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18723687 - 18723186
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  18723687 gatatgaatacaagtttattggaaagatagtcaaatatgtcaacaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtc 18723588  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||    
T  18723587 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacactt 18723488  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18723487 gcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctcc 18723388  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  18723387 aggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagat 18723288  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| || |||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||| | || ||||||||||||    
T  18723287 tcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcattaccact 18723188  T
Q  501 cg 502  Q
    ||    
T  18723187 cg 18723186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 2 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18655079 - 18654578
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  18655079 gatatgaatacaagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtc 18654980  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||    
T  18654979 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacactt 18654880  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  18654879 gcaaaatcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctcc 18654780  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18654779 aggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagat 18654680  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||| || |||||||| |||| || ||||||||| ||   ||||||| | || ||||||||||||    
T  18654679 tcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccact 18654580  T
Q  501 cg 502  Q
    ||    
T  18654579 cg 18654578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Original strand, 18074337 - 18074841
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18074337 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtc 18074436  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | | |||| |  |||||||||||||||    
T  18074437 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacactt 18074536  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |    
T  18074537 gcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttcc 18074636  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    |||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||    |||||||||||| ||  |  |||||||||    
T  18074637 aggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagat 18074736  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | |||||||| |||| |  ||||||||| || | ||||||| | |||||||| |||||     
T  18074737 tcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacc 18074836  T
Q  501 cgaga 505  Q
    |||||    
T  18074837 cgaga 18074841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5090157 - 5090044
Alignment:
Q  400 ttcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccac 499  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  || | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  5090157 ttcttttgattctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccggagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatcattaccac 5090058  T
Q  500 tcgagacagacact 513  Q
    |||||||| |||||    
T  5090057 tcgagacaaacact 5090044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5090392 - 5090285
Alignment:
Q  168 tatggtacttgaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagag 267  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    |||||||||   ||||||||||    
T  5090392 tatgggactggaggaatgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatgtctttgttttcttcccaatgtgagag 5090293  T
Q  268 agaattca 275  Q
    | ||||||    
T  5090292 aaaattca 5090285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 505
Target Start/End: Original strand, 60145 - 60649
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  60145 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtc 60244  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | | |||| |  |||||||||||||||    
T  60245 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacactt 60344  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |    
T  60345 gcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttcc 60444  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    |||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||    |||||||||||| ||  |  |||||||||    
T  60445 aggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagat 60544  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | |||||||| |||| |  ||||||||| || | ||||||| | |||||||| |||||     
T  60545 tcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacc 60644  T
Q  501 cgaga 505  Q
    |||||    
T  60645 cgaga 60649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 267946 - 267440
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||    
T  267946 gatatgaatacaagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtc 267847  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||    
T  267846 tcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaaccctt 267747  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| |    
T  267746 gcaagagcaatctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtgagagaaaattcagctataagtaacttgaaacatctcc 267647  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |  | | ||||||||||| |    |||||||||||| ||| |    || |||||||||||   |  |||||||||    
T  267646 aagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagat 267547  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| | || |||||||| |||| || ||||||||| |||  ||||||| | ||| || ||||||||    
T  267546 tcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgctttggctggaggacttgattggttcggctatggaagcagagtcgtcgttaccact 267447  T
Q  501 cgagaca 507  Q
    |||||||    
T  267446 cgagaca 267440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28163897 - 28163470
Alignment:
Q  85 ctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggatt 184  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  28163897 ctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatgatactggaggctt 28163798  T
Q  185 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||       
T  28163797 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatcc 28163698  T
Q  285 aaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggc 384  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||  |   || |||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||  ||||||    
T  28163697 aacttgaaacatctccaggaagagct-ctttttgaaacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggc 28163599  T
Q  385 tgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctg 484  Q
    | |||  ||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||  |||||||||| |||| ||  |||||||| || | ||||||| |    
T  28163598 tacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcag 28163499  T
Q  485 ggtcatcattaccactcgagacagacact 513  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28163498 ggtcatcattaccactcgagacaaacact 28163470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28127217 - 28126777
Alignment:
Q  66 cttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtagga 164  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||   | ||||||||||||||| | |||||| ||| |  ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  28127217 cttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtagga 28127118  T
Q  165 ctttatggtacttgaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 264  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||    
T  28127117 ctttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28127018  T
Q  265 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaat 364  Q
    |||||| |||| || || |||| ||||||||||| || ||  |||||||||| |||||| ||  | | || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28127017 gagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28126918  T
Q  365 ttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgat 464  Q
    | |    |||||  |||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||    
T  28126917 tgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgat 28126818  T
Q  465 tggtttggccttggaagctgggtcatcattaccactcgaga 505  Q
    ||||| || | |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  28126817 tggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgaga 28126777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 29273444 - 29272932
Alignment:
Q  2 gatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtaagcccttacaagttgccaattatc-tgttggattgcagtc 100  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||    
T  29273444 gatatgaatacaagtttatcggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtc 29273345  T
Q  101 tcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacactt 200  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| | | | || |||||||||||||| |||    
T  29273344 tcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatgggattggtggcttgggtaaatcaaccctt 29273245  T
Q  201 gcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttc 300  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  29273244 gcaagagcaatctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctcc 29273145  T
Q  301 aggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttgggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagat 400  Q
    | ||| | |||||||||||||||  |  | | ||||||||||| |    |||||||||||| ||| |   ||||||||| |||||   |  |||||| ||    
T  29273144 aagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaat 29273045  T
Q  401 tcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatcattaccact 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||   ||||||||||| |||    
T  29273044 tcttttgattctcgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactact 29272945  T
Q  501 cgagacagacact 513  Q
    ||||||| |||||    
T  29272944 cgagacaaacact 29272932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 277
Target Start/End: Original strand, 3280412 - 3280511
Alignment:
Q  178 gaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagc 277  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  3280412 gaggaatgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattcagc 3280511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 275
Target Start/End: Original strand, 16691628 - 16691717
Alignment:
Q  186 ggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 275  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  | |||||||| ||||||    
T  16691628 ggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcatgacgtgagagaaaattca 16691717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 513
Target Start/End: Original strand, 16691834 - 16691955
Alignment:
Q  392 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatc 491  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||| | || | | |||  ||||| || ||||||||||| | ||||||  | ||||||    
T  16691834 aaaaaaggttcttttgattctcgatgatgttgatgagcaaaagcaattgcaagttatggttggagagcccgattggtttggtcctggaagtagagtcatc 16691933  T
Q  492 attaccactcgagacagacact 513  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16691934 attaccactcgagacaaacact 16691955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 57509 - 57395
Alignment:
Q  392 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatc 491  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||| | ||| ||    || |||    
T  57509 aaagaaggttttgttgattctcgatgatgttcacgagctgaagcaattacaggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagtaaagtgatc 57410  T
Q  492 attaccactcgagac 506  Q
    |||||||||||||||    
T  57409 attaccactcgagac 57395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 35694 - 35809
Alignment:
Q  392 aaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagctgggtcatc 491  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  |  ||||| | |||| |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||    || |||    
T  35694 aaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatc 35793  T
Q  492 attaccactcgagaca 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  35794 attaccactcgagaca 35809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Original strand, 43725 - 43786
Alignment:
Q  193 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 254  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  43725 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttctt 43786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2136 - 2056
Alignment:
Q  140 tgatgatggagtccacatggtaggactttatggtacttgaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattt 220  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||| | | | |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  2136 tgatgatcgagtccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataattt 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University