View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13826_high_9 (Length: 429)

Name: NF13826_high_9
Description: NF13826
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13826_high_9
NF13826_high_9
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (14-429)||(11619131-11619546)
chr5 (14-376)||(19609115-19609477)
chr5 (14-388)||(20705850-20706223)
chr5 (14-360)||(20587401-20587744)
chr5 (15-274)||(13065431-13065690)
chr5 (14-282)||(42765118-42765386)
chr5 (15-274)||(8724557-8724816)
chr5 (14-282)||(36961934-36962202)
chr5 (69-237)||(18521670-18521837)
chr5 (70-115)||(13559983-13560028)
chr5 (127-271)||(31291564-31291708)
chr5 (41-112)||(43201244-43201315)
chr5 (43-113)||(38640082-38640152)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (14-366)||(21182392-21182745)
chr1 (14-376)||(38532665-38533027)
chr1 (14-376)||(4179716-4180078)
chr1 (14-373)||(22161499-22161858)
chr1 (14-304)||(27527107-27527402)
chr1 (50-375)||(29600754-29601079)
chr1 (14-376)||(25594785-25595147)
chr1 (14-222)||(11644648-11644856)
chr1 (15-274)||(26418748-26419007)
chr1 (15-274)||(32108273-32108532)
chr1 (15-119)||(11420321-11420425)
chr1 (315-429)||(11644503-11644617)
chr1 (41-125)||(8860151-8860235)
chr1 (45-113)||(28214276-28214344)
chr1 (72-121)||(10848578-10848627)
chr1 (69-112)||(3601278-3601321)
chr1 (13-112)||(11351598-11351697)
chr1 (362-429)||(21179868-21179935)
chr1 (93-176)||(40454625-40454708)
chr1 (16-78)||(44464652-44464714)
chr1 (31-112)||(44839876-44839957)
chr1 (76-104)||(9477084-9477112)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (14-429)||(10515848-10516261)
chr6 (14-388)||(11985948-11986322)
chr6 (14-376)||(21698455-21698817)
chr6 (14-271)||(30063625-30063882)
chr6 (14-176)||(1638228-1638390)
chr6 (14-176)||(1641256-1641417)
chr6 (15-274)||(15950647-15950906)
chr6 (82-237)||(7090448-7090603)
chr6 (126-250)||(33169414-33169538)
chr6 (82-176)||(30147965-30148059)
chr6 (91-247)||(23631460-23631616)
chr6 (43-119)||(13434355-13434431)
chr6 (15-121)||(15923548-15923652)
chr6 (33-92)||(33169536-33169595)
chr6 (69-118)||(8942161-8942210)
chr6 (24-112)||(4513083-4513171)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (14-376)||(14504079-14504441)
chr3 (13-385)||(34934825-34935197)
chr3 (14-375)||(8968346-8968707)
chr3 (14-360)||(9734410-9734757)
chr3 (17-385)||(2439226-2439594)
chr3 (14-288)||(2651767-2652041)
chr3 (14-197)||(26307299-26307482)
chr3 (15-298)||(15789866-15790149)
chr3 (15-119)||(32073567-32073671)
chr3 (45-120)||(29704651-29704726)
chr3 (49-119)||(13434458-13434528)
chr3 (13-79)||(46091978-46092044)
chr3 (322-429)||(2652044-2652151)
chr3 (252-294)||(20820546-20820588)
chr3 (50-122)||(41470554-41470626)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (14-429)||(5609469-5609884)
chr7 (28-424)||(664963-665358)
chr7 (14-388)||(33972817-33973192)
chr7 (82-429)||(32535010-32535359)
chr7 (14-382)||(21824116-21824484)
chr7 (30-367)||(21588126-21588463)
chr7 (14-358)||(27244011-27244355)
chr7 (14-376)||(5086340-5086702)
chr7 (15-298)||(13783694-13783977)
chr7 (15-274)||(29526675-29526934)
chr7 (43-274)||(7097408-7097639)
chr7 (15-232)||(19016988-19017205)
chr7 (82-274)||(15455652-15455844)
chr7 (72-112)||(10325126-10325166)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (14-375)||(21084957-21085318)
chr2 (14-376)||(31426194-31426556)
chr2 (14-376)||(34071324-34071685)
chr2 (14-282)||(20471015-20471283)
chr2 (14-282)||(27072201-27072469)
chr2 (42-113)||(3981775-3981846)
chr2 (50-119)||(7861605-7861670)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (14-421)||(17459100-17459507)
chr4 (14-429)||(15065597-15066012)
chr4 (14-375)||(25552995-25553356)
chr4 (15-323)||(20089018-20089326)
chr4 (15-274)||(47782838-47783097)
chr4 (15-220)||(40686862-40687067)
chr4 (17-119)||(4946655-4946757)
chr4 (50-119)||(13200842-13200911)
chr4 (76-112)||(9633069-9633105)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (14-385)||(28161916-28162287)
chr8 (15-424)||(7994882-7995291)
chr8 (14-385)||(25732299-25732669)
chr8 (15-294)||(12784056-12784333)
chr8 (42-291)||(3989352-3989601)
chr8 (72-226)||(25133067-25133221)
chr8 (45-113)||(39533709-39533777)
chr8 (31-112)||(26440817-26440898)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (14-385)||(11492-11863)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (14-429)||(234673-235088)
[»] scaffold1689 (1 HSPs)
scaffold1689 (14-273)||(761-1020)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (14-273)||(13981-14242)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (15-274)||(2197-2456)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (14-262)||(14414-14661)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (15-237)||(52560-52782)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (14-44)||(215522-215552)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 429
Target Start/End: Original strand, 11619131 - 11619546
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11619131 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttaactaatgcatgcgcaacctcattcgtttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 11619230  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11619231 gttaaataatttctacataattggatattgctatccacaatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 11619330  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  11619331 agtcaacctcgaagtcaacatttgaaagttgaagctcttgtatccaccgaattgcatgatatagaccctgagcctccccaacatcgacataacaaactgg 11619430  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatca 413  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11619431 agtaaaccacattgttttagagcagacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaatcctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcataa 11619530  T
Q  414 acattacatttgtatc 429  Q
    ||||| ||||||||||    
T  11619531 acattgcatttgtatc 11619546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 19609115 - 19609477
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609115 atcatcaaacacctggaagctaatactagatgtggctactttagctaaaacatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 19609214  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||||||  | || ||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19609215 gttaaataattattgcagaattggacattactgtccataatagagccaaattcagtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctactctttttg 19609314  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || |||||||| ||||| | ||   |||  |||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  19609315 agtcaacttcaaaatcaacatttaaaagttgaagttcatgaatccaccgaatcgcatggtgtaatgccagagcctccccaacatcaacagagcaagttgg 19609414  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
      |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||    
T  19609415 gttaaaccacatagtttttgaacgaacatgattctcatccgagtctctgatacacatttcaaa 19609477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20706223 - 20705850
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20706223 atcatcaaagacctggaagctagtactagatgtggctgccttagctaaagcatgtgcaacctcatttgcttgccttctaataaactcgacatgagagttt 20706124  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    | |||||   |  |||| ||||||| | | |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  20706123 gataaattggtgttacagaattggacactactatccatgatagagccgaactcggtgacatctccacgaccattgttgaaataaccagctactcttttag 20706024  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||   |||  |||||||||||||| | ||| || | | |    
T  20706023 agtctacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgtatccactgaatcgcgtgatataacgccagagcctccccaacatccacagagcagact-g 20705925  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttatt 388  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||  || |||||||| |||||||| || ||||| ||||   ||||||||||    
T  20705924 agtaaaccacatagttttagaacgaaattggttcccatccgagtctcgaatacacataccaagacctaccttatt 20705850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20587744 - 20587401
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587744 atcatcaaagacctggaaggtagtactagatgtggctgccttagctaaagcatgtgcaacctcattttcttacctcctaataaactcgacatgagagttt 20587645  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    | |||||   |  |||| ||||||| | | |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20587644 gataaattggtgttacagaattggacactactatccatgatagagccgaactcggtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctactcttttag 20587545  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||   |||||| || |||||||   | |  |||||| ||||||| | ||| || | |||    
T  20587544 agtctacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatggat---ccgaatcgcgtgatataacgctagagcctcctcaacatccacagagcagactgg 20587448  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctc 360  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||    
T  20587447 agtaaaccacatagtttttgaacgaaaatggttcccatccgagtctc 20587401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 13065431 - 13065690
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13065431 tcatcaaagatacggaagctagaactagatgtggctgccttagctagagtatgtgcaacctcattcgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 13065530  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |    | ||| || |||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  13065531 ttaaaaatgaccgacagaaatggatgctactgtccattatggaaccaaattcggtgacatctccactgcctttgttgaaataatccgctactcgtttcga 13065630  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
    |||||| ||||| ||||| |||   |||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  13065631 gtcaacttcaaaatcaacattttcgagttgaagttcatggatccaccgaattgcatgata 13065690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42765386 - 42765118
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42765386 atcatcaaagatctggaagctagtactagatgtggctgccttggctagagtgtgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcaacatgagagttt 42765287  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| |||||   |||  |||||||| |  |||||||||| || || |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42765286 gttaagtaattgtgacaccattggatactcttatccataatggagccgaattcgatgatatctccatggcctttgttgaaataatcagctactcttttag 42765187  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagaccca 282  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  | |||||| |||||||| ||||  ||||| || |||| |||||    
T  42765186 agtcaacctcgaaatcaacatttgttaattgaagttcttgtatccaccttattgcttggtataaaccca 42765118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8724816 - 8724557
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8724816 tcatcaaagatacggaagctagaactagatgtggctgccttagctagattatgtgcaacctcattcgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 8724717  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    |||||      | ||| || || ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  8724716 ttaaaagtgaccgacagaaatgaatgctactgtccattatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatctgctactcgtttcga 8724617  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
    |||||| ||||| ||||| |||   |||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  8724616 gtcaacttcaaaatcaacattttcgagttgaaattcatggatccaccgaattgcatgata 8724557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 36961934 - 36962202
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36961934 atcatcaaaaatctggaagctagtactagatgcggctgccttggctagagtgtgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcaacatgagagttt 36962033  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||| |   |||  |||||||| |  |||||||||| || || |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36962034 gttaagtaactgtgacaccattggatactcttatccataatggagccgaattcggtgatatctccatggcctttgttgaaataatcagctactcttttag 36962133  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagaccca 282  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  | |||||| |||||||| ||||  ||||| || |||| |||||    
T  36962134 agtcaacctcgaaatcaacatttgttaattgaagttcttgtatccaccttattgcttggtataaaccca 36962202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18521837 - 18521670
Alignment:
Q  69 gcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcgg 168  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||     |||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| |    
T  18521837 gcaacctcatttgcttgccttgtaataaacttcacatgagaatttgttaaatagggattacagaattggatactactatttataat-gaaccaaattcag 18521739  T
Q  169 tgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtcaacgtttg 237  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  18521738 tgatatctcctcaacctttgttgaaataattagctacttttttctaatcaacctcaaagtcaacatttg 18521670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13560028 - 13559983
Alignment:
Q  70 caacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13560028 caacctcattgacttgcctcctaataaactcaacattagagtttgt 13559983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31291708 - 31291564
Alignment:
Q  127 tacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaa 226  Q
    |||| ||||||||| |  ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| | |||| | || ||||||||  ||||| ||||  | |||||||||||    
T  31291708 tacagaattggatactattatccatgatggaaccaaactcggtgatatctcccctacctctattaaaataatcaactacttttttcaattcaacctcaaa 31291609  T
Q  227 gtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatg 271  Q
     ||||| ||||  || ||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  31291608 atcaacatttgtgagctgaagttcatgtatccactgaattgcatg 31291564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43201315 - 43201244
Alignment:
Q  41 agatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    ||||||||||  || |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  43201315 agatgtggctttctcagctaatgcatttgcaaccacattgacttgcatcctaatgaactcaacatgagagtt 43201244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 113
Target Start/End: Original strand, 38640082 - 38640152
Alignment:
Q  43 atgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38640082 atgtggctgccttaactaactcatgagcaacctcatctatatgcctcgtaataaacttgacatgagagttt 38640152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21182745 - 21182392
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21182745 atcatcaaaggcatgaaagctagtactagatgtagctcccttagttaatgcatgtgcaacctcatttgtttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 21182646  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggct-actctttta 212  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21182645 gttaaataagtgctacataattggatgctactatccataatagaaccaaattcagtgacatctccacaacctttgttgaaataatcggctaactcttttt 21182546  T
Q  213 gagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattg 312  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  21182545 gagtcaaccttgaagtcaacatttgaaagttgaagttcatgtatccagcgaattgcatgatgtaagcccagggcctccccaacatcgacagaacaaacgg 21182446  T
Q  313 gagtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgc 366  Q
    | ||||||||||| ||||| |||   ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21182445 gggtaaaccacatggtttttgagccgacatggttctcatatgagtctcggatgc 21182392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 38532665 - 38533027
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38532665 atcatcaaagacatgtaagctagtattagatgtggctaccctagctagtgtatgtgcaacctcattcgcttgcctcataataaactcgacatgagagttt 38532764  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||| |  || | || |  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38532765 gttaagtaagtattagaaaagtaaatactgctgtccataatagagccaaattcggtagcatctccacgacctttgttgaaataatcagctactctgttag 38532864  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||    
T  38532865 agtcaacttcaaaatcaacatttgtaagttgaagttcttgtatccaccgaattgcgtggtgtagacccatggcctcccctacatcaatagaacagactgg 38532964  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
    ||  ||  |||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  38532965 agagaaaaacatggttttagaccggacatgattcccatcagaatcacggatgcacatcccaaa 38533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4180078 - 4179716
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4180078 atcatcaaacacctggaagctagtactagatgtggctgctttagttaaaacatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 4179979  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||||||  | || ||||||| | | || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||      
T  4179978 gttaaataattattgcagaattggacactactgttcataatagagccaaattcagtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctactctttttt 4179879  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || |||||||| ||||| | ||    ||  |||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  4179878 agtcaacttcaaaatcaacatttaaaagttgaagttcatgaatccaccgaatcgcatggtgtaatgtcagagcctccccaacatcaacagagcaagttgg 4179779  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
      |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  4179778 gttaaaccacatagtttttgaacgaacatgattctcatccgagtctctgatacacattccaaa 4179716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22161858 - 22161499
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22161858 atcatcaaagatctggaggctagtactagatgcggctgccttagctagattatgagcaacctcattcgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 22161759  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||| |  |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22161758 gttaagtaagtattacaaaattggatactactatccataatagaaccaaatttggtgatatctccatgacctttgttgaaataatcagctactcttttag 22161659  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||  | |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| |||||  || || || || || |  ||||||| |||    
T  22161658 agtcaatctcgaaatcaacatttgttaattgaagttcttgtatccaccgtagtgcatggtataaacccaaagcttctcctacgtctaccgaacaaactgg 22161559  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattcc 373  Q
    ||  || | |||  |||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22161558 agagaaactcataattttggagcgtacatggttcccttctgagtctcggatgcagattcc 22161499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27527402 - 27527107
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatga-----g 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |    
T  27527402 atcatcaaagacctggaagctagtactagatgtggctgccctaactagtgtatgtgcaacctcattcgcttgcctcctaataaactcgacatgacatgag 27527303  T
Q  109 agtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactct 208  Q
    |||||||||| ||| |  || | || |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27527302 agtttgttaagtaagtattagaaaagtaaatactgctgtccataatagaaccaaattcggtagtatctccacggcctttgtagaaataatcagctactct 27527203  T
Q  209 tttagagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgataga 304  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  27527202 tttagagtcaacttcaaaatcaacatttgtaagttgaagttcttgtatccaccgaattgcatggtgtagacccagggcctcccctacatcaataga 27527107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29601079 - 29600754
Alignment:
Q  50 tgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatattgctatcc 149  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |  |||| ||||||| | |||| |||    
T  29601079 tgccttagctaaagcatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgataaattggtgttacagaattggacactgctgtcc 29600980  T
Q  150 ataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagct 249  Q
    || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  29600979 atgatagagccgaactcggtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctattcttttagagtctacctcgaaatcaacatttgagagttgaagtt 29600880  T
Q  250 cttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattggagtaaaccacattgttttagagagaacatgattccc 349  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||   |||  |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||    
T  29600879 catgtatccaccgaatcgcgtgatataacgccagagcctccccaacatccacagagcagattggtgtaaaccacatagttttagaacgaaaatggttccc 29600780  T
Q  350 atctgagtctcggatgcacattccaa 375  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||    
T  29600779 atccgagtctcgaatacacataccaa 29600754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 25594785 - 25595147
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25594785 atcatcaaaggtctggaagctagtactagatgtggctgccctagttagagtatgtgcaacctcattcgcctgcctcctaataaactcgacatgagagttt 25594884  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||  |  |    || |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25594885 gttaaataggtcttggtaaagtaaatactgctgtccattatagaaccaaattcggtgatatcaccacgaccattgttgaaataatcagctgctcttttag 25594984  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||   |||    
T  25594985 agtcaacttcaaaatcaacatttgtaagttgaagttcatatatccaccgaatcgcgtgatgtagacccagggcctcccctacatcaatggaacaggctgg 25595084  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
    ||  ||   ||| ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  25595085 agagaaaatcatggttttagaccggacatgattcccatcggaatcacgaatgcacattccaaa 25595147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11644856 - 11644648
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11644856 atcatcaaagatctggaagttagtattagatgtgactgccttagctaaagtatgcgcaacctcatttgtttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 11644757  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||| |  |||| || |||||  | || | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11644756 gttaaataagtgttacagaaatggatgctactgtgcataatagaaccaaagtcagtgacatcttcacgacctttgttgaaataatcagctactctttttg 11644657  T
Q  214 agtcaacct 222  Q
    |||||||||    
T  11644656 agtcaacct 11644648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 26418748 - 26419007
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26418748 tcatcaaagatgtggaagctaggacctaatgtggctgccttagctaattcatgagcaacctcatttgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 26418847  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |  |  |||| || |||||| |  | |||||||| || ||||||||||||  |||||| |   | |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  26418848 ttaaaaagatattacaaaactggatagtattctccataatggacccaaattcggtgttatctcctcttgccttgttgaaataatcagctactgttttcga 26418947  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
     || |||||||| ||||| ||||  || ||||| || |  || |||||| ||||||||||    
T  26418948 atctacctcaaaatcaacatttgtgagctgaagttcattgatccaccgagttgcatgata 26419007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32108532 - 32108273
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32108532 tcatcaaagatgtggaagctaggacctaatgtggctgccttagctaattcatgagcaacctcatttgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 32108433  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |  |  |||| || |||||| |  | |||||||| || ||||||||||||  |||||| |   | |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  32108432 ttaaaaagatattacaaaactggatagtattctccataatggacccaaattcggtgttatctcctcttgccttgttgaaataatcagctactgttttcga 32108333  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
     || |||||||| ||||| ||||  || ||||| || |  || |||||| ||||||||||    
T  32108332 atctacctcaaaatcaacatttgtgagctgaagttcattgatccaccgagttgcatgata 32108273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 11420321 - 11420425
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11420321 tcatcaaagatgtggaagctaggacctaatgtggctgccttaactaattcatgaacaacctcatttacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 11420420  T
Q  115 ttaaa 119  Q
    |||||    
T  11420421 ttaaa 11420425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11644617 - 11644503
Alignment:
Q  315 gtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatcaa 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||||| || ||||| |    
T  11644617 gtaaaccacattgttttagagcggatatgattcccatatgagtctcggatgcacattcccaatcctaccttatttgtggtatttgaaaaggaggcatcga 11644518  T
Q  415 cattacatttgtatc 429  Q
     ||| ||||| ||||    
T  11644517 tattgcatttatatc 11644503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Original strand, 8860151 - 8860235
Alignment:
Q  41 agatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataattt 125  Q
    |||||||||| |||   |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  8860151 agatgtggctacctgcactaacgcatgagcgacctcattcacttgcctcctaataaatttgacattagagtttgttaaagaattt 8860235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 113
Target Start/End: Original strand, 28214276 - 28214344
Alignment:
Q  45 gtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28214276 gtggatgcctttgctaattcatgggcaaccgcattcacttgtctcctaataaactcaacatgagagttt 28214344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10848627 - 10848578
Alignment:
Q  72 acctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaata 121  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10848627 acctcattaacttgtatcctaataaactcgacatgatagtttgttaaata 10848578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Original strand, 3601278 - 3601321
Alignment:
Q  69 gcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3601278 gcaacctcattcgcttgcctcctattgaactcgacatgagagtt 3601321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 11351598 - 11351697
Alignment:
Q  13 catcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    |||||||| | || |||||||||| |  ||||| |||| || |||||||| |||| || ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11351598 catcatcataaacgtggaagctagcatgagatggggctaccctagctaattcatgagcgaccccattggcttgcctcctattgaactcgacatgagagtt 11351697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21179935 - 21179868
Alignment:
Q  362 gatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatcaacattacatttgtatc 429  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21179935 gatgcacattcccaatcataccttattgatggtatttgaaaatgaggcatcaacattgcatttgtatc 21179868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 176
Target Start/End: Original strand, 40454625 - 40454708
Alignment:
Q  93 ataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatct 176  Q
    |||||||  ||||||||||||| || ||||   ||||| ||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  40454625 ataaactaaacatgagagtttggtagataagagctacaaaattggatactactatccataatgagaccaaattcggtgacatct 40454708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 44464652 - 44464714
Alignment:
Q  16 catcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcat 78  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  44464652 catcaaagatatgaaagttaatactagatgtgactgccttagctaaaacatgtgcaacctcat 44464714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 44839876 - 44839957
Alignment:
Q  31 agctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    |||||| | |||||| |||| || |||||||  |||| || ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44839876 agctagcattagatggggctaccctagctaactcatgagcgaccccattaacttgcctcctattgaactcgacatgagagtt 44839957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9477112 - 9477084
Alignment:
Q  76 cattcacttgcctcctaataaactcgaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9477112 cattcacttgcctcctaataaactcgaca 9477084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10516261 - 10515848
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10516261 atcatcaaagacctagaagctagtattagatgtggttgccttagttaaagtatgcacaacctcatttccttacctcctaataaactcgacatgagagttt 10516162  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  10516161 gttaaataagtgctacataattggatgctactatccataatacaaccaaacttggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcagctacactttttg 10516062  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    || ||||||| || ||||| |||   |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||  ||    
T  10516061 agacaacctcgaaatcaacatttatgagttgaagttcatgtatccaccgaattgcatgatgtaatcccagggcctcccca--atcgacagaacaaaccgg 10515964  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatca 413  Q
    || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||    ||||||| ||  || ||||||    
T  10515963 agaaaaccacattgtttttgagcggacatgattcccatctgagtctcggatgcacatacacaatcctaccttattagtggtatttggaatggaggcatca 10515864  T
Q  414 acattacatttgtatc 429  Q
    ||||||||||||||||    
T  10515863 acattacatttgtatc 10515848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11986322 - 11985948
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11986322 atcatcaaagacctggaagttagtactagacgtggctgccttagctagagcatgtgcaacctcgtttacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 11986223  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||| |  |||| | ||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |    
T  11986222 gttaaataagtgttacaaagttggacactactatccataatggaaccaaactcggtgacatttccacgaccattgttgaaataattagctactctttttg 11986123  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||| ||| || ||||| ||| | |||||||| || || || |||||||| ||||||| ||   ||| ||||||||||| ||| | | | || | |||    
T  11986122 agtcaatctcgaaatcaacatttaagagttgaagttcatgaatccaccgaatcgcatgatgtaacgccagggcctccccaatatcaacatagcagactgg 11986023  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttatt 388  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11986022 agtaaaccacatagttttagagcgaacatggttcccatcggagtctcggatgcacattccaaaacctaccttatt 11985948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21698817 - 21698455
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21698817 atcatcaaacacctggaagctagtactagatgtggctgccttagctaaaacatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 21698718  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||||||  | |  || |||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||      
T  21698717 gttaaataattattgcggaaatggacactactgtccataatagagccaaattcggtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctactctttttt 21698618  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| || |||||||| ||||| | ||    ||  |||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  21698617 agtcaacttcaaaatcaacatttaaaagttgaatttcttgaatccaccgaatcgcatggtttaatgtcagagcctccccaacatctacagatcaagttgg 21698518  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
      |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  21698517 gttaaaccacatagtttttgaacgaacatgattctcatccgagtctctgatacacattccaaa 21698455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Original strand, 30063625 - 30063882
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30063625 atcatcaaacacctggaaggtagtactggatgtggctgttttagctaaaacatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 30063724  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||||||  | || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||      
T  30063725 gttaaataattattgcagaattggacactactgtccatgatagatccaaatttggtgacatctccgcgaccattgttgaaataatcagctactatttttt 30063824  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatg 271  Q
    |||| |  ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  30063825 agtccatttcaaaatcaacatttaaaagttgaagttcatgaatccaccgaatcgcatg 30063882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 1638228 - 1638390
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1638228 atcatcatagatttggaagctagtactagatgtggctgtcttagctaaagtatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaattcgacatgagagttt 1638327  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatct 176  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1638328 gttaaataattgttacataagtgtatactactatccataatagagccaaattcggtgacatct 1638390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 1641256 - 1641417
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1641256 atcatcatagatttggaagctagtactagatgtggctgtcttagctaaagtatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaattcgacatgagcgttt 1641355  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatct 176  Q
    ||| |||||||  ||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1641356 gtt-aataattgttacataagtgtatactactatccataatagagccaaattcggtgacatct 1641417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15950906 - 15950647
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15950906 tcatcaaagatgtggaagctaggacctaatgtggctgccttagctaattcatgagcaacctcatttgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 15950807  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |  |  |||| || |||||| |  | |||||||| || ||||||||||||  |||||| |   | |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  15950806 ttaaaaagatattacaaaactggatagtattctccataatggacccaaattcggtgttatctcctcttgccttgttgaaataatcagctactgttttcga 15950707  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
     || |||||||| ||||| ||||  || ||||| || |  || |||||| ||||||||||    
T  15950706 atctacctcaaaatcaacatttgtgagctgaagttcattgatccaccgagttgcatgata 15950647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Original strand, 7090448 - 7090603
Alignment:
Q  82 cttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacg 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||  ||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |    
T  7090448 cttgcctcctaataaactcaacatgagagtttgttaaatatgatttactgaattggatactagtatccataatggaaccaaactcggtgatatctcccag 7090547  T
Q  182 acctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtcaacgtttg 237  Q
     |||||||| ||| |||| |||||| ||||  | ||||||||||| ||||| ||||    
T  7090548 gcctttgttaaaagaatcagctactattttttaatcaacctcaaaatcaacatttg 7090603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33169538 - 33169414
Alignment:
Q  126 ctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaa 225  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||||| |    
T  33169538 ctacagaattggatacaactatccatgatggaaacaaatttagtgacatctcctcaacctttgttgaaataatcagctactctttccaaagcaacctcga 33169439  T
Q  226 agtcaacgtttgaaagttgaagctc 250  Q
    | |||||||| | ||||||||||||    
T  33169438 aatcaacgttagcaagttgaagctc 33169414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30148059 - 30147965
Alignment:
Q  82 cttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatct 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |   ||| || || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  30148059 cttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaacttgtggaacaaaactgtatattgctattcataatagctccaaattcggtgatatct 30147965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23631616 - 23631460
Alignment:
Q  91 taataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgtt 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  |  |||| || ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||  |||| | |  ||||||||    
T  23631616 taataaactcgatatgagagtttgttaaaaatatattacaaaaatggatattattatccataatggatccaaattcggtgctatcttcgctgcctttgtt 23631517  T
Q  191 gaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaag 247  Q
     ||||||||  ||||| |||| || || |||||||| || || ||||  ||||||||    
T  23631516 aaaataatcaactactgttttcgaatctacctcaaaatcgacatttgtgagttgaag 23631460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13434431 - 13434355
Alignment:
Q  43 atgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaa 119  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |||| ||| ||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13434431 atgtgtctgccttagctaactcatgagcaatctcttttgattgtctcctaataaactcaacatgagagtttgttaaa 13434355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 15923548 - 15923652
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||  |||||||  |||||||||| |||| | |||||     
T  15923548 tcatcaaagatatggaagctagaataggatgtggctgctttagctaattcatgggctaccacatttgcttgcct--taataaactcaacatcaaagttta 15923645  T
Q  115 ttaaata 121  Q
    |||||||    
T  15923646 ttaaata 15923652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 33169595 - 33169536
Alignment:
Q  33 ctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctccta 92  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||  |||||||||||    
T  33169595 ctagtattagatgtggctgccttagttaattcttgtgcaacctcatttgcttgcctccta 33169536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8942210 - 8942161
Alignment:
Q  69 gcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaa 118  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  8942210 gcaacctcattcggttgcctcctagtaaactcgacaatagagtttgttaa 8942161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4513171 - 4513083
Alignment:
Q  24 acatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||| || |||||||| |||  || ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4513171 acatgggagctagtatgagatggggctaccctagctaattcattagcgaccccattggcttgcctcctattgaactcgacatgagagtt 4513083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 14504079 - 14504441
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14504079 atcatcaaagaccaggaagctagtactagatgtggctgtcttagctagagcgtgtgcaacctcattcgcttgcctcctaataaactcgacatgagaattt 14504178  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
     |||| ||  |  |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  14504179 tttaagtatgtgttacagaagtggatattactatccataataaaaccaaattcggtgacatctccatgacctttgttgaaataatcagctattcttttaa 14504278  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  14504279 agtcaacctcgaaatcaacatttgtgagttgaagttcttgtatccaccgaagtgcatgatataaacctagagcctccccaacatcaatagagcaaaatgg 14504378  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
    |  ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14504379 ataaaagcacatagttttagagcggacatgattcccatctgagtctcggatacacattccaaa 14504441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34935197 - 34934825
Alignment:
Q  13 catcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34935197 catcatcaaatgcctggaagctagtactacatgtggctgccttagctaacttatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 34935098  T
Q  113 tgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactctttta 212  Q
    |||||||||||   |||| || |  | | | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  34935097 tgttaaataatcgttacagaagtttaaactactatccataatggagccaaactcggtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctactcttttt 34934998  T
Q  213 gagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattg 312  Q
     |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |    
T  34934997 tagtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgtatccaccgaatcgcatgatttaatgccaaggcctccccaacatcgacagagcaggtcg 34934898  T
Q  313 gagtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctacctt 385  Q
    |||||||||||||  |||||||  | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34934897 gagtaaaccacatgattttagaacggacatggttcccattcgagtctcggatgcacattccaaaacctacctt 34934825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Original strand, 8968346 - 8968707
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8968346 atcatcaaagacttggaagctagtactagatgtggctgccttagctaaagcatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 8968445  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||   || |||| ||||||| | |  ||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  8968446 gttaaattggttttacagaattggacactattatccatgatagaaccgaactcggtaccatctccacggccgttgttgaaatagtcagctactcttttag 8968545  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||   | |  || ||||||||||| | ||| |||| |||    
T  8968546 agtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatggatccaccgaatcgcatggtataatgcaagagcttccccaacatccacagagcaaactgg 8968645  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaa 375  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  8968646 agtaaaccacatagttttagaacgaaaatggttcccatccgagtctcgaatacacatgccaa 8968707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 9734410 - 9734757
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734410 atcatcaaagacctggaagctagtactagatgtggctgccttagctaaagcatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 9734509  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||   |  |||| ||||||| | |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  9734510 gttaaattggtattacagaattggacactattatccatgatagagccaaactcggtgacatctccatgaccattgttgaaatagtcagctactcttttag 9734609  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagaccca-tggcctccccaacatcgatagaacaaattg 312  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || |||| ||| ||||| ||||   | |  | ||||||||||||| |  || |||| ||    
T  9734610 agtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatggatccacctaatcgcatggtataatgcaagagccctccccaacatccactgagcaaactg 9734709  T
Q  313 gagtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctc 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||    
T  9734710 gagtaaaccacatagttttagaacgaaaatggttcccatccgagtctc 9734757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2439594 - 2439226
Alignment:
Q  17 atcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgtt 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2439594 atcaaagacttggaagctagtactacatgtggctgccttagctaaagtatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgtt 2439495  T
Q  117 aaataatttctacataat-tggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagag 215  Q
    ||||||    |||| ||  | || | | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2439494 aaataaccattacagaagcttga-actactatccataatggagccaaactcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcagctactctttttgag 2439396  T
Q  216 tcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattggag 315  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| || | ||| |||||| || ||||||| ||| ||    ||||    
T  2439395 tcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgtatccaccgaatcgcatgatttaaagccagggcctctcctacatcgacagagcaggaaggag 2439296  T
Q  316 taaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctacctt 385  Q
    |  | |||||  |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  2439295 tgtaacacatgattttagagcggacatggttcccatccgagtctcgaatgcacataccgaatcctacctt 2439226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Original strand, 2651767 - 2652041
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2651767 atcatcaaagacctggaagctagtactagatgtggctgccctagctagtgtatgtgcaacctcattcgtttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 2651866  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||| |  || | || |  |||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2651867 gttaaataagtgttagaaaagtaaatattgttgtccataatagagccaaattcggtagcatctccgcggcctttgttgaaataatcagctactcttttat 2651966  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcct 288  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||    
T  2651967 agtcaacttcaaaatcaacaattgtaagttgaagttcttgtatccaccgaattgcgtggtgtagacccagggcct 2652041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26307482 - 26307299
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26307482 atcatcaaagacatggaaactagtactagatgtggctgccctagctaatgcatgtgcaacctcatttacttgcctcctaataaactcgacaggagagttt 26307383  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataa 197  Q
     |||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26307382 attaaataagtgctacataattgaatactactatccataatagagccaaattccgtgacatctccacgacctttattgaaataa 26307299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15790149 - 15789866
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15790149 tcatcaaagatacggaagctagaactagatgtggctgccttagctagattatgtgcaacctcattcgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 15790050  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    |||||     || ||| || || ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  15790049 ttaaaagtgatcgacagaaatgaatgctactgtccattatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatctgctactcgtttcga 15789950  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatc 298  Q
    |||||| ||||| ||||| |||   |||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||    
T  15789949 gtcaacttcaaaatcaacattttcgagttgaagttcatggatccaccgaattgcatgatacagccccagcgcctctccaacatc 15789866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 32073567 - 32073671
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32073567 tcatcaaagatgtggaagctaggacctaatgtggctgccttagctaattcatgagcaacctcatttgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 32073666  T
Q  115 ttaaa 119  Q
    |||||    
T  32073667 ttaaa 32073671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 29704726 - 29704651
Alignment:
Q  45 gtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaat 120  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  29704726 gtggatgcctttgctaattcatgggcaaccacattcgcttgcctcctaataaattcaacatgagagttttttaaat 29704651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Original strand, 13434458 - 13434528
Alignment:
Q  49 ctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaa 119  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13434458 ctgccttagctagttcatgggtaacctcttttacttgtctcctaataaacttaacatgagagtttgttaaa 13434528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 46092044 - 46091978
Alignment:
Q  13 catcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcatt 79  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  46092044 catcatcaaagatctggaagttagtactagatgtagttgtcttagctaatgtatgtgcaacctcatt 46091978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 429
Target Start/End: Original strand, 2652044 - 2652151
Alignment:
Q  322 acattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatcaacattaca 421  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| |||||| |  | |||| ||| || ||||||||||| ||    
T  2652044 acatggttttagaccggacatgattcccatcagaatctcggatgcacatcccaaaacctactttattggagttgtttggaaaggatgcatcaacattgca 2652143  T
Q  422 tttgtatc 429  Q
    ||| ||||    
T  2652144 tttatatc 2652151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20820588 - 20820546
Alignment:
Q  252 tgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaa 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20820588 tgtatccaccgaattgcatgatatagacccggggcctccccaa 20820546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41470626 - 41470554
Alignment:
Q  50 tgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataa 122  Q
    |||||| |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41470626 tgcctttgctaattcatgggcaactccattcgcttgcctcctgtaaaactcaacatgagagtttggtaaataa 41470554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 429
Target Start/End: Original strand, 5609469 - 5609884
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609469 atcatcaaagacctggaagctagtactagatgtagctgctttagctaaagtgtatgcaacctcattcgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 5609568  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||  |  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5609569 gttaagtaggtgttacagaagtggatactgctatccataataaaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcagctactcttttag 5609668  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    || ||||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |||| || ||||| ||||||||| | ||| |||||||||  |||    
T  5609669 agccaacctcgaaatcaacatttgtgagttgaagttcttgtatccaccgagttgcgtgatgtaaacccaaggcctcccctatatcaatagaacaacctgg 5609768  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatca 413  Q
    ||  || ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||  |  |||||| ||| || ||||||    
T  5609769 agagaaacacatagttttagagcggacatgattcccatttgaatctcggatgcccattccaaaacctactttgtttaagttatttggaaatgatgcatca 5609868  T
Q  414 acattacatttgtatc 429  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5609869 acattgcatttatatc 5609884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 424
Target Start/End: Original strand, 664963 - 665358
Alignment:
Q  28 ggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttct 127  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  664963 ggaagctactactagatgtggttgtcttagctaattcatgtgcaacctcatttgcttgtctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataggtact 665062  T
Q  128 acataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaag 227  Q
     || |||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||     
T  665063 gcaaaattggatacaactatccataatataaccaaatttggtgacatgtcctcgacctttgttgaaataatcagctactctttttgaatcaacctcaaaa 665162  T
Q  228 tcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattggagtaaaccacattg 327  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  || | | |||| | |||||| |||||||| |    
T  665163 tcaacgtttgcaagttgaagttcatgtattcaccgaattgcatgatataaacccagggcctccc-aatgtcaacataacacaatggagtgaaccacatag 665261  T
Q  328 ttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatcaacattacattt 424  Q
    |||| |||   ||||| || || ||||| ||||| |||||||| || |||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  665262 tttttgagcagacatggtttccttctgaatctcgaatgcacatacccaatcttaccttattgctggtagttgaaaaagaggcatcaacattacattt 665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33973192 - 33972817
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaat-gcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33973192 atcatcaaagatctggaagctagtactagatgtggctaccttagctaaacgtatgtgcaacctcatttgtttgtctcttaataaacttgacatgagagtt 33973093  T
Q  113 tgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactctttta 212  Q
    |||||||||| |  |||| ||||| | | |  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||     
T  33973092 tgttaaataagtgttacaaaattgtaaactattatctataatggaaccaaactcggtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctactcgtttt 33972993  T
Q  213 gagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattg 312  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||| |||| |     
T  33972992 gagtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgtatccactgaatcgcatgatgtaacgccatggcctccccaacatcgacagagcaaacta 33972893  T
Q  313 gagtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttatt 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33972892 gagtaaaccacatggttttagagcggacatggttcccatccgaatctcggatgcacattccaaagcctaccttatt 33972817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 429
Target Start/End: Original strand, 32535010 - 32535359
Alignment:
Q  82 cttgcctcctaataaactcgacatgaga--gtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctcca 179  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| || |||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32535010 cttgtctcttaataaactcgacatgagagagtttgttaaataagtgctacaaaagtggatgctattatccatgatagaaccaaattcggtgacatctcca 32535109  T
Q  180 cgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagac 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  32535110 cgacctttgttgaaataatcagctactctttatgagttaacctcgaagtcaacatttgtaagttgaagttcatgtatccaccgaattgcatgatgtaagc 32535209  T
Q  280 ccatggcctccccaacatcgatagaacaaattggagtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattc 379  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||| |||||  ||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  32535210 ccagggcctccccaacatcgacagaacagaccggagtgacccacatggttttttagcagacatggtttccatctgagtctcggatgcacatacccaatcc 32535309  T
Q  380 taccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatcaacattacatttgtatc 429  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||    
T  32535310 taccttattgctggtatttgaaaaggtggcatcaacattgcatttatatc 32535359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21824484 - 21824116
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21824484 atcatcaaagacttggaagctagaactacatgtggctgccttagctaacgtatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 21824385  T
Q  114 gttaaataatttctaca-taattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactctttta 212  Q
    ||||| ||||   |||| ||| | ||  |  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21824384 gttaagtaatcattacagtaacttgagcta-ctatccataatagagccgaactcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcagctactctttta 21824286  T
Q  213 gagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattg 312  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||| || | ||||| ||| ||    |    
T  21824285 gagtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgtatccaccggatcgcatgatatagagccagggcctctcctatatcgacagagcaggaag 21824186  T
Q  313 gagtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctac 382  Q
    ||||  | |||||  |||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21824185 gagtgtaacacatgattttagagcggacatggttcccatccgaatctcgaatgcacattccaaatcctac 21824116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 21588126 - 21588463
Alignment:
Q  30 aagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctac 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||     
T  21588126 aagctagtactagatgtggctgcgttagctaattcatgtgcaacctcatttgattgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataggaactat 21588225  T
Q  130 ataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtc 229  Q
    | ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| ||    
T  21588226 agaattggatactactgtccataatggaaccaaattcggtaacatctcctcaacctttgttgaaataatcagctattattttcgaatcaacctcaaaatc 21588325  T
Q  230 aacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattggagtaaaccacattgtt 329  Q
    |||| ||| ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || | ||| || | |||||| ||||| || |||    
T  21588326 aacgattgcaagttgaagttcatgaatccaccgaattgcatgatatagaaccagggcctccccaatgtcaacagagcacaatggagtgaaccatatggtt 21588425  T
Q  330 ttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgca 367  Q
    || ||| ||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  21588426 tttgagcgaacatggtttcctgctgaatctcggatgca 21588463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 358
Target Start/End: Original strand, 27244011 - 27244355
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27244011 atcatcaaagacctggaagctagtactagatgtggctgccttagctaacatatgtgcaacctcatttgtttggttcctaataaactcgacatgagagttt 27244110  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||| |  |||| ||||| | | | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |    
T  27244111 gttaaataagtattacaaaattgtaaactactatccataatggaaccaaactcggtgacatttccacgaccattgttgaaataatcaactactctttttg 27244210  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||  ||||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||| ||   | | ||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  27244211 agtcaacctcgaaatcaatatttgagagttgaagtttatgtatccatcgaatcgcatgatgtaacgctagggcctccccaacatcggcagagcaaactgg 27244310  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtc 358  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  27244311 agtaaaccacatgattttagagcggacatggttcccatccgagtc 27244355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5086702 - 5086340
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5086702 atcatcaaagatctggaagctagtactagatgtggctgccctagctagagtatgtgcaacctcattcgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 5086603  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||   |  |    || |  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5086602 gttaaatgggtcttggtaaagtaaatactactattcataatagaaccaaattcggtgacatcaccacagccattgttgaaataatcagctactcttttag 5086503  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||| || ||||| || |||| |||||| | ||||||||| | ||| || |||||   |||    
T  5086502 agtcaacttcaaaatcaacatttgtaagttgaagttcatatatccatcgaatcgcgtgatgtagaccaagggcctcccctatatcaatggaacaggctgg 5086403  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
    ||  ||  |||| ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  5086402 agagaagaacatggttttagaccggacatgattcccatcagaatcacgaatgcacattccaaa 5086340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13783977 - 13783694
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13783977 tcatcaaagatacggaagctagaactagatgtggctgccttagctagagtatgtgcaacctcattcgcttgcctcctagtaaactcgacatgagattttg 13783878  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |    | ||| || |||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  13783877 ttaaaaatgaccgacaaaaatggatgctactgtccattatggaaccaaattcggtgacatctccacggcctttgttgaaataatccgctactcgtttcga 13783778  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatc 298  Q
    |||||| ||||| ||||| |||   |||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||    
T  13783777 gtcaacttcaaaatcaacatttttgagttgaagttcatggatccaccgaattgcatgatacagtcccagcgcctctccaacatc 13783694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29526934 - 29526675
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29526934 tcatcaaagatgtggaagctaggacctaatgtggctgccttagctaattcatgagcaacctcatttgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 29526835  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |  |  |||| || |||||| |  | |||||||| || ||||||||||||  |||||| |   |||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  29526834 ttaaaaagatattacaaaactggatagtattctccataatggacccaaattcggtgttatctcctcttgctttgttgaaataatcagctattgttttcga 29526735  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
     || |||||||| ||||| ||||  || ||||| || |  || |||||| ||||||||||    
T  29526734 atctacctcaaaatcaacatttgtgagctgaagttcattgatccaccgagttgcatgata 29526675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 274
Target Start/End: Original strand, 7097408 - 7097639
Alignment:
Q  43 atgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatatt 142  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |  |||| || | ||||||    
T  7097408 atgtggctgccttagctaactcatgagcaacctcatttgcttgcctcttaataaactcgacataagagtttattaaaaaggtattacaaaacttgatatt 7097507  T
Q  143 gctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagt 242  Q
      |||||||||| || ||||||||||||  |||||| |  |||||||| |||||| | |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||  ||     
T  7097508 tttatccataatggatccaaattcggtgctatctcctctgcctttgttaaaataaccagctactgttttcgaatctacctcaaaatcaacatttgtgagc 7097607  T
Q  243 tgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
    ||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  7097608 tgaagttcattgatccaccgaattgcatgata 7097639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 19016988 - 19017205
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| | | ||||||| | | ||||| | |||||||| |||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19016988 tcatcaaagatacgaaagctaggatttgatgtagttgccttagttaattcatgggcaaccacatttgcttgcctcctaataaactcaacacgagagtttg 19017087  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    |||||||     |||| || || ||| |  ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||     || | || |||||||| |||||| |||| ||    
T  19017088 ttaaatatgaattacagaaatgtatactattatccatgatggaaccaaactcggtgatatctcccttctctctattaaaataatcagctacttttttcga 19017187  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaac 232  Q
    |||||||||||| |||||    
T  19017188 gtcaacctcaaaatcaac 19017205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15455844 - 15455652
Alignment:
Q  82 cttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |  |||| || |||||| |  | |||||||| || ||||||||||||  |||||| |     
T  15455844 cttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttgttaaaaagatattacaaaactggatagtattctccataatggacccaaattcggtgttatctcctct 15455745  T
Q  182 acctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
      | |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||  || ||||| || |  || |||||| ||||||||||    
T  15455744 tgccttgttgaaataatcagctactgttttcgaatctacctcaaaatcaacatttgtgagctgaagttcattgatccaccgagttgcatgata 15455652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 112
Target Start/End: Original strand, 10325126 - 10325166
Alignment:
Q  72 acctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10325126 acctcattcgtttgcctcctattaaactcgacatgagagtt 10325166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Original strand, 21084957 - 21085318
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21084957 atcatcaaagacctgaaaggtagtactagatgtggctgccttagctaaagcatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 21085056  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    | |||||   |  |||| ||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21085057 gataaatttgtgttacaaaattggacactactatccataatagaaccgaactcggtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctactcttttag 21085156  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| || |||||||    ||  |||||||||||||| | ||| |||| |||    
T  21085157 agtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatggatccaccgaatcgcgtgatataatgtcagagcctccccaacatccacagagcaaactgg 21085256  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaa 375  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21085257 agtaaaccacatagttttagaacgaaaatgattcccatcagagtctcgaatgcacataccaa 21085318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31426556 - 31426194
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31426556 atcatcaaacacctggaagctagtactagatgtggctgctttagttaaaacatgagcaacctcatttgcttgcctcttaataaactcgacatgagagttt 31426457  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||||||  | || ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31426456 gttaaataattattgcagaattggacactactgtccataatagagccaaattcggtgacatctccacgaccattgttgaaataatcagctactctttttg 31426357  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || |||||||| ||||| | ||   |||  |||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  31426356 agtccacttcaaaatcaacatttaaaagttgaagttcatgaatccaccgaatcgcatggtgtaatgccagagcctccccaacatctacagagcaagttgg 31426257  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
      |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  31426256 gttaaaccacatagtttttgagcgaacatgattcccatccgagtctctgatacacattccaaa 31426194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 34071324 - 34071685
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34071324 atcatcaaagacctagaagctagaactagatgtggctgccttagctaaagtgtgtgcaacctcattcgtttgcttcctaataaattcgacatgagagttt 34071423  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||  |  |||| || ||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34071424 gttaaataggtgttacaaaagtggataccactatctataattgaaccaaattcggtgacatctcc-caaccattgttgaagtaatcagctactcttttag 34071522  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || || |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  34071523 agtcaacctcgaaatcaacattagtgagttgaagttcatgaatccaccgaattgcatgatgtaaacccagggcctccccaacgtcaatagaacaggttgg 34071622  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaa 376  Q
    ||  ||  ||||  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34071623 agagaaaaacataattttagagcagacatggttcccatctgagtctcggatgcatattccaaa 34071685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20471283 - 20471015
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20471283 atcatcaaagacctggaagctagtactagatgcggctgccttagctagagtatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactctacatgagagttt 20471184  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||| |   ||| ||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20471183 gttaagtaaatgtgacacaattggatactattatccataatggaaccgaattcggtgatatctccatggcctttgttgaaatagtcagctactcttttag 20471084  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagaccca 282  Q
    |||||||||| || ||||| || |  |||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| |||||    
T  20471083 agtcaacctcgaaatcaacattagttagttgaagttcttgtatccaccgtagtgcatggtataaaccca 20471015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27072469 - 27072201
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27072469 atcatcaaaaatctggaagctagtactagatgcggctgccttggctagagtgtgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcaacatgagagttt 27072370  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||| |   |||  |||||||| |  |||||||||| || || |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27072369 gttaagtaactgtgacaccattggatactcttatccataatggagccgaattcggtgatatctccatggcctttgttgaaataatcagctactcttttag 27072270  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagaccca 282  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  | |||||| |||||||| ||||  ||||| || |||| |||||    
T  27072269 agtcaacctcgaaatcaacatttgttatttgaagttcttgtatccaccttattgcttggtataaaccca 27072201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 113
Target Start/End: Original strand, 3981775 - 3981846
Alignment:
Q  42 gatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||  |||||||    
T  3981775 gatgaggccgccttagctaattcatgggcaacctcattcgcttgtctccgaataaactccacactagagttt 3981846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7861670 - 7861605
Alignment:
Q  50 tgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaa 119  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  7861670 tgccttagctaactcatgagcaatctcatttgcttgcctcctaataaa----acatgagagtttgttaaa 7861605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17459507 - 17459100
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17459507 atcatcaaagacccggaagctagtactagatgtggctgcctttgctagaacatgtgcaacctcattcgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 17459408  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||| |  |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17459407 gttaagtaagtgttacaaaagtggatattactatccataatagaaccaaattcggtgatatctccatgacctttgttgaaataatcaactactcttttag 17459308  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||||| || ||||| |   |||||| |||    
T  17459307 agtcaacctcgaaatcaacatttgttaattgaagttcttgtatccaccgaagtgcatggtataaacccaaagcctctcctacatctaccaaacaaactgg 17459208  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatca 413  Q
    ||  || | |||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||| || ||  || |||||| ||| || ||||||    
T  17459207 agagaaactcataattttagagcgtacatgattcccatctgggtctcggatacacattccaagccctactttgtttgaattatttggaaaggatgcatca 17459108  T
Q  414 acattaca 421  Q
    ||||||||    
T  17459107 acattaca 17459100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15066012 - 15065597
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15066012 atcatcaaagacctggaagctagtactagatgtggctgccctagctagtgtatgtgcaacctcattcgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 15065913  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||| |  || | || |  ||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15065912 gttaagtaagtattagaaaagtaaatactgttgtccataatagaaccaaattcggtagcatctccacggcctttgttgaaataatcaactactcttttag 15065813  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||   |||    
T  15065812 agtcaacttcaaaatcaacatttgtaagttgaagttctcgtatccaccgaattgcgtggtgtagacccagggcctcccctacatcaatagaacagcctgg 15065713  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatca 413  Q
    ||  ||  |||| ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| || ||| |  | |||| ||| || ||||||    
T  15065712 agagaaaaacatggttttagaccggacatgattcccatcagaatctcggatgcacatcccaaaccctactttgttggagttgtttggaaaggatgcatca 15065613  T
Q  414 acattacatttgtatc 429  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  15065612 acattgcatttatatc 15065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25553356 - 25552995
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25553356 atcatcaaagacttggaagctagtactagatgtggctgccttagctaaagcatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcaacatgagagttt 25553257  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||   || |||| ||||||| | |  ||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  25553256 gttaaattggttttacagaattggacactattatccatgatagagccgaactcggtaacatctccacggccattgttgaaatagtcagctactcttttag 25553157  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| || || |||| | | |  || ||||||||||| | ||| |||| |||    
T  25553156 agtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatggatccaccgaatcgcgtggtataaagcaagagcttccccaacatccacagagcaaactgg 25553057  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaa 375  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  25553056 agtaaaccacatagttttagaacgaaaatggttcccatccgagtctcgaatacacataccaa 25552995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 323
Target Start/End: Original strand, 20089018 - 20089326
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||     
T  20089018 tcatcaaagatacggaggctagtactaaatgtggttgccttagataattcatgtgtaacctcatttacttgtctcgtaataaacttgacatgagagttta 20089117  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    |||||||    || |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||    
T  20089118 ttaaatatgaactgcataattggatactattatccataatggacccaaattcggtgacatctcctcgatctttgttgaaatagtcagttactctttttga 20089217  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgga 314  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||| || | ||||    
T  20089218 gtcaacctcaaaatcaacatttgcaagttgaagttcatgaatccaccgaattgcatgataaagacacagggcctctccaacatcaatagagcacaatgga 20089317  T
Q  315 gtaaaccac 323  Q
    || ||||||    
T  20089318 gtgaaccac 20089326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47783097 - 47782838
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47783097 tcatcaaagatgtggaagctaggacctaatgtggctgccttagctaattcatgagcaacctcatttgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 47782998  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |  |  |||| || |||||  |  | |||||||| || ||||||||||||  |||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  47782997 ttaaaaagatattacaaaactggattgtattctccataatggatccaaattcggtgttatctcctcttgctttgttgaaataatcagctactgttttcga 47782898  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
     || |||||||| ||||| ||||  |||| ||| || |  || |||||||||||||||||    
T  47782897 atctacctcaaaatcaacatttgtgagttaaagttcattgatccaccgaattgcatgata 47782838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40687067 - 40686862
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||| ||||| | ||||||||| | | ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||   ||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40687067 tcataaaagatacggaagctaggaatggatgtggttgccttggctaattcatgggcaacctcatttgtttgtctcccaataaactccacatgagagtttg 40686968  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    |||||||     |||||||||||| | | |||||| |||| ||| |||||| ||| | |||||| |||||||| || |||||||  |||||| |||| ||    
T  40686967 ttaaatagaaattacataattggacactactatccttaatggaagcaaatttggttatatctcctcgacctttcttaaaataattagctactattttcga 40686868  T
Q  215 gtcaac 220  Q
     |||||    
T  40686867 atcaac 40686862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Original strand, 4946655 - 4946757
Alignment:
Q  17 atcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgtt 116  Q
    ||||||||  |||||||||| ||   ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4946655 atcaaagatctggaagctaggacataatgtggctgtcttagctaactcatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgatatgagaatttgtt 4946754  T
Q  117 aaa 119  Q
    |||    
T  4946755 aaa 4946757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13200911 - 13200842
Alignment:
Q  50 tgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaa 119  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13200911 tgccttagctaactcatgagcaacctcatttgcttgcctcctaatgaactcgacatgagagtttgttaaa 13200842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9633105 - 9633069
Alignment:
Q  76 cattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9633105 cattcacttgcctcctattgaactcgacatgagagtt 9633069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 385
Target Start/End: Original strand, 28161916 - 28162287
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28161916 atcatcaaagacctggaagctagtactacatgtggctgtcttagctaacgtatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 28162015  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||||    |||| ||    | | | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28162016 gttaaataaacattacagaagcttaaactactatccataatggagccaaactcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcagctactctttttg 28162115  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||| ||  | ||    
T  28162116 agtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgtatccaccgaatcgcatgatttaaagccagggcctccccaacatcgacagagcaggtcgg 28162215  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctacctt 385  Q
    ||||||||||||  |||||||  | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28162216 agtaaaccacatgattttagaacggagatggttcccatccgagtctcggatgcacattccaaaacctacctt 28162287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7995291 - 7994882
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7995291 tcatcaaagatacgaaagctaatattagatgtggctgccttagctaattcatgtgcaacttcatttgtttgcttcataataaactcgacatgagagtttg 7995192  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    |||||||    ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7995191 ttaaataggaactataaaattggatactactatccataatggaaccaaattcgatgacatctcctcgatctttgttgaaataatcagctactcttttcga 7995092  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgga 314  Q
     ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || | | | || | ||||    
T  7995091 atcaacctaaaaatcaacgtttgcaagttgaagttcatttatccaccgaattggatgatatagacccagggcctccccaatgtcaacaaagcacaatgga 7994992  T
Q  315 gtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatcaa 414  Q
    || |||||||  |||||  || | ||||| || ||  |||| ||||| |||||||| || |||  |||||||||||   ||||||||||||| ||| |||    
T  7994991 gtgaaccacagggttttttagcggacatggtttcctgctgaatctcgaatgcacatgcccaatcttaccttattgctgctatttgaaaaagatgcaacaa 7994892  T
Q  415 cattacattt 424  Q
    ||||||||||    
T  7994891 cattacattt 7994882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 385
Target Start/End: Original strand, 25732299 - 25732669
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25732299 atcatcaaagacctggaagctagtactacatgtggttgccttagctaaagcatgtgcaacctcatttgcttacctcctaataaactcgacatgagagttt 25732398  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||| |   |||| ||    | | | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25732399 gttaaatattcattacagaagcttaaactactatccataatggagccaaactcggtgatatctccacgacctttgttgaaataatcagctactctttttg 25732498  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||| || | ||| || |||||||||||||| |||  |  | ||    
T  25732499 agtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgaatccaccgaatcgcatgatttaaagcca-gggctccccaacatcgacagagtaggtcgg 25732597  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctacctt 385  Q
    ||| ||||||||  |||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  25732598 agtgaaccacatgattttagaacggacatggttcccatccgagtctcggatacacataccaaaacctacctt 25732669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 12784056 - 12784333
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaa-cctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12784056 tcatcaaagatacggaagttagtattagatgtagttgccttagctaattcatgtgcaaacctcatttgtttgccttctaataaactccacatgagagttt 12784155  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
      ||||||    ||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  12784156 --taaataggaactatagaattggatactactatccataatggaacccaattcggtgacatctcctcgacctttgtt-aaataatcagctactcttttcg 12784252  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaa 294  Q
    | |||||||||||  |||| |||   || ||||  |  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12784253 aatcaacctcaaaagcaacatttacgagctgaaatttatgtatccatcgaattgcatgatatagacccagggcctctccaa 12784333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3989601 - 3989352
Alignment:
Q  42 gatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatat 141  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||     
T  3989601 gatgtggctaccttagataatttatgggcaacctcatttgcttgtcgtctaataaactccacatgagagtttgttaaataggaattacataattggatac 3989502  T
Q  142 tgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaag 241  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| || |||| |||||| ||||| |||   ||    
T  3989501 tactatccataatggaacgaaacttggtgatatctccacgacttttattaaaataatcagctactattttcgaatcaatctcaaaatcaacatttatgag 3989402  T
Q  242 ttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccc 291  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  3989401 ttgaagtttatgtatccaccgaattgcatggtatagacccaaggcttccc 3989352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25133221 - 25133067
Alignment:
Q  72 acctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtga 171  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||     |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||  |||    
T  25133221 acctcattttcttgcctcctaataaactcaatatgagagtttattaaataggaattacataattggatactactatccataatggaaccaaactctctga 25133122  T
Q  172 catctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttagagtcaacctcaaa 226  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||  |||||| |||| || ||||| |||||    
T  25133121 catctcccctacctttgttaaaataatgagctactattttcgaatcaacttcaaa 25133067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39533777 - 39533709
Alignment:
Q  45 gtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||| |||||| |||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39533777 gtggatgcctttgctaattcgtgggcaaccacattcgcttgcctcctaataaactcaacatgagagttt 39533709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26440898 - 26440817
Alignment:
Q  31 agctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtt 112  Q
    |||||| | |||||| |||| || |||||||  |||| |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26440898 agctagcattagatggggctaccctagctaactcatgagcaaccccattagcttgcctcctattgaactcgacatgagagtt 26440817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 385
Target Start/End: Original strand, 11492 - 11863
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11492 atcatcaaagacctggaagctagtactacatgtggctgccttagctaaagtatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 11591  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||| |   |||| ||    | | | ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11592 gttaaatattcattacagaagcttaaactactacccataatggagccaaactcggtgacatctccactacctttgttgaaataatcagctactctttttg 11691  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||| ||  | ||    
T  11692 agtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgtatccaccgaatcgcatgatttaaagccagggcctccccaacatcgacagagcaggtcgg 11791  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctacctt 385  Q
    ||| ||||||||  ||||| |  | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  11792 agtgaaccacatgattttaaaacggacatggttcccatccgagtctcggatacacataccaaaacctacctt 11863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 429
Target Start/End: Original strand, 234673 - 235088
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  234673 atcatcaaagatctggaagctagtactagatgtggatgccctagctagtgtatgtgcaacctcattcgtttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 234772  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||| ||| |  || | || |  ||| | || ||||||||||| |||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  234773 gttaagtaagtattagaaaagtaaatactactgtccataatagagccaaattcggtagcatctccgcaacctttgttcaaataatcagctactcttttag 234872  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgatatagacccatggcctccccaacatcgatagaacaaattgg 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||   |||    
T  234873 agtcaacttcaaaatcaacatttgtaggttgaagttcttgtatccaccgaattgcgtagtgtagacccagggcctcccctacatcaatagagcagcctgg 234972  T
Q  314 agtaaaccacattgttttagagagaacatgattcccatctgagtctcggatgcacattccaaattctaccttattgcaagtatttgaaaaagaagcatca 413  Q
    ||  ||  |||| ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| || ||| |  | |||| ||| || ||||||    
T  234973 agagaaaaacatggttttagaccggacatgattcccatcagaatctcggatgcacatcccaaaacctactttgttggagttgtttggaaaggatgcatca 235072  T
Q  414 acattacatttgtatc 429  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  235073 acattgcatttatatc 235088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1689 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1689
Description:

Target: scaffold1689; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1020 - 761
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1020 atcatcaaagacttggaaactagtactacatgtggctgccttagctaaggtatgagcaacctcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 921  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    ||||||||||   |||| || | ||   |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  920 gttaaataatcattacagaaattgaagctattatccataatggaaccaaactcggtgacatctccacgacctttgttgaaataattagctactctttttg 821  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgat 273  Q
    | |||||||| || | ||| ||||| |||||||| || ||  | |||||||| |||||||    
T  820 aatcaacctcgaaattaacatttgagagttgaagttcatgagtccaccgaatcgcatgat 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 13981 - 14242
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaat--gcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagt 111  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13981 atcatcaaagactttgaagctagtactacatgtggctgccttagctaaaaggtatgagcaacctcattttcttgcctcctaataaactcgacatgagagt 14080  T
Q  112 ttgttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactctttt 211  Q
    ||||||| ||||   |||| || |  | | |  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14081 ttgttaagtaatcattacagaaatttaaactattatccataatggatccaaactcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcagctactctttt 14180  T
Q  212 agagtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgat 273  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| |||||||    
T  14181 tgagtcaacctcgaaatcaacatttgagagttgaagttcatgaatccactgaatcgcatgat 14242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 2197 - 2456
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2197 tcatcaaagatacggaagctagaactggatgtggctgccttagctagagtatgtgaaacctcattcgcttgcctcctagtaaactcgacatgagagtttg 2296  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |    | ||| || |||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  2297 ttaaaaatgaccgacagaaatggatgctactgtccattatggaaccaaattcggtgacatctccactgcctttgttgaaataatccgctactcgtttcga 2396  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccgaattgcatgata 274  Q
    |||||| ||||| ||||| |||   |||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  2397 gtcaacttcaaaatcaacattttcgagttgaagttcatggatccaccgaattgcatgata 2456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 14414 - 14661
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagttt 113  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  || ||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14414 atcattaaagatattgaagttagtactagatgtgattgtcttagctaaagtatgtgcaacctcatttgcttgcctcctaataaattcgacatgagagttt 14513  T
Q  114 gttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttag 213  Q
    |||||||||||  |||| || |||||  |  |||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| |    
T  14514 gttaaataattgttacagaaatggatgctattatcaatgataaaaccaaattcgg-gacatctccacgacctttgttgaaataattagcaactatttttg 14612  T
Q  214 agtcaacctcaaagtcaacgtttgaaagttgaagctcttgtattcaccg 262  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || |||||| || ||||| |||||    
T  14613 agtcaacctcgaaatcaacatttgtaaattgaagttcatgtatccaccg 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52782 - 52560
Alignment:
Q  15 tcatcaaagacatggaagctagtactagatgtggctgccttagctaatgcatgcgcaacctcattcacttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 114  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52782 tcatcaaagatgtggaagctaggacataatgtggctgccttagctaactcatgaacaacgtcatttgcttgcctcctaataaactcgacatgagagtttg 52683  T
Q  115 ttaaataatttctacataattggatattgctatccataatagaaccaaattcggtgacatctccacgacctttgttgaaataatcggctactcttttaga 214  Q
    ||||| |  |  | || || |||||| |  | |||||||| || ||||||||||||  |||||| |   ||||||  |||||||| |||||| |||| ||    
T  52682 ttaaaaatatattgcaaaactggatagtattctccataatggatccaaattcggtgttatctcctctggctttgtgaaaataatcagctactgttttcga 52583  T
Q  215 gtcaacctcaaagtcaacgtttg 237  Q
     || |||||||| ||||| ||||    
T  52582 atctacctcaaaatcaacatttg 52560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 215552 - 215522
Alignment:
Q  14 atcatcaaagacatggaagctagtactagat 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215552 atcatcaaagacatggaagctagtactagat 215522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University