View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13743_high_15 (Length: 233)

Name: NF13743_high_15
Description: NF13743
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13743_high_15
NF13743_high_15
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (19-233)||(18926-19140)
chr7 (19-233)||(9593369-9593583)
chr7 (20-233)||(11987235-11987449)
chr7 (19-233)||(8917450-8917664)
chr7 (19-232)||(13149179-13149392)
chr7 (19-233)||(13461784-13461999)
chr7 (19-181)||(9644384-9644546)
chr7 (19-233)||(12318150-12318365)
chr7 (19-233)||(11312671-11312886)
chr7 (19-233)||(16724499-16724712)
chr7 (19-233)||(17701513-17701726)
chr7 (19-233)||(15605140-15605356)
chr7 (25-233)||(13635343-13635552)
chr7 (104-233)||(16457310-16457439)
chr7 (19-233)||(15728348-15728562)
chr7 (19-233)||(14216938-14217152)
chr7 (25-233)||(16583279-16583487)
chr7 (19-232)||(6801237-6801449)
chr7 (30-233)||(18556996-18557199)
chr7 (19-233)||(15580714-15580929)
chr7 (20-233)||(35151629-35151843)
chr7 (128-233)||(7519335-7519439)
chr7 (20-233)||(12714887-12715102)
chr7 (20-233)||(12718691-12718906)
chr7 (128-233)||(13918757-13918861)
chr7 (20-233)||(16907069-16907284)
chr7 (20-233)||(18283389-18283604)
chr7 (19-233)||(12704526-12704742)
chr7 (128-233)||(1859063-1859167)
chr7 (20-233)||(16114264-16114479)
chr7 (20-233)||(16117417-16117632)
chr7 (20-233)||(18279426-18279641)
chr7 (19-107)||(16438902-16438990)
chr7 (44-233)||(39722289-39722479)
chr7 (139-233)||(2530378-2530473)
chr7 (20-233)||(26292418-26292633)
chr7 (20-233)||(12723602-12723817)
chr7 (128-233)||(25927480-25927584)
chr7 (19-233)||(70633-70848)
chr7 (19-233)||(74742-74957)
chr7 (128-230)||(18425464-18425562)
chr7 (80-233)||(16275515-16275669)
chr7 (128-233)||(45169988-45170089)
chr7 (19-233)||(33130-33345)
chr7 (185-233)||(2832484-2832532)
chr7 (185-233)||(9751797-9751845)
chr7 (38-155)||(14429995-14430112)
chr7 (19-69)||(48593324-48593374)
chr7 (196-233)||(39267953-39267990)
chr7 (189-233)||(12321788-12321832)
chr7 (189-233)||(14429909-14429953)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (19-233)||(18222246-18222460)
chr4 (22-233)||(17152358-17152568)
chr4 (19-233)||(18228721-18228935)
chr4 (19-233)||(1951629-1951843)
chr4 (19-232)||(26243533-26243746)
chr4 (19-232)||(23139296-23139508)
chr4 (19-233)||(18236915-18237130)
chr4 (19-232)||(16243268-16243481)
chr4 (19-232)||(19757469-19757682)
chr4 (19-232)||(19782124-19782337)
chr4 (19-232)||(2014803-2015016)
chr4 (19-231)||(9530460-9530671)
chr4 (23-233)||(3412822-3413030)
chr4 (19-233)||(36133830-36134045)
chr4 (38-233)||(42997337-42997532)
chr4 (20-233)||(14708502-14708716)
chr4 (20-233)||(28569312-28569526)
chr4 (19-233)||(17810295-17810510)
chr4 (20-233)||(9556553-9556768)
chr4 (21-232)||(45938173-45938383)
chr4 (128-232)||(22634398-22634504)
chr4 (20-233)||(4561202-4561417)
chr4 (128-233)||(43256390-43256494)
chr4 (20-233)||(5756806-5757021)
chr4 (19-233)||(14757290-14757505)
chr4 (20-233)||(33742401-33742615)
chr4 (129-230)||(15224821-15224922)
chr4 (128-233)||(10712876-10712977)
chr4 (128-233)||(10926646-10926747)
chr4 (30-121)||(18602624-18602715)
chr4 (128-233)||(14954149-14954250)
chr4 (128-233)||(25689893-25689994)
chr4 (25-233)||(27534049-27534258)
chr4 (23-109)||(43256033-43256119)
chr4 (128-233)||(12487734-12487835)
chr4 (30-98)||(18609218-18609286)
chr4 (189-233)||(16488124-16488168)
chr4 (185-233)||(20157502-20157550)
chr4 (186-233)||(18602766-18602813)
chr4 (196-233)||(13813072-13813109)
chr4 (188-233)||(18609340-18609385)
chr4 (189-233)||(25555506-25555550)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (19-233)||(18228-18442)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (19-233)||(16231343-16231557)
chr8 (19-233)||(22044908-22045122)
chr8 (19-233)||(23834196-23834411)
chr8 (19-175)||(18619560-18619716)
chr8 (19-233)||(30308622-30308835)
chr8 (19-232)||(23846883-23847096)
chr8 (21-232)||(15538473-15538684)
chr8 (19-167)||(22028647-22028795)
chr8 (21-232)||(15531914-15532124)
chr8 (25-232)||(17828457-17828663)
chr8 (20-233)||(32605234-32605448)
chr8 (67-233)||(32598702-32598868)
chr8 (20-233)||(19278151-19278366)
chr8 (20-233)||(21972453-21972668)
chr8 (20-233)||(21976538-21976753)
chr8 (44-233)||(43251836-43252026)
chr8 (128-233)||(14398086-14398190)
chr8 (145-233)||(21387097-21387184)
chr8 (141-233)||(21383677-21383768)
chr8 (20-185)||(22111924-22112089)
chr8 (128-233)||(18862627-18862728)
chr8 (128-233)||(21827996-21828097)
chr8 (156-232)||(24445511-24445587)
chr8 (132-233)||(21410973-21411070)
chr8 (132-233)||(21805465-21805562)
chr8 (20-233)||(17055257-17055461)
chr8 (20-121)||(22113596-22113697)
chr8 (20-121)||(22135099-22135200)
chr8 (189-233)||(30643338-30643382)
chr8 (20-121)||(22166249-22166350)
chr8 (21-75)||(24434107-24434161)
chr8 (185-233)||(15603059-15603107)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (19-233)||(42805444-42805658)
chr5 (19-233)||(26742614-26742828)
chr5 (19-233)||(18774227-18774442)
chr5 (19-233)||(18784070-18784285)
chr5 (19-232)||(33409253-33409466)
chr5 (19-231)||(20232577-20232788)
chr5 (19-233)||(26665999-26666212)
chr5 (19-233)||(26937596-26937809)
chr5 (19-232)||(16674177-16674390)
chr5 (19-233)||(21340635-21340848)
chr5 (23-232)||(17718311-17718520)
chr5 (19-233)||(24532916-24533129)
chr5 (19-233)||(25229274-25229488)
chr5 (19-233)||(25293430-25293644)
chr5 (19-233)||(23535457-23535670)
chr5 (19-233)||(4036243-4036458)
chr5 (20-233)||(21885057-21885271)
chr5 (20-233)||(26172488-26172702)
chr5 (20-233)||(20295870-20296085)
chr5 (128-233)||(20911148-20911252)
chr5 (20-233)||(19472588-19472803)
chr5 (128-233)||(18355981-18356085)
chr5 (83-230)||(10752970-10753118)
chr5 (128-233)||(17410463-17410570)
chr5 (128-233)||(10753387-10753488)
chr5 (71-233)||(15236700-15236863)
chr5 (23-109)||(18356475-18356561)
chr5 (185-231)||(24767588-24767634)
chr5 (19-59)||(17410645-17410685)
chr5 (189-233)||(21366711-21366755)
chr5 (31-109)||(20910680-20910758)
chr5 (38-155)||(21366552-21366669)
chr5 (189-233)||(123352-123396)
chr5 (189-233)||(12028612-12028656)
chr5 (189-233)||(17919198-17919242)
chr5 (189-233)||(20767000-20767044)
chr5 (189-233)||(26680608-26680652)
chr5 (189-233)||(26952215-26952259)
chr5 (189-233)||(31342173-31342217)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (19-233)||(3398-3612)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (19-233)||(19211891-19212105)
chr1 (19-233)||(23819167-23819381)
chr1 (19-231)||(18882393-18882605)
chr1 (19-230)||(46975494-46975705)
chr1 (19-233)||(12646895-12647107)
chr1 (22-233)||(20138107-20138318)
chr1 (19-233)||(36819176-36819392)
chr1 (19-233)||(16080312-16080527)
chr1 (19-233)||(24782968-24783183)
chr1 (20-233)||(20228677-20228892)
chr1 (19-233)||(1010746-1010961)
chr1 (20-233)||(16375326-16375541)
chr1 (20-233)||(21407378-21407593)
chr1 (138-233)||(33797306-33797400)
chr1 (20-233)||(52639564-52639779)
chr1 (83-230)||(20229161-20229309)
chr1 (128-233)||(1925111-1925212)
chr1 (128-233)||(20924125-20924226)
chr1 (128-230)||(39244123-39244221)
chr1 (128-230)||(39247678-39247776)
chr1 (128-230)||(41388223-41388321)
chr1 (23-109)||(33797681-33797767)
chr1 (189-233)||(3472969-3473013)
chr1 (189-233)||(18182167-18182211)
chr1 (19-95)||(18393831-18393907)
chr1 (184-233)||(22449307-22449356)
chr1 (189-233)||(3705111-3705155)
chr1 (189-233)||(18394012-18394056)
chr1 (189-233)||(33050072-33050116)
chr1 (19-95)||(45310234-45310310)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (26-233)||(12706713-12706920)
chr6 (19-232)||(16741231-16741444)
chr6 (19-233)||(5616682-5616897)
chr6 (19-232)||(9482161-9482374)
chr6 (19-233)||(2685187-2685400)
chr6 (19-233)||(17804220-17804435)
chr6 (19-233)||(19662794-19663006)
chr6 (19-232)||(22592672-22592884)
chr6 (19-232)||(12496333-12496546)
chr6 (19-233)||(25767036-25767251)
chr6 (19-233)||(1587599-1587813)
chr6 (19-233)||(20803421-20803636)
chr6 (19-233)||(22429898-22430113)
chr6 (44-233)||(1644728-1644918)
chr6 (20-233)||(11566885-11567100)
chr6 (20-233)||(23395091-23395306)
chr6 (128-233)||(23414669-23414773)
chr6 (128-233)||(27556427-27556531)
chr6 (20-233)||(21702311-21702525)
chr6 (20-233)||(23989943-23990158)
chr6 (44-233)||(8243884-8244074)
chr6 (19-233)||(14472294-14472508)
chr6 (19-233)||(18955631-18955846)
chr6 (20-233)||(19870613-19870828)
chr6 (19-233)||(22862969-22863184)
chr6 (44-233)||(18917159-18917349)
chr6 (20-233)||(12618713-12618927)
chr6 (83-230)||(31478162-31478310)
chr6 (129-230)||(1644314-1644415)
chr6 (128-230)||(16624158-16624256)
chr6 (128-233)||(31477792-31477893)
chr6 (128-230)||(16760321-16760419)
chr6 (128-233)||(22949131-22949232)
chr6 (128-233)||(22953087-22953188)
chr6 (128-233)||(23871575-23871676)
chr6 (128-233)||(23875531-23875632)
chr6 (23-109)||(27415814-27415900)
chr6 (38-233)||(25135559-25135754)
chr6 (138-233)||(27416181-27416269)
chr6 (189-233)||(16523430-16523474)
chr6 (185-233)||(27325653-27325701)
chr6 (189-233)||(18907137-18907181)
chr6 (189-233)||(19790826-19790870)
chr6 (189-233)||(20908028-20908072)
chr6 (189-233)||(23657468-23657512)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (19-233)||(24836-25051)
scaffold0012 (128-233)||(189359-189460)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (19-233)||(19885-20099)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (19-233)||(228241-228455)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (19-233)||(16797922-16798136)
chr3 (19-233)||(16808749-16808963)
chr3 (19-233)||(17241997-17242210)
chr3 (19-232)||(3833699-3833912)
chr3 (19-232)||(38814409-38814622)
chr3 (19-233)||(20461368-20461583)
chr3 (30-233)||(15482686-15482890)
chr3 (19-233)||(7793217-7793433)
chr3 (21-233)||(327034-327248)
chr3 (24-233)||(15849958-15850165)
chr3 (19-233)||(31097422-31097638)
chr3 (21-232)||(15941774-15941985)
chr3 (24-233)||(2897696-2897906)
chr3 (20-233)||(15617400-15617615)
chr3 (21-232)||(1598350-1598560)
chr3 (20-233)||(7109724-7109939)
chr3 (20-233)||(7113659-7113874)
chr3 (128-233)||(15464889-15464993)
chr3 (20-233)||(22321690-22321905)
chr3 (20-233)||(22336745-22336960)
chr3 (20-233)||(27409512-27409727)
chr3 (20-233)||(28949750-28949965)
chr3 (19-233)||(30065972-30066187)
chr3 (138-233)||(8489459-8489553)
chr3 (128-233)||(5223088-5223192)
chr3 (19-233)||(11854759-11854974)
chr3 (62-233)||(16696809-16696980)
chr3 (83-230)||(4589125-4589273)
chr3 (126-233)||(11854441-11854547)
chr3 (19-233)||(11070094-11070309)
chr3 (19-233)||(11165397-11165612)
chr3 (128-233)||(12339490-12339594)
chr3 (19-233)||(55022893-55023108)
chr3 (128-230)||(16750570-16750668)
chr3 (83-230)||(19775374-19775522)
chr3 (128-233)||(11300743-11300847)
chr3 (128-233)||(4111231-4111332)
chr3 (128-233)||(15964995-15965096)
chr3 (128-233)||(15968919-15969020)
chr3 (128-233)||(15972843-15972944)
chr3 (128-233)||(19775791-19775892)
chr3 (19-175)||(11300379-11300534)
chr3 (132-233)||(4107383-4107480)
chr3 (128-233)||(37439618-37439719)
chr3 (26-233)||(14499351-14499559)
chr3 (19-95)||(16865001-16865077)
chr3 (185-233)||(14668583-14668631)
chr3 (185-233)||(19725953-19726001)
chr3 (19-95)||(3389803-3389879)
chr3 (189-233)||(3403003-3403047)
chr3 (189-233)||(12172822-12172866)
chr3 (185-233)||(14665427-14665475)
chr3 (189-233)||(18383962-18384006)
chr3 (190-233)||(11862819-11862862)
chr3 (38-155)||(322704-322821)
chr3 (189-233)||(322618-322662)
chr3 (189-233)||(1982857-1982901)
chr3 (189-233)||(3389983-3390027)
chr3 (189-233)||(11557431-11557475)
chr3 (189-233)||(11595186-11595230)
chr3 (189-233)||(12496283-12496327)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (19-233)||(6125-6339)
scaffold0546 (38-233)||(1923-2118)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (19-233)||(6968-7182)
scaffold0109 (38-233)||(11189-11384)
scaffold0109 (44-233)||(35836-36025)
scaffold0109 (38-233)||(38706-38901)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (19-233)||(173315-173528)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (19-232)||(9928-10141)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (23-185)||(1-163)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (19-233)||(23240-23454)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (19-232)||(63878-64091)
scaffold0042 (19-232)||(75762-75975)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (19-232)||(19928370-19928583)
chr2 (19-232)||(18855329-18855541)
chr2 (19-233)||(22461058-22461270)
chr2 (20-233)||(24735426-24735640)
chr2 (19-233)||(23187099-23187313)
chr2 (19-233)||(23598362-23598576)
chr2 (19-177)||(19688624-19688781)
chr2 (19-233)||(27263296-27263511)
chr2 (19-233)||(60840-61053)
chr2 (20-233)||(41666973-41667187)
chr2 (19-233)||(10101513-10101728)
chr2 (20-233)||(41530878-41531087)
chr2 (20-233)||(27379301-27379516)
chr2 (20-233)||(27383347-27383562)
chr2 (20-233)||(27601819-27602034)
chr2 (44-233)||(24649380-24649570)
chr2 (20-233)||(12901380-12901595)
chr2 (128-233)||(31344901-31345005)
chr2 (20-233)||(24628347-24628562)
chr2 (20-233)||(26125232-26125441)
chr2 (128-233)||(30344973-30345074)
chr2 (128-233)||(1283412-1283513)
chr2 (20-150)||(15477711-15477841)
chr2 (189-233)||(22811958-22812002)
chr2 (189-233)||(24174826-24174870)
chr2 (189-233)||(24869906-24869950)
chr2 (128-176)||(25961510-25961558)
chr2 (189-233)||(25961581-25961625)
chr2 (185-233)||(37524701-37524749)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (19-232)||(18379-18592)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (19-233)||(9533-9748)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (19-233)||(66283-66498)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (19-233)||(53588-53803)
scaffold0031 (128-233)||(36068-36169)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (19-233)||(18500-18715)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (19-232)||(9445-9658)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (19-232)||(139736-139948)
scaffold0003 (23-109)||(71461-71547)
scaffold0003 (138-233)||(71092-71180)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (20-232)||(36331-36542)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (19-233)||(12927-13142)
scaffold0044 (19-233)||(19211-19426)
scaffold0044 (20-233)||(62284-62498)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (19-233)||(2541-2755)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (19-233)||(5868-6082)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (20-233)||(77039-77253)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (20-233)||(65396-65611)
scaffold0029 (44-233)||(61505-61695)
scaffold0029 (19-233)||(80738-80950)
scaffold0029 (83-230)||(80321-80469)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (20-233)||(1900-2114)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (23-233)||(392-587)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (19-233)||(3743-3958)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (20-233)||(58587-58802)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (44-233)||(4994-5184)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (19-155)||(10452-10587)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (20-233)||(9358-9572)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (19-231)||(13355-13568)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (20-233)||(8523-8737)
scaffold0111 (80-233)||(15667-15821)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (20-231)||(15363-15575)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (128-233)||(6704-6808)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (128-233)||(30908-31012)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (166-233)||(20479-20546)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (20-233)||(16531-16745)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (19-233)||(12445-12660)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (128-233)||(11483-11584)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (128-233)||(14069-14170)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (129-230)||(80754-80855)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (128-233)||(473-575)
scaffold0676 (189-233)||(4456-4500)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (128-214)||(439-521)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (128-233)||(32642-32743)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (44-153)||(901-1009)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (128-233)||(185-300)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (185-233)||(207883-207931)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (185-231)||(2933-2979)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (185-231)||(10085-10131)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (189-233)||(419-463)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (189-233)||(6355-6399)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (189-233)||(2131-2175)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (189-233)||(5612-5656)
scaffold0476 (189-233)||(6807-6851)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (189-233)||(2194-2238)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (38-233)||(1520-1723)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (185-233)||(17154-17202)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (189-233)||(42653-42697)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (189-233)||(73813-73857)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (23-109)||(15290-15375)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (189-233)||(8586-8630)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (189-233)||(7497-7541)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (189-233)||(15113-15157)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (189-233)||(315-359)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (189-233)||(35558-35602)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (185-233)||(9539-9587)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 18926 - 19140
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18926 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggat 19025  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19026 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 19125  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  19126 aactaagttgcatga 19140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9593583 - 9593369
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9593583 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggat 9593484  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9593483 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 9593384  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  9593383 aactaagttgcatga 9593369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11987449 - 11987235
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaa-gatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  11987449 gaaaggaaccttaggtactagtgagacctattaaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggat 11987350  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11987349 tgattgcatttacttgatttattattgaatgatcaagaaactgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 11987250  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  11987249 aactaagttgcatga 11987235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8917664 - 8917450
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  8917664 ggaaaggaactttgggtgctaatgagacctattaaagatattgaccgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggat 8917565  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  8917564 tgattgcatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgttgcaattgttatta 8917465  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  8917464 aactaagttgcatga 8917450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13149392 - 13149179
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  13149392 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 13149293  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149292 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 13149193  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  13149192 aactaagttgcatg 13149179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13461999 - 13461784
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaa-tcatgga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| | |||||    
T  13461999 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatgttgactgagaactctgaagcttttatgaattgttaattgattatgaagtgaaattatgga 13461900  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13461899 ttgattgtttttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgtaatt 13461800  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||| ||||||||    
T  13461799 aaactaatttgcatga 13461784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9644546 - 9644384
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9644546 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggat 9644447  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgatta 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9644446 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12318365 - 12318150
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | || |||    
T  12318365 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgat 12318266  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  12318265 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgattaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 12318167  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  12318166 ttaactaagttgcatga 12318150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11312886 - 11312671
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  11312886 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 11312787  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  11312786 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 11312688  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  11312687 ttaactaagttgcatga 11312671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 16724499 - 16724712
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  16724499 ggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggat 16724597  T
Q  119 tg-attgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16724598 tgaattatatttatttgaattattgttgaatgatcaa-gaactattgagaatgacttgttatttaacctgatgtgatttcattatgctgcaattgttatt 16724696  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  16724697 aaactaagttgcatga 16724712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 17701513 - 17701726
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  17701513 ggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggat 17701611  T
Q  119 tg-attgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17701612 tgaattatatttatttgaattattgttgaatgatcaa-gaactattgagaatgacttgttatttaacctgatgtgatttcattatgctgcaattgttatt 17701710  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  17701711 aaactaagttgcatga 17701726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 15605140 - 15605356
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | || |||    
T  15605140 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgat 15605239  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaa-ttgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtta 215  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  15605240 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 15605338  T
Q  216 tttaactaagttgcatga 233  Q
     ||||||||  |||||||    
T  15605339 attaactaaaatgcatga 15605356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Original strand, 13635343 - 13635552
Alignment:
Q  25 gaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattg 124  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||||||||    
T  13635343 gaaccttaggtactaatgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 13635442  T
Q  125 tatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 222  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  13635443 catt-acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 13635541  T
Q  223 aagttgcatga 233  Q
    |||||||||||    
T  13635542 aagttgcatga 13635552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Original strand, 16457310 - 16457439
Alignment:
Q  104 aagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatg 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16457310 aagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatg 16457409  T
Q  204 ctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16457410 ctgcaattgttattaaactatgttgcatga 16457439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15728562 - 15728348
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  15728562 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggat 15728464  T
Q  119 tgat-tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||  | || || ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15728463 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 15728364  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  15728363 aaactaagttgcatga 15728348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14217152 - 14216938
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||||    
T  14217152 ggaaaggaactgtaggtgctaatgagacctaataatgatattgactaagaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgagttatggat 14217054  T
Q  119 tgat-tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||  | || || ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14217053 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 14216954  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  14216953 gaactaagttgcatga 14216938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16583487 - 16583279
Alignment:
Q  25 gaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattg 124  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||||||||    
T  16583487 gaaccttaggtactaatgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttat-gattgattg 16583389  T
Q  125 tatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 222  Q
     | |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  16583388 ca-ttacttgaattattgttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 16583290  T
Q  223 aagttgcatga 233  Q
    | |||||||||    
T  16583289 acgttgcatga 16583279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6801449 - 6801237
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaa-tcatgga 117  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||| ||||||| | |||||    
T  6801449 ggaaaggaactt-aggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattatgga 6801351  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||||||   |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6801350 ttgattgcccttacttgaattattgttaattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacatgatttgattatgctgcaattgttatt 6801252  T
Q  218 taactaagttgcatg 232  Q
     ||||| ||||||||    
T  6801251 aaactatgttgcatg 6801237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18557199 - 18556996
Alignment:
Q  30 ttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgatt-gtatt 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||  || ||||| |||  |||||| |||||    
T  18557199 ttaggtgctagtgagacctattaaagatattatctgagaactgtgaagcctt-atgagttgttaagtgattaagaaatgaattatgatttgatttgtatt 18557101  T
Q  129 tacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttg 228  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || | |||| ||||| |||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18557100 tacttgaattattgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgctattgaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttg 18557001  T
Q  229 catga 233  Q
    |||||    
T  18557000 catga 18556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15580929 - 15580714
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||  ||    
T  15580929 ggaatggaactttaggttatagtgagacctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaat 15580830  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| |  |||||    
T  15580829 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgataaaaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttat 15580731  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  15580730 ttaactaagttgcatga 15580714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35151843 - 35151629
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  35151843 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagatactgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 35151745  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||| |  | ||||  |||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35151744 tgaattatacttgcttgaattattgttgaatgatgaagaagctattgagtatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 35151645  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  35151644 taactaagttgcatga 35151629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 7519335 - 7519439
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7519335 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 7519433  T
Q  228 gcatga 233  Q
    | ||||    
T  7519434 ggatga 7519439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12715102 - 12714887
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  12715102 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 12715003  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  12715002 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 12714904  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12714903 ttaactaagttacatga 12714887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12718906 - 12718691
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  12718906 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 12718807  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  12718806 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 12718708  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12718707 ttaactaagttacatga 12718691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 13918757 - 13918861
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13918757 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 13918855  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  13918856 gcatga 13918861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 16907069 - 16907284
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  16907069 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 16907168  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  16907169 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 16907267  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16907268 ttaactaagttacatga 16907284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18283604 - 18283389
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  18283604 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 18283505  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  18283504 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 18283406  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18283405 ttaactaagttacatga 18283389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 12704526 - 12704742
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatgga 117  Q
    |||| |||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||    
T  12704526 ggaatggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattga 12704625  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgtta 215  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||  |||| | || |||||||||||| | |||||    
T  12704626 ttgaatgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgtta 12704724  T
Q  216 tttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||| |||||    
T  12704725 tttaactaagttacatga 12704742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 1859063 - 1859167
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1859063 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttattaagcttgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 1859161  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  1859162 gcatga 1859167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16114479 - 16114264
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  16114479 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 16114380  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  | |||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  16114379 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 16114281  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16114280 ttaactaagttacatga 16114264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16117632 - 16117417
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  16117632 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 16117533  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  | |||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  16117532 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 16117434  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16117433 ttaactaagttacatga 16117417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18279641 - 18279426
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  18279641 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 18279542  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||   ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  18279541 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttat 18279443  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18279442 ttaactaagttacatga 18279426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 16438902 - 16438990
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16438902 ggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattaaagatatggactgagaactgtgaagcttatatgaaatgttaagtgattatgaagt 16438990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39722479 - 39722289
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    |||||||||||||||  || || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  39722479 gacctattaaagataaggattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcatt-acttgaattattat 39722381  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39722380 tgaatgatcaggaagttgttgaaaatgagttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 39722289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Original strand, 2530378 - 2530473
Alignment:
Q  139 attattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatg-tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2530378 attatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgattatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 2530473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26292633 - 26292418
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  26292633 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgacttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 26292534  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaa-ttgttgaaaatgaattgtgattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgtta 215  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||| | || |||||||||||| | |||||    
T  26292533 tgattgcattaa-ttgaattattattgaatgat-aaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgtta 26292436  T
Q  216 tttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26292435 tttaactaagttgcatga 26292418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12723817 - 12723602
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  12723817 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 12723718  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||  | ||||||    
T  12723717 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaataaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttat 12723619  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12723618 ttaactaagttacatga 12723602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 25927480 - 25927584
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25927480 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatttttattaagtttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 25927578  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  25927579 gcatga 25927584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 70633 - 70848
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  70633 ggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 70732  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||  | ||||||    
T  70733 tgattgcatt-acttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttat 70831  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  70832 ttaactaagttgcatga 70848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 74742 - 74957
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  74742 ggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 74841  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||  | ||||||    
T  74842 tgattgcatt-acttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttat 74940  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  74941 ttaactaagttgcatga 74957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18425562 - 18425464
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18425562 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 18425467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16275669 - 16275515
Alignment:
Q  80 tttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgat-tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtga 178  Q
    |||||||  |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||  | || || |||||| | || ||||||||||||| || | ||||  |||| |||| |    
T  16275669 tttatgagttgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaactgttgttgaatgatcaagaaactattgagtatgatttgtta 16275570  T
Q  179 ttaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16275569 tttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 45169988 - 45170089
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  45169988 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 45170083  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  45170084 gcatga 45170089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33345 - 33130
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  33345 ggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 33246  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| || |  ||||||||||  | ||||||    
T  33245 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttat 33147  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||    
T  33146 ttaactcagttgcatga 33130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 2832484 - 2832532
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2832484 ttgatgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2832532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 9751797 - 9751845
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9751797 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 9751845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14430112 - 14429995
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||| |||| | |  |||| |||| ||| |||||||    
T  14430112 taatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaa 14430014  T
Q  137 ttattattgaatgatcaag 155  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14430013 atattattgaatgatcaag 14429995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 48593324 - 48593374
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaa 69  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  48593324 ggaaaggaactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaa 48593374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 39267953 - 39267990
Alignment:
Q  196 tgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39267953 tgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 39267990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 12321788 - 12321832
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  12321788 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatga 12321832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14429953 - 14429909
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  14429953 tgtgatctgattatgcggctattgttatttaactaagttgcatga 14429909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 18222246 - 18222460
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18222246 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggat 18222345  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18222346 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 18222445  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  18222446 aactaagttgcatga 18222460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 17152358 - 17152568
Alignment:
Q  22 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17152358 aaggaactttaggtgttaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga 17152457  T
Q  122 ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17152458 ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttg-aaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaac 17152556  T
Q  222 taagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||    
T  17152557 taagttgcatga 17152568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 18228721 - 18228935
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18228721 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggat 18228820  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18228821 tgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttggaaatgaattgttatgaagcttgatgtgatttgattatgctgcaatttttattt 18228920  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  18228921 aactaagttgcatga 18228935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 1951629 - 1951843
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1951629 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggat 1951728  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1951729 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 1951828  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  1951829 aactaagttgcatga 1951843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 26243533 - 26243746
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||  |||||     
T  26243533 ggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggaa 26243632  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26243633 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 26243732  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  26243733 aactaagttgcatg 26243746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23139508 - 23139296
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23139508 ggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 23139409  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||    ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139408 tgattgcccatacttgaattattgttaattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 23139310  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  23139309 aactaagttgcatg 23139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18237130 - 18236915
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagctttt-atgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatgga 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  18237130 ggaaaggaactttaggtgcaaataagacctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatgga 18237031  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18237030 ttgattgtatttacttgaattattgttgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 18236931  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  18236930 taactaagttgcatga 18236915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 16243268 - 16243481
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || | | || ||||  ||||||    
T  16243268 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattgtgaaatgaaatatggat 16243367  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16243368 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 16243467  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  16243468 aactaagttgcatg 16243481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 19757469 - 19757682
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  19757469 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 19757568  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757569 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 19757668  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  19757669 aactaagttgcatg 19757682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19782337 - 19782124
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  19782337 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 19782238  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19782237 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 19782138  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  19782137 aactaagttgcatg 19782124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2015016 - 2014803
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||| || ||||  ||||||    
T  2015016 ggaaatgaactttaggtactaaggtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagaaattatgaaatgaaatatggat 2014917  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2014916 tgattgcctttacttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 2014817  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  2014816 aactaagttgcatg 2014803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9530671 - 9530460
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  || ||||  |||||     
T  9530671 ggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagataatgaccgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattaggaaatgaaatatggag 9530572  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  |||||| |||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9530571 tgattgcctttactcgaattattgttaattgatcaa-gaattgttgagaatgatttattattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtcattt 9530473  T
Q  219 aactaagttgcat 231  Q
    |||||||||||||    
T  9530472 aactaagttgcat 9530460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3413030 - 3412822
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga- 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  3413030 aggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattga-tgagaactgtgaagcttt-atgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaa 3412933  T
Q  122 ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaac 221  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  3412932 ttatattta-ttgaattattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaac 3412834  T
Q  222 taagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||    
T  3412833 taagttgcatga 3412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 36133830 - 36134045
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  36133830 ggaaagaaactttaggtattaatgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 36133929  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| |  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  36133930 tgattgca-ttacttgagttattattgaatgatcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 36134028  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  36134029 ttaactaagttgcatga 36134045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Original strand, 42997337 - 42997532
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  42997337 taatgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaa 42997435  T
Q  137 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    || || || |||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42997436 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatga 42997532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 14708502 - 14708716
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  14708502 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagatactgatcatgaactgtgaagcttt-atgagttgttaaatgattatgaagtgaattatggat 14708600  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14708601 tgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatctaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 14708700  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  14708701 taactaagttgcatga 14708716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 28569312 - 28569526
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||    
T  28569312 gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggat 28569410  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || | ||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28569411 tgaattatactcacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 28569510  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  28569511 taactaagttgcatga 28569526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17810510 - 17810295
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||||||||||  ||||| |||| | || |||    
T  17810510 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgatttattgat 17810411  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  17810410 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 17810312  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  17810311 ttaactaagttgcatga 17810295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9556768 - 9556553
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  9556768 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 9556669  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  9556668 tgattgcatt-acttgaattagtattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 9556570  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  9556569 ttaactaagttgcatga 9556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45938383 - 45938173
Alignment:
Q  21 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatata-aagtgaatcatggatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||  ||  || ||||  |||||||    
T  45938383 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattagaaatgatgactatgaactgtgaagattttacgaactgttaagagataattgaaatgaaatatggatt 45938284  T
Q  120 -gattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
     |||||  || |||||| ||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45938283 tgattgcctt-acttga-ttattgttaattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 45938187  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||| ||||||    
T  45938186 aactaagatgcatg 45938173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 232
Target Start/End: Original strand, 22634398 - 22634504
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  22634398 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 22634497  T
Q  226 ttgcatg 232  Q
    |||||||    
T  22634498 ttgcatg 22634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 4561202 - 4561417
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  4561202 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 4561301  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||  | ||||||    
T  4561302 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaataaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttat 4561400  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  4561401 ttaactaagttgcatga 4561417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 43256390 - 43256494
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43256390 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagtt 43256488  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  43256489 gcatga 43256494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 5756806 - 5757021
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  5756806 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 5756905  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||   ||||| | || |||||||||||  | ||||||    
T  5756906 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttat 5757004  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  5757005 ttaactaagttacatga 5757021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 14757290 - 14757505
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  14757290 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 14757389  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| |||||||||||  | ||||||    
T  14757390 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttat 14757488  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  14757489 ttaactaagttgcatga 14757505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33742615 - 33742401
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||| | |||| | || |||    
T  33742615 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgat 33742516  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  || ||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  33742515 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 33742418  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  33742417 ttaactaagttacatga 33742401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15224922 - 15224821
Alignment:
Q  129 tacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttg 228  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15224922 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 15224823  T
Q  229 ca 230  Q
    ||    
T  15224822 ca 15224821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10712977 - 10712876
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  10712977 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 10712882  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  10712881 gcatga 10712876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10926747 - 10926646
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  10926747 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 10926652  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  10926651 gcatga 10926646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 121
Target Start/End: Original strand, 18602624 - 18602715
Alignment:
Q  30 ttaggtgctaatgagacctattaaaga-tactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga 121  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  18602624 ttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagc-tttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 18602715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 14954149 - 14954250
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  14954149 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaataaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 14954244  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  14954245 gcatga 14954250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25689994 - 25689893
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  25689994 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaataaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 25689899  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  25689898 gcatga 25689893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27534258 - 27534049
Alignment:
Q  25 gaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattg 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||  | ||||  || ||||||||| |  ||||||| |||||   ||||| |||| | || |||||||||    
T  27534258 gaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattg 27534159  T
Q  125 tatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 222  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||||||||  | ||||||| ||||    
T  27534158 catt-acttgaatcattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaact 27534060  T
Q  223 aagttgcatga 233  Q
    |||||||||||    
T  27534059 aagttgcatga 27534049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Original strand, 43256033 - 43256119
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtga 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43256033 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 43256119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12487835 - 12487734
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  12487835 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaataaattgttattaagcttgacatgaattgattatgctgtaattgttgttaaactaagtt 12487740  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  12487739 gcatga 12487734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Original strand, 18609218 - 18609286
Alignment:
Q  30 ttaggtgctaatgagacctattaaaga-tactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtga 98  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18609218 ttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagc-tttatgaattgttaagtga 18609286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 16488124 - 16488168
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16488124 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16488168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 20157502 - 20157550
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  20157502 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatga 20157550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Original strand, 18602766 - 18602813
Alignment:
Q  186 tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  18602766 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatga 18602813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 13813072 - 13813109
Alignment:
Q  196 tgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13813072 tgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 13813109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 18609340 - 18609385
Alignment:
Q  188 atgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  18609340 atgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatga 18609385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25555550 - 25555506
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25555550 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 25555506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 18228 - 18442
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18228 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggat 18327  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18328 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 18427  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  18428 aactaagttgcatga 18442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 16231343 - 16231557
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16231343 ggaaagggactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggat 16231442  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16231443 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 16231542  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  16231543 aactaagttgcatga 16231557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22045122 - 22044908
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22045122 ggaaatgaactttagatactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatggat 22045023  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||      
T  22045022 tgattgcatttacttgaattattatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatca 22044923  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  22044922 aactaagttgcatga 22044908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23834411 - 23834196
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatc-atgga 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  |||||    
T  23834411 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttatgga 23834312  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  23834311 ctgattgtatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgactatgatgcaattgttatt 23834212  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     ||||| |||||||||    
T  23834211 aaactatgttgcatga 23834196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18619716 - 18619560
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18619716 ggaaaggaaccttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggat 18619617  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattg 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18619616 tgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattg 18619560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 30308622 - 30308835
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  30308622 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggat 30308721  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||| |||||||     
T  30308722 tgattgta-ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaatctgatgggatttgattatgttgcaattgttatta 30308820  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||    
T  30308821 aactaatttgcatga 30308835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 23846883 - 23847096
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  23846883 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 23846982  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23846983 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 23847082  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  23847083 aactaagttgcatg 23847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15538684 - 15538473
Alignment:
Q  21 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||  || || ||||  ||||||||    
T  15538684 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaacagtgaagattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggattg 15538585  T
Q  121 attgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaa 220  Q
    ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15538584 attgcctttacttgagttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaa 15538485  T
Q  221 ctaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||    
T  15538484 ctaagttgcatg 15538473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22028795 - 22028647
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22028795 ggaaaggaactttaagtactaatgagacctattgaagatattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggat 22028696  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaa 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22028695 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15532124 - 15531914
Alignment:
Q  21 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||| ||  || || ||||  ||||||||    
T  15532124 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaactatgaagattttat-aactgttaagggataatgaaatgaaatatggattg 15532026  T
Q  121 attgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaa 220  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532025 attgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaa 15531926  T
Q  221 ctaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||    
T  15531925 ctaagttgcatg 15531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 17828457 - 17828663
Alignment:
Q  25 gaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggatt-gatt 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||  || || ||||  ||||||| ||||    
T  17828457 gaactttaggtgctaacgagacctattagagataatgactgtgaactgtgaagattttatgatttgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgatt 17828556  T
Q  124 gtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 223  Q
    || ||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17828557 gtctttacttga-ttattgttaattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaacta 17828654  T
Q  224 agttgcatg 232  Q
    |||||||||    
T  17828655 agttgcatg 17828663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32605448 - 32605234
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  32605448 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 32605350  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32605349 tgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatt 32605250  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  32605249 taactaagttgcatga 32605234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32598868 - 32598702
Alignment:
Q  67 gaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttga 165  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | ||||    
T  32598868 gaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32598770  T
Q  166 aaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
     ||||| |||| |||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32598769 gaatgatttgttatttgacttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 32598702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 19278151 - 19278366
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  19278151 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 19278250  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  19278251 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 19278349  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  19278350 ttaactaagttacatga 19278366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 21972453 - 21972668
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  21972453 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 21972552  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  21972553 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 21972651  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21972652 ttaactaagttacatga 21972668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 21976538 - 21976753
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  21976538 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 21976637  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  21976638 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 21976736  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21976737 ttaactaagttacatga 21976753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43252026 - 43251836
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43252026 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattat 43251928  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  43251927 tgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 43251836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 14398086 - 14398190
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14398086 ttactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaa-tgaattgttattaagctttatgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 14398184  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  14398185 gcatga 14398190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21387184 - 21387097
Alignment:
Q  145 gaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21387184 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 21387097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21383768 - 21383677
Alignment:
Q  141 tattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21383768 tattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 21383677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22112089 - 22111924
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  22112089 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 22111990  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagct 185  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22111989 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagct 22111924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 18862627 - 18862728
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  18862627 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 18862722  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  18862723 gcatga 18862728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 21827996 - 21828097
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21827996 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 21828091  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  21828092 gcatga 21828097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 232
Target Start/End: Original strand, 24445511 - 24445587
Alignment:
Q  156 gaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 232  Q
    |||||||||| ||||| |||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24445511 gaattgttgagaatgatttgttatgaaacctgatgtgatttgattatgctgtaaatgttatttaactaagttgcatg 24445587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21411070 - 21410973
Alignment:
Q  132 ttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcat 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  21411070 ttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcat 21410975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21805562 - 21805465
Alignment:
Q  132 ttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcat 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  21805562 ttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcat 21805467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 17055257 - 17055461
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  17055257 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 17055355  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || |||||          | | |||| ||||| |||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17055356 tgaattatacttacttgaattgttgttgaa----------actattgagaatgatttgttatttaagttgatgttatttgattatgctgcaattgttatt 17055445  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  17055446 taactaagttgcatga 17055461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 22113596 - 22113697
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||    
T  22113596 gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagc-tttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggat 22113694  T
Q  119 tga 121  Q
    |||    
T  22113695 tga 22113697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 22135099 - 22135200
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||    
T  22135099 gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagc-tttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggat 22135197  T
Q  119 tga 121  Q
    |||    
T  22135198 tga 22135200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 30643338 - 30643382
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30643338 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 30643382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 22166249 - 22166350
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||    
T  22166249 gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaagtgtgaagc-tttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggat 22166347  T
Q  119 tga 121  Q
    |||    
T  22166348 tga 22166350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 24434107 - 24434161
Alignment:
Q  21 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtga 75  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  24434107 aaaggaactttaggtgctaatatgacctattagggataatgactgtgaactgtga 24434161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 15603059 - 15603107
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  15603059 ttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 15603107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42805658 - 42805444
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42805658 ggaaaggaactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggat 42805559  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805558 tgattttatttacttgaattattattaaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 42805459  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||| |||||||||||    
T  42805458 aaccaagttgcatga 42805444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 26742614 - 26742828
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |    
T  26742614 ggaaaggaactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtt 26742713  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742714 tgattgtatttactcgaattattattgaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagcctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 26742813  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  26742814 aactaagttgcatga 26742828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18774442 - 18774227
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaa-tcatgga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  18774442 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatgga 18774343  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18774342 ttgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 18774243  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     ||||| |||||||||    
T  18774242 aaactatgttgcatga 18774227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18784285 - 18784070
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaa-tcatgga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  18784285 ggaaaggaactttaggtgctaatgagaccaattaaagatattgactgagaactgtgaggcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatgga 18784186  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18784185 ttgattgtatttacttgaattattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 18784086  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     ||||| |||||||||    
T  18784085 aaactatgttgcatga 18784070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33409466 - 33409253
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  33409466 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 33409367  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33409366 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 33409267  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  33409266 aactaagttgcatg 33409253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20232788 - 20232577
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  20232788 ggaaagaaactttaggtactaataagacctatttaagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 20232689  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20232688 tgattgcctttacttgaattattgttgattgatcaa-taattgttgagaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 20232590  T
Q  219 aactaagttgcat 231  Q
    ||||| |||||||    
T  20232589 aactatgttgcat 20232577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 26665999 - 26666212
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  26665999 ggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 26666098  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  26666099 tgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatta 26666197  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  26666198 aactatgttgcatga 26666212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 26937596 - 26937809
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  26937596 ggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 26937695  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  26937696 tgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatta 26937794  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  26937795 aactatgttgcatga 26937809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16674390 - 16674177
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  || |||    
T  16674390 ggaaacgaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtaaagtttttatgaactgttaagagactatgaaatgaaatatagat 16674291  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674290 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 16674191  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  16674190 aactaagttgcatg 16674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 21340635 - 21340848
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||| || ||||  |||||     
T  21340635 ggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgggaactgtgaagcctttttgaattgttaagggattatgaaatgaaatatggag 21340734  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  |||||| |||||||| || | |||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340735 tgattgcctttactcgaattattgttaattgatcaag-aattgtttagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 21340833  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  21340834 aactaagttgcatga 21340848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 17718311 - 17718520
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgat 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || || ||| || ||||  ||| ||||||    
T  17718311 aggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgtttagagattatgaaatgaaatatgaattgat 17718410  T
Q  123 tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 222  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17718411 ttcctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaacatgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaact 17718510  T
Q  223 aagttgcatg 232  Q
    ||||||||||    
T  17718511 aagttgcatg 17718520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 24532916 - 24533129
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  24532916 ggaaaggaactctaggtgcttgtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggat 24533015  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  24533016 tgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgttgcaattgttatta 24533114  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  24533115 aactatgttgcatga 24533129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 25229274 - 25229488
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  25229274 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 25229372  T
Q  119 tgat-tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||  | || || ||||||||||| ||||||||||||  || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25229373 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 25229472  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  25229473 aaactaagttgcatga 25229488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 25293430 - 25293644
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  25293430 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 25293528  T
Q  119 tgat-tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||  | || || ||||||||||| ||||||||||||  || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25293529 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 25293628  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  25293629 aaactaagttgcatga 25293644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 23535457 - 23535670
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||| | || |||    
T  23535457 ggaaaggaaccttaggtactaatgagacctgtttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattat-acgtgatttattgat 23535555  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
     ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  23535556 agattgca-ttactttaattattattgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 23535653  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  23535654 ttaactaagttgcatga 23535670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4036458 - 4036243
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||    
T  4036458 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccaagaactgtgaagc-tttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggat 4036360  T
Q  119 tg-attgtatttacttgaattattattgaatgatcaag-gaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    || | | || || ||||||||||| |||||||||||||  || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4036359 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttat 4036260  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    | |||||||||||||||    
T  4036259 taaactaagttgcatga 4036243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 21885057 - 21885271
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||    
T  21885057 gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataattattatgaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggat 21885155  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21885156 tgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 21885255  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  21885256 taactaagttgcatga 21885271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26172702 - 26172488
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||    
T  26172702 gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggat 26172604  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| || || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26172603 tgaattacacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaacgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 26172504  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| ||||    
T  26172503 taactaagttgaatga 26172488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20296085 - 20295870
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  20296085 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 20295986  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  20295985 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 20295887  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20295886 ttaactaagttacatga 20295870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 20911148 - 20911252
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20911148 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 20911246  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  20911247 gcatga 20911252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 19472588 - 19472803
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  19472588 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 19472687  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  19472688 tgattgcatt-acttaaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 19472786  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  19472787 ttaactaagttacatga 19472803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18356085 - 18355981
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18356085 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagtt 18355987  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  18355986 gcatga 18355981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10753118 - 10752970
Alignment:
Q  83 atgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgatta 181  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||| |||     
T  10753118 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattcttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 10753019  T
Q  182 agcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgca 230  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10753018 aacttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 10752970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17410570 - 17410463
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  17410570 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 17410471  T
Q  226 ttgcatga 233  Q
    ||||||||    
T  17410470 ttgcatga 17410463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10753488 - 10753387
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  10753488 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 10753393  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  10753392 gcatga 10753387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 15236700 - 15236863
Alignment:
Q  71 tgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatg 170  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | ||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||    
T  15236700 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcatt-acttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatg 15236798  T
Q  171 aattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  15236799 aattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 15236863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18356561 - 18356475
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtga 109  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18356561 aggaaccttagatactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 18356475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 231
Target Start/End: Original strand, 24767588 - 24767634
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcat 231  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24767588 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 24767634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 17410685 - 17410645
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17410685 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatac 17410645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 21366711 - 21366755
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21366711 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 21366755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Original strand, 20910680 - 20910758
Alignment:
Q  31 taggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtga 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  |  ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20910680 taggtactaatgagacctatttaagatgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagtgattataatgtga 20910758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Original strand, 21366552 - 21366669
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||| |||| | |  |||| |||| ||| |||||||    
T  21366552 taatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaa 21366650  T
Q  137 ttattattgaatgatcaag 155  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21366651 atattattgaatgatcaag 21366669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 123352 - 123396
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  123352 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 123396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 12028612 - 12028656
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  12028612 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 12028656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 17919198 - 17919242
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  17919198 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 17919242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20767044 - 20767000
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20767044 tgtgatttgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 20767000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26680652 - 26680608
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  26680652 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 26680608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26952259 - 26952215
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  26952259 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 26952215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31342217 - 31342173
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  31342217 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 31342173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 3398 - 3612
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3398 ggaaaggaactttaggtactaatgagacccattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggat 3497  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3498 tgattgcatttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatactgcaattgttattt 3597  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  3598 aactaagttgcatga 3612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19212105 - 19211891
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19212105 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctataaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggat 19212006  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19212005 tgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattt 19211906  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  19211905 aactaagttgcatga 19211891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 23819167 - 23819381
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23819167 ggaaaggaaccttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggat 23819266  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  23819267 tgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttatta 23819366  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||| |||||||||||    
T  23819367 aacgaagttgcatga 23819381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18882605 - 18882393
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||  |||  |||||     
T  18882605 ggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattaactgagaattgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaaagaaatatggaa 18882506  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18882505 taattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgaaaatgttattt 18882406  T
Q  219 aactaagttgcat 231  Q
    |||||||||||||    
T  18882405 aactaagttgcat 18882393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46975705 - 46975494
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  46975705 ggaaatgaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgacctgttaagagattatgaaatgaaatatggat 46975606  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975605 tgattgtctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 46975506  T
Q  219 aactaagttgca 230  Q
    ||||||||||||    
T  46975505 aactaagttgca 46975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12647107 - 12646895
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  12647107 ggaaaggaactt-aggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 12647009  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  12647008 tgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatta 12646910  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  12646909 aactatgttgcatga 12646895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20138318 - 20138107
Alignment:
Q  22 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || | | || ||||  ||||||||     
T  20138318 aaggaactttaggtactaatgagacctattaaagataataactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattttgaaatgaaatatggattgg 20138219  T
Q  122 ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaac 221  Q
    |||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20138218 ttgcctttgcttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaac 20138119  T
Q  222 taagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||    
T  20138118 taagttgcatga 20138107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 36819176 - 36819392
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||  ||    
T  36819176 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgatttatttat 36819275  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaa-ttgtgattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgtta 215  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  36819276 tgattgcattt-cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgtta 36819374  T
Q  216 tttaactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||||    
T  36819375 attaactaagttgcatga 36819392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 16080312 - 16080527
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  16080312 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 16080411  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||   |||||||||| |||||||||||| | | |||     
T  16080412 tgattgca-ttacttgaattattattggatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaa 16080510  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  16080511 ttaactaagttgcatga 16080527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 24782968 - 24783183
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||| ||  || ||||||||| | |||||  | ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||  ||    
T  24782968 ggaatggaactttaagttatagtgagacctacttaagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaat 24783067  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||  || ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  24783068 taattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttat 24783166  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  24783167 ttaactaagttgcatga 24783183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 20228677 - 20228892
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  20228677 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 20228776  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  20228777 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttat 20228875  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    | |||||||||||||||    
T  20228876 taaactaagttgcatga 20228892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1010961 - 1010746
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  1010961 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 1010862  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  1010861 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 1010763  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  1010762 ttaactaagttgcatga 1010746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 16375326 - 16375541
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  16375326 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 16375425  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  16375426 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 16375524  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16375525 ttaactaagttacatga 16375541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21407593 - 21407378
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  21407593 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 21407494  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  21407493 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 21407395  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21407394 ttaactaagttacatga 21407378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33797400 - 33797306
Alignment:
Q  138 tattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33797400 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 33797306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52639779 - 52639564
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  52639779 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 52639680  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||  | ||||||    
T  52639679 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttat 52639581  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  52639580 ttaactaagttacatga 52639564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Original strand, 20229161 - 20229309
Alignment:
Q  83 atgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgatta 181  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| |||     
T  20229161 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttattt 20229260  T
Q  182 agcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgca 230  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20229261 aacttaatgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagttgca 20229309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 1925111 - 1925212
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  1925111 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 1925206  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  1925207 gcatga 1925212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 20924125 - 20924226
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  20924125 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 20924220  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  20924221 gcatga 20924226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Original strand, 39244123 - 39244221
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39244123 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattcttattaagtttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 39244218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Original strand, 39247678 - 39247776
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39247678 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattcttattaagtttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 39247773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Original strand, 41388223 - 41388321
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41388223 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaatttttattaagcttgatacgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 41388318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 33797767 - 33797681
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtga 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33797767 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 33797681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 3472969 - 3473013
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3472969 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 3473013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 18182167 - 18182211
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18182167 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18182211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 18393831 - 18393907
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag 95  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  18393831 ggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaag 18393907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 233
Target Start/End: Original strand, 22449307 - 22449356
Alignment:
Q  184 cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  22449307 cttgttgtgatctgattatgctgctactattatttaactaagttgcatga 22449356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 3705111 - 3705155
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  3705111 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 3705155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 18394012 - 18394056
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  18394012 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 18394056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 33050072 - 33050116
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  33050072 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 33050116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 45310234 - 45310310
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag 95  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| | |||||| |||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  45310234 ggaatggaactttaggtagtaatgtggcctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaag 45310310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12706920 - 12706713
Alignment:
Q  26 aactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  12706920 aactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggattgattgc 12706821  T
Q  126 atttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12706820 atttacttgaattatttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 12706721  T
Q  226 ttgcatga 233  Q
    ||||||||    
T  12706720 ttgcatga 12706713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16741444 - 16741231
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16741444 ggaaatgaactttaggtactagtgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggat 16741345  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  16741344 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctacaattgttatta 16741245  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  16741244 aactaagttgcatg 16741231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 5616682 - 5616897
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagctttt-atgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatgga 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  5616682 ggaaaggaactttaggtgcaaataagacctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatgga 5616781  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5616782 ttgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgttattaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 5616881  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  5616882 taactaagttgcatga 5616897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 9482161 - 9482374
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||| || |||    
T  9482161 ggaaaggaactttaggtactaatgtgaactattaaagataatgactgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagat 9482260  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9482261 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttattt 9482360  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  9482361 aactaagttgcatg 9482374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 2685187 - 2685400
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  2685187 ggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 2685286  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  2685287 tgattgcccttacttgaattattgtcgattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatta 2685385  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  2685386 aactatgttgcatga 2685400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17804435 - 17804220
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  17804435 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 17804336  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  17804335 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 17804237  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  17804236 ttaactaagttgcatga 17804220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19663006 - 19662794
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  19663006 ggaaaggaactt-aggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 19662908  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  19662907 tgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatta 19662809  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  19662808 aactatgttgcatga 19662794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 22592672 - 22592884
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  22592672 ggaaagaaactttaggtactaatgtgacctattaaagataataactgtgaactgtgaag-ttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 22592770  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22592771 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctacaaatgttattt 22592870  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  22592871 aactaagttgcatg 22592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12496546 - 12496333
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  12496546 ggaaaggaactttaggtagttatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttaggaactgttaagagattatgaactgaaatatggat 12496447  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||  | | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12496446 tgattgcctttacttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgttgtgatctgattatgctgcaaatgttattt 12496347  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  12496346 aactaagttgcatg 12496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 25767036 - 25767251
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| || | | || |||    
T  25767036 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaatttattgat 25767135  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||  ||| |||||| |||||||||||| | |||||     
T  25767136 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttac 25767234  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  25767235 ttaactaagttgcatga 25767251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 1587599 - 1587813
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  1587599 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggat 1587697  T
Q  119 tgat-tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||  | || || ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1587698 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 1587797  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  1587798 aaactaagttgcatga 1587813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 20803421 - 20803636
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  20803421 ggaaaagaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgacttagaactgtgaagcttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 20803520  T
Q  119 tg-attgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    || | | || || ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20803521 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 20803620  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     ||||||| |||||||    
T  20803621 aaactaagctgcatga 20803636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 22429898 - 22430113
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  22429898 ggaatggaactttaggttatggtgagacctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 22429997  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| |  ||||     
T  22429998 tgattgcatt-acttgaattattattaaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaa 22430096  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  22430097 ttaactaagttgcatga 22430113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1644918 - 1644728
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1644918 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattat 1644820  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  1644819 tgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatga 1644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11567100 - 11566885
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  11567100 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 11567001  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  11567000 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 11566902  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11566901 ttaactaagttacatga 11566885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23395306 - 23395091
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  23395306 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 23395207  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  23395206 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 23395108  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23395107 ttaactaagttacatga 23395091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23414773 - 23414669
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23414773 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 23414675  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  23414674 gcatga 23414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27556531 - 27556427
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27556531 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 27556433  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  27556432 gcatga 27556427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21702525 - 21702311
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  21702525 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 21702427  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || || |||||||| || ||||||||||||| || | ||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21702426 tgaattatactttcttgaatttttgttgaatgatcaagaaactattgagtatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattttgctgcaattgttatt 21702327  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21702326 taattaagttgcatga 21702311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23990158 - 23989943
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  23990158 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 23990059  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  | |||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  23990058 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 23989960  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23989959 ttaactaagttacatga 23989943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8244074 - 8243884
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8244074 gacctattaaagataatgattgtgaattgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattat 8243976  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  8243975 tgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 8243884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14472508 - 14472294
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  14472508 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 14472409  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| | |||||||||| | |||||     
T  14472408 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgtta- 14472311  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  14472310 ttaactaagttgcatga 14472294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 18955631 - 18955846
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  18955631 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgat 18955730  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||  ||||||   ||||| ||||  ||||||||||| | ||||||    
T  18955731 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttat 18955829  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    | |||||||||||||||    
T  18955830 taaactaagttgcatga 18955846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19870828 - 19870613
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || |||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  19870828 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctatttaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 19870729  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  | |||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  19870728 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 19870630  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  19870629 ttaactaagttacatga 19870613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22863184 - 22862969
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  22863184 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 22863085  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||  | ||||||    
T  22863084 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattagaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttat 22862986  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  22862985 ttaactaagttgcatga 22862969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 18917159 - 18917349
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  18917159 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattg-cttgaattattat 18917257  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18917258 tgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18917349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 12618713 - 12618927
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||| | |||| | || |||    
T  12618713 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgat 12618812  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  || ||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  12618813 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 12618910  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12618911 ttaactaagttacatga 12618927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Original strand, 31478162 - 31478310
Alignment:
Q  83 atgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgatta 181  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||| |||     
T  31478162 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 31478261  T
Q  182 agcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgca 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31478262 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 31478310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1644415 - 1644314
Alignment:
Q  129 tacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttg 228  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1644415 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 1644316  T
Q  229 ca 230  Q
    ||    
T  1644315 ca 1644314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16624256 - 16624158
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16624256 ttacttgaagtattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagtttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 16624161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 31477792 - 31477893
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  31477792 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 31477887  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  31477888 gcatga 31477893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16760419 - 16760321
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  16760419 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 16760324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22949232 - 22949131
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  22949232 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaataaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 22949137  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  22949136 gcatga 22949131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22953188 - 22953087
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  22953188 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaataaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 22953093  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  22953092 gcatga 22953087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23871676 - 23871575
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  23871676 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaataaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 23871581  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  23871580 gcatga 23871575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23875632 - 23875531
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  23875632 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaataaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 23875537  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  23875536 gcatga 23875531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Original strand, 27415814 - 27415900
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtga 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27415814 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 27415900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Original strand, 25135559 - 25135754
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    |||||||| |||||| ||||| || ||| ||| ||| |||||||  ||| ||||| || || |||||||||    
T  25135559 taatgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtggagcttt-atgaattgataaatgattatgaagtgaactatgaattgaattatacttacttgaa 25135657  T
Q  137 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    || || || |||||||||| |  | |||| | ||| | || | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25135658 ttgttgttaaatgatcaagaacctattgagagtgattcgttacttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaattgagttgcatga 25135754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 27416181 - 27416269
Alignment:
Q  138 tattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27416181 tattaatgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgat------tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 27416269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 16523430 - 16523474
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16523430 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16523474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 27325653 - 27325701
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  27325653 ttgatgtgatatgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatga 27325701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18907181 - 18907137
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  18907181 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatga 18907137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 19790826 - 19790870
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  19790826 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 19790870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 20908028 - 20908072
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20908028 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 20908072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 23657468 - 23657512
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  23657468 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 23657512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 24836 - 25051
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24836 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggat 24935  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatc-aaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24936 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaaggaattattgaaaatgtgttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 25035  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||| ||||||||||    
T  25036 aaactgagttgcatga 25051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 189359 - 189460
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  189359 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 189454  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  189455 gcatga 189460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 19885 - 20099
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | || |||    
T  19885 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgat 19984  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  19985 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatctgattatgttgcaattgttatta 20084  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  20085 aactaagttgcatga 20099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 228241 - 228455
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | || |||    
T  228241 ggaaaggaaccttaggtactaatgagacctacttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttattgat 228340  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  228341 tgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatctgattatgctgcaattgttattt 228440  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  228441 aactaagttgcatga 228455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 16797922 - 16798136
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16797922 ggaaaggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggat 16798021  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||     
T  16798022 tgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgttatta 16798121  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  16798122 aactatgttgcatga 16798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 16808749 - 16808963
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16808749 ggaaaggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggat 16808848  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||     
T  16808849 tgattgtatttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgttgcacttgttatta 16808948  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||  ||||||||    
T  16808949 aactatattgcatga 16808963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17242210 - 17241997
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  17242210 ggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 17242111  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  17242110 tgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatta 17242012  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  17242011 aactatgttgcatga 17241997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3833912 - 3833699
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  3833912 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 3833813  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3833812 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 3833713  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  3833712 aactaagttgcatg 3833699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38814622 - 38814409
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  |||||     
T  38814622 ggaaaggaactttaggtactaatgcgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggaa 38814523  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38814522 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 38814423  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  38814422 aactaagttgcatg 38814409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 20461368 - 20461583
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  20461368 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 20461467  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||   |||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  20461468 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 20461566  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  20461567 ttaactaagttgcatga 20461583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15482890 - 15482686
Alignment:
Q  30 ttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtattt 129  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || ||||||||| | ||    
T  15482890 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 15482792  T
Q  130 acttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  15482791 acttgaattattattgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 15482692  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  15482691 gcatga 15482686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 7793217 - 7793433
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |  | |||    
T  7793217 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgttgat 7793316  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttg-attatgctgcaaatgtta 215  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| || |||||||||| | |||||    
T  7793317 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgtta 7793415  T
Q  216 tttaactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||||    
T  7793416 attaactaagttgcatga 7793433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 327034 - 327248
Alignment:
Q  21 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattg 120  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||||    
T  327034 aaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg 327133  T
Q  121 attgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgat-ttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| ||  ||||||||| | ||||| |    
T  327134 attgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaat 327232  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  327233 taactaagttgcatga 327248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 15849958 - 15850165
Alignment:
Q  24 ggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgatt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | | ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||   |||||||||||    
T  15849958 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgatt 15850057  T
Q  124 gtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 223  Q
    | ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15850058 gcata-acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgt-gaaaatgaattgttattaaacttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaacta 15850155  T
Q  224 agttgcatga 233  Q
    ||||||||||    
T  15850156 agttgcatga 15850165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 31097422 - 31097638
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatga-aatgttaagtgaatataaagtgaatcatgga 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   ||||   || ||    
T  31097422 ggaaaggaactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatattga 31097521  T
Q  118 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtta 215  Q
    ||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31097522 ttgattccact-acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgtta 31097620  T
Q  216 tttaactaagttgcatga 233  Q
     ||||||| |||||||||    
T  31097621 attaactatgttgcatga 31097638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 15941774 - 15941985
Alignment:
Q  21 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggatt- 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || || ||||| ||||||||| ||||||  ||  || |||||||  |||||||     
T  15941774 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattagaggtaatgactgtgagctttgaagattttatgaactgttaaaggataatgaagtgaaatatggattt 15941873  T
Q  120 gattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 219  Q
    |||||  ||||||||| |||||  | | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15941874 gattgcctttacttgatttattgctaattgatcaag-aattgttgaaaatgatttgttattaaatttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 15941972  T
Q  220 actaagttgcatg 232  Q
    |||||||||||||    
T  15941973 actaagttgcatg 15941985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 2897696 - 2897906
Alignment:
Q  24 ggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgatt 123  Q
    ||||||||||||  || |||| |||||| |||||  | ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || ||||||||    
T  2897696 ggaactttaggtaatagtgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 2897795  T
Q  124 gtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaac 221  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  2897796 gcatt-actggaattattattgaatgatcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 2897894  T
Q  222 taagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||    
T  2897895 taagttgcatga 2897906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15617615 - 15617400
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  15617615 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 15617516  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  15617515 tgattacatt-acttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 15617417  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  15617416 ttaactaagttgcatga 15617400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 1598350 - 1598560
Alignment:
Q  21 aaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggatt- 119  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  || || ||||  ||| |||     
T  1598350 aaagggactttaggtgctaatatgacctattagggataatgactgtgaactgtgatgattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatgaattt 1598449  T
Q  120 gattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgatt-aagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||  || |||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1598450 gattgccttcacttga-ttattgttaattgatcaag-aattgttgaaaatgatttgttatttaagcttgatgtgatttgattatgctgc-aatgttattt 1598546  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  1598547 aactaagttgcatg 1598560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7109939 - 7109724
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  7109939 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 7109840  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  7109839 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 7109741  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7109740 ttaactaagttacatga 7109724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7113874 - 7113659
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  7113874 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 7113775  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  7113774 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 7113676  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7113675 ttaactaagttacatga 7113659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15464993 - 15464889
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15464993 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 15464895  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  15464894 gcatga 15464889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22321905 - 22321690
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  22321905 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 22321806  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  22321805 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttat 22321707  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22321706 ttaactaagttacatga 22321690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22336960 - 22336745
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  22336960 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 22336861  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  22336860 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 22336762  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22336761 ttaactaagttacatga 22336745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 27409512 - 27409727
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  27409512 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 27409611  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  27409612 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 27409710  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27409711 ttaactaagttacatga 27409727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28949965 - 28949750
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  28949965 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 28949866  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  28949865 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 28949767  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28949766 ttaactaagttacatga 28949750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30066187 - 30065972
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  30066187 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 30066088  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  30066087 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 30065989  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  30065988 ttaactaagttgcatga 30065972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489553
Alignment:
Q  138 tattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 8489553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5223192 - 5223088
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5223192 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 5223094  T
Q  228 gcatga 233  Q
    | ||||    
T  5223093 gtatga 5223088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11854974 - 11854759
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  11854974 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 11854875  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||   |||||   ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  11854874 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 11854776  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    | |||||||||||||||    
T  11854775 taaactaagttgcatga 11854759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16696980 - 16696809
Alignment:
Q  62 actgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaatt 160  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||  || |||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  16696980 actgtgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgatcatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaact 16696882  T
Q  161 gttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
     |||| ||||  ||||  || | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16696881 attgagaatgttttgttctttaacttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 16696809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Original strand, 4589125 - 4589273
Alignment:
Q  83 atgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgatta 181  Q
    ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||| |||     
T  4589125 atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 4589224  T
Q  182 agcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgca 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4589225 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 4589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11854547 - 11854441
Alignment:
Q  126 atttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| |||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11854547 atttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaag 11854449  T
Q  226 ttgcatga 233  Q
    ||||||||    
T  11854448 ttgcatga 11854441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11070309 - 11070094
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |   |||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  11070309 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 11070210  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||  | ||||||    
T  11070209 tgattgcatt-acttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttat 11070111  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  11070110 ttaactaagttgcatga 11070094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 11165397 - 11165612
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  |||||| || |  |||||||  |||||  ||||| |||| | || |||    
T  11165397 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgatttattgat 11165496  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  11165497 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 11165595  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11165596 ttaactaagttacatga 11165612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12339594 - 12339490
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12339594 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaacttgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 12339496  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  12339495 gcatga 12339490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55023108 - 55022893
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  55023108 ggaatggaactttagatactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 55023009  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| ||||||| |||| | ||||||    
T  55023008 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttat 55022910  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  55022909 ttaactaagttacatga 55022893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Original strand, 16750570 - 16750668
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16750570 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 16750665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19775522 - 19775374
Alignment:
Q  83 atgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgatta 181  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||| |||     
T  19775522 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 19775423  T
Q  182 agcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgca 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19775422 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 19775374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 11300743 - 11300847
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11300743 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaacgttatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagtt 11300841  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  11300842 gcatga 11300847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 4111231 - 4111332
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  4111231 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 4111326  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  4111327 gcatga 4111332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15965096 - 15964995
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  15965096 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 15965001  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  15965000 gcatga 15964995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15969020 - 15968919
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  15969020 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 15968925  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  15968924 gcatga 15968919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15972944 - 15972843
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  15972944 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 15972849  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  15972848 gcatga 15972843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19775892 - 19775791
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  19775892 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 19775797  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  19775796 gcatga 19775791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 11300379 - 11300534
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  || ||| ||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  11300379 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 11300478  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattg 175  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  11300479 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattg 11300534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Original strand, 4107383 - 4107480
Alignment:
Q  132 ttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcat 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  4107383 ttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcat 4107478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 37439618 - 37439719
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  37439618 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctacaattgttgttaaactaagtt 37439713  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  37439714 gcatga 37439719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14499559 - 14499351
Alignment:
Q  26 aactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgt 125  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||| ||  ||||| |||| | || |||||||||     
T  14499559 aactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgc 14499460  T
Q  126 atttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  |||||  ||| ||||||||| |  | |||||||||||||    
T  14499459 att-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaacta 14499361  T
Q  224 agttgcatga 233  Q
    ||||||||||    
T  14499360 agttgcatga 14499351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 16865001 - 16865077
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16865001 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctatcaaagataatgattatgaactgtgaagattttatgaattgttaag 16865077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14668631 - 14668583
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14668631 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 14668583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 19725953 - 19726001
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19725953 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 19726001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 3389803 - 3389879
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag 95  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  3389803 ggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaag 3389879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 3403003 - 3403047
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3403003 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 3403047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12172866 - 12172822
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12172866 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 12172822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14665475 - 14665427
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14665475 ttgatgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 14665427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 18383962 - 18384006
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18383962 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18384006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11862862 - 11862819
Alignment:
Q  190 gtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11862862 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 11862819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 322821 - 322704
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||| | |  |||| |||| ||| |||||||    
T  322821 taatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaa 322723  T
Q  137 ttattattgaatgatcaag 155  Q
     ||||||||||||||||||    
T  322722 atattattgaatgatcaag 322704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 322662 - 322618
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  322662 tgtgatctgattatgccgctattgttatttaactaagttgcatga 322618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 1982857 - 1982901
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  1982857 tgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 1982901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 3389983 - 3390027
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  3389983 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 3390027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 11557431 - 11557475
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  11557431 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 11557475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 11595186 - 11595230
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  11595186 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 11595230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12496327 - 12496283
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  12496327 tgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 12496283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 6125 - 6339
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||    
T  6125 ggaaaagaactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggat 6224  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6225 tgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 6324  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  6325 aactatgttgcatga 6339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2118 - 1923
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| ||| |||||||  ||||||||| || || |||||||||    
T  2118 taatgtgacctattaaagataatgatcaagaactgtggagcttt-atgaattgataaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 2020  T
Q  137 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    || || || |||||||||| || | |||| | ||| |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2019 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatga 1923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7182 - 6968
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||    
T  7182 ggaaaagaactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggat 7083  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7082 tgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 6983  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  6982 aactatgttgcatga 6968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Original strand, 11189 - 11384
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| ||| |||||||  ||||||||| || || |||||||||    
T  11189 taatgtgacctattaaagataatgatcaagaactgtggagcttt-atgaattgataaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 11287  T
Q  137 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    || || || |||||||||| || | |||| | ||| |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11288 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatga 11384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 35836 - 36025
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35836 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattat 35934  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| | | ||||||||| | |||||  ||||||||  |||| |||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35935 tgaatgatcaggaagttgttgaaatt-aattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 36025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Original strand, 38706 - 38901
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    |||| ||| |||||| ||||| || ||| ||| ||| |||||||  ||||||||| || || |||||||||    
T  38706 taatgtgacctattaaagataatgatcatgaaccgtggagcttt-atgaattgataaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 38804  T
Q  137 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    || || || |||||||||| || | |||| | ||| |||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38805 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtcatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatga 38901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 173528 - 173315
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||   || |||    
T  173528 ggaaaggaactttaggtactaaagagacctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatatattgat 173429  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  173428 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 173330  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  173329 aactaagttgcatga 173315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10141 - 9928
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  10141 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 10042  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10041 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 9942  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  9941 aactaagttgcatg 9928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 163 - 1
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgat 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  163 aggaactttaggtactaatgagacttattaaaaatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 64  T
Q  123 tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagct 185  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  63 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23454 - 23240
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23454 ggaaaggaaccttagttactaatgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggat 23355  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||     
T  23354 tgattgtatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattaagctgcaattattatta 23255  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| ||| |||||    
T  23254 aactatgtttcatga 23240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 64091 - 63878
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  64091 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactatgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 63992  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63991 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 63892  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  63891 aactaagttgcatg 63878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 75975 - 75762
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||  ||||||    
T  75975 ggaaaggaaatttcggtactaatgtgacatattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggat 75876  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
     |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75875 agattgcctttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgaaaatgttattt 75776  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  75775 aactaagttgcatg 75762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 19928370 - 19928583
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||||  ||||||    
T  19928370 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaggagattatgaaatgaaatatggat 19928469  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19928470 tgattgtctttatttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 19928569  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  19928570 aactaagttgcatg 19928583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 18855329 - 18855541
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||  ||| |     
T  18855329 ggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaaatgaaatatgaag 18855428  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18855429 tgattgcctttacttgaattattgttaattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgttt 18855527  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  18855528 aactaagttgcatg 18855541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 22461058 - 22461270
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  22461058 ggaaaggaactt-aggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggat 22461156  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  22461157 tgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaa-gaattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatta 22461255  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  22461256 aactatgttgcatga 22461270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24735640 - 24735426
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggatt 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || ||||    
T  24735640 gaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgatt 24735541  T
Q  120 gattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |    
T  24735540 gatcgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 24735442  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  24735441 taactaagttgcatga 24735426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23187313 - 23187099
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||  |||||    
T  23187313 ggaaaggaatcttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggat 23187214  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| || | ||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  23187213 taattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacctgatatgatttgattatgctgcaattgttatta 23187114  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||| ||||| |||||    
T  23187113 aaccaagttccatga 23187099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23598576 - 23598362
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||  |||||    
T  23598576 ggaaaggaatcttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggat 23598477  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| || | ||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  23598476 taattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacctgatatgatttgattatgctgcaattgttatta 23598377  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    ||| ||||| |||||    
T  23598376 aaccaagttccatga 23598362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 19688624 - 19688781
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  19688624 ggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 19688723  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtg 177  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19688724 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgtg 19688781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27263511 - 27263296
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  27263511 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagc-tttacggattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 27263413  T
Q  119 tg-attgtatttacttgaa-ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    || | | || || |||||| ||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27263412 tgaaatatacttgcttgaatttattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttat 27263313  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    | |||||||||||||||    
T  27263312 taaactaagttgcatga 27263296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 61053 - 60840
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||    
T  61053 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccgagaactgtgaagc-tttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggat 60955  T
Q  119 tg-attgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    || | | || || ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  60954 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtga-ttgattatgctgcaattgttatt 60856  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  60855 aaactaagttgcatga 60840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41667187 - 41666973
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||    |||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||| ||    
T  41667187 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaaacttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatgaat 41667089  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41667088 tgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 41666989  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  41666988 taactaagttgcatga 41666973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 10101513 - 10101728
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  10101513 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 10101612  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  10101613 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 10101711  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  10101712 ttaactaagttgcatga 10101728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 41530878 - 41531087
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  41530878 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 41530977  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||     
T  41530978 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgtta 41531072  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  41531073 aactaagttgcatga 41531087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 27379301 - 27379516
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  27379301 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 27379400  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  27379401 tgattgcatt-actttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 27379499  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  27379500 ttaactaagttgcatga 27379516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 27383347 - 27383562
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  27383347 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 27383446  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  27383447 tgattgcatt-actttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 27383545  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  27383546 ttaactaagttgcatga 27383562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27602034 - 27601819
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  27602034 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 27601935  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  27601934 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 27601836  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27601835 ttaactaagttacatga 27601819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24649570 - 24649380
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24649570 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattat 24649472  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24649471 tgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 24649380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 12901380 - 12901595
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  12901380 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 12901479  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||||||||  | ||||||    
T  12901480 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttat 12901578  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  12901579 ttaactaagttgcatga 12901595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31345005 - 31344901
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31345005 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaactaagtt 31344907  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  31344906 gcatga 31344901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 24628347 - 24628562
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  24628347 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 24628446  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  || || | || |||||||||||| | ||||||    
T  24628447 tgattgcattg-cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttat 24628545  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24628546 ttaactaagttacatga 24628562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26125441 - 26125232
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  26125441 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcaagaactgtgaagcttt-atggattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 26125343  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    | | || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| |  || ||||||||||||||||||     |||||||    
T  26125342 ttaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagtttatgtgatttgattatgct-----tgttatt 26125248  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  26125247 taactaagttgcatga 26125232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 30344973 - 30345074
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  30344973 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 30345068  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  30345069 gcatga 30345074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1283513 - 1283412
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  1283513 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaatctaagtt 1283418  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  1283417 gcatga 1283412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15477841 - 15477711
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  15477841 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 15477742  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatga 150  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15477741 tgattgca-ttacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 22811958 - 22812002
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22811958 tgtgatttgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 22812002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24174870 - 24174826
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  24174870 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 24174826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24869950 - 24869906
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  24869950 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 24869906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 25961510 - 25961558
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgt 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  25961510 ttacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaaatgaattgt 25961558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 25961581 - 25961625
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25961581 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 25961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37524749 - 37524701
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  37524749 ttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 37524701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18592 - 18379
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||| |||||     
T  18592 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgaattgttaagagattattaaatgaattatggac 18493  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18492 tgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttattt 18393  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  18392 aactaagttgcatg 18379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 9533 - 9748
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | || |||    
T  9533 ggaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgatttattgat 9632  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgtt-gaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |    
T  9633 tgatcgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttattaaatgaattgttattaagcttgatgtgatctgattacgctgcaattgttaat 9732  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||    
T  9733 taactatgttgcatga 9748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 66283 - 66498
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  66283 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 66382  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  66383 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 66481  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  66482 ttaactaagttgcatga 66498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 53803 - 53588
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  53803 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 53704  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  53703 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 53605  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  53604 ttaactaagttgcatga 53588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 36068 - 36169
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  36068 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 36163  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  36164 gcatga 36169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 18500 - 18715
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  18500 ggaagggaactttaggtactgctgagacctattaaagatattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 18599  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  18600 tgattgca-ttacttgaattatttttgaatgatcaagaaattattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 18698  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||| |||||||||||||    
T  18699 ttacctaagttgcatga 18715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9658 - 9445
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||| || ||||  ||| ||    
T  9658 ggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagttttcatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatgaat 9559  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9558 tgattgcctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttatgatttaattatactgcaaatgttattt 9459  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  9458 aactaagttgcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 139948 - 139736
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || ||| || ||||  |||||     
T  139948 ggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaaggctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggag 139849  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    ||||||  |||||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139848 tgattgcctttactcgaattattgattattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttgttaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 139750  T
Q  219 aactaagttgcatg 232  Q
    ||||||||||||||    
T  139749 aactaagttgcatg 139736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 71547 - 71461
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtga 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  71547 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 71461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 71180 - 71092
Alignment:
Q  138 tattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  71180 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgat------tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 71092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36542 - 36331
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggatt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  36542 gaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaaatatggatt 36443  T
Q  120 gattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 219  Q
    |||||   ||||   |||| || || | ||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36442 gattgccattacccaaattgttgttaattgatcaa-gaattgttaagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 36344  T
Q  220 actaagttgcatg 232  Q
    | |||||||||||    
T  36343 attaagttgcatg 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13142 - 12927
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  13142 ggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 13043  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||| | | |||||     
T  13042 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaa 12944  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  12943 ttaactaagttgcatga 12927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19426 - 19211
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  19426 ggaaatgaactttcggtactaatgagatatatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 19327  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||| | | |||||     
T  19326 tgattgca-ttactttaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaa 19228  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  19227 ttaactaagttgcatga 19211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 62498 - 62284
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  62498 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 62400  T
Q  119 tgat-tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||  | || || ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  62399 tgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 62300  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  62299 taactaagttgcatga 62284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 2541 - 2755
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||   || |||    
T  2541 ggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatatattgat 2640  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  2641 tgattgga-ttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaa 2738  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  2739 ttaactaagttgcatga 2755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 5868 - 6082
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  5868 ggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataatgatattgactgagaattgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattattaagtgaattatggat 5966  T
Q  119 tgat-tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    |||  | || |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5967 tgaaatatacttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 6066  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
     |||||||||||||||    
T  6067 aaactaagttgcatga 6082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 77039 - 77253
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  77039 gaaaagaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 77137  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  77138 tgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 77237  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  77238 taactaagttgcatga 77253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 65396 - 65611
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  65396 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 65495  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  65496 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 65594  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  65595 ttaactaagttgcatga 65611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 61505 - 61695
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  61505 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattat 61603  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  61604 tgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 61695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 80950 - 80738
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | ||  ||    
T  80950 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaat 80851  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  80850 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagatgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttatta 80753  T
Q  219 aactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  80752 aactaagttgcatga 80738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 80469 - 80321
Alignment:
Q  83 atgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgatta 181  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||| |||     
T  80469 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 80370  T
Q  182 agcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgca 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  80369 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 80321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2114 - 1900
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||  |||||    
T  2114 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattctggat 2016  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2015 tgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatt 1916  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  1915 taactaagttgcatga 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 587 - 392
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgat 122  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||         
T  587 aggaaccttaggtactaatgaaacctattaaagatattgactgagaactgtgaagc-tttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatgga----- 494  T
Q  123 tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 222  Q
             |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||  || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  493 ---------ttgaattattgttgaatgattaagaaattattgagaatgatttgttgtttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaatt 403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 3743 - 3958
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  3743 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 3842  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  3843 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 3941  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  3942 ttaactaagttgcatga 3958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 58587 - 58802
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  58587 gaaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 58686  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || |||||||||||| | ||||||    
T  58687 tgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttat 58785  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  58786 ttaactaagttacatga 58802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5184
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4994 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattat 5092  T
Q  144 tgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5093 tgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 10452 - 10587
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  10452 ggaaaagaactttaagtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgat 10551  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaag 155  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10552 tgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaag 10587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9572 - 9358
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  9572 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgcgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 9474  T
Q  119 tgattg-tatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| |  || |||||||| || || || |||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9473 tgaatcctacttacttgagttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 9374  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  9373 taactaagttgcatga 9358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Original strand, 13355 - 13568
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | || |||    
T  13355 ggaaatgaattttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgat 13454  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag--cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||  ||||||   |||||||||| ||||||| |||  | |||||     
T  13455 tgattgca-ttactttaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttattgttaa 13553  T
Q  217 ttaactaagttgcat 231  Q
    |||||| ||||||||    
T  13554 ttaactgagttgcat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8737 - 8523
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgc-taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||||| |||||| | || || ||||||||||||||| |||    ||||| | ||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  8737 gaaaggaaccttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactataaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggat 8639  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8638 tgaattatacttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatt 8539  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  8538 taactaagttgcatga 8523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15821 - 15667
Alignment:
Q  80 tttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtga 178  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| |    
T  15821 tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgtta 15722  T
Q  179 ttaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15721 tttaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 15667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15575 - 15363
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||    ||| |||||||||||  |||  || ||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  15575 gaaaggatctttaggtacttagtgtgacctattaaagatactgatcatgaattgtgaagctttc-tgagttgctaaatgattatgaagtgaattatggat 15477  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||| ||||||||| || |  ||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15476 tgaattatacttacttgaattgttgttggatgatcaagaaactaatgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 15377  T
Q  218 taactaagttgcat 231  Q
    ||||||||||||||    
T  15376 taactaagttgcat 15363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6808 - 6704
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808 ttactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 6710  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  6709 gcatga 6704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31012 - 30908
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31012 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagtt 30914  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  30913 gcatga 30908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Original strand, 20479 - 20546
Alignment:
Q  166 aaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20479 aaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 20546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 16531 - 16745
Alignment:
Q  20 gaaaggaactttaggtgctaa-tgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| |||    |||||||||||| || ||||| |||||| | | ||  |||||||| ||||||    
T  16531 gaaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcatt-atgaattgttaaataattaagaagtgaattatggat 16629  T
Q  119 tga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||| ||||| |||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16630 tgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagttgatatgatttgattatgctgcaattgttatt 16729  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16730 taactaagtcgcatga 16745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12660 - 12445
Alignment:
Q  19 ggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || |||    
T  12660 ggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgat 12561  T
Q  119 tgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||   | | |||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  12560 tgattgcatt-acttgaattattattaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttat 12462  T
Q  217 ttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12461 ttaactaagttacatga 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 11483 - 11584
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  11483 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 11578  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  11579 gcatga 11584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 14069 - 14170
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  14069 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 14164  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  14165 gcatga 14170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 230
Target Start/End: Original strand, 80754 - 80855
Alignment:
Q  129 tacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttg 228  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  80754 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttg 80853  T
Q  229 ca 230  Q
    ||    
T  80854 ca 80855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 575 - 473
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact-aagt 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  575 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgctattgttatttaactaaagt 480  T
Q  227 tgcatga 233  Q
    |||||||    
T  479 tgcatga 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4500 - 4456
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4500 tgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgcatga 4456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 521 - 439
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  521 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgtt 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 32642 - 32743
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  32642 ttacttgaaatattattgaatgatcaag---atgttg-aaataaattgttattaagcttgacatgaattgattatgctgtaattgttgttaaactaagtt 32737  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  32738 gcatga 32743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Original strand, 901 - 1009
Alignment:
Q  44 gacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaattattat 143  Q
    |||||||||||||||  || || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  901 gacctattaaagataaggattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattat 999  T
Q  144 tgaatgatca 153  Q
    ||||||||||    
T  1000 tgaatgatca 1009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 300 - 185
Alignment:
Q  128 ttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgtgattaag----------cttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatt 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||| |           |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  300 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatt 201  T
Q  218 taactaagttgcatga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  200 taactaagttgcatga 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 207883 - 207931
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  207883 ttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 207931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2979 - 2933
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcat 231  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2979 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 2933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 231
Target Start/End: Original strand, 10085 - 10131
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcat 231  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10085 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 463 - 419
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  463 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 6355 - 6399
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6355 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 6399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 2131 - 2175
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2131 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5656 - 5612
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5656 tgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatga 5612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6851 - 6807
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6851 tgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatga 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2238 - 2194
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2238 tgtgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 2194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1723 - 1520
Alignment:
Q  38 taatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgaatataaagtgaatcatggattgattgtatttacttgaa 136  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||| |||| | |  |||| |||| ||| |||||||    
T  1723 taatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaa 1625  T
Q  137 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattg---tgat------taagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 227  Q
     ||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||   ||||      |||  ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1624 atattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 1526  T
Q  228 gcatga 233  Q
    ||||||    
T  1525 gcatga 1520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 17154 - 17202
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  17154 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatga 17202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42697 - 42653
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42697 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 42653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 73813 - 73857
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  73813 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 73857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Original strand, 15290 - 15375
Alignment:
Q  23 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatactgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtga 109  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  15290 aggaacctttggtactaatgagacatattaaa-atgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataagtgattataatgtga 15375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8630 - 8586
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  8630 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7541 - 7497
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  7541 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 7497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15157 - 15113
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  15157 tgtgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 315
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  359 tgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 35558 - 35602
Alignment:
Q  189 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  35558 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 35602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9587 - 9539
Alignment:
Q  185 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 233  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  9587 ttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttgcatga 9539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University