View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1369_low_22 (Length: 461)

Name: NF1369_low_22
Description: NF1369
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1369_low_22
NF1369_low_22
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (8-433)||(32369101-32369526)
chr3 (48-421)||(8169447-8169820)
chr3 (261-421)||(54168571-54168731)
chr3 (336-421)||(53355430-53355515)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (8-433)||(4959067-4959492)
chr1 (261-421)||(26314783-26314943)
chr1 (60-145)||(44537483-44537568)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (8-367)||(18194013-18194372)
chr8 (31-204)||(1182065-1182238)
chr8 (261-421)||(198911-199071)
chr8 (261-421)||(313748-313908)
chr8 (261-421)||(30407030-30407190)
chr8 (261-421)||(43808710-43808870)
chr8 (261-421)||(41948578-41948738)
chr8 (354-421)||(17783375-17783442)
chr8 (363-421)||(1290196-1290254)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (267-433)||(26075706-26075872)
chr4 (177-421)||(50629158-50629402)
chr4 (261-421)||(44150328-44150488)
chr4 (276-415)||(31357946-31358085)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (259-431)||(12368055-12368225)
chr2 (261-421)||(8054162-8054322)
chr2 (261-421)||(36673821-36673981)
chr2 (60-145)||(300836-300921)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (321-429)||(5242574-5242682)
chr7 (261-421)||(7941310-7941470)
chr7 (261-421)||(27760167-27760327)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (261-421)||(46092-46252)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (261-421)||(8316731-8316891)
chr6 (276-421)||(17162881-17163026)
chr6 (261-421)||(17887856-17888016)
chr6 (261-421)||(27569410-27569570)
chr6 (340-424)||(28247939-28248023)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (261-421)||(7100601-7100761)
chr5 (261-421)||(16797439-16797599)
chr5 (261-421)||(12022059-12022219)
chr5 (261-421)||(40368475-40368635)
chr5 (276-421)||(37680821-37680966)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (261-421)||(6276-6436)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (340-424)||(48101-48185)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32369526 - 32369101
Alignment:
Q  8 tgagatgaataacacgtggaacctagttgagttacctgataagaagaaaaccattgatgttaaatggattttcaaagtgaaattgaatcctgatgaatca 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32369526 tgagaagaataacacgtggaacctagatgagttacatgataagaagaaaaccattgatgttaaatggattttcaaagtgaaattgaatcctgatgaatca 32369427  T
Q  108 gtttccaaatacaaagccagattggttgctagaggtttcttatagagatatggtgttgactataatgaggtatttgctccagtagctagattagaaacta 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32369426 ttttccaaatacaaagccagattggttgccagaggtttcttatagagatatggtgttgactataatgaggtatttgctccagtagctaaattagaaacta 32369327  T
Q  208 taagattggtggtggcactggcttgtagcaagaattggtcattatctcatctagatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgta 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32369326 taagattggtggtggcactggcctgtagcaagaattggtcattatctcatatagatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatatgta 32369227  T
Q  308 tgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatgg 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32369226 tgttacacaaccacctgaatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaaacacctagagcatgg 32369127  T
Q  408 aacaagaggattgatcagttcctact 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32369126 aacaagaggattgatcagttcctact 32369101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8169820 - 8169447
Alignment:
Q  48 aagaagaaaaccattgatgttaaatggattttcaaagtgaaattgaatcctgatgaatcagtttccaaatacaaagccagattggttgctagaggtttct 147  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  || |||| ||  ||||||| ||| | || |||||||| |||     
T  8169820 aagaagaaaaacattaatgtgaaatggattttcaaagtcaaattgaatccaaatgacacattttcaaagcacaaagcaagactagtagctagaggcttcc 8169721  T
Q  148 tatagagatatggtgttgactataatgaggtatttgctccagtagctagattagaaactataagattggtggtggcactggcttgtagcaagaattggtc 247  Q
    || |   |||||   ||||||||||||| || ||||| |||||| | ||  ||||||   | ||||||||  | ||| |  |  | || ||||| |||||    
T  8169720 tacattaatatgaaattgactataatgaagtctttgcaccagtatcaaggatagaaatattgagattggttattgcattaaccagcagtaagaaatggtc 8169621  T
Q  248 attatctcatctagatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggag 347  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||  | | ||||||||  |||| |   |||||||| | | ||| | ||||    
T  8169620 attgtttcatttagatgtaaagtctgcattcctaaatggactattggaagaaactatatatgttactgaacctctaagatttgaaatcagaggaagggag 8169521  T
Q  348 catgtggtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  8169520 catatggtgtacaaattacataaatcactttatggctttaagtaggcttctagagcatggaacaagagaattga 8169447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54168731 - 54168571
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  54168731 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 54168632  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  54168631 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 54168571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 53355515 - 53355430
Alignment:
Q  336 aaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
    |||||||||||| || ||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  53355515 aaagggaaggagaatatggtgtatagattacacaaagcactctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 53355430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4959492 - 4959067
Alignment:
Q  8 tgagatgaataacacgtggaacctagttgagttacctgataagaagaaaaccattgatgttaaatggattttcaaagtgaaattgaatcctgatgaatca 107  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||    
T  4959492 tgagaagaataacacctggaaacttgttgagctacctgataagaagaaaaccattgatgttaaatggattttcaaggtgaaattgaatcatgatgggtca 4959393  T
Q  108 gtttccaaatacaaagccagattggttgctagaggtttcttatagagatatggtgttgactataatgaggtatttgctccagtagctagattagaaacta 207  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4959392 atctctaaatacaaagccagattagttgctagaggtttcctacagagatatggtgtagactataatgaggtatttgctccagttgctagactagaaacta 4959293  T
Q  208 taagattggtggtggcactggcttgtagcaagaattggtcattatctcatctagatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgta 307  Q
    | |||||||| |||||||| |   | || || || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  4959292 ttagattggtagtggcacttgtaagcagtaaaaactggtcattatcacatttagatgtaaagtctgcatttctgaatggaccacttgaagaagatgtgta 4959193  T
Q  308 tgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatgg 407  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4959192 tattgcacaaccaccagtatttgaagtaagtggaaaggagcatatggtgtacaagttacacaaagccctctatggcttgaaacaagtacctagagcatgg 4959093  T
Q  408 aacaagaggattgatcagttcctact 433  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  4959092 aataagaggattgatcagttcctact 4959067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 26314783 - 26314943
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  26314783 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 26314882  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  26314883 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 26314943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44537568 - 44537483
Alignment:
Q  60 attgatgttaaatggattttcaaagtgaaattgaatcctgatgaatcagtttccaaatacaaagccagattggttgctagaggttt 145  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44537568 attgatgtcaaatgggttttcaaagtgaaattgaactctgatggacaagtttctaagcacaaagcaagattggtggctagaggttt 44537483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 367
Target Start/End: Original strand, 18194013 - 18194372
Alignment:
Q  8 tgagatgaataacacgtggaacctagttgagttacctgataagaagaaaaccattgatgttaaatggattttcaaagtgaaattgaatcctgatgaatca 107  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  18194013 tgagaagaataacacctggaaacttgttgagctacctgataagaagaaaaccattgatgttaaatggattttcaaggtgaaattgaatcctgatggttca 18194112  T
Q  108 gtttccaaatacaaagccagattggttgctagaggtttcttatagagatatggtgttgactataatgaggtatttgctccagtagctagattagaaacta 207  Q
     | || ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18194113 atctctaaatacaaagccagattagtggctagaggtttcctacagagatatggtgttgactataatgaggtatttgctccagttgctagactagaaacta 18194212  T
Q  208 taagattggtggtggcactggcttgtagcaagaattggtcattatctcatctagatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgta 307  Q
    | |||||||| |||||||| ||  | || || || |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  |  ||||    
T  18194213 ttagattggtagtggcacttgcaagcagtaaaaactggtcactatcacatttagatgtaaagtctgcatttctgaatggaccacttgaagagaaagtgta 18194312  T
Q  308 tgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttaca 367  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18194313 tattacacaaccaccaggatttgaagtaagtgggaaggagcatatggtgtacaagttaca 18194372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 204
Target Start/End: Original strand, 1182065 - 1182238
Alignment:
Q  31 tagttgagttacctgataagaagaaaaccattgatgttaaatggattttcaaagtgaaattgaatcctgatgaatcagtttccaaatacaaagccagatt 130  Q
    ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||   ||||||| ||| ||||||| ||  |    
T  1182065 tagttgaattatcagagaagaagaaaaccattgatgtgaaatgaattttcaaggtaaaaatgaatccagatggcacagtttcaaaacacaaagcaaggct 1182164  T
Q  131 ggttgctagaggtttcttatagagatatggtgttgactataatgaggtatttgctccagtagctagattagaaa 204  Q
     || |||||||| ||| |  || ||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||    
T  1182165 agtggctagaggcttcctgcagcgatatggtgttgattataatgaagtgtttgcactagtggcaagattagaaa 1182238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 199071 - 198911
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  199071 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 198972  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  198971 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 198911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 313908 - 313748
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  313908 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 313809  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  313808 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 313748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 30407190 - 30407030
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  30407190 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 30407091  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  30407090 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 30407030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43808870 - 43808710
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  43808870 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 43808771  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  43808770 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 43808710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 41948578 - 41948738
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | ||||||||  || || ||||||| |    
T  41948578 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacatccaccaggtttcaaaatcaaagggaaatagaatatggtgtata 41948677  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41948678 gattacacaaagctctctatggattgaaacaagcaccaagagcttggaacaagagaattga 41948738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17783442 - 17783375
Alignment:
Q  354 gtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
    |||||||| ||||||||  | || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  17783442 gtgtacaaattacacaagcctctctatggcttgaaacatgctccaagagcatggaataagaggattga 17783375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 421
Target Start/End: Original strand, 1290196 - 1290254
Alignment:
Q  363 ttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  1290196 ttacacaaagctctctatggattgaaacaagcaccaagagcttggaataagagaattga 1290254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 267 - 433
Target Start/End: Original strand, 26075706 - 26075872
Alignment:
Q  267 aagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttac 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26075706 aagtctgcatttctgaatggaccacttgaagaggatgtgtatattacacaaccactaggatttgaagtaagtgggaaggagcatatggtgtacaagttac 26075805  T
Q  367 acaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattgatcagttcctact 433  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26075806 acaaagccctctatggcttgaaataagcacctagagcatggaataagaggattaatcagttcctact 26075872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 50629402 - 50629158
Alignment:
Q  177 gtatttgctccagtagctagattagaaactataagattggtggtggcactggcttgtagcaagaattggtcattatctcatctagatgttaagtctgcat 276  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||| | || ||  | |||||| | | |||||||||| |   |||| | ||||| || ||||| |    
T  50629402 gtatatgctccagttgctagattggaaactgtgagattgatagttgctatagcttgtggaaggaattggtcaatgcatcatttggatgtaaaatctgctt 50629303  T
Q  277 ttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcact 376  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||| ||| || ||||||| |  ||||||||||  ||    
T  50629302 ttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacaaccaccaggtttcgaaatcaaagggaaagaggatatggtgtatagattacacaaagtcct 50629203  T
Q  377 ttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  50629202 ctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 50629158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 44150328 - 44150488
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||  |||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  44150328 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagtcaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 44150427  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  44150428 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 44150488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 415
Target Start/End: Original strand, 31357946 - 31358085
Alignment:
Q  276 tttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcac 375  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || ||||||| |  ||||||||||| |    
T  31357946 tttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacatccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtatagattacacaaagctc 31358045  T
Q  376 tttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagag 415  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31358046 tctatggattgaaacaggcaccaagagcatggaacaagag 31358085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 259 - 431
Target Start/End: Original strand, 12368055 - 12368225
Alignment:
Q  259 tagatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgta 358  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  12368055 tagatgtaaagtctgcatttctgaatggaccacttgaagaggatgtgtat--tacacaaccaccaggatttgaagtaagtgggaaggagcatatggtgta 12368152  T
Q  359 caagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattgatcagttccta 431  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12368153 caagttacaaaaagccctctatggcttgaaacaaacacctatagaatggaataagaggattgatcacttccta 12368225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 8054162 - 8054322
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  8054162 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 8054261  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8054262 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 8054322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 36673821 - 36673981
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  36673821 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 36673920  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  36673921 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 36673981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Original strand, 300836 - 300921
Alignment:
Q  60 attgatgttaaatggattttcaaagtgaaattgaatcctgatgaatcagtttccaaatacaaagccagattggttgctagaggttt 145  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  |||||| || |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  300836 attgatgtcaaatgggttttcagagtgaaattgaactctgatggataagtttctaagcacaaagcaagattggtggctagaggttt 300921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 321 - 429
Target Start/End: Original strand, 5242574 - 5242682
Alignment:
Q  321 cctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattg 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5242574 cctggatttgaagtaaaaggaaaggatcaaatggtgtacaagttacacaaagctctctatggcttgaaacaagcatctagagcatggaacaagaggattg 5242673  T
Q  421 atcagttcc 429  Q
    |||||||||    
T  5242674 atcagttcc 5242682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7941470 - 7941310
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  7941470 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 7941371  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  7941370 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 7941310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 27760167 - 27760327
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  27760167 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 27760266  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27760267 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 27760327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 46252 - 46092
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  46252 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 46153  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  46152 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 46092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8316891 - 8316731
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  8316891 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 8316792  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8316791 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 8316731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 421
Target Start/End: Original strand, 17162881 - 17163026
Alignment:
Q  276 tttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcac 375  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||  | ||||||| |  | |||||| ||||    
T  17162881 tttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacaaccaccaggtttcaaagtcaaagggaaggagagtatggtgtatagatcacacaaggcac 17162980  T
Q  376 tttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  17162981 tatatggtttgaagcaagcaccaagagcctggaacaagagaattga 17163026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17888016 - 17887856
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||| |||||  ||||||| ||||||||||| || ||| || | |||||||| ||| || ||||||| |    
T  17888016 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtccttcagatgaagaagtgtatgtgacacaaccaccaggttttaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtata 17887917  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  17887916 gattacacaaagccctctatggattgaaacaggcaccaagagcttgaaacaagagaattga 17887856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27569570 - 27569410
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || ||  || | |||||||| ||  || ||||||| |    
T  27569570 gatgtaaaatctgcttttctgaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacaaccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaagatatggtgtata 27569471  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  27569470 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcacgaagagcttggaacaagagaattga 27569410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 424
Target Start/End: Original strand, 28247939 - 28248023
Alignment:
Q  340 ggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattgatca 424  Q
    |||||||  |||||||||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28247939 ggaaggaaaatgtggtgtataaactgcataaagcactatatggattaaaacaggctcctagagcatggaacaagaaaattgatca 28248023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7100761 - 7100601
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  7100761 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 7100662  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  7100661 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 7100601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 16797439 - 16797599
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || |||||||||    
T  16797439 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtaca 16797538  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16797539 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 16797599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 12022059 - 12022219
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || ||||||| |    
T  12022059 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtata 12022158  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12022159 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 12022219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 40368635 - 40368475
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| || || || ||  || | |||||||| ||| || ||||||| |    
T  40368635 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccgccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtata 40368536  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  40368535 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 40368475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 421
Target Start/End: Original strand, 37680821 - 37680966
Alignment:
Q  276 tttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcac 375  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||  || | |||||||| ||| || ||||||| |  ||||||||||| |    
T  37680821 tttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacagccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtatagattacacaaagctc 37680920  T
Q  376 tttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  37680921 tctatggattgaaacaggcaccaagaacttggaacaagagaattga 37680966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 421
Target Start/End: Original strand, 6276 - 6436
Alignment:
Q  261 gatgttaagtctgcatttctgaatggaccattagaagaagatctgtatgttacacaaccacctggatttgaagtaaaagggaaggagcatgtggtgtaca 360  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || ||  || | |||||||| ||| || ||||||| |    
T  6276 gatgtaaaatctgcttttctaaatggtcctttagatgaagaagtgtatgtgacacaaccaccaggtttcaaaatcaaagggaaagaggatatggtgtata 6375  T
Q  361 agttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattga 421  Q
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  6376 gattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagaacttggaacaagagaattga 6436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 424
Target Start/End: Original strand, 48101 - 48185
Alignment:
Q  340 ggaaggagcatgtggtgtacaagttacacaaagcactttatggcttgaaacaagcacctagagcatggaacaagaggattgatca 424  Q
    |||||||  |||||||||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48101 ggaaggaaaatgtggtgtataaactgcataaagcactatatggattaaaacaggctcctagagcatggaacaagaaaattgatca 48185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University