View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13808_high_23 (Length: 344)

Name: NF13808_high_23
Description: NF13808
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13808_high_23
NF13808_high_23
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (6-334)||(4416877-4417205)
chr3 (6-334)||(31964445-31964773)
chr3 (6-334)||(50134043-50134371)
chr3 (6-334)||(18277024-18277352)
chr3 (6-334)||(18292325-18292653)
chr3 (6-334)||(18307626-18307954)
chr3 (6-334)||(28115926-28116254)
chr3 (6-334)||(5609294-5609622)
chr3 (6-334)||(29148727-29149055)
chr3 (7-334)||(47023411-47023738)
chr3 (7-334)||(7996520-7996847)
chr3 (7-334)||(10643028-10643355)
chr3 (7-334)||(28339260-28339587)
chr3 (6-334)||(18330627-18330955)
chr3 (6-334)||(6192274-6192602)
chr3 (6-334)||(7073170-7073498)
chr3 (6-334)||(4796625-4796953)
chr3 (6-334)||(8295930-8296258)
chr3 (6-334)||(35880724-35881052)
chr3 (6-334)||(8301239-8301567)
chr3 (6-334)||(10396091-10396419)
chr3 (6-334)||(15741066-15741394)
chr3 (6-334)||(17984928-17985256)
chr3 (6-271)||(51782044-51782309)
chr3 (6-334)||(21674651-21674979)
chr3 (6-326)||(22387550-22387870)
chr3 (6-281)||(5466996-5467271)
chr3 (6-317)||(6542434-6542745)
chr3 (6-334)||(4721589-4721917)
chr3 (6-314)||(5596329-5596637)
chr3 (6-326)||(22870828-22871148)
chr3 (6-326)||(22885887-22886207)
chr3 (7-334)||(5713185-5713512)
chr3 (7-334)||(5724095-5724422)
chr3 (7-334)||(5757055-5757382)
chr3 (7-334)||(5767946-5768273)
chr3 (6-281)||(8211749-8212024)
chr3 (6-281)||(18242750-18243025)
chr3 (6-317)||(36997049-36997360)
chr3 (6-271)||(51797133-51797399)
chr3 (6-334)||(15892678-15893006)
chr3 (6-334)||(18225149-18225477)
chr3 (7-334)||(5013670-5013997)
chr3 (7-334)||(24328117-24328444)
chr3 (6-326)||(4346659-4346979)
chr3 (6-334)||(18051220-18051548)
chr3 (6-317)||(20576819-20577130)
chr3 (6-281)||(48465938-48466213)
chr3 (6-326)||(28021241-28021561)
chr3 (7-281)||(11110322-11110596)
chr3 (6-317)||(29664942-29665253)
chr3 (7-326)||(31034090-31034409)
chr3 (7-329)||(32292715-32293037)
chr3 (28-326)||(32439120-32439418)
chr3 (7-329)||(18530351-18530673)
chr3 (28-317)||(20066018-20066307)
chr3 (7-329)||(16626479-16626801)
chr3 (7-326)||(5652353-5652672)
chr3 (7-326)||(17993757-17994076)
chr3 (7-326)||(4625910-4626229)
chr3 (115-326)||(4893176-4893387)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (6-334)||(19674438-19674766)
chr8 (7-334)||(19208251-19208578)
chr8 (7-334)||(28361846-28362173)
chr8 (7-334)||(31489641-31489968)
chr8 (7-334)||(31354521-31354848)
chr8 (6-334)||(27608795-27609123)
chr8 (6-334)||(16277551-16277879)
chr8 (6-334)||(19688095-19688423)
chr8 (6-334)||(2137149-2137477)
chr8 (6-334)||(14557621-14557949)
chr8 (6-281)||(12092614-12092889)
chr8 (6-317)||(19286476-19286787)
chr8 (6-317)||(3329397-3329708)
chr8 (6-281)||(29829372-29829647)
chr8 (7-334)||(33258720-33259047)
chr8 (6-334)||(16283446-16283774)
chr8 (7-326)||(18710591-18710910)
chr8 (6-164)||(189261-189419)
chr8 (6-326)||(9354627-9354948)
chr8 (25-241)||(22080787-22081003)
chr8 (7-329)||(44563103-44563423)
chr8 (7-241)||(19658931-19659164)
chr8 (8-241)||(33244755-33244988)
chr8 (259-317)||(19518280-19518338)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (7-334)||(26480398-26480725)
chr5 (6-334)||(2511057-2511385)
chr5 (6-334)||(8665303-8665631)
chr5 (6-334)||(15758685-15759013)
chr5 (6-334)||(30152024-30152352)
chr5 (7-334)||(9317457-9317784)
chr5 (7-334)||(12132161-12132488)
chr5 (6-334)||(15658588-15658916)
chr5 (6-334)||(6874311-6874639)
chr5 (6-334)||(9548371-9548699)
chr5 (7-334)||(5637916-5638243)
chr5 (6-334)||(23752278-23752606)
chr5 (6-334)||(30168475-30168803)
chr5 (6-317)||(18500558-18500869)
chr5 (6-325)||(31431455-31431774)
chr5 (6-334)||(11549360-11549688)
chr5 (6-334)||(22998942-22999270)
chr5 (6-334)||(23717816-23718144)
chr5 (6-317)||(28649258-28649569)
chr5 (7-334)||(33516362-33516689)
chr5 (6-326)||(34616532-34616852)
chr5 (6-317)||(37755003-37755314)
chr5 (6-334)||(18375240-18375568)
chr5 (6-334)||(30934639-30934967)
chr5 (6-334)||(33777493-33777821)
chr5 (6-317)||(37671311-37671622)
chr5 (6-281)||(37358471-37358746)
chr5 (6-334)||(24687985-24688313)
chr5 (9-317)||(37770818-37771126)
chr5 (6-281)||(31826235-31826510)
chr5 (6-281)||(43078311-43078586)
chr5 (6-334)||(24970024-24970352)
chr5 (6-281)||(3789600-3789875)
chr5 (7-334)||(29966895-29967222)
chr5 (7-334)||(30029421-30029748)
chr5 (6-317)||(40473377-40473688)
chr5 (13-326)||(28959621-28959934)
chr5 (6-317)||(24681463-24681774)
chr5 (6-317)||(24723990-24724301)
chr5 (6-281)||(13324657-13324932)
chr5 (10-326)||(32599304-32599620)
chr5 (28-334)||(41674715-41675021)
chr5 (7-329)||(29888911-29889233)
chr5 (6-334)||(22888476-22888804)
chr5 (7-334)||(23892212-23892539)
chr5 (28-334)||(25199035-25199341)
chr5 (28-326)||(33292539-33292837)
chr5 (7-326)||(33877261-33877580)
chr5 (7-326)||(11325808-11326127)
chr5 (7-326)||(13184477-13184796)
chr5 (7-241)||(13440323-13440557)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (6-334)||(16736277-16736605)
chr7 (6-334)||(16751331-16751659)
chr7 (6-334)||(17523530-17523858)
chr7 (6-334)||(17529357-17529685)
chr7 (7-334)||(4144941-4145268)
chr7 (7-334)||(9618649-9618976)
chr7 (7-334)||(26319687-26320014)
chr7 (7-334)||(45387341-45387668)
chr7 (7-334)||(26274912-26275239)
chr7 (7-334)||(26669732-26670059)
chr7 (6-334)||(5147157-5147485)
chr7 (6-334)||(11424593-11424921)
chr7 (6-317)||(31564207-31564518)
chr7 (6-334)||(2154571-2154899)
chr7 (6-334)||(5127990-5128318)
chr7 (6-334)||(10916685-10917013)
chr7 (6-317)||(26537687-26537998)
chr7 (6-334)||(16518233-16518561)
chr7 (6-334)||(26435255-26435583)
chr7 (6-334)||(16503197-16503525)
chr7 (6-334)||(24592358-24592686)
chr7 (6-281)||(3445357-3445632)
chr7 (6-281)||(11441623-11441898)
chr7 (6-281)||(31124971-31125246)
chr7 (7-329)||(2108823-2109145)
chr7 (7-329)||(26484697-26485019)
chr7 (7-329)||(39210841-39211163)
chr7 (7-329)||(16449816-16450138)
chr7 (7-334)||(16041321-16041648)
chr7 (7-326)||(2775365-2775684)
chr7 (28-329)||(18540802-18541103)
chr7 (31-326)||(5159525-5159820)
chr7 (7-194)||(4200685-4200872)
chr7 (7-326)||(31088282-31088601)
chr7 (7-241)||(45733551-45733785)
chr7 (7-194)||(26682818-26683005)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (6-334)||(5005885-5006213)
chr4 (6-334)||(14763235-14763563)
chr4 (6-334)||(27163248-27163576)
chr4 (7-334)||(40105570-40105897)
chr4 (6-334)||(6569865-6570193)
chr4 (6-334)||(24592245-24592573)
chr4 (6-317)||(18800544-18800855)
chr4 (7-334)||(31126450-31126777)
chr4 (6-334)||(14665030-14665358)
chr4 (6-334)||(17014012-17014340)
chr4 (7-334)||(14098553-14098880)
chr4 (6-281)||(30753819-30754094)
chr4 (6-317)||(54833416-54833727)
chr4 (6-317)||(33673729-33674040)
chr4 (6-317)||(36344446-36344757)
chr4 (6-317)||(39850667-39850978)
chr4 (6-334)||(21969713-21970041)
chr4 (28-326)||(34188913-34189211)
chr4 (28-326)||(24112682-24112980)
chr4 (7-263)||(15284860-15285116)
chr4 (28-329)||(15227887-15228188)
chr4 (7-334)||(1900269-1900596)
chr4 (28-261)||(14235478-14235711)
chr4 (25-241)||(15391288-15391504)
chr4 (7-326)||(24460537-24460856)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (6-334)||(21677102-21677430)
chr2 (6-334)||(11635106-11635434)
chr2 (7-334)||(34861673-34862000)
chr2 (6-334)||(11641295-11641623)
chr2 (7-334)||(37685830-37686157)
chr2 (7-334)||(37701095-37701422)
chr2 (6-334)||(32049791-32050119)
chr2 (6-334)||(23128486-23128814)
chr2 (6-334)||(28882207-28882535)
chr2 (7-334)||(37925486-37925813)
chr2 (6-334)||(12655535-12655863)
chr2 (7-334)||(22925949-22926276)
chr2 (25-334)||(34286347-34286656)
chr2 (25-334)||(34291407-34291716)
chr2 (7-334)||(16829259-16829586)
chr2 (7-334)||(16891895-16892222)
chr2 (6-334)||(20837911-20838239)
chr2 (6-326)||(39890075-39890395)
chr2 (6-333)||(13936464-13936791)
chr2 (7-334)||(31876274-31876601)
chr2 (6-334)||(27434364-27434692)
chr2 (7-334)||(19416420-19416747)
chr2 (6-317)||(27777232-27777543)
chr2 (6-317)||(27816990-27817301)
chr2 (6-317)||(12716522-12716833)
chr2 (6-317)||(27803717-27804028)
chr2 (79-334)||(34279442-34279697)
chr2 (6-317)||(37375171-37375482)
chr2 (6-317)||(39051742-39052053)
chr2 (6-281)||(260673-260948)
chr2 (6-317)||(12586820-12587131)
chr2 (6-317)||(40233521-40233832)
chr2 (7-317)||(9349903-9350213)
chr2 (7-334)||(21703085-21703412)
chr2 (7-329)||(31891249-31891571)
chr2 (7-329)||(19456342-19456664)
chr2 (7-329)||(27118686-27119008)
chr2 (25-241)||(27393055-27393271)
chr2 (7-329)||(34303224-34303546)
chr2 (7-326)||(3784655-3784974)
chr2 (7-326)||(16163600-16163919)
chr2 (7-326)||(34157012-34157330)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (6-334)||(8997-9325)
scaffold0159 (6-334)||(20012-20340)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (6-334)||(41793239-41793567)
chr1 (7-334)||(10962666-10962993)
chr1 (7-334)||(28584977-28585304)
chr1 (6-334)||(51638214-51638542)
chr1 (7-334)||(20340267-20340594)
chr1 (7-334)||(16207963-16208290)
chr1 (7-329)||(28151863-28152185)
chr1 (28-329)||(20461082-20461383)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (7-334)||(7171-7498)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (6-334)||(16749848-16750176)
chr6 (6-334)||(24304492-24304820)
chr6 (6-334)||(24863711-24864039)
chr6 (6-317)||(4757775-4758086)
chr6 (6-334)||(27000067-27000395)
chr6 (6-325)||(28207457-28207776)
chr6 (6-334)||(26988995-26989323)
chr6 (7-334)||(30557891-30558218)
chr6 (6-334)||(13298825-13299153)
chr6 (6-334)||(15424191-15424519)
chr6 (6-334)||(26918374-26918702)
chr6 (6-317)||(4525297-4525608)
chr6 (6-325)||(4545649-4545968)
chr6 (6-325)||(4724008-4724327)
chr6 (6-317)||(4773017-4773328)
chr6 (6-317)||(34463220-34463531)
chr6 (6-317)||(3696092-3696403)
chr6 (6-317)||(27359866-27360177)
chr6 (6-317)||(27450209-27450520)
chr6 (7-334)||(29573007-29573334)
chr6 (5-326)||(29549477-29549798)
chr6 (6-334)||(22934754-22935082)
chr6 (6-334)||(23857199-23857527)
chr6 (6-314)||(29501429-29501737)
chr6 (6-317)||(26116284-26116595)
chr6 (6-317)||(27044398-27044710)
chr6 (6-281)||(27485176-27485451)
chr6 (12-314)||(26777495-26777797)
chr6 (6-317)||(16674150-16674461)
chr6 (7-334)||(16943902-16944229)
chr6 (6-281)||(27007774-27008049)
chr6 (6-334)||(27272454-27272782)
chr6 (6-281)||(17025324-17025599)
chr6 (6-325)||(20160704-20161023)
chr6 (6-325)||(22171808-22172127)
chr6 (7-329)||(14143160-14143482)
chr6 (7-329)||(26787943-26788265)
chr6 (7-329)||(27196316-27196638)
chr6 (7-329)||(27252602-27252924)
chr6 (6-328)||(27290244-27290566)
chr6 (7-241)||(22456809-22457043)
chr6 (7-326)||(13521948-13522267)
chr6 (10-326)||(27629578-27629894)
chr6 (7-326)||(33374131-33374450)
chr6 (7-326)||(8892186-8892504)
chr6 (7-326)||(8903421-8903739)
chr6 (99-241)||(22477240-22477382)
chr6 (7-329)||(28162656-28162978)
chr6 (9-122)||(17092317-17092430)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (6-334)||(27289-27617)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (6-325)||(7955-8274)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (6-334)||(14861-15189)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (6-334)||(46916-47244)
scaffold0089 (6-334)||(40000-40328)
scaffold0089 (8-334)||(29760-30086)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (6-334)||(30450-30777)
scaffold0124 (7-329)||(20390-20711)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (6-326)||(9571-9891)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (7-334)||(26133-26461)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (6-334)||(60-389)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (6-317)||(6024-6339)
scaffold0415 (7-241)||(1850-2083)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (29-329)||(46756-47072)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (7-334)||(2590-2917)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (10-326)||(94-410)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (52-329)||(5-282)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (25-161)||(568-704)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (25-241)||(21651-21867)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4417205 - 4416877
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4417205 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 4417106  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4417105 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 4417006  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4417005 accttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 4416906  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416905 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 4416877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 31964445 - 31964773
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31964445 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 31964544  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31964545 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 31964644  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31964645 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 31964744  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964745 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 31964773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 50134043 - 50134371
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  50134043 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 50134142  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50134143 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 50134242  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50134243 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 50134342  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134343 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 50134371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 18277024 - 18277352
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  18277024 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 18277123  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18277124 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 18277223  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18277224 accttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 18277323  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18277324 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 18277352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 18292325 - 18292653
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  18292325 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 18292424  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18292425 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 18292524  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18292525 accttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 18292624  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18292625 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 18292653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 18307626 - 18307954
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  18307626 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 18307725  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18307726 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 18307825  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18307826 accttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 18307925  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18307926 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 18307954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 28115926 - 28116254
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  28115926 aggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttcct 28116025  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28116026 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 28116125  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28116126 accttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtat 28116225  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28116226 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 28116254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 5609294 - 5609622
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5609294 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 5609393  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5609394 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 5609493  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5609494 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 5609593  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609594 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 5609622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 29148727 - 29149055
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29148727 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 29148826  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29148827 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 29148926  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29148927 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 29149026  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29149027 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 29149055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47023738 - 47023411
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  47023738 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 47023639  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47023638 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 47023539  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47023538 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 47023439  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023438 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 47023411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7996847 - 7996520
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7996847 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 7996748  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7996747 gatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 7996648  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7996647 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 7996548  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996547 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 7996520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10643355 - 10643028
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10643355 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 10643256  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10643255 gatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 10643156  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10643155 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 10643056  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643055 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 10643028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28339587 - 28339260
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28339587 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 28339488  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28339487 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaa 28339388  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28339387 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 28339288  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339287 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 28339260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18330955 - 18330627
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18330955 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 18330856  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18330855 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 18330756  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18330755 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 18330656  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18330655 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 18330627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6192602 - 6192274
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6192602 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 6192503  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6192502 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctga 6192403  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6192402 accttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 6192303  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6192302 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 6192274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7073498 - 7073170
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  7073498 aggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttcct 7073399  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7073398 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 7073299  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7073298 accttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 7073199  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7073198 cggaggaaaagtaggtctagcttgctgat 7073170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 4796625 - 4796953
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4796625 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 4796724  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4796725 tgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 4796824  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4796825 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 4796924  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4796925 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 4796953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8296258 - 8295930
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8296258 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttcct 8296159  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8296158 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 8296059  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8296058 acctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 8295959  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8295958 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 8295930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35881052 - 35880724
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35881052 aggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 35880953  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35880952 tgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 35880853  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35880852 accttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 35880753  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35880752 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 35880724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 8301239 - 8301567
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8301239 aggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 8301338  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  8301339 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctga 8301438  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8301439 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 8301538  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8301539 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 8301567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10396419 - 10396091
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  10396419 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttccct 10396320  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396319 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 10396220  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  10396219 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtat 10396120  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10396119 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 10396091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 15741066 - 15741394
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15741066 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 15741165  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15741166 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 15741265  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15741266 accttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 15741365  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15741366 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 15741394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 17984928 - 17985256
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17984928 aggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 17985027  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17985028 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctga 17985127  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  17985128 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtat 17985227  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17985228 aggaggaaaagtaggtctagcttgctgat 17985256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51782309 - 51782044
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  51782309 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 51782210  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51782209 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 51782110  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51782109 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagta 51782044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21674979 - 21674651
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  21674979 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttccct 21674880  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21674879 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 21674780  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  21674779 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 21674680  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  21674679 aggaggaaaagttggtctagcttgctgat 21674651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Original strand, 22387550 - 22387870
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22387550 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 22387649  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22387650 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 22387749  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  22387750 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtat 22387849  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||| ||||| || |||||    
T  22387850 aggaggaaaagtcggtctagc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5467271 - 5466996
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||    
T  5467271 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagtttccct 5467172  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5467171 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 5467072  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5467071 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaag 5466996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 6542434 - 6542745
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  6542434 aggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccc 6542533  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542534 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 6542633  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  6542634 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 6542733  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  6542734 aggaggaaaagt 6542745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4721917 - 4721589
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  4721917 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttcct 4721818  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  4721817 tgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctga 4721718  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4721717 accttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 4721618  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4721617 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 4721589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 314
Target Start/End: Original strand, 5596329 - 5596637
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5596329 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 5596428  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596429 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 5596528  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  5596529 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 5596628  T
Q  306 cggagggaa 314  Q
     ||||||||    
T  5596629 aggagggaa 5596637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Original strand, 22870828 - 22871148
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22870828 aggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 22870927  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22870928 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 22871027  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  22871028 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 22871127  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||| ||||| || |||||    
T  22871128 aggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Original strand, 22885887 - 22886207
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22885887 aggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 22885986  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22885987 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 22886086  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  22886087 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 22886186  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||| ||||| || |||||    
T  22886187 aggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5713512 - 5713185
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  5713512 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 5713413  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713412 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5713313  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5713312 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5713213  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5713212 ggagggaaagtaggtctggcttgctgat 5713185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5724422 - 5724095
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  5724422 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 5724323  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724322 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5724223  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5724222 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5724123  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5724122 ggagggaaagtaggtctggcttgctgat 5724095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 5757055 - 5757382
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  5757055 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 5757154  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757155 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5757254  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5757255 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5757354  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5757355 ggagggaaagtaggtctggcttgctgat 5757382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 5767946 - 5768273
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  5767946 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 5768045  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768046 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5768145  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5768146 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5768245  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5768246 ggagggaaagtaggtctggcttgctgat 5768273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8212024 - 8211749
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8212024 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 8211925  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8211924 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 8211825  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8211824 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaag 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18243025 - 18242750
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18243025 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 18242926  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242925 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 18242826  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18242825 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaag 18242750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 36997049 - 36997360
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36997049 aggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttccct 36997148  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36997149 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 36997248  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  36997249 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtat 36997348  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  36997349 aggaggaaaagt 36997360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51797399 - 51797133
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  51797399 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 51797300  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51797299 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 51797200  T
Q  206 accttg-gaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagta 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51797199 accttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagta 51797133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 15892678 - 15893006
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15892678 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 15892777  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  15892778 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctga 15892877  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  15892878 acctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtat 15892977  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15892978 cggagggaaagtaggtctagcttgttgat 15893006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18225477 - 18225149
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18225477 aggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 18225378  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225377 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 18225278  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  18225277 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 18225178  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18225177 aggagggaaggtaggcctagcttgttgat 18225149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5013997 - 5013670
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5013997 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 5013898  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5013897 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 5013798  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || || || ||| | |||||     
T  5013797 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtata 5013698  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  5013697 ggaggaaaagttggcctggcttgctgat 5013670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24328444 - 24328117
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24328444 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 24328345  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24328344 gatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 24328245  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| |||||||     
T  24328244 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtata 24328145  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24328144 ggagggaaggttggcctggcttgctgat 24328117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Original strand, 4346659 - 4346979
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  4346659 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 4346758  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4346759 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 4346858  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  4346859 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 4346958  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||| ||||| || |||||    
T  4346959 aggaggaaaagttggtctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18051548 - 18051220
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18051548 aggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 18051449  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  18051448 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatcggacctga 18051349  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18051348 acctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 18051249  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18051248 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 18051220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 20576819 - 20577130
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  20576819 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 20576918  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  20576919 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 20577018  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20577019 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 20577118  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  20577119 aggaggaaaagt 20577130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 48466213 - 48465938
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  48466213 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 48466114  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48466113 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 48466014  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  48466013 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaag 48465938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28021561 - 28021241
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28021561 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttccct 28021462  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28021461 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 28021362  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  28021361 accttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 28021262  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||| ||||| || |||||    
T  28021261 aggaggaaaagttggtctagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Original strand, 11110322 - 11110596
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  11110322 ggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccct 11110421  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11110422 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaa 11110521  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  11110522 ccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaag 11110596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 29664942 - 29665253
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  29664942 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 29665041  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  29665042 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 29665141  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29665142 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 29665241  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  29665242 aggaggaaaagt 29665253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 31034090 - 31034409
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  31034090 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 31034189  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  31034190 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 31034289  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  31034290 cctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 31034389  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  31034390 agaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32293037 - 32292715
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  32293037 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 32292938  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  32292937 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 32292838  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  32292837 cctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 32292738  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  32292737 agaggaaaggtaggtctagcttg 32292715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32439418 - 32439120
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  32439418 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 32439319  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||| || || || ||    
T  32439318 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 32439219  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagc 326  Q
    ||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  32439218 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18530673 - 18530351
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||| ||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  18530673 ggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 18530574  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  18530573 ggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 18530474  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  ||  | || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  18530473 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatc 18530374  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  18530373 ggaggaaaggtaggtctagcttg 18530351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20066307 - 20066018
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  20066307 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 20066208  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||  | ||    
T  20066207 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccgg 20066108  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagt 317  Q
    ||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  20066107 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 20066018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 16626479 - 16626801
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16626479 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 16626578  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  16626579 ggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 16626678  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || |||||  |||||| | | ||||||    
T  16626679 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatc 16626778  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  16626779 ggaggaaaggtaggtctagcttg 16626801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5652672 - 5652353
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  5652672 ggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 5652573  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  5652572 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 5652473  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| |||| |||||||  ||||||||||  || ||||| || |||||| |  ||||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  5652472 cttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 5652373  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  5652372 agaggaaaggtaggtctagc 5652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 17993757 - 17994076
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  17993757 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 17993856  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| || || | |||    
T  17993857 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaa 17993956  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  17993957 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 17994056  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  17994057 agaggaaaggtaggtctagc 17994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4626229 - 4625910
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    ||||||| |||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  4626229 ggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 4626130  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  4626129 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 4626030  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  4626029 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 4625930  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  4625929 agaggaaaggtaggtctagc 4625910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4893387 - 4893176
Alignment:
Q  115 agcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggag 214  Q
    |||||||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||   |||||||||||    
T  4893387 agcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggag 4893288  T
Q  215 gcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaa 314  Q
    | || || || ||||| || |||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||    
T  4893287 gtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaa 4893188  T
Q  315 agtaggcctagc 326  Q
    ||| || |||||    
T  4893187 agttggtctagc 4893176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19674766 - 19674438
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19674766 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 19674667  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19674666 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 19674567  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19674566 accttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 19674467  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674466 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 19674438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 19208251 - 19208578
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19208251 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 19208350  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208351 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 19208450  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19208451 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 19208550  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208551 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 19208578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 28361846 - 28362173
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28361846 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 28361945  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28361946 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 28362045  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28362046 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 28362145  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28362146 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 28362173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 31489641 - 31489968
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31489641 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 31489740  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31489741 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaa 31489840  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31489841 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 31489940  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31489941 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 31489968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31354848 - 31354521
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31354848 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 31354749  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31354748 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaa 31354649  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31354648 ccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatc 31354549  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354548 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 31354521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 27608795 - 27609123
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27608795 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 27608894  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27608895 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 27608994  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27608995 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 27609094  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27609095 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 27609123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16277879 - 16277551
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16277879 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 16277780  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16277779 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 16277680  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16277679 acctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 16277580  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16277579 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 16277551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19688423 - 19688095
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19688423 aggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttcct 19688324  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19688323 tgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 19688224  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19688223 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 19688124  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19688123 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 19688095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 2137149 - 2137477
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2137149 aggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttcct 2137248  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2137249 tgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 2137348  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2137349 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 2137448  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2137449 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 2137477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14557949 - 14557621
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14557949 aggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 14557850  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14557849 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 14557750  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14557749 accttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtat 14557650  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14557649 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 14557621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Original strand, 12092614 - 12092889
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12092614 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 12092713  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092714 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 12092813  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  12092814 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaag 12092889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19286787 - 19286476
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19286787 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 19286688  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19286687 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 19286588  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  19286587 accttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtat 19286488  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  19286487 aggaggaaaagt 19286476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 3329397 - 3329708
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  3329397 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttccct 3329496  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329497 tgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 3329596  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  3329597 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 3329696  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  3329697 aggaggaaaagt 3329708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29829647 - 29829372
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29829647 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 29829548  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  29829547 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 29829448  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29829447 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaag 29829372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33259047 - 33258720
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33259047 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 33258948  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33258947 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 33258848  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| |||||||     
T  33258847 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtata 33258748  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  33258747 ggagggaaggttggcctggcttgctgat 33258720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16283774 - 16283446
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16283774 aggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 16283675  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||  || ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  16283674 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctga 16283575  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16283574 acctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 16283475  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16283474 cggagggaaggtaggtctagcttgttgat 16283446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18710910 - 18710591
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18710910 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 18710811  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18710810 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaa 18710711  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||     
T  18710710 ccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtata 18710611  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
    ||||| ||||| || |||||    
T  18710610 ggaggaaaagttggtctagc 18710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 189419 - 189261
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  189419 aggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 189320  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacc 164  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  189319 tgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacc 189261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9354948 - 9354627
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9354948 aggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttcct 9354849  T
Q  106 tgatcaatgag-cttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctg 204  Q
    || || |||||  || || ||||| ||| |||| || || || || ||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |    
T  9354848 tggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacgg 9354749  T
Q  205 aaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggta 304  Q
    ||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  ||||||  || || || || |||||||||||| | ||||    
T  9354748 aacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggta 9354649  T
Q  305 tcggagggaaagtaggcctagc 326  Q
    || |||| || ||||| |||||    
T  9354648 tcagaggaaaggtaggtctagc 9354627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Original strand, 22080787 - 22081003
Alignment:
Q  25 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttca 124  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  22080787 tcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttcttta 22080886  T
Q  125 caatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| || |  ||||| ||||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |     
T  22080887 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggtt 22080986  T
Q  225 aggtgggggcttgccct 241  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  22080987 aggtggaggctttccct 22081003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44563423 - 44563103
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  44563423 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttcctt 44563325  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  44563324 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 44563226  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  44563225 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 44563126  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  44563125 agaggaaaggtaggtctagcttg 44563103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 19658931 - 19659164
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19658931 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 19659030  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  19659031 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 19659129  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccct 241  Q
    | | |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  19659130 cttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccct 19659164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33244988 - 33244755
Alignment:
Q  8 gagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttg 107  Q
    ||||||||||| | || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33244988 gagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttg 33244889  T
Q  108 atcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaac 207  Q
     || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | ||||    
T  33244888 gtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaac 33244789  T
Q  208 cttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccct 241  Q
     | |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  33244788 ttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccct 33244755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Original strand, 19518280 - 19518338
Alignment:
Q  259 cctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  19518280 cctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagt 19518338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26480725 - 26480398
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26480725 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 26480626  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480625 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 26480526  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26480525 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 26480426  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480425 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 26480398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2511385 - 2511057
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2511385 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 2511286  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511285 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 2511186  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2511185 accttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 2511086  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511085 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 2511057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 8665303 - 8665631
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8665303 aggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 8665402  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665403 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 8665502  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8665503 accttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 8665602  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665603 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 8665631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 15758685 - 15759013
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15758685 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 15758784  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758785 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 15758884  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15758885 accttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 15758984  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758985 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 15759013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30152352 - 30152024
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30152352 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 30152253  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30152252 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctga 30152153  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30152152 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 30152053  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152052 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 30152024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9317784 - 9317457
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9317784 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 9317685  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317684 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 9317585  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9317584 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 9317485  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317484 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 9317457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12132488 - 12132161
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12132488 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 12132389  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132388 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 12132289  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12132288 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 12132189  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132188 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 12132161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 15658588 - 15658916
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15658588 aggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 15658687  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15658688 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 15658787  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15658788 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 15658887  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15658888 tggagggaaagtaggtctagcttgctgat 15658916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6874639 - 6874311
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6874639 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 6874540  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6874539 tgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 6874440  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6874439 accttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtat 6874340  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874339 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 6874311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 9548371 - 9548699
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9548371 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 9548470  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9548471 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctga 9548570  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9548571 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtat 9548670  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9548671 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 9548699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5638243 - 5637916
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  5638243 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttccctt 5638144  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5638143 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5638044  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5638043 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5637944  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637943 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 5637916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 23752278 - 23752606
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23752278 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 23752377  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23752378 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctga 23752477  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23752478 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 23752577  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23752578 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 23752606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30168803 - 30168475
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||    
T  30168803 aggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttccct 30168704  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30168703 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctga 30168604  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30168603 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 30168504  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30168503 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 30168475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 18500558 - 18500869
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  18500558 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 18500657  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18500658 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 18500757  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18500758 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 18500857  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  18500858 aggaggaaaagt 18500869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31431774 - 31431455
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31431774 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 31431675  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431674 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 31431575  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  31431574 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 31431475  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctag 325  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  31431474 aggaggaaaagttggcctag 31431455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11549688 - 11549360
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11549688 aggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 11549589  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11549588 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 11549489  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11549488 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 11549389  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11549388 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 11549360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 22998942 - 22999270
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22998942 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 22999041  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22999042 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctga 22999141  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22999142 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 22999241  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22999242 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 22999270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 23717816 - 23718144
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23717816 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 23717915  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23717916 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 23718015  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23718016 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 23718115  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23718116 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 23718144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28649569 - 28649258
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28649569 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 28649470  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28649469 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 28649370  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  28649369 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 28649270  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  28649269 aggaggaaaagt 28649258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33516689 - 33516362
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  33516689 ggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccct 33516590  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33516589 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaa 33516490  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||| | |||||     
T  33516489 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtata 33516390  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33516389 ggaggaaaagtaggcctagcttgctgat 33516362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34616852 - 34616532
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  34616852 aggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 34616753  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616752 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 34616653  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  34616652 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 34616553  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||| ||||| || |||||    
T  34616552 aggaggaaaagttggtctagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37755314 - 37755003
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  37755314 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 37755215  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37755214 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 37755115  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  37755114 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 37755015  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  37755014 aggaggaaaagt 37755003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 18375240 - 18375568
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18375240 aggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 18375339  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375340 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 18375439  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  18375440 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtat 18375539  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18375540 aggaggaaaagtaggtctagcttgctgat 18375568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30934967 - 30934639
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30934967 aggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 30934868  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30934867 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 30934768  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30934767 acctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 30934668  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30934667 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 30934639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33777821 - 33777493
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33777821 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 33777722  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  33777721 tgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctga 33777622  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33777621 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 33777522  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33777521 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 33777493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 37671311 - 37671622
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  37671311 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccc 37671410  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37671411 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 37671510  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  37671511 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 37671610  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  37671611 aggaggaaaagt 37671622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Original strand, 37358471 - 37358746
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  37358471 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttccct 37358570  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358571 tgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 37358670  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  37358671 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaag 37358746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 24687985 - 24688313
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24687985 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 24688084  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  24688085 tgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctga 24688184  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  24688185 acctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtat 24688284  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24688285 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 24688313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Original strand, 37770818 - 37771126
Alignment:
Q  9 agcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  37770818 agcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctga 37770917  T
Q  109 tcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacc 208  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37770918 tcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacc 37771017  T
Q  209 ttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcgg 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  37771018 ttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtatagg 37771117  T
Q  309 agggaaagt 317  Q
    ||| |||||    
T  37771118 aggaaaagt 37771126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Original strand, 31826235 - 31826510
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31826235 aggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 31826334  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31826335 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 31826434  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31826435 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaag 31826510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43078586 - 43078311
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43078586 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 43078487  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43078486 tgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 43078387  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43078386 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaag 43078311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24970352 - 24970024
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  24970352 aggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttcct 24970253  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  24970252 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctga 24970153  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24970152 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 24970053  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24970052 cggagggaaagtaggtctagcttgttgat 24970024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3789875 - 3789600
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3789875 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 3789776  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789775 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 3789676  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  3789675 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaag 3789600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 29966895 - 29967222
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29966895 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 29966994  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29966995 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 29967094  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||     
T  29967095 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtata 29967194  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  29967195 ggagggaaggttggcctggcttgctgat 29967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30029748 - 30029421
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30029748 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 30029649  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029648 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 30029549  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||     
T  30029548 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtata 30029449  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  30029448 ggagggaaggttggcctggcttgctgat 30029421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 40473377 - 40473688
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  40473377 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 40473476  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  40473477 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 40473576  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40473577 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 40473676  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  40473677 aggaggaaaagt 40473688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 326
Target Start/End: Original strand, 28959621 - 28959934
Alignment:
Q  13 tcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28959621 tcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaa 28959720  T
Q  113 tgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgg 212  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28959721 tgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgg 28959820  T
Q  213 aggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggaggg 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | ||||| |||||     
T  28959821 aggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagga 28959920  T
Q  313 aaagtaggcctagc 326  Q
    ||||| || |||||    
T  28959921 aaagttggtctagc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24681774 - 24681463
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  24681774 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 24681675  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  24681674 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 24681575  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24681574 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 24681475  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  24681474 aggaggaaaagt 24681463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24724301 - 24723990
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  24724301 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 24724202  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  24724201 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 24724102  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24724101 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 24724002  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  24724001 aggaggaaaagt 24723990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Original strand, 13324657 - 13324932
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13324657 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 13324756  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13324757 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcgga 13324856  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  13324857 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaag 13324932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 32599304 - 32599620
Alignment:
Q  10 gcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32599304 gcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgat 32599403  T
Q  110 caatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32599404 caatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacct 32599503  T
Q  210 tggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcgga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||| | ||||| |||    
T  32599504 tggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtatagga 32599603  T
Q  310 gggaaagtaggcctagc 326  Q
    || ||||| || |||||    
T  32599604 ggaaaagttggtctagc 32599620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41675021 - 41674715
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| || |    
T  41675021 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacga 41674922  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41674921 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcagg 41674822  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagct 327  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41674821 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagct 41674722  T
Q  328 tgctgat 334  Q
    |||||||    
T  41674721 tgctgat 41674715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 29888911 - 29889233
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29888911 ggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttcctt 29889010  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||| |||| ||||||| |||    
T  29889011 gatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaa 29889110  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || || || || ||||||||  | ||||  ||||| || | ||||||||| ||| | ||||||    
T  29889111 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatc 29889210  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  29889211 agaggaaaggtaggtctagcttg 29889233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22888804 - 22888476
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22888804 aggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 22888705  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | ||    
T  22888704 tgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgga 22888605  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | | ||  || || || ||||||||||| ||| | |||||    
T  22888604 acctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtat 22888505  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22888504 cggagggaaggtaggtctagcttgttgat 22888476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23892539 - 23892212
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23892539 ggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcctt 23892440  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || |  |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| || |||| |||    
T  23892439 gatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaa 23892340  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || ||||||||||| ||||| |   | ||||||    
T  23892339 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatc 23892240  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  23892239 ggaggaaaggtaggtctagcttgttgat 23892212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25199341 - 25199035
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199341 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 25199242  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  25199241 tgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcagg 25199142  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagct 327  Q
    ||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || ||||| ||||| ||| | ||||||||||  || ||||| ||||||    
T  25199141 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagct 25199042  T
Q  328 tgctgat 334  Q
    || ||||    
T  25199041 tgttgat 25199035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33292837 - 33292539
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  33292837 atcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 33292738  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||| || || || ||    
T  33292737 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 33292638  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagc 326  Q
    ||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  33292637 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33877580 - 33877261
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  33877580 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 33877481  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  33877480 ggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 33877381  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  33877380 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 33877281  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  33877280 agaggaaaggtaggtctagc 33877261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11326127 - 11325808
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || |||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  11326127 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 11326028  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| || || | |||    
T  11326027 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaa 11325928  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  11325927 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 11325828  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  11325827 agaggaaaggtaggtctagc 11325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 13184477 - 13184796
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  13184477 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 13184576  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  13184577 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 13184676  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  13184677 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 13184776  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  13184777 agaggaaaggtaggtctagc 13184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 13440323 - 13440557
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  13440323 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 13440422  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  13440423 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 13440522  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccct 241  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  13440523 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccct 13440557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 16736277 - 16736605
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16736277 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 16736376  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16736377 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 16736476  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16736477 accttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 16736576  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736577 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 16736605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 16751331 - 16751659
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16751331 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 16751430  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16751431 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 16751530  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16751531 accttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 16751630  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751631 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 16751659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17523858 - 17523530
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17523858 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 17523759  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17523758 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 17523659  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17523658 accttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 17523559  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523558 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 17523530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 17529357 - 17529685
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17529357 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 17529456  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17529457 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 17529556  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17529557 accttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 17529656  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529657 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 17529685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 4144941 - 4145268
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4144941 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 4145040  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145041 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 4145140  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4145141 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 4145240  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145241 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 4145268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9618976 - 9618649
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9618976 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 9618877  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9618876 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 9618777  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9618776 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 9618677  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9618676 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 9618649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 26319687 - 26320014
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26319687 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 26319786  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319787 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 26319886  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26319887 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 26319986  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319987 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 26320014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45387668 - 45387341
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45387668 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 45387569  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45387568 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 45387469  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45387468 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 45387369  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387368 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 45387341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 26274912 - 26275239
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26274912 ggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 26275011  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275012 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 26275111  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26275112 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 26275211  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275212 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 26275239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 26669732 - 26670059
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26669732 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 26669831  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26669832 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 26669931  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26669932 ccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 26670031  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670032 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 26670059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 5147157 - 5147485
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  5147157 aggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 5147256  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5147257 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 5147356  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5147357 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 5147456  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5147457 cggaggaaaagtaggtctagcttgttgat 5147485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 11424593 - 11424921
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11424593 aggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 11424692  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11424693 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 11424792  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11424793 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 11424892  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11424893 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 11424921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 31564207 - 31564518
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31564207 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 31564306  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564307 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 31564406  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  31564407 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 31564506  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  31564507 aggaggaaaagt 31564518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2154899 - 2154571
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2154899 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 2154800  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2154799 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 2154700  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2154699 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 2154600  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2154599 cggagggaaagtatgtctagcttgctgat 2154571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5128318 - 5127990
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5128318 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 5128219  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5128218 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 5128119  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5128118 accttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 5128019  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5128018 cggaggaaaagtaggtctagcttgctgat 5127990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 10916685 - 10917013
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10916685 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 10916784  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10916785 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 10916884  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10916885 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 10916984  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10916985 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 10917013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 26537687 - 26537998
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  26537687 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 26537786  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26537787 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctga 26537886  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26537887 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 26537986  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  26537987 aggaggaaaagt 26537998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 16518233 - 16518561
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16518233 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttcct 16518332  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  16518333 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctga 16518432  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16518433 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 16518532  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16518533 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 16518561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26435583 - 26435255
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  26435583 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 26435484  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26435483 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 26435384  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  26435383 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 26435284  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  26435283 aggaggaaaagttggtctagcttgctgat 26435255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 16503197 - 16503525
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16503197 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 16503296  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  16503297 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctga 16503396  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16503397 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 16503496  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16503497 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 16503525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 24592358 - 24592686
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24592358 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 24592457  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592458 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 24592557  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| |||||||    
T  24592558 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtat 24592657  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24592658 aggagggaaggttggcctggcttgctgat 24592686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3445632 - 3445357
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3445632 aggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 3445533  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3445532 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 3445433  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3445432 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaag 3445357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11441898 - 11441623
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11441898 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 11441799  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11441798 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 11441699  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11441698 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaag 11441623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31125246 - 31124971
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31125246 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 31125147  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31125146 tgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 31125047  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31125046 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaag 31124971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 2108823 - 2109145
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  2108823 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 2108922  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  2108923 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 2109022  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  2109023 cctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatc 2109122  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  2109123 agaggaaaggtaggtctagcttg 2109145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26485019 - 26484697
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  26485019 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 26484920  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  26484919 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 26484820  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  26484819 cctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 26484720  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  26484719 agaggaaaggtaggtctagcttg 26484697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 39210841 - 39211163
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  39210841 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 39210940  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  39210941 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 39211040  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  39211041 cctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 39211140  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  39211141 agaggaaaggtaggtctagcttg 39211163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 16449816 - 16450138
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  16449816 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccct 16449915  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||    
T  16449916 gatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaa 16450015  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || ||||| ||||||| | | ||||||    
T  16450016 cctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatc 16450115  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  16450116 ggaggaaaggtaggtctagcttg 16450138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16041648 - 16041321
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  16041648 ggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccct 16041549  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| || || ||||| | |||    
T  16041548 gatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaa 16041449  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16041448 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatc 16041349  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16041348 ggagggaaggtaggtctagcttgttgat 16041321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2775684 - 2775365
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  2775684 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 2775585  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  2775584 ggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 2775485  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||  || || ||| |||||||||||| | | ||||||    
T  2775484 cctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatc 2775385  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  2775384 agaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18541103 - 18540802
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  18541103 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 18541004  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||| || || || ||    
T  18541003 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 18540904  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagct 327  Q
    ||| ||||| ||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  18540903 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagct 18540804  T
Q  328 tg 329  Q
    ||    
T  18540803 tg 18540802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5159820 - 5159525
Alignment:
Q  31 atattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatat 130  Q
    |||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  5159820 atattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgt 5159721  T
Q  131 acttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 230  Q
    |||| | |||||| |||||||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  5159720 actttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtgg 5159621  T
Q  231 gggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  5159620 aggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 5159525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4200872 - 4200685
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  4200872 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 4200773  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgag 194  Q
    | | |||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  4200772 ggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 4200685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 31088282 - 31088601
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  31088282 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 31088381  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  31088382 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 31088481  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  31088482 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 31088581  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  31088582 agaggaaaggtaggtctagc 31088601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45733785 - 45733551
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  45733785 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 45733686  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  45733685 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 45733586  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccct 241  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  45733585 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccct 45733551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 194
Target Start/End: Original strand, 26682818 - 26683005
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26682818 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 26682917  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgag 194  Q
    | || ||||| || || | ||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  26682918 ggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgag 26683005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5006213 - 5005885
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5006213 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttccct 5006114  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5006113 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 5006014  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5006013 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 5005914  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5005913 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 5005885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 14763235 - 14763563
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  14763235 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 14763334  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14763335 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 14763434  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14763435 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 14763534  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14763535 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 14763563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 27163248 - 27163576
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27163248 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 27163347  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27163348 tgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctga 27163447  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27163448 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 27163547  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163548 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 27163576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 40105570 - 40105897
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40105570 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 40105669  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105670 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 40105769  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||    
T  40105770 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatc 40105869  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105870 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 40105897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6570193 - 6569865
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6570193 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 6570094  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6570093 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 6569994  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  6569993 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 6569894  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6569893 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 6569865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 24592245 - 24592573
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24592245 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 24592344  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24592345 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 24592444  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24592445 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 24592544  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24592545 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 24592573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 18800544 - 18800855
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18800544 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 18800643  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18800644 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctga 18800743  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  18800744 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 18800843  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  18800844 aggaggaaaagt 18800855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 31126450 - 31126777
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31126450 ggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccct 31126549  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31126550 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 31126649  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||     
T  31126650 ccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtata 31126749  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31126750 ggaggaaaagtaggcctagcttgctgat 31126777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14665358 - 14665030
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||    
T  14665358 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttcct 14665259  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14665258 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 14665159  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14665158 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 14665059  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14665058 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 14665030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17014340 - 17014012
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17014340 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 17014241  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  17014240 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctga 17014141  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17014140 acctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 17014041  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17014040 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 17014012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14098880 - 14098553
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14098880 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 14098781  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14098780 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaa 14098681  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||     
T  14098680 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtata 14098581  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14098580 ggaggaaaagtaggtctagcttgctgat 14098553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30754094 - 30753819
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30754094 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 30753995  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30753994 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 30753895  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30753894 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaag 30753819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 54833727 - 54833416
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  54833727 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 54833628  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54833627 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 54833528  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  54833527 accttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtat 54833428  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  54833427 aggaggaaaagt 54833416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 33673729 - 33674040
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  33673729 aggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 33673828  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33673829 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 33673928  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  33673929 accttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 33674028  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  33674029 aggaggaaaagt 33674040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 36344446 - 36344757
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  36344446 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 36344545  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36344546 tgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 36344645  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  36344646 acctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtat 36344745  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  36344746 aggaggaaaagt 36344757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39850978 - 39850667
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  39850978 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 39850879  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  39850878 tgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 39850779  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39850778 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 39850679  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  39850678 aggaggaaaagt 39850667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21970041 - 21969713
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  21970041 aggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 21969942  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  21969941 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 21969842  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  21969841 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 21969742  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21969741 aggaggaaaagtaggcctagcttgctgat 21969713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 326
Target Start/End: Original strand, 34188913 - 34189211
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  34188913 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 34189012  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||| || || || ||    
T  34189013 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 34189112  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagc 326  Q
    ||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  34189113 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34189211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24112980 - 24112682
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  24112980 atcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacga 24112881  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||| || || || ||    
T  24112880 tgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccgg 24112781  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagc 326  Q
    ||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24112780 tggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 24112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 15284860 - 15285116
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15284860 ggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 15284959  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||    
T  15284960 ggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaa 15285059  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctct 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||    
T  15285060 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 15285116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15228188 - 15227887
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15228188 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaa 15228089  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  15228088 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcagg 15227989  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagct 327  Q
    ||| ||||| ||||  || |||||||| ||||||||  | ||||  || || || ||||| ||||||| | | ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  15227988 tggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 15227889  T
Q  328 tg 329  Q
    ||    
T  15227888 tg 15227887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1900596 - 1900269
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1900596 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttcctt 1900497  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||    
T  1900496 gatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaa 1900397  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||  || |||||||||||||||| ||||| || |  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || ||||| ||||| | | | ||||||    
T  1900396 cctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatc 1900297  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  1900296 ggaggaaaggtaggtctagcttgttgat 1900269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 14235478 - 14235711
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  14235478 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttctttacaa 14235577  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||  |   |||||| |||||||| || | |||    
T  14235578 tgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttagg 14235677  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccct 261  Q
    ||| ||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  14235678 tggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccct 14235711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Original strand, 15391288 - 15391504
Alignment:
Q  25 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttca 124  Q
    |||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |    
T  15391288 tcgatcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttcttta 15391387  T
Q  125 caatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| || |  ||||| ||||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |     
T  15391388 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggtt 15391487  T
Q  225 aggtgggggcttgccct 241  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  15391488 aggtggaggcttcccct 15391504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 24460537 - 24460856
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  24460537 ggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 24460636  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  24460637 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 24460736  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  24460737 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 24460836  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  24460837 agaggaaaggtaggtctagc 24460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 21677102 - 21677430
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21677102 aggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 21677201  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677202 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 21677301  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21677302 accttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 21677401  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677402 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 21677430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 11635106 - 11635434
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11635106 aggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 11635205  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11635206 tgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 11635305  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11635306 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 11635405  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11635406 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 11635434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34862000 - 34861673
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34862000 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 34861901  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34861900 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 34861801  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34861800 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 34861701  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861700 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 34861673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 11641295 - 11641623
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11641295 aggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 11641394  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11641395 tgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 11641494  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11641495 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtat 11641594  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11641595 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 11641623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 37685830 - 37686157
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37685830 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 37685929  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37685930 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 37686029  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37686030 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 37686129  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686130 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 37686157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 37701095 - 37701422
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37701095 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 37701194  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37701195 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 37701294  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37701295 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 37701394  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701395 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 37701422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32050119 - 32049791
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  32050119 aggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 32050020  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32050019 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctga 32049920  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32049919 accttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 32049820  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049819 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 32049791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 23128486 - 23128814
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23128486 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 23128585  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23128586 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 23128685  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23128686 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 23128785  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23128786 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 23128814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28882535 - 28882207
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28882535 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 28882436  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28882435 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 28882336  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28882335 acctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 28882236  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28882235 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 28882207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37925813 - 37925486
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37925813 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 37925714  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37925713 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaa 37925614  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37925613 ccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatc 37925514  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925513 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 37925486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12655863 - 12655535
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12655863 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 12655764  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12655763 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 12655664  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12655663 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 12655564  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12655563 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 12655535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 22925949 - 22926276
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22925949 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 22926048  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22926049 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaa 22926148  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22926149 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 22926248  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926249 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 22926276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34286656 - 34286347
Alignment:
Q  25 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttca 124  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34286656 tcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttca 34286557  T
Q  125 caatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286556 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 34286457  T
Q  225 aggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggccta 324  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  34286456 aggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtcta 34286357  T
Q  325 gcttgctgat 334  Q
    ||||||||||    
T  34286356 gcttgctgat 34286347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34291716 - 34291407
Alignment:
Q  25 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttca 124  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34291716 tcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttca 34291617  T
Q  125 caatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291616 cgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 34291517  T
Q  225 aggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggccta 324  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  34291516 aggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtcta 34291417  T
Q  325 gcttgctgat 334  Q
    ||||||||||    
T  34291416 gcttgctgat 34291407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 16829259 - 16829586
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16829259 ggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccct 16829358  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16829359 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaa 16829458  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||| | |||||     
T  16829459 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtata 16829558  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16829559 ggaggaaaagtaggcctagcttgctgat 16829586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16892222 - 16891895
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16892222 ggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccct 16892123  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16892122 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaa 16892023  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||| | |||||     
T  16892022 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtata 16891923  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16891922 ggaggaaaagtaggcctagcttgctgat 16891895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20838239 - 20837911
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20838239 aggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 20838140  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||| || || |||||||    
T  20838139 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctga 20838040  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20838039 acctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 20837940  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20837939 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 20837911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39890395 - 39890075
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  39890395 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 39890296  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39890295 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctga 39890196  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  39890195 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtat 39890096  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||| ||||| || |||||    
T  39890095 aggaggaaaagttggtctagc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 333
Target Start/End: Original strand, 13936464 - 13936791
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13936464 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 13936563  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  13936564 tgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 13936663  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13936664 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 13936763  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctga 333  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||    
T  13936764 cggagggaaagtaggtctggcttgctga 13936791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31876601 - 31876274
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31876601 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 31876502  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31876501 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 31876402  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || || || ||| | |||||     
T  31876401 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtata 31876302  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31876301 ggaggaaaagtaggcctagcttgctgat 31876274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 27434364 - 27434692
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27434364 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 27434463  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  27434464 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctga 27434563  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27434564 acttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtat 27434663  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27434664 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 27434692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 19416420 - 19416747
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19416420 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccctt 19416519  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19416520 gatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 19416619  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| |||||||     
T  19416620 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtata 19416719  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19416720 ggagggaaagttggcctggcttgctgat 19416747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27777543 - 27777232
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  27777543 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 27777444  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  27777443 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 27777344  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27777343 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 27777244  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  27777243 aggaggaaaagt 27777232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27817301 - 27816990
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  27817301 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 27817202  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  27817201 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 27817102  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27817101 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 27817002  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  27817001 aggaggaaaagt 27816990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 12716522 - 12716833
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12716522 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 12716621  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  12716622 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 12716721  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12716722 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 12716821  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  12716822 aggaggaaaagt 12716833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27804028 - 27803717
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  27804028 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 27803929  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  27803928 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 27803829  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27803828 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 27803729  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  27803728 aggaggaaaagt 27803717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 79 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34279697 - 34279442
Alignment:
Q  79 acattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgat 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34279697 acattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgat 34279598  T
Q  179 gaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttgg 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34279597 gaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttgg 34279498  T
Q  279 aagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34279497 aagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgat 34279442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37375482 - 37375171
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  37375482 aggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 37375383  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37375382 tgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 37375283  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  37375282 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtat 37375183  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  37375182 aggaggaaaagt 37375171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 39051742 - 39052053
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  39051742 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 39051841  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  39051842 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 39051941  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39051942 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 39052041  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  39052042 aggaggaaaagt 39052053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Original strand, 260673 - 260948
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||     
T  260673 aggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccc 260772  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  260773 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 260872  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  260873 accttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaag 260948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12587131 - 12586820
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12587131 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 12587032  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  12587031 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 12586932  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12586931 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtat 12586832  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  12586831 aggaggaaaagt 12586820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40233832 - 40233521
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  40233832 aggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 40233733  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  40233732 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccgga 40233633  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| | |||||    
T  40233632 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtat 40233533  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  40233532 aggaggaaaagt 40233521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 317
Target Start/End: Original strand, 9349903 - 9350213
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  9349903 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 9350002  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  9350003 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaa 9350102  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||||||||| || || || ||||| |||||||| |  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9350103 ccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtata 9350202  T
Q  307 ggagggaaagt 317  Q
    ||||| |||||    
T  9350203 ggaggaaaagt 9350213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 21703085 - 21703412
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  21703085 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccct 21703184  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || | |||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  21703185 gatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 21703284  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  21703285 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatc 21703384  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  21703385 ggagggaaggtaggtctagcttgttgat 21703412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 31891249 - 31891571
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || || || ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  31891249 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttcctt 31891348  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31891349 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 31891448  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  31891449 ccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 31891548  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  31891549 agaggaaaggtaggtctagcttg 31891571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 19456342 - 19456664
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19456342 ggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 19456441  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||  | || ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  19456442 ggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 19456541  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || ||||| ||||||| | | ||||||    
T  19456542 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatc 19456641  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  19456642 ggaggaaaggtaggtctagcttg 19456664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27119008 - 27118686
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  27119008 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 27118909  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  27118908 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 27118809  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||| ||| ||||||||    
T  27118808 cttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatc 27118709  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
    |||||||| ||||| ||||||||    
T  27118708 ggagggaaggtaggtctagcttg 27118686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27393271 - 27393055
Alignment:
Q  25 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttca 124  Q
    |||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27393271 tcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttta 27393172  T
Q  125 caatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| || |  ||||| ||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |     
T  27393171 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggtt 27393072  T
Q  225 aggtgggggcttgccct 241  Q
    |||||| ||||||||||    
T  27393071 aggtggaggcttgccct 27393055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 34303224 - 34303546
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  34303224 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 34303323  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  34303324 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 34303423  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  34303424 cttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 34303523  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  34303524 agaggaaaggtaggtctagcttg 34303546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3784974 - 3784655
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  3784974 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 3784875  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  3784874 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 3784775  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  3784774 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 3784675  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  3784674 agaggaaaggtaggtctagc 3784655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16163919 - 16163600
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16163919 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 16163820  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || ||| |||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  16163819 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 16163720  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  16163719 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 16163620  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  16163619 agaggaaaggtaggtctagc 16163600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34157330 - 34157012
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  34157330 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 34157231  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  34157230 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 34157132  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  34157131 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 34157032  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  34157031 agaggaaaggtaggtctagc 34157012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 8997 - 9325
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8997 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 9096  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9097 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctga 9196  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9197 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 9296  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9297 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 9325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20340 - 20012
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20340 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 20241  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20240 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctga 20141  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20140 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 20041  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20040 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 20012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 41793239 - 41793567
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  41793239 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 41793338  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41793339 tgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 41793438  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41793439 accttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 41793538  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793539 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 41793567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10962993 - 10962666
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10962993 ggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 10962894  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962893 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 10962794  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10962793 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 10962694  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962693 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 10962666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28585304 - 28584977
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28585304 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 28585205  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28585204 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaa 28585105  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28585104 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 28585005  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28585004 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 28584977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51638542 - 51638214
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  51638542 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 51638443  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51638442 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 51638343  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  51638342 accttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 51638243  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51638242 cgaagggaaagtaggcctagcttgctgat 51638214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 20340267 - 20340594
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20340267 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttcctt 20340366  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  20340367 ggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 20340466  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||  | ||||||||  | ||||  ||||| || | ||| ||||||| | | ||||||    
T  20340467 cctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatc 20340566  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  20340567 ggaggaaaggtaggtctagcttgctgat 20340594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 16207963 - 16208290
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    ||||||| |||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16207963 ggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcctt 16208062  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  16208063 gatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 16208162  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || ||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || ||||| | ||| ||| | ||||||    
T  16208163 cctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatc 16208262  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  16208263 ggaggaaaggtaggtctagcttgttgat 16208290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28152185 - 28151863
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  28152185 ggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 28152086  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||     
T  28152085 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggag 28151986  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  28151985 cctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 28151886  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  28151885 agaggaaaggtaggtctagcttg 28151863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20461383 - 20461082
Alignment:
Q  28 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaa 127  Q
    ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  20461383 atcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaa 20461284  T
Q  128 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 227  Q
    | ||||||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20461283 tgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcagg 20461184  T
Q  228 tgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagct 327  Q
    ||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || ||||| ||||||| | |  |||||||||| || ||||| ||||||    
T  20461183 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagct 20461084  T
Q  328 tg 329  Q
    ||    
T  20461083 tg 20461082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 7171 - 7498
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7171 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 7270  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7271 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 7370  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7371 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 7470  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16750176 - 16749848
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16750176 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 16750077  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16750076 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 16749977  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16749976 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 16749877  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16749876 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 16749848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 24304492 - 24304820
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24304492 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 24304591  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24304592 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 24304691  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24304692 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 24304791  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24304792 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 24304820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24864039 - 24863711
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24864039 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 24863940  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24863939 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 24863840  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24863839 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 24863740  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24863739 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 24863711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4758086 - 4757775
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4758086 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 4757987  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757986 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 4757887  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  4757886 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 4757787  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  4757786 aggaggaaaagt 4757775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27000395 - 27000067
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27000395 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 27000296  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27000295 tgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 27000196  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27000195 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtat 27000096  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27000095 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 27000067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28207776 - 28207457
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28207776 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 28207677  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207676 tgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 28207577  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  28207576 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 28207477  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctag 325  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  28207476 aggaggaaaagttggcctag 28207457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26989323 - 26988995
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26989323 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 26989224  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26989223 tgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 26989124  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26989123 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 26989024  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26989023 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 26988995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 30557891 - 30558218
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  30557891 ggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccct 30557990  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30557991 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaa 30558090  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||| | |||||     
T  30558091 ccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtata 30558190  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30558191 ggaggaaaagtaggcctagcttgctgat 30558218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 13298825 - 13299153
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13298825 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 13298924  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||| |||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13298925 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 13299024  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13299025 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 13299124  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13299125 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 13299153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 15424191 - 15424519
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15424191 aggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttcct 15424290  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15424291 tgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 15424390  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15424391 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 15424490  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15424491 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 15424519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26918702 - 26918374
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26918702 aggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 26918603  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26918602 tgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 26918503  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26918502 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 26918403  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26918402 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 26918374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4525608 - 4525297
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  4525608 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccc 4525509  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4525508 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctga 4525409  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  4525408 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 4525309  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  4525308 aggaggaaaagt 4525297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Original strand, 4545649 - 4545968
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  4545649 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccc 4545748  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545749 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 4545848  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  4545849 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 4545948  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctag 325  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  4545949 aggaggaaaagttggcctag 4545968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Original strand, 4724008 - 4724327
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  4724008 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccc 4724107  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724108 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 4724207  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  4724208 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 4724307  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctag 325  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  4724308 aggaggaaaagttggcctag 4724327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4773328 - 4773017
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4773328 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 4773229  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773228 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 4773129  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  4773128 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 4773029  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  4773028 aggaggaaaagt 4773017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 34463220 - 34463531
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34463220 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 34463319  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34463320 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 34463419  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34463420 accttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtat 34463519  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  34463520 aggaggaaaagt 34463531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3696403 - 3696092
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3696403 aggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 3696304  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3696303 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctga 3696204  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  3696203 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 3696104  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  3696103 aggaggaaaagt 3696092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 27359866 - 27360177
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27359866 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 27359965  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27359966 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 27360065  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| |||||||    
T  27360066 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtat 27360165  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  27360166 aggaggaaaagt 27360177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 27450209 - 27450520
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27450209 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 27450308  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450309 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 27450408  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| |||||||    
T  27450409 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtat 27450508  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  27450509 aggaggaaaagt 27450520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29573334 - 29573007
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29573334 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 29573235  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29573234 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 29573135  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||     
T  29573134 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtata 29573035  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  29573034 ggaggaaaagttggtctagcttgctgat 29573007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29549798 - 29549477
Alignment:
Q  5 caggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29549798 caggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcc 29549699  T
Q  105 ttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29549698 ttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctg 29549599  T
Q  205 aaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||    
T  29549598 aaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggta 29549499  T
Q  305 tcggagggaaagtaggcctagc 326  Q
    | ||||| ||||| || |||||    
T  29549498 taggaggaaaagttggtctagc 29549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 22934754 - 22935082
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  22934754 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttcct 22934853  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  22934854 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctga 22934953  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22934954 acctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 22935053  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22935054 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 22935082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 23857199 - 23857527
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  23857199 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttcct 23857298  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  23857299 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctga 23857398  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23857399 acctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 23857498  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23857499 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 23857527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29501737 - 29501429
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29501737 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 29501638  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501637 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 29501538  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  29501537 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtat 29501438  T
Q  306 cggagggaa 314  Q
     ||||||||    
T  29501437 aggagggaa 29501429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 26116284 - 26116595
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26116284 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 26116383  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26116384 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 26116483  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||| |||||||    
T  26116484 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtat 26116583  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  26116584 aggaggaaaagt 26116595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27044710 - 27044398
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27044710 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 27044611  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataa-cacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctg 204  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27044610 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctg 27044511  T
Q  205 aaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggta 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||    
T  27044510 aaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggta 27044411  T
Q  305 tcggagggaaagt 317  Q
    | ||||| |||||    
T  27044410 taggaggaaaagt 27044398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27485451 - 27485176
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27485451 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 27485352  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27485351 tgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 27485252  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27485251 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaag 27485176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Original strand, 26777495 - 26777797
Alignment:
Q  12 ttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26777495 ttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatca 26777594  T
Q  112 atgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttg 211  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777595 atgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttg 26777694  T
Q  212 gaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagg 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| ||||||| |||||    
T  26777695 gaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagg 26777794  T
Q  312 gaa 314  Q
    |||    
T  26777795 gaa 26777797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16674461 - 16674150
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16674461 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 16674362  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16674361 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 16674262  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  16674261 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtat 16674162  T
Q  306 cggagggaaagt 317  Q
     ||||| |||||    
T  16674161 aggaggaaaagt 16674150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 16943902 - 16944229
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16943902 ggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 16944001  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16944002 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 16944101  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| |||||||     
T  16944102 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtata 16944201  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16944202 ggagggaaggttggcctggcttgctgat 16944229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27008049 - 27007774
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27008049 aggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 27007950  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27007949 tggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctga 27007850  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  27007849 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaag 27007774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 27272454 - 27272782
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  27272454 aggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttccct 27272553  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || || ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  27272554 tgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctga 27272653  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27272654 acctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 27272753  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  27272754 cggagggaaagtaggtctgacttgctgat 27272782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17025599 - 17025324
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17025599 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccc 17025500  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  17025499 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 17025400  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaag 281  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||  ||||||||    
T  17025399 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttggaag 17025324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20161023 - 20160704
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| | |    
T  20161023 aggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccat 20160924  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || | ||    
T  20160923 tggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacaga 20160824  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  20160823 acctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtat 20160724  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctag 325  Q
    |||||| || ||||| ||||    
T  20160723 cggaggaaaggtaggtctag 20160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Original strand, 22171808 - 22172127
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| | |    
T  22171808 aggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccat 22171907  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || | ||    
T  22171908 tggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacaga 22172007  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  22172008 acctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtat 22172107  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctag 325  Q
    |||||| || ||||| ||||    
T  22172108 cggaggaaaggtaggtctag 22172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 14143160 - 14143482
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  14143160 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 14143259  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  14143260 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 14143359  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||  || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  14143360 cctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 14143459  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  14143460 agaggaaaggtaggtctagcttg 14143482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26788265 - 26787943
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  26788265 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 26788166  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  26788165 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 26788066  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||  || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  26788065 cctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 26787966  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  26787965 agaggaaaggtaggtctagcttg 26787943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27196638 - 27196316
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  27196638 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 27196539  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  27196538 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 27196439  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||  || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  27196438 cctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 27196339  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  27196338 agaggaaaggtaggtctagcttg 27196316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 27252602 - 27252924
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  27252602 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 27252701  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  27252702 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 27252801  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||  || ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||| | | ||||||    
T  27252802 cctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 27252901  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  27252902 agaggaaaggtaggtctagcttg 27252924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 328
Target Start/End: Original strand, 27290244 - 27290566
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27290244 aggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcct 27290343  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | ||    
T  27290344 tgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgga 27290443  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    || | ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||  | ||||||||  | ||||  || || |||||||||||||||||| | |||||    
T  27290444 acttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtat 27290543  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagctt 328  Q
    | |||| || ||||| |||||||    
T  27290544 cagaggaaaggtaggtctagctt 27290566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 22456809 - 22457043
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22456809 ggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttcctt 22456908  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| | |||    
T  22456909 ggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaa 22457008  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccct 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22457009 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccct 22457043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 13521948 - 13522267
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  13521948 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 13522047  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  13522048 ggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 13522147  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  13522148 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 13522247  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  13522248 agaggaaaggtaggtctagc 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 27629578 - 27629894
Alignment:
Q  10 gcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgat 109  Q
    ||||| ||| || |||| ||||| || || || ||||| | ||||||||| || || |||||||| |||  | | ||||||||||||| ||||||||| |    
T  27629578 gcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggt 27629677  T
Q  110 caatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacct 209  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||    
T  27629678 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacgtcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaacct 27629777  T
Q  210 tggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcgga 309  Q
    ||| || || ||||| || || ||| | ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||| || |||    
T  27629778 tggtggtaatggatctggcggaggcctaccctgcctagtcgtacaatgacctctctgaagtaatgttggaagtaaatcagcatacaacatcgggattgga 27629877  T
Q  310 gggaaagtaggcctagc 326  Q
    || ||||||||||||||    
T  27629878 ggaaaagtaggcctagc 27629894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 33374131 - 33374450
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  33374131 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttcctt 33374230  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  33374231 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 33374330  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  33374331 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 33374430  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  33374431 agaggaaaggtaggtctagc 33374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 8892186 - 8892504
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  8892186 ggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 8892285  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  8892286 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 8892384  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  8892385 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 8892484  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  8892485 agaggaaaggtaggtctagc 8892504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 8903421 - 8903739
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  8903421 ggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 8903520  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  8903521 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 8903619  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  8903620 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 8903719  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     |||| || ||||| |||||    
T  8903720 agaggaaaggtaggtctagc 8903739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 241
Target Start/End: Original strand, 22477240 - 22477382
Alignment:
Q  99 ctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatca 198  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| | |    
T  22477240 ctttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtta 22477339  T
Q  199 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccct 241  Q
    || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22477340 gaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccct 22477382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28162978 - 28162656
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  28162978 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 28162879  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| |||| || || || ||  ||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||    
T  28162878 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 28162779  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    | | |||||| | |||||| |||| ||||||||||  || ||||| || |||||| |  | ||||  || || || || |||||||||||| | ||||||    
T  28162778 cttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 28162679  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     |||| || ||||| ||||||||    
T  28162678 agaggaaaggtaggtctagcttg 28162656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 17092317 - 17092430
Alignment:
Q  9 agcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttga 108  Q
    |||||||||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||     
T  17092317 agcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctgg 17092416  T
Q  109 tcaatgagcttctt 122  Q
    ||||||||||||||    
T  17092417 tcaatgagcttctt 17092430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27617 - 27289
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27617 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 27518  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27517 tgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 27418  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27417 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtat 27318  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27317 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 27289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8274 - 7955
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8274 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttccct 8175  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8174 tgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 8075  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  8074 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtat 7975  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctag 325  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  7974 aggaggaaaagttggcctag 7955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 14861 - 15189
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14861 aggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 14960  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14961 tgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 15060  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  15061 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtat 15160  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15161 aggaggaaaagtaggtctagcttgctgat 15189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 46916 - 47244
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46916 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 47015  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47016 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 47115  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47116 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 47215  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47216 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 47244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 40000 - 40328
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40000 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 40099  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  40100 tgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctga 40199  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40200 acctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtat 40299  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40300 cggagggaaagtaggtctagcttgctgat 40328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30086 - 29760
Alignment:
Q  8 gagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttg 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30086 gagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttg 29987  T
Q  108 atcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaac 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || || || || |||||||||||||| |||||||||    
T  29986 atcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaac 29887  T
Q  208 cttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29886 cttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcg 29787  T
Q  308 gagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29786 gagggaaagtaggtctagcttgttgat 29760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30777 - 30450
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  30777 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 30678  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30677 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctga 30578  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  30577 accttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtat 30478  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30477 agga-ggaaagtaggtctagcttgctgat 30450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20711 - 20390
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| ||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20711 ggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaa-tttcctt 20613  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  20612 gatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 20513  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||  | ||||  || || || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  20512 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatc 20413  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
    || || || ||||| ||||||||    
T  20412 gggggaaaggtaggtctagcttg 20390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9891 - 9571
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9891 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccct 9792  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9791 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctga 9692  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||| ||| | |||||    
T  9691 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtat 9592  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagc 326  Q
     ||||| ||||| || |||||    
T  9591 aggaggaaaagttggtctagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 26133 - 26461
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26133 ggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttccctt 26232  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26233 gatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 26332  T
Q  207 cc-ttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtat 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| ||| | |||||    
T  26333 cctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtat 26432  T
Q  306 cggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26433 aggaggaaaagtaggcctagcttgctgat 26461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 60 - 389
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  60 aggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttcct 159  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  160 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctga 259  T
Q  206 accttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaact-cagcatataacctcggta 304  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  260 acttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcggta 359  T
Q  305 tcggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  360 tcggagggaaagtaggtctagcttgctgat 389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6339 - 6024
Alignment:
Q  6 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  6339 aggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccc 6240  T
Q  106 tgatcaatgagcttcttcacaatatacttc-aaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatg-aaagtcacatttgagatcagacct 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6239 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacct 6140  T
Q  204 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagt-aaggttggaagcaactcagcatat-aacctcg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6139 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaaagttggaagcaactcagcatataaacatcg 6040  T
Q  302 gtatcggagggaaagt 317  Q
    |||| ||||| |||||    
T  6039 gtataggaggaaaagt 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 1850 - 2083
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||| ||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  1850 ggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaa-tttcctt 1948  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  1949 gatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 2048  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccct 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049 cctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccct 2083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Original strand, 46756 - 47072
Alignment:
Q  29 tcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaa-gtcaacttt-ccttgatcaatgagcttcttcaca 126  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||     
T  46756 tcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacg 46855  T
Q  127 atatacttcaaagcataa-cacccctcgacatc-at--gacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacct-gaaccttggaggcaacgg 221  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  46856 atatacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacgg 46955  T
Q  222 atcaggtgggggc--ttgcccttgcta-gttgtacaatg-ccctctctggagtaa---ggttggaagcaactcagcatataacctc-ggtatcggaggg- 312  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||||   ||  ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||     
T  46956 atcaggtgggggcgtttgccctgtctaggttgtacaatgtccctctatggagtaaatcggggggaagcaactcagcatacaacatcgggtatcggaggga 47055  T
Q  313 aaagtaggcctagcttg 329  Q
    |||||||| ||||||||    
T  47056 aaagtaggtctagcttg 47072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 2590 - 2917
Alignment:
Q  7 ggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttcctt 106  Q
    |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2590 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttcctt 2689  T
Q  107 gatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 206  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||    
T  2690 ggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 2789  T
Q  207 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatc 306  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||  | ||||||||  | ||||  ||||| || | ||| ||||||| | | ||||||    
T  2790 cctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatc 2889  T
Q  307 ggagggaaagtaggcctagcttgctgat 334  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  2890 ggaggaaaggtaggtctagcttgctgat 2917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 410 - 94
Alignment:
Q  10 gcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgat 109  Q
    ||||| ||| || |||| ||||| || || || ||||| | ||||||||| || || |||||||| |||  | | ||||||||||||| ||||||||| |    
T  410 gcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggt 311  T
Q  110 caatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacct 209  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||    
T  310 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacgtcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaacct 211  T
Q  210 tggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgtacaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcgga 309  Q
    ||| || || ||||| || || ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||| || |||    
T  210 tggtggtaatggatctggcggaggcttaccctgcctagtcgtacaatgacctctctgaagtaatgttggaagtaaatcagcatacaacatcgggattgga 111  T
Q  310 gggaaagtaggcctagc 326  Q
    || ||||||||||||||    
T  110 ggaaaagtaggcctagc 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 329
Target Start/End: Original strand, 5 - 282
Alignment:
Q  52 ggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccct 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  5 ggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctt 104  T
Q  152 cgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgcccttgctagttgt 251  Q
    | ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||     
T  105 caacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttga 204  T
Q  252 acaatgccctctctggagtaaggttggaagcaactcagcatataacctcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 329  Q
     || ||||||||  | ||||  || || || ||||| ||||||| | | ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  205 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Original strand, 568 - 704
Alignment:
Q  25 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttca 124  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  568 tcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttta 667  T
Q  125 caatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatg 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  668 caatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatg 704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21867 - 21651
Alignment:
Q  25 tcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttca 124  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  21867 tcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttcttta 21768  T
Q  125 caatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatc 224  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  || || ||||| || || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | |     
T  21767 caatctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggtt 21668  T
Q  225 aggtgggggcttgccct 241  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21667 aggtggaggcttgccct 21651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University