View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13778_low_6 (Length: 375)

Name: NF13778_low_6
Description: NF13778
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13778_low_6
NF13778_low_6
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (168-372)||(26704341-26704545)
chr6 (168-372)||(2837546-2837750)
chr6 (168-372)||(6086601-6086805)
chr6 (171-372)||(30691855-30692056)
chr6 (168-372)||(26946878-26947082)
chr6 (168-372)||(3347525-3347729)
chr6 (163-358)||(3955782-3955977)
chr6 (169-372)||(17261075-17261278)
chr6 (168-372)||(9459564-9459768)
chr6 (168-372)||(21893456-21893660)
chr6 (168-372)||(18613539-18613743)
chr6 (163-372)||(20726787-20726992)
chr6 (170-372)||(34887294-34887496)
chr6 (168-372)||(11167241-11167445)
chr6 (168-367)||(16307015-16307214)
chr6 (169-372)||(28199510-28199714)
chr6 (177-372)||(1153603-1153798)
chr6 (168-372)||(35198285-35198488)
chr6 (171-369)||(30698934-30699132)
chr6 (168-330)||(52837-52999)
chr6 (237-372)||(33464399-33464534)
chr6 (260-372)||(53001-53113)
chr6 (169-245)||(33463703-33463779)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (168-372)||(18594538-18594742)
chr8 (168-372)||(39206587-39206791)
chr8 (163-372)||(14422699-14422908)
chr8 (168-372)||(29938062-29938266)
chr8 (169-372)||(13110406-13110609)
chr8 (171-372)||(2042526-2042727)
chr8 (163-372)||(144390-144599)
chr8 (168-372)||(22260632-22260836)
chr8 (168-372)||(24113168-24113372)
chr8 (168-372)||(35118033-35118237)
chr8 (171-372)||(10836757-10836958)
chr8 (168-372)||(6144275-6144479)
chr8 (168-372)||(34842367-34842571)
chr8 (168-372)||(39218778-39218982)
chr8 (169-372)||(34998898-34999101)
chr8 (172-369)||(34679462-34679659)
chr8 (168-372)||(4035848-4036052)
chr8 (168-372)||(33278401-33278605)
chr8 (166-372)||(7791410-7791616)
chr8 (170-372)||(41575516-41575718)
chr8 (171-372)||(7774768-7774969)
chr8 (163-370)||(38167159-38167366)
chr8 (173-372)||(44804946-44805145)
chr8 (168-372)||(5320565-5320769)
chr8 (168-372)||(7811996-7812200)
chr8 (169-371)||(28639280-28639484)
chr8 (168-372)||(36491158-36491362)
chr8 (169-372)||(8021721-8021916)
chr8 (168-323)||(40117903-40118058)
chr8 (168-371)||(33287040-33287231)
chr8 (171-372)||(42571598-42571796)
chr8 (170-372)||(66181-66384)
chr8 (171-306)||(26783801-26783936)
chr8 (246-371)||(9807339-9807464)
chr8 (168-318)||(2322068-2322218)
chr8 (172-295)||(5005171-5005294)
chr8 (169-318)||(39220258-39220407)
chr8 (169-254)||(9806875-9806960)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (168-372)||(37698131-37698335)
chr3 (163-372)||(25999379-25999588)
chr3 (168-372)||(42307893-42308097)
chr3 (163-372)||(38856084-38856293)
chr3 (168-372)||(15520130-15520334)
chr3 (172-372)||(21581042-21581242)
chr3 (168-372)||(22174978-22175182)
chr3 (168-372)||(8042603-8042807)
chr3 (168-372)||(50528925-50529129)
chr3 (163-372)||(25494273-25494482)
chr3 (168-372)||(20842336-20842540)
chr3 (169-369)||(32244117-32244317)
chr3 (168-372)||(46452150-46452354)
chr3 (168-369)||(29445484-29445685)
chr3 (168-372)||(12117646-12117850)
chr3 (168-372)||(15520632-15520836)
chr3 (168-372)||(20699145-20699349)
chr3 (168-369)||(54870165-54870366)
chr3 (172-372)||(35226447-35226647)
chr3 (168-372)||(38933942-38934145)
chr3 (168-372)||(54534316-54534518)
chr3 (166-372)||(44609321-44609527)
chr3 (169-372)||(32359256-32359459)
chr3 (157-372)||(2895170-2895389)
chr3 (166-368)||(42104963-42105165)
chr3 (168-372)||(24835687-24835891)
chr3 (172-372)||(26122814-26123014)
chr3 (168-372)||(34700337-34700541)
chr3 (168-372)||(44688762-44688960)
chr3 (172-372)||(53028225-53028417)
chr3 (172-372)||(48924991-48925189)
chr3 (217-372)||(16354391-16354546)
chr3 (168-323)||(35643213-35643368)
chr3 (172-306)||(50529827-50529961)
chr3 (199-371)||(12915934-12916105)
chr3 (168-300)||(49128045-49128177)
chr3 (286-372)||(24366143-24366229)
chr3 (293-372)||(13696914-13696993)
chr3 (326-369)||(50528873-50528916)
chr3 (168-214)||(24366088-24366134)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (168-372)||(36704-36908)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (168-372)||(9008059-9008263)
chr5 (168-372)||(27679171-27679375)
chr5 (170-372)||(24105673-24105875)
chr5 (168-372)||(33491198-33491402)
chr5 (168-371)||(1579038-1579241)
chr5 (168-371)||(1605574-1605777)
chr5 (169-372)||(16069356-16069559)
chr5 (171-372)||(16737449-16737650)
chr5 (168-370)||(27420860-27421062)
chr5 (172-372)||(3386488-3386688)
chr5 (168-372)||(19358528-19358732)
chr5 (168-372)||(20992148-20992352)
chr5 (163-371)||(1165604-1165812)
chr5 (168-372)||(4120939-4121143)
chr5 (168-372)||(8374341-8374544)
chr5 (170-372)||(31883148-31883350)
chr5 (168-372)||(33991142-33991346)
chr5 (169-372)||(3921584-3921787)
chr5 (163-372)||(5202969-5203178)
chr5 (168-372)||(35782646-35782850)
chr5 (172-372)||(38598452-38598652)
chr5 (168-372)||(26602944-26603138)
chr5 (171-371)||(31410481-31410681)
chr5 (211-372)||(27025001-27025162)
chr5 (172-301)||(20992354-20992487)
chr5 (174-307)||(33284642-33284775)
chr5 (316-372)||(35420426-35420482)
chr5 (217-302)||(31638196-31638281)
chr5 (168-318)||(25634584-25634732)
chr5 (232-285)||(41818552-41818605)
chr5 (336-367)||(27024822-27024853)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (168-372)||(54189544-54189748)
chr4 (168-372)||(19913620-19913824)
chr4 (168-372)||(23776449-23776653)
chr4 (166-372)||(1756754-1756960)
chr4 (166-372)||(54412625-54412831)
chr4 (171-372)||(15241018-15241219)
chr4 (168-372)||(53717454-53717658)
chr4 (161-372)||(38055149-38055360)
chr4 (170-372)||(16700782-16700984)
chr4 (168-369)||(14987791-14987992)
chr4 (168-365)||(50055098-50055295)
chr4 (168-372)||(27488638-27488842)
chr4 (169-372)||(20877047-20877250)
chr4 (170-371)||(43289951-43290152)
chr4 (168-372)||(2481398-2481602)
chr4 (168-372)||(6611350-6611554)
chr4 (172-372)||(28032702-28032902)
chr4 (168-372)||(40428710-40428914)
chr4 (168-372)||(44784907-44785111)
chr4 (168-372)||(50353800-50354004)
chr4 (169-372)||(31969681-31969884)
chr4 (169-371)||(52139203-52139405)
chr4 (168-369)||(45424527-45424728)
chr4 (168-372)||(8932168-8932372)
chr4 (168-372)||(11639568-11639772)
chr4 (172-372)||(48909849-48910049)
chr4 (169-372)||(1617084-1617287)
chr4 (169-372)||(8591082-8591285)
chr4 (169-372)||(35490763-35490966)
chr4 (169-371)||(30423556-30423757)
chr4 (168-372)||(6688617-6688815)
chr4 (168-372)||(37464720-37464924)
chr4 (168-372)||(37968747-37968951)
chr4 (170-372)||(53875658-53875860)
chr4 (168-372)||(47632033-47632238)
chr4 (170-364)||(19164971-19165164)
chr4 (172-371)||(23704200-23704399)
chr4 (168-372)||(15669182-15669386)
chr4 (168-372)||(27536094-27536294)
chr4 (178-372)||(33703850-33704044)
chr4 (168-372)||(53353054-53353266)
chr4 (173-372)||(27583622-27583821)
chr4 (172-372)||(44379177-44379377)
chr4 (170-372)||(30171581-30171783)
chr4 (167-365)||(44375843-44376041)
chr4 (173-372)||(40680028-40680227)
chr4 (168-372)||(55344815-55345019)
chr4 (172-340)||(28360433-28360602)
chr4 (178-358)||(38071327-38071504)
chr4 (168-318)||(50053442-50053592)
chr4 (191-371)||(16703843-16704023)
chr4 (246-372)||(23269036-23269162)
chr4 (169-254)||(23265865-23265950)
chr4 (287-372)||(53408137-53408223)
chr4 (168-318)||(44548185-44548336)
chr4 (235-317)||(51780763-51780845)
chr4 (311-372)||(23261876-23261937)
chr4 (206-318)||(17493370-17493482)
chr4 (271-372)||(9595892-9595982)
chr4 (325-372)||(50055301-50055348)
chr4 (308-372)||(48748197-48748261)
chr4 (256-313)||(55344724-55344781)
chr4 (340-372)||(55344683-55344715)
chr4 (168-214)||(9595983-9596028)
chr4 (169-213)||(34615828-34615872)
chr4 (313-372)||(34615904-34615961)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (168-372)||(25897373-25897577)
chr1 (172-372)||(29078519-29078719)
chr1 (168-372)||(39260348-39260552)
chr1 (168-372)||(20089470-20089674)
chr1 (168-372)||(52753149-52753353)
chr1 (166-372)||(26663255-26663461)
chr1 (168-372)||(26580272-26580476)
chr1 (168-372)||(29288148-29288350)
chr1 (168-372)||(1168502-1168706)
chr1 (168-372)||(16052095-16052299)
chr1 (168-372)||(33510483-33510687)
chr1 (172-372)||(38829072-38829272)
chr1 (168-372)||(41928497-41928701)
chr1 (168-372)||(970526-970732)
chr1 (169-372)||(8079711-8079914)
chr1 (169-372)||(19715163-19715366)
chr1 (170-372)||(43905655-43905857)
chr1 (168-372)||(1940749-1940953)
chr1 (168-372)||(42370797-42371001)
chr1 (168-372)||(52696790-52696994)
chr1 (168-371)||(1170447-1170650)
chr1 (168-372)||(32671578-32671782)
chr1 (166-372)||(5215382-5215588)
chr1 (172-372)||(12682823-12683023)
chr1 (169-372)||(46760966-46761169)
chr1 (170-372)||(8120870-8121072)
chr1 (168-372)||(2347655-2347860)
chr1 (168-372)||(17591690-17591891)
chr1 (168-372)||(51359219-51359422)
chr1 (163-372)||(15203106-15203315)
chr1 (170-372)||(46409436-46409640)
chr1 (172-372)||(13996725-13996925)
chr1 (185-369)||(17587510-17587694)
chr1 (172-372)||(40092494-40092694)
chr1 (169-371)||(2473722-2473924)
chr1 (169-372)||(7145207-7145410)
chr1 (166-369)||(6765456-6765659)
chr1 (170-372)||(49146173-49146375)
chr1 (163-372)||(23498454-23498663)
chr1 (171-371)||(15717787-15717986)
chr1 (168-372)||(15554154-15554350)
chr1 (203-372)||(40149497-40149666)
chr1 (172-335)||(29695678-29695842)
chr1 (170-372)||(38171833-38172022)
chr1 (172-298)||(52086270-52086396)
chr1 (182-317)||(23322897-23323032)
chr1 (171-318)||(5217840-5217986)
chr1 (168-240)||(5675104-5675176)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (163-372)||(33359082-33359291)
chr7 (168-372)||(12101170-12101374)
chr7 (168-372)||(24792324-24792528)
chr7 (168-372)||(30181016-30181220)
chr7 (168-372)||(20346488-20346692)
chr7 (168-372)||(42964988-42965192)
chr7 (168-372)||(43067965-43068169)
chr7 (169-372)||(3511324-3511527)
chr7 (166-369)||(7164182-7164385)
chr7 (163-372)||(22649686-22649895)
chr7 (168-372)||(42204154-42204359)
chr7 (169-372)||(5280861-5281064)
chr7 (170-372)||(4477313-4477515)
chr7 (171-372)||(1803029-1803230)
chr7 (168-372)||(15655912-15656116)
chr7 (168-372)||(33846521-33846720)
chr7 (172-372)||(933289-933489)
chr7 (168-372)||(6394751-6394955)
chr7 (168-372)||(25748487-25748691)
chr7 (173-372)||(43156718-43156917)
chr7 (168-372)||(12097582-12097786)
chr7 (168-372)||(36890822-36891025)
chr7 (170-372)||(42673467-42673665)
chr7 (168-372)||(4347273-4347476)
chr7 (168-372)||(32041542-32041746)
chr7 (169-372)||(9452591-9452794)
chr7 (162-372)||(17753594-17753804)
chr7 (168-372)||(8630666-8630870)
chr7 (171-372)||(38866547-38866748)
chr7 (163-372)||(46891331-46891541)
chr7 (167-372)||(46134296-46134501)
chr7 (203-373)||(48865665-48865838)
chr7 (168-369)||(16894502-16894693)
chr7 (168-372)||(43021572-43021772)
chr7 (168-313)||(19828270-19828415)
chr7 (170-318)||(37005857-37006005)
chr7 (168-370)||(43405020-43405223)
chr7 (168-263)||(37704980-37705075)
chr7 (171-318)||(15655458-15655605)
chr7 (163-318)||(30075277-30075429)
chr7 (168-311)||(36849590-36849733)
chr7 (173-257)||(27691433-27691517)
chr7 (173-302)||(20163824-20163953)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (161-372)||(31517217-31517428)
chr2 (161-372)||(3873246-3873457)
chr2 (168-372)||(18806886-18807090)
chr2 (172-372)||(33906049-33906249)
chr2 (168-372)||(26323188-26323392)
chr2 (168-372)||(39635451-39635655)
chr2 (169-372)||(4016039-4016242)
chr2 (169-369)||(28329844-28330042)
chr2 (170-372)||(42937720-42937923)
chr2 (168-372)||(2178771-2178975)
chr2 (168-372)||(4232144-4232348)
chr2 (168-372)||(5733398-5733602)
chr2 (168-372)||(6174830-6175034)
chr2 (168-354)||(1108279-1108464)
chr2 (170-372)||(1482905-1483106)
chr2 (169-372)||(850997-851200)
chr2 (168-372)||(30420181-30420373)
chr2 (173-366)||(16066302-16066495)
chr2 (168-369)||(19901143-19901343)
chr2 (183-371)||(19383938-19384126)
chr2 (168-372)||(30270681-30270885)
chr2 (170-372)||(16588778-16588980)
chr2 (170-370)||(429817-430017)
chr2 (168-372)||(44947551-44947748)
chr2 (168-318)||(42446625-42446775)
chr2 (217-311)||(22101210-22101304)
chr2 (170-318)||(3585291-3585439)
chr2 (172-302)||(12517256-12517385)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (168-369)||(22956-23157)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (168-372)||(8-212)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (168-372)||(3709-3913)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (169-372)||(145247-145450)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (168-372)||(10237-10441)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (166-372)||(297-503)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (169-372)||(8-212)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26704545 - 26704341
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704545 ccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 26704446  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704445 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 26704346  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  26704345 ctctc 26704341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 2837546 - 2837750
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837546 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 2837645  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837646 gtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 2837745  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  2837746 ctctc 2837750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6086805 - 6086601
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086805 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 6086706  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086705 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 6086606  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  6086605 ctctc 6086601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Original strand, 30691855 - 30692056
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691855 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30691954  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691955 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 30692054  T
Q  371 tc 372  Q
    ||    
T  30692055 tc 30692056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26947082 - 26946878
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26947082 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 26946983  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946982 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 26946883  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  26946882 ctctc 26946878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3347729 - 3347525
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3347729 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcata 3347630  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347629 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 3347530  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  3347529 ctctc 3347525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 163 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3955977 - 3955782
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955977 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 3955878  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955877 tcatagtttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 3955782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17261278 - 17261075
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17261278 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatat 17261179  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17261178 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattc 17261079  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  17261078 tctc 17261075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 9459564 - 9459768
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459564 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 9459663  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9459664 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcgatt 9459763  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  9459764 ctctc 9459768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 21893456 - 21893660
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21893456 ccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcata 21893555  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893556 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 21893655  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  21893656 ctctc 21893660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 18613539 - 18613743
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18613539 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 18613638  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613639 gttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 18613738  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  18613739 ctctc 18613743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 20726787 - 20726992
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  20726787 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataactta 20726882  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726883 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 20726982  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  20726983 cgattctctc 20726992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887294
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattct 34887297  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  34887296 ctc 34887294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 11167241 - 11167445
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167241 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 11167340  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167341 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 11167440  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  11167441 ctctc 11167445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16307214 - 16307015
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16307214 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcata 16307115  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16307114 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28199714 - 28199510
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatc---tactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199714 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 28199616  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199615 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 28199517  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  28199516 ttctctc 28199510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 372
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153798
Alignment:
Q  177 gattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 276  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  277 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1153703 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttcgtttctctc 1153798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 35198285 - 35198488
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198285 ccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 35198383  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  35198384 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcattcgatt 35198483  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  35198484 ctctc 35198488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 171 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698934
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 168 - 330
Target Start/End: Original strand, 52837 - 52999
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52837 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 52936  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52937 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 372
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464534
Alignment:
Q  237 ttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaagg 336  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  337 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 33464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 260 - 372
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53113
Alignment:
Q  260 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  360 cttcgattctctc 372  Q
    |||||||||||||    
T  53101 cttcgattctctc 53113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Original strand, 33463703 - 33463779
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463703 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 18594538 - 18594742
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594538 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 18594637  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594638 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 18594737  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  18594738 ctctc 18594742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 39206587 - 39206791
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206587 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 39206686  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206687 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 39206786  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  39206787 ctctc 39206791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 14422699 - 14422908
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422699 tatggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 14422798  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422799 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 14422898  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  14422899 cgattctctc 14422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 29938062 - 29938266
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29938062 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 29938161  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938162 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 29938261  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  29938262 ctctc 29938266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110609
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattc 13110605  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  13110606 tctc 13110609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042526
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 2042528  T
Q  371 tc 372  Q
    ||    
T  2042527 tc 2042526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 144390 - 144599
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  144390 tatgactccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagttta 144489  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144490 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 144589  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  144590 cgattctctc 144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22260836 - 22260632
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22260836 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatccta 22260737  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260736 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 22260637  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  22260636 ctctc 22260632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24113372 - 24113168
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24113372 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcata 24113273  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113272 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 24113173  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  24113172 ctctc 24113168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35118237 - 35118033
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118237 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 35118138  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35118137 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 35118038  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  35118037 ctctc 35118033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10836958 - 10836757
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10836958 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 10836859  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10836858 tcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattatc 10836759  T
Q  371 tc 372  Q
    ||    
T  10836758 tc 10836757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6144479 - 6144275
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144479 ccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 6144380  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144379 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 6144280  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  6144279 ctctc 6144275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34842571 - 34842367
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34842571 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 34842472  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34842471 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcgatt 34842372  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  34842371 ctctc 34842367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 39218778 - 39218982
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39218778 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcata 39218877  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39218878 gcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctccttcgatt 39218977  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  39218978 ctctc 39218982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34999101 - 34998898
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34999101 cccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttag 34999002  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34999001 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctccttcgattc 34998902  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  34998901 tctc 34998898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 172 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679462
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 34679462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 4035848 - 4036052
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4035848 ccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcata 4035947  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035948 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 4036047  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  4036048 ctctc 4036052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 33278401 - 33278605
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33278401 ccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 33278500  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278501 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 33278600  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  33278601 ctctc 33278605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Original strand, 7791410 - 7791616
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7791410 gaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 7791509  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791510 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 7791609  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  7791610 ttctctc 7791616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575718
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41575616 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 41575715  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  41575716 ctc 41575718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Original strand, 7774768 - 7774969
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7774768 cgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 7774867  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774868 tcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 7774967  T
Q  371 tc 372  Q
    ||    
T  7774968 tc 7774969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38167366 - 38167159
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38167366 tatggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagttta 38167267  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38167266 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcctt 38167167  T
Q  363 cgattctc 370  Q
    ||||||||    
T  38167166 cgattctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 173 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44804946
Alignment:
Q  173 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  273 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 44804946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 5320565 - 5320769
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5320565 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcata 5320664  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5320665 gtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 5320764  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  5320765 ctctc 5320769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 7811996 - 7812200
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7811996 ccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 7812095  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7812096 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 7812195  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  7812196 ctctc 7812200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 169 - 371
Target Start/End: Original strand, 28639280 - 28639484
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctata----agcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 264  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28639280 cccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatc 28639379  T
Q  265 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28639380 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctccttcg 28639477  T
Q  365 attctct 371  Q
    |||||||    
T  28639478 attctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 36491158 - 36491362
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36491158 ccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 36491257  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36491258 gtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 36491357  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  36491358 ctctc 36491362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021916
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  8021821 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgattc 8021912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 168 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40118058 - 40117903
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118058 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 40117959  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40117958 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 168 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33287231 - 33287040
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33287231 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 33287132  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287131 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctct------------agcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 33287044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571796
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattctc 42571794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66181
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagt 66285  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctct-ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  66284 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattc 66185  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  66184 tctc 66181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26783936 - 26783801
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26783936 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 26783837  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26783836 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 246 - 371
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807464
Alignment:
Q  246 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  346 atttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctct 9807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2322218 - 2322068
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  |||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  2322218 ccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcaca 2322119  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
     |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2322118 atttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005294
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || | |    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactct 5005270  T
Q  272 cataagctgcttatgccatatttt 295  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  5005271 cataaactgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 318
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220407
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  ||  |||||||||  | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   |     
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  39220358 tttcataagctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 254
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37698335 - 37698131
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698335 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 37698236  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698235 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 37698136  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  37698135 ctctc 37698131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 25999379 - 25999588
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999379 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 25999478  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25999479 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 25999578  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  25999579 cgattctctc 25999588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42308097 - 42307893
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308097 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 42307998  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42307997 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 42307898  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  42307897 ctctc 42307893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 38856084 - 38856293
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856084 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 38856183  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38856184 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttt 38856283  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||| ||||    
T  38856284 cgattatctc 38856293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15520334 - 15520130
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15520334 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatc 15520235  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15520234 gtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 15520135  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  15520134 ctctc 15520130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581242
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctct 21581241  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  21581242 c 21581242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22175182 - 22174978
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22175182 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 22175083  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175082 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 22174983  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  22174982 ctctc 22174978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 8042603 - 8042807
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8042603 ccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcata 8042702  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042703 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 8042802  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  8042803 ctctc 8042807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 50528925 - 50529129
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50528925 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 50529024  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529025 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgatt 50529124  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  50529125 ctctc 50529129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25494482 - 25494273
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494482 tatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 25494383  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25494382 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 25494283  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  25494282 cgattctctc 25494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20842540 - 20842336
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20842540 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcata 20842441  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842440 gtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 20842341  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  20842340 ctctc 20842336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 169 - 369
Target Start/End: Original strand, 32244117 - 32244317
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32244117 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 32244216  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244217 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 32244316  T
Q  369 t 369  Q
    |    
T  32244317 t 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 46452354 - 46452150
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46452354 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 46452255  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452254 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 46452155  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  46452154 ctctc 46452150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Original strand, 29445484 - 29445685
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445484 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 29445583  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29445584 gtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttccatt 29445683  T
Q  368 ct 369  Q
    ||    
T  29445684 ct 29445685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12117850 - 12117646
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12117850 ccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 12117751  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12117750 gtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 12117651  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  12117650 ctctc 12117646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 15520632 - 15520836
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15520632 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 15520731  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15520732 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctccttcgatt 15520831  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  15520832 ctctc 15520836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 20699145 - 20699349
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20699145 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 20699244  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20699245 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcgatt 20699344  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  20699345 ctctc 20699349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 54870366 - 54870165
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54870366 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatc 54870267  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870266 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 54870167  T
Q  368 ct 369  Q
    ||    
T  54870166 ct 54870165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 35226447 - 35226647
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35226447 gtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagttt 35226546  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226547 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 35226646  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  35226647 c 35226647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 38933942 - 38934145
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38933942 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 38934040  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934041 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 38934140  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  38934141 ctctc 38934145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54534518 - 54534316
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54534518 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatg 54534419  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54534418 gttt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 54534321  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  54534320 ctctc 54534316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44609527 - 44609321
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44609527 gaccctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 44609428  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44609427 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctttcga 44609328  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  44609327 ttctctc 44609321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 32359256 - 32359459
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32359256 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatag 32359355  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359356 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 32359455  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  32359456 tctc 32359459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 157 - 372
Target Start/End: Original strand, 2895170 - 2895389
Alignment:
Q  157 tcaaaatatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 256  Q
    |||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2895170 tcaaaatagggccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaa 2895269  T
Q  257 agcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagct----tatgaatttatg 352  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||     
T  2895270 aaattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttata 2895369  T
Q  353 taacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2895370 taacctccttcgattctctc 2895389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 166 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42105165 - 42104963
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  42105165 gaccccattaggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatca 42105066  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105065 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 42104966  T
Q  366 ttc 368  Q
    |||    
T  42104965 ttc 42104963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24835891 - 24835687
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24835891 ccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattata 24835792  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24835791 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactccttcgatt 24835692  T
Q  368 ctctc 372  Q
     ||||    
T  24835691 atctc 24835687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 26122814 - 26123014
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122814 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 26122913  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26122914 cataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcgattctct 26123013  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  26123014 c 26123014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 34700337 - 34700541
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34700337 ccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcata 34700436  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34700437 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttgatt 34700536  T
Q  368 ctctc 372  Q
     ||||    
T  34700537 atctc 34700541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 44688762 - 44688960
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| ||||||||||     ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44688762 ccccgtttgaattggcttat-----gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 44688856  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44688857 gtttcataagctgcttatg-catattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcgatt 44688955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 53028225 - 53028417
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53028225 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatcatatttt 53028316  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028317 cataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 53028416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48924991
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 48924992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 217 - 372
Target Start/End: Original strand, 16354391 - 16354546
Alignment:
Q  217 ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16354391 ataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcctaaattttcagct 16354490  T
Q  317 taccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16354491 tatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgattatctc 16354546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 323
Target Start/End: Original strand, 35643213 - 35643368
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643213 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 35643312  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643313 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccctc 35643368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 172 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 371
Target Start/End: Original strand, 12915934 - 12916105
Alignment:
Q  199 gtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 298  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  12915934 gtgggcttatttactcc-ataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatatttaaat 12916032  T
Q  299 aagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12916033 aagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 168 - 300
Target Start/End: Original strand, 49128045 - 49128177
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  49128045 ccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgta 49128144  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataa 300  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49128145 atttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 286 - 372
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366229
Alignment:
Q  286 gccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctctc 24366229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 293 - 372
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696993
Alignment:
Q  293 tttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctctc 13696993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528873
Alignment:
Q  326 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 50528873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Original strand, 24366088 - 24366134
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactc 214  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24366088 ccccttttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactc 24366134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 36704 - 36908
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36704 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 36803  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36804 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 36903  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  36904 ctctc 36908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9008263 - 9008059
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008263 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 9008164  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9008163 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgatt 9008064  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  9008063 ctctc 9008059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27679375 - 27679171
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679375 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 27679276  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27679275 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgatt 27679176  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  27679175 ctctc 27679171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24105875 - 24105673
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105875 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 24105776  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105775 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 24105676  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  24105675 ctc 24105673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33491402 - 33491198
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491402 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 33491303  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491302 gtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 33491203  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  33491202 ctctc 33491198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 168 - 371
Target Start/End: Original strand, 1579038 - 1579241
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1579038 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 1579137  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579138 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 1579237  T
Q  368 ctct 371  Q
    ||||    
T  1579238 ctct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 168 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1605777 - 1605574
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1605777 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 1605678  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605677 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 1605578  T
Q  368 ctct 371  Q
    ||||    
T  1605577 ctct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069559
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 16069455  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069456 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 16069555  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  16069556 tctc 16069559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737449
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 16737451  T
Q  371 tc 372  Q
    ||    
T  16737450 tc 16737449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 168 - 370
Target Start/End: Original strand, 27420860 - 27421062
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27420860 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcata 27420959  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27420960 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 27421059  T
Q  368 ctc 370  Q
    |||    
T  27421060 ctc 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386488
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3386588 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttcgattatct 3386489  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  3386488 c 3386488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 19358528 - 19358732
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358528 ccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 19358627  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19358628 gtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgatt 19358727  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  19358728 ctctc 19358732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20992352 - 20992148
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20992352 ccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcata 20992253  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20992252 gtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgatt 20992153  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  20992152 ctctc 20992148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1165812 - 1165604
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165812 tatgaccctctttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 1165713  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165712 tcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1165613  T
Q  363 cgattctct 371  Q
    |||||||||    
T  1165612 cgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 4120939 - 4121143
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4120939 ccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcata 4121038  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4121039 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgatt 4121138  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  4121139 ctctc 4121143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8374544 - 8374341
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8374544 ccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 8374445  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8374444 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttcgatt 8374346  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  8374345 ctctc 8374341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 31883148 - 31883350
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31883148 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31883247  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883248 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 31883347  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  31883348 ctc 31883350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 33991142 - 33991346
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991142 ccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 33991241  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33991242 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 33991341  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  33991342 ctctc 33991346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 3921584 - 3921787
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3921584 cccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 3921683  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921684 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 3921783  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  3921784 tctc 3921787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 5202969 - 5203178
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5202969 tatggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 5203068  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5203069 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttctt 5203168  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  5203169 cgattctctc 5203178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35782850 - 35782646
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782850 ccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 35782751  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35782750 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctt-acaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgat 35782652  T
Q  367 tctctc 372  Q
    ||||||    
T  35782651 tctctc 35782646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38598652 - 38598452
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38598652 gtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagttt 38598553  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38598552 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 38598453  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  38598452 c 38598452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26603138 - 26602944
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603138 ccccgtttggattggcttattttgag----------cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 26603049  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26603048 gtttcataaactgcttatgccatattttaataagcataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 26602949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 371
Target Start/End: Original strand, 31410481 - 31410681
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31410481 cgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagtt 31410580  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31410581 ttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 31410680  T
Q  371 t 371  Q
    |    
T  31410681 t 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 211 - 372
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025162
Alignment:
Q  211 actcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattt 310  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattt 27025100  T
Q  311 tcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025101 tcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctccttcgattctctc 27025162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 172 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20992487 - 20992354
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgt----gggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20992487 gtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcata 20992388  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992387 gtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  174 ttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 273  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  274 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaa 307  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284675 taaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420426
Alignment:
Q  316 ttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 35420426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 302
Target Start/End: Original strand, 31638196 - 31638281
Alignment:
Q  217 ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 302  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31638196 ataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataagcttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Original strand, 25634584 - 25634732
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| | | | |||||||||   ||||||  ||| |||   ||||||||||||||   |||||||||||| | |    
T  25634584 ccccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataat--aaaatagcttataaca 25634681  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  25634682 atttcataagccgcttataccatattttaataaaccataattttgagctta 25634732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  232 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 285  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 367
Target Start/End: Original strand, 27024822 - 27024853
Alignment:
Q  336 gagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024822 gagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 27024853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 54189544 - 54189748
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189544 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 54189643  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189644 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 54189743  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  54189744 ctctc 54189748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19913824 - 19913620
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19913824 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcata 19913725  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913724 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 19913625  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  19913624 ctctc 19913620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23776653 - 23776449
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776653 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 23776554  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23776553 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcgatt 23776454  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  23776453 ctctc 23776449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1756960 - 1756754
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1756960 gaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 1756861  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1756860 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 1756761  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  1756760 ttctctc 1756754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Original strand, 54412625 - 54412831
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54412625 gaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 54412724  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54412725 tagtttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcga 54412824  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  54412825 ttctctc 54412831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15241219 - 15241018
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15241219 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtt 15241120  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241119 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 15241020  T
Q  371 tc 372  Q
    ||    
T  15241019 tc 15241018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 53717658 - 53717454
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717658 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 53717559  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717558 gtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 53717459  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  53717458 ctctc 53717454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 161 - 372
Target Start/End: Original strand, 38055149 - 38055360
Alignment:
Q  161 aatatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38055149 aatatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattt 38055248  T
Q  261 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055249 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 38055348  T
Q  361 ttcgattctctc 372  Q
     |||||||||||    
T  38055349 atcgattctctc 38055360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700984
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattct 16700981  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  16700982 ctc 16700984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Original strand, 14987791 - 14987992
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987791 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 14987890  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987891 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 14987990  T
Q  368 ct 369  Q
    ||    
T  14987991 ct 14987992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50055295 - 50055098
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  50055295 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatg 50055196  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055195 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27488842 - 27488638
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488842 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 27488743  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488742 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 27488643  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  27488642 ctctc 27488638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 20877047 - 20877250
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20877047 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 20877146  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20877147 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctccttagattc 20877246  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  20877247 tctc 20877250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 170 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 43290152 - 43289951
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290152 ccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43290053  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290052 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 43289953  T
Q  370 ct 371  Q
    ||    
T  43289952 ct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2481602 - 2481398
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2481602 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 2481503  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481502 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 2481403  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  2481402 ctctc 2481398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6611554 - 6611350
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611554 ccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 6611455  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611454 gtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 6611355  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  6611354 ctctc 6611350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28032902 - 28032702
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032902 gtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtat 28032803  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28032802 cataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatct 28032703  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  28032702 c 28032702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40428914 - 40428710
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428914 ccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 40428815  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428814 gtttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 40428715  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  40428714 ctctc 40428710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44785111 - 44784907
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44785111 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcata 44785012  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44785011 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 44784912  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  44784911 ctctc 44784907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 50353800 - 50354004
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50353800 ccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgata 50353899  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353900 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 50353999  T
Q  368 ctctc 372  Q
     ||||    
T  50354000 atctc 50354004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969884
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31969780  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969781 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 31969880  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  31969881 tctc 31969884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 169 - 371
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139405
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 52139402  T
Q  369 tct 371  Q
    |||    
T  52139403 tct 52139405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45424728 - 45424527
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45424728 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 45424629  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424628 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 45424529  T
Q  368 ct 369  Q
    ||    
T  45424528 ct 45424527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8932372 - 8932168
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  8932372 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgta 8932273  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932272 gtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgatt 8932173  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  8932172 ctctc 8932168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11639772 - 11639568
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639772 ccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 11639673  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11639672 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgatt 11639573  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  11639572 ctctc 11639568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 48909849 - 48910049
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48909849 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 48909948  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48909949 cataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctct 48910048  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  48910049 c 48910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617287
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 1617283  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  1617284 tctc 1617287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591082
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8591186  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8591185 tttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggttc 8591086  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  8591085 tctc 8591082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490763
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 35490867  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35490866 tttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccaccttcgattc 35490767  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  35490766 tctc 35490763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 169 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30423757 - 30423556
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423757 cccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 30423658  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30423657 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttcgattc 30423559  T
Q  369 tct 371  Q
    |||    
T  30423558 tct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6688815 - 6688617
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688815 ccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 6688716  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688715 gtttc------tgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 6688622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 37464720 - 37464924
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37464720 ccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcata 37464819  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464820 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 37464919  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  37464920 ctctc 37464924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37968951 - 37968747
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968951 ccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 37968852  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37968851 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 37968752  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  37968751 ctctc 37968747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875860
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53875758 tttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattct 53875857  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  53875858 ctc 53875860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 47632033 - 47632238
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47632033 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctcat 47632132  T
Q  267 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47632133 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaat 47632232  T
Q  367 tctctc 372  Q
    ||||||    
T  47632233 tctctc 47632238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 170 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19164971
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165064 tttcataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttaccctc-ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 19164971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 172 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23704399 - 23704200
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23704399 gtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 23704300  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23704299 cataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttgattctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 15669182 - 15669386
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15669182 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 15669281  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15669282 gtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttccatt 15669381  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  15669382 ctctc 15669386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27536294 - 27536094
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27536294 ccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggct----tactcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 27536199  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536198 gtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 27536099  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  27536098 ctctc 27536094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 178 - 372
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33704044
Alignment:
Q  178 attggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 277  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  278 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703950 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 33704044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 53353054 - 53353266
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgt----gggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353054 ccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 53353153  T
Q  264 catagtttcataagctgcttatgccatatttta----ataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53353154 catagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacctc 53353253  T
Q  360 cttcgattctctc 372  Q
    |||||||||||||    
T  53353254 cttcgattctctc 53353266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 173 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583622
Alignment:
Q  173 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  273 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctc 27583622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44379377 - 44379177
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44379377 gtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 44379278  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44379277 cataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctct 44379178  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  44379177 c 44379177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171783
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattct 30171780  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  30171781 ctc 30171783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 365
Target Start/End: Original strand, 44375843 - 44376041
Alignment:
Q  167 accccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44375843 accccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 44375942  T
Q  267 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375943 agtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 173 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680028
Alignment:
Q  173 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 272  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  273 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctc 40680028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 55345019 - 55344815
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55345019 ccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 55344920  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
     || ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55344919 tttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgatt 55344820  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  55344819 ctctc 55344815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 172 - 340
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  272 cataagctgcttatgcca-tattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagct 340  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 178 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071327
Alignment:
Q  178 attggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 277  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  278 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 38071327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Original strand, 50053442 - 50053592
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50053442 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatcata 50053541  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50053542 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 16703843 - 16704023
Alignment:
Q  191 gagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccat 290  Q
    ||||||| |||  |||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703843 gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccat 16703942  T
Q  291 attttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16703943 attttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacccccttcgattctct 16704023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269036
Alignment:
Q  246 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  346 atttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctctc 23269036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23265950 - 23265865
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265950 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408223
Alignment:
Q  287 ccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct-ctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 53408223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44548336 - 44548185
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggc-ttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 266  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||     
T  44548336 ccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatcac 44548237  T
Q  267 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
    | ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44548236 aattttataagttgtttatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  235 gtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 317  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261876
Alignment:
Q  311 tcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 23261876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Original strand, 17493370 - 17493482
Alignment:
Q  206 tatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccta 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  17493370 tatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttataagctgcttataccatgttttaataagctca 17493469  T
Q  306 aattttcagctta 318  Q
    |||||| ||||||    
T  17493470 aattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595892
Alignment:
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaact-----------ctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 9595894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 372
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055348
Alignment:
Q  325 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 50055348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 372
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748261
Alignment:
Q  308 ttttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctc 48748261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 55344781 - 55344724
Alignment:
Q  256 tagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 313  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344781 tagcttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 55344715 - 55344683
Alignment:
Q  340 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344715 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 55344683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9596028 - 9595983
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9596028 ccccgtttggattggctta-tttgagtttatgtgggcttatctactc 9595983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 213
Target Start/End: Original strand, 34615828 - 34615872
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctact 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  34615828 cccgtttgaattggcttattttgaacttacgtaggtttatctact 34615872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 372
Target Start/End: Original strand, 34615904 - 34615961
Alignment:
Q  313 agcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||| |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34615904 agcttatcctctgccttaataaagagctta--aatttatgtaacctccttcgattttctc 34615961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 25897373 - 25897577
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897373 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 25897472  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897473 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 25897572  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  25897573 ctctc 25897577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078719
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 29078718  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  29078719 c 29078719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39260552 - 39260348
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260552 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 39260453  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260452 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 39260353  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  39260352 ctctc 39260348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 20089470 - 20089674
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089470 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 20089569  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089570 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 20089669  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  20089670 ctctc 20089674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52753353 - 52753149
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753353 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 52753254  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753253 gtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 52753154  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  52753153 ctctc 52753149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Original strand, 26663255 - 26663461
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26663255 gaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 26663354  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663355 tagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26663454  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  26663455 ttctctc 26663461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26580476 - 26580272
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26580476 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcata 26580377  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580376 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 26580277  T
Q  368 ctctc 372  Q
     ||||    
T  26580276 atctc 26580272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 29288148 - 29288350
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29288148 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 29288247  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29288248 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctccttcgatt 29288345  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  29288346 ctctc 29288350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 1168502 - 1168706
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168502 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 1168601  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1168602 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgatt 1168701  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  1168702 ctctc 1168706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 16052095 - 16052299
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052095 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 16052194  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052195 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 16052294  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  16052295 ctctc 16052299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 33510483 - 33510687
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33510483 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 33510582  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510583 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 33510682  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  33510683 ctctc 33510687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829272
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctct 38829271  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  38829272 c 38829272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41928701 - 41928497
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41928701 ccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 41928602  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41928601 gtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgatt 41928502  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  41928501 ctctc 41928497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 970732 - 970526
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  970732 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 970633  T
Q  268 --gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  970632 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcga 970533  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  970532 ttctctc 970526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079711
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8079815  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8079814 tttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattc 8079715  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  8079714 tctc 8079711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715163
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 19715167  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  19715166 tctc 19715163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 43905655 - 43905857
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905655 ccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43905754  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43905755 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttcgattgt 43905854  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  43905855 ctc 43905857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1940953 - 1940749
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940953 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 1940854  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1940853 gtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaatt 1940754  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  1940753 ctctc 1940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42371001 - 42370797
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42371001 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcata 42370902  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370901 gtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 42370802  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  42370801 ctctc 42370797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 52696790 - 52696994
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  52696790 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 52696889  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696890 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 52696989  T
Q  368 ctctc 372  Q
     ||||    
T  52696990 atctc 52696994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1170650 - 1170447
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1170650 ccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 1170551  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170550 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgatt 1170451  T
Q  368 ctct 371  Q
    ||||    
T  1170450 ctct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 32671578 - 32671782
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671578 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 32671677  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32671678 gtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgatt 32671777  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  32671778 ctctc 32671782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Original strand, 5215382 - 5215588
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5215382 gaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 5215481  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215482 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 5215581  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    || ||||    
T  5215582 ttatctc 5215588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 12682823 - 12683023
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682823 gtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 12682922  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682923 cataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 12683022  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  12683023 c 12683023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761169
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46761066 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttccttcgattc 46761165  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  46761166 tctc 46761169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8121072
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 8121069  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  8121070 ctc 8121072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 2347655 - 2347860
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2347655 ccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 2347754  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccata-ttttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347755 gtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 2347854  T
Q  367 tctctc 372  Q
    ||||||    
T  2347855 tctctc 2347860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 17591690 - 17591891
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17591690 ccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 17591786  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591787 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 17591886  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  17591887 ctctc 17591891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 51359422 - 51359219
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51359422 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcata 51359324  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359323 gtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgatt 51359224  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  51359223 ctctc 51359219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 15203106 - 15203315
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15203106 tatggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagctta 15203205  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15203206 tcatagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 15203305  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  15203306 cgattctctc 15203315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 46409436 - 46409640
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409436 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46409535  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46409536 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 46409635  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  46409636 ctctc 46409640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13996925 - 13996725
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996925 gtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataatggttt 13996826  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13996825 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 13996726  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  13996725 c 13996725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587510
Alignment:
Q  185 tattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctta 284  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  285 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 17587510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 40092494 - 40092694
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40092494 gtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagttt 40092593  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  40092594 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcgattttct 40092693  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  40092694 c 40092694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 169 - 371
Target Start/End: Original strand, 2473722 - 2473924
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2473722 cccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 2473821  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2473822 tttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctccttcgagtc 2473921  T
Q  369 tct 371  Q
    |||    
T  2473922 tct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 7145207 - 7145410
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttatttt-gagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7145207 cccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcata 7145305  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145306 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 7145405  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  7145406 ctctc 7145410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 166 - 369
Target Start/End: Original strand, 6765456 - 6765659
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6765456 gaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 6765555  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6765556 tattttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcga 6765655  T
Q  366 ttct 369  Q
    ||||    
T  6765656 ttct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 49146173 - 49146375
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146173 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 49146272  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  49146273 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacgtcattcgattct 49146372  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  49146373 ctc 49146375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 23498454 - 23498663
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23498454 tatggccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttca 23498553  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23498554 tcatagtttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttt 23498653  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  23498654 cgattctctc 23498663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 371
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717986
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15717886 tcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattctc 15717985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15554350 - 15554154
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  15554350 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcat------ 15554257  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
      ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554256 --ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 15554159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 203 - 372
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149666
Alignment:
Q  203 gcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 302  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  303 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 40149666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 29695678 - 29695842
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataa-gcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29695678 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatcatagtt 29695777  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaag 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29695778 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 38171833 - 38172022
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  38171833 ccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagt 38171932  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38171933 ttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 38172019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Original strand, 52086270 - 52086396
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  52086270 gtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataattt 52086369  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaat 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086370 cataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322897
Alignment:
Q  182 gcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgc 281  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgc 23322933  T
Q  282 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 317  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322932 ttatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5217986 - 5217840
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||   ||||||  ||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||   | ||    
T  5217986 cgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaataa-taaaaatagcttataccaatt 5217888  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  5217887 tcataagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 240
Target Start/End: Original strand, 5675104 - 5675176
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||   |||||| |||| |||| |||||||    
T  5675104 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33359291 - 33359082
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359291 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 33359192  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359191 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33359092  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||||||||    
T  33359091 cgattctctc 33359082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12101374 - 12101170
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101374 ccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 12101275  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101274 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 12101175  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  12101174 ctctc 12101170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24792528 - 24792324
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792528 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 24792429  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792428 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 24792329  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  24792328 ctctc 24792324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30181220 - 30181016
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181220 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30181121  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30181120 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccccttcgatt 30181021  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  30181020 ctctc 30181016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 20346488 - 20346692
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20346488 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 20346587  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20346588 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgatt 20346687  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  20346688 ctctc 20346692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42965192 - 42964988
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965192 ccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 42965093  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965092 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 42964993  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  42964992 ctctc 42964988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43068169 - 43067965
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068169 ccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 43068070  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068069 gtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 43067970  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  43067969 ctctc 43067965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 3511324 - 3511527
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3511324 cccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatag 3511423  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511424 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 3511523  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  3511524 tctc 3511527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 166 - 369
Target Start/End: Original strand, 7164182 - 7164385
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164182 gaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 7164281  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7164282 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 7164381  T
Q  366 ttct 369  Q
    ||||    
T  7164382 ttct 7164385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22649895 - 22649686
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22649895 tatggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 22649796  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22649795 tcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatt 22649696  T
Q  363 cgattctctc 372  Q
    ||||| ||||    
T  22649695 cgattttctc 22649686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 42204154 - 42204359
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42204154 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcat 42204253  T
Q  267 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42204254 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgat 42204353  T
Q  367 tctctc 372  Q
    ||||||    
T  42204354 tctctc 42204359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 5280861 - 5281064
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5280861 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 5280960  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280961 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 5281060  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  5281061 tctc 5281064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477313
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 4477316  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  4477315 ctc 4477313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803230
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 1803228  T
Q  371 tc 372  Q
    ||    
T  1803229 tc 1803230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 15655912 - 15656116
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15655912 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 15656011  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656012 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 15656111  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  15656112 ctctc 15656116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33846720 - 33846521
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846720 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 33846621  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846620 gtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 33846526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 933289 - 933489
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  933289 gtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 933388  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  933389 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgaatctct 933488  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  933489 c 933489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 6394751 - 6394955
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  6394751 ccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatg 6394850  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6394851 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 6394950  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  6394951 ctctc 6394955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 25748487 - 25748691
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748487 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 25748586  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748587 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 25748686  T
Q  368 ctctc 372  Q
     ||||    
T  25748687 atctc 25748691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 173 - 372
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156917
Alignment:
Q  173 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  273 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 372  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156818 ataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 43156917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12097786 - 12097582
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12097786 ccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 12097687  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097686 gtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 12097587  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  12097586 ctctc 12097582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36891025 - 36890822
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36891025 ccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 36890927  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890926 gtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 36890827  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  36890826 ctctc 36890822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673665
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatagt 42673562  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673563 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 42673662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 4347273 - 4347476
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4347273 ccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccata 4347372  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4347373 gtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc-ccttctatt 4347471  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  4347472 ctctc 4347476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 32041542 - 32041746
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041542 ccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 32041641  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  32041642 gtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattcgatt 32041741  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  32041742 ctctc 32041746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452794
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 9452790  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  9452791 tctc 9452794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 162 - 372
Target Start/End: Original strand, 17753594 - 17753804
Alignment:
Q  162 atatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753594 atatgaccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 17753693  T
Q  262 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 361  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17753694 aacatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcct 17753793  T
Q  362 tcgattctctc 372  Q
    |||||||||||    
T  17753794 tcgattctctc 17753804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 8630666 - 8630870
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8630666 ccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 8630765  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8630766 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcgatt 8630865  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  8630866 ctctc 8630870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 171 - 372
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866748
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 370  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38866647 tcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatc 38866746  T
Q  371 tc 372  Q
    ||    
T  38866747 tc 38866748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 46891541 - 46891331
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46891541 tatgatcccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 46891442  T
Q  262 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 361  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46891441 gtcatagttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctcct 46891342  T
Q  362 tcgattctctc 372  Q
    |||||| ||||    
T  46891341 tcgattgtctc 46891331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 46134501 - 46134296
Alignment:
Q  167 accccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46134501 accccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattat 46134402  T
Q  267 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 366  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  46134401 agtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctcattcgat 46134302  T
Q  367 tctctc 372  Q
    ||||||    
T  46134301 tctctc 46134296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 203 - 373
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865838
Alignment:
Q  203 gcttatctactcctataagcctttt---taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 299  Q
    ||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 48865764  T
Q  300 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctcg 373  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865765 agcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctcg 48865838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16894693 - 16894502
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16894693 ccccgtttggattggcttattttgag----------cttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcata 16894604  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16894603 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatccttcgatt 16894504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43021772 - 43021572
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  43021772 ccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattata 43021673  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    |  | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021672 gtttcataagctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 43021577  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  43021576 ctctc 43021572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Original strand, 19828270 - 19828415
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19828270 ccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcata 19828369  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 313  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828370 gtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37006005 - 37005857
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  37006005 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaat 37005906  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  37005905 ttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 370
Target Start/End: Original strand, 43405020 - 43405223
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43405020 ccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgta 43405119  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttat-gaatttatgtaacctccttcgat 366  Q
     ||||||||| || || | | ||||||||||||||| || |||| |||||| |    |||||| || ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||    
T  43405120 atttcataagttgtttctactatattttaataagcccaattttttagcttaacacaaggcttatcacggagcttatggaattcaagggacctccttcgat 43405219  T
Q  367 tctc 370  Q
    ||||    
T  43405220 tctc 43405223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 263
Target Start/End: Original strand, 37704980 - 37705075
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 263  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704980 ccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15655605 - 15655458
Alignment:
Q  171 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 270  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||| |||| ||||||   ||||| |||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  15655605 cgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttaccacaatt 15655506  T
Q  271 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15655505 ttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30075429 - 30075277
Alignment:
Q  163 tatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 262  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||   ||||||| ||| | |   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30075429 tatggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagctta 30075331  T
Q  263 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
    | ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30075330 t-ata-tttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36849733 - 36849590
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||| ||||| || ||||||   ||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |    
T  36849733 ccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcaca 36849634  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 311  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  36849633 atttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691433
Alignment:
Q  173 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 257  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Original strand, 20163824 - 20163953
Alignment:
Q  173 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 272  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  || |||||| |||    |||| ||||| | || | |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  20163824 tttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttc 20163923  T
Q  273 ataagctgcttatgccatattttaataagc 302  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20163924 ataagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31517428 - 31517217
Alignment:
Q  161 aatatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517428 aatatggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 31517329  T
Q  261 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517328 tatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcc 31517229  T
Q  361 ttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||    
T  31517228 ttcgattctctc 31517217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 161 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3873457 - 3873246
Alignment:
Q  161 aatatgaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 260  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3873457 aatatggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagct 3873358  T
Q  261 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3873357 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctca 3873258  T
Q  361 ttcgattctctc 372  Q
    ||||||||||||    
T  3873257 ttcgattctctc 3873246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18807090 - 18806886
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807090 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 18806991  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806990 gtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 18806891  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  18806890 ctctc 18806886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33906249 - 33906049
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906249 gtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 33906150  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33906149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatct 33906050  T
Q  372 c 372  Q
    |    
T  33906049 c 33906049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26323392 - 26323188
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26323392 ccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 26323293  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26323292 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 26323193  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  26323192 ctctc 26323188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 39635451 - 39635655
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39635451 ccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcata 39635550  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39635551 gtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctccttcgatt 39635650  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  39635651 ctctc 39635655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016242
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 4016238  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  4016239 tctc 4016242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 169 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329844
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacc--ctagcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattc 28329845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Original strand, 42937720 - 42937923
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42937720 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 42937819  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaat-aagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937820 ttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 42937919  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  42937920 tctc 42937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2178975 - 2178771
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2178975 ccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 2178876  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178875 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 2178776  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  2178775 ctctc 2178771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4232348 - 4232144
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232348 ccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 4232249  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4232248 gtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 4232149  T
Q  368 ctctc 372  Q
     ||||    
T  4232148 atctc 4232144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 5733398 - 5733602
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  5733398 ccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcata 5733497  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5733498 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgatt 5733597  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  5733598 ctctc 5733602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6175034 - 6174830
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6175034 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 6174935  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6174934 gtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgatt 6174835  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  6174834 ctctc 6174830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 168 - 354
Target Start/End: Original strand, 1108279 - 1108464
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1108279 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 1108377  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108378 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482905
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgt 1483008  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1483007 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattct 1482908  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  1482907 ctc 1482905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851200
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 851196  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  851197 tctc 851200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420181
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30420274  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30420273 ggttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag------------cttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgatt 30420186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 173 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066302
Alignment:
Q  173 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  273 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19901343 - 19901143
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19901343 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagcttatcata 19901245  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19901244 gtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 19901145  T
Q  368 ct 369  Q
    ||    
T  19901144 ct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19383938
Alignment:
Q  183 cttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 282  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgtt 19384027  T
Q  283 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384026 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30270885 - 30270681
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  30270885 ccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcata 30270786  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30270785 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgatt 30270686  T
Q  368 ctctc 372  Q
     ||||    
T  30270685 atctc 30270681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16588980 - 16588778
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16588980 ccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 16588881  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  16588880 ttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctccgtcgattat 16588781  T
Q  370 ctc 372  Q
    |||    
T  16588780 ctc 16588778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 370
Target Start/End: Original strand, 429817 - 430017
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  429817 ccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataat 429916  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 369  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  429917 ttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 430016  T
Q  370 c 370  Q
    |    
T  430017 c 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44947748 - 44947551
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| | | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44947748 ccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 44947649  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947648 gtttcataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctccttcgatt 44947556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42446775 - 42446625
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| | |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |    
T  42446775 ccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcaca 42446676  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42446675 atttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22101304 - 22101210
Alignment:
Q  217 ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22101304 ataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagcccaaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Original strand, 3585291 - 3585439
Alignment:
Q  170 ccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 269  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||| ||||  ||||| |||   |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |  |||||| | |    
T  3585291 ccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaat 3585390  T
Q  270 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3585391 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517256
Alignment:
Q  172 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 271  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   |||||| ||  |||| |||||||| ||  | ||| |||| |||||||| || |||    
T  12517385 gtttggattggcttattta-agcttatgtgagcttatctactaaaataagctttcctaaaagtgtttggataccttaattaaaagagcttatcctaattt 12517287  T
Q  272 cataagctgcttatgccatattttaataagc 302  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  12517286 cataagcagcttaagcaatattttaacaagc 12517256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23157 - 22956
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23157 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 23058  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23057 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 22958  T
Q  368 ct 369  Q
    ||    
T  22957 ct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 8
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 ccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 113  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112 gtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 13  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  12 ctctc 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 3709 - 3913
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3709 ccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3808  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3809 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgatt 3908  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  3909 ctctc 3913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145247
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  269 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattc 145251  T
Q  369 tctc 372  Q
    ||||    
T  145250 tctc 145247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 168 - 372
Target Start/End: Original strand, 10237 - 10441
Alignment:
Q  168 ccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10237 ccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 10336  T
Q  268 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10337 gtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 10436  T
Q  368 ctctc 372  Q
    |||||    
T  10437 ctctc 10441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 503 - 297
Alignment:
Q  166 gaccccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  503 gaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 404  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  403 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 304  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  303 ttctctc 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 8
Alignment:
Q  169 cccgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatc---tactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 114  T
Q  266 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 15  T
Q  366 ttctctc 372  Q
    |||||||    
T  14 ttctctc 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University