View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13671_low_1 (Length: 459)

Name: NF13671_low_1
Description: NF13671
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13671_low_1
NF13671_low_1
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (9-443)||(22077720-22078154)
chr6 (34-443)||(20636356-20636765)
chr6 (34-443)||(22761510-22761919)
chr6 (83-443)||(27330537-27330897)
chr6 (83-443)||(27391277-27391637)
chr6 (34-443)||(18406999-18407406)
chr6 (34-443)||(25608916-25609325)
chr6 (46-443)||(23079286-23079683)
chr6 (47-443)||(16625785-16626181)
chr6 (47-443)||(25113369-25113765)
chr6 (47-443)||(29590988-29591384)
chr6 (47-443)||(2873871-2874267)
chr6 (50-443)||(1542155-1542548)
chr6 (47-443)||(24312236-24312632)
chr6 (41-444)||(22443083-22443486)
chr6 (47-443)||(28262265-28262661)
chr6 (47-443)||(28341014-28341410)
chr6 (41-444)||(22434685-22435088)
chr6 (34-443)||(16926695-16927104)
chr6 (34-443)||(16962500-16962909)
chr6 (47-443)||(19865504-19865900)
chr6 (47-443)||(27188253-27188649)
chr6 (47-443)||(27260591-27260987)
chr6 (41-443)||(5838281-5838683)
chr6 (131-443)||(18196877-18197189)
chr6 (34-443)||(15896911-15897320)
chr6 (47-443)||(19488340-19488736)
chr6 (47-443)||(18966363-18966756)
chr6 (47-313)||(27564889-27565155)
chr6 (50-443)||(21472418-21472811)
chr6 (41-443)||(18795507-18795909)
chr6 (41-443)||(15460153-15460555)
chr6 (34-443)||(19880115-19880524)
chr6 (50-356)||(21563203-21563509)
chr6 (50-356)||(21569062-21569368)
chr6 (288-428)||(28287982-28288122)
chr6 (35-443)||(34644642-34645050)
chr6 (98-443)||(25769008-25769353)
chr6 (50-443)||(10467920-10468313)
chr6 (50-443)||(19454237-19454630)
chr6 (362-443)||(27566363-27566444)
chr6 (50-168)||(18449602-18449720)
chr6 (34-162)||(16649024-16649152)
chr6 (34-162)||(16381428-16381556)
chr6 (34-162)||(18836963-18837091)
chr6 (317-443)||(19435819-19435945)
chr6 (34-108)||(23997400-23997474)
chr6 (50-435)||(8762004-8762389)
chr6 (303-435)||(24365237-24365369)
chr6 (50-443)||(14380538-14380931)
chr6 (34-108)||(18572805-18572879)
chr6 (41-162)||(1647876-1647997)
chr6 (50-159)||(5296277-5296386)
chr6 (50-442)||(14378988-14379380)
chr6 (286-435)||(18436434-18436583)
chr6 (34-162)||(21928303-21928431)
chr6 (34-162)||(35275141-35275269)
chr6 (34-105)||(14624412-14624483)
chr6 (34-108)||(14129621-14129695)
chr6 (34-108)||(16234180-16234254)
chr6 (34-107)||(23026771-23026844)
chr6 (34-162)||(19986477-19986605)
chr6 (62-108)||(16099202-16099248)
chr6 (34-107)||(18196788-18196861)
chr6 (315-443)||(28282149-28282277)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (34-443)||(50416-50825)
scaffold0081 (47-443)||(19586-19982)
scaffold0081 (47-443)||(35010-35406)
scaffold0081 (34-103)||(330-399)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (34-443)||(7004-7413)
scaffold0120 (34-443)||(13042-13451)
scaffold0120 (62-162)||(23441-23541)
scaffold0120 (50-443)||(481-873)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (34-443)||(23066975-23067383)
chr2 (34-443)||(23107180-23107589)
chr2 (47-443)||(21144504-21144900)
chr2 (47-443)||(27371853-27372249)
chr2 (50-443)||(10869434-10869827)
chr2 (47-443)||(16925944-16926340)
chr2 (47-443)||(16999584-16999980)
chr2 (47-443)||(24710618-24711014)
chr2 (47-443)||(16923473-16923869)
chr2 (47-443)||(16982736-16983132)
chr2 (47-443)||(17064301-17064697)
chr2 (47-443)||(41607848-41608244)
chr2 (47-443)||(44385032-44385428)
chr2 (47-443)||(21324729-21325125)
chr2 (47-443)||(24262954-24263350)
chr2 (47-443)||(27218600-27218996)
chr2 (47-443)||(24876212-24876608)
chr2 (131-443)||(21890265-21890577)
chr2 (47-443)||(24676073-24676469)
chr2 (47-443)||(22324319-22324715)
chr2 (101-443)||(22755982-22756324)
chr2 (183-443)||(9610720-9610980)
chr2 (57-443)||(24706955-24707341)
chr2 (183-443)||(17067959-17068218)
chr2 (47-435)||(23111327-23111716)
chr2 (237-443)||(24819339-24819545)
chr2 (50-356)||(23099484-23099790)
chr2 (50-443)||(27209638-27210031)
chr2 (50-435)||(30210384-30210768)
chr2 (41-162)||(12639690-12639811)
chr2 (50-443)||(23277360-23277753)
chr2 (50-168)||(45533204-45533322)
chr2 (34-162)||(22278970-22279098)
chr2 (50-443)||(1064335-1064728)
chr2 (50-327)||(30011650-30011925)
chr2 (303-443)||(20828843-20828983)
chr2 (303-443)||(20833569-20833709)
chr2 (303-435)||(31831250-31831382)
chr2 (225-443)||(27364720-27364938)
chr2 (34-107)||(22761019-22761092)
chr2 (34-162)||(24569118-24569246)
chr2 (34-108)||(24830638-24830712)
chr2 (342-443)||(19651810-19651911)
chr2 (374-435)||(45530103-45530164)
chr2 (65-160)||(20829126-20829221)
chr2 (50-153)||(31831532-31831635)
chr2 (50-120)||(12575260-12575330)
chr2 (59-160)||(19651525-19651626)
chr2 (375-435)||(11357665-11357725)
chr2 (399-443)||(12640048-12640092)
chr2 (315-443)||(27788325-27788453)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (35-443)||(6205-6613)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (34-443)||(25857-26266)
scaffold0243 (34-162)||(747-875)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (34-441)||(22361226-22361633)
chr1 (34-443)||(21749909-21750317)
chr1 (47-443)||(16373497-16373894)
chr1 (47-441)||(21831273-21831667)
chr1 (47-443)||(33390024-33390420)
chr1 (47-443)||(51332488-51332884)
chr1 (34-443)||(22109990-22110399)
chr1 (34-443)||(22113839-22114248)
chr1 (50-443)||(41352660-41353053)
chr1 (47-443)||(19107336-19107732)
chr1 (47-443)||(21837918-21838314)
chr1 (34-341)||(431098-431405)
chr1 (47-443)||(16349591-16349990)
chr1 (47-443)||(17044010-17044406)
chr1 (140-443)||(50619332-50619635)
chr1 (47-443)||(16077651-16078047)
chr1 (47-443)||(21025141-21025537)
chr1 (47-345)||(21234726-21235024)
chr1 (249-443)||(20250769-20250963)
chr1 (247-443)||(20139798-20139994)
chr1 (34-443)||(19759855-19760264)
chr1 (50-435)||(20855758-20856143)
chr1 (50-356)||(23197244-23197550)
chr1 (50-443)||(24098601-24098994)
chr1 (303-435)||(20295388-20295520)
chr1 (47-160)||(19662132-19662245)
chr1 (34-162)||(20830374-20830502)
chr1 (50-126)||(21744550-21744626)
chr1 (34-162)||(22134539-22134667)
chr1 (50-443)||(19855273-19855666)
chr1 (41-159)||(20060941-20061059)
chr1 (50-443)||(31538995-31539388)
chr1 (50-354)||(20834898-20835202)
chr1 (50-435)||(37678056-37678441)
chr1 (50-444)||(21951876-21952270)
chr1 (34-108)||(20914904-20914978)
chr1 (315-443)||(20939326-20939454)
chr1 (47-93)||(24793612-24793658)
chr1 (407-443)||(20835243-20835279)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (34-443)||(16639-17047)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (34-443)||(17490422-17490831)
chr3 (34-443)||(16491330-16491739)
chr3 (47-443)||(10006172-10006568)
chr3 (47-443)||(15588554-15588950)
chr3 (47-443)||(10906782-10907178)
chr3 (47-443)||(15401679-15402075)
chr3 (47-443)||(20061216-20061612)
chr3 (47-443)||(5424092-5424488)
chr3 (47-443)||(14580104-14580500)
chr3 (47-443)||(15339841-15340237)
chr3 (47-443)||(15724096-15724492)
chr3 (47-443)||(16636345-16636741)
chr3 (47-443)||(43163669-43164065)
chr3 (47-443)||(13253262-13253658)
chr3 (47-443)||(48426019-48426415)
chr3 (47-443)||(15347407-15347803)
chr3 (47-443)||(16411444-16411840)
chr3 (50-443)||(53384183-53384576)
chr3 (47-443)||(6601308-6601704)
chr3 (100-443)||(26791614-26791957)
chr3 (47-443)||(12498820-12499216)
chr3 (47-443)||(14875661-14876056)
chr3 (57-443)||(16755757-16756143)
chr3 (47-443)||(14125756-14126152)
chr3 (34-277)||(15260368-15260611)
chr3 (125-443)||(16371984-16372302)
chr3 (47-443)||(16692736-16693132)
chr3 (47-443)||(16806109-16806484)
chr3 (47-443)||(15228231-15228627)
chr3 (58-299)||(15062434-15062675)
chr3 (47-414)||(15234128-15234495)
chr3 (50-443)||(14574505-14574898)
chr3 (273-443)||(15209463-15209633)
chr3 (273-443)||(15248719-15248889)
chr3 (41-443)||(10419190-10419592)
chr3 (46-443)||(14087255-14087652)
chr3 (50-356)||(16827357-16827663)
chr3 (35-443)||(13971259-13971667)
chr3 (50-435)||(15014921-15015306)
chr3 (373-443)||(15062316-15062386)
chr3 (41-160)||(17187239-17187358)
chr3 (41-443)||(17493212-17493614)
chr3 (293-443)||(16329057-16329207)
chr3 (50-443)||(31694340-31694733)
chr3 (377-443)||(9523291-9523357)
chr3 (50-435)||(28754908-28755293)
chr3 (34-162)||(8273548-8273676)
chr3 (303-443)||(10384550-10384690)
chr3 (315-443)||(16337931-16338059)
chr3 (50-443)||(31939485-31939878)
chr3 (50-435)||(47124534-47124919)
chr3 (41-162)||(25767181-25767302)
chr3 (34-162)||(13966493-13966621)
chr3 (34-162)||(15610966-15611094)
chr3 (34-162)||(18750807-18750935)
chr3 (34-162)||(30138669-30138797)
chr3 (34-162)||(30148220-30148348)
chr3 (315-438)||(13299941-13300064)
chr3 (315-438)||(13310599-13310722)
chr3 (34-108)||(6152002-6152076)
chr3 (34-108)||(16741852-16741926)
chr3 (315-443)||(11960588-11960716)
chr3 (315-443)||(13319921-13320049)
chr3 (50-162)||(13942887-13942999)
chr3 (273-324)||(15216451-15216502)
chr3 (50-108)||(12359681-12359739)
chr3 (34-108)||(16258061-16258135)
chr3 (34-162)||(12793004-12793132)
chr3 (34-162)||(17193957-17194085)
chr3 (50-108)||(18133500-18133558)
chr3 (407-443)||(16380439-16380475)
chr3 (50-162)||(44778110-44778222)
chr3 (39-102)||(55514872-55514935)
chr3 (39-161)||(6711565-6711687)
chr3 (407-443)||(12360053-12360089)
chr3 (407-443)||(16836021-16836057)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (34-443)||(2249-2662)
scaffold0319 (34-192)||(1-159)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (34-443)||(112401-112810)
scaffold0040 (34-443)||(15861-16270)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (34-443)||(29929-30338)
scaffold0026 (50-443)||(29041-29434)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (34-443)||(21921089-21921498)
chr8 (34-443)||(21043464-21043873)
chr8 (34-443)||(21393218-21393627)
chr8 (34-443)||(21787712-21788121)
chr8 (34-443)||(23651060-23651469)
chr8 (34-437)||(21251969-21252372)
chr8 (47-443)||(18857596-18857992)
chr8 (47-443)||(22128324-22128720)
chr8 (47-443)||(17673389-17673785)
chr8 (47-443)||(19113709-19114105)
chr8 (47-443)||(21165904-21166300)
chr8 (47-443)||(22119540-22119936)
chr8 (50-443)||(19483433-19483826)
chr8 (47-443)||(30312510-30312906)
chr8 (47-443)||(19978986-19979382)
chr8 (48-443)||(32601163-32601558)
chr8 (51-443)||(15534402-15534794)
chr8 (57-443)||(22376830-22377216)
chr8 (57-443)||(22383005-22383391)
chr8 (47-443)||(22040878-22041274)
chr8 (47-443)||(22132407-22132803)
chr8 (140-443)||(22988215-22988518)
chr8 (125-443)||(16407489-16407807)
chr8 (34-443)||(22247786-22248179)
chr8 (34-443)||(20395485-20395894)
chr8 (34-411)||(23886075-23886452)
chr8 (47-285)||(20017629-20017867)
chr8 (50-443)||(20984916-20985309)
chr8 (47-443)||(19858466-19858862)
chr8 (47-443)||(19852430-19852826)
chr8 (63-435)||(20009302-20009674)
chr8 (47-443)||(20389118-20389514)
chr8 (50-443)||(21841436-21841829)
chr8 (51-443)||(23655946-23656338)
chr8 (50-443)||(22371959-22372343)
chr8 (50-443)||(1267257-1267650)
chr8 (341-443)||(23949938-23950040)
chr8 (50-435)||(14566169-14566554)
chr8 (34-162)||(16876448-16876576)
chr8 (293-435)||(12305785-12305927)
chr8 (303-443)||(16270846-16270986)
chr8 (62-162)||(20651714-20651814)
chr8 (34-162)||(22435603-22435731)
chr8 (34-108)||(21849690-21849764)
chr8 (342-443)||(31416135-31416236)
chr8 (303-443)||(803295-803435)
chr8 (34-162)||(21195855-21195983)
chr8 (50-153)||(6604967-6605070)
chr8 (50-153)||(6680420-6680523)
chr8 (50-114)||(22623405-22623469)
chr8 (315-443)||(29303060-29303188)
chr8 (62-108)||(23156393-23156439)
chr8 (366-435)||(6604685-6604754)
chr8 (366-435)||(6680138-6680207)
chr8 (72-160)||(803064-803152)
chr8 (50-153)||(22052172-22052275)
chr8 (374-435)||(22623557-22623618)
chr8 (407-443)||(22051882-22051918)
chr8 (399-443)||(22316210-22316254)
chr8 (50-162)||(31570211-31570323)
chr8 (315-443)||(31570476-31570604)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (34-443)||(7244-7653)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (34-443)||(7033-7442)
scaffold0358 (44-415)||(3532-3903)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (34-441)||(980-1387)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (46-443)||(31678-32075)
scaffold0180 (50-160)||(12456-12566)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (34-443)||(8000-8409)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (34-443)||(19254-19663)
scaffold0114 (347-435)||(45509-45597)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (47-443)||(26737832-26738228)
chr5 (34-443)||(21338389-21338798)
chr5 (47-443)||(22331992-22332388)
chr5 (47-443)||(29475178-29475574)
chr5 (47-443)||(16357387-16357783)
chr5 (47-443)||(22135553-22135949)
chr5 (47-443)||(27519292-27519687)
chr5 (47-443)||(27684505-27684901)
chr5 (47-443)||(34567379-34567775)
chr5 (47-443)||(40709665-40710061)
chr5 (47-443)||(27667595-27667991)
chr5 (47-443)||(14998844-14999240)
chr5 (47-443)||(19770845-19771241)
chr5 (47-443)||(27611239-27611635)
chr5 (47-443)||(41771727-41772123)
chr5 (47-443)||(23441095-23441491)
chr5 (47-443)||(37290601-37290997)
chr5 (86-443)||(23517411-23517768)
chr5 (47-443)||(23574622-23575010)
chr5 (47-434)||(23472123-23472509)
chr5 (125-443)||(20800333-20800651)
chr5 (47-443)||(21881834-21882230)
chr5 (34-281)||(25427480-25427727)
chr5 (34-443)||(20467190-20467598)
chr5 (47-443)||(21563078-21563474)
chr5 (59-443)||(21830878-21831262)
chr5 (50-443)||(20822320-20822713)
chr5 (248-443)||(18776655-18776850)
chr5 (275-443)||(25424074-25424241)
chr5 (47-270)||(18776854-18777077)
chr5 (34-443)||(21679870-21680279)
chr5 (50-435)||(22462827-22463211)
chr5 (50-443)||(24619403-24619796)
chr5 (50-443)||(24715634-24716027)
chr5 (50-443)||(24748662-24749055)
chr5 (341-443)||(22349308-22349410)
chr5 (41-435)||(28894041-28894435)
chr5 (41-435)||(28915512-28915906)
chr5 (41-435)||(28922867-28923261)
chr5 (50-168)||(21408298-21408416)
chr5 (41-435)||(20774634-20775028)
chr5 (50-435)||(20343157-20343542)
chr5 (50-435)||(24797505-24797890)
chr5 (115-443)||(21889932-21890260)
chr5 (41-165)||(28930780-28930904)
chr5 (50-443)||(17268442-17268835)
chr5 (315-435)||(23079462-23079582)
chr5 (34-162)||(24582358-24582486)
chr5 (50-423)||(22503566-22503939)
chr5 (34-172)||(27012222-27012360)
chr5 (50-435)||(25848950-25849335)
chr5 (34-162)||(21936280-21936408)
chr5 (276-443)||(21496940-21497107)
chr5 (50-435)||(14886099-14886484)
chr5 (303-443)||(37542742-37542882)
chr5 (50-105)||(21497147-21497202)
chr5 (50-120)||(21872158-21872228)
chr5 (50-120)||(21876438-21876508)
chr5 (399-443)||(21936645-21936689)
chr5 (56-108)||(22235034-22235086)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (34-443)||(320956-321365)
chr7 (34-443)||(11771160-11771569)
chr7 (34-443)||(14040637-14041046)
chr7 (34-443)||(14350667-14351076)
chr7 (47-443)||(8199570-8199966)
chr7 (47-443)||(8708547-8708943)
chr7 (47-443)||(44790283-44790679)
chr7 (47-443)||(11236145-11236541)
chr7 (47-443)||(12688443-12688838)
chr7 (47-443)||(14333338-14333734)
chr7 (47-443)||(18550690-18551086)
chr7 (34-423)||(14955516-14955905)
chr7 (47-443)||(10871937-10872333)
chr7 (47-443)||(18178684-18179080)
chr7 (48-443)||(23202546-23202941)
chr7 (48-443)||(23508673-23509068)
chr7 (47-443)||(9596999-9597395)
chr7 (47-443)||(13687006-13687402)
chr7 (47-438)||(16250-16641)
chr7 (47-443)||(11552034-11552430)
chr7 (47-443)||(15159989-15160385)
chr7 (47-443)||(14212616-14213012)
chr7 (34-443)||(15204561-15204970)
chr7 (34-279)||(15147804-15148049)
chr7 (47-443)||(15625494-15625892)
chr7 (47-444)||(12205710-12206107)
chr7 (47-443)||(19148154-19148550)
chr7 (47-443)||(20747553-20747949)
chr7 (274-443)||(15153816-15153985)
chr7 (50-443)||(11387341-11387734)
chr7 (56-441)||(16071214-16071598)
chr7 (34-443)||(19613618-19614027)
chr7 (50-354)||(14263157-14263461)
chr7 (50-435)||(15101516-15101901)
chr7 (50-443)||(12457583-12457976)
chr7 (39-162)||(13455970-13456093)
chr7 (315-443)||(16949650-16949778)
chr7 (50-435)||(11305176-11305561)
chr7 (333-443)||(13022300-13022410)
chr7 (34-162)||(7825123-7825251)
chr7 (303-435)||(13967834-13967966)
chr7 (34-162)||(27106693-27106821)
chr7 (34-162)||(27171504-27171632)
chr7 (50-435)||(49153252-49153637)
chr7 (50-147)||(15341670-15341767)
chr7 (50-162)||(23504783-23504895)
chr7 (303-435)||(26117771-26117903)
chr7 (342-435)||(12456653-12456746)
chr7 (315-443)||(585-713)
chr7 (39-159)||(4441154-4441274)
chr7 (407-443)||(14130816-14130852)
chr7 (407-443)||(14434634-14434670)
chr7 (407-443)||(15341374-15341410)
chr7 (39-162)||(13354372-13354495)
chr7 (50-153)||(14285289-14285392)
chr7 (50-177)||(18052866-18052993)
chr7 (34-108)||(14937624-14937698)
chr7 (34-108)||(15365217-15365291)
chr7 (366-435)||(8211357-8211426)
chr7 (47-108)||(21673466-21673527)
chr7 (399-443)||(4440870-4440914)
chr7 (399-443)||(13354092-13354136)
chr7 (315-435)||(14285554-14285674)
chr7 (34-162)||(17924874-17925002)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (34-443)||(14124-14533)
scaffold0324 (125-443)||(19006-19324)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (34-443)||(4855-5264)
scaffold0270 (34-443)||(11985-12394)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (47-443)||(40473993-40474389)
chr4 (47-443)||(12477553-12477949)
chr4 (47-443)||(19777456-19777852)
chr4 (47-443)||(23956700-23957096)
chr4 (47-443)||(8052286-8052682)
chr4 (47-443)||(14681520-14681916)
chr4 (47-443)||(29038067-29038463)
chr4 (47-443)||(8387365-8387761)
chr4 (47-443)||(12524629-12525025)
chr4 (47-443)||(18298158-18298554)
chr4 (47-443)||(27712289-27712685)
chr4 (47-443)||(15146548-15146944)
chr4 (47-443)||(14302641-14303037)
chr4 (47-443)||(14850029-14850425)
chr4 (34-443)||(14695066-14695475)
chr4 (47-443)||(18226109-18226505)
chr4 (47-443)||(16354108-16354504)
chr4 (47-443)||(14160423-14160819)
chr4 (47-409)||(18614487-18614849)
chr4 (47-443)||(8706871-8707269)
chr4 (252-443)||(7091385-7091576)
chr4 (47-443)||(15413949-15414345)
chr4 (50-435)||(15002290-15002675)
chr4 (50-435)||(27901347-27901732)
chr4 (323-443)||(1639364-1639484)
chr4 (120-443)||(15078588-15078911)
chr4 (54-435)||(15246885-15247266)
chr4 (50-153)||(15071602-15071705)
chr4 (50-443)||(15358046-15358439)
chr4 (47-210)||(15320322-15320485)
chr4 (50-435)||(3263720-3264105)
chr4 (50-435)||(11206157-11206542)
chr4 (342-443)||(33223876-33223977)
chr4 (62-443)||(1648215-1648596)
chr4 (50-443)||(16148664-16149057)
chr4 (50-443)||(16152810-16153203)
chr4 (50-435)||(29452463-29452848)
chr4 (50-435)||(44660792-44661177)
chr4 (34-162)||(15292068-15292196)
chr4 (34-108)||(14998604-14998678)
chr4 (375-443)||(20891935-20892003)
chr4 (41-162)||(9292069-9292190)
chr4 (62-108)||(13248933-13248979)
chr4 (34-162)||(12341775-12341903)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (34-443)||(1877-2286)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (34-443)||(7356-7765)
scaffold0403 (249-443)||(3775-3969)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (47-443)||(108737-109133)
scaffold0029 (34-443)||(113543-113952)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (47-441)||(7925-8319)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (69-443)||(680-1054)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (56-440)||(131094-131477)
scaffold0023 (46-443)||(3381-3779)
scaffold0023 (47-443)||(28294-28694)
scaffold0023 (50-435)||(59747-60130)
scaffold0023 (34-162)||(54854-54982)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (41-443)||(102217-102619)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (124-442)||(1661-1979)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (34-443)||(25446-25855)
scaffold0011 (50-443)||(149554-149946)
scaffold0011 (34-108)||(181243-181317)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (47-443)||(8381-8777)
scaffold0080 (128-443)||(49167-49482)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (47-443)||(9458-9854)
scaffold0028 (47-443)||(15920-16316)
scaffold0028 (50-443)||(44138-44528)
scaffold0028 (225-435)||(720-930)
scaffold0028 (34-443)||(49427-49836)
scaffold0028 (34-162)||(105486-105614)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (47-443)||(3178-3574)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (34-443)||(18128-18537)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (47-443)||(62957-63353)
scaffold0031 (50-160)||(108897-109007)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (34-356)||(2507-2829)
scaffold0621 (403-443)||(2451-2491)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (47-443)||(8350-8746)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (47-443)||(4279-4675)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (71-443)||(181183-181555)
scaffold0020 (56-160)||(100497-100601)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (50-443)||(66389-66782)
scaffold0042 (47-443)||(38746-39142)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (34-443)||(218330-218739)
scaffold0012 (270-443)||(230027-230200)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (47-443)||(5015-5411)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (47-443)||(6998-7394)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (47-443)||(9954-10349)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (47-443)||(79420-79816)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (47-443)||(57001-57397)
scaffold0017 (47-443)||(196404-196800)
scaffold0017 (47-443)||(18993-19389)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (47-443)||(277756-278152)
scaffold0005 (407-443)||(261292-261328)
scaffold0005 (50-147)||(261588-261685)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (47-443)||(32499-32895)
scaffold0109 (47-443)||(9580-9976)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (34-443)||(6804-7213)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (98-443)||(17665-18009)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (34-443)||(16890-17299)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (34-443)||(13452-13861)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (51-443)||(2898-3290)
scaffold0010 (50-435)||(41262-41647)
scaffold0010 (50-435)||(46328-46713)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (47-443)||(3331-3727)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (47-443)||(25958-26354)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (47-311)||(29497-29761)
scaffold0215 (389-434)||(29822-29867)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (34-443)||(13994-14401)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (183-443)||(2876-3136)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (34-356)||(15395-15717)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (47-443)||(115831-116227)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (188-443)||(1-256)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (47-350)||(24544-24847)
scaffold0198 (373-443)||(24482-24552)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (220-436)||(39002-39218)
scaffold0122 (34-161)||(38861-38988)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (47-441)||(39685-40079)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (34-253)||(39731-39950)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (34-228)||(7566-7760)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (47-443)||(24005-24394)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (47-443)||(202394-202790)
scaffold0004 (34-162)||(118491-118619)
scaffold0004 (315-443)||(323688-323816)
scaffold0004 (57-118)||(324013-324074)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (50-435)||(48096-48481)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (34-443)||(9929-10338)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (60-443)||(1-384)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (47-356)||(10508-10817)
scaffold0089 (50-443)||(15642-16035)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (47-443)||(1892-2288)
scaffold0647 (34-93)||(8572-8631)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (50-435)||(3168-3553)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (50-443)||(10777-11170)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (212-423)||(4144-4355)
scaffold0074 (58-178)||(4361-4481)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (237-393)||(18073-18229)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (47-287)||(1558-1798)
scaffold0044 (47-287)||(15298-15538)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (50-354)||(51-355)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (50-443)||(5414-5807)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (50-443)||(27508-27901)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (34-443)||(19833-20242)
scaffold0090 (34-443)||(23995-24404)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (47-443)||(9734-10130)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (50-443)||(47963-48356)
scaffold0053 (407-443)||(57133-57169)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (50-435)||(68362-68747)
scaffold0034 (197-443)||(12977-13223)
scaffold0034 (53-356)||(3885-4188)
scaffold0034 (56-108)||(12843-12895)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (47-299)||(177188-177440)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (237-443)||(11313-11519)
scaffold0018 (237-443)||(17505-17711)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (50-434)||(4769-5153)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (34-443)||(32590-32999)
scaffold0076 (50-443)||(55829-56222)
scaffold0076 (34-162)||(41523-41651)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (50-443)||(867-1260)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (50-435)||(5742-6127)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (50-435)||(89374-89759)
scaffold0001 (50-435)||(90052-90437)
scaffold0001 (410-443)||(390489-390522)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (47-270)||(39536-39759)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (47-349)||(6015-6319)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (50-443)||(853-1246)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (50-356)||(1783-2089)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (50-435)||(18341-18726)
scaffold0244 (34-162)||(25690-25818)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (58-443)||(910-1294)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (50-435)||(32403-32788)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (58-435)||(170-548)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (330-444)||(32-146)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (50-258)||(50804-51012)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (80-435)||(4551-4906)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (55-289)||(6264-6498)
scaffold0149 (55-289)||(10695-10929)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (41-443)||(2250-2652)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (350-443)||(3358-3451)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (50-246)||(15293-15489)
scaffold0266 (34-162)||(8774-8902)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (34-378)||(6598-6942)
scaffold0117 (34-162)||(337-465)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (50-435)||(2414-2799)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (47-336)||(40789-41078)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (366-443)||(1398-1475)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (47-443)||(10983-11379)
scaffold0298 (47-443)||(14753-15149)
scaffold0298 (238-443)||(20967-21172)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (50-435)||(43775-44160)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (371-443)||(22851-22923)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (56-354)||(3207-3505)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (56-354)||(30220-30518)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (50-435)||(20112-20497)
scaffold0058 (125-168)||(58218-58261)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (34-259)||(23098-23323)
scaffold0100 (377-443)||(24975-25041)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (50-443)||(3735-4126)
scaffold0035 (47-168)||(43033-43154)
scaffold0035 (78-168)||(38385-38475)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (54-435)||(620-1000)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (383-443)||(8774-8834)
scaffold0091 (34-162)||(45610-45738)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (58-423)||(95-451)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (50-354)||(74-378)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (34-172)||(8520-8658)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (47-356)||(13271-13580)
scaffold0124 (34-172)||(6721-6859)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (50-168)||(85448-85566)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (34-147)||(16477-16590)
scaffold0077 (34-162)||(27179-27307)
scaffold0077 (34-107)||(25795-25868)
scaffold0077 (315-441)||(20635-20761)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (34-162)||(2788-2916)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (34-162)||(727-855)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (34-162)||(24659-24787)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (34-162)||(14173-14301)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (200-435)||(28217-28452)
scaffold0156 (50-114)||(35426-35490)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (50-289)||(24805-25044)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (34-162)||(25091-25219)
scaffold0008 (62-108)||(133430-133476)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (50-300)||(27752-28001)
scaffold0067 (315-443)||(51374-51502)
scaffold0067 (315-443)||(60408-60536)
scaffold0067 (315-443)||(66796-66924)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (333-443)||(7357-7467)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (62-172)||(10549-10659)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (34-108)||(8491-8565)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (333-435)||(32531-32633)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (47-105)||(12918-12976)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (34-108)||(32326-32400)
scaffold0021 (62-162)||(72454-72554)
scaffold0021 (34-162)||(25227-25355)
scaffold0021 (34-108)||(15750-15824)
scaffold0021 (399-443)||(24946-24990)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (34-162)||(6439-6567)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (315-443)||(27245-27373)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (50-443)||(2284-2677)
scaffold0222 (56-443)||(8044-8431)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (34-107)||(19367-19440)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (50-159)||(42185-42294)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (50-218)||(1763-1931)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (276-435)||(14352-14511)
scaffold0261 (276-435)||(22531-22690)
scaffold0261 (65-138)||(14243-14316)
scaffold0261 (65-138)||(22422-22495)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (47-106)||(23999-24058)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (50-177)||(96414-96541)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (34-103)||(15390-15459)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (342-435)||(81053-81146)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (407-443)||(6197-6233)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (407-443)||(12072-12108)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (343-435)||(20386-20478)
scaffold0104 (343-435)||(23206-23298)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (342-434)||(27926-28018)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (315-435)||(249605-249725)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (34-100)||(1832-1898)
scaffold0876 (34-107)||(3864-3937)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (34-108)||(7803-7877)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (50-108)||(12052-12110)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (34-104)||(13727-13797)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (50-159)||(10386-10495)
scaffold0235 (50-159)||(20600-20709)
scaffold0235 (399-443)||(26790-26834)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (342-443)||(4673-4774)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (407-443)||(848-884)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (50-118)||(6167-6235)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (399-443)||(3222-3266)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (315-435)||(48400-48520)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 443
Target Start/End: Original strand, 22077720 - 22078154
Alignment:
Q  9 gaacaatatgcagaggaagctggtcttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077720 gaacaatatgcagaggaagctggtcttttgagttgagctatcatccgagtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 22077819  T
Q  109 cgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077820 cgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaag 22077919  T
Q  209 attgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgatt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22077920 attgatattgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactaaagatggtgatt 22078019  T
Q  309 ttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078020 ttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaag 22078119  T
Q  409 tagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078120 tagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 22078154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 20636356 - 20636765
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  20636356 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgctatgatggtaaaggagttcgag 20636455  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  20636456 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagta 20636555  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20636556 ttaaagaagcgcaaaaggttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 20636655  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20636656 gaggtttcgaggtaggatttttattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 20636755  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  20636756 acgaagatgt 20636765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 22761510 - 22761919
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  22761510 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaggagttcgag 22761609  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  22761610 ttgcttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgttatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaattcctgaagagta 22761709  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22761710 ttaaagaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgactttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 22761809  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22761810 gaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 22761909  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  22761910 acgaagatgt 22761919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 443
Target Start/End: Original strand, 27330537 - 27330897
Alignment:
Q  83 ttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctg 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  27330537 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttcaaagatttgagcctagtttgcgagatgtcatcta 27330636  T
Q  183 agagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 282  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330637 agagtttgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 27330736  T
Q  283 tagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaag 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27330737 tagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcaaaatagaatatgtattccagacgatgatgagatgaagaag 27330836  T
Q  383 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27330837 atgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgt 27330897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 443
Target Start/End: Original strand, 27391277 - 27391637
Alignment:
Q  83 ttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctg 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  27391277 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttcaaagatttgagcctagtttgcgagatgtcatcta 27391376  T
Q  183 agagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 282  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27391377 agagtttgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 27391476  T
Q  283 tagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaag 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27391477 tagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcaaaatagaatatgtattccagacgatgatgagatgaagaag 27391576  T
Q  383 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27391577 atgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgt 27391637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 18406999 - 18407406
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  18406999 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 18407098  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||    
T  18407099 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgagagtg--aagctaggaatgctgaagattgatagcgaatttctaaagagta 18407196  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18407197 ttaaagaggaacagaaagtcgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactggagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 18407296  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  18407297 gaggtttcgaggtaggatttgtattccagatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatctgggagct 18407396  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  18407397 acgaagatgt 18407406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 25608916 - 25609325
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |  |||||||||    
T  25608916 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagagagttcgag 25609015  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  25609016 ttgttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagattgtaaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgagaaata 25609115  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||    
T  25609116 ttaaagaagcatagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaagatcgatgaccaaggtgtatt 25609215  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25609216 gaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgaagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 25609315  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    || |||||||    
T  25609316 acaaagatgt 25609325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 46 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23079683 - 23079286
Alignment:
Q  46 ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacag 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||  | || || ||||||    
T  23079683 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttaattttctggaacag 23079584  T
Q  146 ttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23079583 tttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcatctcagagtgtgaggctaggaatgctgaaaattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaagcgc 23079484  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||    
T  23079483 ataaagttgatgttaggtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagg 23079384  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  23079383 gagaatttctattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgt 23079286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 16625785 - 16626181
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  16625785 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagt 16625884  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  16625885 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcaca 16625984  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16625985 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 16626084  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16626085 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16626181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25113765 - 25113369
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  25113765 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 25113666  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  25113665 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtaaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgagaagtatcaaggaagcaca 25113566  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  25113565 gaaagtcgatgtaaaatttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaattcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 25113466  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25113465 agaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 25113369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 29590988 - 29591384
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  29590988 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 29591087  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  29591088 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 29591187  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  29591188 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgagga 29591287  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29591288 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 29591384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 2873871 - 2874267
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  2873871 tatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 2873970  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||    
T  2873971 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtttctgaaaaatatcaaggaagcaca 2874070  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  2874071 gaaagttgatgtaaagtttgaggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 2874170  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2874171 agaatttgtatcccagacaatggagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 2874267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 1542155 - 1542548
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  1542155 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttta 1542254  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  1542255 gagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagttcctgaagagtatcaaggaagcacagaa 1542354  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  1542355 agttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtgaccagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtctgttgagattccgagagaga 1542454  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1542455 atttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 1542548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 24312236 - 24312632
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |  |||||||| |||||||||||||    
T  24312236 tatcatccaggtaaagctaatgttgtttcagattccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgattgttagagagttcgaattgcttgaacagt 24312335  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || || ||||||||    
T  24312336 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttttgaaaagcatcaaggaagcaca 24312435  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  24312436 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 24312535  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24312536 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 24312632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22443486 - 22443083
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||||||||    
T  22443486 ttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatagttagagagttcgagttgcttg 22443387  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22443386 aacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaaga 22443287  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||  | ||||| || ||| ||||||| ||     
T  22443286 agcacagatagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgacttcaaggtcgatgaccacggtgtgttgagattc 22443187  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
    ||||   ||||||||| ||  |  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22443186 cgagatcgaatttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaga 22443087  T
Q  441 tgtt 444  Q
    ||||    
T  22443086 tgtt 22443083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 28262265 - 28262661
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  28262265 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 28262364  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||   |||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  28262365 tcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcaca 28262464  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||     
T  28262465 gaaagttgatgtgaagttcgtggatttgttggttgctagagatcaggctcaaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgaggg 28262564  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262565 agaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 28262661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 28341014 - 28341410
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  28341014 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 28341113  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||   |||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  28341114 tcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcaca 28341213  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||     
T  28341214 gaaagttgatgtgaagttcgtggatttgttggttgctagagatcaggctcaaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgaggg 28341313  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341314 agaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 28341410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22435088 - 22434685
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||||||||    
T  22435088 ttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatagttagagagttcgagttgcttg 22434989  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22434988 aacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaaga 22434889  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||  | ||||| || ||| ||||||| ||     
T  22434888 agcacagagagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgacttcaaggtcgatgaccacggtgtgttgagattc 22434789  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
    ||||   ||||||||| ||  |  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22434788 cgagatcgaatttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaga 22434689  T
Q  441 tgtt 444  Q
    ||||    
T  22434688 tgtt 22434685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 16926695 - 16927104
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  16926695 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgag 16926794  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    || || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||   || | || ||| |||||| || || |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16926795 ttactggaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaacggttacctcagaatgtgaaactgggaatgcggaagattgatagtgaatttctgaagagta 16926894  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||| ||||    
T  16926895 ttaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgtt 16926994  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || |||||  | ||||| | ||  |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926995 gagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaggaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagct 16927094  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  16927095 acgaagatgt 16927104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 16962500 - 16962909
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  16962500 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgag 16962599  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    || || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||   || |  | |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16962600 ttactggaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaacggttacgtcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagta 16962699  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||  ||||    
T  16962700 ttaaaaaggcacataaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggcgtgtt 16962799  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || |||||  | ||||| | ||  |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16962800 gagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaggaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 16962899  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  16962900 acgaagatgt 16962909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19865900 - 19865504
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||    
T  19865900 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagttcgagctgcttgaacagt 19865801  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||   ||||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  19865800 ttagagatatgagcttagtttgtgactggtcatctcaaagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcaca 19865701  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| |||||||      
T  19865700 gaaagttgatgtcaagtttatagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagatttcgagtt 19865601  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19865600 cgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 19865504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27188649 - 27188253
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||| ||| | ||||||||||    
T  27188649 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttgaacagt 27188550  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  27188549 tccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcaca 27188450  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||  ||||||| || ||||||    
T  27188449 aagagttgatgtaaagtttgtggatttattggttgctagagatcaggctgaagacagcgattttagaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagga 27188350  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| | || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27188349 agaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgt 27188253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 27260591 - 27260987
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||| ||| | ||||||||||    
T  27260591 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttgaacagt 27260690  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  27260691 tccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcaca 27260790  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||  ||||||| || ||||||    
T  27260791 aagagttgatgtaaagtttgtggatttattggttgctagagatcaggctgaagacagcgattttagaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagga 27260890  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| | || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27260891 agaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgt 27260987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 41 - 443
Target Start/End: Original strand, 5838281 - 5838683
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||    
T  5838281 ttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttg 5838380  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||||| ||   |||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||    
T  5838381 agcagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcatagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattttctgaatagtatcaagga 5838480  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| || ||| |||| || ||     
T  5838481 agcacagaaagttgatgtcaagtttgtggatttgttagtcgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaggtcgatgaccatggtgtgttaagattc 5838580  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
    | |||   ||||||||  |  ||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5838581 caaggtcaaatttgtatccctgacaatgaagagatgaagaaaatgattctcgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 5838680  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  5838681 tgt 5838683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 131 - 443
Target Start/End: Original strand, 18196877 - 18197189
Alignment:
Q  131 gagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaa 229  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18196877 gagttacttgaacaggttagagatttgagtttagtttgcgaattgtcatctcagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtg-atttcttgaaa 18196975  T
Q  230 agtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggta 329  Q
    |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||| |||||  | ||||||||||||     
T  18196976 agtattattgaagcgcagaaagttgacgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcacactaaggatagtgactttaaggtcgatgatcaaggtg 18197075  T
Q  330 tgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18197076 tgttgagatttcgaggtagaatttgtattccagacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccggg 18197175  T
Q  430 agctacgaagatgt 443  Q
    |||||| |||||||    
T  18197176 agctaccaagatgt 18197189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15897320 - 15896911
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| || || || |||    
T  15897320 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgcgatgatgatcaaagaatttgag 15897221  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  15897220 ttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaattcttgaacagta 15897121  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  | |||| | | ||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||| ||  ||||    
T  15897120 ttaaagaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtagatttacttgttggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggttgatgatcagggagtgtt 15897021  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | || ||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  15897020 gcgattacgaggcagaattcgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttaaagagagtcacacaagtatcttgagtatccatccaggagct 15896921  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    || |||||||    
T  15896920 acaaagatgt 15896911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 19488340 - 19488736
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  19488340 tatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagt 19488439  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||  || | ||||||||| |||||||| |||||||    || |  ||  |||| |||||||||||||| ||    
T  19488440 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagagagttcttgaatagtattaaagaagcgca 19488539  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |  |||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  19488540 gaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttccaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggc 19488639  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| ||| ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19488640 agaattcgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 19488736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 18966363 - 18966756
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||   |||| |||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||   || ||||| ||| |||| |||||||    
T  18966363 tatcatctaggtaaagctaacgttgt---agatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggctaaagagttggagctgctcgaacagt 18966459  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||  |||||||||| |  ||  ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  18966460 ttagagacctgagtttagtctatgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctcaatagtattaaagaagcgca 18966559  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||  |||| ||||||||||| || ||  ||| | | ||||||||| ||||  |||| |||||  |||||||||| ||  ||||| | ||||||||     
T  18966560 gaaagtgaatgtaaagtttgtagatttatttattggtggaaatcagactaaagatagtgactttaaggttgatgatcagggagtgttgtgatttcgaggt 18966659  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18966660 agaatttgtattcctgacaatgatgagatgaggaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 18966756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 313
Target Start/End: Original strand, 27564889 - 27565155
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |   ||||||| || ||||||||||    
T  27564889 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagaaagttcgaattacttgaacagt 27564988  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| || ||||| ||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||    
T  27564989 ttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagggtattaaagaggcaca 27565088  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaa 313  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  27565089 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgactttaaa 27565155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21472811 - 21472418
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  21472811 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttccttgaacaattta 21472712  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||||||| || || || |||||||| || | |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| |||||||  ||||| || |    
T  21472711 gagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgaacagtattagggaagcgcaga 21472613  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    || ||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||  ||||||||||  ||||||     
T  21472612 aaattgatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggcgtgttgaggttcagaggaat 21472513  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | ||  ||   ||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21472512 aatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagcagcttaagtattcacccgggagctacaaagatgt 21472418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18795909 - 18795507
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||    
T  18795909 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttg 18795810  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    || |||| ||||| |||||| | ||||| ||  ||||| || |||||||| || | |||||| |||| ||  |||||| |||  |||| ||||| | |||    
T  18795809 aatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagaga 18795710  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||| || ||  || ||  |||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||     
T  18795709 agcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatgttttatagtaatcaatctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttc 18795610  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
     |||| |||||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||  | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18795609 agaggtagaatttgtattccggacaatgatgagttgaaaaagttgatcttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaga 18795510  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  18795509 tgt 18795507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15460555 - 15460153
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  15460555 ttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttg 15460456  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaag 239  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| || ||  |||||||  | |||||| |  | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||  |||||   ||    
T  15460455 aacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgagtagtatccgag 15460357  T
Q  240 aagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtt 339  Q
    |||||||   ||||||||| |||||||| || ||  |||||| |||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||| ||    
T  15460356 aagcacaacgagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagatt 15460257  T
Q  340 tcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaag 439  Q
    | |||| |||||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||     
T  15460256 tagaggcagaatttgtattcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccaggagctacgaaa 15460157  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  15460156 atgt 15460153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19880524 - 19880115
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||| || |||    
T  19880524 ttttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtagaaagacgttgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgag 19880425  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| ||  ||||| |  |||||||| || | || ||| |||| ||  ||| || |||  |||  ||||    
T  19880424 ttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgagtagta 19880325  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||||||  | |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  19880324 tcagagaagcacaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcagactgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgtt 19880225  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||  |||| |||||||||| ||   || | ||||||||||| | | ||||| | ||||| || || |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  19880224 gaggttcagaggcagaatttgtattcctaacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagccacaagagtagcttgagtatccatccgggagct 19880125  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  19880124 acgaagatgt 19880115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 356
Target Start/End: Original strand, 21563203 - 21563509
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  21563203 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttta 21563302  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||  ||||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||      
T  21563303 gagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtg-atttcttgaaaagtatcagagaagcgcaac 21563401  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||||  |||| |   ||||||| ||  ||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||    
T  21563402 aagttgatgtcaagtttgtggatatattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgagatttagaggcag 21563501  T
Q  349 aatttgta 356  Q
    ||||||||    
T  21563502 aatttgta 21563509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 356
Target Start/End: Original strand, 21569062 - 21569368
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  21569062 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttta 21569161  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||  ||||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||      
T  21569162 gagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtg-atttcttgaaaagtatcagagaagcgcaac 21569260  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||||  |||| |   ||||||| ||  ||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||    
T  21569261 aagttgatgtcaagtttgtggatgtattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgagatttagaggcag 21569360  T
Q  349 aatttgta 356  Q
    ||||||||    
T  21569361 aatttgta 21569368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 288 - 428
Target Start/End: Original strand, 28287982 - 28288122
Alignment:
Q  288 atcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgat 387  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||    
T  28287982 atcaggctgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgat 28288081  T
Q  388 tcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgg 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28288082 tcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgg 28288122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 443
Target Start/End: Original strand, 34644642 - 34645050
Alignment:
Q  35 tttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagt 134  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| | ||||| || ||||    
T  34644642 tttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagt 34644741  T
Q  135 tgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||| |  |||||||| || | |||||| |||| ||  |||||| |||  || | |||||    
T  34644742 tgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtat 34644841  T
Q  235 taaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttg 334  Q
    || |||||| ||   ||| || || |||||||| || ||  || ||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| || ||| |||||    
T  34644842 tagagaagcgcaactagtggacgtcaagtttgtggatttaatgattgatagcaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgttg 34644941  T
Q  335 aggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaaga-tgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    || ||  |||| |||||||| | ||  ||  | ||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  34644942 agattcagaggcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaa-aagattgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagct 34645040  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  34645041 acgaagatgt 34645050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25769353 - 25769008
Alignment:
Q  98 ttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctag 197  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| |  |||| ||| | ||| || |||||||| ||   |    
T  25769353 ttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtagg 25769254  T
Q  198 gtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaa-agtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactg 296  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||| ||| | ||| |  ||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| | ||    
T  25769253 gtatgttgaagatcaatagtg-atttcttaaacaatatcagggaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaaatg 25769155  T
Q  297 aagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaaga 396  Q
    |||| ||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||   ||||||| |||| ||| ||||| | |||||    
T  25769154 aagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaaga 25769055  T
Q  397 gagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25769054 aagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 25769008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 10467920 - 10468313
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| || || || ||||||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| || || || |    
T  10467920 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaattta 10468019  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||  ||||| || ||||| |  || | || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||   |||||||||      
T  10468020 gagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacagc 10468118  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||  |||||||  ||||| |||| || ||  |||| || ||| |||||||||| ||| | ||||||||  |||||||    
T  10468119 aagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgagacagaggatagtgacttcaaagttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaag 10468218  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10468219 agtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgt 10468313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19454630 - 19454237
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| | || || || || ||||| || || || |    
T  19454630 catccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaattta 19454531  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||||||||| | || || ||  || || || |||||||| || | || |||||||||||| | |||| |||||| ||| | ||| | |||||||||      
T  19454530 gagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggggatgctgaagattaacagtg-atttcttgaataatatcagagaagcacaac 19454432  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||   ||||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  19454431 aagtggatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 19454332  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||  ||||| | || || ||||| |  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19454331 aatttgtattcctgatgatgacgagttgaaaaaattgattttcgaggaaagtcacaagagtaacttaagtattcatccgggagctacgaaaatgt 19454237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 27566363 - 27566444
Alignment:
Q  362 gacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27566363 gacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 27566444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18449720 - 18449602
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  18449720 catccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagttgcttgcacagttca 18449621  T
Q  150 gagatttgagtttagtttg 168  Q
     ||| |||||||| |||||    
T  18449620 aagacttgagtttggtttg 18449602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 16649024 - 16649152
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  16649024 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 16649123  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  16649124 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 16649152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 16381428 - 16381556
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  16381428 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 16381527  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  16381528 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 16381556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 18836963 - 18837091
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  18836963 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 18837062  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  18837063 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 18837091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19435945 - 19435819
Alignment:
Q  317 gatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 416  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||| | ||||| |  ||||||||||    
T  19435945 gatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaataaagtcacaagagtagcttga 19435846  T
Q  417 gtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19435845 gtattcatccgggagctacaaagatgt 19435819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23997474 - 23997400
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23997474 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 23997400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 8762004 - 8762389
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |    
T  8762004 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagttta 8762103  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    |||| |||||  | || || ||  || || || |||||||  || | || |||||||| ||| ||||||  || ||||| |||||   |||| | ||  |    
T  8762104 gagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaaccgcagca 8762203  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||  |||||||  ||||| | || || ||  |||| || ||  |||||||||| ||| | ||||| ||  |||| |||    
T  8762204 agtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtaga 8762303  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762304 atttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaataaagtcacaaaagtagcttgagtattcacccgggagctac 8762389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24365369 - 24365237
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||| ||| |||||| ||  ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24365369 gtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 24365270  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24365269 caatagtaggttgagtattcacccgggggctac 24365237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 14380538 - 14380931
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||| ||  |||||||||| ||  ||||| | || || ||||| ||||| ||  ||||||    
T  14380538 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttca 14380637  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||||||||| | || || ||  || || || |||||||  |  | || ||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||| ||      
T  14380638 gagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggggatgctaaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcgcagc 14380736  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | |||||| |||||   ||||| ||  |||| || |   | |||||||| ||| | ||||||||  |||||||    
T  14380737 aagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatggcactgaggaaagtgacttcatggtggatgatcagggtgtattgaggttcagaggaag 14380836  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| | ||| | || || ||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  14380837 aatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtgttcatccgggagctacaaagatgt 14380931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18572879 - 18572805
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18572879 tttttagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagaccttgcatatgtc 18572805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Original strand, 1647876 - 1647997
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||| | || ||||| || ||| |||    
T  1647876 ttgagttatcatccaggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatgtgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattg 1647975  T
Q  141 aacagttcagagatttgagttt 162  Q
    | |||||  |||| ||||||||    
T  1647976 agcagtttcgagacttgagttt 1647997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Original strand, 5296277 - 5296386
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| || ||||| |    
T  5296277 catccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagttta 5296376  T
Q  150 gagatttgag 159  Q
    |||| |||||    
T  5296377 gagacttgag 5296386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 14378988 - 14379380
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||| ||  |||||||||| ||  ||||| | || || ||||| ||||| ||  ||||||    
T  14378988 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttca 14379087  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||||||||| | || || ||  || || || |||||||  |  | || ||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||| ||      
T  14379088 gagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggggatgctaaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcgcagc 14379186  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | |||||| |||||   ||||| ||  |||| || |   | |||||||| ||| | ||||||||  |||||||    
T  14379187 aagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatggcactgaggaaagtgacttcatggtggatgatcagggtgtattgaggttcagaggaag 14379286  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatg 442  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| | ||| | || || ||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  14379287 aatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtgttcatccgggagctacaaagatg 14379380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18436583 - 18436434
Alignment:
Q  286 taatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatg 385  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    |||||||||| ||  || |||   || || || ||| ||    
T  18436583 taatcagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatcaaaaagttg 18436484  T
Q  386 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  18436483 attctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggacctac 18436434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21928431 - 21928303
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  21928431 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggcaaatgttgttgccgacgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgaa 21928332  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  21928331 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 21928303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 35275141 - 35275269
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||| | ||| | || ||||| ||     
T  35275141 ttttaagttgagttatcatcctaggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcttatgtttgctttgatggttaaagagttggaa 35275240  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  35275241 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 35275269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 105
Target Start/End: Original strand, 14624412 - 14624483
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatat 105  Q
    |||| ||||||| |||||||| |  || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14624412 ttttcagttgagttatcatcccgaaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatat 14624483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14129695 - 14129621
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14129695 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgtgtagaaagactttgcatatgtc 14129621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16234254 - 16234180
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16234254 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgtggatgctttgtgtagaaagactttgcatatgtc 16234180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Original strand, 23026771 - 23026844
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgt 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  23026771 ttttcagttgagttattatcccgggaaagctaatgttgttgttgatgctttgagtataaagactttgcatatgt 23026844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 19986477 - 19986605
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||     
T  19986477 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgtagttaccgatgctttgaatagaaagactttgcatatgtctgctttgatgattaaagagttggaa 19986576  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| | |||  |||| ||||||||    
T  19986577 ttgattgagccgttttgagacttgagttt 19986605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16099248 - 16099202
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16099248 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 16099202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Original strand, 18196788 - 18196861
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgt 107  Q
    ||||| |||||  |||||| | ||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  18196788 ttttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 28282149 - 28282277
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||||| ||  ||  |||| || ||||| ||| | || || || || |||||||  ||||||||    
T  28282149 ttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagctt 28282248  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||    
T  28282249 aagcattcatccgggagctacgaagatgt 28282277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 50825 - 50416
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50825 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggtaaaggagttcgag 50726  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50725 ttgcttgaacagttcaaagatttgagcttagtttgtgagatgtcatctaagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaagagta 50626  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  50625 ttaaagaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttactagtaatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtatt 50526  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50525 gaggtttcgaggtagaatttgtattccagaagatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 50426  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  50425 acgaagatgt 50416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19982 - 19586
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  19982 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagt 19883  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  || | || ||| |||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19882 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcaca 19783  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  19782 gaaagttgatgttaagtttgtagacttgtcggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 19683  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19682 cgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgt 19586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35406 - 35010
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  35406 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagt 35307  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  || | || ||| |||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35306 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcaca 35207  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  35206 gaaagttgatgttaagtttgtagacttgtcggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 35107  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35106 cgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgt 35010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 399 - 330
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcat 103  Q
    |||| ||||||  |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  399 ttttcagttgatttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcat 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7413 - 7004
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  7413 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaatgagttcgag 7314  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  7313 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagta 7214  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  7213 ttaaagaagcacagaaagtcgatgttaagtttgttgacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaagctgtgtt 7114  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
     |||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7113 aaggtttagaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccaggagct 7014  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  7013 acgaagatgt 7004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13451 - 13042
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||    
T  13451 ttttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggtaaaggagttcgag 13352  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13351 ttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagta 13252  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  13251 ttaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgtt 13152  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| |||||||| || ||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13151 gagatttcgaggtaggatttgtattccagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcaccctggagct 13052  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  13051 acgaagatgt 13042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23541 - 23441
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtt 161  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  23541 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggagttgattgagcagtttcgagatttgagtt 23442  T
Q  162 t 162  Q
    |    
T  23441 t 23441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 481 - 873
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | || || || || ||| | || ||||| |    
T  481 catccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagttta 580  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | || || ||  || || || |||||||  || | || |||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||    ||||||||      
T  581 gagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtg-atttcttgaatagtatccgggaagcacaac 679  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| ||| | || || ||| |||||||| |||||   ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  680 aagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtattgaggttcagaggaag 779  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||  |||| ||| |||| ||| ||||| | || || ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  780 aatttgtattcctgataatga-gagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgt 873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23067383 - 23066975
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23067383 ttttgagttga-ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 23067285  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || ||||    
T  23067284 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatttgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataacgaatttctaaagagta 23067185  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23067184 ttaaagaagcacggaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggtttctagtgatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 23067085  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23067084 gcggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 23066985  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  23066984 acgaagatgt 23066975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 23107180 - 23107589
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  23107180 ttttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgag 23107279  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23107280 ttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatccgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagta 23107379  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23107380 ttaaagaggcacataaagctgatgtaatgtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacaatgattttaaaattgatgatcaaggtgtgct 23107479  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  23107480 gaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcctgaagagagccatagaagtaacttgagtattaatccgggagct 23107579  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  23107580 acgaagatgt 23107589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 21144504 - 21144900
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  21144504 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 21144603  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21144604 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagcgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 21144703  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||     
T  21144704 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttattggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggg 21144803  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21144804 agaatttgtattccagacaatgaggagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 21144900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27372249 - 27371853
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  27372249 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagt 27372150  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  27372149 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcaca 27372050  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  27372049 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 27371950  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27371949 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 27371853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10869827 - 10869434
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||| |    
T  10869827 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagttta 10869728  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  10869727 gagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagagtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaa 10869628  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10869627 agttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaga 10869528  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10869527 atttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 10869434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16926340 - 16925944
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  16926340 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 16926241  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  16926240 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 16926141  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16926140 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 16926041  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16926040 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16925944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16999980 - 16999584
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  16999980 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 16999881  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  16999880 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 16999781  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16999780 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 16999681  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16999680 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16999584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24711014 - 24710618
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  24711014 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 24710915  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  24710914 ttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 24710815  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  24710814 aaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 24710715  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24710714 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 24710618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16923869 - 16923473
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  16923869 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 16923770  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  16923769 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 16923670  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16923669 ggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 16923570  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16923569 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16923473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16983132 - 16982736
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  16983132 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 16983033  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  16983032 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 16982933  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16982932 ggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 16982833  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16982832 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16982736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17064697 - 17064301
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  17064697 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 17064598  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  17064597 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 17064498  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  17064497 ggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 17064398  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17064397 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 17064301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 41607848 - 41608244
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  41607848 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 41607947  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  41607948 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgca 41608047  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  41608048 gaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 41608147  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41608148 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 41608244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 44385032 - 44385428
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  44385032 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 44385131  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  44385132 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctaaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcaca 44385231  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||    
T  44385232 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaaattccgagga 44385331  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44385332 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 44385428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 21324729 - 21325125
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  21324729 tatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 21324828  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21324829 ttagagatatgagtttggtttgcgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaggcaca 21324928  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  21324929 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttgattgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 21325028  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325029 cgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 21325125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24263350 - 24262954
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |  |||||||| |||||||||||||    
T  24263350 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgaccagagagttcgaattgcttgaacagt 24263251  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  24263250 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 24263151  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  24263150 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 24263051  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24263050 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 24262954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27218996 - 27218600
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| ||||||||| |||    
T  27218996 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaatagt 27218897  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  27218896 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 27218797  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  27218796 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 27218697  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27218696 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 27218600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 24876212 - 24876608
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  24876212 tatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattacttgaacagt 24876311  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatg-tcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  24876312 tcagagatatgagtttggtttgcga-atgatcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcac 24876410  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||    
T  24876411 agaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcggaccgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagg 24876510  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24876511 aagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 24876608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 131 - 443
Target Start/End: Original strand, 21890265 - 21890577
Alignment:
Q  131 gagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  21890265 gagttgcttgaacagttcagagatttgagtctagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaga 21890364  T
Q  231 gtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtat 330  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21890365 gtattaaagaggcgcaaaaagttgatgttaagtttatggacttgttggttgctagtaatcagactgaaggaggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgt 21890464  T
Q  331 gttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccggga 430  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  21890465 gttgaggtttcgaggtaggatttgtattctagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctagga 21890564  T
Q  431 gctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||    
T  21890565 gctacgaagatgt 21890577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24676469 - 24676073
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  24676469 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 24676370  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| || ||||| |||  |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  24676369 ttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcaca 24676270  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  24676269 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggc 24676170  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24676169 cgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctgagtattcatccgggagctacgaagatgt 24676073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 22324319 - 22324715
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  22324319 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 22324418  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  22324419 tccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaacagtatcaaggaagcgca 22324518  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  22324519 gaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 22324618  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||   | |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22324619 agaatttgtgtcccagataatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 22324715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 101 - 443
Target Start/End: Original strand, 22755982 - 22756324
Alignment:
Q  101 catatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggta 200  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||  | |    
T  22755982 catatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacattttagagatctgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactgagaa 22756081  T
Q  201 tgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaaga 300  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756082 tgctaaagattgatagtgaaattctgaaaagtatcaatgaagcacataaagtttatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaaga 22756181  T
Q  301 cggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagt 400  Q
     ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||  ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22756182 tggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagt 22756281  T
Q  401 catagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22756282 catagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgt 22756324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 183 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9610980 - 9610720
Alignment:
Q  183 agagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 282  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  9610980 agagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgc 9610881  T
Q  283 tagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaag 382  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||    
T  9610880 tagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaag 9610781  T
Q  383 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9610780 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 9610720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 443
Target Start/End: Original strand, 24706955 - 24707341
Alignment:
Q  57 gtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 156  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| | |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  24706955 gtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatat 24707054  T
Q  157 gagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgat 256  Q
    ||| || ||||| |||  |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24707055 gagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacataaagttgat 24707154  T
Q  257 gttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    || |||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||| ||||||| || |||||  |||||||||    
T  24707155 gtcaagtttttttatttgttagttgttagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgta 24707254  T
Q  357 ctctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||  || |||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24707255 ttcctgatgatgaattgatgaagaaaatggttcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgt 24707341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17068218 - 17067959
Alignment:
Q  183 agagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 282  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  17068218 agagtgtgaa-ctgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacaggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgc 17068120  T
Q  283 tagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaag 382  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||    
T  17068119 tagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaag 17068020  T
Q  383 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17068019 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 17067959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23111716 - 23111327
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||||||| |||    
T  23111716 tatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttttagttgcttgaagagt 23111617  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| || ||| ||||||| | |||||| |||||||  | |||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  23111616 ttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgaattcttgaacagtattaaagaagcaca 23111517  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||     
T  23111516 gaaatttgatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatcaaactagagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgagattctgaggc 23111417  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagc-ttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||  | ||| |||  ||||||| |||| ||| ||||| | || || ||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23111416 agaattttcattcttgacagtgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacataagtagctttaagtattcatccgggagctac 23111327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 443
Target Start/End: Original strand, 24819339 - 24819545
Alignment:
Q  237 aagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgag 336  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||| | |||||||||||  |||||||    
T  24819339 aagaagcgcagaaagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgag 24819438  T
Q  337 gtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacg 436  Q
     ||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||      
T  24819439 attctgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctaga 24819538  T
Q  437 aagatgt 443  Q
    |||||||    
T  24819539 aagatgt 24819545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 356
Target Start/End: Original strand, 23099484 - 23099790
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  23099484 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttta 23099583  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||  ||||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||      
T  23099584 gagacttgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtg-atttcttgaaaagtatcagagaagcgcaac 23099682  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||  |||| |   ||||||| ||  ||||||| |||||  ||||||||||  |||| ||    
T  23099683 aagttgatgtcaagtttgtggatttattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgaggttcagaggcag 23099782  T
Q  349 aatttgta 356  Q
    ||||||||    
T  23099783 aatttgta 23099790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 27209638 - 27210031
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| |    
T  27209638 catccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagttta 27209737  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||  | |||||| | |||||| || | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||      
T  27209738 gagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 27209836  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |     
T  27209837 aagttgatgtcaagtttgtggattttatggttactagtaatcaggctgagaatagtgatttcaagattgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcaa 27209936  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||| |||| ||  ||| || | ||  |||||||| ||||  | ||||| |||||||  || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27209937 aatctgtattcctgacaataaagaattgaagaagttgatattagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaaaatgt 27210031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 30210384 - 30210768
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| | |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  30210384 catccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaagtaggaaaacata-catatgtctgctatgatggttagagagttggagttgctttaacagttca 30210482  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  ||||  |  ||||||||||  | || ||| |||||||  | |    |||| || | ||||| ||||| || || ||    
T  30210483 gagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacaaatttttggatagtatcaaagaggctcagaa 30210582  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga-ag 348  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||    
T  30210583 ggtggatgtgaagttggtagatttcatggttggcaataatcagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttc-aggatag 30210681  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  || |||   || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  30210682 aatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattctagaagaaagtcacaaaagtaatttgagtattcatccgggagctac 30210768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Original strand, 12639690 - 12639811
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| || ||| |||    
T  12639690 ttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattg 12639789  T
Q  141 aacagttcagagatttgagttt 162  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  12639790 aacagtttcgagatttgagttt 12639811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23277753 - 23277360
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || ||  ||||  | ||||| |    
T  23277753 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagttta 23277654  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    |||| |||||| | || || ||| || || || |||||||  || | || || ||||||||| | ||||  ||  |||| |||||   |||||| ||  |    
T  23277653 gagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggattctgaagattaacagtgacttcttgaatagtatccgagaagcgcagca 23277554  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||| ||||| ||||| || || ||| |||||| | ||||| | ||||||||  ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  23277553 agtagatgtgaagttcgttgatttgatggttgttggtaatgaaactgaagatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaga 23277454  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| ||  ||  |||||||  |||| ||| | ||| | || || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23277453 atttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 23277360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45533322 - 45533204
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||  ||||||| ||||| ||| | |  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  45533322 catccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaatagttca 45533223  T
Q  150 gagatttgagtttagtttg 168  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  45533222 gagacttgagtttggtttg 45533204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22279098 - 22278970
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||| || ||     
T  22279098 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtatgctttaatggttaaggacttggaa 22278999  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  22278998 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 22278970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1064728 - 1064335
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  1064728 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 1064629  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| || |    
T  1064628 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtg-atttcttgaacagtattcgagaagctcaga 1064530  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | |||||||| || ||| ||  | |  ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||| |  |||||||  |||| ||    
T  1064529 aagaggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtag 1064430  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||| ||   || |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1064429 agtttgtattcctaacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaagatgt 1064335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 327
Target Start/End: Original strand, 30011650 - 30011925
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| || || |||  ||| ||||| ||| | |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  30011650 catccgagtaaggctaatgttgttgcagatgttttaagtaggaaaacattacat--gtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaacagttca 30011747  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  ||||  |  ||||||||||  | || ||| |||||||  | |  | |||| || | ||||| ||||| || || ||    
T  30011748 gagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaatttttggatagtatcaaagaggctcagaa 30011847  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaagg 327  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||  || |||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30011848 ggtggatgtgaagttggtagatttaatgtttgggaataatcagactgaagatggtgattttaaagttgatgatcaagg 30011925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20828983 - 20828843
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| ||| |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20828983 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 20828884  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |  ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20828883 caagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgt 20828843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20833709 - 20833569
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| ||| |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20833709 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 20833610  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |  ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20833609 caagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgt 20833569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31831382 - 31831250
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||| |||||| ||  ||| |||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  31831382 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaggagttaaagaagttgattcttgaggagagtca 31831283  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  31831282 caagagtaggttgagtattcacccaggggctac 31831250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 443
Target Start/End: Original strand, 27364720 - 27364938
Alignment:
Q  225 tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatca 324  Q
    |||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||  | |||  |||||||||  |||| ||  ||||||| ||| ||||||| ||    
T  27364720 tgaatagtatcaaagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaaca 27364819  T
Q  325 aggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcac 424  Q
    |||| |||||| |||  |||| |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||     
T  27364820 aggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccat 27364919  T
Q  425 ccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27364920 ccgggagctacgaagatgt 27364938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Original strand, 22761019 - 22761092
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgt 107  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22761019 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 22761092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 24569118 - 24569246
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  24569118 ttttcagttgagttatcatcccgggaagacaaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtgaaagagttagaa 24569217  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  24569218 ttgattgagtagttttgagatttgagttt 24569246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 24830638 - 24830712
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||  || || |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24830638 ttttcagttgagttatcatctcggaaaggctaatgttgttacggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 24830712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 19651810 - 19651911
Alignment:
Q  342 gaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
    ||||||||||||| | ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  19651810 gaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagctacgaaaat 19651909  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  19651910 gt 19651911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45530164 - 45530103
Alignment:
Q  374 atgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  45530164 atgaaaaagatgattctagaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctac 45530103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20829221 - 20829126
Alignment:
Q  65 aatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 160  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  20829221 aatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagt 20829126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31831635 - 31831532
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||    
T  31831635 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttca 31831536  T
Q  150 gaga 153  Q
    ||||    
T  31831535 gaga 31831532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12575330 - 12575260
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgat 120  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  12575330 catccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgat 12575260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 160
Target Start/End: Original strand, 19651525 - 19651626
Alignment:
Q  59 aaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttga 158  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||  |||||||||| |||  |||| | || || ||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  19651525 aaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttga 19651624  T
Q  159 gt 160  Q
    ||    
T  19651625 gt 19651626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 435
Target Start/End: Original strand, 11357665 - 11357725
Alignment:
Q  375 tgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  11357665 tgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctac 11357725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Original strand, 12640048 - 12640092
Alignment:
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  12640048 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgt 12640092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27788453 - 27788325
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||||| ||  ||  |||| || ||||| ||| | || || || || |||||||  ||||||||    
T  27788453 ttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagctt 27788354  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||    
T  27788353 aagcattcatccgggagctacgaagatgt 27788325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 35 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6613 - 6205
Alignment:
Q  35 tttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagt 134  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6613 tttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagt 6514  T
Q  135 tgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||| |||||    
T  6513 tgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaggattgataatgaatttttgaagagtat 6414  T
Q  235 taaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttg 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  6413 taaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgataaaggtgtgttg 6314  T
Q  335 aggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagcta 434  Q
    | ||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  6313 aagtttcgaggtaggatttgcattctagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagcta 6214  T
Q  435 cgaagatgt 443  Q
     ||||||||    
T  6213 tgaagatgt 6205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 25857 - 26266
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  25857 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgag 25956  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| | |||||    
T  25957 ttgttggaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgttgaagattgatagtgagtttctaagaagta 26056  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26057 ttaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttagttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 26156  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26157 gagatttcgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagct 26256  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  26257 acgaagatgt 26266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 875 - 747
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  875 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 776  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| || ||  |||||||||||||    
T  775 ttgattgagcattttcgagatttgagttt 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 34 - 441
Target Start/End: Original strand, 22361226 - 22361633
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||  ||||||||    
T  22361226 ttttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggtaaaatagttcgag 22361325  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  22361326 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatcttaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaagagta 22361425  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  22361426 ttaaagaagcataaaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgct 22361525  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22361526 gaggtttcgaggtaggatttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagaaacttgagtattcatccgggagct 22361625  T
Q  434 acgaagat 441  Q
    ||||||||    
T  22361626 acgaagat 22361633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21750317 - 21749909
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  21750317 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgag 21750218  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  21750217 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaagagta 21750118  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21750117 ttaaagaagcacaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggtggctagtgattagactgaagacagagattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 21750018  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| |||||||| || ||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21750017 gagatttcgaggtaggatttgtattccagatgat-atgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 21749919  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  21749918 acgaagatgt 21749909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16373894 - 16373497
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16373894 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaaggagttcgagttgcttgaacagt 16373795  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaag-cac 245  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||   |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| | |    
T  16373794 ttagagatctgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaattcttgaaaagtattaaaaaagacgc 16373695  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16373694 agaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgactttaaggtcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgagg 16373595  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16373594 tagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctgcgaagatgt 16373497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 47 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21831667 - 21831273
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  21831667 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 21831568  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21831567 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcaca 21831468  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  21831467 gagagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 21831368  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831367 agaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 21831273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 33390024 - 33390420
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  33390024 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 33390123  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  33390124 ttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcaca 33390223  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  33390224 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 33390323  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33390324 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 33390420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 51332488 - 51332884
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  51332488 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagt 51332587  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||| ||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  51332588 ttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcaca 51332687  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  51332688 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 51332787  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51332788 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 51332884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22110399 - 22109990
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||    
T  22110399 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatggtaaaagagtttgag 22110300  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  22110299 ttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagta 22110200  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||  ||||    
T  22110199 ttaaagaagcgcataaaatcgatgttaagtttgtggacttgttggttcctagtaatcagactgaagatagtgattttaagatcgatgaccaaggagtgtt 22110100  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22110099 gagattccgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagct 22110000  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  22109999 acgaagatgt 22109990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22114248 - 22113839
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||    
T  22114248 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatggtaaaagagtttgag 22114149  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  22114148 ttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagta 22114049  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||  ||||    
T  22114048 ttaaagaagcgcataaaatcgatgttaagtttgtggacttgttggttcctagtaatcagactgaagatagtgattttaagatcgatgaccaaggagtgtt 22113949  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22113948 gagattccgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagct 22113849  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  22113848 acgaagatgt 22113839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 41352660 - 41353053
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||| ||||||||||||     
T  41352660 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttcc 41352759  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  41352760 gagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattttctgagaagcatcaaagaagcacagaa 41352859  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||     
T  41352860 agttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagg 41352959  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41352960 atttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 41353053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19107732 - 19107336
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  19107732 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgtatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 19107633  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  19107632 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 19107533  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  19107532 gaaagttaatgtaaagtttgtggacttgttagttgctagagaacagactaaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 19107433  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19107432 agaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagccacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 19107336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21838314 - 21837918
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  21838314 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 21838215  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  21838214 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcaca 21838115  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  21838114 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggtttctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 21838015  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21838014 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaataagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 21837918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Original strand, 431098 - 431405
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||    
T  431098 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcgag 431197  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  431198 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagta 431297  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  431298 ttaaagaggcacagaaagctgatgtgaagtttgtggacttgttggttgttagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgct 431397  T
Q  334 gaggtttc 341  Q
    ||||||||    
T  431398 gaggtttc 431405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 16349591 - 16349990
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  16349591 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 16349690  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaag--aagca 244  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||    
T  16349691 tccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtaatcaaggaaagca 16349790  T
Q  245 cataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgag 344  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  16349791 cagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgag 16349890  T
Q  345 gaag-aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||| ||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16349891 gaagtaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16349990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 17044010 - 17044406
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| |||||||| |    
T  17044010 tatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaat 17044109  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||   |||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  17044110 tcagagatttgagtttggtttatgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcaca 17044209  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||| || |||||     
T  17044210 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacgacatgttgagattccgaggt 17044309  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||||| ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17044310 cggatttgtattcccgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgt 17044406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 140 - 443
Target Start/End: Original strand, 50619332 - 50619635
Alignment:
Q  140 gaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaag 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  50619332 gaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctaagaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaagg 50619431  T
Q  240 aagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtt 339  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50619432 aagcagagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttactagtaatcagactgaagacagatattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtt 50619531  T
Q  340 tcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaag 439  Q
    |||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50619532 tcgaggtagaatttgtattccatacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaag 50619631  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  50619632 atgt 50619635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 16077651 - 16078047
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||||| ||||||||||    
T  16077651 tatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagt 16077750  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  16077751 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcata 16077850  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||| ||||||| || | |||     
T  16077851 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgaccacggtgtgttgagattccaaggt 16077950  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| |  |  |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16077951 cggatttgcatccctgacgatgcagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16078047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21025537 - 21025141
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  21025537 tatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagt 21025438  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  |||| || |||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  21025437 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcaca 21025338  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  |||| || ||| ||||||| || |||||     
T  21025337 gaaaattgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcaatgaccatggtgtgttgagattccgaggc 21025238  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  || ||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21025237 cgaatttgtattcctgatgatgaagggaggaagaaaatgattcttgaaaagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 21025141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 345
Target Start/End: Original strand, 21234726 - 21235024
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  21234726 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 21234825  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||  |||||  |  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21234826 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaattgagaatgctgaagatagatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 21234925  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || |||||    
T  21234926 gaaagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgagg 21235024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 249 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20250963 - 20250769
Alignment:
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20250963 aagttgatgttaagtttgtggacttgttggtggctagtaatcggactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtatgttgaggttttgaggtag 20250864  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20250863 gatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgt 20250769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 247 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20139994 - 20139798
Alignment:
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  20139994 taaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaatatcgatgaccaaggtgtgttgaggtttcaaggt 20139895  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    || ||||||| || |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20139894 aggatttgtattccagactatgaagaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 20139798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 19759855 - 19760264
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||  | || || |||    
T  19759855 ttttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatctaagaattggag 19759954  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  19759955 ctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtgaatttatgaatagta 19760054  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | ||||||||||| || | |||||| ||||||||||| || ||  |||   | | ||||||||||||  |||| |||||  | |||||||| ||  ||||    
T  19760055 taaaagaagcacagaaggctgatgtaaagtttgtagatttatttattggagggactcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgtt 19760154  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | || ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||    
T  19760155 gcgattccgaggtagaatttgtattcctgacgacgatgagatgagaaagatgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtatccatccaggagct 19760254  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    |  |||||||    
T  19760255 ataaagatgt 19760264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 20855758 - 20856143
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||||| |||||||| |    
T  20855758 catccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagttta 20855857  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    | ||||| ||| | || || ||  |||||||| | |||||| || | ||||||||||||||  |||||| ||||| || | ||||| | |||||| ||      
T  20855858 gggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttggatagtatcagagaagcgcaac 20855956  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||   | ||  |  ||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||    
T  20855957 aagttgatgttaagtttgtggatttgatggtcgctagtaatctagcggagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattaagaggcag 20856056  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||| |||||||||||    
T  20856057 aatttgtattcctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctac 20856143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 356
Target Start/End: Original strand, 23197244 - 23197550
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| || ||||| |    
T  23197244 catccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagttta 23197343  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||  || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    ||||||||      
T  23197344 gagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgtgaagcacagc 23197442  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| ||| | | ||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  23197443 aagtggatgttaagtttgtggatttgatggttgctggtagtgaaactgaagatagtgactttaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 23197542  T
Q  349 aatttgta 356  Q
    ||||||||    
T  23197543 aatttgta 23197550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 24098601 - 24098994
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  24098601 catcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagttta 24098700  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | || || ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||| ||      
T  24098701 gagacttgagccttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagctcagc 24098799  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| || || || ||||| | ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||| ||| | ||||||||  |||||||    
T  24098800 aagtggatttgaagtttgttgatttgatgattactggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgacgatcagggtgttttgaggttcagaggaag 24098899  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||||| | |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24098900 aatttgtattcctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgt 24098994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20295520 - 20295388
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||||||| |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20295520 gtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtca 20295421  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20295420 caagagtaggttgagtattcacccgggggctac 20295388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 19662132 - 19662245
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| | || || || || ||||| || ||||    
T  19662132 tatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagt 19662231  T
Q  147 tcagagatttgagt 160  Q
    | ||||||||||||    
T  19662232 ttagagatttgagt 19662245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 20830374 - 20830502
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  20830374 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 20830473  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  20830474 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 20830502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 126
Target Start/End: Original strand, 21744550 - 21744626
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaagga 126  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  21744550 catccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaagga 21744626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 22134539 - 22134667
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | ||  |||| ||     
T  22134539 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaatagttggaa 22134638  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  22134639 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 22134667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19855666 - 19855273
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| | || || || || || || || ||||| |    
T  19855666 catccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagttta 19855567  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | || || ||  || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||   |||||||||      
T  19855566 gagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaac 19855468  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | |||||| |||||   ||||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||  |||||||    
T  19855467 aagtggatgttaagtttgttgatttgattgttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaag 19855368  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||| ||  ||  |||| ||| |||| ||| ||||| | || || ||||| |  | |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  19855367 gatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagaatagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgt 19855273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Original strand, 20060941 - 20061059
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || || ||||| || || ||| | ||||| || ||||||||||    
T  20060941 ttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttg 20061040  T
Q  141 aacagttcagagatttgag 159  Q
    | || || |||||||||||    
T  20061041 agcattttagagatttgag 20061059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 31538995 - 31539388
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  31538995 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 31539094  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| || ||||| |  || | || ||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||   |||||| || |    
T  31539095 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtg-atttcttgaacagtatccgagaagctcaga 31539193  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | |||||||| || ||| ||  | || ||||| | ||||  ||  ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||   ||| ||    
T  31539194 aagaagatttgaagtttgttgatttggtgacttctggtaatgacactggggatagtgatttcaaaattgatgatcagggtgtgctgaggttcacaggtag 31539293  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| ||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  31539294 agtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacgaaaatgt 31539388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 354
Target Start/End: Original strand, 20834898 - 20835202
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |    
T  20834898 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagttta 20834997  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | || || ||  |  || || |||||||  || | || |||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||   |||||||||      
T  20834998 gagacttgagccttgtctgtgaattaacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaac 20835096  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
     ||| ||||| |||||||| || ||  |||||||| |||||   ||||| ||  ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  20835097 tagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 20835196  T
Q  349 aatttg 354  Q
    ||||||    
T  20835197 aatttg 20835202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37678441 - 37678056
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  37678441 catcctggtaaggccaatgtggttgttgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 37678342  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| || ||||| |  || | || ||| |||||||||||||||  ||  |||| |||||   |||||| || ||    
T  37678341 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttgggaatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaa 37678242  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||  ||| | |||||||| || ||| ||  | |  ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||| |  |||||||  |||| |||    
T  37678241 agaagatttgaagtttgttgatttgatgacttccggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtaga 37678142  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  37678141 gtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctac 37678056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21952270 - 21951876
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||| || || ||| | |||||||| |    
T  21952270 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagttta 21952171  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    |||| |||||  | || || ||  |||||||| ||||| |  || | || ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||  |||||| || ||    
T  21952170 gagacttgagccttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtaattttttgaacagtattcgagaagcccagaa 21952071  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||  ||| | || || || || ||| ||  | || ||| | | ||||| ||| ||||||||||  | |||||||| ||| |  |||| ||  ||||||||    
T  21952070 agcagatttgaaattggttgatttgatgactactggtagtgacactgaggacagtgattttaaggtggatgatcagggtgtactgagattcagaggaaga 21951971  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtt 444  Q
     |||||| ||   || |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21951970 gtttgtattcctaacaatgatgatttgaagaagttgatccttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaatatgtt 21951876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20914978 - 20914904
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| ||||||||  | || |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20914978 ttttcagttgagttatcatcccaggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 20914904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 20939326 - 20939454
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||| | ||  || ||||||||  | || ||| | ||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  20939326 ttgatgatcaaggtgtgttgagattcagaagaagaatttgcattcctgatgatgatgatttaaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagagtagctt 20939425  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20939426 gagtattcatccgggagctacgaaaatgt 20939454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 93
Target Start/End: Original strand, 24793612 - 24793658
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaa 93  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  24793612 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaa 24793658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Original strand, 20835243 - 20835279
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20835243 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgt 20835279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17047 - 16639
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| ||||| ||     
T  17047 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagtttgaa 16948  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16947 ttattggaacagtttagagatttgaggttagtttgcgaaatgtcatctaagagtgtgaacctaggaatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 16848  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  16847 ttaaagaagcacagaaagttgatgttaaggttgtagacttgttggttgctagtaatcagacagaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtctt 16748  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16747 gaggtttcgaggtagaatttgcattccagacgatg-tgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 16649  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  16648 acgaagatgt 16639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17490831 - 17490422
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  17490831 ttttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagtagttcgag 17490732  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  17490731 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttgtgaaatgtcatatgaatgtgtgaagctaagaatgttgaagattgataatgaatttctgaagagta 17490632  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  17490631 ttaaagaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacaatgattttaaaatcgttgatcaaggtgtgtt 17490532  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17490531 gaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 17490432  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  17490431 acgaagatgt 17490422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 16491330 - 16491739
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  16491330 ttttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgag 16491429  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16491430 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtatgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagta 16491529  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  16491530 ttaaagaggaacagaaagctgatgttaagtttgtggacctgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatggtcaaggtgtatt 16491629  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||| ||||  | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16491630 gaggttttgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagtaccataaaagtaacttgagtattcatccgggagct 16491729  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  16491730 acgaagatgt 16491739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10006568 - 10006172
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  10006568 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 10006469  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  10006468 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 10006369  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  10006368 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 10006269  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10006268 agaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 10006172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 15588554 - 15588950
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  15588554 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 15588653  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15588654 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 15588753  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  15588754 gaaagttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 15588853  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15588854 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 15588950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10907178 - 10906782
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| ||||| |||||||    
T  10907178 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgctagaacagt 10907079  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| || |||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  10907078 ttagagatatgtgtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 10906979  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  10906978 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 10906879  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10906878 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 10906782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 15401679 - 15402075
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  15401679 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaatttcttgaacagt 15401778  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  15401779 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15401878  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  15401879 gagagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccaagga 15401978  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15401979 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 15402075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 20061216 - 20061612
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  20061216 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 20061315  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20061316 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 20061415  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  20061416 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 20061515  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20061516 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 20061612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 5424092 - 5424488
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  5424092 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 5424191  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||   | || || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  5424192 ttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 5424291  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  5424292 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 5424391  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5424392 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 5424488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 14580104 - 14580500
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14580104 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaatttacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagt 14580203  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14580204 tcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagctaggaatgttgaagattgataatgaatttttgaaaagtattaaggaagcaca 14580303  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| || || |||||||||||| | || |||||||||||     
T  14580304 gaaagttgatgtcaagtttgtggatttgttggttactagtaatcagattgaagatagtgatttcaagatcgatgatcaaggtgtattaaggtttcgaggt 14580403  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14580404 agaatttgtattccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcacagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaaaatgt 14580500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15340237 - 15339841
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  15340237 tatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 15340138  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  15340137 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15340038  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  15340037 gagagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 15339938  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339937 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 15339841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 15724096 - 15724492
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  15724096 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 15724195  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  15724196 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcgca 15724295  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  15724296 gaaagttgatttcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 15724395  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| ||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15724396 agaatctgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 15724492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16636741 - 16636345
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  16636741 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 16636642  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  16636641 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 16636542  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16636541 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 16636442  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16636441 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16636345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43164065 - 43163669
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  43164065 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 43163966  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  43163965 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 43163866  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  43163865 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 43163766  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43163765 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 43163669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13253658 - 13253262
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  13253658 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 13253559  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||  ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13253558 ttagagatatgagttcggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaggttgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 13253459  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  13253458 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 13253359  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253358 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 13253262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 48426415 - 48426019
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  48426415 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 48426316  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||    
T  48426315 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctcaagattgatagtgaatttttgaaaaatatcaaggaagcaca 48426216  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  48426215 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 48426116  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48426115 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 48426019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 15347407 - 15347803
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  15347407 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 15347506  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  15347507 ttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcaca 15347606  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  15347607 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 15347706  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15347707 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 15347803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 16411444 - 16411840
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  16411444 tatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 16411543  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||   |||| || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  16411544 tcagggatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 16411643  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16411644 gaaagttgatttaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagtctgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 16411743  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16411744 agaatttgtattccagacaatgaagaggttaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16411840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 53384183 - 53384576
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||| ||||||||||||     
T  53384183 catccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttcc 53384282  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |     
T  53384283 gagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagatggatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacagag 53384382  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
     | |||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| |||    
T  53384383 ggatgatgtgaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggaga 53384482  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53384483 atttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 53384576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6601704 - 6601308
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  6601704 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 6601605  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||   | || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  6601604 tccgagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaacatcaaagaagcaca 6601505  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| || |||||     
T  6601504 gagagttgatgtaaagtttgtggatttgctggttgccagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgaggg 6601405  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| | ||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601404 agaatttgcattcccgacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 6601308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 26791614 - 26791957
Alignment:
Q  100 gcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggt 199  Q
    |||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||    
T  26791614 gcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggt 26791713  T
Q  200 atgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaag 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26791714 atgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaag 26791813  T
Q  300 acggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagag 399  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26791814 acagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagag 26791913  T
Q  400 tcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26791914 tcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 26791957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12499216 - 12498820
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  12499216 tatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgatttacttgaacagt 12499117  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||| |||  |||| || | |||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12499116 ttagagatatgagtttggtttgtgagtggtcacctcaaagtgtgaaactgggaatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaggcaca 12499017  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  12499016 gaaatttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagttggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 12498917  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498916 cggatttgcattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 12498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 14875661 - 14876056
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||  | |  |||||||||||||||||| |||    
T  14875661 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagttagagagttcgagttgcttgaatagt 14875760  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  |||| || |||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  14875761 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatttttgaaaagtattaaagaggcaca 14875860  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  14875861 aaaagttgatatcaagtttgtagacttgttggttgcaagtaatcagactgaagatggtga-cttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 14875959  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14875960 tgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaaaagagttatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 14876056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 57 - 443
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16756143
Alignment:
Q  57 gtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatat 16755856  T
Q  157 gagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgat 256  Q
    |||||| ||||| ||   | || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||| | || ||||    
T  16755857 gagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagcatcaaggaagcacagagagatgat 16755956  T
Q  257 gttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    || |||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |    
T  16755957 gtaaagtttgtggatttgttggttgccagagatcagactgaagacatcgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgca 16756056  T
Q  357 ctctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756057 ttccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 16756143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 14125756 - 14126152
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||||||| ||    
T  14125756 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattacttgaaccgt 14125855  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  14125856 ttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttcttaagagtattaaagaggcaca 14125955  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||||| || |||||     
T  14125956 aatagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgattatcatggtgtgttgagattccgaggt 14126055  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||   ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14126056 tgtatttgcattccttacgatgtagagatgatgaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagcattcaaccgggagctacgaagatgt 14126152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15260611 - 15260368
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||    
T  15260611 ttttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgag 15260512  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15260511 ttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtttgcgagttgtcatctcaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttatgaaaagta 15260412  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15260411 ttaaagaagcacataaagtagatgttaagtttgtagacttgttg 15260368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16372302 - 16371984
Alignment:
Q  125 gagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||| || |||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  16372302 gagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtgatcacctcagagtgtgacactgggaatgctgaagattgatagtgaattgc 16372203  T
Q  225 tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatca 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  | ||||| ||    
T  16372202 taaaaagtattaaagaggcacataaagttgatgtcaagtttgtatacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtggctttaaggtcgatgacca 16372103  T
Q  325 aggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcac 424  Q
     ||| ||||||| || ||||   ||||||||| ||  || ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16372102 tggtgtgttgagattccgagcccgaatttgtattcctgatgataaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcac 16372003  T
Q  425 ccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16372002 ccgggagctacgaagatgt 16371984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16693132 - 16692736
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  16693132 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgccttgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 16693033  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||| || |||  ||||| || ||  |||| ||||||||||||| |||  ||||  |||||||||| ||| |    
T  16693032 tcagagacttgagtttagtttgcgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggagtgctaaagattgatagtgaattcatgaagggtattaaagaggcata 16692933  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||| |  | ||||| ||| ||||||| || |||||     
T  16692932 gaaagttgatgtcaagttcgtacacctgttggttgctagtaattagactgaagatggagactttaaagtcaacgatcacggtgtgttgagattccgaggt 16692833  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16692832 cggatttgcattcctgacgatgcagagatgaaaaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgagagctacgaagatgt 16692736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 16806109 - 16806484
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  16806109 tatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 16806208  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||   |||| || |||||||||| ||||| ||| |||||                     ||||||||||| |||||    
T  16806209 tcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaag---------------------agtattaaagaggcaca 16806287  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||      
T  16806288 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgtctttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgagat 16806387  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  16806388 cggatttgcattcctgacgatccagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgt 16806484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15228627 - 15228231
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || || || ||||||||||| || |    
T  15228627 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatagttaaagattttgagttgcttgagcaat 15228528  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || | ||||||||  | |||||| |||||||  | ||||  ||  |||| |||||||||||||||||    
T  15228527 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaatagtattaaagaagcaca 15228428  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||  |||| || ||  |||||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  15228427 gaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagtaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagta 15228328  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| || ||  ||  |||||||| |||| | | ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  15228327 agaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgt 15228231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15062675 - 15062434
Alignment:
Q  58 taaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttg 157  Q
    ||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  15062675 taaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatg 15062576  T
Q  158 agtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatg 257  Q
    || |||||||  |||  |||| || |||||||||| || || ||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  15062575 agcttagtttatgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagatcgatagtaaatttctcaagagtattaaagaggtacagaaagttgatg 15062476  T
Q  258 ttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15062475 tcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaag 15062434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15234495 - 15234128
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || || || ||||||||||| || |    
T  15234495 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatagttaaagattttgagttgcttgagcaat 15234396  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || | ||||||||  | |||||| |||||||  | ||||  ||  |||| |||||||||||||||||    
T  15234395 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaatagtattaaagaagcaca 15234296  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||  |||| || ||  |||||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  15234295 gaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagtaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagta 15234196  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    ||||||| || ||  ||  |||||||| |||| | | ||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  15234195 agaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaagtagctt 15234128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14574898 - 14574505
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| || ||||| |    
T  14574898 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaatgaatttgatttgctagagcagttta 14574799  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||   |||||||||      
T  14574798 gagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgagtagtatccgagaagcacagc 14574700  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  14574699 aagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtagtgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcatggtgtgttgaggttcagaggaag 14574600  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | ||  ||   ||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14574599 aatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 14574505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 273 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15209633 - 15209463
Alignment:
Q  273 tgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatga 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||    
T  15209633 tgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcatggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgttttcttgacgacgatga 15209534  T
Q  373 gatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15209533 gatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggtgctacgaagatgt 15209463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 273 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15248889 - 15248719
Alignment:
Q  273 tgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatga 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||    
T  15248889 tgttggttgctaggaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgtattcctgacgacgatga 15248790  T
Q  373 gatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15248789 gatgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 15248719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 443
Target Start/End: Original strand, 10419190 - 10419592
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  10419190 ttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttg 10419289  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    ||||||| || || |||||| |||| || ||  | |||||| | |||||| || | |||||| |||||||  ||||||  ||  |||| ||||| | |||    
T  10419290 aacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagaga 10419389  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    ||||||   ||||||||| |||||||| || ||  |||||| |||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||| |||    
T  10419390 agcacaacgagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagattt 10419489  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
     |||| |||||||||  ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  10419490 agaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccaggagctacgaaaa 10419589  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  10419590 tgt 10419592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14087652 - 14087255
Alignment:
Q  46 ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacag 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14087652 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacattacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacag 14087553  T
Q  146 ttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||  ||||| |  |||||| |||| | |||||| |||| ||  |||||| |||  |||| ||||| | |||||| |    
T  14087552 tttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgagaagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgc 14087453  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    |  | |||||||| |||||||| || ||  | |||  |||||||||  |||| ||  ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||  ||||    
T  14087452 aacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagagg 14087353  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |||||||| | || |||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14087352 cagaatttgcattccagacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 14087255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 356
Target Start/End: Original strand, 16827357 - 16827663
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||| || || || |    
T  16827357 catccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaccatttta 16827456  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| |  | || ||| ||||| || || ||||  || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||     
T  16827457 gagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacagtatcagagaagcacatc 16827555  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||   ||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  16827556 aagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagataatgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaaa 16827655  T
Q  349 aatttgta 356  Q
    ||||||||    
T  16827656 aatttgta 16827663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 443
Target Start/End: Original strand, 13971259 - 13971667
Alignment:
Q  35 tttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagt 134  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||||| || ||||    
T  13971259 tttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagt 13971358  T
Q  135 tgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtat 234  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||| |  |||||||| || | |||||| | || ||  |||||| |||  |||| |||||    
T  13971359 tgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 13971458  T
Q  235 taaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttg 334  Q
     ||| |||| ||  | ||||||||  ||||||| || ||  | |||  |||||||||  |||| ||  ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  13971459 caaataagcgcaacaggttgatgtcgagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 13971558  T
Q  335 aggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagcta 434  Q
    | |||  |||| |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||    
T  13971559 aagttcagaggcagaatttgcattcccgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagcta 13971658  T
Q  435 cgaagatgt 443  Q
    |||||||||    
T  13971659 cgaagatgt 13971667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 15014921 - 15015306
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| | |  |||||  | ||||||||||||||||    
T  15014921 catccgggtaaggctaatgttgttacaaatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagagagttgcatttgcttgaacagttca 15015020  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
     ||| |||||||||||||| ||  ||||     ||||||||||  |||| |||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||| | || ||    
T  15015021 aagacttgagtttagtttgtgaagtgtcgcagcagagtgtgaaattagggatgctgaagatcaacagtgaatttttgaatagtattaaagaaactcagaa 15015120  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
     |  ||||| ||||| ||||||||  ||||||  |  ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    |||    
T  15015121 ggaagatgtgaagttggtagacttaatggttgggaacaattagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaataga 15015220  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||| ||  || |||   || ||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15015221 atttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaattcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctac 15015306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15062386 - 15062316
Alignment:
Q  373 gatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15062386 gatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 15062316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17187358 - 17187239
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  17187358 ttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttg 17187259  T
Q  141 aacagttcagagatttgagt 160  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  17187258 aacagttcagagacttgagt 17187239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17493614 - 17493212
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |  || || || ||||| |    
T  17493614 ttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctag 17493515  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaag 239  Q
    ||||||| ||||| ||||||   || || ||  || || || |||||||  |  | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   ||    
T  17493514 aacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtacatttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgag 17493416  T
Q  240 aagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtt 339  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  17493415 aagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtagtgacactgaagatagtgacttaaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtt 17493316  T
Q  340 tcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaag 439  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||  |||| ||| |||| ||| ||||| | || || ||||| |  |||||||| ||||||||  | |||||||||||     
T  17493315 tagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcattctggagctacgaaa 17493216  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  17493215 atgt 17493212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 293 - 443
Target Start/End: Original strand, 16329057 - 16329207
Alignment:
Q  293 actgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttg 392  Q
    ||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||||||| |||||| ||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16329057 actgaggacagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttg 16329156  T
Q  393 aagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  16329157 aggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggggtctacaaagatgt 16329207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 31694340 - 31694733
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||| | || || || || ||||| |||||||| |    
T  31694340 catcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagttta 31694439  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| ||||   | || || ||  || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||      
T  31694440 gagacttgaaccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtattcgagaagcacagc 31694538  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||   ||||| ||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||    
T  31694539 aagtggatgtgaagtttgttgacttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaag 31694638  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | ||  || ||||| ||  |||| ||| ||||| | || || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31694639 aatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 31694733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9523357 - 9523291
Alignment:
Q  377 aagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9523357 aagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgt 9523291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28755293 - 28754908
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  28755293 catcctggtaaggccaatgtggttgcggatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 28755194  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||||||||||||||  ||  |||| |||||   |||||| || ||    
T  28755193 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaa 28755094  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||  ||| | |||||||| || ||| ||  | || ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| |||    
T  28755093 agaggatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaga 28754994  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  28754993 gtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctac 28754908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 8273548 - 8273676
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  8273548 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 8273647  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  8273648 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 8273676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10384690 - 10384550
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||| ||| |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10384690 gtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 10384591  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10384590 caagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgt 10384550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 16337931 - 16338059
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| || |||||||  |||||||| |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  16337931 ttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcataagagtaggtt 16338030  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16338031 gagtattcacctgggggctacaaagatgt 16338059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31939878 - 31939485
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||| | || || || || ||||| |||||||| |    
T  31939878 catcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagttta 31939779  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| | |||  | |  || ||  || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||      
T  31939778 gagactcgagccttgcctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtattcgagaagcacagc 31939680  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||   ||||| ||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||    
T  31939679 aagtggatgtgaagtttgttgacttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaag 31939580  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | ||  || ||||| ||  |||| ||| ||||| | || || ||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31939579 aatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagggtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 31939485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 47124919 - 47124534
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  47124919 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 47124820  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||   |||||| || |    
T  47124819 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtg-atttcttgaacagtatccgagaagctcaga 47124721  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | |||||||| || ||| ||  | || ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||    
T  47124720 aagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtag 47124621  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    | |||| | ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  47124620 agtttgcattcctgacaatgaggagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctac 47124534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25767302 - 25767181
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| || ||| |||    
T  25767302 ttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattg 25767203  T
Q  141 aacagttcagagatttgagttt 162  Q
    | |||||  |||||||||||||    
T  25767202 agcagtttcgagatttgagttt 25767181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 13966493 - 13966621
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  13966493 tttttagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgaa 13966592  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  13966593 ttgattgagaagtttcgagatttgagttt 13966621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15611094 - 15610966
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  15611094 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagattttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 15610995  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  15610994 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 15610966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18750935 - 18750807
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  18750935 ttttcagttgagttatcatccagggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 18750836  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  18750835 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 18750807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30138797 - 30138669
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  30138797 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 30138698  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  30138697 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 30138669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30148348 - 30148220
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  30148348 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 30148249  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  30148248 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 30148220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 438
Target Start/End: Original strand, 13299941 - 13300064
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||  || |||||||   |||| ||| ||||| | || || ||||| |  ||||||||    
T  13299941 ttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagctt 13300040  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13300041 gagtattcacccgggagctacgaa 13300064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 438
Target Start/End: Original strand, 13310599 - 13310722
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||  || |||||||   |||| ||| ||||| | || || ||||| |  ||||||||    
T  13310599 ttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagctt 13310698  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13310699 gagtattcacccgggagctacgaa 13310722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 6152002 - 6152076
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6152002 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 6152076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 16741852 - 16741926
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16741852 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 16741926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 11960588 - 11960716
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| || |||||||  |||||||| |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    ||||| ||    
T  11960588 ttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagattttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacgatagtagttt 11960687  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||    
T  11960688 gagtattcacccaggggctataaagatgt 11960716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 13319921 - 13320049
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||  || |||||||   |||| ||| ||||| | || || ||||| |  ||||| ||    
T  13319921 ttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagatt 13320020  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13320021 gagtattcacccgggagctacgaaaatgt 13320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13942999 - 13942887
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  13942999 catccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagttta 13942900  T
Q  150 gagatttgagttt 162  Q
    ||||  |||||||    
T  13942899 gagacatgagttt 13942887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15216502 - 15216451
Alignment:
Q  273 tgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15216502 tgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatca 15216451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 108
Target Start/End: Original strand, 12359681 - 12359739
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12359681 catccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagacgttgcatatgtc 12359739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16258135 - 16258061
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16258135 ttttcagttgagttatcatcccagaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 16258061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12793132 - 12793004
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||  || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  12793132 ttttcagttgagttatcatctcggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagtaagattttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 12793033  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| | |||  |||||||||||||    
T  12793032 ttgattgagctgtttcgagatttgagttt 12793004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17194085 - 17193957
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  17194085 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctattgttgttgatgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 17193986  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| || ||  |||||||||||||    
T  17193985 ttgattgagcaatttcgagatttgagttt 17193957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 108
Target Start/End: Original strand, 18133500 - 18133558
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||    
T  18133500 catccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgcatatgtc 18133558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Original strand, 16380439 - 16380475
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16380439 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16380475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44778222 - 44778110
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || || || || || || |||||||| |    
T  44778222 catccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagttta 44778123  T
Q  150 gagatttgagttt 162  Q
    ||||  |||||||    
T  44778122 gagacatgagttt 44778110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 102
Target Start/End: Original strand, 55514872 - 55514935
Alignment:
Q  39 agttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgca 102  Q
    ||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  55514872 agttgagttatcatccaagaaaggctaacgttgttgctgataccttgagtaggaagactttgca 55514935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Original strand, 6711565 - 6711687
Alignment:
Q  39 agttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgct 138  Q
    ||||||| || ||||| || || || ||||| || |||||| |||||||||||| | | ||||||||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| |    
T  6711565 agttgagttaccatcccgggaaggcgaatgtggtggcagatgctttgagtaggatgccgttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggagttgat 6711664  T
Q  139 tgaacagttcagagatttgagtt 161  Q
    ||| |||||  ||||||||||||    
T  6711665 tgagcagtttcgagatttgagtt 6711687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Original strand, 12360053 - 12360089
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12360053 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgt 12360089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Original strand, 16836021 - 16836057
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16836021 agtagcttgagtattcatcccggagctacgaagatgt 16836057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2662 - 2249
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  2662 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 2563  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  2562 ttgcttgaatagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaattctgaagattgataatgaatttctgaagagta 2463  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2462 ttaaagaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtgtacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 2363  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtc----atagaagtagcttgagtattcacccggg 429  Q
    |||||||||||| || ||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2362 gaggtttcgaggtaggatttgtcttccagacgatgacgagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatatatagaagtaacttgagtattcatccggg 2263  T
Q  430 agctacgaagatgt 443  Q
    |||| |||||||||    
T  2262 agctccgaagatgt 2249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 1
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  159 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 60  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaa 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  59 ttgcttgaatagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 112401 - 112810
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||| |||||||||    
T  112401 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagttcgag 112500  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  112501 ttgttggaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 112600  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  112601 ttaaagaagcacagaaggtcgatgttaagtttgtagacttgttagctgctagtaatcatactgaagatggtgattttaaaatcgatgatcgaggtgtgtt 112700  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  112701 gagattccgaggtagaatttgtattccagacgatgaggagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 112800  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  112801 acgaagatgt 112810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16270 - 15861
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||    
T  16270 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgag 16171  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  16170 ctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaagagta 16071  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    || | ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||| | |||||||| ||| ||||    
T  16070 ttcatgaagcgcagaaagaggatgttaagtttgtggacttgttggttgcaagtaatcagacggaagatagtgacttcaaagtcgatgatcagggtgtgtt 15971  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| |||||||  | |||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15970 gagatttcgagatataatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagct 15871  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    || |||||||    
T  15870 actaagatgt 15861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 30338 - 29929
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  30338 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 30239  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || ||||    
T  30238 ttggttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataacgaatttctaaagagta 30139  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||    
T  30138 taaaagaggcacaaaaagttgatgttaagtttgtacatttgttggtttctagtgatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaacgtgtgtt 30039  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30038 gaggtttcgaggtaggatttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 29939  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  29938 acgaagatgt 29929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29434 - 29041
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||| || ||||| |    
T  29434 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaagaagtttgagttgctagagcagttta 29335  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||| | | ||||| ||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| | ||| | |||||||||      
T  29334 gagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaataatatcagagaagcacagc 29236  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||  ||||| |||||||| | |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  29235 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 29136  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||  | ||  ||   ||||||| |||| ||| ||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  29135 aattttcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 29041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 21921089 - 21921498
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||| ||    
T  21921089 ttttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaaggagttcaag 21921188  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| || ||||    
T  21921189 ttgcttgaatagttcagagatttgactttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctagttatgctgaagattgataacgaatttctaaagagta 21921288  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  21921289 ttaaagaggcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacaacgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgct 21921388  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  21921389 gaggtttcgaggtaggatttgtattcaagacgatgatgagataaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagct 21921488  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  21921489 acgaagatgt 21921498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21043873 - 21043464
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||    
T  21043873 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtgaaagagttcgag 21043774  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  21043773 ttgcttgaacagttcagagatctgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgatgaagattgataatgaatttctgaagagta 21043674  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  || |    
T  21043673 ttaaagaggcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgcaagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaagagtgct 21043574  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  21043573 gaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgagagct 21043474  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  21043473 acgaagatgt 21043464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 21393218 - 21393627
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  21393218 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 21393317  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21393318 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctgaaaagta 21393417  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |    
T  21393418 ttaaagaggcacagaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgct 21393517  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  21393518 gaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccaggagct 21393617  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  21393618 acgaagatgt 21393627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 21787712 - 21788121
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  21787712 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 21787811  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21787812 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctgaaaagta 21787911  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |    
T  21787912 ttaaagaggcacagaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgct 21788011  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  21788012 gaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccaggagct 21788111  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  21788112 acgaagatgt 21788121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23651469 - 23651060
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||    
T  23651469 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttcgag 23651370  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||   |||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  23651369 ttgttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgctgaagcttgatagtgaatttctgaaaaata 23651270  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||    
T  23651269 ttaaagaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactaaagacagtgattttaagatcgatgatcaatgtgtgtt 23651170  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  23651169 gaggtttcgaggtaggatttgtattttagacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtatcttgagtattcatctgggagct 23651070  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  23651069 acgaagatgt 23651060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 34 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21252372 - 21251969
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  21252372 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgag 21252273  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  21252272 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtaaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttcagaaaagta 21252173  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  21252172 ttaaagaggcacagaaagccgatgttaagtttgtggacttgttggttgttagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgct 21252073  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  21252072 gaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccacagaagtaacctgagtattcatccgggagct 21251973  T
Q  434 acga 437  Q
    ||||    
T  21251972 acga 21251969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18857992 - 18857596
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  18857992 tatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 18857893  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18857892 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttatgaaaagtattaaggaagcaca 18857793  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  18857792 gagagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcggactgaagaaagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 18857693  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    || ||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18857692 aggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 18857596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 22128324 - 22128720
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  22128324 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 22128423  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  22128424 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 22128523  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22128524 gagagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 22128623  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128624 agaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 22128720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 17673389 - 17673785
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  17673389 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattacttgaacagt 17673488  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| |||| |||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  17673489 ttagagatatgagtttggtttccgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 17673588  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  17673589 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 17673688  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17673689 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 17673785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19114105 - 19113709
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  19114105 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattacttgaacagt 19114006  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  19114005 tccgagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 19113906  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  19113905 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactaaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgagga 19113806  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19113805 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 19113709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 21165904 - 21166300
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  21165904 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttgaacagt 21166003  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| ||||| || |||  |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21166004 ttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcaca 21166103  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  21166104 taaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggagactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 21166203  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166204 cgaatttgtattcccaacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 21166300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 22119540 - 22119936
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  22119540 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatggcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 22119639  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | | |||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  22119640 ttaaagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcgca 22119739  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22119740 gagagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtatgttgagattccgagga 22119839  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22119840 agaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaatagagtcatagaagttgcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 22119936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 19483433 - 19483826
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||| ||||||||||||     
T  19483433 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttcc 19483532  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  19483533 gagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattttctgagaagcatcaaagaagcacagaa 19483632  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||     
T  19483633 agttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagg 19483732  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19483733 atttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 19483826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 30312510 - 30312906
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  30312510 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 30312609  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||  ||||| || || |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30312610 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattaatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 30312709  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || |||||     
T  30312710 taaagttgatgtcaagtttgtagatttgttagttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggt 30312809  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30312810 cggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 30312906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19979382 - 19978986
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||| ||||||||||||||||    
T  19979382 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagt 19979283  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  |||| || |||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||    
T  19979282 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatttttgaagagtatcaaagaagcaca 19979183  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| | ||||| || |||||     
T  19979182 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcaggctgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtattgagattccgaggt 19979083  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19979082 cgaatttgtattcttgacaatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 19978986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32601558 - 32601163
Alignment:
Q  48 atcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagtt 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  32601558 atcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttatagagttcgagttacttgaacaatt 32601459  T
Q  148 cagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacat 247  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||   |||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  32601458 cagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcacaa 32601359  T
Q  248 aaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaa 347  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||      
T  32601358 aaagttgatgtcaagtatgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtc 32601259  T
Q  348 gaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | ||||||| ||  |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32601258 ggatttgtattcccgacgatgcagagatgaaggaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 32601163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15534794 - 15534402
Alignment:
Q  51 atccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcag 150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||| | |  ||||||||||| |||||||| || ||    
T  15534794 atccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaatttag 15534695  T
Q  151 agatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaa 250  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  15534694 agatttgagtttggtttgcgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattatagaggcacagaaa 15534595  T
Q  251 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaa 350  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||  | |    
T  15534594 gtagatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 15534495  T
Q  351 tttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||| | ||  || ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15534494 tttgcattcatgatgatgcagaaataaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 15534402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 57 - 443
Target Start/End: Original strand, 22376830 - 22377216
Alignment:
Q  57 gtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  22376830 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatct 22376929  T
Q  157 gagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgat 256  Q
    |||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| || ||| |||||    
T  22376930 gagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgcagaaaattgat 22377029  T
Q  257 gttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  22377030 gttaagtttgtgcacttgttggtttctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatctgggagtgttgagattctgaggcagaatttgta 22377129  T
Q  357 ctctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22377130 ttcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 22377216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 57 - 443
Target Start/End: Original strand, 22383005 - 22383391
Alignment:
Q  57 gtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  22383005 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatct 22383104  T
Q  157 gagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgat 256  Q
    |||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| || ||| |||||    
T  22383105 gagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgcagaaaattgat 22383204  T
Q  257 gttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  22383205 gttaagtttgtgcacttgttggtttctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcggggagtgttgagattctgaggcagaatttgta 22383304  T
Q  357 ctctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22383305 ttcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 22383391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22041274 - 22040878
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||||| ||||||||||    
T  22041274 tatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagt 22041175  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22041174 tcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatcctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaggcaca 22041075  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||     
T  22041074 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagacggaagacgatgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggt 22040975  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22040974 cggatttgcattcctgacgatgcaaatatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgt 22040878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 22132407 - 22132803
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||||| |||||||  |    
T  22132407 tatcatccaggtaaagctaatgatgttatagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttcatggttagagagtttgagttacttgaaccat 22132506  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    ||||||||||||||||||| || ||   |||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22132507 tcagagatttgagtttagtctgtgaatggtcaccttagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 22132606  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| ||  ||||     
T  22132607 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattctgaggt 22132706  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22132707 cggatttgcattcccgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcattgaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 22132803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 140 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22988518 - 22988215
Alignment:
Q  140 gaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaag 239  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  22988518 gaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcatctcagagtgtaaagttaggaatgctgaagattgatagtgaattcctgaagagtattaaag 22988419  T
Q  240 aagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtt 339  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  22988418 aagcgcataaaattgatgttaagtttgtggaattgttgatttctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagatt 22988319  T
Q  340 tcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaag 439  Q
     ||||| ||||||| || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22988318 ccgaggcagaatttctattccttacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaa 22988219  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  22988218 atgt 22988215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Original strand, 16407489 - 16407807
Alignment:
Q  125 gagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc 224  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||   ||||||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||    
T  16407489 gagttcgagttaattgagcagtttagagatatgagcttggtttgtgaatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattaatagtgaatttc 16407588  T
Q  225 tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatca 324  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||    
T  16407589 tgaagagtattaaagaagcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgacca 16407688  T
Q  325 aggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcac 424  Q
     ||| ||||||| || |||||  | ||||| | ||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407689 tggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgaagagatgaataaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcac 16407788  T
Q  425 ccgggagctacgaagatgt 443  Q
    || ||||||||||||||||    
T  16407789 ccaggagctacgaagatgt 16407807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 22247786 - 22248179
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||                |||    
T  22247786 ttttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctat----------------gag 22247869  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  || |  ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  22247870 ttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtcggcaaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagta 22247969  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | |||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  22247970 tcaaagaagtgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgtt 22248069  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || | ||| |||||||||| ||  |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22248070 gagattccaaggcagaatttgtattcctgacattgacgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgtgtattcatccgggagct 22248169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 20395485 - 20395894
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||| | || ||||| |||    
T  20395485 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatggttaaagagttggag 20395584  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     |||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  20395585 ctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtgaatttttgaatagta 20395684  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||| | | ||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||  ||||    
T  20395685 ttaaggaagcacagaaagtggatgtaaagtttgtagattatttgattggtgggaatcagactgaggatggtgacttaaaagttgatgatcagggattgtt 20395784  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | |||||||| ||||||| || ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20395785 gcgatttcgaggcagaatttatattcccgacaatgatgagataaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagct 20395884  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    || |||||||    
T  20395885 acaaagatgt 20395894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23886452 - 23886075
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  23886452 ttttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatgatcaaagagttggag 23886353  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||  ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23886352 ctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaatagta 23886253  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||  ||| | | ||||||||||||||  |||| | |||  | |||||| | ||  ||||    
T  23886252 ttaaagaggcgcatgaagtggatgtaaagtttgtagatttatttattggtggaaatcagactgaagatagtgactctaaggtcgatgattagggagtgtt 23886153  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtag 411  Q
    |   || ||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23886152 gcaattccgaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtag 23886075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 285
Target Start/End: Original strand, 20017629 - 20017867
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  20017629 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 20017728  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20017729 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 20017828  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctag 285  Q
      |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20017829 ggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctag 20017867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 20984916 - 20985309
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||  | ||||| |    
T  20984916 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagttta 20985015  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| ||||| || |||||||| || | |||||| |||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |    
T  20985016 gagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgaacagtatcagagaagcacaga 20985114  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  | ||| |||||||| | |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  20985115 aagttgatgtcaagtttgttgatttaatagttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaag 20985214  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||   |  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20985215 aatttgtattcctaaaaatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtatcttaagtattcacccgagagctacaaagatgt 20985309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19858862 - 19858466
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19858862 tatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagt 19858763  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||  |  | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| |    
T  19858762 tcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcgc 19858664  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    | ||| ||||||| |||||||| || ||  || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  ||||    
T  19858663 agaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatgattgctagtattcaaactgaagatggtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagagg 19858564  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| | ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  19858563 aagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 19858466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19852826 - 19852430
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19852826 tatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagt 19852727  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||  |  | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| |    
T  19852726 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcgc 19852628  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    | ||| ||||||| |||||||| || ||  || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  ||||    
T  19852627 agaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatgattgctagtattcaaactgaagatggtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagagg 19852528  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| | ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  19852527 aagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 19852430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 435
Target Start/End: Original strand, 20009302 - 20009674
Alignment:
Q  63 ctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  20009302 ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtct 20009401  T
Q  163 agtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaa 261  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||||| |  | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| | ||| | |||||| || ||| ||||||| ||    
T  20009402 agtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaacaatatcatagaagcgcagaaaattgatgtcaa 20009500  T
Q  262 gtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactcta 361  Q
    | |||| || ||  ||||| |||||||||  |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||     
T  20009501 gcttgtggatttaatggttactagtaatcgaactgaagagggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattctt 20009600  T
Q  362 gacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20009601 gataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctac 20009674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20389514 - 20389118
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || |||||  | |||||||||||||    
T  20389514 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagttttatttgcttgaacagt 20389415  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | || || |||||  ||||||| ||| ||||  || ||||||||||| |  ||||| |||||||  | ||||  ||  |||| | ||| ||||||||| |    
T  20389414 ttagggacttgagcctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacaatatcaaagaagcata 20389315  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| || ||  |||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  20389314 gaaggttgatattaagtttgtcgacttgttggttgctagtattcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggc 20389215  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20389214 agaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacatacgtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 20389118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21841829 - 21841436
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  21841829 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 21841730  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| || ||| | ||||| ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||      
T  21841729 gagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacagtatcagagaagcacaac 21841631  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  21841630 aagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaattaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 21841531  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  21841530 gatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 21841436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 51 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23656338 - 23655946
Alignment:
Q  51 atccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcag 150  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  23656338 atccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttag 23656239  T
Q  151 agatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||| |||||| | || || ||| ||||| || ||||| |  || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||   |||||||||  |    
T  23656238 agacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgagtagtatccgagaagcacaaca 23656140  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  23656139 agtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaga 23656040  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||||| |||||  |||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23656039 atttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaggtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 23655946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22372343 - 22371959
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22372343 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagttta 22372244  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaa-agtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||  ||||| | |||||   | |||||||| |||||||| || | |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| ||||| | |||||| || |    
T  22372243 gagacctgagtcttgtttgtttgttgtcatctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttaaacagtatcagagaagcgcaga 22372145  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    || |         |||||| || ||  |||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||  |||||||||   || ||||||||||  |||||||    
T  22372144 aact---------gtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaaccgaaaagggtgatttcaaggttgatgatctgtgtgtgttgaggttcagaggaag 22372054  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||| |  | ||  ||   ||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22372053 aatattcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattatagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcacctgggagctacaaagatgt 22371959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1267650 - 1267257
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| |    
T  1267650 catctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaagaatttgatttgctagagcagttta 1267551  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||||||||| |||| || ||| | ||| || | ||| |  |  |||| |||||||||||| | |||| |||||| ||  |||||   ||||||||||     
T  1267550 gagatttgagtctagtctgtgagttatcacctcaaagtatacaattagggatgctgaagattaacagtg-atttcttgagcagtatccgagaagcacatc 1267452  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| ||| | || || ||| |||||||| ||||| | ||||| ||  ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||    
T  1267451 aagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaag 1267352  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  1267351 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacaaagatgt 1267257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23950040 - 23949938
Alignment:
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
    ||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23950040 cgaggcagaaattgtattcctgacaatgatgagatgaagaagacgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaga 23949941  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  23949940 tgt 23949938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14566554 - 14566169
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||    
T  14566554 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttca 14566455  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||  ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||   |||||| || |    
T  14566454 gagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtg-atttcttgaacagtatccgagaagctcaga 14566356  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | |||||||| || ||| ||  | || ||||  | ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| ||    
T  14566355 aagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaacgacactgaggatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtag 14566256  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    | |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  14566255 agtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaaaagtaggttgagtattcacccaggggctac 14566169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 16876448 - 16876576
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  16876448 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 16876547  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  16876548 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 16876576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 293 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12305927 - 12305785
Alignment:
Q  293 actgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttg 392  Q
    ||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||  || ||||| | || | ||  ||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  12305927 actgaggacagtgattttaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagatgaagagtatgcattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattcttg 12305828  T
Q  393 aagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12305827 aagagagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctac 12305785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Original strand, 16270846 - 16270986
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| |  |||||||  |||||||| | |||| ||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16270846 gtgattttaaggttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtca 16270945  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16270946 caagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgt 16270986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 20651714 - 20651814
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtt 161  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  20651714 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttaatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtt 20651813  T
Q  162 t 162  Q
    |    
T  20651814 t 20651814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22435731 - 22435603
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  22435731 ttttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaaaactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 22435632  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| | |||  |||||||||||||    
T  22435631 ttgattgagccgtttcgagatttgagttt 22435603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 21849690 - 21849764
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21849690 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggacgactttgcatatgtc 21849764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 31416135 - 31416236
Alignment:
Q  342 gaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31416135 gaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagat 31416234  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  31416235 gt 31416236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Original strand, 803295 - 803435
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| ||| |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  803295 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctagaggagagtca 803394  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |  ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  803395 caagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgt 803435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 21195855 - 21195983
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||| | || ||||| ||     
T  21195855 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggcgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtttgcttttatggttaaagagttggaa 21195954  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  21195955 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 21195983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6605070 - 6604967
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | || |||||||||||| | ||||||||||    
T  6605070 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttca 6604971  T
Q  150 gaga 153  Q
    ||||    
T  6604970 gaga 6604967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6680523 - 6680420
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | || |||||||||||| | ||||||||||    
T  6680523 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttca 6680424  T
Q  150 gaga 153  Q
    ||||    
T  6680423 gaga 6680420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Original strand, 22623405 - 22623469
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctat 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  22623405 catccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctat 22623469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 29303060 - 29303188
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| || |||||||  || ||||| |||||| ||  ||| |||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||| |  ||||| ||    
T  29303060 ttgatgatcagggtgtgctgaggttcagatgaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaaattgattcttgtagagagtcacaagagtaggtt 29303159  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  29303160 gagcattcacccgggggctacaaagatgt 29303188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Original strand, 23156393 - 23156439
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  23156393 gctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagactttgcatatgtc 23156439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6604754 - 6604685
Alignment:
Q  366 atgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6604754 atgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctac 6604685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6680207 - 6680138
Alignment:
Q  366 atgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6680207 atgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctac 6680138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 160
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803152
Alignment:
Q  72 ttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagt 803152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22052275 - 22052172
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| |||||||| |    
T  22052275 catcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagttta 22052176  T
Q  150 gaga 153  Q
    ||||    
T  22052175 gaga 22052172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Original strand, 22623557 - 22623618
Alignment:
Q  374 atgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  22623557 atgaaaaagatgattctggaaaaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctac 22623618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22051918 - 22051882
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22051918 agtaggttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 22051882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22316254 - 22316210
Alignment:
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22316254 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgt 22316210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Original strand, 31570211 - 31570323
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| || || || || || || |||||||| |    
T  31570211 catccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacacttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagttta 31570310  T
Q  150 gagatttgagttt 162  Q
    ||||  |||||||    
T  31570311 gagacatgagttt 31570323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 31570476 - 31570604
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||||| ||  ||  |||| || ||||| ||| | || || || || |||||||  ||||||||    
T  31570476 ttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagctt 31570575  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||    
T  31570576 aagcattcatccgggagctacgaagatgt 31570604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 7244 - 7653
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  7244 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggtaaaagagttcgag 7343  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  7344 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtgtgtgaaatgtcatttgaaagtgtgtagctaggaatgctgaagattggtaatgaatttctgaaaagta 7443  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  7444 ttaaagaggcacataaagccgatgttaagtttgtagacttgttggttgttagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtact 7543  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7544 gaggtttcgaggtaggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 7643  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  7644 acgaagatgt 7653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7442 - 7033
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  7442 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgag 7343  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7342 ttgcttgaatagttcagagatttgagcttagtgtgttaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagta 7243  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |  |    
T  7242 ttaaagaggcacaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttagttgttagtgatcagactaaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtact 7143  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||| ||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7142 gaggttttgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 7043  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  7042 acgaagatgt 7033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 44 - 415
Target Start/End: Original strand, 3532 - 3903
Alignment:
Q  44 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaac 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||    
T  3532 agctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttgaattgttagaac 3631  T
Q  144 agttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagc 243  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632 agttcagagatttgagtttggtatgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagc 3731  T
Q  244 acataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcga 343  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||    
T  3732 gcagaaagttgatgttaagtttgttgacttcttggttgcaagtaatcaaaccgaagacagcgatattaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccga 3831  T
Q  344 ggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttg 415  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3832 ggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaacaagatgattcttgaagagagccataggagtagcttg 3903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 441
Target Start/End: Original strand, 980 - 1387
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| ||||||||     
T  980 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgaa 1079  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1080 ttgttcgaacagtttagagatttgagtttattctgagagttgtcatctcagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 1179  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1180 ttaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagactttttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 1279  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1280 gagattccgaggtagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgatatttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagct 1379  T
Q  434 acgaagat 441  Q
    ||||||||    
T  1380 acgaagat 1387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 46 - 443
Target Start/End: Original strand, 31678 - 32075
Alignment:
Q  46 ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacag 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31678 ctatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacag 31777  T
Q  146 ttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    || ||||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  31778 tttagagatttgagtttagtctgcaagttgtcatcttaaagtgtgaagctgggaatgctaaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaagcgc 31877  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||    
T  31878 agaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttagttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagg 31977  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31978 tagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 32075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 160
Target Start/End: Original strand, 12456 - 12566
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | || || ||||| ||||| |||||||| |    
T  12456 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgctgcatatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagttta 12555  T
Q  150 gagatttgagt 160  Q
    |||| ||||||    
T  12556 gagacttgagt 12566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 8000 - 8409
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||| || || ||| |||  |||||||||    
T  8000 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagttcgag 8099  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8100 ttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtgaagctagaaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 8199  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  8200 ttaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtatacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgagtttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 8299  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  8300 gagattccgaggtagaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagaatcatagaagtggcttaagtatccatccgggagct 8399  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||| ||||||    
T  8400 acgcagatgt 8409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 19254 - 19663
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||    
T  19254 ttttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcaag 19353  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  19354 ttgcttgaacagttcaaagatttaagattagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaagagta 19453  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  19454 ttaaagaggcacagaaagctgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtact 19553  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  19554 gaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagatgtaacttgagtattcatccgggagct 19653  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  19654 acgaagatgt 19663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45597 - 45509
Alignment:
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45597 agaatttgtaatcttgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctac 45509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 26737832 - 26738228
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | || ||||    
T  26737832 tatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgttggagcagt 26737931  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  26737932 ttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaaagaca 26738031  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  26738032 taaagttgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaaatcgatgatcatggtgcgttgagatttcgagga 26738131  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  26738132 agaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaaaatgt 26738228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 21338389 - 21338798
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||   |||||||||| ||||| ||| | || ||| |||||    
T  21338389 ttttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggttaaagagctcgag 21338488  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21338489 ttgctggaacagtttaaagatttgagtttagtttgcaagatgtcatctcagaatgtgaagctaggaatgcagaagattgataatgaatttctgaaaagta 21338588  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||  | ||    
T  21338589 ttaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaaaacaatgattttaaaatcgatgatcagggagtatt 21338688  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21338689 gagattccgaggtagaatttgtattctagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 21338788  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||| ||||    
T  21338789 acgaaaatgt 21338798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 22331992 - 22332388
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  22331992 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 22332091  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22332092 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcaca 22332191  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22332192 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 22332291  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332292 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 22332388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 29475178 - 29475574
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| ||||||||||||     
T  29475178 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacaga 29475277  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  29475278 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcgca 29475377  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  29475378 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 29475477  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29475478 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 29475574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16357783 - 16357387
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  16357783 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 16357684  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  16357683 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 16357584  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16357583 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 16357484  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16357483 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16357387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22135949 - 22135553
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||||    
T  22135949 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcggagagttcaaattgcttgaacagt 22135850  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  22135849 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 22135750  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  22135749 gaaagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagaaagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagaa 22135650  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    || ||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22135649 aggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 22135553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27519687 - 27519292
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  27519687 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 27519588  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  27519587 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaa-ctgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 27519489  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  27519488 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 27519389  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27519388 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 27519292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 27684505 - 27684901
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  27684505 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 27684604  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  27684605 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgca 27684704  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  27684705 gaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 27684804  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27684805 agaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 27684901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34567775 - 34567379
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  34567775 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 34567676  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  34567675 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 34567576  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  34567575 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 34567476  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34567475 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 34567379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40710061 - 40709665
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  40710061 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 40709962  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  40709961 tccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 40709862  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  40709861 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 40709762  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709761 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 40709665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 27667595 - 27667991
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  27667595 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 27667694  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||   | || || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  27667695 ttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcaca 27667794  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  27667795 gaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagatttcgagga 27667894  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| | || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27667895 agaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgt 27667991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 14998844 - 14999240
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  14998844 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 14998943  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  14998944 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattcatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgca 14999043  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| || ||||||| || ||||||    
T  14999044 gaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaagtgtgttgagattccgagga 14999143  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14999144 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 14999240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19771241 - 19770845
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  19771241 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 19771142  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||   | || || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  19771141 tcagagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcaca 19771042  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  19771041 gaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 19770942  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19770941 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 19770845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27611635 - 27611239
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||  | ||||||||||    
T  27611635 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaactacttgaacagt 27611536  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  27611535 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagcgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 27611436  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  27611435 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgagga 27611336  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27611335 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 27611239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41772123 - 41771727
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  41772123 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 41772024  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||   |||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||  | ||||||||    
T  41772023 tccgagatatgagtttggtttatgaatggtcacctcagagcgtgaaactaggtatgctcaagattgatagtgaatttttgaaaaatatctaggaagcaca 41771924  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  41771923 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 41771824  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41771823 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 41771727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23441491 - 23441095
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  23441491 tatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattacttgaacagt 23441392  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||||||||| ||   | || || ||||||||||  | || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  23441391 ttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaagtgggaatgctgaagattgatagtgaatttatgaagagtattaaagaggcaca 23441292  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  23441291 aaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 23441192  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23441191 cggatttgcattcgtgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 23441095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 37290601 - 37290997
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  || ||||| |||||||||||||    
T  37290601 tatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagt 37290700  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||| ||   ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  37290701 ttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcatcttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagaaagcaca 37290800  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||| || ||||||    
T  37290801 aaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctaaagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaagctgtgttgagattccgagga 37290900  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | ||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37290901 agaatttgtatcccagacattgaagagattaggaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagccacgaagatgt 37290997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23517768 - 23517411
Alignment:
Q  86 agtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgaga 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||| || |||    
T  23517768 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtgatcacctcaga 23517669  T
Q  186 gtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctag 285  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23517668 gtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcacataaagttgatgtcaagtttgtagacttattggttgctag 23517569  T
Q  286 taatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatg 385  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||  ||||||||| ||   | ||||| ||||||||||| |||    
T  23517568 taatcagacagaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctaaagatgaagagatgaagaaaatg 23517469  T
Q  386 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23517468 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgt 23517411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23575010 - 23574622
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  23575010 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagt 23574911  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23574910 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaattcctgaagagtatcaaagaagcaca 23574811  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  23574810 aaaaattgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagattgaggatggtgattttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggc 23574711  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||       ||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23574710 cgaatttgtattc------ctgat--gatgaagaaaatgtttattgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 23574622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23472509 - 23472123
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23472509 tatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagt 23472410  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |  |||  |||  | ||| |||||||||||    
T  23472409 ttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgata-taaattcttgagcaatatcaaagaagcaca 23472311  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| || |||||||   |||||||||||| ||||||   ||  ||||| | ||||||||     
T  23472310 gaaaactgatgttaagtttgtggacttgttggatactagtaattaggctgaagataatgattttaaaatcgatgatttgggagtgttgcgttttcgaggc 23472211  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagcta 434  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23472210 agaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatttatagaagtagcttaagtattcatccgggagcta 23472123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20800651 - 20800333
Alignment:
Q  125 gagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||  |||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||| |||||    
T  20800651 gagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcctagtttgcgagtggtcacctcagagtgtgaaactgagaatgctgaagattgacagtgaatttc 20800552  T
Q  225 tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatca 324  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||    
T  20800551 tgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgacca 20800452  T
Q  325 aggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcac 424  Q
     ||| ||||||| || |||||  ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20800451 tggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacctgagtattcac 20800352  T
Q  425 ccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20800351 ccgggagctacgaagatgt 20800333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21882230 - 21881834
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |  ||||| ||||||||||||||||    
T  21882230 tatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagt 21882131  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | | |||| ||||  ||||||| |||  |||| || |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21882130 ttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgtgaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcaca 21882031  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  21882030 gaaagttgatgtcaagtttgtatacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaatgtcgatgaccatggtgtgttgagtttccgaggt 21881931  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||||| ||  ||  |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21881930 cgtatttgtattcctgattatgtagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgagagctacgaagatgt 21881834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25427727 - 25427480
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  25427727 ttttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 25427628  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  25427627 ttgcttgaacagttcagaaatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtatagctaggaatcatgaagattgataatgaatttctgaagagta 25427528  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttg 281  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25427527 ttaaagaagaacataaagttcatgttaagtttgtggacttgttggttg 25427480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 20467190 - 20467598
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  20467190 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactctacatatgtccgctatgatgatcaaagagttagag 20467289  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     |||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  20467290 ctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgagttgtcacctcagagcgtgaagttaggaatgctaaagattgatagtgaatttctgactagta 20467389  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||| |||  || ||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||| | | ||||||||||||||  |||| |||||  | |||||||| ||  ||||    
T  20467390 ttaaaaaag-gcagaaagtggatgtaaagtttgtagatttatttattggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgtt 20467488  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | |||||||| | |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20467489 gcgatttcgaggcaaaatttgtattcctgatgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtaacagaagtagcttgagtattcatccgggagct 20467588  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  20467589 acgaagatgt 20467598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 21563078 - 21563474
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  21563078 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagt 21563177  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||  ||||| | ||||| ||| ||||  || ||||||||||| | |||||| |||||||  | ||||  ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  21563178 ttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacagtatcaaagaagcaca 21563277  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||| || ||||||| || |||       
T  21563278 gaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaacgtgtgttgagattccgacac 21563377  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||||| ||   |  || ||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  21563378 ataatttgtattccttataattatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 21563474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 443
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831262
Alignment:
Q  59 aaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  159 gtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgt 258  Q
    || | ||||| ||| ||||  || ||||||||||| | |||||| |||||||  | ||||  ||  |||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacaatattaaagaagcgcagaaagttgatgt 21831077  T
Q  259 taagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtact 358  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||      
T  21831078 taagtttgtagaattgttggttgctagtaatcaaactaaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattctgaggcagaatttgtatc 21831177  T
Q  359 ctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21831178 cctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagtttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 21831262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20822713 - 20822320
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  20822713 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagttta 20822614  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| || ||| |||| || ||| | |||||| | |||||| || | |||||| |||||||  |||| | ||||| |||| ||||| | |||||||||      
T  20822613 gagacttaagtctagtgtgtgagttatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagcg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 20822515  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||| ||| |||| ||    
T  20822514 aagttgatgttaagtttgtagatttgatagtcgctagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagatttagaggcag 20822415  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||  ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20822414 aatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgt 20822320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 248 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18776850 - 18776655
Alignment:
Q  248 aaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaa 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || |||||      
T  18776850 aaagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacgatgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtc 18776751  T
Q  348 gaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18776750 ggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 18776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25424241 - 25424074
Alignment:
Q  275 ttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgaga 374  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  25424241 ttggttgctagtgatcagactggagatagtgattttaaaatcgatgatcaacgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgaga 25424142  T
Q  375 tgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25424141 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta-attgagtattcatccgggagctacgaagatgt 25424074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18777077 - 18776854
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  18777077 tatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 18776978  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||    
T  18776977 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggctca 18776878  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtaga 270  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  18776877 gaaagttgatgtcaagtttgtaga 18776854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 21679870 - 21680279
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||||| ||||||    
T  21679870 ttttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgag 21679969  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||| |  |||||||| || | |||||| |||| ||  |||||| |||  |||| ||||    
T  21679970 ttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagta 21680069  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||  | |||  |||||||||  |||| ||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  21680070 tcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgtt 21680169  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    || |||  |||| |||||||| | ||  ||| | |||||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  || ||||||||||| || |||||||||    
T  21680170 gaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagct 21680269  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  21680270 acgaagatgt 21680279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22463211 - 22462827
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  22463211 catccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagttta 22463112  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    | ||||| ||| | || || ||  |||||||| | |||||| || | ||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||      
T  22463111 gggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 22463013  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||  | ||  |  ||||||| ||  ||||| | |||||| ||||||| ||| |||| ||    
T  22463012 aagttgatgttaagtttgtggatttaatggttgctggtaatcaagcagagaatagtgatttcaaggttgat-aacaaggtgtgttgagatttagaggcag 22462914  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||| |||||||||||    
T  22462913 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttggaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctac 22462827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 24619403 - 24619796
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||||||| |    
T  24619403 catccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagttta 24619502  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | | ||| ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   ||||||  |      
T  24619503 gagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcttagc 24619601  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||| ||  | ||||| ||  |||||| ||| ||| |  |||||||  |||||||    
T  24619602 aagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaag 24619701  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24619702 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgt 24619796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 24715634 - 24716027
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||||||| |    
T  24715634 catccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagttta 24715733  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | | ||| ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   ||||||  |      
T  24715734 gagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcttagc 24715832  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||| ||  | ||||| ||  |||||| ||| ||| |  |||||||  |||||||    
T  24715833 aagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaag 24715932  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24715933 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgt 24716027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 24748662 - 24749055
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||||||| |    
T  24748662 catccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagttta 24748761  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | | ||| ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   ||||||  |      
T  24748762 gagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcttagc 24748860  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||| ||  | ||||| ||  |||||| ||| ||| |  |||||||  |||||||    
T  24748861 aagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaag 24748960  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24748961 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgt 24749055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22349410 - 22349308
Alignment:
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22349410 cgaggaagaatttgtattctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacgggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaga 22349311  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  22349310 tgt 22349308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 435
Target Start/End: Original strand, 28894041 - 28894435
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28894041 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 28894140  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    ||||||| || || |||||| |||| || ||  | |||||| | |||||  || | |||||| |||||||  ||||||  ||  || | ||| | | |||    
T  28894141 aacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagaga 28894240  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || || ||| ||||||   |||||||  | || ||  ||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  28894241 agcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattt 28894340  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||| ||||||||||  |  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | |||||  ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  28894341 agaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctac 28894435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 435
Target Start/End: Original strand, 28915512 - 28915906
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28915512 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 28915611  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    ||||||| || || |||||| |||| || ||  | |||||| | |||||  || | |||||| |||||||  ||||||  ||  || | ||| | | |||    
T  28915612 aacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagaga 28915711  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || || ||| ||||||   |||||||  | || ||  ||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  28915712 agcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattt 28915811  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||| ||||||||||  |  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | |||||  ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  28915812 agaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctac 28915906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 435
Target Start/End: Original strand, 28922867 - 28923261
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28922867 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 28922966  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    ||||||| || || |||||| |||| || ||  | |||||| | |||||  || | |||||| |||||||  ||||||  ||  || | ||| | | |||    
T  28922967 aacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagaga 28923066  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || || ||| ||||||   |||||||  | || ||  ||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  28923067 agcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattt 28923166  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||| ||||||||||  |  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | |||||  ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  28923167 agaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctac 28923261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21408416 - 21408298
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21408416 catccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagttgcttgaacagttca 21408317  T
Q  150 gagatttgagtttagtttg 168  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  21408316 gagacttgagtttggtttg 21408298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20775028 - 20774634
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20775028 ttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 20774929  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaag 239  Q
    ||||||| || || |||||| | || || ||  | |||||| | |||||| || | |||||| |||||||  |||||| ||||| ||   ||||| | ||    
T  20774928 aacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgggtagtatcagag 20774830  T
Q  240 aagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtt 339  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||||  ||||||||  | || ||  ||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||    
T  20774829 aagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttgtgagtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatt 20774730  T
Q  340 tcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    | |||| ||||||||||  |  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | |||||  ||||||  || | |||||||||||||| |||||||||    
T  20774729 tagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacctgggagctac 20774634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20343542 - 20343157
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| || || || || ||| | ||||||||||    
T  20343542 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttca 20343443  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||  ||||| | || |  ||  |||||||| ||||| |  || | || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| || |    
T  20343442 gagacatgagtcttgtctatgaattgtcatctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtg-atttcttgaacagtattcgagaagctcaga 20343344  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| ||  | |  ||||| | ||||| ||  ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||||||    
T  20343343 aagtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatgacactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaag 20343244  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    | |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20343243 agtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctac 20343157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 24797505 - 24797890
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  24797505 catcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 24797604  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| |||||||| | |||||| ||| |||||   |||||| || |    
T  24797605 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgataggg-atttcttgaacagtatccgagaagctcaga 24797703  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | |||||||| || ||| ||  | || ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||    
T  24797704 aagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgttttgaggttcagaggtag 24797803  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    | |||| | ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24797804 agtttgcattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggagctac 24797890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 443
Target Start/End: Original strand, 21889932 - 21890260
Alignment:
Q  115 aatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgat 214  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||||||  ||    
T  21889932 aatggtaaaggagtttgagttgctagagaagtttagagacttgagtcttgtttatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagatcaat 21890031  T
Q  215 agtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaa 313  Q
    |||| |||||| ||| ||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| ||| || |  |||| || ||     
T  21890032 agtg-atttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtcgatttaatggttgctagtaatcaaactaaatatagtgacttcaag 21890130  T
Q  314 attgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagct 413  Q
     ||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||  ||   ||||||| |||| ||| ||| | | ||||| || || | ||||||||    
T  21890131 gttggtgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgagtttggaagaaagccacaaaagtagct 21890230  T
Q  414 tgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21890231 ttagtattcatccgggagctacaaagatgt 21890260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 165
Target Start/End: Original strand, 28930780 - 28930904
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28930780 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttg 28930879  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagt 165  Q
    ||||||| || || |||||| ||||    
T  28930880 aacagtttagggacttgagtctagt 28930904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 17268442 - 17268835
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  17268442 catccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagttta 17268541  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||  ||||||| || || ||| ||||  || | || ||  || | || ||||| |||||| | ||||  |||||||  |||||   |||||||||  |    
T  17268542 gagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagca 17268641  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
     || ||||| |||||||| ||  || |||||||| |||||   | ||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||    
T  17268642 ggtggatgtcaagtttgttgatctgatggttgctggtaatggcattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtaga 17268741  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| ||  ||  |||| || ||||| ||| | || || || || ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17268742 atttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcacaagagtagcttgagcattcatccgggagctacgaagatgt 17268835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 435
Target Start/End: Original strand, 23079462 - 23079582
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||  |||||||| |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  23079462 ttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaaaagtagttt 23079561  T
Q  415 gagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  23079562 gagtattcacccgggggctac 23079582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24582486 - 24582358
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  24582486 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 24582387  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  24582386 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 24582358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22503939 - 22503566
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||| | |||||||| |    
T  22503939 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagttta 22503840  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| |||| || ||| ||||| || ||||| |  || | || ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||   ||||||  | |    
T  22503839 gagacttgagtctagtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagt-aatttcttgaacagtatccgagaagcttaga 22503741  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | || || || || ||| ||  | || ||| | | ||||| |||  |||||||||  |||||||||| ||| |  |||||||  |||||||    
T  22503740 aagcagatttgaaattggttgatttgatgactactggtagtgacactgaggacaatgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaag 22503641  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattca 423  Q
    | | |||| ||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  22503640 agtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtcataagagtaggttgagtattca 22503566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27012360 - 27012222
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  27012360 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 27012261  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgag 172  Q
    ||| |||| |||||  |||| |||||||| ||| |||||    
T  27012260 ttgattgagcagtttcgagacttgagtttggttagcgag 27012222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25849335 - 25848950
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | || || || || ||||| ||| ||||||    
T  25849335 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttca 25849236  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||  ||||| | || || ||  |||||||| ||||| |  || | || ||||| |||||||||||||  ||  |||| |||||   |||||| || ||    
T  25849235 gagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggggatgctaaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaa 25849136  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||| ||| | |||||| | || ||| ||  | |  ||||| | ||||| ||  ||||||||||  |||||||||| ||| |  |||||||  ||||||||    
T  25849135 agtggatttgaagtttattgatttgatgacttcaggtaatgacactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaaga 25849036  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     | |||| ||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25849035 gtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgatgatagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctac 25848950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 21936280 - 21936408
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  21936280 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 21936379  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  21936380 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 21936408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21497107 - 21496940
Alignment:
Q  276 tggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagat 375  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||   |  | |||||  |    
T  21497107 tggttgctagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataaggatgattt 21497008  T
Q  376 gaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  21497007 gaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 21496940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 14886099 - 14886484
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  14886099 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 14886198  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||   |||||| || |    
T  14886199 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtg-atttcttgaacagtatccgagaagctcaga 14886297  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | || ||||| || ||| ||  | || ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||  || |||||||  |||| ||    
T  14886298 aagaagatttgaaatttgttgatttgatgacttctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggggtgctgaggttcagaggtag 14886397  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    | |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14886398 agtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctac 14886484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Original strand, 37542742 - 37542882
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| |  |||||||  |||| ||| |||||| ||  ||| | || ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  37542742 gtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaacgaagagttgaagaaattgattcttgaggagagtca 37542841  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37542842 caagagtaggttgagtattcacccaggagctacgaaaatgt 37542882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21497202 - 21497147
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatat 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  21497202 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttacatat 21497147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 21872158 - 21872228
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgat 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  21872158 catccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatgat 21872228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 21876438 - 21876508
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgat 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  21876438 catccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatgat 21876508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Original strand, 21936645 - 21936689
Alignment:
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  21936645 gtcatagaagtagtttgagtattcacccaggagcaactaagatgt 21936689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Original strand, 22235034 - 22235086
Alignment:
Q  56 ggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||    
T  22235034 ggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtc 22235086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 320956 - 321365
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  320956 ttttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaaggagttcgag 321055  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagt 232  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||  |  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  321056 ttgctggagtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtgaagttagggatgctgaagattgatagtg-atttcttgaagagt 321154  T
Q  233 attaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgt 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  321155 attaaagaagcacaaaaagttgatgttaagcttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgt 321254  T
Q  333 tgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagc 432  Q
    |||| || ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||    
T  321255 tgagattccgagatagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtgatagaagtagcttgagtatccatccaggagc 321354  T
Q  433 tacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||    
T  321355 tacgaagatgt 321365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 11771160 - 11771569
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||  | ||     
T  11771160 ttttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagaaattgaa 11771259  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11771260 ttgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 11771359  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  || |    
T  11771360 ttaaagaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtggt 11771459  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11771460 gagatttcgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 11771559  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  11771560 acgaagatgt 11771569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14041046 - 14040637
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  14041046 ttttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatggtaaaagagttcgag 14040947  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| | |||||||| | |||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14040946 ttgttggaacagtttacagatttaagtttagtatgtgagttgtcatcttagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 14040847  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14040846 ttaaagaagcagagaaatttgatgttaagtttgtagatttgttggttgttagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 14040747  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14040746 gagattccgaggtagaatttgtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagct 14040647  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  14040646 acgaagatgt 14040637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14351076 - 14350667
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  14351076 ttttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatggtaaaagagttcgag 14350977  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| | |||||||| | |||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14350976 ttgttggaacagtttacagatttaagtttagtatgtgagttgtcatcttagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 14350877  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14350876 ttaaagaagcagagaaatttgatgttaagtttgtagatttgttggttgttagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 14350777  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14350776 gagattccgaggtagaatttgtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagct 14350677  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  14350676 acgaagatgt 14350667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8199966 - 8199570
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  8199966 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 8199867  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  8199866 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 8199767  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8199766 gaaagttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 8199667  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8199666 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 8199570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8708943 - 8708547
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  8708943 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagt 8708844  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  8708843 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcaca 8708744  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8708743 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 8708644  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8708643 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 8708547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 44790283 - 44790679
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  44790283 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagt 44790382  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  44790383 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 44790482  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  44790483 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 44790582  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44790583 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 44790679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 11236145 - 11236541
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  11236145 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 11236244  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  11236245 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaaattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgca 11236344  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  11236345 gagggttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 11236444  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236445 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 11236541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12688838 - 12688443
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  12688838 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 12688739  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  12688738 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 12688639  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  12688638 gaaagttgatttaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacattgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 12688539  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12688538 agaatttgtattctagac-atgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 12688443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14333734 - 14333338
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  14333734 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 14333635  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  14333634 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 14333535  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  14333534 gaaagttgatgtaaagtgtgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatctaggtgtgttgagattccgagga 14333435  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14333434 agaatttgtatcccaggcaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 14333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 18550690 - 18551086
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  18550690 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagt 18550789  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  18550790 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcaca 18550889  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  18550890 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 18550989  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18550990 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 18551086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 34 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14955905 - 14955516
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||    
T  14955905 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgag 14955806  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14955805 ttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 14955706  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14955705 tcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 14955606  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattca 423  Q
    ||| || |||||||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14955605 gagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattca 14955516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10872333 - 10871937
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  10872333 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 10872234  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||   | || || ||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  10872233 ttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattggatatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 10872134  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  10872133 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 10872034  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10872033 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 10871937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18179080 - 18178684
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| || |||||||| |    
T  18179080 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattacttgaacatt 18178981  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18178980 tcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 18178881  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  18178880 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactaaagacagtgattttagaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 18178781  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| | || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178780 agaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 18178684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 48 - 443
Target Start/End: Original strand, 23202546 - 23202941
Alignment:
Q  48 atcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagtt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||||||    
T  23202546 atcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagtt 23202645  T
Q  148 cagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacat 247  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||     
T  23202646 cagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacag 23202745  T
Q  248 aaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaa 347  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  23202746 aaagtagatgtgaagtttgtggactcgtcggttgctagagatcagactgaagatagtgattttagaaccgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaa 23202845  T
Q  348 gaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||| || | || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23202846 gaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 23202941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 48 - 443
Target Start/End: Original strand, 23508673 - 23509068
Alignment:
Q  48 atcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagtt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||||||    
T  23508673 atcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagtt 23508772  T
Q  148 cagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacat 247  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||     
T  23508773 cagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacag 23508872  T
Q  248 aaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaa 347  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  23508873 aaagtagatgtgaagtttgtggactcgtcggttgctagagatcagactgaagatagtgattttagaaccgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaa 23508972  T
Q  348 gaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||| || | || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23508973 gaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 23509068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9597395 - 9596999
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  9597395 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgaattacttgaacagt 9597296  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9597295 ttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 9597196  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||     
T  9597195 aaaagctgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgaggt 9597096  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9597095 cggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 9596999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13687402 - 13687006
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  13687402 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 13687303  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| |||||||| | |||| || |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||    
T  13687302 ttagagatatgagtttggtttgcgaaaggtcacctcagagtgtgagactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcgca 13687203  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || |||| || ||||||    
T  13687202 gaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgctgagattccgagga 13687103  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13687102 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 13687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 438
Target Start/End: Original strand, 16250 - 16641
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||||| ||||||||||    
T  16250 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagt 16349  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | |    
T  16350 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggaaaa 16449  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||  || ||||||| || |||||     
T  16450 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacagtgtgttgagattccgaggt 16549  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaa 438  Q
     | ||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16550 cggatttgtattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa 16641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 11552034 - 11552430
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||  |||||||||    
T  11552034 tatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttagttgaacagt 11552133  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |   |||| || ||||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  11552134 tcagatatatgagtttggtttgcaaatggtcaccttagagtgtgaaattgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 11552233  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  11552234 gaaagttcatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagaccgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 11552333  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || | || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11552334 agaatttgtattccatacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 11552430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 15159989 - 15160385
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  15159989 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 15160088  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  15160089 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgagactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgca 15160188  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || |||| || ||||||    
T  15160189 gaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgctgagattccgagga 15160288  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15160289 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtatatttagtattcatccgggagctacgaagatgt 15160385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14213012 - 14212616
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||||| |||||||| |    
T  14213012 tatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaat 14212913  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||   |||| || |||  ||||| || || |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| |||||    
T  14212912 tcagagatttgagcttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgataatgaatttctaaagagtattaaagaggcaca 14212813  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||     
T  14212812 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggt 14212713  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||||| ||  |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14212712 cggatttgtattcccgacgatgcagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatcgaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 14212616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15204970 - 15204561
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||    
T  15204970 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggttaaagagttggag 15204871  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     |||| ||| |||| |||||  |||||||||| |||||  ||||  || | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  15204870 ctgctcgaatagtttagagacctgagtttagtctgcgaactgtcgcctcatagtataaagctaggaatgctgaagattgatagtgaattcttgaacagta 15204771  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||  | |||||||| || |||||    
T  15204770 ttaaagaagcgcataaagttgatgttaagtttgtgggcttgttggttgctagtaattagactgaagatagtgacttcaaggtcgatgatcagggaatgtt 15204671  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15204670 gagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgaagagataaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccggaagct 15204571  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  15204570 acgaagatgt 15204561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 279
Target Start/End: Original strand, 15147804 - 15148049
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||    
T  15147804 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttcgag 15147903  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||   |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  15147904 ttgcttgaacagtttagtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagaata 15148003  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggt 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15148004 ttaaagaagcacataatgttgatgtcaagtttgtatacttgttggt 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15625892 - 15625494
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||| | || ||||| ||| |||| |||||||    
T  15625892 tatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcgaacagt 15625793  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||| |||| || ||  ||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  15625792 ttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctcaatagtattaaagaagcgca 15625693  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaat--tgatgatcaaggtatgttgaggtttcgag 344  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || |   ||| | | ||||||||||||||  |||| |||||  |   |||||||| ||  ||||| | |||||||    
T  15625692 aaaagtggatgtaaagtttgtagatttatatattggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgagatgatcagggagtgttgcgatttcgag 15625593  T
Q  345 gaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15625592 gcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 15625494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 444
Target Start/End: Original strand, 12205710 - 12206107
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | || || || ||||||||||  ||||    
T  12205710 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatggttaaagaatttgagttgcttggtcagt 12205809  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || | ||||||||  | |||||| |||||||  | ||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  12205810 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagtttttgaatagtattaaagaagcaca 12205909  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
      | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||  |||| || ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  12205910 ggaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagcaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 12206009  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtt 444  Q
    |||||||||| ||  ||  |||||||| |||| | | ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  12206010 agaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtt 12206107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19148550 - 19148154
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  19148550 tatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagt 19148451  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    | ||||| ||| || | ||||| ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||    
T  19148450 ttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatgggtatgctgaaaattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcac 19148352  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    |  |||||||||| |||||||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  19148351 agcaagttgatgtcaagtttgtgggtttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagagg 19148252  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| | || |||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  19148251 aagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 19148154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20747949 - 20747553
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  20747949 tatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagt 20747850  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    | ||||| ||| || | ||||| ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||    
T  20747849 ttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatgggtatgctgaaaattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcac 20747751  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    |  |||||||||| |||||||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  20747750 agcaagttgatgtcaagtttgtgggtttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagagg 20747651  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| | || |||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  20747650 aagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 20747553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 274 - 443
Target Start/End: Original strand, 15153816 - 15153985
Alignment:
Q  274 gttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgag 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  15153816 gttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgag 15153915  T
Q  374 atgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  15153916 atgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtatccatccgggagctatgaagatgt 15153985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 11387341 - 11387734
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  11387341 catccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttta 11387440  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||  ||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| ||      
T  11387441 gagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcgcaac 11387539  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |||| ||  ||||||| ||  ||||||| |||||  ||||||||||  |||| ||    
T  11387540 aagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgaggttcagaggcag 11387639  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||  |||||||| |||| ||| | ||| | || || || || || |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  11387640 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagtatccatccgggagctacgaagatgt 11387734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 441
Target Start/End: Original strand, 16071214 - 16071598
Alignment:
Q  56 ggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 155  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  16071214 ggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactagaacagtttagagact 16071313  T
Q  156 tgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagttg 254  Q
    ||||| | ||||| ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||   |||||||| | || | |    
T  16071314 tgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagt-aatttcttgaatagtatccgagaagcacgtcaaatgg 16071412  T
Q  255 atgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttg 354  Q
    |||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  16071413 atgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttg 16071512  T
Q  355 tactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
    || ||  ||  |||||||  | || ||| ||||| | || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16071513 tattcatgataatgatga-tttaaaaagttgattttagaggaaagccatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagat 16071598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19614027 - 19613618
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||||| || |||    
T  19614027 ttttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgag 19613928  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||| |  |||||||| || | |||||| |||| ||  |||||| |||  |||| ||||    
T  19613927 ttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagta 19613828  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||  | |||  |||||||||  |||| ||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  19613827 tcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgtt 19613728  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    || |||  |||| |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  || ||||||||||| || |||||||||    
T  19613727 gaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagct 19613628  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  19613627 acgaagatgt 19613618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 354
Target Start/End: Original strand, 14263157 - 14263461
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14263157 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttgaacagttta 14263256  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| || ||| | ||||| ||| ||||| || ||||| |  || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||| | |||||||||      
T  14263257 gagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgagtagtatcagagaagcacaac 14263355  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| ||||| || || ||  ||||| |||||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  14263356 aagttgatgtcaagttcgttgatttaatggttactagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 14263455  T
Q  349 aatttg 354  Q
    ||||||    
T  14263456 aatttg 14263461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 15101516 - 15101901
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| || ||||| |    
T  15101516 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagttta 15101615  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |||||   |||||||||      
T  15101616 gagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaacagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaac 15101714  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||| | || ||| |||||| | ||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| || |||||||  |||||||    
T  15101715 aagtggatgtcaagtttattgatttgatggttgttggtaatgacactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaag 15101814  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||  | |||||  |||| ||| ||||| | || || ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15101815 aatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctac 15101901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12457976 - 12457583
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| || || || ||||||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| || || || |    
T  12457976 catcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaattta 12457877  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||  | ||  ||||| || ||||| |  || | || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| ||      
T  12457876 gagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagttggggatgctgaagattgatagtg-atttcttgaacagtattcgagaagctcagc 12457778  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| |   | |  ||||| | ||||| ||  ||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||| |||||||    
T  12457777 aagtagatttgaagtttgtggatttgataaatacgggtaatgacactgaggatagtgattttaaggttgatgaccaaggtgtgctgaggtttagaggaag 12457678  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||| ||  ||| | |||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12457677 agtttgtattcctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgt 12457583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13456093 - 13455970
Alignment:
Q  39 agttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgct 138  Q
    ||||||| |||||||| || || || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| |    
T  13456093 agttgagttatcatcccggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggagttgat 13455994  T
Q  139 tgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||    
T  13455993 tgagcagtttagagatttgagttt 13455970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 16949650 - 16949778
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||   || |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  16949650 ttgatgatcagggtgttttgagatttagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 16949749  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16949750 gagtattcacccgggagctacaaagatgt 16949778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 11305176 - 11305561
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||    
T  11305176 catcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttca 11305275  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||  ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||   |||||| || |    
T  11305276 gagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtg-atttcttgaacagtatccgagaagctcaga 11305374  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | |||||||| || ||| ||  | || ||||  | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||  |||| ||    
T  11305375 aagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaacgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgtactgaggttcagaggtag 11305474  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    | |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  11305475 agtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctac 11305561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13022410 - 13022300
Alignment:
Q  333 tgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagc 432  Q
    |||||||  |||||||| |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13022410 tgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggc 13022311  T
Q  433 tacgaagatgt 443  Q
    ||| |||||||    
T  13022310 tacaaagatgt 13022300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7825251 - 7825123
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  7825251 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 7825152  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  7825151 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 7825123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Original strand, 13967834 - 13967966
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||  |||||||| |||||| ||| |||  ||||||  |||||||  ||||||| || ||||||||    
T  13967834 gtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcttgacagtgatgatttgaagaatttgattctcgaggagagtca 13967933  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13967934 caagagtaggttgagtattcacccgggggctac 13967966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 27106693 - 27106821
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  27106693 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 27106792  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  27106793 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 27106821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27171632 - 27171504
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  27171632 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 27171533  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  27171532 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 27171504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49153637 - 49153252
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49153637 catcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttca 49153538  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||  ||||  | || || ||   |||| |  ||||| |  || | || ||| |||| |||||||||   ||| |||| |||||   |||||| || ||    
T  49153537 gagacatgagccttgtctgtgaatggtcaccccagagtattcagttgggaatgttgaaaattgatagtaactttttgaacagtatccgagaagctcagaa 49153438  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||  ||| | |||||||| || ||||||  | || ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||| |  |||||||  |||| |||    
T  49153437 agaggatttgaagtttgttgatttgttgacttctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggtaga 49153338  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  49153337 gtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctac 49153252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15341767 - 15341670
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagtt 147  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  15341767 catcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtt 15341670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Original strand, 23504783 - 23504895
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |    
T  23504783 catccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagttta 23504882  T
Q  150 gagatttgagttt 162  Q
    ||||  |||||||    
T  23504883 gagacatgagttt 23504895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Original strand, 26117771 - 26117903
Alignment:
Q  303 gtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtca 402  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||| | | |||||| ||  ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26117771 gtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaaagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtca 26117870  T
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26117871 caagagtaggttgagtattcacccgggggctac 26117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12456746 - 12456653
Alignment:
Q  342 gaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12456746 gaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctac 12456653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 585 - 713
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||  || ||| |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  585 ttgatgatcagggtgttatgaggttcagaagaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 684  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  685 gagtattcatccgggagcaacaaagatgt 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4441274 - 4441154
Alignment:
Q  39 agttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgct 138  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| || ||| |    
T  4441274 agttgagttatcaccccgggaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtaggaagactttgcatatatcctctttgatggttaaagagttggaattgat 4441175  T
Q  139 tgaacagttcagagatttgag 159  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  4441174 tgagcagtttcgagatttgag 4441154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14130852 - 14130816
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14130852 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 14130816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14434670 - 14434634
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14434670 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 14434634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15341410 - 15341374
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15341410 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 15341374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13354495 - 13354372
Alignment:
Q  39 agttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgct 138  Q
    ||||||| |||||||  || || |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||| ||  || | ||| | |||||||| || ||| |    
T  13354495 agttgagttatcatcacgggaaggctaatgttgttgccgatgccttgagtaggaagacgtggcatatatctactttgatggttaaggagttggaattgat 13354396  T
Q  139 tgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    |||||| ||  |||||||||||||    
T  13354395 tgaacaatttcgagatttgagttt 13354372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285392
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| |||||||| |    
T  14285289 catcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagttta 14285388  T
Q  150 gaga 153  Q
    ||||    
T  14285389 gaga 14285392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Original strand, 18052866 - 18052993
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| || || || || ||  | |||||||| |    
T  18052866 catccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagttta 18052965  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtc 177  Q
    ||||  ||||||| ||||| ||| ||||    
T  18052966 gagacatgagtttggtttgtgagttgtc 18052993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14937698 - 14937624
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || || ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14937698 ttttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgtc 14937624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15365291 - 15365217
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || || ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15365291 ttttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgtc 15365217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 435
Target Start/End: Original strand, 8211357 - 8211426
Alignment:
Q  366 atgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8211357 atgaagagttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctac 8211426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 108
Target Start/End: Original strand, 21673466 - 21673527
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  21673466 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatggtttgagtaaaaagactttgcatatgtc 21673527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4440914 - 4440870
Alignment:
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4440914 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgacgaagatgt 4440870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13354136 - 13354092
Alignment:
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  13354136 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgt 13354092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 435
Target Start/End: Original strand, 14285554 - 14285674
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  |||| || ||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | || || ||||| |  ||||||||    
T  14285554 ttgatgatcagggtgtgttgagattcagagggaggatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagctt 14285653  T
Q  415 gagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  14285654 gagtattcatcctggagctac 14285674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17925002 - 17924874
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |  ||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  17925002 ttttcagttgagttatcatcctgggaaggaaaatgttgttgtcgacgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 17924903  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  17924902 ttgattgagaagtttcgagatttgagttt 17924874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 14124 - 14533
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  14124 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgag 14223  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14224 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatatgaacgtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctgaaaagta 14323  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  14324 ttaaagaggcacagaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcaaactgaagacaatgaatttaaaatcgatgatcaaggtgtgct 14423  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14424 gaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 14523  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  14524 acgaagatgt 14533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Original strand, 19006 - 19324
Alignment:
Q  125 gagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||    
T  19006 gagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatatgaacgtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttc 19105  T
Q  225 tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatca 324  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  19106 tgaaaagtattaaagaggcacagaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcaaactgaagacaatgaatttaaaatcgatgatca 19205  T
Q  325 aggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcac 424  Q
    |||| || |||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  19206 aggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcat 19305  T
Q  425 ccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19306 ccgggagctacgaagatgt 19324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5264 - 4855
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||    
T  5264 ttttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaaaagtttgag 5165  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5164 ttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 5065  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  5064 ttaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgactttaaaatcgatgatcaaggagtgtt 4965  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4964 gagattccgagccagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 4865  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    || |||||||    
T  4864 acaaagatgt 4855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12394 - 11985
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||    
T  12394 ttttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaaaagtttgag 12295  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12294 ttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaagattgatagtgaatttctgaaaagta 12195  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  12194 ttaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgactttaaaatcgatgatcaaggagtgtt 12095  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12094 gagattccgagccagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 11995  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    || |||||||    
T  11994 acaaagatgt 11985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40474389 - 40473993
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  40474389 tatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagt 40474290  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  40474289 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggtatgctgaaaattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 40474190  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  40474189 taaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 40474090  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40474089 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgt 40473993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12477949 - 12477553
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  12477949 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 12477850  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  12477849 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 12477750  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  12477749 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 12477650  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12477649 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 12477553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 19777456 - 19777852
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  19777456 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 19777555  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  19777556 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 19777655  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  19777656 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 19777755  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19777756 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 19777852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23957096 - 23956700
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  23957096 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 23956997  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  23956996 ttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcaca 23956897  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  23956896 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 23956797  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23956796 agaatttgtatccaggacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 23956700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 8052286 - 8052682
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  8052286 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 8052385  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  8052386 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 8052485  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8052486 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 8052585  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8052586 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagattcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 8052682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14681916 - 14681520
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  14681916 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgttttgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 14681817  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  14681816 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 14681717  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14681716 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttagtttctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgagga 14681617  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14681616 agaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 14681520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 29038067 - 29038463
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  29038067 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 29038166  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  29038167 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcaca 29038266  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  29038267 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 29038366  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29038367 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 29038463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8387761 - 8387365
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  8387761 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 8387662  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||    
T  8387661 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgagaggtatcaaggaagcaca 8387562  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8387561 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 8387462  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8387461 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 8387365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12525025 - 12524629
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  12525025 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 12524926  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  12524925 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 12524826  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  12524825 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactaaagacagtgattttaaaatcgatgatgaaggtgtgttgagattccgagga 12524726  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  12524725 agaatttgtattccagacgatggagagattaaggagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccggaagctacgaagatgt 12524629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18298554 - 18298158
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  18298554 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 18298455  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18298454 tccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 18298355  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||    
T  18298354 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtttagattccgagga 18298255  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18298254 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgt 18298158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27712685 - 27712289
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  27712685 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 27712586  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||   | || || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  27712585 tcagagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcaca 27712486  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||    
T  27712485 gaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgagga 27712386  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27712385 agaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 27712289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 15146548 - 15146944
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  15146548 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagt 15146647  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15146648 ttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatgaaggaagcaca 15146747  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||| | || ||| ||||||| || |||||     
T  15146748 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttattggtagctagtaatcagactgaagaaggtgaatttaaggtcgataaacatggtgtgttgagattccgaggt 15146847  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |||| |||| ||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15146848 cgaatatgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 15146944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 14302641 - 14303037
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  14302641 tatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaatttcttgaacagt 14302740  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||    
T  14302741 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaagggagcaca 14302840  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  14302841 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgagga 14302940  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||  | |||| || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14302941 agaatttgtatcccagacaataaagagtttaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 14303037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 14850029 - 14850425
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  14850029 tatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaaaagagtttgagttgcttgagcagt 14850128  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| ||||| |||||| ||||| || ||||||| || ||  | ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| ||    
T  14850129 ttagagatctgaggttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaaactgtgaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgca 14850228  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||  | |||||||||||  ||||||| || |||||     
T  14850229 gaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagattgaagatagagactttaaggtcgatgatcaaggcgtgttgagattccgaggc 14850328  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14850329 agaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagattcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgt 14850425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14695475 - 14695066
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||    
T  14695475 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgttaaaagagtttgag 14695376  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||| || | || ||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  14695375 ttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagta 14695276  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | ||||||||  | ||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  14695275 tcaaagaagcgtagaaaatagatgttaagtttgtggacttgttggtttctagtaattaaactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgtt 14695176  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14695175 gagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtactcatccgggagct 14695076  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  14695075 acgaagatgt 14695066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 18226109 - 18226505
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| | |   |||| ||||| ||||||| ||    
T  18226109 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtcagctttgatggttagaaagtttgagttacttgaacggt 18226208  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || ||||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18226209 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 18226308  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || ||| ||||||| || |||||     
T  18226309 taaatttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgagcacggtgtgttgagattccgaggt 18226408  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18226409 cggatttgcattcctgacgatgcagatatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 18226505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 16354108 - 16354504
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||| | ||||    
T  16354108 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttaagcagt 16354207  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16354208 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 16354307  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| || | | |||| || || |||||     
T  16354308 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggtagctaataatcagaccgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatgatgtgttaagattccgaggt 16354407  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
       ||||| | ||   ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16354408 cagatttgaattcctaacggtgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 16354504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14160819 - 14160423
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||| | |    
T  14160819 tatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagaccttgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgctagaataat 14160720  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||| || |||||||| ||||||||    
T  14160719 ttagagatttgagtttggtctgcgaattgtcgtctcagagtgtaaagttaggaatgctgaagattgataatgaatttctaaagagtattaaggaagcaca 14160620  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||  |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||| || || ||     
T  14160619 gaaagatgatgttaaatttgtggacttgttggttgctgataatcagtcagaagatagtgactttaaagttgatgaccaaggagtgttgagattccgcggt 14160520  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14160519 agaatttgtattccagacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagccatcggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 14160423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 409
Target Start/End: Original strand, 18614487 - 18614849
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||||| |||||||| |    
T  18614487 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaat 18614586  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||   |||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18614587 tcagagatttgagtttaatttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 18614686  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||| ||||||| ||  ||||     
T  18614687 gaaatttgatgtcaagtttgtagatttattggttgctagtaatcagactgaagactgtgattttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattctgaggt 18614786  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagt 409  Q
     | ||||| | ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18614787 cggatttgcattcttgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagt 18614849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8707269 - 8706871
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |  ||||| ||||||||||||||||    
T  8707269 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagt 8707170  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcac- 245  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||  || | ||||||||| | ||||||||||||||  | ||||  ||  |||| | |||||||||||| |     
T  8707169 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtgagttcttgaacaatattaaagaagcgcg 8707070  T
Q  246 -ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgag 344  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  8707069 cagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgag 8706970  T
Q  345 gaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||||||| ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  8706969 gcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtaacttaagtattcatccgagagctacaaagatgt 8706871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 252 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7091576 - 7091385
Alignment:
Q  252 ttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||    
T  7091576 ttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtatgat 7091477  T
Q  352 ttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  7091476 ttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattattgaagagagccatagaagtaacttaagtatttatccgggagctacgaagatgt 7091385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 15413949 - 15414345
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || || || |||||||| || || |    
T  15413949 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagaatttgagttgctggagcatt 15414048  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||  ||||||  ||  |||| |||||||||||||||||    
T  15414049 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtgagttcttgaatagtattaaagaagcaca 15414148  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     || |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||  || ||||||| ||| ||||||| ||  |||||    
T  15414149 gaaggttgatattaagtttgtggatttgttggttgttagtaatcaaactgaagaaagtgatttcaaggttcatgatcagggtgtgttgagattctgagga 15414248  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||   |  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||    
T  15414249 agaatttgtattcctcataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagtttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 15414345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 15002290 - 15002675
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||  | ||||| |    
T  15002290 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctatagcagttta 15002389  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| || ||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||      
T  15002390 gagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacagtatcagagaagcacaac 15002488  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    ||| |||||| |||||||| || ||  |||||||||||||| | ||||||||   ||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  15002489 aagatgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatgaaactgaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 15002588  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||  |||||||  |||| ||  ||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15002589 aatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattctagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctac 15002675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27901732 - 27901347
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  27901732 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagttta 27901633  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||  ||||| || | ||||| ||| | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||      
T  27901632 gagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtaaagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtataagagaagcacaac 27901534  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||  |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |||| ||  | ||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||    
T  27901533 aagttgatgcaaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcag 27901434  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  27901433 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccggaagctac 27901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 443
Target Start/End: Original strand, 1639364 - 1639484
Alignment:
Q  323 caaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 422  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1639364 caaggtgtgttgaggtttcgaggtagaatttgtatttcagacaatgaagagattaaggagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 1639463  T
Q  423 acccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  1639464 acccgagagctacgaagatgt 1639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15078911 - 15078588
Alignment:
Q  120 taaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgt 219  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| ||||| || | |||||| || | |||||| |||||||  ||||||     
T  15078911 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 15078812  T
Q  220 atttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgat 319  Q
    |||  |||| ||||| |  |||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||  ||| |||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  | |||    
T  15078811 attcttgaatagtatcagggaagcacagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatggatgctagtaatcaaactgaagaggaagatttcaaggtcgat 15078712  T
Q  320 gatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagta 419  Q
    || || ||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||| ||   ||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15078711 gagcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcatagaagtagcttaagta 15078612  T
Q  420 ttcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||| || |||||||| |||||||    
T  15078611 ttcatccaggagctacaaagatgt 15078588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15247266 - 15246885
Alignment:
Q  54 cgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagaga 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| || ||||| |||||    
T  15247266 cgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagaga 15247167  T
Q  154 tttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacataaagt 252  Q
     |||||| | || |  ||| || ||  | |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||||||  ||||    
T  15247166 cttgagtcttgtctatgagttgacacttcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 15247068  T
Q  253 tgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatt 352  Q
     ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  15247067 ggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcaggggaagaatt 15246968  T
Q  353 tgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||| ||  ||  |||| ||| |||| ||| ||||||| || || ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15246967 tgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctac 15246885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15071705 - 15071602
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  15071705 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagttta 15071606  T
Q  150 gaga 153  Q
    ||||    
T  15071605 gaga 15071602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 15358046 - 15358439
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || || ||  |  | ||| | |    
T  15358046 catccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggaatttgatttaatatagcagctta 15358145  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    |||| |||||| | || || ||  || || || | |||||  || |||| |||||||||||| ||||||  ||  |||| |||||   |||||||||  |    
T  15358146 gagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcatagtgtacagttagggatgctgaagattaatagtgacttcttgaatagtatccgagaagcacagca 15358245  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||   ||||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  15358246 agtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaga 15358345  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||| | ||  | ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15358346 atttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagtaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgt 15358439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15320485 - 15320322
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  15320485 tatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatggtaaaggattttgagttgcttgagcagt 15320386  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagat 210  Q
    | ||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |||||||| || | |||||| |||||||    
T  15320385 ttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatgttgaagat 15320322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 3263720 - 3264105
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  3263720 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 3263819  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||   |||||| || |    
T  3263820 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtg-atttcttgaacagtatccgagaagctcaga 3263918  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||  ||| | |||||||| || ||| ||  | || ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| ||    
T  3263919 aagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtag 3264018  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    | |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3264019 agtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctac 3264105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 11206157 - 11206542
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | || || || || ||| | ||||||||||    
T  11206157 catcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttca 11206256  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||  ||||| | || || ||  |||||||| ||||| |  || | || ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||   |||||| || |    
T  11206257 gagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggggatgttgaagattgatagtg-atttcttgaacagtatctgagaagctcaga 11206355  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| ||  | |  ||||| | || || ||  ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||||||    
T  11206356 aagtggatttaaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatgacaccgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaag 11206455  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
      |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11206456 ggtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctac 11206542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33223977 - 33223876
Alignment:
Q  342 gaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33223977 gaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagat 33223878  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  33223877 gt 33223876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 443
Target Start/End: Original strand, 1648215 - 1648596
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| || ||||    
T  1648215 gctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtt 1648314  T
Q  162 tagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgtta 260  Q
    ||||||| ||| ||||| || | ||| | ||  | || |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||   |||||| ||  | || ||||| |    
T  1648315 tagtttgtgagttgtcacctcaaagtattaaatttgggatgctgaagattaacagtg-atttcttgaatagtatccgagaagctcaacaggtggatgtaa 1648413  T
Q  261 agtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactct 360  Q
    | ||||| || ||  || ||||| ||||| | |||||  | |||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||  || | |||||||||| ||     
T  1648414 aatttgttgatttaatgattgctggtaatgaaactgagaatggtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagattcagaagcagaatttgtattcc 1648513  T
Q  361 agacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||  |||||||| |||| | | | ||||| || || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1648514 tgataatgatgagttgaaaaggttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 1648596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16149057 - 16148664
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| || ||||| ||| | || ||||| |    
T  16149057 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagttta 16148958  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | || || ||  || || || ||||| |  || | || |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||   |||| | ||      
T  16148957 gagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacagtatacgagaaactcagc 16148859  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||   ||||| ||  |||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||   ||||||    
T  16148858 aagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaag 16148759  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||| | | |||| ||| ||| ||| || || ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16148758 aatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctggaggaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgt 16148664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16153203 - 16152810
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| || ||||| ||| | || ||||| |    
T  16153203 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagttta 16153104  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | || || ||  || || || ||||| |  || | || |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||   |||| | ||      
T  16153103 gagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacagtatacgagaaactcagc 16153005  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||   ||||| ||  |||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||   ||||||    
T  16153004 aagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaag 16152905  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||| | | |||| ||| ||| ||| || || ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16152904 aatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctggaggaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgt 16152810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 29452463 - 29452848
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  29452463 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttca 29452562  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| ||||||||||  ||  |||| |||||   |||||| || ||    
T  29452563 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaa 29452662  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||  ||| | |||||||| || ||| ||  | |  ||||| | ||||| ||   |||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| |||    
T  29452663 agaagatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatgacactgaggataatgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaga 29452762  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29452763 gtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctac 29452848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 44660792 - 44661177
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || || ||| | ||||||||||    
T  44660792 catcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaagaaaactttgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttca 44660891  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||  ||||| | || || ||  |||||||| ||||| |  || | || ||| |||| |||||||| |  ||  |||| |||||   |||||| || ||    
T  44660892 gagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagcgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaa 44660991  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||| ||| | |||||||| || ||| ||  | |  ||||| | || || ||  ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||| |||    
T  44660992 agtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatgataccgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaga 44661091  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||||| ||  ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44661092 gtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctac 44661177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 15292068 - 15292196
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  15292068 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 15292167  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  15292168 ttgattgagaagtttcgagatttgagttt 15292196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14998678 - 14998604
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14998678 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 14998604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20892003 - 20891935
Alignment:
Q  375 tgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20892003 tgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgt 20891935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9292190 - 9292069
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| || ||| |||    
T  9292190 ttgagttatcatcctgggagggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattggttg 9292091  T
Q  141 aacagttcagagatttgagttt 162  Q
    | |||||  |||| ||||||||    
T  9292090 agcagtttcgagacttgagttt 9292069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 13248979 - 13248933
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13248979 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 13248933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 12341775 - 12341903
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || || |||||||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||  |  | ||| | |||||||| |||    
T  12341775 tttttagttgagttatcatcctgggaaggcaaatgttgtggcggattctttgagtatgaagtctttgcatatgtcttccttgatggttaaggagttggag 12341874  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  | |||||||||||    
T  12341875 ttgattgagcagtttcgggatttgagttt 12341903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2286 - 1877
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| ||||| ||     
T  2286 ttttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagtttgaa 2187  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    ||| | |||| ||| |||||| |||||||||| || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2186 ttgttggaacggttgagagatatgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagta 2087  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2086 ttaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttggtagttgctagtaatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 1987  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
     || || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1986 cagattccgaggtagaatttgtattctagacgatgaggagatgaagaagatgattctcaaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 1887  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||| ||||    
T  1886 acgaaaatgt 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7765 - 7356
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  7765 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgag 7666  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7665 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatccgaaagtgtgaagctagaaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagta 7566  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||||| ||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  7565 ttaaagaggcacagaaaaccgatgttaagtttgtggacttgttggttgttagagatcagactaaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtact 7466  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
     |||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  7465 aaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatccatagaagtaacttgagtattcatctgggagct 7366  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  7365 acgaagatgt 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3969 - 3775
Alignment:
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||| ||| ||| ||||||||||  |||| ||    
T  3969 aagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagagagtgacttcaaggttgatgttcagggtgtgttgaggttcagagggag 3870  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | || |||  |||||||| |||| ||| | ||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3869 aatttgcattccagataatgatgagttgaaaaagtttattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 3775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 108737 - 109133
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  108737 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagt 108836  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  108837 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 108936  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  108937 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 109036  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| || || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109037 agaatttatattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 109133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 113952 - 113543
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||| | ||||| || |||    
T  113952 ttttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgag 113853  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||  ||||| |  |||||||| || | || ||| |||| ||  ||| || |||  |||| ||||    
T  113852 ttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagta 113753  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||| ||  | |||||||| ||| |||| || ||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||  ||  ||||||| || ||| ||||    
T  113752 tcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagcttgtggatttaatggttaatagtaatcaaactgaagatagtgattgcaaggttgatgaacacggtgtgtt 113653  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| ||  |||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  | |||||||||||| || |||||||||    
T  113652 gagattcggaggcagaatttgtattcttgacaacgatgagatgaaaaggctgattttggaagaaagtcacaagaatagcttgagtatccatccgggagct 113553  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  113552 acgaagatgt 113543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 47 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8319 - 7925
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  8319 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagt 8220  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8219 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcaca 8120  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8119 gagagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 8020  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8019 agaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 7925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 69 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1054 - 680
Alignment:
Q  69 ttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttg 168  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1054 ttgtagcagatgctttaagtaggaagaccttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttaagagatttgagtttagtctg 955  T
Q  169 cgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgta 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  954 cgagatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatccaaaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaggcacataaaattgatgttaagtttgta 855  T
Q  269 gacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatg 368  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || |||| || || |||||| |    
T  854 gagttgttggtggctagtaatcagactgaggatagtgattttaaaatcgatgatcaagctgtgttgaggtttcgaggtaggatttctattccagacgacg 755  T
Q  369 atgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  754 atgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgattattcatccgggagctacgaagatgt 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 56 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131094
Alignment:
Q  56 ggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 131378  T
Q  156 tgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttga 255  Q
    |||| ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  131377 tgagcttagggtgtgagatgtcgtctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatt-ctgaaaagtattaaagaggcacagaaagctga 131279  T
Q  256 tgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgt 355  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||    
T  131278 tgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactgaggtttcgaggtcggatttgt 131179  T
Q  356 actctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
    | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  131178 attcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagcaacttgagtattcatccgggagctacgaaga 131094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 46 - 443
Target Start/End: Original strand, 3381 - 3779
Alignment:
Q  46 ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacag 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||  |||| ||| | || |||||  | ||||||||||||    
T  3381 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatggttaaagagttttaattgcttgaacag 3480  T
Q  146 ttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaa-gca 244  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  | |||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |  ||| || ||||||||||||||| |||    
T  3481 tttagagatttgagtttagtctgcgaattttcatcatagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgataataaattcctaaaaagtattaaagaaagca 3580  T
Q  245 cataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgag 344  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||  |||||| || ||||    
T  3581 tagaaagttgatgttaagtttgtagacttggtggttgctaataatcagactgaaggtagtgattttaaaatcgatgctcaaggtgcgttgagattccgag 3680  T
Q  345 gaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | |||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  3681 gtagaatttgtattcctgacggtgatgagatgaaaaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgt 3779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 28294 - 28694
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| |||| ||||||||||    
T  28294 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttctagtttcttgaacagt 28393  T
Q  147 tcagagatttgagtt----tagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaag 242  Q
    | |||| | |||| |    ||||||| |||  |||| || |||||||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |    
T  28394 ttagagctgtgagctagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctaaagattgaaagtgaatttctaaaaagtattaaagagg 28493  T
Q  243 cacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcg 342  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||| ||||||| || ||    
T  28494 cacaaaaagttgatgtcaagtttatagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagtttccg 28593  T
Q  343 aggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatg 442  Q
    |||  | ||||||| ||   ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28594 aggtcggatttgtattccttacgatgtagagttgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatg 28693  T
Q  443 t 443  Q
    |    
T  28694 t 28694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 60130 - 59747
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||| || || |||||||  | ||| ||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  60130 catccgggtaagggtaatgttgttgcagatgctttaaataggaaaacattacatatgtttgatatgatggtta--gagttggagttgcttgaacaattca 60033  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
     |||||||||||| ||||| ||  ||||  |  ||||||||||  |||| |||||||||||  | | || ||||||||| ||||| ||| |||  || ||    
T  60032 aagatttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgtagagtgtgaaattaggaatgctgaagatcaacaatgaatttctgaatagtatcaaataagatcagaa 59933  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||  ||||||  |  ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    |||    
T  59932 agaagatgtgaagttagtagacttaatggttgggaacaatcagactaaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaataga 59833  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||| ||  || |||   || ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  59832 atttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctac 59747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 54854 - 54982
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||| ||     
T  54854 tttttagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtataaagactttgcatgtgtctgctttaatggttaaggagttggaa 54953  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  54954 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 54982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 102619 - 102217
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  102619 ttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttg 102520  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  102519 aacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtgaagctagaaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaaga 102420  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||     
T  102419 agcgcagaaagtcgatgttaagtttgtagatttgttggttgatagtaatgagactgaaaatagtgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattc 102320  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  102319 cgaggtagaatttgtattcctgacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaa 102220  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  102219 tgt 102217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1979 - 1661
Alignment:
Q  124 ggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtattt 223  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1979 ggagttcgagttacttgaacattttagagatttgagtttggtatgtgagatgtcatctgatagtgtgaagttaggaatgttgaagattgatagtgaattt 1880  T
Q  224 ctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatc 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  1879 ctgaagagtattaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacgatc 1780  T
Q  324 aaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattca 423  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1779 aaggtgtgttgagatttagaggaaggatttgtattctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcattgaagtagtttgagtattca 1680  T
Q  424 cccgggagctacgaagatg 442  Q
     ||||||||||||||||||    
T  1679 tccgggagctacgaagatg 1661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 25446 - 25855
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||    
T  25446 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgag 25545  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  25546 ttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtgaaacttggaatgctaaagattgatagtgaattcctgaacagta 25645  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| | ||  ||||    
T  25646 ttaaaaaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagcgattttaaaatcgatgattagggagtgtt 25745  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | |||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25746 gcgttttcgagggagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 25845  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  25846 acgaagatgt 25855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 149946 - 149554
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| | ||| | || || || || ||||| || ||||| |    
T  149946 catccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagttta 149848  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||||||      
T  149847 gagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaac 149749  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||     
T  149748 tagtggatgtcaagtttgtggacttgatggttgctggtaatgaaactgaggaaagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaa 149649  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||||| || || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  149648 aatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 149554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 181317 - 181243
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  181317 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttggtgctgatgctttgagtagaaaaactttgcatatgtc 181243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8777 - 8381
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  8777 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtgagagagttcgagttacttgaacagt 8678  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  8677 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaaa 8578  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| || | ||||    
T  8577 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatggtcaaggtgtgttgagattccaagga 8478  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8477 agaatttgtattccagacaatggagagattacgaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 8381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 128 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 49482 - 49167
Alignment:
Q  128 ttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctga 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||    
T  49482 ttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctga 49383  T
Q  228 aaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaagg 327  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  49382 aaagtattaaagaggcacaaaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaagg 49283  T
Q  328 tatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccg 427  Q
    | || |||||||||||||  | ||||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||    
T  49282 tgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgacaatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccataaaagtaacttgagtattcatccg 49183  T
Q  428 ggagctacgaagatgt 443  Q
    | || |||||||||||    
T  49182 gcagatacgaagatgt 49167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9854 - 9458
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  9854 tatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattacttgaacagt 9755  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  9754 tcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctgagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaca 9655  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| || |||| || ||||||    
T  9654 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcggactgaagacaatgatttgaaaatcgatgatcaaggtgtggtgagattccgagga 9555  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9554 agaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 9458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16316 - 15920
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  16316 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagttggaagacattgcatatgtcttctatgatggtcagagagttcgaattacttgaacagt 16217  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  16216 tcagagataagagtttggtttgcgaatggtcacctgagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaatttcttaaaagtatcaaggaagcaca 16117  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||||||    
T  16116 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcggactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtggtgagattccgagga 16017  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16016 agaatttgtattccagacaataaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 15920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44528 - 44138
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || ||||||||||    
T  44528 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttactcgaacagttca 44429  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||   |||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  44428 gagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagttcctgaagagtatcaaggaagcacagaa 44329  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  44328 agttgatgtcaagtttgtggacttg---gttgctagtgaccagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagagaga 44232  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| |  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44231 atttgtattacagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcactcgggagctacgaagatgt 44138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 225 - 435
Target Start/End: Original strand, 720 - 930
Alignment:
Q  225 tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatca 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  720 tgaaaagtattaaagaagcacaaaaagttgatgtcaagtttgtggccttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatca 819  T
Q  325 aggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcac 424  Q
     ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  820 tggtgtattgaggtttcgaggtagaatttgtattctagacgatgaagagataaagaagatgattctggaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcat 919  T
Q  425 ccgggagctac 435  Q
    |||||||||||    
T  920 ccgggagctac 930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 49427 - 49836
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||||| || |||    
T  49427 ttttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgag 49526  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||| |  |||||||| || | ||||||  ||| ||  |||||| |||  |||| ||||    
T  49527 ttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtagaaaatcaatagtgaattcttgaatagta 49626  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||  | |||  ||||||| |  |||| ||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  49627 tcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatgaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgtt 49726  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    || |||  || | |||||||| | ||  ||  | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  || ||||||||||| || |||||||||    
T  49727 gaagttcagatgcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagct 49826  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  49827 acgaagatgt 49836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 105486 - 105614
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| |||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  105486 ttttcagttaagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggat 105585  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  105586 ttggttgagcagtttcgagacttgagttt 105614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3574 - 3178
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  3574 tatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagt 3475  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  3474 ttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtaaatttctgaaaactatcaaggaagcaca 3375  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  3374 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgccagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 3275  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
      |||||||| ||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3274 ttaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgt 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 18128 - 18537
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||    
T  18128 ttttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgag 18227  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  18228 ttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaatagta 18327  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | | |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  18328 tcacaaaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttggtttctagtaatcagactgaagattgtgattttaaaatcgatgatcagggagtgtt 18427  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | ||||||   |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18428 gcgttttcgattcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagct 18527  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  18528 acgaagatgt 18537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 62957 - 63353
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||    
T  62957 tatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagtgttcgagttgcttgaacagt 63056  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||   |||| | ||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  63057 ttagagatttgagcttagtttgtgagtgctcatatcagagtgtaaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgcaaagtatcaaggaagcaca 63156  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||  | |||||| ||||||| || |||||     
T  63157 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagaaggtgactttaaagtcgaaaaacaaggtgtgttgagattacgaggt 63256  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||| | ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63257 cgaatttgaattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 63353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 109007 - 108897
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || ||||| || ||  |||| |    
T  109007 catccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagttta 108908  T
Q  150 gagatttgagt 160  Q
    |||| ||||||    
T  108907 gagacttgagt 108897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2829 - 2507
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  2829 ttttgagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 2730  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  2729 ttacttgaacagttcaaagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaagagta 2630  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  2629 ttatagatgcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgtt 2530  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    || |||| |||| ||||||||||    
T  2529 gaagtttagaggtagaatttgta 2507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 403 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2491 - 2451
Alignment:
Q  403 tagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  2491 tagaagtagcttaagtattgatccgggagctacgaagatgt 2451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8746 - 8350
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  8746 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattacttgaacagt 8647  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||   |||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||    
T  8646 ttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaaattctgaaaagtatcaaggaagcgca 8547  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8546 gaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttagttgcaagagatcggactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagga 8447  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8446 agaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 8350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 4279 - 4675
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| | |  ||||||||||||||| ||||||    
T  4279 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttaaacagt 4378  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||    
T  4379 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaagagtatcaaagaagcaca 4478  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  4479 gaaagttgatgtcaagtttttagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggttgatgaccatggtgtgttgagattccgaggt 4578  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||| | ||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4579 cgaatttgcattcctgacgatgaagagatgaagataatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 71 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181183
Alignment:
Q  71 gttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcg 170  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  171 agatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtaga 270  Q
    |   ||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctaaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtaga 181356  T
Q  271 cttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgat 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||  || |||||  ||||||||| ||  ||||||||     
T  181355 cttgttggttgctaataatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgaaattccgaggccgaatttgtattcctgacgatgaa 181256  T
Q  371 gagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  181255 gagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 181183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 100497 - 100601
Alignment:
Q  56 ggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 155  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  100497 ggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatt 100596  T
Q  156 tgagt 160  Q
    |||||    
T  100597 tgagt 100601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 66782 - 66389
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  66782 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaagaagacattgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttaaacagttca 66683  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||| || |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  66682 gagatttgagtttagtttgtgaatggtcaccttagagagtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaggcacagaa 66583  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||  |     
T  66582 agttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcggactgaagacggtgactttaaagttgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgg 66483  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  66482 atttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctacgaaaatgt 66389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 38746 - 39142
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  38746 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttgaacagt 38845  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| ||||| || |||  |||| || |||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  38846 ttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaattctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcaca 38945  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || ||| ||||||| || ||||      
T  38946 gaaagttgatgtcaattttttagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaagcttgatgaccatggtgtgttgagattccgagat 39045  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39046 cgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagactcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgt 39142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 218330 - 218739
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||    
T  218330 ttttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaagagtttgag 218429  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||  |||| | ||    
T  218430 ttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacaata 218529  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||  ||||    
T  218530 tcaaagaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacaatgattttaaaatcaatgatcagggattgtt 218629  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || ||||| |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  218630 gagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 218729  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  218730 acgaagatgt 218739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 270 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 230200 - 230027
Alignment:
Q  270 acttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatga 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  230200 acttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttatattccagacgatga 230101  T
Q  370 tgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  230100 tgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 230027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5411 - 5015
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5411 tatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgcttgaacagt 5312  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | || |||||||||||||| || ||  ||||| || |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| ||    
T  5311 ttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgca 5212  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||  | |||||||| ||  ||||| | ||||||||     
T  5211 gaaaattgatgttaagtttgtagacttgttggttgcaagtaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgttttcgaggc 5112  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5111 agaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtaatcatccgggagctacgaagatgt 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7394 - 6998
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||    
T  7394 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacattgcatatgtcctctatgatggttagagagttcgagttacttgatcagt 7295  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  |||| || ||||| |||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  7294 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtctgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttttgaaaagtattaaagaggcaca 7195  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| |  ||| ||||||| || |||||     
T  7194 aaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagcaatcaaactgaagatggtgattttaaagtcgatgaccttggtgtgttgagattccgaggt 7095  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7094 cgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgt 6998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10349 - 9954
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  10349 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggttaaggagttcgagttgcttgaacaat 10250  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |  |||||||||| ||||| | |||| ||    
T  10249 ttagagatttgagtttagtctgtgaggtgtcacctcagagtgtgaagctagggatgctaaagatcaatagcgagtttctgaaaa-tattatataagcgca 10151  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||   ||| |||||  | ||||| |||||| ||||||| ||  |||||    
T  10150 gaaagttgatgttaagtttgtgtacttgttggttgctagtaatcagacaaaagataatgactttaaggtcgatgaccaaggtgtgttgagattctgagga 10051  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10050 agaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagcattcatccaggagctacgaagatgt 9954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 79420 - 79816
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||    
T  79420 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatgatggttagagagttcgagttacttgagcagt 79519  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||  |||| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  79520 ttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 79619  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || ||||      
T  79620 aaaagttgatgtcaagtttgtagacttattggtagctagtaatcagactgaagaaggtgaatttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattacgagat 79719  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
      |||||||| ||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  79720 caaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgt 79816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 57397 - 57001
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  57397 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgcttttatggtcagagagttcgagtttcttgaacagt 57298  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||   |||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |    
T  57297 tcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttatgaagagtattaaagaggcaaa 57198  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || |||||     
T  57197 gaaagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggt 57098  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||  | ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  57097 cggatttacattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgt 57001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 196404 - 196800
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  |||||||||||||||||||| |    
T  196404 tatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttgaacaat 196503  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||  |||| || |||||||||| || || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||    
T  196504 ttagagatatgagtttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgttgaagattggtagtgaatttctgaaaagtattaaaggggtaca 196603  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  || ||||||| || |||||     
T  196604 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagttgatgaccatcgtgtgttgagattccgaggt 196703  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  196704 cgtatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagccatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgt 196800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 18993 - 19389
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||| || | |||   |  |||||||| || ||||||| ||    
T  18993 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaatacattgcatatgtccactttgatgggtagagagttcgaattccttgaacggt 19092  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| |||| || ||||| |||  |||| || |||||||||| || || || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||    
T  19093 ttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatactgaagattgatagtgaatttttgaagagtattaatgaggcaca 19192  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||  ||||||||| |||||     
T  19193 aaaagttgatgtccagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagttgatgaccatggtgcgttgaggttccgaggt 19292  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19293 cggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 19389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 277756 - 278152
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  277756 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagt 277855  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||  ||||||| ||||| |||  |||| || ||||||| || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  277856 ttagagacatgagtttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtaaaactgggaatgcttaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 277955  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || |||||     
T  277956 gaaagttgatgtcaaaattgtagactctttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggc 278055  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278056 cgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaggttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 278152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 261328 - 261292
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  261328 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 261292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 261685 - 261588
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagtt 147  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| ||||||||    
T  261685 catccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtt 261588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 32499 - 32895
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| || | ||| | || ||||||||||| |  ||||| |    
T  32499 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtccactttgatggtcaaagagttcgagttaccggaacaat 32598  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||   |||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32599 tcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 32698  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || |||||     
T  32699 aaaagttgatgtcaagtttctagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggt 32798  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32799 cggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 32895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9976 - 9580
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| | ||||||||    
T  9976 tatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacctgaacagt 9877  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatg-tcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9876 tcagagaattgagtttcgtttgtga-atgatcaccttagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcac 9778  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || |||||    
T  9777 agaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagaatgaagacggtgaatttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgagg 9678  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
      | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  9677 tcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgt 9580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 6804 - 7213
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  6804 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatgatcaaagagttggag 6903  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||  |||| ||||    
T  6904 ctgcttgaacagtttagagacttgagcttagtctgcgaagtgtcaccttagagtgtgaagttaggaatgatgaagattgttagtgaattcttgaacagta 7003  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||  | |||||||| ||  ||||    
T  7004 ttaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagataatgactttaaggtcgatgatcagggagtgtt 7103  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | ||| |||| |||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7104 gcgtttttgaggtagaatttgtattccttacgatgatgaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagct 7203  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  7204 acgaagatgt 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 98 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18009 - 17665
Alignment:
Q  98 ttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctag 197  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||| || | |||||||||||||    
T  18009 ttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtatgcaat-tgtcacctcatagtgtgaagctag 17911  T
Q  198 gtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactga 297  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910 gaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactga 17811  T
Q  298 agacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagag 397  Q
    |||   |||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17810 agataatgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagag 17711  T
Q  398 agtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17710 agtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaagatgt 17665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 16890 - 17299
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||| | ||||| || |||    
T  16890 ttttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatggtcaaggaatttgag 16989  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||  |||| | ||    
T  16990 ttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatgaattcttgaacaata 17089  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||  |||||||||| |   ||||    
T  17090 ttaaagaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagataatgacttcaaggttgatgatcaggaggtgtt 17189  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | ||  |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17190 gcgattctgaggcagaatttgtattcttgaagatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtaacttgagtattcatccgggagct 17289  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  17290 acgaagatgt 17299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13861 - 13452
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||    
T  13861 ttttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatggtaaaagagtttgag 13762  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||  |||| ||||    
T  13761 ttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtgaattcttgaacagta 13662  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | |||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| || ||  ||||    
T  13661 tcaaagaagcgcagaaaattaatgttaagtttgtggacttgttggatgctagtaatcagactggagacggtgactttaaagtcgatgaccacggcgtgtt 13562  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||| || |||||  | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13561 gagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagct 13462  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  13461 acgaagatgt 13452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3290 - 2898
Alignment:
Q  51 atccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcag 150  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  3290 atccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacaatttag 3191  T
Q  151 agatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaa 250  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||  | || ||||| |||||||| || |||    
T  3190 agatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattcttaaatagtatcaaagaagcgcagaaa 3091  T
Q  251 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaa 350  Q
       |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||    
T  3090 accgatgttaagtttgtggacttgttggttactagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggggtgttgagattctgaggcagaa 2991  T
Q  351 tttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| ||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2990 tttgtattcctaatgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgt 2898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 41262 - 41647
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||||||||    
T  41262 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttca 41361  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||| ||||| | || || ||  ||||| |  ||||| |  || | || ||| |||| ||||||||||  ||  |||| |||||   |||||| || ||    
T  41362 gagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaa 41461  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||  ||| | |||||||| || ||| ||  | || ||||| | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||  |||| |||    
T  41462 agaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaga 41561  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     |||||| ||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41562 gtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctac 41647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 46328 - 46713
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| || || || ||| | || ||||| |    
T  46328 catcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagttta 46427  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| ||||   | || || ||  || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||||||      
T  46428 gagacttgatccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacagc 46526  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| |  |||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  46527 aagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaagctgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 46626  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||| |||| ||  ||  |||||||  |||| ||| | ||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  46627 aatctgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctac 46713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 3331 - 3727
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||||| | ||||||||    
T  3331 tatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacctgaacagt 3430  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatg-tcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| || |||  ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3431 tcagagaattgagtttcgtttgtga-atgatcaccttagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcac 3529  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || |||||    
T  3530 agaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagaatgaagacggtgaatttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgagg 3629  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
      | ||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  3630 tcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgt 3727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26354 - 25958
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| ||| | ||||    
T  26354 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttactttatcagt 26255  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||| ||||||| ||||| ||   |||| || ||| |||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26254 ttagagatatgagttttgtttgtgattggtcacctcagattgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 26155  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || | | |||| || || |||||     
T  26154 gaaagttgatgttaagtttgtatacttgttggttgctattaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatgatgtgttaagattccgaggt 26055  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
       ||||| | ||   ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26054 cagatttgaattcctaacggtgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 25958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 311
Target Start/End: Original strand, 29497 - 29761
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  29497 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagt 29596  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||    
T  29597 ttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactggaaatgctgaagattgatagtgaatttttgaaaagtatcaaggaagcaca 29696  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgatttta 311  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29697 gaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgcttgtaatcagactgaagatggtgacttta 29761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 434
Target Start/End: Original strand, 29822 - 29867
Alignment:
Q  389 cttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagcta 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29822 cttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagcta 29867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 13994 - 14401
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  13994 ttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatcaaagagttggag 14093  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     |||| |||||||| | |||  ||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||  || |||    
T  14094 ctgctcgaacagtttaaagacctgagtttagtttgtgagttgtcaccatagagtgtgaagttaggaatgcagaagattgatagtgaatttct-taatgta 14192  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||   | ||||||||||||||  |||| |||||  | |||||||| ||  ||||    
T  14193 ttaaagaagcgcagaaagtcgatgtaaagtttgtagatttatttgttg-ggggaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgtt 14291  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14292 gcggtttcgaggcagaatttgtattcctgactatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatcagggagct 14391  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  14392 acgaagatgt 14401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 183 - 443
Target Start/End: Original strand, 2876 - 3136
Alignment:
Q  183 agagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 282  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2876 agagtgtgaaactaggaatgctgtagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgc 2975  T
Q  283 tagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaag 382  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||  |||||||  |||||||||||     
T  2976 tagtaataagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgaggttccgaggtcggatttgtattcctgacgatgtagagatgaagaaa 3075  T
Q  383 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3076 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgt 3136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Original strand, 15395 - 15717
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||    
T  15395 ttttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaagagtttgag 15494  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| | || ||||| | ||||||||||| |||  |||| ||||    
T  15495 ttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgctaaggattgatagtgaattcttgaacagta 15594  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  15595 tcaaagaagcgcataaaattgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaaatcgatgatcagggagtgtt 15694  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    ||| || ||||| ||||||||||    
T  15695 gagattccgaggcagaatttgta 15717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 115831 - 116227
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||| | ||| |||| |||||||    
T  115831 tatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatcaaagagctggagctgctcgaacagt 115930  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |||||  |||||||||| || ||  ||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||   |||||||||| |  ||    
T  115931 ttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgatgattgatagtgaatttatgattggtattaaagaggtgca 116030  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||  ||| | | ||||||||||||||  |||| |||||  | |||||||| ||  ||||| | ||||||||     
T  116031 taaagttgatgtaaagtttgtagattcatttattggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggc 116130  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  116131 agaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 116227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 188 - 443
Target Start/End: Original strand, 1 - 256
Alignment:
Q  188 gtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagta 287  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||      
T  1 gtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacatagagttgatgtaaagtttgtggatttgctggttgccagag 100  T
Q  288 atcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgat 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| || ||||| |||||||||| || |||| | || ||||| |||||||||||    
T  101 atcaggctgaagacggtgattttaaaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacaacgaagagattaagaagatgat 200  T
Q  388 tcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 tcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24847 - 24544
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  24847 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagt 24748  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  24747 ttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcaca 24648  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||| ||||||| || ||| ||    
T  24647 aaaagttgatggcaagtgtgtagacttgctggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgatga 24548  T
Q  347 agaa 350  Q
    ||||    
T  24547 agaa 24544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24552 - 24482
Alignment:
Q  373 gatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  24552 gatgaagaaaatgattattgaagagagtcgtagaagtagcttgagaattcatcgaggagctacgaagatgt 24482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 220 - 436
Target Start/End: Original strand, 39002 - 39218
Alignment:
Q  220 atttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgat 319  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  39002 atttctaaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgat 39101  T
Q  320 gatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagta 419  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39102 gatcaaggagtgatgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttgagta 39201  T
Q  420 ttcacccgggagctacg 436  Q
    |||| ||||||||||||    
T  39202 ttcatccgggagctacg 39218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 161
Target Start/End: Original strand, 38861 - 38988
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  38861 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 38960  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38961 ttgcttgaacagttcagagattcgagtt 38988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 441
Target Start/End: Original strand, 39685 - 40079
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |    
T  39685 tatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaat 39784  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||  || ||||| ||||| | |||||| |||||||  | | ||  ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  39785 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatcaaagaagcaca 39884  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  39885 aaaagttgatattaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggcgtgttgagatttcgagga 39984  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
    |||||||||| ||   |  |||||||  |||| ||| ||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  39985 agaatttgtattccttataatgatgaattgaaaaagttgattttagaagatattcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagat 40079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39950 - 39731
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  39950 ttttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgag 39851  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||    
T  39850 ttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttttgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataacgaattcctgaagagta 39751  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagtt 253  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  39750 ttaaagaagcacagaaagtt 39731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 228
Target Start/End: Original strand, 7566 - 7760
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  7566 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgag 7665  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  7666 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaa 7760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 24005 - 24394
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  24005 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagt 24097  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| |||||||   || ||||||||||| |  ||||| |||||||  | ||||  ||  |||| | |||||||||||| ||    
T  24098 ttagagacttgagtctagtttgtgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacaatattaaagaagcgca 24197  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  24198 gaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggc 24297  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24298 agaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 24394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 202394 - 202790
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| |    
T  202394 tatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacatt 202493  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||  || ||||||||||| | |||||| |||||||  | ||||  ||  |||| | |||||||||||  ||    
T  202494 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacaatattaaagaagtgca 202593  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||||||| || || ||     
T  202594 gaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctaaaaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgcggt 202693  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||  ||  |||||||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  202694 agaatttgtattcctgataatgatgagttaaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaagatgt 202790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 118619 - 118491
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| || ||||| |||    
T  118619 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatgatcaaagagttggag 118520  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  118519 ctgctcgaacagtttagagacttgagttt 118491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 323816 - 323688
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||| | ||| || ||||||||  |||| ||| | ||| | || || ||||| |  ||||||||    
T  323816 ttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattttggaggaaagtcacaagagtagctt 323717  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  323716 gagtattcatccgggagctacgaaaatgt 323688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 324074 - 324013
Alignment:
Q  57 gtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatg 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  324074 gtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctttaatg 324013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 48481 - 48096
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||| || ||||| |    
T  48481 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggattttgagttgctagagcagttta 48382  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| | ||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||| | ||||||||||     
T  48381 gagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgagtagtatcagagaagcacatc 48283  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    | |||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  48282 aggttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatgaaggtgtgttgaggttcagaggaag 48183  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48182 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctac 48096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 9929 - 10338
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||   || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || || || |||    
T  9929 ttttgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatcaaagaattggag 10028  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||  ||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10029 ctgcttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaatagta 10128  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    |||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || ||  ||| | | || |||||||||||  |||| |||||  | || ||||| ||  ||||    
T  10129 ttaaagaagcgcaaaaagcggatgtaaagtttgtagatttatttattggtggaaaccagactgaagatagtgactttaaggtcgacgatcagggagtgtt 10228  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    | | || ||| | |||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10229 gcgattccgaagcagaatttgtattcctgacgacgatgacatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatacatccgggagct 10328  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    || |||||||    
T  10329 acaaagatgt 10338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 443
Target Start/End: Original strand, 1 - 384
Alignment:
Q  60 aagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 159  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  160 tttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgt 258  Q
    | ||||||| ||| ||||| || |||||||| || | |||||| |||||||  |||||| ||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgaacaatatcagagaagcacataaaattgatgt 199  T
Q  259 taagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtact 358  Q
     | |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| | |    
T  200 catgtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaacttgcatt 299  T
Q  359 ctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    || ||   ||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  300 cttgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10817 - 10508
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || || || ||||||||||||||||    
T  10817 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagaatttgagttgcttgaacagt 10718  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||  || ||||||||||| |  ||||| |||||||  | |||| |||  |||| |||||||||||||| ||    
T  10717 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtgaattcttgaacagtattaaagaagcgca 10618  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||| ||||| ||||||| |  |||||     
T  10617 gaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatgaaggtgtgttgagataccgaggc 10518  T
Q  347 agaatttgta 356  Q
    ||||||||||    
T  10517 agaatttgta 10508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 15642 - 16035
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||| | ||||||||||    
T  15642 catcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagactttgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttca 15741  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    ||||  ||||| | || || ||  |||||||| ||||| |  || | || | | |||| ||||||| ||  ||  |||| |||||   |||||| || ||    
T  15742 gagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatatagttgggaaggttgaaaattgataatgacttcttgaatagtatccgagaagctcaaaa 15841  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||| ||| | |||||||| || ||| ||  | |  ||||| | ||  | ||  ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||| |||    
T  15842 agtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatgataccaaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaga 15941  T
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     |||||| ||  ||  |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15942 gtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgt 16035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2288 - 1892
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||  |||| ||| |||  |||||||    
T  2288 tatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggttaaaaagttggagctgcacgaacagt 2189  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | |  ||  ||||||| ||||| ||  ||||| || ||||||| ||| | || ||| |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  2188 ttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtgaatttttgaacagtattaaagaagcaca 2089  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     |||   ||| | ||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||| ||  ||||| | ||||||||     
T  2088 gaaaacggatctaaagtttgtagatttattgattggtggaaatcagactgaggatagtgactttaaagttgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggc 1989  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  1988 agaatttgtattcttgacaatgatgagataaagaagatgattctcgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctataaagatgt 1892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Original strand, 8572 - 8631
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaa 93  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8572 ttttgagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagtaggaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3553 - 3168
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || || || |    
T  3553 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctattatggtaaaggagtttgagttgctagagcatttta 3454  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||      
T  3453 gagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacagtatcagagaagcacagc 3355  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||  |||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| | | ||| ||||||||||  |||||||    
T  3354 aagttgatgccaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatggtgagggtgtgttgaggttcagaggaag 3255  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3254 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagatgattctggaagaatgtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctac 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11170 - 10777
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  11170 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 11071  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| ||||  || |||||||| || | |||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  11070 gagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacata 10972  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||  |||||||||| ||| | |||||| | ||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  10971 aagtttatgtaaagtttgttgatttaatggttgctagcaatgaaactgaaaatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 10872  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||| | ||| ||  |||||||  |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10871 gatttgcattcttgataatgatgatttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacagaagtagcctaagtattcatccgggagctacaaagatgt 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4144
Alignment:
Q  212 gatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgatttta 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  4355 gatagtgaatttctgaaaagtattaaagaagcgcagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaggatagtgacttta 4256  T
Q  312 aaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtag 411  Q
     | ||||||| |||||| || |||| ||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4255 gagttgatgaccaaggtgtgctgagatttcgaggccgaatttgtattcatgacgatgatgagattaagaagatgattttggaagagagtcatagaagtag 4156  T
Q  412 cttgagtattca 423  Q
    ||||||||||||    
T  4155 cttgagtattca 4144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4481 - 4361
Alignment:
Q  58 taaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttg 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  4481 taaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagtttcttgaacaatttagggatttg 4382  T
Q  158 agtttagtttgcgagatgtca 178  Q
    || ||||| |||||| |||||    
T  4381 agcttagtctgcgagttgtca 4361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 18073 - 18229
Alignment:
Q  237 aagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  18073 aagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtattgag 18172  T
Q  337 gtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttga 393  Q
    | | ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18173 gatccgaggtagaatttgtattccagacgatgaagagatgaagaagatgattcttga 18229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1798 - 1558
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||||| ||||||||||    
T  1798 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagt 1699  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||    
T  1698 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgatgagtattaaaggggcaca 1599  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagta 287  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598 taaagttgatgtcaagtttgtatacttgttggttgctagta 1558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15538 - 15298
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||||| ||||||||||    
T  15538 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagt 15439  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||    
T  15438 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgatgagtattaaaggggcaca 15339  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagta 287  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15338 taaagttgatgtcaagtttgtatacttgttggttgctagta 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 355 - 51
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  355 catccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgtgttgcttgaatagttca 256  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | ||||| ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||      
T  255 gagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacagc 157  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||||||  |||||||    
T  156 aagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcagggggtgttgaggttcagaggaag 57  T
Q  349 aatttg 354  Q
    ||||||    
T  56 aatttg 51  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5807 - 5414
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  5807 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 5708  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||| |    
T  5707 gagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacagtatcagagaagcacaaa 5609  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||  ||||| |||||||| | |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  5608 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 5509  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | ||  ||   ||||||| |||| |||  |||| | ||||| |  || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  5508 aatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagtcgattttggaagaaatacacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 5414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27901 - 27508
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| | |||||||| || |    
T  27901 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagctacttgaacaattta 27802  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| || ||| | ||||| ||| ||||| || |||||||| || | |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| ||||| | |||||| || |    
T  27801 gagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgaacagtatcagagaagcgcaga 27703  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    || ||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||| | | ||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  27702 aaattgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaactgaaaatgatgacttcaatgttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 27603  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27602 aatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgt 27508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20242 - 19833
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||||||| || |||    
T  20242 ttttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgag 20143  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||| |  |||||||| || | ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||||    
T  20142 ttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagta 20043  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||  |||||  | |||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  20042 tcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttaatggtaatcaagctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgtt 19943  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||  |||| |||||||| | ||  ||| ||||||||||||| ||| | ||| | || || ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19942 gaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagct 19843  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  19842 acgaagatgt 19833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24404 - 23995
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||||||| || |||    
T  24404 ttttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgag 24305  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||| |  |||||||| || | |||||| |||| ||  |||||| |||  |||| ||||    
T  24304 ttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagta 24205  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||  || ||  | |||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  24204 tcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatgttttattgtaatcaatctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgtt 24105  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    ||||||  |||| |||||||| | ||  ||| ||||||||||||| ||| | ||| | || || ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  24104 gaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagct 24005  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  24004 acgaagatgt 23995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 9734 - 10130
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| |||| ||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||    
T  9734 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatggttaaagaatttgagttgcttgagcagt 9833  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | | ||| |||||| ||||||| ||| ||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||  | ||||  ||  || | ||||||| |||||||||    
T  9834 ttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttggatagtattagagaagcaca 9933  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagga 346  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||| ||||  |||| || ||  |||||||||  ||| ||||||| || ||||||    
T  9934 gaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggttggtagtaatccaactaaagatagtgacttcaaggttgatgatctgggtgtgttgagattccgagga 10033  T
Q  347 agaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||| |   ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||    
T  10034 agaatttgtatttctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctaaaaagatgt 10130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 47963 - 48356
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| | || ||||| |    
T  47963 catccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgttagagcagttta 48062  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||| ||  |||||| |||||| ||| | ||| | |||||||||      
T  48063 gagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtatagttgggtatgttgaaaatcaatagtg-atttcttgaacattatcagagaagcacagc 48161  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  48162 aagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 48261  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||    
T  48262 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagccataggagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgt 48356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Original strand, 57133 - 57169
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  57133 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 57169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 68747 - 68362
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  68747 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagttta 68648  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||  ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||      
T  68647 gagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 68549  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |||| ||  | ||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||    
T  68548 aagttgatgctaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcag 68449  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  68448 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccgggagctac 68362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 443
Target Start/End: Original strand, 12977 - 13223
Alignment:
Q  197 ggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagact 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||||||  |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||  |||||   |||    
T  12977 ggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatacgagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgcgggtaatggcact 13075  T
Q  296 gaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaag 395  Q
    || ||  |||| || ||  |||||||||| ||| | ||||| ||  ||||||||||||| | ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||    
T  13076 gaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaag 13175  T
Q  396 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13176 aaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 13223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 356
Target Start/End: Original strand, 3885 - 4188
Alignment:
Q  53 ccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagag 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| | || || || |||||||| || || || ||||    
T  3885 ccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagag 3984  T
Q  153 atttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaag 251  Q
    | |||||| | ||||| ||  || || || |||||||  || | || |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||   |||||||||   ||    
T  3985 acttgagtcttgtttgtgaattgacaccttagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaactag 4083  T
Q  252 ttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaat 351  Q
    | ||||| |||||||| || ||  |||||||| |||||   ||||| ||  |||| |||||  | |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  4084 tagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaat 4183  T
Q  352 ttgta 356  Q
    |||||    
T  4184 ttgta 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Original strand, 12843 - 12895
Alignment:
Q  56 ggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12843 ggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtc 12895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 177188 - 177440
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||| | || || || || ||||| |||||||    
T  177188 tatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgctatgatggttaaagaattagaattgctagaacagt 177287  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||| ||||  || ||||||||||| | |||||| |||||||  |||||| |||  |||| ||||||||||||||| |    
T  177288 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtgaattcttgaacagtattaaagaagcata 177387  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaag 299  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177388 aaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaag 177440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 443
Target Start/End: Original strand, 11313 - 11519
Alignment:
Q  237 aagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgag 336  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||| | |||||||||||  |||||||    
T  11313 aagaagcgcagaaagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgag 11412  T
Q  337 gtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacg 436  Q
     ||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||      
T  11413 attctgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctaga 11512  T
Q  437 aagatgt 443  Q
    |||||||    
T  11513 aagatgt 11519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 443
Target Start/End: Original strand, 17505 - 17711
Alignment:
Q  237 aagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgag 336  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||| | |||||||||||  |||||||    
T  17505 aagaagcgcagaaagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgag 17604  T
Q  337 gtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacg 436  Q
     ||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||      
T  17605 attctgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctaga 17704  T
Q  437 aagatgt 443  Q
    |||||||    
T  17705 aagatgt 17711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5153 - 4769
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  5153 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgttgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctggagcagttta 5054  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| ||||| || | |||||  || |  |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||      
T  5053 gagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagttgagtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 4955  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  4954 aagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaaccgaagagggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 4855  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagcta 434  Q
    |||||| | ||   |  |||||||  |||  ||| ||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4854 aatttgcattcctaataatgatgatttgataaagttgattttagaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccgggagcta 4769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 32590 - 32999
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||||| ||||||    
T  32590 ttttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgag 32689  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||| |  |||||||| || | |||||| |||| ||  |||||| |||  |||| ||||    
T  32690 ttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagta 32789  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||| ||  | |||||||| |||||||| || ||  | |||  |||||||||  |||| ||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  32790 tcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgtt 32889  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagct 433  Q
    || |||  |||| |||||||| | ||  ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  || ||||||||||| || |||||||||    
T  32890 gaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagct 32989  T
Q  434 acgaagatgt 443  Q
    ||||||||||    
T  32990 acgaagatgt 32999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 55829 - 56222
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  55829 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagttta 55928  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| |  || | || |||||||| ||| |||||  ||||| |||| |||||   |||||| ||      
T  55929 gagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaaaattaatagt-aatttcttgaatagtatccgagaagctcagc 56027  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    || | ||||  |||||||| || ||| |  ||||| |||||   ||||| ||  |||| || ||  | |||||||| ||| | ||||| ||  |||||||    
T  56028 aattggatgggaagtttgttgatttgataattgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtattgagattcagaggaag 56127  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  56128 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgagagctacaaagatgt 56222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41651 - 41523
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  41651 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 41552  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  41551 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 41523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 867
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  1260 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttgaacagttta 1161  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||  ||||| || | |||||| || | |||||  |||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||      
T  1160 gagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatattgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 1062  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  ||||  |  ||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||    
T  1061 aagttgatgtcaagtttgtggattttatggttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcag 962  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  961 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6127 - 5742
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  | ||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  6127 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 6028  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || |  ||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||||||      
T  6027 gagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaac 5929  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | | ||||||  |||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  5928 aagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaag 5829  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5828 aatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctac 5742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 89374 - 89759
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| || ||||| |    
T  89374 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagttta 89473  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| | ||| || |||||||  || | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||   |||||||||      
T  89474 gagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacagc 89572  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  89573 aagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 89672  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||| | ||  ||| |||||||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  89673 aatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctac 89759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 90052 - 90437
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| || ||||| |    
T  90052 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagttta 90151  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| | ||| || |||||||  || | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||   |||||||||      
T  90152 gagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacagc 90250  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  90251 aagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 90350  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||| | ||  ||| |||||||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  90351 aatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctac 90437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 443
Target Start/End: Original strand, 390489 - 390522
Alignment:
Q  410 agcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  390489 agcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 390522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39759 - 39536
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||| | |  |||||  |||| ||||||||||    
T  39759 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaagacattgcatatgtccgctttgatggtcagagagtttaagttacttgaacagt 39660  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||  ||||| || || |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39659 tcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagtattaaagaggcaca 39560  T
Q  247 taaagttgatgttaagtttgtaga 270  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  39559 gaaagttgatgtcaagtttgtaga 39536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 349
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6319
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgtt--gttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaaca 144  Q
    ||||| || ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  6015 tatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagttggagttgcttgagca 6114  T
Q  145 gttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagc 243  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||| || | |||||| |||||||  |||||| ||||| |||| ||||| || ||| |    
T  6115 gtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgaacagtatcaaggaaac 6213  T
Q  244 acataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcga 343  Q
    ||| ||| | ||||  |||||||| || ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||  ||    
T  6214 acagaaaatcgatgccaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaagttgatgatcaaggtgtgttaaggttcaga 6313  T
Q  344 ggaaga 349  Q
    ||||||    
T  6314 ggaaga 6319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1246 - 853
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||  |||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||  |    
T  1246 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagtttctagaatagtaaa 1147  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| ||||  || |||||||  |  | |||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||      
T  1146 gagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgccttagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 1048  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  1047 aagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatgaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 948  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||| ||  ||  |  ||||  |||| ||| ||||| | | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  947 aatttgtattcctgataacaatgatttgaaaaagttgattttggtagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgt 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 356
Target Start/End: Original strand, 1783 - 2089
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  1783 catccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 1882  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| || || || ||||||| ||| | || |||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||| | |||||||||      
T  1883 gagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacaatatcagagaagcacaac 1981  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||| | ||||||||  |||| || ||  || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  1982 aagttgatgtcaagtttgttgatttgatgattgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttaatgatcagggtgtgttgaggttccgaggaag 2081  T
Q  349 aatttgta 356  Q
    ||||||||    
T  2082 aatttgta 2089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18726 - 18341
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| || || || || ||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||| | || |    
T  18726 catccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagacatttcacatctctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaatatttta 18627  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| |||||  | | |||||  || | |||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||      
T  18626 gagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagttgggtatgctgaaggttaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacagc 18528  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  18527 aagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 18428  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||| | ||  ||   ||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||| | | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18427 aatttgcattcatgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtaacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctac 18341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 25690 - 25818
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || ||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  25690 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaacgttgttgttgatgctttgagtagaaagacattgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 25789  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  25790 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 25818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 443
Target Start/End: Original strand, 910 - 1294
Alignment:
Q  58 taaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttg 157  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| |||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||    
T  910 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttg 1009  T
Q  158 agtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacataaagttgat 256  Q
    ||| | ||||| ||| ||  | || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||  |||  |||    
T  1010 agtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagccgat 1108  T
Q  257 gttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    || |||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  1109 gtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatg-gactgaagatagtgatttcaaggttgatgatcaaggagtgttgaggttcagaggaagaatttgca 1207  T
Q  357 ctctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||  ||| |||||||| |||| | | ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||    
T  1208 ttcctgacaatgatgagttgaaaatgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgt 1294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32788 - 32403
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| |  | ||| |    
T  32788 catccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggttta 32689  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    ||||||||||| | || || ||  ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||  ||||||| ||      
T  32688 gagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccaagaagcgcaac 32590  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  32589 aagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 32490  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||||| || || ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32489 aatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctac 32403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 435
Target Start/End: Original strand, 170 - 548
Alignment:
Q  58 taaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttg 157  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| |||||||||| || ||||| |||||||| || || ||     
T  170 taaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggactta 269  T
Q  158 agtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgat 256  Q
    ||| | || || ||  |||||||| |||||||| || | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||  ||||||||    
T  270 agtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgat 368  T
Q  257 gttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  |  ||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  369 gttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgta 468  T
Q  357 ctctagacgatgatgagatgaagaagatgattctt-gaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
     ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||  || | |||||||||||| |||||||||||    
T  469 ttcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctac 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 444
Target Start/End: Original strand, 32 - 146
Alignment:
Q  330 tgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccggg 429  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32 tgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccggg 131  T
Q  430 agctacgaagatgtt 444  Q
    |||||||||||||||    
T  132 agctacgaagatgtt 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 258
Target Start/End: Original strand, 50804 - 51012
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  50804 catccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagttta 50903  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | | ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||     
T  50904 gagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggctatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtattagagaagcacatc 51002  T
Q  249 aagttgatgt 258  Q
    ||||||||||    
T  51003 aagttgatgt 51012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 435
Target Start/End: Original strand, 4551 - 4906
Alignment:
Q  80 actttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcat 179  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||      
T  4551 actttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgcgaagtgtcgc 4650  T
Q  180 ctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggt 279  Q
    |  ||||||||||  |||| ||||||||| |  | |||| |||| |||| ||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| ||  ||||    
T  4651 cgcagagtgtgaaattaggaatgctgaaggtccacagtgaatttttgaatagtatcaaagaagctcagaaggcagatgtgaagttggtagatttaatggt 4750  T
Q  280 tgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaag 379  Q
    ||  |  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||     ||||||||| ||  ||  ||   || |||||     
T  4751 tgggaacaatcagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaattgaatttgtattcctgataatacagaaatgaaa 4850  T
Q  380 aagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  4851 aagatgattctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctac 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 289
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6498
Alignment:
Q  55 gggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagat 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 6363  T
Q  155 ttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagtt 253  Q
    |||||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||   |||||||||  |||||    
T  6364 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtt 6462  T
Q  254 gatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaat 289  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  6463 gatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaat 6498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 289
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10929
Alignment:
Q  55 gggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagat 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 10794  T
Q  155 ttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagtt 253  Q
    |||||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||   |||||||||  |||||    
T  10795 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtt 10893  T
Q  254 gatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaat 289  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  10894 gatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaat 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 443
Target Start/End: Original strand, 2250 - 2652
Alignment:
Q  41 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttg 140  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||| ||  | ||| | || || || ||||||||||    
T  2250 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgcttg 2349  T
Q  141 aacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaaga 240  Q
    | ||||||||||| |||||| | ||||| ||  || || || |||||||| || | |||||| |||| ||| | |||| |||  |||  |||||   |||    
T  2350 agcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtatccgaga 2449  T
Q  241 agcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggttt 340  Q
    ||||||  |||| ||||| ||||| || ||  || | |||||| |||||   ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||     
T  2450 agcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctgattgttgctggtaatggcactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttc 2549  T
Q  341 cgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaga 440  Q
     |||| ||||||||||  |  ||| |||||| | |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2550 agaggcagaatttgtatccctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaga 2649  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  2650 tgt 2652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 350 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3451 - 3358
Alignment:
Q  350 atttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3451 atttgtattccagacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 3358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15489 - 15293
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  15489 catctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagttta 15390  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcaca 246  Q
    |||| |||||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  15389 gagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcaca 15293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 8774 - 8902
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctat-aatgataaaggagttcga 132  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||| ||||| ||    
T  8774 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgaatgttaaa-gagttaga 8872  T
Q  133 gttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  8873 gttgattgagcagtttcgagatttgagttt 8902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 378
Target Start/End: Original strand, 6598 - 6942
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||| | ||||| || |||    
T  6598 ttttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgag 6697  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||  |  |||||||| || | |||||| |||| ||  ||| || |||  |||| ||||    
T  6698 ttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgagttgtcgccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagta 6797  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgtt 333  Q
    | | |||||| ||  | |||||||| ||| |||| || ||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  6798 tcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagcttgtggatttaagggttaatagtaatcaaactgaagatagtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgtt 6897  T
Q  334 gaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaa 378  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||  ||| |||||||||||||    
T  6898 gaggttcagaggcagaatttgtgttcctgacaatgatgagatgaa 6942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 337 - 465
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||||||     
T  337 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtccgctttgatggttaaagagttcgaa 436  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  437 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Original strand, 2414 - 2799
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  2414 catccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagttta 2513  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| | ||| || |||||||  || | |||||| |||||||| || ||  ||||| |||| |||||   |||||||||      
T  2514 gagacttgagtcttgtctgtgagttctcaccttagagtgtacagttgggtatgttgaagattaattgt-aatttcttgaatagtatccgagaagcacagc 2612  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    || | ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||    
T  2613 aactggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatgagggtgtgttgaggttcggagaaag 2712  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||| | ||  ||  |||||||| |||| ||  ||||| | || || ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2713 aatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaatttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctac 2799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41078 - 40789
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| || ||||    
T  41078 tatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagt 40979  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    | ||||| |||||| | || || ||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||   ||||||||    
T  40978 ttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcac 40880  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgag 336  Q
    || |||| ||| | |||||||| || ||| ||||| |||  ||| | |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| ||| |||||||    
T  40879 atcaagtggatatcaagtttgttgatttgatggttactaacaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgattatcagggtgtgttgag 40789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 366 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1475 - 1398
Alignment:
Q  366 atgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1475 atgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 1398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 10983 - 11379
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||| || || || ||||| || ||||    
T  10983 tatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagt 11082  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    | ||||| |||||| | || || ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| | | || ||||| |||| ||||||  |||||| |    
T  11083 ttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggaatgctgaagattaacattg-atttcttgaatagtattcgagaagcgc 11181  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    |  |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||   |||    
T  11182 agcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaagg 11281  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||| | || || || || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11282 aagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgt 11379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Original strand, 14753 - 15149
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||| || || || ||||| || ||||    
T  14753 tatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagt 14852  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    | ||||| |||||| | || || ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| | | || ||||| |||| ||||||  |||||| |    
T  14853 ttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggaatgctgaagattaacattg-atttcttgaatagtattcgagaagcgc 14951  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    |  |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||   |||    
T  14952 agcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaagg 15051  T
Q  346 aagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||| | || || || || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15052 aagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgt 15149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21172 - 20967
Alignment:
Q  238 agaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgagg 337  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | | ||||||  |||| || ||  || ||||||| ||||| |||| |    
T  21172 agaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaattgaagatagtgacttcaaggttaatgatcagggtatattgaag 21073  T
Q  338 tttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 437  Q
    ||   |||||| ||||||| ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||| | || || ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21072 ttcacaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacga 20973  T
Q  438 agatgt 443  Q
    | ||||    
T  20972 aaatgt 20967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44160 - 43775
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||| || || ||||| ||||| || |    
T  44160 catcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttta 44061  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||  | ||||| ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||| ||      
T  44060 gagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagctcagc 43962  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| ||  |||| ||||| | ||||| ||  |||| || ||  |||||||||| ||| | ||||||||  |||||||    
T  43961 aagtagatttgaagtttgttgatttgatgactgctggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaag 43862  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43861 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctac 43775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22923 - 22851
Alignment:
Q  371 gagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22923 gagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 22851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 354
Target Start/End: Original strand, 3207 - 3505
Alignment:
Q  56 ggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 155  Q
    |||||| ||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||  | || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  3207 ggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagact 3306  T
Q  156 tgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacataaagttg 254  Q
    ||||| | ||||| ||| ||||| || |||||||| |  | |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| ||||| || ||||| || ||| | |    
T  3307 tgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgaacagtatcaaggaagcgcagaaaatgg 3405  T
Q  255 atgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttg 354  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3406 atgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatgttgacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttg 3505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 354
Target Start/End: Original strand, 30220 - 30518
Alignment:
Q  56 ggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 155  Q
    |||||| ||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||  | || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  30220 ggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagact 30319  T
Q  156 tgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacataaagttg 254  Q
    ||||| | ||||| ||| ||||| || |||||||| |  | |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| ||||| || ||||| || ||| | |    
T  30320 tgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagatcaatagtg-atttcttgaacagtatcaaggaagcgcagaaaatgg 30418  T
Q  255 atgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttg 354  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  30419 atgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatgttgacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttg 30518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20497 - 20112
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||| | ||||| ||||| || || ||||| || |    
T  20497 catcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactagaacaattta 20398  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | ||||| ||  || || || ||||| |  || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||| ||      
T  20397 gagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtattcagttggggatgctgaagattaatagtg-atttcttgaacagtatccgagaagcgcaac 20299  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||||| || ||||| |  |||||||   ||| || ||| |||||||||| ||| | ||||| ||  |||||||    
T  20298 aagtggatgttaagtttgttgatttgatggttactggtaatgaagctgaagatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtattgagattcagaggaag 20199  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20198 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagagagtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctac 20112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 168
Target Start/End: Original strand, 58218 - 58261
Alignment:
Q  125 gagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttg 168  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  58218 gagttggagttgcttgaatagttcagagatttgagtttggtttg 58261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 259
Target Start/End: Original strand, 23098 - 23323
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | || |||||||| | ||| ||||||||  |||| ||| | || ||||| |||    
T  23098 ttttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatggttaaagagttggag 23197  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagta 233  Q
     |||| ||| |||| ||| | |||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||| |||| | || ||||    
T  23198 ctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtgaattttttaatagta 23297  T
Q  234 ttaaagaagcacataaagttgatgtt 259  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||    
T  23298 ttaaagaagcgcagaaagtggatgtt 23323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 443
Target Start/End: Original strand, 24975 - 25041
Alignment:
Q  377 aagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  24975 aagaaaatgattcttgaagaaagtaacagacgtagcttgagtattcattagggagctacaaagatgt 25041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4126 - 3735
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| | |||| | ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| | ||||| || ||||| |    
T  4126 catccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagttta 4027  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| ||||| || |||||    || | || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||      
T  4026 gagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtac--agttgggaatgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccaagaagcacagc 3930  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||   | ||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  3929 aagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcattgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaag 3830  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||| | ||  ||  |||||||  |||| ||| ||||| | || || ||||| |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  3829 aatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacgaaaatgt 3735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 168
Target Start/End: Original strand, 43033 - 43154
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||| | || ||||| ||||| ||||||||||    
T  43033 tatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggttaaagagttggagtttcttgaacagt 43132  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttg 168  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  43133 tcagagacttgagtttggtttg 43154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 168
Target Start/End: Original strand, 38385 - 38475
Alignment:
Q  78 atactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttg 168  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||  | ||| ||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  38385 atactttaagtaggaaaacattacatatgtttgttatgatggttaaagagttggagttgcttgtacagttcagagacttgagtttggtttg 38475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 620 - 1000
Alignment:
Q  54 cgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagaga 153  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| || ||||| |||||    
T  620 cgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagaga 719  T
Q  154 tttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagt 252  Q
     |||||| | || || ||| || || || ||| |||  || | || ||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||   |||||||||  ||||    
T  720 cttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagactgtacagttggggatgatgaagattaat-gtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 817  T
Q  253 tgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatt 352  Q
     ||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||| | || |||||   ||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  818 ggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctaataatgaaacggaagatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatt 917  T
Q  353 tgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    || | ||  ||   ||||||| || | ||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  918 tgcattcctgatagtgatgagttggaaaagttgattctagaagaaagtcacaagagtagctagagtattcacccgggagctac 1000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 383 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8834 - 8774
Alignment:
Q  383 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8834 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 8774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45738 - 45610
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||| ||     
T  45738 ttttcagttgagttatcatcccgggaaagcgaatgtttttgctgatgctttgagtaaaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaggagttggaa 45639  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  45638 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 45610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 423
Target Start/End: Original strand, 95 - 451
Alignment:
Q  58 taaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttg 157  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgaacaactcaaagacttg 194  T
Q  158 agtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacataaagttgat 256  Q
    ||| | ||||| ||| || || ||          || | |||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||| || || ||||||    
T  195 agtcttgtttgtgagctgccacct---------cagttgggtatgctaaagattaatagtg-atttcttgaatagtattagagaagcccagaatgttgat 284  T
Q  257 gttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgta 356  Q
    || |||| ||| || ||  ||||| |||||||| | ||||||||  |||| || ||  |||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  285 gtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatcgtgacttcaaggttgacgattagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgca 384  T
Q  357 ctctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattca 423  Q
     ||  ||   ||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  385 ttcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttcgaagaaagtcacagaagtagcttaagtattca 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 74
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  378 catccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagttta 279  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataa 249  Q
    |||| |||||| | || || ||| || || || |||||||  || | || ||| |||| ||| ||||||  || ||||| |||||   |||||||||  |    
T  278 gagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagtttgggatgttgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaagcacagca 179  T
Q  250 agttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaaga 349  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| | |||||| |||||   | ||| ||  |||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  178 agtagatgttaagtttgttgatttgattgttgctggtaatgttattgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaga 79  T
Q  350 atttg 354  Q
    |||||    
T  78 atttg 74  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8658 - 8520
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  8658 ttttcagttgagttatcacccgaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 8559  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgag 172  Q
    ||| |||| |||||  |||| |||||||| ||| |||||    
T  8558 ttgattgagcagttttgagacttgagtttggttagcgag 8520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13580 - 13271
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| | || || || || ||||| || ||||    
T  13580 tatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagt 13481  T
Q  147 tcagagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcac 245  Q
    | ||||| |||||| | || || ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||   ||||||||    
T  13480 ttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacaccttagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcac 13382  T
Q  246 ataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgagg 345  Q
    |   ||| ||||| |||||||| || ||  |||||||| |||||   ||||| ||  |||| |||||  | |||||||| ||| ||||||||||  ||||    
T  13381 aactagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgaggttcagagg 13282  T
Q  346 aagaatttgta 356  Q
    |||||||||||    
T  13281 aagaatttgta 13271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 172
Target Start/End: Original strand, 6721 - 6859
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||| | || ||||| ||     
T  6721 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgactgctttgatggttaaagagttggaa 6820  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcgag 172  Q
    ||| |||| |||||  |||| |||||||| ||| |||||    
T  6821 ttgattgagcagtttcgagacttgagtttggttagcgag 6859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 85448 - 85566
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  85448 catccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagttta 85547  T
Q  150 gagatttgagtttagtttg 168  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  85548 gagacttgagtttggtttg 85566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 16477 - 16590
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| |||    
T  16477 ttttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgag 16576  T
Q  134 ttgcttgaacagtt 147  Q
    ||| |||| |||||    
T  16577 ttgattgagcagtt 16590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 27179 - 27307
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  27179 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 27278  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  27279 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 27307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Original strand, 25795 - 25868
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgt 107  Q
    |||| ||||||| |||||||  || || |||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  25795 ttttcagttgagttatcatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctctgagtagaaagactttgcatatgt 25868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 441
Target Start/End: Original strand, 20635 - 20761
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||| | ||  || ||||||||  |||| ||| ||||| | ||| | ||||| |  ||||||||    
T  20635 ttgatgatcatggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagtagctt 20734  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20735 aagtattcatccgggagctacaaagat 20761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 2788 - 2916
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  2788 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 2887  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  2888 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 2916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 855 - 727
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  855 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgat 756  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  755 ttgtttgagcagtttcgagacttgagttt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24787 - 24659
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  24787 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 24688  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  24687 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 24659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14301 - 14173
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  14301 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 14202  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  14201 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 14173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28452 - 28217
Alignment:
Q  200 atgctgaagattgatagtgtatttct-gaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaa 298  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||   |||||||||  |||| ||||| |||||||| ||| || | |||||| ||||| | |||||     
T  28452 atgctgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgacctgatagttgctggtaatgaaactgag 28354  T
Q  299 gacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaga 398  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||||| || || |    
T  28353 gatagtgactataaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaggaaa 28254  T
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28253 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctac 28217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35490 - 35426
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctat 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  35490 catccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgttgcacatgtctgctat 35426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 289
Target Start/End: Original strand, 24805 - 25044
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||  ||| | ||| | || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  24805 catccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgttgcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagcagttta 24904  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||||||| || | || || ||  || || ||||||||||  || | || ||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||   ||||||||||     
T  24905 gagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgtacagttggggatgttgaagattaatagtg-atttcttgaatagtatccgagaagcacatc 25003  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaat 289  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  25004 aagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaat 25044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25219 - 25091
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  25219 ttttcagttgagttatcatcccgggaaagtgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaa 25120  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  25119 ttgattgagcagtttcgagatttgagttt 25091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Original strand, 133430 - 133476
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  133430 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 133476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28001 - 27752
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||| | |||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| || ||||| |    
T  28001 catccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagca-gaagacgttggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagttta 27903  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
     ||| |||||| | ||||||||| ||||| || |||||||  || | |||||| |||||||| | | || ||||| |||| |||||   |||||||||      
T  27902 aagacttgagtcttgtttgcgagttgtcaccttagagtgtacagttgggtatgttgaagattaacaatg-atttcttgaatagtatccgagaagcacagc 27804  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaaga 300  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  27803 aagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaaga 27752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 51374 - 51502
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  51374 ttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 51473  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  51474 gagtattcatccgcgagctacgaaaatgt 51502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 60408 - 60536
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  60408 ttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 60507  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  60508 gagtattcatccgcgagctacgaaaatgt 60536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 66796 - 66924
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  66796 ttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 66895  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  66896 gagtattcatccgcgagctacgaaaatgt 66924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 443
Target Start/End: Original strand, 7357 - 7467
Alignment:
Q  333 tgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagc 432  Q
    |||||||  |||||||| |||||| ||  ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  7357 tgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgagggc 7456  T
Q  433 tacgaagatgt 443  Q
    ||| |||||||    
T  7457 tacaaagatgt 7467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10659 - 10549
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtt 161  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||||||    
T  10659 gctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttttgagacttgagtt 10560  T
Q  162 tagtttgcgag 172  Q
    | ||| |||||    
T  10559 tggttagcgag 10549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 8565 - 8491
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8565 ttttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtatgaagactttgcatatgtc 8491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 435
Target Start/End: Original strand, 32531 - 32633
Alignment:
Q  333 tgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagc 432  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||  ||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  32531 tgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggc 32630  T
Q  433 tac 435  Q
    |||    
T  32631 tac 32633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Original strand, 12918 - 12976
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  12918 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 12976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 32326 - 32400
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32326 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 32400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 72554 - 72454
Alignment:
Q  62 gctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtt 161  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||| || ||| |||| |||||  |||| |||||||    
T  72554 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaggagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagtt 72455  T
Q  162 t 162  Q
    |    
T  72454 t 72454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25355 - 25227
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||  || || |||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  25355 ttttcagttgagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaatgagtttgaa 25256  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  25255 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 25227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15824 - 15750
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||  || || |||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15824 ttttcagttgagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 15750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24990 - 24946
Alignment:
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24990 gtcatagaactagtttgagtattcacccaggagctactaagatgt 24946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6567 - 6439
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 133  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| | || ||||| ||     
T  6567 ttttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagtctttgcatatgtctgctttgatggttaatgagttggaa 6468  T
Q  134 ttgcttgaacagttcagagatttgagttt 162  Q
    ||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  6467 ttgattgagcagtttcgagacttgagttt 6439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27373 - 27245
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| || |||||||   ||||||| |||||| ||  ||  |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| ||    
T  27373 ttgatgatcagggtgtgctgaggttcaaaggaagagtttgtattcctgatcatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggtt 27274  T
Q  415 gagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27273 gagtattcacccgggggctacaaagatgt 27245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 443
Target Start/End: Original strand, 2284 - 2677
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||| |||| || ||||| ||||| || || || |    
T  2284 catcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtaggaaaacgttgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaattta 2383  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 248  Q
    |||| |||||| | || || ||| || || || |||||||  || | || |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||   |||||| ||      
T  2384 gagacttgagtcttgtgtgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaacagtg-atttcttgaacagtatccgagaagcgcaac 2482  T
Q  249 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 348  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||  |||||| | ||||| | || || ||  |||| || ||  | |||||||| ||| |||| |||||  |||||||    
T  2483 aagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggtcgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaag 2582  T
Q  349 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
     ||||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  2583 gatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacgaaaatgt 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8431 - 8044
Alignment:
Q  56 ggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 155  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||  || ||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  8431 ggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgttgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagact 8332  T
Q  156 tgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttga 255  Q
    ||||  | || || ||  || || || |||||||  || | || |||||||||||| | ||||  ||  |||| ||||||  |||||| ||  | || ||    
T  8331 tgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaacagtgacttcttgaatagtattcgagaagcgcagcatgtaga 8232  T
Q  256 tgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgt 355  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||| || ||||    ||||| ||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  8231 tgtgaagtttgttgatttgatggttactggtaagggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaattttc 8132  T
Q  356 actctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    | ||  || |||||||   |||| ||| | ||| | || |||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  8131 attcctgatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggagagtcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgt 8044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19440 - 19367
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgt 107  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19440 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgcttttagtagaaagactttgcatatgt 19367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42294 - 42185
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |    
T  42294 catccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagttta 42195  T
Q  150 gagatttgag 159  Q
    |||| |||||    
T  42194 gagacttgag 42185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 218
Target Start/End: Original strand, 1763 - 1931
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |    
T  1763 catcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatgataaaagaattcgaattgttagaacagttta 1862  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtg 218  Q
    |||| |||||| | || || ||  ||||| || ||||| |  || | || |||||||||||||||||||    
T  1863 gagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatatagttggggatgctgaagattgatagtg 1931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 435
Target Start/End: Original strand, 14352 - 14511
Alignment:
Q  276 tggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagat 375  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||  ||  |||||||  |    
T  14352 tggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgatgattt 14451  T
Q  376 gaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||| ||| ||||| | || || ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14452 gaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctac 14511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 435
Target Start/End: Original strand, 22531 - 22690
Alignment:
Q  276 tggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagat 375  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||  ||  |||||||  |    
T  22531 tggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgatgattt 22630  T
Q  376 gaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||| ||| ||||| | || || ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  22631 gaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctac 22690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Original strand, 14243 - 14316
Alignment:
Q  65 aatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgct 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||| || || ||||||||    
T  14243 aatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgct 14316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22495
Alignment:
Q  65 aatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgct 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||| || || ||||||||    
T  22422 aatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgct 22495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Original strand, 23999 - 24058
Alignment:
Q  47 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatg 106  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23999 tatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatg 24058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 96541 - 96414
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| |    
T  96541 catccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagttta 96442  T
Q  150 gagatttgagtttagtttgcgagatgtc 177  Q
    ||||  ||||||| ||||| ||| ||||    
T  96441 gagacatgagtttggtttgtgagttgtc 96414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15459 - 15390
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcat 103  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15459 ttttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcat 15390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Original strand, 81053 - 81146
Alignment:
Q  342 gaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||| |||||||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  81053 gaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattcttgaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctac 81146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6233 - 6197
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6233 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 6197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Original strand, 12072 - 12108
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12072 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgt 12108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20478 - 20386
Alignment:
Q  343 aggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||||||||| ||  ||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20478 aggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctac 20386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23298 - 23206
Alignment:
Q  343 aggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctac 435  Q
    |||||||||||||| ||  ||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  23298 aggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctac 23206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28018 - 27926
Alignment:
Q  342 gaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagcta 434  Q
    |||||||| |||||| ||  ||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28018 gaggaagagtttgtattcctgacaacgatgaattgaggaagttgattcttgaagagagtcacaagagtagattgagtattcacccgggggcta 27926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 249725 - 249605
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||  ||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||| | ||||| |  ||||| ||    
T  249725 ttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagtagttt 249626  T
Q  415 gagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  249625 gagtattcacccgggggctac 249605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 1832 - 1898
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttg 100  Q
    |||| |||| || |||||||| || || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1832 ttttcagttaagttatcatcccgggaaggctaatattgttgctgatgctttgagtaggaagactttg 1898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3937 - 3864
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgt 107  Q
    |||| ||||||| |||| ||| || || ||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3937 ttttcagttgagttatcttcccgggaaggctaatgttgttattgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 3864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 7803 - 7877
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    |||| ||||||| |||||||| |  || |||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7803 ttttcagttgagttatcatcccgagaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtacaaagattttgcatatgtc 7877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12110 - 12052
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 108  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||    
T  12110 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtc 12052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 13727 - 13797
Alignment:
Q  34 ttttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcata 104  Q
    |||| ||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  13727 ttttcagtggagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttaagtagaaagactttgcata 13797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Original strand, 10386 - 10495
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||| || || | || || ||| | ||||| |||||||| |    
T  10386 catcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagttta 10485  T
Q  150 gagatttgag 159  Q
    |||| |||||    
T  10486 gagacttgag 10495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Original strand, 20600 - 20709
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||| || || | || || ||| | ||||| |||||||| |    
T  20600 catcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagttta 20699  T
Q  150 gagatttgag 159  Q
    |||| |||||    
T  20700 gagacttgag 20709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26834 - 26790
Alignment:
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  26834 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgt 26790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 4673 - 4774
Alignment:
Q  342 gaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagat 441  Q
    |||| |||||||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  4673 gaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcataagagtagcttgagtattcatccggaagctacgaaaat 4772  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  4773 gt 4774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 407 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 884 - 848
Alignment:
Q  407 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  884 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgt 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6235
Alignment:
Q  50 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||    
T  6167 catcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctgctttaatg 6235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Original strand, 3222 - 3266
Alignment:
Q  399 gtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgt 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  3222 gtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgt 3266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 435
Target Start/End: Original strand, 48400 - 48520
Alignment:
Q  315 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 414  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||  |||| |||||||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | || || |||||||  ||||||||    
T  48400 ttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcataagagtagctt 48499  T
Q  415 gagtattcacccgggagctac 435  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  48500 gagtattcatccgggagctac 48520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University