View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13792_low_5 (Length: 470)

Name: NF13792_low_5
Description: NF13792
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13792_low_5
NF13792_low_5
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (98-470)||(43539739-43540132)
chr7 (98-470)||(3817323-3817708)
chr7 (98-377)||(28420971-28421245)
chr7 (98-470)||(3811181-3811566)
chr7 (99-377)||(20238824-20239097)
chr7 (98-377)||(351660-351933)
chr7 (98-377)||(339253-339518)
chr7 (98-377)||(5979186-5979460)
chr7 (98-377)||(35148016-35148295)
chr7 (98-280)||(42767307-42767489)
chr7 (98-356)||(12803893-12804147)
chr7 (98-265)||(26383606-26383773)
chr7 (111-377)||(5849403-5849659)
chr7 (109-278)||(30219269-30219438)
chr7 (17-99)||(43540172-43540254)
chr7 (285-377)||(35150735-35150827)
chr7 (208-377)||(15843820-15843984)
chr7 (208-377)||(15860929-15861093)
chr7 (152-239)||(22741991-22742076)
chr7 (394-470)||(26383431-26383508)
chr7 (394-470)||(35152849-35152926)
chr7 (393-470)||(28421278-28421356)
chr7 (386-470)||(351549-351633)
chr7 (215-369)||(7608324-7608475)
chr7 (189-265)||(26381059-26381134)
chr7 (408-470)||(22742265-22742327)
chr7 (386-470)||(339143-339226)
chr7 (310-374)||(22742148-22742212)
chr7 (311-374)||(26380960-26381023)
chr7 (393-470)||(7608189-7608267)
chr7 (147-265)||(18666557-18666673)
chr7 (393-470)||(35148328-35148406)
chr7 (396-444)||(15843734-15843783)
chr7 (396-444)||(15860843-15860892)
chr7 (393-468)||(5979494-5979571)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (98-470)||(25387516-25387902)
chr1 (98-470)||(25381547-25381933)
chr1 (98-377)||(31057918-31058191)
chr1 (98-374)||(34739862-34740133)
chr1 (127-377)||(8092887-8093132)
chr1 (127-377)||(31051418-31051662)
chr1 (98-347)||(50306093-50306336)
chr1 (98-241)||(1078228-1078371)
chr1 (118-378)||(12183616-12183877)
chr1 (98-377)||(38151987-38152250)
chr1 (98-368)||(27955042-27955307)
chr1 (98-265)||(44409992-44410157)
chr1 (101-242)||(24926769-24926912)
chr1 (98-242)||(24963714-24963860)
chr1 (393-470)||(1078006-1078084)
chr1 (393-470)||(50305959-50306037)
chr1 (286-376)||(1078119-1078207)
chr1 (310-377)||(44409874-44409941)
chr1 (393-470)||(31051306-31051384)
chr1 (393-470)||(31057806-31057884)
chr1 (386-470)||(8093159-8093243)
chr1 (386-470)||(34739748-34739832)
chr1 (310-377)||(24926980-24927047)
chr1 (423-470)||(33458259-33458306)
chr1 (397-466)||(38152287-38152356)
chr1 (321-377)||(24963939-24963995)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (98-470)||(4580333-4580719)
chr6 (98-470)||(8650815-8651201)
chr6 (98-470)||(31756227-31756616)
chr6 (98-377)||(25354085-25354358)
chr6 (98-358)||(21190878-21191133)
chr6 (127-377)||(25343498-25343742)
chr6 (98-288)||(32035298-32035488)
chr6 (98-241)||(21782765-21782908)
chr6 (98-227)||(8662793-8662922)
chr6 (101-265)||(17581615-17581770)
chr6 (98-265)||(21197033-21197198)
chr6 (108-233)||(18778595-18778720)
chr6 (127-265)||(21783350-21783486)
chr6 (127-265)||(21789573-21789709)
chr6 (131-265)||(21770603-21770735)
chr6 (310-377)||(21197249-21197316)
chr6 (120-227)||(6097999-6098103)
chr6 (310-376)||(21770786-21770852)
chr6 (393-470)||(25353973-25354051)
chr6 (99-213)||(34603344-34603457)
chr6 (99-213)||(34724621-34724734)
chr6 (165-229)||(1106229-1106294)
chr6 (420-470)||(12801887-12801937)
chr6 (393-470)||(21197360-21197438)
chr6 (408-470)||(21783662-21783723)
chr6 (408-470)||(21789885-21789946)
chr6 (393-469)||(28728047-28728123)
chr6 (408-470)||(21770901-21770962)
chr6 (430-470)||(17581398-17581438)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (98-377)||(32896886-32897160)
chr8 (98-377)||(32890762-32891036)
chr8 (98-377)||(42993016-42993289)
chr8 (109-470)||(5542183-5542558)
chr8 (98-377)||(9935152-9935426)
chr8 (98-377)||(14417814-14418085)
chr8 (109-377)||(36818845-36819107)
chr8 (159-377)||(10705711-10705923)
chr8 (147-364)||(10699916-10700127)
chr8 (98-377)||(22219728-22220013)
chr8 (98-377)||(39735564-39735834)
chr8 (98-276)||(7771202-7771379)
chr8 (99-233)||(14799429-14799562)
chr8 (98-271)||(1882764-1882940)
chr8 (98-377)||(39727332-39727594)
chr8 (99-177)||(24250171-24250249)
chr8 (310-376)||(42033675-42033741)
chr8 (393-468)||(22220047-22220123)
chr8 (393-470)||(32890650-32890728)
chr8 (393-470)||(32896774-32896852)
chr8 (393-470)||(10699791-10699869)
chr8 (310-377)||(1883038-1883105)
chr8 (393-470)||(9935045-9935121)
chr8 (386-470)||(36818734-36818818)
chr8 (393-453)||(42033580-42033641)
chr8 (386-470)||(42993314-42993397)
chr8 (422-470)||(39735889-39735936)
chr8 (99-166)||(31379435-31379502)
chr8 (430-470)||(1883200-1883240)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (98-377)||(10760662-10760936)
chr3 (109-377)||(11839748-11840011)
chr3 (98-377)||(10244346-10244620)
chr3 (98-470)||(8331549-8331934)
chr3 (100-377)||(17055807-17056079)
chr3 (98-377)||(30051114-30051388)
chr3 (98-470)||(38455562-38455948)
chr3 (98-377)||(10238224-10238498)
chr3 (98-470)||(38449075-38449461)
chr3 (98-377)||(42191232-42191506)
chr3 (98-377)||(42197174-42197448)
chr3 (98-377)||(49151485-49151759)
chr3 (98-377)||(49157552-49157826)
chr3 (109-367)||(11846086-11846340)
chr3 (98-377)||(55003424-55003695)
chr3 (98-350)||(53069066-53069318)
chr3 (99-241)||(10766884-10767026)
chr3 (98-377)||(13444931-13445198)
chr3 (99-265)||(46656664-46656830)
chr3 (127-283)||(17593323-17593479)
chr3 (98-219)||(48128059-48128180)
chr3 (133-265)||(34300477-34300609)
chr3 (147-365)||(12108729-12108945)
chr3 (124-244)||(28964869-28964989)
chr3 (251-377)||(10769134-10769255)
chr3 (311-377)||(13837547-13837613)
chr3 (313-377)||(26429639-26429703)
chr3 (393-470)||(10238532-10238610)
chr3 (393-470)||(10244654-10244732)
chr3 (393-470)||(10769289-10769367)
chr3 (393-470)||(11840045-11840123)
chr3 (393-470)||(26429737-26429815)
chr3 (393-470)||(42191540-42191618)
chr3 (393-470)||(42197482-42197560)
chr3 (393-470)||(48128359-48128437)
chr3 (108-169)||(24643574-24643635)
chr3 (386-470)||(49151374-49151458)
chr3 (386-470)||(49157441-49157525)
chr3 (393-469)||(9760481-9760557)
chr3 (393-470)||(10760970-10761048)
chr3 (393-470)||(28964642-28964720)
chr3 (397-470)||(46656442-46656516)
chr3 (393-469)||(13367157-13367233)
chr3 (310-369)||(34300371-34300430)
chr3 (386-470)||(30051415-30051498)
chr3 (430-470)||(55003759-55003799)
chr3 (388-470)||(17056108-17056189)
chr3 (311-369)||(48128260-48128318)
chr3 (408-465)||(53069386-53069443)
chr3 (438-470)||(23138782-23138814)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (98-377)||(36750288-36750562)
chr2 (98-377)||(28682957-28683231)
chr2 (98-377)||(13455973-13456247)
chr2 (98-377)||(13461914-13462188)
chr2 (98-377)||(31002250-31002524)
chr2 (98-377)||(31008228-31008502)
chr2 (98-377)||(35090661-35090938)
chr2 (98-377)||(30965201-30965475)
chr2 (98-377)||(35084688-35084965)
chr2 (122-377)||(44716840-44717091)
chr2 (98-375)||(13149698-13149968)
chr2 (98-265)||(29833191-29833355)
chr2 (99-377)||(35438722-35438991)
chr2 (99-265)||(11048566-11048732)
chr2 (98-232)||(23343574-23343708)
chr2 (393-470)||(13150009-13150087)
chr2 (393-470)||(13455861-13455939)
chr2 (393-470)||(13461802-13461880)
chr2 (393-470)||(31002138-31002216)
chr2 (393-470)||(35439690-35439768)
chr2 (386-470)||(28683258-28683342)
chr2 (394-470)||(7771508-7771583)
chr2 (313-377)||(19879472-19879536)
chr2 (310-377)||(23343427-23343494)
chr2 (396-470)||(36750176-36750251)
chr2 (393-470)||(31008116-31008194)
chr2 (215-265)||(31651612-31651662)
chr2 (393-470)||(35084999-35085077)
chr2 (393-470)||(35090972-35091050)
chr2 (316-377)||(11048776-11048837)
chr2 (393-469)||(11048874-11048951)
chr2 (393-470)||(30965089-30965167)
chr2 (393-470)||(44717125-44717203)
chr2 (394-469)||(23284708-23284784)
chr2 (409-470)||(19879356-19879416)
chr2 (393-469)||(23343318-23343394)
chr2 (438-470)||(35442198-35442230)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (98-377)||(12686191-12686465)
chr5 (98-377)||(12692293-12692567)
chr5 (99-377)||(7389561-7389833)
chr5 (98-377)||(28525398-28525672)
chr5 (98-377)||(28531494-28531768)
chr5 (98-377)||(30384390-30384672)
chr5 (99-377)||(30772155-30772430)
chr5 (98-363)||(41297170-41297424)
chr5 (98-241)||(24054338-24054482)
chr5 (127-265)||(32094201-32094338)
chr5 (98-264)||(32096973-32097138)
chr5 (98-221)||(16215186-16215309)
chr5 (98-206)||(14610188-14610296)
chr5 (99-211)||(37896311-37896423)
chr5 (148-279)||(20500104-20500235)
chr5 (121-271)||(19059799-19059951)
chr5 (99-377)||(19066120-19066398)
chr5 (98-265)||(26509832-26509994)
chr5 (286-377)||(14610042-14610131)
chr5 (146-214)||(28542269-28542337)
chr5 (393-470)||(41297041-41297119)
chr5 (259-377)||(32094394-32094507)
chr5 (259-377)||(32097195-32097308)
chr5 (397-470)||(7389871-7389945)
chr5 (393-470)||(32097342-32097420)
chr5 (99-216)||(26316805-26316922)
chr5 (386-470)||(28525699-28525783)
chr5 (396-470)||(28531804-28531879)
chr5 (393-470)||(12686498-12686576)
chr5 (393-470)||(12692600-12692678)
chr5 (164-265)||(33848964-33849066)
chr5 (310-369)||(19059990-19060049)
chr5 (214-265)||(33753381-33753432)
chr5 (393-470)||(14609932-14610009)
chr5 (214-378)||(26318381-26318547)
chr5 (394-470)||(32094542-32094619)
chr5 (200-265)||(8706536-8706601)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (98-377)||(24287860-24288134)
chr4 (99-377)||(49976460-49976733)
chr4 (98-377)||(10739351-10739625)
chr4 (98-377)||(10953120-10953394)
chr4 (127-377)||(33458308-33458553)
chr4 (123-377)||(48160833-48161081)
chr4 (123-377)||(48167052-48167300)
chr4 (98-377)||(6257217-6257491)
chr4 (98-352)||(10733258-10733507)
chr4 (98-352)||(10947027-10947276)
chr4 (152-369)||(44831678-44831897)
chr4 (127-377)||(33461434-33461678)
chr4 (154-380)||(4632252-4632482)
chr4 (98-376)||(50168469-50168740)
chr4 (99-241)||(26963354-26963494)
chr4 (102-244)||(3769569-3769710)
chr4 (99-227)||(19686341-19686469)
chr4 (310-377)||(26957022-26957089)
chr4 (98-186)||(26956841-26956929)
chr4 (393-470)||(10739658-10739734)
chr4 (393-470)||(10953427-10953503)
chr4 (108-206)||(9237402-9237500)
chr4 (408-470)||(24287749-24287811)
chr4 (251-377)||(10733517-10733638)
chr4 (393-470)||(10733671-10733747)
chr4 (251-377)||(10947286-10947407)
chr4 (393-470)||(10947440-10947516)
chr4 (159-233)||(50427380-50427462)
chr4 (156-212)||(50155990-50156046)
chr4 (393-470)||(26957123-26957201)
chr4 (143-197)||(28704559-28704613)
chr4 (98-159)||(34308083-34308144)
chr4 (386-470)||(44831928-44832012)
chr4 (127-233)||(32284666-32284770)
chr4 (386-468)||(33461705-33461787)
chr4 (127-174)||(55473183-55473230)
chr4 (393-470)||(50168357-50168435)
chr4 (98-163)||(4632869-4632934)
chr4 (180-244)||(31986745-31986808)
chr4 (311-375)||(32284555-32284619)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (98-377)||(1206-1480)
[»] scaffold0208 (4 HSPs)
scaffold0208 (122-377)||(12269-12519)
scaffold0208 (122-377)||(6396-6646)
scaffold0208 (393-470)||(6284-6362)
scaffold0208 (393-470)||(12157-12235)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (98-377)||(634-905)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (100-377)||(172904-173176)
scaffold0012 (388-470)||(173205-173287)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (98-304)||(5479-5682)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (98-264)||(38411-38575)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (108-224)||(5945-6060)
scaffold0185 (285-370)||(5825-5910)
[»] scaffold1114 (2 HSPs)
scaffold1114 (159-377)||(957-1174)
scaffold1114 (393-458)||(837-903)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (393-470)||(14035-14113)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 43540132 - 43539739
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43540132 gatttcatagaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaa 43540033  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  43540032 gaatattaaaaattagggtattatgaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctgaaa 43539933  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaaggagaa------------ 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                
T  43539932 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggagaagagagagtttgc 43539833  T
Q  386 ---------tatattgggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
             |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43539832 cgtgcacggtatatt-ggggaccataacctcttttatattgggtgaccattagggttttccgttattccgttaatgggtcatccagacatccact 43539739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 3817323 - 3817708
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817323 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 3817422  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |   |||||||| |||    
T  3817423 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaa---gatgatctgaaa 3817519  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaaggaga------------- 384  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||                 
T  3817520 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgt 3817617  T
Q  385 -----atatattgggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
          |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3817618 gtacggtatatt-ggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 3817708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 28420971 - 28421245
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28420971 gatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 28421070  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  28421071 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 28421167  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28421168 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 28421245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 3811181 - 3811566
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811181 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 3811280  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||| |   |||||||| |||    
T  3811281 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataacaaaagagagaa---gatgatctgaaa 3811377  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaaggaga------------- 384  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||                 
T  3811378 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgt 3811475  T
Q  385 -----atatattgggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
          |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3811476 gtacggtatatt-ggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 3811566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 99 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20239097 - 20238824
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20239097 atttcataaaacatgttcaacaatcatacatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 20238998  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaac 298  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||   |||||||| ||||    
T  20238997 gatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacaataaccaaagagatga---gatgatctgaaac 20238901  T
Q  299 acacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20238900 acac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 20238824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 351933 - 351660
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351933 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 351834  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||   |||||||| |||    
T  351833 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaa-agagga---gatgatctgaaa 351738  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  351737 cacac--aatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 351660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 339518 - 339253
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339518 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 339419  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctc-tcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaa 296  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |          ||| ||||||||||  |||| |||||||||||   |||||||| ||    
T  339418 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctct----------ctcatcaacaacaatgataaccaaagagagga---gatgatctgaa 339332  T
Q  297 acacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  339331 acacac--aatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 5979186 - 5979460
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  |||||||||| |||  | ||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  5979186 gatttcataatacatgttgaacaatcgtaaatcaatagcgaaagcaaacaaactattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttattaa 5979285  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||   |||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  5979286 ggatgttaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 5979382  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5979383 cacac--aatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttcagatggg 5979460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 35148016 - 35148295
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35148016 gatttcataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacacgtttgatttatcaa 35148115  T
Q  198 gaatattaaaaatta-gggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaa 296  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |  ||||  ||||||||| | |||  | |||| |    |||||||| ||    
T  35148116 ggatattaagaattaggggtattaggaatacctggataaagctttcatggtagccctcgtaacaacaacaacaaa-tatgagaaggtgggatgatctgaa 35148214  T
Q  297 acacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  35148215 acacacaaaatatggtcagcagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaaattctcttcagatggg 35148295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 42767307 - 42767489
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42767307 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttatcaa 42767406  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagag 280  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  42767407 ggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataatcaaagagag 42767489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12804147 - 12803893
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12804147 gatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaagcaaaacattgaacatgaacatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaa 12804048  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacct--ggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaa 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||    ||||||||||   | |||| | |    
T  12804047 gaatattaagaattagggtattaagaatacctggggatgaagctttggtagcagccctctcgacaacaacgat----aaagagagga---ggtgatttga 12803955  T
Q  296 aacacaca-aaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgc 356  Q
    |||| |||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12803954 aacaaacatcaacatggttagcgacgactgattaggttcttcctcaaccggtacctttatgc 12803893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26383773 - 26383606
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||||||||||| | | |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383773 gatttcataagacatgttcaacaattatgaatcaacaacagaaacaaacaaaatattgaacatgatcatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 26383674  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  26383673 gcatactaagaattagggtattaggaataccttgatgaagctttgatggcagccctctcaacaacaac 26383606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5849659 - 5849403
Alignment:
Q  111 atgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaat 210  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  5849659 atgttcaatgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaat 5849560  T
Q  211 tagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatg 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| ||  | |||           ||||||| ||| |||||| ||||     
T  5849559 taggatattaggaatacctggatgaagctttaatgacagctctctcaacaacaacgatggagaaa---------ctatgatctgaaatacacaacatat- 5849470  T
Q  311 gttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  5849469 gttagcggcgtctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttatcttcagatggg 5849403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 278
Target Start/End: Original strand, 30219269 - 30219438
Alignment:
Q  109 acatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  30219269 acatgttcaataattatgaatcattagcggaatcaaacaaaacgttgaacatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttattaaagatattaaga 30219368  T
Q  209 attagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagag 278  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| | ||||| || |||| ||||||||||||    
T  30219369 attatggtattaggaatatctggataaagctttcatgacaaccatctcagcatcaacgataaacaaagag 30219438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43540254 - 43540172
Alignment:
Q  17 aataaagccatagaggaagaacattgataatttaaaattagtcgaatacacgtgagtataaaatattaatagatgaaacatga 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43540254 aataaagccatagatgaagaacattgataatttaaaattagtcgaatacacgtgagtataaaatctcaatagatgaaacatga 43540172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 285 - 377
Target Start/End: Original strand, 35150735 - 35150827
Alignment:
Q  285 tgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35150735 tgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcggctgatttggttattcttcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 35150827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15843984 - 15843820
Alignment:
Q  208 aattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | ||||||| |||| |||||||||||   |||||||  ||||||||  |||    
T  15843984 aattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagagga---gatgatcggaaacacac--aat 15843890  T
Q  308 atggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15843889 agagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggg 15843820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15861093 - 15860929
Alignment:
Q  208 aattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | ||||||| |||| |||||||||||   |||||||  ||||||||  |||    
T  15861093 aattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagagga---gatgatcggaaacacac--aat 15860999  T
Q  308 atggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15860998 agagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggg 15860929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 239
Target Start/End: Original strand, 22741991 - 22742076
Alignment:
Q  152 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22741991 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattgaggatta-ggtattaggaatacctggatgaagct 22742076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26383508 - 26383431
Alignment:
Q  394 gggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383508 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccattaatgggtcatccggacatccact 26383431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Original strand, 35152849 - 35152926
Alignment:
Q  394 gggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35152849 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 35152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 28421278 - 28421356
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28421278 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 28421356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 351633 - 351549
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  351633 tatattgggg-accatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccagtaatgggccatccggacatccact 351549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7608475 - 7608324
Alignment:
Q  215 gtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggtta 314  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||| |||||||| |||   ||||||| ||||||||| ||   | |||    
T  7608475 gtattagaaatatctgaataaagctttgatgacagtcatctcatcaacaatgataaccaaagagatgag---atgatctgaaacacacataagcggatta 7608379  T
Q  315 gcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctt 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7608378 gcggcgactgatttggtacttcctaaatcggtacctttatgactcaagttctctt 7608324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26381134 - 26381059
Alignment:
Q  189 atttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26381134 atttatcaagcatgctaagaattagggtattaggagtac-tggatgaagctttgatgacaaccctctcaacaacaac 26381059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 408 - 470
Target Start/End: Original strand, 22742265 - 22742327
Alignment:
Q  408 tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22742265 tttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 22742327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 339226 - 339143
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  339226 tatattgggg-accatgacctcttttatattggatggccattag-gtttcccattattccagtaatgggccatccggacatccact 339143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 374
Target Start/End: Original strand, 22742148 - 22742212
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagat 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22742148 ggttagcggcggctgatttggtttttcatcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 22742212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26381023 - 26380960
Alignment:
Q  311 gttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagat 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26381023 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttcttcagat 26380960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7608267 - 7608189
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7608267 ggggaccataacatcttttatattggatggtcattagggtttttcattatttcattaatgggtcatccggacatccact 7608189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 265
Target Start/End: Original strand, 18666557 - 18666673
Alignment:
Q  147 aaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataa 246  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |  |||||||||||    |||||||| |||| |    
T  18666557 aaaacattgaacttgattatgatcagat-tacgacatgtttgatttagcaatgatattaataatta-gacattaggaatacacacatgaagctctgatga 18666654  T
Q  247 caatcctctcaacaacaac 265  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  18666655 caaccctctcaccaacaac 18666673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 35148328 - 35148406
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  35148328 ggggatcatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattctgttaatgagccatccggacatccact 35148406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15843783 - 15843734
Alignment:
Q  396 gaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattcc 444  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15843783 gaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcccattattcc 15843734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15860892 - 15860843
Alignment:
Q  396 gaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattcc 444  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15860892 gaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcccattattcc 15860843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 468
Target Start/End: Original strand, 5979494 - 5979571
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttta--tattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatcca 468  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||| || |||||| |||||||    
T  5979494 ggggaccataacctcttttattattggatgaccattagactttcccattattctgttaattggccatccgaacatcca 5979571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 25387516 - 25387902
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387516 gatttcataaaacatgttcaacaaatatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 25387615  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| |||    
T  25387616 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttaaaaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatctgaaa 25387712  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaag--gagaatatattg--- 392  Q
    ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||   |||||       
T  25387713 cacacaataga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 25387810  T
Q  393 -------------ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
                 |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25387811 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggccatccggacatccact 25387902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 25381547 - 25381933
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25381547 gatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgaaatgtttgatttaccaa 25381646  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| |||    
T  25381647 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatctgaaa 25381743  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaag--gagaatatattg--- 392  Q
    ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||   |||||       
T  25381744 cacacaataga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 25381841  T
Q  393 -------------ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
                 |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25381842 tgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggccatccggacatccact 25381933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31058191 - 31057918
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||  | ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31058191 gatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 31058092  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||  || ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  31058091 g-atattaagaattagggtattaagaatacttggataaaacttttgtagcaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctaaaa 31057996  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31057995 cacac--aatagagttagcggcgactgatttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 31057918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34740133 - 34739862
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34740133 gatttcataaaacatgttcatcaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 34740034  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |    ||||||| |||    
T  34740033 ggatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaa---aatgatctgaaa 34739937  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagat 374  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34739936 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 34739862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 377
Target Start/End: Original strand, 8092887 - 8093132
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  8092887 aatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggtatgaggaata 8092986  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgat 326  Q
    ||||||| |||||||  || || |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||   |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  8092987 cctggataaagcttttgtagcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagatga---gatgatctgaaacaaac-aacta-ggttagcggcggctgat 8093081  T
Q  327 ttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8093082 ttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 8093132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31051662 - 31051418
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31051662 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaata 31051564  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgat 326  Q
    ||||||| || ||||  || ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||    
T  31051563 cctggataaaacttttgtagcaaccctttcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcggctgat 31051469  T
Q  327 ttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31051468 ttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 31051418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 50306336 - 50306093
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50306336 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattataatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 50306237  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  50306236 g-atattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 50306141  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggta 347  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  50306140 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 50306093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1078371 - 1078228
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1078371 gatttcataatacatgttcaacaattattaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaa 1078272  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagcttt 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1078271 gaatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 1078228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 378
Target Start/End: Original strand, 12183616 - 12183877
Alignment:
Q  118 ataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggta 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  12183616 ataattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaatattgaacataattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaatttgagta 12183714  T
Q  218 ttaggaatacctggatgaagctttgataacaa--tcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttag 315  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||| |||  |  | |||||| ||||  |||||  |||||| || |||| |||| |||||||||  | | |||||     
T  12183715 ttaggaatacctgaataaagctttcatagcaaccttatttcaacatcaaccgtaaaccgagagagaaggtgataatctgaaacacacagca-agggttac 12183813  T
Q  316 cggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctc-tttagatggga 378  Q
    | ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12183814 cagcgactgatttggttatttctcaaccgctacctttatgcctcaagttctcttttagatggga 12183877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 38151987 - 38152250
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||    
T  38151987 gatttcataaaacatgttcaacaattattaatcaacagcggaagcaaacaaaatattgaacatgatca------gatctacgacatgtttgatttatcaa 38152080  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||  | |||           ||||||| |||    
T  38152081 acatattaagaattagggtattaggaatacctgaatgaaactttgatgacaatcctctcaacaacaatgatggagaaa---------ccatgatctgaaa 38152171  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
     |||||| |||  |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  38152172 tacacaacata-cgttagcggcagctaatttggttcttcttcaaccggtacctttatgcttcaagttttctttagatggg 38152250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27955307 - 27955042
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||    
T  27955307 gatttcataaaacatgtttaataatcat-aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgat-----aa 27955214  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataaca-atc-ctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaa 295  Q
    | ||| |||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||| || | |  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |    
T  27955213 ggata-taaataataaggtattaggaagacctggataaagctttcatgatagctctctctcaacaacaacgataaagaaagagaggatgtgatgatctga 27955115  T
Q  296 aacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctct 368  Q
    ||||||||| | |  |||| || |||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27955114 aacacacaacaaaatgttaacgacgactgatttagttattcctcaaccggtacctttatgtcttaagttctct 27955042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44410157 - 44409992
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44410157 gatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaa 44410058  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    | |||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||  |||||||||||||||    
T  44410057 ggatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataaagcttttatggcagccctctcaacaacaac 44409992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 242
Target Start/End: Original strand, 24926769 - 24926912
Alignment:
Q  101 ttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaa 200  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926769 ttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacattaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaagaa 24926868  T
Q  201 tattaaaaattagggtattaggaatacctg--gatgaagctttg 242  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24926869 tattaagaattaacgtattaggaatacctgaagatgaagctttg 24926912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 242
Target Start/End: Original strand, 24963714 - 24963860
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24963714 gatttcataaaacatgttcaacgaatatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatctacgccatgtttgatttatcaa 24963813  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctg--gatgaagctttg 242  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24963814 gaatagtaagaattaaagtattaggaatacctgaagatgaagctttg 24963860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1078084 - 1078006
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1078084 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 1078006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 50306037 - 50305959
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  50306037 ggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 50305959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1078207 - 1078119
Alignment:
Q  286 gatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgg 376  Q
    |||||||| |||||||||| | |  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1078207 gatgatctgaaacacacaataga--gttagcggccgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 1078119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44409941 - 44409874
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44409941 ggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 44409874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31051384 - 31051306
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31051384 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 31051306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31057884 - 31057806
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||  || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31057884 ggggatcatagcctcttttatattgtatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 31057806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Original strand, 8093159 - 8093243
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8093159 tatattgggg-accatagcctcttttatatttgatgatcgttagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 8093243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34739832 - 34739748
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34739832 tatattgggg-accacagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 34739748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 24926980 - 24927047
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  24926980 ggttagtggcagctgatttggttcttcctcaaccggtacctatatgcctcaagttctcttcagatggg 24927047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 470
Target Start/End: Original strand, 33458259 - 33458306
Alignment:
Q  423 cattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33458259 cattagggtttctcgttatttcattaatggatcatccggacatccact 33458306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 466
Target Start/End: Original strand, 38152287 - 38152356
Alignment:
Q  397 accataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatc 466  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38152287 accatagcctcttttatattggatggtcattag-gtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatc 38152356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Original strand, 24963939 - 24963995
Alignment:
Q  321 actgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  24963939 actgatttggttcttcctcaaccagtacatttatgcctcaagtcctcttcagatggg 24963995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 4580333 - 4580719
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4580333 gatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaa 4580432  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  4580433 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 4580529  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaag--gagaatatattg--- 392  Q
    ||| |  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||   |||||       
T  4580530 cacgc--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 4580627  T
Q  393 -------------ggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
                 |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580628 tgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggtcatccggacatccact 4580719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 8650815 - 8651201
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650815 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 8650914  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| |||    
T  8650915 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatctgaaa 8651011  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaag--gagaatatattg--- 392  Q
    ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||   |||||       
T  8651012 cacacaataga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 8651109  T
Q  393 -------------ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
                 |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8651110 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 8651201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 31756227 - 31756616
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31756227 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacaacggaagcaaataaaacattgaacatgattataatcggatctacgacatgtttgaattatcaa 31756326  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| || |||  |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  31756327 ggatattaagaattagggtattatgaatatctggatagagctttcatgacagccctctcaacagcaaccatacacagagagaggaggtgatgatctgaaa 31756426  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaaggaga------------- 384  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||                 
T  31756427 cacacaatatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaacaggtacctttatacctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgt 31756526  T
Q  385 -----atatattgggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
         ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31756527 gtttgatatatt-ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattcc-ttaatgggtcatccggacatccact 31756616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25354358 - 25354085
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||  | ||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354358 gatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaagcattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 25354259  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  25354258 g-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 25354163  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25354162 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 25354085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Original strand, 21190878 - 21191133
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21190878 gatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgatatatttgatttatcaa 21190977  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
      ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||| | |||    
T  21190978 agatattaagaattagggtattagaaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatatgaaa 21191074  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcct 358  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21191075 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcct 21191133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25343742 - 25343498
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    |||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25343742 aatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatttttgatttatcaag-atattaagaattagagtattaggaata 25343644  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgat 326  Q
    ||| ||| |||||||  || ||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||    
T  25343643 cctagataaagcttttgtagcagccctttcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcggctgat 25343549  T
Q  327 ttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25343548 ttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 25343498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 288
Target Start/End: Original strand, 32035298 - 32035488
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035298 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 32035397  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgat 288  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  32035398 ggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgat 32035488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 241
Target Start/End: Original strand, 21782765 - 21782908
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782765 gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 21782864  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagcttt 241  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21782865 ggatattaagaattagggtattaggaatagctggataaagcttt 21782908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 227
Target Start/End: Original strand, 8662793 - 8662922
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662793 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 8662892  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatac 227  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8662893 ggatattaagaattaggctattaggaatac 8662922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17581770 - 17581615
Alignment:
Q  101 ttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaa 200  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  17581770 ttcataaaacatgttcaactattatgaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattattataggatctacgacatgtttgatttaccaag-- 17581673  T
Q  201 tattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
           |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  17581672 -------aattagggtattaggaatacctggataaagctttcatgacagccctctcaacaacaac 17581615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 21197033 - 21197198
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21197033 gatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacaacatgtttgatttatcaa 21197132  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    | |||| || |||||  |||||| |||||||||||| || |||| ||  ||  |||||||||||||||    
T  21197133 ggatatcaagaatta--gtattatgaatacctggataaatcttttatggcagccctctcaacaacaac 21197198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18778720 - 18778595
Alignment:
Q  108 aacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||     
T  18778720 aacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacgttgaacataattatgatcggatctacgacgtatttgatttatcaa-tatattaag 18778622  T
Q  208 aatta-gggtattaggaatacctggat 233  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18778621 aattaggggttttaggaatacctggat 18778595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Original strand, 21783350 - 21783486
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||    
T  21783350 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaata 21783447  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    |||| || ||||||| ||  ||  |||||||||||||||    
T  21783448 cctgaataaagcttttatggcacccctctcaacaacaac 21783486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Original strand, 21789573 - 21789709
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||    
T  21789573 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaata 21789670  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    |||| || ||||||| ||  ||  |||||||||||||||    
T  21789671 cctgaataaagcttttatggcacccctctcaacaacaac 21789709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 265
Target Start/End: Original strand, 21770603 - 21770735
Alignment:
Q  131 aatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctg 230  Q
    ||||| |||| |||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||| |||    
T  21770603 aatagaggaagtaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatatctg 21770700  T
Q  231 gatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
     || ||||||| ||  ||  |||||||||||||||    
T  21770701 aataaagcttttatggcagccctctcaacaacaac 21770735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 21197249 - 21197316
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21197249 ggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggg 21197316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6098103 - 6097999
Alignment:
Q  120 aattatgaatcaa-tagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtat 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  6098103 aattatgaatcaaatagcggaagtagacaaaacattgaacatgaa---gaacggatctacgacgtgtttgatttatcaag-atgttaagaattagggtat 6098008  T
Q  219 taggaatac 227  Q
    |||||||||    
T  6098007 taggaatac 6097999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 376
Target Start/End: Original strand, 21770786 - 21770852
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgg 376  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21770786 ggttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 21770852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 25354051 - 25353973
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  25354051 ggggaccatagcctcttttatattagatgaccattagagtttcccattattccgttaatgggccatccggatatccact 25353973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Original strand, 34603344 - 34603457
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||| ||| |||||||  || |||||||||| ||||||| ||  ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34603344 atttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatttatcaag 34603442  T
Q  199 aatattaaaaattag 213  Q
     ||||||| ||||||    
T  34603443 gatattaacaattag 34603457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Original strand, 34724621 - 34724734
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||| ||| |||||||  || |||||||||| ||||||| ||  ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34724621 atttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatttatcaag 34724719  T
Q  199 aatattaaaaattag 213  Q
     ||||||| ||||||    
T  34724720 gatattaacaattag 34724734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1106294 - 1106229
Alignment:
Q  165 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaatt-agggtattaggaatacct 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  1106294 atgatcggatctacaacatgtttgattcatcaagaatattaataattcaaggtattaggaatacct 1106229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 470
Target Start/End: Original strand, 12801887 - 12801937
Alignment:
Q  420 gaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12801887 gaccattagggtttcccattattccattaatgggtcatccagacatccact 12801937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 21197360 - 21197438
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21197360 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggttttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 21197438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 408 - 470
Target Start/End: Original strand, 21783662 - 21783723
Alignment:
Q  408 tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21783662 tttatattggatg-ccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 21783723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 408 - 470
Target Start/End: Original strand, 21789885 - 21789946
Alignment:
Q  408 tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21789885 tttatattggatg-ccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 21789946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 28728123 - 28728047
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccac 469  Q
    |||||||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  28728123 ggggaccatagcctcattatataggatggccattagggtttcccattattccgttaatggaccatccggacatccac 28728047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 470
Target Start/End: Original strand, 21770901 - 21770962
Alignment:
Q  408 tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21770901 tttatattggttggccattagggtttcccattattccgttaatgg-tcatccggacatccact 21770962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 430 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17581438 - 17581398
Alignment:
Q  430 gtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17581438 gtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 17581398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32897160 - 32896886
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32897160 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaa 32897061  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||   |||||||| |||    
T  32897060 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatga---gatgatctgaaa 32896964  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32896963 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 32896886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32891036 - 32890762
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32891036 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaa 32890937  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||   |||||||| |||    
T  32890936 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatga---gatgatctgaaa 32890840  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32890839 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 32890762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 42993016 - 42993289
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993016 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 42993115  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || | | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  42993116 g-atattaagaattagggtattaggaataccttgataaagcttttgtagccaccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 42993211  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42993212 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 42993289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 109 - 470
Target Start/End: Original strand, 5542183 - 5542558
Alignment:
Q  109 acatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaa 208  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5542183 acatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaaga 5542282  T
Q  209 attagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaata 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||   ||||||| |||||||||| | |    
T  5542283 attagggtattaggaatacctagataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagaggggag---atgatctgaaacacacaataga 5542379  T
Q  309 tggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaag--gagaatatattg-------------- 392  Q
      |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||   |||||                  
T  5542380 --gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgta 5542477  T
Q  393 --ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
      |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5542478 ttggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 5542558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9935426 - 9935152
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9935426 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 9935327  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||  ||||| | |||||||  ||| |||||| ||||   |||||||| |||    
T  9935326 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaatctttcatagcagccctctaatcaacaacgttaaccaaagatagga---gatgatctgaaa 9935230  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9935229 cacacaatagat--ttagcggcggctgatttggttcttcctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 9935152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14418085 - 14417814
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14418085 gatttcataaaacatgtt---taactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 14417989  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | |||| || |||| ||||||||| ||   ||||||| |||    
T  14417988 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaag---atgatctgaaa 14417892  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||| |  |  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14417891 cacacaatagtt--ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggg 14417814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 109 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36819107 - 36818845
Alignment:
Q  109 acatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaa 208  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36819107 acatgttcaacaattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaaga 36819009  T
Q  209 attagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaata 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |   ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||    
T  36819008 attagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aata 36818914  T
Q  309 tggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
      |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  36818913 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcatcagatggg 36818845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 159 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10705923 - 10705711
Alignment:
Q  159 atgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||  |||||||     
T  10705923 atgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaga-tattaagaattagggtattaggattacctggataaagcttttgtagcagccctctcat 10705825  T
Q  259 caacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcct 358  Q
    ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  10705824 caacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatggct 10705730  T
Q  359 aaagttctctttagatggg 377  Q
     |||||||||| |||||||    
T  10705729 taagttctcttcagatggg 10705711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10700127 - 10699916
Alignment:
Q  147 aaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataa 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||     
T  10700127 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatatctggataaaacttttgtag 10700029  T
Q  247 caatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggt 346  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    ||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  10700028 cagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---aatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggt 10699934  T
Q  347 acctttatgcctaaagtt 364  Q
    |||||||||||| |||||    
T  10699933 acctttatgcctcaagtt 10699916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 22219728 - 22220013
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaat-aaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatca 196  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22219728 gatttcataaaacatgttcaatagttatgaatcaatagcagaagaaaaagaaaactttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatca 22219827  T
Q  197 agaatattaaaaattagggtattaggaatacctggat-gaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttga------tg 289  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||| |  ||||| || |      ||      ||    
T  22219828 aggatattaagaattagggtattaggaatacctggattgaagctttgatggcagccctctcaacaacaaccaacaacaacgataaacaaagaaaaaattg 22219927  T
Q  290 atctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||| ||||| |||| | |  ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22219928 atctgaaacaaacaataaa--gttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 22220013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 39735564 - 39735834
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39735564 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagtaaataaaatattgaacatgattatgattgtatctacgacatgtttgatttatcaa 39735663  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
      ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||  ||| |||||||||||||||  |    |||||||| |   | |||||| |||    
T  39735664 agatattaagaactagggtataaggaatacctggat-aaaatttcatggcaaccctctcaacaacaacggt----aaagagagaa---ggtgatctgaaa 39735755  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    || |||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||   ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  39735756 caaacaaca-agggttagcggcggctgatttgattcttccttaactggtacatttatgcctcaagtactcttcagatggg 39735834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7771379 - 7771202
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7771379 gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaa 7771280  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaag 276  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||| ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  7771279 ggatattaagaattagggtattaagaatacctggat-aagcttttgtagcaaccctctcatcaacaacgataaccaaag 7771202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 14799429 - 14799562
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14799429 atttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 14799528  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggat 233  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14799529 -atattaagaattagggtattaggaatacctggat 14799562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 271
Target Start/End: Original strand, 1882764 - 1882940
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatct-acgacatgtttgatttatca 196  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1882764 gatttcatagaacatgttcaacaattaagaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatctaatgacatgtttgatttatca 1882863  T
Q  197 agaatattaaaaattagggtattaggaatacctg--gatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaa 271  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| |||||    
T  1882864 aggatgttaagaattagggtattaggaatacctggagatgaagctttcatggcagccctctcaacaacaacgataaa 1882940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 39727332 - 39727594
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||    
T  39727332 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaataacggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatc---------acatgtttgatttatcaa 39727422  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||  |  ||| |||||||||||||||  |    |||||||| |   | |||||| |||    
T  39727423 ggatattaagaattagggtataagaaatacctggaaaaaactttcttggcaaccctctcaacaacaacggt----aaagagagaa---ggtgatctgaaa 39727515  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    || |||  | | ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  39727516 caaacagca-agggttagcggctgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtactcttgagatggg 39727594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24250249 - 24250171
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatcta 177  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24250249 atttcataaaacatgttgaacaaatatgaatcaatagcggaaacaaacaaaatattgaacattattatgatcggatcta 24250171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42033741 - 42033675
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgg 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42033741 ggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 42033675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 468
Target Start/End: Original strand, 22220047 - 22220123
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatcca 468  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22220047 ggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatcca 22220123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32890728 - 32890650
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32890728 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 32890650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32896852 - 32896774
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32896852 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 32896774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10699869 - 10699791
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10699869 ggggaccatagtctcttttatatttgatgaccattagggtttcccattactccgttaatgggtcatccggacatccact 10699791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 1883038 - 1883105
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1883038 ggttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctcttcagatggg 1883105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 9935121 - 9935045
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||||   |||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9935121 ggggaccatagcctcttttatttggatggccattag-gtttcccattattccgttaatgggtcatccggatatccact 9935045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36818818 - 36818734
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36818818 tatattgggg-accatagcctcttttatatttgatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 36818734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 42033641 - 42033580
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatggg 453  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  42033641 ggggaccatagcctcctttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatggg 42033580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Original strand, 42993314 - 42993397
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  42993314 tatattgggg-accataacctcttttatattggatggcgattagggtttcccattattccgttaatgggccat-cggacatccact 42993397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 470
Target Start/End: Original strand, 39735889 - 39735936
Alignment:
Q  422 ccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39735889 ccattagggtttccc-ttattccgttaatgggtcatccggacatccact 39735936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 31379435 - 31379502
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattat 166  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  31379435 atttcataacacatgtttaataattatgaatcaatgacggaggcaaataaaacattgaacatgattat 31379502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 430 - 470
Target Start/End: Original strand, 1883200 - 1883240
Alignment:
Q  430 gtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1883200 gtttcccattatttcgttaatgggtcatccggacatccact 1883240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 10760662 - 10760936
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760662 gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 10760761  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  10760762 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 10760858  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10760859 cacac--aatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 10760936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 109 - 377
Target Start/End: Original strand, 11839748 - 11840011
Alignment:
Q  109 acatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaa 208  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11839748 acatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaaga 11839847  T
Q  209 attagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaata 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||    
T  11839848 attagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aata 11839942  T
Q  309 tggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
      |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11839943 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 11840011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 10244346 - 10244620
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244346 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 10244445  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||| | |||    
T  10244446 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatatgaaa 10244542  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10244543 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggg 10244620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8331934 - 8331549
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331934 gattttataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 8331835  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  8331834 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcgtcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctaaaa 8331738  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaaggaga-atatattg---- 392  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| | |  |||        
T  8331737 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgt 8331640  T
Q  393 ------------ggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
                |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8331639 gtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 8331549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 377
Target Start/End: Original strand, 17055807 - 17056079
Alignment:
Q  100 tttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaga 199  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17055807 tttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagg 17055906  T
Q  200 atattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaaca 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | |||||||  ||| |||||| ||||   |||||||| |||||    
T  17055907 atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacggtaaccaaagatagga---gatgatctgaaaca 17056003  T
Q  300 cacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17056004 cac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 17056079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 30051114 - 30051388
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30051114 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattataatcagatctacgacatgtttgatttatcaa 30051213  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||| | | ||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  30051214 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcattacagccctctaatcgacaacaataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 30051310  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  ||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30051311 cacac--aatagagttagcgacggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 30051388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 38455562 - 38455948
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38455562 gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaa 38455661  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  38455662 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 38455758  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaag--gagaatatattg--- 392  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||   |||||       
T  38455759 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 38455856  T
Q  393 -------------ggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
                 |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38455857 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 38455948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 10238224 - 10238498
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10238224 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcagatctacgacatgtttgatttatcaa 10238323  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    ||||| | |||    
T  10238324 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---tatgatatgaaa 10238420  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10238421 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggg 10238498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 470
Target Start/End: Original strand, 38449075 - 38449461
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38449075 gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaa 38449174  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||     ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  38449175 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 38449271  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgggaag--gagaatatattg--- 392  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||   |||||       
T  38449272 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 38449369  T
Q  393 -------------ggggaccataacctc-tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
                 |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38449370 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 38449461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 42191232 - 42191506
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191232 gatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 42191331  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  42191332 gggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 42191428  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42191429 cacac--aatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 42191506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 42197174 - 42197448
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197174 gatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 42197273  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  42197274 gggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 42197370  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42197371 cacac--aatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 42197448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49151759 - 49151485
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49151759 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaa 49151660  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  49151659 ggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 49151563  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  49151562 cacac--aatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggg 49151485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49157826 - 49157552
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49157826 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaa 49157727  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  49157726 ggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 49157630  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  49157629 cacac--aatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggg 49157552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 109 - 367
Target Start/End: Original strand, 11846086 - 11846340
Alignment:
Q  109 acatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaa 208  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11846086 acatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagtatattaaga 11846185  T
Q  209 attagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaata 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |   |||||||| ||||||||  ||||    
T  11846186 attagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaa---gatgatctgaaacacac--aata 11846280  T
Q  309 tggttagcggcgactga-tttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctc 367  Q
      |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  11846281 gagttagcggcggctgattttggttcttcctcaaccggaacctttatgccgcaagttctc 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 55003424 - 55003695
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55003424 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaa 55003523  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||  ||||| | ||||||| |||| ||||||||  |   |||||||| |||    
T  55003524 gtatattaagaattagggtattagaaatatctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaaaa---gatgatctgaaa 55003620  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
     ||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  55003621 tacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcct---caatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 55003695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 350
Target Start/End: Original strand, 53069066 - 53069318
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53069066 gattttataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaa 53069165  T
Q  198 gaatattaaaaatta-gggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaa 296  Q
    | ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| || |||| ||   | || ||| ||||||||| | |||  | |||| |   ||||||||| ||    
T  53069166 ggatattaagaatcaggggtattaagaatacctggataaaactttcatggtagtcatcttaacaacaacaacaaa-gatgagaaggtgtgatgatctgaa 53069264  T
Q  297 acacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacct 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  53069265 acacacaaaatatggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct 53069318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 241
Target Start/End: Original strand, 10766884 - 10767026
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||| |||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10766884 atttcataatacatgttcaacaattataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgaccggatctacgacatgtttgatttatcaag 10766983  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagcttt 241  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10766984 gatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 10767026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13445198 - 13444931
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13445198 gatttgatagaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacatt----------atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 13445109  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | || || |||   ||||||  |||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||     
T  13445108 ggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaaacattcatgacagctctctcagtaacaaccataaacaaagaggagatgtgatgatctgaa- 13445010  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
      ||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13445009 -ccacaaaacagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaagttctcttcagatggg 13444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 46656830 - 46656664
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  46656830 atttcataaaacatgttcaataaatatgaattaatagctgaagtaaataaaacattcaatataattatgatcggatctacgatatgtttgatttatcaat 46656731  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
     ||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  46656730 gatattgagaatgagggtattagaaatacctgaatgaagctttcatgacaaccctctcaacaacaac 46656664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Original strand, 17593323 - 17593479
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17593323 aatcaatcgcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagaatattaagaattagggtattaggaata 17593422  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggag 283  Q
    ||||||| || ||||     ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17593423 cctggataaacctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag 17593479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 48128059 - 48128180
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  48128059 gatttcatgaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaaacaaacaaaacattgaacatgattatgatcggttctacgacatgtttgatttattaa 48128158  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtatt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  48128159 gaatattaagaattagggtatt 48128180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34300609 - 34300477
Alignment:
Q  133 tagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctgga 232  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  34300609 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttataaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaa 34300510  T
Q  233 tgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    | ||||||| ||  ||| |||||||||| ||||    
T  34300509 ttaagctttcatggcaaccctctcaacagcaac 34300477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 365
Target Start/End: Original strand, 12108729 - 12108945
Alignment:
Q  147 aaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataa 246  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | || |    
T  12108729 aaaacattgaatatgattatgatttgatctaagacatgtttgatttatcaaggatattaacaatta-ggtattaagaatacctgaatgaagctctaatga 12108827  T
Q  247 caatcctctcaacaacaactat---aaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaacc 343  Q
    ||| | ||| ||||  |||  |   ||||  ||||| ||   | |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12108828 caaccttctgaacatgaacggtctgaaacggagagatga---ggtgatatgaaacacacaacata-ggttagcggcgactgatttggttcttctttaacc 12108923  T
Q  344 ggtacctttatgcctaaagttc 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  12108924 ggtacctttatgcctcaagttc 12108945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28964989 - 28964869
Alignment:
Q  124 atgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattagga 223  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||| |  |||||||    
T  28964989 atgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatatcaatagtta-gaaattagga 28964891  T
Q  224 atacctgga-tgaagctttgat 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  28964890 atacctggattgaagctttgat 28964869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 377
Target Start/End: Original strand, 10769134 - 10769255
Alignment:
Q  251 cctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacct 350  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10769134 cctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatctgaaatacacaataga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct 10769228  T
Q  351 ttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||    
T  10769229 ttatgcctcaagttctcttcagatggg 10769255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13837613 - 13837547
Alignment:
Q  311 gttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13837613 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 13837547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 377
Target Start/End: Original strand, 26429639 - 26429703
Alignment:
Q  313 tagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26429639 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 26429703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 10238532 - 10238610
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10238532 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10238610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 10244654 - 10244732
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10244654 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10244732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 10769289 - 10769367
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10769289 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10769367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 11840045 - 11840123
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11840045 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 11840123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 26429737 - 26429815
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26429737 ggggaccatagcctcttttatactggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 26429815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 42191540 - 42191618
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42191540 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 42191618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 42197482 - 42197560
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42197482 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 42197560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 48128359 - 48128437
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48128359 ggggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggttttccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 48128437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 24643574 - 24643635
Alignment:
Q  108 aacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgat 169  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24643574 aacatgttcaacatttatgaatcaatagcggaagtaaataaaacattgaacatgattatgat 24643635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 49151458 - 49151374
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49151458 tatattgggg-accatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 49151374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 49157525 - 49157441
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49157525 tatattgggg-accatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 49157441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9760557 - 9760481
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccac 469  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  9760557 ggggaccatatcctctttatattggatgaccattagggtttcctattattcctttaatggaccatccagacatccac 9760481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 10760970 - 10761048
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10760970 ggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10761048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28964720 - 28964642
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  28964720 ggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattccgttaatggaccatccggacatccact 28964642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 397 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 46656516 - 46656442
Alignment:
Q  397 accataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46656516 accataacctcttttatattggataaccaatagggtttcccattattccgttaataggtcatccggacatccact 46656442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Original strand, 13367157 - 13367233
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccac 469  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  13367157 ggggaccatagcctctttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggaccatccagacatccac 13367233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34300430 - 34300371
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctt 369  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  34300430 ggttagcggcgacttatttggttattcttcaaccggtactttcatgcctcaagttctctt 34300371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Original strand, 30051415 - 30051498
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30051415 tatattgggg-accatagcctcttttatattggatggccattagggtttcca-ttattccgttaatgggccatccggacatccact 30051498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 430 - 470
Target Start/End: Original strand, 55003759 - 55003799
Alignment:
Q  430 gtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55003759 gtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 55003799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 470
Target Start/End: Original strand, 17056108 - 17056189
Alignment:
Q  388 tattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  17056108 tattgggg-accatagcctcttttatattggatgtccattagggtttcccattattccgttaatagg-catccggacatccact 17056189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Original strand, 48128260 - 48128318
Alignment:
Q  311 gttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctt 369  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  48128260 gttagcagcggctgatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctttagttctctt 48128318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 465
Target Start/End: Original strand, 53069386 - 53069443
Alignment:
Q  408 tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacat 465  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  53069386 tttatattggacgatcattagggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacat 53069443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 470
Target Start/End: Original strand, 23138782 - 23138814
Alignment:
Q  438 ttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23138782 ttattccgttaatgggtcatccggacatccact 23138814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36750562 - 36750288
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750562 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 36750463  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||  ||||| | ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  36750462 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 36750366  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36750365 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggg 36750288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 28682957 - 28683231
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28682957 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 28683056  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||   |||| |||||||| |||    
T  28683057 ggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacgataaccaagga---gagtggatgatctgaaa 28683153  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28683154 cacac--aatagagttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 28683231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13456247 - 13455973
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13456247 gatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 13456148  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  13456147 gggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 13456051  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13456050 cacac--aatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 13455973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13462188 - 13461914
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462188 gatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 13462089  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  13462088 gggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 13461992  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13461991 cacac--aatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 13461914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31002524 - 31002250
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||  | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002524 gatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 31002425  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||  ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||   |||||||| |||    
T  31002424 gaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaaaagagga---gatgatctgaaa 31002328  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31002327 cacac--aatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 31002250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31008502 - 31008228
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||  | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31008502 gatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 31008403  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||  ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||   |||||||| |||    
T  31008402 gaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaaaagagga---gatgatctgaaa 31008306  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31008305 cacac--aatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttcagatggg 31008228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 35090661 - 35090938
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090661 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 35090760  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||||| || |||| ||||||  |||||||      |||||| |||    
T  35090761 gaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttcatggcagccctctcagcatcaacaataaac--agagagg------tgatctgaaa 35090852  T
Q  298 cacaca------aaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    || |||      ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35090853 caaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 35090938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30965475 - 30965201
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || ||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965475 gatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 30965376  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
      || |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||   |||||||| |||    
T  30965375 ttattttaagaattagggtattaggaatacctgtataaatcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagatga---gatgatctgaaa 30965279  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30965278 cacac--aatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 30965201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 35084688 - 35084965
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084688 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 35084787  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||||| || |||| ||||||  |||||||      |||||| |||    
T  35084788 gaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttcatggcagccctctcagcatcaacaataaac--agagagg------tgatctgaaa 35084879  T
Q  298 cacaca------aaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    || |||      ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35084880 caaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 35084965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Original strand, 44716840 - 44717091
Alignment:
Q  122 ttatgaatcaatagcggaattaaat-aaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtatta 220  Q
    |||| ||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  44716840 ttatcaatcaatagcggaagcaaaagaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtatta 44716939  T
Q  221 ggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcg 320  Q
    ||||||||||||| |||||||  || ||   |||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||    
T  44716940 ggaatacctggataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcg 44717034  T
Q  321 actgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44717035 gctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 44717091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 375
Target Start/End: Original strand, 13149698 - 13149968
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||  | ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149698 gatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 13149797  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||  || ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| |||    
T  13149798 ga-tattaagaattagggtattaagaatacctg-ataaaacttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatctgaaa 13149892  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatg 375  Q
    ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13149893 cacacaataga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatg 13149968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29833355 - 29833191
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29833355 gatttcataatacatgtttaataattgtgaatcaataacggaaacaaataaaatattgaacataattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaa 29833256  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    | |||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  29833255 g-ataacaataatta-ggtattaagaatacctggatgaag-tttgatgacaaccctctcaacaacaac 29833191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 377
Target Start/End: Original strand, 35438722 - 35438991
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  35438722 atttcataaaacatgttcaacagttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatt------- 35438814  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataa--acaaagagaggagttgatgatctaaa 296  Q
      || ||  || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||  | |||| |||||||| | ||  | || |||| |||  | |||||| ||    
T  35438815 --tactaggaaatagggtattaggaatacctgtataaagctttcatggcagccgtctcgacaacaacaacaacgataaggaga-gaggaggtgatctgaa 35438911  T
Q  297 acacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||| |||  | | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35438912 acaaacatca-acggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 35438991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 265
Target Start/End: Original strand, 11048566 - 11048732
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||    
T  11048566 atttcataaaacatgtccaacaattatgaatcaatagctgaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggatatacgtcatgtttgatgtaccaag 11048665  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
     ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||  |||||| ||||||||    
T  11048666 gatattaagaattagggcactaggaatacttggataaagcttttatgacagccctctcgacaacaac 11048732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23343708 - 23343574
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23343708 gatttcataaaacatgttcaacgattacgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacgaatctacgacatgtttgatttatcaa 23343609  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctgga 232  Q
    | ||||||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  23343608 ggatattaagagttggggtattaggaatacatgga 23343574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 13150009 - 13150087
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13150009 ggggaccataacctcttttatattagatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccgtacatccact 13150087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13455939 - 13455861
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13455939 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 13455861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13461880 - 13461802
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13461880 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 13461802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31002216 - 31002138
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31002216 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 31002138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 35439690 - 35439768
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35439690 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 35439768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Original strand, 28683258 - 28683342
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28683258 tatattgggg-accatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 28683342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Original strand, 7771508 - 7771583
Alignment:
Q  394 gggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  7771508 gggaccataacctttttatattggatgacgattag-gtttcccattattctgttaatgggtcatccggacgtccact 7771583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19879536 - 19879472
Alignment:
Q  313 tagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19879536 tagcggcggctgatttgattcttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 19879472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23343494 - 23343427
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23343494 ggttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 23343427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36750251 - 36750176
Alignment:
Q  396 gaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36750251 gaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 36750176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31008194 - 31008116
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31008194 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgggtcattcggacatccact 31008116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31651662 - 31651612
Alignment:
Q  215 gtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31651662 gtattaggaatagttggatgaagctttgataacaaccctctcaacaacaac 31651612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 35084999 - 35085077
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35084999 ggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 35085077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 35090972 - 35091050
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35090972 ggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 35091050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 377
Target Start/End: Original strand, 11048776 - 11048837
Alignment:
Q  316 cggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11048776 cggcgactaatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 11048837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Original strand, 11048874 - 11048951
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccac 469  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11048874 ggggaccatagcctcttttatattggatcgccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccagacatccac 11048951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30965167 - 30965089
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30965167 ggggaccatagcctcttttatattagatggccattaggatttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 30965089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 44717125 - 44717203
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44717125 ggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggttttccattattccgttaatgggccatccggacatccact 44717203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23284784 - 23284708
Alignment:
Q  394 gggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccac 469  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  23284784 gggaccataacatcttttatatttgatggccattagagtttcacattattccgttaatgggtcatcagaacatccac 23284708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19879416 - 19879356
Alignment:
Q  409 ttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  19879416 ttatattggatggccatta-agtttcccattattccgttaatgggtcatctggacattcact 19879356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23343394 - 23343318
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccac 469  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23343394 ggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttcca-ttattctgttaatgggtcatccggacatccac 23343318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 470
Target Start/End: Original strand, 35442198 - 35442230
Alignment:
Q  438 ttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35442198 ttattccgttaatgggtcatccggacatccact 35442230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 12686191 - 12686465
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686191 gatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 12686290  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  12686291 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 12686387  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12686388 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 12686465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 12692293 - 12692567
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692293 gatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 12692392  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  12692393 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 12692489  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12692490 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 12692567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 377
Target Start/End: Original strand, 7389561 - 7389833
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7389561 atttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatccacgacatgtttgatttatcaag 7389660  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaac 298  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |    |||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||    
T  7389661 -atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgctctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaac 7389756  T
Q  299 acacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7389757 acac--aatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 7389833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 28525398 - 28525672
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28525398 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaa 28525497  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  28525498 ggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 28525594  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  || ||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  28525595 cacac--aatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggg 28525672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 28531494 - 28531768
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28531494 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaa 28531593  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  28531594 ggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 28531690  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  || ||||| | |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  28531691 cacac--aatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccagtacctttatgcctcacgttctcttcagatggg 28531768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 30384390 - 30384672
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30384390 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacacgattatgatcggatcta-gacatgtctgatttatcaa 30384488  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactat---aaacaaagagaggagttga--tgatc 292  Q
    | ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||  |||||  || |||| ||   |||||| |||||||| |||  | |||    
T  30384489 ggatattaagaataagggtattaagaatacctggatgaagctttcgtgacaactctctcgccatcaacgatctaaaacaaggagaggagatgatctaatc 30384588  T
Q  293 taaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  30384589 tgaaacacacaacata-gcttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatacctcgagttctcttcagatggg 30384672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30772430 - 30772155
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaat-attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||  ||| ||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30772430 atttcataaaacatgttcaataattatgaataaacagtggaagcaaacaaaaacaatgaacatgattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaa 30772331  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||  ||  |||||||||||||   |||||| |||||| |   ||||||||| |||    
T  30772330 ggatattaagaattagggtattaggattacctggataaagtttttatggcagccctctcaacaaca---ataaac-aagagaaggtgtgatgatctgaaa 30772235  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30772234 cacacaacaaagggttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 30772155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41297424 - 41297170
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297424 gatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 41297325  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||||||      ||||| |   ||| ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||   | |||||| |||    
T  41297324 ggatataaagaattagggtattaggaatacctg------gctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaggagagga---ggtgatctgaaa 41297234  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagt 363  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  41297233 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagt 41297170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24054482 - 24054338
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054482 gatttcataaaacatgttcaacaattataaatctatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 24054383  T
Q  198 gaatattaaaaattaggg-tattaggaatacctggatgaagcttt 241  Q
    | ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24054382 ggatattaagaatttgggatattaggaatacctggataaagcttt 24054338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Original strand, 32094201 - 32094338
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32094201 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggaata 32094299  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    |||| || ||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  32094300 cctgaataaagctttcatagcagccctctcaacaacaac 32094338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 32096973 - 32097138
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || |||  | ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32096973 gatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaa 32097072  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaa 264  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  32097073 ggatattaagaatta-ggtattaggattacctgaataaagctttcatagcagtcctctcaacaacaa 32097138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 221
Target Start/End: Original strand, 16215186 - 16215309
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  |||| || || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16215186 gatttcataacacatattcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatttaacatgattatgattggatctacgaaatgtttgatttatcaa 16215285  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattag 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  16215286 ggatattaaaaattagggtattag 16215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14610296 - 14610188
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14610296 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaattaatagcggaagcaaataaaccattgaacatgattatgatcggatttacgacatgtttgatttatcaa 14610197  T
Q  198 gaatattaa 206  Q
    | |||||||    
T  14610196 ggatattaa 14610188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 211
Target Start/End: Original strand, 37896311 - 37896423
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| | ||| || |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37896311 atttcataaatcatatttaataatcatgaatcaacagcagaagtaaataaaatgttgaacatgattatgatcggatctacgacatgattgatttatcaag 37896410  T
Q  199 aatattaaaaatt 211  Q
    |||||||| ||||    
T  37896411 aatattaataatt 37896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20500235 - 20500104
Alignment:
Q  148 aaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||  |    
T  20500235 aaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatacttgatttatcaaggatactaagaattagagtattagaaatacctggataaaacttttatggc 20500136  T
Q  248 aatcctctcaacaacaactataaacaaagaga 279  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  20500135 agccctctcaacatcaacgataaacagagaga 20500104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 271
Target Start/End: Original strand, 19059799 - 19059951
Alignment:
Q  121 attatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtatta 220  Q
    ||||| ||||| ||| ||||  ||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19059799 attataaatcattaggggaagcaaacaaaatattaaacatgaatataaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtatta 19059898  T
Q  221 ggaatacctg--gatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaa 271  Q
    | ||||||||  |||||||||||| |  ||  |||||| |||||||| |||||    
T  19059899 gaaatacctggagatgaagctttggtggcagccctctcgacaacaacgataaa 19059951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 377
Target Start/End: Original strand, 19066120 - 19066398
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| | |||||| ||  ||||| ||||| ||||||||  ||| |||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19066120 atttcataaaccatgttcaacgattataaatcattagcggaagcaaacaaaacattaagcatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaag 19066219  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctg--gatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaa 296  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |  ||   ||||| |||||||| ||||| | ||| ||       |||||| ||    
T  19066220 gatattaagaattatggtattaggaataccaggagatgaagctttggtggcagctctctcgacaacaacgataaagagagaaag-------tgatctgaa 19066312  T
Q  297 aca----caca-aaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||    ||||  || | ||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19066313 acaaacccacatcaacacggttagcggcagctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 19066398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26509994 - 26509832
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||   |||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||    
T  26509994 gatttcataaaacatgttcaatcattatgaa---atagtggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatataaactacgacatatttgattcatcaa 26509898  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26509897 ga-tattaagaattagg-tattaggaatatatgaatgaagctttgatgacagtcctctcaacatcaac 26509832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14610131 - 14610042
Alignment:
Q  286 gatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||| ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14610131 gatgatctgaaacaaacaaaag--ggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctcttcagatggg 14610042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28542337 - 28542269
Alignment:
Q  146 taaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  28542337 taaaacattgaacatgattatgatcgaaactacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 28542269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41297119 - 41297041
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41297119 ggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacatccact 41297041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 377
Target Start/End: Original strand, 32094394 - 32094507
Alignment:
Q  259 caacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcct 358  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||   ||||||| |||||||||| | |  |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32094394 caacaacaataaccaaagagagaag---atgatctgaaacacacaataga--gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcct 32094488  T
Q  359 aaagttctctttagatggg 377  Q
     |||||||||| |||||||    
T  32094489 caagttctcttcagatggg 32094507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 377
Target Start/End: Original strand, 32097195 - 32097308
Alignment:
Q  259 caacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcct 358  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||| | |  |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32097195 caacaacgataaccaaagagatgag---atgatctgaaacacacaataga--gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcct 32097289  T
Q  359 aaagttctctttagatggg 377  Q
     |||||||||| |||||||    
T  32097290 caagttctcttcagatggg 32097308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 470
Target Start/End: Original strand, 7389871 - 7389945
Alignment:
Q  397 accataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7389871 accatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattccgttaatgggtcatccgaacatccact 7389945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 32097342 - 32097420
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32097342 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 32097420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 26316805 - 26316922
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||  ||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |     
T  26316805 atttcataaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagcaaaaaaaacattgaacattaatatgattggatctaggacatgtttgatttatctac 26316904  T
Q  199 aatattaaaaattagggt 216  Q
      |||||| |||||||||    
T  26316905 ggtattaataattagggt 26316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Original strand, 28525699 - 28525783
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28525699 tatattgggg-accatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 28525783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 470
Target Start/End: Original strand, 28531804 - 28531879
Alignment:
Q  396 gaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28531804 gaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 28531879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 12686498 - 12686576
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12686498 ggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 12686576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 12692600 - 12692678
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12692600 ggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 12692678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 265
Target Start/End: Original strand, 33848964 - 33849066
Alignment:
Q  164 tatgatcggatctacgacatgt---ttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaaca 260  Q
    |||||||| ||||||||||||    ||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  33848964 tatgatcgaatctacgacatgcatgttgatctatcaaga-tactaataattagg-tattaggaataccttgatgaagttttgatgacagtcctctcaaca 33849061  T
Q  261 acaac 265  Q
    |||||    
T  33849062 acaac 33849066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 369
Target Start/End: Original strand, 19059990 - 19060049
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctt 369  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19059990 ggttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacttttatgcctcaagttctctt 19060049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 265
Target Start/End: Original strand, 33753381 - 33753432
Alignment:
Q  214 ggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33753381 ggtattaggaataccttgatgaagttttgatgacagtcctctcaacaacaac 33753432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14610009 - 14609932
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14610009 ggggaccataacctcttttacattagatgaccattagggtttcca-ttattccgttaatgggccatccggacatccact 14609932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 378
Target Start/End: Original strand, 26318381 - 26318547
Alignment:
Q  214 ggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactat---aaacaaagagaggagttgatg--atctaaaacacacaaaata 308  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||| ||||   |||| ||| |||  |||      
T  26318381 ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaacgatctgaaacagagagaggagatgatctaatctgaaatacaacaaa-- 26318478  T
Q  309 tggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggga 378  Q
     |||||||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  26318479 -ggttagcggcaattgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagatggga 26318547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Original strand, 32094542 - 32094619
Alignment:
Q  394 gggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  32094542 gggaccatagcctcttttatattagatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatacact 32094619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Original strand, 8706536 - 8706601
Alignment:
Q  200 atattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaac 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| || |||| | |||||||| ||||    
T  8706536 atattaagaattagggtattaggaatacctgaattatgctttcatgacaaccatctcaacagcaac 8706601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24288134 - 24287860
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24288134 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgtatctacgacatgtttgatttatcaa 24288035  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||  ||||| | ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  24288034 ggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 24287938  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24287937 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 24287860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49976733 - 49976460
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| ||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49976733 atttcataaaacatattcaacaattatgaatcgatagcgaaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 49976634  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaac 298  Q
     ||| |||   |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49976633 gataataa---ttagagtattaggaataccag-atgaagctttgataacactcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctcaaac 49976538  T
Q  299 acacaaaat-atggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  49976537 acacaaaataagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaa-cggta-ctttatgcctcaagttctcttcagatggg 49976460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 10739351 - 10739625
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739351 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 10739450  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||| | |||    
T  10739451 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatttgaaa 10739547  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  10739548 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggg 10739625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 10953120 - 10953394
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953120 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 10953219  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||| | |||    
T  10953220 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatttgaaa 10953316  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  10953317 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggg 10953394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 377
Target Start/End: Original strand, 33458308 - 33458553
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33458308 aatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 33458407  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgat 326  Q
    ||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||   |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||    
T  33458408 cctggataaagctttcttagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagatga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcggctgat 33458502  T
Q  327 ttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33458503 ttggttctttctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 33458553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48161081 - 48160833
Alignment:
Q  123 tatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48161081 tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattagg 48160983  T
Q  223 aatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgac 322  Q
    |||||||| || |||||||  |||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  48160982 aatacctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcgac 48160888  T
Q  323 tgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48160887 taatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 48160833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48167300 - 48167052
Alignment:
Q  123 tatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattagg 222  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48167300 tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattagg 48167202  T
Q  223 aatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgac 322  Q
    |||||||| || |||||||  |||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  48167201 aatacctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcgac 48167107  T
Q  323 tgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48167106 taatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 48167052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 6257217 - 6257491
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| || ||| || |||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6257217 gatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaa 6257316  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | || |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||   |||||||| |||    
T  6257317 ggatgttaagaattaggatattaggaatacctggataaagctttcgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagtgagga---gatgatctgaaa 6257413  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6257414 cacac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 6257491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 352
Target Start/End: Original strand, 10733258 - 10733507
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733258 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 10733357  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||| | |||    
T  10733358 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatttgaaa 10733454  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtaccttt 352  Q
    |||||  ||||  ||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10733455 cacac--aatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10733507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 352
Target Start/End: Original strand, 10947027 - 10947276
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947027 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 10947126  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||| | |||    
T  10947127 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatttgaaa 10947223  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtaccttt 352  Q
    |||||  ||||  ||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10947224 cacac--aatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 369
Target Start/End: Original strand, 44831678 - 44831897
Alignment:
Q  152 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatc 251  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44831678 attgaacatgaatatgatcgaatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaactagggtattaagaatacctagatgaagctttgataacaacc 44831777  T
Q  252 ctctcaacaacaactataaac--aaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacc 349  Q
    |||||||||||||| ||||||  | |||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  |||||||||      
T  44831778 ctctcaacaacaacgataaacagagagagagaaggtgatgatctgaaacacacaaaatagggttagcgacggctgatgtggttcttcctcaaccggtatt 44831877  T
Q  350 tttatgcctaaagttctctt 369  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  44831878 tttatgcctcaagttctctt 44831897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 377
Target Start/End: Original strand, 33461434 - 33461678
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33461434 aatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaacatgattatggtcggatttacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaata 33461532  T
Q  227 cctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgat 326  Q
     |||||| |||||||   | ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||   |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||    
T  33461533 tctggataaagcttttgcagcagccctctcatcaacaacgataatcaaagagatga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcggctgat 33461627  T
Q  327 ttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  33461628 ttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttcttttcagatggg 33461678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4632482 - 4632252
Alignment:
Q  154 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcct 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| || |||| |||    
T  4632482 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtatcagaaatacttggataaagctttcatgacaaccct 4632384  T
Q  254 ctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaa-----acacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtac 348  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| ||     | |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||     
T  4632383 ttcaacaacaaccataaacaaataggagatgtgatgatctgaattctgaaacacaaaacatagttagcggcttctgatttggttcttcctcaaccggtat 4632284  T
Q  349 ctttatgcctaaagttctctttagatgggaag 380  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4632283 ctttatgcctcaagttctcttcagatgagaag 4632252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50168740 - 50168469
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  50168740 gattacataaaacacgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgaatatacgacatgtttgatttatcaa 50168641  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  | | || |||||||||||| | || || ||||||||  || |||||| |||    
T  50168640 gaatattaacaatta-ggtataaggaatacctggttgaggctttcatggc-agccactcaacaacaacaacaatcagagagagga--tg-tgatctgaaa 50168546  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatgg 376  Q
    || |||| | | | |||||||||  |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50168545 caaacaaca-aggattagcggcggttgatttagttcttcctcaa-cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 50168469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 241
Target Start/End: Original strand, 26963354 - 26963494
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963354 atttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaag 26963453  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagcttt 241  Q
     |||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26963454 gatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataaagcttt 26963494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3769710 - 3769569
Alignment:
Q  102 tcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaat 201  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  3769710 tcataaaatatgttcaataattatgaatcaataatttaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttcattaatcaaggat 3769611  T
Q  202 attaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgat 244  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  3769610 attaataatta-ggtattaggaatacttgaatgaggctttgat 3769569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Original strand, 19686341 - 19686469
Alignment:
Q  99 atttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 198  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  19686341 atttcataaaacatgttcaataactataaatcaataacggaagcaaacaaaatattgaacgtaattatcatcggatctacaacatgcttgattaatcaag 19686440  T
Q  199 aatattaaaaattagggtattaggaatac 227  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  19686441 catattaagaattcgggtattatgaatac 19686469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 377
Target Start/End: Original strand, 26957022 - 26957089
Alignment:
Q  310 ggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26957022 ggttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 26957089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 186
Target Start/End: Original strand, 26956841 - 26956929
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtt 186  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  26956841 gatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataagtatgaacggatctacgacatgtt 26956929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 10739658 - 10739734
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10739658 ggggaccatagcctctt-atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 10739734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 10953427 - 10953503
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10953427 ggggaccatagcctctt-atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 10953503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9237500 - 9237402
Alignment:
Q  108 aacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaa 206  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||  |||  ||| | || |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9237500 aacatgttcaatgattatgaatgaatagtcgaagcaaacagaacattgaatatgattatgctcggatttacgacatgtttgatttatcaagtatattaa 9237402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24287811 - 24287749
Alignment:
Q  408 tttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24287811 tttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 24287749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 377
Target Start/End: Original strand, 10733517 - 10733638
Alignment:
Q  251 cctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacct 350  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  10733517 cctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatttgaaacacacaataga--gttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgatacct 10733611  T
Q  351 ttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||    
T  10733612 ttatgcctcaaattctcttcagatggg 10733638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 10733671 - 10733747
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10733671 ggggaccatagcctctt-atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10733747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 377
Target Start/End: Original strand, 10947286 - 10947407
Alignment:
Q  251 cctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacct 350  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  10947286 cctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatttgaaacacacaataga--gttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgatacct 10947380  T
Q  351 ttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||    
T  10947381 ttatgcctcaaattctcttcagatggg 10947407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 10947440 - 10947516
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctctttatattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10947440 ggggaccatagcctctt-atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10947516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50427462 - 50427380
Alignment:
Q  159 atgattatgatcggatctacgacatgttt--------gatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggat 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50427462 atgattatgatcggatgtacgacatgtttaatttattgatttatcaagaagattaagaattagggtattaggaatacctggat 50427380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50156046 - 50155990
Alignment:
Q  156 aacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaatta 212  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50156046 aacataattaagatcggatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaatta 50155990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Original strand, 26957123 - 26957201
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26957123 ggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgagccatccggacatccact 26957201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28704613 - 28704559
Alignment:
Q  143 aaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28704613 aaataaaatattgagcatgaatatgatcagatctacaacatgtttgatgtatcaa 28704559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Original strand, 34308083 - 34308144
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaaca 159  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  34308083 gattttataaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcatacaaaatattgaaca 34308144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Original strand, 44831928 - 44832012
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  44831928 tatattgggg-accatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccaattattccgttaatggaccatccggacatgcact 44832012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32284770 - 32284666
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaata 226  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||  ||||  ||| | | || ||||||||||    
T  32284770 aatcattagcggaaacaaataaaatattgaacaggaatataatcagatctagaacatgttttatttatcaaagatat--aaattcaaggcattaggaata 32284673  T
Q  227 cctggat 233  Q
    |||||||    
T  32284672 cctggat 32284666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Original strand, 33461705 - 33461787
Alignment:
Q  386 tatattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatcca 468  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  33461705 tatattgggg-accatagcctcttttatattggatgatcatcagggtttcccattatcccgttaatgagtcatccggacatcca 33461787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 174
Target Start/End: Original strand, 55473183 - 55473230
Alignment:
Q  127 aatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggat 174  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  55473183 aatcaatagcggaagcaaataaaatattgaatatgattatgattggat 55473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 50168435 - 50168357
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  50168435 ggggaccatagcctcttttatattgaatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggtcattcggtcatccact 50168357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4632934 - 4632869
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgat 163  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||    
T  4632934 gatttcataaaacatgttcaacaattattaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 4632869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Original strand, 31986745 - 31986808
Alignment:
Q  180 acatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgat 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  31986745 acatgtttgatttatcaaggataacaataatta-ggtattaggaatatctgaatgaagttttgat 31986808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32284619 - 32284555
Alignment:
Q  311 gttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  32284619 gttagtggcgactgatttggttcttcctcgatcggtacctttaggcctcaagttttcttcagatg 32284555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1480
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1206 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaaaggcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgatatgtttgatttatcaa 1305  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  1306 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 1402  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1403 cacac--aatagagttagcggcgactgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggg 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12519 - 12269
Alignment:
Q  122 ttatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattag 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  12519 ttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattag 12420  T
Q  222 gaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcga 321  Q
    ||||| |||||| ||||||| |   || |||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||     
T  12419 gaatatctggataaagctttcaaggcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcgg 12325  T
Q  322 ctgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12324 ctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 12269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6646 - 6396
Alignment:
Q  122 ttatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattag 221  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  6646 ttatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgactgaatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattag 6547  T
Q  222 gaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcga 321  Q
    |||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||     
T  6546 gaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacac--aatagagttagcggcgg 6452  T
Q  322 ctgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6451 ctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 6396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6362 - 6284
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6362 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12235 - 12157
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12235 ggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 12157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 377
Target Start/End: Original strand, 634 - 905
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  634 gatttcataaaacatgtt---taactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 730  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | |||| || |||| ||||||||| ||   ||||||| |||    
T  731 ggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaag---atgatctgaaa 827  T
Q  298 cacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    ||||||| |  |  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  828 cacacaatagtt--ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggg 905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 377
Target Start/End: Original strand, 172904 - 173176
Alignment:
Q  100 tttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaga 199  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  172904 tttcataaaacatgttctacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagg 173003  T
Q  200 atattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaaca 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  | |  ||||| | ||||||| |||| ||||||||| |   |||||||| |||||    
T  173004 atattaagaattaggatattaggaatacatggataaagctttcaagatagccctcttatcaacaacgataaccaaagagagaa---gatgatctgaaaca 173100  T
Q  300 cacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctctttagatggg 377  Q
    |||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  173101 cac--aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 173176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 470
Target Start/End: Original strand, 173205 - 173287
Alignment:
Q  388 tattgggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  173205 tattgggg-accatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatagaacatccggacatccact 173287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5682 - 5479
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682 gatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 5583  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaa 297  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||    
T  5582 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaa 5486  T
Q  298 cacacaa 304  Q
    |||||||    
T  5485 cacacaa 5479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38575 - 38411
Alignment:
Q  98 gatttcatagaacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 197  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||  |||||| || ||||  ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38575 gatttcataagacatgttcaatcattagaaatcaacagtggaagcaaacaaaacattgaacatagttatgatcggatctacaacatgtttg-tttatcaa 38477  T
Q  198 gaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaa 264  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  38476 gaatattaataattagg-tattaggaatacctggatgaagctttgacgacaatcatctcaacaacaa 38411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6060 - 5945
Alignment:
Q  108 aacatgttgaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaa 207  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  6060 aacatgttcaataattattaatcaatagcggcattaaacaaaacattgaacatgaatatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaaaatattatt 5961  T
Q  208 aattagggtattaggaa 224  Q
    ||||| |||||||||||    
T  5960 aatta-ggtattaggaa 5945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5910 - 5825
Alignment:
Q  285 tgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcctaaagttctcttt 370  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  5910 tgatggtctaaaacgcacaacatagggttagcgacgactaatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatcttt 5825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1174 - 957
Alignment:
Q  159 atgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattaggaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaa 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| || |||| ||  ||   |||||||    
T  1174 atgattatgatcggatcaacgacatgtttgacttatcatgcatattaacaattagagtattagaaatatctggataaaactttcatggcagctctctcaa 1075  T
Q  259 caacaactataaacaaagagaggagttgatgatctaaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttctccaaccggtacctttatgcct 358  Q
    || |||| |||||  |||||| |   ||||||||  |||||||||  | | |||||| |||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  1074 catcaacaataaaacaagagaaggtgtgatgatcggaaacacacacca-agggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgttatctttatgcct 976  T
Q  359 aaagttctctttagatggg 377  Q
     |||||||||| |||||||    
T  975 caagttctcttcagatggg 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 903 - 837
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatc 458  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  903 ggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcatc 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14113 - 14035
Alignment:
Q  393 ggggaccataacctcttt-atattgggtgaccattagagtttcccgttattccattaatgggtcatccggacatccact 470  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14113 ggggaccataacctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 14035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University