View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13763_low_124 (Length: 321)

Name: NF13763_low_124
Description: NF13763
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13763_low_124
NF13763_low_124
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (10-303)||(44262332-44262624)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (12-303)||(24934637-24934927)
chr6 (10-293)||(24942168-24942450)
chr6 (18-303)||(30135101-30135386)
chr6 (12-281)||(21160386-21160654)
chr6 (20-281)||(24738956-24739216)
chr6 (12-303)||(29949636-29949926)
chr6 (18-303)||(29953433-29953717)
chr6 (16-303)||(30149501-30149787)
chr6 (10-303)||(30053395-30053687)
chr6 (14-278)||(24898049-24898312)
chr6 (10-303)||(30577507-30577799)
chr6 (78-224)||(29366238-29366384)
chr6 (76-285)||(15726946-15727154)
chr6 (78-239)||(29348401-29348561)
chr6 (91-223)||(29898126-29898254)
chr6 (39-208)||(29887294-29887463)
chr6 (91-190)||(30118592-30118691)
chr6 (39-193)||(28926395-28926549)
chr6 (91-190)||(29905688-29905787)
chr6 (78-208)||(29835251-29835381)
chr6 (78-208)||(29866685-29866815)
chr6 (78-208)||(29894589-29894719)
chr6 (75-179)||(15714854-15714958)
chr6 (39-191)||(24730852-24731004)
chr6 (78-202)||(29073799-29073923)
chr6 (78-202)||(29078563-29078687)
chr6 (78-202)||(29106372-29106496)
chr6 (78-206)||(29929309-29929437)
chr6 (78-193)||(29357827-29357942)
chr6 (43-233)||(16701964-16702153)
chr6 (40-202)||(30126894-30127056)
chr6 (10-133)||(30029316-30029439)
chr6 (10-133)||(30154579-30154702)
chr6 (78-190)||(24890097-24890209)
chr6 (78-202)||(29211232-29211356)
chr6 (39-143)||(30061893-30061997)
chr6 (91-202)||(24263591-24263702)
chr6 (78-145)||(30060058-30060125)
chr6 (76-238)||(29889764-29889925)
chr6 (10-133)||(24271855-24271978)
chr6 (78-181)||(29116297-29116400)
chr6 (22-133)||(30029118-30029229)
chr6 (81-199)||(29882474-29882592)
chr6 (81-199)||(29909630-29909748)
chr6 (78-148)||(29099379-29099449)
chr6 (12-49)||(30154470-30154507)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (12-283)||(24226790-24227060)
chr3 (78-133)||(24219143-24219198)
chr3 (76-215)||(16351084-16351223)
chr3 (75-237)||(33997973-33998134)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (12-283)||(43628-43898)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (90-303)||(9782587-9782799)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (26-272)||(3217-3462)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (39-220)||(17251310-17251491)
chr1 (23-142)||(28946396-28946516)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (77-272)||(6231-6425)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (14-223)||(8651238-8651446)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (76-215)||(125949-126088)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (43-273)||(121249-121478)
scaffold0014 (78-215)||(104564-104701)
scaffold0014 (96-215)||(137428-137547)
[»] scaffold0652 (1 HSPs)
scaffold0652 (43-273)||(1064-1293)
[»] scaffold0573 (1 HSPs)
scaffold0573 (39-193)||(4134-4288)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (43-273)||(27354-27583)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (39-272)||(8992-9224)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (78-145)||(22379-22446)
[»] scaffold0654 (1 HSPs)
scaffold0654 (43-133)||(1128-1218)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (156-272)||(43088-43203)
scaffold0051 (76-180)||(47764-47868)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (43-130)||(31225-31312)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44262624 - 44262332
Alignment:
Q  10 gaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44262624 gaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgttatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaa 44262525  T
Q  110 aaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44262524 aaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggacta 44262425  T
Q  210 tgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtatagtgtgatg 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44262424 tgcaaaaatggaa-gacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtacagtgtgatg 44262332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 24934637 - 24934927
Alignment:
Q  12 agaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaa 111  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24934637 agaatctctgatgcttgggatcttgtaaatgagatgcataatagaggccaacctgccgatgtgatcacttacagttccttattggatgctttgtgcaaaa 24934736  T
Q  112 accatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24934737 accatcaggttgacaaggcaatcacattaataacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatttatacttacactatacttgttgatggactatg 24934836  T
Q  212 caaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtatagtgtgatg 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24934837 caaaaatggaa-gacttaaggatgcacaagcggtttatcaggatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtataatgtgatg 24934927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 24942168 - 24942450
Alignment:
Q  10 gaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaa 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24942168 gaagaatctctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatagaggccaacctgctgatgtgatcacgtacaattccttattggatgctttgttcaa 24942267  T
Q  110 aaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24942268 aaaccatcaggttgacaaggcaattacattattaatgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgatggacta 24942367  T
Q  210 tgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgta 293  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24942368 tgcaaaaatggaa-gatttaagcatgcacaagcggtttatcagtatcttctttttaagggctatcatttagatgttaaaatgta 24942450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 30135101 - 30135386
Alignment:
Q  18 tctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30135101 tctgatgtttgggatcttatagatgagatgcatgaaagaggtcaacctgctaatgtgatcacttacaattctttattggatgctttgtgcaaaaaccatc 30135200  T
Q  118 agg-ttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaa 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  30135201 aggtttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggtattcagccaaatttgtatacatacacattacttgttgatggaatatgcaaaa 30135300  T
Q  217 atggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtatagtgtgatg 303  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30135301 atggaa-aacttaaggatgcaaaagcggtttatcaagatcttctgattaagggatatcatttagatgttataatgtataatgtgatg 30135386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21160654 - 21160386
Alignment:
Q  12 agaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaa 111  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21160654 agaatctctgatgcttgggatcttgtaaatgagatgcataatagaggccaacctgctgatgtgatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaa 21160555  T
Q  112 accatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatg 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  21160554 accatcaggttgacatggcaatcacattatttacgaagataaaagaccaaggaattcagccgtatatatatacatacacaatacttgttgatggtttatg 21160455  T
Q  212 caaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttaga 281  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  21160454 caaaaatggaa-gacttaaggacgcgcaagaggtctatcagattcttttgattaaaggctatcatttaga 21160386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24739216 - 24738956
Alignment:
Q  20 tgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcag 119  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24739216 tgatgcttgggatcttgtaaatgagatgcataatagaggccaacctgctgatgtgatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcag 24739117  T
Q  120 gttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  24739116 gttgacaaggcaatcacattacttacgaagatcaaagaccaaggaattcagccggatatatatacatacacaatacttgttgatggtttatgcaaaaatg 24739017  T
Q  220 gaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttaga 281  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24739016 gaa-gactcaaggacgcgcaagaggtttatcagattcttttgattaaaggctatcatttaga 24738956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29949926 - 29949636
Alignment:
Q  12 agaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  29949926 agaatctctgatgtttgggatcttcttgtcgagatgcatgatataggccaacctgctaatgtgatcacttacaattctttattagatgctttatgcaaaa 29949827  T
Q  112 accatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29949826 accatcaggttgacaaggcgattgcattattaaaaaagataaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacatacactatacttgttgatggactatg 29949727  T
Q  212 caaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtatagtgtgatg 303  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||| | |||||| |||| |||| |||||   ||||||| |||||||    
T  29949726 caaaaatggaa-gacttgaggatgcacaagagatttatcatgatcttctgactaagggttatcctttaaatgtttcgatgtataatgtgatg 29949636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29953717 - 29953433
Alignment:
Q  18 tctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29953717 tctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatagatgtcaaccggttaatgtgatcacttacaattctttattggatgctttgtgcaaaaaccatc 29953618  T
Q  118 aggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaa 217  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29953617 aggttgacaaggcgattgcattattaaagaagatgaaagaccaagggattcagccaaatatgtatacatacactatacttgttgatgggctatgcaaaaa 29953518  T
Q  218 tggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtatagtgtgatg 303  Q
    ||||| |||||  |||||||| || | |||||||  ||||||| | |||||| |||| |||| |||||   ||||||| |||||||    
T  29953517 tggaa-gacttgcggatgcacgagagatttatcatgatcttctgactaagggttatcctttaaatgtttcgatgtataatgtgatg 29953433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Original strand, 30149501 - 30149787
Alignment:
Q  16 tatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaacca 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||  | ||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30149501 tatctgatgtttgggattttatagatgagatgcatgatagaggtcaaccaaccgacataatcacttacaattctttatttgatggattgtgcaaaaacca 30149600  T
Q  116 tcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  30149601 tcaggttgacagggcaattgcattattaaaaaagatcaaagaccagggaattcagccaagtatgtattcatacactatactttttgttggactatgcaaa 30149700  T
Q  216 aatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtatagtgtgatg 303  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||   ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  30149701 aacggaa-gacttgaggatgcacaagaagtttatcgggatcttacgattaaaggctatcatttagatgctaagatgtatactgtgatg 30149787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 30053395 - 30053687
Alignment:
Q  10 gaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaa 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||   || ||||| ||| || | |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||    
T  30053395 gaagaatctctgatgtttgggatcttatagatgatatttataattgtggtcaaccagctaatataatcacttacaattctttattatatggattgtgcaa 30053494  T
Q  110 aaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  30053495 aaaccatcaggttgacaaggcaattgcgttgttaacgaagatgaaagacgaaggaattcagccagatatgtttacatacacaacacttgttgatggacta 30053594  T
Q  210 tgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtatagtgtgatg 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||   ||||||||| |  ||| || ||| |||||||| |||||||    
T  30053595 tgcaaaaatggaa-gacttaaggatgcacaaaggatttatcaggatcttctatgtaagggctacccattaaatattagaatgtataatgtgatg 30053687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Original strand, 24898049 - 24898312
Alignment:
Q  14 aatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||  |||||  | |||| |||||  || ||||||||||| ||||  ||||||    
T  24898049 aatatctgatgtttgggatcttatagatgatatgcatgatagaggtcaacaagctgacataatcatttacacctcgttattggatgcattgtttaaaaac 24898148  T
Q  114 catcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgca 213  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||  || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  24898149 catcaagttgacaaggcaattgcgttattgaagaagatcaaagaccggggaattgaaccagatatgttcacatacacaatgcttgttgatggactatgca 24898248  T
Q  214 aaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcattt 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||    
T  24898249 aaaatggaa-gacttaaggatgcacaagaggtttatcgggatcttatggttaagggctatcattt 24898312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30577799 - 30577507
Alignment:
Q  10 gaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaa 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| |   | ||| |||| ||||| |||| ||| |||||  ||| |||||||||    
T  30577799 gaagaatctcttatgtttgggatcttatagatgagatgcgtgctacaggtcggtcagctaatgtgatcacatacagttctttattaaatgttttgtgcaa 30577700  T
Q  110 aaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggacta 209  Q
    ||    |||  |||||| |||||| | | |||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||     
T  30577699 aagtggtcattttgacacggcaattagaatatttacaaagatcaaagacaaaggatttgagccaaatatggttacatacaatatacttgttgatggactg 30577600  T
Q  210 tgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaatgtatagtgtgatg 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||    
T  30577599 tgcaaaaatggaa-gacttaaggatgcacaagagatttttcatgatcttctgattaagggctatcgtttagatgttagactgtacactgtgatg 30577507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29366384 - 29366238
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||    
T  29366384 acttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgttgttaacgaagatgaaagatgaaggaattcaaccagata 29366285  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaagg 224  Q
    | | ||| ||||| | | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29366284 tttgtacatacacaacattagttgatggactatgcaaaaatggaagg 29366238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15727154 - 15726946
Alignment:
Q  76 tcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaa 175  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   |||| | | ||| ||||||||||| || |||||  || |    
T  15727154 tcacttacaattcgttaatagatgctttatgcaaaaaccatcacgttgacaaggcaattgtattagtcaagaaaatcaaagaccagggcattcaatcaga 15727055  T
Q  176 tatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatca 275  Q
    ||||||||| || | ||||||| | || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| | ||||| |||||| |    
T  15727054 tatgtatacatatagtatacttatcgatggactatgcaaacaaggaa-gacttaaggatgcacaagtgatttttcaagatcttttgattaaaggctataa 15726956  T
Q  276 tttagatgtt 285  Q
    |||| |||||    
T  15726955 tttaaatgtt 15726946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29348561 - 29348401
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||    
T  29348561 acttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgttgttaacgaagatgaaagatgaaggaattcaaccagata 29348462  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcaca 239  Q
    |||| || |||||||| ||| |||| ||| | || |||  ||||| |||| |||||||||||    
T  29348461 tgtacacatacactattcttattgatggattgtgtaaaggtggaa-gactaaaggatgcaca 29348401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 223
Target Start/End: Original strand, 29898126 - 29898254
Alignment:
Q  91 tattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacac 190  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    ||||||||||| |||| | ||| |||||    
T  29898126 tattgaatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacgttgttaacaaagattaaagac----gaattcagccagatatttgtacatacac 29898221  T
Q  191 tatacttgttgacggactatgcaaaaatggaag 223  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29898222 aacacttgttgatggactatggaaaaatggaag 29898254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 208
Target Start/End: Original strand, 29887294 - 29887463
Alignment:
Q  39 gatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacat 138  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| | || ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  29887294 gatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataattacttacagttctttattagatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgt 29887393  T
Q  139 tattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggact 208  Q
    ||||||| ||  | |||||||| || ||||  ||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||    
T  29887394 tattaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacactattcttattgatggact 29887463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30118691 - 30118592
Alignment:
Q  91 tattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacac 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  30118691 tattggatgctttatgcaaaaactatcaggttgacaaggcaatcacattattaacaaaattgaaagacctgggaattcaaccaaatatgtacacatacac 30118592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28926549 - 28926395
Alignment:
Q  39 gatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacat 138  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| | || ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  28926549 gatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataattacttacagttctctattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcat 28926450  T
Q  139 tattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactat 193  Q
    ||||||| ||  | |||||||| ||  |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28926449 tattaacaaaattgaaagaccagggtcttcaaccaaatatgtacacatacactat 28926395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 190
Target Start/End: Original strand, 29905688 - 29905787
Alignment:
Q  91 tattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacac 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  29905688 tattggatgctttatgcaaaaactatcaggttgacaaggcaatcacattattaacaaaattgaaagacctgggtattcaaccaaatatgtacacatacac 29905787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 208
Target Start/End: Original strand, 29835251 - 29835381
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||  | |||||||| || ||||  |||||||    
T  29835251 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgttattaacaaaattgaaagaccagggtattcgaccaaata 29835350  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttgacggact 208  Q
    |||| || |||||||| ||| |||| |||||    
T  29835351 tgtacacatacactattcttattgatggact 29835381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 208
Target Start/End: Original strand, 29866685 - 29866815
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||  | |||||||| || ||||  |||||||    
T  29866685 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgttattaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccaaata 29866784  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttgacggact 208  Q
    |||| || |||||||| ||| |||| |||||    
T  29866785 tgtacacatacactattcttattgatggact 29866815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 208
Target Start/End: Original strand, 29894589 - 29894719
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||  | |||||||| || ||||  |||||||    
T  29894589 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgttattaacaaaattgaaagaccagggtattcgaccaaata 29894688  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttgacggact 208  Q
    |||| || |||||||| ||| |||| |||||    
T  29894689 tgtacacatacactattcttattgatggact 29894719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15714958 - 15714854
Alignment:
Q  75 atcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaa 174  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||  | | |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15714958 atcacatacaattccttattgcatgctttatgcaaaaatcatcacgttgacaaggcaattgctttggtcaagaagatcaaagaccaaggaattgaaccaa 15714859  T
Q  175 atatg 179  Q
    |||||    
T  15714858 atatg 15714854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 24730852 - 24731004
Alignment:
Q  39 gatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacat 138  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  || || | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  24730852 gatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataataacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcat 24730951  T
Q  139 tattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacact 191  Q
    ||||||| ||  | |||||||| || ||||  ||| ||||||| || ||||||    
T  24730952 tattaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccagatatgtacacatacact 24731004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Original strand, 29073799 - 29073923
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |||| ||    
T  29073799 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcattattaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaacta 29073898  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttga 202  Q
    || | || |||||||| ||| ||||    
T  29073899 tgcacacatacactattcttattga 29073923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Original strand, 29078563 - 29078687
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |||| ||    
T  29078563 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcattattaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaacta 29078662  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttga 202  Q
    || | || |||||||| ||| ||||    
T  29078663 tgcacacatacactattcttattga 29078687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Original strand, 29106372 - 29106496
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |||| ||    
T  29106372 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcattattaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaacta 29106471  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttga 202  Q
    || | || |||||||| ||| ||||    
T  29106472 tgcacacatacactattcttattga 29106496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 206
Target Start/End: Original strand, 29929309 - 29929437
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |||| |     
T  29929309 acttacaattctatattagatgctttatgcaaaacccatcaggttgacaaagcaattgcattgttaacgaaattcaaagaccagggtattcaaccaagtg 29929408  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttgacgga 206  Q
    |||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  29929409 tgtacacatacactattcttattgacgga 29929437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29357942 - 29357827
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||| ||| |||| || ||||| |||||||    
T  29357942 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaatgcaattgcgttattaacacagatgaaaaaccagggtattcaaccaaata 29357843  T
Q  178 tgtatacttacactat 193  Q
    |||| || ||||||||    
T  29357842 tgtacacatacactat 29357827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16702153 - 16701964
Alignment:
Q  43 agatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattatt 142  Q
    |||||| | ||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |    
T  16702153 agatgcgtgatagaggccaacctcccaatgtaatcacttacaattccttattacatgctttatgtaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcattggt 16702054  T
Q  143 aacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaagga 233  Q
     |  ||  | ||||||||||| ||||| ||| ||||| | || || | || ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  16702053 caacaattttaaagaccaaggcattcaaccagatatgcacacatataatacacttgttgatggactatgcaaacaaggaa-gacttaagga 16701964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30127056 - 30126894
Alignment:
Q  40 atgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacatt 139  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| | || | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  30127056 atgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataattatttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaagcaattgcatt 30126957  T
Q  140 attaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttga 202  Q
     ||||||||  | ||| |||| || ||||| |||| | |||| || |||||||| ||| ||||    
T  30126956 gttaacgaaatttaaaaaccagggtattcaaccaagtgtgtacacatacactattcttattga 30126894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 30029316 - 30029439
Alignment:
Q  10 gaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaa 109  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||  |||| |||| ||||||| | || | |||||||||    
T  30029316 gaagaatcgctgatgcttggtatcttatagatgagatgcacgatagaggccaaccagctaatgtggtcacatacacttccttaatagacggtttgtgcaa 30029415  T
Q  110 aaaccatcaggttgacaaggcaat 133  Q
    ||||||| |  |||||||||||||    
T  30029416 aaaccataatcttgacaaggcaat 30029439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 30154579 - 30154702
Alignment:
Q  10 gaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaa 109  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||  |||| |||| ||||||| | || | |||||||||    
T  30154579 gaagaatcgctgatgcttggtatcttatagatgagatgcacgatagaggccaaccagctaatgtggtcacatacacttccttaatagacggtttgtgcaa 30154678  T
Q  110 aaaccatcaggttgacaaggcaat 133  Q
    ||||||| |  |||||||||||||    
T  30154679 aaaccataatcttgacaaggcaat 30154702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24890209 - 24890097
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||||| || ||||  ||| |||    
T  24890209 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcattattaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccagata 24890110  T
Q  178 tgtatacttacac 190  Q
    |||| || |||||    
T  24890109 tgtacacatacac 24890097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29211356 - 29211232
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  29211356 acttacagttctatattggatgctttatgcaaaacccatcgggttgacaaggcagttgcattattaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaaata 29211257  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttga 202  Q
    || | || |||||||| ||| ||||    
T  29211256 tgcacacatacactattcttattga 29211232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30061997 - 30061893
Alignment:
Q  39 gatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacat 138  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  || || | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30061997 gatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaattctatattggatgctttatgcaaacgccatcatcttgacaaggcaatcacat 30061898  T
Q  139 tatta 143  Q
    |||||    
T  30061897 tatta 30061893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24263702 - 24263591
Alignment:
Q  91 tattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacac 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||  | |||||||| || ||||  ||||||||||| || |||||    
T  24263702 tattggatgccttatgcaaaaaccatctggttgacaaggcaattgcattattaataaaattgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacac 24263603  T
Q  191 tatacttgttga 202  Q
    ||| ||| ||||    
T  24263602 tattcttattga 24263591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30060125 - 30060058
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaac 145  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30060125 acttacaattctatattaaatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcattattaac 30060058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 238
Target Start/End: Original strand, 29889764 - 29889925
Alignment:
Q  76 tcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaa 175  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||  |||| | ||||||  | ||||||||  | ||||| |||||    
T  29889764 tcacttacaattctatattagatgctttatgcaaaacccatcaggttgacaaaacaattgcattgtcaacgaaatttaaagaccagagtattcaaccaaa 29889863  T
Q  176 tatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcac 238  Q
    | |||| || |||||||| ||| |||| ||| | ||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  29889864 tgtgtaaacatacactattcttattgatggattgtgcaaaggtggaa-gactaaaggatgcac 29889925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24271978 - 24271855
Alignment:
Q  10 gaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaa 109  Q
    ||||||||||  ||| || ||| ||||  |||||||||||| ||  ||| ||||   ||||| | ||||| |||| |||  ||||||||| ||| |||||    
T  24271978 gaagaatatcatatgctttggaacttaacgatgagatgcatgatcgagggcaacaacctgatataatcacgtacagttctatattggatgatttatgcaa 24271879  T
Q  110 aaaccatcaggttgacaaggcaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24271878 aaaccatcaggttgacaaggcaat 24271855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Original strand, 29116297 - 29116400
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||  | |||||| | || ||||| |||||||    
T  29116297 acttacaattctatattagatgctttatgcaaaatccatcaagttgacaaagcaattgcattgttaacgaaattgaaagacaagggtattcaaccaaata 29116396  T
Q  178 tgta 181  Q
    ||||    
T  29116397 tgta 29116400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Original strand, 30029118 - 30029229
Alignment:
Q  22 atgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggt 121  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  | ||| ||| ||| | ||| |||| ||||| |||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| |  |    
T  30029118 atgttttggatcttattgatgagatgtgtgatagaggtcaagcagctaatgtgatcacgtacacttccttaatggacgcgttgtgcaaaaaccataatct 30029217  T
Q  122 tgacaaggcaat 133  Q
    ||||||||||||    
T  30029218 tgacaaggcaat 30029229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 29882474 - 29882592
Alignment:
Q  81 tacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgt 180  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||  | |||| |||||| ||||  ||| |||||     
T  29882474 tacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgttgacaaagcaattgcattattaacaaaattgaaaggccaaggtattcgaccagatatga 29882573  T
Q  181 atacttacactatacttgt 199  Q
    | || |||||||| |||||    
T  29882574 acacatacactattcttgt 29882592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 29909630 - 29909748
Alignment:
Q  81 tacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgt 180  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||  | |||| |||||| ||||  ||| |||||     
T  29909630 tacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgttgacaaagcaattgcattattaacaaaattgaaaggccaaggtattcgaccagatatga 29909729  T
Q  181 atacttacactatacttgt 199  Q
    | || |||||||| |||||    
T  29909730 acacatacactattcttgt 29909748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 148
Target Start/End: Original strand, 29099379 - 29099449
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaa 148  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  29099379 acttacaattctatattagatgctttatgcaaaacccatcaagttgacaaagcaattgcattgttaacgaa 29099449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 49
Target Start/End: Original strand, 30154470 - 30154507
Alignment:
Q  12 agaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgca 49  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30154470 agaatctctgatgtttggtatcttatagatgagatgca 30154507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Original strand, 24226790 - 24227060
Alignment:
Q  12 agaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  24226790 agaatatatgatgtttgggatttcataggtgagatgcatgatagaggtcaaccagctaacataatcacttacaattctttattagatggattgtgcaaaa 24226889  T
Q  112 accatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24226890 accatcaggttgacaaggcaatcacattgttaacgaagatcaagaatcaaggaattcggccaaatatctatacatacactatacttgttgatggactgtg 24226989  T
Q  212 caaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatg 283  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  24226990 caaaaatggaa-gacttagggatgcacaagaggtttatcaggatcttctgaataaaggctatcagttagatg 24227060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24219198 - 24219143
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaat 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24219198 acttacaattctttattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaat 24219143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Original strand, 16351084 - 16351223
Alignment:
Q  76 tcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaa 175  Q
    ||||||||||||| ||  | |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||| | | ||| || ||||| || || ||||| |||||    
T  16351084 tcacttacaattctttgatagatgttttctgcaaaaaccaacatgttgacaaggctattgcattagttaagaaaattaaagaacatggcattcaaccaaa 16351183  T
Q  176 tatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaa 215  Q
    |||||  || |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16351184 tatgtgcacatacaatatacttattgatggactatgcaaa 16351223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 33997973 - 33998134
Alignment:
Q  75 atcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacatta-ttaacgaagatcaaagaccaaggaattcagcca 173  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||  | ||| ||||||| |||||  |||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  33997973 atcacttataattctttattgcatgctttatgcaaaaatcatcatctcgaccaggcaattacattggttaaggaa-attaaagaccaaggtattcagcca 33998071  T
Q  174 aatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgca 237  Q
    ||| | |  || || |||| |||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  33998072 aatgtttgcacatatactacactaattgatggactatgcaaagatggaa-gacttgaggatgca 33998134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43898 - 43628
Alignment:
Q  12 agaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaa 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  |  | |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  43898 agaatgtctgatgcttgggattttatagatgagatgcatgatagaggtcaaccagcgaacattatcacttacagttctttattagatggattgtgcaaaa 43799  T
Q  112 accatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43798 accatcaggttgacaaggcaatcactttgttaacgaagatcaagaaccaaggaattcagctagatatctatacatacactatacttgttgatggactgtg 43699  T
Q  212 caaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatg 283  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||   ||||||||||||||    
T  43698 caaaaatggaa-aacttagggatgcacaagaggtttatcaggttcttctgaataacacctatcatttagatg 43628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Original strand, 9782587 - 9782799
Alignment:
Q  90 ttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  9782587 ttattggatgctttgtgcaaaatccatcaggttgacaaggcaattgcgttgttaacaaagatgaaagacgaaggaattcagccagatatgtgtacataca 9782686  T
Q  190 ctatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggctatcatttagatgttaaaa 289  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||   ||||| || ||||||||||||| ||  |    
T  9782687 ctatacttgttgatggactgtgcaaaaatggaa-gacttaaggatgcacaaagggtttatcgggatcttacgattaaaggttatcatttagatgctagga 9782785  T
Q  290 tgtatagtgtgatg 303  Q
    |||||| |||||||    
T  9782786 tgtatactgtgatg 9782799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 272
Target Start/End: Original strand, 3217 - 3462
Alignment:
Q  26 ttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgac 125  Q
    |||||| ||| | |||||||||| | |||  || ||||| |||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3217 ttgggagcttgttgatgagatgcgtgatagtggtcaaccagctgatataatcacttacaattcattaatagatgctttatgcaaaaaccatcatgttgac 3316  T
Q  126 aaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaagga 225  Q
    ||||| ||  ||||| | | ||| || ||||||||||| ||||| | | ||||||| || |||| ||||||| | || |||||||||||| | ||||||     
T  3317 aaggctattgcattagtcaagaaaattaaagaccaaggcattcaactagatatgtacacatacaatatacttatcgatggactatgcaaacaaggaagg- 3415  T
Q  226 cttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggcta 272  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||| |||||    
T  3416 cttaaggatgcacaagtgatttttcaggatcttttgattaaaggcta 3462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Original strand, 17251310 - 17251491
Alignment:
Q  39 gatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacat 138  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  || |||| || ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||    
T  17251310 gatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatgtaataacttacacttctttgatagatgctttgtgcaaaagccatcaagttgataaggcaattgcat 17251409  T
Q  139 tattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatgg 220  Q
    || ||| ||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17251410 tactaaagaaaattaaagatcaaggtattcaggcaaatatgtatacatacaatatacttgttgatggactttgcaaagatgg 17251491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 142
Target Start/End: Original strand, 28946396 - 28946516
Alignment:
Q  23 tgtttgggatcttatagatgagatgca-taatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggt 121  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| | ||| || |||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||||  ||||||| || |||||| |||| ||    
T  28946396 tgtttaggatcttcttgatgagatgcattgatagagaccaaccagcttatgtgatcacctaaaattccctattaaatgctttatgaaaaaactatcatgt 28946495  T
Q  122 tgacaaggcaatcacattatt 142  Q
    ||| |||||| | ||||||||    
T  28946496 tgataaggcagttacattatt 28946516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6425
Alignment:
Q  77 cacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaat 176  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||   |||| | | ||| || ||||||||||| ||||| | ||||    
T  6231 cacttacaattctttaatagatgcattatgcaaaaaccatcatgttgacaaggctattgtattagtcaagaaaattaaagaccaaggcattcaactaaat 6330  T
Q  177 atgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatcttcttattaagggcta 272  Q
    ||||| || |||| ||||||| | || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||| |||||    
T  6331 atgtacacatacaatatacttatcgatggactatgcaaacaaggaagg-cttaaggatgcacaagtgatttttcaggatcttttgattaaaggcta 6425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 8651238 - 8651446
Alignment:
Q  14 aatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaac 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||  |||||  | |||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  8651238 aatatatgttgttttggatcttatagatga-atgcatgatagatgtcaacaagctgacataatcacttacacttctttatttgatgcattgttcaaaaac 8651336  T
Q  114 catcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgca 213  Q
    ||| ||||| ||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||  |  |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  8651337 cataaggtttacatggcaattgcattattgaagaagatcaaagaccatagaattgaaccatatatgttcatatacacactacttgttgatggactatgca 8651436  T
Q  214 aaaatggaag 223  Q
    ||||||||||    
T  8651437 aaaatggaag 8651446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 126088 - 125949
Alignment:
Q  76 tcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaa 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | | ||| |||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  126088 tcacttacaattccttaatagatgctttatgcaaaaaccatcagattgacaaggctattgcattagttaagaaaatcaaagatcaaggcattcaaccaga 125989  T
Q  176 tatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaa 215  Q
    |||||  || |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  125988 tatgtgcacatacaatatacttattgatggactatgcaaa 125949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 121478 - 121249
Alignment:
Q  43 agatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattatt 142  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||  || | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |    
T  121478 agatgcatgatagaggtcaacctgccaatattatcacatacaattccttattgcatgctttatgcaaaaatcatcaagttgacaaggcaattgcattggt 121379  T
Q  143 aacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagt 242  Q
     | ||| || ||||| || || ||||| || |||||  | || |||| ||||||| | || |||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||    
T  121378 caagaaaattaaagatcagggcattcaacccaatattaacacatacaatatacttatcgatggactatgcaaagaaggaa-gacttgagaatgcacaagt 121280  T
Q  243 ggtttatcagaatcttcttattaagggctat 273  Q
    | ||| |||| ||||| | ||||| ||||||    
T  121279 gatttttcaggatcttttgattaaaggctat 121249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 104701 - 104564
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaata 177  Q
    ||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||  ||||||| || || |||||| | | ||| || ||||||||||| ||||| ||| |||    
T  104701 acttacagttctttaatagatgctttatgcaaaaacaatcatcttgacaaagctatgacattagtcaagaaaattaaagaccaaggcattcaaccagata 104602  T
Q  178 tgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaa 215  Q
    |||| || |||| ||||||| |||| ||  ||||||||    
T  104601 tgtacacatacaatatacttattgatgggttatgcaaa 104564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 215
Target Start/End: Original strand, 137428 - 137547
Alignment:
Q  96 gatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatac 195  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||||| || ||  ||||| | | ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  137428 gatgctttatgcaaaaacaatcatcttgacaaagctattgcattagtcaagaaaattaaagaccaaggcattcaaccaaatatgtacacatacaatatac 137527  T
Q  196 ttgttgacggactatgcaaa 215  Q
    || |||| ||  ||||||||    
T  137528 ttattgatgggttatgcaaa 137547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0652
Description:

Target: scaffold0652; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1293 - 1064
Alignment:
Q  43 agatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattatt 142  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |    
T  1293 agatgcatgatagaggtcaacctgccgatgtgatcacttacaattccttcttacacgctttatgtaaaaatcatcaagttgacaaggcaattgcattggt 1194  T
Q  143 aacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagt 242  Q
     | ||| || ||||| || || ||||| || |||||  | || |||| ||||||| | || |||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||    
T  1193 caagaaaattaaagatcagggcattcaacccaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaaagaaggaa-gacttgagaatgcacaagt 1095  T
Q  243 ggtttatcagaatcttcttattaagggctat 273  Q
    | ||| |||| ||||| | ||||| ||||||    
T  1094 gatttttcaggatcttttgattaaaggctat 1064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0573 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0573
Description:

Target: scaffold0573; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 4134 - 4288
Alignment:
Q  39 gatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacat 138  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| | || ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  |||    
T  4134 gatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataattacttacagttctctattggatgctttatgcaaaaaccatccaggtgacaaggcaattgcat 4233  T
Q  139 tattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactat 193  Q
    ||||||| ||  | |||||||| ||  |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  4234 tattaacaaaattgaaagaccagggtcttcaaccaaatatgtacacatacactat 4288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 273
Target Start/End: Original strand, 27354 - 27583
Alignment:
Q  43 agatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattatt 142  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||| |  ||||  |    
T  27354 agatgcatgctagaggtcaacctgccgatgtaatcacatacacctccttcttgcatgctttatgtaaaaaccaccaagttgacaaggcagttgcattggt 27453  T
Q  143 aacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagt 242  Q
     | ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  | || |||| ||||||| | || |||||||||||| | |||| || || || ||||||||||    
T  27454 caagaaaattaaagaccaaggcattcaaccaaatattaacacgtacaatatacttatcgatggactatgcaaagaaggaa-gatttgagaatgcacaagt 27552  T
Q  243 ggtttatcagaatcttcttattaagggctat 273  Q
    | ||| |||| ||||| | ||||| ||||||    
T  27553 gatttttcaggatcttttgattaaaggctat 27583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 272
Target Start/End: Original strand, 8992 - 9224
Alignment:
Q  39 gatgagatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacat 138  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||| ||||||| || ||| |||||  | ||| | || ||||||| ||| ||||||||||||||   ||    
T  8992 gatgagatgcatgatagaggtcaacctgccaatgtaatcactttcagttcattattacacgctctatgtaaaaaccgtcatgttgacaaggcaattgaat 9091  T
Q  139 tattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcac 238  Q
    |  | | |||  | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||||||| | || |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  9092 tggtcaagaaacttaaagaccgagacattcaaccaaatatgtacacatacaatatacttatcgatggactatgcaaacaaggaa-gacttaaggacgcac 9190  T
Q  239 aagtggtttatcagaatcttcttattaagggcta 272  Q
    ||||| ||| |||  ||||| | ||||| |||||    
T  9191 aagtgatttttcaagatcttttcattaaaggcta 9224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 145
Target Start/End: Original strand, 22379 - 22446
Alignment:
Q  78 acttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaac 145  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  22379 acttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgtggacaaagcaattacattattaac 22446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0654 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:

Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 1128
Alignment:
Q  43 agatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaat 133  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1218 agatgcatgatagaggtcaacatgcaaatgtgatcacttacaattccttcttacacgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaat 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43203 - 43088
Alignment:
Q  156 gaccaaggaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaaggacttaaggatgcacaagtggtttatcagaat 255  Q
    |||||||| ||||| | | | ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  43203 gaccaaggcattcaactagacatgtacacatacaatatacttattgatggactatgcaagcaaggaagg-cttaaggatgcacaagtgatttttcaggat 43105  T
Q  256 cttcttattaagggcta 272  Q
    ||| | ||||| |||||    
T  43104 cttttgattaaaggcta 43088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47868 - 47764
Alignment:
Q  76 tcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaa 175  Q
    ||||||||||||| ||| |  || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| | |  || |||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  47868 tcacttacaattctttaataaattctttatgcaaaaactatcaggttgacaaggctattgcattagttaataaaatcaaagatcaagggattcaaccaga 47769  T
Q  176 tatgt 180  Q
    |||||    
T  47768 tatgt 47764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31312 - 31225
Alignment:
Q  43 agatgcataatataggccaacctgctgatgtcatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggc 130  Q
    |||||||| ||| |||||||| | |  |||| |||||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  31312 agatgcatgatagaggccaacgtcccaatgtaatcacttatacttccttattacatgctttatgtaaaaaccatcatgttgacaaggc 31225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University