View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13763_high_172 (Length: 236)

Name: NF13763_high_172
Description: NF13763
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13763_high_172
NF13763_high_172
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (35-236)||(22222653-22222854)
chr8 (35-236)||(22228995-22229196)
chr8 (16-236)||(22233820-22234038)
chr8 (16-209)||(16958551-16958743)
chr8 (16-209)||(22243213-22243405)
chr8 (16-209)||(8743253-8743444)
chr8 (16-209)||(9068137-9068328)
chr8 (16-209)||(13509965-13510156)
chr8 (16-209)||(13599495-13599686)
chr8 (16-209)||(16580086-16580277)
chr8 (16-209)||(22180602-22180794)
chr8 (16-209)||(11308957-11309148)
chr8 (16-209)||(27348027-27348218)
chr8 (16-209)||(28370094-28370285)
chr8 (16-209)||(28926113-28926304)
chr8 (16-209)||(41577301-41577492)
chr8 (16-209)||(3298803-3298994)
chr8 (16-190)||(4861920-4862091)
chr8 (18-209)||(17992895-17993085)
chr8 (16-209)||(12538158-12538350)
chr8 (30-209)||(1607286-1607464)
chr8 (16-209)||(34006741-34006921)
chr8 (26-190)||(24040737-24040898)
chr8 (136-209)||(21692168-21692242)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (16-209)||(33247989-33248181)
chr3 (16-209)||(1232460-1232656)
chr3 (16-209)||(3588401-3588592)
chr3 (16-209)||(7653192-7653383)
chr3 (16-209)||(8615504-8615695)
chr3 (16-209)||(10386040-10386231)
chr3 (16-206)||(26335121-26335299)
chr3 (16-209)||(9989397-9989588)
chr3 (17-209)||(45527648-45527838)
chr3 (17-209)||(52308056-52308246)
chr3 (16-209)||(22097668-22097859)
chr3 (16-190)||(20837115-20837286)
chr3 (16-209)||(37471656-37471847)
chr3 (16-209)||(2357162-2357353)
chr3 (17-190)||(36469406-36469576)
chr3 (33-209)||(27030670-27030844)
chr3 (16-209)||(23193924-23194115)
chr3 (16-209)||(49434098-49434288)
chr3 (25-184)||(4742979-4743135)
chr3 (16-190)||(27850520-27850691)
chr3 (16-209)||(48168163-48168354)
chr3 (16-209)||(23385397-23385588)
chr3 (145-209)||(20963749-20963814)
chr3 (16-53)||(20963677-20963714)
chr3 (101-209)||(17405114-17405221)
chr3 (136-209)||(25804983-25805057)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (16-209)||(5988972-5989163)
chr6 (16-229)||(1454777-1454988)
chr6 (16-229)||(1466469-1466680)
chr6 (16-209)||(24878866-24879057)
chr6 (16-209)||(34006503-34006694)
chr6 (16-209)||(3539048-3539239)
chr6 (16-209)||(26515398-26515589)
chr6 (16-236)||(13173793-13174003)
chr6 (16-236)||(13182326-13182536)
chr6 (16-209)||(32806732-32806923)
chr6 (16-209)||(25976951-25977141)
chr6 (16-209)||(26604340-26604531)
chr6 (16-209)||(9932775-9932966)
chr6 (16-209)||(14270673-14270864)
chr6 (17-209)||(21631181-21631373)
chr6 (16-191)||(15642436-15642609)
chr6 (16-209)||(24161225-24161416)
chr6 (33-209)||(14479561-14479735)
chr6 (16-209)||(21596497-21596692)
chr6 (16-191)||(9518413-9518586)
chr6 (16-200)||(32821812-32821991)
chr6 (139-209)||(34913450-34913520)
chr6 (16-89)||(6868022-6868095)
chr6 (16-94)||(34913803-34913881)
chr6 (145-209)||(26510408-26510473)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (16-209)||(12173-12362)
scaffold0298 (16-209)||(15943-16132)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (16-209)||(12196-12385)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (16-209)||(953-1144)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (16-209)||(8996231-8996422)
chr1 (16-209)||(38121902-38122093)
chr1 (16-209)||(39001151-39001342)
chr1 (16-209)||(12168186-12168377)
chr1 (16-209)||(33492168-33492359)
chr1 (16-209)||(11738767-11738958)
chr1 (16-209)||(16832752-16832943)
chr1 (16-209)||(41000073-41000264)
chr1 (16-190)||(432310-432481)
chr1 (16-209)||(13218015-13218206)
chr1 (29-209)||(49249073-49249251)
chr1 (16-190)||(9667665-9667836)
chr1 (36-209)||(13830289-13830460)
chr1 (16-209)||(15161104-15161295)
chr1 (19-209)||(16129660-16129848)
chr1 (16-209)||(44505238-44505431)
chr1 (19-190)||(16130234-16130402)
chr1 (16-191)||(9268655-9268828)
chr1 (40-191)||(39454123-39454272)
chr1 (149-209)||(36080221-36080281)
chr1 (16-99)||(36083868-36083949)
chr1 (47-209)||(6244202-6244363)
chr1 (136-209)||(7612376-7612450)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (16-190)||(3544849-3545021)
chr7 (16-209)||(2477659-2477851)
chr7 (16-209)||(2797532-2797724)
chr7 (16-209)||(12190844-12191035)
chr7 (16-209)||(10346275-10346466)
chr7 (16-209)||(2631397-2631588)
chr7 (16-209)||(8107858-8108049)
chr7 (16-209)||(22909119-22909310)
chr7 (16-209)||(31878602-31878792)
chr7 (16-209)||(12183867-12184058)
chr7 (16-209)||(1274589-1274780)
chr7 (16-209)||(31158246-31158437)
chr7 (16-209)||(23795095-23795286)
chr7 (16-209)||(29032753-29032944)
chr7 (19-209)||(24482745-24482935)
chr7 (16-209)||(12090430-12090621)
chr7 (16-190)||(22321770-22321941)
chr7 (26-190)||(22818433-22818594)
chr7 (16-209)||(31664464-31664655)
chr7 (16-209)||(1953958-1954149)
chr7 (16-209)||(45500680-45500871)
chr7 (16-209)||(6172528-6172708)
chr7 (16-117)||(19472159-19472259)
chr7 (71-209)||(19063515-19063651)
chr7 (52-209)||(19472269-19472424)
chr7 (150-209)||(33160183-33160243)
chr7 (145-209)||(27954734-27954799)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (16-209)||(21677637-21677828)
chr4 (16-209)||(1187966-1188157)
chr4 (16-209)||(30218360-30218552)
chr4 (16-209)||(33110672-33110864)
chr4 (16-209)||(4839106-4839297)
chr4 (16-209)||(19247797-19247988)
chr4 (16-209)||(22047682-22047873)
chr4 (16-208)||(46692006-46692196)
chr4 (35-184)||(53895406-53895553)
chr4 (16-209)||(42532857-42533048)
chr4 (16-209)||(323439-323630)
chr4 (16-209)||(26069726-26069920)
chr4 (16-209)||(6639978-6640169)
chr4 (16-209)||(20948746-20948938)
chr4 (17-209)||(40995520-40995710)
chr4 (16-190)||(55326795-55326968)
chr4 (16-209)||(5273532-5273712)
chr4 (16-209)||(52618515-52618695)
chr4 (16-209)||(26373599-26373790)
chr4 (16-190)||(35416665-35416824)
chr4 (53-209)||(44432060-44432214)
chr4 (29-209)||(8894932-8895111)
chr4 (145-209)||(9417532-9417597)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (16-209)||(36557491-36557683)
chr2 (16-209)||(28457846-28458038)
chr2 (16-209)||(36040232-36040423)
chr2 (16-209)||(36667838-36668030)
chr2 (16-201)||(21159975-21160158)
chr2 (16-209)||(27257386-27257577)
chr2 (16-209)||(29223716-29223906)
chr2 (16-209)||(29337015-29337205)
chr2 (16-209)||(42702176-42702367)
chr2 (16-206)||(14700645-14700834)
chr2 (16-209)||(13230311-13230502)
chr2 (16-201)||(9787075-9787258)
chr2 (16-208)||(43991533-43991717)
chr2 (16-209)||(23925001-23925192)
chr2 (16-209)||(32522930-32523121)
chr2 (33-209)||(5784511-5784685)
chr2 (16-209)||(24663100-24663292)
chr2 (149-209)||(492740-492800)
chr2 (145-209)||(8687769-8687834)
chr2 (16-93)||(41977710-41977787)
chr2 (145-209)||(11651817-11651882)
chr2 (136-209)||(31758275-31758349)
chr2 (16-54)||(11651893-11651931)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (16-209)||(28869-29060)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (16-209)||(7314966-7315157)
chr5 (16-209)||(9404425-9404616)
chr5 (16-209)||(11723246-11723437)
chr5 (16-209)||(11766756-11766947)
chr5 (16-209)||(34456298-34456489)
chr5 (16-209)||(34869715-34869907)
chr5 (16-209)||(16904579-16904770)
chr5 (16-209)||(30607046-30607237)
chr5 (16-209)||(27167067-27167258)
chr5 (16-209)||(31845981-31846172)
chr5 (16-209)||(33434604-33434795)
chr5 (16-209)||(39656007-39656198)
chr5 (16-209)||(24835736-24835927)
chr5 (16-209)||(37251874-37252064)
chr5 (29-209)||(14344470-14344648)
chr5 (16-209)||(6269891-6270082)
chr5 (139-209)||(32226834-32226904)
chr5 (16-54)||(7315358-7315396)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (16-209)||(14186-14376)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (16-209)||(25620-25811)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (16-209)||(16442-16634)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (16-209)||(116537-116728)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (16-209)||(8743-8934)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (16-209)||(35252-35443)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (16-190)||(6753-6924)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (18-209)||(76423-76612)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (34-209)||(1565-1738)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (40-191)||(9446-9595)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (78-209)||(1-131)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (16-58)||(12450-12492)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (16-66)||(7205-7255)
scaffold0447 (16-66)||(11819-11869)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (16-66)||(9814-9864)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 22222653 - 22222854
Alignment:
Q  35 ttacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaa 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  22222653 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaaga 22222752  T
Q  135 tttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctcaatgtaattgcatctttctctaaga 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22222753 ttccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctatggaattgcatctttctctaaga 22222852  T
Q  235 ac 236  Q
    ||    
T  22222853 ac 22222854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 22228995 - 22229196
Alignment:
Q  35 ttacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaa 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  22228995 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaaga 22229094  T
Q  135 tttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctcaatgtaattgcatctttctctaaga 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22229095 ttccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctatggaattgcatctttctctaaga 22229194  T
Q  235 ac 236  Q
    ||    
T  22229195 ac 22229196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Original strand, 22233820 - 22234038
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22233820 atattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 22233919  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctcaatgta 215  Q
    || | ||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  22233920 tgaagaaaaga--tgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctatgga 22234017  T
Q  216 attgcatctttctctaagaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22234018 attgcatctttctctaagaac 22234038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16958743 - 16958551
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16958743 atattaaaagatcaagaaattaaataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 16958644  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  16958643 tg--aagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgtttctc 16958551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 22243213 - 22243405
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22243213 atattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 22243312  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  22243313 tg--aagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttctaactaccttgttttgtgtttctc 22243405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 8743253 - 8743444
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8743253 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 8743351  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8743352 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 8743444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 9068137 - 9068328
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9068137 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 9068235  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9068236 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 9068328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13510156 - 13509965
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13510156 atattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 13510057  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  13510056 tg--aagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaacatcttgctttgtgtttctc 13509965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13599686 - 13599495
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13599686 atattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 13599587  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  13599586 tg--aagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaacatcttgctttgtgtttctc 13599495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16580277 - 16580086
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16580277 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 16580179  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16580178 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 16580086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22180794 - 22180602
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22180794 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 22180695  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| ||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22180694 t-gaagaaag-gatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttttgtttctc 22180602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 11308957 - 11309148
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11308957 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 11309055  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | |  | ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11309056 t-gaagaaag-ggtggagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 11309148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27348218 - 27348027
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348218 atattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaagac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaagga 27348120  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27348119 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 27348027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28370285 - 28370094
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28370285 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 28370187  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28370186 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 28370094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 28926113 - 28926304
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28926113 atattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 28926211  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28926212 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 28926304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 41577301 - 41577492
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41577301 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctc-aaagctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 41577399  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41577400 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 41577492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3298994 - 3298803
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  3298994 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaatgga 3298896  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3298895 t-gaagaaag-ggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 3298803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 4861920 - 4862091
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4861920 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 4862018  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4862019 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaac 4862091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17992895
Alignment:
Q  18 attaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17993085 attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 17992986  T
Q  118 gaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
      || || |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  17992985 --aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctc 17992895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12538350 - 12538158
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12538350 atattaaatgatcaaaaaattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctaagatagctttgcaaatga 12538251  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||||||| || |||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  12538250 tg--aagaagagatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcatagcttgaatctaatcctaactaccttgatttgtgtttctc 12538158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1607464 - 1607286
Alignment:
Q  30 aaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||| | ||||    
T  1607464 aaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgcctatgaaagctttgcaaaggatg--aaagaaagat 1607367  T
Q  130 aaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctc 209  Q
     || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  1607366 gaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttaggaagaatatactcttaacacccttgctttgtgtttctc 1607286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 34006741 - 34006921
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34006741 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 34006839  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||             || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34006840 tg-------------aagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctttaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 34006921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24040898 - 24040737
Alignment:
Q  26 atcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||    
T  24040898 atcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-ataagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg--aggaag 24040802  T
Q  126 agataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    | || || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24040801 aaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttctaac 24040737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21692242 - 21692168
Alignment:
Q  136 ttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacact-ttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  21692242 ttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctc 21692168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33248181 - 33247989
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33248181 atattaaaatatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgcagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 33248082  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  |||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33248081 tg--aaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 33247989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 1232460 - 1232656
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1232460 atattaaatgatcaagaaattacataatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctataatagctttgcaaagga 1232559  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacac-----tttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  1232560 tg--aagaagagataaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaacaccttattttgctttgtgtttctc 1232656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3588592 - 3588401
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3588592 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 3588494  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3588493 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 3588401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 7653192 - 7653383
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7653192 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaagga 7653290  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7653291 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 7653383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8615695 - 8615504
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8615695 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 8615597  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8615596 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 8615504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 10386040 - 10386231
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10386040 atattaaaagatcaaaggattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 10386138  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10386139 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctcgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 10386231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26335299 - 26335121
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26335299 atattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 26335200  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgttt 206  Q
    ||             || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  26335199 tg-------------aagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgttt 26335121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9989588 - 9989397
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9989588 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg- 9989491  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9989490 ttgaagaaag-ggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 9989397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45527838 - 45527648
Alignment:
Q  17 tattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggat 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45527838 tattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctagatatgtctatgatagctttgcaaaggat 45527740  T
Q  117 ggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    |  |  || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45527739 g--atgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 45527648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 52308056 - 52308246
Alignment:
Q  17 tattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  52308056 tattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggat 52308154  T
Q  117 ggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
     ||| |||| | | || ||| |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52308155 -gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctaaacaaatattggctagaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 52308246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22097859 - 22097668
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22097859 atattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 22097761  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22097760 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttactttgtgtttctc 22097668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20837286 - 20837115
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20837286 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 20837188  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20837187 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 20837115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 37471656 - 37471847
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37471656 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaacc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 37471754  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37471755 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaactactttgctttgtgtttctc 37471847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2357353 - 2357162
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||| |||||||| || |||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||    
T  2357353 atattagaagatcaagagtttacatcatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaatgttagatgtagctacatatgtctatacaagcttggcaaagga 2357254  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    || || |||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2357253 tgaaagaaaga--tgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctc 2357162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 36469406 - 36469576
Alignment:
Q  17 tattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggat 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36469406 tattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagttgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggat 36469504  T
Q  117 ggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    |  || || |||| || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36469505 g--aagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 36469576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 209
Target Start/End: Original strand, 27030670 - 27030844
Alignment:
Q  33 gattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  27030670 gattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggat-gaagaaag-ggtgaa 27030766  T
Q  133 aatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
     ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27030767 gattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 27030844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23194115 - 23193924
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  23194115 atattaaatgatcaaaagattacgtaatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctctgat-agtttgcaaagga 23194017  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  23194016 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctc 23193924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49434288 - 49434098
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  || ||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  49434288 atattaaaagatgaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacgcacaaga-taaatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaagga 49434190  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    || || |||||  |||| ||| ||| |||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49434189 tgaaagaaaga--taaagattacatacctaaactcataatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 49434098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Original strand, 4742979 - 4743135
Alignment:
Q  25 gatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||    
T  4742979 gatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaacgatg--aagaa 4743075  T
Q  125 gagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctact 184  Q
     |||| || |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  4743076 aagatgaagatttcatgacaagatccatgatctctcaacaaatcttggcttgaatctact 4743135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 27850520 - 27850691
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27850520 atattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttaaatacctcaaaacc-acaagattggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 27850618  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    ||  || ||  ||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27850619 tg--aagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 27850691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 48168163 - 48168354
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  48168163 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcatagga 48168261  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  ||    ||||  | ||| ||||   |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  48168262 tg--aagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgcttcgtgtttctc 48168354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23385588 - 23385397
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23385588 atattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacct-aaaaactacaagaatagatgtagctaaatatgtctatgatagctttgcaaagga 23385490  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | |  | |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  23385489 t-gaagaaag-ggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttttgtttctc 23385397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 20963749 - 20963814
Alignment:
Q  145 agattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20963749 agatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 20963814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 20963677 - 20963714
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 53  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20963677 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 20963714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Original strand, 17405114 - 17405221
Alignment:
Q  101 taactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca-ctttgctt 199  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||| |||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||    
T  17405114 taactttgcaacagatggaagaaaga--tgaatattacatgtcaagactcatgatatctctacaaatcttgaaaagaatctactcctaacacccttgctt 17405211  T
Q  200 tgtgtttctc 209  Q
    ||||||||||    
T  17405212 tgtgtttctc 17405221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25805057 - 25804983
Alignment:
Q  136 ttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacact-ttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  25805057 ttcatgacaagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatcaacttctaacactcttgcttcatgtttctc 25804983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 5988972 - 5989163
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5988972 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatga 5989071  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||   |||| |||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5989072 tg---aaaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 5989163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1454988 - 1454777
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  1454988 atattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaagga 1454889  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctcaatgta 215  Q
    || || |||||  | || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  1454888 tgaaagaaaga--tgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctataga 1454791  T
Q  216 attgcatctttctc 229  Q
    | ||||||||||||    
T  1454790 aatgcatctttctc 1454777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1466680 - 1466469
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  1466680 atattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaagga 1466581  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctcaatgta 215  Q
    || || |||||  | || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  1466580 tgaaagaaaga--tgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctataga 1466483  T
Q  216 attgcatctttctc 229  Q
    | ||||||||||||    
T  1466482 aatgcatctttctc 1466469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24879057 - 24878866
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24879057 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtatatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 24878959  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  24878958 tg--aagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctc 24878866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34006694 - 34006503
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34006694 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 34006596  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34006595 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggtttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 34006503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3539239 - 3539048
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3539239 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 3539141  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3539140 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 3539048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 26515398 - 26515589
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26515398 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 26515496  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26515497 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 26515589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Original strand, 13173793 - 13174003
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||    
T  13173793 atattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggtagatgta--------tgtctatgatagctttgcaaagga 13173884  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctcaatgta 215  Q
    || | ||||||||| || ||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||  |    
T  13173885 tgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttactttgtgtttttctataga 13173982  T
Q  216 attgcatctttctctaagaac 236  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13173983 aatgcatctttctctaagaac 13174003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Original strand, 13182326 - 13182536
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||    
T  13182326 atattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggtagatgta--------tgtctatgatagctttgcaaagga 13182417  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctcaatgta 215  Q
    || | ||||||||| || ||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||  |    
T  13182418 tgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttactttgtgtttttctataga 13182515  T
Q  216 attgcatctttctctaagaac 236  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13182516 aatgcatctttctctaagaac 13182536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 32806732 - 32806923
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32806732 atattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtaggtgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaagga 32806830  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32806831 tg--aagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 32806923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25977141 - 25976951
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25977141 atattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa-ga 25977043  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25977042 tg--aagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 25976951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26604531 - 26604340
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  26604531 atattaaatgatcaaa-gattacataatagcttttttgaatacctcaatacccacaaggatagatgtagctacatatgtctatgaaagctttgcaaaaga 26604433  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||| ||  |||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26604432 tggaagaa--agatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctacttctaacacccttgctttgtgtttctc 26604340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 9932775 - 9932966
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9932775 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaagga 9932873  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  9932874 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgccttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctc 9932966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14270864 - 14270673
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  14270864 atattaaaaaatcaagaaattacataattgcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtatatatagctacatatgtctatgatagttttgcaaaaga 14270765  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14270764 tg--aagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 14270673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21631373 - 21631181
Alignment:
Q  17 tattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggat 116  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21631373 tattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaatcc-acaagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttacaaaggat 21631275  T
Q  117 ggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | | ||||||||| || |||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  21631274 gaagaaaagagatgaagattctatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttaaatctactcttaactaccttgctttatgtttctc 21631181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15642609 - 15642436
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  15642609 atattaaaagatcaagagtttacataatagcttatttgaatacctcaaaacccacaagggtagatttagctacatatgtctatgcaagcttagcaaagga 15642510  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca 191  Q
    ||  ||| | |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15642509 tg--aaagaaagatgaagatttcatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtaagaatctactcctaaca 15642436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 24161225 - 24161416
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  24161225 atattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgccaagaa 24161323  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24161324 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctttgcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 24161416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14479735 - 14479561
Alignment:
Q  33 gattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||  | ||    
T  14479735 gattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaaga--tgaa 14479639  T
Q  133 aatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
     ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14479638 gattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 14479561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 21596497 - 21596692
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21596497 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagtttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 21596595  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgc----ctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||||    | ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  21596596 tg--aagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccatgctttgtgtttctc 21596692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 9518413 - 9518586
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  9518413 atattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgcaaacttggcaaagga 9518512  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca 191  Q
    ||  ||| | |||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||    
T  9518513 tg--aaagaaagatgaagatttcatgctaaaattcatgatgtctcaacaaatcttcataagaatctacttctaaca 9518586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32821991 - 32821812
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  32821991 atattaaaa-atctaaagattacataattgcttatttgaatacctcaaaacccacaag--tagatgtagctacatttgtctatgatagcttttaaaagga 32821895  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgcttt 200  Q
    |||| ||  ||||| || |||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||    
T  32821894 tggagaa--gagatgaagattcaatgcatagatccatgatttatcaacaaatcttgggttgaatctattcctaataccttgcttt 32821812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34913520 - 34913450
Alignment:
Q  139 atgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34913520 atgcctaaatccataatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 34913450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Original strand, 6868022 - 6868095
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactaca 89  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6868022 atattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaacccacaagggtagatgtagctaca 6868095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34913881 - 34913803
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgt 94  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34913881 atattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgt 34913803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 26510408 - 26510473
Alignment:
Q  145 agattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26510408 agatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 26510473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 12173 - 12362
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12173 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagcta--tatgtctatgatagctttgcaaagga 12270  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12271 tg--aagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 12362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 15943 - 16132
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15943 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagcta--tatgtctatgatagctttgcaaagga 16040  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16041 tg--aagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 16132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12385 - 12196
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12385 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagcta--tatgtctatgatagctttgcaaagga 12288  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12287 tg--aagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 12196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 953 - 1144
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  953 atattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctgtgataactttgcaaagga 1052  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
     |  || |||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1053 cg--aagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttggatagaatctactcctaacaccttactttgtgtttctc 1144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 8996231 - 8996422
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8996231 atattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacatcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 8996330  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||||||| || |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8996331 tg--aagaagagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcgcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 8996422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 38121902 - 38122093
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38121902 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 38122000  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38122001 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 38122093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 39001151 - 39001342
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39001151 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 39001249  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39001250 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 39001342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 12168186 - 12168377
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12168186 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 12168284  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||  | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  12168285 tg--aagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacacctaactaccttgctttgtgtttctc 12168377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 33492168 - 33492359
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33492168 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaa-ctacaagagtagatgtggctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 33492266  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33492267 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 33492359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 11738767 - 11738958
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11738767 atattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 11738865  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11738866 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtgtcaacaaatcttggcttgaatttactcctaactaccttgctttgtgtttctc 11738958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 16832752 - 16832943
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16832752 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatatagctacatatatctatgatagctttgcaaagga 16832850  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16832851 tg--aagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttactttgtgtttctc 16832943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 41000073 - 41000264
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41000073 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagatttgcaaagga 41000171  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  |  |||| || || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41000172 tg--aggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 41000264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 432310 - 432481
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  432310 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 432408  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  432409 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgagtctactcctaac 432481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 13218015 - 13218206
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13218015 atattaaattatcaaaagattacataatatcttgtttgaatgcctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 13218113  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaa-cactttgctttgtgtttctc 209  Q
    || | ||||||  | || ||| |||| | || | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13218114 tgaagaaaaga--tgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaaccaccttgctttgtgtttctc 13218206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49249251 - 49249073
Alignment:
Q  29 aaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |     
T  49249251 aaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggat-gaagaaag-gg 49249155  T
Q  129 taaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  49249154 tgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttactttgtgtttctc 49249073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 9667665 - 9667836
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9667665 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagaatgtatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 9667763  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9667764 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 9667836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13830460 - 13830289
Alignment:
Q  36 tacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaat 135  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | || || ||    
T  13830460 tacataatagcttgtttgaatacctaaaaacccacaagggtaaatgtagctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatg--aaagaaaaatgaagat 13830363  T
Q  136 ttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  13830362 ttcatgctaagattcatgacgtctcaacaaatcttaggaagaatctactcctaacacccttccttgtgtttctc 13830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15161295 - 15161104
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15161295 atattaaaaaatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccataagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagagga 15161196  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || | || || ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15161195 tg--aagaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctactcctaatatcttgctttgtgtttctc 15161104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16129848 - 16129660
Alignment:
Q  19 ttaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  16129848 ttaaatgatcaaaagattacataatagattgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatg- 16129751  T
Q  119 aaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
     || |||| || || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  16129750 -aagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctc 16129660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 44505238 - 44505431
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgttt-gaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagg 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44505238 atattaaataatcaaaagattacataatagcttgttttgaatacctcaaaaaccacaagtttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 44505337  T
Q  115 atggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||| | ||||||  | || ||| |||| |  ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44505338 atgaagaaaaga--tgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 44505431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16130402 - 16130234
Alignment:
Q  19 ttaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatgg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16130402 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgataactttgcaaatgatg- 16130305  T
Q  119 aaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
     || |||| || || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16130304 -aagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaac 16130234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9268828 - 9268655
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  |  || ||||||||    
T  9268828 atattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctttgcaagtttggcaaagga 9268729  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca 191  Q
    |  |||| | |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||    
T  9268728 t--aaaagaaagatgaagatttcatgtctagactcatgatgtctcaataaatattaggaagaatctactcttaaca 9268655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39454272 - 39454123
Alignment:
Q  40 taatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaatttca 139  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | || ||| ||    
T  39454272 taatagcttgtttgaataccttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaaga--tgaagattcca 39454175  T
Q  140 tgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca 191  Q
    | |  ||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  39454174 tactaagattcatgatatctctacaaatcctaggaagaatctacttctaaca 39454123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36080281 - 36080221
Alignment:
Q  149 tcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36080281 tcatgatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 36080221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36083949 - 36083868
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatg 99  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36083949 atattaaaagat-aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggtagatgtaactacatatgtctatg 36083868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6244363 - 6244202
Alignment:
Q  47 ttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaatttcatgcctag 146  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || | |  ||  || ||||||||| ||||||| || ||  | || ||| |||| | |     
T  6244363 ttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctatatgttttcatagtagctttgcaaaagatggaagaagga--tgaagattccatgacaat 6244266  T
Q  147 attcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6244265 attcatgatatctctacaaatctttagaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctc 6244202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Original strand, 7612376 - 7612450
Alignment:
Q  136 ttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacact-ttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  7612376 ttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctc 7612450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 3544849 - 3545021
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3544849 atattaaaagatcaagtaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 3544948  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    |||  | ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3544949 tgg--agaagagatgaagatttaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 3545021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2477851 - 2477659
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2477851 atattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatggagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 2477752  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  |  || |||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2477751 tg--aggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 2477659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 2797532 - 2797724
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2797532 atattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 2797631  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  2797632 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctc 2797724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12191035 - 12190844
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12191035 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtaaatacatatgtctatgatagctttgcaaagga 12190937  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12190936 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 12190844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 10346275 - 10346466
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10346275 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 10346373  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10346374 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 10346466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2631588 - 2631397
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2631588 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaagga 2631490  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2631489 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 2631397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 8107858 - 8108049
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8107858 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ttacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 8107956  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8107957 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 8108049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22909310 - 22909119
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22909310 atattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 22909211  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22909210 tg--aagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatgtctcaacaaatcttagattgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 22909119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31878792 - 31878602
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  31878792 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctttgatagttttgcaaagga 31878694  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||   |||| |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31878693 tg---aaaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 31878602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12184058 - 12183867
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12184058 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaaaagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 12183960  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12183959 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 12183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1274780 - 1274589
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1274780 atattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcatagga 1274681  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || |||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  1274680 tg--aagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatgtctcaacaaatcttgagttaaatctactcataacaccttactttgtgtttctc 1274589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 31158246 - 31158437
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31158246 atattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 31158344  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31158345 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 31158437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23795286 - 23795095
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23795286 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatggagctacatatgtctataatagctttgcaaagga 23795188  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  23795187 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgagtttctc 23795095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 29032753 - 29032944
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||| ||    
T  29032753 atattaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttagatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaatga 29032852  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  ||| | |||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29032853 tg--aaagaaagatgaagattccatgtctagactcatgatgtctcaacaaatcttgaatagaatctactcctaacaccttactttgtgtttctc 29032944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24482935 - 24482745
Alignment:
Q  19 ttaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctc-aaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24482935 ttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctctaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 24482836  T
Q  118 gaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
      || ||||||| || |||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  24482835 --aagaagagatgaagattcaatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggtttgatctactcataactcccttgctttgtgtttctc 24482745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 12090430 - 12090621
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12090430 atattaaatgatcaaaatattacatattagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagattagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 12090528  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12090529 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatttactcctaactaccttgctttgtgtttctc 12090621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 22321770 - 22321941
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22321770 atattaaaggatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 22321868  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    | ||| |||| ||| || |||  |||   |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22321869 t-gaagaaag-gatgaagattcaatgaaaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 22321941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22818594 - 22818433
Alignment:
Q  26 atcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||     
T  22818594 atcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatg--aagaaa 22818498  T
Q  126 agataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    |||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22818497 agatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 22818433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 31664464 - 31664655
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  31664464 atattaaatgatcaaaagattacataatagcctgttcgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctagatatgtttatgatagctttgtaaagga 31664562  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    |   || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31664563 t--taagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 31664655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1954149 - 1953958
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1954149 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaacc-acaatagtagatatagctacatatgtctatgatagcttttcaaagga 1954051  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||||  | || |||  ||| | |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1954050 tg--aagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacattgctttgtgtttctc 1953958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 45500680 - 45500871
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  45500680 atattaaatggtcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctgtgatagctttgcaaatga 45500778  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || |||| || || |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  45500779 tg--aagaagaaatgaagattcaatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcataactaccttgctttgtgtttctc 45500871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6172708 - 6172528
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6172708 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 6172610  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||             || ||| |||| |  |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6172609 tg-------------aagattccatgacaggatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 6172528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Original strand, 19472159 - 19472259
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19472159 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaagga 19472257  T
Q  116 tg 117  Q
    ||    
T  19472258 tg 19472259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19063651 - 19063515
Alignment:
Q  71 aagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatctt 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||  || ||||||| || |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19063651 aagggtagatataactacatatgtctatgatagctttacatagaatg--aagaagagatgaagattcaatgcttagatccatgatgtctcaacaaatttt 19063554  T
Q  171 gggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
     ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19063553 aggttgaatctactcctaacaccttactttgtgtttctc 19063515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 19472269 - 19472424
Alignment:
Q  52 tgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattca 151  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||  | || ||| || | | |||| ||    
T  19472269 tgaagatctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaagga--tgaagattccaagacaagatcca 19472365  T
Q  152 tgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19472366 tgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 19472424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33160243 - 33160183
Alignment:
Q  150 catgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33160243 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 33160183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 27954734 - 27954799
Alignment:
Q  145 agattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacact-ttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  27954734 agattcatgatgtctcaacaaattttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctc 27954799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 21677637 - 21677828
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21677637 atattaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 21677735  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21677736 tg--aagaaaagatgaagattttatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctattcctaactactttgctttgtgtttctc 21677828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1188157 - 1187966
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1188157 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgcctatgatagctttgcaaagga 1188059  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1188058 tg--aagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 1187966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 30218360 - 30218552
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30218360 atattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgctaagga 30218459  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  30218460 tg--aagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgacgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgtttctc 30218552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 33110672 - 33110864
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33110672 atattaaaagatcaaaagtttacataatggcttgtgtgaatacctcaaaacccacaagggtatatataactacatatgtctacgatagctttgcaaagga 33110771  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  ||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  33110772 tg--aaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctc 33110864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 4839106 - 4839297
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4839106 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 4839204  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4839205 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 4839297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 19247797 - 19247988
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19247797 atattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 19247895  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  19247896 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatattggtttgaatctactcccaactaccttgctttgtgtttctc 19247988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22047873 - 22047682
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22047873 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 22047775  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22047774 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccataatgtctcaacaaatcttggcttgaatcttctcctaactaccttgctttgtgtttctc 22047682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 46692006 - 46692196
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46692006 atattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga 46692104  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttct 208  Q
    ||  |  |||| || || |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46692105 tg--aggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttct 46692196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53895553 - 53895406
Alignment:
Q  35 ttacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| || |    
T  53895553 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg--aagaagagatgaaga 53895456  T
Q  135 tttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctact 184  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53895455 ctccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctact 53895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 42532857 - 42533048
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  42532857 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatga 42532955  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaa-cactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42532956 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacgtctcaacaaatctaggcttgaatctactcctaaccaccttgctttgtgtttctc 42533048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 323630 - 323439
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  323630 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaagga 323532  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  323531 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctc 323439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26069920 - 26069726
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtag--atgtaactacatatgtctatgataactttgcaaag 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26069920 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag 26069821  T
Q  114 gatggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||  || ||||| | || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  26069820 gatg--aagaagagttgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttctaactaccttgctttgtgtttctc 26069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6640169 - 6639978
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  6640169 atattaaatgatcaaa-gattccataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgaaagctttggaaaaga 6640071  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| ||  |||| || ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6640070 tagaagaa--agatgaagattacatgctaagattcaagatgtctcaacaaattttgggaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctc 6639978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20948938 - 20948746
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | ||||||| |||  |||||||    
T  20948938 atattaaaatatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggatagatgtagctacatatatttatgatagcttgacaaagga 20948839  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  20948838 tg--aagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcgacaaatcttgggttgaatctacttttaactaccttgctttgtgtttctc 20948746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 40995520 - 40995710
Alignment:
Q  17 tattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggat 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40995520 tattaaatgatcaaaagattacataatagcttttttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggat 40995618  T
Q  117 ggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    |  || ||||||| || |||  |||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  40995619 g--aagaagagatgaagattcaatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgatttgtgtttctc 40995710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 55326968 - 55326795
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  55326968 atattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgcttgaatacctcaaaacc-acaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttggaatgga 55326870  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga--atctactcctaac 190  Q
    ||  || || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  55326869 tg--aagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatatctactcctaac 55326795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 5273532 - 5273712
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5273532 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 5273630  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||             || | | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5273631 tg-------------aagaatccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 5273712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52618695 - 52618515
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52618695 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaatagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 52618597  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||             || ||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52618596 tg-------------aagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 52618515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 26373599 - 26373790
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |  ||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26373599 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acatgaggtgatatagctatatatgtctatgatagctttgcaaagga 26373697  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    |  ||| |||| || || |||  |||   |||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26373698 t--aaagaagaaatgaagattcaatgataagatccatgatatctcaacaaatattggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 26373790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 35416665 - 35416824
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||       
T  35416665 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttg-ttgaatacatcaaaacc-acaagagtagatgtaactacatatgtctatgatagttgtgcaaa--- 35416759  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
              |||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35416760 ----------agatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 35416824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Original strand, 44432060 - 44432214
Alignment:
Q  53 gaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcat 152  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| | | || ||| |||| | |||| |||    
T  44432060 gaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggat-gaagaaag-ggtgaagattccatggcaagatccat 44432156  T
Q  153 gatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  44432157 gatgtctcaagaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgagtttctc 44432214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8895111 - 8894932
Alignment:
Q  29 aaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtct-atgataactttgcaaaggatggaaaaaagag 127  Q
    ||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| ||  || | ||||||| ||||||| |||||     
T  8895111 aaaagattacataatagcttgcttaagtacctctaaacccacaagggcagatttagctacatat-tctcatagtagccttgcaaaagatggaagaaaga- 8895014  T
Q  128 ataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctc 209  Q
     | || |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  8895013 -tgaagatttcatgacaagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctacttctaacacccttgcattgtgtttctc 8894932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 9417532 - 9417597
Alignment:
Q  145 agattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacact-ttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  9417532 agattcatgatgtctcaacaaatcttggaaataatccacttctaacactcttgcttcatgtttctc 9417597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 36557491 - 36557683
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36557491 atattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 36557590  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  36557591 tg--aagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctatgtgtttctc 36557683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 28457846 - 28458038
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28457846 atattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagcattgcaaagga 28457945  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28457946 tg--aagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 28458038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 36040232 - 36040423
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36040232 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 36040330  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36040331 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 36040423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 36667838 - 36668030
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36667838 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 36667937  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||||||| || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36667938 tg--aagaagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttaagtctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 36668030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21160158 - 21159975
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21160158 atattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaaga 21160059  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttg 201  Q
    ||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||    
T  21160058 tg--aagaagagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaacaccttactttg 21159975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27257577 - 27257386
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27257577 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 27257479  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  27257478 tg--aagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttaaatctcctccaaactaccttgttttgtgtttctc 27257386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29223906 - 29223716
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29223906 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 29223809  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29223808 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 29223716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29337205 - 29337015
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29337205 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 29337108  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29337107 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 29337015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 42702176 - 42702367
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42702176 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttatttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 42702274  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
     |||| ||| |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42702275 -ggaagaaa-agatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 42702367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14700834 - 14700645
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14700834 atattaaaagatcaaaagtttacataatagttagtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcaaagga 14700735  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgttt 206  Q
    ||  || || | || ||  || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  14700734 tg--aagaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgttt 14700645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 13230311 - 13230502
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13230311 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaagga 13230409  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  13230410 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcataactaccttgctttgtgtttctc 13230502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 9787075 - 9787258
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9787075 atattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaatggtagatatacttacatatgtctatgatagctttgcaaagga 9787174  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttg 201  Q
    ||  || || | || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  9787175 tg--aagaaaatatgaagatttcatgcctagattcatgatatctcaacaaatcttgataagaatctactcctaacatcttgctttg 9787258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43991717 - 43991533
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43991717 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 43991619  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttct 208  Q
    || | |||||        ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43991618 tgaagaaaag--------attccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgccttgtgtttct 43991533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 23925001 - 23925192
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23925001 atattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaca-acaagagtagatgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaagga 23925099  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    || | ||||||  | || ||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23925100 tgaagaaaaga--tgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttcgcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 23925192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32523121 - 32522930
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32523121 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagggtagaaatagctacatatgtccatgatagctttgcaaagga 32523023  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
     |  || |||| || || |||  ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32523022 cg--aagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaataaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 32522930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 209
Target Start/End: Original strand, 5784511 - 5784685
Alignment:
Q  33 gattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  5784511 gattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggat-gaagaaag-ggtgaa 5784607  T
Q  133 aatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
     ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5784608 gattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaacttccttgctttgtgtttctc 5784685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 24663100 - 24663292
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  24663100 atattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaaactcacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgcaagcttcgcaaagga 24663199  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  ||| | |||| || |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24663200 tg--aaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtatgaaactactcctaacaaccttgctttgtgtttctc 24663292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 492800 - 492740
Alignment:
Q  149 tcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  492800 tcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgatttgtgtttctc 492740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 8687769 - 8687834
Alignment:
Q  145 agattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8687769 agatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 8687834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41977787 - 41977710
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatg 93  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||| |||||    
T  41977787 atattaaaatatcaaaagtttacataatggcttgtttgaataccttaaaacccacaatggtagatgtagctatatatg 41977710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11651882 - 11651817
Alignment:
Q  145 agattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  11651882 agattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctactcataacacccttgctttgtgtttctc 11651817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31758349 - 31758275
Alignment:
Q  136 ttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacact-ttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  31758349 ttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctc 31758275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 11651931 - 11651893
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 54  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651931 atattagatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 11651893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 28869 - 29060
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28869 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 28967  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28968 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 29060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7315157 - 7314966
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7315157 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 7315059  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7315058 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 7314966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9404616 - 9404425
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9404616 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 9404518  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9404517 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 9404425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 11723246 - 11723437
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11723246 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 11723344  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11723345 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 11723437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11766947 - 11766756
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11766947 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 11766849  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11766848 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 11766756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34456489 - 34456298
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34456489 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 34456391  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34456390 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 34456298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 34869715 - 34869907
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  34869715 atattaaatgatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagaa 34869814  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || ||||||| || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  34869815 tg--aataagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctc 34869907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 16904579 - 16904770
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16904579 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 16904677  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  16904678 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacccctaactaccttgctttgtgtttctc 16904770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 30607046 - 30607237
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30607046 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 30607144  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30607145 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatattggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 30607237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 27167067 - 27167258
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27167067 atattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 27167165  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27167166 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtcccaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 27167258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31846172 - 31845981
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31846172 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagattaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 31846074  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31846073 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 31845981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33434795 - 33434604
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33434795 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgagtacctcaaaa-ctacaagaggagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 33434697  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33434696 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 33434604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 39656007 - 39656198
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||  |||||||    
T  39656007 atattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctttgcaagcttgacaaagga 39656106  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    || || |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  39656107 tgaaagaaaga--tgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttttgtagaatctactcctaacaccttacgttgtgtttctc 39656198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24835927 - 24835736
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24835927 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 24835829  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  24835828 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcctgacttgaatctactcctaactaccttgatttgtgtttctc 24835736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 37251874 - 37252064
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37251874 atattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaagga 37251973  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| || ||| ||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  37251974 tg--aagaaaagatgaagattccat-ccttgactcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctacacctaacaccttgttttgtgtctctc 37252064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14344648 - 14344470
Alignment:
Q  29 aaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |     
T  14344648 aaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggat-gaagaaag-gg 14344552  T
Q  129 taaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  14344551 tgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgagtttctc 14344470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6270082 - 6269891
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6270082 atattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 6269984  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || | || || ||| | || | |||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  6269983 tg--aagaaaatatgaagattccttgacaagatccatgttgtcacaacaaatcttggcttgaatctactcataactacatttctttgtgtttctc 6269891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32226904 - 32226834
Alignment:
Q  139 atgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32226904 atgcctagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 32226834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 7315396 - 7315358
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315396 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 7315358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14376 - 14186
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14376 atattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaagga 14278  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  ||||| |||| || ||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14277 tg--aaaaaaagatgaagattccatccctaaactcatgatgtctcaacaaatcttgagttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtctctc 14186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 25620 - 25811
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25620 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaagga 25718  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25719 t-gaagaaag-ggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 25811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 16442 - 16634
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16442 atattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaatacctcaaaacccacaagggtatatgtagatacatatgtctaagatagcttggcaaagga 16541  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    || | ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  16542 tgaagaaaaga--tgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcttaactaccttactttgtgtttctc 16634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 116537 - 116728
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  116537 atattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaacc-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 116635  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||  || || |||| |  ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  116636 tg--aagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 116728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8934 - 8743
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8934 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 8836  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    | ||| |||| | | || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  8835 t-gaagaaag-ggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgccttgtgtttctc 8743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 35252 - 35443
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  35252 atattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaatggtggatgtacctacatatgtctatgcaagcttggcaaagga 35351  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacactttgctttgtgtttctc 209  Q
    || || ||| |  | || ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35352 tgaaagaaaaa--tgaagatttcataccgagactcataatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc 35443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6924 - 6753
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaagga 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6924 atattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc-acaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 6826  T
Q  116 tggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 190  Q
    ||  || || |||| || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6825 tg--aagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 6753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 76423 - 76612
Alignment:
Q  18 attaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  76423 attaaatgatcaaaagattacataataacttgtttgaatacctcaaaatc-acaagagtagatgtatctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 76521  T
Q  118 gaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
      || ||  | | || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  76522 --aagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 76612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1738 - 1565
Alignment:
Q  34 attacataatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | | ||     
T  1738 attacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggat-gaagaaag-ggtgaag 1642  T
Q  134 atttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1641 attccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctc 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 191
Target Start/End: Original strand, 9446 - 9595
Alignment:
Q  40 taatagcttgtttgaatatctcaaaacctacaagggtagatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaatttca 139  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | || ||| ||    
T  9446 taatagcttgtttgaataccttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaaga--tgaagattcca 9543  T
Q  140 tgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca 191  Q
    | |  ||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  9544 tactaagattcatgatatctctacaaatcctaggaagaatctacttctaaca 9595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 1 - 131
Alignment:
Q  78 gatgtaactacatatgtctatgataactttgcaaaggatggaaaaaagagataaaaatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 177  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||  || |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  1 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg--aagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttga 98  T
Q  178 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctc 209  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  99 atctactcccaactaccttgctttgtctttctc 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12492
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatat 58  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12450 atattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatat 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7255 - 7205
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaac 66  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7255 atattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 7205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11869 - 11819
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaac 66  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11869 atattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9864 - 9814
Alignment:
Q  16 atattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatatctcaaaac 66  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9864 atattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 9814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University