View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13763_high_59 (Length: 467)

Name: NF13763_high_59
Description: NF13763
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13763_high_59
NF13763_high_59
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-450)||(23783161-23783610)
chr2 (1-446)||(23768472-23768917)
chr2 (1-429)||(30395604-30396032)
chr2 (1-427)||(30384852-30385278)
chr2 (123-359)||(30476499-30476735)
chr2 (95-436)||(8378819-8379160)
chr2 (117-359)||(30484671-30484913)
chr2 (124-317)||(30425260-30425453)
chr2 (124-409)||(30431293-30431578)
chr2 (130-355)||(30437554-30437779)
chr2 (130-339)||(30469365-30469574)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (72-359)||(41626745-41627032)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (126-295)||(15858506-15858675)
chr8 (223-339)||(15844327-15844443)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23783610 - 23783161
Alignment:
Q  1 tgattttgtatgaggttttgaggttgtaccctcctgtaaccggcgttgctcgaaaagttgagaatgatataaaacttggagacttgacattatatgctgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783610 tgattttgtatgaggttttgaggttgtaccctcctgtaaccggcgttgctcgaaaagttgagaatgatataaaacttggagacttgacattatatgctgg 23783511  T
Q  101 aatggaggtttacatgccaattgttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783510 aatggaggtttacatgccaattgttttgattcaccatgattgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatt 23783411  T
Q  201 tccaaagcaacaaacggtagattttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783410 tccaaagcaacaaacggtagattttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaa 23783311  T
Q  301 tggcattgattttacaaaaattttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctccatctgtggtgctttctgttcagccacaacatggtgctcatgt 400  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783310 tggcattgattttaaagaatttttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctccatctgtggtgctttctgttcagccacaacatggtgctcatgt 23783211  T
Q  401 tattctacgcaaaatcaaaacataaaaacaacatcagagaagaaacgtat 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783210 tattctacgcaaaatcaaaacataaaaacaacatcagagaagaaacgtat 23783161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 23768472 - 23768917
Alignment:
Q  1 tgattttgtatgaggttttgaggttgtaccctcctgtaaccggcgttgctcgaaaagttgagaatgatataaaacttggagacttgacattatatgctgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23768472 tgattttgtatgaggttttgaggttgtaccctcctataaccggcgtttctcgaaaagttgagaatgatataaaacttggagacttgacattatatgctgg 23768571  T
Q  101 aatggaggtttacatgccaattgttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatt 200  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23768572 aatggatgtttacttgccgattgttttgattcaccatgattgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatt 23768671  T
Q  201 tccaaagcaacaaacggtagattttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  23768672 tccaaagcaacaaacggtagattttcatattttccgtttggagcaggtcctagaatctgcattggacagaccttttctctattggaagcaaagatggcaa 23768771  T
Q  301 tggcattgattttacaaaaattttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctccatctgtggtgctttctgttcagccacaacatggtgctcatgt 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23768772 tggcattgattttacagaatttttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctccatctgtggtgcttactgttcagccacaacatggtgctcatgt 23768871  T
Q  401 tattctacgcaaaatcaaaacataaaaacaacatcagagaagaaac 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23768872 tattctacgcaaaatcaaaacataaaaacaacatcagagaagaaac 23768917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 30395604 - 30396032
Alignment:
Q  1 tgattttgtatgaggttttgaggttgtaccctcctgtaaccggcgttgctcgaaaagttgagaatgatataaaacttggagacttgacattatatgctgg 100  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||  ||  ||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||  ||||||    
T  30395604 tgattttgtatgaggttcttagattataccctccagtaatgggacttgctagaaatgttgtgaaagatatgaaacttggaaacctgacattacctgctgg 30395703  T
Q  101 aatggaggtttacatgccaattgttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatt 200  Q
    | ||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30395704 agtggaggttttcttaccaattcttttgattcatcatgactgcaaactatggggcgatgatgctaaaatgttcaatcctgagagattttccggaggaatt 30395803  T
Q  201 tccaaagcaacaaacggtagattttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaa 300  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  30395804 tctaaagcaacaaatggtagagtttcattttttccatttggatggggtccaagaatttgcattggacaaaacttttccctaatggaagcaaagatggcat 30395903  T
Q  301 tggcattgattttacaaaaattttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctccatctgtggtgctttctgttcagccacaacatggtgctcatgt 400  Q
    || || ||||||| ||| | |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    ||| || || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  30395904 tgtcaatgattttgcaacatttttcatttgaactttcctcaacctatgctcatgctccatcaactgtgattactcttcagccacaatatggtgctcatat 30396003  T
Q  401 tattctacgcaaaatcaaaacataaaaac 429  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  30396004 tattatacgcaaagtggaaacataaaaac 30396032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 30384852 - 30385278
Alignment:
Q  1 tgattttgtatgaggttttgaggttgtaccctcctgtaaccggcgttgctcgaaaagttgagaatgatataaaacttggagacttgacattatatgctgg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |  | ||| ||  ||||||    
T  30384852 tgattttgtatgaggttcttaggttataccctcccgtaattggccttgctcgaaatgttgagaaagatgtgaaacttggaaatctaacactacctgctgg 30384951  T
Q  101 aatggaggtttacatgccaattgttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatt 200  Q
    | ||||| ||| | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  30384952 agtggagattttcttaccaattcttttgattcaccatgactgcgaactatggggtgatgatgctaaaatgttcaatcctgaaagattttttggaggaatt 30385051  T
Q  201 tccaaagcaacaaacggtagattttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaa 300  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  30385052 tccaaagcaacaaatggaagagtttcattttttccatttggatggggtcctcgaatttgcattggacaaaacttttctctaatggaagcaaaaatggcaa 30385151  T
Q  301 tggcattgattttacaaaaattttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctccatctgtggtgctttctgttcagccacaacatggtgctcatgt 400  Q
    || |||||||||| ||| | || |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||   | || || || ||||||||||| |||| |||||| |    
T  30385152 tgacattgattttgcaacatttctcatttgaactttcaccgacctatgctcatgctccatcctcgatgattactcttcagccacaatatggcgctcatat 30385251  T
Q  401 tattctacgcaaaatcaaaacataaaa 427  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||    
T  30385252 tattatacgcaaactggaaacataaaa 30385278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 123 - 359
Target Start/End: Original strand, 30476499 - 30476735
Alignment:
Q  123 gttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatttccaaagcaacaaacggtagat 222  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  30476499 gttttggttcaccatgactccgaactatggggtgaagatgctaaggtgttcaatcctgagagattttctggaggaatttccaaagcaacaaatgggagat 30476598  T
Q  223 tttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaatggcattgattttacaaaaatt 322  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30476599 tttcattttttccatttggagggggtccaagaatttgcattggacaaaatttttccatgttggaagcaaagatggcaatggcaatgattttaaaaaaatt 30476698  T
Q  323 ttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctcca 359  Q
     |||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  30476699 ctcatttgaactttctccatcttatgctcatgctcca 30476735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 95 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8379160 - 8378819
Alignment:
Q  95 tgctggaatggaggtttacatgccaattgttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggt 194  Q
    ||||||| |||| |||| | | |||||| ||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||      
T  8379160 tgctggagtggaagttttcttaccaattattttgcttcaacataacaatgaactatggggtgatgatgcaaagatgttcaatcctgagagatttgctgaa 8379061  T
Q  195 ggaatttccaaagcaacaaacggtagattttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaaga 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8379060 ggaatttccaaagcaacaaatggtagatttatatattttccatttggagggggtcctagagtttgcatgggacaaaacttttccctattggaagcaaaga 8378961  T
Q  295 tggcaatggcattgattttacaaaaattttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctccatctgtggtgctttctgttcagccacaacatggtgc 394  Q
    ||||| || || ||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  | | ||| |  || |||||||| || | |||||    
T  8378960 tggcagtgtcaatgattttacaaaatttctattttgaactttctccaacctatgctcatactccaaatttagtgatgactattcagccagaaaagggtgc 8378861  T
Q  395 tcatgttattctacgcaaaatcaaaacataaaaacaacatca 436  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||    
T  8378860 tcatgttattctacgcaaagtgaaagcataaaagcagcatca 8378819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 117 - 359
Target Start/End: Original strand, 30484671 - 30484913
Alignment:
Q  117 ccaattgttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatttccaaagcaacaaacg 216  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |  ||| |||| ||||||||||| |    
T  30484671 ccaatagtttggattcaccacaaccatgaactatggggtgaagatgctaaggtgttcaatcctgagagatttgcagaaggagtttcaaaagcaacaaatg 30484770  T
Q  217 gtagattttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaatggcattgattttaca 316  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  30484771 gtagaaattcattttttccatttggagggggtcctagaatttgtattggacaaaacttttccatgttggaagcaaagatggcaataacattgattttgca 30484870  T
Q  317 aaaattttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctcca 359  Q
      | || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30484871 gcatttctcatttgaactttctccaacctatgctcatgctcca 30484913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 317
Target Start/End: Original strand, 30425260 - 30425453
Alignment:
Q  124 ttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatttccaaagcaacaaacggtagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||  |||  ||||||||||| || |||      
T  30425260 ttttggttcaccatgacatagaactatggggtgatgatgctaaggtgttcaatcccgagagattttcagaaggtgttttaaaagcaacaaatggaagaaa 30425359  T
Q  224 ttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaatggcattgattttacaa 317  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30425360 ttcattttttccatttggagggggtcctagaatttgcattggacaaaacttttctatgttggaagcaaagatggcaatagcaatgattttacaa 30425453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 409
Target Start/End: Original strand, 30431293 - 30431578
Alignment:
Q  124 ttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatttccaaagcaacaaacggtagatt 223  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||  |||  ||||||||||| || |||      
T  30431293 ttttggttcaccatgacatagaactatggggtgaagatgctaaggtgttcaatcccgagagattttcagaaggtgttttaaaagcaacaaatggaagaaa 30431392  T
Q  224 ttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaatggcattgattttacaaaaattt 323  Q
    ||||| | |||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||     
T  30431393 ttcatttattccatttgaagggggtcctagaatttgaattggacaaaacttttccatgttggaagcaaagatggcaatagcaatgattttacaacgtttc 30431492  T
Q  324 tcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctccatctgtggtgctttctgttcagccacaacatggtgctcatgttattctacg 409  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||  ||  |||  || |  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  30431493 tcatttgaactttctccatcttatgctcatgccccggctacggtaattacgcttcagccacaatatggtgctcatataattctacg 30431578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 355
Target Start/End: Original strand, 30437554 - 30437779
Alignment:
Q  130 ttcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatttccaaagcaacaaacggtagattttcata 229  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||  |||  ||||||||||| || |||  |||||     
T  30437554 ttcaccatgactccgaactatggggtgacgatgctaaggtgttcaatcctgagagattttctgaaggtgttttgaaagcaacaaatggaagaaattcatt 30437653  T
Q  230 ttttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaatggcattgattttacaaaaattttcattt 329  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||   || |||||     
T  30437654 tgttccatttggagggggtcctagaatttgcattggacagaacttttctatgttggaagcaaagatggcgatagcaatgattttacaacgtttctcattc 30437753  T
Q  330 gaactttctcaaacatatgctcatgc 355  Q
    |||||||||| | | |||||||||||    
T  30437754 gaactttctccatcttatgctcatgc 30437779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Original strand, 30469365 - 30469574
Alignment:
Q  130 ttcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatttccaaagcaacaaacggtagattttcata 229  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||  |||  |||||||| || || |||  |||||     
T  30469365 ttcaccatgacatagaactatggggtgaagatgctaaggtgttcaatcccgagagattttctgaaggtgttttaaaagcaaccaatggaagaaattcatt 30469464  T
Q  230 ttttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaatggcattgattttacaaaaattttcattt 329  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   || ||||||    
T  30469465 ttttccatttgcagggggtcctagaatttgcattggacagaacttttccatgttggaagcaaagatggcaatagcaatgattttacaacgtttctcattt 30469564  T
Q  330 gaactttctc 339  Q
    ||||||||||    
T  30469565 gaactttctc 30469574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41627032 - 41626745
Alignment:
Q  72 aaacttggagacttgacattatatgctggaatggaggtttacatgccaattgttttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattt 171  Q
    ||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  41627032 aaacttggaaacctaacattatctgctggagtggaggttttcatgccaattatattgttgcaccatgattgtgaattatggggtgatgatgctaaaatgt 41626933  T
Q  172 tcaatcctgagagattttctggtggaatttccaaagcaacaaacggtagattttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaa 271  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41626932 tcaatcctgaaagattttctggaggaatttccaaagcaacgaacggtagagtttcattttttccatttggatggggtcctaggatctgcattgggcaaaa 41626833  T
Q  272 cttttccctgttggaagcaaagatggcaatggcattgattttacaaaaattttcatttgaactttctcaaacatatgctcatgctcca 359  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  41626832 cttttctctattggaagcaaagatggcaatgacattgattttacagcatttctcatttcaactttctccagcctatgctcatgctcca 41626745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15858675 - 15858506
Alignment:
Q  126 ttgattcaccatgactgtgaactatggggtgatgatgctaagattttcaatcctgagagattttctggtggaatttccaaagcaacaaacggtagatttt 225  Q
    ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |||   ||||| ||||| || ||| |||  |||||| | || |||||||| ||   | |||    
T  15858675 ttgattcaccaagatcatgatctatggggtgatgatgcaaaggagttcaaacctgaaaggtttgctgaaggaattgcgaaggcaacaaaaggacaagttt 15858576  T
Q  226 catattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagat 295  Q
    | ||||| || ||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| || | || |||||||||||    
T  15858575 cttatttcccttttggatggggtcctagaatttgtcttggacaaaactttgccttattagaagcaaagat 15858506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15844443 - 15844327
Alignment:
Q  223 tttcatattttccgtttggagcgggtcctagaatctgcattggacaaaacttttccctgttggaagcaaagatggcaatggcattgattttacaaaaatt 322  Q
    |||| ||||| || ||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| || | || ||||||||||| |||||  ||||| |  | || || ||    
T  15844443 tttcttatttcccctttggatggggtcctagaatttgtcttggacaaaactttaccttattagaagcaaagatagcaatatcattgttgctgcagaattt 15844344  T
Q  323 ttcatttgaactttctc 339  Q
     ||||||||||||||||    
T  15844343 ctcatttgaactttctc 15844327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University