View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13688_high_7 (Length: 338)

Name: NF13688_high_7
Description: NF13688
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13688_high_7
NF13688_high_7
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (5-329)||(6311171-6311502)
chr8 (4-319)||(36979262-36979582)
chr8 (28-329)||(7289831-7290138)
chr8 (4-319)||(4759967-4760288)
chr8 (4-319)||(30655525-30655851)
chr8 (4-319)||(18870453-18870772)
chr8 (4-319)||(33037700-33038019)
chr8 (4-320)||(18853059-18853382)
chr8 (28-329)||(25328184-25328489)
chr8 (4-318)||(10689034-10689354)
chr8 (4-243)||(1261847-1262089)
chr8 (33-329)||(39784734-39785035)
chr8 (6-240)||(31071124-31071362)
chr8 (4-240)||(26287866-26288094)
chr8 (4-240)||(26301123-26301351)
chr8 (4-240)||(26313117-26313345)
chr8 (33-303)||(35745294-35745566)
chr8 (83-265)||(10684224-10684410)
chr8 (122-205)||(26403240-26403327)
chr8 (124-205)||(4456028-4456113)
chr8 (124-239)||(7412305-7412426)
chr8 (122-205)||(23799587-23799674)
chr8 (124-205)||(19175766-19175851)
chr8 (125-205)||(4696609-4696693)
chr8 (122-202)||(6127224-6127308)
chr8 (144-203)||(9765852-9765914)
chr8 (125-205)||(19752407-19752491)
chr8 (122-205)||(5702493-5702580)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (28-329)||(1457067-1457373)
chr5 (4-281)||(31180138-31180418)
chr5 (4-327)||(30631283-30631610)
chr5 (28-329)||(43592152-43592459)
chr5 (28-329)||(27449687-27449994)
chr5 (28-329)||(43598597-43598904)
chr5 (28-329)||(43604089-43604396)
chr5 (28-329)||(43609581-43609888)
chr5 (28-329)||(27444843-27445150)
chr5 (28-329)||(15044560-15044865)
chr5 (33-329)||(28807485-28807786)
chr5 (4-303)||(38219302-38219602)
chr5 (33-327)||(37556533-37556833)
chr5 (33-327)||(37561355-37561655)
chr5 (12-303)||(38192077-38192369)
chr5 (4-243)||(24135809-24136052)
chr5 (4-243)||(35387624-35387866)
chr5 (83-271)||(31396953-31397144)
chr5 (33-303)||(2785278-2785550)
chr5 (83-271)||(31401810-31402001)
chr5 (33-303)||(33791219-33791491)
chr5 (88-215)||(33768169-33768299)
chr5 (5-205)||(15464532-15464735)
chr5 (124-205)||(9353344-9353429)
chr5 (124-205)||(36932362-36932447)
chr5 (122-205)||(10281751-10281838)
chr5 (122-205)||(19588746-19588833)
chr5 (122-204)||(11916982-11917068)
chr5 (124-205)||(14520230-14520315)
chr5 (122-205)||(3880299-3880386)
chr5 (122-205)||(17003970-17004057)
chr5 (124-202)||(12084187-12084269)
chr5 (125-205)||(28832259-28832343)
chr5 (125-205)||(42127423-42127507)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (4-319)||(28503756-28504067)
chr3 (4-319)||(7167129-7167449)
chr3 (28-329)||(22173100-22173406)
chr3 (4-320)||(2671478-2671800)
chr3 (4-320)||(8738955-8739278)
chr3 (4-320)||(9091193-9091516)
chr3 (4-303)||(8477267-8477569)
chr3 (4-243)||(40372688-40372929)
chr3 (4-164)||(28501589-28501750)
chr3 (43-329)||(18656305-18656598)
chr3 (5-239)||(26928484-26928721)
chr3 (29-327)||(2676993-2677297)
chr3 (5-239)||(32143287-32143524)
chr3 (6-240)||(1305914-1306150)
chr3 (29-303)||(2672837-2673114)
chr3 (83-220)||(8512202-8512342)
chr3 (83-220)||(8517082-8517222)
chr3 (83-265)||(32475424-32475608)
chr3 (29-303)||(24968010-24968286)
chr3 (83-265)||(32480282-32480466)
chr3 (5-239)||(27452924-27453161)
chr3 (125-239)||(27986449-27986567)
chr3 (124-205)||(8370488-8370573)
chr3 (124-205)||(27974954-27975039)
chr3 (159-303)||(10207836-10207981)
chr3 (122-205)||(18552883-18552970)
chr3 (122-204)||(36029094-36029180)
chr3 (124-205)||(16264350-16264435)
chr3 (124-205)||(21711223-21711308)
chr3 (122-202)||(1736305-1736389)
chr3 (125-205)||(33386669-33386753)
chr3 (181-240)||(1309819-1309878)
chr3 (122-205)||(3716002-3716089)
chr3 (122-205)||(30709790-30709877)
chr3 (122-205)||(40592782-40592869)
chr3 (122-205)||(48438214-48438301)
chr3 (124-205)||(6794715-6794800)
chr3 (122-205)||(40844652-40844738)
chr3 (125-205)||(1417493-1417577)
chr3 (125-205)||(39039995-39040079)
chr3 (122-205)||(25795781-25795868)
chr3 (122-205)||(26298988-26299075)
chr3 (122-205)||(47923906-47923993)
chr3 (125-205)||(3328359-3328443)
chr3 (125-205)||(37466291-37466375)
chr3 (122-205)||(24695164-24695251)
chr3 (5-73)||(27986341-27986408)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (4-319)||(24741825-24742145)
chr4 (28-329)||(51520330-51520637)
chr4 (28-329)||(9224312-9224618)
chr4 (28-329)||(3813897-3814202)
chr4 (28-329)||(9229099-9229405)
chr4 (4-319)||(29760527-29760845)
chr4 (88-329)||(56146677-56146923)
chr4 (33-329)||(18855600-18855900)
chr4 (29-327)||(45357203-45357506)
chr4 (29-327)||(45347723-45348027)
chr4 (43-329)||(5732535-5732828)
chr4 (4-240)||(28468431-28468660)
chr4 (5-239)||(31985529-31985764)
chr4 (122-205)||(10047379-10047466)
chr4 (122-205)||(16623303-16623390)
chr4 (122-205)||(39245994-39246081)
chr4 (124-205)||(5396683-5396768)
chr4 (124-205)||(36315241-36315326)
chr4 (124-205)||(36329450-36329535)
chr4 (122-205)||(38152449-38152536)
chr4 (122-200)||(6743425-6743507)
chr4 (123-204)||(5143260-5143345)
chr4 (125-205)||(5269204-5269288)
chr4 (122-205)||(3796529-3796616)
chr4 (123-204)||(5147678-5147763)
chr4 (124-204)||(3777550-3777634)
chr4 (122-201)||(16630690-16630773)
chr4 (122-205)||(24333809-24333896)
chr4 (123-205)||(54867184-54867269)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (4-319)||(11098819-11099139)
chr2 (4-319)||(14291372-14291693)
chr2 (4-319)||(9296293-9296614)
chr2 (62-329)||(44312563-44312835)
chr2 (29-327)||(32246660-32246966)
chr2 (28-329)||(39811894-39812199)
chr2 (6-240)||(3491716-3491952)
chr2 (4-303)||(25398399-25398699)
chr2 (4-303)||(25403537-25403837)
chr2 (33-327)||(19344296-19344596)
chr2 (33-327)||(19349154-19349454)
chr2 (125-239)||(40738810-40738926)
chr2 (4-167)||(25407663-25407826)
chr2 (122-205)||(21629944-21630030)
chr2 (122-205)||(8040060-8040147)
chr2 (122-202)||(13569331-13569415)
chr2 (124-205)||(28259189-28259274)
chr2 (121-205)||(20522220-20522308)
chr2 (122-205)||(10445454-10445541)
chr2 (122-205)||(17865203-17865290)
chr2 (122-205)||(34682344-34682431)
chr2 (5-77)||(40738963-40739035)
chr2 (122-204)||(34388859-34388945)
chr2 (122-205)||(14699018-14699104)
chr2 (122-205)||(31056044-31056131)
chr2 (122-205)||(33528631-33528718)
chr2 (122-204)||(10707262-10707348)
chr2 (122-202)||(8390160-8390244)
chr2 (127-205)||(42039684-42039766)
chr2 (122-205)||(16940219-16940306)
chr2 (122-205)||(17010884-17010971)
chr2 (122-205)||(39482931-39483018)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (28-329)||(9549-9851)
scaffold0355 (231-329)||(1-98)
scaffold0355 (28-110)||(3754-3836)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (27-329)||(12406205-12406512)
chr7 (28-329)||(24024232-24024539)
chr7 (28-329)||(12396785-12397091)
chr7 (4-303)||(20357439-20357741)
chr7 (28-329)||(31109489-31109794)
chr7 (33-329)||(19992186-19992487)
chr7 (4-320)||(2057842-2058171)
chr7 (4-243)||(1533335-1533579)
chr7 (4-243)||(21639770-21640012)
chr7 (119-329)||(4866603-4866819)
chr7 (4-243)||(21645968-21646210)
chr7 (33-327)||(21812149-21812448)
chr7 (6-243)||(18408726-18408964)
chr7 (6-240)||(18413606-18413840)
chr7 (83-265)||(24266162-24266348)
chr7 (83-265)||(24261283-24261469)
chr7 (83-265)||(16880012-16880197)
chr7 (83-265)||(16884868-16885053)
chr7 (122-205)||(29159803-29159890)
chr7 (123-204)||(21983285-21983370)
chr7 (122-205)||(46516320-46516407)
chr7 (122-205)||(49091661-49091748)
chr7 (128-205)||(47263678-47263757)
chr7 (122-205)||(55948-56034)
chr7 (123-204)||(21988909-21988992)
chr7 (124-205)||(44848696-44848781)
chr7 (125-205)||(9190021-9190105)
chr7 (125-205)||(20284089-20284173)
chr7 (124-205)||(2479337-2479421)
chr7 (122-205)||(2647706-2647793)
chr7 (122-205)||(33332460-33332547)
chr7 (125-205)||(2580390-2580474)
chr7 (124-205)||(35960816-35960901)
chr7 (125-205)||(9185178-9185262)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (28-329)||(22010602-22010908)
chr6 (28-329)||(11856845-11857154)
chr6 (28-329)||(14737482-14737788)
chr6 (28-329)||(14742342-14742647)
chr6 (28-329)||(28184376-28184684)
chr6 (4-303)||(5674661-5674962)
chr6 (33-329)||(6438374-6438674)
chr6 (29-329)||(28155477-28155782)
chr6 (29-303)||(16838647-16838923)
chr6 (29-270)||(33330351-33330596)
chr6 (33-303)||(6005320-6005592)
chr6 (29-270)||(33335848-33336093)
chr6 (9-239)||(22708984-22709207)
chr6 (124-205)||(5757490-5757575)
chr6 (127-205)||(21356036-21356118)
chr6 (124-205)||(31086485-31086570)
chr6 (168-270)||(5343416-5343519)
chr6 (122-205)||(5572251-5572338)
chr6 (123-205)||(4629954-4630040)
chr6 (123-205)||(10077176-10077262)
chr6 (122-205)||(22963700-22963786)
chr6 (122-205)||(23824607-23824693)
chr6 (122-205)||(31979513-31979600)
chr6 (255-302)||(30125940-30125987)
chr6 (125-205)||(5017482-5017566)
chr6 (144-205)||(31936587-31936651)
chr6 (122-193)||(21801354-21801429)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (28-329)||(34967-35273)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (4-297)||(24787256-24787552)
chr1 (29-329)||(25444996-25445301)
chr1 (28-329)||(41398111-41398415)
chr1 (33-329)||(44023785-44024084)
chr1 (33-329)||(39445373-39445673)
chr1 (28-303)||(41390488-41390760)
chr1 (4-243)||(24202662-24202904)
chr1 (33-329)||(1054923-1055223)
chr1 (4-240)||(19358736-19358975)
chr1 (4-240)||(19361325-19361564)
chr1 (4-240)||(19379965-19380204)
chr1 (83-327)||(43988424-43988675)
chr1 (4-79)||(19366201-19366276)
chr1 (122-205)||(47703946-47704033)
chr1 (124-205)||(26644909-26644994)
chr1 (122-205)||(9476261-9476348)
chr1 (122-205)||(19072928-19073015)
chr1 (122-205)||(19120818-19120905)
chr1 (122-205)||(13598398-13598485)
chr1 (122-205)||(16124526-16124613)
chr1 (122-205)||(27104382-27104469)
chr1 (122-205)||(29651811-29651898)
chr1 (124-205)||(3281708-3281793)
chr1 (124-205)||(37069770-37069855)
chr1 (122-205)||(775672-775759)
chr1 (125-205)||(47098837-47098921)
chr1 (29-103)||(25439803-25439877)
chr1 (124-205)||(13604635-13604720)
chr1 (124-205)||(21536581-21536666)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (33-329)||(236-536)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (4-243)||(17845-18087)
scaffold0188 (4-243)||(23938-24180)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (83-303)||(2211-2433)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (83-303)||(148916-149138)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (83-265)||(14269-14455)
scaffold0197 (60-303)||(19102-19347)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (173-319)||(300-449)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (139-265)||(181980-182110)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (124-205)||(8431-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (124-204)||(85684-85768)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (122-205)||(5683-5770)
scaffold0006 (122-205)||(2492-2579)
scaffold0006 (124-205)||(133292-133377)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (124-205)||(43973-44058)
scaffold0087 (124-205)||(36844-36929)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (122-205)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (125-205)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (122-202)||(17266-17350)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6311502 - 6311171
Alignment:
Q  5 aaagcttcctctagtgacttctctttt--agggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6311502 aaagcttcctctagtgacttctcttttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaa 6311403  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaaca 200  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311402 ggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaaca 6311303  T
Q  201 atcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--tt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  6311302 atcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgtt 6311203  T
Q  298 gttgtttgcttggaaaccatttgttctcattg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311202 gttgtttgcttggaaaccatttgttctcattg 6311171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36979582 - 36979262
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  36979582 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaa 36979484  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979483 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 36979384  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttg 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  36979383 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttg 36979285  T
Q  299 ttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  36979284 ttgttgttgcttggaaaccattt 36979262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 7289831 - 7290138
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  7289831 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 7289929  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289930 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 7290029  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttat-gcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  7290030 ttttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttg 7290129  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  7290130 ttctcattg 7290138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 4759967 - 4760288
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||     
T  4759967 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaa 4760065  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760066 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaac 4760165  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttg 298  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  4760166 aatcttcttgatgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttg 4760265  T
Q  299 ttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  4760266 ttgttgttgcttggaaaccattt 4760288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30655851 - 30655525
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||     
T  30655851 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaa 30655753  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655752 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 30655653  T
Q  200 aatcttctcggtg----ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg-g 293  Q
    |||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||      
T  30655652 aatcttcttggtgttttttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtt 30655553  T
Q  294 ttttgttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  30655552 ttttgttgttgttgcttggaaaccattt 30655525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 18870453 - 18870772
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  18870453 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaa 18870551  T
Q  103 agctagagcttcttgcaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaa 198  Q
     ||||  | |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18870552 tgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaa 18870651  T
Q  199 caatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || ||||||||||   ||||    
T  18870652 caatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttt 18870750  T
Q  298 gttgtttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18870751 gttgtttgcttggaaaccattt 18870772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 33037700 - 33038019
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  33037700 taaagcttcctctagtgtcttctcttt-agggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaa 33037797  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaaca 200  Q
     ||||  | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037798 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaaca 33037897  T
Q  201 atcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttg 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||    
T  33037898 atcttcttggtgttttgttcttcttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattg 33037996  T
Q  299 ttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  33037997 ttgttgttgcttggaaaccattt 33038019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 18853059 - 18853382
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  18853059 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaa 18853157  T
Q  103 agctagagcttcttgcaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaa 198  Q
     ||||  | |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853158 tgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaa 18853257  T
Q  199 caatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggc---tggt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || ||||||||||   |  |    
T  18853258 caatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttt 18853356  T
Q  295 tttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18853357 tttgttgtttgcttggaaaccatttg 18853382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 25328184 - 25328489
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  25328184 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 25328281  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc--tt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25328282 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttt 25328381  T
Q  223 cctttcttgcttatcttgtttatg-cttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 319  Q
    |||||   | |||||| |||||||  ||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  25328382 cctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggttgttttgttgttgttggcttggagaccattt 25328479  T
Q  320 gttctcattg 329  Q
    ||||||||||    
T  25328480 gttctcattg 25328489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 10689034 - 10689354
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaa-gggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  10689034 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga 10689132  T
Q  102 tagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaa 198  Q
      ||||  | |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689133 aggctattgtttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaa 10689232  T
Q  199 caatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||  |||||| || ||||    
T  10689233 caatcttcttggtgttttgttcttcctttcttacttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgttttt 10689331  T
Q  298 gttgt--ttgcttggaaaccatt 318  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  10689332 gttgttgttgcttggaaaccatt 10689354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 1261847 - 1262089
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||      
T  1261847 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaa-gcttgca 1261945  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1261946 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaac 1262044  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1262045 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttctatcttatcttgttt 1262089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 39784734 - 39785035
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39784734 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 39784830  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  39784831 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 39784929  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgtt 322  Q
    ||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  39784930 ttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgtt 39785028  T
Q  323 ctcattg 329  Q
    |||||||    
T  39785029 ctcattg 39785035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Original strand, 31071124 - 31071362
Alignment:
Q  6 aagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatag 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  ||    
T  31071124 aagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaag 31071222  T
Q  105 ctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 200  Q
    |||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||    
T  31071223 ctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaaca 31071321  T
Q  201 atcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31071322 atctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 31071362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26288094 - 26287866
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||      
T  26288094 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaa-cacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgca 26287997  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||     | || |      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287996 agcta-----tttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 26287908  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26287907 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 26287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26301351 - 26301123
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||      
T  26301351 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaa-cacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgca 26301254  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||     | || |      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301253 agcta-----tttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 26301165  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26301164 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 26301123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26313345 - 26313117
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||      
T  26313345 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaa-cacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgca 26313248  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||     | || |      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313247 agcta-----tttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 26313159  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26313158 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 26313117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35745566 - 35745294
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 129  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  35745566 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 35745470  T
Q  130 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 223  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  35745469 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 35745371  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  35745370 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 35745294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Original strand, 10684224 - 10684410
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10684224 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 10684321  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  10684322 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 10684410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403327
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26403327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4456113 - 4456028
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456113 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7412426 - 7412305
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgt 218  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  7412426 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttcatggtgtgtttgt 7412327  T
Q  219 tcttcctttc-ttgcttatctt 239  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  7412326 tccttctttcattgcttatctt 7412305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 23799587 - 23799674
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23799587 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 23799674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 19175766 - 19175851
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19175766 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696693
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 4696693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6127308 - 6127224
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  6127308 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 203
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  144 tggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752491
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19752491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 5702493 - 5702580
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5702493 cttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5702580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 1457067 - 1457373
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  1457067 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 1457165  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457166 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 1457265  T
Q  225 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 321  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  1457266 tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 1457365  T
Q  322 tctcattg 329  Q
    ||||||||    
T  1457366 tctcattg 1457373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31180418 - 31180138
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgata 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  31180418 taaagcttcctctagtgtcttctcttttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaag 31180319  T
Q  104 gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 201  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180318 gctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 31180219  T
Q  202 tcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 281  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31180218 tcttcttggtgttttgttctttctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30631610 - 30631283
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||     
T  30631610 taaagcttcctctagtgacttctcttt-agggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaa 30631512  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaaca 200  Q
     ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30631511 ggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaaca 30631412  T
Q  201 atcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgt 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30631411 atcttcttggtgttttgttcttcctttcttacttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggct-gttttgt 30631313  T
Q  300 tgt--ttgcttggaaaccatttgttctcat 327  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  30631312 tgttgttgcttgaaaaccatttgttctcat 30631283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43592459 - 43592152
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43592459 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43592361  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592360 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43592261  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  43592260 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 43592161  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  43592160 ttctcattg 43592152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27449994 - 27449687
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  27449994 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 27449896  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449895 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 27449796  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg--gttttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27449795 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttg 27449696  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    | |||||||    
T  27449695 tactcattg 27449687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43598904 - 43598597
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43598904 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43598806  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598805 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43598706  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  43598705 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43598606  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  43598605 ttctcattg 43598597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43604396 - 43604089
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43604396 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43604298  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604297 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43604198  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  43604197 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43604098  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  43604097 ttctcattg 43604089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43609888 - 43609581
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43609888 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43609790  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609789 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43609690  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  43609689 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43609590  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  43609589 ttctcattg 43609581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27445150 - 27444843
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  27445150 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 27445052  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445051 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 27444952  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg--gttttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27444951 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttg 27444852  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    | |||||||    
T  27444851 tactcattg 27444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15044865 - 15044560
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  15044865 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaacctttt 15044768  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15044767 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcc 15044668  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||| ||||||||    
T  15044667 ttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttg 15044569  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  15044568 ttctcattg 15044560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 28807485 - 28807786
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaac 131  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  28807485 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaga--ttcttgtaaccttttgtaac 28807581  T
Q  132 actttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctt 226  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  28807582 actt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttt 28807680  T
Q  227 tcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 323  Q
    |   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28807681 taccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgagtggttttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttc 28807780  T
Q  324 tcattg 329  Q
    ||||||    
T  28807781 tcattg 28807786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38219602 - 38219302
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||      
T  38219602 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgca 38219504  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219503 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 38219405  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  38219404 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttt 38219308  T
Q  298 gttgtt 303  Q
    ||||||    
T  38219307 gttgtt 38219302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Original strand, 37556533 - 37556833
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  37556533 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaa 37556629  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  37556630 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccat 37556729  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 323  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  37556730 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctc 37556829  T
Q  324 tcat 327  Q
    ||||    
T  37556830 tcat 37556833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Original strand, 37561355 - 37561655
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  37561355 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaa 37561451  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  37561452 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccat 37561551  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 323  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  37561552 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctc 37561651  T
Q  324 tcat 327  Q
    ||||    
T  37561652 tcat 37561655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38192369 - 38192077
Alignment:
Q  12 cctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 110  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||       
T  38192369 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt 38192271  T
Q  111 cttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 207  Q
     |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38192270 -ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt 38192172  T
Q  208 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38192171 tggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtt 38192077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24136052 - 24135809
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||      
T  24136052 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaa-gcttgca 24135954  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135953 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 24135855  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24135854 aatcttcttggtgtgtttgttcttccttttctagcttatcttgttt 24135809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35387866 - 35387624
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   | | ||||||||| |||||      
T  35387866 taaaacttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaa-gcttgca 35387768  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35387767 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaac 35387669  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387668 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctcgttt 35387624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 271
Target Start/End: Original strand, 31396953 - 31397144
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31396953 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 31397050  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgt---tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttg 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31397051 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgtt-ttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttg 31397144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2785550 - 2785278
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 129  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | || ||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  2785550 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 2785454  T
Q  130 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 223  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  2785453 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 2785355  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  2785354 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 2785278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 271
Target Start/End: Original strand, 31401810 - 31402001
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31401810 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggcca 31401907  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttg 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31401908 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttg 31402001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33791491 - 33791219
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 129  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  33791491 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 33791395  T
Q  130 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 223  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  33791394 acacattcacatattggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 33791296  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
     ||| | | ||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  33791295 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctctatatgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 33791219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33768299 - 33768169
Alignment:
Q  88 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg 183  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  33768299 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccacattg 33768202  T
Q  184 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33768201 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt 33768169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15464735 - 15464532
Alignment:
Q  5 aaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||      
T  15464735 aaagcttccttttgtgtcttctcttttagggttcattattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgca 15464638  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaa 198  Q
    |||||    |||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  15464637 agctattt-ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaa 15464539  T
Q  199 caatctt 205  Q
    |||||||    
T  15464538 caatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 9353344 - 9353429
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353344 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 36932362 - 36932447
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932362 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10281838 - 10281751
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281838 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19588833 - 19588746
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588833 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Original strand, 11916982 - 11917068
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916982 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14520315 - 14520230
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520315 tttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3880386 - 3880299
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  3880386 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatctt 3880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004057
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 17004057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Original strand, 12084187 - 12084269
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 202  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12084187 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832259
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatctt 28832259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127507
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 42127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 28503756 - 28504067
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  28503756 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaa 28503855  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaaca 200  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503856 ggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaaca 28503955  T
Q  201 atcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  28503956 atcttctcggtgttttgttcttcctt---------tcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggct-gttttgt 28504045  T
Q  300 tgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  28504046 tgttgttgcttggaaaccattt 28504067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7167449 - 7167129
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  7167449 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaa 7167351  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167350 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 7167251  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttg 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  7167250 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggct-gttttg 7167152  T
Q  299 ttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  7167151 ttgttgttgcttggaaaccattt 7167129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 22173100 - 22173406
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22173100 ttttagggttcatattaggagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 22173198  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173199 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 22173298  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     |||   ||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22173299 ttttaccgcttatcttattt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 22173397  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  22173398 ttctcattg 22173406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 2671478 - 2671800
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||||| |||||      
T  2671478 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaa-gcttgca 2671576  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    | |||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671577 atctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 2671676  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--- 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||| ||       
T  2671677 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttg 2671775  T
Q  296 ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  2671776 ttgttgtttgcttggagaccatttg 2671800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 8738955 - 8739278
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||     
T  8738955 taaagcttcctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaa 8739053  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739054 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 8739153  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| | ||||    
T  8739154 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggttttt 8739252  T
Q  298 gttg---tttgcttggaaaccatttg 320  Q
    ||||   |||||||||||||||||||    
T  8739253 gttgttatttgcttggaaaccatttg 8739278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 9091193 - 9091516
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||     
T  9091193 taaagcttcctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaa 9091291  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091292 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 9091391  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| | ||||    
T  9091392 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggttttt 9091490  T
Q  298 gttg---tttgcttggaaaccatttg 320  Q
    ||||   |||||||||||||||||||    
T  9091491 gttgttatttgcttggaaaccatttg 9091516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8477569 - 8477267
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtgggg-aaacaccaaagggtagaatctagggtctgtct--tgtgtaaagcttg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |  ||||||| |||||    
T  8477569 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgtaa-gcttg 8477471  T
Q  101 atagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtca 197  Q
      |||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477470 caagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtca 8477371  T
Q  198 acaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt 296  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||  | | | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8477370 acaatcttcttggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttatctttgtggtgttgttctacactagtctagggctggttt 8477274  T
Q  297 tgttgtt 303  Q
    |||||||    
T  8477273 tgttgtt 8477267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 40372688 - 40372929
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||      
T  40372688 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgca 40372786  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372787 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 40372885  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40372886 aatcttcttggtgttttgttcttcctatcttgcttatcttgttt 40372929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 28501589 - 28501750
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  28501589 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaa 28501688  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 164  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501689 ggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18656598 - 18656305
Alignment:
Q  43 tgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcat 141  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18656598 tgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcat 18656502  T
Q  142 attggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-ttcctttcttgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| |||||||   | |    
T  18656501 attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtt 18656402  T
Q  234 tatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattg 329  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18656401 tatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattg 18656305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Original strand, 26928484 - 26928721
Alignment:
Q  5 aaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |    
T  26928484 aaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaa 26928582  T
Q  104 gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaaca 200  Q
    ||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26928583 gctattttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaaca 26928682  T
Q  201 atcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 239  Q
    ||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  26928683 atctt-ttggtgtgtttgttctttctttctagcttatctt 26928721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Original strand, 2676993 - 2677297
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 125  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  2676993 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 2677089  T
Q  126 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 220  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  2677090 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 2677188  T
Q  221 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 317  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||    
T  2677189 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 2677287  T
Q  318 ttgttctcat 327  Q
    ||| ||||||    
T  2677288 ttgctctcat 2677297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32143524 - 32143287
Alignment:
Q  5 aaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |    
T  32143524 aaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaa 32143426  T
Q  104 gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaac 199  Q
    ||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  32143425 gctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaac 32143327  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 239  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32143326 aatctttt-ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 32143287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1306150 - 1305914
Alignment:
Q  6 aagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatag 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  |     
T  1306150 aagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaaa 1306052  T
Q  105 ctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 201  Q
    |||    |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306051 ctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 1305953  T
Q  202 tcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1305952 tctt-ttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 1305914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 303
Target Start/End: Original strand, 2672837 - 2673114
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 125  Q
    |||| |||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  2672837 tttaaggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 2672933  T
Q  126 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 220  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  2672934 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 2673032  T
Q  221 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  2673033 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 2673114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8512342 - 8512202
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8512342 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 8512245  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8512244 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc 8512202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8517222 - 8517082
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8517222 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 8517125  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8517124 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc 8517082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32475608 - 32475424
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32475608 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 32475512  T
Q  180 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  32475511 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 32475424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24968286 - 24968010
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttt 125  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||    
T  24968286 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaagtaccaaagggtaga-tctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 24968190  T
Q  126 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 220  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  24968189 tgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 24968091  T
Q  221 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
     ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  24968090 tttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 24968010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32480466 - 32480282
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32480466 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 32480370  T
Q  180 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  32480369 attggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 32480282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27453161 - 27452924
Alignment:
Q  5 aaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata 103  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |    
T  27453161 aaagcttccttttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaataggaattgttcttgtgtaa-gcttgcaa 27453063  T
Q  104 gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaac 199  Q
    ||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||    
T  27453062 gctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaac 27452964  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 239  Q
    |||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27452963 aatctt-ttggtgtgtttgttccttctttcttgcttatctt 27452924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986567
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgtt 219  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgtt 27986547  T
Q  220 cttcctttcttgcttatctt 239  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  27986548 cattctttcttgcttatctt 27986567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 8370488 - 8370573
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370488 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 27974954 - 27975039
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974954 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10207981 - 10207836
Alignment:
Q  159 ctctctcccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttag 254  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||    
T  10207981 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttag 10207884  T
Q  255 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  10207883 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 10207836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 18552883 - 18552970
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18552883 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 18552970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36029180 - 36029094
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgc--tctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36029180 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16264435 - 16264350
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16264435 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21711308 - 21711223
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21711308 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21711223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Original strand, 1736305 - 1736389
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1736305 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1309878 - 1309819
Alignment:
Q  181 ttggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1309878 ttggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 1309819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 3716002 - 3716089
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3716002 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 3716089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 30709790 - 30709877
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709790 cttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 40592782 - 40592869
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40592782 cttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 40592869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48438301 - 48438214
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  48438301 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatctt 48438214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 6794715 - 6794800
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  6794715 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatctt 6794800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40844738 - 40844652
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  40844738 cttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatctt 40844652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417577
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 1417577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25795868 - 25795781
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795868 ctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26299075 - 26298988
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26299075 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 26298988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 47923906 - 47923993
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47923906 cttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 47923993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328443
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggc-tgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatctt 3328443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466291
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 37466291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 24695164 - 24695251
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  24695164 cttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 24695251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Original strand, 27986341 - 27986408
Alignment:
Q  5 aaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaa 73  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  27986341 aaagcttccttttgtgtcttctcttttagggttgatattgagagagt-gggaaacacaaatgggtagaa 27986408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24742145 - 24741825
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  24742145 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaa 24742047  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742046 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 24741947  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttg 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24741946 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttg 24741848  T
Q  299 ttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  24741847 ttgttgttgcttggaaaccattt 24741825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51520637 - 51520330
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  51520637 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 51520539  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520538 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 51520439  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| |  |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  51520438 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 51520339  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  51520338 ttctcattg 51520330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 9224312 - 9224618
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  9224312 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 9224410  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224411 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9224510  T
Q  225 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  9224511 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 9224609  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  9224610 ttctcattg 9224618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3814202 - 3813897
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  3814202 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaacctttt 3814106  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3814105 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttc 3814006  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  3814005 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 3813906  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
     ||||||||    
T  3813905 ctctcattg 3813897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 9229099 - 9229405
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  9229099 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 9229197  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229198 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9229297  T
Q  225 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  9229298 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 9229396  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  9229397 ttctcattg 9229405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29760845 - 29760527
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttga 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||     
T  29760845 taaagcttcctctagtgtcttctctt--agggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgc 29760749  T
Q  102 tagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaa 198  Q
      ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760748 aggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaa 29760649  T
Q  199 caatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||    
T  29760648 caatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctaggg-ttgtttt 29760551  T
Q  298 gttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  29760550 gttgttgttgcttggaaaccattt 29760527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 329
Target Start/End: Original strand, 56146677 - 56146923
Alignment:
Q  88 tgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggc 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  56146677 tgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggc 56146775  T
Q  186 tgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagt 283  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  56146776 tgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagt 56146875  T
Q  284 ctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattg 329  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  56146876 ctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattg 56146923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18855900 - 18855600
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  18855900 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 18855804  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  18855803 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 18855705  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 324  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18855704 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttct 18855605  T
Q  325 cattg 329  Q
    |||||    
T  18855604 cattg 18855600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Original strand, 45357203 - 45357506
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  45357203 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttg 45357300  T
Q  128 taacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--c 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45357301 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcc 45357400  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  45357401 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 45357499  T
Q  321 ttctcat 327  Q
    |||||||    
T  45357500 ttctcat 45357506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Original strand, 45347723 - 45348027
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||    
T  45347723 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggt-cttgtaaccttttg 45347821  T
Q  128 taacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--c 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45347822 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcc 45347921  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  45347922 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 45348020  T
Q  321 ttctcat 327  Q
    |||||||    
T  45348021 ttctcat 45348027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5732828 - 5732535
Alignment:
Q  43 tgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcat 141  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5732828 tgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcat 5732732  T
Q  142 attggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-ttcctttcttgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| |||||||   | |    
T  5732731 attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtt 5732632  T
Q  234 tatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattg 329  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5732631 tatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattg 5732535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 28468431 - 28468660
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtc-ttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||  |||||||| |||||      
T  28468431 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttattgtgtaa-gcttgca 28468529  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    | |||    || || |      ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28468530 aacta----ttttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaac 28468619  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28468620 aatctt-ttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 28468660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Original strand, 31985529 - 31985764
Alignment:
Q  5 aaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata 103  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |    
T  31985529 aaagcttccttttgtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaa 31985626  T
Q  104 gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 200  Q
    ||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  31985627 gctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 31985725  T
Q  201 atcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 239  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31985726 atctt-ttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 31985764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10047466 - 10047379
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10047466 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10047379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 16623303 - 16623390
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  16623303 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 16623390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39246081 - 39245994
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39246081 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 39245994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 5396683 - 5396768
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396683 tttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 36315241 - 36315326
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36315241 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36315326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 36329450 - 36329535
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36329450 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36329535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152536
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 38152536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 200
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  123 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269288
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 5269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 3796529 - 3796616
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796529 cttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  123 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3777634 - 3777550
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777634 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 201
Target Start/End: Original strand, 16630690 - 16630773
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||    
T  16630690 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333809
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 24333809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54867269 - 54867184
Alignment:
Q  123 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54867269 ttttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 54867184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 11098819 - 11099139
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||      
T  11098819 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgca 11098917  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098918 agctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 11099017  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttg 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  11099018 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttccttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttg 11099116  T
Q  299 ttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  11099117 ttgttgttgcttggaaaccattt 11099139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14291693 - 14291372
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||     
T  14291693 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaa 14291595  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291594 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 14291495  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--- 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||       
T  14291494 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttg 14291396  T
Q  296 ttgttgtttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14291395 ttgttgtttgcttggaaaccattt 14291372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 9296293 - 9296614
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||     
T  9296293 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtataa-gcttgaa 9296391  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296392 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaac 9296491  T
Q  200 aatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--- 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||       
T  9296492 aatcttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttg 9296590  T
Q  296 ttgttgtttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9296591 ttgttgtttgcttggaaaccattt 9296614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 62 - 329
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312835
Alignment:
Q  62 caaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 44312661  T
Q  161 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 256  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  44312662 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 44312760  T
Q  257 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattg 329  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44312761 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattg 44312835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32246966 - 32246660
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  32246966 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttg 32246869  T
Q  128 taacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32246868 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcc 32246769  T
Q  225 ----tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 317  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||| |||||    
T  32246768 tttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccat 32246670  T
Q  318 ttgttctcat 327  Q
    ||||||||||    
T  32246669 ttgttctcat 32246660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 39811894 - 39812199
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  39811894 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 39811991  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc-ttc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39811992 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 39812091  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  39812092 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 39812190  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  39812191 ttctcattg 39812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3491952 - 3491716
Alignment:
Q  6 aagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatag 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  ||    
T  3491952 aagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaag 3491854  T
Q  105 ctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 201  Q
    |||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491853 ctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 3491755  T
Q  202 tcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3491754 tctt-ttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 3491716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25398699 - 25398399
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||      
T  25398699 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgca 25398601  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25398600 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaac 25398502  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  25398501 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttt 25398405  T
Q  298 gttgtt 303  Q
    ||||||    
T  25398404 gttgtt 25398399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25403837 - 25403537
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||      
T  25403837 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgca 25403739  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25403738 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaac 25403640  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  25403639 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttt 25403543  T
Q  298 gttgtt 303  Q
    ||||||    
T  25403542 gttgtt 25403537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19344596 - 19344296
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 129  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  19344596 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19344500  T
Q  130 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 223  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19344499 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcc 19344400  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 321  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  19344399 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19344302  T
Q  322 tctcat 327  Q
    ||||||    
T  19344301 tctcat 19344296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19349454 - 19349154
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 129  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  19349454 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19349358  T
Q  130 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 223  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19349357 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcc 19349258  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 321  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  19349257 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19349160  T
Q  322 tctcat 327  Q
    ||||||    
T  19349159 tctcat 19349154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738810
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 221  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctccccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttct 40738828  T
Q  222 tcctttcttgcttatctt 239  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40738827 tcctttctagcttatctt 40738810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25407826 - 25407663
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   || |||||||| |||||||      
T  25407826 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgt-aagcttgca 25407728  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 167  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25407727 agcta-tttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccc 25407663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21630030 - 21629944
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21630030 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 21629944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040060
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 8040060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13569415 - 13569331
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13569415 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 28259189 - 28259274
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259189 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20522308 - 20522220
Alignment:
Q  121 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20522308 ccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20522220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 10445454 - 10445541
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10445454 cttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 10445541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17865290 - 17865203
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17865290 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatctt 17865203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 34682344 - 34682431
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34682344 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 34682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 40739035 - 40738963
Alignment:
Q  5 aaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatcta 77  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  40739035 aaagcttactattgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaacta 40738963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34388945 - 34388859
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388945 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 14699018 - 14699104
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14699018 cttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14699104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056044
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 33528631 - 33528718
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33528631 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 33528718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Original strand, 10707262 - 10707348
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707262 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Original strand, 8390160 - 8390244
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8390160 cttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Original strand, 42039684 - 42039766
Alignment:
Q  127 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039684 gtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940306
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 16940306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010971
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 17010971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39483018 - 39482931
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39483018 cttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39482931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9851
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  9549 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 9645  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9745  T
Q  225 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  9746 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctc-ttgtgtggttttgctatatactagcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgct 9844  T
Q  323 ctcattg 329  Q
    |||||||    
T  9845 ctcattg 9851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 329
Target Start/End: Original strand, 1 - 98
Alignment:
Q  231 gcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcatt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  1 gcttatcttgtttatgcttgttagctc---gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcatt 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Original strand, 3754 - 3836
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||    
T  3754 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag 3836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12406512 - 12406205
Alignment:
Q  27 cttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  12406512 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttt 12406414  T
Q  126 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12406413 tgtaacactttctcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttt 12406314  T
Q  224 ctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  12406313 cttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccattt 12406215  T
Q  320 gttctcattg 329  Q
    ||||||||||    
T  12406214 gttctcattg 12406205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 24024232 - 24024539
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||    
T  24024232 ttttagggttcatcgtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacatttt 24024329  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgtttt-gttctt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  24024330 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttctt 24024429  T
Q  223 ccttt-cttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||   ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24024430 ccttttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatatactagtcataggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 24024529  T
Q  320 gttctcattg 329  Q
    ||||||||||    
T  24024530 gttctcattg 24024539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12397091 - 12396785
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  12397091 ttttagggttcatattgtgatagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagag-ttcttgtaacctttt 12396993  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt-c 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12396992 gtaacactttctcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 12396893  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    ||||   ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  12396892 ctttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 12396794  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  12396793 ttctcattg 12396785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 303
Target Start/End: Original strand, 20357439 - 20357741
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||     
T  20357439 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaa 20357538  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaaca 200  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357539 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaaca 20357638  T
Q  201 atcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttg 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  20357639 atcttcttggtattttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttg 20357736  T
Q  299 ttgtt 303  Q
    |||||    
T  20357737 ttgtt 20357741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 31109489 - 31109794
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  31109489 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 31109586  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31109587 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttc 31109686  T
Q  224 c-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 319  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  31109687 cttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 31109784  T
Q  320 gttctcattg 329  Q
    ||||||||||    
T  31109785 gttctcattg 31109794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19992487 - 19992186
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19992487 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 19992391  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  19992390 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 19992291  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 324  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19992290 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagccatttgttct 19992191  T
Q  325 cattg 329  Q
    |||||    
T  19992190 cattg 19992186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2058171 - 2057842
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaa-gggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  2058171 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttga 2058073  T
Q  102 tagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaa 198  Q
      ||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058072 atgctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaa 2057973  T
Q  199 caatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttg----tttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || |||||||||| |    
T  2057972 caatcttcttggtgttttgttcttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgg 2057873  T
Q  293 gtt---ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  2057872 tttttgttgttgtttgcttggaaaccatttg 2057842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 1533335 - 1533579
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttga 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||     
T  1533335 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgc 1533433  T
Q  102 tagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaa 198  Q
     |||||  | |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533434 aagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaa 1533533  T
Q  199 caatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1533534 caatcttattggtgtgtttgttctttctttcttgcttatattgttt 1533579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21640012 - 21639770
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||      
T  21640012 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgca 21639914  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639913 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 21639815  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639814 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 21639770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4866819 - 4866603
Alignment:
Q  119 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866819 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt 4866720  T
Q  217 gttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgctttt-gttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttgga 311  Q
    |||||||||||    ||||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  4866719 gttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttgga 4866621  T
Q  312 aaccatttgttctcattg 329  Q
     ||||||||| |||||||    
T  4866620 gaccatttgtcctcattg 4866603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21646210 - 21645968
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||      
T  21646210 taaatcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgca 21646112  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646111 agctattt-ttcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaac 21646013  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646012 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 21645968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Original strand, 21812149 - 21812448
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagctt-gata-gctagagcttcttgcaaccttttgta 129  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||||||||    
T  21812149 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagag--tcttggaaccttttgta 21812245  T
Q  130 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcc 224  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||     
T  21812246 agactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttct 21812344  T
Q  225 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 323  Q
    |||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  21812345 tttaccgtttatcttgtttatgcttgttaactctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgttagcttggaagccatttgctc 21812444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18408964 - 18408726
Alignment:
Q  6 aagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatag 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  ||    
T  18408964 aagcttcctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaag 18408867  T
Q  105 ctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 201  Q
     ||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408866 ttattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18408768  T
Q  202 tcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18408767 tctt-ttggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgttt 18408726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18413840 - 18413606
Alignment:
Q  6 aagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatag 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |     
T  18413840 aagcttcctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaat 18413743  T
Q  105 ctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaat 202  Q
    |||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413742 ctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaat 18413644  T
Q  203 cttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 240  Q
    ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18413643 ctt-ttggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttg 18413606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Original strand, 24266162 - 24266348
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24266162 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 24266259  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24266260 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 24266348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Original strand, 24261283 - 24261469
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24261283 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 24261380  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24261381 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 24261469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16880197 - 16880012
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16880197 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 16880100  T
Q  180 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  16880099 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 16880012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16885053 - 16884868
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16885053 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 16884956  T
Q  180 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  16884955 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 16884868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29159890 - 29159803
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29159890 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 29159803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  123 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 46516320 - 46516407
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46516320 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 46516407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 49091748 - 49091661
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49091748 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatctt 49091661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  128 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 56034 - 55948
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  56034 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 55948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  123 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 44848696 - 44848781
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848696 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190105
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9190105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284089
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20284089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2479421 - 2479337
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479421 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctccccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 2647706 - 2647793
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2647706 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatctt 2647793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 33332460 - 33332547
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  33332460 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 33332547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2580474 - 2580390
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  2580474 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 2580390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960816
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatctt 35960816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185262
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9185262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 22010602 - 22010908
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22010602 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 22010700  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010701 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 22010800  T
Q  225 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     ||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22010801 ttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 22010899  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  22010900 ttctcattg 22010908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11857154 - 11856845
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  11857154 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 11857056  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg---ttttgttct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||    
T  11857055 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtttttttgttct 11856956  T
Q  222 tcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 317  Q
    ||| ||| | |||| |||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  11856955 tccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccat 11856857  T
Q  318 ttgttctcattg 329  Q
    ||||||||||||    
T  11856856 ttgttctcattg 11856845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 14737482 - 14737788
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  14737482 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 14737579  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc-ttc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14737580 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 14737679  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctc-tttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 319  Q
     |||   ||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  14737680 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 14737778  T
Q  320 gttctcattg 329  Q
    ||||||||||    
T  14737779 gttctcattg 14737788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 14742342 - 14742647
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  14742342 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 14742439  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14742440 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 14742539  T
Q  225 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  14742540 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttg 14742638  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  14742639 ttctcattg 14742647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28184684 - 28184376
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  | ||| ||||||||    
T  28184684 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tgttgtaacctttt 28184587  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28184586 gtaacactttctcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 28184487  T
Q  225 tttct--tgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaacca--t 317  Q
    ||| |   ||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  |    
T  28184486 tttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 28184388  T
Q  318 ttgttctcattg 329  Q
    ||||||||||||    
T  28184387 ttgttctcattg 28184376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 303
Target Start/End: Original strand, 5674661 - 5674962
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttga 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||     
T  5674661 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgc 5674759  T
Q  102 tagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaa 198  Q
     |||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674760 aagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaa 5674859  T
Q  199 caatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  5674860 caatctctttggtgtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgta-ttctctttgtggtgttgctctacactagactagggctggtttt 5674956  T
Q  298 gttgtt 303  Q
    ||||||    
T  5674957 gttgtt 5674962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6438674 - 6438374
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  6438674 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 6438578  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  6438577 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 6438479  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 324  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6438478 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccattggttct 6438379  T
Q  325 cattg 329  Q
    |||||    
T  6438378 cattg 6438374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Original strand, 28155477 - 28155782
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||    
T  28155477 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaa--ttcttgtaaccttttg 28155573  T
Q  128 taacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-- 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      
T  28155574 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 28155673  T
Q  223 cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  28155674 catttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 28155773  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
     ||||||||    
T  28155774 ctctcattg 28155782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16838923 - 16838647
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttt 125  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||    
T  16838923 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 16838827  T
Q  126 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 220  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  16838826 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 16838728  T
Q  221 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
     ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  16838727 tttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 16838647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 270
Target Start/End: Original strand, 33330351 - 33330596
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 125  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  33330351 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 33330447  T
Q  126 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 220  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  33330448 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 33330546  T
Q  221 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgctttt 270  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33330547 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggtttt 33330596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6005592 - 6005320
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 129  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  6005592 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 6005496  T
Q  130 acactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 223  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  6005495 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 6005397  T
Q  224 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  6005396 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 6005320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 270
Target Start/End: Original strand, 33335848 - 33336093
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 125  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  33335848 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 33335944  T
Q  126 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 220  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  33335945 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 33336043  T
Q  221 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgctttt 270  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33336044 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggtttt 33336093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22709207 - 22708984
Alignment:
Q  9 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagcta 107  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   || |||||||| |||||||  |||||    
T  22709207 cttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta 22709109  T
Q  108 gagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatc 203  Q
        || |       | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  | ||||| ||||||||||     
T  22709108 ----tttt-------tcttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaat- 22709021  T
Q  204 ttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 239  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22709020 tttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 22708984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 5757490 - 5757575
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757490 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21356118 - 21356036
Alignment:
Q  127 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356118 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086570
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatctt 31086570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5343519 - 5343416
Alignment:
Q  168 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtg 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  5343519 agattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtg 5343423  T
Q  264 tgctttt 270  Q
    || ||||    
T  5343422 tggtttt 5343416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 5572251 - 5572338
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  5572251 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 5572338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  123 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 205
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077262
Alignment:
Q  123 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 10077262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22963786 - 22963700
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22963786 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 22963700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 23824607 - 23824693
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23824607 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 23824693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31979600 - 31979513
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31979600 cttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31979513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 302
Target Start/End: Original strand, 30125940 - 30125987
Alignment:
Q  255 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt 302  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30125940 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgt 30125987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017566
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatctt 5017566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936587
Alignment:
Q  144 tggattggagagctgctc--tctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 31936587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 21801354 - 21801429
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgct--ctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgg 193  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801354 cttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 34967 - 35273
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  34967 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 35065  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35066 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 35165  T
Q  225 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  35166 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 35264  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  35265 ttctcattg 35273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 297
Target Start/End: Original strand, 24787256 - 24787552
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||     
T  24787256 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaa 24787355  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct--ctcccagattaggccatattggctgaactgggtcaaca 200  Q
     ||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787356 ggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaaca 24787455  T
Q  201 atcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtttt 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||| ||||    
T  24787456 atcttcttggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttt 24787552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Original strand, 25444996 - 25445301
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  25444996 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaacctttt 25445092  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt- 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25445093 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttt 25445192  T
Q  223 -cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttg 320  Q
     | |||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  25445193 ccttttaccgtttatcttgtttacgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttg 25445292  T
Q  321 ttctcattg 329  Q
    |||||||||    
T  25445293 ttctcattg 25445301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41398415 - 41398111
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  41398415 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 41398318  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398317 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 41398218  T
Q  225 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggtt-----ttgttgtttgcttggaaacca 316  Q
    ||     |||||||||||||||| ||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||| ||||    
T  41398217 tt-----cttatcttgtttatgctttggtatctctttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagacca 41398124  T
Q  317 tttgttctcattg 329  Q
    | |||||||||||    
T  41398123 tatgttctcattg 41398111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 44023785 - 44024084
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44023785 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 44023881  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-cctt 226  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44023882 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 44023980  T
Q  227 tcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctc 325  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44023981 taccatttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctc 44024080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39445673 - 39445373
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39445673 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 39445577  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  39445576 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 39445478  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 324  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39445477 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttca 39445378  T
Q  325 cattg 329  Q
    |||||    
T  39445377 cattg 39445373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41390760 - 41390488
Alignment:
Q  28 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  41390760 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 41390663  T
Q  127 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41390662 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatcttctcgatgttttgttcttcc 41390563  T
Q  225 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
    ||     |||||||||||||||| ||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41390562 tt-----cttatcttgtttatgctttgatatctctttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggct-gttttgttgtt 41390488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 24202662 - 24202904
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||      
T  24202662 taaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgca 24202760  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202761 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 24202859  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202860 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 24202904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 1054923 - 1055223
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  1054923 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 1055019  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  1055020 cactt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 1055118  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 324  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||  ||||||||  |||||||||     
T  1055119 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagacatttgttca 1055218  T
Q  325 cattg 329  Q
    |||||    
T  1055219 cattg 1055223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 19358736 - 19358975
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||      
T  19358736 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgca 19358834  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19358835 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaac 19358933  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 240  Q
    |||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19358934 aatctt-ttgatgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19358975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 19361325 - 19361564
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||      
T  19361325 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgca 19361423  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    | |||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19361424 aactattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaac 19361522  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 240  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19361523 aatctt-ttggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19361564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 19379965 - 19380204
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||      
T  19379965 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgca 19380063  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    | |||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19380064 aactattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaac 19380162  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 240  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19380163 aatctt-ttggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19380204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 43988424 - 43988675
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43988424 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 43988521  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 275  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||| |||| || || | |  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  43988522 cattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatgcttgttagctcttagtgtggttgtgctat 43988621  T
Q  276 acactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcat 327  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  43988622 acattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcat 43988675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 19366201 - 19366276
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 79  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19366201 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctagg 19366276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704033
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47704033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 26644909 - 26644994
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644909 tttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476261
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9476261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19073015 - 19072928
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073015 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19120905 - 19120818
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120905 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598398
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 13598398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 16124526 - 16124613
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16124526 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 16124613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 27104382 - 27104469
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  27104382 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 27104469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651811
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatctt 29651811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3281793 - 3281708
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281793 tttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37069855 - 37069770
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069855 tttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775672
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 775672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098921
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47098921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Original strand, 25439803 - 25439877
Alignment:
Q  29 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgata 103  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  25439803 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-ctctagggtttgttcatgtgtaaagcttgata 25439877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 13604635 - 13604720
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604635 tttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 21536581 - 21536666
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca-tattggctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||    
T  21536581 tttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatctt 21536666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 236
Alignment:
Q  33 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 130  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  536 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 440  T
Q  131 cactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 225  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  439 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 341  T
Q  226 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 324  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttct 241  T
Q  325 cattg 329  Q
    |||||    
T  240 cattg 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 17845 - 18087
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||      
T  17845 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgca 17943  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17944 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 18042  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18043 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 18087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 23938 - 24180
Alignment:
Q  4 taaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgat 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||      
T  23938 taaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgca 24036  T
Q  103 agctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaac 199  Q
    |||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24037 agctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaac 24135  T
Q  200 aatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 243  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24136 aatctttttggtgtgtttgttcttcctttctttcttatcttgttt 24180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 303
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2433
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2211 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggcca 2308  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 274  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2309 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgcta 2405  T
Q  275 tacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
    |||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  2406 tacattaggcttaggct-gttttgttgtt 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 303
Target Start/End: Original strand, 148916 - 149138
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  148916 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggcca 149013  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 274  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  149014 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgcta 149110  T
Q  275 tacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
    |||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  149111 tacattaggcttaggct-gttttgttgtt 149138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Original strand, 14269 - 14455
Alignment:
Q  83 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14269 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 14366  T
Q  179 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14367 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 14455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 303
Target Start/End: Original strand, 19102 - 19347
Alignment:
Q  60 accaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagc 156  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  19102 accaaagggtaga-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagc 19198  T
Q  157 tgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttg 250  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||    
T  19199 tgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttg 19295  T
Q  251 ttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  |||| |||||||||||    
T  19296 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggct-gttttgttgtt 19347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 319
Target Start/End: Original strand, 300 - 449
Alignment:
Q  173 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttg 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttcttggtgttttgttctttctttctagcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggttttg 398  T
Q  272 ttatacactagtctagggctg-gttttgttgt--ttgcttggaaaccattt 319  Q
     |   ||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  399 ctcctcactagtttagggctgttttttgttgttgttgcttggaaaccattt 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 265
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182110
Alignment:
Q  139 catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | |     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  233 ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg 265  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  182080 ttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtg 182110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 8431 - 8516
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8431 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 85768 - 85684
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 204  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85768 tttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5683
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2492
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatctt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 133292 - 133377
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133292 tttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 43973 - 44058
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43973 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 36844 - 36929
Alignment:
Q  124 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36844 tttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10816 - 10729
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  10816 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 10729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45253
Alignment:
Q  125 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 205  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17350 - 17266
Alignment:
Q  122 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  17350 cttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University