View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13712_high_2 (Length: 501)

Name: NF13712_high_2
Description: NF13712
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13712_high_2
NF13712_high_2
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (3-501)||(16743990-16744489)
chr3 (127-416)||(17912483-17912771)
chr3 (54-422)||(2049777-2050147)
chr3 (54-422)||(14842487-14842856)
chr3 (54-422)||(12030073-12030443)
chr3 (54-432)||(13838852-13839232)
chr3 (101-433)||(15858996-15859331)
chr3 (127-293)||(2449238-2449404)
chr3 (117-433)||(51158008-51158325)
chr3 (134-422)||(15936634-15936922)
chr3 (6-189)||(19231982-19232169)
chr3 (134-422)||(15938476-15938764)
chr3 (139-415)||(15614808-15615085)
chr3 (127-259)||(13975722-13975853)
chr3 (127-259)||(45860937-45861068)
chr3 (127-274)||(13954890-13955036)
chr3 (54-173)||(19260749-19260869)
chr3 (348-478)||(15468555-15468686)
chr3 (161-430)||(16821099-16821369)
chr3 (348-478)||(22275119-22275250)
chr3 (139-422)||(55316187-55316471)
chr3 (280-415)||(47984624-47984759)
chr3 (280-415)||(48003198-48003333)
chr3 (139-422)||(41270043-41270327)
chr3 (280-415)||(47993911-47994046)
chr3 (280-415)||(48012484-48012619)
chr3 (6-85)||(3992873-3992953)
chr3 (6-85)||(55513193-55513273)
chr3 (11-88)||(15857120-15857198)
chr3 (6-85)||(2844514-2844594)
chr3 (448-493)||(2449391-2449436)
chr3 (370-422)||(19231945-19231997)
chr3 (6-85)||(54037976-54038056)
chr3 (31-85)||(17955861-17955916)
chr3 (6-85)||(7854305-7854385)
chr3 (25-85)||(45581954-45582016)
chr3 (348-422)||(13955112-13955185)
chr3 (348-422)||(13975944-13976017)
chr3 (360-422)||(45860773-45860834)
chr3 (143-184)||(14080715-14080756)
chr3 (401-433)||(22144532-22144564)
chr3 (134-252)||(11986173-11986293)
chr3 (13-65)||(17191884-17191936)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (127-501)||(22907214-22907588)
chr8 (54-415)||(16193643-16194005)
chr8 (6-422)||(16404852-16405268)
chr8 (54-422)||(43373392-43373761)
chr8 (54-432)||(24928716-24929096)
chr8 (127-293)||(5238184-5238350)
chr8 (127-293)||(24661248-24661414)
chr8 (127-293)||(43685643-43685809)
chr8 (127-419)||(17345540-17345832)
chr8 (139-415)||(24548956-24549233)
chr8 (139-415)||(6774258-6774535)
chr8 (161-422)||(21844594-21844856)
chr8 (161-422)||(21851987-21852249)
chr8 (139-422)||(30120690-30120974)
chr8 (202-422)||(222754-222975)
chr8 (202-422)||(736377-736598)
chr8 (202-422)||(860272-860493)
chr8 (448-501)||(5238144-5238197)
chr8 (448-501)||(24661401-24661454)
chr8 (448-501)||(43685603-43685656)
chr8 (6-85)||(274766-274846)
chr8 (6-85)||(641003-641083)
chr8 (6-85)||(826809-826889)
chr8 (6-85)||(24716714-24716794)
chr8 (139-259)||(16674392-16674512)
chr8 (278-432)||(23837154-23837308)
chr8 (349-430)||(13662481-13662561)
chr8 (369-418)||(16674624-16674672)
chr8 (143-184)||(23226076-23226117)
chr8 (396-433)||(41246613-41246650)
chr8 (6-85)||(39115598-39115678)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (127-501)||(26680089-26680463)
chr4 (6-433)||(54118120-54118551)
chr4 (54-433)||(13246386-13246769)
chr4 (54-418)||(15675009-15675381)
chr4 (54-259)||(122020-122226)
chr4 (127-293)||(10488659-10488825)
chr4 (127-293)||(16327926-16328092)
chr4 (154-415)||(31115603-31115865)
chr4 (54-418)||(10104170-10104523)
chr4 (161-422)||(10644187-10644449)
chr4 (127-274)||(13048221-13048368)
chr4 (139-422)||(47357622-47357906)
chr4 (291-422)||(111362-111493)
chr4 (54-189)||(33240901-33241043)
chr4 (6-85)||(25119059-25119139)
chr4 (448-493)||(10488627-10488672)
chr4 (448-493)||(16328079-16328124)
chr4 (143-325)||(40885570-40885753)
chr4 (344-419)||(7849970-7850044)
chr4 (6-85)||(5682380-5682460)
chr4 (311-372)||(41166116-41166177)
chr4 (401-433)||(44055870-44055902)
chr4 (278-422)||(15044794-15044938)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (127-501)||(7292905-7293279)
chr7 (54-434)||(13036938-13037322)
chr7 (54-422)||(16211733-16212103)
chr7 (54-422)||(36052634-36053003)
chr7 (13-422)||(3059933-3060344)
chr7 (54-422)||(11580661-11581035)
chr7 (127-293)||(11516324-11516490)
chr7 (127-293)||(15441564-15441730)
chr7 (127-293)||(30262129-30262295)
chr7 (127-415)||(47481031-47481320)
chr7 (134-422)||(18253842-18254130)
chr7 (162-419)||(16478985-16479244)
chr7 (128-415)||(13320988-13321278)
chr7 (127-259)||(25292338-25292470)
chr7 (161-422)||(13572644-13572906)
chr7 (139-422)||(10989378-10989661)
chr7 (161-422)||(2437425-2437687)
chr7 (161-404)||(13911046-13911292)
chr7 (448-501)||(15441717-15441770)
chr7 (448-501)||(30262282-30262335)
chr7 (6-85)||(126738-126818)
chr7 (62-419)||(295900-296257)
chr7 (6-85)||(32493898-32493978)
chr7 (448-501)||(11516284-11516337)
chr7 (6-85)||(1936869-1936949)
chr7 (127-169)||(14113989-14114031)
chr7 (127-169)||(14423639-14423681)
chr7 (6-85)||(111121-111201)
chr7 (401-433)||(15822691-15822723)
chr7 (348-422)||(25292560-25292633)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (127-501)||(37066-37440)
scaffold0078 (6-85)||(41632-41712)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (3-419)||(41394191-41394610)
chr1 (54-422)||(20445646-20446019)
chr1 (54-422)||(20931312-20931682)
chr1 (66-422)||(20531411-20531770)
chr1 (54-433)||(20893551-20893933)
chr1 (54-422)||(20913004-20913367)
chr1 (54-422)||(37844374-37844746)
chr1 (127-293)||(51452589-51452755)
chr1 (161-415)||(2116228-2116484)
chr1 (177-422)||(22227777-22228022)
chr1 (177-422)||(22232474-22232719)
chr1 (161-259)||(45051554-45051652)
chr1 (161-422)||(18601140-18601402)
chr1 (139-422)||(5072388-5072672)
chr1 (6-85)||(21860334-21860414)
chr1 (12-85)||(44034829-44034903)
chr1 (448-493)||(51452557-51452602)
chr1 (335-415)||(45051416-45051496)
chr1 (6-65)||(41218749-41218808)
chr1 (401-432)||(49967607-49967638)
chr1 (312-393)||(20254308-20254389)
chr1 (13-65)||(13376711-13376763)
chr1 (311-390)||(22143531-22143611)
chr1 (13-65)||(27675139-27675191)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (6-433)||(19794581-19795011)
chr2 (6-422)||(20627190-20627609)
chr2 (54-422)||(36982364-36982737)
chr2 (6-422)||(43642833-43643250)
chr2 (54-422)||(462706-463075)
chr2 (60-422)||(8891209-8891574)
chr2 (127-293)||(19689401-19689567)
chr2 (127-293)||(23820168-23820334)
chr2 (54-418)||(24341309-24341681)
chr2 (127-293)||(14906440-14906606)
chr2 (127-293)||(20015108-20015274)
chr2 (127-415)||(25265390-25265679)
chr2 (177-419)||(7507894-7508138)
chr2 (127-259)||(17396653-17396784)
chr2 (139-422)||(19886661-19886945)
chr2 (6-85)||(22284278-22284358)
chr2 (54-147)||(22863171-22863267)
chr2 (6-85)||(22275045-22275125)
chr2 (6-84)||(15633538-15633617)
chr2 (448-493)||(19689554-19689599)
chr2 (448-493)||(14906593-14906638)
chr2 (448-493)||(20015076-20015121)
chr2 (448-493)||(23820136-23820181)
chr2 (360-422)||(17396887-17396948)
chr2 (311-393)||(19669279-19669362)
chr2 (312-372)||(9636761-9636821)
chr2 (13-69)||(19660217-19660273)
chr2 (311-390)||(19666525-19666605)
chr2 (312-356)||(24884718-24884762)
chr2 (401-433)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-422)||(1091-1462)
scaffold0266 (54-422)||(3508-3877)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (54-422)||(48565-48935)
scaffold0023 (161-418)||(36065-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-422)||(36836-37209)
scaffold0077 (6-65)||(15319-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (62-422)||(19173-19537)
scaffold0195 (127-422)||(21257-21553)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (54-422)||(23506932-23507302)
chr5 (54-433)||(27182471-27182854)
chr5 (54-418)||(22053753-22054125)
chr5 (54-414)||(18530988-18531355)
chr5 (127-293)||(20623066-20623232)
chr5 (127-293)||(21233528-21233694)
chr5 (127-293)||(16536294-16536460)
chr5 (127-290)||(37052844-37053007)
chr5 (129-293)||(25900408-25900571)
chr5 (127-419)||(34939248-34939540)
chr5 (139-422)||(22366481-22366765)
chr5 (139-422)||(25426596-25426880)
chr5 (161-422)||(18778014-18778276)
chr5 (139-422)||(12342-12626)
chr5 (139-422)||(19499867-19500151)
chr5 (139-422)||(21073595-21073879)
chr5 (161-403)||(4200007-4200251)
chr5 (161-422)||(27009809-27010071)
chr5 (139-259)||(29188284-29188404)
chr5 (161-422)||(43443417-43443679)
chr5 (348-432)||(17471803-17471887)
chr5 (448-501)||(20623026-20623079)
chr5 (448-501)||(21233681-21233734)
chr5 (342-415)||(29190479-29190552)
chr5 (448-493)||(25900558-25900603)
chr5 (448-501)||(37052801-37052854)
chr5 (448-493)||(16536262-16536307)
chr5 (11-65)||(11584394-11584448)
chr5 (278-390)||(23493916-23494029)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (54-433)||(23153403-23153786)
chr6 (98-415)||(14626089-14626407)
chr6 (127-422)||(35009439-35009735)
chr6 (127-419)||(1657748-1658040)
chr6 (127-419)||(15862443-15862734)
chr6 (139-415)||(1650105-1650382)
chr6 (167-422)||(25175531-25175787)
chr6 (286-419)||(27740808-27740941)
chr6 (139-422)||(27653983-27654267)
chr6 (139-422)||(16825752-16826038)
chr6 (54-122)||(23148266-23148335)
chr6 (6-85)||(19983144-19983224)
chr6 (6-85)||(35015009-35015089)
chr6 (311-433)||(18381853-18381975)
chr6 (127-210)||(27751605-27751688)
chr6 (278-408)||(22361902-22362032)
chr6 (127-325)||(29665937-29666137)
chr6 (6-85)||(18583640-18583720)
chr6 (404-433)||(32898745-32898774)
chr6 (311-390)||(33324690-33324770)
chr6 (311-390)||(35136182-35136262)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-433)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-422)||(882-1250)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (54-422)||(128095-128464)
scaffold0008 (161-403)||(31697-31942)
scaffold0008 (401-429)||(22650-22678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-422)||(5990-6358)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (54-422)||(123087-123460)
scaffold0011 (401-433)||(255074-255106)
scaffold0011 (401-433)||(261680-261712)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-422)||(12083-12450)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (54-432)||(171863-172242)
scaffold0001 (54-432)||(177566-177945)
scaffold0001 (401-433)||(70882-70914)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (63-422)||(4996-5356)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-422)||(247366-247738)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (95-422)||(148688-149018)
scaffold0025 (65-418)||(8820-9180)
scaffold0025 (54-147)||(146844-146938)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-422)||(8846-9215)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (54-422)||(26340-26710)
scaffold0162 (127-415)||(8180-8466)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (127-293)||(26892-27058)
scaffold0141 (134-293)||(22637-22796)
scaffold0141 (448-493)||(22605-22650)
scaffold0141 (448-493)||(26860-26905)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (127-293)||(1582-1748)
scaffold0124 (448-493)||(1735-1780)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (66-259)||(51121-51314)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-432)||(271983-272362)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (134-422)||(48155-48443)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (134-422)||(107715-108003)
scaffold0026 (196-422)||(64585-64812)
scaffold0026 (142-184)||(89863-89905)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (127-415)||(13480-13769)
scaffold0132 (6-85)||(42677-42754)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (127-415)||(41622-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (127-420)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (127-419)||(34460-34755)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (54-259)||(89378-89586)
scaffold0028 (54-178)||(107708-107835)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (161-415)||(9371-9626)
scaffold0215 (161-415)||(16269-16524)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (138-415)||(2936-3215)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (177-422)||(5254-5498)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (134-259)||(5660-5785)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (291-433)||(9338-9480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (177-422)||(3690-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (162-422)||(42965-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (161-422)||(14083-14344)
scaffold0139 (161-422)||(21138-21399)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (161-422)||(3-265)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (161-259)||(13347-13445)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (139-259)||(1304-1424)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (302-422)||(48482-48601)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (345-422)||(71-147)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (6-85)||(80187-80267)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (177-390)||(54415-54630)
scaffold0066 (177-325)||(45094-45244)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (6-86)||(166116-166197)
scaffold0016 (12-86)||(162036-162111)
scaffold0016 (315-434)||(116687-116806)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (6-85)||(31132-31212)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (335-414)||(3183-3262)
scaffold0361 (127-220)||(3360-3453)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6015)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (369-422)||(1815-1867)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-86)||(304-385)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (134-252)||(56106-56226)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (396-433)||(132505-132542)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (302-433)||(77008-77139)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (6-65)||(1721-1780)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (6-65)||(19802-19861)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (312-390)||(104793-104872)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (311-408)||(10642-10739)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (311-372)||(2471-2532)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (143-184)||(1546-1587)
scaffold0456 (143-184)||(8691-8732)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (404-433)||(7522-7551)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (143-184)||(8216-8257)
scaffold0123 (311-390)||(8007-8087)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (143-184)||(70307-70348)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (404-433)||(38253-38282)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (302-413)||(197414-197525)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 501
Target Start/End: Original strand, 16743990 - 16744489
Alignment:
Q  3 tggagaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaatt 101  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16743990 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaatt 16744089  T
Q  102 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16744090 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatg 16744189  T
Q  202 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctata 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16744190 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatg 16744289  T
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16744290 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaatt 16744389  T
Q  402 gttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16744390 gttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 16744489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 127 - 416
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912771
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  327 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttg 416  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgtgggtgttttg 17912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049777
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | ||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 2049777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842856
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14842856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030443
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | | |||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 12030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838852
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 350  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  351 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||| || ||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 13838852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 101 - 433
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859331
Alignment:
Q  101 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  199 atgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagc 297  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||||||||     
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagt 15859195  T
Q  298 tataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttg 397  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15859196 tatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttg 15859295  T
Q  398 aattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  15859296 aattgttgttgttgttttggtgaaaatggtgaattg 15859331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 117 - 433
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158325
Alignment:
Q  117 aattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaatt 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  217 acatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaatt 315  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  316 gatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgtt-ggtgttt 414  Q
    |||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||  ||||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttaagtgttt 51158307  T
Q  415 tggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    || | ||||||||||||||    
T  51158308 tgct-aaatttgtgaattg 51158325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936922
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  333 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15936922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19232169 - 19231982
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtg-aatttt 103  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19232169 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaatttt 19232070  T
Q  104 caaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232069 caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938764
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  333 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgctgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15938764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614808
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 337  Q
    || ||||| |||| || ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||| | | | |||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  15614985 gataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 15614886  T
Q  338 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15614885 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 15614808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955036
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaattt 13955036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  153 tccaactttgatgatatgttt 173  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 348 - 478
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468686
Alignment:
Q  348 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgata 446  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttgttgttttggtgaaatttgtgaaattggtgaattatgaca 15468654  T
Q  447 agttgttgttgaattatgatggagtgtatgat 478  Q
     ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15468655 tgttgttgttgaaacatgatggaatgtatgat 15468686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821099
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | | |||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 430  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatgataa-ataaatggttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 16821099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275119
Alignment:
Q  348 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgata 446  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| |    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaaattagtgaattatgaca 22275151  T
Q  447 agttgttgttgaattatgatggagtgtatgat 478  Q
     ||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  22275150 tgttgttgttgaaacatgatggaatgcatgat 22275119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316187
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 55316187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984624
Alignment:
Q  280 gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 379  Q
    ||||| |||| |||||| | | |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  380 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  47984659 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47984624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003198
Alignment:
Q  280 gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 379  Q
    ||||| |||| |||||| | | |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  380 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  48003233 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48003198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270043
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  |||||||| || | ||||| ||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 41270043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993911
Alignment:
Q  280 gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 379  Q
    ||||| |||| |||||| | | |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  380 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  47993946 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47993911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012484
Alignment:
Q  280 gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 379  Q
    ||||| |||| |||||| | | |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  380 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  48012519 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48012484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992953 - 3992873
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992953 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513273 - 55513193
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513273 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  11 cataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 88  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844594 - 2844514
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844594 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Original strand, 2449391 - 2449436
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2449391 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 2449436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 370 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19231997 - 19231945
Alignment:
Q  370 atattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19231997 atattcatgaattgatgatgataatttggattgttgttggtgttttggtgaaa 19231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037976 - 54038056
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54037976 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  31 tagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854385 - 7854305
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  7854385 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 13955112 - 13955185
Alignment:
Q  348 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13955112 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13955185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 13975944 - 13976017
Alignment:
Q  348 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13975944 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13976017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45860834 - 45860773
Alignment:
Q  360 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45860834 ttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 45860773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 22144532 - 22144564
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144532 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 22144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986293
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacat-ttttaaa-tatg 231  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| || || |||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatg 11986272  T
Q  232 taaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||  ||||  |||||||||||    
T  11986273 tattaatgtcaagttatgaaa 11986293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191884
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 127 - 501
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907588
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  327 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 22907513  T
Q  427 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22907514 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 22907588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 415
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16194005
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  254 ttgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 352  Q
    ||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||    
T  16193843 ttgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaa 16193942  T
Q  353 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  16193943 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttggtgtttt 16194005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Original strand, 16404852 - 16405268
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||    
T  16404852 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttc 16404950  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16404951 aaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 16405050  T
Q  203 ttgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctata 301  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||     
T  16405051 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatg 16405147  T
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 401  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  16405148 attcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatgataatttgagat 16405247  T
Q  402 gttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16405248 gttgttggtgttttgatgaaa 16405268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373761
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||| ||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  350 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaa---ttgttggtgttttggtgaaa 43373761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929096
Alignment:
Q  54 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 350  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| |||   |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  351 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||  ||| || ||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 24929096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345540
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 17345540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548956
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 337  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | | |||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  338 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 24548956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774535
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 337  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | | |||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  338 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgatttgttgttggtgtttt 6774535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 21844594 - 21844856
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  21844594 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 21844693  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | ||| |||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  21844694 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 21844793  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21844794 cttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21844856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 21851987 - 21852249
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  21851987 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 21852086  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  21852087 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 21852186  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21852187 cttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21852249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120690
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | |||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatgataatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 30120690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 422
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222975
Alignment:
Q  202 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 299  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  300 taattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 399  Q
    | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 222953  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  222954 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 222975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 422
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736598
Alignment:
Q  202 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 299  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  300 taattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 399  Q
    | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 736576  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  736577 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 736598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 422
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860493
Alignment:
Q  202 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 299  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  300 taattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 399  Q
    | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 860471  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  860472 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 860493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 5238197 - 5238144
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5238197 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 5238144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Original strand, 24661401 - 24661454
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24661401 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 24661454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 43685656 - 43685603
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43685656 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 43685603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274846 - 274766
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274846 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 641003 - 641083
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641003 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 826809 - 826889
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826809 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716714 - 24716794
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716714 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837154
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | ||  | || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattca 23837209  T
Q  377 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23837208 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttggtggtggttttgtgaaattggtgaatt 23837154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Original strand, 13662481 - 13662561
Alignment:
Q  349 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 430  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  13662481 tgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatgagaa-ctaaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 13662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Original strand, 16674624 - 16674672
Alignment:
Q  369 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16674624 catattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggt 16674672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 41246650 - 41246613
Alignment:
Q  396 tgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246650 tgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 41246613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115678 - 39115598
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115678 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 127 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680089
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  327 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 26680164  T
Q  427 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26680163 ggaatcgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 26680089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 433
Target Start/End: Original strand, 54118120 - 54118551
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  54118120 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttc 54118219  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  54118220 aaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 54118319  T
Q  203 ttgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctata 301  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||     
T  54118320 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatg 54118419  T
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 401  Q
    |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54118420 attcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaatt 54118519  T
Q  402 gttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  54118520 gttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 54118551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| ||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  350 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 13246386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 418
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675381
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 246  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||  |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  247 atgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 345  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  346 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 15675381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115603
Alignment:
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  254 ttgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 352  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  353 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 31115603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 418
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104523
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 246  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||  |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  247 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 345  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||                   ||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt-------------------gt 10104450  T
Q  346 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104451 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 10104523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10644449 - 10644187
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||     
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 10644350  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | | |||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  10644349 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 10644250  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10644249 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10644187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048368
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaattt 13048368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357622
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatgagaatttgagctg-tgttggtgttttggtgaaa 47357622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111362
Alignment:
Q  291 attgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatga 390  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatga 111394  T
Q  391 aaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  111393 taatttgagatgttgttggtgttttgatgaaa 111362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119059 - 25119139
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119059 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10488672 - 10488627
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10488672 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 10488627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Original strand, 16328079 - 16328124
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16328079 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 16328124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 325
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaa-tatgtaaaaatgaa 241  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  242 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7850044 - 7849970
Alignment:
Q  344 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7850044 gttgatgaatcatgacttgagtatacataatcatgaattggtgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtg 7849970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682380 - 5682460
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682380 agaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 372
Target Start/End: Original strand, 41166116 - 41166177
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166116 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44055902 - 44055870
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055902 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 44055870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044794
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | ||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| | |||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15044839  T
Q  377 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||  |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15044838 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 127 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7292905
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  327 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 7292980  T
Q  427 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7292979 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgat 7292905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 434
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037322
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| || ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||||| ||||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  350 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 434  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 13037322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211733
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | ||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||| | |||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatgaagagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 16211733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052634
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  350 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 36052634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3059933
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgtt 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  112 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtt 211  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||||||     
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  212 aaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc-aaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgt 309  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| |||  |||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| ||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgt 3060046  T
Q  310 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttgg 409  Q
     ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| ||    
T  3060045 tcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgtggg 3059946  T
Q  410 tgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||| |||||    
T  3059945 tgttttgatgaaa 3059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11581035
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||||     
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  149 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttat 248  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  249 gaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttg 347  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  348 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgaggacgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 11581035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481320
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| || ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcg 47481230  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     |  |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481231 ctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttgaattgttgttggtgtttt 47481320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254130
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  333 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18254130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 162 - 419
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479244
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaa 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16479084  T
Q  262 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 360  Q
    ||| | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | | |||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |    
T  16479085 aattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgct 16479184  T
Q  361 tgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16479185 tgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 16479244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13320988
Alignment:
Q  128 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacattttt--a 225  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  226 aatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgt 323  Q
    | |||||| |||||  |||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  324 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    || || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatgagaatttggattgttgttggtgtttt 13320988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13572906 - 13572644
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  13572906 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 13572807  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  13572806 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 13572707  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13572706 cttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13572644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989378
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| | | | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10989378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2437687 - 2437425
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||      
T  2437687 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgtt 2437588  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  2437587 caattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 2437488  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2437487 cttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 2437425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 404
Target Start/End: Original strand, 13911046 - 13911292
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||     
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 13911145  T
Q  261 aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 357  Q
     ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | | |||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||     
T  13911146 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 13911245  T
Q  358 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt 404  Q
      |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13911246 tcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 13911292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Original strand, 15441717 - 15441770
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15441717 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 15441770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Original strand, 30262282 - 30262335
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30262282 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 30262335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126818 - 126738
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126818 agaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 419
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296257
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaact 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||| ||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  160 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgt-g 258  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||| |      
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatat 296098  T
Q  259 caaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 356  Q
    | |||||| |||| ||||  |  ||| |  |||||||| | | | |||| ||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||   |||||||||| |     
T  296099 ccaaatgg-tgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgatgaattac 296194  T
Q  357 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  296195 tgattgggtatgcttattcatggattgatgttgaaaaattgaatttgtgttggtgttttggtg 296257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493898 - 32493978
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493898 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 11516337 - 11516284
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11516337 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgagtatatgttatgattgtggttgat 11516284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936869 - 1936949
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936869 agaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 111121 - 111201
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  111121 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 15822691 - 15822723
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822691 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 15822723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 25292560 - 25292633
Alignment:
Q  348 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25292560 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttaatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 25292633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 127 - 501
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37440
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttga 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  327 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 37365  T
Q  427 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37366 tgaattgatgaaatatgataagtttttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgat 37440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41712 - 41632
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41712 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41394610 - 41394191
Alignment:
Q  3 tggagaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaatt 101  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41394610 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaatt 41394511  T
Q  102 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  41394510 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatg 41394411  T
Q  202 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctat 300  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |    
T  41394410 attgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagattt 41394311  T
Q  301 aattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaa 399  Q
     |||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41394310 gattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaa 41394211  T
Q  400 ttgttgttggtgttttggtg 419  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41394210 ttgttgttggtgttttggtg 41394191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445646
Alignment:
Q  54 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 348  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  349 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20445646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931312
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || ||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20931312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531411
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  164 tgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaa 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  264 tggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttg 362  Q
    | | |||||||  | | ||||| ||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  20531570 ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttg 20531471  T
Q  363 ggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531470 ggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20531411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893933
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  ||| |||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  350 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttgaagaaatttgtgaattg 20893933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913004
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | |||       |||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| ||||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgttaatttg-------attcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20913004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844746
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatga-aaagttatg 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || || | | |||||| ||| |  ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 348  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  349 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 37844746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116228
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||     
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 2116385  T
Q  261 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattga-gctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||   | | |||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2116384 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattg 2116285  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2116284 cttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2116228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227777
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttga 276  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||      
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  277 c-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 375  Q
    | | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  376 atggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22227822 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22227777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232474
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttga 276  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||      
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  277 c-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 375  Q
    | | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  376 atggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232519 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22232474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45051652 - 45051554
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45051652 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 18601140 - 18601402
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  18601140 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 18601239  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  | |  || |||||| || |    
T  18601240 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattg 18601339  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18601340 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 18601402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072672
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 5072672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860414 - 21860334
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860414 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 51452602 - 51452557
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452602 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 51452557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 45051496 - 45051416
Alignment:
Q  335 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45051496 gatgttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 45051416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41218808 - 41218749
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41218808 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggg 41218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49967638 - 49967607
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967638 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 49967607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20254389 - 20254308
Alignment:
Q  312 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa 393  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20254389 aattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaa 20254308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376763
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13376763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 390
Target Start/End: Original strand, 22143531 - 22143611
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 390  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  22143531 caattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatgatga 22143611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675139
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggg 27675139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 433
Target Start/End: Original strand, 19794581 - 19795011
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  19794581 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-c 19794679  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19794680 aaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatga 19794779  T
Q  203 ttgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctata 301  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||     
T  19794780 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatg 19794879  T
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 401  Q
    |||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19794880 attcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaatt 19794979  T
Q  402 gttgttggtg-ttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19794980 tttgttggtgtttttggtgaaa-ttgtgaattg 19795011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Original strand, 20627190 - 20627609
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-tttt 103  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  20627190 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaatttt 20627289  T
Q  104 caaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgat 203  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20627290 caaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgat 20627389  T
Q  204 tgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataa 302  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||    
T  20627390 tgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaa 20627489  T
Q  303 ttcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg 402  Q
    ||||||| |||||||| || | | || |||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||    
T  20627490 ttcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatgataatttgagatg 20627589  T
Q  403 ttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20627590 ttgttggtgttttgatgaaa 20627609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982737
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 348  Q
    ||||||||||  ||| | |||| |||| || ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  349 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttagtgaaa 36982737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Original strand, 43642833 - 43643250
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642833 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttc 43642932  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43642933 aaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 43643032  T
Q  203 ttgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctata 301  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||     
T  43643033 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatg 43643132  T
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 401  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||       
T  43643133 attcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttga--- 43643229  T
Q  402 gttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  43643230 gatgttggtgttttgatgaaa 43643250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462706
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    ||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||| ||  |||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatga 462776  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  462775 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggataagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 462706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891209
Alignment:
Q  60 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  158 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgt 257  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  258 gcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 356  Q
    ||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8891374 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcat 8891275  T
Q  357 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8891274 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 8891209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 418
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341681
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 246  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||  |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  247 atgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 345  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||    
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  346 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattattgttggtgttttggt 24341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265679
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |   |  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 25265679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 419
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508138
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttga 276  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||| | ||||||||     
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  277 c-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgc-aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 374  Q
    | | ||||| ||| ||||||| ||| |||| |||   |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  7507994 ctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatatt 7508092  T
Q  375 catggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7508093 catggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 7508138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886945
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19886945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284358 - 22284278
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284358 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863171
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 22863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275125 - 22275045
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275125 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15633617 - 15633538
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 84  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633617 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Original strand, 19689554 - 19689599
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689554 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 19689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Original strand, 14906593 - 14906638
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14906593 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 14906638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20015121 - 20015076
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20015121 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 20015076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23820181 - 23820136
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23820181 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 23820136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Original strand, 17396887 - 17396948
Alignment:
Q  360 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17396887 ttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 17396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 393
Target Start/End: Original strand, 19669279 - 19669362
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaa 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  19669279 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatgaaaa 19669362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  312 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 372  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660217
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggggttag 69  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaaggggttag 19660217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19666605 - 19666525
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 390  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  19666605 caattgatgttgttgttgctaagtgatattgtcgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgttttgatgatga 19666525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  312 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 356  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32465845 - 32465813
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32465845 tgttgttggtgttttggtgaaatttatgaattg 32465813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1091
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 350  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  351 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| || | |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3877
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | | || ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || || | |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatgaggagagtttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 3877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48565
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 48565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36065
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | |||| ||| |||| |||||| |  ||| || | |||  | |  ||||||||| || |    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttatggt 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 422
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37209
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| |    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 348  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||| | |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  349 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 37209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 15319 - 15378
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15319 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggg 15378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 62 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19173
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 158  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 19338  T
Q  259 caaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 357  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||     
T  19337 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcatt 19238  T
Q  358 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19237 gcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 19173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21257
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 21257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506932
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 23506932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182854
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  350 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttttgaattg 27182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 418
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054125
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 246  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||  |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  247 atgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 345  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  346 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 22054125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 414
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531355
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  148 tgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagtta 247  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||  |||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  248 tgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagtt 346  Q
    |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgtt 18531287  T
Q  347 gatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 414  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531288 gatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 18531355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttga 290  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 129 - 293
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  129 ggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaat 228  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  229 atgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939248
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 34939248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366765
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22366765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426596
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 18778014 - 18778276
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18778276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12342
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 12342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499867
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19499867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073879
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||    |  ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21073879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 403
Target Start/End: Original strand, 4200007 - 4200251
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||     
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
    |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | | |||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgt 403  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatgagaatttgaattgt 4200251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27010071 - 27009809
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |     
T  27010071 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtact 27009972  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  27009971 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 27009872  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27009871 cttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 27009809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 43443417 - 43443679
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 43443516  T
Q  261 aaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | ||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | | | |||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  43443517 caattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 43443616  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443617 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgaggatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 43443679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 348 - 432
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471887
Alignment:
Q  348 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaattggtgaatt 17471887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 20623079 - 20623026
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20623079 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 20623026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Original strand, 21233681 - 21233734
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21233681 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 21233734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 415
Target Start/End: Original strand, 29190479 - 29190552
Alignment:
Q  342 tagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29190479 tagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 29190552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Original strand, 25900558 - 25900603
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25900558 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 25900603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 37052854 - 37052801
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 501  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37052854 gttgttgttgagttatgatggagggtatgattatatgttatgattgtggttgat 37052801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16536307 - 16536262
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16536307 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattgtatgttatgattg 16536262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584394
Alignment:
Q  11 cataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 11584394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493916
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | ||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  377 tggattgatgatga 390  Q
    ||  ||||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatga 23493916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153403
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||| ||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| |||||||| || | | || |||| |||||||| ||||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  350 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatgaattaaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 23153403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 415
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626407
Alignment:
Q  98 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtg 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  198 tatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgag 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||| ||  | ||||| ||| | |||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgag 14626288  T
Q  297 ctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaattt 396  Q
     | | |||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||    
T  14626289 atttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaattt 14626388  T
Q  397 gaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14626389 gaattgttgttggtgtttt 14626407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 422
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009735
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |   |  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 35009735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1658040
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 1658040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862443
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     |||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 15862443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650382
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 337  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | | |||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  338 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 1650382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175531
Alignment:
Q  167 tatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatgg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  267 atgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttggg 364  Q
     |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||    
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25175588  T
Q  365 tatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25175587 tatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25175531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740808
Alignment:
Q  286 gttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 385  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  386 gatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740841 gatgaaaatttgaattggtgttggtgttttggtg 27740808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654267
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 336  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  337 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattg-tgtcggtgttttggtgaaa 27654267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826038
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgta--tgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaa 236  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  | ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  237 atgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatg--ttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 334  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| | || ||||  | |   |||| ||| | ||||| | | |||||||| ||| ||||||| |  ||| ||       
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  335 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| || |  ||||||||| || | || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 16826038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983144 - 19983224
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983144 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015009 - 35015089
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015009 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Original strand, 18381853 - 18381975
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttgg 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  18381853 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttgg 18381951  T
Q  410 tgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    || ||| |||||||| ||||||||    
T  18381952 tggttttgtgaaattggtgaattg 18381975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 210  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 408
Target Start/End: Original strand, 22361902 - 22362032
Alignment:
Q  278 atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 376  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  22361902 atgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 22362001  T
Q  377 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttg 408  Q
    || ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  22362002 tgaattgatgatgagaa-ttgagttgttgttg 22362032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacattttt-- 224  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  225 aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgt 323  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  324 tg 325  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583720 - 18583640
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  18583720 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32898774 - 32898745
Alignment:
Q  404 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898774 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 32898745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33324770 - 33324690
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 390  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  33324770 caattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 33324690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 390
Target Start/End: Original strand, 35136182 - 35136262
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 390  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  35136182 caattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 35136262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41686
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||||||| ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgattattagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa-ttgtgaattg 41686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 882 - 1250
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  |||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt-ttggtgttttggtgaaa 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128464
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||| ||||||  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| |  ||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 128464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 403
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31942
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||     
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  261 aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 357  Q
     ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | | |||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||     
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  358 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgt 403  Q
    | |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattgt 31942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22678 - 22650
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6358
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   |||| |  |||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 6358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123460
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  250 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 348  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  349 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| || | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 255074 - 255106
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  255074 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 255106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 261680 - 261712
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  261680 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 261712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12083
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 350  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | | |||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  351 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttagtgaaa 12083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171863
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttg-ttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 171863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177566
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttg-ttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 433
Target Start/End: Original strand, 70882 - 70914
Alignment:
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70882 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 70914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 63 - 422
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5356
Alignment:
Q  63 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaacttt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaa 261  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  262 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 360  Q
    ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  361 tgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 5356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247738
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||| ||| || ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  251 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 349  Q
    |||||||||  ||| | | || ||||  | ||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  350 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaactgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 247738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 95 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148688
Alignment:
Q  95 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataat 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  193 aagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaa 291  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| |     
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaat 148819  T
Q  292 ttgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaa 391  Q
    ||||| | | |||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  148818 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatgag 148719  T
Q  392 aatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148718 aatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 148688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8820
Alignment:
Q  65 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 158  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 8981  T
Q  259 caaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 357  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| |||||||||||||     
T  8980 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcatt 8881  T
Q  358 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 418  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8880 gcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaatttttgttggtgttttggt 8820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146844
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaatt 146844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8846
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 8846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 422
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26710
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||| |||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  252 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 350  Q
    |||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  351 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatgagaatttg-agtgttgttggtgttttgatgaaa 26710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8466
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |   |  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatgagaatttgaattgttgctggtgtttt 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22650 - 22605
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22650 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 22605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26905 - 26860
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26905 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 26860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1780
Alignment:
Q  448 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1735 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51314
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  166 atatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 271983
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  || |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||| || ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  253 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 351  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  352 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 432  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||  | |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg-ttatagagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattagtgaatt 271983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48155
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  333 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 48155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107715
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 332  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  333 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||||||  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 107715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 422
Target Start/End: Original strand, 64585 - 64812
Alignment:
Q  196 tgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaatt 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||    
T  64585 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 64684  T
Q  294 gagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa 393  Q
    ||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
T  64685 gagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaa 64784  T
Q  394 tttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  64785 tttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 64812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  142 taaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13480
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |   |  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatgagaatttgaatttttgtaggtgtttt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42677
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42754 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41622
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
     ||||||||||||  ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |   |  | ||| |||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 41712  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
     || |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41711 ttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 41622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 420
Target Start/End: Original strand, 534 - 828
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||| ||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  326 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtga 420  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtga 828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34755
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaa 226  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  227 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttg-tgcaattgatgttgtt 324  Q
     | |||||||||   ||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||| || |  |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  325 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 419  Q
    | || || | |||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 34755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 178  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 415
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9626
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  261 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 359  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | | |||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  360 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 9626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 415
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16524
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  261 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 359  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | | |||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  360 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 16524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2936
Alignment:
Q  138 ttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaa 237  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  238 tgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctataattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 335  Q
    ||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  336 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 415  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 422
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5498
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttg 275  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||| ||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  276 acatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 375  Q
        ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | |||||||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattc 5452  T
Q  376 atggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5453 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 5498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  234 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9338
Alignment:
Q  291 attgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatga 390  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 9381  T
Q  391 aaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9380 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3690
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaa-tgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttg 275  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||| | |||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  276 ac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 374  Q
     | | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  375 catggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttgatgttttggtgaaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42965
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaa 261  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  262 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 359  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | |||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |     
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  360 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttaaattg-tgttggtgttttggtgaaa 42965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14344
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgct 14182  T
Q  261 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 359  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| | | | ||||| |   |||||||| ||||| ||||| |  ||| |  | |||||| |  ||||||||| || |     
T  14183 caattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgc 14282  T
Q  360 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14283 ttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Original strand, 21138 - 21399
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||     
T  21138 tgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagct 21237  T
Q  261 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 359  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |   |||||||| ||||||||||| |  ||| || | |||||| |  ||||||||| || |     
T  21238 caattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgc 21337  T
Q  360 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21338 ttgagtttgcatattcatggattaatgatgaaaatttgaactg-tgttggtgttttggtgaaa 21399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 3
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||     
T  265 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgct 166  T
Q  261 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 358  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | | || ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  165 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 66  T
Q  359 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
     |||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  65 cttgggtttgcatattcatgaattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13445
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  239 gaaaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48601 - 48482
Alignment:
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 401  Q
    |||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48601 attcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 48502  T
Q  402 gttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  48501 g-tgttggtgttttgatgaaa 48482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Original strand, 71 - 147
Alignment:
Q  345 ttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  71 ttgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt-ttggtgttttggtgaaa 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80267 - 80187
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80267 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54415
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaa--tatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  275 -gacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 373  Q
     || ||||||| |||||| |||| | | |||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  374 tcatggattgatgatga 390  Q
    | |||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatga 54415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45094
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacattttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tt 273  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||  || |||||| |||||  ||||| || ||||||| |  ||| | |||| ||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  274 tgacatgttgtagttgaattgagctataattcttgtgcaattgatgttgttg 325  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| | | |||| ||| | |||||||||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttg 45094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 166116 - 166197
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166116 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 434
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116806
Alignment:
Q  315 tgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata-ttcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtt 413  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | |||| ||||||  ||| ||||||||| | || |||||||||||| |    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatgga-ttgttgttggtggt 116785  T
Q  414 ttggtgaaatttgtgaattga 434  Q
    || || ||||| |||||||||    
T  116786 tttgtaaaattggtgaattga 116806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 31132 - 31212
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31132 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3183
Alignment:
Q  335 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 414  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatgaagagaattggaattgttgttggtgttt 3183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacat 220  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1867 - 1815
Alignment:
Q  369 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1867 catattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 304 - 385
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  304 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacat-ttttaaa-tatg 231  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  232 taaaaatgaaaagttatgaaa 252  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 433
Target Start/End: Original strand, 132505 - 132542
Alignment:
Q  396 tgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132505 tgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 132542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 433
Target Start/End: Original strand, 77008 - 77139
Alignment:
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaat 400  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||| |||||| ||  ||| |    
T  77008 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaa-atgagt 77106  T
Q  401 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  77107 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 77139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1721
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1780 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 19802 - 19861
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19802 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 19861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 390
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104872
Alignment:
Q  312 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 390  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatga 104872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10739 - 10642
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttg 408  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||| | |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10739 caattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgaaaa-atgaattgttgttg 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7551 - 7522
Alignment:
Q  404 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7551 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8087 - 8007
Alignment:
Q  311 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 390  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  8087 caattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatagcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 8007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38282 - 38253
Alignment:
Q  404 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 413
Target Start/End: Original strand, 197414 - 197525
Alignment:
Q  302 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaat 400  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | ||| | |||||  |||||||||| || |||| |    
T  197414 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtcttcataaatcatgctttgatgatgagaa-ttgagt 197512  T
Q  401 tgttgttggtgtt 413  Q
    |||||||| ||||    
T  197513 tgttgttgttgtt 197525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University