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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF13755_low_14 (Length: 349)
Name: NF13755_low_14
Description: NF13755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF13755_low_14 |
 |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] chr2 (35 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr4 (38 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] chr7 (46 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr8 (44 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (37 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0892 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0670 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0598 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1666 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0761 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0193 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0107 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0175 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 956
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1218 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt |
1119 |
T |
 |
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1118 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
1019 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1018 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6064
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6326 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
6227 |
T |
 |
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6226 |
aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
6127 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6126 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
6064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507228
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23506965 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
23507064 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23507065 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
23507164 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23507165 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccat |
23507228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623309
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623085 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
20623184 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623185 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
20623284 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623285 |
catgattatgataaagactaacccc |
20623309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233451
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233675 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
21233576 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233575 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
21233476 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233475 |
catgattatgataaagactaacccc |
21233451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182546
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
27182810 |
catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
27182711 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182710 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattat |
27182611 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182610 |
catcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccatt |
27182546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536537
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16536313 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata |
16536412 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16536413 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
16536512 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16536513 |
catgattatgataaagactaacccc |
16536537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 126 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900329
Alignment:
| Q |
126 |
aattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900552 |
aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
25900453 |
T |
 |
| Q |
226 |
aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac |
325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900452 |
aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccgttcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac |
25900353 |
T |
 |
| Q |
326 |
atgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900352 |
atgattatgataaagactaacccc |
25900329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531068
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18531330 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
18531231 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18531230 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
18531131 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18531130 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
18531068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053084
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37052860 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
37052959 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37052960 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatctcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
37053059 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
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37053060 |
catgattatgataaagactaacccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
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Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053834
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109 |
Q |
| |
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| T |
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catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
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T |
 |
| Q |
110 |
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208 |
Q |
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| T |
22053996 |
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22053897 |
T |
 |
| Q |
209 |
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271 |
Q |
| |
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22053896 |
catcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
22053834 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 34939292 - 34939618
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123 |
Q |
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| T |
34939292 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattcacaatgacttagc |
34939391 |
T |
 |
| Q |
124 |
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223 |
Q |
| |
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| T |
34939392 |
aaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcat |
34939491 |
T |
 |
| Q |
224 |
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322 |
Q |
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| T |
34939492 |
acaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatg |
34939591 |
T |
 |
| Q |
323 |
aacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
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||||||||||||| || ||||||||| |
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| T |
34939592 |
aacatgattatgaagaacactaacccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 29188486 - 29188284
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157 |
Q |
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aacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaactt |
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T |
 |
| Q |
158 |
attatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta |
257 |
Q |
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| T |
29188386 |
atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatcta |
29188287 |
T |
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| Q |
258 |
gca |
260 |
Q |
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||| |
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| T |
29188286 |
gca |
29188284 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443398
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
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| T |
43443647 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat |
43443548 |
T |
 |
| Q |
110 |
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207 |
Q |
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| T |
43443547 |
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43443448 |
T |
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| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta |
257 |
Q |
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| T |
43443447 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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| T |
22366733 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat |
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T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
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| T |
22366633 |
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22366534 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
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| T |
22366533 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
22366481 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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| T |
25426628 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25426727 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
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| T |
25426728 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25426827 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
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| T |
25426828 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
25426880 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777995
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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| T |
18778244 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
18778145 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
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| T |
18778144 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
18778045 |
T |
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| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta |
257 |
Q |
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| T |
18778044 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
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T |
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Target: chr5; HSP #16
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12374 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
12473 |
T |
 |
| Q |
109 |
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207 |
Q |
| |
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| T |
12474 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
12573 |
T |
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| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
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| T |
12574 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
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Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010089
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
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| T |
27009841 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
109 |
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207 |
Q |
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| T |
27009941 |
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27010040 |
T |
 |
| Q |
208 |
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256 |
Q |
| |
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| T |
27010041 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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T |
 |
| Q |
109 |
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207 |
Q |
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| T |
19499999 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
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T |
 |
| Q |
208 |
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260 |
Q |
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| T |
19500099 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
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Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
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| T |
21073747 |
taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
21073648 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
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| T |
21073647 |
acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
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Q |
| |
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|
| T |
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 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
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| |
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caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
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 |
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tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcattt |
282 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
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|
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| |
|
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 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 29918129 - 29918212
Alignment:
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174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29918129 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt |
29918212 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
10778112 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatg |
10778014 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10778013 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
10777968 |
T |
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Target: chr5; HSP #25
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256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
19862371 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19862456 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
23981601 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
23981516 |
T |
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Target: chr5; HSP #27
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23514729 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
23514819 |
T |
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Target: chr5; HSP #28
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
1219662 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatg |
1219564 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1219563 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
1219518 |
T |
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Target: chr5; HSP #29
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| Q |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
21297260 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattt |
21297175 |
T |
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Target: chr5; HSP #30
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| Q |
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
5450928 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt |
5450844 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
21222693 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
21222609 |
T |
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Target: chr5; HSP #32
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| Q |
78 |
aacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaatt-catcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-ttt |
174 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| |||||| |||||| || ||||||||| || ||||||| |||||||| || | ||| | || |||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
35791287 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatct-cataacttaacatttatacatacttt |
35791189 |
T |
 |
| Q |
175 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35791188 |
gaaacatgtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
35791096 |
T |
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Target: chr5; HSP #33
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
22885806 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaattt |
22885889 |
T |
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Target: chr5; HSP #34
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11212153 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaatt |
11212063 |
T |
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17471676 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaatt |
17471586 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
432625 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattt |
432710 |
T |
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Target: chr5; HSP #37
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| Q |
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255 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
21617181 |
gaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
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T |
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
36989912 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
36989814 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36989813 |
cacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaatt |
36989768 |
T |
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Target: chr5; HSP #39
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174 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| || ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | | |
|
|
| T |
24084144 |
aacatcaattaaacatgattcacatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactat |
24084241 |
T |
 |
| Q |
175 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
24084242 |
gaacatgtaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatca |
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T |
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Target: chr5; HSP #40
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207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
26559962 |
aacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
26559865 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26559864 |
tcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaattt |
26559815 |
T |
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Target: chr5; HSP #41
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
21932523 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
21932425 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
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220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
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caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
21938595 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21938594 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
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220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
35582150 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
35582248 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
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| |
|
|||||||||| |||||| | | ||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
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| |
|
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|
|
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| |
|
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|
|
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Target: chr5; HSP #47
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Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
54 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29190522 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa |
29190482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3585
Alignment:
| Q |
12 |
tcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-tta |
110 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3843 |
tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
3744 |
T |
 |
| Q |
111 |
acaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3743 |
acaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
3644 |
T |
 |
| Q |
211 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatc |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3643 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatc |
3585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1387
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1124 |
catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
1223 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1224 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
1323 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1324 |
tatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
1387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396576
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
17396916 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
17396817 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
17396816 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
17396717 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17396716 |
tcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatgtcaacccatttcatacaaatcatgaa |
17396618 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17396617 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccc |
17396576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463001
Alignment:
| Q |
15 |
tcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat-taaca |
113 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |
|
|
| T |
462743 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
462842 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
462843 |
acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatca |
462942 |
T |
 |
| Q |
214 |
attcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
462943 |
attcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
463001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820411
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23820187 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
23820286 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23820287 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
23820386 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23820387 |
catgattatgataaagactaacccc |
23820411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891506
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8891242 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
8891341 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8891342 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattat |
8891441 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8891442 |
catcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
8891506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906363
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906587 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
14906488 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906487 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
14906388 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906387 |
catgattatgataaagactaacccc |
14906363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689324
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19689548 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
19689449 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19689448 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
19689349 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19689348 |
catgattatgataaagactaacccc |
19689324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982440
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
36982704 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
36982605 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36982604 |
caacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattat |
36982505 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36982504 |
catcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
36982440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627313
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
20627576 |
catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat |
20627477 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20627476 |
taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
20627377 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20627376 |
catcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccat |
20627313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265312
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| || | ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| | || ||| |||| |
|
|
| T |
25265653 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
25265554 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265553 |
caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
25265454 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
25265453 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgag |
25265354 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25265353 |
aaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccc |
25265312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794703
Alignment:
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
19794967 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
19794868 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19794867 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
19794768 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
19794767 |
tatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccatt |
19794703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341390
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24341652 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
24341553 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341552 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattat |
24341453 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341452 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatcca |
24341390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507766
Alignment:
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaa-caagaatcaaatctcaat |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| || ||||| | ||||||||| || || || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
7508107 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat |
7508008 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7508007 |
taacaacaacttagccaaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
7507908 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |
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|
| T |
7507907 |
catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaataattattcattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgag |
7507808 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7507807 |
aaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccc |
7507766 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015351
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20015127 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg |
20015226 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20015227 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaaccaatttcatctaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
20015326 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20015327 |
catgatcatgataaagactaacccc |
20015351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642958
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
43643220 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat |
43643121 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43643120 |
taataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
43643021 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43643020 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatcca |
43642958 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
19886913 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
19886814 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| || || |||||||| |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
19886813 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19886714 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886713 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
19886661 |
T |
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Target: chr2; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 24884848 - 24884933
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| Q |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
24884848 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
24884933 |
T |
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
68154 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
68238 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 12728560 - 12728650
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12728560 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
12728650 |
T |
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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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Target Start/End: Original strand, 34824643 - 34824733
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34824643 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
34824733 |
T |
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaa |
253 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
19660044 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaa |
19660124 |
T |
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| Q |
175 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagca |
249 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
19669191 |
gaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagca |
19669116 |
T |
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Target: chr2; HSP #22
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12635956 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaatt |
12635866 |
T |
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Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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| Q |
185 |
tttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
22579933 |
tttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
22579863 |
T |
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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23778133 |
aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaatt |
23778043 |
T |
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Target: chr2; HSP #25
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aacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
9636845 |
aacaacaacatagcacaattcaacaattagagcataatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
9636942 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
9636943 |
tcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca |
9636974 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #26
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
22775290 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
22780668 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||| |
|
|
| T |
43646059 |
aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt |
43646139 |
T |
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3798691 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
3798645 |
T |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
11231480 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
11231382 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11231381 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
11231336 |
T |
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Target: chr2; HSP #31
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
19666690 |
tttgaacatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattt |
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T |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
22513327 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
22513229 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22513228 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
22513183 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
24685923 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
24685825 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
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|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24685824 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
24685779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28775949 - 28775805
Alignment:
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
28775949 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
28775851 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28775850 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
28775805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Original strand, 24277861 - 24277990
Alignment:
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
24277861 |
aacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattg |
24277958 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaat-tcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
24277959 |
tcaccaatatcatgtattcaaacatatcatca |
24277990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13048471 - 13048144
Alignment:
| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat-taacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13048471 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttag |
13048372 |
T |
 |
| Q |
123 |
ca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
221 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
13048371 |
gagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgc |
13048272 |
T |
 |
| Q |
222 |
atacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaat |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13048271 |
atacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaat |
13048172 |
T |
 |
| Q |
322 |
gaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13048171 |
gaacatgatggtgataaagactaacccc |
13048144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680540
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
26680201 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
26680300 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26680301 |
caactacaacat-gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat |
26680399 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26680400 |
tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccattccatacaaatcatgaaa |
26680499 |
T |
 |
| Q |
309 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26680500 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
26680540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675090
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15675352 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
15675253 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675252 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
15675153 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675152 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
15675090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246694
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
13246430 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
13246529 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246530 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
13246629 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246630 |
cattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccatt |
13246694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327849
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16328073 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
16327974 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16327973 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
16327874 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16327873 |
catgattatgataaagactaacccc |
16327849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118243
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | || ||| |
|
|
| T |
54118507 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc |
54118408 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118407 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
54118308 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118307 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
54118243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 125 - 347
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488900
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488678 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
10488777 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488778 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaactcatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
10488877 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacc |
347 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
10488878 |
catgattaagataaagaccaacc |
10488900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104251
Alignment:
| Q |
78 |
aacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttga |
176 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10104445 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattga |
10104346 |
T |
 |
| Q |
177 |
acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104345 |
acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatcca |
10104251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 109 - 272
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122152
Alignment:
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
121989 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
122088 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
122089 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccat |
122152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31115629 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
31115728 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31115729 |
caacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
31115828 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31115829 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
31115865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644467
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
10644219 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
10644318 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644319 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
10644418 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
10644419 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
10644467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
47357654 |
catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
47357753 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
47357754 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
47357853 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357854 |
acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
47357906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
Alignment:
| Q |
78 |
aacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttg |
175 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
40885749 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatactttg |
40885651 |
T |
 |
| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40885650 |
aacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt |
40885570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 271
Target Start/End: Original strand, 33240890 - 33240962
Alignment:
| Q |
199 |
atacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
271 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33240890 |
atacaatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
33240962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111493
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
111395 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
111493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16609074 - 16609022
Alignment:
| Q |
297 |
caaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16609074 |
caaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
16609022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 273
Target Start/End: Original strand, 7850090 - 7850264
Alignment:
| Q |
101 |
atctcaatt-aacaacaacttagcaaaatt-catcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatc |
198 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7850090 |
atctcaattcaacaatcacttagcaaaatttcatcacttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatc |
7850189 |
T |
 |
| Q |
199 |
atacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| |
|
|
| T |
7850190 |
acacagttttcatcaatacattcattcaaacataacatctccattggagcacgaatttaacagcaattatgcatt |
7850264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17145845 - 17145655
Alignment:
| Q |
78 |
aacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttg |
175 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| |||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
17145845 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcactaattgagtataattt-cacaacttaacatttatacatactttg |
17145747 |
T |
 |
| Q |
176 |
aa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | | || ||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
17145746 |
aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaatt |
17145655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Original strand, 18169084 - 18169228
Alignment:
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
18169084 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatg |
18169182 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18169183 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
18169228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Original strand, 15044990 - 15045074
Alignment:
| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
15044990 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
15045074 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Target Start/End: Original strand, 18276596 - 18276681
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
18276596 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattt |
18276681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47535150 - 47535065
Alignment:
| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
47535150 |
tttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
47535065 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13809595 - 13809511
Alignment:
| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| || |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
13809595 |
tttgaacatgaaatctcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
13809511 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15013365 - 15013282
Alignment:
| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta |
257 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
15013365 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattc-aacatatcatcataattagagcacgaattta |
15013282 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15109434 - 15109350
Alignment:
| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15109434 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt |
15109350 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18238304 - 18238175
Alignment:
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
18238304 |
aacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
18238207 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaat-tcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
18238206 |
tcaccaatatcatgtattcaaacatatcatca |
18238175 |
T |
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Target: chr4; HSP #27
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| Q |
78 |
aacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttg |
175 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| |||||| |||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
8374576 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatattaaaattcactaattgagtataattt-cataacttaacatttatacatactttg |
8374674 |
T |
 |
| Q |
176 |
aa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8374675 |
aagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
8374722 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #28
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7132153 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaatt |
7132063 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #29
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| Q |
167 |
acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || ||||||| |||| |
|
|
| T |
7964802 |
acatacttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattt |
7964712 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #30
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176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19020654 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaatt |
19020744 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #31
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catcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22738390 |
catcaattaagcataattt-cacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
22738483 |
T |
 |
Back To:
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
18494412 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
18494329 |
T |
 |
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| Q |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
30232581 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
30232498 |
T |
 |
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| Q |
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agttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31132545 |
agttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
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T |
 |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
40905017 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
41256516 |
aacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
41256419 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| | ||||| |||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
41256418 |
tcaccaatttcatgcattc-aacatttcatcataattagagcacgaattt |
41256370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
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| Q |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatc |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
38764873 |
tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatc |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
54 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10104494 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa |
10104450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842561
Alignment:
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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|
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14842824 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
14842725 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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| T |
14842724 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattat |
14842625 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14842624 |
cttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
14842561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158018
Alignment:
| Q |
9 |
acatcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat |
108 |
Q |
| |
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| T |
51158282 |
acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
51158183 |
T |
 |
| Q |
109 |
-taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
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|
| T |
51158182 |
ctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
51158083 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
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| T |
51158082 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
51158018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954813
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
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| T |
13955153 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13955054 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
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| T |
13955053 |
taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
13954954 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
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| T |
13954953 |
tcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccatttcatacaattcatgaa |
13954855 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
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| T |
13954854 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccc |
13954813 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859023
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
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| T |
15859287 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
15859188 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
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| T |
15859187 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
15859088 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
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| T |
15859087 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
15859023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936633
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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| T |
15936890 |
catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
15936791 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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| T |
15936790 |
taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
15936691 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
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|
| T |
15936690 |
catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt |
15936633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861145
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
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|
| T |
45860805 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
45860904 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
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| T |
45860905 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
45861004 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
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| T |
45861005 |
tcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccatttcatacaattcatgaa |
45861103 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
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| T |
45861104 |
aaattgcaaagaatgaatatgattatggtaaagactaacccc |
45861145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912407
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
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|
| T |
17912744 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt |
17912645 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
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| T |
17912644 |
caactacaacatatcaaa-ttcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
17912546 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaa |
308 |
Q |
| |
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|
| T |
17912545 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaataatg-aa |
17912448 |
T |
 |
| Q |
309 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17912447 |
aattgcaataaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
17912407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030147
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |
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|
| T |
12030410 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat |
12030311 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12030310 |
taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
12030211 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12030210 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
12030147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975654
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
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|
| T |
13975985 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13975886 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
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|
| T |
13975885 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
13975786 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| |
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| T |
13975785 |
tcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccatttcatacaattcatgaa |
13975687 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaag |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
13975686 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaag |
13975654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050073
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2049810 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat |
2049909 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2049910 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
2050009 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2050010 |
catcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
2050073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938475
Alignment:
| Q |
13 |
catcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaa |
111 |
Q |
| |
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| T |
15938729 |
catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa |
15938630 |
T |
 |
| Q |
112 |
caacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
211 |
Q |
| |
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| T |
15938629 |
caacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
15938530 |
T |
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| Q |
212 |
caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
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| T |
15938529 |
caattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaatt |
15938475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449161
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
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| T |
2449385 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
2449286 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
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|
| T |
2449285 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
2449186 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
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| T |
2449185 |
catgattatgataaagactaacccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 268
Target Start/End: Original strand, 13838908 - 13839153
Alignment:
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24 |
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Q |
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| T |
13838908 |
gaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag |
13839007 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
13839008 |
caaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgca |
13839107 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13839108 |
tacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattat |
13839153 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #14
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14 |
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112 |
Q |
| |
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|||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |
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| T |
15614838 |
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15614937 |
T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15614938 |
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15615037 |
T |
 |
| Q |
213 |
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228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
15615038 |
aattcatgcatacaaa |
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T |
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Target: chr3; HSP #15
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108 |
Q |
| |
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|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
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catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
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T |
 |
| Q |
109 |
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207 |
Q |
| |
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|||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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| T |
55316319 |
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55316418 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
55316419 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
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T |
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Target: chr3; HSP #16
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
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|
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41270075 |
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41270174 |
T |
 |
| Q |
109 |
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207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
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|
| T |
41270175 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta |
41270274 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
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|
| T |
41270275 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
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T |
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Target: chr3; HSP #17
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
16821139 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
16821238 |
T |
 |
| Q |
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207 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821239 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16821338 |
T |
 |
| Q |
208 |
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238 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16821339 |
tcatcaatttatgcatacaaacataacatca |
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T |
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Target: chr3; HSP #18
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109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
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catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
16744278 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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||| | ||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
16744277 |
caactataacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttat |
16744179 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
16744178 |
tatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccat |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||| |
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|
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aacaacaacttagcaaaattcactatttgagcacaattt-cataacttgacattaatacatactttaaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaatta |
11986231 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
11986230 |
tcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaaggag |
11986131 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11986130 |
aagttgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccc |
11986089 |
T |
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Q |
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|
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19231979 |
atcatcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
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T |
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Q |
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|
||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
54651558 |
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T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattat |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54651657 |
tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattat |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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|
|||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
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T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
47984750 |
caacaacaacttagca |
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T |
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
48003224 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
48003323 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
48003324 |
caacaacaacttagca |
48003339 |
T |
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220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
25058853 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatg |
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T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25058952 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
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T |
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220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
49232550 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatg |
49232648 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
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T |
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174 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| |||||| |||||| || ||||||||| || ||||||| |||||||| || | ||| | || |||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
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aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatct-cataacttaacatttatacatacttt |
12264883 |
T |
 |
| Q |
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gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
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gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
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T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
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tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
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T |
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109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |||||| | ||||||| | ||| | |||| | |||||| || |
|
|
| T |
15468596 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt |
15468497 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
206 |
Q |
| |
|
|| | ||| || |||| |||||||||| || | ||||| || ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |
|
|
| T |
15468496 |
caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataattt-catgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata |
15468398 |
T |
 |
| Q |
207 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15468397 |
atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
15468338 |
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Q |
| |
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| T |
47993937 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
47994036 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
47994037 |
caacaacaacttagca |
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T |
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Target: chr3; HSP #31
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108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| | || || |||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
48012510 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
48012609 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
48012610 |
caacaacaacttagca |
48012625 |
T |
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174 |
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256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || | |||||| |||||||| |
|
|
| T |
4145896 |
tgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt |
4145814 |
T |
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Target: chr3; HSP #33
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111 |
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208 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| || || |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
6228771 |
acaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattat |
6228674 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| || ||||||||||| || | || |||||||||||| |
|
|
| T |
6228673 |
caccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
6228625 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
17191703 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
17191788 |
T |
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
17204843 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
17204928 |
T |
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc-atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19260924 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatcc |
19260825 |
T |
 |
| Q |
271 |
at |
272 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
19260824 |
at |
19260823 |
T |
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268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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12902178 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattat |
12902086 |
T |
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
17139670 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
17139754 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
30207378 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
30207462 |
T |
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| Q |
173 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||| |
|
|
| T |
3576522 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaatt |
3576439 |
T |
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Target: chr3; HSP #41
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| Q |
110 |
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207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
14814912 |
aacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
14814815 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || ||||||||||| || | || ||||||||||| |
|
|
| T |
14814814 |
tcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaattt |
14814765 |
T |
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18911161 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaatt |
18911251 |
T |
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22275377 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
22275467 |
T |
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5228481 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat |
5228570 |
T |
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256 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
9590839 |
tttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattt |
9590754 |
T |
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| Q |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34560061 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcat |
34560126 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || || |||||||| |
|
|
| T |
12953126 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaatt |
12953210 |
T |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaa |
253 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
13301552 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaa |
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T |
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaa |
253 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
13312208 |
tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaa |
13312128 |
T |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
15517795 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
15517878 |
T |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || |||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
41661729 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattt |
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T |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
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caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
1467783 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1467782 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
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31412416 |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | || || || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
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| |
|
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|
|
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T |
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Back To:
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Target: scaffold0049 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48453
Alignment:
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
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|
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| T |
48187 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
48286 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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|
| T |
48287 |
taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
48386 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48387 |
catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatcaattca |
48453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25292587 - 25292261
Alignment:
| Q |
24 |
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122 |
Q |
| |
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| T |
25292587 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctag |
25292488 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
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| T |
25292487 |
gagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcataca |
25292388 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatg |
322 |
Q |
| |
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|
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| T |
25292387 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcttgaaaaattgcaaagaatg |
25292288 |
T |
 |
| Q |
323 |
aacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25292287 |
aacttgattatgataaagactaacccc |
25292261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253841
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18254098 |
catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
18253999 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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|
| T |
18253998 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
18253899 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
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|
| T |
18253898 |
catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt |
18253841 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47480953
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47481294 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
47481195 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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|
| T |
47481194 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat |
47481095 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
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| T |
47481094 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgag |
47480995 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
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| T |
47480994 |
aaattgcaataaatgaatatgattatgatgaagactaacccc |
47480953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293356
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
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|
| T |
7293017 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
7293116 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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| T |
7293117 |
caacaacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat |
7293215 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaa |
308 |
Q |
| |
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| T |
7293216 |
tattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaa |
7293315 |
T |
 |
| Q |
309 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
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|
| T |
7293316 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
7293356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Original strand, 16211780 - 16212029
Alignment:
| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
16211780 |
gaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag |
16211879 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
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|
| T |
16211880 |
caaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgca |
16211979 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16211980 |
tacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccat |
16212029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516567
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
11516343 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
11516442 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11516443 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
11516542 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11516543 |
catgattatgataaagactaacccc |
11516567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441487
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15441711 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
15441612 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15441611 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
15441512 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
15441511 |
catgattatgataaagactaacccc |
15441487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262052
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30262276 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
30262177 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30262176 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
30262077 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30262076 |
catgattatgataaagactaacccc |
30262052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052928
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
36052667 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
36052766 |
T |
 |
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
209 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36052767 |
ta--acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattatc |
36052864 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36052865 |
atcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccatt |
36052928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580738
Alignment:
| Q |
15 |
tcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat-taaca |
113 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |
|
|
| T |
11580997 |
tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
11580898 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
213 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11580897 |
acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
11580798 |
T |
 |
| Q |
214 |
attcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11580797 |
attcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatt |
11580738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037013
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||| | |||||| |
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|
| T |
13037277 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc |
13037178 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13037177 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattat |
13037078 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13037077 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
13037013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060229
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
3059966 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
3060065 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
3060066 |
taacaacaacttaacaaaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattat |
3060165 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
3060166 |
catcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
3060229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321357
Alignment:
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| |||| ||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13321014 |
catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
13321113 |
T |
 |
| Q |
110 |
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205 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13321114 |
caacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat |
13321212 |
T |
 |
| Q |
206 |
tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcat |
304 |
Q |
| |
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| T |
13321213 |
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13321312 |
T |
 |
| Q |
305 |
gaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
13321313 |
gagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccc |
13321357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478968
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16479213 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat |
16479114 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16479113 |
taaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
16479014 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
16479013 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaat |
16478968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
10989410 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
10989509 |
T |
 |
| Q |
110 |
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208 |
Q |
| |
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|||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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| T |
10989510 |
tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaa |
10989609 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10989610 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
10989661 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437715
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctca-at |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
2437457 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat |
2437556 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaa-ttcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
2437557 |
taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
2437656 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2437657 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaatt |
2437715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572924
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
13572676 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13572775 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
13572776 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca |
13572875 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13572876 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
13572924 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911024
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
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|
| T |
13911277 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
13911178 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaactt-agca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13911177 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
13911078 |
T |
 |
| Q |
207 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13911077 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca |
13911024 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113912
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14114031 |
atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatga |
14113932 |
T |
 |
| Q |
330 |
ttatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14113931 |
ttatgataaagactaacccc |
14113912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 230 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423563
Alignment:
| Q |
230 |
atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatga |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14423681 |
atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatga |
14423582 |
T |
 |
| Q |
330 |
ttatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14423581 |
ttatgat-aagactaacccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 296224 - 295965
Alignment:
| Q |
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catcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt--a |
110 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||| | | | ||||||| ||||||| |||||| | | ||||| | |
|
|
| T |
296224 |
catcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaacatcaattgaacatgaatcacaacacaattcaa |
296128 |
T |
 |
| Q |
111 |
acaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
210 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||| || ||| | |||||| | ||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
296127 |
acatcaatttagcaaaattcaccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatca |
296028 |
T |
 |
| Q |
211 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||| || | | || || ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
296027 |
tcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcatt |
295965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48622758 - 48622664
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48622758 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaatt |
48622664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16915013 - 16914928
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| Q |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
16915013 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Original strand, 9611470 - 9611555
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
9611470 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9611555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
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Target Start/End: Original strand, 9839041 - 9839126
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
9839041 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9839126 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #26
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
15950933 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatg |
15950835 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15950834 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
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T |
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Target: chr7; HSP #27
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
13377691 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
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T |
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Target: chr7; HSP #28
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18980109 |
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207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
28722210 |
aacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
28722307 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
28722308 |
tcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||| |
|
|
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48356806 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15927736 |
aacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaatt |
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T |
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Target: chr7; HSP #32
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| Q |
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256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||| |
|
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14271899 |
T |
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||| |||| |
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T |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||||| |
|
|
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14935524 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaattt |
14935607 |
T |
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Target: chr7; HSP #35
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||||| |
|
|
| T |
15363117 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaattt |
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T |
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176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
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|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13758538 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
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T |
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Target: chr7; HSP #37
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca |
235 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15358961 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatca |
15359023 |
T |
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Target: chr7; HSP #38
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176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15760202 |
aacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataatt |
15760112 |
T |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
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| T |
7822842 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
7822940 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7822941 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
7822986 |
T |
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Target: chr7; HSP #40
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| Q |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
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| T |
7830153 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
7830251 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7830252 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
7830297 |
T |
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Target: chr7; HSP #41
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
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|
| T |
27101779 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
27101681 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27101680 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
27101635 |
T |
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Target: chr7; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27109127 - 27108983
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
27109127 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
27109029 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27109028 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
27108983 |
T |
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Target: chr7; HSP #43
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Target Start/End: Original strand, 27176547 - 27176691
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| Q |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
27176547 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
27176645 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27176646 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
27176691 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38783871 - 38783727
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| Q |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
38783871 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
38783773 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38783772 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
38783727 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
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| Q |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || ||||| || |||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
13274939 |
tttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
13275023 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17224023 - 17223939
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
17224023 |
tttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
17223939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
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Target Start/End: Original strand, 5552 - 5869
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| Q |
34 |
acccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaacaacaacttagca-aaattca |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
5552 |
acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca |
5651 |
T |
 |
| Q |
132 |
tcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacat |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5652 |
ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat |
5751 |
T |
 |
| Q |
232 |
atcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgatt |
331 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5752 |
aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattattcattcattcgtttcaatccatttcatacaaatcatgaaaaattgtaaagaatgaacatgatt |
5851 |
T |
 |
| Q |
332 |
atgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5852 |
atggtaaagactaacccc |
5869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907137
Alignment:
| Q |
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
22907476 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
22907377 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22907376 |
caactacaacat-gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat |
22907278 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22907277 |
tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaa |
22907178 |
T |
 |
| Q |
309 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22907177 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
22907137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373467
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
43373731 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
43373632 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43373631 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattat |
43373532 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43373531 |
catcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccatt |
43373467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193716
Alignment:
| Q |
9 |
acatcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa- |
107 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16193980 |
acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa |
16193881 |
T |
 |
| Q |
108 |
ttaacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16193880 |
ttaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatta |
16193781 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16193780 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
16193716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238427
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
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| T |
5238203 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
5238302 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5238303 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
5238402 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5238403 |
catgattatgataaagactaacccc |
5238427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661171
Alignment:
| Q |
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224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
24661296 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661295 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
24661196 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661195 |
catgattatgataaagactaacccc |
24661171 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685886
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685662 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
43685761 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685762 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
43685861 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685862 |
catgattatgataaagactaacccc |
43685886 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Original strand, 17345584 - 17345910
Alignment:
| Q |
24 |
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123 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
17345584 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattcacaataacttagc |
17345683 |
T |
 |
| Q |
124 |
aaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcat |
223 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17345684 |
aaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcat |
17345783 |
T |
 |
| Q |
224 |
acaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatg |
322 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |
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| T |
17345784 |
ataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatg |
17345883 |
T |
 |
| Q |
323 |
aacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17345884 |
aacatgattatgatgaagactaacccc |
17345910 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24929040 - 24928791
Alignment:
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24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| || | |||||| ||| ||||||||| |
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| T |
24929040 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttag |
24928941 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24928940 |
cgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
24928841 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24928840 |
tacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
24928791 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404975
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16405235 |
catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt |
16405136 |
T |
 |
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
209 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16405135 |
ta--acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
16405038 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16405037 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccat |
16404975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaac |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |
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|
| T |
24548986 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
24549085 |
T |
 |
| Q |
113 |
aacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
212 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24549086 |
aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
24549185 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24549186 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca |
24549233 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
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| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaac |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6774505 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
6774406 |
T |
 |
| Q |
113 |
aacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
212 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6774405 |
aataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
6774306 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6774305 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca |
6774258 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21844810 - 21844576
Alignment:
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122 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21844810 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttag |
21844711 |
T |
 |
| Q |
123 |
ca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
221 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21844710 |
gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgc |
21844611 |
T |
 |
| Q |
222 |
atacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21844610 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
21844576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21852203 - 21851969
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| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21852203 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttag |
21852104 |
T |
 |
| Q |
123 |
ca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
221 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21852103 |
gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgc |
21852004 |
T |
 |
| Q |
222 |
atacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21852003 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
21851969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
30120722 |
catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
30120821 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
30120822 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
30120921 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30120922 |
acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
30120974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
16674644 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
16674545 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16674544 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
16674445 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16674444 |
acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca |
16674392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222754
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctc-aat |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
222943 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
222844 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
222843 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
222754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736377
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108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
736566 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
736467 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
736466 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860272
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Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
860461 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
860362 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
860361 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
860272 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 26011656 - 26011741
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256 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
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| T |
26011656 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
26011741 |
T |
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22006400 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatg |
22006302 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22006301 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
22006256 |
T |
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Target: chr8; HSP #21
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172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
17285366 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
17285450 |
T |
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Target: chr8; HSP #22
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139 |
agcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691967 |
agcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
691909 |
T |
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Target: chr8; HSP #23
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16195399 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaatt |
16195489 |
T |
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256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||| |
|
|
| T |
15933460 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt |
15933545 |
T |
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
21198237 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
21198152 |
T |
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| Q |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
25296320 |
tttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattt |
25296405 |
T |
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
25758340 |
tttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattt |
25758425 |
T |
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| Q |
177 |
acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
23226156 |
acatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
23226076 |
T |
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110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
33172328 |
aacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
33172425 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
33172426 |
tcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca |
33172457 |
T |
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Target: chr8; HSP #30
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123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |
|
|
| T |
13662407 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatg |
13662309 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13662308 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
13662263 |
T |
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Target: chr8; HSP #31
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13721016 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaatt |
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T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
5854776 |
tttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
5854861 |
T |
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106 |
aattaacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || || |
|
|
| T |
24552721 |
aattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattca |
24552624 |
T |
 |
| Q |
204 |
attatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
24552623 |
attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatca |
24552588 |
T |
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Target: chr8; HSP #34
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
16873093 |
T |
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207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
18261618 |
aacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaagatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
18261521 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| | |||||||||||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
18261520 |
tcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataactagagcacgaattt |
18261471 |
T |
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atttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca-tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23151919 |
atttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattt |
23151833 |
T |
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220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
271502 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
271404 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
271403 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
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T |
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220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
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caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
644516 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
644517 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
644562 |
T |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
830153 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
830251 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
830252 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
830297 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #40
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
22088936 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaag |
22088838 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
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Target: chr8; HSP #41
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Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
22742864 |
aacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
22742961 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca |
235 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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| |
|
||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Original strand, 23837360 - 23837445
Alignment:
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172 |
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256 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
23837360 |
tttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
23837445 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45559084 - 45558955
Alignment:
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
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|
| T |
45559084 |
aacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
45558987 |
T |
 |
| Q |
208 |
tca-tcaattcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||| | | |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
45558986 |
tcactaatttcatgtactcaaacatatcatca |
45558955 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
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Target Start/End: Original strand, 12115 - 12376
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| Q |
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12115 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt |
12214 |
T |
 |
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
209 |
Q |
| |
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| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12215 |
a-caacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattatc |
12313 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12314 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
12376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9141
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8878 |
catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
8977 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8978 |
taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
9077 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9078 |
catcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccat |
9141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108004
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
107747 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
107846 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
107847 |
taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
107946 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
107947 |
catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaatt |
108004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64527
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
64780 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
64681 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
64680 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
64581 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatc-----aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
64580 |
tcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
64527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 89915 - 89863
Alignment:
| Q |
206 |
tatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89915 |
tatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
89863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19470
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
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|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |
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|
| T |
19206 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
19305 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19306 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
19405 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19406 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
19470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
21290 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
21389 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21390 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
21489 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21490 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148981
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
148721 |
catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
148820 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
148821 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
148920 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatc |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
148921 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatc |
148981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9111
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| | | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8849 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt |
8948 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8949 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
9048 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcca |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9049 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatcca |
9111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 238
Target Start/End: Original strand, 53508 - 53575
Alignment:
| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat-tcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53508 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatca |
53575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Original strand, 85697 - 85779
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174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
85697 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaattt |
85779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931608
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20931345 |
catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
20931444 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20931445 |
taacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
20931544 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20931545 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
20931608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 270
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913291
Alignment:
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20913037 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaat------t |
20913130 |
T |
 |
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20913131 |
aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc |
20913230 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20913231 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatcc |
20913291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893625
Alignment:
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
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Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
20893889 |
catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc |
20893790 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattat |
20893690 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20893689 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccatt |
20893625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452832
Alignment:
| Q |
125 |
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224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452608 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
51452707 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452708 |
caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
51452807 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452808 |
catgattaagataaagactaacccc |
51452832 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394485
Alignment:
| Q |
10 |
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108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394222 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca |
41394321 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394322 |
taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattat |
41394421 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41394422 |
catcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
41394485 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
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Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445943
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
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|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||| |
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|
| T |
20445679 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20445778 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20445779 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
20445878 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445879 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
20445943 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228066
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| Q |
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22227809 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22227908 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
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|
| T |
22227909 |
taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat |
22228008 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22228009 |
catcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaatt |
22228066 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232763
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22232506 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22232605 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232606 |
taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat |
22232705 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22232706 |
catcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaatt |
22232763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844449
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
37844714 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
37844615 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaactt-attatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || || |||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37844614 |
taacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
37844515 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37844514 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccatt |
37844449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531708
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||| |
|
|
| T |
20531444 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20531543 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20531544 |
caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
20531643 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20531644 |
catcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
20531708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116506
Alignment:
| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaa-tctcaa-ttaa |
111 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
2116258 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa |
2116357 |
T |
 |
| Q |
112 |
caacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
211 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2116358 |
caataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
2116457 |
T |
 |
| Q |
212 |
caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2116458 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca |
2116506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
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| Q |
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
5072640 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
5072541 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
5072540 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
5072441 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5072440 |
acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
5072388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601118
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
18601370 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
18601271 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
18601270 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
18601171 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18601170 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca |
18601118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051674
Alignment:
| Q |
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174 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45051489 |
ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatattt |
45051588 |
T |
 |
| Q |
175 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
45051589 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22143446 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
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17609090 |
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17609174 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
20177337 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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aacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
21195114 |
aacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaatta |
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T |
 |
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tcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||| |
|
|
| T |
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tcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
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Target: chr1; HSP #19
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
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|
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T |
 |
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221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
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Q |
| |
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|
| T |
18059801 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
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T |
 |
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Target: chr1; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 27329840 - 27329757
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| Q |
172 |
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255 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
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| T |
27329840 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
27329757 |
T |
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Target: chr1; HSP #21
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
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37233945 |
tttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca |
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T |
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176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17148735 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
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T |
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174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca-tcaattcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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8537993 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatca |
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T |
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca-tcaattcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |
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tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatca |
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T |
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220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
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caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
17004850 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17004851 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
17004896 |
T |
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Q |
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|
|||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |
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|
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38033748 |
aatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt |
38033675 |
T |
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
38055233 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
38055135 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38055134 |
cacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaatt |
38055089 |
T |
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Target: chr1; HSP #28
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106 |
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203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| || || |
|
|
| T |
5768320 |
aattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattca |
5768223 |
T |
 |
| Q |
204 |
attatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
5768222 |
attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatca |
5768187 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
16646074 |
tttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
16646158 |
T |
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Target: chr1; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Original strand, 16656800 - 16656884
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
16656800 |
tttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
16656884 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
128431 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt |
128332 |
T |
 |
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
209 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
128331 |
aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc |
128232 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
128231 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat |
128169 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31697
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
31928 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
31829 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaactt-agca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31828 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact |
31729 |
T |
 |
| Q |
207 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
31728 |
aacatcaattcatgcattcaaacataacatca |
31697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 48598 - 48861
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
48598 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
48697 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48698 |
tagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
48797 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48798 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
48861 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
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Target Start/End: Original strand, 36093 - 36323
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
36093 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat |
36192 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
36193 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
36292 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36293 |
acatcaattcatacatacaaacataacatca |
36323 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
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123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
154149 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatg |
154051 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
154050 |
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154005 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
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109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
37328 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc |
37229 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||| ||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
37228 |
caactacaacatgtcaaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat |
37130 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37129 |
tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaa |
37030 |
T |
 |
| Q |
309 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37029 |
aattgtaaggaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
36989 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123163
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || ||| |
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| T |
123427 |
catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc |
123328 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
123327 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
123228 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
123227 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
123163 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26663 - 26414
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25 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |
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|
| T |
26663 |
aatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagc |
26564 |
T |
 |
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124 |
aaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcat |
223 |
Q |
| |
|
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|
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26563 |
aaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcat |
26464 |
T |
 |
| Q |
224 |
acaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26463 |
acaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacatt |
26414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8102
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||||||| || |||||| || | ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| | || ||| |||| |
|
|
| T |
8440 |
catcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
8341 |
T |
 |
| Q |
110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
209 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8340 |
--caacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
8243 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaaa |
308 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||| | |
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| T |
8242 |
accaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgaga |
8143 |
T |
 |
| Q |
309 |
aattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8142 |
aattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccc |
8102 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7110 - 7025
Alignment:
| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
7110 |
tttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
7025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5060
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat- |
108 |
Q |
| |
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|||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |
|
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| T |
5324 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc |
5225 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5224 |
taacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattat |
5125 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5124 |
catcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccatt |
5060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1505
Alignment:
| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1729 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
1630 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1629 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
1530 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1529 |
catgattatgataaagactaacccc |
1505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1657996 - 1657670
Alignment:
| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaattaacaacaacttagc |
123 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
1657996 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattcacaataacttagc |
1657897 |
T |
 |
| Q |
124 |
aaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcat |
223 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1657896 |
aaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcat |
1657797 |
T |
 |
| Q |
224 |
acaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatg |
322 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |
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| T |
1657796 |
ccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatg |
1657697 |
T |
 |
| Q |
323 |
aacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1657696 |
aacatgattatgatgaagactaacccc |
1657670 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 273
Target Start/End: Original strand, 23153461 - 23153711
Alignment:
| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat-taacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
23153461 |
gaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
23153560 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23153561 |
caaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
23153660 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23153661 |
tacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccatt |
23153711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626118
Alignment:
| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaac |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14626377 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac |
14626278 |
T |
 |
| Q |
113 |
aacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626277 |
aacaacttagcataattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
14626178 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14626177 |
aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccat |
14626118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009361
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| | || ||| |||| |
|
|
| T |
35009702 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
35009603 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009602 |
caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
35009503 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
35009502 |
catcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttcttcaattcaacccatattcatacaacaaatgag |
35009403 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35009402 |
aaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccc |
35009361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Original strand, 15862487 - 15862812
Alignment:
| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaattaacaacaacttagc |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| || | ||||||| | | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
15862487 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaattcacaataacttagc |
15862585 |
T |
 |
| Q |
124 |
aaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcat |
223 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862586 |
aaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcat |
15862685 |
T |
 |
| Q |
224 |
acaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatg |
322 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
15862686 |
acaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatg |
15862785 |
T |
 |
| Q |
323 |
aacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15862786 |
aacatgattatgatgaagactaacccc |
15862812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650105
Alignment:
| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaac |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1650352 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
1650253 |
T |
 |
| Q |
113 |
aacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
212 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650252 |
cataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
1650153 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1650152 |
aattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca |
1650105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
25175563 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25175662 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
25175663 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25175762 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175763 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca |
25175815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
27654235 |
catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat |
27654136 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
27654135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
27654036 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27654035 |
acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
27653983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctc-aat |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
16826006 |
catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
16825907 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatca--tacaat |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | |||| || ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |
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|
| T |
16825906 |
taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac |
16825807 |
T |
 |
| Q |
206 |
tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825806 |
taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
16825752 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751765
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187 |
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286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccatttattcaattcaac |
27751702 |
T |
 |
| Q |
287 |
ccat-ttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27751703 |
ccatattcatacaca-aatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccc |
27751765 |
T |
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78 |
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175 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||| | |||| |||| |
|
|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatactttg |
29666039 |
T |
 |
| Q |
176 |
aa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29666040 |
aaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat |
29666137 |
T |
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Target: chr6; HSP #12
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
18629693 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
18629608 |
T |
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10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| | | ||||| | ||| | | | |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27740838 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
27740937 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattt |
148 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27740938 |
caacaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt |
27740977 |
T |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||| |
|
|
| T |
29605614 |
tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
29605696 |
T |
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Target: chr6; HSP #15
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| Q |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16887877 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt |
16887792 |
T |
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat |
254 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
17083280 |
tgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
17083200 |
T |
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaac |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17557102 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-caaacatatcatcataattagagcacgaatttaacaac |
17557012 |
T |
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1556173 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
1556263 |
T |
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16232060 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
16232150 |
T |
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35136097 |
tttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt |
35136013 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
21623330 |
tttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaatt |
21623414 |
T |
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Target: chr6; HSP #22
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18086911 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaatt |
18086821 |
T |
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
16556281 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
16556183 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16556182 |
cacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaatt |
16556137 |
T |
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
16632837 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
16632739 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16632738 |
cacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaatt |
16632693 |
T |
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Target: chr6; HSP #25
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22225880 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatg |
22225782 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22225781 |
cacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaatt |
22225736 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||| |
|
|
| T |
22361850 |
tttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattt |
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T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33324855 |
tttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt |
33324939 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
18381768 |
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18381684 |
T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
18399100 |
tttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
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T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta |
257 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15079793 |
tttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcatacaa-catatcatcctagttagagcacgaattta |
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T |
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23977937 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
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T |
 |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatat |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatat |
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T |
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ttcacaacttattatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||| || |||| | |
|
|
| T |
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ttcacaacatatcactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttag |
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T |
 |
| Q |
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agcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
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agcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
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caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
10488911 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10488912 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
10488957 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16376515 - 16376371
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| Q |
123 |
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220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
16376515 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
16376417 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16376416 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
16376371 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16383839 - 16383695
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| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
16383839 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
16383741 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16383740 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
16383695 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Original strand, 22848115 - 22848244
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207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
22848115 |
aacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaatt--cacaatataacattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatta |
22848212 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22848213 |
tcaccaatttcttgcatttaaacatatcatca |
22848244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22880
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125 |
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224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22656 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
22755 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22756 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattattcattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
22855 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22856 |
catgattatgataaagactaacccc |
22880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27135
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| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26911 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
27010 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27011 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaaggaa |
27110 |
T |
 |
| Q |
325 |
catgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27111 |
catgattatgataaagactaacccc |
27135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36912
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
37176 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc |
37077 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
37076 |
caaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattat |
36977 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36976 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccatt |
36912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13847
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| | || ||| |||| |
|
|
| T |
13506 |
catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
13605 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13606 |
caacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
13705 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
13706 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgag |
13805 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13806 |
aaattgcaataaataaacatgattatgatgaagactaacccc |
13847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34383
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaa-caagaatcaaatctcaat |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||||| || ||||| | ||||||||| || || || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
34724 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat |
34625 |
T |
 |
| Q |
109 |
t-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34624 |
tcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
34525 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatga |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
34524 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatga |
34425 |
T |
 |
| Q |
307 |
aaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaaccc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34424 |
gaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccc |
34383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 247691 - 247441
Alignment:
| Q |
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gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat-taacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
247691 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
247592 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
247591 |
caaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgca |
247492 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
247491 |
tacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
247441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34336 - 34156
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88 |
gaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttg-aacatgtaa |
184 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| || ||||||||| || | ||||||||||||| || | || |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
34336 |
gaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacatatccaaattcatcaattaagtataa-cttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaa |
34238 |
T |
 |
| Q |
185 |
tttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34237 |
tttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt |
34156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41992
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| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat-taac |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
41733 |
atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac |
41832 |
T |
 |
| Q |
113 |
aacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41833 |
aacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatc |
41932 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41933 |
aattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
41992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:
Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 783 - 533
Alignment:
| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat-taacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | || ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
783 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttag |
684 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
683 |
caaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
584 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
583 |
tacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
533 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9371
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| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaac |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9596 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
9497 |
T |
 |
| Q |
113 |
aacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
212 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9496 |
aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
9397 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9396 |
aattcatgcatacaaacataacatca |
9371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16269
Alignment:
| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaac |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16494 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
16395 |
T |
 |
| Q |
113 |
aacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
212 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16394 |
aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
16295 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
16294 |
aattcatgcatacaaacataacatca |
16269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41988
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||| | | ||||||| ||||||| | || ||| |||| |
|
|
| T |
41648 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
41747 |
T |
 |
| Q |
110 |
-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41748 |
caacaacaacatagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
41847 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccat-ttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| | || |||| |
|
|
| T |
41848 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatac-aacaatgag |
41946 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41947 |
aaattgaaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccc |
41988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Original strand, 171919 - 172168
Alignment:
| Q |
24 |
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122 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
171919 |
gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag |
172018 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
172019 |
caaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcca |
172118 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
172119 |
tacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccat |
172168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Original strand, 177622 - 177871
Alignment:
| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
177622 |
gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag |
177721 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
177722 |
caaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcca |
177821 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
177822 |
tacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccat |
177871 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5466 |
catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
5368 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5367 |
taacaacaactcagcaaaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
5268 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
5267 |
catcaattcatgca |
5254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 103007 - 102923
Alignment:
| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
103007 |
tttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt |
102923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctc-aat |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3722 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
3821 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttatta-tttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3822 |
taacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
3921 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
3922 |
tcatcaattcatgca |
3936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21110
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
21367 |
catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat |
21268 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21267 |
taacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattat |
21168 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21167 |
catcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaatt |
21110 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14083
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
14312 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat |
14213 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
208 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14212 |
tatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattat |
14113 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
14112 |
catcaattcatgcatacagacataacatca |
14083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43226
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
42997 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat |
43096 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43097 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43196 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatc |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
43197 |
tcatcaattcatgcatagaaacataacatc |
43226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Original strand, 39217 - 39361
Alignment:
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
39217 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
39315 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
39316 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
39361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Original strand, 272039 - 272288
Alignment:
| Q |
24 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttag |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
272039 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag |
272138 |
T |
 |
| Q |
123 |
caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
272139 |
caaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattca |
272238 |
T |
 |
| Q |
223 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
272239 |
tacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccat |
272288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Original strand, 35 - 283
Alignment:
| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
35 |
catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
134 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
234 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
235 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0529 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:
Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3220
Alignment:
| Q |
14 |
atcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaa-caagaatcaaatctcaatt-aa |
111 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||| || ||||| | ||||||||| || || || |||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
2966 |
atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa |
3065 |
T |
 |
| Q |
112 |
caacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3066 |
caacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
3165 |
T |
 |
| Q |
212 |
caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3166 |
caattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaatt |
3220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 89618 - 89453
Alignment:
| Q |
108 |
ttaacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89618 |
ttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
89519 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89518 |
tcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
89453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107783
Alignment:
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
107835 |
catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccatt |
107783 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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Target Start/End: Original strand, 79704 - 79786
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175 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
79704 |
gaacatgcaatttcaccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt |
79786 |
T |
 |
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Target: scaffold0018 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
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aattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
225 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51328 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac |
51229 |
T |
 |
| Q |
226 |
aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
272 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51228 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
51182 |
T |
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Target: scaffold0420 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
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Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13479 - 13325
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| Q |
106 |
aattaacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13479 |
aattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat |
13380 |
T |
 |
| Q |
206 |
tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13379 |
tatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagca |
13325 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
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Target: scaffold1711; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 1439 - 1304
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| Q |
125 |
aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1439 |
aaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcata |
1340 |
T |
 |
| Q |
225 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1339 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
1304 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:
Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
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Target Start/End: Original strand, 3290 - 3528
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110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
3290 |
aacaacaacttagcaaaattcaccatttgagtacaattt-cataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaata |
3388 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| | || | || |
|
|
| T |
3389 |
tcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccatttattca-atcaacccatttca-cataacaaggag |
3486 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
3487 |
aaattgcaataaatgaacatgattatgaggaagaataacccc |
3528 |
T |
 |
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Target: scaffold0361; HSP #2
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| Q |
12 |
tcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaatt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
3210 |
tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaatt |
3266 |
T |
 |
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Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
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catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctc-aat |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48514 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat |
48613 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
48614 |
taacaac |
48620 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:
Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 56022
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110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
56262 |
aacaacaacttagcaaaattcaccatttgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaatta |
56164 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| || |
|
|
| T |
56163 |
tcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatctattcattccaatcaaccaatttcatacaacaagggag |
56064 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccc |
349 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
56063 |
aagttgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccc |
56022 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctc-aat |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
115 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat |
16 |
T |
 |
| Q |
109 |
taacaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15 |
taacaac |
9 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
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| Q |
10 |
catcatcaatacaagaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaat |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9382 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
9480 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
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Target Start/End: Original strand, 45098 - 45244
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| Q |
78 |
aacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttg |
175 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| |||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
45098 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-caaaacttgacatttatacatactttg |
45196 |
T |
 |
| Q |
176 |
aa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45197 |
aaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
45244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 54484 - 54630
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| Q |
78 |
aacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttg |
175 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| |||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
54484 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatacatactttg |
54582 |
T |
 |
| Q |
176 |
aa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54583 |
aaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
54630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
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Target Start/End: Original strand, 8172 - 8257
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8172 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
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Target: scaffold0467; HSP #1
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176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10427 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattat |
10335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0151 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
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Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
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65 |
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162 |
Q |
| |
|
|||||||| | | ||||||| || |||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||| || || ||| || |
|
|
| T |
22615 |
aattaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaattcaataatttgagcataatt--cataagttagcat |
22518 |
T |
 |
| Q |
163 |
ttttacatattt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
22517 |
ttatacatattttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt |
22422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
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Target: scaffold0138; HSP #1
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110 |
aacaacaacttagcaaaattcatc-aattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||| ||| | || |||| | |||||||||| || ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
22576 |
aacaacaacttagcataattcacccaattgagcataatt--cacaagttaacacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaatta |
22479 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22478 |
tcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattt |
22429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
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Target: scaffold0700; HSP #1
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256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
2687 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
2772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0409; HSP #1
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1433 |
tttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
1348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9688 |
tttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
9603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
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172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
70391 |
tttgaacatgcaaattcac-aacaataattgaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt |
70307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0243; HSP #1
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172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
2401 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
2317 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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Target Start/End: Original strand, 54038 - 54132
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| | || | | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
54038 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaatt |
54132 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||| |
|
|
| T |
76932 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaattt |
76847 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 3)
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Target: scaffold0032; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 93858 - 93773
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
93858 |
tttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaattt |
93773 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 104708 - 104623
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca-tgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
104708 |
tttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattt |
104623 |
T |
 |
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Target: scaffold0032; HSP #3
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| Q |
245 |
gagcacgaattt-agcaacaattatccattcactcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagact |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
13379 |
gagcacgaattttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--catgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataact |
13282 |
T |
 |
| Q |
344 |
aacccc |
349 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
13281 |
aacccc |
13276 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0892 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0892; HSP #1
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
3577 |
tttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatg |
3625 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
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Target: scaffold0483; HSP #1
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
6823 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
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Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
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| Q |
186 |
ttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1617 |
ttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
1546 |
T |
 |
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Target: scaffold0456; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 8762 - 8691
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| Q |
186 |
ttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8762 |
ttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8691 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
28698 |
tttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
28781 |
T |
 |
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Target: scaffold0389 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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| Q |
202 |
caattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
10854 |
caattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt |
10908 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
31184 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaatt |
31266 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0670 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:
Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
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| Q |
110 |
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207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
7822 |
aacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
7725 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
7724 |
tcaccaatttcatgtagtcaaacatatcatca |
7693 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0598 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
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Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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110 |
aacaacaacttagcaaaattcatcaatt-gagcacaattttcacaacttattatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3351 |
aacaacaacatagcacaattcaacaattagagcccaatt--cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta |
3448 |
T |
 |
| Q |
208 |
tcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
3449 |
tcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca |
3480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Original strand, 35640 - 35724
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35640 |
tttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaatt |
35724 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
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Target: scaffold1272; HSP #1
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| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
456 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
523 |
T |
 |
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Target: scaffold0387; HSP #1
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || || ||||||||| |
|
|
| T |
1045 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattt |
962 |
T |
 |
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Target: scaffold0165; HSP #1
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| Q |
174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30128 |
tgaacatgcaatttcacctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagtaagagcacgaattt |
30211 |
T |
 |
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Target: scaffold0080; HSP #1
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172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
43883 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatca |
43816 |
T |
 |
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Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
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172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
97283 |
tttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
97200 |
T |
 |
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Target: scaffold1666; HSP #1
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aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
84 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
38 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0761
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Target: scaffold0761; HSP #1
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| Q |
176 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1663 |
aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
1617 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0193; HSP #1
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174 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4769 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatca |
4831 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0107; HSP #1
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caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
220 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
31423 |
caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag |
31521 |
T |
 |
| Q |
221 |
catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt |
266 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31522 |
cacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt |
31567 |
T |
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Back To:
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27661 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca |
27726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Original strand, 21674 - 21758
Alignment:
| Q |
172 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
21674 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattt |
21758 |
T |
 |
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