View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13767_low_2 (Length: 511)

Name: NF13767_low_2
Description: NF13767
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13767_low_2
NF13767_low_2
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (9-494)||(26143383-26143864)
chr6 (9-494)||(25580237-25580718)
chr6 (9-494)||(25539058-25539539)
chr6 (9-490)||(25483578-25484055)
chr6 (9-494)||(26056437-26056918)
chr6 (9-494)||(26076407-26076888)
chr6 (9-434)||(26656536-26656961)
chr6 (9-434)||(26762507-26762932)
chr6 (9-440)||(26647044-26647475)
chr6 (9-440)||(26753012-26753443)
chr6 (9-444)||(26884631-26885066)
chr6 (9-358)||(26862227-26862576)
chr6 (9-450)||(27337281-27337722)
chr6 (9-450)||(27398021-27398462)
chr6 (9-444)||(27530487-27530922)
chr6 (9-441)||(26623835-26624267)
chr6 (9-441)||(26729812-26730244)
chr6 (9-492)||(27214969-27215448)
chr6 (9-459)||(28786788-28787234)
chr6 (9-257)||(25511640-25511888)
chr6 (9-433)||(28792931-28793355)
chr6 (303-494)||(25511453-25511640)
chr6 (9-441)||(27717685-27718117)
chr6 (9-418)||(25492505-25492914)
chr6 (9-459)||(28781651-28782097)
chr6 (9-444)||(27610306-27610741)
chr6 (9-403)||(31285161-31285555)
chr6 (9-444)||(27603890-27604325)
chr6 (9-442)||(26803009-26803442)
chr6 (9-444)||(27705590-27706025)
chr6 (12-444)||(27426801-27427233)
chr6 (9-439)||(27697772-27698202)
chr6 (9-444)||(27679511-27679946)
chr6 (9-444)||(27592207-27592642)
chr6 (9-444)||(27676806-27677241)
chr6 (155-360)||(26824464-26824669)
chr6 (162-245)||(28140295-28140378)
chr6 (168-244)||(26937790-26937866)
chr6 (155-237)||(28097775-28097857)
chr6 (191-256)||(26849461-26849526)
chr6 (174-262)||(28243538-28243626)
chr6 (155-237)||(26950511-26950593)
chr6 (191-256)||(26975700-26975765)
chr6 (388-444)||(26862144-26862200)
chr6 (174-246)||(29843338-29843410)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (8-433)||(28126860-28127285)
chr1 (8-428)||(28163561-28163980)
chr1 (9-444)||(267526-267961)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (9-444)||(18730686-18731121)
chr4 (9-444)||(18678742-18679177)
chr4 (9-444)||(18698582-18699017)
chr4 (9-444)||(18654659-18655094)
chr4 (9-444)||(18723267-18723702)
chr4 (12-444)||(18074322-18074754)
chr4 (154-262)||(5090284-5090392)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (9-459)||(8037-8483)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (9-459)||(12861-13307)
scaffold0277 (9-433)||(3898-4322)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (9-441)||(2725-3157)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (9-444)||(29273024-29273459)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (12-444)||(60130-60562)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (155-254)||(3280410-3280509)
chr2 (155-260)||(17992547-17992652)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (155-254)||(16691618-16691717)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (174-262)||(43700-43788)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 26143864 - 26143383
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143864 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 26143765  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26143764 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaac 26143665  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26143664 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 26143565  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143564 aatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 26143465  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143464 caataaacttgtattcatatctattcatgtcca----ataagataaattagaaaatacactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 26143383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25580718 - 25580237
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||     
T  25580718 acatcatcaaaaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctactaacttaaagtaaaatttaacta 25580619  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||||||||||||  |  |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25580618 ttattaaaaggagataataatggagatgtttcaagttattaagaattgaaatctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaac 25580519  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25580518 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaccacatcctcagagcccatgtcaagaagc 25580419  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580418 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 25580319  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580318 caataaacttgtattcatatctattcgtgtcca----ataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 25580237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25539539 - 25539058
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||     
T  25539539 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttttagatagtctttcctttatgattgttattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 25539440  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| |  |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25539439 tttttgaaaggagcttcttttggagatgtttcaagttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaacttcaaattgatcagcaac 25539340  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25539339 aaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccaagtcaagaagc 25539240  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539239 aatttcacttgttctattggggactgtaatccaacagggtatttggccacatataaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 25539140  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539139 caataaacttgtattcatatctattcatgtcca----ataagataagttagaacataaactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 25539058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25484055 - 25483578
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||     
T  25484055 acatcatcaacaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 25483956  T
Q  109 ttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    || || ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25483955 tttttgaaaggagcatcttt-tggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaa 25483857  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25483856 gaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 25483757  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25483756 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaatcatgattgatattgttggagatgtattggactatcttc 25483657  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatg 490  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25483656 tcaataaacttgtgttcatatctattcatgtcca----ataagataagttagaacatacactaaaaccaaaatcatatccatg 25483578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 26056918 - 26056437
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||| |  ||  |||||||||     
T  26056918 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctaactgaccgtcaaatttaacta 26056819  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26056818 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaat 26056719  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26056718 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagc 26056619  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26056618 aatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgccttcgactatcttct 26056519  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 494  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26056518 caataaacttgcattcagatctattcatgtcca----ataaggtaagttagaacatacactagaatcaaaatcacatccatgtatt 26056437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 26076888 - 26076407
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||| || |  ||  |||||||||     
T  26076888 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaacta 26076789  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26076788 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaat 26076689  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26076688 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagc 26076589  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26076588 aatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgccttcgactatcttct 26076489  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 494  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26076488 caataaacttgcattcagatctattcatgtcca----ataaggtaagttagaacatacactagaatcaaaatcacatccatgtatt 26076407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26656961 - 26656536
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||| |    
T  26656961 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacag 26656862  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26656861 tttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgac 26656762  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  26656761 aaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagc 26656662  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26656661 aatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgtcggagatgtctttgactatattct 26656562  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26656561 caataaacttgtattcatatctattc 26656536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26762932 - 26762507
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||| |    
T  26762932 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacag 26762833  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26762832 tttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgac 26762733  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  26762732 aaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagc 26762633  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26762632 aatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgtcggagatgtctttgactatattct 26762533  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26762532 caataaacttgtattcatatctattc 26762507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26647475 - 26647044
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  26647475 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactg 26647376  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26647375 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaac 26647276  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||  | || |||||||||    
T  26647275 aaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagc 26647176  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26647175 aatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttcc 26647076  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtcc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26647075 caataaacttgtattcatatctattcatgtcc 26647044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26753443 - 26753012
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  26753443 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactg 26753344  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26753343 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaac 26753244  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||  | || |||||||||    
T  26753243 aaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagc 26753144  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26753143 aatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttcc 26753044  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtcc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26753043 caataaacttgtattcatatctattcatgtcc 26753012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26885066 - 26884631
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  26885066 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctatgtagtctttcctttatgagtggaattccctcactaacatctcctaacttaatgtttaatttaattg 26884967  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26884966 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaagttattatgagttgaattctccctgactttatgcagaaaacatacacattcaaattgatcagcaac 26884867  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | || | |||  |||| |||||||||    
T  26884866 ataattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaattcctaccatgtgtaccccttcgttagattccttatcaagaagc 26884767  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||| | ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||     
T  26884766 aattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacagggtatttggctacatgtaaaacaacacgattgattttgtcggagatatcttcgactatcttcc 26884667  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  26884666 cgataaactcgtattcgtatctattcatgtccaata 26884631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26862576 - 26862227
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26862576 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactg 26862477  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||||||| || || | ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26862476 tttttaaaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 26862377  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||  || | |||||||||    
T  26862376 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagc 26862277  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctac 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26862276 aatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 26862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 450
Target Start/End: Original strand, 27337281 - 27337722
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| || |||||    
T  27337281 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactg 27337380  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  27337381 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaat 27337480  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||  |||  |||||||||    
T  27337481 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagc 27337580  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||  |||||| |||||||  | | ||| |||| ||||||||| ||||    
T  27337581 aattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggcaacgtgtagaaaaacacgattgatcctatcggaaatgtgttcgactatattct 27337680  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataag 450  Q
    |||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27337681 caataagctcgtactcatatctattcatgtccaatagataag 27337722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 450
Target Start/End: Original strand, 27398021 - 27398462
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| || |||||    
T  27398021 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactg 27398120  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  27398121 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaat 27398220  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||  |||  |||||||||    
T  27398221 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagc 27398320  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||  |||||| |||||||  | | ||| |||| ||||||||| ||||    
T  27398321 aattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggcaacgtgtagaaaaacacgattgatcctatcggaaatgtgttcgactatattct 27398420  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataag 450  Q
    |||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27398421 caataagctcgtactcatatctattcatgtccaatagataag 27398462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 27530487 - 27530922
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||| ||||||    
T  27530487 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttgcttaatgattggaattccctgactaacacctcctaacttaatgtccaatctaactg 27530586  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| |  || |||||||||||||  ||||    | | |||||| |||| ||||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  27530587 tttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatctgaagtcgaattcactctcacattttctagaaaacataaaacttcaaattgatcagcaat 27530686  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    |  |||||| ||    
T  27530687 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacctatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcagatttttcatcaagatgc 27530786  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
      |||||| |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    || || | ||  ||||||| |||||||||||||||||      
T  27530787 cctttcacatgttgtactcgggactgtaatccaacaggatatttggcaacatctaagggctcacgactaatcctgttggaaatgtcttcgactatctttc 27530886  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27530887 caataaactcgtattcatatctattcatgtccaata 27530922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26624267 - 26623835
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||   | ||||  |  ||    
T  26624267 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttg 26624168  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26624167 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26624068  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||| |||||  ||||| |||| ||||| || || ||||||||     
T  26624067 aaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagt 26623968  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| || |||| ||||   ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |    
T  26623967 gatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactatctttt 26623868  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtcca 441  Q
    ||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||    
T  26623867 caataaaatcatattcatatctgttcatgtcca 26623835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26730244 - 26729812
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||   | ||||  |  ||    
T  26730244 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttg 26730145  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26730144 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26730045  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||| |||||  ||||| |||| ||||| || || ||||||||     
T  26730044 aaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagt 26729945  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| || |||| ||||   ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |    
T  26729944 gatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactatctttt 26729845  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtcca 441  Q
    ||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||    
T  26729844 caataaaatcatattcatatctgttcatgtcca 26729812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27215448 - 27214969
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||  || ||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |    
T  27215448 acatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttgacatagcattttttttatctttgtaatcccctcactaacacctcctaacttatcgtctaatctaaccg 27215349  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | | |||||  | |||||| || |||||||  |||||   | ||||||||||| | ||||  |  |||||| ||  || |||||| ||||||||||     
T  27215348 ttttcataaggatcttttcctgcaggtgtttcaagttatttaaagttgaattctctttcacatcttctagaaaatatgaaccttcaaactgatcagcaat 27215249  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  27215248 gaaattaaaaattgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagctccatgaagtcctaccatgtggacctcttccttagatcccttgtcaagaagc 27215149  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||| ||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||| || ||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27215148 aattttacttgttgtatttgggtatgtaatccaacagggtgtttggcaacatgtaaaaaatcacgattcgtcttgtttgagatgtcttcaactatcttct 27215049  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgta 492  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||    ||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  27215048 caataaacttgtattcatatctgttaatgtcca----ataagataagttagtgcatacaccaacatcaatatcagatccatgta 27214969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28787234 - 28786788
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| || || ||    
T  28787234 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28787135  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| ||     
T  28787134 tttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 28787035  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |  |||||||||    
T  28787034 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 28786935  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||||| || |||||| |       
T  28786934 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatctc 28786835  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttag 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  28786834 caataaacttgtattcatatctattcatgtc----atataagataagttag 28786788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25511888 - 25511640
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||| || |  ||  |||||||||     
T  25511888 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaacta 25511789  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25511788 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaat 25511689  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 257  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25511688 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctctagta 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28793355 - 28792931
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| || || ||    
T  28793355 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28793256  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||   |  |||| ||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| ||     
T  28793255 tttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatctatttgaagctgaactctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 28793156  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |  |||||||||    
T  28793155 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 28793056  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||||| || |||||| |       
T  28793055 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatctc 28792956  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctatt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28792955 caataaacttgtattcatatctatt 28792931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 303 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511453
Alignment:
Q  303 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgacta 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgttcaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgtcttcgacta 25511541  T
Q  403 tcttctcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgtatt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25511540 tcttctcaataaacttgtattcagatctattcatgtcca----ataaggtaagttagaacatacactagaatcaaaatcacatccatgtatt 25511453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 27717685 - 27718117
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||| ||||||   ||||| || || |    
T  27717685 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagt 27717783  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||   | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27717784 gtttttaaaaggagctccttctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27717883  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  |  ||||||||    
T  27717884 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 27717983  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || || | ||||||||||||| || ||||||||      
T  27717984 cgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactggtcttgttggagatgtatttgactatctct 27718083  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctattcgtgtcca 441  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27718084 ccaataaactcgtattcatatctattcatgtcca 27718117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 418
Target Start/End: Original strand, 25492505 - 25492914
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  ||  ||| ||||      
T  25492505 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctctctacatagtccttgttttatgattgcaattccctcactaacacttcttaacttaatgtctaatctaacca 25492604  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca-gtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    || |  ||||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||||| ||||     |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25492605 ttttcgaaaggagtttttcctggagatctttcaagtttcttg-gagttgaattctctctcacatctcctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 25492703  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
      || ||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||  || |||||    
T  25492704 tgaagttatagattgattttgcaagtgttgatttacctaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaactcatcctcagatacctcatctagaag 25492803  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||  | |  ||||||||||||||||| |||    
T  25492804 caatttcacgtgttgtactcgggattgtaatccaacagggtatttggcaacatgtaatgaaacacgattgatcctatccgagatgtcttcgactatattc 25492903  T
Q  408 tcaataaactt 418  Q
    |||||||||||    
T  25492904 tcaataaactt 25492914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28782097 - 28781651
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| || || ||    
T  28782097 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28781998  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
     | |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  28781997 cttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 28781898  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||| | || |   ||||||||    
T  28781897 taagttataaactgcttttacaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatcctgactccattatcatatccttcaccaagaagc 28781798  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||||| || |||||| |       
T  28781797 gatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagtgctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgc 28781698  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttag 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  28781697 caataaacttgtattcatatctattcatgtc----atataagataagttag 28781651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 27610306 - 27610741
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||| ||||||   ||||| || || |    
T  27610306 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagt 27610404  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||   | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27610405 gtttttaaaaggagctcctcctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27610504  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  |  ||||||||    
T  27610505 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 27610604  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    | ||||||||| || || | | ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||||| || ||||||||      
T  27610605 cgatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctct 27610704  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
     || |||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  27610705 ccagtaaactcgtattcatatctattcatgcccaata 27610741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31285555 - 31285161
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||   | ||||  || ||    
T  31285555 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccaattg 31285456  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||| |||     
T  31285455 ttttcaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataatccgtcaaattgatcaccaat 31285356  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| | ||| | |  | ||   |||| |||||||||    
T  31285355 aaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctcctatcccataaagtcctaccatgtgtacccctttattagtttccttatcaagaagc 31285256  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactat 403  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||   ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  31285255 aatttcacttgttgtattcgaaacttaaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactat 31285161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 27603890 - 27604325
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  |   || |||||||| ||    |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| || || |    
T  27603890 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcattgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagt 27603988  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27603989 gtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27604088  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  |  ||||||||    
T  27604089 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 27604188  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
      |||||||||||| || ||| ||||| || |||| ||| || ||||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||| ||||  ||||||||     
T  27604189 agatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaataggataattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatttctttcactatcttt 27604288  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
     |||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  27604289 ccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaata 27604325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26803442 - 26803009
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||   |||||||    ||||||  |  ||    
T  26803442 acatcatcgagaatcaaaagaatcttatttctacacagtctttcctttataattggaatcccctcacaaacatgatctaacttgattttcaatccagttg 26803343  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||| ||| || |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26803342 tttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26803243  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  |||||||||    
T  26803242 aaaattatagattgctcttgcaagtgctgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagc 26803143  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     ||||||||| || || ||| || || || ||||||||||| || || |||| ||||     | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||       
T  26803142 gatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggtaattagcaacatgtaagggctgacgattgatcttgttggagatgtatttgactatctctc 26803043  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaa 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26803042 caatcaacttgtattcatatctattcatgtccaa 26803009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 27705590 - 27706025
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| || ||| ||||||| |||||   |||||||    ||| ||  |  ||    
T  27705590 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacagcctttcctttatgaatggaatcccctcacaaacatgatctaactttattttcgatccagttg 27705689  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||| ||| || |  || |||||||||||||  | ||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27705690 tttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagtcattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 27705789  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  ||||||||     
T  27705790 aaaattataaattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctccaatgccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagt 27705889  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||  |||| |||| ||||  |    || |||| ||||||||||||| || |||||||||      
T  27705890 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggatgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatctttc 27705989  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27705990 caataagcttgtattcatatctattcatgtgcaata 27706025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 444
Target Start/End: Original strand, 27426801 - 27427233
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||| || || |||      
T  27426801 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 27426900  T
Q  112 ttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaa 210  Q
    || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27426901 ttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaa 27426999  T
Q  211 aattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaa 310  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  ||||||||| |    
T  27427000 aattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcga 27427099  T
Q  311 tttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttctca 410  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||  |||| |||| |||| |     || |||| ||||||||||||| || |||||||||  ||    
T  27427100 tttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatctttcca 27427199  T
Q  411 ataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  27427200 ataagctcgtattcatatctattcatgtccaata 27427233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 439
Target Start/End: Original strand, 27697772 - 27698202
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||| |||   | | ||  |  ||    
T  27697772 acatcgtcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccgtcactaacatggtctaaattaatttccgatccagttg 27697871  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | |||||||| |  || |||||||||| ||  ||||| | |  |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27697872 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgttccaagttatttttagctgaattcattctcacattatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 27697971  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
     |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| || || |||||||      
T  27697972 caaattatagattgctcttgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaatt 27698071  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     ||||||||  || || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||||| || ||||||||  |    
T  27698072 gatttcactctttgtacttgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctt 27698171  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27698172 caataaacttgtattcatatctactcgtgtc 27698202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27679946 - 27679511
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||   | |||      ||    
T  27679946 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacataatctttcctttatgactggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaaacctgttg 27679847  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| |  || ||||||| |||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||    
T  27679846 tttttaaaaggagcttctcttggagatatttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacatgaaccttcgaattgatctgcaac 27679747  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| || || ||||  |||||||||    
T  27679746 aaaattatagatttgtcttgcaagtgttgatttccccaaacctccaatgccataaattccaaccatatggaccccatcatcggatccctcatcaagaagc 27679647  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||  |||| |||| ||||       || |||| ||||||||||||| || |||||||||      
T  27679646 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggctgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatctttc 27679547  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27679546 caataagcttgtattcatatctattcatgtgcaata 27679511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 27592207 - 27592642
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||  | | |||||| || ||||||  ||||||||||   ||||| || || |    
T  27592207 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaat-ttcaagttgaagt 27592305  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || | |||||||| |||||  |||||   |  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27592306 gtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27592405  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| || |  ||||||||    
T  27592406 taaagttataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaag 27592505  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||||||       || |||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  27592506 cgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatttaagggctgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatcttt 27592605  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27592606 ccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaata 27592642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 27676806 - 27677241
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||  | | |||||| || ||||||  ||||||||||   ||||| || || |    
T  27676806 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaat-ttcaagttgaagt 27676904  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || | |||||||| |||||  |||||   |  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27676905 gtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27677004  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| || |  ||||||||    
T  27677005 taaaattataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaag 27677104  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    | |||||| ||||| || ||| ||||| || |||||||||||  |||| |||| ||||      ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  27677105 cgatttcatttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggttgttgactgatcttgttggagatgtatttgactatcttt 27677204  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27677205 ccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaata 27677241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26824669 - 26824464
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||| | |  |||||||| |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  26824669 tgaattctctctcacgttctcaagaaaacaaaaaacttcaaatttatcagcaatagaattaaaagttgcttttgcaagtgttgatttacctaaacctcca 26824570  T
Q  255 gtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttgg 354  Q
     |||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||  | || ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26824569 ataccgtaaagtcctaccatatggaccacatcatcagattcgttatcaagaagagatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaaccgggtatttgg 26824470  T
Q  355 ctacat 360  Q
    | ||||    
T  26824469 caacat 26824464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28140378 - 28140295
Alignment:
Q  162 tctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  28140378 tctctcacattatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcggcaataaaattataaattgcttgtgcaagtgttgttttaccc 28140295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26937866 - 26937790
Alignment:
Q  168 acattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacc 244  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  26937866 acattatgaagaaaacacaaactttcaaattgatcaccaatcaaattataaattgctcgtgcaagtgttgatttacc 26937790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 28097775 - 28097857
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 237  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28097775 tgaattttctctcacattgtgaaggaaacagacacattcaaattgaccagcaatgaaattataaaccgcttttgcaagtgttg 28097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26849526 - 26849461
Alignment:
Q  191 ttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 256  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  26849526 ttcaaattgatcagcaatcgaattataaactgcttgagcaagtgttgtttttcccattcctccagt 26849461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28243626 - 28243538
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  28243626 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 28243538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26950593 - 26950511
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 237  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   | ||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  26950593 tgaattttctctcacattgtgaagaaaacatttgcattcaaattgattagcaatcaagttataaactgcttgagcaagtgttg 26950511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26975765 - 26975700
Alignment:
Q  191 ttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 256  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  26975765 ttcaaattgattagcaatcaaattataaactgcttgagcaagtgttgtcttacccattcccccagt 26975700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26862200 - 26862144
Alignment:
Q  388 agatgtcttcgactatcttctcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  26862200 agatgtctctgactatcttcccaataaactcatattcatatctattcacgtccaata 26862144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 246
Target Start/End: Original strand, 29843338 - 29843410
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccca 246  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  29843338 tgaagaaaacacaaacattcaaatttatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccca 29843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 433
Target Start/End: Original strand, 28126860 - 28127285
Alignment:
Q  8 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||  ||||    
T  28126860 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctgcatagcctttgttttatgattgcaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccaatccaact 28126959  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| | |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||| ||||  |  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28126960 gttttcaaaaggagcttttcttggagatgtttcaaattatatggagttgaaatctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 28127059  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||    
T  28127060 tgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccaataccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaag 28127159  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    ||| |||||||||| || | ||  |||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||| || |||||||    
T  28127160 caaattcacttgttgtacttggtcctgtaatccaacaggatatttggcaacatgtaagaaaacacgattgatcctgtcggatatgtctttgattatcttc 28127259  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctatt 433  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28127260 tgaataaacttgtattcatatctatt 28127285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 428
Target Start/End: Original strand, 28163561 - 28163980
Alignment:
Q  8 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || | || |||||    
T  28163561 gacatcatcaagaatcaaaagaattttatttctatgtagcctttgttttatgattgtaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccgatctaact 28163660  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  ||     || ||||||||||||| ||||  |  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28163661 gtt-tcaaaaagagctcttcctggagatgtttcaagttggatggagttgaattctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 28163759  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||    
T  28163760 tgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtatcataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaag 28163859  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    |||||||||||||| || | | || ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| |||||| |||||||  ||| |||| || ||| || ||||| |    
T  28163860 caatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacaggatattttgcaacatgtaaaaaaacacgattgatcctgtcggaggtgcctttgattatctcc 28163959  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatat 428  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  28163960 tgaataaacttgtattcatat 28163980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 267526 - 267961
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||   | ||||  |  ||    
T  267526 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaatgccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccagttg 267625  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagttta-ttatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    || |||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||  || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  267626 tttttaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttacttatagct-gaattttctctcacatcatgaagaaaacataatccttcaaattgatcagcaa 267724  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| || || ||||||||    
T  267725 taaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaag 267824  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    |||||||||||||| || | | |||  ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    || || |||| ||||||||||||| || ||||||||      
T  267825 caatttcacttgttgtacttgagaccataatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctcacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctct 267924  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  267925 ccaataaacttgtattcatatctattcatgtcaaata 267961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 18730686 - 18731121
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| |   | ||    
T  18730686 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatatagggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtg 18730785  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18730786 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18730885  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | | ||| || || |||||||||    
T  18730886 aaaattataaattactttagcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccataagatcctttatcaagaagc 18730985  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||  | || ||||||||| |    
T  18730986 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaaatggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagacatatttgactatctttt 18731085  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18731086 caataaacttgtattcatatctattcatgtccaata 18731121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 18678742 - 18679177
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| |  || ||    
T  18678742 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtg 18678841  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18678842 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18678941  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |  |  |||||||||    
T  18678942 aaaattataaattgcttttgcaagtgttaatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaccatgcggactccatcataagatcattcatcaagaagc 18679041  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||       || |||| ||||| |||| || || ||||||||       
T  18679042 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgccgactgatcttgttagagacgtatttgactatctctc 18679141  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18679142 caataaacttgtattcatatctattcatgtccaata 18679177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 18698582 - 18699017
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| |   | ||    
T  18698582 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtg 18698681  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18698682 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18698781  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| || || |||||||||    
T  18698782 aaaattataaattgctttcgcaagtgttgatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaacatgcggactccatcatcagatcctttatcaagaagc 18698881  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
      ||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || |||| |||||||||| || || |||||| |       
T  18698882 gctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagacgtatttgactatatctc 18698981  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18698982 caataaacttgtattcatatctattcatgtccaata 18699017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 18654659 - 18655094
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| |  || ||    
T  18654659 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtg 18654758  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||| ||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18654759 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagatgaattttctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18654858  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    | |||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | ||||| || || |||||||||    
T  18654859 acaattattaattgattttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccatcagatcctttatcaagaagc 18654958  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||  ||| ||||     | || |||| ||||||||||  | || |||||||||      
T  18654959 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaactggcagcatgtaagggctgacgactgatcttgttggagacatatttgactatctttc 18655058  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18655059 caataaacttgtattcatatctattcatgtccaata 18655094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 18723267 - 18723702
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||| ||    | ||||| |||||||||| ||||||| |||   |||| |  || ||    
T  18723267 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagccttttctttatataaggaattctctcactaacacctcctaagttaattttcagtgaaagtg 18723366  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18723367 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacgttttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18723466  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | | ||| || || |||||||||    
T  18723467 aaaattataaattccttttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccattagatcctttatcaagaagc 18723566  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||     | || |||| ||||||  ||  | || |||||||||      
T  18723567 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaagtggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttgttgacatatttgactatctttc 18723666  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18723667 caataaacttgtattcatatctattcatgtccaata 18723702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18074754 - 18074322
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||| || || |||      
T  18074754 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 18074655  T
Q  112 ttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaa 210  Q
    || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18074654 ttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaa 18074556  T
Q  211 aattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaa 310  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  ||||||||| |    
T  18074555 aattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcga 18074456  T
Q  311 tttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttctca 410  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||  |||| |||| |||| |     || |||| ||||||||||||| || |||||||||  ||    
T  18074455 tttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatctttcca 18074356  T
Q  411 ataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  18074355 ataagctcgtattcatatctattcatgtccaata 18074322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 262
Target Start/End: Original strand, 5090284 - 5090392
Alignment:
Q  154 ttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcc 253  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  5090284 ttgaattttctctcacattgggaagaaaacaaagacattcaaattgatgagcaatgaaattgtaaattgcttttccaagtgtggttttacccattcctcc 5090383  T
Q  254 agtaccata 262  Q
    ||| |||||    
T  5090384 agtcccata 5090392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 8483 - 8037
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||    | ||||||||||||||||  ||||||||||   |||  || || ||    
T  8483 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtg 8384  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| ||     
T  8383 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 8284  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| || |  |||||||||    
T  8283 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 8184  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     ||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||||| || |||||| |       
T  8183 gatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgc 8084  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttag 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  8083 caataaacttgtattcatatctattcatgtc----atataagataagttag 8037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 459
Target Start/End: Original strand, 12861 - 13307
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||    | ||||||||||||||||  ||||||||||   |||  || || ||    
T  12861 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtg 12960  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| ||     
T  12961 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 13060  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| || |  |||||||||    
T  13061 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 13160  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     ||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || |||| ||||||||||||| || |||||| |       
T  13161 gatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgc 13260  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaatatataagataagttag 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  13261 caataaacttgtattcatatctattcatgtc----atataagataagttag 13307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Original strand, 3898 - 4322
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |   || |||||||| ||    |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| || || |    
T  3898 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagt 3996  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||| ||||||||    
T  3997 gtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattcatcagcaa 4096  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||  ||||| || |  ||||||||    
T  4097 taaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtgggctccatgatcagatccttcatcaagaag 4196  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    | ||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||     |||| |||| |||||||||||||  | ||||||||      
T  4197 cgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgatgactgatcttgttggagatgttcttgactatctct 4296  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctatt 433  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  4297 ccaataaacttgtattcatatctatt 4322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 2725 - 3157
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||| ||||||   ||||| || || |    
T  2725 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagt 2823  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| ||   ||| |||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  2824 gtttttaaaaggagctccaactgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 2923  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  |  ||||||||    
T  2924 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 3023  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||  |  ||||||||||| ||||| |||| ||||     | || || | ||||||||||||| || ||||||||      
T  3024 cgatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactggtcttgttggagatgtatttgactatctct 3123  T
Q  408 tcaataaacttgtattcatatctattcgtgtcca 441  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3124 ccaataaactcgtattcatatctattcatgtcca 3157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 444
Target Start/End: Original strand, 29273024 - 29273459
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||| || |||| ||| |||||||||||||   ||||||||   | ||||  |  ||    
T  29273024 acatcatcgagaatcaaaagaattttctttctacttagcctctcctttataattggaatcccctcactaacatgatctaacttaatttccaatccagttg 29273123  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| |  || |||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  29273124 tttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaatcttcaaattgatcagcaaa 29273223  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| |||||  ||| | |||| ||||| || || |||||||||    
T  29273224 aaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagccaccaatcccataaattccaaccatatggatcccatcatcagatccattatcaagaagc 29273323  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||| ||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   ||  |  |||| ||||||||||||| || ||||||||       
T  29273324 gatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttggcaacatgtaagggcacgcggctgatcttgttggagatgtatttgactatctctc 29273423  T
Q  409 caataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29273424 cgataaacttgtattcatatctattcatgtcaaata 29273459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 60562 - 60130
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||| || || |||      
T  60562 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 60463  T
Q  112 ttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaa 210  Q
    || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  60462 ttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaa 60364  T
Q  211 aattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaa 310  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  ||||||||| |    
T  60363 aattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcga 60264  T
Q  311 tttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttctca 410  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||  |||| |||| |||| |     || |||| ||||||||||||| || |||||||||  ||    
T  60263 tttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatctttcca 60164  T
Q  411 ataaacttgtattcatatctattcgtgtccaata 444  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  60163 ataagctcgtattcatatctattcatgtccaata 60130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3280509 - 3280410
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  3280509 tgaattttctctcacattgtgaagaaaacatacacattcaaattgattagcaatgaaattataaactgctcttgcaagagttgtcttacccattcctcca 3280410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 260
Target Start/End: Original strand, 17992547 - 17992652
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||   || || |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| || |||    
T  17992547 tgaattttctctcacattgtgaaggaaacacttacattgaaattgattagcaaccaaattataaactgcttgagcaagagttgtcttgcccattccacca 17992646  T
Q  255 gtacca 260  Q
    ||||||    
T  17992647 gtacca 17992652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16691717 - 16691618
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||| |||||| || ||||||    
T  16691717 tgaattttctctcacgtcatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccgattcctcca 16691618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43788 - 43700
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  43788 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 43700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University