View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13748_low_3 (Length: 222)

Name: NF13748_low_3
Description: NF13748
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13748_low_3
NF13748_low_3
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (2-215)||(5866129-5866342)
chr8 (2-215)||(21491048-21491261)
chr8 (2-214)||(17140969-17141181)
chr8 (5-215)||(21255279-21255488)
chr8 (5-215)||(21249441-21249650)
chr8 (88-210)||(26355557-26355679)
chr8 (2-210)||(23760698-23760912)
chr8 (87-212)||(20498704-20498829)
chr8 (2-211)||(6520421-6520632)
chr8 (2-212)||(38855107-38855319)
chr8 (2-212)||(21285650-21285863)
chr8 (2-210)||(21673757-21673967)
chr8 (71-212)||(983257-983401)
chr8 (83-212)||(37116486-37116615)
chr8 (7-46)||(17612134-17612173)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (2-215)||(28505153-28505366)
chr7 (2-214)||(34200839-34201051)
chr7 (2-215)||(11995882-11996095)
chr7 (11-212)||(15754744-15754946)
chr7 (2-117)||(16495455-16495570)
chr7 (2-210)||(67798-68008)
chr7 (2-210)||(18005699-18005910)
chr7 (2-210)||(16219574-16219785)
chr7 (87-212)||(15113084-15113209)
chr7 (87-212)||(15116621-15116746)
chr7 (2-208)||(44014231-44014434)
chr7 (2-212)||(16056381-16056593)
chr7 (5-210)||(810988-811196)
chr7 (2-212)||(47831860-47832073)
chr7 (138-211)||(16324197-16324270)
chr7 (30-212)||(20220044-20220226)
chr7 (83-212)||(22073052-22073181)
chr7 (83-212)||(12901461-12901594)
chr7 (4-46)||(19486768-19486810)
chr7 (172-212)||(9389552-9389592)
chr7 (83-133)||(14044885-14044935)
chr7 (83-133)||(14354915-14354965)
chr7 (2-46)||(2280143-2280187)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (2-215)||(19660690-19660903)
chr5 (2-210)||(22959392-22959600)
chr5 (5-212)||(21565598-21565808)
chr5 (2-210)||(19668951-19669161)
chr5 (2-212)||(21329352-21329565)
chr5 (2-212)||(21502009-21502224)
chr5 (2-212)||(26011890-26012103)
chr5 (2-212)||(20026795-20027009)
chr5 (70-117)||(36314672-36314719)
chr5 (2-46)||(36314630-36314674)
chr5 (157-212)||(21741400-21741455)
chr5 (4-46)||(40725908-40725950)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (2-215)||(16596701-16596914)
chr4 (2-215)||(15551870-15552082)
chr4 (64-212)||(8846490-8846638)
chr4 (2-212)||(12774060-12774263)
chr4 (2-212)||(13705-13919)
chr4 (87-212)||(43198410-43198532)
chr4 (2-210)||(12288066-12288278)
chr4 (2-212)||(39706144-39706356)
chr4 (83-211)||(15099485-15099613)
chr4 (83-212)||(15190452-15190581)
chr4 (83-212)||(53082005-53082135)
chr4 (2-51)||(8846409-8846458)
chr4 (83-212)||(46640311-46640439)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (2-215)||(15714-15927)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (2-215)||(11345-11558)
scaffold0046 (8-181)||(2056-2229)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (5-212)||(28496329-28496536)
chr6 (5-212)||(29808740-29808947)
chr6 (11-212)||(1561365-1561567)
chr6 (2-212)||(19652248-19652459)
chr6 (2-212)||(23019459-23019672)
chr6 (83-212)||(19668509-19668638)
chr6 (87-212)||(20109280-20109407)
chr6 (138-212)||(9098380-9098454)
chr6 (138-212)||(27333140-27333214)
chr6 (138-212)||(27393880-27393954)
chr6 (143-212)||(22080594-22080663)
chr6 (83-212)||(35008287-35008416)
chr6 (146-212)||(4668069-4668135)
chr6 (146-212)||(4674916-4674982)
chr6 (83-211)||(23076869-23076997)
chr6 (2-46)||(27333242-27333286)
chr6 (2-46)||(27393982-27394026)
chr6 (71-114)||(9098466-9098509)
chr6 (146-212)||(4185679-4185745)
chr6 (4-46)||(8227535-8227577)
chr6 (3-51)||(4185840-4185888)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (2-215)||(29132-29348)
scaffold0218 (2-212)||(7931-8142)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (6-215)||(20918661-20918870)
chr1 (2-212)||(33681060-33681273)
chr1 (2-212)||(52927837-52928038)
chr1 (2-210)||(20248332-20248539)
chr1 (2-134)||(22130843-22130975)
chr1 (2-212)||(22237680-22237894)
chr1 (2-117)||(14295504-14295619)
chr1 (17-117)||(51130632-51130732)
chr1 (2-212)||(22921724-22921937)
chr1 (103-212)||(21754192-21754301)
chr1 (87-212)||(21861424-21861549)
chr1 (83-212)||(21896113-21896239)
chr1 (73-211)||(20636975-20637113)
chr1 (87-212)||(12271695-12271813)
chr1 (88-212)||(49261481-49261605)
chr1 (83-212)||(16368141-16368270)
chr1 (83-208)||(35981547-35981672)
chr1 (2-124)||(35261023-35261146)
chr1 (2-46)||(21754098-21754142)
chr1 (2-46)||(21861594-21861638)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (2-216)||(34176-34390)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (18-215)||(2297-2494)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (2-210)||(6865-7073)
scaffold0556 (71-212)||(8140-8281)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (1-170)||(23071849-23072018)
chr2 (103-212)||(22134072-22134181)
chr2 (87-212)||(22459416-22459541)
chr2 (2-208)||(25175903-25176112)
chr2 (2-212)||(28406029-28406243)
chr2 (71-212)||(18786757-18786898)
chr2 (87-212)||(7587-7712)
chr2 (83-212)||(23791412-23791541)
chr2 (83-212)||(23207415-23207544)
chr2 (2-112)||(7679638-7679750)
chr2 (4-46)||(19671885-19671927)
chr2 (2-51)||(22134226-22134275)
chr2 (87-132)||(23708553-23708598)
chr2 (2-46)||(7757-7801)
chr2 (187-215)||(23071815-23071843)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (5-212)||(13210184-13210392)
chr3 (2-177)||(12174152-12174327)
chr3 (2-212)||(16097381-16097594)
chr3 (1-212)||(16103832-16104045)
chr3 (64-212)||(49389485-49389633)
chr3 (2-212)||(32307730-32307933)
chr3 (2-212)||(1644539-1644742)
chr3 (2-210)||(9512973-9513171)
chr3 (111-212)||(12934167-12934268)
chr3 (2-210)||(9520948-9521146)
chr3 (3-212)||(15470978-15471189)
chr3 (110-212)||(49667940-49668042)
chr3 (4-210)||(14234542-14234753)
chr3 (83-212)||(37251022-37251151)
chr3 (83-212)||(1465266-1465395)
chr3 (4-46)||(23274742-23274784)
chr3 (4-46)||(37642289-37642331)
chr3 (2-51)||(49668095-49668144)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (2-212)||(10396-10609)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (3-212)||(129959-130171)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (2-212)||(45647-45860)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (4-212)||(160739-160949)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (2-212)||(182-394)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (2-212)||(22529-22738)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (2-117)||(1022-1137)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (2-212)||(53403-53617)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (2-212)||(1135-1348)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (103-212)||(28666-28775)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (2-206)||(62251-62455)
scaffold0028 (103-212)||(132808-132917)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (2-212)||(12819-13032)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (2-210)||(6588-6798)
scaffold0621 (87-212)||(8608-8735)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (2-212)||(40029-40242)
scaffold0023 (2-212)||(100427-100640)
scaffold0023 (169-212)||(101616-101659)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (2-212)||(10580-10793)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (2-210)||(5696-5906)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (2-210)||(19317-19528)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (2-210)||(5980-6191)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (2-210)||(2502-2713)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (2-212)||(32589-32801)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (2-210)||(14554-14765)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (87-208)||(7917-8038)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (87-212)||(12709-12834)
scaffold0413 (2-46)||(12621-12665)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (103-200)||(32248-32345)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (7-212)||(2073-2281)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (103-212)||(2158-2267)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (137-212)||(2659-2734)
scaffold0628 (2-46)||(2830-2874)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (2-212)||(12992-13205)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (83-212)||(136222-136352)
scaffold0021 (83-212)||(144930-145060)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (71-212)||(6736-6877)
scaffold0333 (71-212)||(14116-14257)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (71-210)||(892-1030)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (83-212)||(103493-103622)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (138-212)||(15687-15761)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (146-212)||(9275-9341)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (4-46)||(11519-11561)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (4-46)||(38280-38322)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (2-51)||(23902-23951)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (83-211)||(78459-78587)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (83-212)||(97144-97272)
scaffold0006 (83-212)||(106422-106550)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (2-46)||(1085-1129)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (85-212)||(1652-1779)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (65-117)||(207470-207522)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5866342 - 5866129
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866342 aacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 5866243  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5866242 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 5866143  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  5866142 acatcaactcgaac 5866129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 21491048 - 21491261
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491048 aacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 21491147  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21491148 ttatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 21491247  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    |||| |||||||||    
T  21491248 acattaactcgaac 21491261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 17140969 - 17141181
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140969 aacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatgtaaatcatcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 17141068  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17141069 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 17141168  T
Q  202 acatcaactcgaa 214  Q
    |||||||||||||    
T  17141169 acatcaactcgaa 17141181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Original strand, 21255279 - 21255488
Alignment:
Q  5 agcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaatta 104  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255279 agcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaatta 21255378  T
Q  105 tataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21255379 tataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttagtgagacattaacagcagggt-aacaacttagttcctaacctctaagataaactcaca 21255477  T
Q  205 tcaactcgaac 215  Q
    |||||||||||    
T  21255478 tcaactcgaac 21255488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Original strand, 21249441 - 21249650
Alignment:
Q  5 agcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaatta 104  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249441 agcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaatta 21249540  T
Q  105 tataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21249541 tataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttagtgagacattaacagcagggt-aacaacttagttcctaacctctaagataaactcaca 21249639  T
Q  205 tcaactcgaac 215  Q
    |||||| ||||    
T  21249640 tcaacttgaac 21249650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26355679 - 26355557
Alignment:
Q  88 taatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  26355679 taatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaataacaaaaagataaacaacttagtttctaacc 26355580  T
Q  188 tctaagatcaactcacatcaact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26355579 tctaagatcaactcacatcaact 26355557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23760912 - 23760698
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||   |||| |||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  23760912 aacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaattcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatata 23760814  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcat-cagtcttactggaacattaacagcaa---ggtaaacaacttagtttttaacctctaaga 194  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   || ||| ||||||| ||||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760813 caattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttactgaaacaacaacaacaacaaggtaaacaacttagtttttaacctctaaga 23760714  T
Q  195 tcaactcacatcaact 210  Q
    ||||||||||||||||    
T  23760713 tcaactcacatcaact 23760698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Original strand, 20498704 - 20498829
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||    
T  20498704 gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacatcaagataaacaacttagtttcttac 20498803  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20498804 ctccaagatcaactcacatcaactcg 20498829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Original strand, 6520421 - 6520632
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatca--aacttaagtcatgtaatgtatatac 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   || | ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  6520421 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatac 6520520  T
Q  100 aattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6520521 aattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaac 6520620  T
Q  200 tcacatcaactc 211  Q
    ||||||||||||    
T  6520621 tcacatcaactc 6520632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38855319 - 38855107
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  38855319 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatata 38855221  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||  || ||||||||    
T  38855220 caattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttcctaatgtccaagatcaa 38855121  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
     |||||||||||||    
T  38855120 ttcacatcaactcg 38855107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 21285650 - 21285863
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||  |||  |||||| ||||   ||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21285650 aacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatata 21285749  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    |||||||||| |||||  | ||| ||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  21285750 caattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaagcacttagtttcttacctctaagatcaa 21285849  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  21285850 ctcacatcaactcg 21285863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 21673757 - 21673967
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||   |||| ||||||  | || | || |||||||||||    
T  21673757 aacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaatat-aatttatttaatgtatata 21673855  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcat-cagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   || ||  ||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21673856 caattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataa-caacttagtttttaacctctaatatca 21673954  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    |||||||| ||||    
T  21673955 actcacattaact 21673967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 983401 - 983257
Alignment:
Q  71 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaa---ggt 167  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| | |||||    |||| ||||||| ||||  |||| |||   | |    
T  983401 atcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaacaacaacaacatgat 983302  T
Q  168 aaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  983301 aaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcatatcaactcg 983257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 37116486 - 37116615
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||    ||||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||||||     
T  37116486 tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttc 37116585  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  37116586 ttacccccatgatcatctcacatcaactcg 37116615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 17612173 - 17612134
Alignment:
Q  7 caacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17612173 caacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatat 17612134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28505366 - 28505153
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505366 aacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcggatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 28505267  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28505266 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattgacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 28505167  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  28505166 acatcaactcgaac 28505153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 34200839 - 34201051
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200839 aacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 34200938  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34200939 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactgggacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 34201038  T
Q  202 acatcaactcgaa 214  Q
    |||||||||||||    
T  34201039 acatcaactcgaa 34201051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11996095 - 11995882
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996095 aacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaactcaaatatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 11995996  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11995995 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactgggacattaacagcaaggtaaacaaattagtttctaacctctaagataaactc 11995896  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  11995895 acatcaactcgaac 11995882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15754946 - 15754744
Alignment:
Q  11 ataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataac 110  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754946 ataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataac 15754847  T
Q  111 attataagcaacatt-aattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaac 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15754846 attataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaac 15754747  T
Q  210 tcg 212  Q
    |||    
T  15754746 tcg 15754744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 16495455 - 16495570
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16495455 aacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaa 16495554  T
Q  102 ttatataacattataa 117  Q
    ||||||||||||||||    
T  16495555 ttatataacattataa 16495570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 67798 - 68008
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||   ||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  67798 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaat-atcaa-cataattcatataatgtatata 67895  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcat-cagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  |||||   || ||| || |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  67896 caattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatca 67995  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    |||||||||||||    
T  67996 actcacatcaact 68008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 18005699 - 18005910
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  18005699 aacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatata 18005797  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18005798 caattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatca 18005897  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    ||||| |||||||    
T  18005898 actcatatcaact 18005910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16219785 - 16219574
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   | ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16219785 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 16219686  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16219685 caattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaa 16219586  T
Q  199 ctcacatcaact 210  Q
    || |||||||||    
T  16219585 ctaacatcaact 16219574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Original strand, 15113084 - 15113209
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||   ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||    
T  15113084 gtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactcatataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttac 15113183  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15113184 ctctaagatcaactcacatcaactcg 15113209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Original strand, 15116621 - 15116746
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||  |||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||| | ||    
T  15116621 gtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactcatatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttcttac 15116720  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15116721 ctctaagatcaactcacatcaactcg 15116746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 44014231 - 44014434
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| || ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||     
T  44014231 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacag 44014329  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaact 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44014330 ttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagat-aacaacttagtttttaacctct--gatcaact 44014426  T
Q  201 cacatcaa 208  Q
    ||||||||    
T  44014427 cacatcaa 44014434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 16056381 - 16056593
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||| |||||  |||  |||||| ||||   ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16056381 aacagcaacatagacattatgcaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 16056479  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||| | ||||  |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16056480 caattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaacatcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaa 16056579  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  16056580 ctcacatcaactcg 16056593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 811196 - 810988
Alignment:
Q  5 agcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca--attatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || |||  ||| |||  |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  811196 agcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaa 811097  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| |||   ||||||||| |||| |||||||||| |||| || ||| |||||||    
T  811096 ttatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaactacaacagcaagataaataacttagtttctaacttccaaggtcaactc 810997  T
Q  202 acatcaact 210  Q
    |||||||||    
T  810996 acatcaact 810988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 47831860 - 47832073
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca--attatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||  |  ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  47831860 aacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatata 47831959  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47831960 caattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaa 47832059  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  47832060 ctcacatcaactcg 47832073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 211
Target Start/End: Original strand, 16324197 - 16324270
Alignment:
Q  138 tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactc 211  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324197 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 16324270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20220226 - 20220044
Alignment:
Q  30 tcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatt 129  Q
    ||||||||||| |||||  |||  |||||| || |||||  |||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| || |    
T  20220226 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaat 20220127  T
Q  130 cataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||    ||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||| | ||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  20220126 catctaaatcaggcttactggaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccctgtgatcacctcacatcaactcg 20220044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 22073052 - 22073181
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||| ||||  |||||||||||||      
T  22073052 tcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagttcc 22073151  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22073152 ttacctgtaagatcaactcacatcaactcg 22073181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 12901461 - 12901594
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt- 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||    |||  ||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||     
T  12901461 tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 12901560  T
Q  182 tta---acctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
     ||   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12901561 ctacgtacctccaagatcaactcacatcaactcg 12901594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 19486810 - 19486768
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19486810 cagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatat 19486768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9389592 - 9389552
Alignment:
Q  172 aacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9389592 aacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcg 9389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Original strand, 14044885 - 14044935
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  14044885 tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Original strand, 14354915 - 14354965
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  14354915 tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 2280187 - 2280143
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  2280187 aacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatat 2280143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19660903 - 19660690
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660903 aacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaatataaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 19660804  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19660803 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 19660704  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  19660703 acatcaactcgaac 19660690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22959600 - 22959392
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22959600 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaa 22959501  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22959500 ttatataacattttaaccaacattgattcatatgcatcagtcttactggaacaaaaacaacaagataaacaacttggtttttaacctctaagatcaactc 22959401  T
Q  202 acatcaact 210  Q
    |||||||||    
T  22959400 acatcaact 22959392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 21565598 - 21565808
Alignment:
Q  5 agcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21565598 agcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaa 21565697  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21565698 ttatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 21565797  T
Q  202 acatcaactcg 212  Q
    |||||||||||    
T  21565798 acatcaactcg 21565808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 19668951 - 19669161
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19668951 aacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaactcaaatatcaaacataagtcctgtaatgtatatacaa 19669050  T
Q  102 ttatataacattataagcaacatta--attcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19669051 ttatataacattataaacaacatcaatattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacaacaagataaacgacttagtttctaacctctaagatcaac 19669150  T
Q  200 tcacatcaact 210  Q
    |||||||||||    
T  19669151 tcacatcaact 19669161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21329565 - 21329352
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca--attatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||  |  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21329565 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 21329466  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21329465 caattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaa 21329366  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  21329365 ctcacatcaactcg 21329352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21502224 - 21502009
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataa---atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||  ||   |||| || || ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21502224 aacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 21502125  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt-taacctctaagatc 196  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  21502124 caattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttttctaacttccaagatc 21502025  T
Q  197 aactcacatcaactcg 212  Q
    |||| |||||||||||    
T  21502024 aactaacatcaactcg 21502009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26012103 - 26011890
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||  ||| | ||||| ||||   ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26012103 aacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 26012004  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    |||||||||||||| |  | |||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||  || | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26012003 caattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggcttactgaaacaacaataacaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaa 26011904  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  26011903 ctcacatcaactcg 26011890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20027009 - 20026795
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaacca--tcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca-attatcaaacttaagtcatgtaatgtatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||  |||  || ||| |||| ||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20027009 aacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaacatcacaacatcaaacataattcatgtaatgtatat 20026910  T
Q  98 acaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||  ||||    |||| ||||||| ||||   ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20026909 acaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactacaacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatca 20026810  T
Q  198 actcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  20026809 actcacatcgactcg 20026795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 117
Target Start/End: Original strand, 36314672 - 36314719
Alignment:
Q  70 tatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314672 tatcgaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 36314719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 36314630 - 36314674
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36314630 aacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatat 36314674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21741455 - 21741400
Alignment:
Q  157 aacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21741455 aacatcaaggtaattaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcg 21741400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 40725908 - 40725950
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40725908 cagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatat 40725950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 16596701 - 16596914
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596701 aacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 16596800  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16596801 ttatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 16596900  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  16596901 acatcaactcgaac 16596914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 15551870 - 15552082
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551870 aacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaaggtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 15551969  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15551970 ttatataacattataagcaacattgattcataagcatcagtcttactgggacattaacagcagggt-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 15552068  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  15552069 acatcaactcgaac 15552082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 212
Target Start/End: Original strand, 8846490 - 8846638
Alignment:
Q  64 ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagca 163  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  8846490 ctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaactaca 8846589  T
Q  164 aggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8846590 agataaacaacttagtttctaatctctaagttcaactcacatcaactcg 8846638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 12774060 - 12774263
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataa--atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatac 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||  | || || |||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||    
T  12774060 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaatcaacaacatctcaattatcaa-cataatccatttaatgtatatac 12774158  T
Q  100 aattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    ||        |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12774159 aa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaac 12774250  T
Q  200 tcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||    
T  12774251 tcacatcaactcg 12774263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13919 - 13705
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattat-caaacttaagtcatgtaatgtatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||  |||  || ||| ||||   |||| ||| || |  ||| ||| |||||||||||    
T  13919 aacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatat 13820  T
Q  98 acaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13819 acaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaacaacttagtttcttacctctaagatca 13720  T
Q  198 actcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||||    
T  13719 actcacatcaactcg 13705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43198532 - 43198410
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  43198532 gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcattagtcttactggaacatcaacaacaagataaacaacttagttttttac 43198433  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||   | |||||||||||||||||    
T  43198432 ctct---agcaactcacatcaactcg 43198410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12288278 - 12288066
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaacca--tcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca-attatcaaacttaagtcatgtaatgtatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||  |||  || ||| |||| ||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12288278 aacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatcacaacatcaaacataattcatgtaatgtatat 12288179  T
Q  98 acaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||    |||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||    
T  12288178 acaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatca 12288079  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    |||||||||||||    
T  12288078 actcacatcaact 12288066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39706356 - 39706144
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatca--aacttaagtcatgtaatgtatatac 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || |||  |||   || | ||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  39706356 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatgaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatac 39706257  T
Q  100 aattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  |||||    |||| ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||    
T  39706256 aattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggcttactaaaacaacaacagcaagataaacaacttaattcctaatctccaagatcaac 39706157  T
Q  200 tcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||    
T  39706156 tcacatcaactcg 39706144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 211
Target Start/End: Original strand, 15099485 - 15099613
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||     ||| ||||||||||    |||| ||||||||| ||||||||||     
T  15099485 tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaatgacaacatcaaggtaaataacttagtttc 15099584  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactc 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15099585 taacctccaagatcaactcacatcaactc 15099613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 15190452 - 15190581
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||     ||| ||||||||||    |||| ||||||||| ||||||||||     
T  15190452 tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaatgacaacatcaaggtaaataacttagtttc 15190551  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15190552 taacccccaagatcaactcacatcaactcg 15190581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53082135 - 53082005
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt- 181  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| || |||||    |||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||||||     
T  53082135 tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttc 53082036  T
Q  182 ttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  53082035 ttaccccccaagatcaactcacatcaactcg 53082005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 8846409 - 8846458
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaat 51  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  8846409 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46640439 - 46640311
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| || | |||||| || |||||    ||||  |||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||     
T  46640439 tcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataacagtaagataagcaacttagtttc 46640340  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  46640339 ttacccc-atgatcaactcacatcaactcg 46640311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 15714 - 15927
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714 aacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 15813  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15814 ttatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtcttactggatcattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 15913  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  15914 acatcaactcgaac 15927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 11345 - 11558
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11345 aacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacta 11444  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11445 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttacttgaacattaacaccaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactc 11544  T
Q  202 acatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||    
T  11545 acatcaactcgaac 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Original strand, 2056 - 2229
Alignment:
Q  8 aacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056 aacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatat 2155  T
Q  108 aacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2156 aacattataagcaacattaattcataagcatcagacttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt 2229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28496536 - 28496329
Alignment:
Q  5 agcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaatta 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28496536 agcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaatta 28496437  T
Q  105 tataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28496436 tataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactctaagatcaactcaca 28496337  T
Q  205 tcaactcg 212  Q
    ||||||||    
T  28496336 tcaactcg 28496329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29808947 - 29808740
Alignment:
Q  5 agcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaatta 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29808947 agcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaatta 29808848  T
Q  105 tataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29808847 tataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactctaagatcaactcaca 29808748  T
Q  205 tcaactcg 212  Q
    ||||||||    
T  29808747 tcaactcg 29808740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 1561365 - 1561567
Alignment:
Q  11 ataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataac 110  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561365 ataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataac 1561464  T
Q  111 attataagcaacatt-aattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaac 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1561465 attataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaac 1561564  T
Q  210 tcg 212  Q
    |||    
T  1561565 tcg 1561567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 19652248 - 19652459
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataa--atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatac 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||  | || || |||||  ||||| | |||  ||| ||| ||||||||    
T  19652248 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaacatcaa-cataatccatttaaagtatatac 19652346  T
Q  100 aattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19652347 aattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaac 19652446  T
Q  200 tcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||    
T  19652447 tcacatcaactcg 19652459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 23019459 - 23019672
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||  |||  || ||| ||||   ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23019459 aacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 23019558  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23019559 caattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaa 23019658  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  23019659 ctcacatcaactcg 23019672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 19668509 - 19668638
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||  |||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||     
T  19668509 tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 19668608  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19668609 ttacctccaagatcaactcacatcaactcg 19668638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Original strand, 20109280 - 20109407
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaat--tatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttttta 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||| |||    | ||||||| ||||||||||||||| |     
T  20109280 gtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgatatacatcagtcttactagaaagacatcagcaagataaacaacttagtttctt 20109379  T
Q  185 acctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109380 acctctaagatcaactcacatcaactcg 20109407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9098454 - 9098380
Alignment:
Q  138 tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098454 tcaggcttactgaaacaataactgcaagataaacaaattagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcg 9098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27333214 - 27333140
Alignment:
Q  138 tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333214 tcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 27333140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27393954 - 27393880
Alignment:
Q  138 tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393954 tcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 27393880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22080663 - 22080594
Alignment:
Q  143 cttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||| ||||  || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080663 cttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 22080594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 35008287 - 35008416
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||    ||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||     
T  35008287 tcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacagtaagataagcaacttagtttc 35008386  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  35008387 ttacccccatgatcaactcacatcaactcg 35008416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4668135 - 4668069
Alignment:
Q  146 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||| ||||||| | ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4668135 actggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaactcacaacaactcg 4668069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4674982 - 4674916
Alignment:
Q  146 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||| ||||||| | ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4674982 actggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaactcacaacaactcg 4674916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 211
Target Start/End: Original strand, 23076869 - 23076997
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||    ||||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||| ||| |||||||     
T  23076869 tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaaattagtttc 23076968  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactc 211  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  23076969 ttacccccatgatcaactcacatcaactc 23076997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 27333286 - 27333242
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  27333286 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatat 27333242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 27394026 - 27393982
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  27394026 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatat 27393982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9098509 - 9098466
Alignment:
Q  71 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9098509 atcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatta 9098466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4185745 - 4185679
Alignment:
Q  146 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||| |||| || | ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4185745 actggaacatcaacaacatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaactcacaacaactcg 4185679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 8227577 - 8227535
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8227577 cagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatat 8227535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 4185888 - 4185840
Alignment:
Q  3 acagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaat 51  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  4185888 acagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaat 4185840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29348 - 29132
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29348 aacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtactgtatatacaa 29249  T
Q  102 ttatataacat---tataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29248 ttatataacataattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaa 29149  T
Q  199 ctcacatcaactcgaac 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  29148 ctcacatcaactcgaac 29132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8142 - 7931
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaacca--tcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca-attatcaaacttaagtcatgtaatgtatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||| |  |||| |  ||| |||||||||||||||    
T  8142 aacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaacaacatcacaacatcatatataattcatgtaatgtatat 8043  T
Q  98 acaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    |||| ||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8042 acaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaaca---acagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatca 7946  T
Q  198 actcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||||    
T  7945 actcacatcaactcg 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 20918661 - 20918870
Alignment:
Q  6 gcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattat 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918661 gcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattat 20918760  T
Q  106 ataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacat 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20918761 ataacattataagcaacatcaattcataagcatgagtcttactggaacattaacaacaaggtaaacgacttagtttctaacctctaagatcaactcacat 20918860  T
Q  206 caactcgaac 215  Q
    ||| ||||||    
T  20918861 caagtcgaac 20918870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 33681060 - 33681273
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||  ||||   |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33681060 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatata 33681159  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33681160 caattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaa 33681259  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  33681260 ctcacatcaactcg 33681273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52928038 - 52927837
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||         || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52928038 aacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat---------catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaa 52927948  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52927947 ttatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaatagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 52927848  T
Q  202 acatcaactcg 212  Q
    |||||||||||    
T  52927847 acatcaactcg 52927837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 20248332 - 20248539
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248332 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaa 20248431  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |     
T  20248432 ttatatatcattataaacaacatggattcatatgcatcagtcttactgg-acaacaacatcaagataaataacttagtttctaacctctaagatcaattt 20248530  T
Q  202 acatcaact 210  Q
    |||||||||    
T  20248531 acatcaact 20248539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130843
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatatacaa 22130876  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22130875 ttatataacattataagcaacatcaaatcataa 22130843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 22237680 - 22237894
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22237680 aacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatata 22237779  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaa-cagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237780 caattatataactttagaaacaacatcaattcatatgtatcagtctcgctggaacaacaatcagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatca 22237879  T
Q  198 actcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||||    
T  22237880 actcacatcaactcg 22237894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14295619 - 14295504
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14295619 aacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaa 14295520  T
Q  102 ttatataacattataa 117  Q
    ||||||||||||||||    
T  14295519 ttatataacattataa 14295504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130732
Alignment:
Q  17 agtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattata 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattata 51130731  T
Q  117 a 117  Q
    |    
T  51130732 a 51130732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22921937 - 22921724
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||   |||| |||||| |  || |||| |||||||||||    
T  22921937 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-caaaattcatataatgtatata 22921839  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22921838 caattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatca 22921739  T
Q  198 actcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||||    
T  22921738 actcacatcaactcg 22921724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Original strand, 21754192 - 21754301
Alignment:
Q  103 tatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactca 202  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21754192 tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctgagatcaactca 21754291  T
Q  203 catcaactcg 212  Q
    ||||||||||    
T  21754292 catcaactcg 21754301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21861549 - 21861424
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||   |||| ||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  21861549 gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatagcaagataaacaacttagtttcttac 21861450  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21861449 ctctaagatcaactcacatcaactcg 21861424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21896239 - 21896113
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||   ||| |||| |||||||||||||||     
T  21896239 tcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaaca---acaacaagataaacaacttagtttc 21896143  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21896142 ttacatctaagatcaactcacatcaactcg 21896113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 20636975 - 20637113
Alignment:
Q  73 caaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaaca 172  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||    |||| ||||||||||    |||| ||||||||| |    
T  20636975 caaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactggaatgacaacatcaaggtaaata 20637074  T
Q  173 acttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactc 211  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20637075 acttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactc 20637113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Original strand, 12271695 - 12271813
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||       ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||    
T  12271695 gtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactca-------cagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttac 12271787  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12271788 ctctaagatcaactcacatcaactcg 12271813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 212
Target Start/End: Original strand, 49261481 - 49261605
Alignment:
Q  88 taatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||    || | ||||||||||    |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  49261481 taatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactggaaggacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacc 49261580  T
Q  188 tctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  49261581 tccaagatcaactcacatcaactcg 49261605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16368270 - 16368141
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| || |||||    |||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||| |||     
T  16368270 tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataaacaacttaatttc 16368171  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16368170 ttacccctatgatcaactcacatcaactcg 16368141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35981672 - 35981547
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    |||     ||| ||||||||||    |||| |||| |||| ||||||||||     
T  35981672 tcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaatgacaacatcaagataaataacttagtttc 35981573  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35981572 taacctccaagatcaactcacatcaa 35981547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35261146 - 35261023
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaatta-tcaaacttaagtcatgtaatgtatataca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||  |||  |||||| || |||||  | ||| || ||| ||| |||||| |||||||    
T  35261146 aacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacatctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatataca 35261047  T
Q  101 attatataacattataagcaacat 124  Q
    |||| || ||||||| | ||||||    
T  35261046 attacatcacattattaacaacat 35261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 21754098 - 21754142
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  21754098 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatat 21754142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 21861638 - 21861594
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  21861638 aacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatat 21861594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 34176 - 34390
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34176 aacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcaaacttaagtcaagtaatatatatacaa 34275  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34276 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaaaattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 34375  T
Q  202 acatcaactcgaaca 216  Q
    ||||||||| |||||    
T  34376 acatcaactagaaca 34390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2494 - 2297
Alignment:
Q  18 gtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2494 gtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaattatataacattataa 2395  T
Q  118 gcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcgaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2394 gcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaacctctaagatcaactcacataaactcgaac 2297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 6865 - 7073
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6865 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaa 6964  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6965 ttatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactc 7064  T
Q  202 acatcaact 210  Q
    |||||||||    
T  7065 acatcaact 7073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 8140 - 8281
Alignment:
Q  71 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 170  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||    
T  8140 atcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaa 8239  T
Q  171 caacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8240 caacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 8281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23072018 - 23071849
Alignment:
Q  1 gaacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatataca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23072018 gaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatataca 23071919  T
Q  101 attatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23071918 attatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattagcaacaaggtaaa 23071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22134181 - 22134072
Alignment:
Q  103 tatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactca 202  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134181 tatacaacattataaacaacaccaattcatatgcatcagtcttactggaaaaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactca 22134082  T
Q  203 catcaactcg 212  Q
    ||||||||||    
T  22134081 catcaactcg 22134072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22459541 - 22459416
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || || ||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  22459541 gtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaactcgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttac 22459442  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22459441 ctctaaggtcaactcacatcaactcg 22459416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 25175903 - 25176112
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||    
T  25175903 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataacgtatata 25176001  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
     |||||||||||||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25176002 taattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatca 25176101  T
Q  198 actcacatcaa 208  Q
    ||| |||||||    
T  25176102 acttacatcaa 25176112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 28406029 - 28406243
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaac-catcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||   |||| |||||| ||||| ||||  |||||||||    
T  28406029 aacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cttaattcataaaatgtatat 28406127  T
Q  98 acaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatc 196  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||| ||  |||||   | | || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28406128 acaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttactaaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatc 28406227  T
Q  197 aactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  28406228 aactcacatcaactcg 28406243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18786898 - 18786757
Alignment:
Q  71 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 170  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| | |||||    | || ||||||| ||||  ||||||| | ||||    
T  18786898 atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaacaacagcatgataaa 18786799  T
Q  171 caacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786798 caacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcg 18786757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7712 - 7587
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||    |||| ||||||| ||||  |||| || | |||||||||||||||   ||    
T  7712 gtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaacaacttagtttcctac 7613  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7612 ctccaagatcaactcacatcaactcg 7587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 23791412 - 23791541
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| || |||||    |||| ||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||     
T  23791412 tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 23791511  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23791512 caacccccaagatcaactcacatcaactcg 23791541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 23207415 - 23207544
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| || |||||    |||| |||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||||||||     
T  23207415 tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaacagtaagataagcaacttagtttc 23207514  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23207515 ttacccccaagatcaactcacatcaactcg 23207544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Original strand, 7679638 - 7679750
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tc--aattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||| ||| ||| |||| ||  ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7679638 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaata-tcaatgtaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 7679736  T
Q  99 caattatataacat 112  Q
     |||||||||||||    
T  7679737 taattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 19671885 - 19671927
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19671885 cagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatat 19671927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 22134275 - 22134226
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaat 51  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  22134275 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaat 22134226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23708598 - 23708553
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcat 132  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  23708598 gtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcat 23708553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 7801 - 7757
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  7801 aacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatat 7757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23071843 - 23071815
Alignment:
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcgaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071843 ctctaagatcaactcacatcaactcgaac 23071815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13210392 - 13210184
Alignment:
Q  5 agcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaatta 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13210392 agcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaacttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaatta 13210293  T
Q  105 tataacattataagcaacatt-aattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcac 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13210292 tataacattataagcaacattgaattcatatgcatcagccttactggaatgttaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcac 13210193  T
Q  204 atcaactcg 212  Q
    |||||||||    
T  13210192 atcaactcg 13210184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12174327 - 12174152
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12174327 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaaacaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaa 12174228  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaactta 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  12174227 ttatataacattataaacaacattgattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 16097381 - 16097594
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||   |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16097381 aacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatata 16097480  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16097481 caattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctctaagatcaa 16097580  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  16097581 ctcacatcaactcg 16097594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16103832 - 16104045
Alignment:
Q  1 gaacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataa--atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||  | || || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  16103832 gaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatttaatgtatata 16103931  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16103932 aaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagattaa 16104031  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  16104032 ctcacatcaactcg 16104045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49389633 - 49389485
Alignment:
Q  64 ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagca 163  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  49389633 ctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacaaca 49389534  T
Q  164 aggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49389533 agataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacacacatcaactcg 49389485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 32307730 - 32307933
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataa--atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatac 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||  | || || |||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||    
T  32307730 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaattatcaa-cataatccatttaatgtatatac 32307828  T
Q  100 aattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    ||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32307829 aa--------cattataaacaacattaattcataagcatcagtcttactagaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaac 32307920  T
Q  200 tcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||    
T  32307921 tcacatcaactcg 32307933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1644742 - 1644539
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||| |||   |||||||||||| | |||  ||| |||||||||||    
T  1644742 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaacaatatctcaattatcaa-cataatccatttaatgtatata 1644645  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    |||        |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1644644 caa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaa 1644553  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  1644552 ctcacatcaactcg 1644539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 9512973 - 9513171
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| || |||| ||||||| | |||  ||| ||||||||||| ||    
T  9512973 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacatctcatttatcaa-cataatccatttaatgtatataaaa 9513070  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
            |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9513071 --------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactc 9513162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12934268 - 12934167
Alignment:
Q  111 attataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 210  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934268 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 12934169  T
Q  211 cg 212  Q
    ||    
T  12934168 cg 12934167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 9520948 - 9521146
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| || |||| ||||||| | |||  ||| |||||||||||  |    
T  9520948 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacatctcatttatcaa-cataatccatttaatgtatataaca 9521045  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactc 201  Q
            |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9521046 --------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactc 9521137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 15470978 - 15471189
Alignment:
Q  3 acagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15470978 acagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatac 15471077  T
Q  100 aattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    |||||||||||||||  | |||| |||  |||||    |||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  15471078 aattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcatc 15471176  T
Q  200 tcacatcaactcg 212  Q
    | |||||||||||    
T  15471177 taacatcaactcg 15471189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49668042 - 49667940
Alignment:
Q  110 cattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaac 209  Q
    |||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49668042 cattatatacaacatcaactcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaac 49667943  T
Q  210 tcg 212  Q
    |||    
T  49667942 tcg 49667940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 14234542 - 14234753
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca--attatcaaacttaagtcatgtaatgtatataca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||  |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14234542 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatataca 14234641  T
Q  101 attatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg--gaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||  | | |    |||| |||||||   ||||  |||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14234642 attatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggcttactgaacaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaa 14234741  T
Q  199 ctcacatcaact 210  Q
    || |||||||||    
T  14234742 ctaacatcaact 14234753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37251151 - 37251022
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| || |||||    |||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||     
T  37251151 tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttc 37251052  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37251051 ttacccccaagatcaactcacatcaactcg 37251022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1465395 - 1465266
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcat--cagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    |||| ||   ||| ||||||||||    | || ||||||||| |||||||||    
T  1465395 tcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattaga--ataaacaatccaggcttactggaatgacagcatcaaggtaaataacttagtt 1465298  T
Q  181 tttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1465297 tctaacctccaagatcaactcacatcaactcg 1465266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 23274742 - 23274784
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23274742 cagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatat 23274784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 37642331 - 37642289
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37642331 cagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatat 37642289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 49668144 - 49668095
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaat 51  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  49668144 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10609 - 10396
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10609 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatata 10510  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10509 caattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaa 10410  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  10409 ctcacatcaactcg 10396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 129959 - 130171
Alignment:
Q  3 acagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  129959 acagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatac 130058  T
Q  100 aattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130059 aattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaac 130158  T
Q  200 tcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||    
T  130159 tcacatcaactcg 130171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45860 - 45647
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||   ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  45860 aacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatcaacatctcaattatcaaacataattcatgtgatgtatata 45761  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45760 caattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaattacagcaatataaacaacttagtttctaacctctaagatcaa 45661  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  45660 ctcacatcaactcg 45647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 160739 - 160949
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatataca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||  || ||| ||||   |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  160739 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacataagtcatgtaatatatataca 160837  T
Q  101 attatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaact 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  160838 attatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaact 160937  T
Q  201 cacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||    
T  160938 cacatcaactcg 160949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 182 - 394
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||   |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  182 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatata 281  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||  ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  282 caattatataatattataaacaacatcaattcatatgtatcagtctcactagaacaacaacagcaagat-aacaactcagtttctaacctctaagatcaa 380  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  381 ctcacatcaactcg 394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22738 - 22529
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22738 aacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatata 22639  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||    | ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22638 caattatataacattataaacaacatcaat----atgcatcagtcttactggaacagcaacatcaagacaaacaacttagtttctaacctctaagatcaa 22543  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  22542 ctcacatcaactcg 22529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1137 - 1022
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1137 aacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaa 1038  T
Q  102 ttatataacattataa 117  Q
    ||||||||||||||||    
T  1037 ttatataacattataa 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53617 - 53403
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattat-caaacttaagtcatgtaatgtatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||  |||  || ||| ||||   |||| ||| || |  ||| ||| |||||||||||    
T  53617 aacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatat 53518  T
Q  98 acaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  53517 acaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaacaacttagtttcttacctctaagatca 53418  T
Q  198 actcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||||    
T  53417 actcacatcaactcg 53403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 1135 - 1348
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||   ||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  1135 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcatcaacatttcaaacatcaaacataattcatggaatgtatata 1234  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||| ||||||||||||  | |||||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  1235 caactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttactggaacaacaacaacaagataaaaaacttagtttcttacctctaagatcaa 1334  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  1335 ctcacatcaactcg 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28775 - 28666
Alignment:
Q  103 tatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactca 202  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28775 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactca 28676  T
Q  203 catcaactcg 212  Q
    ||||||||||    
T  28675 catcaactcg 28666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 62251 - 62455
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||  | | || || ||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  62251 aacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgcacaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaa 62349  T
Q  102 ttatataacattataagcaacattaattcataagcat-cagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaact 200  Q
    |||||||||||||  | || ||||| |||||||  || ||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62350 ttatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaact 62449  T
Q  201 cacatc 206  Q
    ||||||    
T  62450 cacatc 62455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Original strand, 132808 - 132917
Alignment:
Q  103 tatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactca 202  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  132808 tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactca 132907  T
Q  203 catcaactcg 212  Q
    ||||||||||    
T  132908 catcaactcg 132917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 12819 - 13032
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca--attatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||  |  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12819 aacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 12918  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  |||||    |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12919 caattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggcttactggaacaacaacagcaagataaaccacttagtttctaacctctaagatcaa 13018  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  13019 ctcacatcaactcg 13032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 6588 - 6798
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  6588 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatata 6686  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6687 caattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagat-aacaacttagtttttaacctctaagatca 6785  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    |||||||||||||    
T  6786 actcacatcaact 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Original strand, 8608 - 8735
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaat--tatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttttta 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| |     
T  8608 gtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaacatcagcaagataaacaacttagtttctt 8707  T
Q  185 acctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8708 acctctaagatcaattcacatcaactcg 8735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40242 - 40029
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||   |||| |||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  40242 aacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatata 40144  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcat-cagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| |||||  | |||||| |  |||||   || ||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40143 caattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatca 40044  T
Q  198 actcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||||    
T  40043 actcacatcaactcg 40029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 100427 - 100640
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||   ||||| |||  ||| ||| |||| |||||||||||    
T  100427 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat-taacataattcatataatgtatata 100525  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  |||||   | | || ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  100526 caattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagagca 100625  T
Q  198 actcacatcaactcg 212  Q
    | |||||||||||||    
T  100626 agtcacatcaactcg 100640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 212
Target Start/End: Original strand, 101616 - 101659
Alignment:
Q  169 aacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101616 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 101659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 10580 - 10793
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||   ||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  10580 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcgaacataattcatgtaatgtatata 10679  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10680 caattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaa 10779  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  10780 ctcacatcaactcg 10793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 5696 - 5906
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  5696 aacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatata 5794  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5795 caattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaa-aacttagtttttaacctctaagatca 5893  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    |||||||||||||    
T  5894 actcacatcaact 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 19317 - 19528
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  19317 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatata 19415  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    |||||  |||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19416 caattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactgaaacaacaacatcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatca 19515  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    |||||||||||||    
T  19516 actcacatcaact 19528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6191 - 5980
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca--attatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  || |||  ||| |||  |  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6191 aacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatata 6092  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6091 caattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaataacagcaagataaataacttagtttttaacctccaagatcaa 5992  T
Q  199 ctcacatcaact 210  Q
    || |||||||||    
T  5991 ctaacatcaact 5980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2713 - 2502
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  2713 aacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatata 2615  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2614 caattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacatcagcaagataaacaacttaatttctaacctctaagatca 2515  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    |||||||||||||    
T  2514 actcacatcaact 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 32589 - 32801
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataa--atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatac 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||  |||  ||  | || || |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32589 aacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatac 32688  T
Q  100 aattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaac 199  Q
    || ||||||||||||  |  |||||||  | |||    |||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32689 aactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggcttactgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaac 32788  T
Q  200 tcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||    
T  32789 tcacatcaactcg 32801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14765 - 14554
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||   |||| |||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  14765 aacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatata 14667  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatca 197  Q
    | |||||||| |||||  |  |||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14666 ctattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagatatacaacttagtttctaacctctaagatca 14567  T
Q  198 actcacatcaact 210  Q
    |||||||||||||    
T  14566 actcacatcaact 14554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8038 - 7917
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||  ||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||   ||    
T  8038 gtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcagcaagataaacaacttagtttcatac 7939  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7938 ctctaagatcaactcacatcaa 7917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Original strand, 12709 - 12834
Alignment:
Q  87 gtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaac 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | |||  ||| || ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  12709 gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttattac 12808  T
Q  187 ctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  12809 ctctaagatcaactcacatccactcg 12834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 12621 - 12665
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  12621 aacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatat 12665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Original strand, 32248 - 32345
Alignment:
Q  103 tatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaact 200  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32248 tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaact 32345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2073
Alignment:
Q  7 caacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaatt 103  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||  |||||| ||||   |||| |||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataattcatataatgtatatacaatt 2183  T
Q  104 atataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactca 202  Q
    ||||| |||||  | |||||||   |||||   | |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2182 atataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctctaagatcaactca 2083  T
Q  203 catcaactcg 212  Q
    ||||||||||    
T  2082 catcaactcg 2073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2267 - 2158
Alignment:
Q  103 tatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactca 202  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |  | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2267 tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactgggataagatcagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactca 2168  T
Q  203 catcaactcg 212  Q
    |||| |||||    
T  2167 catccactcg 2158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2734 - 2659
Alignment:
Q  137 atcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2734 atcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 2659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 2874 - 2830
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  2874 aacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatat 2830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 12992 - 13205
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaatataaatcagcaac-tca--attatcaaacttaagtcatgtaatgtatata 98  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  12992 aacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcgtgtaatgtatata 13091  T
Q  99 caattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||  | ||     |||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  13092 caattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaatctccatgatcaa 13191  T
Q  199 ctcacatcaactcg 212  Q
    ||||||||||||||    
T  13192 ctcacatcaactcg 13205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 136352 - 136222
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaat-tcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||  |||||    |||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  136352 tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 136253  T
Q  182 ttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  136252 cctacctccaagatcaactcacatcaactcg 136222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 145060 - 144930
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaat-tcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||  |||||    |||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  145060 tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 144961  T
Q  182 ttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  144960 cctacctccaagatcaactcacatcaactcg 144930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 6736 - 6877
Alignment:
Q  71 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 170  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||    |||  ||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  6736 atcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaa 6835  T
Q  171 caacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6836 caacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcg 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 14116 - 14257
Alignment:
Q  71 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 170  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||    |||  ||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  14116 atcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaa 14215  T
Q  171 caacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14216 caacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcg 14257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 892
Alignment:
Q  71 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatta-attcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaa 169  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| | ||   |||| ||||||| ||||  |||| |||| |||    
T  1030 atcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatttacaa--ttcaggcttactgaaacaacaacaacaagataa 933  T
Q  170 acaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 210  Q
    | |||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||    
T  932 ataacttagtttctaacttccaagatcaactaacatcaact 892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 103622 - 103493
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||| |||||    |||| ||||||| ||||  ||||| ||| |||| ||||||||||     
T  103622 tcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaggaagataaagaacttagtttc 103523  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  103522 ctacctccaagatcaactcacatcaactcg 103493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15687
Alignment:
Q  138 tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15761 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctccaagatcaactcacatcaactcg 15687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 212
Target Start/End: Original strand, 9275 - 9341
Alignment:
Q  146 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    |||||||||| ||||||| | ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9275 actggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaactcacaacaactcg 9341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 11519 - 11561
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11519 cagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatat 11561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 38322 - 38280
Alignment:
Q  4 cagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38322 cagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatat 38280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23951 - 23902
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatattgaat 51  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  23951 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 23902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 211
Target Start/End: Original strand, 78459 - 78587
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| || |||||    |||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||      
T  78459 tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagttgc 78558  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactc 211  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  78559 ttacccccatgatcaactcacatcaactc 78587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 97144 - 97272
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||    ||||| ||||||| ||||  ||||| |||  || |||||||||||     
T  97144 tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagcaacttagtttc 97243  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  97244 ttacccc-atgatcaactcacatcaactcg 97272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Original strand, 106422 - 106550
Alignment:
Q  83 tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttt 182  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||    ||||| ||||||| ||||  ||||| |||  || |||||||||||     
T  106422 tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagcaacttagtttc 106521  T
Q  183 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  106522 ttacccc-atgatcaactcacatcaactcg 106550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 1085 - 1129
Alignment:
Q  2 aacagcaacataggcagtatggaaaccatcatgatataataatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  1085 aacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatat 1129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1779 - 1652
Alignment:
Q  85 atgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt-tt 183  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||| | || |||||    |||| ||||||||||||  || || ||| ||  ||||||||||| ||    
T  1779 atgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaatagtaagataggcaacttagtttctt 1680  T
Q  184 aacctctaagatcaactcacatcaactcg 212  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1679 accctc-aagatcaactcacatcaactcg 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 207522 - 207470
Alignment:
Q  65 tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 117  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  207522 tcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatataattatataacattataa 207470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University