View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13746_low_4 (Length: 347)

Name: NF13746_low_4
Description: NF13746
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13746_low_4
NF13746_low_4
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (9-347)||(9077952-9078290)
chr5 (12-347)||(24529223-24529558)
chr5 (9-343)||(25421532-25421866)
chr5 (9-343)||(1096467-1096801)
chr5 (9-347)||(24493569-24493906)
chr5 (9-347)||(8286626-8286964)
chr5 (9-343)||(25431395-25431728)
chr5 (9-347)||(13095495-13095832)
chr5 (9-347)||(13025311-13025648)
chr5 (9-343)||(23390284-23390617)
chr5 (9-347)||(22075018-22075356)
chr5 (113-346)||(21985931-21986164)
chr5 (9-347)||(21292754-21293090)
chr5 (12-224)||(22412187-22412388)
chr5 (12-347)||(11581028-11581361)
chr5 (147-347)||(22107157-22107356)
chr5 (9-176)||(21808343-21808510)
chr5 (12-343)||(36154615-36154942)
chr5 (9-117)||(21997547-21997655)
chr5 (12-175)||(264768-264930)
chr5 (9-176)||(21729018-21729185)
chr5 (12-175)||(29329934-29330096)
chr5 (12-175)||(29345980-29346142)
chr5 (12-175)||(39363384-39363546)
chr5 (12-174)||(10732941-10733102)
chr5 (12-175)||(20909012-20909174)
chr5 (12-175)||(29348453-29348615)
chr5 (12-175)||(29350926-29351088)
chr5 (12-175)||(42245365-42245527)
chr5 (12-175)||(32027393-32027555)
chr5 (28-343)||(22144068-22144384)
chr5 (12-175)||(39245136-39245298)
chr5 (12-135)||(20902049-20902172)
chr5 (12-135)||(2154654-2154776)
chr5 (15-175)||(18319033-18319193)
chr5 (12-175)||(10775675-10775838)
chr5 (12-175)||(31061068-31061231)
chr5 (12-135)||(38619434-38619557)
chr5 (13-191)||(21565546-21565723)
chr5 (16-216)||(37723910-37724108)
chr5 (23-224)||(18418594-18418793)
chr5 (13-135)||(23064512-23064634)
chr5 (12-175)||(20917952-20918110)
chr5 (9-127)||(21329500-21329618)
chr5 (75-224)||(20766035-20766174)
chr5 (15-175)||(24067110-24067270)
chr5 (13-124)||(22959538-22959649)
chr5 (28-127)||(20026942-20027043)
chr5 (9-80)||(19660884-19660956)
chr5 (9-107)||(36314577-36314675)
chr5 (9-224)||(40725853-40726069)
chr5 (9-128)||(21502158-21502277)
chr5 (9-131)||(26012034-26012154)
chr5 (11-157)||(17517174-17517320)
chr5 (9-124)||(19668898-19669013)
chr5 (58-184)||(18356364-18356488)
chr5 (13-216)||(21873254-21873453)
chr5 (58-131)||(29448052-29448126)
chr5 (13-77)||(26704075-26704139)
chr5 (13-77)||(26973808-26973872)
chr5 (58-128)||(20910801-20910869)
chr5 (28-131)||(22178218-22178323)
chr5 (12-66)||(20806850-20806904)
chr5 (25-78)||(26732884-26732937)
chr5 (13-77)||(22032323-22032387)
chr5 (28-78)||(26740697-26740747)
chr5 (13-98)||(23201360-23201445)
chr5 (13-82)||(23501403-23501472)
chr5 (13-77)||(18770054-18770118)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (10-347)||(50209996-50210333)
chr1 (12-347)||(34509783-34510118)
chr1 (9-347)||(22532269-22532607)
chr1 (9-347)||(27250513-27250850)
chr1 (9-347)||(21026680-21027017)
chr1 (10-347)||(20135188-20135525)
chr1 (86-343)||(22354360-22354616)
chr1 (12-347)||(433012-433345)
chr1 (10-223)||(22468604-22468816)
chr1 (147-347)||(22355958-22356158)
chr1 (147-347)||(22357644-22357844)
chr1 (9-343)||(38801179-38801508)
chr1 (12-191)||(23593719-23593897)
chr1 (11-175)||(21840766-21840929)
chr1 (12-175)||(13988866-13989028)
chr1 (12-175)||(21923291-21923453)
chr1 (9-175)||(45574842-45575008)
chr1 (12-175)||(21475087-21475249)
chr1 (12-175)||(29776688-29776850)
chr1 (12-175)||(31612313-31612475)
chr1 (10-191)||(16361915-16362095)
chr1 (12-175)||(29298137-29298298)
chr1 (9-215)||(13212821-13213027)
chr1 (12-175)||(16275363-16275526)
chr1 (189-347)||(20847003-20847161)
chr1 (12-212)||(21346961-21347161)
chr1 (6-212)||(21342090-21342296)
chr1 (12-175)||(21707167-21707329)
chr1 (12-175)||(21711709-21711871)
chr1 (146-225)||(48603651-48603730)
chr1 (6-120)||(15860064-15860177)
chr1 (24-296)||(16758664-16758938)
chr1 (9-111)||(20847173-20847275)
chr1 (16-135)||(21754052-21754170)
chr1 (12-175)||(22123067-22123230)
chr1 (13-191)||(33681011-33681188)
chr1 (28-343)||(35260866-35261180)
chr1 (13-131)||(22921868-22921986)
chr1 (28-191)||(21896195-21896358)
chr1 (28-190)||(21861510-21861672)
chr1 (15-175)||(40389157-40389317)
chr1 (9-124)||(14295557-14295672)
chr1 (13-193)||(21787979-21788159)
chr1 (13-156)||(22237631-22237773)
chr1 (10-77)||(20454606-20454673)
chr1 (25-191)||(20918620-20918782)
chr1 (13-124)||(20248283-20248394)
chr1 (13-216)||(21714546-21714754)
chr1 (28-131)||(50614114-50614219)
chr1 (28-131)||(50621942-50622047)
chr1 (28-131)||(41050033-41050138)
chr1 (58-191)||(22130850-22130978)
chr1 (58-184)||(33797570-33797694)
chr1 (24-107)||(52927993-52928076)
chr1 (28-131)||(16368284-16368388)
chr1 (13-77)||(42865266-42865330)
chr1 (13-70)||(21161720-21161778)
chr1 (147-224)||(21477654-21477732)
chr1 (246-343)||(26065176-26065274)
chr1 (301-347)||(33681301-33681347)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (9-347)||(20593773-20594111)
chr6 (9-347)||(25629138-25629476)
chr6 (9-343)||(29060540-29060874)
chr6 (9-347)||(19303324-19303661)
chr6 (10-347)||(18409610-18409947)
chr6 (9-347)||(20360744-20361081)
chr6 (9-347)||(20638067-20638404)
chr6 (9-346)||(22780012-22780348)
chr6 (9-343)||(17287584-17287917)
chr6 (9-347)||(16920417-16920751)
chr6 (9-347)||(22831503-22831839)
chr6 (12-175)||(22782227-22782389)
chr6 (9-176)||(20076700-20076863)
chr6 (12-175)||(2291180-2291342)
chr6 (12-175)||(12742317-12742479)
chr6 (9-176)||(16496244-16496411)
chr6 (12-175)||(18334592-18334754)
chr6 (12-175)||(19005046-19005208)
chr6 (12-175)||(19858919-19859081)
chr6 (12-175)||(24422547-24422709)
chr6 (12-175)||(33861794-33861956)
chr6 (12-175)||(33864278-33864440)
chr6 (28-343)||(18456735-18457049)
chr6 (24-294)||(25644335-25644607)
chr6 (10-175)||(30676710-30676874)
chr6 (12-175)||(1540911-1541073)
chr6 (12-175)||(8055029-8055191)
chr6 (12-175)||(25754809-25754971)
chr6 (12-175)||(26924640-26924802)
chr6 (10-175)||(34963371-34963535)
chr6 (12-175)||(1595549-1595711)
chr6 (12-175)||(25656629-25656791)
chr6 (12-135)||(25688502-25688624)
chr6 (47-292)||(25603223-25603467)
chr6 (12-175)||(20556894-20557054)
chr6 (12-175)||(3852017-3852179)
chr6 (15-175)||(16448526-16448686)
chr6 (28-162)||(18461895-18462028)
chr6 (218-347)||(18821603-18821731)
chr6 (47-347)||(25611507-25611805)
chr6 (36-251)||(15041430-15041644)
chr6 (9-273)||(8227367-8227632)
chr6 (9-191)||(20109140-20109322)
chr6 (28-347)||(11185524-11185839)
chr6 (9-184)||(35245586-35245758)
chr6 (9-124)||(28496477-28496592)
chr6 (9-124)||(29808888-29809003)
chr6 (28-193)||(18821782-18821946)
chr6 (13-131)||(19652199-19652316)
chr6 (9-107)||(27333241-27333339)
chr6 (9-107)||(27393981-27394079)
chr6 (9-131)||(23019408-23019528)
chr6 (9-70)||(25714417-25714478)
chr6 (9-124)||(1561303-1561418)
chr6 (191-260)||(5834367-5834436)
chr6 (191-260)||(20177096-20177165)
chr6 (191-260)||(22158826-22158895)
chr6 (24-124)||(9098518-9098620)
chr6 (24-127)||(19668386-19668491)
chr6 (11-128)||(19847997-19848114)
chr6 (21-124)||(4185827-4185930)
chr6 (11-157)||(23992429-23992572)
chr6 (58-128)||(27415943-27416011)
chr6 (30-81)||(33443068-33443119)
chr6 (9-56)||(22080799-22080846)
chr6 (36-77)||(21766718-21766759)
chr6 (13-62)||(31155465-31155514)
chr6 (179-251)||(16965190-16965261)
chr6 (246-294)||(18453419-18453467)
chr6 (13-77)||(19873120-19873184)
chr6 (118-193)||(25642120-25642196)
chr6 (171-251)||(31164727-31164807)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (9-347)||(14972854-14973192)
chr3 (12-347)||(40213504-40213838)
chr3 (9-347)||(18438534-18438872)
chr3 (9-343)||(25476172-25476506)
chr3 (9-347)||(13442274-13442611)
chr3 (13-343)||(14576620-14576949)
chr3 (9-347)||(17487856-17488194)
chr3 (9-343)||(23083149-23083482)
chr3 (9-347)||(20698220-20698556)
chr3 (9-347)||(26686887-26687224)
chr3 (9-343)||(11424550-11424880)
chr3 (9-347)||(17499338-17499676)
chr3 (9-347)||(43840932-43841269)
chr3 (22-343)||(14572602-14572922)
chr3 (27-296)||(42386428-42386698)
chr3 (9-341)||(12399209-12399537)
chr3 (12-224)||(24153115-24153326)
chr3 (146-338)||(16796684-16796875)
chr3 (24-347)||(30029855-30030176)
chr3 (12-191)||(29172567-29172745)
chr3 (11-175)||(13544024-13544187)
chr3 (12-175)||(9707607-9707769)
chr3 (12-175)||(10247723-10247885)
chr3 (16-175)||(12567564-12567722)
chr3 (12-175)||(17463178-17463340)
chr3 (12-175)||(34159326-34159488)
chr3 (12-155)||(36166598-36166739)
chr3 (12-175)||(45606907-45607069)
chr3 (12-175)||(55476491-55476653)
chr3 (28-343)||(53070485-53070799)
chr3 (12-175)||(7781347-7781509)
chr3 (12-175)||(8899094-8899256)
chr3 (12-175)||(16454281-16454443)
chr3 (12-175)||(17672626-17672788)
chr3 (12-175)||(28848611-28848773)
chr3 (12-175)||(38961891-38962053)
chr3 (12-175)||(13151790-13151953)
chr3 (12-175)||(13154255-13154418)
chr3 (12-175)||(6469134-6469296)
chr3 (12-175)||(17446655-17446816)
chr3 (12-175)||(50242822-50242984)
chr3 (23-224)||(21618460-21618650)
chr3 (9-175)||(43550478-43550644)
chr3 (14-175)||(16282811-16282971)
chr3 (12-135)||(15977515-15977637)
chr3 (12-126)||(55500942-55501055)
chr3 (14-175)||(41123892-41124049)
chr3 (9-273)||(24340579-24340844)
chr3 (12-215)||(12119684-12119887)
chr3 (12-135)||(15412429-15412552)
chr3 (12-120)||(8499518-8499625)
chr3 (146-225)||(14179569-14179648)
chr3 (13-191)||(16103784-16103960)
chr3 (27-294)||(23274705-23274973)
chr3 (28-296)||(52523561-52523831)
chr3 (9-124)||(13210333-13210448)
chr3 (16-135)||(32307684-32307802)
chr3 (12-112)||(44494809-44494908)
chr3 (13-131)||(15470928-15471046)
chr3 (13-191)||(16097332-16097509)
chr3 (12-131)||(10556985-10557104)
chr3 (12-191)||(27165250-27165429)
chr3 (12-119)||(53301562-53301669)
chr3 (9-127)||(14234487-14234605)
chr3 (13-188)||(12174205-12174376)
chr3 (9-224)||(37642170-37642386)
chr3 (11-157)||(46822267-46822413)
chr3 (13-135)||(49668071-49668193)
chr3 (11-157)||(12511059-12511205)
chr3 (12-111)||(17737236-17737337)
chr3 (90-343)||(2050986-2051239)
chr3 (13-115)||(9512924-9513026)
chr3 (13-115)||(9520899-9521001)
chr3 (248-347)||(17248069-17248168)
chr3 (28-131)||(37251165-37251270)
chr3 (28-131)||(43925977-43926082)
chr3 (12-73)||(28194693-28194755)
chr3 (12-65)||(45577947-45578000)
chr3 (16-135)||(1644670-1644787)
chr3 (28-125)||(12377940-12378039)
chr3 (28-131)||(22110349-22110454)
chr3 (9-224)||(22147431-22147646)
chr3 (13-77)||(856140-856204)
chr3 (13-77)||(23077530-23077594)
chr3 (10-72)||(14665398-14665460)
chr3 (173-224)||(36166747-36166799)
chr3 (10-72)||(14668554-14668616)
chr3 (30-79)||(13919350-13919399)
chr3 (238-282)||(12339980-12340024)
chr3 (13-77)||(14878569-14878633)
chr3 (13-77)||(15878104-15878168)
chr3 (13-77)||(17525211-17525275)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (11-347)||(39479-39814)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-347)||(74998-75333)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (6-347)||(6759255-6759594)
chr8 (10-347)||(28648827-28649164)
chr8 (9-347)||(16092124-16092463)
chr8 (9-347)||(22875065-22875403)
chr8 (9-347)||(18818193-18818530)
chr8 (9-347)||(22626736-22627073)
chr8 (9-347)||(21923712-21924049)
chr8 (9-343)||(20536208-20536541)
chr8 (9-347)||(18879021-18879352)
chr8 (9-343)||(23406379-23406714)
chr8 (9-328)||(7372778-7373088)
chr8 (9-347)||(21918784-21919121)
chr8 (10-344)||(23648554-23648888)
chr8 (9-347)||(31971257-31971592)
chr8 (9-336)||(45130793-45131117)
chr8 (9-347)||(16199430-16199765)
chr8 (146-347)||(25362924-25363124)
chr8 (12-347)||(41598188-41598522)
chr8 (12-175)||(14409444-14409606)
chr8 (12-175)||(1484402-1484564)
chr8 (12-175)||(5853292-5853454)
chr8 (16-175)||(16413316-16413474)
chr8 (12-175)||(20403227-20403389)
chr8 (12-175)||(22001753-22001915)
chr8 (12-175)||(15203231-15203393)
chr8 (12-175)||(20046195-20046357)
chr8 (12-175)||(4483281-4483442)
chr8 (12-224)||(26219717-26219918)
chr8 (9-230)||(21389353-21389571)
chr8 (12-175)||(4542373-4542535)
chr8 (9-225)||(21395888-21396101)
chr8 (9-225)||(21790381-21790594)
chr8 (12-175)||(19896265-19896430)
chr8 (12-155)||(26225268-26225409)
chr8 (9-212)||(21778697-21778897)
chr8 (10-135)||(26223917-26224041)
chr8 (9-131)||(38855250-38855372)
chr8 (16-294)||(13507920-13508199)
chr8 (9-127)||(6520368-6520486)
chr8 (12-175)||(14823774-14823935)
chr8 (16-294)||(13597452-13597731)
chr8 (28-224)||(19801333-19801527)
chr8 (6-134)||(19937046-19937174)
chr8 (25-135)||(15070571-15070681)
chr8 (12-175)||(25484275-25484430)
chr8 (9-124)||(5866280-5866395)
chr8 (9-112)||(17140916-17141019)
chr8 (9-124)||(21490995-21491110)
chr8 (16-135)||(45290734-45290853)
chr8 (13-131)||(21285601-21285719)
chr8 (9-273)||(17611969-17612231)
chr8 (11-157)||(18678075-18678221)
chr8 (11-157)||(32121734-32121880)
chr8 (13-131)||(23760843-23760961)
chr8 (13-130)||(26355699-26355815)
chr8 (24-127)||(983407-983512)
chr8 (28-191)||(20498581-20498744)
chr8 (21-131)||(21673716-21673826)
chr8 (9-124)||(21249384-21249500)
chr8 (9-124)||(21255222-21255338)
chr8 (13-193)||(23776772-23776952)
chr8 (28-131)||(37116366-37116471)
chr8 (13-225)||(17353843-17354060)
chr8 (35-131)||(17439504-17439602)
chr8 (173-224)||(26222987-26223039)
chr8 (28-131)||(17266991-17267096)
chr8 (28-131)||(24353039-24353143)
chr8 (90-131)||(40492850-40492891)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (9-347)||(16383-16721)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (14-347)||(14038653-14038986)
chr4 (12-347)||(16377305-16377639)
chr4 (9-347)||(44052829-44053166)
chr4 (9-336)||(16239764-16240090)
chr4 (9-343)||(12902757-12903090)
chr4 (11-347)||(22636437-22636771)
chr4 (9-347)||(7088877-7089214)
chr4 (9-347)||(7893703-7894038)
chr4 (16-347)||(23374143-23374473)
chr4 (9-226)||(16270140-16270356)
chr4 (9-347)||(14053086-14053422)
chr4 (12-347)||(44928706-44929042)
chr4 (146-347)||(17047856-17048056)
chr4 (9-193)||(7798774-7798958)
chr4 (206-347)||(15091093-15091234)
chr4 (147-347)||(3096782-3096980)
chr4 (12-224)||(54798669-54798872)
chr4 (12-224)||(14280316-14280518)
chr4 (9-181)||(6899891-6900062)
chr4 (10-175)||(19618172-19618336)
chr4 (12-175)||(18215274-18215436)
chr4 (9-128)||(52873369-52873488)
chr4 (12-347)||(44102214-44102548)
chr4 (12-175)||(12307-12469)
chr4 (12-191)||(1837494-1837671)
chr4 (12-175)||(15118352-15118514)
chr4 (9-249)||(17046487-17046724)
chr4 (12-175)||(44773087-44773249)
chr4 (12-175)||(52312510-52312672)
chr4 (6-175)||(19242693-19242861)
chr4 (24-343)||(52242980-52243302)
chr4 (12-175)||(3515007-3515169)
chr4 (12-175)||(44615288-44615450)
chr4 (12-175)||(50222339-50222501)
chr4 (12-175)||(18239419-18239581)
chr4 (12-175)||(23803265-23803427)
chr4 (12-175)||(51463868-51464030)
chr4 (16-175)||(15355324-15355483)
chr4 (12-155)||(8574844-8574985)
chr4 (28-330)||(6190481-6190782)
chr4 (10-175)||(14970707-14970871)
chr4 (12-175)||(12610950-12611105)
chr4 (9-224)||(15367690-15367905)
chr4 (9-224)||(15402703-15402918)
chr4 (9-273)||(15371202-15371466)
chr4 (9-273)||(15373483-15373747)
chr4 (9-95)||(3096293-3096379)
chr4 (12-175)||(7641192-7641344)
chr4 (28-191)||(13790-13953)
chr4 (13-135)||(12774011-12774132)
chr4 (9-135)||(15370018-15370144)
chr4 (9-273)||(16223532-16223796)
chr4 (28-173)||(21815587-21815731)
chr4 (9-119)||(39706299-39706409)
chr4 (9-124)||(15551817-15551932)
chr4 (24-191)||(43198492-43198661)
chr4 (91-343)||(15464716-15464970)
chr4 (11-175)||(22353835-22353999)
chr4 (24-127)||(12288211-12288316)
chr4 (13-113)||(8846360-8846460)
chr4 (15-175)||(20149832-20149992)
chr4 (298-347)||(7798985-7799034)
chr4 (58-184)||(43256106-43256230)
chr4 (28-131)||(46640453-46640558)
chr4 (173-224)||(8574784-8574836)
chr4 (13-193)||(15093775-15093955)
chr4 (47-112)||(16596686-16596751)
chr4 (244-313)||(20157106-20157177)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (12-339)||(3564155-3564482)
chr7 (9-347)||(38227481-38227818)
chr7 (9-343)||(9509189-9509522)
chr7 (9-347)||(12698831-12699169)
chr7 (9-347)||(10589039-10589375)
chr7 (24-347)||(15143820-15144143)
chr7 (9-343)||(26211995-26212329)
chr7 (9-347)||(16386031-16386369)
chr7 (12-224)||(18456319-18456530)
chr7 (11-347)||(40443393-40443726)
chr7 (9-346)||(27847618-27847951)
chr7 (12-224)||(48273392-48273594)
chr7 (9-175)||(13647325-13647491)
chr7 (9-175)||(18430709-18430874)
chr7 (9-296)||(2279952-2280238)
chr7 (12-347)||(44116509-44116843)
chr7 (12-175)||(456321-456483)
chr7 (12-175)||(11972496-11972658)
chr7 (12-175)||(14949122-14949284)
chr7 (12-175)||(15376713-15376875)
chr7 (12-191)||(16213684-16213861)
chr7 (12-175)||(16232520-16232682)
chr7 (12-175)||(18640272-18640434)
chr7 (12-175)||(20385123-20385285)
chr7 (12-175)||(21189595-21189757)
chr7 (12-175)||(24702238-24702400)
chr7 (12-175)||(32125491-32125653)
chr7 (12-175)||(41522917-41523079)
chr7 (12-175)||(41525379-41525541)
chr7 (13-175)||(11393287-11393448)
chr7 (12-343)||(17061747-17062077)
chr7 (12-175)||(27216860-27217022)
chr7 (16-162)||(24275175-24275320)
chr7 (12-173)||(16410059-16410219)
chr7 (12-175)||(3386333-3386495)
chr7 (12-175)||(24704688-24704847)
chr7 (9-132)||(67745-67868)
chr7 (12-135)||(13869346-13869469)
chr7 (12-135)||(13831373-13831495)
chr7 (16-175)||(38898376-38898535)
chr7 (48-296)||(12756550-12756797)
chr7 (12-192)||(20110556-20110724)
chr7 (9-124)||(34200786-34200901)
chr7 (13-131)||(18005650-18005768)
chr7 (9-131)||(22072913-22073036)
chr7 (9-107)||(28505321-28505419)
chr7 (9-124)||(16495402-16495517)
chr7 (13-119)||(811142-811248)
chr7 (9-273)||(19486600-19486865)
chr7 (9-127)||(47831807-47831925)
chr7 (13-122)||(44014182-44014291)
chr7 (36-343)||(12255578-12255887)
chr7 (13-128)||(16219719-16219834)
chr7 (75-175)||(26355983-26356083)
chr7 (75-175)||(26358435-26358535)
chr7 (9-124)||(11996033-11996148)
chr7 (36-290)||(15211484-15211728)
chr7 (9-124)||(15754893-15755008)
chr7 (24-230)||(1867895-1868101)
chr7 (24-131)||(16056343-16056449)
chr7 (35-230)||(15008398-15008594)
chr7 (9-131)||(10063817-10063939)
chr7 (13-178)||(14932685-14932851)
chr7 (13-178)||(15356120-15356286)
chr7 (13-178)||(15360234-15360400)
chr7 (15-77)||(18154894-18154956)
chr7 (58-128)||(2530140-2530208)
chr7 (97-192)||(15113031-15113125)
chr7 (28-122)||(20220194-20220290)
chr7 (24-115)||(12901338-12901431)
chr7 (13-77)||(12187019-12187083)
chr7 (13-77)||(17138113-17138177)
chr7 (28-79)||(18203831-18203882)
chr7 (10-72)||(2832499-2832561)
chr7 (298-343)||(16056617-16056662)
chr7 (24-79)||(14044761-14044817)
chr7 (24-79)||(14354791-14354847)
chr7 (246-294)||(17017303-17017351)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (16-347)||(25848-26179)
scaffold0122 (134-347)||(33278-33491)
scaffold0122 (12-155)||(44682-44825)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (9-347)||(4508-4845)
scaffold0228 (9-347)||(12090-12427)
scaffold0228 (9-347)||(22042-22379)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (10-347)||(16998-17337)
scaffold0056 (28-343)||(79116-79430)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (9-347)||(38761-39098)
scaffold0145 (9-226)||(32942-33158)
scaffold0145 (7-135)||(9744-9871)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (9-343)||(22337115-22337449)
chr2 (9-347)||(23660023-23660360)
chr2 (9-343)||(23076442-23076775)
chr2 (9-347)||(22737964-22738300)
chr2 (9-347)||(23285865-23286198)
chr2 (9-347)||(22731017-22731355)
chr2 (9-314)||(23060513-23060815)
chr2 (9-329)||(23654188-23654507)
chr2 (9-347)||(37900-38235)
chr2 (12-343)||(298602-298933)
chr2 (9-347)||(20309108-20309442)
chr2 (164-347)||(27753730-27753912)
chr2 (28-347)||(32451713-32452031)
chr2 (12-175)||(22105412-22105575)
chr2 (9-343)||(23708405-23708738)
chr2 (12-175)||(18808943-18809105)
chr2 (12-175)||(23130862-23131024)
chr2 (12-175)||(23133329-23133491)
chr2 (12-175)||(23709532-23709694)
chr2 (12-175)||(23712013-23712175)
chr2 (12-175)||(26505379-26505541)
chr2 (12-175)||(26507857-26508019)
chr2 (12-175)||(34402522-34402684)
chr2 (12-175)||(39682313-39682475)
chr2 (10-175)||(32214921-32215085)
chr2 (12-175)||(571397-571559)
chr2 (12-175)||(6725995-6726157)
chr2 (12-175)||(23135590-23135752)
chr2 (12-175)||(24367774-24367936)
chr2 (15-175)||(21155060-21155219)
chr2 (12-175)||(24898195-24898358)
chr2 (12-175)||(24900678-24900841)
chr2 (12-175)||(24903155-24903318)
chr2 (12-175)||(24905632-24905795)
chr2 (12-175)||(24908107-24908270)
chr2 (12-175)||(32039498-32039660)
chr2 (14-175)||(43137301-43137461)
chr2 (12-175)||(28577099-28577261)
chr2 (12-175)||(45029854-45030016)
chr2 (9-296)||(19671830-19672114)
chr2 (9-178)||(23103348-23103516)
chr2 (12-135)||(24529569-24529691)
chr2 (14-131)||(28405981-28406099)
chr2 (12-175)||(38967374-38967537)
chr2 (13-131)||(25175854-25175972)
chr2 (9-82)||(8946657-8946730)
chr2 (13-193)||(22799063-22799243)
chr2 (13-193)||(23019643-23019823)
chr2 (9-72)||(23040247-23040310)
chr2 (10-135)||(22134203-22134326)
chr2 (13-127)||(7679589-7679702)
chr2 (9-107)||(23071972-23072070)
chr2 (16-157)||(25616192-25616333)
chr2 (39-176)||(7687-7824)
chr2 (28-131)||(23207296-23207401)
chr2 (15-70)||(24643054-24643109)
chr2 (98-175)||(24642856-24642933)
chr2 (28-230)||(20520092-20520295)
chr2 (24-124)||(18786907-18787009)
chr2 (28-230)||(22413035-22413240)
chr2 (35-131)||(23004774-23004872)
chr2 (30-79)||(23287384-23287433)
chr2 (30-78)||(26392403-26392451)
chr2 (105-192)||(22459500-22459587)
chr2 (28-131)||(23791292-23791397)
chr2 (121-193)||(22758652-22758725)
chr2 (90-131)||(24697604-24697645)
chr2 (118-193)||(22740897-22740973)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (9-347)||(51913-52249)
scaffold0011 (9-347)||(167763-168099)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (12-347)||(339734-340065)
scaffold0003 (12-175)||(158450-158612)
scaffold0003 (58-128)||(71350-71418)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (9-294)||(2987-3271)
scaffold0540 (306-347)||(796-837)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (12-347)||(22886-23220)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (9-347)||(13211-13548)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (9-347)||(39858-40194)
scaffold0026 (9-327)||(25896-26213)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (9-343)||(39913-40246)
scaffold0080 (28-130)||(19883-19987)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (91-347)||(27912-28168)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (9-347)||(3470-3807)
scaffold0292 (9-343)||(343-676)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (9-343)||(1851-2184)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (9-343)||(8320-8650)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (9-347)||(833-1169)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (9-343)||(8479-8808)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (9-347)||(5905-6245)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (27-347)||(24085-24406)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (61-347)||(13144-13429)
scaffold0175 (9-124)||(34123-34238)
scaffold0175 (9-65)||(273-329)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (9-347)||(20910-21248)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (9-343)||(32746-33077)
scaffold0120 (9-343)||(45928-46259)
scaffold0120 (9-220)||(16113-16323)
scaffold0120 (9-70)||(17389-17450)
scaffold0120 (245-344)||(16323-16422)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (9-347)||(1952-2289)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (9-347)||(13497-13832)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (9-343)||(4849-5181)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (10-213)||(3103-3306)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (9-347)||(32067-32401)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (9-347)||(15249-15584)
scaffold0114 (13-77)||(7295-7359)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (9-347)||(10210-10544)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (147-347)||(124723-124922)
scaffold0021 (10-187)||(174767-174943)
scaffold0021 (9-78)||(121766-121835)
scaffold0021 (28-127)||(136370-136471)
scaffold0021 (28-127)||(145078-145179)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (169-347)||(10323-10501)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (9-347)||(4712-5049)
scaffold0358 (74-347)||(1-273)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (68-347)||(746-1021)
scaffold0395 (9-75)||(4888-4954)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (9-347)||(1289-1623)
scaffold0106 (9-347)||(7266-7600)
scaffold0106 (12-77)||(15291-15356)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (72-235)||(3424-3588)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (9-347)||(16282-16616)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (68-347)||(6669-6947)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (9-347)||(836-1170)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (30-347)||(4545-4861)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (9-347)||(51582-51916)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (146-347)||(1051-1251)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (168-347)||(3640-3818)
scaffold0165 (168-347)||(7704-7882)
scaffold0165 (24-215)||(27663-27855)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (12-347)||(4915-5246)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (28-347)||(51668-51985)
scaffold0034 (9-131)||(32538-32657)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (11-175)||(10772-10935)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (9-345)||(46995-47321)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (12-175)||(4694-4856)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (12-175)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (12-175)||(37821-37983)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (9-128)||(28414-28533)
scaffold0046 (9-124)||(11292-11407)
scaffold0046 (9-124)||(1997-2112)
scaffold0046 (9-62)||(4552-4605)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (12-175)||(94411-94573)
scaffold0023 (16-175)||(17440-17598)
scaffold0023 (12-172)||(44454-44614)
scaffold0023 (13-131)||(100378-100496)
scaffold0023 (13-131)||(40173-40291)
scaffold0023 (9-80)||(119875-119947)
scaffold0023 (13-216)||(38394-38596)
scaffold0023 (13-80)||(101503-101571)
scaffold0023 (117-216)||(23581-23679)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (201-347)||(20595-20740)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (12-224)||(16784-16995)
scaffold0142 (319-347)||(17090-17118)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (12-175)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (12-175)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (12-175)||(136680-136842)
scaffold0028 (12-175)||(139149-139311)
scaffold0028 (12-175)||(144087-144249)
scaffold0028 (12-175)||(134211-134373)
scaffold0028 (12-175)||(141618-141780)
scaffold0028 (11-131)||(62200-62317)
scaffold0028 (13-135)||(132662-132784)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (16-175)||(501088-501246)
scaffold0001 (12-215)||(85539-85742)
scaffold0001 (13-191)||(160688-160864)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (11-175)||(9241-9404)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (24-341)||(15887-16206)
scaffold0357 (28-313)||(13147-13435)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (188-328)||(17790-17929)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (12-175)||(82072-82234)
scaffold0037 (24-191)||(22610-22776)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (28-296)||(20259-20524)
scaffold0031 (9-176)||(128751-128917)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (12-155)||(116430-116571)
scaffold0022 (28-131)||(128968-129072)
scaffold0022 (35-131)||(78348-78445)
scaffold0022 (173-224)||(116579-116631)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (193-343)||(11301-11450)
scaffold0235 (9-126)||(11447-11564)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (10-175)||(11286-11450)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (12-175)||(106-268)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (12-175)||(40400-40562)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (10-175)||(12249-12413)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (12-215)||(161049-161252)
scaffold0007 (92-215)||(164550-164674)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (15-175)||(4300-4459)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (12-175)||(12064-12220)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (9-131)||(6535-6657)
scaffold0621 (24-191)||(8481-8650)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (12-215)||(2088-2291)
scaffold0247 (9-224)||(17932-18148)
scaffold0247 (300-347)||(6578-6625)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (12-175)||(4214-4377)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (9-191)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (9-191)||(38195-38377)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (13-131)||(19268-19386)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (26-175)||(29946-30094)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (24-191)||(10481-10647)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (13-131)||(2805-2923)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (268-343)||(163-238)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (13-191)||(45732-45909)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (21-191)||(129917-130086)
scaffold0010 (35-343)||(60500-60811)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (12-124)||(15664-15776)
scaffold0261 (13-98)||(1339-1424)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (15-175)||(1280-1440)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (12-191)||(38641-38820)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (66-296)||(225465-225694)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (13-191)||(133-310)
scaffold1984 (316-347)||(437-468)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (9-119)||(6134-6244)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (13-131)||(14696-14814)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (21-131)||(5655-5765)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (39-191)||(53488-53640)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (9-124)||(1075-1190)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (9-119)||(15788-15898)
scaffold0020 (13-76)||(178898-178961)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (9-117)||(6611-6719)
scaffold0333 (9-117)||(13991-14099)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (9-127)||(1037-1155)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (9-127)||(12766-12884)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (13-131)||(2644-2762)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (13-216)||(23843-24048)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (36-216)||(16264-16442)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (28-131)||(1051-1154)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (28-131)||(12587-12690)
scaffold0413 (245-347)||(15398-15500)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (24-131)||(10542-10649)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (13-131)||(1086-1204)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (13-115)||(23898-24000)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (21-124)||(6824-6927)
scaffold0556 (84-131)||(8090-8137)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (24-127)||(8075-8180)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (13-127)||(12943-13057)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (13-80)||(28818-28887)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (30-191)||(7998-8161)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (35-131)||(38342-38440)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (13-193)||(4741-4921)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (36-265)||(192850-193070)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (260-347)||(1860-1947)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (28-131)||(6281-6386)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (24-131)||(25121-25229)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (58-184)||(15362-15486)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (66-131)||(2217-2281)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (30-79)||(206575-206624)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (13-77)||(10575-10639)
scaffold0297 (13-73)||(15736-15796)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (13-76)||(36454-36517)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (121-227)||(32544-32650)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (28-131)||(97024-97129)
scaffold0006 (28-131)||(106302-106407)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (28-70)||(11982-12024)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (97-135)||(13092-13130)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (100-188)||(1169-1257)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (13-77)||(1881-1945)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (13-77)||(21856-21920)
scaffold0210 (13-77)||(29748-29812)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (13-77)||(14664-14728)
scaffold0081 (13-77)||(23679-23743)
scaffold0081 (13-77)||(39103-39167)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (28-127)||(569-669)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (24-127)||(103632-103737)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (28-131)||(267679-267784)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (13-216)||(26828-27027)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (13-115)||(29558-29660)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (90-131)||(1795-1836)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (13-77)||(6095-6159)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (13-77)||(69794-69858)
scaffold0004 (121-216)||(69905-70000)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078290
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 9078051  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078052 agtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9078151  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9078152 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggcac 9078251  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078252 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 9078290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529558
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  212 agattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactct 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| | ||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatcattaagtttcaatactaccccaaggttcaactctcaactactagtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctct 24529522  T
Q  312 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529523 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 24529558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421866
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25421631  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421632 attgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25421731  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  25421732 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcac 25421831  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25421832 tcggtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctct 25421866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096801
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatca 1096566  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1096567 aatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 1096666  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||     
T  1096667 cataggttataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggtccaacttttaacaacttgtgcgacagagatcgcaaaattctaaaaaggcat 1096766  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096767 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 1096801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493906
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagctt 24493767  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  24493768 cacagattataattaacatcattattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacac 24493867  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  24493868 tctgtttatgggttactcacgaggcgaaagcctctgctc 24493906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286626
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaa-catcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatc 8286865  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||  ||| |||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286864 aattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 8286765  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   || ||| || |||||||||| ||||||| ||    
T  8286764 tcacataatataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctcaacaactcaagcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtca 8286666  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286665 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 8286626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431728
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25431493  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||||||||| || | | |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25431494 attgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25431593  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  25431594 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgctacctcaaggttcaactctcaacaactcgtgtaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcac 25431693  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25431694 tcgatttctgggtcactcgcgaggtgagagcctct 25431728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095832
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13095693  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  13095694 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagtcac 13095793  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13095794 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagggcctctgctc 13095832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025648
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13025509  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  13025510 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaaatcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagtcac 13025609  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13025610 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagggcctttgctc 13025648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390284
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23390518  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23390517 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 23390418  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || || ||||||| |||||||||||    
T  23390417 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcacaaaatc-taacaaggcac 23390319  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  23390318 tctgttttagggtcactcgtgaggcgatagcctct 23390284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075356
Alignment:
Q  9 acatcatcat-cttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatc 22075117  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22075118 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 22075217  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||  || ||||||| |||| ||| || ||||||||   ||||||| ||    
T  22075218 tcacatattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa--ctaacaagtca 22075315  T
Q  308 ctctg-tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075316 ctctgttttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 22075356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 113 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21985931
Alignment:
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 212  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
Q  213 gattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctg 312  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  21986064 aattatagttaacatcatcatcaagtctgaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacactctg 21985965  T
Q  313 tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21985964 tttctgggtcactcgcgaggcgagggcctctgct 21985931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21292754
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatca 21292993  T
Q  109 a-atgcaagt-caacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 206  Q
    | || ||| | || |||||||| |  |||||||| ||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |    
T  21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaac 21292894  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggc 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||   |||||| |||| ||| || |||||||||| ||| ||| |    
T  21292893 ttcacagattataattaacctcattattaagtcttaatcctacccaagggtccaactcccgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taaaaagtc 21292795  T
Q  307 actctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292794 actctatttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 21292754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22412375  T
Q  212 agattataattaa 224  Q
    |||||||||||||    
T  22412376 agattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581028
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 210  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataa-caacatcaa-tcatcataaatcaacttca 11581165  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    |||||||| ||||| || || ||  | | || || ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| || |||||||||| |||  | ||| |    
T  11581164 cagattatcattaatattat-atataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtacgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcatt 11581066  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581065 ctgtaaatgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 11581028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22107356 - 22107157
Alignment:
Q  147 tcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatac 246  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22107356 tcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatac 22107257  T
Q  247 taccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 346  Q
    ||| | |||||||| |||| ||||||| |||| ||| || ||||||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107256 tactcaaaggttcatctctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaagt-atcacaaggcactctatttccgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 22107158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808343
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21808411  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacat 176  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21808410 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154615
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 36154748  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    || || || ||||| |  || ||  | | || || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||| |||  | ||| |    
T  36154747 catatcatcattaataatat-atataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcatt 36154649  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  36154648 ctgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctct 36154615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 21997556  T
Q  109 aatgcaagt 117  Q
    |||||||||    
T  21997555 aatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729018
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacat 176  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 21729018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732941
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcac 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 10732941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144384
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaac 225  Q
    |||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||| | || |||||     
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcatcattaat 22144266  T
Q  226 atcatcattaagtctt-aatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcac 324  Q
    ||||| |  || |||| | ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| |||  | ||| |||||  |||||  ||    
T  22144267 atcataaacaa-tcttcattacgactccaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcattctgtaactgggcaac 22144365  T
Q  325 tcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22144366 tcgcgaggcgagagcctct 22144384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245298
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 39245298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902049
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcat-caacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  20902073 tgcaagtcaacaacgtctcaattat 20902049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154654
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattat 2154654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319033
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  115 agtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 18319033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775675
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 10775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061231
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| ||   |||| | || |||||| ||||| |||||||||||    
T  31061167 gcaagtcaatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcaca 31061231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619557
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattat 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  38619533 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 38619557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565723
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724108
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    |||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || |||||||||  |    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
Q  115 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc--ttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 212  Q
    | ||| |||||||||||| || || |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||  |||||||||||||    
T  37724007 attcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaatta-aacattatatcacatcatattcaacactaacatctc-aaaacagcttcaca 37724104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  23 atcaacttagatcgactcatacagcttagttaaa-taacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 121  Q
    |||||||||||  ||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcatttgcaattca-c 18418690  T
Q  122 aacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataa 220  Q
    ||||||| ||| || |||| | |  ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18418691 aacatcttaat-attcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064634
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
Q  113 caagtcaa-caacatctcaattat 135  Q
    |||||||| |||| ||||||||||    
T  23064611 caagtcaatcaacgtctcaattat 23064634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20917952
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||      
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaa-- 20918014  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattataca-atcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
      ||||||||||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| || ||||  |||||||||||    
T  20918013 --aagtcaacaacgtctcaattattcacatc-taattcaagtaaagcatatataattatatcaca 20917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329500
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatc 21329520  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
     ||| ||||||| |||||||    
T  21329519 gaattcaagtcatcaacatc 21329500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766035
Alignment:
Q  75 cagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcac 174  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||  ||    
T  20766174 cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtacgac 20766086  T
Q  175 atcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766085 atcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067270
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
Q  115 agtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||| || | |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  24067209 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 24067270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959538
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||  |||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  112 gcaagtcaacaac 124  Q
    |||| ||||||||    
T  22959550 gcaaatcaacaac 22959538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatcc-aaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  125 atc 127  Q
    |||    
T  20026944 atc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660884
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 19660884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726069
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatc 40725951  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
      | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 40726051  T
Q  207 ttcacagattataattaa 224  Q
    ||||||||| || |||||    
T  40726052 ttcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502158
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatct 128  Q
     ||||||||||| || |||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatct 21502158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26012034
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatc 26012058  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||  | |||||||||||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaa 26012034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517174
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 17517221  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
     |||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17517220 cgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 17517174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669013
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatc 19668996  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     ||||||| ||||||||    
T  19668997 gaatgcaaatcaacaac 19669013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356488
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||  | ||| |||  ||  || |||||||||    
T  18356364 aacaacagcaacataggcagcatac--aaacagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgc 18356461  T
Q  158 ttataacattatatcacatcataatca 184  Q
     || ||||||||||||||| |||||||    
T  18356462 ataaaacattatatcacattataatca 18356488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873453
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | || |||||| | ||||||||||       
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatct 21873353  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 212  Q
    ||  |   |||||||| ||  || |||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||    
T  21873354 cattt---caacatcttaaccattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcaca 21873449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 131
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448126
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29448052 aacaacagcaacataggcagtatat-aaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 29448126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704139
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcag 26704139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973872
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcag 26973872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910801
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 128  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  20910869 aacaacagcaacatagacagcatac--aaacagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 20910801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178218
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||  ||||||  |||||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatat-aaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  22178224 atctcaa 22178218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806850
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagc 66  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagc 20806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  25 caacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 78  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 78  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 23201360 - 23201445
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacat 98  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||| |||||||    
T  23201360 catcatcttgttcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 23201445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23501472 - 23501403
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac 82  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| || |||||| ||||    
T  23501472 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcacaggcagaatac 23501403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18770054
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaatagcaacataggcag 18770054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50209996
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 50210234  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210233 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 50210134  T
Q  210 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  50210133 acagattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccaaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcact 50210034  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210033 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 50209996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510118
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  212 agattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||| | ||||||    
T  34509983 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaaccctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacatgacactct 34510082  T
Q  312 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34510083 gtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctctgctc 34510118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532607
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcc 22532368  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532369 attgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22532468  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  22532469 cacagttcataaataacatcatcattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctcaacagctcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaagtcac 22532568  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532569 tctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 22532607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250513
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 27250751  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  || | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27250750 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 27250651  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||  |||||||| ||    
T  27250650 cacagattataattaacctcttcattaagtatcaatgctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaat-ataacaagggac 27250552  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250551 tctgtttctgtgtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 27250513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21027017
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| |||  ||||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatca 21026779  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21026780 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagctt 21026879  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||  || ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  21026880 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 21026978  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026979 tttgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 21027017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135525
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcat 20135287  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 209  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| |||| | |  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20135288 gtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagcttc 20135387  T
Q  210 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||| || ||||| || | ||||||| ||||    
T  20135388 acagattataattaacaacatcattaggtcttactactaccctaaggttcaactctcaacaactcgtacaacaaaggtcgcataaacctaacaagtcact 20135487  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  20135488 ctgtttctgggttactcgcgaggtgagagcttctgctc 20135525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354360
Alignment:
Q  86 aacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaa 185  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  186 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacctaaaggttcaattctcaacaactcgtgcaacaaag 22354417  T
Q  286 ttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
     |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22354416 gtcgcaaaa-cctaacaagtcactctgtttctgggtcacttgcgaggcgagagcctct 22354360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433345
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||| |    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttta 433208  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaata-ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    ||||| || ||||| || ||   ||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||| |||  | ||| |    
T  433209 cagatcatcattaatattatttataa-tattcatagctaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcatt 433307  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
     ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433308 ttgcaactgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 433345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468604
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 209  Q
     ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  210 acagattataatta 223  Q
    ||||||||||||||    
T  22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22356158 - 22355958
Alignment:
Q  147 tcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaata 245  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22356158 tcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 22356059  T
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaa-ggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctg 344  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || || ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  22356058 ctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtctcaaaatc-taacaatgtcactctgtttctaggtcactcgcgatgcga-agcctctg 22355961  T
Q  345 ctc 347  Q
    |||    
T  22355960 ctc 22355958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22357844 - 22357644
Alignment:
Q  147 tcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaata 245  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22357844 tcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 22357745  T
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaa-ggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctg 344  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || || ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  22357744 ctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtctcaaaatc-taacaatgtcactctgtttctaggtcactcgcgatgcga-agcctctg 22357647  T
Q  345 ctc 347  Q
    |||    
T  22357646 ctc 22357644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801179
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |   |||| || |||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgc---aacagcaagacataattatatc 38801413  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||| | |  |||||||| ||   ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||    |||||| || | ||| || |||||||||| ||||||| ||    
T  38801313 tcacaaattatagttaatctcattattaagtcttaatcctacccaagggttcaacttccgacaactcgtacaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtca 38801215  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38801214 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctct 38801179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840929
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 21840864  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21840865 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574842
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacca 45574909  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  45574908 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362095
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaa 16362013  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  16362014 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212821
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13212929  T
Q  109 aatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |    
T  13212928 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcaac 13212830  T
Q  207 ttcacagat 215  Q
    |||||||||    
T  13212829 ttcacagat 13212821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275363
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||   | || |||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcaca 16275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20847161 - 20847003
Alignment:
Q  189 caacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagtt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||  || ||||||| |||| ||| || |    
T  20847161 caacacatctttaaacagcttcatagattatggttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggt 20847062  T
Q  288 cgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20847061 cgcaaaatct-aacaagtcactctgtttctgggtcactcgcgaggcaagagcctctgctc 20847003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347161
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21347158  T
Q  210 aca 212  Q
    |||    
T  21347159 aca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342296
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataata 105  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 21342188  T
Q  106 tcaaatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-c 203  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||| ||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |    
T  21342189 tcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatc 21342287  T
Q  204 agcttcaca 212  Q
    |||||||||    
T  21342288 agcttcaca 21342296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707329
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaat-agtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  21707266 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21707329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711871
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaat-agtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  21711808 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21711871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 225
Target Start/End: Original strand, 48603651 - 48603730
Alignment:
Q  146 ctcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 225  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603651 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 48603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataata 105  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 15860079  T
Q  106 tcaaatgcaagtcaa 120  Q
    | |||||||||||||    
T  15860078 ttaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758938
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  121 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 219  Q
    ||||||| |||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| ||     
T  16758763 caacatcacaa-cattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatc 16758861  T
Q  220 attaacatcatcattaagtctt-aatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatc 296  Q
    ||||| ||||| |  || |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  16758862 attaatatcataaacaa-tcttcattacgaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatc 16758938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847173
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||  ||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatca 20847176  T
Q  109 aat 111  Q
    |||    
T  20847175 aat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754170
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 21754150  T
Q  115 agtcaacaacatctcaattat 135  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21754151 a-tcaacaacatctcaattat 21754170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123067
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||    ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22123067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681188
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260866
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   |    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---t 35261085  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaac 225  Q
    |||||  || ||  ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||| || | |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||  ||||     
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcacatattatcgttaat 35260985  T
Q  226 atcatcattaagtct-taatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaa-caaggcactctgtttctgggtca 323  Q
    ||||| ||  | |||  | ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||| ||| ||||| | | |||  |||||  |    
T  35260984 atcat-atacaatctccattactaccccaatgttcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaagcaaggtattttgtaactgggaaa 35260886  T
Q  324 ctcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  35260885 ctcgcgaggcgagggcctct 35260866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921868
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaa 22921868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896195
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||||  || ||   |||| ||| ||||||  ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 21896195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatca 190  Q
    |||||  || ||   |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389317
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
Q  115 agtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||| || | |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  40389256 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 40389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295557
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaac 14295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21788159 - 21787979
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||   || | |||| |||||| |  ||||||||| |     
T  21788159 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaattt 21788060  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21788059 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaaca 21787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237773
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatg 156  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 22237773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918782
Alignment:
Q  25 caacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  124 catctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
       ||||||||| ||| | ||| ||| ||||||  ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20918719 ---ctcaattat-caaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaa 20918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248394
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  112 gcaagtcaacaac 124  Q
    |||| ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714754
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataata-----atatc 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||  ||||||| |||     |||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacatcatataacgatatc 21714645  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc--ttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 205  Q
    ||||  ||   | |||||||||||| || || |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || | |||||    
T  21714646 aaataaaaacaagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaatta-aacattatatcacatcatattcaacactaacatctcat-aacag 21714743  T
Q  206 cttcacagatt 216  Q
    |||||||||||    
T  21714744 cttcacagatt 21714754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614114
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  50614120 atctcaa 50614114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621942
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  50621948 atctcaa 50621942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41050033
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 125  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||  ||| |  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  126 tctcaa 131  Q
    ||||||    
T  41050038 tctcaa 41050033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22130978 - 22130850
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||   ||||||||| ||| | ||| ||| |||||||    
T  22130978 aacaacagcaacataggcagtat-ccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattat-caaacttaagtcatgtaatgc 22130884  T
Q  158 ttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
     ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22130883 atatacaattatataacattataagcaacatcaa 22130850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797694
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  | ||| |||  |   || |||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatac--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattcttaagtaatgc 33797667  T
Q  158 ttataacattatatcacatcataatca 184  Q
     || ||||||||||||||| |||||||    
T  33797668 ataaaacattatatcacattataatca 33797694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927993
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 52927993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368284
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 16368291  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  16368290 atctcaa 16368284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865266
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcag 42865266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161778
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaaca 70  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca 21161778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 224
Target Start/End: Original strand, 21477654 - 21477732
Alignment:
Q  147 tcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 224  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  21477654 tcaagtaatgcgtatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 21477732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 26065176 - 26065274
Alignment:
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa-tcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  || ||||||| | |||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  26065176 ctaccccaaggataaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgcaaaaccctaaacaaggtattctgtaactgggcaactcgcgaggcgagagcctct 26065274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 347
Target Start/End: Original strand, 33681301 - 33681347
Alignment:
Q  301 caaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33681301 caaggcactctgtaactgggtaattcgcgaggcgagagcctctgctc 33681347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20594111
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 20593872  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593873 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20593972  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20593973 cacagattataattatcattatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggcac 20594072  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20594073 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 20594111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629138
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatca 25629377  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629376 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 25629277  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  25629276 cacagattataattaacaacatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaactcgtgcaacaaaagtcgcaaaatcctaacaaggcac 25629177  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629176 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 25629138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060874
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 29060639  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060640 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 29060739  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29060740 cacagattataattaatatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcagctcttagcaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcac 29060839  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060840 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 29060874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303324
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 19303563  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagctt 19303463  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19303462 cacagattataattaacatcatcattaattctcagtgctaccccaaggttcaactcttagcaacttgtgcgacatagatcgcaaaatcctaacaaggcac 19303363  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19303362 tctgtttctgggtcactctcgaggcgagagcctctgctc 19303324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409610
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaa 18409848  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409847 atgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18409748  T
Q  210 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  18409747 acatattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccctaaggttcaactctcaataactcgtgcaacaaaggtcgtaaaatcctaacaaggcact 18409648  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18409647 ctgtttctgggtcactagagaggcgagagcctctgctc 18409610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360744
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatca 20360982  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20360981 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 20360882  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  20360881 cacatattataattaacctcatcattaagtcttaatactacccaaaggttcaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagtcac 20360783  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20360782 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctcagctc 20360744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638067
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 20638305  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| | | ||||||||  | ||| ||| |||   ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638304 attgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20638205  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  20638204 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcac 20638106  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20638105 tctgtttctgggtcactcgcgaggtgagagcctttgctc 20638067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780012
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatca 22780249  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780248 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22780149  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| || || ||||| | ||||| | |||    
T  22780148 cacagattatgattaacatcatcattaagtctttatactaccccaaggttcaactctcggcaacttgtgcaacaaaggtcacaaaa-cctaacaggacac 22780050  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 346  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22780049 tctgtttctaggttactcgcgaggcgagagcctttgct 22780012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287584
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatca 17287818  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17287817 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagctt 17287718  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || | || ||| | ||||||| |||    
T  17287717 cacaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaagatagc-aaaccctaacaagacac 17287619  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  17287618 tctgtttctgggtcactcacgagacaagagcctct 17287584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920417
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatc 16920655  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| | | ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  16920654 aaattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagct 16920556  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||  | || | |||| ||| || ||||||||||  |||||| ||    
T  16920555 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgagaaatcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-caacaagtca 16920457  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16920456 ctttgtttctgggtcactcgcaaggcgagagcctctgctc 16920417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831839
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |   |||  ||||||||||| |||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttc---aacgacatgacataatcatatc 22831599  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctca-at-tatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 205  Q
    |||| ||| ||| |||||||| | || ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||    
T  22831600 aaattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcag 22831698  T
Q  206 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaagg 305  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  | |||||||||| |||||| | |||||||||||  || | | |||||||| || ||||||||||  ||||||     
T  22831699 cttcacagattatagttaacctcattctcaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgacgaatcgtgcgacaaaggtcgcaaaatc-caacaagt 22831797  T
Q  306 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831798 cactctgtttctcggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 22831839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076863
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacat 176  Q
    ||||||| ||||||   ||| ||  || |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20076799 aatgcaaatcaaca---tcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496411
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 16496343  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacat 176  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16496344 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 16496411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18457049
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
Q  128 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaaca 226  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || ||||| |    
T  18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaata 18456932  T
Q  227 tcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaat-cttaacaaggcactctgtttctgggtcac 324  Q
    | || ||  | | || || ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||  |||||   ||||  ||    
T  18456933 ttat-atataatattcataactgccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctgaacaaggc-ttctgtaattgggcaac 18457030  T
Q  325 tcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18457031 tcgcgaggcgagagcctct 18457049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644607
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  123 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 221  Q
    |||||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||  |||| || | ||||||||||||| || ||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcat 25644534  T
Q  222 taacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa 294  Q
    ||| ||||| ||  | |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||    
T  25644535 taatatcat-atataatctttataactaccccaaggttcaactctcagcaactcgtgcgacaaagatcgcaaaa 25644607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 30676776  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30676775 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540911
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 1540911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 34963469  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34963470 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595711
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcaca 1595711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656791
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||   |||| |||| |||| | ||||  |||||||||||    
T  25656728 gcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcaca 25656791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688624
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattat 25688624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25603467 - 25603223
Alignment:
Q  47 cttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataac 146  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||  |  || ||| | ||||||||||||| |||| | |      
T  25603467 cttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaattattcaataaaact 25603369  T
Q  147 tcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatac 246  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||  |    
T  25603368 tcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacagattctattaaacatcgtcattaagtcttaaagc 25603269  T
Q  247 taccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaa 292  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||    
T  25603268 tacccaaaggttcaactctaagcaactcatgcgacacagatcgcaa 25603223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556894
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctcaatttcaca--tataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20556894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448526
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  115 agtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 16448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
Q  128 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 162  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18821731 - 18821603
Alignment:
Q  218 taattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttct 317  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18821731 taattaatatcatattcaagtcttaatgctaccccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatct-aacaagtcactctgtttct 18821633  T
Q  318 gggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18821632 gggtcgctcgcgaggcgagagcctctgctc 18821603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25611805 - 25611507
Alignment:
Q  47 cttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataac 146  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||  |  || ||| | ||||||||||||| |||| | |      
T  25611805 cttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaattattcaataaaact 25611707  T
Q  147 tcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatac 246  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| |||||||||| |||  |    
T  25611706 tcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcatagattctgttaaacatcgtcattaagtcctaaagc 25611607  T
Q  247 taccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 346  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||||| |||| || || | |||| ||||||||||   |  |  |||||||||||||||||||||||    
T  25611606 tacccaaaggttcaactctaagtaactcatgcgacacagatcgc-aagtcctcacaatgcactctgttctagactagctcgcgaggcgagagcctctgct 25611508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041430
Alignment:
Q  36 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||   || | |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  136 acaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 235  Q
     |||| | | ||||||||||||  ||| ||||| | || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  15041544 tcaataaaatctcaagtaatgcacata-cattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagattgtatctaacatcatcatta 15041446  T
Q  236 agtcttaatactaccc 251  Q
     |||| | ||||||||    
T  15041445 ggtctcattactaccc 15041430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227367
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 8227534  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
      | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 8227434  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaact 273  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||| | || || ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8227433 ttcacagatcatcattaatattataattaa-tattcataactaccctaaggttcaactctcaacaact 8227367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109322
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||| ||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacataatataacaatatc 20109236  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185839
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcat 11185620  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaaca 226  Q
    ||    ||||||| |||   ||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||   |||||     
T  11185621 cttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aactttataacacttcataatcagcaacaacatatcttattcatcttcacagattacggttaacc 11185719  T
Q  227 tcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactc 326  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| | ||| | |  ||  |||||   ||| ||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11185720 tcactattaagtcttaatcctacccaagggtccgatcctcgacaacccatgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactatgtttctgggtcactc 11185818  T
Q  327 gcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  11185819 acgaggcgagggcctctgctc 11185839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 184
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245758
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatatc 35245682  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatca 184  Q
    || | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  35245683 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496477
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808888
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821782
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cat 126  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| || ||||| |||||| |||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcat 18821849  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcat-aatcaacatcaaca 193  Q
    ||||||||| || | | |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaaca 18821782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652316
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaa 19652316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333241
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393981
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019528
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 23019504  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 23019528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca 70  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561418
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     ||||||| ||||||||    
T  1561402 gaatgcaaatcaacaac 1561418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5834436 - 5834367
Alignment:
Q  191 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttca 260  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5834436 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtcccaatactaccccaaggttca 5834367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 20177096 - 20177165
Alignment:
Q  191 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttca 260  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20177096 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtcccaatactaccccaaggttca 20177165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22158895 - 22158826
Alignment:
Q  191 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttca 260  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22158895 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtcccaatactaccccaaggttca 22158826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098518
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||  ||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgc-aaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaa 9098522  T
Q  121 caac 124  Q
    ||||    
T  9098521 caac 9098518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 127
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  121 caacatc 127  Q
    |||||||    
T  19668485 caacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847997
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| ||  |||||| ||||||||     
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaat 19848015  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatct 128  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  19848014 tgcaattcaacaatatct 19847997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185827
Alignment:
Q  21 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtca 119  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 4185832  T
Q  120 acaac 124  Q
     ||||    
T  4185831 tcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992572
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 23992528  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    ||||| |   |||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  23992529 tgcaatt---caacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 23992572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415943
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  27416011 aacaacagcaacataggcagcatac--aaacagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatct 27415943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443119
Alignment:
Q  30 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtata 81  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtata 33443119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080799
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaa 56  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 77
Target Start/End: Original strand, 21766718 - 21766759
Alignment:
Q  36 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21766718 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155465
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16965261 - 16965190
Alignment:
Q  179 taatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccc 251  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  16965261 taataaacatcaacatgtcttaaacagctt-acagattgtatttaacatcatccttaggtattattactaccc 16965190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 294
Target Start/End: Original strand, 18453419 - 18453467
Alignment:
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa 294  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18453419 ctaccccaaggatcaactcataacatcttgtgcgacaaagatcgcaaaa 18453467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873184
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 19873184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25642196 - 25642120
Alignment:
Q  118 caacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataa-cattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    ||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25642196 caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 25642120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31164807 - 31164727
Alignment:
Q  171 tcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccc 251  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||   |||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  31164807 tcacatcctaattagcatcaaaacatcttaaacagctttacaaattatctctaacatcaacattaggtctcactactaccc 31164727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973192
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 14972953  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972954 aatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 14973053  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  14973054 catagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttagcaacttgtgcgacacaaatcgcaaaatcctaacaaggcac 14973153  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14973154 tctgtttctgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctc 14973192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213504
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  212 agattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  40213639 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttaaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactct 40213540  T
Q  312 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213539 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 40213504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438872
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 18438633  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18438634 aatgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagctt 18438733  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  18438734 cacagattatagttaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacactcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacac 18438833  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438834 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 18438872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476172
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 25476407  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25476406 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 25476307  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  25476306 cacagattgtaattaacatcctcattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcac 25476207  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476206 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 25476172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442611
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13442373  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442374 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13442473  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13442474 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgtcatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcac 13442572  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442573 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 13442611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576620
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtataa-acaacagcatgacataataatatcaattg 14576851  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 212  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14576850 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 14576751  T
Q  213 gattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||    
T  14576750 gattataattaacatcatcattaaatcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactttg 14576651  T
Q  313 tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14576650 tttctaggtcactcgcgaggcgagagcctct 14576620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17488194
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17487955  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17487956 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17488055  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  17488056 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcac 17488154  T
Q  309 tctg-tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488155 tctgttttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 17488194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083149
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 23083383  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| ||||  ||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23083382 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagctt 23083283  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  23083282 cacagattgtaattaacatcatcactaagtcttaatactacctcaaggttcaactctgaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagacac 23083184  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23083183 tatgtttctgggtcattcgcgaggcgagagcctct 23083149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698220
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatca 20698457  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| |  ||| |||  ||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20698456 attgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagctt 20698358  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  20698357 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaattctatccaaaggttcaactctcgacaactcgtgccacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 20698259  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698258 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 20698220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687224
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 26686986  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| | || |||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686987 attgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 26687086  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||| ||| || ||| |||| | ||||||| |||    
T  26687087 cacagattataattaacatcctcattaagtcccaatactaccccaaagttcaactctcaacgattcgtgcaacaaaggtcgtaaaa-cctaacaagacac 26687185  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687186 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 26687224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424550
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatca 11424782  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |  |||| ||||||   |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11424781 atagcaaatcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagctt 11424685  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  11424684 cacagattaaaattaacatcaacattaagtctcaatactaccccaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacac 11424585  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11424584 tctgtttctaggtcgctcgcgaggcgagagcctct 11424550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499676
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17499437  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17499438 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17499537  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  17499538 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcac 17499636  T
Q  309 tctg-tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17499637 tctgttttctaggtcactagagaggcgagagcctctgctc 17499676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841269
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 43841031  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841032 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 43841131  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||  ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  43841132 cacagattataattaacatcctcgttaagtcccaatactaccccaaagtcaaactctcaacaactcgtgtaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagacac 43841230  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43841231 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagggcctttgctc 43841269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 343
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14572922
Alignment:
Q  22 catcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 121  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  122 aacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 221  Q
    ||||||| || ||| |||| |||  |||| |||||   | |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14572701 aacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataat 14572800  T
Q  222 taacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||    
T  14572801 taacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaggtactctgtttctaggt 14572900  T
Q  322 cactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14572901 cactcgcgaggcgagagcctct 14572922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 296
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386698
Alignment:
Q  27 acttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 225  Q
    ||||| ||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  226 atcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatc 296  Q
    ||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42386628 atcataaacaagtcccaatactaccccaaggttcaactcacaacaactcgtgcgacaaagttcgcaaaatc 42386698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399537
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 12399308  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12399309 aatgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagctt 12399408  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||| |||| | ||  |  ||||||| |||| ||| || ||| ||||   ||||||| ||     
T  12399409 cacagattatagttaacctcttcattatgtcttaatgctacccaaaggcttaatccccaacaactcgtgcaacaaaggtcggaaaa--ctaacaagtca- 12399505  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcct 341  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12399506 -ctgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcct 12399537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24153128  T
Q  212 agattataattaa 224  Q
    |||||||||||||    
T  24153127 agattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 16796684 - 16796875
Alignment:
Q  146 ctcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaata 245  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||     
T  16796684 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttcattaagtcttaatg 16796783  T
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagag 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16796784 ctacccaaaggttcaactcttaacaattcgtgcaacaaaggtcgcaaagtc-tcacaaggcactctgtttccgggtcactcgcgaggcgagag 16796875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 347
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30030176
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 123  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||| | |||| |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
Q  124 catctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 223  Q
    | ||| || ||| |||| | |  ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttcacatattatattaa 30030053  T
Q  224 acatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctggg-tc 322  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |     
T  30030054 acatcatcattaagtcttaaagctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcattctg-ttctgggatt 30030151  T
Q  323 actcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30030152 actcgcgaggcgagagcctctgctc 30030176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172567
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |  |||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaa 29172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 13544122  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13544123 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166739
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070485
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  128 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaaca 226  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||   ||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| || || ||||| |    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatctaa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacaaatcatcattaata 53070602  T
Q  227 tcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaat-cttaacaaggcactctgtttctgggtcac 324  Q
    | || ||  | | || || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||  |||||   ||||  ||    
T  53070601 ttat-atacaatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaaggc-ttctgtaattgggcaac 53070504  T
Q  325 tcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||    
T  53070503 tcgcgaggcgagagcctct 53070485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848611
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 28848611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469134
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||   |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcaca 6469134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446655
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   || | ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618650
Alignment:
Q  23 atcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  123 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataat 221  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  21618558 acatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcat 21618647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550478
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatca 43550545  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  43550544 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 43550478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
Q  14 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
Q  114 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977637
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaattat 15977637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  112 gcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||||||||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
Q  14 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
Q  114 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340579
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgc-acaacatcatgatataataatatc 24340746  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 24340646  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaact 273  Q
    ||||||||| || ||||| ||  | | ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24340645 ttcacagatcatcattaatattgtaaataa-tattcataactaccccaaggttcaactctcaacaact 24340579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119684
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||   ||||   || |||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  12119788 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 12119690  T
Q  210 acagat 215  Q
    ||||||    
T  12119689 acagat 12119684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412552
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattat 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  15412528 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 15412552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  112 gcaagtcaa 120  Q
    |||||||||    
T  8499617 gcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 225
Target Start/End: Original strand, 14179569 - 14179648
Alignment:
Q  146 ctcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 225  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179569 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 14179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103960
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||  |||||  ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatat-caaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274973
Alignment:
Q  27 acttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 125  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  126 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaa-acagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||| ||| ||   |||| |||||||| |  ||||  |||| ||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||||| || |||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagcttcacagatcatcattaa 23274903  T
Q  225 catcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa 294  Q
     || || ||||| | || || |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23274904 tattataattaa-tattcataactatcccaaggctcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaa 23274973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523561
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  125 atctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatta 223  Q
    |||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || ||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa-tcatcttataacagcttctcagatcatcatta 52523634  T
Q  224 acatcatcattaagtctt-aatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatc 296  Q
    | ||| | ||  | |||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||| || ||||||||||    
T  52523633 atatc-ttatacaatcttcattactaccccaaagttcaactctcaatgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatc 52523561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210333
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     ||||||| ||||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307802
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 32307782  T
Q  115 agtcaacaacatctcaattat 135  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  32307783 a-tcaacaacatctcaattat 32307802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494908
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaat 44494907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471046
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatctcaa 15471046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097509
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||| |||||| |||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557104
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaa 131  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  10557084 gcaagccaatcaacatctcaa 10557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165429
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| ||||| |||  |||||||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| ||   |||| | ||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301562
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  111 tgcaagtca 119  Q
    |||||||||    
T  53301570 tgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234605
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatc 14234605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174205
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacat 188  Q
    ||||   ||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatat-caaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 12174205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642170
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 37642288  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
      | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 37642188  T
Q  207 ttcacagattataattaa 224  Q
    ||||||||| || |||||    
T  37642187 ttcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822413
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 46822366  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  46822367 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 46822413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668071
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T
Q  112 gcaagtcaac-aacatctcaattat 135  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||    
T  49668094 gcaa-tcaacaaacatctcatttat 49668071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511205
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 12511158  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  12511159 tgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgc 12511205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737337
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta---tacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||   ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatactacaacaacagcatgacataataatatca 17737334  T
Q  109 aat 111  Q
    |||    
T  17737335 aat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2051239 - 2050986
Alignment:
Q  90 tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatc 189  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  2051239 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatc 2051140  T
Q  190 aacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctt-aatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagtt 287  Q
    ||  ||||||| | |||||||||| || || ||||| ||||| |  || |||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||| || |    
T  2051139 aa-tcatcttatagcagcttcacaaatcatcattaatatcataaacaa-tcttcattacgacctcaatgttcaactctcaacaactcatgcgacaaagat 2051042  T
Q  288 cgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||| |||  | ||| | |||  |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2051041 cgcaaaatcctaaacaagcattttgtaactgggcaactcacgaggcgagagcctct 2050986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513026
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T
Q  112 gcaa 115  Q
    ||||    
T  9513023 gcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9521001
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T
Q  112 gcaa 115  Q
    ||||    
T  9520998 gcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17248168 - 17248069
Alignment:
Q  248 accccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaat-cttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 346  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||| || |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248168 accccaaggtttaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaattctaaacaag-cattctgtaactgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 17248070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251165
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  37251171 atctcaa 37251165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926082
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  43926076 atctcaa 43926082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacatag 73  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577947
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacag 65  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644670
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||| ||| |||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcattatataacaatatcgaatacaa 1644689  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattat 135  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  1644688 -tcaacaatatctcaattat 1644670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378039
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||  ||| |  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110349
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  22110355 atctcaa 22110349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147431
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||| || ||| |||| |||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 22147548  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
      | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| |||| ||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagc 22147449  T
Q  207 ttcacagattataattaa 224  Q
    ||||||||| || |||||    
T  22147448 ttcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665460
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacata 72  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacata 14665460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Original strand, 36166747 - 36166799
Alignment:
Q  173 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  36166747 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668616
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacata 72  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 14668616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  30 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 79  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 282
Target Start/End: Original strand, 12339980 - 12340024
Alignment:
Q  238 tcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgaca 282  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12339980 tcttcatactacccaaaggttcaactctcaacaactcgtgcgaca 12340024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14878633 - 14878569
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14878633 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 14878569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878104
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 15878104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17525275 - 17525211
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17525275 catcattttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggcag 17525211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39814
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 39677  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactc 310  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  39678 tagattataattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctgacaaggcactc 39777  T
Q  311 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39778 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 74998
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 75135  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactc 310  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  75134 tagattataattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctgacaaggcactc 75035  T
Q  311 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75034 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 74998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759594
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataata 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 6759354  T
Q  106 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-ca 204  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6759355 tcaaatgcaagtcaaca---tctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaaca 6759451  T
Q  205 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  6759452 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttagcaacttgtgcgacacagattgcaaaatcctaacaag 6759551  T
Q  305 gcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759552 acactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 6759594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648827
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 28649065  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649064 atgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 28648965  T
Q  210 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  28648964 acatattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcact 28648865  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  28648864 ctgtttctgggtcatgcgcaaggcgagagcctctgctc 28648827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092124
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 16092364  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16092363 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaact 16092264  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  16092263 tcgcatattataattaacatcatccttaagtctcaatattaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgtgacacagatcgcaaaatcctaacagggca 16092164  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16092163 ctctgtttctgggtcactcgggaggcgagagcctctgctc 16092124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875403
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 22875163  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagct 22875263  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||| ||    
T  22875264 tcacagattataattaacatcaccattacatctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacatagatcgcaaagccctaacaagtca 22875363  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875364 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 22875403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818193
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 18818431  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | || ||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818430 attgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 18818331  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  18818330 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccctaaatttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagacac 18818232  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818231 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 18818193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22627073
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 22626834  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||| ||| |||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 22626934  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  22626935 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacac 22627034  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22627035 tctgtttctagatcactcgcgaggcgagagcctctgctc 22627073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923712
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatca 21923950  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21923949 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 21923850  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | || ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  21923849 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactacctcaaggttcaactctcaactactcgggcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaaggcac 21923751  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923750 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 21923712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536541
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 20536307  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20536308 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaactt 20536407  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||| || |||||||| | ||| ||| |||    
T  20536408 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaggttcaacactcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaataagtcac 20536506  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536507 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 20536541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879021
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatca 18879258  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  18879257 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagctt 18879159  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  18879158 cacagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggccgcaaaatc-taacaaggcac 18879060  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879059 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 18879021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406714
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23406478  T
Q  109 aatgcaagtcaac--aacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 206  Q
    | |||||||||||  | ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23406479 attgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaac 23406578  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggc 306  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||| |||||||||| || |||| |||| ||| || || ||||| | |||||||||    
T  23406579 ttcacatattataattaacatcctcattaagtcccaatattatcccaaagttcaactctcaataactcgtgcaacaaaggtcacaaaa-cctaacaaggc 23406677  T
Q  307 actctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406678 actctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 23406714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7373088
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7372877  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372878 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc--------ttatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 7372969  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  7372970 cacagattataattaacatcctcattaagtctcactaccaccccaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagacac 7373068  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgc 328  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7373069 tctgtttctgggtcactcgc 7373088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918784
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 21919022  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaa-tcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| ||| | ||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21919021 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagct 21918923  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||  ||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||||| ||    
T  21918922 tcacagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaatcttacccaagggttcaactctcgacaactcatgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtca 21918824  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918823 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 21918784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648888
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcat 23648653  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 209  Q
     |||||  ||||||||||| || ||| |||| | |  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23648654 ttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctta 23648753  T
Q  210 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||| || | ||||||| ||||    
T  23648754 acagattataattaacatcatcattaggtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcataaacctaacaagtcact 23648853  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctg 344  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23648854 ctgtttctgggttactcacgaggcgagagcctctg 23648888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971592
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  31971356 attccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatctt 31971454  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  31971455 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcagctctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 31971553  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  31971554 tctatttctgggtcgctcgcgaggtgacagcctctgctc 31971592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45130793
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatca 45131020  T
Q  109 aatgcaagt-caacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    | | ||| | || |||||||| |  |||||||| ||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagct 45130921  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||| ||| ||    
T  45130920 tcacagattataattaacctcattattaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taataagtca 45130822  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130821 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgag 45130793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199430
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatc 16199668  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || | ||| ||| | |||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16199667 aatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagct 16199569  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||||||||  || ||| ||    
T  16199568 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-caataagtca 16199470  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16199469 ctctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcgtctgctc 16199430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25363124 - 25362924
Alignment:
Q  146 ctcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaata 245  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  25363124 ctcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaata 25363025  T
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgc 345  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | || ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25363024 ctacccaaaggttcaactctcaacaactcgtgcaagaaaggtcgcaaagtc-tcacaaggcactctgtttccgggtcactctcgaggcgagagcctctgc 25362926  T
Q  346 tc 347  Q
    ||    
T  25362925 tc 25362924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598522
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 41598385  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    ||||| || ||||| || || ||  | | || || ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || || |||||||||| |||  | ||| |    
T  41598386 cagatcatcattaatattat-atataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcggcaaagatcgcaaaatcctaaacaagcatt 41598484  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598485 ctgtaactaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 41598522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046195
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20046195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219918
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttca 26219904  T
Q  211 cagattataattaa 224  Q
     ||||||| |||||    
T  26219905 tagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389353
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
Q  208 tcacagattataattaacatcat 230  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||    
T  21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542373
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaag-atacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4542373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395888
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21395906  T
Q  208 tcacagattataattaac 225  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21395905 tcacagattacaattaac 21395888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790381
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21790399  T
Q  208 tcacagattataattaac 225  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21790398 tcacagattacaattaac 21790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgac---ataataatatca 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||| ||||||   ||||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225268
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-caatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 155  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778697
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21778702  T
Q  208 tcaca 212  Q
    |||||    
T  21778701 tcaca 21778697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224041
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || ||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 26224015  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26224016 atgcaagtcaacaacatctcaattat 26224041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855250
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaa 38855250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13507920
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
Q  115 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaa-acagcttcacag 213  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||| |||||||    
T  13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagtttcacag 13508001  T
Q  214 attataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa 294  Q
    || || ||||| || || ||||| | || || |||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  13508000 atcatcattaatattataattaa-tattcataactatcccacgattcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaa 13507920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520486
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatc 6520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597452
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgc-aaaacatcatgatataataatatcgaacgca 13597633  T
Q  115 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaa-acagcttcacag 213  Q
    ||| ||||||||| ||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||| |||||||    
T  13597632 agtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagtttcacag 13597533  T
Q  214 attataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa 294  Q
    || || ||||| || || ||||| | || || |||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  13597532 atcatcattaatattataattaa-tattcataactatcccacgattcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaa 13597452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  128 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataa-caacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937046
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataata 105  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataaga 19937076  T
Q  106 tcaaatgcaagtcaa-caacatctcaatta 134  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19937075 tcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaatta 19937046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070681
Alignment:
Q  25 caacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caa 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaa 15070669  T
Q  124 catctcaattat 135  Q
    | ||||||||||    
T  15070670 cgtctcaattat 15070681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| |        |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866280
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141019
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatc 17141014  T
Q  108 aaatg 112  Q
     ||||    
T  17141015 gaatg 17141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491110
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||     
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatt 21491093  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  21491094 gaatgtaaatcaacaac 21491110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290734
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 45290755  T
Q  116 gtcaa-caacatctcaattat 135  Q
    | ||| |||| ||||||||||    
T  45290754 gccaatcaacgtctcaattat 45290734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285719
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatctcaa 21285719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17611969
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 17612133  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
      | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||   ||||||||  |||| |||| ||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattata---aacatcaaatcatcataaatcagc 17612036  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaact 273  Q
    ||||||||| || ||||| ||  | | ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17612035 ttcacagatcatcattaatattgtaaataa-tattcataactaccccaaggttcaactctcaacaact 17611969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678075
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 18678122  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  18678121 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 18678075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121880
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| ||||||||     
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 32121833  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32121834 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 32121880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760843
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||| |||||  |||    
T  23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgatataacaatattgaat 23760863  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  23760862 tcaaatcaacaacatctcaa 23760843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355699
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||| || |||| |||||| |||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctca 130  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctca 26355699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaa-aacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 121  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  122 aacatc 127  Q
    ||||||    
T  983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498744
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgt-aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||||  || ||   |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 20498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673826
Alignment:
Q  21 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 21673814  T
Q  120 acaacatctcaa 131  Q
    ||||||||||||    
T  21673815 acaacatctcaa 21673826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249500
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaat--aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatat 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||| | ||  |||||||| ||||||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgc-aattcatcatgatataataatat 21249482  T
Q  107 caaatgcaagtcaacaac 124  Q
    | |||| || ||||||||    
T  21249483 cgaatgtaaatcaacaac 21249500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255338
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaat--aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatat 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||| | ||  |||||||| ||||||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgc-aattcatcatgatataataatat 21255320  T
Q  107 caaatgcaagtcaacaac 124  Q
    | |||| || ||||||||    
T  21255321 cgaatgtaaatcaacaac 21255338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23776952 - 23776772
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||   || | | || |||||| |  ||||||||| |     
T  23776952 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaattt 23776853  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23776852 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaaca 23776772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116471
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  37116465 atctcaa 37116471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353843
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataata-----atatc 107  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||| ||||||| |||     |||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacatcatataacgatatc 17353961  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatg-cttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 206  Q
    |||| ||||  | || ||||||||| || || |||||| ||||||||||   |  ||||| || |||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||    
T  17353960 aaatacaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgaaatcaaacatcatctcacatcatattcaacataaacatttcat-aacagc 17353862  T
Q  207 ttcacagattataattaac 225  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  17353861 ttcacagattacaattaac 17353843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17439602 - 17439504
Alignment:
Q  35 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17439602 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 17439504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  173 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266991
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |  |||||   |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacat-aaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17266998  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  17266997 atctcaa 17266991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353143
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  24353137 atctcaa 24353143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492850
Alignment:
Q  90 tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 40492850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16383
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 16622  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621 aatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16522  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16521 cacagactataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcctaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcccaacaaggcac 16422  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16421 tctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 16383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038986
Alignment:
Q  14 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 113  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
Q  114 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacag 14038852  T
Q  214 attataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgt 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14038853 attataattaatatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttagcaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggcactctgt 14038952  T
Q  314 ttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038953 ttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 14038986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377305
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  212 agattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctta-acaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| ||| || | |||||||| ||||||||||||     
T  16377441 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcataaaactcgtgcaacaaaggtagcaaaatcctaacaaggcacta 16377342  T
Q  311 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16377341 tgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctctgctc 16377305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44053166
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 44052928  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44052929 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagctt 44053028  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  44053029 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcac 44053127  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44053128 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagtctctgctc 44053166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239764
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16239892  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  16239891 cgcagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagtcac 16239792  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239791 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgag 16239764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12903090
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 12902856  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | || || ||| |||||||| || ||| |||  || | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902857 attgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 12902956  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  12902957 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcaacagctcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcac 12903055  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12903056 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgggagcctct 12903090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636771
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 210  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttca 22636635  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactc 310  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||||    
T  22636636 cagattataattaacatcctcgttaagtcttaatactaccccaaggttcaattctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagacactc 22636734  T
Q  311 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22636735 tgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctctgctc 22636771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7089214
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7088976  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| |  ||| |||  || | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||    
T  7088977 attgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaactt 7089076  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  7089077 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctactcaaaggttcaactctcgacaactcttgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagacac 7089175  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089176 tctgtttccgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 7089214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7894038
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7893802  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  7893803 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagctt 7893899  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||  ||| ||| || |||||||| | ||||||| | |    
T  7893900 cacagattataattaacatcatcgttaagtcttaatattaccccaaggttcaactctcggcaactcatgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 7893999  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7894000 tctgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctctgctc 7894038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374143
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 215  Q
     |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagagat 23374274  T
Q  216 tataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgttt 315  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||  || ||||||| |||| ||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23374273 tatagttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggttgcaaaatc-taacaagtcactctgttt 23374175  T
Q  316 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23374174 ctgggtcacccgcgaggcgagagcctctgctc 23374143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270140
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16270158  T
Q  209 cacagattataattaaca 226  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16270157 cacagattataatcaaca 16270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053086
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacat-ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 206  Q
    || | ||| ||| |||||| || |   ||||||  ||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggc 14053226  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggc 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |    
T  14053225 ttcacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtc 14053127  T
Q  307 actctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14053126 actctgtttctgggtcactcgcaaggcgagagcctctgctc 14053086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928706
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttca 44928843  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    ||||| || ||||| || || ||  | | || || |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||| |||  | ||| |    
T  44928842 cagatcatcattaatattat-atataatattcataactaccacaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcatt 44928744  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928743 ctgtaactgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 44928706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17048056 - 17047856
Alignment:
Q  146 ctcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaata 245  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || ||||||||||||||||    
T  17048056 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttcattaagtcttaata 17047957  T
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgc 345  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047956 ctacccaaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaagtc-tcacaaggcactctgtttccgggtcactcgcgaggcgagagcctctgc 17047858  T
Q  346 tc 347  Q
    ||    
T  17047857 tc 17047856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798958
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7798873  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    | ||||||||| |||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7798874 attgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaaca 7798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 206 - 347
Target Start/End: Original strand, 15091093 - 15091234
Alignment:
Q  206 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaagg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15091093 cttcacagattataattaacatcttcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttagaaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaagg 15091192  T
Q  306 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15091193 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 15091234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 3096782 - 3096980
Alignment:
Q  147 tcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatac 246  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  3096782 tcaagtaatgcata-aacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcatcattaagtatttatcc 3096880  T
Q  247 taccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 346  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096881 tacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 3096979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798669
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 54798683  T
Q  211 cagattataattaa 224  Q
    |||||||| |||||    
T  54798682 cagattatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280518
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-ggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 14280504  T
Q  211 cagattataattaa 224  Q
    |||||||| |||||    
T  14280505 cagattatcattaa 14280518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900062
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatca 6899989  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataa 181  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 19618238  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19618237 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873369
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 52873389  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatct 128  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  52873388 attgcaagtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102548
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 210  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 44102411  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    ||||| || ||||| || || ||  | | || || |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| || |||||||||| |||  | | | |    
T  44102412 cagatcatcattaatattat-atataatattcataactatcccaaggttcaactctcaacgactcgtgctacaaagatcgcaaaatcctaaacaagtatt 44102510  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102511 ctgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 44102548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa-caacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046724
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatag---aacaacatgacataattatatc 17046583  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagct 17046682  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactac 249  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  17046683 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaatcctac 17046724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242861
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataata 105  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataata 19242791  T
Q  106 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19242792 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52242980
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  121 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 219  Q
    |||||||||||  || ||   ||||  |||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatc 52243104  T
Q  220 attaacatcatcattaagtctt-aatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctg 318  Q
    ||||| ||| | ||  | |||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || |||||||||| |||  | ||| |||||  |||    
T  52243103 attaatatc-ttatacaatcttcattactaccccaaagttcaactctttacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcattctgtaactg 52243005  T
Q  319 ggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||  |||||||||||||||||||||    
T  52243004 ggcaactcgcgaggcgagagcctct 52242980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239419
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 18239419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355324
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
Q  116 gtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  15355384 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 15355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574844
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 155  Q
    | || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 330
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190782
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 125  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  126 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcata-atcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||||| || | | |  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || ||| |||||||||  ||| |||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata-cattagatcacatcatacatcaacattaacatctcataa-cagcttcacgaattgtaattaa 6190677  T
Q  225 catcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcac 324  Q
     |||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| || |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  6190678 tatcatattcaagtcttaatgctacgccaaggttcaactctcgacagctcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactctatttttgggtcac 6190776  T
Q  325 tcgcga 330  Q
    ||||||    
T  6190777 tcgcga 6190782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970707
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14970773  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  14970772 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcaca 14970707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |        || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12611041  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12611042 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367905
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15367788  T
Q  109 aatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| ||| || ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15367789 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15367887  T
Q  207 ttcacagattataattaa 224  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15367888 ttcacagatcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402918
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15402801  T
Q  109 aatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| ||| || ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15402802 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15402900  T
Q  207 ttcacagattataattaa 224  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15402901 ttcacagatcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371466
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15371300  T
Q  109 aatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||   |||| |||| ||| || ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15371301 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15371399  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaact 273  Q
    ||||||||| || ||||| ||  | | ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15371400 ttcacagatcatcattaatattgtaaataa-tattcataactaccccaaggttcaactctcaacaact 15371466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373747
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15373581  T
Q  109 aatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||   |||| |||| ||| || ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15373582 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15373680  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaact 273  Q
    ||||||||| || ||||| ||  | | ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15373681 ttcacagatcatcattaatattgtaaataa-tattcataactaccccaaggttcaactctcaacaact 15373747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096379
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatga 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641192
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |           |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-----------aaaacaacatgacataataatatcaaat 7641256  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  7641255 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7641192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13790
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||| ||| ||   |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774132
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattat 12774132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370144
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15370116  T
Q  109 aatgcaagtcaa-caacatctcaattat 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15370117 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattat 15370144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223796
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatct 16223630  T
Q  109 aatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||  | ||||  |||||||||||  |||| ||||||||   |||| |||| ||||    
T  16223631 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataa-caacatcacatcatcataaatcagc 16223729  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaact 273  Q
    ||||||||| || ||||| ||| | | ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16223730 ttcacagatcatcattaatatcgtaaataa-tattcataactaccccaaggttcaactctcaacaact 16223796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815587
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
Q  128 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatca 173  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 21815587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706299
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  108 aaatgcaagtca 119  Q
     |||||||||||    
T  39706310 gaatgcaagtca 39706299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551932
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgatataataatatc 15551915  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     || | || ||||||||    
T  15551916 gaaggtaaatcaacaac 15551932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||     
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgc-aaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcat 43198563  T
Q  121 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||| ||||||| ||| ||   |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  43198562 caatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464716
Alignment:
Q  91 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatca 190  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||   |||| ||||||| ||| ||||  ||||||||| ||  ||| | ||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatcaaattttaaacgacatca 15464871  T
Q  191 acacatcttaaa-cagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcg 289  Q
    |  |||| || | |||||||||| || || ||||| |||||    || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |    
T  15464870 aatcatcatatatcagcttcacaaatcatcattaatatcatatacaattctcattactactccaaggttcaactcataacaacttgtgcgacaaagattg 15464771  T
Q  290 caaaat-cttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||| || |||||| || |||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  15464770 caaaatcctaaacaagtcattctgtaactgggcaactcgcgaggcgagagcctct 15464716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353999
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |     |||| |||||||||| ||||||||     
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaat 22353934  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    | ||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22353935 tacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  121 caacatc 127  Q
    |||||||    
T  12288217 caacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846460
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  112 gc 113  Q
    ||    
T  8846459 gc 8846460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149992
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| || |||  | ||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
Q  115 agtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||| || | |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  20149931 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 20149992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 347
Target Start/End: Original strand, 7798985 - 7799034
Alignment:
Q  298 taacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798985 taacaagacactttgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 7799034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256106
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  | ||| |||  |   || |||||||||    
T  43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattcttaagtaatgc 43256133  T
Q  158 ttataacattatatcacatcataatca 184  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||    
T  43256132 atataatattatatcacattataatca 43256106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640453
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  46640459 atctcaa 46640453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8574836 - 8574784
Alignment:
Q  173 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  8574836 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 15093775 - 15093955
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||  ||   || | |||| |||||| | |||||||||| |     
T  15093775 catcatcttaatcatcttgtattgactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagcatgacttcataatatcaattt 15093874  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    ||  || ||||||| | ||| || |||| |||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15093875 catttctacaacatattaatcattcaataatatattaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 15093955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596751
Alignment:
Q  47 cttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 16596751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20157177 - 20157106
Alignment:
Q  244 tactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgca--aaatcttaacaaggcactctgt 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||   || || |||||||||||||||    
T  20157177 tactatcccaaggttcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcactctgt 20157106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564155
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcat 3564283  T
Q  212 agattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactct 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  3564282 aggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttaaactcttaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactct 3564183  T
Q  312 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564182 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagc 3564155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227818
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||| |||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatctt 38227679  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  38227680 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaggcac 38227779  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227780 tctgtttatgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 38227818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509522
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatca 9509288  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509289 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9509388  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  9509389 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcttgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcac 9509487  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509488 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 9509522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12699169
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatc 12698930  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698931 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 12699030  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| ||    
T  12699031 tcacagattataattaacatcctcattaactcttaatactaccccaaggttcaactatcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagtca 12699129  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12699130 ctttgtttctgggtcactcacgaggtgagagcctctgctc 12699169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589375
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatca 10589138  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||  | | | |||  ||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10589139 attgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||| | | || |||||||||| ||||||| |||    
T  10589238 cacagattataattaacctcatcattaagtcttaatcctacccaaaggtccaactctagacaactcgtgcaaaaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 10589336  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10589337 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 10589375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143820
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | | |||| || || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  124 catctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataatt 222  Q
    |||||||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |     
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  223 aacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtc 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtcttagtactaccccgaggttcaactcttagcaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactctgtttctaggtc 15143845  T
Q  323 actcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15143844 actcgcgaggcgagagcctctgctc 15143820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212329
Alignment:
Q  9 acatcatcat-cttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 26212094  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26212095 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagct 26212194  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||  || ||||||| |||| ||| || ||||||||   ||||||  ||    
T  26212195 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa--ctaacaaatca 26212292  T
Q  308 ctctg-tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212293 ctctgttttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 26212329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386031
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || || |  ||| |||||||| || ||| ||| ||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 16386170  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||||| ||    
T  16386169 tcacagattatagttaacctcttcattaagtcttaatgttacccaaaggttcaactctggacaactcatgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtca 16386071  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16386070 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagccactgctc 16386031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18456332  T
Q  212 agattataattaa 224  Q
    |||||||||||||    
T  18456331 agattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443726
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaa 40443490  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 209  Q
     | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 40443589  T
Q  210 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| | |||||| ||||  |||||| |||| ||| || ||||||||||  || ||| ||||    
T  40443590 acagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcatctctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-caataagtcact 40443688  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443689 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 40443726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847618
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||   ||||  |||||||||| |||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatc 27847855  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  27847854 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 27847756  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| ||    
T  27847755 tcacagattatagttaatctcattattaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtca 27847657  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847656 ctctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 27847618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273594
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatctcaa-tatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 48273580  T
Q  211 cagattataattaa 224  Q
    |||||||| |||||    
T  48273581 cagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647491
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatca 13647424  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13647425 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430874
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatca 18430807  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18430808 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2279952
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagc 2280042  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctt-aatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatc 296  Q
    ||||||||| || ||| | ||||| | ||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  2280041 ttcacagatcatcattgatatcataaataa-tcttcattacgaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgtgacaaagatcgcaaaatc 2279952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116843
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 44116706  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcact 309  Q
    || || || ||||| || || ||  | | || || |||||||||||||||||| || ||| ||| |||| | | || |||||||||| |||    ||  |    
T  44116707 catatcatcattaatattat-atatattattcataactaccccaaggttcaaccctcaacgactcgtgcaataaagatcgcaaaatcctaaactagcgtt 44116805  T
Q  310 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116806 ctgtaactgagtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 44116843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213861
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
     |||||||||||| ||| |||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa-caacatcaa 16213861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061747
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 209  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 17061881  T
Q  210 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||| || ||||| || || ||  | | || || ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||| |||  | |||     
T  17061880 acagatcattattaatattat-atgtaatattcataactaccccatggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcat 17061782  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  17061781 tctgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctct 17061747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275320
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttata 162  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 173
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410219
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatca 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||| | ||||  |||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatca 16410219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386495
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcaca 3386495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||   || ||||||||||||||||||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaa---caagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67868
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 67843  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaat 132  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatctcaat 67868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869469
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattat 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  13869445 gcaagtcaatcaacgtctcaattat 13869469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831495
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacac-ggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  13831472 gcaagtcaacaacgtctcaattat 13831495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898376
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacag-cagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  116 gtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38898376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12756797 - 12756550
Alignment:
Q  48 ttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataact 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||   | || |    
T  12756797 ttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattcacataaaatt 12756699  T
Q  148 caagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-a 245  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||| |||||||| || ||||| || || ||  | | || || |    
T  12756698 caagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcatcacagatcatcattaatattat-atacaatattcataa 12756601  T
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatc 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  12756600 ctaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatc 12756550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110724
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaac 192  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaac 20110724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200901
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac 34200901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005768
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaa 18005768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073036
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 22073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505321
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495517
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaac 16495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811142
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  112 gcaagtca 119  Q
    ||||||||    
T  811149 gcaagtca 811142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486600
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 19486767  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
      | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| |||||| |||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 19486667  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaact 273  Q
    ||||||||| || ||||| ||  | ||||| | || || ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19486666 ttcacagatcatcattaatattttaattaa-tattcataactaccctaaggttcaactctcaacaact 19486600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47831925
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | | | |||||||| |||| ||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatc 47831925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014291
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  112 gcaagtcaaca 122  Q
    |||| ||||||    
T  44014281 gcaaatcaaca 44014291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12255887 - 12255578
Alignment:
Q  36 gactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaat 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||     
T  12255887 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgc-aaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaa 12255789  T
Q  133 tatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcatc 231  Q
     || ||   |||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||| ||||| |||| || ||||| || ||     
T  12255788 cattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaat-catcttataacaacttcatagatcatcattaatat-att 12255691  T
Q  232 attaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcga 330  Q
    ||  | |||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| |||  | ||| |||||  |||||  ||||||||    
T  12255690 atacaatcttcattactaccccaaaattcaactctcaacaactcgtgtgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcattctgtaactgggaaactcgcga 12255591  T
Q  331 ggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||    
T  12255590 ggcgagagcctct 12255578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219719
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  112 gcaagtcaacaacatct 128  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatct 16219719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26356083 - 26355983
Alignment:
Q  75 cagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcac 174  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  26356083 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 26355984  T
Q  175 a 175  Q
    |    
T  26355983 a 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26358535 - 26358435
Alignment:
Q  75 cagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcac 174  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  26358535 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 26358436  T
Q  175 a 175  Q
    |    
T  26358435 a 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11996033
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||     
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatt 11996050  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  11996049 gaatgtaaatcaacaac 11996033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 290
Target Start/End: Original strand, 15211484 - 15211728
Alignment:
Q  36 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatta 134  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||  |  || || |||||||||||||||    
T  15211484 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 15211582  T
Q  135 tacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatt 234  Q
    | |||| | |  |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| || ||  | ||| |||| |||    
T  15211583 ttcaataaaacttcaagcgatgtatacaacattatatcacatcataatca----------atcttaaacagcttcacatatcatcttaaacgtcattatt 15211672  T
Q  235 aagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgc 290  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||||  ||||| |||| ||||    
T  15211673 aagtcttaaagctacccaaaggttcaactctaagcaactcatgcgaaacagatcgc 15211728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754893
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     ||||||| ||||||||    
T  15754909 gaatgcaaatcaacaac 15754893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867895
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  121 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataa 220  Q
    |||||||||||  || ||   |||| ||| ||||||| ||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  1868003 caacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatca 1867905  T
Q  221 ttaacatcat 230  Q
    |||| |||||    
T  1867904 ttaatatcat 1867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056449
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  123 acatctcaa 131  Q
    |||||||||    
T  16056441 acatctcaa 16056449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15008594 - 15008398
Alignment:
Q  35 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  15008594 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctcaa 15008497  T
Q  132 ttatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcat 230  Q
      ||   || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15008496 acatcatat-ataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattatcattaatatcat 15008398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10063939 - 10063817
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| || ||||| | |||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  10063939 acatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgc-acaacatcatgatataataatatc 10063841  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
     ||  ||||| |||||||||||||    
T  10063840 gaacacaagtaaacaacatctcaa 10063817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932685
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  113 caa-gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatca 178  Q
    |||  |||||||||  | || ||| |||| | |  |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14932751 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 14932685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356120
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  113 caa-gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatca 178  Q
    |||  |||||||||  | || ||| |||| | |  |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  15356186 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360234
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  113 caa-gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatca 178  Q
    |||  |||||||||  | || ||| |||| | |  |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  15360300 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15360234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530140
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  2530208 aacaacagcaacataggcaacatac--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 2530140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113125
Alignment:
Q  97 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaac 192  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||   ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaac 15113125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220194
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 20220194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901431
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaa 12901431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 79  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832499
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacata 72  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 2832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 343
Target Start/End: Original strand, 16056617 - 16056662
Alignment:
Q  298 taacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16056617 taacaaggcattctgtaactgggtaactcgcgaggcgagagcctct 16056662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044817
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 79  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354847
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 79  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14354847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17017351 - 17017303
Alignment:
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa 294  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  17017351 ctaccccaaggatcaactcataacatcttgtgcgacaaagatcgcaaaa 17017303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25848
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 215  Q
     |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  216 tataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25979 tataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcagctcttagcaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactctgttt 25880  T
Q  316 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25879 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 25848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33491 - 33278
Alignment:
Q  134 atacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcat 233  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33491 atacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcat 33392  T
Q  234 taagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggc 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33391 taagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtatgacacagatcgcaaaatcctgacaaggcactctgtttctgggtcacacgcgaggc 33292  T
Q  334 gagagcctctgctc 347  Q
    |||||||| |||||    
T  33291 gagagcctttgctc 33278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44682
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4845
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 4606  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4607 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 4706  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||    
T  4707 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacactgatcgcaaaatcctaactaggtac 4806  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4807 cctgtttctgggtcactcgcgaagcgagagcctctgctc 4845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12427
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 12188  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12189 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 12288  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||    
T  12289 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacactgatcgcaaaatcctaactaggtac 12388  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12389 cctgtttctgggtcactcgcgaagcgagagcctctgctc 12427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22379
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 22140  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22141 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22240  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||    
T  22241 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacactgatcgcaaaatcctaactaggtac 22340  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22341 cctgtttctgggtcactcgcgaagcgagagcctctgctc 22379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 16998
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaa--catcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatc 17238  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17237 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagct 17138  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||| |||| |    
T  17137 ttacagattataattaacatcatgattaagtctcaatactaccccaaggtttaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaataaggta 17038  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17037 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 16998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79116
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  128 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaaca 226  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| || ||||| |    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcactgatcatcattaata 79233  T
Q  227 tcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaat-cttaacaaggcactctgtttctgggtcac 324  Q
    | || ||  | | || || ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||  |||||   ||||  ||    
T  79232 ttat-atacaatattcataactaccccaaggttcaactctcaatgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaaggc-ttctgtaattgggcaac 79135  T
Q  325 tcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||    
T  79134 tcgcgaggcgagagcctct 79116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 38761 - 39098
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 38859  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||| | |||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 38959  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  38960 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagtcac 39059  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39060 tatgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 39098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33158
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 33040  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 33140  T
Q  209 cacagattataattaaca 226  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  33141 cacagattataatcaaca 33158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9871
Alignment:
Q  7 ggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatat 106  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatat 9842  T
Q  107 caaatgcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9843 caagtgcaagtcaacaacgtctcaattat 9871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337449
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatca 22337214  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22337215 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaactt 22337314  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || || ||||| | ||||||| | |    
T  22337315 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatactactccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcacaaaaacctaacaagactc 22337414  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337415 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 22337449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660360
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatca 23660121  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23660221  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | || || ||||| | |||||||||||    
T  23660222 tacaaattataattaacatcatcaataagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaataactcgtgcaataaaggtcacaaaaacctaacaaggcac 23660321  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23660322 tctgtttctgggtcactcacgaggcgagagcctctgctc 23660360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076775
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 23076541  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||||||||||| |||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076542 attgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagctt 23076641  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  23076642 cacagattataattaacatcatcataaaatcccaatactaccccaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaaggcac 23076740  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23076741 tctgtttctgggtaactcgcgaggcgagagcctct 23076775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22737964
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22738202  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738201 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22738102  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  22738101 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaggttcaattctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaaggcac 22738003  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738002 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 22737964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23286198
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatca 23285960  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||   |   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 23286060  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  23286061 cacagattataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctcaacaactcatgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 23286159  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286160 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 23286198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731017
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22731256  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||| | || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731255 attgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22731156  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatacta-ccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||| || |||| ||| || |||||||| | ||||||||||    
T  22731155 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccccaaggttcaattatcaacagctcgtgcaacaaagatcgcaaaa-cctaacaaggca 22731057  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22731056 ctctgtttctgggtgactcgtgaggcgagagcctttgctc 22731017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 314
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060815
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23060612  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||||||||| || |||  ||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060613 attgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23060712  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||  ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  23060713 caca-attataattaacatcatcattaagtcccaatactaccccaaagttcaattctcaacaactcgtg-aacaaaggtcgcaaaa-cctaacaaggcac 23060809  T
Q  309 tctgtt 314  Q
    ||||||    
T  23060810 tctgtt 23060815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654188
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  23654307 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 23654209  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcg 329  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23654208 tctgtttctgggtcactcgcg 23654188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 37900
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 38137  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | | | | ||| || ||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  38136 atttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagctt 38038  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    || |||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||||| || ||||||| |||    
T  38037 cagagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaagtc-taacaagtcac 37939  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37938 tatgtttctgggtcgctcgcgaggcgagagcctctgctc 37900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298602
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 210  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactc 310  Q
    || |||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||  || ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||    
T  298733 catattatagttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactc 298635  T
Q  311 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298634 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 298602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309442
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 20309303  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||| | |||| |||  | |||||||||| ||||||| ||    
T  20309304 tcacagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaaatcgtgcaacaagggtcgcaaaatc-taacaagtca 20309402  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309403 ctttgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 20309442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 164 - 347
Target Start/End: Original strand, 27753730 - 27753912
Alignment:
Q  164 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaact 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  27753730 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaagcttcaact 27753829  T
Q  264 cttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||  |||||| |||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27753830 ctcgacaactcgtgcaacgaaggtcgcaaaatc-taacaaggcactctgtttctgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctc 27753912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451713
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 125  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  126 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||||| || | | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | | |||||||||||| ||| |||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acataatatcacatcataaatcaacattaacatcccat-aacagcttcacaaattgtaattaa 32451835  T
Q  225 catcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcac 324  Q
     |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32451834 tatcatattcaagtcttaatgctaccccaaggttcatctctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactctgtttctgggtcac 32451736  T
Q  325 tcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32451735 tcgcgaggcgagagcctctgctc 32451713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708405
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 206  Q
    || ||||| ||| | |||||||||  || |||  |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagc 23708542  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctt-aatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaagg 305  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |  || |||| | ||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||| |||  | |    
T  23708541 ttcacagatcatcattaatatcataaacaa-tcttcattacgaccccaaggttcaactatcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaag 23708443  T
Q  306 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    || |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23708442 cattctgtaactgggtaactcgcaaggcgagagcctct 23708405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 32214987  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32214986 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135752
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 23135752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  115 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
Q  14 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgc 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
Q  114 aagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaa-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029854
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcaca 45029854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 296
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672114
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 19671928  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 206  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| || | ||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatctcaa-tattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaa-tcatcatagatcagc 19672025  T
Q  207 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatc 296  Q
    |||||||||||| ||||| || || | ||| | || || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  19672026 ttcacagattatcattaatattataaataa-tattcataacta-cccaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatc 19672114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103348
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc--ttataacattatatcacatca 178  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||| || || |||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgcaatta-aacattatatcacatca 23103348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529569
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattat 24529569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406099
Alignment:
Q  14 atcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaa 28406099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967537
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |  || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38967537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175972
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaa 25175972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946730
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatac 8946730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22799243 - 22799063
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||   || | ||||||||||| | |||||||||| |     
T  22799243 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaattt 22799144  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22799143 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 22799063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019643
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||   || | |||| |||||| | |||||||||| |     
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 23019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacata 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134203
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    |||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||| |    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcga 22134228  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  22134227 atgcaa-tcaataacatctcatttat 22134203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679702
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aat 7679686  T
Q  112 gcaagtcaacaacatc 127  Q
    | |||||| |||||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatc 7679702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071972
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616333
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||   |||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
     |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 25616333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7687
Alignment:
Q  39 tcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatac 137  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  || |    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 7726  T
Q  138 aatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacat 176  Q
    |   |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  7725 atatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacat 7687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207401
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  23207395 atctcaa 23207401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca 70  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
Q  98 taataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520092
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  125 atctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatta 223  Q
    |||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| || | | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  20520197 atctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacagattatcatta 20520099  T
Q  224 acatcat 230  Q
    | |||||    
T  20520098 atatcat 20520092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786907
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||| ||  |||||| |||| ||| |||||||||| ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 18786911  T
Q  121 caac 124  Q
    ||||    
T  18786910 caac 18786907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413035
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataata--atatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  123 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 221  Q
    |||||||||    | ||  |||| ||| ||||||| ||||   ||||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  22413141 acatctcaacatcataa--ataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattaacat 22413044  T
Q  222 taacatcat 230  Q
    ||| |||||    
T  22413043 taatatcat 22413035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 23004774 - 23004872
Alignment:
Q  35 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |  ||| |  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23004774 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 23004872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  30 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 79  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  30 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 78  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22459587 - 22459500
Alignment:
Q  105 atcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaac 192  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  22459587 atcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791397
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||  | ||| || |||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  23791391 atctcaa 23791397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22758725 - 22758652
Alignment:
Q  121 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataa-cattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22758725 caacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 22758652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24697645 - 24697604
Alignment:
Q  90 tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24697645 tcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaa 24697604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22740973 - 22740897
Alignment:
Q  118 caacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataa-cattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    ||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22740973 caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 22740897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52249
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 52012  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52013 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagctt 52112  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  52113 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaaca-aggtcgcaaaa-cctaacaagacac 52210  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52211 tcagtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 52249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167763
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 168000  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  || | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  167999 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 167901  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| | |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  167900 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaattcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 167802  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167801 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 167763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339734
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  212 agattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactct 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  339868 agattataattaacgtcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacgactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaaggcactct 339770  T
Q  312 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339769 atttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 339734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71418
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  71350 aacaacagcaacataggcagcatac--aaacagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatct 71418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 2987
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 3173  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 3073  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  3072 cacaggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacacaggtcgcaaaa 2987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 837 - 796
Alignment:
Q  306 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  837 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctccgctc 796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23220
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 211  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23084  T
Q  212 agattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactct 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| ||||||    
T  23085 agattataaataacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacactct 23184  T
Q  312 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23185 gtttctaggtcactcgcgaggcgagggcctctgctc 23220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13548
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 13310  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13311 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13410  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13411 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactgtcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcac 13509  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13510 tctgattctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 13548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40194
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaatatcatgacataataatatca 39956  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 40056  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  40057 cacaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta-cccaaggttcaactctcaacaaattgtgcaacaaaggtcgcaaaatcataacaaggcac 40155  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40156 tcggtttctaggtcacccgcgaggcgagagcctctgctc 40194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 327
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26213
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaatatcatgacataataatatca 25994  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 26094  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  26095 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaaatcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcac 26194  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcg 327  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  26195 ttggtttctgggtcactcg 26213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40246
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 40011  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    |||||| ||||| ||||||| || |||   || |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagctt 40111  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||  | |||||||| ||    
T  40112 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaacacctaacaaggtac 40211  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40212 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 40246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19883
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  125 atctca 130  Q
    ||||||    
T  19888 atctca 19883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 91 - 347
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28168
Alignment:
Q  91 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatca 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  191 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgc 290  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  28012 acaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagattgc 28111  T
Q  291 aaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28112 aaaatcctgacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctttgctc 28168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3807
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 3569  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3570 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 3669  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||  |||    
T  3670 catagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaagttcaattctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaactcac 3768  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3769 tctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 3807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 343 - 676
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatca 441  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | || ||||||||||||||| || ||| | || |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 541  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| || | |||||| | ||||||| |||    
T  542 catatattataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcatgcaacaaaggttgcaaaaacctaacaagacac 641  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  642 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 1851 - 2184
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 1950  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1951 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 2050  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || || ||||||| |||||||||||    
T  2051 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcacaaaatc-taacaaggcac 2149  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  2150 tctgttttagggtcactcgtgaggcgatagcctct 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8320
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8455  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatacta-ccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||  || |||||||| | ||||||| ||    
T  8454 cacagattataattaacatcctcattaagtcccaatactacccccaacgttcaactctcaacaactcgtgcaacgaaggtcgcaaaa-cctaacaagaca 8356  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8355 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 8320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 833
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 1070  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  || | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1069 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 971  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| | |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  970 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaattcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 872  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  871 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8808
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatca 8578  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | |||||||||||||||||| ||  || |||   ||  |||||||||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8579 attgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagctt 8674  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| |||    
T  8675 cacagattgtaattaacatcatcattaagtcttaatactactccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagacac 8773  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8774 tctgtttctgggtcattcgcgaggcgagagcctct 8808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 5905
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca---taggcagtatacgaaaacatcatgacataataata 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  106 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 205  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 6046  T
Q  206 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaagg 305  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | |||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||    
T  6045 cttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttccactctcgataactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagg 5947  T
Q  306 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5946 cactctgtttctgggtcactaacgaggcgagagcctctgctc 5905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24085
Alignment:
Q  27 acttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaa-acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  126 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataat-caacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 224  Q
    ||| || ||| |||  ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  225 catcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcac 324  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24206 catcctcaataagtcttaatactatcccaaagttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcactttgtttctaggtcac 24108  T
Q  325 tcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24107 tcgcgaggcgagagcctctgctc 24085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13429
Alignment:
Q  61 aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgctta 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  161 taacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttca 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtcccaatactaccccaaagttca 13343  T
Q  261 actcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13344 actctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagacactcagtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 13429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34238
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac-aacccatcatgatataataatatc 34221  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  34222 gaatgtaaatcaacaac 34238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 273 - 329
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacag 65  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21248
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||| |||   |    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagct 21109  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| ||| || |||||||| || |||||| ||    
T  21110 tcacaggttataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctgatcaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-ctcaacaagtca 21208  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21209 ctctgtttttgggtcactcacgaggcgagagcctctgctc 21248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32746
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagct 207  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| | || |||  || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagct 32882  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  32881 tcacagattataactaacaccttcaataagtttcaatactaccccaaggttcaactcttaacaattggtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaagaca 32782  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32781 ttctgtttatgggtcactcgcgaggcgggagcctct 32746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46259
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagct 207  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| | || |||  || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagct 46123  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  46124 tcacagattataactaacaccttcaataagtttcaatactaccccaaggttcaactcttaacaattggtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaagaca 46223  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  46224 ttctgtttatgggtcactcgcgaggcgggagcctct 46259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16323
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatca 16212  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 207  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16213 aatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatca--acatcttaaaacagct 16310  T
Q  208 tcacagattataa 220  Q
    |||||||||||||    
T  16311 tcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 344
Target Start/End: Original strand, 16323 - 16422
Alignment:
Q  245 actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctg 344  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  16323 actacctcaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcacttgcgaggtgagggcctctg 16422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2289
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatca 2051  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||| ||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  2052 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagctt 2151  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
     ||| ||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||| | |||    
T  2152 tacatattattaataaccttatcattaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacatgtcac 2250  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2251 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 2289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13832
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | | | | ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  13596 atttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||| |||| ||| |  |||||||||| ||||||| |||    
T  13695 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctaccgaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaagtcgcaaaatc-taacaagtcac 13793  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13794 tctgtttctgggtcgctcgcgaggcgagagcctctgctc 13832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5181
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 4948  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||| |||  |   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4949 aatgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 5048  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||||||||||| | ||| || |||||| ||  || ||||||| |||| ||| || | ||||||   ||||||| |||    
T  5049 cacagattatagctaaccccttcattaagtcttattgctagccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtggcaaaa--ctaacaagtcac 5146  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5147 tctgtttctaggtcactcgcgaggcaagagcctct 5181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 3207  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3206 atgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 3107  T
Q  210 acag 213  Q
    ||||    
T  3106 acag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32401
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatca 32164  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  32165 atttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 32263  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||| | || ||| || ||||||||||  || |||  ||    
T  32264 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactagagcaacaaaggtcgcaaaatc-aaaaaagtaac 32362  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32363 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 32401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15249
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  |||| ||  ||   ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  15485 atttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcata-aatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| | |  ||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  15386 cacagattataattaaccttattattaagtcttaatcctacccaacgagtcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 15288  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 15249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10210
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataataatatc 10448  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || | ||| |||||||||||| || |||||||  ||   ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||| |||| |||  | |||||||||| ||||||| ||    
T  10348 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaatggtcgcaaaatc-taacaagtca 10250  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10249 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 10210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 124723 - 124922
Alignment:
Q  147 tcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatac 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  124723 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgc 124822  T
Q  247 taccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 346  Q
    || ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124823 tatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagacactctttttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 124921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174943
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttat-aacattatatcacatcataatcaaca 187  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaactaaacattatatcacgtcatattcaaca 174943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  125 atc 127  Q
    |||    
T  136372 atc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  125 atc 127  Q
    |||    
T  145080 atc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 169 - 347
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10501
Alignment:
Q  169 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaa 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaa 10422  T
Q  269 caacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  10423 caacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggcactttgtttctaggtcactcgcgaggcgggaagctctgctc 10501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 4712 - 5049
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatca 4811  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 208  Q
    | ||||| ||| ||| |||| |  |||||||  ||   |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  4812 attgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaactt 4910  T
Q  209 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcac 308  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||| |||| ||| || | ||||||   ||||||| |||    
T  4911 cacagattatacttaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactgtcgacaactcgtgcaacaaaggttgcaaaaatctaacaagtcac 5010  T
Q  309 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5011 tcttattatgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctc 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 347
Target Start/End: Original strand, 1 - 273
Alignment:
Q  74 gcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatca 173  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||||| ||| ||| |||| |  |||||||  ||   |||||||| || || ||||||||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatca 99  T
Q  174 catcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaact 273  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  100 catcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactgtcgacaact 199  T
Q  274 tgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
     |||| ||| || | ||||||   ||||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  200 cgtgcaacaaaggttgcaaaaatctaacaagtcactcttattatgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctc 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 746
Alignment:
Q  68 acataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacatt 167  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  1021 acataggcagtatac---aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatt 926  T
Q  168 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  925 atatcacatcgtaatcgacatcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctca 826  T
Q  268 acaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||| || |||| ||| || ||| |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  825 acagctcgtgcaacaaaggtcgaaaaatcctaacaagactctctgtttctaggtcactcacgaggcgggaacctctgctc 746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggc 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1623
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||| | ||| |||||||  |||||| |||| ||| || ||||||| ||  |||||| ||    
T  1485 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaactc-caacaagtca 1583  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1584 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 1623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7600
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatc 7362  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  7363 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 7461  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||| | ||| |||||||  |||||| |||| ||| || ||||||| ||  |||||| ||    
T  7462 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaactc-caacaagtca 7560  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7561 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 7600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  72 aggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatat 171  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  172 cacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16616
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatc 16378  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||| | |  ||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  16379 aaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 16477  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||  | || | |||| ||| || || |||||||  |||||| ||    
T  16478 tcacagattatagttaacctcattattaagtcttaatcctacccaagcgttcaactctcgagaaatcgtgcaacaaaggtcacaaaatc-caacaagtca 16576  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16577 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 16616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 347
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6947
Alignment:
Q  68 acataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacatt 167  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| || ||| ||| ||| | ||||||||||| || ||| ||    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  168 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||      
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaatcctacccaaaggttcaactctcg 6868  T
Q  268 acaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6869 acaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacatgtcactctgtttatgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 6947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 836
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattatatc 1074  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  1073 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagct 975  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||| |||||| | |||||||||||  |||| | |||| ||| || | |||||||| ||||||| ||    
T  974 tcacagattatagttaacctcattcttaagacttaatcctacccaagggttcaactctcgacaaatcgtgcaacaaaggttgcaaaatc-taacaagtca 876  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  875 ctctgtttctgggttactcgcgaggcgagagcctctgctc 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 347
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4861
Alignment:
Q  30 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctc 129  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| | | | || || || || ||||||||||||  || ||||||||||||     
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  130 aattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaacatc 228  Q
    || ||| || | |||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatcaaca--tcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  229 atcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgc 328  Q
     ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  || ||    
T  4743 ttcaataagtctcaatactacctcaaggttcaactcttaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacatggcattctgtttctgggtagcttgc 4842  T
Q  329 gaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  4843 gaggcgagagcctttgctc 4861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51916
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataac 51678  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||    
T  51679 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcata-aacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagct 51777  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    |||||||||||| ||||| |||   |||||||||||| |||||| | ||| ||| |||  |||||| |||| ||| |  ||||||||||| |||||| ||    
T  51778 tcacagattatagttaacctcactcttaagtcttaatcctacccaagggtccaattctcgacaactcgtgcaacaaaagtcgcaaaatct-aacaagtca 51876  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51877 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 51916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1251
Alignment:
Q  146 ctcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaata 245  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  1051 ctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaata 1150  T
Q  246 ctaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgc 345  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1151 ctacccaaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaagtc-tcacaaggcactttgtttccgggtcactcgtgaggcgagagcctctgc 1249  T
Q  346 tc 347  Q
    ||    
T  1250 tc 1251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 347
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3818
Alignment:
Q  168 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctca 3739  T
Q  268 acaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||| |||| ||| || || |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3740 acaactcgtgcaacaaaggtcacaaagtc-tcacaaggcactctgtttccgggtcactcgcgagacgagagcctctgctc 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 347
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7882
Alignment:
Q  168 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctca 7803  T
Q  268 acaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||| |||| ||| || || |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7804 acaactcgtgcaacaaaggtcacaaagtc-tcacaaggcactctgtttccgggtcactcgcgagacgagagcctctgctc 7882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27663
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  123 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 215  Q
    |||||||||  || ||   |||| || |||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 4915
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatcaaa 5150  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 210  Q
    | ||| ||| |||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||  ||| ||||    
T  5149 ttcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatattttattcagtttca 5051  T
Q  211 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactc 310  Q
    || |||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||  |||||| |||| ||| || || |||||||  || ||| |||||    
T  5050 catattataattaaccttattattaaatcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtctcaaaatc-caataagtcactc 4952  T
Q  311 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4951 tgtttctgtgtcactcgcgaggcgagatcctctgctc 4915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51668
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 125  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || | |||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
Q  126 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||||| || | | |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |  || | |||||||||||| ||| |||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaatatctcat-aacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
Q  225 catcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcac 324  Q
     |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  51789 tatcatattcaagtcttaatgctaccccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactctgtttctgggtcac 51691  T
Q  325 tcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  51690 tagcgaggtgagagcctctgctc 51668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32657
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 32634  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatctcaa 32657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10935
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 10870  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47321
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   | || |||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttac---agcagcatgacataataatatc 47091  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    || | ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagct 47190  T
Q  208 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggca 307  Q
    ||||||||||||       ||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||| |||| ||| || |||| |  || ||||||| ||    
T  47191 tcacagattata------ctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgccatttc-taacaagtca 47283  T
Q  308 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgc 345  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47284 ctctggttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgc 47321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 28513  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatct 128  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  28514 attgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11407
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2112
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4605
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 172
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44614
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaa-catcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100496
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaa 100496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40173
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaa 40173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119947
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38394
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| |||   || | |||| |||||| |  ||||||||| |     
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 212  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||    
T  38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcaca 38398  T
Q  213 gatt 216  Q
    ||||    
T  38397 gatt 38394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101571
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtat 101571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23679 - 23581
Alignment:
Q  117 tcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 216  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
T  23679 tcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 23581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 201 - 347
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20740
Alignment:
Q  201 aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||| |||| ||| || |||||||||| |||    
T  20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctattccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taa 20693  T
Q  301 caaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20694 caaggcactctgtttctaggtcgctcgcgaggcgagagcctctgctc 20740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16995
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 16981  T
Q  211 cagattataattaa 224  Q
    ||||| || |||||    
T  16982 cagatcatcattaa 16995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 347
Target Start/End: Original strand, 17090 - 17118
Alignment:
Q  319 ggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17090 ggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 17118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13554
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 62200 - 62317
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||||||| || || ||||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||| |    
T  62200 atcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcga 62298  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||   ||||||||||||||    
T  62299 atgca---caacaacatctcaa 62317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132784
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||||| | || |||||| |||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    | || ||| |||| ||||||||||    
T  132762 gtaa-tcatcaacgtctcaattat 132784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  16 catcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
Q  116 gtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85539
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 209  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 85545  T
Q  210 acagat 215  Q
    ||||||    
T  85544 acagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160864
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||| |||||   ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatat-caaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaa 160864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9404
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 9339  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9340 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 15887
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  123 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 221  Q
    |||||||||  || |    |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatcat 16008  T
Q  222 taacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaat-cttaacaaggcactctgtttctggg 320  Q
    | | |||||    || |   | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||  |||||    
T  16007 tgatatcatatacaatttccattactacccaaaggttcaactcataacaacttgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaaggcattctgtaactggg 15908  T
Q  321 tcactcgcgaggcgagagcct 341  Q
      |||||||||||||| ||||    
T  15907 caactcgcgaggcgagggcct 15887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13435
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  127 ct-caattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaa 224  Q
    ||  ||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||| |    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatcattga 13345  T
Q  225 catcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaat-cttaacaaggcactctgt 313  Q
     |||||    || |   | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||    
T  13346 tatcatatacaatttccattactaccccaaggtttaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaaggcattctgt 13435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17790
Alignment:
Q  188 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagtt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccaaaggttcaattctcaacaactcgtgcaacaaaggt 17830  T
Q  288 cgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgc 328  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  17829 cgcaaaa-cctaacaagtcactctatttctgggtgactcgc 17790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  123 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22677 acatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20259
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  128 tcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaaca 226  Q
    |||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa--aacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaaca 20329  T
Q  227 tcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatc 296  Q
    | || ||  | | || || |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||  |||||||||    
T  20328 ttat-atacaatattcataactatcccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagaccgcaaaatc 20259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128917
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |   |  | |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaa-aaaacagcatgacataataatatca 128849  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacat 176  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  128850 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116571
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaat 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128968
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacat-aaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 128975  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  128974 atctcaa 128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 78348 - 78445
Alignment:
Q  35 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  78348 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaa 78445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Original strand, 116579 - 116631
Alignment:
Q  173 acatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  116579 acatcataatcaacattaacatatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11301
Alignment:
Q  193 acatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaa 292  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||||    
T  11450 acatgttaatcagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaattctacccaaaggttcaactctctacaactcgtgcaacaaaggtcgcaa 11351  T
Q  293 aatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11350 aatc-taacaagtcactttgtttctgtgtcactcgcgaggtgagagcctct 11301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11447
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatca 108  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T
Q  109 aatgcaagtcaacaacat 126  Q
    | | ||| ||| ||||||    
T  11464 atttcaattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11450
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 11384  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   || | ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11385 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40562
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   | || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 40562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12249
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaa 109  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaa 12315  T
Q  110 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||    ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12314 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161049
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||  |||| ||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caatatcaaatcatcataaatcagcttc 161055  T
Q  210 acagat 215  Q
    ||||||    
T  161054 acagat 161049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  92 atgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatca 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  191 acacatcttaaa-cagcttcacagat 215  Q
    |  |||| |||| |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  115 agtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    | |||||||| |||||||||  ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||      |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6657
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaa 6657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  123 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2088
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 209  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  2192 gcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 2094  T
Q  210 acagat 215  Q
    ||||||    
T  2093 acagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17932
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgc-acaacatcatgatataataatatc 18050  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 206  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 17950  T
Q  207 ttcacagattataattaa 224  Q
    ||||||||| || |||||    
T  17949 ttcacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6625 - 6578
Alignment:
Q  300 acaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6625 acaaggcactctatttctgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctc 6578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4377
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  112 gcaagtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 4377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11646
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 11562  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
      | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38195
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 38279  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
      | | |||| ||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 38195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19386
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaa 19386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 175
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30094
Alignment:
Q  26 aacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 125  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacg 30044  T
Q  126 tctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||||||| ||   |||| |||| |||| | ||||  |||||||||||    
T  30045 tctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcaca 30094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  123 acatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10548 acatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2805
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaa 2805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Original strand, 163 - 238
Alignment:
Q  268 acaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  163 acaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgtggcgagagcctct 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45732
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||  ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattat-caaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130086
Alignment:
Q  21 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 130015  T
Q  120 acaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
     ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  ||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  130016 tcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaa 130086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 60811 - 60500
Alignment:
Q  35 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  60811 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaacagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaa 60714  T
Q  132 ttatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcat 230  Q
      || ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  60713 acattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcattaatatcat 60614  T
Q  231 cattaagtct-taatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaa-tcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgc 328  Q
     ||  | |||  | | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||  || ||||| | | |||||  |||||  ||||||    
T  60613 -atacaatctccattcctaccccaaggttcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcacaaaaccctaaacaatgtattctgtaactgggaaactcgc 60515  T
Q  329 gaggcgagagcctct 343  Q
    |||||||||||||||    
T  60514 gaggcgagagcctct 60500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15776
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  111 tgcaagtcaacaac 124  Q
    || || ||||||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 1339 - 1424
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacat 98  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||  |||| |||||| ||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||    
T  1339 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttgtttaagtaacaatagcaacataggcagattacaacaacattatgacat 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1280
Alignment:
Q  15 tcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 114  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
Q  115 agtcaa-caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcaca 175  Q
    |||||| || | |||||||||| ||   |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  1341 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38641
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  111 tgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||  |   |||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 296
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225694
Alignment:
Q  66 caacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataaca 165  Q
    |||||||| |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||   |||| ||||||||||| ||||  |    
T  225465 caacatagtcagtatgc-aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaa 225562  T
Q  166 ttatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat-actaccccaaggttcaact 263  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  |||| || | ||||||||||| | || ||||| ||||| ||  | |||| || |||||||||||||||||||    
T  225563 ttatatcacattataaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagttcattattaatatcat-atataatcttcataactaccccaaggttcaact 225661  T
Q  264 cttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatc 296  Q
    || ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  225662 ctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatc 225694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 133 - 310
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||  ||||||| | || |||| |||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaa 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Original strand, 437 - 468
Alignment:
Q  316 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  437 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6134
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6146  T
Q  108 aaatgcaagtca 119  Q
     |||||||||||    
T  6145 gaatgcaagtca 6134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14696
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaa 14696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5765
Alignment:
Q  21 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaa-catcatgacataataatatcaaatgcaagtc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat--gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatc 5752  T
Q  119 aacaacatctcaa 131  Q
    |||||||||||||    
T  5753 aacaacatctcaa 5765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53488
Alignment:
Q  39 tcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatac 137  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 53542  T
Q  138 aatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    |   |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  53541 atatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1075
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaac 124  Q
     |||| || ||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaac 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15788
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 15800  T
Q  108 aaatgcaagtca 119  Q
     |||||||||||    
T  15799 gaatgcaagtca 15788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggca 76  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6719
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 6709  T
Q  108 aaatgcaagt 117  Q
     |||||||||    
T  6710 gaatgcaagt 6719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14099
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 14089  T
Q  108 aaatgcaagt 117  Q
     |||||||||    
T  14090 gaatgcaagt 14099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1037
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | | | |||||||| |||| || |||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgc-agatcatcatgatataacaacatc 1057  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  1056 gaatgcaagtcatcaacatc 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12884
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatc 107  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 12864  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatc 127  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatc 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2644
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||  |||| |||||  |||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaa 2644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 23843 - 24048
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgac-----ataataatatc 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||  |||||     |||| ||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacatcatataacaatatc 23942  T
Q  108 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 207  Q
    ||||  ||  || |||||||||||| || || |||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| |||||||    
T  23943 aaat--aaaacagcaacatctcaatcattcattcatagttcaagtaatgaaattaacattatatcacatcatattcaacactaacatctctt-aacagct 24039  T
Q  208 tcacagatt 216  Q
    |||||||||    
T  24040 tcacagatt 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16264
Alignment:
Q  36 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatta 134  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || | ||||||||||| | |||||||||| |  |  |||||||||||| ||| |    
T  16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca-tatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatta-atttcaacaacatcttaatca 16345  T
Q  135 tacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 216  Q
    | |||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16344 ttcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 16264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1154
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||| | | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  1150 ctcaa 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12690
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  127 ctcaa 131  Q
    |||||    
T  12686 ctcaa 12690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15500 - 15398
Alignment:
Q  245 actaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctg 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| || ||| |||||| |||  | | | | |||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15500 actaccccaaggttcaactctcaacgattcgtgcgacaaagatcgaaaaatcctaagcaagtattttgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctctg 15401  T
Q  345 ctc 347  Q
    |||    
T  15400 ctc 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10649
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  123 acatctcaa 131  Q
    |||||||||    
T  10641 acatctcaa 10649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1204
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 1184  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
     || |||| |||||| ||||    
T  1185 acaggtcatcaacatttcaa 1204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23898
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 23902  T
Q  112 gcaa 115  Q
    ||||    
T  23901 gcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6927
Alignment:
Q  21 tcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtca 119  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||  ||||||| |||    
T  6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatca 6922  T
Q  120 acaac 124  Q
    |||||    
T  6923 acaac 6927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 131
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8137
Alignment:
Q  84 aaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 8137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8075
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  121 caacatc 127  Q
    |||||||    
T  8081 caacatc 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13057
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaat 111  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  112 gcaagtcaacaacatc 127  Q
    |||||||| |||||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatc 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28818
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataaca--acagcaacataggcagtat 80  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtat 28818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7998
Alignment:
Q  30 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 126  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||| ||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgc-aaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  127 ctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaa 191  Q
    || ||  || ||   |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8062 cttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 38342 - 38440
Alignment:
Q  35 cgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38342 cgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaa 38440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4741
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| || ||||||||||||| || |||| |||||||||   || | |||| | |||| | |||||||||| |     
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagcttgacttcataatatcaattt 4822  T
Q  113 caagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 193  Q
    ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4821 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatatacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 4741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 193070 - 192850
Alignment:
Q  36 gactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatta 134  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||  |  || || |||||||||||||||    
T  193070 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 192972  T
Q  135 tacaatcataactcaagtaatg-cttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcat 233  Q
    | |||| | |  |||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||          |||||||||||||||| |||| ||  | |||||||| ||    
T  192971 ttcaataaaacttcaagtgatgtattacaacattatatcacaccataatca----------atcttaaacagcttcaaagatcatcttaaacatcattat 192882  T
Q  234 taagtcttaatactaccccaaggttcaactct 265  Q
    ||| | ||||  |||||| |||||||||||||    
T  192881 taaattttaaagctacccaaaggttcaactct 192850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1947 - 1860
Alignment:
Q  260 aactcttaacaacttgtgcgacacagttcgcaaaatcttaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 347  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||| |||  | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1947 aactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcattctgtaactgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctc 1860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6281
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatat-aaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  6287 atctcaa 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25229
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  121 caacatctcaa 131  Q
    |||||||||||    
T  25219 caacatctcaa 25229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15362
Alignment:
Q  58 aacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgc 157  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  | ||| |||  |   || |||||||||    
T  15486 aacaacatcaacataggcagcatac--aaacagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattcttaagtaatgc 15389  T
Q  158 ttataacattatatcacatcataatca 184  Q
     || ||||||||||||||| |||||||    
T  15388 ataaaacattatatcacattataatca 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2217
Alignment:
Q  66 caacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  30 tagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 79  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15736
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacatag 73  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15796 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatag 15736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36517
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggca 76  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggca 36517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 227
Target Start/End: Original strand, 32544 - 32650
Alignment:
Q  121 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataa-cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattata 219  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||  |    
T  32544 caacatctcaatcattcattcataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcat-aacagcttcacagattgca 32642  T
Q  220 attaacat 227  Q
    ||||||||    
T  32643 attaacat 32650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97129
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  97123 atctcaa 97129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106407
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  106401 atctcaa 106407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 70
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaaca 70  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 135
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13130
Alignment:
Q  97 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 13130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1169
Alignment:
Q  100 ataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacat 188  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||| ||| || |||| ||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1257 ataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaaataatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21856
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 21856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29748
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 29748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 14664 - 14728
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  14664 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 14728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 23679 - 23743
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  23679 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 23743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39167
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  39103 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 39167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 569 - 669
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 666  T
Q  125 atc 127  Q
    |||    
T  667 atc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103632
Alignment:
Q  24 tcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 120  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||  |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataa-aaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaa 103639  T
Q  121 caacatc 127  Q
    |||||||    
T  103638 caacatc 103632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267784
Alignment:
Q  28 cttagatcgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaaca--tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 124  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatat-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  125 atctcaa 131  Q
    |||||||    
T  267778 atctcaa 267784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 26828 - 27027
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaac-atcatgacataataatatcaaat 111  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||| ||||||  ||||| ||||| |||    
T  26828 catcattttaatcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattatatc-aat 26924  T
Q  112 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 210  Q
     ||| ||| |||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  26925 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 27021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29660
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacatcatgacataataatatcaaatg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||    |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  113 caa 115  Q
    |||    
T  29658 caa 29660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1795
Alignment:
Q  90 tcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1836 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6159
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69858
Alignment:
Q  13 catcatcttcatcaacttagatcgactcatacagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 77  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 69858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 216
Target Start/End: Original strand, 69905 - 70000
Alignment:
Q  121 caacatctcaattatacaatcataactcaagtaatgcttataa-cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 216  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||  || | ||||||||||||||||    
T  69905 caacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacactaacatctcat-aacagcttcacagatt 70000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University