View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF13736_low_12 (Length: 337)
Name: NF13736_low_12
Description: NF13736
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF13736_low_12 |
 |  |
|
| [»] scaffold0006 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0702 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0662 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0238 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1480 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0069 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 40908083 - 40908336
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40908083 |
aatatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaacttt |
40908182 |
T |
 |
| Q |
113 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908183 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
40908282 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908283 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
40908336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8476562 - 8476308
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476562 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
8476463 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8476462 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacaggcatataca |
8476363 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476362 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
8476308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 26848839 - 26849093
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26848839 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactt |
26848938 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26848939 |
tattcccacccttttccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
26849038 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849039 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
26849093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11239374 - 11239113
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239374 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
11239275 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239274 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
11239175 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagtgt |
273 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11239174 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagtgt |
11239113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6231755 - 6231501
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6231755 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
6231656 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6231655 |
tattcccaccattttcattgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
6231556 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6231555 |
ttcctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
6231501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47115111 - 47114856
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47115111 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
47115012 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47115011 |
tattcccacccttttccttgggaatttttttttatttccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
47114912 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47114911 |
ttccaatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
47114856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28124690 - 28124436
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28124690 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataatatgtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactt |
28124591 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28124590 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttatattccgaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatataca |
28124491 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28124490 |
ttcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
28124436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33218167 - 33217917
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33218167 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactt |
33218068 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33218067 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttaataaatttgtaacaaacataggcatataca |
33217968 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33217967 |
ttcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
33217917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48340011 - 48339760
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48340011 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
48339912 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48339911 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
48339812 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48339811 |
tttatatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
48339760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9320702 - 9320448
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9320702 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggatcataataagtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactt |
9320603 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
9320602 |
tattcccacctttttccttaggaaattttttctattcccaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagtatataca |
9320503 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9320502 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
9320448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 20297610 - 20297864
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20297610 |
aatatgtttggttgactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
20297709 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20297710 |
tattcccacccttttccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatataca |
20297809 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20297810 |
tttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
20297864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 1099016 - 1099267
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1099016 |
aatatgtttggctagctttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaat-atttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
1099114 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1099115 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagggatataca |
1099214 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1099215 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
1099267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31611239 - 31611004
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31611239 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactt |
31611140 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31611139 |
tattcccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
31611040 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattata |
247 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31611039 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattata |
31611004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 44952125 - 44952379
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcct-aggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaact |
110 |
Q |
| |
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| T |
44952125 |
aatatgtttggttaactttataatattccttaggaac-ataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaact |
44952223 |
T |
 |
| Q |
111 |
ttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatac |
210 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44952224 |
ttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatac |
44952323 |
T |
 |
| Q |
211 |
attcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44952324 |
atttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
44952379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20414719 - 20414465
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20414719 |
aatatgtttgattagctttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
20414620 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20414619 |
tattcccacccttttccttgggaatttttttttatttccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaatttataacaaacataggcatataca |
20414520 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20414519 |
ttccaatcattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
20414465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 24574384 - 24574646
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24574384 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
24574483 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa--------cattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
203 |
Q |
| |
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|||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24574484 |
tattcccaccatttttcttgggaaattttttctatttccagaaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
24574583 |
T |
 |
| Q |
204 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24574584 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
24574646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 46359769 - 46360002
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
46359769 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
46359868 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
|
| T |
46359869 |
tattcccacccttttccttgggaaatattttctattcacaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatataca |
46359968 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaatta |
245 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| | |||||||||||| |
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|
| T |
46359969 |
ttcctatcattttattccaagaaatcaacaatta |
46360002 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43132410 - 43132157
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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| T |
43132410 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaact-atttatgaatttaatctcatctccgtgggaactc |
43132312 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43132311 |
tattcccacccttttccttgggaaaaaatttatattctcaggtacattttatacatgaaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatata |
43132212 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
| T |
43132211 |
ttcctattattttattctcgagaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
43132157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 53165978 - 53165733
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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|
|
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53165978 |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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| T |
53165879 |
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53165780 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa |
258 |
Q |
| |
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|
|
| T |
53165779 |
ttcctatcattttatttatgggaatcaacaaatataacttgaaacaa |
53165733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31436173 - 31435923
Alignment:
| Q |
16 |
atgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
114 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31436173 |
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31436075 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
214 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31436074 |
tcccaccaatttctttgggaaaatttttctattttcaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattt |
31435975 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31435974 |
ctatcattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
31435923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10822971 - 10822733
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10822971 |
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10822873 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10822872 |
tattcccacccttttcctagggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaattttttttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
10822773 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataactt |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10822772 |
cttctatcattttattcccggaaatcaacaaatataactt |
10822733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12228508 - 12228255
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttat-atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||| | | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12228508 |
aatatgtttggttagttttatgatattcttaggaatcataaaaataagtattataatagataact-acatatgattttattctcatctccatgggaactt |
12228410 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12228409 |
tattctcacc-ttttctttggaaatttttttctattcccagaaacattttgtacccgagaataaaatttagtaaacttgtaataaacataggcatatata |
12228311 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12228310 |
tttctatcattttattcgcaggaattaacaactatattttaaaacaaacacaccca |
12228255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43719179 - 43718994
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43719179 |
aatatgtttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataagtaaattatttatgaatt-----ccatctccatgggatctt |
43719085 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43719084 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttatgccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacatag |
43718994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 19532962 - 19533130
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
19532962 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaact-atttatgaatttattcccatctccaaggaaactt |
19533060 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaattta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19533061 |
tattcccacccttttccttggaaaaaaatttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta |
19533130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28770432 - 28770210
Alignment:
| Q |
43 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
28770432 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ttacatatgaaatcattcccatcttcatgagaactttattcccaccattttctttgggaaaattttt |
28770334 |
T |
 |
| Q |
143 |
ctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaa |
242 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
28770333 |
ctattgctaggaacgttttatacccaggaatcaaatttagtaaacttgtaccaaacatagacatgcatatttctatctttttattcccaggaatctacga |
28770234 |
T |
 |
| Q |
243 |
ttataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28770233 |
atataacttgaaagaaacacaccc |
28770210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1247153 - 1246912
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13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||| || |||| || || ||||||||| |||||||||||| ||| | || || ||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1247153 |
aatatgtttggttaactctataatactccttggtactataaaaatatggattataatagataact-atataagaatttattccgatctccatgtgaact- |
1247056 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
1247055 |
-attcccacctttttccttcggaaattttttctattaccaggaacattttattcttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatgta |
1246957 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaac |
256 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
1246956 |
tttctatcattttattcccgagaatcaacaaatatagcttcaaac |
1246912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Original strand, 29512417 - 29512546
Alignment:
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13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29512417 |
aatacgtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctctatgggaactt |
29512515 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaatttttt |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29512516 |
tatttccacccttttccttgggaaatttttt |
29512546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12931155 - 12930945
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50 |
taaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcc |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12931155 |
taaaaataaggaatataataggtaa-ttacacataattttattcccatctctatgggaactttattcccaccattttctttgagaaaacttttctattcc |
12931057 |
T |
 |
| Q |
150 |
caggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataac |
249 |
Q |
| |
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|
| T |
12931056 |
cataaacattttata-ccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagccatatgcatttttatgattttattcccaacaatctacaa-tataac |
12930959 |
T |
 |
| Q |
250 |
ttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
12930958 |
ttgaaacaaacaca |
12930945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
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Target Start/End: Original strand, 18460827 - 18461008
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182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18460827 |
tgaatttattttcatctccaagagaactttatttccaccattttctttgggaaaatttttctattcccagaaacattttataccaaagaataaaatttag |
18460926 |
T |
 |
| Q |
183 |
taaacttgtaacaaacataggc--atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18460927 |
taaacttgtaacaaacatagacatatatatatttctattatttcattattaggaaacaacaaatataacttgaaacaaacac |
18461008 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 264
Target Start/End: Original strand, 27823114 - 27823343
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27823114 |
atattcctagaaatcataaaaatatggattataacaggtaa-ttacacatgaatttgttctcatcttcatgagaattttattcccacccttttctttggg |
27823212 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| | | |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27823213 |
aaaattttcctatttcgatgaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttatagcaaacatagacatttatatttctatcattttattcccata |
27823312 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27823313 |
aatttatgaatataacttgaaacaaacacac |
27823343 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
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Target Start/End: Complemental strand, 26849399 - 26849164
Alignment:
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13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
26849399 |
aatatgtttggttaactttataatattcataggaaccataaaaatagagattataataggt-aactatttatgaatttattctcatctctgtaggaactt |
26849301 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttggga-aattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatac |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26849300 |
tattcccaccatttttctttgaatttttttttctattcccagaaactttttatacccggg----------agtaaacttgtaacaaacatagacatatat |
26849211 |
T |
 |
| Q |
211 |
attcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849210 |
atttctatcattttattatcggtaat---caaatataacttgaaacaaac |
26849164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 32071264 - 32071508
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32071264 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggtaact-acatacaaatttattctcatctccatgt-aactt |
32071361 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||| || |||| | |||||||| ||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
32071362 |
tattctcgcccttttctttaagaaaatctttctatttccatgaacatttcatacccaa-aataaaatttagtaaacttgtaacaaacat----atatata |
32071456 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32071457 |
tttctatcattttatttttagaaatcaataaatataacttcaaacaaacaca |
32071508 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2565644 - 2565460
Alignment:
| Q |
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tatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaattt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
2565644 |
tatgaatttactctcatcttcatgggaactttattcccaccattttctttggaaaaaattttctattccaagaaacattttatacccg-gaaataaattt |
2565546 |
T |
 |
| Q |
181 |
agtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
2565545 |
aacaaacttgtaacaaacacaggtatatatatttctattattttattcctaagaatcaacaaatataacttaaaacgaacacaccc |
2565460 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33647923 - 33647703
Alignment:
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45 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| | |
|
|
| T |
33647923 |
aaccataaaaatagaaattataatagataa-ttacacgtgaatttattctcatcttcaaggaaactttatttccactcttttctttggaaatttttttat |
33647825 |
T |
 |
| Q |
145 |
attcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaatt |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||||| ||||| || | | |
|
|
| T |
33647824 |
attctcagaaacgttttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagagatgtatatttctaacgttttattcccgagaatctacgaat |
33647725 |
T |
 |
| Q |
245 |
ataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33647724 |
attacttgaaacaaacacaccc |
33647703 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 264
Target Start/End: Original strand, 40584431 - 40584669
Alignment:
| Q |
16 |
atgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40584431 |
atgtttggttaacattataatattccaaggaaccttaaaaataggaaatataataggtga-ttacacataattttattcccatctccatgggaactttat |
40584529 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
214 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
40584530 |
tcccaccattttctttggaaaaacttttctat----------attttatatccgaaaataaaatttaataaacttgtagaaaacatagacatatgcattt |
40584619 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
40584620 |
ttatgattttattctcaggaatctacaaatataacttaaaacaaatacac |
40584669 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 266
Target Start/End: Original strand, 45826687 - 45826847
Alignment:
| Q |
105 |
ggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc |
204 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
45826687 |
ggaacttttttcccatccttttctttgtgaatgttcttctattcccaggaacattttatatcatgaaataaaatttaataaacttgtaa-aaacatatga |
45826785 |
T |
 |
| Q |
205 |
atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45826786 |
atgcagatttctatcattttattccctggaatctacaacgataacttgaaacaaacacaccc |
45826847 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 266
Target Start/End: Original strand, 27093957 - 27094087
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| Q |
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ttttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatca-ttttattcccgggaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
27093957 |
ttttttctattcccataaacattttatacccgagaataagatatagtaaacttataacaaacataggcatatatatttcaatcatttttttttccgggaa |
27094056 |
T |
 |
| Q |
236 |
tcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
27094057 |
cctacacatataacttaaaacaaatacaccc |
27094087 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28139846 - 28139720
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tttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaa |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||| |||| | |
|
|
| T |
28139846 |
tttctattcccaagaacgttttatatccgaaaataaaatttactaatcttgtaacaaacataagcatgtatatttctatctttttattcctaagaatata |
28139747 |
T |
 |
| Q |
240 |
caattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28139746 |
cgaatataacttgaaacaaacgcaccc |
28139720 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38140600 - 38140425
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| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
38140600 |
atattcctgggaacctaaaaaataaggattataatagg-aaattacacatgaacttattctcatcttcatgg-aactttattctcacccttttctttgga |
38140503 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaac--attttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
209 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
38140502 |
aaaaaatttctattcctaggaacatattttatactcgtcaataaattatagtaaacttataacaaacattgacatata |
38140425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43715370 - 43715308
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| Q |
204 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43715370 |
catatacatttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
43715308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6832079 - 6831948
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142 |
tctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || | | |||||||| || |||||| ||| |
|
|
| T |
6832079 |
tctattcccaggaatattttatacctg-gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgt-gttttttgtgattttatttccaggaatctaca |
6831982 |
T |
 |
| Q |
242 |
attataacttgaaacaaacacacccaaagtgtaa |
275 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
6831981 |
aatataagttgaaacaaacacaccctaattgtaa |
6831948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Original strand, 29512631 - 29512705
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aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29512631 |
aaattttttctattccgatgaacattttatactcaggaataaaatttagtaaacttgaaacaaacgtaggcatat |
29512705 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
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| Q |
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cttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcat |
221 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| | |
|
|
| T |
28693570 |
cttttctttgagaaaatttttctattctcaggatcgttttatactcatgaataaaatttaattgacttataacaaacataagcatacatatttttatttt |
28693471 |
T |
 |
| Q |
222 |
tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28693470 |
tttattctcgggaatctatgaatataacttgaaacaaacacac |
28693428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
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34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| | |
|
|
| T |
24784049 |
atattccaaggaaccttaaaaataaagattataataggtaa-ttacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcatacactttt-ctttga |
24784146 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
24784147 |
aaaaactttatattcttatgaatattttatattag-gaataaaatttagtaaacttgtaacaaac--tgacatatgtatttttataattttattccaaaa |
24784243 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24784244 |
aatctacaattataacttaaaacaaacacaccc |
24784276 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
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107 |
aactttattcccacccttttccttgggaaattttttct-attcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | |||| || ||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
33497768 |
aactttattctcacccttttctttaggatttttttttttattctcatgaacattttgtatcctagaataaaatttaataaatttgtaacaaatataagca |
33497867 |
T |
 |
| Q |
206 |
tatacattcctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33497868 |
tgtatatttctatcattttatt |
33497889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 55435488 - 55435392
Alignment:
| Q |
170 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
55435488 |
gaataaaatttaacaaacttgtaacaaacatgagaatgcatattcctatcattttattcccaggtatctacaaaaataacttgaaacaaatacaccc |
55435392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39932631 - 39932529
Alignment:
| Q |
160 |
ttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc--atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaaca |
257 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
39932631 |
ttatatccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataaacatatatacatttctatcattttattcccatgaatttatgaatataacttgaaaca |
39932532 |
T |
 |
| Q |
258 |
aac |
260 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
39932531 |
aac |
39932529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9320446 - 9320405
Alignment:
| Q |
200 |
taggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9320446 |
taggtatatacattcctatcattttattcccgagaatcaaca |
9320405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 13642893 - 13643083
Alignment:
| Q |
17 |
tgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| || || | ||||||| ||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13642893 |
tgtttggttaactttataatattca-aggaaccttacaaatagagattataataggtaa-ttccacataattttattctcattttcatggaaactttatt |
13642990 |
T |
 |
| Q |
116 |
cccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttag-taaacttgtaacaaacataggcatat |
208 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13642991 |
cc-accattttttttggaaaaacttttctattcctaagaacattttataatcaagaacaaaaattaggttaacttgtaacaaacatagacatat |
13643083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Original strand, 26085678 - 26085750
Alignment:
| Q |
157 |
attttatacccgagaataaaatttagtaaacttgt-aacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
26085678 |
attttatacccaaaaataaaatttagtaaacttgtaaaaaaacatagtcatgtatatttctatcactttattc |
26085750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 180
Target Start/End: Original strand, 12108247 - 12108298
Alignment:
| Q |
129 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaattt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12108247 |
ttgggaaattttttctattcctaaaaatattttatatccgagaataaaattt |
12108298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6832176 - 6832114
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
74 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6832176 |
aatatgtttggttaacttcatagtattccaaagaaccttaaaaataaggattataataggtaa |
6832114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Original strand, 29512704 - 29512750
Alignment:
| Q |
220 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29512704 |
attttattcccagaaattaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
29512750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 69)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 266
Target Start/End: Original strand, 2430317 - 2430568
Alignment:
| Q |
15 |
tatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430317 |
tatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataagtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
2430416 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430417 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
2430516 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430517 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
2430568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3572819 - 3572565
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572819 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
3572720 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572719 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatataca |
3572620 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572619 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
3572565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 46666526 - 46666780
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666526 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
46666625 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666626 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
46666725 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666726 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
46666780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20260340 - 20260085
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260340 |
aatatgtttgcttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
20260241 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260240 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
20260141 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260140 |
ttccaatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
20260085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 14788541 - 14788797
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14788541 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
14788640 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14788641 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaatataatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
14788740 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaa |
268 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14788741 |
ttcctattattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacacccaa |
14788797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 9115655 - 9115909
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115655 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
9115754 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115755 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
9115854 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115855 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
9115909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 39329426 - 39329680
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39329426 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
39329525 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
39329526 |
tattcccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
39329625 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39329626 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
39329680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 25789581 - 25789834
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25789581 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
25789680 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25789681 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
25789780 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25789781 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
25789834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 52630591 - 52630845
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52630591 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
52630690 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
52630691 |
tattcccacccttttctttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
52630790 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52630791 |
ttcctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
52630845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9832124 - 9831872
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9832124 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
9832025 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9832024 |
tattcccacccttttccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
9831925 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
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9831924 |
tttctatcattttattcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
9831872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12190431 - 12190177
Alignment:
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13 |
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111 |
Q |
| |
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| T |
12190431 |
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12190332 |
T |
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| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
12190331 |
tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatgtaca |
12190232 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
12190231 |
ttcctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
12190177 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 36361601 - 36361851
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
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T |
 |
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112 |
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211 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 2632671 - 2632924
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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aatatgtttggttaactttataatatttctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tattcc-accattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatataca |
2632869 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2632870 |
ttcctattattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
2632924 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 8331832 - 8332086
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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|
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8331832 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
8331931 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8331932 |
tattcccacccttttccttgaaattttttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgcaacaaacataggcatataca |
8332031 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8332032 |
ttccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
8332086 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 39930275 - 39930529
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
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211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tattcccacccttttccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
39930474 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39930475 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
39930529 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 32824739 - 32824992
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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tattcccacccttttcctt-gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatac |
210 |
Q |
| |
|
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| T |
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32824938 |
T |
 |
| Q |
211 |
attcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
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|
| T |
32824939 |
attcctattattttatttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
32824992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1597596 - 1597342
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
1597496 |
tattcccaccctttttcttggaaaaatttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
1597397 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1597396 |
ttcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
1597342 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51445333 - 51445083
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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51445333 |
aatatgtttggttacctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
51445234 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata-ctaagaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggtatataca |
51445135 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51445134 |
tttatatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
51445083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 6978588 - 6978842
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| Q |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
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T |
 |
| Q |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6978688 |
tattcccacccttttccttgagaaattttttctattccctgaaacattttatacgaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
6978787 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6978788 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
6978842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 6911303 - 6911565
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa--------cattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
203 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
6911502 |
T |
 |
| Q |
204 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
| T |
6911503 |
catatacattcttatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4683627 - 4683374
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4683527 |
tattccc-cccttttttttgggaaattttttctattcctaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataggcatataca |
4683429 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4683428 |
ttcctatcattttatttctgggaatcaacaattataaattgaaacaaagacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38964932 - 38964683
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atatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
112 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
113 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
212 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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attcccaccctttctcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaatttttgtaaacttgtaacaaacataagcatatacat |
38964733 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38964732 |
ttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 50191018 - 50190767
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| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
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T |
 |
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112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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tattcccacctttttccttgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtaggcatataca |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
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| T |
50190819 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5518757 - 5518504
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5518658 |
tattcccacctttttccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatata |
5518559 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5518558 |
tttctatcattttattcctgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
5518504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 35187275 - 35187528
Alignment:
| Q |
14 |
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112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35187275 |
atatgtttggttagttttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaacttattcttatctccatgggaacttt |
35187374 |
T |
 |
| Q |
113 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35187375 |
attcccacccttctccttgggaaattttttctattcccacgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacat |
35187474 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35187475 |
ttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaaaaaacacaccc |
35187528 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 61 - 266
Target Start/End: Original strand, 47037324 - 47037529
Alignment:
| Q |
61 |
attataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattt |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattt |
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T |
 |
| Q |
161 |
tatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47037424 |
tataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
47037523 |
T |
 |
| Q |
261 |
acaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
47037524 |
acaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48916275 - 48916022
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatatgtttggttaactttataatattcctagaaaccataaaaatagggattataataggcaact-acatatgaatttattcccatctccatgggaactt |
48916177 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48916176 |
tattcccatccttatctttgggaaattttttctattcccatgaacattttatacccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
48916077 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48916076 |
tttctatcattttattctctggaatcaacaaatataacttgaaataaacacaccc |
48916022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5806530 - 5806291
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5806530 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5806430 |
tattcc-----------ttggaaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaa----ggcatataca |
5806346 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5806345 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
5806291 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 13653670 - 13653917
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13653670 |
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13653768 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |
|
|
| T |
13653769 |
tattcccaccattttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatata |
13653868 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13653869 |
tttctatcattttattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac |
13653917 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49823150 - 49822917
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49823150 |
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49823051 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49823050 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcag---------------------aaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
49822972 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49822971 |
tttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
49822917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37436873 - 37436630
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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37436873 |
aatatgtttggttaactttataatattcttaggaaccataaaaataaggattataatagataact-atttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
37436775 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37436774 |
tattctcacccttttctttgggaaaatttt-ctattctcagtaacattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatataca |
37436676 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaaca |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
37436675 |
ttcctatcattttattctcgtgaatcaacaaatataacatgaaaca |
37436630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52699697 - 52699466
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52699697 |
atattcctgggaaccatgaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttctttggg |
52699599 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
52699598 |
aaaaatgttctattcccaggaacgttttatacccgggaataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatgtgtattcctatcattttattcccagg |
52699499 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52699498 |
aatctacgaatataacttgaaacaaacgcaccc |
52699466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32202567 - 32202331
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32202567 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
32202468 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32202467 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccataaacattttataccaaggattaaattttagta------------------gcatataca |
32202386 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32202385 |
tttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
32202331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 29091490 - 29091738
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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29091490 |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
29091584 |
tattcccacctttttttttgggaaattttttctattccgatgaacattttttactcgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatata |
29091683 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29091684 |
tttttatcattttattatcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
29091738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 30240829 - 30241075
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aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
30240829 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaagaaccataaaagtagggattataataggtaa-ttacatataaatttattctcatcttcatgagaactt |
30240927 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30240928 |
tattctcactcttttctttgggaatttttttctattcccaataactttttattccgg-gaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatata |
30241026 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30241027 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 266
Target Start/End: Original strand, 1007663 - 1007819
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209 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
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1007663 |
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1007762 |
T |
 |
| Q |
210 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tattcatatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
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| |
|
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|
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| Q |
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agtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
259 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 263
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| |
|
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|
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| |
|
|||||| |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
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95 |
catctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaac |
194 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46960528 |
catcttcatgggaactttattcccacccttttcattgggaaaacttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaac |
46960627 |
T |
 |
| Q |
195 |
aaacataggcatatacatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
46960628 |
aaacataggcatatgcatt |
46960646 |
T |
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Target: chr1; HSP #40
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Target Start/End: Complemental strand, 17475502 - 17475321
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184 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17475502 |
aatttactcccatctctattggaactttattcccactcttttctttgggaaattttatttattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta |
17475403 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||| | | | ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
17475402 |
aacttataacaaacataaacatatatatttctatcgttttattttcgggaacctatgaatataacttgtaacaaacataccc |
17475321 |
T |
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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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Target Start/End: Complemental strand, 24116555 - 24116338
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45 |
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144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |||| | |
|
|
| T |
24116555 |
aaccataaaaataggaattataataggtaa-ttacacataaatatattctcatcttcatgggagctttattccctcccttttctttgggaattctttttt |
24116457 |
T |
 |
| Q |
145 |
attcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaatt |
244 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||| | |
|
|
| T |
24116456 |
atttacaggaacgttttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataaacatat--atttctatcgttttattctcaggaatctacaaat |
24116359 |
T |
 |
| Q |
245 |
ataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24116358 |
ataacctgaaacaaacacacc |
24116338 |
T |
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Target: chr1; HSP #42
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Target Start/End: Complemental strand, 19083285 - 19083105
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185 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19083285 |
atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
19083186 |
T |
 |
| Q |
186 |
acttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19083185 |
acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacaccc |
19083105 |
T |
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Target: chr1; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 86 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19131173 - 19130993
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| Q |
86 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaa |
185 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19131173 |
atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
19131074 |
T |
 |
| Q |
186 |
acttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19131073 |
acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacaccc |
19130993 |
T |
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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
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Target Start/End: Original strand, 47677462 - 47677714
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47677462 |
aatatgtttggttaactttgtaatattctaaggaaccttaaaaatagggattataatatgtaa-ttacacataattttattcccatcttcatgggaactt |
47677560 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
47677561 |
tattcccatcctttcctttgggaaaacttttctattcaatggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaatttataacaaacacaaacatatgta |
47677660 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
47677661 |
tttttatgattttattccc-ggaatccacaaatataacgggaaacaaacacaccc |
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T |
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Target: chr1; HSP #45
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Target Start/End: Complemental strand, 1228131 - 1227936
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13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || | ||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1228131 |
aatatgtttggtgaactttataatatttcaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa-ttctacataattttattctaatcttcatgggaactt |
1228033 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat |
208 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1228032 |
tattcccgaccttttctttcggaaatcttttctattccaagaaacattttatacctgaaaataaaatttaataaacttgtaacaagcataggcatat |
1227936 |
T |
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Target: chr1; HSP #46
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Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13932048 - 13931885
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200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13932048 |
catgggaaatttattcccacccttttctttaggaaaacatttctattcc-aggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
13931950 |
T |
 |
| Q |
201 |
aggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13931949 |
aggcatatgtatttttatgattttattcctaggaatctacaaatataacttcaaacaaacacacc |
13931885 |
T |
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Target: chr1; HSP #47
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Target Start/End: Complemental strand, 38519281 - 38519064
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| Q |
45 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac-ccttttccttgggaaattttttc |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
38519281 |
aaccataaaaatagggattataataggtaatttatacatgaattt-ttcctaatttcatgggaactttattcccaaaccttttctttgggaaaatttttc |
38519183 |
T |
 |
| Q |
144 |
tattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaat |
243 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
38519182 |
t--tcccaaaaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatctgtatttctattgatttatttccaaaaatctacaaa |
38519085 |
T |
 |
| Q |
244 |
tataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38519084 |
tataacttgaaacaaacacac |
38519064 |
T |
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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
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Target Start/End: Original strand, 13521213 - 13521392
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| Q |
86 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaa |
185 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13521213 |
atttattctcatctttctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctattcccaagaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
13521312 |
T |
 |
| Q |
186 |
acttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| || ||| |||||||| || |||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13521313 |
acttgtaacaaacacagacatgtatatttctatcattgta-tcccaaaaatctacaaatataattagaaacaaacacaccc |
13521392 |
T |
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Target: chr1; HSP #49
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Target Start/End: Complemental strand, 9011374 - 9011167
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
9011374 |
aaaataagaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccaccactatgggaactttattccgacccttttctttgggaaaaattttcgattctca |
9011276 |
T |
 |
| Q |
152 |
ggaa-cattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataact |
250 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
9011275 |
cgaaaccttttatacc-gaaaataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatgtatattcctatcattttattttcaagaatctacgaatataact |
9011177 |
T |
 |
| Q |
251 |
tgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
9011176 |
tgaaacaaac |
9011167 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #50
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Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20505213 - 20504990
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44 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| ||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
20505213 |
gaaccataaaaatagggattataatatgtag-ttacacatgaatttattttcatcttcatggaagctttattttcacctttttctttggtaatttttttt |
20505115 |
T |
 |
| Q |
144 |
t---attcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaac |
240 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| | | |||| || |
|
|
| T |
20505114 |
tcttattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattctcagaaatctac |
20505015 |
T |
 |
| Q |
241 |
aattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|| ||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
20505014 |
aaatataatttaaaacaaacgcacc |
20504990 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #51
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54 |
aatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt-ttctattcccag |
152 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
13440255 |
aatatggattataataggtag-ttacatatgaatttattctcatcttcatggaaactttatttccacccttttctttggaatttttttttctattctcag |
13440353 |
T |
 |
| Q |
153 |
gaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13440354 |
gaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaaattctaacaaacatagtcatttatatttctatcattgtattccc |
13440431 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
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13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattc |
93 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47031677 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc |
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T |
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aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48462349 |
aatatgtttggttaactttataatatttgtaggaaccataaaaataaggattataataggtaact-atttatgaatttattcccaattccatgggaactt |
48462447 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaatttt |
140 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
48462448 |
tatacccatcctttt-cttcggaaatttt |
48462475 |
T |
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Target: chr1; HSP #54
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tttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaa |
239 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
52186172 |
tttctattcccagaaacattttatcgtcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatatatttctatcattttattataagaaatcaa |
52186073 |
T |
 |
| Q |
240 |
caattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52186072 |
caaatataacttgaaacaaacaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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gattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttg-ggaaattttttctattcccaggaacat |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29769378 |
gattataataggtaa-ttacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccctttttctttaggaaaattgttctattgccaggaacat |
29769476 |
T |
 |
| Q |
159 |
tttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat |
208 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29769477 |
tttatgtcaaagaataaaatttagtaattttgtaacaaacatagacatat |
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T |
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179 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| | || ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
37261734 |
tatgaatttattcatatcttcgtgagaacttttattctcaaccttttttttgggaaattttttctattcccaaaaagattttatgtcgg-gaataaaatt |
37261832 |
T |
 |
| Q |
180 |
tagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||| | |||||| | | ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37261833 |
taataaacttgtaacaaacatatgcatgtatatttctataattttattctcaggaatctatgaatataatttgaaacaaacgcacc |
37261918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37336664 - 37336514
Alignment:
| Q |
45 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || | || |||||||||||||| || ||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
37336664 |
aaccataaaaatagagattataataggtaa-ttatacatgaatttattctctccttcgtgaaaactttattcccactctattctttggaaagaaatttct |
37336566 |
T |
 |
| Q |
145 |
attcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37336565 |
attcccaataatattttatatctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaa |
37336514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 266
Target Start/End: Original strand, 19094020 - 19094185
Alignment:
| Q |
101 |
catgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19094020 |
catgggaactttattcccacagttttctttgggaatgttatttcattatcaggaacattttatatctagaaataaaatttaataaacttgcaacaaacat |
19094119 |
T |
 |
| Q |
201 |
aggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||| || | ||| | |||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19094120 |
aggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
19094185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Original strand, 1007589 - 1007669
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattc |
93 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1007589 |
aatatgtttgattaactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggt-aactatttatgaatttattc |
1007669 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33702533 - 33702381
Alignment:
| Q |
76 |
ttatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttta-tacccgagaata |
174 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| | || |||| | | ||| | |||| |
|
|
| T |
33702533 |
ttatatataaatttattctcatcgtcatgggaattttattctcacctttttattcgggaaattttttctattccctgaaaaatttaattccccaaaaata |
33702434 |
T |
 |
| Q |
175 |
aaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33702433 |
aaatttaataaatttgtaacaaacttaagaatatatatttctatcattttatt |
33702381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16257189 - 16257004
Alignment:
| Q |
85 |
aatttattcccatctccatgggaacttt-attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagt |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
16257189 |
aatttatttccatcttcatggaaacttttattccaaccattttcgatgggaatatttttct-ttcctaagaatcttttatacctaagaataaaatttaat |
16257091 |
T |
 |
| Q |
184 |
aaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaag |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | || || ||| ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16257090 |
aaacttgtaaaaaacattgaaatgtatatttttatgattttattccaagaaatatacaaatataacttcaaacaaacacacccaaag |
16257004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Original strand, 52276877 - 52276930
Alignment:
| Q |
151 |
aggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
52276877 |
aggaacattttatatccga--ataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcat |
52276930 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Original strand, 3939516 - 3939583
Alignment:
| Q |
170 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatc |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
3939516 |
gaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataagcatgtatatttctatcattctattctcaggaatc |
3939583 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 52186260 - 52186170
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttt |
125 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | || || ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52186260 |
atattcttagaaaccataaaaatagaaattataataggtaact-atgtagaaatttattcacatctcaatgtgaacttaattcccacccttt |
52186170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 201
Target Start/End: Original strand, 45771956 - 45772088
Alignment:
| Q |
74 |
aattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcc-----caggaacattttatacccg |
168 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||| || |
|
|
| T |
45771956 |
aattatatatgaatttattctcatcttcatgaaatttttattcccaccattttctttggaaaaaattttctattcccatgacacgaacgttttatatcca |
45772055 |
T |
 |
| Q |
169 |
agaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45772056 |
gaaataaaatttaataaacttataacaaacata |
45772088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Original strand, 38602234 - 38602297
Alignment:
| Q |
138 |
tttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38602234 |
tttttctattcccttaaatattttatacacaagaataaaatttactaaacttgtaaaaaacata |
38602297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 151
Target Start/End: Original strand, 3939356 - 3939455
Alignment:
| Q |
50 |
taaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcc |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3939356 |
taaaaatatagattataataggtaacc-atgtatgaatttattctcatcttaatggaaacttgattcctacactttt-ctttggaatttttttctattcc |
3939453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13048485 - 13048405
Alignment:
| Q |
50 |
taaaaatagggattataataggtaaattatttatgaattta----ttcccatctccatgggaactttattcccacccttttc |
127 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13048485 |
taaaaataaggattataataggtaa-ttatacatgaatttaattattcccatattcatggaaactttatttccacccttttc |
13048405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13053482 - 13053402
Alignment:
| Q |
50 |
taaaaatagggattataataggtaaattatttatgaattta----ttcccatctccatgggaactttattcccacccttttc |
127 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13053482 |
taaaaataaggattataataggtaa-ttatacatgaatttaattattcccatattcatggaaactttatttccacccttttc |
13053402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 201743 - 202001
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201743 |
aatatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaacttt |
201842 |
T |
 |
| Q |
113 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201843 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
201942 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
201943 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagt |
202001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 143431 - 143678
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
143431 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaact-acatatgaatttattctcatctccatgggaactt |
143529 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |
|
|
| T |
143530 |
tattcccaccattttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatata |
143629 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
143630 |
tttctatcattttattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac |
143678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 230
Target Start/End: Original strand, 119161 - 119355
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
119161 |
atattccccggaaccttaagaatagggattataataggtag-ttacacatga-tttattctcatctgcctgaaaactttatttccacccttttctttgga |
119258 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
230 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
119259 |
aaaaattttctattcccaggaacattttatactcatgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattccc |
119355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35818678 - 35818424
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818678 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
35818579 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818578 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
35818479 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818478 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
35818424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37392800 - 37392546
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392800 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
37392701 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392700 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatataca |
37392601 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37392600 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaatacaccc |
37392546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 38363898 - 38364152
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38363898 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
38363997 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38363998 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
38364097 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38364098 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
38364152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18726874 - 18726619
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18726874 |
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18726775 |
T |
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210 |
Q |
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| T |
18726774 |
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18726675 |
T |
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| Q |
211 |
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266 |
Q |
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| T |
18726674 |
attcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
18726619 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32661188 - 32660933
Alignment:
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111 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttcc-ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatac |
210 |
Q |
| |
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| T |
32661088 |
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T |
 |
| Q |
211 |
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266 |
Q |
| |
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32660988 |
attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16313761 - 16313502
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Q |
| |
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ttcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1554608 - 1554354
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
212 |
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266 |
Q |
| |
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| T |
1554408 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 12710462 - 12710716
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
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T |
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211 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 18297929 - 18298183
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Q |
| |
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T |
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Q |
| |
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T |
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266 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 3049826 - 3050074
Alignment:
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Q |
| |
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T |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 25837728 - 25837987
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| Q |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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25837927 |
T |
 |
| Q |
212 |
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271 |
Q |
| |
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|
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25837928 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagt |
25837987 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26602191 - 26601941
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
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26602092 |
T |
 |
| Q |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaagaacattttataccag-gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
26601993 |
T |
 |
| Q |
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataatttgaaacaaacaca |
26601941 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 26061961 - 26062215
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| Q |
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Q |
| |
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aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
26062060 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
26062061 |
tattcccaccctttttcttgggaatttttttctattcccagggacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggaatataca |
26062160 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
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|
|
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26062161 |
tttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
26062215 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38132992 - 38132737
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaatttttt-ctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatac |
210 |
Q |
| |
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| T |
38132892 |
tattcccacccttttccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatac |
38132793 |
T |
 |
| Q |
211 |
attcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
|
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38132792 |
atttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7931156 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttataacaaacatatacatataca |
7931255 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
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|
| T |
7931256 |
tttctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
7931306 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41228967 - 41228714
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Q |
| |
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T |
 |
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112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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tattcccacccttttcctcgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtaggcatataca |
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T |
 |
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212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 42755684 - 42755937
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Q |
| |
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T |
 |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
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Q |
| |
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42755884 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10896470 - 10896213
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Q |
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| T |
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T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
|
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10896370 |
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T |
 |
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaag |
270 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10896271 |
tttctatcattttattcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaag |
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T |
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Target: chr8; HSP #19
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Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
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T |
 |
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
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T |
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Target: chr8; HSP #20
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Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |
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T |
 |
| Q |
212 |
t---tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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ttcctcctatcattttattcccatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #21
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Target Start/End: Complemental strand, 29421742 - 29421493
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Q |
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||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
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T |
 |
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112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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Q |
| |
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|
|
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tttctatcattttattctcatgaatcaacaaatataatttgaaacaaacac |
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T |
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Target: chr8; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21137385 - 21137134
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111 |
Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
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|
|
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Back To:
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Target: chr8; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 35394208 - 35394461
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Q |
| |
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|
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
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|
|
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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Q |
| |
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|
|
| T |
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tttctttcattttattctcgtgaatcaataaatataacttgaaacaaacaaaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
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Target Start/End: Complemental strand, 33444876 - 33444627
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111 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
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|
|
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tttttatcattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
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| |
|
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|
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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229 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||| |
|
|
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19160795 |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 41432559 - 41432804
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |
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|
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tatttccaccctttttctagggaaaaattttctattcccataaacgttttataccgg-gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtgta |
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T |
 |
| Q |
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
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| |
|
|||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
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 |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
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|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
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T |
 |
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210 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
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catttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacataccc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 13 - 191
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Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
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|
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T |
 |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgt |
191 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6805777 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 42 - 261
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||| | || |
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T |
 |
| Q |
142 |
tctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
241 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| || ||||| | | |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
242 |
attataacttgaaacaaaca |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43871990 |
attataacttgaaacaaaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 16 - 266
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| |
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|
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T |
 |
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tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
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| |
|
||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
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|
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 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
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Alignment:
| Q |
14 |
atatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
112 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31117776 |
atatgcttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagatattataataggtaact-atttatgaatttatccccat------gggaacttt |
31117684 |
T |
 |
| Q |
113 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
31117683 |
attcccaccctttttcttggaaatttttttctattctgaagaacattttatattcggaaataaaatttaataaaatcgtaacaaacatag |
31117594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 260
Target Start/End: Original strand, 38437369 - 38437519
Alignment:
| Q |
110 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
209 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38437369 |
tttatttccacccttttctttgggaaaaattttctattctcaggaacgttttatacccgaaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatatg |
38437468 |
T |
 |
| Q |
210 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38437469 |
tattcctatcgttttattttcaggaatatacaaatataacttaaaacaaac |
38437519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 40197307 - 40197223
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattccca |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40197307 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca |
40197223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14764111 - 14763969
Alignment:
| Q |
85 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagta |
184 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14764111 |
aatttattatcatcttcatgtgaactttattcccacctttttcattga-attttttttctattctcatgaacattttatacccgtgaataaaatttagta |
14764013 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
228 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14764012 |
aacttgaaacaaacatatgcatgtatatttctatcattttattc |
14763969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 25899548 - 25899702
Alignment:
| Q |
110 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
25899548 |
tttattctcaccattttctttggaaaaacttttctattccgaggaacattt-atacccggaaataaaatttaataaacttgcaacaaacatagacacatg |
25899646 |
T |
 |
| Q |
210 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25899647 |
catttttatgattttattcccaggaatctacaaatataatttgaaacaaacacacc |
25899702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 266
Target Start/End: Original strand, 34672289 - 34672405
Alignment:
| Q |
150 |
caggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataac |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
34672289 |
caggaacattttatatctgagaataaaatttattaaacttgtaataaatgtaagcatatatatttttatcattttattttcaggaatcaacaaatacaac |
34672388 |
T |
 |
| Q |
250 |
ttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34672389 |
ttcaaacaaacacaccc |
34672405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37982008 - 37981857
Alignment:
| Q |
43 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
37982008 |
ggaaccataaaaatagggattataacaagtaa-ttacatataaatttattctcattttcataggaactttatttccacccttttcctt--gatttttttt |
37981912 |
T |
 |
| Q |
143 |
ctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaac |
198 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37981911 |
taattcccaagaacgttttatatccaagaat-aaattttgtaaacttgaaacaaac |
37981857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 264
Target Start/End: Original strand, 8635664 - 8635703
Alignment:
| Q |
225 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8635664 |
attcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
8635703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 12649976 - 12650137
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| | |
|
|
| T |
12649976 |
atattcttaggaacttaaaaaatagagattataataggtag-ttacatgtgaatttattttcattttcatgggaactttattcccactattttctttgcg |
12650074 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
197 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12650075 |
taaatttt-ctatttccatgaatattttatacacagaaataaaatttaataatcttgtaacaaa |
12650137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32901858 - 32901725
Alignment:
| Q |
129 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata----cattcctatcatttt |
224 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||| |
|
|
| T |
32901858 |
ttgggaaaattttcctattcccagaaacattttata-ccatgaataaatttttttaaacttgtgacaaacataagaatatatatttatttatatcaattt |
32901760 |
T |
 |
| Q |
225 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
259 |
Q |
| |
|
|||| | | |||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32901759 |
attctcagaaatctacaaatataacttgaaacaaa |
32901725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4765814 - 4765560
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765814 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
4765715 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765714 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatataca |
4765615 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765614 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
4765560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19065758 - 19065505
Alignment:
| Q |
14 |
atatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065758 |
atatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
19065659 |
T |
 |
| Q |
113 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065658 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
19065559 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065558 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
19065505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 18412026 - 18412280
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412026 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
18412125 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412126 |
tattcccacctttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
18412225 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412226 |
ttcctatcattttattcccaggaatcaataattataacttgaaacaaacacaccc |
18412280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22936166 - 22935912
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936166 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
22936067 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936066 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
22935967 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22935966 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
22935912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12970784 - 12970530
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12970784 |
aatatgtttggttagctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactt |
12970685 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970684 |
tattcccacccttttccttaagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
12970585 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970584 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
12970530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11855909 - 11855658
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11855909 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactt |
11855810 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855809 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
11855710 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855709 |
ttcctatcattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
11855658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8646642 - 8646412
Alignment:
| Q |
15 |
tatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8646642 |
tatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttat |
8646543 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8646542 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataaccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
8646443 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaatta |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8646442 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaatta |
8646412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 28602373 - 28602626
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28602373 |
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28602472 |
T |
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112 |
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211 |
Q |
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| T |
28602473 |
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28602571 |
T |
 |
| Q |
212 |
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266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28602572 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
28602626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29543269 - 29543015
Alignment:
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13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
29543170 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29543169 |
tattcccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
29543070 |
T |
 |
| Q |
212 |
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266 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543069 |
ttccaatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
29543015 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14207075 - 14206821
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14206875 |
tttctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
14206821 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 555960 - 555706
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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555960 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccatcaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactt |
555861 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
555860 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattccctggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
555761 |
T |
 |
| Q |
212 |
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266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
555760 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
555706 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 6091532 - 6091782
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6091632 |
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6091731 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6091732 |
tttatatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
6091782 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Original strand, 36703691 - 36703949
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
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36703691 |
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36703790 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36703791 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
36703890 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaag |
270 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703891 |
tttctatcattttattcccgataatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaag |
36703949 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 8406711 - 8406959
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
8406811 |
tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatataggcatgtaca |
8406910 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8406911 |
ttcctatcattttattctcgaaaatcaacaattataacttgaaacaaac |
8406959 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 27481174 - 27481428
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| Q |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatatgtaaactatttatgaatttattctcatcttcatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27481274 |
tattcccacccttttccttgggaaatattttttattctcaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
27481373 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27481374 |
ttcctatcattttatttccaaaaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
27481428 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Original strand, 32535754 - 32536016
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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32535754 |
aatatgtttggttagctttataatattctcaggaaccataaaaataggggttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
32535853 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
32535854 |
tattcccacccttttccttaggaaattttttctattcccaataacattttataccaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatataca |
32535953 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagtgta |
274 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32535954 |
tttctatcattttattcctgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacactcaaagtgta |
32536016 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42012406 - 42012174
Alignment:
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tcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaat |
137 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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42012406 |
tccttggaaccataaaaatatggattataataggtaact-atataagaatttattctgatctccatgtgaactttattcccacccttttccttcggaaat |
42012308 |
T |
 |
| Q |
138 |
tttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatc |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42012307 |
tttttctattcctaggaacattttatactcgagaataaaatttagtaaatttgtaacaaacatagacatatgtatttctatcattttattcccgagaatc |
42012208 |
T |
 |
| Q |
238 |
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271 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42012207 |
aacaaatatagcttcaaacaaacacaccctaagt |
42012174 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 20962408 - 20962659
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20962408 |
aatatgtttgcttaacattataatatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcattaatttattctcatctccatgagaactt |
20962506 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
20962507 |
tactcccacccttttccttgggaaaaattttctattcccagaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcacgtgta |
20962606 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20962607 |
ttcctatcattttattcccaagaatctacgaatataacttgaaacaaacacac |
20962659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 27480828 - 27481069
Alignment:
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111 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27480828 |
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27480926 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |
|
|
| T |
27480927 |
tattctcacc-ttttccttggaaaaaattttctattcccatgaacattttatacacaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatacata |
27481025 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27481026 |
ttcctatcattttattctcaaaaatcaacaaatataacttgaaa |
27481069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 6930459 - 6930714
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||| ||||||||||| ||| | | ||| |||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6930459 |
aatatgtttggttaactttataatattcctagaaaccttacagatagagattataatagataact-agatataaatttatttccatcttcatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc----ata |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
6930558 |
tattcccacaattttctttgggaaatttt-tctattcccaataatattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatata |
6930656 |
T |
 |
| Q |
208 |
tacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6930657 |
tatatttctatcattttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaataaacacacc |
6930714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35348755 - 35348534
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34 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
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35348755 |
atattcccgggaaccataaaaatatgaattataataggtaa-ttacatgtgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttctttggg |
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T |
 |
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134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35348656 |
aaa-attttctattcccaaaaacattttataccc-aaaatacaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatt-ctatctttttattcccgaa |
35348560 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35348559 |
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35348534 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43347118 - 43346895
Alignment:
| Q |
42 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
43347118 |
aggaaccttaaaaatagggattaaaataggtaa-ttacgcataattttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttcattggaaaaacttt |
43347020 |
T |
 |
| Q |
142 |
tctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
241 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||| | |||||| ||| |
|
|
| T |
43347019 |
tctattgccagaaacaatttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacatacatatgtatttttatgattttattttcaggaatctaca |
43346920 |
T |
 |
| Q |
242 |
attataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43346919 |
aatataacttgaaacaaacacaccc |
43346895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 1664548 - 1664754
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
1664548 |
aatatgtttggttaactttataatattcttatgaaccataaaaatagggattataataggtaact-acatataaatttattctcatctccatgggaattt |
1664646 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
1664647 |
aattcccacccgtttctttgggaaaaaatttctattctcaggaacattttatagctggtaataaaatttagtcaatttgtaacaaacataagcatataga |
1664746 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatc |
219 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
1664747 |
tttctatc |
1664754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 17251653 - 17251854
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
17251653 |
atattcctag-aaccataaaaatagggattataatatatag-ttacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccatcattttctttggg |
17251750 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| | || |
|
|
| T |
17251751 |
aaattttttctattatcatgaacattttatactcgagaataaaatttagtaaaattataacaaacataaacatgtatatttctatcattttattctcagg |
17251850 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatc |
237 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
17251851 |
aatc |
17251854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31583284 - 31583102
Alignment:
| Q |
42 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
141 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
31583284 |
aggaaccgtaaaaatagggattataataggtac-ttacatatgaatt-atttccatctttgtgggaactttattcccacctttttctttggaaaattttt |
31583187 |
T |
 |
| Q |
142 |
tctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
31583186 |
tctattcctgggaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagaca-atatatttctatcgttttatt |
31583102 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40275986 - 40275766
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
40275986 |
atattccatggaaccttaaaaatagggattttaataggtta-ttagagataattttattcccatcttcatgggaactttattcccatcattttctttggg |
40275888 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40275887 |
aaaacttttctattcccaggaatatttcatatctgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacatagacatatgtatttttataattttattcccaaa |
40275788 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaa |
255 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40275787 |
aatctacaaatataacttgaaa |
40275766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19089889 - 19089718
Alignment:
| Q |
94 |
ccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaa |
193 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
19089889 |
ccatcttcatgagaactttatacccatcattttctttgggaaattttttctattcccaaaaacgttttatactcaagaataaaatttaataaacttataa |
19089790 |
T |
 |
| Q |
194 |
caaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||| |||| |||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
19089789 |
caaacataaacatgcatatttctatttttttattcccaggaatttacgaatataacttaaaacaaacgcacc |
19089718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26637139 - 26637045
Alignment:
| Q |
170 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26637139 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatataattctatcattttattcccattaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
26637045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41783805 - 41783624
Alignment:
| Q |
82 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaa-ttttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaattt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41783805 |
atgaatttgttcacatctttatggaaactttattcccaacctttttctttgaattcttttttctattttcagaaacattttatatccgagaataaaattt |
41783706 |
T |
 |
| Q |
181 |
agtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||| |||| ||||| | || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41783705 |
agtaaacttataacaaacatatgcgtgtacatttttatgattttaatcccaagaatctataaatataacttgaaataaacac |
41783624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Original strand, 30899470 - 30899618
Alignment:
| Q |
110 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
30899470 |
tttattctcacccttttctttggaaaattgtttctattcccaagaatattttatatccaggaataaaatttagaaaacttgtaacatacataagcatgta |
30899569 |
T |
 |
| Q |
210 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
259 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| |||| |||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30899570 |
tattaatatca-tttgttcctaggaatctacgaatataacttgaaacaaa |
30899618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 36703599 - 36703656
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
69 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703599 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
36703656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15200704 - 15200547
Alignment:
| Q |
105 |
ggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc |
204 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
15200704 |
ggaattttattcccacc-tgttctttgggaa-ttttttctat-cccagaaacattttatgcctgagaataaaatttaataaatttataacaaacatagac |
15200608 |
T |
 |
| Q |
205 |
atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15200607 |
atatatatttatatcattttattttcaaaaatctataaatataacttgaaacaaacgcacc |
15200547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16720321 - 16720213
Alignment:
| Q |
157 |
attttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaac |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || || ||| |||||| ||||||| |||||| || | |||||| |||||| |
|
|
| T |
16720321 |
attttatacccgataataaaatttagtaaacttgcaacaaacatatgtatgtatatttctatca-tttattcataggaatctacgaatataacatgaaac |
16720223 |
T |
 |
| Q |
257 |
aaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16720222 |
aaacacaccc |
16720213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 202
Target Start/End: Original strand, 28023719 - 28023840
Alignment:
| Q |
82 |
atgaatttattcccatctccatgggaa-ctttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaattt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | || ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28023719 |
atgaatttattctcatcttcgtgagaaactttattctcacccttttgtttgagaaattttttctattcccaaacacattttatatgtgagaataaaattt |
28023818 |
T |
 |
| Q |
181 |
agtaaacttgtaacaaacatag |
202 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28023819 |
aatgaacttgtaacaaatatag |
28023840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3913404 - 3913201
Alignment:
| Q |
48 |
cataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctatt |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
3913404 |
cataaaaatagaaactataataggtaa-ttacatatgagtttattcccatctttatgggaactttattcccacattttt-----------tttttctatt |
3913317 |
T |
 |
| Q |
148 |
cccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattata |
247 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||| ||||| || | |||| |
|
|
| T |
3913316 |
cctaa-aacattttatacctg-gaataaaatttagtaaatttgtaataaacatacacatgtatatttctatcgttttattcccaagaatctacgaatata |
3913219 |
T |
 |
| Q |
248 |
acttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
3913218 |
acttgaaataaacgcacc |
3913201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 28429676 - 28429733
Alignment:
| Q |
170 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28429676 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatgtatatttctatcattttatt |
28429733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26637271 - 26637137
Alignment:
| Q |
17 |
tgtttggttagctttata-tattcctaggaaccata-aaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
26637271 |
tgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaaatatggattataataggt-agttacatttgaatttattctcatatccataggaacttt-- |
26637175 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26637174 |
---cacccttttctctcagaaattttttctatttccaggaa |
26637137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
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Alignment:
| Q |
170 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36978267 |
gaataaaattttgtaagtttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttatt |
36978210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 830115 - 830058
Alignment:
| Q |
171 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
830115 |
aataaaatttaataaacttgtaacaaacatattcatatatattgatatctttttattc |
830058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15776261 - 15776182
Alignment:
| Q |
118 |
cacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| || |||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15776261 |
cacccttttctttgg-aaactttttctattaccagaaatattttataatcaaaaataaaatttagtaaatttgtaagaaac |
15776182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 346599 - 346345
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346599 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
346500 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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| T |
346499 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatataca |
346400 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346399 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
346345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 6171608 - 6171862
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
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| T |
6171608 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
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T |
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| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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| T |
6171708 |
tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
6171807 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
6171808 |
ttcctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42674915 - 42674656
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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| T |
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactt |
42674816 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
42674815 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
42674716 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagt |
271 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
42674715 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagt |
42674656 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 2050683 - 2050935
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaatcataaaaataggaattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
2050783 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatataca |
2050882 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
2050883 |
ttcctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
2050935 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 266
Target Start/End: Original strand, 37533772 - 37534023
Alignment:
| Q |
15 |
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114 |
Q |
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| T |
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tatgtttggttagctttatatattcctgggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttat |
37533871 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
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tcccacccttttttttgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattc |
37533971 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37533972 |
ctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
37534023 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 4559376 - 4559630
Alignment:
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13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4559376 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4559476 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
4559575 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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| T |
4559576 |
ttccaatcattttattcttgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
4559630 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 11071422 - 11071676
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
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| T |
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aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactt |
11071521 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11071522 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
11071621 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
| T |
11071622 |
ttcctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
11071676 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 2521492 - 2521746
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
2521492 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattt |
2521591 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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| T |
2521592 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
2521691 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
2521692 |
ttccaatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
2521746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5770364 - 5770110
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5770364 |
aatatgtttggttagctttataatattcctagcaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactt |
5770265 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5770264 |
tattcccaccatttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
5770165 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5770164 |
ttcctatcattttattcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacataccc |
5770110 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9734100 - 9733846
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| Q |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9734100 |
aatatgtttggttggctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
9734001 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9734000 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
9733901 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9733900 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
9733846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14777752 - 14777498
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| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
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|
| T |
14777752 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777652 |
tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
14777553 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777552 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataaattgaaacaaacacaccc |
14777498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Original strand, 17965800 - 17966061
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactt |
17965899 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17965900 |
tattcccaccctttttcatgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttggtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
17965999 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagtgt |
273 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17966000 |
ttccaatcattttattatcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagtgt |
17966061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21737662 - 21737400
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13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21737662 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
21737563 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt--------ttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
203 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21737562 |
tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataga |
21737463 |
T |
 |
| Q |
204 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21737462 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
21737400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 41750346 - 41750599
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111 |
Q |
| |
|
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|
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aatatgtttggttaactttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
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41750446 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
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T |
 |
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
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| |
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| T |
41750546 |
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41750599 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 37192339 - 37192591
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| |
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37192339 |
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112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
37192439 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacatagacatataca |
37192538 |
T |
 |
| Q |
212 |
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264 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37192539 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
37192591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34356953 - 34356700
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
34356953 |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34356854 |
tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatataca |
34356755 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34356754 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
34356700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41729384 - 41729130
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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| T |
41729384 |
aatatgtttggttagctttataatattcctagtaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactt |
41729285 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
41729284 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatctggcaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatcca |
41729185 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41729184 |
ttcctatcattttattcccgggaataaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
41729130 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39995393 - 39995131
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt--------ttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
203 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
39995194 |
T |
 |
| Q |
204 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39995193 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28311950 - 28311701
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
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| T |
28311950 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaact-atttatgaatttattcccatctccacgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaagattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatatata |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
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|
| T |
28311751 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 638411 - 638660
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111 |
Q |
| |
|
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|
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
638511 |
tattccc-cccttttccttgggaaattttttatattcctaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacctgtaacaaacatagacatataca |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
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| T |
638610 |
ttcctatcattttatttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
638660 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 37233247 - 37233496
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37233247 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaataaggattataataggtaact-atttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37233346 |
tattcccacccttttccttgggaacgattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatg |
37233445 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37233446 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac |
37233496 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40951113 - 40950859
Alignment:
| Q |
13 |
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Q |
| |
|
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|
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40951014 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
40951013 |
tattcccacccttttccttggaaatttttttgtattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataagcatatata |
40950914 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40950913 |
tttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
40950859 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 26310084 - 26310335
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aatatggttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
26310183 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaac--ataggcatata |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
26310184 |
tattcccacccttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttctaacaaacatatagacatata |
26310283 |
T |
 |
| Q |
210 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
261 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26310284 |
catttctatcattttattcccgggaatcaacaattataactttaaacaaaca |
26310335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20426736 - 20426483
Alignment:
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20426736 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaccaaccataaaaatagagattataataggtaact-atttatgaatttattctcatctccataggaactt |
20426638 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20426637 |
tattctcacccttttccttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatatccggggataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataaa |
20426538 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20426537 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaaatataatttgaaacaaacacaccc |
20426483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27358216 - 27357963
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
|
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|
|
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aatatgtttgattaaatttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaact-atttatgaatttattctcatctctatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27358117 |
tattcccacccttttccttgggtaaatttttctattcccatgaatattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
27358018 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27358017 |
tccctatcattttatacctgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
27357963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 45409068 - 45409321
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45409068 |
aatatgtttgattaaatttataatatttctaggaaccataaaaataaggattataataggtaact-atttatgaatttatttccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45409167 |
tattcccacccttttccttgggtaaatttttctattcccatgaatattttatacccggtaataaaatttagtaaacttgtaaaaaacataggcatataca |
45409266 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
| T |
45409267 |
ttcctatcattttatacttgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 14832628 - 14832877
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13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14832628 |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
14832727 |
tattcccacccttttctttgggaaaatttttctattcccaagaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttttaacaaacataggcatatata |
14832826 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
14832827 |
tttctatcattttattcctaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac |
14832877 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 1988129 - 1988387
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| |
|
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1988227 |
T |
 |
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112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
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T |
 |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18713910 - 18713660
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111 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | | | ||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18713910 |
aatatgtttggttaactttataatattcctatgaaccataaaaatagggtttataataggttact-acgtataaatttatttccatctccatgggaactt |
18713812 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
18713811 |
tattcccacccttttctttgggaaattttttttattaccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatata |
18713712 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18713711 |
tttatatcattttattaccatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca |
18713660 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
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13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23943980 |
aatatgtttggttacctttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
23944079 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23944080 |
tattcccacccttttcgttgagaaattttttctattcccaggaacattttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
23944165 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3902274 |
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3902372 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |
|
|
| T |
3902373 |
tattcccaccattttctttgggaatttttttctattcccaggaacattttaaacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtctatata |
3902472 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3902473 |
tttctatcattttattctcaggaaagaacaaatataacttgaaacaaac |
3902521 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13760784 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
13760883 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc |
166 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13760884 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccataaacattttatacc |
13760938 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #33
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133 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45694028 |
atattcctgggaaccataaaaataggaattataattgc-aaattactcatgaatttattttcatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
45694126 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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aaaaattttctattcccatgaacgttttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttattcccaga |
45694226 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45694227 |
aatctacgaatataacttgaaacaaacgcaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Original strand, 40569838 - 40570091
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| Q |
16 |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40569838 |
atgtttggttaacattataatgttccaaggaacctcaaaaatagggattataataggtaa-ttatacatgattttattcccatttccatgggaacttctt |
40569936 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
40569937 |
tattcccaccattttctttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcatgtatg |
40570036 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40570037 |
tttttatgattttattcccaggaatctacaattataacttgaaacaaacacaccc |
40570091 |
T |
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Target: chr2; HSP #35
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Target Start/End: Complemental strand, 11763577 - 11763374
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
11763577 |
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11763479 |
T |
 |
| Q |
159 |
tttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa |
258 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
11763478 |
tttatgtccgagaataaaatttagtaaatttataacaaacatagacatatatattcctatcatttcattcccgaaaaacaacaaatataacttgaaa-aa |
11763380 |
T |
 |
| Q |
259 |
acacac |
264 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
11763379 |
acacac |
11763374 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
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Target Start/End: Original strand, 6571602 - 6571758
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| Q |
110 |
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209 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6571602 |
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T |
 |
| Q |
210 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
6571702 |
tattcctatcattttatttccggaaatcaacaaatataactttaaacaaatacaccc |
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T |
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Target: chr2; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 14253412 - 14253578
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184 |
Q |
| |
|
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|
|
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14253412 |
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14253511 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataactt |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14253512 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
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Target Start/End: Original strand, 39819507 - 39819763
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13 |
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108 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | | ||| | |||| || ||||| |||| ||| |
|
|
| T |
39819507 |
aatatgtttggttgactttataatattccaaggaaccttaaaaataaggattatattaggtaaacaaacatatataattttactctcatcttcatgagaa |
39819606 |
T |
 |
| Q |
109 |
ctttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttt---atacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39819607 |
ctttattcccaccattttctttggaaatttttttcaattcccaggaacattattatatacccgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca |
39819706 |
T |
 |
| Q |
206 |
tatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
|
||| ||| || |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39819707 |
tatgtattttcatgattttattttcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacac |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
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184 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25454914 |
tttattctcgtcttcatgggaactttttattccctccattttttttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgagaatgaaatttagta |
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T |
 |
| Q |
185 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25455014 |
aacttgtaacaaacatagacatatgtatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
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aggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
4875624 |
aggaaccataaaaatagggattataatatgtaa-ttacatatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccgtttctttgggattttttt |
4875722 |
T |
 |
| Q |
142 |
tctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
241 |
Q |
| |
|
| ||||| | |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| || || | ||| |
|
|
| T |
4875723 |
tttattctcgagaacgttttata-ttgaaaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataaacaaatttatttctatcattttatttccaaaaagctaca |
4875821 |
T |
 |
| Q |
242 |
attataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
4875822 |
aatataacttaaaacaaacgcaccc |
4875846 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
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42 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
142 |
tctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || | | |||||||||||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
5002960 |
tctattcccagaaacattttatacttg-gaataaaatttagcaaacttgtaacaaatatatgcatgtatacttctatcattttattcttagaaatctaca |
5002862 |
T |
 |
| Q |
242 |
attataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5002861 |
aatataacttgaaacaaacgcaccc |
5002837 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
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atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |
|
|
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41298149 |
atattccaaggaaccataagaatagagattataataggtaa-ttataaatgaatatattctcatcttcatgagaactttattcacaccctttgctttggg |
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T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
201 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41298050 |
aaattttttttatttctaaaaacattttatatccgggaataaaatttaataaacttgtaacatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
7007402 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaagaaccattaaaatagggagtataataggtaact-acatatgaatttattctcatctccatggtaattt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | || ||| | |
|
|
| T |
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tattcccaccattttctttgggaa--tttttttattatcaataacatttt---------agtaaaatttagtaaacttgtatgaaacattgacaaatata |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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Q |
| |
|
|| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
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Target Start/End: Original strand, 25724918 - 25725107
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| |
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| T |
25724918 |
ttattctcatcttcatgagaactttattcccacccttttctttgggaaactttttctattcccagaaacattttatacccagcaataaaattttaataaa |
25725017 |
T |
 |
| Q |
187 |
cttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagtgtaaa |
276 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
25725018 |
cctgcaacaaacataggaatacgtatttctatcattttgttcccaagaatttccaaagataacttgaaacaaacgcaccccaagtataaa |
25725107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8868851 - 8868664
Alignment:
| Q |
76 |
ttatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataa |
175 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
8868851 |
ttattcataaatttatacccatcttcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaa-tattccta-tcccaggaacattttctacctaggaataa |
8868754 |
T |
 |
| Q |
176 |
aatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8868753 |
aatttactaatcctgtaacaaacataagaatatgtatttctatcaatttattcctaggaatctacaa-aataacttgaaacaaacgcaccc |
8868664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 266
Target Start/End: Original strand, 1623206 - 1623453
Alignment:
| Q |
18 |
gtttggttagctttatat-attcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
1623206 |
gtttgattaactttatattattcgtaggaaccataaaaatagagattataattggtaact-acatatgaatttattctcatattcattgaaactttattc |
1623304 |
T |
 |
| Q |
117 |
ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcct |
216 |
Q |
| |
|
|| || | ||| |||| ||| ||| ||| | | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
1623305 |
ccgccatgttctttggaaaaatttctctgtactcaggaacattttataaccgggaatcaaatttaataaactcgtaac-aacatagacatatatatttct |
1623403 |
T |
 |
| Q |
217 |
atcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
1623404 |
attattttactcttaggaatcaacaaatataatttaaaacaaacataccc |
1623453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 13539519 - 13539675
Alignment:
| Q |
45 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
13539519 |
aaccataaaaataaggattataatagataa-ttacacatgaatctattcccatgttcatgggaactttattcccactagtttctgtgagaaattttttcc |
13539617 |
T |
 |
| Q |
145 |
attcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
202 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13539618 |
attcccataaacattttatacctgcgaataaaatttaataaatttgtaacaaacatag |
13539675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14403419 - 14403233
Alignment:
| Q |
82 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctat---tcccaggaacattttatacccgagaataaaat |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14403419 |
atgaatttattctcacc-ccatgaaaactttattcacaccattttctttggtaaaatttttctttctatttcaggaacattttatacctgagaataaaat |
14403321 |
T |
 |
| Q |
179 |
ttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14403320 |
ttattaaacttgtaataaatgtaggcatgtatatttttatcattttatttccaggaatcaacaaatacaacttcaaacaaacacaccc |
14403233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Original strand, 37851704 - 37851929
Alignment:
| Q |
41 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggga--aatt |
138 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| | || |
|
|
| T |
37851704 |
taggaatcataaaaatatgaattataataggtag-ttacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttattctcaccattttctttggaatttttt |
37851802 |
T |
 |
| Q |
139 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| | | || ||| ||||||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
37851803 |
ttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaa-ttagtaaacttctagcaaacataagaaggtatatttctatcattttattttcagaaatct |
37851901 |
T |
 |
| Q |
239 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37851902 |
acgaatattacttgaaacaaacccaccc |
37851929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 13790130 - 13790276
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattattt-atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgg |
132 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13790130 |
atattccaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa--tattacatgattttattcccatctccatgggaactttattcccaccgtttt------ |
13790221 |
T |
 |
| Q |
133 |
gaaattttttctattcccaggaacatttta--tacccgagaataaaatttagtaaactt |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13790222 |
----ttttttctatttccaagaacattttatgtactctagaataaaatttagtaaactt |
13790276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 264
Target Start/End: Original strand, 24499400 - 24499509
Alignment:
| Q |
153 |
gaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttg |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24499400 |
gaacattttataccatggaataaaatttagtaaacttataacaaacatag--atatatatttctatcattttatttctatgaatcaacaaatataacttg |
24499497 |
T |
 |
| Q |
253 |
aaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
24499498 |
aaacaaacacac |
24499509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3254245 - 3254142
Alignment:
| Q |
85 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt-ttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3254245 |
aatttattctcatcttcatgggaactttattcccaccatttcctttgggaaaaaattttctattcccagaaacattttgtacgcgagaataaaatttagt |
3254146 |
T |
 |
| Q |
184 |
aaac |
187 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
3254145 |
aaac |
3254142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Original strand, 13760941 - 13761013
Alignment:
| Q |
191 |
taacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13760941 |
taacaaacataggtacatatattcctatcattttattcccgaaaatcaataattataacttgaaacaaacaca |
13761013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Original strand, 25625328 - 25625418
Alignment:
| Q |
137 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25625328 |
ttttttctattcccatgaacattttatacctcagaataaaatctagtaaatttgcaacaaacctagacattcatatttctatcattttatt |
25625418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Original strand, 4685064 - 4685211
Alignment:
| Q |
82 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttg-ggaaattttttctattcccagg-aacattttatacccgagaataaaatt |
179 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4685064 |
atgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcacacccttttctttgatttttttttttctattgccaggaaacgttttatactctgaaataaaatt |
4685163 |
T |
 |
| Q |
180 |
tagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
|| |||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4685164 |
taataaatttataacaaacataaacatgtatatttctatcattttatt |
4685211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1723336 - 1723230
Alignment:
| Q |
158 |
ttttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaaca |
257 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||| | |||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1723336 |
ttttatatccaagaataaaatttaataaacttgtaacaaacattgaaatgtatatttccatcattttattcatggaaatatacaaacataacttgaaaca |
1723237 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacacac |
264 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
1723236 |
aacacac |
1723230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 516572 - 516463
Alignment:
| Q |
85 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagta |
184 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||| ||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
516572 |
aatttattctcatcttcacgggaattttattctcaccattttctttgg-aatttttttatattcccaaaaacattttatacccagaaataaaatttacta |
516474 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacttgtaaca |
195 |
Q |
| |
|
|| || ||||| |
|
|
| T |
516473 |
aaattataaca |
516463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11763654 - 11763597
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
69 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11763654 |
aatatgtttgattaattttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataata |
11763597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3254346 - 3254284
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
74 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
3254346 |
aatatgtttggttaacttcataatattcctagaaaccataaaaataagggttataataagtaa |
3254284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Original strand, 14137054 - 14137153
Alignment:
| Q |
45 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
14137054 |
aaccataaaaatagagattttaataagtaa-ttacatatgaatttattctcgtcttcatgagaactttattcttaaccttttttttgagaaaatttttct |
14137152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48519145 - 48518885
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48519145 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggtattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
48519046 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48519045 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
48518946 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagtg |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48518945 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacacccaaagtg |
48518885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27763153 - 27762898
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27763153 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
27763054 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27763053 |
tattcccacccttttccttgggaaatattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
27762954 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27762953 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
27762898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13230243 - 13229989
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230243 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
13230144 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230143 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
13230044 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230043 |
tttctatcattttattcccgggaataaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
13229989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 48879146 - 48879400
Alignment:
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13 |
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111 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
48879146 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
48879245 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
48879246 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
48879345 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48879346 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
48879400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6280175 - 6279921
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6280075 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6279975 |
ttcatatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
6279921 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 35999507 - 35999761
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
35999706 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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| T |
35999707 |
tttctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
35999761 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39730547 - 39730293
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgtgaactt |
39730448 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
39730348 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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39730347 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 42773769 - 42774023
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
42773868 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
42773869 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttttatccccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
42773968 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42773969 |
ttccaatcattttattcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45748049 - 45747796
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataat-ggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
45747951 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45747950 |
tattcccccccttttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
45747851 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45747850 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
45747796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 55968254 - 55968000
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
55968155 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
55968154 |
tattcccaccctttttcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacagagacatataca |
55968055 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55968054 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
55968000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41859300 - 41859040
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41859300 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
41859201 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41859200 |
tattcccacccttttccttgggaaattttt-ctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
41859102 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagtgt |
273 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41859101 |
ttccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagtgt |
41859040 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25916287 - 25916035
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| Q |
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aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25916287 |
aatatgtttgattagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactt |
25916188 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25916187 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc--ataca |
25916090 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25916089 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
25916035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 25932262 - 25932521
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25932262 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
25932361 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25932362 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
25932461 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagt |
271 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25932462 |
tttctatcattttattcctaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagt |
25932521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34049851 - 34049596
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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34049752 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34049751 |
tattcccaccatttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccctggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
34049652 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34049651 |
ttcctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
34049596 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 40435721 - 40435975
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40435821 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
40435920 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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40435921 |
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40435975 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Original strand, 43723085 - 43723346
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
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43723184 |
T |
 |
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112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tattctcacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
43723284 |
T |
 |
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagtgt |
273 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 45596089 - 45596343
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| |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
45596288 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45596289 |
tttctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacgcaccc |
45596343 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 32953344 - 32953600
Alignment:
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111 |
Q |
| |
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32953443 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
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tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaagataggcatataca |
32953543 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaa |
268 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
32953544 |
ttcctatcattttgttcctgggaatcaacaattataacttgagacaaacacacccaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50673158 - 50672908
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111 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
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50672959 |
ttcctatcattttattccc-ggaatcaacaat--taacttaaaacaaacacaccc |
50672908 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 935947 - 936201
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111 |
Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
936147 |
ttccaatcattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 23686608 - 23686862
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| Q |
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111 |
Q |
| |
|
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|
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aatatgtttggttagttttataatattcctaggaaccataaaaatatgaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatata |
23686807 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23686808 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
23686862 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41744475 - 41744222
Alignment:
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgag-aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatac |
210 |
Q |
| |
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|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatac |
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T |
 |
| Q |
211 |
attcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
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41744275 |
atttctatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaataaacacac |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18405487 - 18405234
Alignment:
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Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
18405387 |
tattctcacccttttccttgg-aaattttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
18405289 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18405288 |
tttctataattttattctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
18405234 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39835561 - 39835307
Alignment:
| Q |
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
39835461 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatatgcatataca |
39835362 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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39835361 |
tttatatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
39835307 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 27942558 - 27942814
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |
|
|
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatttcaatgggaactt |
27942657 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgta------acaaacataggca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| || |
|
|
| T |
27942658 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataataaacataaacatagaca |
27942757 |
T |
 |
| Q |
206 |
tatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27942758 |
tatacattcctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
27942814 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
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Target Start/End: Original strand, 27555248 - 27555485
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112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatatgtttggttagctttatatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
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T |
 |
| Q |
113 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27555348 |
attcccacccttttccttgggaaattttt----------------ttttatacccgcgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacat |
27555431 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27555432 |
tcctatcattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
27555485 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tatttccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
47670382 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
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|
| T |
47670383 |
tttctatcattttatttccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
47670436 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 13 - 264
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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| T |
18931674 |
tattcccaccatttttcttggaaatttttttctattcccaggaacattttatacacgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatataca |
18931773 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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18931774 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
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Q |
| |
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 |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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| T |
8322166 |
tattcccacccttttccttggaaatttttttctattcccaagaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaa |
254 |
Q |
| |
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
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 |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
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tatttccacccttttccttggaattttttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatataca |
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 |
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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|
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
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Q |
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| T |
39501985 |
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39502084 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
39502085 |
tatttccacccttttccttggaattttttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatataca |
39502184 |
T |
 |
| Q |
212 |
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266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39502185 |
tttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
39502239 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34238208 - 34238007
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111 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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34238109 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
34238108 |
tattcccacccttttccttgggaaattgtttctattcccaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
34238009 |
T |
 |
| Q |
212 |
tt |
213 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
34238008 |
tt |
34238007 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Original strand, 30415746 - 30415977
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133 |
Q |
| |
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30415746 |
atattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ttatttatgaaattattttcatctttatggaaattttattcccaccattttctttggg |
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T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
30415845 |
aaattttttctattccaaagaacattttatatttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagacatatatattcctatcattttattatcggg |
30415944 |
T |
 |
| Q |
234 |
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266 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
30415945 |
aatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 48873842 - 48873978
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
48873941 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattc |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48873942 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattc |
48873978 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31938123 - 31937870
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| Q |
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111 |
Q |
| |
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aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaactg-tttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
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210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |
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|
| T |
31938024 |
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31937925 |
T |
 |
| Q |
211 |
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265 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31937924 |
gtttttatgattttattttcaaaaatctacaattataacttgaaacaaacacacc |
31937870 |
T |
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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 38414032 - 38414278
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114 |
Q |
| |
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|||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
38414032 |
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38414130 |
T |
 |
| Q |
115 |
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214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| |
|
|
| T |
38414131 |
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38414229 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
38414230 |
ctatcattttattccc--gaatcaacaaatataactttagacaaacacacc |
38414278 |
T |
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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 265
Target Start/End: Original strand, 7258807 - 7259036
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133 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || || |
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|
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7258807 |
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T |
 |
| Q |
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aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
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|
| T |
7258906 |
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7259004 |
T |
 |
| Q |
234 |
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265 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7259005 |
aatctaccaatataacttgaaacaaacgcacc |
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T |
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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 266
Target Start/End: Original strand, 51968632 - 51968852
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142 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
143 |
ctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaa |
242 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ctattcccaggaacgttttatactcaagaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataggcatgcatatttctatctttttattcccagaaatttacga |
51968828 |
T |
 |
| Q |
243 |
ttataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51968829 |
atataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10400961 - 10400810
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209 |
Q |
| |
|
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|
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10400862 |
T |
 |
| Q |
210 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
261 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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10400861 |
catttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaaca |
10400810 |
T |
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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 52469523 - 52469734
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114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaatatagagattataataggtaact-atattggaatttatttccatctccatgggaactttat |
52469621 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattc |
214 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |
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|
| T |
52469622 |
tcccaccaatttccttggaaaaaaatttctattcctagaaacattttattgccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatatgcaatt |
52469721 |
T |
 |
| Q |
215 |
ctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
52469722 |
ctatcattttatt |
52469734 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36858630 - 36858378
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Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36858630 |
aatatgtttgtttaacattataatattcccggaaaccataaaaatagggattataatatgtaa-ttacatatgaaattattctcatcttcatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaatttttt---ctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
36858531 |
tattcccacccttttatttg--aattttttttttctattctcaggaacattttatacccgggcataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagc--at |
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T |
 |
| Q |
209 |
acattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36858435 |
gcatttctatctttttattcttgggaatctaagaatataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
18405597 |
atatttctaggaaccataaaaatagagattataataggtaa-ttacacatggatttattcccatcttaatgagaactttattcccacccttttctttagg |
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T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
18405696 |
aaaaattttctattcctaggaacattttatacctagaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatgtatatttatatcgttttattctcgga |
18405795 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18405796 |
aatctctgaatataacttaaaacaaacacaccca |
18405829 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 38394759 - 38394943
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141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
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ggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttatttccatctctatcagaactttattcccaccccttttctttgggaatttttt |
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T |
 |
| Q |
142 |
tctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
228 |
Q |
| |
|
| |||| |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||| |
|
|
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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47426488 - 47426269
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Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
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aatatatttggttaactttataatattcctaggaacc-------tagggattataataggtaact-atttatgaatttattttcatcttcatgggaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttc-cttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatat-a |
209 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
47426396 |
tattgccacccttttttcttgataatatttttctatttccaggaacattttatatcaagaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataa |
47426297 |
T |
 |
| Q |
210 |
cattcctatcattttattcccgggaatc |
237 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
47426296 |
tattcatatcattttattctcaggaatc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 36858228 - 36858351
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| |
|
||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
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tattcccacccttttctttgggaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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143 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24805305 |
aaccataaaaatagggaatataataggtaa-ttacacatggatttattcccatattcatgggaactttattttccaccattttctttgtgaaattttttc |
24805207 |
T |
 |
| Q |
144 |
tattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaat |
243 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| | || |||||||| | | |||| || | |
|
|
| T |
24805206 |
tattcccaa-aatgttttattcccgaaaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataaacatgtatatttttttcgttttattctcagaaatctacgaa |
24805108 |
T |
 |
| Q |
244 |
tataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24805107 |
aataacttgaaacaaacaca |
24805088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 48059899 - 48060065
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| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
48059899 |
atatttctaggaattataaaaataagaattataataggtaa-ttatatatgaatttatttatatttttatgagaactttattcccaccattttatttggg |
48059997 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48059998 |
aaattttttctattcccataaatattttatatccaaaaataaaatttaataaactcgtaacaaacata |
48060065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Original strand, 18094099 - 18094324
Alignment:
| Q |
41 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggga--aatt |
138 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| | || |
|
|
| T |
18094099 |
taggaatcataaaaatatgaattataataggtag-ttacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttattctcaccattttctttggaatttttt |
18094197 |
T |
 |
| Q |
139 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| | | || ||| ||||||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
18094198 |
ttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaa-ttagtaaacttctagcaaacataagaaggtatatttctatcattttattttcagaaatct |
18094296 |
T |
 |
| Q |
239 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18094297 |
acgaatattacttgaaacaaacccaccc |
18094324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22654638 - 22654515
Alignment:
| Q |
107 |
aactttattcccacccttttccttggga--aattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22654638 |
aactttattcccaccctttttttttggagaaagtttttctattcgcaataacattttttacccgagaataaaaattagttaacttgtaataaacataggc |
22654539 |
T |
 |
| Q |
205 |
atatacattcctatcattttattc |
228 |
Q |
| |
|
|| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22654538 |
atgtatatttctatcattttattc |
22654515 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 260
Target Start/End: Original strand, 44309670 - 44309829
Alignment:
| Q |
101 |
catgggaactttattcccacccttttccttgggaaa-ttttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaaca |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44309670 |
catgggaactttattcccacccttttctttaggaaatttttttctattctctagaacgttttatactag-gaataaaatttagtaaccttgtaacaaaca |
44309768 |
T |
 |
| Q |
200 |
taggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||| ||||| ||||||| | | |||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44309769 |
tagacatgcatatttctatcgttttattttcagaaatctacgaatataacttgaaacaaac |
44309829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 266
Target Start/End: Original strand, 26165261 - 26165439
Alignment:
| Q |
87 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaa |
186 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26165261 |
tttattctcatcttaatgggaactttattctcactattttctttatgaaaacttttctattctaag-aacattttatattcatgaataaaatttagtaaa |
26165359 |
T |
 |
| Q |
187 |
cttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26165360 |
cttgtaacaaacataaacatgtgcatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacatgaaacaaacacaccc |
26165439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12276075 - 12275953
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| Q |
102 |
atgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12276075 |
atgggaattttattcccaccttttcttttgggaaaatatttctttttccaagaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
12275976 |
T |
 |
| Q |
202 |
ggcatatacattcctatcatttt |
224 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
12275975 |
aacatatatatttctatcatttt |
12275953 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37014569 - 37014451
Alignment:
| Q |
82 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaattta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
37014569 |
atgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccactcttttctttgggaaattttttctattcctatgaacatgttatacctggatataaaattta |
37014470 |
T |
 |
| Q |
182 |
gtaaacttgtaacaaacat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37014469 |
ataaactcataacaaacat |
37014451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34237480 - 34237424
Alignment:
| Q |
206 |
tatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34237480 |
tatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
34237424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32384625 - 32384492
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32384625 |
atattcctggaaaccataaaattagggattataataggtaa-ttgcacataaatttgttccaatctttatgggaattttattcccacccttttctttggg |
32384527 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaatt-ttttctattcccaggaacattttataccc |
167 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
32384526 |
aaatttttttctgtttccatgaacgttttataccc |
32384492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9327346 - 9327245
Alignment:
| Q |
166 |
ccgagaataaaatttagtaaacttgt-aacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9327346 |
ccgagaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacac |
9327247 |
T |
 |
| Q |
265 |
cc |
266 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
9327246 |
cc |
9327245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9374105 - 9374004
Alignment:
| Q |
166 |
ccgagaataaaatttagtaaacttgt-aacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9374105 |
ccgagaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacac |
9374006 |
T |
 |
| Q |
265 |
cc |
266 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
9374005 |
cc |
9374004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 167
Target Start/End: Original strand, 30790438 - 30790518
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| Q |
87 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30790438 |
tttatttccatcttcatggaaactttattcccatccttttcattggaaaaacttttctattctcagaaacattttataccc |
30790518 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 265
Target Start/End: Original strand, 36860106 - 36860191
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| Q |
179 |
ttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36860106 |
ttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttatatcattttatt-taagaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
36860191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 10401031 - 10400973
Alignment:
| Q |
16 |
atgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
74 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10401031 |
atgtttggttag-tttataatattcctcggaaccataaaaataaggattataataggtaa |
10400973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9382383 - 9382297
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| Q |
166 |
ccgagaataaaatttagtaaacttgt-aacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataactt |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9382383 |
ccgagaataaaatttagtaaatttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataactt |
9382297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 54478495 - 54478555
Alignment:
| Q |
141 |
ttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
201 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54478495 |
ttctatttccaataacattttatacccatgaatgaaatttagtaaacttataacaaacata |
54478555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 266
Target Start/End: Original strand, 37296662 - 37296753
Alignment:
| Q |
175 |
aaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| || |||||| | | |||||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
37296662 |
aaatttagcaaactagtaacaaacataagcatgtatatttctatcattttatttccaggaatctatgaatataaccttaaacaaacgcaccc |
37296753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9297172 - 9297144
Alignment:
| Q |
172 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9297172 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
9297144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35488443 - 35488189
Alignment:
| Q |
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aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35488443 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactt |
35488344 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488343 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
35488244 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488243 |
ttccaatcattttattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
35488189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 45045443 - 45045697
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45045443 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
45045542 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45045543 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatataca |
45045642 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45045643 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacaccc |
45045697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8419843 - 8419589
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419843 |
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T |
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211 |
Q |
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| T |
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T |
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212 |
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266 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 11329810 - 11330064
Alignment:
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111 |
Q |
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T |
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112 |
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211 |
Q |
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| T |
11329910 |
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T |
 |
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212 |
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266 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 40212706 - 40212961
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13 |
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111 |
Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
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T |
 |
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212 |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 27248110 - 27248364
Alignment:
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Q |
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T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
212 |
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266 |
Q |
| |
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ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45265302 - 45265049
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| Q |
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Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 48341180 - 48341430
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Q |
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 13 - 266
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211 |
Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 39554000 - 39554254
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Q |
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 |
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211 |
Q |
| |
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39554199 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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Q |
| |
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39554200 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 44565862 - 44566117
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| Q |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
44565962 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatataca |
44566061 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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44566062 |
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44566117 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 25097886 - 25098140
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25097986 |
tattcccacccttttccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatgggcatataca |
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T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
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|
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25098086 |
ttcctatcattttattcccgaaaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
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13 |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
27213910 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
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|
| T |
27213909 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
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| T |
27419378 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
27419279 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
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|
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27419278 |
tttctatcattttattcccgggaatcagcaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 33378651 - 33378918
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaa--------cattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
203 |
Q |
| |
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tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
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T |
 |
| Q |
204 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagt |
271 |
Q |
| |
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catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38396620 - 38396370
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Q |
| |
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T |
 |
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tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
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ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
38396420 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Original strand, 38544011 - 38544269
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| Q |
13 |
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111 |
Q |
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| T |
38544011 |
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38544110 |
T |
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| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
38544111 |
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38544210 |
T |
 |
| Q |
212 |
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270 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38544211 |
ttcctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaag |
38544269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 48313939 - 48314193
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48313939 |
aatatgtttggttagctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactt |
48314038 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48314039 |
tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttctaacaaacataggcatataca |
48314138 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48314139 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
48314193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 43949062 - 43949315
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43949062 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactt |
43949161 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43949162 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
43949261 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43949262 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
43949315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9814468 - 9814211
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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aatatgtttgattagctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactt |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9814368 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaaca----catataca |
9814273 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagtgt |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9814272 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaagtgt |
9814211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25924891 - 25924637
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25924891 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctctatgggaactt |
25924792 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25924791 |
tattcccacccttttcctggggaaattttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
25924692 |
T |
 |
| Q |
212 |
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266 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25924691 |
tttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacataccc |
25924637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 45448759 - 45449009
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
45448759 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataatagataaactatttatgaatttattcccctctctatgggaactt |
45448858 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
45448859 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatctaca |
45448958 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
262 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45448959 |
ttcctatcattttattcccgagaatcaaaaattataacttgaaacaaacac |
45449009 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16825586 - 16825354
Alignment:
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34 |
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133 |
Q |
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|
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|
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atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
16825487 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
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|
| T |
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aaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctagg |
16825387 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825386 |
aattaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
16825354 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34930721 - 34930466
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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34930622 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaac-aaacataggcatatac |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34930621 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaaacataggcatatac |
34930522 |
T |
 |
| Q |
211 |
attcctatcattttattcccgggaatcaacaattataac-ttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34930521 |
atttctatcattttattcccaggaatcaacaattataactttgaaacaaacacacc |
34930466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41632618 - 41632365
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41632618 |
aatatgtttggttagctttataatattcctatgaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactt |
41632519 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41632518 |
tattcccaccctttttcttgggaaattttttctattcctaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaataaacataggcatataca |
41632419 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41632418 |
tttctatcattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
41632365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28904440 - 28904186
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| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28904440 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
28904341 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28904340 |
tattcccaccctttttcttataaatttttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
28904241 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28904240 |
tttctatcattttattctcgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacaccc |
28904186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48160827 - 48160591
Alignment:
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13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48160827 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
48160728 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
48160727 |
tattcccaccattttcctt-ggaaattttttctcttcccag-----------------gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataca |
48160646 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48160645 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
48160591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 44820071 - 44820323
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13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44820071 |
aatatatttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggactataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
44820170 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
44820171 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctgttccgaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacatgtaacaaacacatacaaataca |
44820270 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44820271 |
tttctatcattttattcctgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
44820323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25045838 - 25045618
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44 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
143 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
25045838 |
gaaccatgaaaatatggattataatatgtaa-ttatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttacgaaaatttttc |
25045740 |
T |
 |
| Q |
144 |
tattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaat |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
25045739 |
tattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatatattcctatcttttta-tccccagaatcaacaaa |
25045641 |
T |
 |
| Q |
244 |
tataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25045640 |
tataacttgaaacaaacacaccc |
25045618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30686245 - 30685993
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13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
30686245 |
aatatgtttggttaactttataatattcctaggaaccataaaaatagcgattataataagtaact-atttatgaatttattcccatctccctaggaactt |
30686147 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
30686146 |
tattcccacctttttccttggaattttttttctattcccatgaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatg |
30686047 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
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|| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
30686046 |
tttttatgattttattccaacgaatctacaattataacttgaaacaaacacacc |
30685993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37534356 - 37534105
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534356 |
aatatgtttggttaactttataatattcttaggaactataataatagggattataataagtaact-atttatgaatttattcacatctccatgggaactt |
37534258 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
37534257 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccataaatattttatacccggaaataaaagttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatg |
37534158 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37534157 |
tttttatgattttatttccaggaatctacaattataacatgaaacaaacacac |
37534105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 266
Target Start/End: Original strand, 18824007 - 18824217
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
18824007 |
atagggattataataggtaa-ttatttatgaatttattcccatctccatgg-aactttattcccacctttttccttgggaaaatttttctattcccaaaa |
18824104 |
T |
 |
| Q |
155 |
acattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca-ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttga |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
18824105 |
acattttatacccgggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatatattttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatacaacttga |
18824204 |
T |
 |
| Q |
254 |
aacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
18824205 |
aacaaacacaccc |
18824217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 275
Target Start/End: Original strand, 11000552 - 11000783
Alignment:
| Q |
44 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
11000552 |
gaaccataaaaatagggattataataggcgacttcat-atgaatttattctcatatgcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaaatttttc |
11000650 |
T |
 |
| Q |
144 |
tattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc-atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
11000651 |
tattcccaagaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggctatatatatttatatcattttatttccaggaatcaacat |
11000750 |
T |
 |
| Q |
243 |
ttataacttgaaacaaacacacccaaagtgtaa |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
11000751 |
atataacttgaaacaaacacaccctaaatgtaa |
11000783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6656724 - 6656476
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6656724 |
aatatgttttgttaactttataatatttctaagaaccaaaaaaatatagattataataggtaact-atttatgactttattcccatctccatgggaactt |
6656626 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
6656625 |
tattcccatatttttcattgggaaaacttttctattcccagaaacattttatactcgaaaat-aaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatata |
6656527 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6656526 |
ttcatatca-tttatttccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca |
6656476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41684275 - 41684022
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41684275 |
aatatgtttggttaattttataatatttataggaaccataaaaatagagattataataggtaact-acatataaatttattttcatctccatgagaactt |
41684177 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
41684176 |
tattcccactcttttctttgggcaaaattttctattcccaagaacatcttatatccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatata |
41684077 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41684076 |
tttctatcatattattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
41684022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 45722967 - 45723170
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || | ||||||||||| |
|
|
| T |
45722967 |
aatatgtttaattaactttataatattcctagaaatcataaaaatatggattataataggtaact-atttatgaatttatttctattttcatgggaactt |
45723065 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
45723066 |
tattcccaccatttttcttgggaaaatttttctattcccaagaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataggcatatata |
45723165 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcct |
216 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
45723166 |
ttcct |
45723170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6656454 - 6656226
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6656454 |
atattcttaggaaccaaaaaaatacagattataataggtaact-atttatgattttattcccatctccatggaaactttatttccaccctttttattggg |
6656356 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
6656355 |
aaaacttttctatttccagaaatattttatactcgaaaataaa-tttagtaaacttataacaaacataggtatatatattcatatcattttatttccaaa |
6656257 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
264 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6656256 |
aatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
6656226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 45440747 - 45440980
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
45440747 |
atattccaagtaaccttaaaactagggattataataggtaa-ttatacatgatttttttcccatctccatgagaactttattcccactactttctttggg |
45440845 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata-cattcctatcattttattcccgg |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45440846 |
aaaatttttatattccgaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgttttttatgattttattcccaa |
45440945 |
T |
 |
| Q |
233 |
gaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45440946 |
gaatctacaattataacttgaaacaaacacaccca |
45440980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43446062 - 43445890
Alignment:
| Q |
87 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaa |
186 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43446062 |
tttattctcatctccatgagaactttattcccaccattttctttgggaaaacttttttattctcatgaacattttatattcgagaataaaatttagtaaa |
43445963 |
T |
 |
| Q |
187 |
cttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
259 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43445962 |
cttataacaaatataggcatatacatttttataattttattcgcaagaatctataaatataacttgaaacaaa |
43445890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31921978 - 31921811
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31921978 |
aatatgtatggttaactttataatatttctaggaaccataaaaatagacattataatagg---actatatatgaatttattctcatctctatgggaactt |
31921882 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
31921881 |
tattcccacccttttctttggaaatttttttctattcccacaaacattttatactcaggaataaaatttag |
31921811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22156401 - 22156248
Alignment:
| Q |
44 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt- |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22156401 |
gaaccataaaaatatggattataatatgtaa-ttacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctacccttttctttgggaaattttttt |
22156303 |
T |
 |
| Q |
143 |
ctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22156302 |
ctattcccaggaacgttttatacgcgggattaaaatttattaaacttgtaacaaa |
22156248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22212316 - 22212163
Alignment:
| Q |
44 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt- |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22212316 |
gaaccataaaaatatggattataatatgtaa-ttacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctacccttttctttgggaaattttttt |
22212218 |
T |
 |
| Q |
143 |
ctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22212217 |
ctattcccaggaacgttttatacgcgggattaaaatttattaaacttgtaacaaa |
22212163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5543354 - 5543167
Alignment:
| Q |
43 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcctt-gggaaattttt |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |
|
|
| T |
5543354 |
ggaaccataaaaatatggattataataggtaa-ttacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcccactatttttctttgggaaaaaatt |
5543256 |
T |
 |
| Q |
142 |
tctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
5543255 |
tctattcccaagaaagttttatacgagagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtatatttatatcgttttattccc |
5543167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40385859 - 40385692
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttt-tccttgg |
132 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
40385859 |
atattcctaagaaccataaaaatatggattataataggtag-ttacacatgagtttatttccatcttaatgggaactttattcccaccatttctttttgg |
40385761 |
T |
 |
| Q |
133 |
gaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
201 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40385760 |
gatattttttctattcccagaaacattttatagacaggaataaaattcagtaaacttctaacaaacata |
40385692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38528920 - 38528764
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taaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcc |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
38528920 |
taaaaatagggattataatatgcaa-ttacacataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcacctttttctttg--atatttattctattcc |
38528824 |
T |
 |
| Q |
150 |
caggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
209 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38528823 |
caataacattttatacccaagaataaaatctagtaaacttgtaacaaacataagcatata |
38528764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47246281 - 47246063
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taaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcc |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || | ||||| |
|
|
| T |
47246281 |
taaaaatagggattataatagatagtttacacatgaatttattctcatattcatgggaactttattctcacccttttcttttaaaaaaaatt-caattcc |
47246183 |
T |
 |
| Q |
150 |
caggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcc--tatcattttattcccgggaatcaacaattata |
247 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| | ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
47246182 |
taagaacattttatacctgagaataaaattcagtaaacttgtaacaaacatagaaatatatatttctatatcattttatttctaagaatctacaaatata |
47246083 |
T |
 |
| Q |
248 |
acttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47246082 |
atttgaaacaaacgcaccca |
47246063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43569937 - 43569773
Alignment:
| Q |
14 |
atatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaacttt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
43569937 |
atatgtttgattaactttataatatttttagaaatcataaaaatagggattataatagataa-ttatttatgaatttatttacatcctcatgtgaatttt |
43569839 |
T |
 |
| Q |
113 |
attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaat |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || || ||||| |||| | | ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43569838 |
attcccaccctttttcttaggtaaatttttatatttcgaagaatattttatacccgggaataaaat |
43569773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10902779 - 10902689
Alignment:
| Q |
137 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10902779 |
ttttttctattcccaaaaacattttatatccaaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttatt |
10902689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Original strand, 45723211 - 45723277
Alignment:
| Q |
199 |
ataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45723211 |
ataggcatatatattcctatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
45723277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 228
Target Start/End: Original strand, 30871130 - 30871221
Alignment:
| Q |
137 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30871130 |
ttttttctattcccacaaacatttgatatccgaaaataaaacttaataaacttgtaacaaacataaaaatgtatatttctatcattttattc |
30871221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 31598623 - 31598742
Alignment:
| Q |
140 |
tttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaa |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
31598623 |
tttctattcc-aggaacgttttataccttgtaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataagcatttgtatttctatcgttttattttcaggaatcta |
31598721 |
T |
 |
| Q |
240 |
caattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31598722 |
tgaatataacttgaaacaaac |
31598742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31921813 - 31921748
Alignment:
| Q |
200 |
taggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31921813 |
taggcatatatatttctatcattttatttccga-aatgaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
31921748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 20601297 - 20601355
Alignment:
| Q |
171 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcc |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20601297 |
aataaaatttaataaatttataacaaacattagaatgtacattcctatcattttattcc |
20601355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Original strand, 19156613 - 19156685
Alignment:
| Q |
191 |
taacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || |||||| |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19156613 |
taacaaacattggaatgtacatttctatcattttattcttgaaaatatacaaatataacttgaaacaaacaca |
19156685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Original strand, 20756012 - 20756084
Alignment:
| Q |
191 |
taacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || |||||| |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20756012 |
taacaaacattggaatgtacatttctatcattttattcttgaaaatatacaaatataacttgaaacaaacaca |
20756084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 2657517 - 2657771
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657517 |
aatatgtttggttaactttataatattcctagtaatcataaaaatatggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
2657616 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2657617 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatataca |
2657716 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657717 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
2657771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 1316836 - 1317090
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1316836 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactt |
1316935 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316936 |
tattcccacccttttccttgggaaatttt-tctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
1317034 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1317035 |
ttccaatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
1317090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7053832 - 7053570
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053832 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
7053733 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatt--------ttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053732 |
tattcccaccattttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg |
7053633 |
T |
 |
| Q |
204 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053632 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
7053570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 16968742 - 16968989
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16968742 |
aatatgtttggttagctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactt |
16968841 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
16968842 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataga |
16968941 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968942 |
ttcctatcattttattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
16968989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 14170832 - 14171084
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14170832 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcc-atctccatgggaactt |
14170930 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14170931 |
tattcccacccttttccttgg-aaattttttctattcccaggaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataga |
14171029 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14171030 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
14171084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 18897738 - 18897989
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897738 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
18897837 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897838 |
tatttccacccttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatataca |
18897937 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897938 |
tttctatcactttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
18897989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7344315 - 7344083
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344315 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
7344216 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7344215 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatatacattcctatcattttattctcgga |
7344116 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7344115 |
aatttacaattataatttgaaacgaacacaccc |
7344083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 8029120 - 8029297
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029120 |
aatatgtttggttggctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
8029219 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaactt |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8029220 |
tattcccacccttttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaactt |
8029297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6705950 - 6705760
Alignment:
| Q |
81 |
tatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaattt |
180 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6705950 |
tatgaaattattctcatctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaaattt |
6705851 |
T |
 |
| Q |
181 |
agtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccaaagt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6705850 |
agtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctaccattttattccaatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccctaagt |
6705760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 346051 - 345833
Alignment:
| Q |
45 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
346051 |
aaccataaaaataggaattttaatagg-aaattactcatgaatttattctcatctccattggaactttattcccacccttttctttgggaaaaattttct |
345953 |
T |
 |
| Q |
145 |
attcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta-ttcccgggaatcaacaat |
243 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
345952 |
attcctaaaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttatttcctaggaatctacgaa |
345853 |
T |
 |
| Q |
244 |
tataacttgaaacaaacaca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
345852 |
tataacttaaaacaaacaca |
345833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10246370 - 10246259
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246370 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
10246271 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccaccct |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
10246270 |
tattcccaccct |
10246259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Original strand, 8029316 - 8029404
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| Q |
178 |
tttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029316 |
tttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
8029404 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10849961 - 10849784
Alignment:
| Q |
89 |
tattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcctt-gggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaac |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
10849961 |
tattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttacacccaggaagaaaagttactaaac |
10849862 |
T |
 |
| Q |
188 |
ttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| | ||| | | |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10849861 |
ttgtaactaatataggaagatataattctatcattttattcccaggaatctataaaaataacttgaaacaaacacacc |
10849784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21008208 - 21008035
Alignment:
| Q |
81 |
tatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaattt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
21008208 |
tatgaatttattcccatctctatgagaactttattcccacctttttgtttga-attttttttctattcccaagaacatttcatgttcgggaataaaattt |
21008110 |
T |
 |
| Q |
181 |
agtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa |
255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21008109 |
agtaaacctgtaacaaatagaggcatatatatttttatcattttattcccagaaatcaacaaatataacttgaaa |
21008035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14781842 - 14781626
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
14781842 |
atattcctgggaaccataaaagtaggatttataataggtaa-ttactcatgaatttattcccatctcct----aactt-----ccacccttttcttttgg |
14781753 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| || | || |
|
|
| T |
14781752 |
aaaaaatttctattcccatgagcattttatacctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtatgtatattcctattgttttaatcgcagg |
14781653 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14781652 |
aatctacgaatataatttgaaacaaac |
14781626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 266
Target Start/End: Original strand, 3869391 - 3869576
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| Q |
80 |
ttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc---ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaa |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3869391 |
ttatgaatttattctcatcttcgtgggaactttattctcaccaccattttctttgggaaaacttttctattccattgaacattttatgcc----aataaa |
3869486 |
T |
 |
| Q |
177 |
atttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||| | ||| | |||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3869487 |
atttaatgaacatttaacaaacgtagtaatacatatttctatcattttattcccagaaatctacaaaaataacttgaaacaaacacaccc |
3869576 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 266
Target Start/End: Original strand, 8314874 - 8314984
Alignment:
| Q |
156 |
cattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa |
255 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314874 |
cattttatatacgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgaatgtatgtttttatgattttattctcatgaatctagaattataacttgaaa |
8314973 |
T |
 |
| Q |
256 |
caaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |
|
|
| T |
8314974 |
caaacataccc |
8314984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9760497 - 9760376
Alignment:
| Q |
139 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || | | | |||||||||||| | || || |
|
|
| T |
9760497 |
ttttctattctcatgaacattttatatcctgaaataaaatttagtaaacttataacaaaaataggcatgtataattcgatcattttattctcaagagtct |
9760398 |
T |
 |
| Q |
239 |
acaattataacttgaaacaaac |
260 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9760397 |
acaaagataacttgaaacaaac |
9760376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10246258 - 10246221
Alignment:
| Q |
230 |
cgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
267 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246258 |
cgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccca |
10246221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 164
Target Start/End: Original strand, 8314741 - 8314864
Alignment:
| Q |
42 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattc-ccatctccatgggaactttattccca-cccttttccttgggaaattt |
139 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| || | |||| || ||||| | |
|
|
| T |
8314741 |
aggaaccttaaaaatagggattataataggt-aattacatttgaatttattctcaatcttcatggaaactttattctcatcattttttttttggaaaaat |
8314839 |
T |
 |
| Q |
140 |
tttctattcccaggaacattttata |
164 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8314840 |
tttctattgccagaaacattttata |
8314864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29206 - 28957
Alignment:
| Q |
13 |
aatatgtttggttagctttata-tattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29206 |
aatatgtttggttagctttataatattcctaggaattataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactt |
29107 |
T |
 |
| Q |
112 |
tattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29106 |
tattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataca |
29007 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29006 |
ttcctatcattttattcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
28957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0702 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:
Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3796 - 3565
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
133 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |
|
|
| T |
3796 |
atattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaa-ttacacataattttattttcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgag |
3698 |
T |
 |
| Q |
134 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
3697 |
aaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattttattcctaga |
3598 |
T |
 |
| Q |
234 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3597 |
aatctacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
3565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0662 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:
Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Original strand, 4306 - 4539
Alignment:
| Q |
34 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaattt-attcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgg |
132 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
4306 |
atattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaattacactattaattttattttcatctccatgggaactttattcccaccattttctttga |
4405 |
T |
 |
| Q |
133 |
gaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgg |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
4406 |
gaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattttattcctag |
4505 |
T |
 |
| Q |
233 |
gaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4506 |
aaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
4539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:
Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23517 - 23297
Alignment:
| Q |
44 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
143 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
23517 |
gaaccttaaaaatagggattataataggtag-ttacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccgttttctttggaaaaaaattta |
23419 |
T |
 |
| Q |
144 |
tattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaat |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||| | | |||| |||| |
|
|
| T |
23418 |
tattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctataattttattctcagaaatctacaaa |
23319 |
T |
 |
| Q |
244 |
tataacttgaaacaaacacacc |
265 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
23318 |
tataatttaaaacaaacgcacc |
23297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1480 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:
Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 556 - 385
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| Q |
95 |
catctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaac |
194 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
556 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttctttgggaatgttatttcattcccaggaacattttatatttaggaataaaatttaataaacttgcaac |
457 |
T |
 |
| Q |
195 |
aaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||| | |||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
456 |
aaacataggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaagataacttgaaacaaacacaccc |
385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0069 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:
Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21961 - 21790
Alignment:
| Q |
95 |
catctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaac |
194 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21961 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttttttgggaatgttatttcatacccaggaacattttatatctaggaataaaatttaataaacttgcaac |
21862 |
T |
 |
| Q |
195 |
aaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||| | |||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21861 |
aaacataggaatgcatatttccatcattctatttcgaggaatttacaaagataacttgaaacaaatacaccc |
21790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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