View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13808_low_24 (Length: 371)

Name: NF13808_low_24
Description: NF13808
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13808_low_24
NF13808_low_24
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (1-371)||(6311173-6311549)
chr8 (9-371)||(36979262-36979628)
chr8 (9-371)||(4759921-4760288)
chr8 (25-371)||(30655543-30655897)
chr8 (25-371)||(33037654-33038001)
chr8 (9-371)||(18870407-18870772)
chr8 (8-371)||(18853013-18853382)
chr8 (1-301)||(7289831-7290136)
chr8 (10-371)||(10688986-10689354)
chr8 (1-301)||(25328184-25328487)
chr8 (1-286)||(39784744-39785033)
chr8 (86-371)||(1261803-1262089)
chr8 (8-286)||(35745274-35745556)
chr8 (8-246)||(10684224-10684467)
chr8 (89-336)||(31071111-31071362)
chr8 (89-204)||(26287866-26287985)
chr8 (89-204)||(26301123-26301242)
chr8 (89-204)||(26313117-26313236)
chr8 (124-207)||(26403240-26403327)
chr8 (124-205)||(4456028-4456113)
chr8 (90-205)||(7412305-7412426)
chr8 (124-207)||(23799587-23799674)
chr8 (124-205)||(19175766-19175851)
chr8 (250-336)||(26288020-26288105)
chr8 (250-336)||(26301277-26301362)
chr8 (250-336)||(26313271-26313356)
chr8 (124-204)||(4696609-4696693)
chr8 (127-207)||(6127224-6127308)
chr8 (126-185)||(9765852-9765914)
chr8 (124-204)||(19752407-19752491)
chr8 (124-207)||(5702493-5702580)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (48-371)||(31180138-31180464)
chr5 (1-371)||(30631283-30631657)
chr5 (1-301)||(1457067-1457371)
chr5 (1-283)||(43592154-43592441)
chr5 (1-283)||(27449689-27449976)
chr5 (1-283)||(43598599-43598886)
chr5 (1-283)||(43604091-43604378)
chr5 (1-283)||(43609583-43609870)
chr5 (1-283)||(27444845-27445132)
chr5 (1-286)||(15044562-15044850)
chr5 (1-286)||(28807495-28807784)
chr5 (1-286)||(37556543-37556833)
chr5 (1-286)||(37561365-37561655)
chr5 (86-371)||(24135809-24136097)
chr5 (86-336)||(38219360-38219613)
chr5 (86-371)||(35387624-35387910)
chr5 (86-317)||(38192135-38192369)
chr5 (8-246)||(31396953-31397195)
chr5 (8-246)||(31401810-31402052)
chr5 (8-207)||(2785258-2785461)
chr5 (8-286)||(33791199-33791481)
chr5 (8-241)||(33768062-33768299)
chr5 (124-205)||(9353344-9353429)
chr5 (124-205)||(36932362-36932447)
chr5 (124-207)||(10281751-10281838)
chr5 (124-205)||(15464532-15464617)
chr5 (124-207)||(19588746-19588833)
chr5 (125-207)||(11916982-11917068)
chr5 (124-205)||(14520230-14520315)
chr5 (124-207)||(3880299-3880386)
chr5 (124-207)||(17003970-17004057)
chr5 (127-205)||(12084187-12084269)
chr5 (124-204)||(28832259-28832343)
chr5 (124-204)||(42127423-42127507)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (9-371)||(28503710-28504067)
chr3 (9-371)||(7167129-7167495)
chr3 (8-371)||(2671432-2671800)
chr3 (86-371)||(8738909-8739197)
chr3 (86-371)||(9091147-9091435)
chr3 (86-371)||(40372642-40372929)
chr3 (86-371)||(8477324-8477615)
chr3 (1-283)||(22173118-22173404)
chr3 (165-371)||(28501543-28501750)
chr3 (1-286)||(18656307-18656598)
chr3 (1-278)||(2677015-2677297)
chr3 (1-246)||(8512091-8512342)
chr3 (1-246)||(8516971-8517222)
chr3 (90-336)||(26928472-26928721)
chr3 (9-278)||(2672859-2673133)
chr3 (89-336)||(1305914-1306163)
chr3 (90-336)||(32143287-32143536)
chr3 (8-241)||(24967990-24968227)
chr3 (56-246)||(32475416-32475608)
chr3 (56-246)||(32480274-32480466)
chr3 (8-170)||(10207816-10207981)
chr3 (90-336)||(27452924-27453173)
chr3 (90-204)||(27986449-27986567)
chr3 (124-205)||(8370488-8370573)
chr3 (124-205)||(27974954-27975039)
chr3 (124-207)||(18552883-18552970)
chr3 (125-207)||(36029094-36029180)
chr3 (124-205)||(16264350-16264435)
chr3 (124-205)||(21711223-21711308)
chr3 (127-207)||(1736305-1736389)
chr3 (124-204)||(33386669-33386753)
chr3 (89-148)||(1309819-1309878)
chr3 (124-207)||(3716002-3716089)
chr3 (124-207)||(30709790-30709877)
chr3 (124-207)||(40592782-40592869)
chr3 (124-207)||(48438214-48438301)
chr3 (124-205)||(6794715-6794800)
chr3 (124-207)||(40844652-40844738)
chr3 (124-204)||(1417493-1417577)
chr3 (124-204)||(39039995-39040079)
chr3 (124-207)||(25795781-25795868)
chr3 (124-207)||(26298988-26299075)
chr3 (124-207)||(47923906-47923993)
chr3 (124-204)||(3328359-3328443)
chr3 (124-204)||(37466291-37466375)
chr3 (124-207)||(24695164-24695251)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (9-371)||(24741825-24742191)
chr4 (9-371)||(29760527-29760891)
chr4 (1-283)||(51520332-51520619)
chr4 (1-286)||(18855602-18855890)
chr4 (1-286)||(9224327-9224616)
chr4 (1-286)||(3813899-3814187)
chr4 (1-286)||(9229114-9229403)
chr4 (1-241)||(56146677-56146921)
chr4 (1-286)||(45357217-45357506)
chr4 (1-286)||(5732537-5732828)
chr4 (1-286)||(45347737-45348027)
chr4 (89-336)||(28468420-28468660)
chr4 (90-217)||(31985634-31985764)
chr4 (124-207)||(10047379-10047466)
chr4 (124-207)||(16623303-16623390)
chr4 (124-207)||(39245994-39246081)
chr4 (124-205)||(5396683-5396768)
chr4 (124-205)||(36315241-36315326)
chr4 (124-205)||(36329450-36329535)
chr4 (124-207)||(38152449-38152536)
chr4 (129-207)||(6743425-6743507)
chr4 (125-206)||(5143260-5143345)
chr4 (124-204)||(5269204-5269288)
chr4 (124-207)||(3796529-3796616)
chr4 (125-206)||(5147678-5147763)
chr4 (125-205)||(3777550-3777634)
chr4 (128-207)||(16630690-16630773)
chr4 (124-207)||(24333809-24333896)
chr4 (124-206)||(54867184-54867269)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (8-371)||(20357393-20357761)
chr7 (1-286)||(19992188-19992477)
chr7 (1-302)||(12406207-12406512)
chr7 (1-301)||(24024232-24024537)
chr7 (1-301)||(12396787-12397091)
chr7 (8-371)||(2057842-2058219)
chr7 (1-286)||(31109504-31109792)
chr7 (86-371)||(1533290-1533579)
chr7 (1-286)||(21812159-21812448)
chr7 (86-336)||(21639770-21640023)
chr7 (1-210)||(4866605-4866819)
chr7 (86-336)||(21645968-21646221)
chr7 (8-246)||(24266162-24266405)
chr7 (89-336)||(18413606-18413853)
chr7 (8-246)||(24261283-24261526)
chr7 (86-332)||(18408726-18408973)
chr7 (8-246)||(16879955-16880197)
chr7 (8-246)||(16884811-16885053)
chr7 (124-207)||(29159803-29159890)
chr7 (125-206)||(21983285-21983370)
chr7 (124-207)||(46516320-46516407)
chr7 (124-207)||(49091661-49091748)
chr7 (124-201)||(47263678-47263757)
chr7 (124-207)||(55948-56034)
chr7 (125-206)||(21988909-21988992)
chr7 (124-205)||(44848696-44848781)
chr7 (124-204)||(9190021-9190105)
chr7 (124-204)||(20284089-20284173)
chr7 (124-205)||(2479337-2479421)
chr7 (124-207)||(2647706-2647793)
chr7 (124-207)||(33332460-33332547)
chr7 (124-204)||(2580390-2580474)
chr7 (124-205)||(35960816-35960901)
chr7 (124-204)||(9185178-9185262)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (9-371)||(11098773-11099139)
chr2 (9-371)||(14291372-14291739)
chr2 (9-371)||(9296248-9296614)
chr2 (1-286)||(39811909-39812197)
chr2 (1-265)||(44312565-44312833)
chr2 (1-286)||(32246660-32246952)
chr2 (89-336)||(3491716-3491965)
chr2 (86-337)||(25398457-25398711)
chr2 (1-286)||(19344296-19344586)
chr2 (1-286)||(19349154-19349444)
chr2 (86-337)||(25403595-25403849)
chr2 (90-204)||(40738810-40738926)
chr2 (162-337)||(25407663-25407838)
chr2 (124-207)||(21629944-21630030)
chr2 (124-207)||(8040060-8040147)
chr2 (127-207)||(13569331-13569415)
chr2 (124-205)||(28259189-28259274)
chr2 (124-208)||(20522220-20522308)
chr2 (124-207)||(10445454-10445541)
chr2 (124-207)||(17865203-17865290)
chr2 (124-207)||(34682344-34682431)
chr2 (125-207)||(34388859-34388945)
chr2 (124-207)||(14699018-14699104)
chr2 (124-207)||(31056044-31056131)
chr2 (124-207)||(33528631-33528718)
chr2 (125-207)||(10707262-10707348)
chr2 (127-207)||(8390160-8390244)
chr2 (252-336)||(40738963-40739047)
chr2 (124-202)||(42039684-42039766)
chr2 (124-207)||(16940219-16940306)
chr2 (124-207)||(17010884-17010971)
chr2 (124-207)||(39482931-39483018)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (25-367)||(24787214-24787559)
chr1 (1-286)||(25445010-25445299)
chr1 (1-286)||(44023795-44024082)
chr1 (5-286)||(39445379-39445663)
chr1 (5-286)||(1054933-1055217)
chr1 (1-286)||(41398113-41398400)
chr1 (25-286)||(41390485-41390745)
chr1 (86-336)||(24202651-24202904)
chr1 (1-246)||(43988424-43988675)
chr1 (89-336)||(19358725-19358975)
chr1 (89-336)||(19361314-19361564)
chr1 (89-336)||(19379954-19380204)
chr1 (124-207)||(47703946-47704033)
chr1 (250-336)||(19366190-19366276)
chr1 (124-205)||(26644909-26644994)
chr1 (124-207)||(9476261-9476348)
chr1 (124-207)||(19072928-19073015)
chr1 (124-207)||(19120818-19120905)
chr1 (124-207)||(13598398-13598485)
chr1 (124-207)||(16124526-16124613)
chr1 (124-207)||(27104382-27104469)
chr1 (124-207)||(29651811-29651898)
chr1 (124-205)||(3281708-3281793)
chr1 (124-205)||(37069770-37069855)
chr1 (124-207)||(775672-775759)
chr1 (124-204)||(47098837-47098921)
chr1 (124-205)||(13604635-13604720)
chr1 (124-205)||(21536581-21536666)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (1-286)||(9564-9849)
scaffold0355 (1-98)||(1-96)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-286)||(238-526)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-301)||(22010602-22010906)
chr6 (1-301)||(11856847-11857154)
chr6 (1-286)||(6438376-6438664)
chr6 (86-371)||(5674616-5674905)
chr6 (1-286)||(14737497-14737786)
chr6 (1-286)||(14742357-14742645)
chr6 (17-286)||(28184396-28184669)
chr6 (1-286)||(28155491-28155780)
chr6 (8-286)||(6005300-6005582)
chr6 (8-278)||(16838627-16838901)
chr6 (8-278)||(33330373-33330649)
chr6 (8-278)||(33335870-33336146)
chr6 (8-161)||(5343363-5343519)
chr6 (124-205)||(5757490-5757575)
chr6 (90-204)||(22708984-22709102)
chr6 (124-202)||(21356036-21356118)
chr6 (124-205)||(31086485-31086570)
chr6 (124-207)||(5572251-5572338)
chr6 (124-206)||(4629954-4630040)
chr6 (124-206)||(10077176-10077262)
chr6 (250-336)||(22709137-22709223)
chr6 (124-207)||(22963700-22963786)
chr6 (124-207)||(23824607-23824693)
chr6 (124-207)||(31979513-31979600)
chr6 (124-204)||(5017482-5017566)
chr6 (8-74)||(30125940-30126008)
chr6 (124-185)||(31936587-31936651)
chr6 (136-207)||(21801354-21801429)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-286)||(34982-35271)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (86-371)||(17801-18087)
scaffold0188 (86-371)||(23894-24180)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (8-246)||(2211-2453)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (8-246)||(148916-149158)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (8-246)||(14269-14512)
scaffold0197 (8-246)||(19125-19367)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (25-156)||(300-431)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (8-190)||(181980-182167)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (124-205)||(8431-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (125-205)||(85684-85768)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (124-207)||(5683-5770)
scaffold0006 (124-207)||(2492-2579)
scaffold0006 (124-205)||(133292-133377)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (124-205)||(43973-44058)
scaffold0087 (124-205)||(36844-36929)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (124-207)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (124-204)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (127-207)||(17266-17350)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 6311173 - 6311549
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6311173 atgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagc 6311272  T
Q  99 aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaag 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311273 aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaag 6311372  T
Q  197 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagacagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccc 296  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  6311373 tgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 6311472  T
Q  297 t--aaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311473 taaaaaagagaagtcactagaggaagcttttgatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 6311549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 36979262 - 36979628
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36979262 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaag 36979359  T
Q  106 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36979360 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 36979459  T
Q  203 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaa 301  Q
    ||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  36979460 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 36979558  T
Q  302 gagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979559 gagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 36979628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4760288 - 4759921
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4760288 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaag 4760190  T
Q  106 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 202  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4760189 gaagaacaaaacatcaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 4760090  T
Q  203 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaa 301  Q
    ||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  4760089 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 4759991  T
Q  302 gagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759990 gagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 4759921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 371
Target Start/End: Original strand, 30655543 - 30655897
Alignment:
Q  25 aacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa----cac 119  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  30655543 aacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacac 30655642  T
Q  120 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaaga 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  30655643 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 30655742  T
Q  217 agctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactaga 315  Q
    | |  ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  30655743 aacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 30655841  T
Q  316 ggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655842 ggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 30655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33038001 - 33037654
Alignment:
Q  25 aacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 123  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33038001 aacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaagaacaaaacaccaag 33037903  T
Q  124 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |      
T  33037902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 33037803  T
Q  222 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaag 320  Q
    ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33037802 tagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct-aaagagaagacactagaggaag 33037705  T
Q  321 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037704 ctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 33037654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18870772 - 18870407
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagga 107  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||  || || || |||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18870772 aaatggtttccaagcaaacaacaaaaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagga 18870675  T
Q  108 agaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18870674 agaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaa 18870575  T
Q  205 aagg-ttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaag 302  Q
    |||| || |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  18870574 aagggttacaagaaacaatagcattcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 18870476  T
Q  303 agaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870475 agaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 18870407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18853382 - 18853013
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaaca--gccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||| |  ||||||  || || || |||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18853382 caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa 18853284  T
Q  105 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18853283 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgtta 18853184  T
Q  202 caaaagg-ttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaa 299  Q
    ||||||| || |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||    
T  18853183 caaaagggttacaagaaacaatagcattcaagctt-acacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaa 18853085  T
Q  300 aagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853084 aagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 18853013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7290136 - 7289831
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagc-ataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||     
T  7290136 atgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagt 7290037  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290036 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 7289937  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacc 294  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |    
T  7289936 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaac 7289838  T
Q  295 cctaaaa 301  Q
    |||||||    
T  7289837 cctaaaa 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10689354 - 10688986
Alignment:
Q  10 aatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 106  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||   ||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10689354 aatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaagg 10689257  T
Q  107 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10689256 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 10689157  T
Q  204 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc-ttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaa 301  Q
     | |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  10689156 gagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 10689058  T
Q  302 gagaagtcactagaggaagctttaaatcct--tccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689057 gagaagacactagaggaagctttagatcctcccccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 10688986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25328487 - 25328184
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaag-cataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||  ||||||| |||||| |    
T  25328487 atgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaac 25328390  T
Q  99 aagaaaggaa--gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 194  Q
       |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328389 ggtaaaggaaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 25328290  T
Q  195 agtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgac 293  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     
T  25328289 agtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaa 25328192  T
Q  294 ccctaaaa 301  Q
    ||||||||    
T  25328191 ccctaaaa 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39785033 - 39784744
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||    
T  39785033 atgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagc 39784935  T
Q  99 aagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgaga 193  Q
       ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  39784934 ggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg- 39784836  T
Q  194 aagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  39784835 aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 39784744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1262089 - 1261803
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1262089 aaacaagataagatagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 1261990  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  1261989 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccact 1261892  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1261891 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaat 1261803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 35745274 - 35745556
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||     
T  35745274 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa 35745370  T
Q  106 g---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35745371 ggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 35745469  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  35745470 tacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcaca 35745556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10684467 - 10684224
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaa-caacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||    
T  10684467 caaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaa 10684372  T
Q  105 ggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 198  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10684371 agaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtg 10684272  T
Q  199 ttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10684271 ttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 10684224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31071362 - 31071111
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31071362 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 31071263  T
Q  185 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactct 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||||||||||||    
T  31071262 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactct 31071165  T
Q  283 cacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  31071164 cacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaa 31071111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Original strand, 26287866 - 26287985
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26287866 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26287965  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaa 204  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26287966 ctatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Original strand, 26301123 - 26301242
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26301123 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26301222  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaa 204  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26301223 ctatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Original strand, 26313117 - 26313236
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26313117 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26313216  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaa 204  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26313217 ctatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456113
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 4456113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 205
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412426
Alignment:
Q  90 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcc 184  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  185 aatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaa 7412426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799587
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23799587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175766
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 19175766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 336
Target Start/End: Original strand, 26288020 - 26288105
Alignment:
Q  250 cctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26288020 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 26288105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 336
Target Start/End: Original strand, 26301277 - 26301362
Alignment:
Q  250 cctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26301277 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 26301362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 336
Target Start/End: Original strand, 26313271 - 26313356
Alignment:
Q  250 cctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26313271 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 26313356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127308
Alignment:
Q  127 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6127308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  126 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 185  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752407
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702493
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaag 5702493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 48 - 371
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180464
Alignment:
Q  48 tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagcc 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagcc 31180237  T
Q  147 aatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  31180238 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaaga 31180337  T
Q  245 cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaa 344  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31180338 caaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaa 31180437  T
Q  345 ctcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31180438 ctcctcactacccaaggtgattacaat 31180464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 30631283 - 30631657
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||| | | || |||||| ||||||||||||||||     
T  30631283 atgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagt 30631381  T
Q  99 aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631382 aagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaag 30631481  T
Q  197 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgaccc 295  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  30631482 tgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaacc 30631581  T
Q  296 ctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcct-cactacccaaggtgattacaat 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30631582 ct-aaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctccactacccaaggtgattacaat 30631657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1457371 - 1457067
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  1457371 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataaga 1457272  T
Q  99 aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaag 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457271 aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaag 1457172  T
Q  197 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgaccc 295  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  1457171 tgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaacc 1457073  T
Q  296 ctaaaa 301  Q
    ||||||    
T  1457072 ctaaaa 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 43592154 - 43592441
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  43592154 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagt 43592253  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592254 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 43592353  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43592354 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 43592441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 27449689 - 27449976
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  27449689 atgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagt 27449788  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449789 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 27449888  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27449889 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 27449976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 43598599 - 43598886
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  43598599 atgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagt 43598698  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598699 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 43598798  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43598799 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 43598886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 43604091 - 43604378
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  43604091 atgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagt 43604190  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604191 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 43604290  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43604291 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 43604378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 43609583 - 43609870
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  43609583 atgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagt 43609682  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609683 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 43609782  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43609783 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 43609870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 27444845 - 27445132
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  27444845 atgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagt 27444944  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444945 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 27445044  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27445045 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 27445132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 15044562 - 15044850
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  15044562 atgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagc 15044660  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044661 aagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 15044760  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15044761 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 15044850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28807784 - 28807495
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaag--ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28807784 atgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaac 28807685  T
Q  99 aagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgaga 193  Q
       ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28807684 ggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg- 28807586  T
Q  194 aagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  28807585 aagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 28807495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37556833 - 37556543
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaag-ctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37556833 atgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-tatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaac 37556735  T
Q  99 aagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgaga 193  Q
       ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37556734 ggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga 37556635  T
Q  194 aagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  37556634 aagtgttacaaaaggttacaagta--tctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 37556543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37561655 - 37561365
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaag-ctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37561655 atgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-tatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaac 37561557  T
Q  99 aagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgaga 193  Q
       ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37561556 ggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga 37561457  T
Q  194 aagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  37561456 aagtgttacaaaaggttacaagta--tctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 37561365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Original strand, 24135809 - 24136097
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 181  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  24135809 aaacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaa 24135908  T
Q  182 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccac 279  Q
    | || || || |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24135909 tgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccac 24136006  T
Q  280 tctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24136007 tctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaat 24136097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 336
Target Start/End: Original strand, 38219360 - 38219613
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38219360 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 38219459  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  38219460 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccact 38219557  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38219558 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 38219613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Original strand, 35387624 - 35387910
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35387624 aaacgagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35387723  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    | | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| | |   ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  35387724 ctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccact 35387821  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35387822 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagttttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaat 35387910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Original strand, 38192135 - 38192369
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38192135 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 38192234  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  38192235 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccact 38192332  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagagg 317  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||    
T  38192333 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagagg 38192369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31397195 - 31396953
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |    
T  31397195 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaag 31397098  T
Q  107 aagaacaaa---acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 200  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31397097 aa-aacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgtt 31396999  T
Q  201 acaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31396998 acaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 31396953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31402052 - 31401810
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||     
T  31402052 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa 31401956  T
Q  106 gaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31401955 gaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 31401857  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31401856 tacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 31401810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Original strand, 2785258 - 2785461
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||     
T  2785258 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa 2785354  T
Q  106 g---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2785355 ggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 2785453  T
Q  200 tacaaaag 207  Q
    ||||||||    
T  2785454 tacaaaag 2785461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 33791199 - 33791481
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||| | | |||     
T  33791199 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa 33791295  T
Q  106 g---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33791296 ggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 33791394  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  33791395 tacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcaca 33791481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Original strand, 33768062 - 33768299
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  || ||||| | | |||     
T  33768062 caaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caggataaacgataaaa 33768158  T
Q  106 g---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33768159 ggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 33768257  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 241  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  33768258 tacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacaca 33768299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353344
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 9353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932362
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36932362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281838
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10281838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464617
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 15464617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588833
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 19588833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916982
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 11916982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520315
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaa 14520315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 3880299 - 3880386
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3880299 aagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3880386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084187
Alignment:
Q  127 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 12084187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832343
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127423
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28504067 - 28503710
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||         ||||    
T  28504067 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga---------aagg 28503978  T
Q  107 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503977 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 28503878  T
Q  205 aaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagac-agaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaaga 303  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  28503877 aaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaaga 28503778  T
Q  304 gaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503777 gaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 28503710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 7167129 - 7167495
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7167129 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg 7167227  T
Q  107 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7167228 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 7167327  T
Q  204 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaag 302  Q
    || |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  7167328 aagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 7167426  T
Q  303 agaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167427 agaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 7167495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2671800 - 2671432
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2671800 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa 2671702  T
Q  105 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2671701 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 2671602  T
Q  202 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaa 300  Q
    |||| |||| |||||| |  ||| |  ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  2671601 caaagggttacaagaaacaatagattgcaagc-ttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 2671503  T
Q  301 agagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671502 agagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 2671432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8739197 - 8738909
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8739197 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 8739098  T
Q  184 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  8739097 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactc 8738999  T
Q  282 tcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8738998 tcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagctttagatcctttcaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 8738909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9091435 - 9091147
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9091435 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 9091336  T
Q  184 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  9091335 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactc 9091237  T
Q  282 tcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091236 tcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagctttagatcctttcaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 9091147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40372929 - 40372642
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatc 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40372929 aaacaagataagcaagataggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 40372830  T
Q  184 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  40372829 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactc 40372732  T
Q  282 tcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372731 tcataatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 40372642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Original strand, 8477324 - 8477615
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8477324 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 8477423  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacaca--agacagaccctagattctacccttcggtgttt-cccca 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |||||  ||||| |||||||  | |||   |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8477424 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccca 8477522  T
Q  279 ctctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477523 ctctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 8477615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22173404 - 22173118
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||    
T  22173404 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagc 22173306  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173305 ggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 22173206  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22173205 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 22173118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501543
Alignment:
Q  165 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  264 ttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtg 363  Q
    || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtg 28501551  T
Q  364 attacaat 371  Q
    ||||||||    
T  28501550 attacaat 28501543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 18656307 - 18656598
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  18656307 atgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaac 18656404  T
Q  99 aagaaaggaa-gaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatg 190  Q
       ||||||| ||||||||    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18656405 ggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 18656504  T
Q  191 agaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  18656505 agaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 18656598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2677297 - 2677015
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2677297 atgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaac 2677200  T
Q  99 aa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgag 192  Q
     | |||| |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2677199 catgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg 2677101  T
Q  193 aaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctacccttcggtgtttcccca 278  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  2677100 aatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttccca 2677015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 8512091 - 8512342
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataag- 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||      
T  8512091 atgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaa 8512187  T
Q  98 caagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga 191  Q
    | | ||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8512188 cgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgt 8512287  T
Q  192 gaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8512288 gaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 8512342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 8516971 - 8517222
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataag- 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||      
T  8516971 atgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaa 8517067  T
Q  98 caagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga 191  Q
    | | ||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8517068 cgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgt 8517167  T
Q  192 gaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8517168 gaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 8517222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26928721 - 26928472
Alignment:
Q  90 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaa 186  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  26928721 aagataagctagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccac 26928623  T
Q  187 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctca 284  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  26928622 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctca 26928524  T
Q  285 caagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  26928523 caatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaa 26928472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2673133 - 2672859
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaag 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||     
T  2673133 aaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaa 2673036  T
Q  106 gaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 200  Q
    |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2673035 gaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgtt 2672937  T
Q  201 acaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctacccttcggtgtttcccca 278  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  2672936 acaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttccca 2672859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 336
Target Start/End: Original strand, 1305914 - 1306163
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1305914 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatcca 1306012  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
     || || |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1306013 ctacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctc 1306110  T
Q  284 acaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
     ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  1306111 tcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaa 1306163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 336
Target Start/End: Original strand, 32143287 - 32143536
Alignment:
Q  90 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32143287 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 32143385  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32143386 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 32143483  T
Q  284 acaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
     ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  32143484 tcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaa 32143536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Original strand, 24967990 - 24968227
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||     
T  24967990 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa 24968086  T
Q  106 gaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24968087 gaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 24968185  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagcta-tcaagctttacaca 241  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24968186 tacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagctttacaca 24968227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Original strand, 32475416 - 32475608
Alignment:
Q  56 agcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatat 151  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32475416 agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgt 32475513  T
Q  152 ggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32475514 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 32475608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Original strand, 32480274 - 32480466
Alignment:
Q  56 agcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatat 151  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32480274 agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgt 32480371  T
Q  152 ggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32480372 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 32480466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Original strand, 10207816 - 10207981
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagat-aagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  10207816 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataaaccatgaaa 10207913  T
Q  105 gg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggagagag 170  Q
     |  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10207914 agaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagag 10207981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 336
Target Start/End: Original strand, 27452924 - 27453173
Alignment:
Q  90 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27452924 aagataagcaagaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatcca 27453022  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  27453023 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctc 27453120  T
Q  284 acaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
     ||| | || |||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  27453121 tcaatatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 27453173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27986567 - 27986449
Alignment:
Q  90 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27986567 aagataagcaagaaagaatgaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 27986469  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaa 204  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  27986468 ctatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370488
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8370488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974954
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 27974954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552883
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 18552883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029180
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagaga--gcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 36029180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264435
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 16264435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711308
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 21711308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736305
Alignment:
Q  127 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 1736305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 148
Target Start/End: Original strand, 1309819 - 1309878
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1309819 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacccagttcagccaa 1309878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3716002
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 3716002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709790
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaag 30709790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592782
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaag 40592782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 48438214 - 48438301
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48438214 aagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 48438301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6794800 - 6794715
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6794800 aagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 6794715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 40844652 - 40844738
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40844652 aagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 40844738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795868
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaag 25795868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 26298988 - 26299075
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  26298988 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 26299075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923906
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaag 47923906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328359
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttca-gccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Original strand, 37466291 - 37466375
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466291 aagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24695251 - 24695164
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  24695251 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaag 24695164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 24741825 - 24742191
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24741825 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaag 24741922  T
Q  106 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24741923 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 24742022  T
Q  203 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaa 301  Q
    ||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  24742023 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24742121  T
Q  302 gagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742122 gagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 24742191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 29760527 - 29760891
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||  |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29760527 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaagg 29760624  T
Q  107 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29760625 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 29760724  T
Q  204 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaa 301  Q
    || |||| |||||| |  ||||   ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||  ||    
T  29760725 aagggttacaagaaacaatagcctgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccct--aa 29760821  T
Q  302 gagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760822 gagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 29760891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 51520332 - 51520619
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  51520332 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagt 51520431  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520432 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 51520531  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51520532 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 51520619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 18855602 - 18855890
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  18855602 atgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacgg 18855701  T
Q  101 gaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18855702 taaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aa 18855800  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  18855801 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9224616 - 9224327
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  9224616 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc 9224518  T
Q  99 -aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224517 ggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 9224418  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9224417 gtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcaca 9224327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 3813899 - 3814187
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaag-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813899 atgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 3813998  T
Q  99 aagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3813999 aagaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaa 3814098  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  3814099 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 3814187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9229403 - 9229114
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  9229403 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc 9229305  T
Q  99 -aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229304 ggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 9229205  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9229204 gtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcaca 9229114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 56146921 - 56146677
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  56146921 atgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagt 56146822  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146821 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 56146722  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacaca 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  56146721 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacaca 56146677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45357506 - 45357217
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||    
T  45357506 atgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagc 45357408  T
Q  99 aagaaagg--aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 194  Q
       ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357407 ggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 45357308  T
Q  195 agtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  45357307 agtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 45357217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 5732537 - 5732828
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  5732537 atgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaac 5732634  T
Q  99 aagaaaggaa-gaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatg 190  Q
       ||||||| ||||||||    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5732635 ggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 5732734  T
Q  191 agaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  5732735 agaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 5732828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45348027 - 45347737
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||    
T  45348027 atgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagc 45347929  T
Q  99 aagaaagg--aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 194  Q
       ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347928 ggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 45347829  T
Q  195 agtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  45347828 agtgttacaaaaggttacaag-acctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 45347737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28468660 - 28468420
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatcca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28468660 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatcca 28468562  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa-gacagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
     ||||| |||||||||||||      | || ||    ||| |  ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28468561 ctatgatgaaagtgttacaa------gaaaaaa----tagtttgcaagc-ttacacaataacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 28468473  T
Q  284 acaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
     ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28468472 tcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 28468420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31985764 - 31985634
Alignment:
Q  90 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31985764 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccac 31985666  T
Q  187 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 217  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31985665 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 31985634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047466
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10047466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623303
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16623303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246081
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 39246081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396683
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaa 5396683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315241
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36315241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329450
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36329450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  129 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 206  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269204
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796529
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3796529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777634
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 3777634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630690
Alignment:
Q  128 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 24333809 - 24333896
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333809 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Original strand, 54867184 - 54867269
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867184 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20357761 - 20357393
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20357761 caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaa 20357664  T
Q  105 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 201  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357663 aggaagaacaaaataccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 20357564  T
Q  202 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaa 300  Q
    |||| |||| |||||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  20357563 caaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 20357464  T
Q  301 agagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357463 agagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 20357393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 19992188 - 19992477
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  19992188 atgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacgg 19992287  T
Q  101 gaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19992288 taaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaa 19992387  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  19992388 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 19992477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 12406207 - 12406512
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  12406207 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc 12406305  T
Q  99 -aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12406306 ggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaa 12406405  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacc 294  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |    
T  12406406 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaac 12406504  T
Q  295 cctaaaag 302  Q
    ||||||||    
T  12406505 cctaaaag 12406512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24024537 - 24024232
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaag-ctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024537 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc-tatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 24024439  T
Q  99 aag-aaaggaagaac-aaaacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgaga 193  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024438 aagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgaga 24024339  T
Q  194 aagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacga 292  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||    
T  24024338 aagtgttacaaaatgttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatga 24024241  T
Q  293 cccctaaaa 301  Q
     ||||||||    
T  24024240 accctaaaa 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 12396787 - 12397091
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  12396787 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc 12396885  T
Q  99 aagaaagg-aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12396886 ggtaaagggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaa 12396985  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacc 294  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  | || ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || |    
T  12396986 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaac 12397084  T
Q  295 cctaaaa 301  Q
    |||||||    
T  12397085 cctaaaa 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 371
Target Start/End: Original strand, 2057842 - 2058219
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaaca--gccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaa----caagataagcaa 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||  || || || |||||| |||||||||||| || ||| ||| |||    ||||||||||||    
T  2057842 caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaa 2057941  T
Q  101 gaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 196  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2057942 taaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaag 2058041  T
Q  197 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc-ttcggtgtttccccactctcacaagacgacc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| | || |    
T  2058042 tgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaac 2058140  T
Q  295 cctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatcct--tccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058141 cctaaaagagaagacactagaggaagctttagatcctcccccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 2058219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31109792 - 31109504
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |    
T  31109792 atgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaac 31109695  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109694 aagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 31109595  T
Q  195 agtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||    
T  31109594 agtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcaca 31109504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1533579 - 1533290
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  1533579 aaacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaat 1533480  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctacccttcggtgtttccccac 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |||||  ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1533479 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccac 1533381  T
Q  280 tctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533380 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaat 1533290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21812448 - 21812159
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  21812448 atgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacgg 21812349  T
Q  101 gaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  21812348 taaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtg-aa 21812250  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatc-aagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    || |||||||||||| |||||  ||||||| | || |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  21812249 gtcttacaaaaggttccaaga--ctctagcttgtcaaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 21812159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 336
Target Start/End: Original strand, 21639770 - 21640023
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21639770 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 21639869  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21639870 ccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccact 21639967  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21639968 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa 21640023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 4866605 - 4866819
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaac-aaacagccctaagctagtgtatagc-aaagccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag 97  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||||| ||||||||||||    
T  4866605 atgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataag 4866703  T
Q  98 c-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 194  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866704 cggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 4866803  T
Q  195 agtgttacaaaaggtt 210  Q
    ||||||||||||||||    
T  4866804 agtgttacaaaaggtt 4866819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 336
Target Start/End: Original strand, 21645968 - 21646221
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  21645968 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaat 21646067  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21646068 ccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccact 21646165  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21646166 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagatttagatccttccaa 21646221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24266405 - 24266162
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaa-caacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||    
T  24266405 caaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaa 24266310  T
Q  105 ggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 198  Q
    ||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24266309 ggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtg 24266210  T
Q  199 ttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24266209 ttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 24266162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 89 - 336
Target Start/End: Original strand, 18413606 - 18413853
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaa 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18413606 caagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggagagagcagctctccaatccac 18413704  T
Q  187 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctca 284  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  18413705 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctca 18413802  T
Q  285 caagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||| | || ||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  18413803 caatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaagcttaagatccttccaa 18413853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24261526 - 24261283
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaa-caacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||    
T  24261526 caaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaa 24261431  T
Q  105 ggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 198  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24261430 agaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtg 24261331  T
Q  199 ttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24261330 ttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 24261283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 18408726 - 18408973
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18408726 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18408824  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    || ||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  18408825 ccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccact 18408922  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatcctt 332  Q
    ||||||| | || ||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  18408923 ctcacaatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaagcttaagatcctt 18408973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 16879955 - 16880197
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaa-caacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||    
T  16879955 caaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaa 16880050  T
Q  105 ggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 198  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  16880051 agaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtt 16880150  T
Q  199 ttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16880151 ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 16880197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 16884811 - 16885053
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaa-caacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||    
T  16884811 caaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaa 16884906  T
Q  105 ggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 198  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  16884907 agaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtt 16885006  T
Q  199 ttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16885007 ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 16885053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159890
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29159890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516320
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 46516320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091748
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 49091748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 201
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 201  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56034
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 56034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848696
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 44848696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190021
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284173
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggggagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647706
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2647706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332460
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 33332460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580474
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 2580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 35960816 - 35960901
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960816 aagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185178
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11099139 - 11098773
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  11099139 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaag 11099042  T
Q  106 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11099041 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 11098942  T
Q  203 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaa 301  Q
    ||| |||| |||||| |  |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  11098941 aaagggttacaagaaacaatagcttgcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11098843  T
Q  302 gagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098842 gagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgtactcctcactacccaaggtgattacaat 11098773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 14291372 - 14291739
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14291372 aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaag 14291470  T
Q  106 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14291471 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 14291570  T
Q  203 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaa 301  Q
    ||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  14291571 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 14291669  T
Q  302 gagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291670 gagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 14291739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9296614 - 9296248
Alignment:
Q  9 aaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  9296614 aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaag 9296516  T
Q  106 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9296515 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 9296416  T
Q  203 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaa 301  Q
    ||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  9296415 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 9296317  T
Q  302 gagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296316 gagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaat 9296248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39812197 - 39811909
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||    
T  39812197 atgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagc 39812099  T
Q  99 aagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
       ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812098 ggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 39811999  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  39811998 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 39811909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44312833 - 44312565
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  44312833 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc 44312735  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312734 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 44312635  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  44312634 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctt 44312565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 32246660 - 32246952
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  32246660 atgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagc 32246758  T
Q  99 aagaaa----ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga 191  Q
    ||||||    ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32246759 aagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 32246858  T
Q  192 gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  32246859 gaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcaca 32246952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 336
Target Start/End: Original strand, 3491716 - 3491965
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3491716 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 3491814  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctc 283  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  3491815 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 3491912  T
Q  284 acaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    |||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  3491913 acaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaa 3491965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 25398457 - 25398711
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25398457 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25398556  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| |  ||||||| |||||    
T  25398557 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccact 25398654  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaac 337  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25398655 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaac 25398711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 19344296 - 19344586
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |    
T  19344296 atgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaac 19344392  T
Q  99 aagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgag 192  Q
     | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19344393 gataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtg 19344492  T
Q  193 aaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  19344493 aatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcaca 19344586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 19349154 - 19349444
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |    
T  19349154 atgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaac 19349250  T
Q  99 aagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgag 192  Q
     | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19349251 gataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtg 19349350  T
Q  193 aaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  19349351 aatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcaca 19349444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 25403595 - 25403849
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25403595 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25403694  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| |  ||||||| |||||    
T  25403695 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccact 25403792  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaac 337  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25403793 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaac 25403849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 40738810 - 40738926
Alignment:
Q  90 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaat 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  40738810 aagataagctagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggggagagcagctctccaatccact 40738908  T
Q  188 atga-gaaagtgttacaa 204  Q
    |||| |||||||||||||    
T  40738909 atgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 337
Target Start/End: Original strand, 25407663 - 25407838
Alignment:
Q  162 gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattct 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||||| |||||||| ||   ||||| ||||    
T  25407663 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa-tagcttgcaagctt-acacaagaacaagtcctagtttct 25407760  T
Q  260 acccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaac 337  Q
    |||| |  ||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25407761 acccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaac 25407838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630030
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 21630030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040147
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569415
Alignment:
Q  127 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13569415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259189
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 28259189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 208
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522308
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagg 20522308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445454
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaag 10445454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865290
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17865290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682344
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 34682344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388945
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 34388945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14699018
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaag 14699018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33528718 - 33528631
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33528718 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 33528631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707262
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10707262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390160
Alignment:
Q  127 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaag 8390160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 336
Target Start/End: Original strand, 40738963 - 40739047
Alignment:
Q  252 tagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| | || |||||||  ||||||||||    
T  40738963 tagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaatagtaagcttttgatccttccaa 40739047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039684
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 202  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttac 42039684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16940306 - 16940219
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| || ||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940306 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17010971 - 17010884
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| || ||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010971 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 39482931 - 39483018
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  39482931 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaag 39483018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24787559 - 24787214
Alignment:
Q  25 aacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccga 122  Q
    |||||||| |||||||||||  ||  |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24787559 aacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaa 24787462  T
Q  123 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggag--agagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |     
T  24787461 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 24787362  T
Q  221 ctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaa 319  Q
     ||||  |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24787361 atagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 24787262  T
Q  320 gctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgatta 367  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24787261 gctttagatccttccaactaatgaactcctcactgcccaaggtgatta 24787214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25445299 - 25445010
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |      
T  25445299 atgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacgg 25445200  T
Q  101 gaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445199 taaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 25445100  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  25445099 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcaca 25445010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44024082 - 44023795
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  44024082 atgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatgg 44023983  T
Q  101 gaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaag 196  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44023982 taaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aag 44023884  T
Q  197 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  44023883 tgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 44023795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 39445379 - 39445663
Alignment:
Q  5 gaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  39445379 gaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaa 39445478  T
Q  105 gg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39445479 aggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgt 39445577  T
Q  200 tacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  39445578 tacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 39445663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1055217 - 1054933
Alignment:
Q  5 gaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  1055217 gaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaa 1055118  T
Q  105 gg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  1055117 aggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtg-aagtgt 1055019  T
Q  200 tacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1055018 tacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 1054933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 41398113 - 41398400
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaa----acagccctaagctagtgtatagcaaag--ccacacaaagagctaacaa-gcataaacaaga 93  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  41398113 atgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaaga 41398211  T
Q  94 taagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga 191  Q
    ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398212 taag-----aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 41398306  T
Q  192 gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  41398307 gaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 41398400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 286
Target Start/End: Original strand, 41390485 - 41390745
Alignment:
Q  25 aacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaag--ccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacacc 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||| |    
T  41390485 aacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacatc 41390578  T
Q  121 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  41390579 gagaagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-- 41390676  T
Q  219 ctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  41390677 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 41390745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24202904 - 24202651
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24202904 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24202805  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24202804 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccact 24202707  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24202706 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa 24202651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43988675 - 43988424
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |  | | || |    
T  43988675 atgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaacc 43988577  T
Q  99 aagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgaga 193  Q
    | |||| |||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43988576 atgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga 43988477  T
Q  194 aagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43988476 atgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 43988424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358725
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  185 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactct 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19358779  T
Q  283 cacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    | ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19358778 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 19358725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361314
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  185 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactct 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19361368  T
Q  283 cacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    | ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19361367 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 19361314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19379954
Alignment:
Q  89 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  185 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactct 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19380008  T
Q  283 cacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    | ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19380007 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 19379954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703946
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19366276 - 19366190
Alignment:
Q  250 cctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19366276 cctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 19366190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644909
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaa 26644909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476348
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073015
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19073015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120905
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19120905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124526
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16124526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27104469 - 27104382
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27104469 aagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 27104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651898
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281793
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaa 3281793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069855
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaa 37069855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775759
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098837
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604635
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 13604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536581
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaa 21536581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9849 - 9564
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagca 99  Q
    |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9849 atgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagca 9751  T
Q  100 agaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9750 agaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagt 9651  T
Q  198 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  9650 gttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 9564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 1
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  96 atgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 238 - 526
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  238 atgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacgg 337  T
Q  101 gaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  338 taaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aa 436  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  437 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22010906 - 22010602
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  22010906 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc 22010808  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010807 gataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 22010708  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacc 294  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | || |    
T  22010707 gtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaac 22010609  T
Q  295 cctaaaa 301  Q
    |||||||    
T  22010608 cctaaaa 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 11856847 - 11857154
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||    
T  11856847 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagc 11856945  T
Q  99 aagaaa-ggaagaacaaaa---caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgag 192  Q
     | ||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856946 gataaaaggaagaacaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgag 11857045  T
Q  193 aaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacg 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  11857046 aaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatg 11857144  T
Q  292 acccctaaaa 301  Q
    | ||||||||    
T  11857145 aaccctaaaa 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 6438376 - 6438664
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  6438376 atgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacgg 6438475  T
Q  99 aagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
     | || | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6438476 taaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aa 6438574  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6438575 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 6438664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5674905 - 5674616
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5674905 aaacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaaagagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 5674806  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctacccttcggtgtttccccac 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |||||  ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5674805 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccac 5674707  T
Q  280 tctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674706 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaat 5674616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14737786 - 14737497
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaa-gagctaacaa-gcataaacaagataag 97  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  14737786 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataag 14737688  T
Q  98 caagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 194  Q
    |   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737687 cggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaa 14737588  T
Q  195 agtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14737587 agtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 14737497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14742645 - 14742357
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  14742645 atgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagc 14742547  T
Q  99 -aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742546 ggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 14742447  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14742446 gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 14742357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Original strand, 28184396 - 28184669
Alignment:
Q  17 tccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagca--agaaaggaagaac 112  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  28184396 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaac 28184494  T
Q  113 aaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28184495 aaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 28184594  T
Q  211 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
     ||| |  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  28184595 acaaca--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 28184669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28155780 - 28155491
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaag-ctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 98  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28155780 atgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagcc-tatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaac 28155682  T
Q  99 aagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgaga 193  Q
       ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155681 ggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgaga 28155582  T
Q  194 aagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  28155581 aagtgttacaaaaggttacaagaa--tttagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 28155491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 6005300 - 6005582
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||     
T  6005300 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa 6005396  T
Q  106 g---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6005397 ggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 6005495  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  6005496 tacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcaca 6005582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 16838627 - 16838901
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||     
T  16838627 caaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa 16838723  T
Q  106 gaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16838724 gaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 16838822  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagcta-tcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttcccca 278  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  16838823 tacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttccca 16838901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33330649 - 33330373
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaag-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaa 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  33330649 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaa 33330552  T
Q  104 aggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 198  Q
    | |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33330551 aagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtg 33330453  T
Q  199 ttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctacccttcggtgtttcccca 278  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  33330452 ttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttccca 33330373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33336146 - 33335870
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaag-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaa 103  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  33336146 caaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaa 33336049  T
Q  104 aggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 198  Q
    | |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33336048 aagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtg 33335950  T
Q  199 ttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctacccttcggtgtttcccca 278  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  33335949 ttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttccca 33335870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 5343363 - 5343519
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaag-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||    
T  5343363 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaa 5343459  T
Q  105 ggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 161  Q
    ||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5343460 ggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 5343519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757490
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 5757490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 22708984 - 22709102
Alignment:
Q  90 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| |  |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22708984 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaaaattgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 22709082  T
Q  186 atatga-gaaagtgttacaa 204  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  22709083 ctatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356118
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 202  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac 21356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086485
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572251
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5572251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 206  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077176
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 206  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 336
Target Start/End: Original strand, 22709137 - 22709223
Alignment:
Q  250 cctagattctacccttcggtgtttccccactctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaa 336  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  22709137 cctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagtttttgatccttccaa 22709223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 22963700 - 22963786
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22963700 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 22963786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23824693 - 23824607
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23824693 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23824607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979600
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaag 31979600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5017566 - 5017482
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017566 aagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 30126008 - 30125940
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagag 74  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30126008 caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggaga--gagcagctctccaatcca 185  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801354
Alignment:
Q  136 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagag--agcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaag 21801354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35271 - 34982
Alignment:
Q  1 atgagaacaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  35271 atgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc 35173  T
Q  99 -aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 195  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35172 ggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaa 35073  T
Q  196 gtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccactctcaca 286  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35072 gtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcaca 34982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18087 - 17801
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18087 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 17988  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  17987 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccact 17890  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17889 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaat 17801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24180 - 23894
Alignment:
Q  86 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24180 aaacaagataagaaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24081  T
Q  183 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctacccttcggtgtttccccact 280  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  24080 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccact 23983  T
Q  281 ctcacaagacgacccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaat 371  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23982 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaat 23894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2453 - 2211
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||    
T  2453 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaag 2357  T
Q  106 gaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2356 gaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 2258  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2257 tacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 2211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 149158 - 148916
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||    
T  149158 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaag 149062  T
Q  106 gaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  149061 gaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgt 148963  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  148962 tacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 148916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14512 - 14269
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaa-caacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||    
T  14512 caaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaa 14417  T
Q  105 ggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 198  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14416 agaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtg 14317  T
Q  199 ttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14316 ttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 14269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19367 - 19125
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||     
T  19367 caaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa 19271  T
Q  106 gaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 199  Q
    |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||    
T  19270 gaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgt 19172  T
Q  200 tacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 246  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19171 tacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 19125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 431 - 300
Alignment:
Q  25 aacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 123  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  431 aacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaagaaagaacaaaacaccaag 333  T
Q  124 aagattgttgacccagttcagccaatatggcct 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  332 aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 182167 - 181980
Alignment:
Q  8 caaatggcttccaagctaa-caacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaagccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||    
T  182167 caaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaa 182072  T
Q  105 ggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 190  Q
     |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  182071 agaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8431
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85768
Alignment:
Q  125 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaa 85768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133292
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 133292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43973
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 43973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36844
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaa 36844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10816
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 10816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  124 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 204  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17350
Alignment:
Q  127 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 207  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaag 17350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University